MUON/AliMUONReAlignTask.cxx

   1 /**************************************************************************
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   3 *                                                                        *
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  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 //-----------------------------------------------------------------------------
  19 /// \class AliMUONReAlignTask
  20 /// AliAnalysisTask to realign the MUON spectrometer.
  21 /// The Task reads as input ESDs moves the clusters of a MUONTrack acoording
  22 /// to the re aligned geometry taken from a misalignment file in the OCDB
  23 /// and refit the track. Then it produces a AliMUONClusterInfo object for each
  24 /// cluster. The output is a TTree of AliMUONClusterInfo
  25 ///
  26 /// \author Javier Castillo, CEA/Saclay - Irfu/SPhN
  27 //-----------------------------------------------------------------------------
  28
  29 #include <fstream>
  30
  31 #include <TString.h>
  32 #include <TError.h>
  33 #include <TTree.h>
  34 #include <TChain.h>
  35 #include <TClonesArray.h>
  36 #include <TRandom.h>
  37 #include <TGeoGlobalMagField.h>
  38 #include <TGeoManager.h>
  39 #include <Riostream.h>
  40
  41 #include "AliAnalysisTask.h"
  42 #include "AliAnalysisManager.h"
  43 #include "AliESDInputHandler.h"
  44 #include "AliESDEvent.h"
  45 #include "AliESDMuonTrack.h"
  46 #include "AliMagF.h"
  47 #include "AliCDBManager.h"
  48 #include "AliGRPManager.h"
  49 #include "AliGeomManager.h"
  50
  51 #include "AliMpConstants.h"
  52 #include "AliMpCDB.h"
  53 #include "AliMpSegmentation.h"
  54 #include "AliMpVSegmentation.h"
  55 #include "AliMpPad.h"
  56 #include "AliMUONCalibrationData.h"
  57 #include "AliMUONVCalibParam.h"
  58 #include "AliMUONPadInfo.h"
  59 #include "AliMUONClusterInfo.h"
  60 #include "AliMUONRecoParam.h"
  61 #include "AliMUONESDInterface.h"
  62 #include "AliMUONRefitter.h"
  63 #include "AliMUONRecoParam.h"
  64 #include "AliMUONVDigit.h"
  65 #include "AliMUONVCluster.h"
  66 #include "AliMUONTrack.h"
  67 #include "AliMUONVTrackStore.h"
  68 #include "AliMUONVDigitStore.h"
  69 #include "AliMUONTrackParam.h"
  70 #include "AliMUONTrackExtrap.h"
  71 #include "AliMUONGeometryTransformer.h"
  72
  73 #include "AliMUONReAlignTask.h"
  74
  75 ///\cond CLASSIMP
  76 ClassImp(AliMUONReAlignTask)
  77 ///\endcond
  78
  79 //________________________________________________________________________
  80 AliMUONReAlignTask::AliMUONReAlignTask(const char *name, const char *geofilename, const char *defaultocdb, const char *misalignocdb)
  81   : AliAnalysisTask(name, ""),
  82     fESD(0x0),
  83     fClusterInfoTree(0x0),
  84     fClusterInfo(0x0),
  85     fESDInterface(0x0),
  86     fRefitter(0x0),
  87     fRecoParam(0x0),
  88     fGeoFilename(geofilename),
  89     fMisAlignOCDB(misalignocdb),
  90     fDefaultOCDB(defaultocdb),
  91     fGeoTransformer(0x0),
  92     fNewGeoTransformer(0x0),
  93     fGainStore(0x0),
  94     fPedStore(0x0),
  95     fPrintLevel(0),
  96     fLastRun(-1)
  97 {
  98   /// Default Constructor
  99   // Define input and output slots here
 100   // Input slot #0 works with a TChain
 101   DefineInput(0, TChain::Class());
 102   // Output slot #0 writes a TTree
 103   DefineOutput(0, TTree::Class());
 104
 105   fClusterInfo = new AliMUONClusterInfo();
 106   fESDInterface = new AliMUONESDInterface();
 107   fGeoTransformer = new AliMUONGeometryTransformer();
 108   fNewGeoTransformer = new AliMUONGeometryTransformer();
 109 }
 110
 111 //________________________________________________________________________
 112 AliMUONReAlignTask::AliMUONReAlignTask(const AliMUONReAlignTask& obj)
 113   : AliAnalysisTask(obj),
 114     fESD(0x0),
 115     fClusterInfoTree(0x0),
 116     fClusterInfo(0x0),
 117     fESDInterface(0x0),
 118     fRefitter(0x0),
 119     fRecoParam(0x0),
 120     fGeoFilename(""),
 121     fMisAlignOCDB(""),
 122     fDefaultOCDB(""),
 123     fGeoTransformer(0x0),
 124     fNewGeoTransformer(0x0),
 125     fGainStore(0x0),
 126     fPedStore(0x0),
 127     fPrintLevel(0),
 128     fLastRun(-1)
 129 {
 130   /// Copy constructor
 131   fESD = obj.fESD;
 132   fClusterInfoTree = obj.fClusterInfoTree;
 133   fClusterInfo = obj.fClusterInfo;
 134   fESDInterface = obj.fESDInterface;
 135   fRefitter = obj.fRefitter;
 136   fRecoParam = obj.fRecoParam;
 137   fGeoFilename = obj.fGeoFilename;
 138   fMisAlignOCDB = obj.fMisAlignOCDB;
 139   fDefaultOCDB = obj.fDefaultOCDB;
 140   fGeoTransformer = obj.fGeoTransformer;
 141   fNewGeoTransformer = obj.fNewGeoTransformer;
 142   fGainStore = obj.fGainStore;
 143   fPedStore = obj.fPedStore;
 144   fPrintLevel = obj.fPrintLevel;
 145   fLastRun = obj.fLastRun;
 146 }
 147
 148 //________________________________________________________________________________
 149 AliMUONReAlignTask& AliMUONReAlignTask::operator=(const AliMUONReAlignTask& other)
 150 {
 151   /// Assignment
 152   AliAnalysisTask::operator=(other);
 153   fESD = other.fESD;
 154   fClusterInfoTree = other.fClusterInfoTree;
 155   fClusterInfo = other.fClusterInfo;
 156   fESDInterface = other.fESDInterface;
 157   fRefitter = other.fRefitter;
 158   fRecoParam = other.fRecoParam;
 159   fGeoFilename = other.fGeoFilename;
 160   fMisAlignOCDB = other.fMisAlignOCDB;
 161   fDefaultOCDB = other.fDefaultOCDB;
 162   fGeoTransformer = other.fGeoTransformer;
 163   fNewGeoTransformer = other.fNewGeoTransformer;
 164   fGainStore = other.fGainStore;
 165   fPedStore = other.fPedStore;
 166   fPrintLevel = other.fPrintLevel;
 167   fLastRun = other.fLastRun;
 168
 169   return *this;
 170 }
 171
 172
 173 //________________________________________________________________________
 174 AliMUONReAlignTask::~AliMUONReAlignTask()
 175 {
 176   /// Destructor
 177   if (fESDInterface) delete fESDInterface;
 178   if (fGeoTransformer) delete fGeoTransformer;
 179   if (fNewGeoTransformer) delete fNewGeoTransformer;
 180 }
 181
 182 //________________________________________________________________________
 183 void AliMUONReAlignTask::LocalInit()
 184 {
 185   /// Local initialization, called once per task on the client machine
 186   /// where the analysis train is assembled
 187   AliMpCDB::LoadMpSegmentation();
 188
 189   // prepare the refitting
 190   gRandom->SetSeed(0);
 191   Prepare(fGeoFilename.Data(),fDefaultOCDB.Data(),fMisAlignOCDB.Data());
 192
 193   fRefitter = new AliMUONRefitter(fRecoParam);
 194   fRefitter->Connect(fESDInterface);
 195
 196   // Original geotransformer
 197   fGeoTransformer->LoadGeometryData();
 198   // Apply mis alignments
 199   AliGeomManager::ApplyAlignObjsFromCDB("MUON");
 200   // New geotransformer
 201   fNewGeoTransformer->LoadGeometryData();
 202
 203 }
 204
 205 //________________________________________________________________________
 206 void AliMUONReAlignTask::ConnectInputData(Option_t *)
 207 {
 208   /// Connect ESD here. Called on each input data change.
 209   // Connect ESD here
 210   TTree* esdTree = dynamic_cast<TTree*> (GetInputData(0));
 211   if (!esdTree) {
 212     Printf("ERROR: Could not read chain from input slot 0");
 213   }
 214   else {
 215     AliESDInputHandler *esdH = dynamic_cast<AliESDInputHandler*> (AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetInputEventHandler());
 216     if (!esdH) {
 217       Printf("ERROR: Could not get ESDInputHandler");
 218     }
 219     else {
 220       fESD = esdH->GetEvent();
 221     }
 222   }
 223 }
 224
 225 //________________________________________________________________________
 226 void AliMUONReAlignTask::CreateOutputObjects()
 227 {
 228   /// Executed once on each worker (machine actually running the analysis code)
 229   //
 230   // This method has to be called INSIDE the user redefined CreateOutputObjects
 231   // method, before creating each object corresponding to the output containers
 232   // that are to be written to a file. This need to be done in general for the big output
 233   // objects that may not fit memory during processing.
 234   OpenFile(0);
 235
 236   fClusterInfoTree = new TTree("clusterInfoTree","clusterInfoTree");
 237   fClusterInfoTree->Branch("clusterInfo", &fClusterInfo, 32000, 99);
 238
 239 }
 240
 241 //________________________________________________________________________
 242 void AliMUONReAlignTask::Exec(Option_t *)
 243 {
 244   /// Main loop, called for each event
 245   if (!fESD) {
 246     Printf("ERROR: fESD not available");
 247     return;
 248   }
 249
 250   // Prepare Gain and Pedestal store
 251   if (!fGainStore || fLastRun!=fESD->GetRunNumber()){
 252     fGainStore = AliMUONCalibrationData::CreateGains(fESD->GetRunNumber());
 253     fLastRun = fESD->GetRunNumber();
 254   }
 255   if (!fPedStore || fLastRun!=fESD->GetRunNumber()){
 256     fPedStore = AliMUONCalibrationData::CreatePedestals(fESD->GetRunNumber());
 257     fLastRun = fESD->GetRunNumber();
 258   }
 259
 260   AliMUONPadInfo padInfo;
 261
 262   Int_t nTracks = (Int_t)fESD->GetNumberOfMuonTracks();
 263   if (nTracks < 1) return;
 264
 265   // load the current event
 266   fESDInterface->LoadEvent(*fESD);
 267   AliMUONVDigitStore* digitStore = fESDInterface->GetDigits();
 268
 269   Double_t lX = 0.;
 270   Double_t lY = 0.;
 271   Double_t lZ = 0.;
 272   Double_t gX = 0.;
 273   Double_t gY = 0.;
 274   Double_t gZ = 0.;
 275   // loop over cluster to modify their position
 276   AliMUONVCluster *cluster;
 277   TIter next(fESDInterface->CreateClusterIterator());
 278   while ((cluster = static_cast<AliMUONVCluster*>(next()))) {
 279     //       cout << "Original cluster" << endl;
 280     //       cluster->Print();
 281     gX = cluster->GetX();
 282     gY = cluster->GetY();
 283     gZ = cluster->GetZ();
 284     fGeoTransformer->Global2Local(cluster->GetDetElemId(),gX,gY,gZ,lX,lY,lZ);
 285     fNewGeoTransformer->Local2Global(cluster->GetDetElemId(),lX,lY,lZ,gX,gY,gZ);
 286     cluster->SetXYZ(gX,gY,gZ);
 287     //       cout << "Aligned cluster" << endl;
 288     //       cluster->Print();
 289   }
 290
 291   // refit the tracks from digits
 292   AliMUONVTrackStore* newTrackStore = fRefitter->ReconstructFromClusters();
 293
 294   //----------------------------------------------//
 295   // ------ fill new ESD and print results ------ //
 296   //----------------------------------------------//
 297   // loop over the list of ESD tracks
 298   TClonesArray *esdTracks = (TClonesArray*) fESD->FindListObject("MuonTracks");
 299   for (Int_t iTrack = 0; iTrack <  nTracks; iTrack++) {
 300     // get the ESD track
 301     AliESDMuonTrack* esdTrack = (AliESDMuonTrack*) esdTracks->UncheckedAt(iTrack);
 302
 303     // skip ghost tracks (leave them unchanged in the new ESD file)
 304     if (!esdTrack->ContainTrackerData()) continue;
 305
 306     // get the corresponding MUON track
 307     AliMUONTrack* track = fESDInterface->FindTrack(esdTrack->GetUniqueID());
 308
 309     // Find the corresponding re-fitted MUON track
 310     AliMUONTrack* newTrack = (AliMUONTrack*) newTrackStore->FindObject(esdTrack->GetUniqueID());
 311
 312 //     // replace the content of the current ESD track or remove it if the refitting has failed
 313 //     if (newTrack) {
 314 //       Double_t vertex[3] = {esdTrack->GetNonBendingCoor(), esdTrack->GetBendingCoor(), esdTrack->GetZ()};
 315 //       AliMUONESDInterface::MUONToESD(*newTrack, *esdTrack, vertex, esdInterface.GetDigits());
 316 //       } else {
 317 //       esdTracks->Remove(esdTrack);
 318 //       }
 319
 320     // print initial and re-fitted track parameters at first cluster if any
 321     if (fPrintLevel>0) {
 322       cout<<"            ----------------track #"<<iTrack+1<<"----------------"<<endl;
 323       cout<<"before refit:"<<endl;
 324       AliMUONTrackParam *param = (AliMUONTrackParam*) track->GetTrackParamAtCluster()->First();
 325       param->Print("FULL");
 326       if (fPrintLevel>1) param->GetCovariances().Print();
 327       if (!newTrack) continue;
 328       cout<<"after refit:"<<endl;
 329       param = (AliMUONTrackParam*) newTrack->GetTrackParamAtCluster()->First();
 330       param->Print("FULL");
 331       if (fPrintLevel>1) param->GetCovariances().Print();
 332       cout<<"            ----------------------------------------"<<endl;
 333     }
 334
 335     // Cluster Info part
 336     UInt_t muonClusterMap = BuildClusterMap(*newTrack);
 337
 338     // loop over clusters
 339     AliMUONTrackParam* trackParam = static_cast<AliMUONTrackParam*>(newTrack->GetTrackParamAtCluster()->First());
 340     while (trackParam) {
 341       fClusterInfo->Clear("C");
 342
 343       // fill cluster info
 344       cluster = trackParam->GetClusterPtr();
 345       fClusterInfo->SetRunId(fESD->GetRunNumber());
 346       fClusterInfo->SetEventId(fESD->GetEventNumberInFile());
 347       fClusterInfo->SetZ(cluster->GetZ());
 348       fClusterInfo->SetClusterId(cluster->GetUniqueID());
 349       fClusterInfo->SetClusterXY(cluster->GetX(), cluster->GetY());
 350       fClusterInfo->SetClusterXYErr(cluster->GetErrX(), cluster->GetErrY());
 351       fClusterInfo->SetClusterChi2(cluster->GetChi2());
 352       fClusterInfo->SetClusterCharge(cluster->GetCharge());
 353
 354       // fill track info
 355       fClusterInfo->SetTrackId(newTrack->GetUniqueID());
 356       fClusterInfo->SetTrackXY(trackParam->GetNonBendingCoor(), trackParam->GetBendingCoor());
 357       fClusterInfo->SetTrackThetaXY(TMath::ATan(trackParam->GetNonBendingSlope()), TMath::ATan(trackParam->GetBendingSlope()));
 358       fClusterInfo->SetTrackP(trackParam->P());
 359       const TMatrixD paramCov = trackParam->GetCovariances();
 360       fClusterInfo->SetTrackXYErr(TMath::Sqrt(paramCov(0,0)), TMath::Sqrt(paramCov(2,2)));
 361       fClusterInfo->SetTrackChi2(newTrack->GetNormalizedChi2());
 362       fClusterInfo->SetTrackCharge((Short_t)trackParam->GetCharge());
 363       fClusterInfo->SetTrackNHits(newTrack->GetNClusters());
 364       fClusterInfo->SetTrackChamberHitMap(muonClusterMap);
 365
 366       // fill pad info if available
 367       for (Int_t i=0; i<cluster->GetNDigits(); i++) {
 368         AliMUONVDigit* digit = digitStore->FindObject(cluster->GetDigitId(i));
 369         if (!digit) continue;
 370
 371         // pad location
 372         const AliMpVSegmentation* seg = AliMpSegmentation::Instance()->
 373           GetMpSegmentation(digit->DetElemId(),AliMp::GetCathodType(digit->Cathode()));
 374         AliMpPad pad = seg->PadByIndices(digit->PadX(), digit->PadY());
 375
 376         // calibration parameters
 377         AliMUONVCalibParam* ped =  fPedStore ? static_cast<AliMUONVCalibParam*>(fPedStore->FindObject(digit->DetElemId(), digit->ManuId())) : 0x0;
 378         AliMUONVCalibParam* gain = fGainStore ? static_cast<AliMUONVCalibParam*>(fGainStore->FindObject(digit->DetElemId(), digit->ManuId())) : 0x0;
 379         Int_t manuChannel = digit->ManuChannel();
 380         Int_t planeType = 0;
 381         if ( digit->ManuId() & AliMpConstants::ManuMask(AliMp::kNonBendingPlane)) {
 382           planeType = 1;
 383         }
 384
 385         // fill pad info
 386         padInfo.SetPadId(digit->GetUniqueID());
 387         padInfo.SetPadPlaneType(planeType);
 388         padInfo.SetPadXY(pad.GetPositionX(), pad.GetPositionY());
 389         padInfo.SetPadDimXY(pad.GetDimensionX(), pad.GetDimensionY());
 390         padInfo.SetPadCharge((Double_t)digit->Charge());
 391         padInfo.SetPadADC(digit->ADC());
 392         padInfo.SetSaturated(digit->IsSaturated());
 393         padInfo.SetCalibrated(digit->IsCalibrated());
 394         if (ped) {
 395           padInfo.SetPedestal(ped->ValueAsFloatFast(manuChannel,0), ped->ValueAsFloatFast(manuChannel,1));
 396         } else {
 397           padInfo.SetPedestal(-250.,-5.);
 398         }
 399         if (gain) {
 400           padInfo.SetGain(gain->ValueAsFloatFast(manuChannel,0), gain->ValueAsFloatFast(manuChannel,1),
 401                           gain->ValueAsIntFast(manuChannel,2), gain->ValueAsIntFast(manuChannel,3));
 402         } else {
 403           padInfo.SetGain(-1.,-0.1,-4095,-1);
 404         }
 405         fClusterInfo->AddPad(padInfo);
 406       }
 407
 408       // fill cluster info tree
 409       fClusterInfoTree->Fill();
 410       trackParam = static_cast<AliMUONTrackParam*>(track->GetTrackParamAtCluster()->After(trackParam));
 411     }
 412   }
 413   // free memory
 414   delete newTrackStore;
 415
 416
 417   // Post final data. Write histo list to a file with option "RECREATE"
 418   PostData(0,fClusterInfoTree);
 419 }
 420
 421 //________________________________________________________________________
 422 void AliMUONReAlignTask::Terminate(const Option_t*)
 423 {
 424   /// Called once per task on the client machine at the end of the analysis.
 425
 426 }
 427
 428 //-----------------------------------------------------------------------
 429 void AliMUONReAlignTask::Prepare(const char* geoFilename, const char* defaultOCDB, const char* misAlignOCDB)
 430 {
 431   /// Set the geometry, the magnetic field, the mapping and the reconstruction parameters
 432
 433   // Import TGeo geometry (needed by AliMUONTrackExtrap::ExtrapToVertex)
 434   if (!gGeoManager) {
 435     AliGeomManager::LoadGeometry(geoFilename);
 436     if (!gGeoManager) {
 437       Error("AliMUONReAlignTask", "getting geometry from file %s failed", "generated/galice.root");
 438       return;
 439     }
 440   }
 441
 442   // Load mapping
 443   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
 444   man->SetDefaultStorage(defaultOCDB);
 445   man->SetSpecificStorage("MUON/Align/Data",misAlignOCDB);
 446   man->Print();
 447   man->SetRun(0);
 448   if ( ! AliMpCDB::LoadDDLStore() ) {
 449     Error("MUONRefit","Could not access mapping from OCDB !");
 450     exit(-1);
 451   }
 452
 453   // set mag field
 454   if (!TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField()) {
 455     printf("Loading field map...\n");
 456     AliGRPManager *grpMan = new AliGRPManager();
 457     grpMan->ReadGRPEntry();
 458     grpMan->SetMagField();
 459     delete grpMan;
 460   }
 461   // set the magnetic field for track extrapolations
 462   AliMUONTrackExtrap::SetField();
 463
 464   // Load initial reconstruction parameters from OCDB
 465   // reconstruction parameters
 466   fRecoParam = AliMUONRecoParam::GetCosmicParam();
 467
 468   // digit selection
 469   fRecoParam->SetPadGoodnessMask(0x400BE80);
 470 //   TString caliboption = caliboption1;
 471 //   if ( calib == 2 ) caliboption = caliboption2;
 472 //   fRecoParam->SetCalibrationMode("NOGAIN"caliboption.Data());
 473   fRecoParam->SetCalibrationMode("NOGAIN");
 474
 475   // chamber resolution (incuding misalignment)
 476   for (Int_t iCh=0; iCh<10; iCh++) {
 477     fRecoParam->SetDefaultNonBendingReso(iCh,0.4);
 478     fRecoParam->SetDefaultBendingReso(iCh,0.4);
 479   }
 480   fRecoParam->SetMaxNonBendingDistanceToTrack(10.);
 481   fRecoParam->SetMaxBendingDistanceToTrack(10.);
 482
 483   // cut on (non)bending slopes
 484   //fRecoParam->SetMaxNonBendingSlope(0.6);
 485   //fRecoParam->SetMaxBendingSlope(0.6);
 486
 487   // tracking algorithm
 488   //  fRecoParam->MakeMoreTrackCandidates(kTRUE);
 489   fRecoParam->RequestStation(0, kFALSE);
 490   fRecoParam->RequestStation(2, kFALSE);
 491 //   fRecoParam->RequestStation(3, kFALSE);
 492 //   fRecoParam->RequestStation(4, kFALSE);
 493   fRecoParam->SetSigmaCutForTracking(7.);
 494   fRecoParam->ImproveTracks(kTRUE, 7.);
 495   Info("MUONRefit", "\n initial recontruction parameters:");
 496   fRecoParam->Print("FULL");
 497
 498   AliMUONESDInterface::ResetTracker(fRecoParam);
 499 }
 500
 501 //-----------------------------------------------------------------------
 502 UInt_t AliMUONReAlignTask::BuildClusterMap(AliMUONTrack &track)
 503 {
 504   /// Build the map of clusters in tracking chambers
 505
 506   UInt_t muonClusterMap = 0;
 507
 508   AliMUONTrackParam* trackParam = static_cast<AliMUONTrackParam*>(track.GetTrackParamAtCluster()->First());
 509   while (trackParam) {
 510
 511     muonClusterMap |= BIT(trackParam->GetClusterPtr()->GetChamberId());
 512
 513     trackParam = static_cast<AliMUONTrackParam*>(track.GetTrackParamAtCluster()->After(trackParam));
 514   }
 515
 516   return muonClusterMap;
 517
 518 }