PHOS/AliPHOS.cxx

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  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 /* History of cvs commits:
  17  *
  18  * $Log$
  19  * Revision 1.116  2007/10/10 09:05:10  schutz
  20  * Changing name QualAss to QA
  21  *
  22  * Revision 1.115  2007/08/22 09:20:50  hristov
  23  * Updated QA classes (Yves)
  24  *
  25  * Revision 1.114  2007/08/07 14:12:03  kharlov
  26  * Quality assurance added (Yves Schutz)
  27  *
  28  * Revision 1.113  2007/07/18 16:29:54  policheh
  29  * Raw Sdigits energy converted to GeV.
  30  *
  31  * Revision 1.112  2007/02/25 22:59:13  policheh
  32  * Digits2Raw(): ALTRO buffer and mapping created per each DDL.
  33  *
  34  * Revision 1.111  2007/02/18 15:21:47  kharlov
  35  * Corrections for memory leak in Digits2Raw due to AliAltroMapping
  36  *
  37  * Revision 1.110  2007/02/13 10:52:08  policheh
  38  * Raw2SDigits() implemented
  39  *
  40  * Revision 1.109  2007/02/05 10:43:25  hristov
  41  * Changes for correct initialization of Geant4 (Mihaela)
  42  *
  43  * Revision 1.108  2007/02/01 10:34:47  hristov
  44  * Removing warnings on Solaris x86
  45  *
  46  * Revision 1.107  2007/01/29 16:29:37  kharlov
  47  * Digits2Raw(): special workaround for digits with time out of range
  48  *
  49  * Revision 1.106  2007/01/17 17:28:56  kharlov
  50  * Extract ALTRO sample generation to a separate class AliPHOSPulseGenerator
  51  *
  52  * Revision 1.105  2007/01/12 21:44:29  kharlov
  53  * Simulate and reconstruct two gains simulaneouslsy
  54  */
  55
  56 //_________________________________________________________________________
  57 // Base Class for PHOS description:
  58 //   PHOS consists of a PbWO4 calorimeter (EMCA) and a gazeous charged
  59 //    particles detector (CPV or PPSD).
  60 //   The only provided method here is CreateMaterials,
  61 //    which defines the materials common to all PHOS versions.
  62 //
  63 //*-- Author: Laurent Aphecetche & Yves Schutz (SUBATECH)
  64 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  65
  66
  67 // --- ROOT system ---
  68 class TFile;
  69 #include <TF1.h>
  70 #include <TFolder.h>
  71 #include <TGeoGlobalMagField.h>
  72 #include <TH1F.h>
  73 #include <TRandom.h>
  74 #include <TTree.h>
  75 #include <TVirtualMC.h>
  76
  77 // --- Standard library ---
  78
  79 // --- AliRoot header files ---
  80 #include "AliMagF.h"
  81 #include "AliPHOS.h"
  82 #include "AliPHOSLoader.h"
  83 #include "AliRun.h"
  84 #include "AliRawReader.h"
  85 #include "AliPHOSDigitizer.h"
  86 #include "AliPHOSSDigitizer.h"
  87 #include "AliPHOSDigit.h"
  88 #include "AliAltroBuffer.h"
  89 #include "AliAltroMapping.h"
  90 #include "AliCaloAltroMapping.h"
  91 #include "AliLog.h"
  92 #include "AliCDBManager.h"
  93 #include "AliCDBEntry.h"
  94 #include "AliCDBStorage.h"
  95 #include "AliPHOSCalibData.h"
  96 #include "AliPHOSPulseGenerator.h"
  97 #include "AliDAQ.h"
  98 #include "AliPHOSRawFitterv0.h"
  99 #include "AliPHOSCalibData.h"
 100 #include "AliPHOSRawDigiProducer.h"
 101 #include "AliPHOSQAChecker.h"
 102 #include "AliPHOSRecoParam.h"
 103 #include "AliPHOSSimParam.h"
 104
 105 ClassImp(AliPHOS)
 106
 107 //____________________________________________________________________________
 108   AliPHOS:: AliPHOS() : AliDetector(),fgCalibData(0)
 109 {
 110   // Default ctor
 111   fName   = "PHOS" ;
 112
 113 }
 114
 115 //____________________________________________________________________________
 116 AliPHOS::AliPHOS(const char* name, const char* title): AliDetector(name, title),
 117 fgCalibData(0)
 118 {
 119   //   ctor : title is used to identify the layout
 120 }
 121
 122 //____________________________________________________________________________
 123 AliPHOS::~AliPHOS()
 124 {
 125   if(fgCalibData) delete fgCalibData ;
 126 }
 127
 128 //____________________________________________________________________________
 129 AliDigitizer* AliPHOS::CreateDigitizer(AliDigitizationInput* digInput) const
 130 {
 131   return new AliPHOSDigitizer(digInput);
 132 }
 133
 134 //____________________________________________________________________________
 135 void AliPHOS::CreateMaterials()
 136 {
 137   // Definitions of materials to build PHOS and associated tracking media.
 138   // media number in idtmed are 699 to 798.
 139
 140   // --- The PbWO4 crystals ---
 141   Float_t aX[3] = {207.19, 183.85, 16.0} ;
 142   Float_t zX[3] = {82.0, 74.0, 8.0} ;
 143   Float_t wX[3] = {1.0, 1.0, 4.0} ;
 144   Float_t dX = 8.28 ;
 145
 146   AliMixture(0, "PbWO4$", aX, zX, dX, -3, wX) ;
 147
 148
 149   // --- The polysterene scintillator (CH) ---
 150   Float_t aP[2] = {12.011, 1.00794} ;
 151   Float_t zP[2] = {6.0, 1.0} ;
 152   Float_t wP[2] = {1.0, 1.0} ;
 153   Float_t dP = 1.032 ;
 154
 155   AliMixture(1, "Polystyrene$", aP, zP, dP, -2, wP) ;
 156
 157   // --- Aluminium ---
 158   AliMaterial(2, "Al$", 26.98, 13., 2.7, 8.9, 999., 0, 0) ;
 159   // ---         Absorption length is ignored ^
 160
 161  // --- Tyvek (CnH2n) ---
 162   Float_t aT[2] = {12.011, 1.00794} ;
 163   Float_t zT[2] = {6.0, 1.0} ;
 164   Float_t wT[2] = {1.0, 2.0} ;
 165   Float_t dT = 0.331 ;
 166
 167   AliMixture(3, "Tyvek$", aT, zT, dT, -2, wT) ;
 168
 169   // --- Polystyrene foam ---
 170   Float_t aF[2] = {12.011, 1.00794} ;
 171   Float_t zF[2] = {6.0, 1.0} ;
 172   Float_t wF[2] = {1.0, 1.0} ;
 173   Float_t dF = 0.12 ;
 174
 175   AliMixture(4, "Foam$", aF, zF, dF, -2, wF) ;
 176
 177  // --- Titanium ---
 178   Float_t aTIT[3] = {47.88, 26.98, 54.94} ;
 179   Float_t zTIT[3] = {22.0, 13.0, 25.0} ;
 180   Float_t wTIT[3] = {69.0, 6.0, 1.0} ;
 181   Float_t dTIT = 4.5 ;
 182
 183   AliMixture(5, "Titanium$", aTIT, zTIT, dTIT, -3, wTIT);
 184
 185  // --- Silicon ---
 186   AliMaterial(6, "Si$", 28.0855, 14., 2.33, 9.36, 42.3, 0, 0) ;
 187
 188
 189
 190   // --- Foam thermo insulation ---
 191   Float_t aTI[2] = {12.011, 1.00794} ;
 192   Float_t zTI[2] = {6.0, 1.0} ;
 193   Float_t wTI[2] = {1.0, 1.0} ;
 194   Float_t dTI = 0.04 ;
 195
 196   AliMixture(7, "Thermo Insul.$", aTI, zTI, dTI, -2, wTI) ;
 197
 198   // --- Textolith ---
 199   Float_t aTX[4] = {16.0, 28.09, 12.011, 1.00794} ;
 200   Float_t zTX[4] = {8.0, 14.0, 6.0, 1.0} ;
 201   Float_t wTX[4] = {292.0, 68.0, 462.0, 736.0} ;
 202   Float_t dTX    = 1.75 ;
 203
 204   AliMixture(8, "Textolit$", aTX, zTX, dTX, -4, wTX) ;
 205
 206   //--- FR4  ---
 207   Float_t aFR[4] = {16.0, 28.09, 12.011, 1.00794} ;
 208   Float_t zFR[4] = {8.0, 14.0, 6.0, 1.0} ;
 209   Float_t wFR[4] = {292.0, 68.0, 462.0, 736.0} ;
 210   Float_t dFR = 1.8 ;
 211
 212   AliMixture(9, "FR4$", aFR, zFR, dFR, -4, wFR) ;
 213
 214   // --- The Composite Material for  micromegas (so far polyetylene) ---
 215   Float_t aCM[2] = {12.01, 1.} ;
 216   Float_t zCM[2] = {6., 1.} ;
 217   Float_t wCM[2] = {1., 2.} ;
 218   Float_t dCM = 0.935 ;
 219
 220   AliMixture(10, "Compo Mat$", aCM, zCM, dCM, -2, wCM) ;
 221
 222   // --- Copper ---
 223   AliMaterial(11, "Cu$", 63.546, 29, 8.96, 1.43, 14.8, 0, 0) ;
 224
 225   // --- G10 : Printed Circuit material ---
 226   Float_t aG10[4] = { 12., 1., 16., 28.} ;
 227   Float_t zG10[4] = { 6., 1., 8., 14.} ;
 228   Float_t wG10[4] = { .259, .288, .248, .205} ;
 229   Float_t dG10  = 1.7 ;
 230
 231
 232   AliMixture(12, "G10$", aG10, zG10, dG10, -4, wG10);
 233
 234   // --- Lead ---
 235   AliMaterial(13, "Pb$", 207.2, 82, 11.35, 0.56, 0., 0, 0) ;
 236
 237  // --- The gas mixture ---
 238  // Co2
 239   Float_t aCO[2] = {12.0, 16.0} ;
 240   Float_t zCO[2] = {6.0, 8.0} ;
 241   Float_t wCO[2] = {1.0, 2.0} ;
 242   Float_t dCO = 0.001977 ;
 243
 244   AliMixture(14, "CO2$", aCO, zCO, dCO, -2, wCO);
 245
 246  // Ar
 247   Float_t dAr = 0.001782 ;
 248   AliMaterial(15, "Ar$", 39.948, 18.0, dAr, 14.0, 0., 0, 0) ;
 249
 250   // Ar+CO2 Mixture (80% / 20%)
 251   Float_t arContent = 0.80 ;  // Ar-content of the ArCO2-mixture
 252   Float_t aArCO[3]  = {39.948, 12.0, 16.0} ;
 253   Float_t zArCO[3]  = {18.0  ,  6.0,  8.0} ;
 254   Float_t wArCO[3];
 255   wArCO[0] = arContent;
 256   wArCO[1] = (1-arContent)*1;
 257   wArCO[2] = (1-arContent)*2;
 258   Float_t dArCO = arContent*dAr + (1-arContent)*dCO ;
 259   AliMixture(16, "ArCO2$", aArCO, zArCO, dArCO,  -3, wArCO) ;
 260
 261
 262   // --- Stainless steel (let it be pure iron) ---
 263   AliMaterial(17, "Steel$", 55.845, 26, 7.87, 1.76, 0., 0, 0) ;
 264
 265
 266   // --- Fiberglass ---
 267   Float_t aFG[4] = {16.0, 28.09, 12.011, 1.00794} ;
 268   Float_t zFG[4] = {8.0, 14.0, 6.0, 1.0} ;
 269   Float_t wFG[4] = {292.0, 68.0, 462.0, 736.0} ;
 270   Float_t dFG    = 1.9 ;
 271
 272   AliMixture(18, "Fibergla$", aFG, zFG, dFG, -4, wFG) ;
 273
 274   // --- Cables in Air box  ---
 275   // SERVICES
 276
 277   Float_t aCA[4] = { 1.,12.,55.8,63.5 };
 278   Float_t zCA[4] = { 1.,6.,26.,29. };
 279   Float_t wCA[4] = { .014,.086,.42,.48 };
 280   Float_t dCA    = 0.8 ;  //this density is raw estimation, if you know better - correct
 281
 282   AliMixture(19, "Cables  $", aCA, zCA, dCA, -4, wCA) ;
 283
 284
 285   // --- Air ---
 286   Float_t aAir[4]={12.0107,14.0067,15.9994,39.948};
 287   Float_t zAir[4]={6.,7.,8.,18.};
 288   Float_t wAir[4]={0.000124,0.755267,0.231781,0.012827};
 289   Float_t dAir = 1.20479E-3;
 290
 291   AliMixture(99, "Air$", aAir, zAir, dAir, 4, wAir) ;
 292
 293   // DEFINITION OF THE TRACKING MEDIA
 294
 295   // for PHOS: idtmed[699->798] equivalent to fIdtmed[0->100]
 296   Int_t   isxfld = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Integ() ;
 297   Float_t sxmgmx = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Max() ;
 298
 299   // The scintillator of the calorimeter made of PBW04                              -> idtmed[699]
 300   AliMedium(0, "PHOS Xtal    $", 0, 1,
 301             isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 302
 303   // The scintillator of the CPV made of Polystyrene scintillator                   -> idtmed[700]
 304   AliMedium(1, "CPV scint.   $", 1, 1,
 305             isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 306
 307   // Various Aluminium parts made of Al                                             -> idtmed[701]
 308   AliMedium(2, "Al parts     $", 2, 0,
 309              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
 310
 311   // The Tywek which wraps the calorimeter crystals                                 -> idtmed[702]
 312   AliMedium(3, "Tyvek wrapper$", 3, 0,
 313              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
 314
 315   // The Polystyrene foam around the calorimeter module                             -> idtmed[703]
 316   AliMedium(4, "Polyst. foam $", 4, 0,
 317              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 318
 319   // The Titanium around the calorimeter crystal                                    -> idtmed[704]
 320   AliMedium(5, "Titan. cover $", 5, 0,
 321              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.0001, 0.0001, 0, 0) ;
 322
 323   // The Silicon of the pin diode to read out the calorimeter crystal               -> idtmed[705]
 324  AliMedium(6, "Si PIN       $", 6, 0,
 325              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.01, 0.01, 0, 0) ;
 326
 327  // The thermo insulating material of the box which contains the calorimeter module -> idtmed[706]
 328   AliMedium(7, "Thermo Insul.$", 7, 0,
 329              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 330
 331   // The Textolit which makes up the box which contains the calorimeter module      -> idtmed[707]
 332   AliMedium(8, "Textolit     $", 8, 0,
 333              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 334
 335   // FR4: The Plastic which makes up the frame of micromegas                        -> idtmed[708]
 336   AliMedium(9, "FR4 $", 9, 0,
 337              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.0001, 0, 0) ;
 338
 339
 340   // The Composite Material for  micromegas                                         -> idtmed[709]
 341   AliMedium(10, "CompoMat   $", 10, 0,
 342              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 343
 344   // Copper                                                                         -> idtmed[710]
 345   AliMedium(11, "Copper     $", 11, 0,
 346              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.0001, 0, 0) ;
 347
 348   // G10: Printed Circuit material                                                  -> idtmed[711]
 349
 350   AliMedium(12, "G10        $", 12, 0,
 351              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.01, 0, 0) ;
 352
 353   // The Lead                                                                       -> idtmed[712]
 354
 355   AliMedium(13, "Lead      $", 13, 0,
 356              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 357
 358   // The gas mixture: ArCo2                                                         -> idtmed[715]
 359
 360   AliMedium(16, "ArCo2      $", 16, 1,
 361              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.01, 0, 0) ;
 362
 363   // Stainless steel                                                                -> idtmed[716]
 364   AliMedium(17, "Steel     $", 17, 0,
 365              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.0001, 0, 0) ;
 366
 367   // Fibergalss                                                                     -> idtmed[717]
 368   AliMedium(18, "Fiberglass$", 18, 0,
 369              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 370
 371   // Cables in air                                                                  -> idtmed[718]
 372   AliMedium(19, "Cables    $", 19, 0,
 373              isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 374
 375   // Air                                                                            -> idtmed[798]
 376   AliMedium(99, "Air          $", 99, 0,
 377              isxfld, sxmgmx, 10.0, 1.0, 0.1, 0.1, 10.0, 0, 0) ;
 378 }
 379
 380 //_____________________________________________________________________________
 381 void AliPHOS::Init()
 382 {
 383 }
 384
 385 //____________________________________________________________________________
 386 void AliPHOS::Digits2Raw()
 387 {
 388 // convert digits of the current event to raw data
 389
 390   if(AliPHOSSimParam::GetInstance()->IsEDigitizationOn()){
 391     AliError("Energy digitization should be OFF if use Digits2Raw") ;
 392   }
 393
 394   AliPHOSLoader * loader = static_cast<AliPHOSLoader*>(fLoader) ;
 395
 396   // get the digits
 397   loader->LoadDigits();
 398   TClonesArray* digits = loader->Digits() ;
 399
 400   if (!digits) {
 401     AliError(Form("No digits found !"));
 402     return;
 403   }
 404
 405   // get the geometry
 406   AliPHOSGeometry* geom = GetGeometry();
 407   if (!geom) {
 408     AliError(Form("No geometry found !"));
 409     return;
 410   }
 411
 412   // get mapping from OCDB
 413   const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParam::GetMappings();
 414   if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
 415
 416   // some digitization constants
 417   const Float_t    kThreshold = 1.; // skip digits below 1 ADC channel
 418   const Int_t      kAdcThreshold = 1;  // Lower ADC threshold to write to raw data
 419
 420   Int_t prevDDL = -1;
 421
 422   if(fgCalibData==0)
 423     fgCalibData= new AliPHOSCalibData(-1) ;
 424
 425   // Create a shaper pulse object
 426   AliPHOSPulseGenerator *pulse = new AliPHOSPulseGenerator();
 427
 428   //Set Time step of sample
 429   pulse->SetTimeStep(TMath::Abs(fgCalibData->GetSampleTimeStep())) ;
 430
 431   Int_t *adcValuesLow = new Int_t[pulse->GetRawFormatTimeBins()];
 432   Int_t *adcValuesHigh= new Int_t[pulse->GetRawFormatTimeBins()];
 433
 434   const Int_t maxDDL = 20;
 435   AliAltroBuffer  *buffer[maxDDL];
 436   AliAltroMapping *mapping[maxDDL];
 437
 438   for(Int_t jDDL=0; jDDL<maxDDL; jDDL++) {
 439     buffer[jDDL]=0;
 440     mapping[jDDL]=0;
 441   }
 442
 443   //!!!!for debug!!!
 444   Int_t modMax=-111;
 445   Int_t colMax=-111;
 446   Int_t rowMax=-111;
 447   Float_t eMax=-333;
 448   //!!!for debug!!!
 449
 450   // loop over digits (assume ordered digits)
 451   for (Int_t iDigit = 0; iDigit < digits->GetEntries(); iDigit++) {
 452     AliPHOSDigit* digit = static_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(iDigit)) ;
 453
 454     // Skip small energy below treshold
 455     if (digit->GetEnergy() < kThreshold)
 456       continue;
 457
 458     Int_t relId[4];
 459     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relId);
 460     Int_t module = 5-relId[0];
 461
 462     // Begin FIXME
 463     if (relId[1] != 0)
 464       continue;    // ignore digits from CPV
 465     // End FIXME
 466
 467     Int_t row = relId[2]-1;
 468     Int_t col = relId[3]-1;
 469
 470     Int_t iRCU = -111;
 471
 472     //RCU0
 473     if(0<=row&&row<16 && 0<=col&&col<56) iRCU=0;
 474
 475     //RCU1
 476     if(16<=row&&row<32 && 0<=col&&col<56) iRCU=1;
 477
 478     //RCU2
 479     if(32<=row&&row<48 && 0<=col&&col<56) iRCU=2;
 480
 481     //RCU3
 482     if(48<=row&&row<64 && 0<=col&&col<56) iRCU=3;
 483
 484
 485     // PHOS EMCA has 4 DDL per module. Splitting is based on the (row,column) numbers.
 486     // here module already in PHOS online convention: 0<module<4 and inverse order.
 487     Int_t iDDL = 4 * module  + iRCU;
 488
 489     // new DDL
 490     if (iDDL != prevDDL) {
 491       if (buffer[iDDL] == 0) {
 492         // open new file and write dummy header
 493         TString fileName = AliDAQ::DdlFileName("PHOS",iDDL);
 494
 495         mapping[iDDL] = (AliAltroMapping*)maps->At(iDDL);
 496         buffer[iDDL]  = new AliAltroBuffer(fileName.Data(),mapping[iDDL]);
 497         buffer[iDDL]->WriteDataHeader(kTRUE, kFALSE);  //Dummy;
 498       }
 499       prevDDL = iDDL;
 500     }
 501
 502     AliDebug(2,Form("digit E=%.4f GeV, t=%g s, (mod,col,row)=(%d,%d,%d)\n",
 503                     digit->GetEnergy(),digit->GetTimeR(),
 504                     relId[0]-1,relId[3]-1,relId[2]-1));
 505     // if a signal is out of time range, write only trailer
 506     if (digit->GetTimeR() > pulse->GetRawFormatTimeMax()*0.5 ) {
 507       AliDebug(2,"Signal is out of time range.\n");
 508       buffer[iDDL]->FillBuffer(0);
 509       buffer[iDDL]->FillBuffer(pulse->GetRawFormatTimeBins() );  // time bin
 510       buffer[iDDL]->FillBuffer(3);                               // bunch length
 511       buffer[iDDL]->WriteTrailer(3, relId[3]-1, relId[2]-1, 0);  // trailer
 512
 513     // calculate the time response function
 514     } else {
 515       Double_t energy = 0 ;
 516       if (digit->GetId() <= geom->GetNModules() * geom->GetNCristalsInModule()) {
 517         energy=digit->GetEnergy();
 518         if(energy>eMax) {eMax=energy; modMax=relId[0]; colMax=col; rowMax=row;}
 519       }
 520       else {
 521         energy = 0; // CPV raw data format is now know yet
 522       }
 523       pulse->SetAmplitude(energy);
 524       pulse->SetTZero(digit->GetTimeR());
 525       Double_t r =fgCalibData->GetHighLowRatioEmc(relId[0],relId[3],relId[2]) ;
 526       pulse->SetHG2LGRatio(r) ;
 527       pulse->MakeSamples();
 528       pulse->GetSamples(adcValuesHigh, adcValuesLow) ;
 529
 530       buffer[iDDL]->WriteChannel(relId[3]-1, relId[2]-1, 0,
 531                            pulse->GetRawFormatTimeBins(), adcValuesLow , kAdcThreshold);
 532       buffer[iDDL]->WriteChannel(relId[3]-1, relId[2]-1, 1,
 533                            pulse->GetRawFormatTimeBins(), adcValuesHigh, kAdcThreshold);
 534     }
 535   }
 536   delete [] adcValuesLow;
 537   delete [] adcValuesHigh;
 538
 539   // write real header and close last file
 540   for (Int_t iDDL=0; iDDL<maxDDL; iDDL++) {
 541     if (buffer[iDDL]) {
 542       buffer[iDDL]->Flush();
 543       buffer[iDDL]->WriteDataHeader(kFALSE, kFALSE);
 544       delete buffer[iDDL];
 545       //if (mapping[iDDL]) delete mapping[iDDL];
 546     }
 547   }
 548
 549   AliDebug(1,Form("Digit with max. energy:  modMax %d colMax %d rowMax %d  eMax %f\n",
 550          modMax,colMax,rowMax,eMax));
 551
 552   delete pulse;
 553   loader->UnloadDigits();
 554 }
 555
 556 //____________________________________________________________________________
 557 void AliPHOS::Hits2SDigits()
 558 {
 559 // create summable digits
 560
 561   AliPHOSSDigitizer phosDigitizer(fLoader->GetRunLoader()->GetFileName().Data()) ;
 562   phosDigitizer.SetEventRange(0, -1) ; // do all the events
 563
 564   phosDigitizer.Digitize("all") ;
 565 }
 566
 567
 568 //____________________________________________________________________________
 569 AliLoader* AliPHOS::MakeLoader(const char* topfoldername)
 570 {
 571 //different behaviour than standard (singleton getter)
 572 // --> to be discussed and made eventually coherent
 573  fLoader = new AliPHOSLoader(GetName(),topfoldername);
 574  return fLoader;
 575 }
 576
 577 //____________________________________________________________________________
 578 void AliPHOS::SetTreeAddress()
 579 {
 580   // Links Hits in the Tree to Hits array
 581   TBranch *branch;
 582   char branchname[20];
 583   snprintf(branchname,20,"%s",GetName());
 584   // Branch address for hit tree
 585     TTree *treeH = fLoader->TreeH();
 586   if (treeH) {
 587     branch = treeH->GetBranch(branchname);
 588     if (branch)
 589      {
 590        if (fHits == 0x0) fHits= new TClonesArray("AliPHOSHit",1000);
 591        //AliInfo(Form("<%s> Setting Hits Address",GetName()));
 592        branch->SetAddress(&fHits);
 593      }
 594   }
 595 }
 596
 597 //____________________________________________________________________________
 598 Bool_t AliPHOS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
 599 {
 600
 601   AliPHOSLoader * loader = static_cast<AliPHOSLoader*>(fLoader) ;
 602
 603   TTree * tree = 0 ;
 604   tree = loader->TreeS() ;
 605   if ( !tree ) {
 606     loader->MakeTree("S");
 607     tree = loader->TreeS() ;
 608   }
 609
 610   TClonesArray * sdigits = loader->SDigits() ;
 611   if(!sdigits) {
 612     loader->MakeSDigitsArray();
 613     sdigits = loader->SDigits();
 614   }
 615   sdigits->Clear();
 616
 617   rawReader->Reset() ;
 618
 619   const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParam::GetMappings();
 620   if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
 621
 622   AliAltroMapping *mapping[20];
 623   for(Int_t i = 0; i < 20; i++) {
 624     mapping[i] = (AliAltroMapping*)maps->At(i);
 625   }
 626
 627   AliPHOSRawFitterv0 fitter;
 628
 629   fitter.SubtractPedestals(AliPHOSSimParam::GetInstance()->EMCSubtractPedestals());
 630   fitter.SetAmpOffset(AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetGlobalAltroOffset());
 631   fitter.SetAmpThreshold(AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetGlobalAltroThreshold());
 632
 633   AliPHOSRawDigiProducer pr(rawReader,mapping);
 634   pr.SetSampleQualityCut(AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetEMCSampleQualityCut());
 635   pr.MakeDigits(sdigits,&fitter);
 636
 637   Int_t bufferSize = 32000 ;
 638   // TBranch * sdigitsBranch = tree->Branch("PHOS",&sdigits,bufferSize);
 639   tree->Branch("PHOS",&sdigits,bufferSize);
 640   tree->Fill();
 641
 642   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 643   return kTRUE;
 644
 645 }