PHOS/AliPHOSClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 /* $Log:
  19    1 October 2000. Yuri Kharlov:
  20      AreNeighbours()
  21      PPSD upper layer is considered if number of layers>1
  22
  23    18 October 2000. Yuri Kharlov:
  24      AliPHOSClusterizerv1()
  25      CPV clusterizing parameters added
  26
  27      MakeClusters()
  28      After first PPSD digit remove EMC digits only once
  29 */
  30 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  31 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  32 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  33 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  34 //  Results are stored in TreeR#, branches PHOSEmcRP (EMC recPoints),
  35 //  PHOSCpvRP (CPV RecPoints) and AliPHOSClusterizer (Clusterizer with all
  36 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  37 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  38 //  standalone mode.
  39 // Use Case:
  40 //  root [0] AliPHOSClusterizerv1 * cl = new AliPHOSClusterizerv1("galice.root")
  41 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  42 //               //reads gAlice from header file "..."
  43 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  44 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  45 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  46 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  47 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  48 //               //sets another title four output branches
  49 //  root [4] cl->SetEmcLocalMaxCut(0.03)
  50 //               //set clusterization parameters
  51 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  52 //               //once more finds RecPoints options are
  53 //               // deb - print number of found rec points
  54 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  55 //               // time - print benchmarking results
  56
  57 // --- ROOT system ---
  58
  59 #include "TROOT.h"
  60 #include "TFile.h"
  61 #include "TFolder.h"
  62 #include "TMath.h"
  63 #include "TMinuit.h"
  64 #include "TTree.h"
  65 #include "TSystem.h"
  66 #include "TBenchmark.h"
  67
  68 // --- Standard library ---
  69
  70 #include <iostream.h>
  71 #include <iomanip.h>
  72
  73 // --- AliRoot header files ---
  74
  75 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
  76 #include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
  77 #include "AliPHOSDigit.h"
  78 #include "AliPHOSDigitizer.h"
  79 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
  80 #include "AliPHOS.h"
  81 #include "AliPHOSGetter.h"
  82 #include "AliRun.h"
  83
  84 ClassImp(AliPHOSClusterizerv1)
  85
  86 //____________________________________________________________________________
  87   AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1() : AliPHOSClusterizer()
  88 {
  89   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
  90
  91   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
  92   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
  93
  94   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
  95   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;
  96
  97   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
  98   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
  99
 100   fW0                      = 4.5 ;
 101   fW0CPV                   = 4.0 ;
 102
 103   fEmcTimeGate             = 1.e-8 ;
 104
 105   fToUnfold                = kTRUE ;
 106
 107   fHeaderFileName          = "" ;
 108   fDigitsBranchTitle       = "" ;
 109   fRecPointsInRun          = 0 ;
 110 }
 111
 112 //____________________________________________________________________________
 113 AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1(const char* headerFile,const char* name)
 114 :AliPHOSClusterizer(headerFile, name)
 115 {
 116   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
 117
 118
 119   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
 120   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
 121
 122   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
 123   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;
 124
 125   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
 126   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
 127
 128   fW0                      = 4.5 ;
 129   fW0CPV                   = 4.0 ;
 130
 131   fEmcTimeGate             = 1.e-8 ;
 132
 133   fToUnfold                = kTRUE ;
 134
 135   fHeaderFileName          = GetTitle() ;
 136   fDigitsBranchTitle       = GetName() ;
 137
 138   TString clusterizerName( GetName()) ;
 139   clusterizerName.Append(":") ;
 140   clusterizerName.Append(Version()) ;
 141   SetName(clusterizerName) ;
 142   fRecPointsInRun          = 0 ;
 143
 144   Init() ;
 145
 146 }
 147 //____________________________________________________________________________
 148   AliPHOSClusterizerv1::~AliPHOSClusterizerv1()
 149 {
 150 }
 151 //____________________________________________________________________________
 152 Float_t  AliPHOSClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp, Int_t absId) const
 153 {
 154   if(absId <= fEmcCrystals) //calibrate as EMC
 155     return fADCpedestalEmc + amp*fADCchanelEmc ;
 156   else //Digitize as CPV
 157     return fADCpedestalCpv+ amp*fADCchanelCpv ;
 158 }
 159 //____________________________________________________________________________
 160 void AliPHOSClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
 161 {
 162   // Steering method
 163
 164   if( strcmp(GetName(), "")== 0 )
 165     Init() ;
 166
 167   if(strstr(option,"tim"))
 168     gBenchmark->Start("PHOSClusterizer");
 169
 170   if(strstr(option,"print"))
 171     Print("") ;
 172
 173   gAlice->GetEvent(0) ;
 174
 175  //check, if the branch with name of this" already exits?
 176   TObjArray * lob = (TObjArray*)gAlice->TreeR()->GetListOfBranches() ;
 177   TIter next(lob) ;
 178   TBranch * branch = 0 ;
 179   Bool_t phosemcfound = kFALSE, phoscpvfound = kFALSE, clusterizerfound = kFALSE ;
 180
 181   TString branchname = GetName() ;
 182   branchname.Remove(branchname.Index(Version())-1) ;
 183
 184   while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!phosemcfound || !phoscpvfound || !clusterizerfound) ) {
 185     if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOSEmcRP")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), branchname.Data())==0) )
 186       phosemcfound = kTRUE ;
 187
 188     else if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOSCpvRP")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), branchname.Data())==0) )
 189       phoscpvfound = kTRUE ;
 190
 191     else if ((strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSClusterizer")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 192       clusterizerfound = kTRUE ;
 193   }
 194
 195   if ( phoscpvfound || phosemcfound || clusterizerfound ) {
 196     cerr << "WARNING: AliPHOSClusterizer::Exec -> Emc(Cpv)RecPoints and/or Clusterizer branch with name "
 197          << branchname.Data() << " already exits" << endl ;
 198     return ;
 199   }
 200
 201   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 202   Int_t nevents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
 203   Int_t ievent ;
 204
 205   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
 206
 207     if(ievent == 0) GetCalibrationParameters() ;
 208
 209     fNumberOfEmcClusters  = 0 ;
 210     fNumberOfCpvClusters  = 0 ;
 211
 212     gime->Event(ievent,"D") ;
 213
 214     //    if(!ReadDigits(ievent))   continue;  //reads digits for event ievent
 215
 216     MakeClusters() ;
 217
 218     if(fToUnfold)             MakeUnfolding() ;
 219
 220     WriteRecPoints(ievent) ;
 221
 222     if(strstr(option,"deb"))  PrintRecPoints(option) ;
 223   }
 224
 225   if(strstr(option,"tim")){
 226     gBenchmark->Stop("PHOSClusterizer");
 227     cout << "AliPHOSClusterizer:" << endl ;
 228     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer") << " seconds for Clusterizing "
 229          <<  gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer")/nevents << " seconds per event " << endl ;
 230     cout << endl ;
 231   }
 232
 233 }
 234
 235 //____________________________________________________________________________
 236 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::FindFit(AliPHOSEmcRecPoint * emcRP, int * maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 237                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 238 {
 239   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 240   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 241   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 242
 243   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 244   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 245
 246
 247   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 248   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 249   gMinuit->SetFCN(AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 250                                          // To set the address of the minimization function
 251
 252   TList * toMinuit = new TList();
 253   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 254   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
 255
 256   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 257
 258   // filling initial values for fit parameters
 259   AliPHOSDigit * digit ;
 260
 261   Int_t ierflg  = 0;
 262   Int_t index   = 0 ;
 263   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 264
 265   Int_t iDigit ;
 266
 267   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 268
 269   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 270     digit = (AliPHOSDigit *) maxAt[iDigit];
 271
 272     Int_t relid[4] ;
 273     Float_t x = 0.;
 274     Float_t z = 0.;
 275     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 276     geom->RelPosInModule(relid, x, z) ;
 277
 278     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 279
 280     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 281     index++ ;
 282     if(ierflg != 0){
 283       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : x = " << x << endl ;
 284       return kFALSE;
 285     }
 286     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 287     index++ ;
 288     if(ierflg != 0){
 289       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : z = " << z << endl ;
 290       return kFALSE;
 291     }
 292     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 293     index++ ;
 294     if(ierflg != 0){
 295       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : energy = " << energy << endl ;
 296       return kFALSE;
 297     }
 298   }
 299
 300   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 301                       //  depends on it.
 302   Double_t p1 = 1.0 ;
 303   Double_t p2 = 0.0 ;
 304
 305   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 306   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 307   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 308   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 309
 310   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 311
 312   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 313     cout << "PHOS Unfolding>  Fit not converged, cluster abandoned "<< endl ;
 314     return kFALSE ;
 315   }
 316   for(index = 0; index < nPar; index++){
 317     Double_t err ;
 318     Double_t val ;
 319     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 320     fitparameters[index] = val ;
 321    }
 322
 323   delete toMinuit ;
 324   return kTRUE;
 325
 326 }
 327
 328 //____________________________________________________________________________
 329 void AliPHOSClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 330 {
 331   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 332   TString branchname = GetName() ;
 333   branchname.Remove(branchname.Index(Version())-1) ;
 334   AliPHOSDigitizer * dig = gime->Digitizer(branchname) ;
 335   fADCchanelEmc   = dig->GetEMCchannel() ;
 336   fADCpedestalEmc = dig->GetEMCpedestal();
 337
 338   fADCchanelCpv   = dig->GetCPVchannel() ;
 339   fADCpedestalCpv = dig->GetCPVpedestal() ;
 340
 341 }
 342 //____________________________________________________________________________
 343 void AliPHOSClusterizerv1::Init()
 344 {
 345   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 346   // Attach the Clusterizer task to the list of PHOS tasks
 347
 348   if ( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
 349     SetTitle("galice.root") ;
 350
 351   TString branchname = GetName() ;
 352   branchname.Remove(branchname.Index(Version())-1) ;
 353
 354   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(), branchname) ;
 355   if ( gime == 0 ) {
 356     cerr << "ERROR: AliPHOSClusterizerv1::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ;
 357     return ;
 358   }
 359
 360   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 361   fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
 362
 363   if(!gMinuit)
 364     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 365
 366   gime->PostClusterizer(this) ;
 367   // create a folder on the white board //YSAlice/WhiteBoard/RecPoints/PHOS/recpointsName
 368   gime->PostRecPoints(branchname ) ;
 369
 370   gime->PostDigits(branchname) ;
 371   gime->PostDigitizer(branchname) ;
 372
 373 }
 374
 375 //____________________________________________________________________________
 376 Int_t AliPHOSClusterizerv1::AreNeighbours(AliPHOSDigit * d1, AliPHOSDigit * d2)const
 377 {
 378   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 379   //                                       = 1 are neighbour
 380   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 381   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 382   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 383   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 384
 385   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ;
 386
 387   Int_t rv = 0 ;
 388
 389   Int_t relid1[4] ;
 390   geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 391
 392   Int_t relid2[4] ;
 393   geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 394
 395   if ( (relid1[0] == relid2[0]) && (relid1[1]==relid2[1]) ) { // inside the same PHOS module
 396     Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[2] - relid2[2] ) ;
 397     Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[3] - relid2[3] ) ;
 398
 399     if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 400       if((relid1[1] != 0) || (TMath::Abs(d1->GetTime() - d2->GetTime() ) < fEmcTimeGate))
 401       rv = 1 ;
 402     }
 403     else {
 404       if((relid2[2] > relid1[2]) && (relid2[3] > relid1[3]+1))
 405         rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 406     }
 407
 408   }
 409   else {
 410
 411     if( (relid1[0] < relid2[0]) || (relid1[1] != relid2[1]) )
 412       rv=2 ;
 413
 414   }
 415
 416   return rv ;
 417 }
 418
 419
 420 //____________________________________________________________________________
 421 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInEmc(AliPHOSDigit * digit) const
 422 {
 423   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
 424
 425   Bool_t rv = kFALSE ;
 426   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ;
 427
 428   Int_t relid[4] ;
 429   geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 430
 431   if ( relid[1] == 0  ) rv = kTRUE;
 432
 433   return rv ;
 434 }
 435
 436 //____________________________________________________________________________
 437 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInCpv(AliPHOSDigit * digit) const
 438 {
 439   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
 440
 441   Bool_t rv = kFALSE ;
 442   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ;
 443
 444   Int_t relid[4] ;
 445   geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 446
 447   if ( relid[1] != 0  ) rv = kTRUE;
 448
 449   return rv ;
 450 }
 451
 452 //____________________________________________________________________________
 453 void AliPHOSClusterizerv1::WriteRecPoints(Int_t event)
 454 {
 455
 456   // Creates new branches with given title
 457   // fills and writes into TreeR.
 458
 459   TString branchName(GetName() ) ;
 460   branchName.Remove(branchName.Index(Version())-1) ;
 461
 462   AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 463   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints(branchName) ;
 464   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints(branchName) ;
 465   TClonesArray * digits = gime->Digits(branchName) ;
 466
 467   Int_t index ;
 468   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties...
 469   for(index = 0; index < emcRecPoints->GetEntries(); index++)
 470     ((AliPHOSEmcRecPoint *)emcRecPoints->At(index))->EvalAll(fW0,digits) ;
 471
 472   emcRecPoints->Sort() ;
 473
 474   for(index = 0; index < emcRecPoints->GetEntries(); index++)
 475     ((AliPHOSEmcRecPoint *)emcRecPoints->At(index))->SetIndexInList(index) ;
 476
 477   emcRecPoints->Expand(emcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 478
 479   //Now the same for CPV
 480   for(index = 0; index < cpvRecPoints->GetEntries(); index++)
 481     ((AliPHOSRecPoint *)cpvRecPoints->At(index))->EvalAll(fW0CPV,digits)  ;
 482
 483   cpvRecPoints->Sort() ;
 484
 485   for(index = 0; index < cpvRecPoints->GetEntries(); index++)
 486     ((AliPHOSRecPoint *)cpvRecPoints->At(index))->SetIndexInList(index) ;
 487
 488   cpvRecPoints->Expand(cpvRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 489
 490   //Make branches in TreeR for RecPoints and Clusterizer
 491   char * filename = 0;
 492   if(gSystem->Getenv("CONFIG_SPLIT_FILE")!=0){   //generating file name
 493     filename = new char[strlen(gAlice->GetBaseFile())+20] ;
 494     sprintf(filename,"%s/PHOS.Reco.root",gAlice->GetBaseFile()) ;
 495   }
 496
 497   //Make new branches
 498   TDirectory *cwd = gDirectory;
 499
 500
 501   Int_t bufferSize = 32000 ;
 502   Int_t splitlevel = 0 ;
 503
 504   //First EMC
 505   TBranch * emcBranch = gAlice->TreeR()->Branch("PHOSEmcRP","TObjArray",&emcRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 506   emcBranch->SetTitle(branchName);
 507   if (filename) {
 508     emcBranch->SetFile(filename);
 509     TIter next( emcBranch->GetListOfBranches());
 510     TBranch * sb ;
 511     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 512       sb->SetFile(filename);
 513     }
 514
 515     cwd->cd();
 516   }
 517
 518   //Now CPV branch
 519   TBranch * cpvBranch = gAlice->TreeR()->Branch("PHOSCpvRP","TObjArray",&cpvRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 520   cpvBranch->SetTitle(branchName);
 521   if (filename) {
 522     cpvBranch->SetFile(filename);
 523     TIter next( cpvBranch->GetListOfBranches());
 524     TBranch * sb;
 525     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 526       sb->SetFile(filename);
 527     }
 528     cwd->cd();
 529   }
 530
 531   //And Finally  clusterizer branch
 532   AliPHOSClusterizerv1 * cl = (AliPHOSClusterizerv1*)gime->Clusterizer(branchName) ;
 533   TBranch * clusterizerBranch = gAlice->TreeR()->Branch("AliPHOSClusterizer","AliPHOSClusterizerv1",
 534                                               &cl,bufferSize,splitlevel);
 535   clusterizerBranch->SetTitle(branchName);
 536   if (filename) {
 537     clusterizerBranch->SetFile(filename);
 538     TIter next( clusterizerBranch->GetListOfBranches());
 539     TBranch * sb ;
 540     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 541       sb->SetFile(filename);
 542     }
 543     cwd->cd();
 544   }
 545   emcBranch        ->Fill() ;
 546   cpvBranch        ->Fill() ;
 547   clusterizerBranch->Fill() ;
 548
 549   gAlice->TreeR()->Write(0,kOverwrite) ;
 550
 551 }
 552
 553 //____________________________________________________________________________
 554 void AliPHOSClusterizerv1::MakeClusters()
 555 {
 556   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 557   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 558   TString branchName(GetName()) ;
 559   branchName.Remove(branchName.Index(Version())-1) ;
 560
 561   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 562
 563   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints(branchName) ;
 564   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints(branchName) ;
 565   emcRecPoints->Delete() ;
 566   cpvRecPoints->Delete() ;
 567
 568   TClonesArray * digits = gime->Digits(branchName) ;
 569   TClonesArray * digitsC =  (TClonesArray*)digits->Clone() ;
 570
 571
 572   // Clusterization starts
 573
 574   TIter nextdigit(digitsC) ;
 575   AliPHOSDigit * digit ;
 576   Bool_t notremoved = kTRUE ;
 577
 578   while ( (digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the list of digitsC
 579     AliPHOSRecPoint * clu = 0 ;
 580
 581     TArrayI clusterdigitslist(1500) ;
 582     Int_t index ;
 583
 584     if (( IsInEmc (digit) && Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) > fEmcClusteringThreshold  ) ||
 585         ( IsInCpv (digit) && Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) > fCpvClusteringThreshold  ) ) {
 586
 587       Int_t iDigitInCluster = 0 ;
 588
 589       if  ( IsInEmc(digit) ) {
 590         // start a new EMC RecPoint
 591         if(fNumberOfEmcClusters >= emcRecPoints->GetSize())
 592           emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters+1) ;
 593
 594         emcRecPoints->AddAt(new  AliPHOSEmcRecPoint(), fNumberOfEmcClusters) ;
 595         clu = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ;
 596         fNumberOfEmcClusters++ ;
 597         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId())) ;
 598         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList() ;
 599         iDigitInCluster++ ;
 600         digitsC->Remove(digit) ;
 601
 602       } else {
 603
 604         // start a new CPV cluster
 605         if(fNumberOfCpvClusters >= cpvRecPoints->GetSize())
 606           cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters+1);
 607
 608         cpvRecPoints->AddAt(new AliPHOSCpvRecPoint(), fNumberOfCpvClusters) ;
 609
 610         clu =  (AliPHOSCpvRecPoint *) cpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters)  ;
 611         fNumberOfCpvClusters++ ;
 612         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) ) ;
 613         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList()  ;
 614         iDigitInCluster++ ;
 615         digitsC->Remove(digit) ;
 616         nextdigit.Reset() ;
 617
 618         // Here we remove remaining EMC digits, which cannot make a cluster
 619
 620         if( notremoved ) {
 621           while( ( digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit() ) ) {
 622             if( IsInEmc(digit) )
 623               digitsC->Remove(digit) ;
 624             else
 625               break ;
 626           }
 627           notremoved = kFALSE ;
 628         }
 629
 630       } // else
 631
 632       nextdigit.Reset() ;
 633
 634       AliPHOSDigit * digitN ;
 635       index = 0 ;
 636       while (index < iDigitInCluster){ // scan over digits already in cluster
 637         digit =  (AliPHOSDigit*)digits->At(clusterdigitslist[index])  ;
 638         index++ ;
 639         while ( (digitN = (AliPHOSDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the reduced list of digits
 640           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 641           switch (ineb ) {
 642           case 0 :   // not a neighbour
 643             break ;
 644           case 1 :   // are neighbours
 645             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp(), digitN->GetId() ) ) ;
 646             clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 647             iDigitInCluster++ ;
 648             digitsC->Remove(digitN) ;
 649             break ;
 650           case 2 :   // too far from each other
 651             goto endofloop;
 652           } // switch
 653
 654         } // while digitN
 655
 656       endofloop: ;
 657         nextdigit.Reset() ;
 658
 659       } // loop over cluster
 660
 661     } // energy theshold
 662
 663
 664   } // while digit
 665
 666   delete digitsC ;
 667
 668 }
 669
 670 //____________________________________________________________________________
 671 void AliPHOSClusterizerv1::MakeUnfolding()
 672 {
 673   // Unfolds clusters using the shape of an ElectroMagnetic shower
 674   // Performs unfolding of all EMC/CPV clusters
 675
 676   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 677
 678   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 679   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 680   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 681   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 682
 683   // Unfold first EMC clusters
 684   if(fNumberOfEmcClusters > 0){
 685
 686     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
 687
 688     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfEmcClusters ;
 689     Int_t index ;
 690     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
 691
 692       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcRecPoints->At(index) ;
 693       if(emcRecPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 694         break ;
 695
 696       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 697       Int_t * maxAt = new Int_t[nMultipl] ;
 698       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 699       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fEmcLocMaxCut,digits) ;
 700
 701       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 702         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 703         emcRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 704         emcRecPoints->Compress() ;
 705         index-- ;
 706         fNumberOfEmcClusters -- ;
 707         numberofNotUnfolded-- ;
 708       }
 709
 710       delete[] maxAt ;
 711       delete[] maxAtEnergy ;
 712     }
 713   }
 714   // Unfolding of EMC clusters finished
 715
 716
 717   // Unfold now CPV clusters
 718   if(fNumberOfCpvClusters > 0){
 719
 720     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
 721
 722     Int_t numberofCpvNotUnfolded = fNumberOfCpvClusters ;
 723     Int_t index ;
 724     for(index = 0 ; index < numberofCpvNotUnfolded ; index++){
 725
 726       AliPHOSRecPoint * recPoint = (AliPHOSRecPoint *) cpvRecPoints->At(index) ;
 727
 728       if(recPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 729         break ;
 730
 731       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = (AliPHOSEmcRecPoint*) recPoint ;
 732
 733       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 734       Int_t * maxAt = new Int_t[nMultipl] ;
 735       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 736       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fCpvLocMaxCut,digits) ;
 737
 738       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 739         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 740         cpvRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 741         cpvRecPoints->Compress() ;
 742         index-- ;
 743         numberofCpvNotUnfolded-- ;
 744         fNumberOfCpvClusters-- ;
 745       }
 746
 747       delete[] maxAt ;
 748       delete[] maxAtEnergy ;
 749     }
 750   }
 751   //Unfolding of Cpv clusters finished
 752
 753 }
 754
 755 //____________________________________________________________________________
 756 Double_t  AliPHOSClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 757 {
 758   // Shape of the shower (see PHOS TDR)
 759   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 760
 761   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 762   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 763   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 764   return shape ;
 765 }
 766
 767 //____________________________________________________________________________
 768 void  AliPHOSClusterizerv1::UnfoldCluster(AliPHOSEmcRecPoint * iniEmc,
 769                                                  Int_t nMax,
 770                                                  int * maxAt,
 771                                                  Float_t * maxAtEnergy)
 772 {
 773   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 774
 775   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 776   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 777   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 778   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 779   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 780
 781   Int_t nPar = 3 * nMax ;
 782   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
 783
 784   Bool_t rv = FindFit(iniEmc, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
 785   if( !rv ) {
 786     // Fit failed, return and remove cluster
 787     delete[] fitparameters ;
 788     return ;
 789   }
 790
 791   // create ufolded rec points and fill them with new energy lists
 792   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with fit (without fluctuations): efit[]
 793   // and later correct this number in acordance with actual energy deposition
 794
 795   Int_t nDigits = iniEmc->GetMultiplicity() ;
 796   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
 797   Float_t xDigit=0.,zDigit=0.,distance=0. ;
 798   Float_t xpar=0.,zpar=0.,epar=0.  ;
 799   Int_t relid[4] ;
 800   AliPHOSDigit * digit = 0 ;
 801   Int_t * emcDigits = iniEmc->GetDigitsList() ;
 802
 803   Int_t iparam ;
 804   Int_t iDigit ;
 805   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 806     digit = (AliPHOSDigit*) digits->At(emcDigits[iDigit] ) ;
 807     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 808     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 809     efit[iDigit] = 0;
 810
 811     iparam = 0 ;
 812     while(iparam < nPar ){
 813       xpar = fitparameters[iparam] ;
 814       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 815       epar = fitparameters[iparam+2] ;
 816       iparam += 3 ;
 817       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 818       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 819       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(distance) ;
 820     }
 821   }
 822
 823
 824   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
 825   // so that energy deposited in each cell is distributed betwin new clusters proportionally
 826   // to its contribution to efit
 827
 828   Float_t * emcEnergies = iniEmc->GetEnergiesList() ;
 829   Float_t ratio ;
 830
 831   iparam = 0 ;
 832   while(iparam < nPar ){
 833     xpar = fitparameters[iparam] ;
 834     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 835     epar = fitparameters[iparam+2] ;
 836     iparam += 3 ;
 837
 838     AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = 0 ;
 839
 840     if(iniEmc->IsEmc()){ //create new entries in fEmcRecPoints...
 841
 842       if(fNumberOfEmcClusters >= emcRecPoints->GetSize())
 843         emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters) ;
 844
 845       (*emcRecPoints)[fNumberOfEmcClusters] = new AliPHOSEmcRecPoint() ;
 846       emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters);
 847       fNumberOfEmcClusters++ ;
 848     }
 849     else{//create new entries in fCpvRecPoints
 850       if(fNumberOfCpvClusters >= cpvRecPoints->GetSize())
 851         cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters) ;
 852
 853       (*cpvRecPoints)[fNumberOfCpvClusters] = new AliPHOSCpvRecPoint() ;
 854       emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) cpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters);
 855       fNumberOfCpvClusters++ ;
 856     }
 857
 858     Float_t eDigit ;
 859     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 860       digit = (AliPHOSDigit*) digits->At( emcDigits[iDigit] ) ;
 861       geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 862       geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 863       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 864       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 865       ratio = epar * ShowerShape(distance) / efit[iDigit] ;
 866       eDigit = emcEnergies[iDigit] * ratio ;
 867       emcRP->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
 868     }
 869   }
 870
 871   delete[] fitparameters ;
 872   delete[] efit ;
 873
 874 }
 875
 876 //_____________________________________________________________________________
 877 void AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad, Double_t & fret, Double_t * x, Int_t iflag)
 878 {
 879   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 880   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 881
 882
 883   TList * toMinuit = (TList*) gMinuit->GetObjectFit() ;
 884
 885   AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint*) toMinuit->At(0)  ;
 886   TClonesArray * digits = (TClonesArray*)toMinuit->At(1)  ;
 887
 888
 889
 890   //  AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) gMinuit->GetObjectFit() ; // EmcRecPoint to fit
 891
 892   Int_t * emcDigits     = emcRP->GetDigitsList() ;
 893
 894   Int_t nOdigits = emcRP->GetDigitsMultiplicity() ;
 895
 896   Float_t * emcEnergies = emcRP->GetEnergiesList() ;
 897
 898   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ;
 899   fret = 0. ;
 900   Int_t iparam ;
 901
 902   if(iflag == 2)
 903     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)
 904       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
 905
 906   Double_t efit ;
 907
 908   AliPHOSDigit * digit ;
 909   Int_t iDigit ;
 910
 911   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOdigits ; iDigit++) {
 912
 913     digit = (AliPHOSDigit*) digits->At( emcDigits[iDigit] ) ;
 914
 915     Int_t relid[4] ;
 916     Float_t xDigit ;
 917     Float_t zDigit ;
 918
 919     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 920
 921     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 922
 923      if(iflag == 2){  // calculate gradient
 924        Int_t iParam = 0 ;
 925        efit = 0 ;
 926        while(iParam < nPar ){
 927          Double_t distance = (xDigit - x[iParam]) * (xDigit - x[iParam]) ;
 928          iParam++ ;
 929          distance += (zDigit - x[iParam]) * (zDigit - x[iParam]) ;
 930          distance = TMath::Sqrt( distance ) ;
 931          iParam++ ;
 932          efit += x[iParam] * ShowerShape(distance) ;
 933          iParam++ ;
 934        }
 935        Double_t sum = 2. * (efit - emcEnergies[iDigit]) / emcEnergies[iDigit] ; // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 936        iParam = 0 ;
 937        while(iParam < nPar ){
 938          Double_t xpar = x[iParam] ;
 939          Double_t zpar = x[iParam+1] ;
 940          Double_t epar = x[iParam+2] ;
 941          Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
 942          Double_t shape = sum * ShowerShape(dr) ;
 943          Double_t r4 = dr*dr*dr*dr ;
 944          Double_t r295 = TMath::Power(dr,2.95) ;
 945          Double_t deriv =-4. * dr*dr * ( 2.32 / ( (2.32 + 0.26 * r4) * (2.32 + 0.26 * r4) ) +
 946                                          0.0316 * (1. + 0.0171 * r295) / ( ( 1. + 0.0652 * r295) * (1. + 0.0652 * r295) ) ) ;
 947
 948          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x
 949          iParam++ ;
 950          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z
 951          iParam++ ;
 952          Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy
 953          iParam++ ;
 954        }
 955      }
 956      efit = 0;
 957      iparam = 0 ;
 958
 959      while(iparam < nPar ){
 960        Double_t xpar = x[iparam] ;
 961        Double_t zpar = x[iparam+1] ;
 962        Double_t epar = x[iparam+2] ;
 963        iparam += 3 ;
 964        Double_t distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 965        distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 966        efit += epar * ShowerShape(distance) ;
 967      }
 968
 969      fret += (efit-emcEnergies[iDigit])*(efit-emcEnergies[iDigit])/emcEnergies[iDigit] ;
 970      // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 971   }
 972
 973 }
 974
 975 //____________________________________________________________________________
 976 void AliPHOSClusterizerv1::Print(Option_t * option)const
 977 {
 978   // Print clusterizer parameters
 979
 980   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
 981
 982     // Print parameters
 983
 984     TString taskName(GetName()) ;
 985     taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
 986
 987     cout << "---------------"<< taskName.Data() << " " << GetTitle()<< "-----------" << endl
 988          << "Clusterizing digits from the file: " << fHeaderFileName.Data() << endl
 989          << "                           Branch: " << fDigitsBranchTitle.Data() << endl
 990          << endl
 991          << "                       EMC Clustering threshold = " << fEmcClusteringThreshold << endl
 992          << "                       EMC Local Maximum cut    = " << fEmcLocMaxCut << endl
 993          << "                       EMC Logarothmic weight   = " << fW0 << endl
 994          << endl
 995          << "                       CPV Clustering threshold = " << fCpvClusteringThreshold << endl
 996          << "                       CPV Local Maximum cut    = " << fCpvLocMaxCut << endl
 997        << "                       CPV Logarothmic weight   = " << fW0CPV << endl
 998          << endl ;
 999     if(fToUnfold)
1000       cout << " Unfolding on " << endl ;
1001     else
1002       cout << " Unfolding off " << endl ;
1003
1004     cout << "------------------------------------------------------------------" <<endl ;
1005   }
1006   else
1007     cout << " AliPHOSClusterizerv1 not initialized " << endl ;
1008 }
1009 //____________________________________________________________________________
1010 void AliPHOSClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
1011 {
1012   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliPHOSClusterizer
1013
1014   TObjArray * emcRecPoints = AliPHOSGetter::GetInstance()->EmcRecPoints() ;
1015   TObjArray * cpvRecPoints = AliPHOSGetter::GetInstance()->CpvRecPoints() ;
1016
1017   cout << "AliPHOSClusterizerv1: : event "<<gAlice->GetEvNumber() << endl ;
1018   cout << "       Found "<< emcRecPoints->GetEntriesFast() << " EMC Rec Points and "
1019            << cpvRecPoints->GetEntriesFast() << " CPV RecPoints" << endl ;
1020
1021   fRecPointsInRun +=  emcRecPoints->GetEntriesFast() ;
1022   fRecPointsInRun +=  cpvRecPoints->GetEntriesFast() ;
1023
1024   if(strstr(option,"all")) {
1025     cout << "EMC clusters " << endl ;
1026     cout << " Index  Ene(MeV)   Multi  Module     X      Y      Z    Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list "      <<  endl;
1027
1028     Int_t index ;
1029     for (index = 0 ; index < emcRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1030       AliPHOSEmcRecPoint * rp = (AliPHOSEmcRecPoint * )emcRecPoints->At(index) ;
1031       TVector3  locpos;
1032       rp->GetLocalPosition(locpos);
1033       Float_t lambda[2];
1034       rp->GetElipsAxis(lambda);
1035       Int_t * primaries;
1036       Int_t nprimaries;
1037       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1038
1039       cout << setw(4) << rp->GetIndexInList() << "   "
1040            << setw(7) << setprecision(3) << rp->GetEnergy() << "           "
1041            << setw(3) <<         rp->GetMultiplicity() << "  "
1042            << setw(1) <<              rp->GetPHOSMod() << "  "
1043            << setw(6) << setprecision(2) << locpos.X() << "  "
1044            << setw(6) << setprecision(2) << locpos.Y() << "  "
1045            << setw(6) << setprecision(2) << locpos.Z() << "  "
1046            << setw(4) << setprecision(2) << lambda[0]  << "  "
1047            << setw(4) << setprecision(2) << lambda[1]  << "  "
1048            << setw(2) << nprimaries << "  " ;
1049
1050       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
1051         cout << setw(4) <<   primaries[iprimary] << "  "  ;
1052       cout << endl ;
1053     }
1054
1055     //Now plot CPV recPoints
1056     cout << "EMC clusters " << endl ;
1057     cout << "  Index    "
1058          << "  Multi    "
1059          << "  Module   "
1060          << "    X      "
1061          << "    Y      "
1062          << "    Z      "
1063          << " # of prim "
1064          << " Primaries list "      <<  endl;
1065
1066     for (index = 0 ; index < cpvRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1067       AliPHOSRecPoint * rp = (AliPHOSRecPoint * )cpvRecPoints->At(index) ;
1068       cout << setw(6) << rp->GetIndexInList() << "     ";
1069       cout << setw(6) << rp->GetPHOSMod()     << "        CPV     ";
1070
1071       TVector3  locpos;
1072       rp->GetLocalPosition(locpos);
1073       cout << setw(6) <<  locpos.X()          << "     ";
1074       cout << setw(6) <<  locpos.Y()          << "     ";
1075       cout << setw(6) <<  locpos.Z()          << "     ";
1076
1077       Int_t * primaries;
1078       Int_t nprimaries ;
1079       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1080       cout << setw(6) <<    nprimaries         << "     ";
1081
1082       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
1083         cout << setw(4)  <<  primaries[iprimary] << " ";
1084       cout << endl;
1085     }
1086
1087
1088     cout << "-----------------------------------------------------------------------"<<endl ;
1089   }
1090 }
1091