fd39e19d69636cfa176dbf2ff90943ca8370450f
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSAnalyze.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 //_________________________________________________________________________
19 // Algorythm class to analyze PHOSv1 events:
20 // Construct histograms and displays them.
21 // Use the macro EditorBar.C for best access to the functionnalities
22 //*--
23 //*-- Author: Y. Schutz (SUBATECH) & Gines Martinez (SUBATECH)
24 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
25
26 // --- ROOT system ---
27
28 #include "TFile.h"
29 #include "TH1.h"
30 #include "TPad.h"
31 #include "TH2.h"
32 #include "TParticle.h"
33 #include "TClonesArray.h"
34 #include "TTree.h"
35 #include "TMath.h"
36 #include "TCanvas.h" 
37 #include "TStyle.h" 
38
39 // --- Standard library ---
40
41 #include <iostream.h>
42 #include <stdio.h>
43
44 // --- AliRoot header files ---
45
46 #include "AliRun.h"
47 #include "AliPHOSAnalyze.h"
48 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
49 #include "AliPHOSTrackSegmentMakerv1.h"
50 #include "AliPHOSPIDv1.h"
51 #include "AliPHOSReconstructioner.h"
52 #include "AliPHOSDigit.h"
53 #include "AliPHOSTrackSegment.h"
54 #include "AliPHOSRecParticle.h"
55 #include "AliPHOSIndexToObject.h"
56 #include "AliPHOSHit.h"
57 #include "AliPHOSCPVHit.h"
58 #include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
59
60 ClassImp(AliPHOSAnalyze)
61
62 //____________________________________________________________________________
63   AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze()
64 {
65   // default ctor (useless)
66   
67   fRootFile = 0 ; 
68 }
69
70 //____________________________________________________________________________
71 AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze(Text_t * name)
72 {
73   // ctor: analyze events from root file "name"
74   
75   Bool_t ok = OpenRootFile(name)  ; 
76   if ( !ok ) {
77     cout << " AliPHOSAnalyze > Error opening " << name << endl ; 
78   }
79   else { 
80       //========== Get AliRun object from file 
81       gAlice = (AliRun*) fRootFile->Get("gAlice") ;
82
83       //=========== Get the PHOS object and associated geometry from the file      
84       fPHOS  = (AliPHOSv1 *)gAlice->GetDetector("PHOS") ;
85       fGeom  = AliPHOSGeometry::GetInstance( fPHOS->GetGeometry()->GetName(), fPHOS->GetGeometry()->GetTitle() );
86  
87       //========== Initializes the Index to Object converter
88       fObjGetter = AliPHOSIndexToObject::GetInstance(fPHOS) ; 
89       //========== Current event number 
90       fEvt = -999 ; 
91
92   }
93   fDebugLevel = 0;
94   fClu = 0 ;
95   fPID = 0 ;
96   fTrs = 0 ;
97   fRec = 0 ;
98   ResetHistograms() ;
99 }
100
101 //____________________________________________________________________________
102 AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze(const AliPHOSAnalyze & ana)
103 {
104   // copy ctor
105   ( (AliPHOSAnalyze &)ana ).Copy(*this) ;
106 }
107
108 //____________________________________________________________________________
109 void AliPHOSAnalyze::Copy(TObject & obj)
110 {
111   // copy an analysis into an other one
112   TObject::Copy(obj) ;
113   // I do nothing more because the copy is silly but the Code checkers requires one
114 }
115
116 //____________________________________________________________________________
117 AliPHOSAnalyze::~AliPHOSAnalyze()
118 {
119   // dtor
120
121   if(fRootFile->IsOpen()) fRootFile->Close() ; 
122   if(fRootFile)   {delete fRootFile ; fRootFile=0 ;}
123   if(fPHOS)       {delete fPHOS     ; fPHOS    =0 ;}
124   if(fClu)        {delete fClu      ; fClu     =0 ;}
125   if(fPID)        {delete fPID      ; fPID     =0 ;}
126   if(fRec)        {delete fRec      ; fRec     =0 ;}
127   if(fTrs)        {delete fTrs      ; fTrs     =0 ;}
128
129 }
130 //____________________________________________________________________________
131 void AliPHOSAnalyze::DrawRecon(Int_t Nevent,Int_t Nmod){
132   //Draws pimary particles and reconstructed 
133   //digits, RecPoints, RecPartices etc 
134   //for event Nevent in the module Nmod.
135
136   TH2F * digitOccupancy  = new TH2F("digitOccupancy","EMC digits", 64,-71.,71.,64,-71.,71.);
137   TH2F * emcOccupancy    = new TH2F("emcOccupancy","EMC RecPoints",64,-71.,71.,64,-71.,71.);
138   TH2F * ppsdUp          = new TH2F("ppsdUp","PPSD Up digits",     128,-71.,71.,128,-71.,71.) ;
139   TH2F * ppsdUpCl        = new TH2F("ppsdUpCl","PPSD Up RecPoints",128,-71.,71.,128,-71.,71.) ;
140   TH2F * ppsdLow         = new TH2F("ppsdLow","PPSD Low digits",     128,-71.,71.,128,-71.,71.) ;
141   TH2F * ppsdLowCl       = new TH2F("ppsdLowCl","PPSD Low RecPoints",128,-71.,71.,128,-71.,71.) ;
142   TH2F * nbar            = new TH2F("nbar","Primary nbar",    64,-71.,71.,64,-71.,71.);
143   TH2F * phot            = new TH2F("phot","Primary Photon",  64,-71.,71.,64,-71.,71.);
144   TH2F * charg           = new TH2F("charg","Primary charged",64,-71.,71.,64,-71.,71.);
145   TH2F * recPhot         = new TH2F("recPhot","RecParticles with primary Photon",64,-71.,71.,64,-71.,71.);
146   TH2F * recNbar         = new TH2F("recNbar","RecParticles with primary Nbar",  64,-71.,71.,64,-71.,71.);
147
148   //========== Create the Clusterizer
149   fClu = new AliPHOSClusterizerv1() ; 
150
151   fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.05) ;
152   fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ;
153   fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ;
154   fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ;
155   fClu->SetLocalMaxCut(0.03) ;
156   fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ;
157   
158   gAlice->GetEvent(Nevent);
159   
160   TClonesArray * primaryList  = gAlice->Particles();
161   
162   TParticle * primary ;
163   Int_t iPrimary ;
164   for ( iPrimary = 0 ; iPrimary < primaryList->GetEntries() ; iPrimary++)
165     {
166       primary = (TParticle*)primaryList->At(iPrimary) ;
167       Int_t primaryType = primary->GetPdgCode() ;
168       if( (primaryType == 211)||(primaryType == -211)||(primaryType == 2212)||(primaryType == -2212) ) {
169         Int_t moduleNumber ;
170         Double_t primX, primZ ;
171         fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
172         if(moduleNumber==Nmod)
173           charg->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
174       }
175       if( primaryType == 22 ) {
176         Int_t moduleNumber ;
177         Double_t primX, primZ ;
178         fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
179         if(moduleNumber==Nmod)
180           phot->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
181       }
182       else{
183         if( primaryType == -2112 ) {
184           Int_t moduleNumber ;
185           Double_t primX, primZ ;
186           fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
187           if(moduleNumber==Nmod)
188             nbar->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
189         }
190       }
191     }  
192
193   fPHOS->SetTreeAddress() ;
194
195   gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
196   gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
197   
198   TObjArray ** emcRecPoints =  fPHOS->EmcRecPoints() ;
199   TObjArray ** ppsdRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
200   TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
201   
202   Int_t iDigit ;
203   AliPHOSDigit * digit ;
204   
205   for(iDigit = 0; iDigit < fPHOS->Digits()->GetEntries(); iDigit++)
206     {
207       digit = (AliPHOSDigit *) fPHOS->Digits()->At(iDigit) ;
208       Int_t relid[4];
209       fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
210       Float_t x,z ;
211       fGeom->RelPosInModule(relid,x,z) ;
212       Float_t e = fClu->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
213       if(relid[0]==Nmod){
214         if(relid[1]==0)  //EMC
215           digitOccupancy->Fill(x,z,e) ;
216         if((relid[1]>0)&&(relid[1]<17))
217           ppsdUp->Fill(x,z,e) ;
218         if(relid[1]>16)
219           ppsdLow->Fill(x,z,e) ;
220       }
221     }
222   
223   Int_t irecp ;
224   TVector3 pos ;
225   
226   for(irecp = 0; irecp < (*emcRecPoints)->GetEntries() ; irecp ++){
227     AliPHOSEmcRecPoint * emc= (AliPHOSEmcRecPoint*)(*emcRecPoints)->At(irecp) ;
228     if(emc->GetPHOSMod()==Nmod){
229       emc->GetLocalPosition(pos) ;
230       emcOccupancy->Fill(pos.X(),pos.Z(),emc->GetEnergy());
231     }
232   }
233   
234   for(irecp = 0; irecp < (*ppsdRecPoints)->GetEntries() ; irecp ++){
235     AliPHOSPpsdRecPoint * ppsd= (AliPHOSPpsdRecPoint *)(*ppsdRecPoints)->At(irecp) ;
236     if(ppsd->GetPHOSMod()==Nmod){
237       ppsd->GetLocalPosition(pos) ;
238       if(ppsd->GetUp())
239         ppsdUpCl->Fill(pos.X(),pos.Z(),ppsd->GetEnergy());
240       else
241         ppsdLowCl->Fill(pos.X(),pos.Z(),ppsd->GetEnergy());
242     }
243   }
244   
245   AliPHOSRecParticle * recParticle ;
246   Int_t iRecParticle ;
247   for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*recParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
248     {
249       recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(iRecParticle) ;
250       
251       Int_t moduleNumberRec ;
252       Double_t recX, recZ ;
253       fGeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
254       if(moduleNumberRec == Nmod){
255         
256         Double_t minDistance = 5. ;
257         Int_t closestPrimary = -1 ;
258         
259         Int_t numberofprimaries ;
260         Int_t * listofprimaries  = recParticle->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
261         Int_t index ;
262         TParticle * primary ;
263         Double_t distance = minDistance ;
264           
265         for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
266           primary = (TParticle*)primaryList->At(listofprimaries[index]) ;
267           Int_t moduleNumber ;
268           Double_t primX, primZ ;
269           fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
270           if(moduleNumberRec == moduleNumber)
271             distance = TMath::Sqrt((recX-primX)*(recX-primX)+(recZ-primZ)*(recZ-primZ) ) ;
272           if(minDistance > distance)
273             {
274               minDistance = distance ;
275               closestPrimary = listofprimaries[index] ;
276             }
277         }
278         
279         if(closestPrimary >=0 ){
280           
281           Int_t primaryType = ((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->GetPdgCode() ;
282           
283           if(primaryType==22)
284             recPhot->Fill(recZ,recX,recParticle->Energy()) ;
285           else
286             if(primaryType==-2112)
287               recNbar->Fill(recZ,recX,recParticle->Energy()) ; 
288         }
289       }
290     }
291   
292   
293   digitOccupancy->Draw("box") ;
294   emcOccupancy->SetLineColor(2) ;
295   emcOccupancy->Draw("boxsame") ;
296   ppsdUp->SetLineColor(3) ;
297   ppsdUp->Draw("boxsame") ;
298   ppsdLow->SetLineColor(4) ;
299   ppsdLow->Draw("boxsame") ;
300   phot->SetLineColor(8) ;
301   phot->Draw("boxsame") ;
302   nbar->SetLineColor(6) ;
303   nbar->Draw("boxsame") ;
304   
305 }
306 //____________________________________________________________________________
307  void AliPHOSAnalyze::Reconstruct(Int_t nevents,Int_t firstEvent )    
308 {     
309
310   // Performs reconstruction of EMC and CPV (GPS2, IHEP or MIXT)
311   // for events from FirstEvent to Nevents
312
313   Int_t ievent ;   
314   for ( ievent=firstEvent; ievent<nevents; ievent++) {  
315     if (ievent==firstEvent) {
316       cout << "Analyze > Starting Reconstructing " << endl ; 
317       //========== Create the Clusterizer
318       fClu = new AliPHOSClusterizerv1() ; 
319       fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.05) ; 
320       fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ; 
321       fClu->SetLocalMaxCut(0.03) ;
322       if      (strcmp(fGeom->GetName(),"GPS2") == 0 || strcmp(fGeom->GetName(),"MIXT") == 0) {
323         fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ; 
324         fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ; 
325       }
326       else if (strcmp(fGeom->GetName(),"IHEP") == 0 || strcmp(fGeom->GetName(),"MIXT") == 0) {
327         fClu->SetLocalMaxCutCPV(0.03) ;
328         fClu->SetLogWeightCutCPV(4.0) ;
329         fClu->SetCpvEnergyThreshold(0.09) ;
330       }
331       fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ; 
332       
333       //========== Creates the track segment maker
334       fTrs = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1()  ;
335           //      fTrs->UnsetUnfoldFlag() ; 
336      
337       //========== Creates the particle identifier for GPS2 only
338       if      (strcmp(fGeom->GetName(),"GPS2") == 0 || strcmp(fGeom->GetName(),"MIXT") == 0) {
339         fPID = new AliPHOSPIDv1() ;
340         fPID->SetShowerProfileCuts(0.3, 1.8, 0.3, 1.8 ) ; 
341       }   
342       
343       //========== Creates the Reconstructioner
344       fRec = new AliPHOSReconstructioner(fClu, fTrs, fPID) ; 
345       if (fDebugLevel != 0) fRec -> SetDebugReconstruction(kTRUE);     
346     }
347       
348     if (fDebugLevel != 0 ||
349         (ievent+1) % (Int_t)TMath::Power( 10, (Int_t)TMath::Log10(ievent+1) ) == 0)
350       cout <<  "======= Analyze ======> Event " << ievent+1 << endl ;
351     
352     //=========== Connects the various Tree's for evt
353     Int_t tracks = gAlice->GetEvent(ievent);
354
355     fPHOS->Hit2Digit(tracks) ;
356         
357     //=========== Do the reconstruction
358     fPHOS->Reconstruction(fRec);    
359
360   }
361   
362   if(fClu)      {delete fClu      ; fClu     =0 ;}
363   if(fPID)      {delete fPID      ; fPID     =0 ;}
364   if(fRec)      {delete fRec      ; fRec     =0 ;}
365   if(fTrs)      {delete fTrs      ; fTrs     =0 ;}
366   
367 }
368
369 //-------------------------------------------------------------------------------------
370 void AliPHOSAnalyze::ReadAndPrintCPV(Int_t EvFirst, Int_t EvLast)
371 {
372   //
373   // Read and print generated and reconstructed hits in CPV
374   // for events from EvFirst to Nevent.
375   // If only EvFirst is defined, print only this one event.
376   // Author: Yuri Kharlov
377   // 12 October 2000
378   //
379
380   if (EvFirst!=0 && EvLast==0) EvLast=EvFirst;
381   for ( Int_t ievent=EvFirst; ievent<=EvLast; ievent++) {  
382     
383     //========== Event Number>
384     cout << endl <<  "==== ReadAndPrintCPV ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
385     
386     //=========== Connects the various Tree's for evt
387     Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
388
389     //========== Creating branches ===================================
390     AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** emcRecPoints = fPHOS->EmcRecPoints() ;
391     gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP" , emcRecPoints  ) ;
392     
393     AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** cpvRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
394     gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", cpvRecPoints ) ;
395
396     // Read and print CPV hits
397       
398     AliPHOSCPVModule cpvModule;
399     TClonesArray    *cpvHits;
400     Int_t           nCPVhits;
401     AliPHOSCPVHit   *cpvHit;
402     TLorentzVector   p;
403     Float_t          xgen, zgen;
404     Int_t            ipart;
405     Int_t            nGenHits = 0;
406     for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
407       //=========== Get the Hits Tree for the Primary track itrack
408       gAlice->ResetHits();
409       gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
410       Int_t iModule = 0 ;       
411       for (iModule=0; iModule < fGeom->GetNModules(); iModule++) {
412         cpvModule = fPHOS->GetCPVModule(iModule);
413         cpvHits   = cpvModule.Hits();
414         nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
415         for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
416           nGenHits++;
417           cpvHit = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
418           p      = cpvHit->GetMomentum();
419           xgen   = cpvHit->X();
420           zgen   = cpvHit->Y();
421           ipart  = cpvHit->GetIpart();
422           printf("CPV hit in module %d: ",iModule+1);
423           printf(" p = (%f, %f, %f, %f) GeV,\n",
424                  p.Px(),p.Py(),p.Pz(),p.Energy());
425           printf("                  (X,Z) = (%8.4f, %8.4f) cm, ipart = %d\n",
426                  xgen,zgen,ipart);
427         }
428       }
429     }
430
431     // Read and print CPV reconstructed points
432
433     //=========== Gets the Reconstruction TTree
434     gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
435     TIter nextRP(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
436     AliPHOSPpsdRecPoint *cpvRecPoint ;
437     Int_t nRecPoints = 0;
438     while( ( cpvRecPoint = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextRP() ) ) {
439       nRecPoints++;
440       TVector3  locpos;
441       cpvRecPoint->GetLocalPosition(locpos);
442       Int_t phosModule = cpvRecPoint->GetPHOSMod();
443       printf("CPV recpoint in module %d: (X,Z) = (%f,%f) cm\n",
444              phosModule,locpos.X(),locpos.Z());
445     }
446     printf("This event has %d generated hits and %d reconstructed points\n",
447            nGenHits,nRecPoints);
448   }
449 }
450
451 //____________________________________________________________________________
452 void AliPHOSAnalyze::AnalyzeCPV(Int_t Nevents)
453 {
454   //
455   // Analyzes CPV characteristics
456   // Author: Yuri Kharlov
457   // 9 October 2000
458   //
459
460   // Book histograms
461
462   TH1F *hDx   = new TH1F("hDx"  ,"CPV x-resolution@reconstruction",100,-5. , 5.);
463   TH1F *hDz   = new TH1F("hDz"  ,"CPV z-resolution@reconstruction",100,-5. , 5.);
464   TH1F *hDr   = new TH1F("hDr"  ,"CPV r-resolution@reconstruction",100, 0. , 5.);
465   TH1S *hNrp  = new TH1S("hNrp" ,"CPV rec.point multiplicity",      21,-0.5,20.5);
466   TH1S *hNrpX = new TH1S("hNrpX","CPV rec.point Phi-length"  ,      21,-0.5,20.5);
467   TH1S *hNrpZ = new TH1S("hNrpZ","CPV rec.point Z-length"    ,      21,-0.5,20.5);
468
469   cout << "Start CPV Analysis"<< endl ;
470   for ( Int_t ievent=0; ievent<Nevents; ievent++) {  
471       
472     //========== Event Number>         
473 //      if ( (ievent+1) % (Int_t)TMath::Power( 10, (Int_t)TMath::Log10(ievent+1) ) == 0)
474       cout << endl <<  "==== AnalyzeCPV ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
475     
476     //=========== Connects the various Tree's for evt
477     Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
478     
479     //========== Creating branches ===================================
480     AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** emcRecPoints = fPHOS->EmcRecPoints() ;
481     gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP" , emcRecPoints  ) ;
482     
483     AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** cpvRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
484     gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", cpvRecPoints ) ;
485
486     // Create and fill arrays of hits for each CPV module
487       
488     Int_t nOfModules = fGeom->GetNModules();
489     TClonesArray **hitsPerModule = new TClonesArray *[nOfModules];
490     Int_t iModule = 0;  
491     for (iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++)
492       hitsPerModule[iModule] = new TClonesArray("AliPHOSCPVHit",100);
493
494     AliPHOSCPVModule cpvModule;
495     TClonesArray    *cpvHits;
496     Int_t           nCPVhits;
497     AliPHOSCPVHit   *cpvHit;
498     TLorentzVector   p;
499     Float_t          xzgen[2];
500     Int_t            ipart;
501
502     // First go through all primary tracks and fill the arrays
503     // of hits per each CPV module
504
505     for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
506       // Get the Hits Tree for the Primary track itrack
507       gAlice->ResetHits();
508       gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
509       for (Int_t iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++) {
510         cpvModule = fPHOS->GetCPVModule(iModule);
511         cpvHits   = cpvModule.Hits();
512         nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
513         for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
514           cpvHit   = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
515           p        = cpvHit->GetMomentum();
516           xzgen[0] = cpvHit->X();
517           xzgen[1] = cpvHit->Y();
518           ipart    = cpvHit->GetIpart();
519           TClonesArray &lhits = *(TClonesArray *)hitsPerModule[iModule];
520           new(lhits[hitsPerModule[iModule]->GetEntriesFast()]) AliPHOSCPVHit(*cpvHit);
521         }
522         cpvModule.Clear();
523       }
524     }
525     for (iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++) {
526       Int_t nsum = hitsPerModule[iModule]->GetEntriesFast();
527       printf("Module %d has %d hits\n",iModule,nsum);
528     }
529
530     // Then go through reconstructed points and for each find
531     // the closeset hit
532     // The distance from the rec.point to the closest hit
533     // gives the coordinate resolution of the CPV
534
535     // Get the Reconstruction Tree
536     gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
537     TIter nextRP(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
538     AliPHOSCpvRecPoint *cpvRecPoint ;
539     Float_t xgen, zgen;
540     while( ( cpvRecPoint = (AliPHOSCpvRecPoint *)nextRP() ) ) {
541       TVector3  locpos;
542       cpvRecPoint->GetLocalPosition(locpos);
543       Int_t phosModule = cpvRecPoint->GetPHOSMod();
544       Int_t rpMult     = cpvRecPoint->GetDigitsMultiplicity();
545       Int_t rpMultX, rpMultZ;
546       cpvRecPoint->GetClusterLengths(rpMultX,rpMultZ);
547       Float_t xrec  = locpos.X();
548       Float_t zrec  = locpos.Z();
549       Float_t dxmin = 1.e+10;
550       Float_t dzmin = 1.e+10;
551       Float_t r2min = 1.e+10;
552       Float_t r2;
553
554       cpvHits = hitsPerModule[phosModule-1];
555       Int_t nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
556       for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
557         cpvHit = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
558         xgen   = cpvHit->X();
559         zgen   = cpvHit->Y();
560         r2 = TMath::Power((xgen-xrec),2) + TMath::Power((zgen-zrec),2);
561         if ( r2 < r2min ) {
562           r2min = r2;
563           dxmin = xgen - xrec;
564           dzmin = zgen - zrec;
565         }
566       }
567       hDx  ->Fill(dxmin);
568       hDz  ->Fill(dzmin);
569       hDr  ->Fill(TMath::Sqrt(r2min));
570       hNrp ->Fill(rpMult);
571       hNrpX->Fill(rpMultX);
572       hNrpZ->Fill(rpMultZ);
573     }
574     delete [] hitsPerModule;
575   }
576   // Save histograms
577
578   Text_t outputname[80] ;
579   sprintf(outputname,"%s.analyzed",fRootFile->GetName());
580   TFile output(outputname,"RECREATE");
581   output.cd();
582
583   hDx  ->Write() ;
584   hDz  ->Write() ;
585   hDr  ->Write() ;
586   hNrp ->Write() ;
587   hNrpX->Write() ;
588   hNrpZ->Write() ;
589
590   // Plot histograms
591
592   TCanvas *cpvCanvas = new TCanvas("CPV","CPV analysis",20,20,800,400);
593   gStyle->SetOptStat(111111);
594   gStyle->SetOptFit(1);
595   gStyle->SetOptDate(1);
596   cpvCanvas->Divide(3,2);
597
598   cpvCanvas->cd(1);
599   gPad->SetFillColor(10);
600   hNrp->SetFillColor(16);
601   hNrp->Draw();
602
603   cpvCanvas->cd(2);
604   gPad->SetFillColor(10);
605   hNrpX->SetFillColor(16);
606   hNrpX->Draw();
607
608   cpvCanvas->cd(3);
609   gPad->SetFillColor(10);
610   hNrpZ->SetFillColor(16);
611   hNrpZ->Draw();
612
613   cpvCanvas->cd(4);
614   gPad->SetFillColor(10);
615   hDx->SetFillColor(16);
616   hDx->Fit("gaus");
617   hDx->Draw();
618
619   cpvCanvas->cd(5);
620   gPad->SetFillColor(10);
621   hDz->SetFillColor(16);
622   hDz->Fit("gaus");
623   hDz->Draw();
624
625   cpvCanvas->cd(6);
626   gPad->SetFillColor(10);
627   hDr->SetFillColor(16);
628   hDr->Draw();
629
630   cpvCanvas->Print("CPV.ps");
631
632 }
633
634 //____________________________________________________________________________
635  void AliPHOSAnalyze::InvariantMass(Int_t Nevents )    
636 {
637   // Calculates Real and Mixed invariant mass distributions
638
639   const Int_t nMixedEvents = 4 ; //# of events used for calculation of 'mixed' distribution 
640   Int_t mixedLoops = (Int_t )TMath::Ceil(Nevents/nMixedEvents) ;
641   
642   //========== Booking Histograms
643   TH2D * hRealEM   = new TH2D("hRealEM",   "Real for EM particles",      250,0.,1.,40,0.,4.) ;
644   TH2D * hRealPhot = new TH2D("hRealPhot", "Real for kPhoton particles", 250,0.,1.,40,0.,4.) ;
645   TH2D * hMixedEM  = new TH2D("hMixedEM",  "Mixed for EM particles",     250,0.,1.,40,0.,4.) ;
646   TH2D * hMixedPhot= new TH2D("hMixedPhot","Mixed for kPhoton particles",250,0.,1.,40,0.,4.) ;
647   
648   Int_t ievent;
649   Int_t eventInMixedLoop ;
650   
651   Int_t nRecParticles[4];//nMixedEvents] ;
652   
653   AliPHOSRecParticle::RecParticlesList * allRecParticleList  = new TClonesArray("AliPHOSRecParticle", nMixedEvents*1000) ;
654   
655   for(eventInMixedLoop = 0; eventInMixedLoop < mixedLoops; eventInMixedLoop++  ){
656     Int_t iRecPhot = 0 ;
657     
658     for ( ievent=0; ievent < nMixedEvents; ievent++){        
659       
660       Int_t absEventNumber = eventInMixedLoop*nMixedEvents + ievent ;
661       
662       //=========== Connects the various Tree's for evt
663       gAlice->GetEvent(absEventNumber);
664
665       //========== Creating branches ===================================       
666       fPHOS->SetTreeAddress() ;
667       
668       gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
669       gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
670       
671       TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
672       
673             
674       AliPHOSRecParticle * recParticle ;
675       Int_t iRecParticle ;
676       for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*recParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
677         {
678           recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(iRecParticle) ;
679           if((recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)||
680              (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEM)){ 
681             new( (*allRecParticleList)[iRecPhot] ) AliPHOSRecParticle(*recParticle) ;
682             iRecPhot++;
683           }
684         }
685       
686         nRecParticles[ievent] = iRecPhot-1 ;  
687     }
688     
689     //Now calculate invariant mass:
690     Int_t irp1,irp2 ;
691     Int_t nCurEvent = 0 ;
692
693     for(irp1 = 0; irp1 < allRecParticleList->GetEntries()-1; irp1++){
694       AliPHOSRecParticle * rp1 = (AliPHOSRecParticle *)allRecParticleList->At(irp1) ;
695
696       for(irp2 = irp1+1; irp2 < allRecParticleList->GetEntries(); irp2++){
697         AliPHOSRecParticle * rp2 = (AliPHOSRecParticle *)allRecParticleList->At(irp2) ;
698             
699         Double_t invMass ;
700         invMass = (rp1->Energy()+rp2->Energy())*(rp1->Energy()+rp2->Energy())-
701           (rp1->Px()+rp2->Px())*(rp1->Px()+rp2->Px())-
702           (rp1->Py()+rp2->Py())*(rp1->Py()+rp2->Py())-
703           (rp1->Pz()+rp2->Pz())*(rp1->Pz()+rp2->Pz()) ;
704         
705         if(invMass> 0)
706           invMass = TMath::Sqrt(invMass);
707         
708         Double_t pt ; 
709         pt = TMath::Sqrt((rp1->Px()+rp2->Px() )*( rp1->Px()+rp2->Px() ) +(rp1->Py()+rp2->Py())*(rp1->Py()+rp2->Py()));
710
711         if(irp1 > nRecParticles[nCurEvent])
712           nCurEvent++;
713             
714         if(irp2 <= nRecParticles[nCurEvent]){ //'Real' event
715           hRealEM->Fill(invMass,pt);
716           if((rp1->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)&&(rp2->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA))
717             hRealPhot->Fill(invMass,pt);
718         }
719         else{
720           hMixedEM->Fill(invMass,pt);
721           if((rp1->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)&&(rp2->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA))
722             hMixedPhot->Fill(invMass,pt);
723         } //real-mixed
724             
725       } //loop over second rp
726     }//loop over first rp
727     allRecParticleList->Delete() ;
728   } //Loop over events
729   
730   delete allRecParticleList ;
731   
732   //writing output
733   TFile output("invmass.root","RECREATE");
734   output.cd();
735   
736   hRealEM->Write() ;
737   hRealPhot->Write() ;
738   hMixedEM->Write() ;
739   hMixedPhot->Write() ;
740   
741   output.Write();
742   output.Close();
743
744 }
745
746 //____________________________________________________________________________
747  void AliPHOSAnalyze::ReadAndPrintEMC(Int_t EvFirst, Int_t EvLast)    
748 {
749   //
750   // Read and print generated and reconstructed hits in EMC
751   // for events from EvFirst to Nevent.
752   // If only EvFirst is defined, print only this one event.
753   // Author: Yuri Kharlov
754   // 24 November 2000
755   //
756
757   if (EvFirst!=0 && EvLast==0) EvLast=EvFirst;
758   Int_t ievent;
759   for (ievent=EvFirst; ievent<=EvLast; ievent++) {  
760     
761     //========== Event Number>
762     cout << endl <<  "==== ReadAndPrintEMC ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
763
764     //=========== Connects the various Tree's for evt
765     Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
766     fPHOS->SetTreeAddress() ;
767     
768     gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
769     gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
770
771     // Loop over reconstructed particles
772       
773     TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;     
774     AliPHOSRecParticle * recParticle ;
775     Int_t iRecParticle ;
776     Int_t *primList;
777     Int_t nPrimary;
778     for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*recParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ ) {
779       recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(iRecParticle) ;
780       Float_t recE = recParticle->Energy();
781       primList     = recParticle->GetPrimaries(nPrimary);
782       Int_t moduleNumberRec ;
783       Double_t recX, recZ ;
784       fGeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
785       printf("Rec point: module %d, (X,Z) = (%8.4f,%8.4f) cm, E = %.3f GeV, primary = %d\n",
786              moduleNumberRec,recX,recZ,recE,*primList);
787     }
788
789     // Read and print EMC hits from EMCn branches
790       
791     AliPHOSCPVModule emcModule;
792     TClonesArray    *emcHits;
793     Int_t           nEMChits;
794     AliPHOSCPVHit   *emcHit;
795     TLorentzVector   p;
796     Float_t          xgen, zgen;
797     Int_t            ipart, primary;
798     Int_t            nGenHits = 0;
799     for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
800       //=========== Get the Hits Tree for the Primary track itrack
801       gAlice->ResetHits();
802       gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
803       Int_t iModule = 0 ;
804       for (iModule=0; iModule < fGeom->GetNModules(); iModule++) {
805         emcModule = fPHOS->GetEMCModule(iModule);
806         emcHits   = emcModule.Hits();
807         nEMChits  = emcHits->GetEntriesFast();
808         for (Int_t ihit=0; ihit<nEMChits; ihit++) {
809           nGenHits++;
810           emcHit = (AliPHOSCPVHit*)emcHits->UncheckedAt(ihit);
811           p      = emcHit->GetMomentum();
812           xgen   = emcHit->X();
813           zgen   = emcHit->Y();
814           ipart  = emcHit->GetIpart();
815           primary= emcHit->GetTrack();
816           printf("EMC hit A: module %d, ",iModule+1);
817           printf("    p = (%f .4, %f .4, %f .4, %f .4) GeV,\n",
818                  p.Px(),p.Py(),p.Pz(),p.Energy());
819           printf("                     (X,Z) = (%8.4f, %8.4f) cm, ipart = %d, primary = %d\n",
820                  xgen,zgen,ipart,primary);
821         }
822       }
823     }
824
825 //      // Read and print EMC hits from PHOS branch
826
827 //      for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
828 //        //=========== Get the Hits Tree for the Primary track itrack
829 //        gAlice->ResetHits();
830 //        gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
831 //        TClonesArray *hits = fPHOS->Hits();
832 //        AliPHOSHit   *hit ;
833 //        Int_t ihit;
834 //        for ( ihit = 0 ; ihit < hits->GetEntries() ; ihit++ ) {
835 //      hit = (AliPHOSHit*)hits->At(ihit) ;
836 //      Float_t hitXYZ[3];
837 //      hitXYZ[0]   = hit->X();
838 //      hitXYZ[1]   = hit->Y();
839 //      hitXYZ[2]   = hit->Z();
840 //      ipart       = hit->GetPid();
841 //      primary     = hit->GetPrimary();
842 //      Int_t absId = hit->GetId();
843 //      Int_t relId[4];
844 //      fGeom->AbsToRelNumbering(absId, relId) ;
845 //      Int_t module = relId[0];
846 //      if (relId[1]==0 && !(hitXYZ[0]==0 && hitXYZ[2]==0))
847 //        printf("EMC hit B: module %d, (X,Z) = (%8.4f, %8.4f) cm, ipart = %d, primary = %d\n",
848 //               module,hitXYZ[0],hitXYZ[2],ipart,primary);
849 //        }
850 //      }
851
852   }
853 }
854
855 //____________________________________________________________________________
856  void AliPHOSAnalyze::AnalyzeEMC(Int_t Nevents)
857 {
858   //
859   // Read generated and reconstructed hits in EMC for Nevents events.
860   // Plots the coordinate and energy resolution histograms.
861   // Coordinate resolution is a difference between the reconstructed
862   // coordinate and the exact coordinate on the face of the PHOS
863   // Author: Yuri Kharlov
864   // 27 November 2000
865   //
866
867   // Book histograms
868
869   TH1F *hDx1   = new TH1F("hDx1"  ,"EMC x-resolution", 100,-5. , 5.);
870   TH1F *hDz1   = new TH1F("hDz1"  ,"EMC z-resolution", 100,-5. , 5.);
871   TH1F *hDE1   = new TH1F("hDE1"  ,"EMC E-resolution", 100,-2. , 2.);
872
873   TH2F *hDx2   = new TH2F("hDx2"  ,"EMC x-resolution", 100, 0., 10., 100,-5. , 5.);
874   TH2F *hDz2   = new TH2F("hDz2"  ,"EMC z-resolution", 100, 0., 10., 100,-5. , 5.);
875   TH2F *hDE2   = new TH2F("hDE2"  ,"EMC E-resolution", 100, 0., 10., 100, 0. , 5.);
876
877   cout << "Start EMC Analysis"<< endl ;
878   for (Int_t ievent=0; ievent<Nevents; ievent++) {  
879       
880     //========== Event Number>         
881     if ( (ievent+1) % (Int_t)TMath::Power( 10, (Int_t)TMath::Log10(ievent+1) ) == 0)
882       cout << "==== AnalyzeEMC ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
883     
884     //=========== Connects the various Tree's for evt
885     Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
886
887     fPHOS->SetTreeAddress() ;
888     
889     gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
890     gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
891
892     // Create and fill arrays of hits for each EMC module
893       
894     Int_t nOfModules = fGeom->GetNModules();
895     TClonesArray **hitsPerModule = new TClonesArray *[nOfModules];
896     Int_t iModule;
897     for (iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++)
898       hitsPerModule[iModule] = new TClonesArray("AliPHOSCPVHit",100);
899
900     AliPHOSCPVModule emcModule;
901     TClonesArray    *emcHits;
902     Int_t           nEMChits;
903     AliPHOSCPVHit   *emcHit;
904
905     // First go through all primary tracks and fill the arrays
906     // of hits per each EMC module
907
908     for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
909       // Get the Hits Tree for the Primary track itrack
910       gAlice->ResetHits();
911       gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
912       for (Int_t iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++) {
913         emcModule = fPHOS->GetEMCModule(iModule);
914         emcHits   = emcModule.Hits();
915         nEMChits  = emcHits->GetEntriesFast();
916         for (Int_t ihit=0; ihit<nEMChits; ihit++) {
917           emcHit   = (AliPHOSCPVHit*)emcHits->UncheckedAt(ihit);
918           TClonesArray &lhits = *(TClonesArray *)hitsPerModule[iModule];
919           new(lhits[hitsPerModule[iModule]->GetEntriesFast()]) AliPHOSCPVHit(*emcHit);
920         }
921         emcModule.Clear();
922       }
923     }
924
925     // Loop over reconstructed particles
926       
927     TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;     
928     AliPHOSRecParticle * recParticle ;
929     Int_t nEMCrecs = (*recParticleList)->GetEntries();
930     if (nEMCrecs == 1) {
931       recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(0) ;
932       Float_t recE = recParticle->Energy();
933       Int_t phosModule;
934       Double_t recX, recZ ;
935       fGeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), phosModule, recX, recZ) ;
936
937       // for this rec.point take the hit list in the same PHOS module
938
939       emcHits = hitsPerModule[phosModule-1];
940       Int_t nEMChits  = emcHits->GetEntriesFast();
941       if (nEMChits == 1) {
942         Float_t genX, genZ, genE;
943         for (Int_t ihit=0; ihit<nEMChits; ihit++) {
944           emcHit = (AliPHOSCPVHit*)emcHits->UncheckedAt(ihit);
945           genX   = emcHit->X();
946           genZ   = emcHit->Y();
947           genE   = emcHit->GetMomentum().E();
948         }
949         Float_t dx = recX - genX;
950         Float_t dz = recZ - genZ;
951         Float_t de = recE - genE;
952         hDx1  ->Fill(dx);
953         hDz1  ->Fill(dz);
954         hDE1  ->Fill(de);
955         hDx2  ->Fill(genE,dx);
956         hDz2  ->Fill(genE,dz);
957         hDE2  ->Fill(genE,recE);
958       }
959     }
960     delete [] hitsPerModule;
961   }
962   // Save histograms
963
964   Text_t outputname[80] ;
965   sprintf(outputname,"%s.analyzed",fRootFile->GetName());
966   TFile output(outputname,"RECREATE");
967   output.cd();
968
969   hDx1  ->Write() ;
970   hDz1  ->Write() ;
971   hDE1  ->Write() ;
972   hDx2  ->Write() ;
973   hDz2  ->Write() ;
974   hDE2  ->Write() ;
975
976   // Plot histograms
977
978   TCanvas *emcCanvas = new TCanvas("EMC","EMC analysis",20,20,700,300);
979   gStyle->SetOptStat(111111);
980   gStyle->SetOptFit(1);
981   gStyle->SetOptDate(1);
982   emcCanvas->Divide(3,1);
983
984   emcCanvas->cd(1);
985   gPad->SetFillColor(10);
986   hDx1->SetFillColor(16);
987   hDx1->Draw();
988
989   emcCanvas->cd(2);
990   gPad->SetFillColor(10);
991   hDz1->SetFillColor(16);
992   hDz1->Draw();
993
994   emcCanvas->cd(3);
995   gPad->SetFillColor(10);
996   hDE1->SetFillColor(16);
997   hDE1->Draw();
998
999   emcCanvas->Print("EMC.ps");
1000
1001 }
1002
1003 //____________________________________________________________________________
1004  void AliPHOSAnalyze::AnalyzeResolutions(Int_t Nevents )    
1005 {
1006   // analyzes Nevents events and calculate Energy and Position resolution as well as
1007   // probaility of correct indentifiing of the incident particle
1008
1009   //========== Booking Histograms
1010   cout << "AnalyzeResolutions > " << "Booking Histograms" << endl ; 
1011   BookResolutionHistograms();
1012
1013   Int_t counter[9][5] ;     
1014   Int_t i1,i2,totalInd = 0 ;
1015   for(i1 = 0; i1<9; i1++)
1016     for(i2 = 0; i2<5; i2++)
1017       counter[i1][i2] = 0 ;
1018   
1019   Int_t totalPrimary = 0 ;
1020   Int_t totalRecPart = 0 ;
1021   Int_t totalRPwithPrim = 0 ;
1022   Int_t ievent;
1023
1024   cout << "Start Analysing"<< endl ;
1025   for ( ievent=0; ievent<Nevents; ievent++)
1026     {  
1027       
1028       //========== Event Number>         
1029       //      if ( ( log10((Float_t)(ievent+1)) - (Int_t)(log10((Float_t)(ievent+1))) ) == 0. ) 
1030         cout <<  "AnalyzeResolutions > " << "Event is " << ievent << endl ;  
1031       
1032       //=========== Connects the various Tree's for evt
1033       gAlice->GetEvent(ievent);
1034
1035       //=========== Gets the Kine TTree
1036       gAlice->TreeK()->GetEvent(0) ;
1037       
1038       //=========== Gets the list of Primari Particles
1039       TClonesArray * primaryList  = gAlice->Particles();     
1040
1041       TParticle * primary ;
1042       Int_t iPrimary ;
1043       for ( iPrimary = 0 ; iPrimary < primaryList->GetEntries() ; iPrimary++)
1044         {
1045           primary = (TParticle*)primaryList->UncheckedAt(iPrimary) ;
1046           Int_t primaryType = primary->GetPdgCode() ;
1047           if( primaryType == 22 ) {
1048             Int_t moduleNumber ;
1049             Double_t primX, primZ ;
1050             fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
1051             if(moduleNumber){
1052               fhPrimary->Fill(primary->Energy()) ;
1053               if(primary->Energy() > 0.3)
1054                 totalPrimary++ ;
1055             }
1056           } 
1057         }
1058       
1059       fPHOS->SetTreeAddress() ;
1060       
1061       gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
1062       gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
1063       
1064       TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;     
1065       
1066       AliPHOSRecParticle * recParticle ;
1067       Int_t iRecParticle ;
1068       for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*recParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
1069         {
1070           recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(iRecParticle) ;
1071           fhAllRP->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy())) ;
1072           
1073           Int_t moduleNumberRec ;
1074           Double_t recX, recZ ;
1075           fGeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
1076           
1077           Double_t minDistance  = 100. ;
1078           Int_t closestPrimary = -1 ;
1079           
1080           Int_t numberofprimaries ;
1081           Int_t * listofprimaries  = recParticle->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
1082           Int_t index ;
1083           TParticle * primary ;
1084           Double_t distance = minDistance ;
1085           Double_t dX, dZ; 
1086           Double_t dXmin = 0.; 
1087           Double_t dZmin = 0. ;
1088           for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
1089             primary = (TParticle*)primaryList->UncheckedAt(listofprimaries[index]) ;
1090             Int_t moduleNumber ;
1091             Double_t primX, primZ ;
1092             fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
1093             if(moduleNumberRec == moduleNumber) {
1094               dX = recX - primX;
1095               dZ = recZ - primZ;
1096               distance = TMath::Sqrt(dX*dX + dZ*dZ) ;
1097               if(minDistance > distance) {
1098                 minDistance = distance ;
1099                 dXmin = dX;
1100                 dZmin = dZ;
1101                 closestPrimary = listofprimaries[index] ;
1102               }
1103             }
1104           }
1105           totalRecPart++ ;
1106
1107           if(closestPrimary >=0 ){
1108             totalRPwithPrim++;
1109             
1110             Int_t primaryType = ((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->GetPdgCode() ;
1111 //          TParticlePDG* pDGparticle = ((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->GetPDG();
1112 //          Double_t charge =  PDGparticle->Charge() ;
1113 //          if(charge)
1114 //            cout <<"Primary " <<primaryType << " E " << ((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->Energy() << endl ;
1115             Int_t primaryCode ;
1116             switch(primaryType)
1117               {
1118               case 22:
1119                 primaryCode = 0;  //Photon
1120                 fhAllEnergy   ->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy()) ;
1121                 fhAllPosition ->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), minDistance) ;
1122                 fhAllPositionX->Fill(dXmin);
1123                 fhAllPositionZ->Fill(dZmin);
1124                 break;
1125               case 11 :
1126                 primaryCode = 1;  //Electron
1127                 break;
1128               case -11 :
1129                 primaryCode = 1;  //positron
1130                 break;
1131               case 321 :
1132                 primaryCode = 4;  //K+
1133                 break;
1134               case -321 :
1135                 primaryCode = 4;  //K-
1136                 break;
1137               case 310 :
1138                 primaryCode = 4;  //K0s
1139                 break;
1140               case 130 :
1141                 primaryCode = 4;  //K0l
1142                 break;
1143               case 211 :
1144                 primaryCode = 2;  //K0l
1145                 break;
1146               case -211 :
1147                 primaryCode = 2;  //K0l
1148                 break;
1149               case 2212 :
1150                 primaryCode = 2;  //K0l
1151                 break;
1152               case -2212 :
1153                 primaryCode = 2;  //K0l
1154                 break;
1155               default:
1156                 primaryCode = 3; //ELSE
1157                 break;
1158               }
1159             
1160             switch(recParticle->GetType())
1161               {
1162               case AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA:
1163                 if(primaryType == 22){
1164                   fhPhotEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
1165                   fhEMEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
1166                   fhPPSDEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
1167
1168                   fhPhotPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
1169                   fhEMPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
1170                   fhPPSDPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
1171
1172                   fhPhotReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1173                   fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1174                   fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1175
1176                   fhPhotPhot->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1177                 }
1178                 if(primaryType == 2112){ //neutron
1179                   fhNReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1180                   fhNEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1181                   fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1182                 }
1183                 
1184                 if(primaryType == -2112){ //neutron ~
1185                   fhNBarReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1186                   fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1187                   fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1188                   
1189                 }
1190                 if(primaryCode == 2){
1191                   fhChargedReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1192                   fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1193                   fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1194                 }
1195                 
1196                 fhAllReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1197                 fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1198                 fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1199                 fhShape->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1200                 fhVeto->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1201                 fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1202                 counter[0][primaryCode]++;
1203                 break;
1204               case  AliPHOSFastRecParticle::kELECTRON:
1205                 if(primaryType == 22){ 
1206                   fhPhotElec->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1207                   fhEMEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
1208                   fhEMPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
1209                   fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1210                   fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1211                 }         
1212                 if(primaryType == 2112){ //neutron
1213                   fhNEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1214                   fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1215                 }
1216                 
1217                 if(primaryType == -2112){ //neutron ~
1218                   fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1219                   fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1220                   
1221                 }
1222                 if(primaryCode == 2){
1223                   fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1224                   fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1225                 }
1226                 
1227                 fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1228                 fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1229                 fhShape->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1230                 fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1231                 counter[1][primaryCode]++;
1232                 break;
1233               case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALHA:
1234                 if(primaryType == 22) 
1235                   fhPhotNeuH->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1236
1237                 fhVeto->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;           
1238                 counter[2][primaryCode]++;
1239                 break ;
1240               case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEM:
1241                 if(primaryType == 22){
1242                   fhEMEnergy->Fill(((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),recParticle->Energy() ) ; 
1243                   fhEMPosition->Fill(((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance ) ;
1244                 
1245                   fhPhotNuEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1246                   fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1247                 }
1248                 if(primaryType == 2112) //neutron
1249                   fhNEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1250                 
1251                 if(primaryType == -2112) //neutron ~
1252                   fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1253                 
1254                 if(primaryCode == 2)
1255                   fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1256                 
1257                 fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1258                 fhShape->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1259                 fhVeto->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1260
1261                 counter[3][primaryCode]++;
1262                 break ;
1263               case  AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDHA:
1264                 if(primaryType == 22) //photon
1265                   fhPhotChHa->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1266                 
1267                 counter[4][primaryCode]++ ;
1268                 break ;
1269               case  AliPHOSFastRecParticle::kGAMMAHA:
1270                   if(primaryType == 22){ //photon
1271                     fhPhotGaHa->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1272                     fhPPSDEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
1273                     fhPPSDPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
1274                     fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1275                   }
1276                   if(primaryType == 2112){ //neutron
1277                     fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1278                   }
1279                 
1280                   if(primaryType == -2112){ //neutron ~
1281                     fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ; 
1282                   }
1283                   if(primaryCode == 2){
1284                     fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1285                   }
1286                 
1287                   fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1288                   fhVeto->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1289                   fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1290                   counter[5][primaryCode]++ ;
1291                   break ;       
1292               case  AliPHOSFastRecParticle::kABSURDEM:        
1293                 counter[6][primaryCode]++ ;
1294                 fhShape->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
1295                 break;
1296               case  AliPHOSFastRecParticle::kABSURDHA:
1297                 counter[7][primaryCode]++ ;
1298                 break;
1299               default:
1300                 counter[8][primaryCode]++ ;
1301                 break;
1302               }
1303           }
1304         }  
1305     }   // endfor
1306   SaveHistograms();
1307   cout << "Resolutions: Analyzed " << Nevents << " event(s)" << endl ;
1308   cout << "Resolutions: Total primary       " << totalPrimary << endl ;
1309   cout << "Resoluitons: Total reconstracted " << totalRecPart << endl ;
1310   cout << "TotalReconstructed with Primarie " << totalRPwithPrim << endl ;
1311   cout << "                        Primary:   Photon   Electron   Ch. Hadr.  Neutr. Hadr  Kaons" << endl ; 
1312   cout << "             Detected as photon       " << counter[0][0] << "          " << counter[0][1] << "          " << counter[0][2] << "          " <<counter[0][3] << "          " << counter[0][4] << endl ;
1313   cout << "           Detected as electron       " << counter[1][0] << "          " << counter[1][1] << "          " << counter[1][2] << "          " <<counter[1][3] << "          " << counter[1][4] << endl ; 
1314   cout << "     Detected as neutral hadron       " << counter[2][0] << "          " << counter[2][1] << "          " << counter[2][2] << "          " <<counter[2][3] << "          " << counter[2][4] << endl ;
1315   cout << "         Detected as neutral EM       " << counter[3][0] << "          " << counter[3][1] << "          " << counter[3][2] << "          " <<counter[3][3] << "          " << counter[3][4] << endl ;
1316   cout << "     Detected as charged hadron       " << counter[4][0] << "          " << counter[4][1] << "          " << counter[4][2] << "          " <<counter[4][3] << "          " << counter[4][4] << endl ;
1317   cout << "       Detected as gamma-hadron       " << counter[5][0] << "          " << counter[5][1] << "          " << counter[5][2] << "          " <<counter[5][3] << "          " << counter[5][4] << endl ;
1318   cout << "          Detected as Absurd EM       " << counter[6][0] << "          " << counter[6][1] << "          " << counter[6][2] << "          " <<counter[6][3] << "          " << counter[6][4] << endl ;
1319   cout << "      Detected as absurd hadron       " << counter[7][0] << "          " << counter[7][1] << "          " << counter[7][2] << "          " <<counter[7][3] << "          " << counter[7][4] << endl ;
1320   cout << "          Detected as undefined       " << counter[8][0] << "          " << counter[8][1] << "          " << counter[8][2] << "          " <<counter[8][3] << "          " << counter[8][4] << endl ;
1321       
1322       for(i1 = 0; i1<9; i1++)
1323         for(i2 = 0; i2<5; i2++)
1324           totalInd+=counter[i1][i2] ;
1325       cout << "Indentified particles            " << totalInd << endl ;
1326       
1327 }           // endfunction
1328
1329
1330 //____________________________________________________________________________
1331 void  AliPHOSAnalyze::BookingHistograms()
1332 {
1333   // Books the histograms where the results of the analysis are stored (to be changed)
1334
1335   delete fhEmcDigit  ;
1336   delete fhVetoDigit  ;
1337   delete fhConvertorDigit   ;
1338   delete  fhEmcCluster   ;
1339   delete fhVetoCluster   ;
1340   delete fhConvertorCluster  ;
1341   delete fhConvertorEmc  ;
1342   
1343   fhEmcDigit                = new TH1F("hEmcDigit",      "hEmcDigit",         1000,  0. ,  25.);
1344   fhVetoDigit               = new TH1F("hVetoDigit",     "hVetoDigit",         500,  0. ,  3.e-5);
1345   fhConvertorDigit          = new TH1F("hConvertorDigit","hConvertorDigit",    500,  0. ,  3.e-5);
1346   fhEmcCluster              = new TH1F("hEmcCluster",    "hEmcCluster",       1000,  0. ,  30.);
1347   fhVetoCluster             = new TH1F("hVetoCluster",   "hVetoCluster",       500,  0. ,  3.e-5);
1348   fhConvertorCluster        = new TH1F("hConvertorCluster","hConvertorCluster",500,  0. ,  3.e-5);
1349   fhConvertorEmc            = new TH2F("hConvertorEmc",  "hConvertorEmc",      200,  1. ,  3., 200, 0., 3.e-5);
1350
1351 }
1352 //____________________________________________________________________________
1353 void  AliPHOSAnalyze::BookResolutionHistograms()
1354 {
1355   // Books the histograms where the results of the Resolution analysis are stored
1356
1357 //   if(fhAllEnergy)
1358 //     delete fhAllEnergy ;
1359 //   if(fhPhotEnergy)
1360 //     delete fhPhotEnergy ;
1361 //   if(fhEMEnergy)
1362 //     delete fhEMEnergy ;
1363 //   if(fhPPSDEnergy)
1364 //     delete fhPPSDEnergy ;
1365
1366
1367   fhAllEnergy  = new TH2F("hAllEnergy",  "Energy of any RP with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
1368   fhPhotEnergy = new TH2F("hPhotEnergy", "Energy of kGAMMA with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
1369   fhEMEnergy   = new TH2F("hEMEnergy",   "Energy of EM with primary photon",    100, 0., 5., 100, 0., 5.);
1370   fhPPSDEnergy = new TH2F("hPPSDEnergy", "Energy of PPSD with primary photon",  100, 0., 5., 100, 0., 5.);
1371
1372 //   if(fhAllPosition)
1373 //     delete fhAllPosition ;
1374 //   if(fhPhotPosition)
1375 //     delete fhPhotPosition ;
1376 //   if(fhEMPosition)
1377 //     delete fhEMPosition ;
1378 //   if(fhPPSDPosition)
1379 //     delete fhPPSDPosition ;
1380
1381
1382   fhAllPosition  = new TH2F("hAllPosition",  "Position of any RP with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
1383   fhPhotPosition = new TH2F("hPhotPosition", "Position of kGAMMA with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
1384   fhEMPosition   = new TH2F("hEMPosition",   "Position of EM with primary photon",    100, 0., 5., 100, 0., 5.);
1385   fhPPSDPosition = new TH2F("hPPSDPosition", "Position of PPSD with primary photon",  100, 0., 5., 100, 0., 5.);
1386
1387   fhAllPositionX = new TH1F("hAllPositionX", "#Delta X of any RP with primary photon",100, -2., 2.);
1388   fhAllPositionZ = new TH1F("hAllPositionZ", "#Delta X of any RP with primary photon",100, -2., 2.);
1389
1390 //   if(fhAllReg)
1391 //     delete fhAllReg ;
1392 //   if(fhPhotReg)
1393 //     delete fhPhotReg ;
1394 //   if(fhNReg)
1395 //     delete fhNReg ;
1396 //   if(fhNBarReg)
1397 //     delete fhNBarReg ;
1398 //   if(fhChargedReg)
1399 //     delete fhChargedReg ;
1400   
1401   fhAllReg    = new TH1F("hAllReg",    "All primaries registered as photon",  100, 0., 5.);
1402   fhPhotReg   = new TH1F("hPhotReg",   "Photon registered as photon",         100, 0., 5.);
1403   fhNReg      = new TH1F("hNReg",      "N registered as photon",              100, 0., 5.);
1404   fhNBarReg   = new TH1F("hNBarReg",   "NBar registered as photon",           100, 0., 5.);
1405   fhChargedReg= new TH1F("hChargedReg", "Charged hadron registered as photon",100, 0., 5.);
1406   
1407 //   if(fhAllEM)
1408 //     delete fhAllEM ;
1409 //   if(fhPhotEM)
1410 //     delete fhPhotEM ;
1411 //   if(fhNEM)
1412 //     delete fhNEM ;
1413 //   if(fhNBarEM)
1414 //     delete fhNBarEM ;
1415 //   if(fhChargedEM)
1416 //     delete fhChargedEM ;
1417   
1418   fhAllEM    = new TH1F("hAllEM",    "All primary registered as EM",100, 0., 5.);
1419   fhPhotEM   = new TH1F("hPhotEM",   "Photon registered as EM", 100, 0., 5.);
1420   fhNEM      = new TH1F("hNEM",      "N registered as EM",      100, 0., 5.);
1421   fhNBarEM   = new TH1F("hNBarEM",   "NBar registered as EM",   100, 0., 5.);
1422   fhChargedEM= new TH1F("hChargedEM","Charged registered as EM",100, 0., 5.);
1423
1424 //   if(fhAllPPSD)
1425 //     delete fhAllPPSD ;
1426 //   if(fhPhotPPSD)
1427 //     delete fhPhotPPSD ;
1428 //   if(fhNPPSD)
1429 //     delete fhNPPSD ;
1430 //   if(fhNBarPPSD)
1431 //     delete fhNBarPPSD ;
1432 //   if(fhChargedPPSD)
1433 //     delete fhChargedPPSD ;
1434   
1435   fhAllPPSD    = new TH1F("hAllPPSD",    "All primary registered as PPSD",100, 0., 5.);
1436   fhPhotPPSD   = new TH1F("hPhotPPSD",   "Photon registered as PPSD", 100, 0., 5.);
1437   fhNPPSD      = new TH1F("hNPPSD",      "N registered as PPSD",      100, 0., 5.);
1438   fhNBarPPSD   = new TH1F("hNBarPPSD",   "NBar registered as PPSD",   100, 0., 5.);
1439   fhChargedPPSD= new TH1F("hChargedPPSD","Charged registered as PPSD",100, 0., 5.);
1440   
1441 //   if(fhPrimary)
1442 //     delete fhPrimary ;
1443   fhPrimary= new TH1F("hPrimary", "hPrimary",  100, 0., 5.);
1444
1445 //   if(fhAllRP)
1446 //     delete fhAllRP ;
1447 //   if(fhVeto)
1448 //     delete fhVeto ;
1449 //   if(fhShape)
1450 //     delete fhShape ;
1451 //   if(fhPPSD)
1452 //     delete fhPPSD ;
1453
1454   fhAllRP = new TH1F("hAllRP","All Reconstructed particles",  100, 0., 5.);
1455   fhVeto  = new TH1F("hVeto", "All uncharged particles",      100, 0., 5.);
1456   fhShape = new TH1F("hShape","All particles with EM shaower",100, 0., 5.);
1457   fhPPSD  = new TH1F("hPPSD", "All PPSD photon particles",    100, 0., 5.);
1458
1459
1460 //   if(fhPhotPhot)
1461 //     delete fhPhotPhot ;
1462 //   if(fhPhotElec)
1463 //     delete fhPhotElec ;
1464 //   if(fhPhotNeuH)
1465 //     delete fhPhotNeuH ;
1466 //   if(fhPhotNuEM)
1467 //     delete fhPhotNuEM ;
1468 //   if(fhPhotChHa)
1469 //     delete fhPhotChHa ;
1470 //   if(fhPhotGaHa)
1471 //     delete fhPhotGaHa ;
1472
1473   fhPhotPhot = new TH1F("hPhotPhot","hPhotPhot", 100, 0., 5.);   //Photon registered as photon
1474   fhPhotElec = new TH1F("hPhotElec","hPhotElec", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Electron
1475   fhPhotNeuH = new TH1F("hPhotNeuH","hPhotNeuH", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Neutral Hadron
1476   fhPhotNuEM = new TH1F("hPhotNuEM","hPhotNuEM", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Neutral EM
1477   fhPhotChHa = new TH1F("hPhotChHa","hPhotChHa", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Charged Hadron
1478   fhPhotGaHa = new TH1F("hPhotGaHa","hPhotGaHa", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Gamma-Hadron
1479 }
1480
1481 //____________________________________________________________________________
1482 Bool_t AliPHOSAnalyze::OpenRootFile(Text_t * name)
1483 {
1484   // Open the root file named "name"
1485   
1486   fRootFile   = new TFile(name, "update") ;
1487   return  fRootFile->IsOpen() ; 
1488 }
1489
1490 //____________________________________________________________________________
1491 void AliPHOSAnalyze::SaveHistograms()
1492 {
1493   // Saves the histograms in a root file named "name.analyzed" 
1494
1495   Text_t outputname[80] ;
1496   sprintf(outputname,"%s.analyzed",fRootFile->GetName());
1497   TFile output(outputname,"RECREATE");
1498   output.cd();
1499
1500   if (fhAllEnergy)    
1501     fhAllEnergy->Write() ;
1502   if (fhPhotEnergy)    
1503     fhPhotEnergy->Write() ;
1504   if(fhEMEnergy)
1505     fhEMEnergy->Write()  ;
1506   if(fhPPSDEnergy)
1507     fhPPSDEnergy->Write() ;
1508   if(fhAllPosition)
1509     fhAllPosition->Write() ;
1510   if(fhAllPositionX)
1511     fhAllPositionX->Write() ;
1512   if(fhAllPositionZ)
1513     fhAllPositionZ->Write() ;
1514   if(fhPhotPosition)
1515     fhPhotPosition->Write() ;
1516   if(fhEMPosition)
1517     fhEMPosition->Write() ;
1518   if(fhPPSDPosition)
1519     fhPPSDPosition->Write() ;
1520   if (fhAllReg) 
1521     fhAllReg->Write() ;
1522   if (fhPhotReg) 
1523     fhPhotReg->Write() ;
1524   if(fhNReg)
1525     fhNReg->Write() ;
1526   if(fhNBarReg)
1527     fhNBarReg->Write() ;
1528   if(fhChargedReg)
1529     fhChargedReg->Write() ;
1530   if (fhAllEM) 
1531     fhAllEM->Write() ;
1532   if (fhPhotEM) 
1533     fhPhotEM->Write() ;
1534   if(fhNEM)
1535     fhNEM->Write() ;
1536   if(fhNBarEM)
1537     fhNBarEM->Write() ;
1538   if(fhChargedEM)
1539     fhChargedEM->Write() ;
1540   if (fhAllPPSD) 
1541     fhAllPPSD->Write() ;
1542   if (fhPhotPPSD) 
1543     fhPhotPPSD->Write() ;
1544   if(fhNPPSD)
1545     fhNPPSD->Write() ;
1546   if(fhNBarPPSD)
1547     fhNBarPPSD->Write() ;
1548   if(fhChargedPPSD)
1549     fhChargedPPSD->Write() ;
1550   if(fhPrimary)
1551     fhPrimary->Write() ;
1552   if(fhAllRP)
1553     fhAllRP->Write()  ;
1554   if(fhVeto)
1555     fhVeto->Write()  ;
1556   if(fhShape)
1557     fhShape->Write()  ;
1558   if(fhPPSD)
1559     fhPPSD->Write()  ;
1560   if(fhPhotPhot)
1561     fhPhotPhot->Write() ;
1562   if(fhPhotElec)
1563     fhPhotElec->Write() ;
1564   if(fhPhotNeuH)
1565     fhPhotNeuH->Write() ;
1566   if(fhPhotNuEM)
1567     fhPhotNuEM->Write() ;
1568   if(fhPhotNuEM)
1569     fhPhotNuEM->Write() ;
1570   if(fhPhotChHa)
1571     fhPhotChHa->Write() ;
1572   if(fhPhotGaHa)
1573     fhPhotGaHa->Write() ;
1574   if(fhEnergyCorrelations)
1575     fhEnergyCorrelations->Write() ;
1576   
1577   output.Write();
1578   output.Close();
1579 }
1580 //____________________________________________________________________________
1581 Float_t AliPHOSAnalyze::CorrectEnergy(Float_t ERecPart)
1582 {
1583   return ERecPart/0.8783 ;
1584 }
1585
1586 //____________________________________________________________________________
1587 void AliPHOSAnalyze::ResetHistograms()
1588 {
1589    fhEnergyCorrelations = 0 ;     //Energy correlations between Eloss in Convertor and PPSD(2)
1590
1591    fhEmcDigit = 0 ;               // Histo of digit energies in the Emc 
1592    fhVetoDigit = 0 ;              // Histo of digit energies in the Veto 
1593    fhConvertorDigit = 0 ;         // Histo of digit energies in the Convertor
1594    fhEmcCluster = 0 ;             // Histo of Cluster energies in Emc
1595    fhVetoCluster = 0 ;            // Histo of Cluster energies in Veto
1596    fhConvertorCluster = 0 ;       // Histo of Cluster energies in Convertor
1597    fhConvertorEmc = 0 ;           // 2d Convertor versus Emc energies
1598
1599    fhAllEnergy = 0 ;       
1600    fhPhotEnergy = 0 ;        // Total spectrum of detected photons
1601    fhEMEnergy = 0 ;         // Spectrum of detected electrons with electron primary
1602    fhPPSDEnergy = 0 ;
1603    fhAllPosition = 0 ; 
1604    fhAllPositionX = 0 ; 
1605    fhAllPositionZ = 0 ; 
1606    fhPhotPosition = 0 ; 
1607    fhEMPosition = 0 ; 
1608    fhPPSDPosition = 0 ; 
1609
1610    fhPhotReg = 0 ;          
1611    fhAllReg = 0 ;          
1612    fhNReg = 0 ;          
1613    fhNBarReg = 0 ;          
1614    fhChargedReg = 0 ;          
1615    fhPhotEM = 0 ;          
1616    fhAllEM = 0 ;          
1617    fhNEM = 0 ;          
1618    fhNBarEM = 0 ;          
1619    fhChargedEM = 0 ;          
1620    fhPhotPPSD = 0 ;          
1621    fhAllPPSD = 0 ;          
1622    fhNPPSD = 0 ;          
1623    fhNBarPPSD = 0 ;          
1624    fhChargedPPSD = 0 ;          
1625
1626    fhPrimary = 0 ;          
1627
1628    fhPhotPhot = 0 ;
1629    fhPhotElec = 0 ;
1630    fhPhotNeuH = 0 ;
1631    fhPhotNuEM = 0 ; 
1632    fhPhotChHa = 0 ;
1633    fhPhotGaHa = 0 ;
1634
1635 }