PHOS/AliPHOSClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 /* History of cvs commits:
  19  *
  20  * $Log$
  21  * Revision 1.87  2005/11/22 08:46:43  kharlov
  22  * Updated to new CDB (Boris Polichtchouk)
  23  *
  24  * Revision 1.86  2005/11/14 21:52:43  hristov
  25  * Coding conventions
  26  *
  27  * Revision 1.85  2005/09/27 16:08:08  hristov
  28  * New version of CDB storage framework (A.Colla)
  29  *
  30  * Revision 1.84  2005/09/21 10:02:47  kharlov
  31  * Reading calibration from CDB (Boris Polichtchouk)
  32  *
  33  * Revision 1.82  2005/09/02 15:43:13  kharlov
  34  * Add comments in GetCalibrationParameters and Calibrate
  35  *
  36  * Revision 1.81  2005/09/02 14:32:07  kharlov
  37  * Calibration of raw data
  38  *
  39  * Revision 1.80  2005/08/24 15:31:36  kharlov
  40  * Setting raw digits flag
  41  *
  42  * Revision 1.79  2005/07/25 15:53:53  kharlov
  43  * Read raw data
  44  *
  45  * Revision 1.78  2005/05/28 14:19:04  schutz
  46  * Compilation warnings fixed by T.P.
  47  *
  48  */
  49
  50 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  51 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  52 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  53 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  54 //  Results are stored in TreeR#, branches PHOSEmcRP (EMC recPoints),
  55 //  PHOSCpvRP (CPV RecPoints) and AliPHOSClusterizer (Clusterizer with all
  56 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  57 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  58 //  standalone mode.
  59 // Use Case:
  60 //  root [0] AliPHOSClusterizerv1 * cl = new AliPHOSClusterizerv1("galice.root", "recpointsname", "digitsname")
  61 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  62 //               // reads gAlice from header file "galice.root", uses digits stored in the branch names "digitsname" (default = "Default")
  63 //               // and saves recpoints in branch named "recpointsname" (default = "digitsname")
  64 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  65 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  66 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  67 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  68 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  69 //               //sets another title four output branches
  70 //  root [4] cl->SetEmcLocalMaxCut(0.03)
  71 //               //set clusterization parameters
  72 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  73 //               //once more finds RecPoints options are
  74 //               // deb - print number of found rec points
  75 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  76 //               // time - print benchmarking results
  77
  78 // --- ROOT system ---
  79
  80 #include "TMath.h"
  81 #include "TMinuit.h"
  82 #include "TTree.h"
  83 #include "TBenchmark.h"
  84
  85 // --- Standard library ---
  86
  87 // --- AliRoot header files ---
  88 #include "AliLog.h"
  89 #include "AliPHOSGetter.h"
  90 #include "AliPHOSGeometry.h"
  91 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
  92 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
  93 #include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
  94 #include "AliPHOSDigit.h"
  95 #include "AliPHOSDigitizer.h"
  96 #include "AliPHOSCalibrationDB.h"
  97 #include "AliCDBManager.h"
  98 #include "AliCDBStorage.h"
  99 #include "AliCDBEntry.h"
 100
 101 ClassImp(AliPHOSClusterizerv1)
 102
 103 //____________________________________________________________________________
 104   AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1() : AliPHOSClusterizer()
 105 {
 106   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
 107
 108   InitParameters() ;
 109   fDefaultInit = kTRUE ;
 110 }
 111
 112 //____________________________________________________________________________
 113 AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1(const TString alirunFileName, const TString eventFolderName)
 114 :AliPHOSClusterizer(alirunFileName, eventFolderName)
 115 {
 116   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
 117
 118   InitParameters() ;
 119   Init() ;
 120   fDefaultInit = kFALSE ;
 121 }
 122
 123 //____________________________________________________________________________
 124   AliPHOSClusterizerv1::~AliPHOSClusterizerv1()
 125 {
 126   // dtor
 127
 128 }
 129 //____________________________________________________________________________
 130 const TString AliPHOSClusterizerv1::BranchName() const
 131 {
 132   return GetName();
 133 }
 134
 135 //____________________________________________________________________________
 136 Float_t  AliPHOSClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp, Int_t absId)
 137 {
 138   // Convert digitized amplitude into energy.
 139   // Calibration parameters are taken from calibration data base for raw data,
 140   // or from digitizer parameters for simulated data.
 141
 142   if(fCalibData){
 143     Int_t relId[4];
 144     AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::Instance();
 145     gime->PHOSGeometry()->AbsToRelNumbering(absId,relId) ;
 146     Int_t   module = relId[0];
 147     Int_t   column = relId[3];
 148     Int_t   row    = relId[2];
 149     if(absId <= fEmcCrystals) { //calibrate as EMC
 150       fADCchanelEmc   = fCalibData->GetADCchannelEmc (module,column,row);
 151       fADCpedestalEmc = fCalibData->GetADCpedestalEmc(module,column,row);
 152       return fADCpedestalEmc + amp*fADCchanelEmc ;
 153     }
 154     else //calibrate as CPV, not implemented yet
 155       return 0;
 156   }
 157   else{ //simulation
 158     if(absId <= fEmcCrystals) //calibrate as EMC
 159       return fADCpedestalEmc + amp*fADCchanelEmc ;
 160     else //calibrate as CPV
 161       return fADCpedestalCpv+ amp*fADCchanelCpv ;
 162   }
 163 }
 164
 165 //____________________________________________________________________________
 166 void AliPHOSClusterizerv1::Exec(Option_t *option)
 167 {
 168   // Steering method to perform clusterization for events
 169   // in the range from fFirstEvent to fLastEvent.
 170   // This range is optionally set by SetEventRange().
 171   // if fLastEvent=-1 (by default), then process events until the end.
 172
 173   if(strstr(option,"tim"))
 174     gBenchmark->Start("PHOSClusterizer");
 175
 176   if(strstr(option,"print")) {
 177     Print() ;
 178     return ;
 179   }
 180
 181   GetCalibrationParameters() ;
 182
 183   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 184   if (fRawReader == 0)
 185     gime->SetRawDigits(kFALSE);
 186   else
 187     gime->SetRawDigits(kTRUE);
 188
 189   if (fLastEvent == -1)
 190     fLastEvent = gime->MaxEvent() - 1 ;
 191   else
 192     fLastEvent = TMath::Min(fFirstEvent, gime->MaxEvent()); // one event at the time
 193   Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
 194
 195   Int_t ievent ;
 196   for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
 197     if (fRawReader == 0)
 198       gime->Event(ievent    ,"D"); // Read digits from simulated data
 199     else
 200       gime->Event(fRawReader,"W"); // Read digits from raw data
 201
 202     fNumberOfEmcClusters  = fNumberOfCpvClusters  = 0 ;
 203
 204     MakeClusters() ;
 205
 206     if(fToUnfold)
 207       MakeUnfolding() ;
 208
 209     WriteRecPoints();
 210
 211     if(strstr(option,"deb"))
 212       PrintRecPoints(option) ;
 213
 214     //increment the total number of recpoints per run
 215     fRecPointsInRun += gime->EmcRecPoints()->GetEntriesFast() ;
 216     fRecPointsInRun += gime->CpvRecPoints()->GetEntriesFast() ;
 217     }
 218
 219   if(fWrite) //do not unload in "on flight" mode
 220     Unload();
 221
 222   if(strstr(option,"tim")){
 223     gBenchmark->Stop("PHOSClusterizer");
 224     AliInfo(Form("took %f seconds for Clusterizing %f seconds per event \n",
 225          gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer"),
 226          gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer")/nEvents )) ;
 227   }
 228 }
 229
 230 //____________________________________________________________________________
 231 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::FindFit(AliPHOSEmcRecPoint * emcRP, AliPHOSDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 232                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 233 {
 234   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 235   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 236   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 237
 238
 239   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 240   TClonesArray * digits = gime->Digits();
 241
 242
 243   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 244   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 245   gMinuit->SetFCN(AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 246                                          // To set the address of the minimization function
 247
 248   TList * toMinuit = new TList();
 249   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 250   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
 251
 252   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 253
 254   // filling initial values for fit parameters
 255   AliPHOSDigit * digit ;
 256
 257   Int_t ierflg  = 0;
 258   Int_t index   = 0 ;
 259   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 260
 261   Int_t iDigit ;
 262
 263   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 264
 265   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 266     digit = maxAt[iDigit];
 267
 268     Int_t relid[4] ;
 269     Float_t x = 0.;
 270     Float_t z = 0.;
 271     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 272     geom->RelPosInModule(relid, x, z) ;
 273
 274     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 275
 276     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 277     index++ ;
 278     if(ierflg != 0){
 279       Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : x = %f\n", x ) ;
 280       return kFALSE;
 281     }
 282     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 283     index++ ;
 284     if(ierflg != 0){
 285        Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : z =%f\n", z ) ;
 286       return kFALSE;
 287     }
 288     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 289     index++ ;
 290     if(ierflg != 0){
 291       Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : energy = %f\n", energy ) ;
 292       return kFALSE;
 293     }
 294   }
 295
 296   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 297                       //  depends on it.
 298   Double_t p1 = 1.0 ;
 299   Double_t p2 = 0.0 ;
 300
 301   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 302   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 303   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 304   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 305
 306   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 307
 308   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 309     Warning("FindFit", "PHOS Unfolding fit not converged, cluster abandoned\n" );
 310     return kFALSE ;
 311   }
 312   for(index = 0; index < nPar; index++){
 313     Double_t err ;
 314     Double_t val ;
 315     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 316     fitparameters[index] = val ;
 317    }
 318
 319   delete toMinuit ;
 320   return kTRUE;
 321
 322 }
 323
 324 //____________________________________________________________________________
 325 void AliPHOSClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 326 {
 327   // Set calibration parameters:
 328   // if calibration database exists, they are read from database,
 329   // otherwise, they are taken from digitizer.
 330   //
 331   // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction, for example:
 332   // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
 333
 334   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 335
 336   if(AliCDBManager::Instance()->IsDefaultStorageSet()){
 337     AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*) AliCDBManager::Instance()->GetDefaultStorage()
 338       ->Get("PHOS/GainFactors_and_Pedestals/Calibration",gAlice->GetRunNumber());
 339     if (entry) fCalibData = (AliPHOSCalibData*) entry->GetObject();
 340   }
 341
 342
 343   if(!fCalibData)
 344     {
 345       if ( !gime->Digitizer() )
 346         gime->LoadDigitizer();
 347       AliPHOSDigitizer * dig = gime->Digitizer();
 348       fADCchanelEmc   = dig->GetEMCchannel() ;
 349       fADCpedestalEmc = dig->GetEMCpedestal();
 350
 351       fADCchanelCpv   = dig->GetCPVchannel() ;
 352       fADCpedestalCpv = dig->GetCPVpedestal() ;
 353     }
 354 }
 355
 356 //____________________________________________________________________________
 357 void AliPHOSClusterizerv1::Init()
 358 {
 359   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 360   // Attach the Clusterizer task to the list of PHOS tasks
 361
 362   AliPHOSGetter* gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 363   if(!gime)
 364     gime = AliPHOSGetter::Instance(GetTitle(), fEventFolderName.Data());
 365
 366   AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry();
 367
 368   fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
 369
 370   if(!gMinuit)
 371     gMinuit = new TMinuit(100);
 372
 373   if ( !gime->Clusterizer() ) {
 374     gime->PostClusterizer(this);
 375   }
 376 }
 377
 378 //____________________________________________________________________________
 379 void AliPHOSClusterizerv1::InitParameters()
 380 {
 381
 382   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
 383   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
 384
 385   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
 386   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;
 387
 388   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
 389   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
 390
 391   fEmcMinE                 = 0.01 ;
 392   fCpvMinE                 = 0.0  ;
 393
 394   fW0                      = 4.5 ;
 395   fW0CPV                   = 4.0 ;
 396
 397   fEmcTimeGate             = 1.e-8 ;
 398
 399   fToUnfold                = kTRUE ;
 400
 401   fRecPointsInRun          = 0 ;
 402
 403   fWrite                   = kTRUE ;
 404
 405   fCalibData               = 0 ;
 406
 407   SetEventRange(0,-1) ;
 408 }
 409
 410 //____________________________________________________________________________
 411 Int_t AliPHOSClusterizerv1::AreNeighbours(AliPHOSDigit * d1, AliPHOSDigit * d2)const
 412 {
 413   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 414   //                                       = 1 are neighbour
 415   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 416   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 417   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 418   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 419
 420   AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 421
 422   Int_t rv = 0 ;
 423
 424   Int_t relid1[4] ;
 425   geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 426
 427   Int_t relid2[4] ;
 428   geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 429
 430   if ( (relid1[0] == relid2[0]) && (relid1[1]==relid2[1]) ) { // inside the same PHOS module
 431     Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[2] - relid2[2] ) ;
 432     Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[3] - relid2[3] ) ;
 433
 434     if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 435       if((relid1[1] != 0) || (TMath::Abs(d1->GetTime() - d2->GetTime() ) < fEmcTimeGate))
 436       rv = 1 ;
 437     }
 438     else {
 439       if((relid2[2] > relid1[2]) && (relid2[3] > relid1[3]+1))
 440         rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 441     }
 442
 443   }
 444   else {
 445
 446     if( (relid1[0] < relid2[0]) || (relid1[1] != relid2[1]) )
 447       rv=2 ;
 448
 449   }
 450
 451   return rv ;
 452 }
 453 //____________________________________________________________________________
 454 void AliPHOSClusterizerv1::CleanDigits(TClonesArray * digits){
 455   for(Int_t i=0; i<digits->GetEntriesFast(); i++){
 456     AliPHOSDigit * digit = static_cast<AliPHOSDigit*>(digits->At(i)) ;
 457     Float_t cut = IsInEmc(digit) ? fEmcMinE : fCpvMinE ;
 458     if(Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) < cut)
 459       digits->RemoveAt(i) ;
 460   }
 461   digits->Compress() ;
 462   for (Int_t i = 0 ; i < digits->GetEntriesFast() ; i++) {
 463     AliPHOSDigit *digit = static_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ;
 464     digit->SetIndexInList(i) ;
 465   }
 466
 467 }
 468 //____________________________________________________________________________
 469 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInEmc(AliPHOSDigit * digit) const
 470 {
 471   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
 472
 473   Bool_t rv = kFALSE ;
 474   AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 475
 476   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 477
 478   if(digit->GetId() <= nEMC )   rv = kTRUE;
 479
 480   return rv ;
 481 }
 482
 483 //____________________________________________________________________________
 484 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInCpv(AliPHOSDigit * digit) const
 485 {
 486   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
 487
 488   Bool_t rv = kFALSE ;
 489
 490   AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 491
 492   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 493
 494   if(digit->GetId() > nEMC )   rv = kTRUE;
 495
 496   return rv ;
 497 }
 498
 499 //____________________________________________________________________________
 500 void AliPHOSClusterizerv1::Unload()
 501 {
 502   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 503   gime->PhosLoader()->UnloadDigits() ;
 504   gime->PhosLoader()->UnloadRecPoints() ;
 505 }
 506
 507 //____________________________________________________________________________
 508 void AliPHOSClusterizerv1::WriteRecPoints()
 509 {
 510
 511   // Creates new branches with given title
 512   // fills and writes into TreeR.
 513
 514   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 515
 516   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 517   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 518   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 519
 520
 521   Int_t index ;
 522   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties..
 523   Int_t nEmc = emcRecPoints->GetEntriesFast();
 524   for(index = 0; index < nEmc; index++){
 525     AliPHOSEmcRecPoint * rp = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(index) );
 526     rp->Purify(fEmcMinE) ;
 527     if(rp->GetMultiplicity()>0.) //If this RP is not empty
 528       rp->EvalAll(fW0,digits) ;
 529     else{
 530       emcRecPoints->RemoveAt(index) ;
 531       delete rp ;
 532     }
 533   }
 534   emcRecPoints->Compress() ;
 535   emcRecPoints->Sort() ;
 536   //  emcRecPoints->Expand(emcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 537   for(index = 0; index < emcRecPoints->GetEntries(); index++){
 538     dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(index) )->SetIndexInList(index) ;
 539   }
 540
 541   //Now the same for CPV
 542   for(index = 0; index < cpvRecPoints->GetEntries(); index++){
 543     AliPHOSCpvRecPoint * rp = dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( cpvRecPoints->At(index) );
 544     rp->EvalAll(fW0CPV,digits) ;
 545   }
 546   cpvRecPoints->Sort() ;
 547
 548   for(index = 0; index < cpvRecPoints->GetEntries(); index++)
 549     dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( cpvRecPoints->At(index) )->SetIndexInList(index) ;
 550
 551   cpvRecPoints->Expand(cpvRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 552
 553   if(fWrite){ //We write TreeR
 554     TTree * treeR = gime->TreeR();
 555
 556     Int_t bufferSize = 32000 ;
 557     Int_t splitlevel = 0 ;
 558
 559     //First EMC
 560     TBranch * emcBranch = treeR->Branch("PHOSEmcRP","TObjArray",&emcRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 561     emcBranch->SetTitle(BranchName());
 562
 563     //Now CPV branch
 564     TBranch * cpvBranch = treeR->Branch("PHOSCpvRP","TObjArray",&cpvRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 565     cpvBranch->SetTitle(BranchName());
 566
 567     emcBranch        ->Fill() ;
 568     cpvBranch        ->Fill() ;
 569
 570     gime->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 571     gime->WriteClusterizer("OVERWRITE");
 572   }
 573 }
 574
 575 //____________________________________________________________________________
 576 void AliPHOSClusterizerv1::MakeClusters()
 577 {
 578   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 579   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 580
 581
 582   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 583
 584   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 585   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 586
 587   emcRecPoints->Delete() ;
 588   cpvRecPoints->Delete() ;
 589
 590   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 591
 592   //Remove digits below threshold
 593   CleanDigits(digits) ;
 594
 595
 596   TClonesArray * digitsC =  static_cast<TClonesArray*>( digits->Clone() ) ;
 597
 598
 599   // Clusterization starts
 600
 601   TIter nextdigit(digitsC) ;
 602   AliPHOSDigit * digit ;
 603   Bool_t notremoved = kTRUE ;
 604
 605   while ( (digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit()) ) ) { // scan over the list of digitsC
 606
 607
 608     AliPHOSRecPoint * clu = 0 ;
 609
 610     TArrayI clusterdigitslist(1500) ;
 611     Int_t index ;
 612
 613     if (( IsInEmc (digit) && Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) > fEmcClusteringThreshold  ) ||
 614         ( IsInCpv (digit) && Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) > fCpvClusteringThreshold  ) ) {
 615       Int_t iDigitInCluster = 0 ;
 616
 617       if  ( IsInEmc(digit) ) {
 618         // start a new EMC RecPoint
 619         if(fNumberOfEmcClusters >= emcRecPoints->GetSize())
 620           emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters+1) ;
 621
 622         emcRecPoints->AddAt(new  AliPHOSEmcRecPoint(""), fNumberOfEmcClusters) ;
 623         clu = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ) ;
 624           fNumberOfEmcClusters++ ;
 625         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId())) ;
 626         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList() ;
 627         iDigitInCluster++ ;
 628         digitsC->Remove(digit) ;
 629
 630       } else {
 631
 632         // start a new CPV cluster
 633         if(fNumberOfCpvClusters >= cpvRecPoints->GetSize())
 634           cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters+1);
 635
 636         cpvRecPoints->AddAt(new AliPHOSCpvRecPoint(""), fNumberOfCpvClusters) ;
 637
 638         clu =  dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( cpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters) ) ;
 639         fNumberOfCpvClusters++ ;
 640         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) ) ;
 641         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList()  ;
 642         iDigitInCluster++ ;
 643         digitsC->Remove(digit) ;
 644         nextdigit.Reset() ;
 645
 646         // Here we remove remaining EMC digits, which cannot make a cluster
 647
 648         if( notremoved ) {
 649           while( ( digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit() ) ) ) {
 650             if( IsInEmc(digit) )
 651               digitsC->Remove(digit) ;
 652             else
 653               break ;
 654           }
 655           notremoved = kFALSE ;
 656         }
 657
 658       } // else
 659
 660       nextdigit.Reset() ;
 661
 662       AliPHOSDigit * digitN ;
 663       index = 0 ;
 664       while (index < iDigitInCluster){ // scan over digits already in cluster
 665         digit =  dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(clusterdigitslist[index]) )  ;
 666         index++ ;
 667         while ( (digitN = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit() ) ) ) { // scan over the reduced list of digits
 668           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 669           switch (ineb ) {
 670           case 0 :   // not a neighbour
 671             break ;
 672           case 1 :   // are neighbours
 673             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp(), digitN->GetId() ) ) ;
 674             clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 675             iDigitInCluster++ ;
 676             digitsC->Remove(digitN) ;
 677             break ;
 678           case 2 :   // too far from each other
 679             goto endofloop;
 680           } // switch
 681
 682         } // while digitN
 683
 684       endofloop: ;
 685         nextdigit.Reset() ;
 686
 687       } // loop over cluster
 688
 689     } // energy theshold
 690
 691
 692   } // while digit
 693
 694   delete digitsC ;
 695
 696 }
 697
 698 //____________________________________________________________________________
 699 void AliPHOSClusterizerv1::MakeUnfolding()
 700 {
 701   // Unfolds clusters using the shape of an ElectroMagnetic shower
 702   // Performs unfolding of all EMC/CPV clusters
 703
 704   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 705
 706   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 707
 708   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 709   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 710   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 711
 712   // Unfold first EMC clusters
 713   if(fNumberOfEmcClusters > 0){
 714
 715     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
 716
 717     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfEmcClusters ;
 718     Int_t index ;
 719     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
 720
 721       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(index) ) ;
 722       if(emcRecPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 723         break ;
 724
 725       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 726       AliPHOSDigit ** maxAt = new AliPHOSDigit*[nMultipl] ;
 727       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 728       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fEmcLocMaxCut,digits) ;
 729
 730       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 731         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 732         emcRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 733         emcRecPoints->Compress() ;
 734         index-- ;
 735         fNumberOfEmcClusters -- ;
 736         numberofNotUnfolded-- ;
 737       }
 738       else{
 739         emcRecPoint->SetNExMax(1) ; //Only one local maximum
 740       }
 741
 742       delete[] maxAt ;
 743       delete[] maxAtEnergy ;
 744     }
 745   }
 746   // Unfolding of EMC clusters finished
 747
 748
 749   // Unfold now CPV clusters
 750   if(fNumberOfCpvClusters > 0){
 751
 752     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
 753
 754     Int_t numberofCpvNotUnfolded = fNumberOfCpvClusters ;
 755     Int_t index ;
 756     for(index = 0 ; index < numberofCpvNotUnfolded ; index++){
 757
 758       AliPHOSRecPoint * recPoint = dynamic_cast<AliPHOSRecPoint *>( cpvRecPoints->At(index) ) ;
 759
 760       if(recPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 761         break ;
 762
 763       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint*>(recPoint) ;
 764
 765       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 766       AliPHOSDigit ** maxAt = new AliPHOSDigit*[nMultipl] ;
 767       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 768       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fCpvLocMaxCut,digits) ;
 769
 770       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 771         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 772         cpvRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 773         cpvRecPoints->Compress() ;
 774         index-- ;
 775         numberofCpvNotUnfolded-- ;
 776         fNumberOfCpvClusters-- ;
 777       }
 778
 779       delete[] maxAt ;
 780       delete[] maxAtEnergy ;
 781     }
 782   }
 783   //Unfolding of Cpv clusters finished
 784
 785 }
 786
 787 //____________________________________________________________________________
 788 Double_t  AliPHOSClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 789 {
 790   // Shape of the shower (see PHOS TDR)
 791   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 792
 793   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 794   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 795   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 796   return shape ;
 797 }
 798
 799 //____________________________________________________________________________
 800 void  AliPHOSClusterizerv1::UnfoldCluster(AliPHOSEmcRecPoint * iniEmc,
 801                                           Int_t nMax,
 802                                           AliPHOSDigit ** maxAt,
 803                                           Float_t * maxAtEnergy)
 804 {
 805   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 806
 807   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
 808
 809   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 810
 811   const TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 812   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
 813   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
 814
 815   Int_t nPar = 3 * nMax ;
 816   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
 817
 818   Bool_t rv = FindFit(iniEmc, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
 819   if( !rv ) {
 820     // Fit failed, return and remove cluster
 821     iniEmc->SetNExMax(-1) ;
 822     delete[] fitparameters ;
 823     return ;
 824   }
 825
 826   // create ufolded rec points and fill them with new energy lists
 827   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with fit (without fluctuations): efit[]
 828   // and later correct this number in acordance with actual energy deposition
 829
 830   Int_t nDigits = iniEmc->GetMultiplicity() ;
 831   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
 832   Float_t xDigit=0.,zDigit=0.,distance=0. ;
 833   Float_t xpar=0.,zpar=0.,epar=0.  ;
 834   Int_t relid[4] ;
 835   AliPHOSDigit * digit = 0 ;
 836   Int_t * emcDigits = iniEmc->GetDigitsList() ;
 837
 838   Int_t iparam ;
 839   Int_t iDigit ;
 840   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 841     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(emcDigits[iDigit] ) ) ;
 842     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 843     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 844     efit[iDigit] = 0;
 845
 846     iparam = 0 ;
 847     while(iparam < nPar ){
 848       xpar = fitparameters[iparam] ;
 849       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 850       epar = fitparameters[iparam+2] ;
 851       iparam += 3 ;
 852       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 853       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 854       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(distance) ;
 855     }
 856   }
 857
 858
 859   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
 860   // so that energy deposited in each cell is distributed betwin new clusters proportionally
 861   // to its contribution to efit
 862
 863   Float_t * emcEnergies = iniEmc->GetEnergiesList() ;
 864   Float_t ratio ;
 865
 866   iparam = 0 ;
 867   while(iparam < nPar ){
 868     xpar = fitparameters[iparam] ;
 869     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 870     epar = fitparameters[iparam+2] ;
 871     iparam += 3 ;
 872
 873     AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = 0 ;
 874
 875     if(iniEmc->IsEmc()){ //create new entries in fEmcRecPoints...
 876
 877       if(fNumberOfEmcClusters >= emcRecPoints->GetSize())
 878         emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters) ;
 879
 880       (*emcRecPoints)[fNumberOfEmcClusters] = new AliPHOSEmcRecPoint("") ;
 881       emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( emcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ) ;
 882       fNumberOfEmcClusters++ ;
 883       emcRP->SetNExMax((Int_t)nPar/3) ;
 884     }
 885     else{//create new entries in fCpvRecPoints
 886       if(fNumberOfCpvClusters >= cpvRecPoints->GetSize())
 887         cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters) ;
 888
 889       (*cpvRecPoints)[fNumberOfCpvClusters] = new AliPHOSCpvRecPoint("") ;
 890       emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( cpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters) ) ;
 891       fNumberOfCpvClusters++ ;
 892     }
 893
 894     Float_t eDigit ;
 895     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 896       digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At( emcDigits[iDigit] ) ) ;
 897       geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 898       geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 899       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 900       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 901       ratio = epar * ShowerShape(distance) / efit[iDigit] ;
 902       eDigit = emcEnergies[iDigit] * ratio ;
 903       emcRP->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
 904     }
 905   }
 906
 907   delete[] fitparameters ;
 908   delete[] efit ;
 909
 910 }
 911
 912 //_____________________________________________________________________________
 913 void AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad, Double_t & fret, Double_t * x, Int_t iflag)
 914 {
 915   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 916   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 917
 918   TList * toMinuit = dynamic_cast<TList*>( gMinuit->GetObjectFit() ) ;
 919
 920   AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint*>( toMinuit->At(0) )  ;
 921   TClonesArray * digits = dynamic_cast<TClonesArray*>( toMinuit->At(1) )  ;
 922
 923
 924
 925   //  AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( gMinuit->GetObjectFit() ) ; // EmcRecPoint to fit
 926
 927   Int_t * emcDigits     = emcRP->GetDigitsList() ;
 928
 929   Int_t nOdigits = emcRP->GetDigitsMultiplicity() ;
 930
 931   Float_t * emcEnergies = emcRP->GetEnergiesList() ;
 932
 933   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 934   fret = 0. ;
 935   Int_t iparam ;
 936
 937   if(iflag == 2)
 938     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)
 939       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
 940
 941   Double_t efit ;
 942
 943   AliPHOSDigit * digit ;
 944   Int_t iDigit ;
 945
 946   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOdigits ; iDigit++) {
 947
 948     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At( emcDigits[iDigit] ) );
 949
 950     Int_t relid[4] ;
 951     Float_t xDigit ;
 952     Float_t zDigit ;
 953
 954     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 955
 956     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 957
 958      if(iflag == 2){  // calculate gradient
 959        Int_t iParam = 0 ;
 960        efit = 0 ;
 961        while(iParam < nPar ){
 962          Double_t distance = (xDigit - x[iParam]) * (xDigit - x[iParam]) ;
 963          iParam++ ;
 964          distance += (zDigit - x[iParam]) * (zDigit - x[iParam]) ;
 965          distance = TMath::Sqrt( distance ) ;
 966          iParam++ ;
 967          efit += x[iParam] * ShowerShape(distance) ;
 968          iParam++ ;
 969        }
 970        Double_t sum = 2. * (efit - emcEnergies[iDigit]) / emcEnergies[iDigit] ; // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 971        iParam = 0 ;
 972        while(iParam < nPar ){
 973          Double_t xpar = x[iParam] ;
 974          Double_t zpar = x[iParam+1] ;
 975          Double_t epar = x[iParam+2] ;
 976          Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
 977          Double_t shape = sum * ShowerShape(dr) ;
 978          Double_t r4 = dr*dr*dr*dr ;
 979          Double_t r295 = TMath::Power(dr,2.95) ;
 980          Double_t deriv =-4. * dr*dr * ( 2.32 / ( (2.32 + 0.26 * r4) * (2.32 + 0.26 * r4) ) +
 981                                          0.0316 * (1. + 0.0171 * r295) / ( ( 1. + 0.0652 * r295) * (1. + 0.0652 * r295) ) ) ;
 982
 983          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x
 984          iParam++ ;
 985          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z
 986          iParam++ ;
 987          Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy
 988          iParam++ ;
 989        }
 990      }
 991      efit = 0;
 992      iparam = 0 ;
 993
 994      while(iparam < nPar ){
 995        Double_t xpar = x[iparam] ;
 996        Double_t zpar = x[iparam+1] ;
 997        Double_t epar = x[iparam+2] ;
 998        iparam += 3 ;
 999        Double_t distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
1000        distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
1001        efit += epar * ShowerShape(distance) ;
1002      }
1003
1004      fret += (efit-emcEnergies[iDigit])*(efit-emcEnergies[iDigit])/emcEnergies[iDigit] ;
1005      // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
1006   }
1007
1008 }
1009
1010 //____________________________________________________________________________
1011 void AliPHOSClusterizerv1::Print(const Option_t *)const
1012 {
1013   // Print clusterizer parameters
1014
1015   TString message ;
1016   TString taskName(GetName()) ;
1017   taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
1018
1019   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ) {
1020     // Print parameters
1021     message  = "\n--------------- %s %s -----------\n" ;
1022     message += "Clusterizing digits from the file: %s\n" ;
1023     message += "                           Branch: %s\n" ;
1024     message += "                       EMC Clustering threshold = %f\n" ;
1025     message += "                       EMC Local Maximum cut    = %f\n" ;
1026     message += "                       EMC Logarothmic weight   = %f\n" ;
1027     message += "                       CPV Clustering threshold = %f\n" ;
1028     message += "                       CPV Local Maximum cut    = %f\n" ;
1029     message += "                       CPV Logarothmic weight   = %f\n" ;
1030     if(fToUnfold)
1031       message += " Unfolding on\n" ;
1032     else
1033       message += " Unfolding off\n" ;
1034
1035     message += "------------------------------------------------------------------" ;
1036   }
1037   else
1038     message = " AliPHOSClusterizerv1 not initialized " ;
1039
1040   AliInfo(Form("%s, %s %s %s %s %s %s %s %s %s %s", message.Data(),
1041        taskName.Data(),
1042        GetTitle(),
1043        taskName.Data(),
1044        GetName(),
1045        fEmcClusteringThreshold,
1046        fEmcLocMaxCut,
1047        fW0,
1048        fCpvClusteringThreshold,
1049        fCpvLocMaxCut,
1050        fW0CPV )) ;
1051 }
1052
1053
1054 //____________________________________________________________________________
1055 void AliPHOSClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
1056 {
1057   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliPHOSClusterizer
1058
1059   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance();
1060
1061   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
1062   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
1063
1064   AliInfo(Form("\nevent %d \n    Found %d EMC RecPoints and %d CPV RecPoints",
1065                gAlice->GetEvNumber(),
1066                emcRecPoints->GetEntriesFast(),
1067                cpvRecPoints->GetEntriesFast() ))  ;
1068
1069   fRecPointsInRun +=  emcRecPoints->GetEntriesFast() ;
1070   fRecPointsInRun +=  cpvRecPoints->GetEntriesFast() ;
1071
1072
1073   if(strstr(option,"all")) {
1074     printf("\n EMC clusters \n") ;
1075     printf("Index    Ene(MeV) Multi Module     X    Y   Z    Lambdas_1  Lambda_2  # of prim  Primaries list\n") ;
1076     Int_t index ;
1077     for (index = 0 ; index < emcRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1078       AliPHOSEmcRecPoint * rp = (AliPHOSEmcRecPoint * )emcRecPoints->At(index) ;
1079       TVector3  locpos;
1080       rp->GetLocalPosition(locpos);
1081       Float_t lambda[2];
1082       rp->GetElipsAxis(lambda);
1083       Int_t * primaries;
1084       Int_t nprimaries;
1085       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1086       printf("\n%6d  %8.2f  %3d     %2d     %4.1f   %4.1f   %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
1087               rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(), rp->GetPHOSMod(),
1088               locpos.X(), locpos.Y(), locpos.Z(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
1089
1090       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
1091         printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
1092       }
1093       printf("\n") ;
1094     }
1095
1096     //Now plot CPV recPoints
1097     printf("\n CPV clusters \n") ;
1098     printf("Index    Ene(MeV) Module     X     Y    Z  \n") ;
1099     for (index = 0 ; index < cpvRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1100       AliPHOSCpvRecPoint * rp = (AliPHOSCpvRecPoint * )cpvRecPoints->At(index) ;
1101
1102       TVector3  locpos;
1103       rp->GetLocalPosition(locpos);
1104
1105       printf("\n%6d  %8.2f  %2d     %4.1f    %4.1f %4.1f \n",
1106              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetPHOSMod(),
1107              locpos.X(), locpos.Y(), locpos.Z()) ;
1108     }
1109   }
1110 }
1111