PHOS/AliPHOSClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 /* History of cvs commits:
  19  *
  20  * $Log: AliPHOSClusterizerv1.cxx,v $
  21  * Revision 1.118  2007/12/11 21:23:26  kharlov
  22  * Added possibility to swith off unfolding
  23  *
  24  * Revision 1.117  2007/10/18 08:42:05  kharlov
  25  * Bad channels cleaned before clusterization
  26  *
  27  * Revision 1.116  2007/10/01 20:24:08  kharlov
  28  * Memory leaks fixed
  29  *
  30  * Revision 1.115  2007/09/26 14:22:17  cvetan
  31  * Important changes to the reconstructor classes. Complete elimination of the run-loaders, which are now steered only from AliReconstruction. Removal of the corresponding Reconstruct() and FillESD() methods.
  32  *
  33  * Revision 1.114  2007/09/06 16:06:44  kharlov
  34  * Absence of sorting results in loose of all unfolded clusters
  35  *
  36  * Revision 1.113  2007/08/28 12:55:07  policheh
  37  * Loaders removed from the reconstruction code (C.Cheshkov)
  38  *
  39  * Revision 1.112  2007/08/22 09:20:50  hristov
  40  * Updated QA classes (Yves)
  41  *
  42  * Revision 1.111  2007/08/08 12:11:28  kharlov
  43  * Protection against uninitialized fQADM
  44  *
  45  * Revision 1.110  2007/08/07 14:16:00  kharlov
  46  * Quality assurance added (Yves Schutz)
  47  *
  48  * Revision 1.109  2007/07/24 17:20:35  policheh
  49  * Usage of RecoParam objects instead of hardcoded parameters in reconstruction.
  50  * (See $ALICE_ROOT/PHOS/macros/BeamTest2006/RawReconstruction.C).
  51  *
  52  * Revision 1.108  2007/06/18 07:00:51  kharlov
  53  * Bug fix for attempt to use AliPHOSEmcRecPoint after its deletion
  54  *
  55  * Revision 1.107  2007/05/25 14:12:26  policheh
  56  * Local to tracking CS transformation added for CPV rec. points
  57  *
  58  * Revision 1.106  2007/05/24 13:01:22  policheh
  59  * Local to tracking CS transformation invoked for each EMC rec.point
  60  *
  61  * Revision 1.105  2007/05/02 13:41:22  kharlov
  62  * Mode protection against absence of calib.data from AliPHOSCalibData to AliPHOSClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
  63  *
  64  * Revision 1.104  2007/04/27 16:55:53  kharlov
  65  * Calibration stops if PHOS CDB objects do not exist
  66  *
  67  * Revision 1.103  2007/04/11 11:55:45  policheh
  68  * SetDistancesToBadChannels() added.
  69  *
  70  * Revision 1.102  2007/03/28 19:18:15  kharlov
  71  * RecPoints recalculation in TSM removed
  72  *
  73  * Revision 1.101  2007/03/06 06:51:27  kharlov
  74  * Calculation of cluster properties dep. on vertex posponed to TrackSegmentMaker
  75  *
  76  * Revision 1.100  2007/01/10 11:07:26  kharlov
  77  * Raw digits writing to file (B.Polichtchouk)
  78  *
  79  * Revision 1.99  2006/11/07 16:49:51  kharlov
  80  * Corrections for next event switch in case of raw data (B.Polichtchouk)
  81  *
  82  * Revision 1.98  2006/10/27 17:14:27  kharlov
  83  * Introduce AliDebug and AliLog (B.Polichtchouk)
  84  *
  85  * Revision 1.97  2006/08/29 11:41:19  kharlov
  86  * Missing implementation of ctors and = operator are added
  87  *
  88  * Revision 1.96  2006/08/25 16:56:30  kharlov
  89  * Compliance with Effective C++
  90  *
  91  * Revision 1.95  2006/08/11 12:36:26  cvetan
  92  * Update of the PHOS code needed in order to read and reconstruct the beam test raw data (i.e. without an existing galice.root)
  93  *
  94  * Revision 1.94  2006/08/07 12:27:49  hristov
  95  * Removing obsolete code which affected the event numbering scheme
  96  *
  97  * Revision 1.93  2006/08/01 12:20:17  cvetan
  98  * 1. Adding a possibility to read and reconstruct an old rcu formatted raw data. This is controlled by an option of AliReconstruction and AliPHOSReconstructor. 2. In case of raw data processing (without galice.root) create the default AliPHOSGeometry object. Most likely this should be moved to the CDB
  99  *
 100  * Revision 1.92  2006/04/29 20:26:46  hristov
 101  * Separate EMC and CPV calibration (Yu.Kharlov)
 102  *
 103  * Revision 1.91  2006/04/22 10:30:17  hristov
 104  * Add fEnergy to AliPHOSDigit and operate with EMC amplitude in energy units (Yu.Kharlov)
 105  *
 106  * Revision 1.90  2006/04/11 15:22:59  hristov
 107  * run number in query set to -1: forces AliCDBManager to use its run number (A.Colla)
 108  *
 109  * Revision 1.89  2006/03/13 14:05:42  kharlov
 110  * Calibration objects for EMC and CPV
 111  *
 112  * Revision 1.88  2006/01/11 08:54:52  hristov
 113  * Additional protection in case no calibration entry was found
 114  *
 115  * Revision 1.87  2005/11/22 08:46:43  kharlov
 116  * Updated to new CDB (Boris Polichtchouk)
 117  *
 118  * Revision 1.86  2005/11/14 21:52:43  hristov
 119  * Coding conventions
 120  *
 121  * Revision 1.85  2005/09/27 16:08:08  hristov
 122  * New version of CDB storage framework (A.Colla)
 123  *
 124  * Revision 1.84  2005/09/21 10:02:47  kharlov
 125  * Reading calibration from CDB (Boris Polichtchouk)
 126  *
 127  * Revision 1.82  2005/09/02 15:43:13  kharlov
 128  * Add comments in GetCalibrationParameters and Calibrate
 129  *
 130  * Revision 1.81  2005/09/02 14:32:07  kharlov
 131  * Calibration of raw data
 132  *
 133  * Revision 1.80  2005/08/24 15:31:36  kharlov
 134  * Setting raw digits flag
 135  *
 136  * Revision 1.79  2005/07/25 15:53:53  kharlov
 137  * Read raw data
 138  *
 139  * Revision 1.78  2005/05/28 14:19:04  schutz
 140  * Compilation warnings fixed by T.P.
 141  *
 142  */
 143
 144 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
 145 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 146 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
 147 //  unfolds the clusters having several local maxima.
 148 //  Results are stored in TreeR#, branches PHOSEmcRP (EMC recPoints),
 149 //  PHOSCpvRP (CPV RecPoints) and AliPHOSClusterizer (Clusterizer with all
 150 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
 151 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
 152 //  standalone mode.
 153 // Use Case:
 154 //  root [0] AliPHOSClusterizerv1 * cl = new AliPHOSClusterizerv1(<pointer_to_phos_geometry_onject>)
 155 //  root [1] cl->Digits2Clusters(digitsTree,clusterTree)
 156 //               //finds RecPoints in the current event
 157 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
 158 //               //sets another title for Digitis (input) branch
 159 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
 160 //               //sets another title four output branches
 161 //  root [4] cl->SetEmcLocalMaxCut(0.03)
 162 //               //set clusterization parameters
 163
 164 // --- ROOT system ---
 165
 166 #include "TMath.h"
 167 #include "TMinuit.h"
 168 #include "TTree.h"
 169 #include "TBenchmark.h"
 170 #include "TClonesArray.h"
 171
 172 // --- Standard library ---
 173
 174 // --- AliRoot header files ---
 175 #include "AliLog.h"
 176 #include "AliConfig.h"
 177 #include "AliPHOSGeometry.h"
 178 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
 179 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
 180 #include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
 181 #include "AliPHOSDigit.h"
 182 #include "AliPHOSDigitizer.h"
 183 #include "AliPHOSCalibrationDB.h"
 184 #include "AliCDBManager.h"
 185 #include "AliCDBStorage.h"
 186 #include "AliCDBEntry.h"
 187 #include "AliPHOSRecoParam.h"
 188 #include "AliPHOSReconstructor.h"
 189 #include "AliPHOSCalibData.h"
 190
 191 ClassImp(AliPHOSClusterizerv1)
 192
 193 //____________________________________________________________________________
 194 AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1() :
 195   AliPHOSClusterizer(),
 196   fDefaultInit(0),            fEmcCrystals(0),          fToUnfold(0),
 197   fWrite(0),                  fNumberOfEmcClusters(0),  fNumberOfCpvClusters(0),
 198   fEmcClusteringThreshold(0), fCpvClusteringThreshold(0),
 199   fEmcLocMaxCut(0),           fW0(0),                   fCpvLocMaxCut(0),
 200   fW0CPV(0),                  fEmcTimeGate(0)
 201 {
 202   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
 203
 204   InitParameters() ;
 205   fDefaultInit = kTRUE ;
 206 }
 207
 208 //____________________________________________________________________________
 209 AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1(AliPHOSGeometry *geom) :
 210   AliPHOSClusterizer(geom),
 211   fDefaultInit(0),            fEmcCrystals(0),          fToUnfold(0),
 212   fWrite(0),                  fNumberOfEmcClusters(0),  fNumberOfCpvClusters(0),
 213   fEmcClusteringThreshold(0), fCpvClusteringThreshold(0),
 214   fEmcLocMaxCut(0),           fW0(0),                   fCpvLocMaxCut(0),
 215   fW0CPV(0),                  fEmcTimeGate(0)
 216 {
 217   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
 218
 219   InitParameters() ;
 220   Init() ;
 221   fDefaultInit = kFALSE ;
 222 }
 223
 224 //____________________________________________________________________________
 225   AliPHOSClusterizerv1::~AliPHOSClusterizerv1()
 226 {
 227   // dtor
 228
 229 }
 230 //____________________________________________________________________________
 231 void AliPHOSClusterizerv1::Digits2Clusters(Option_t *option)
 232 {
 233   // Steering method to perform clusterization for one event
 234   // The input is the tree with digits.
 235   // The output is the tree with clusters.
 236
 237   if(strstr(option,"tim"))
 238     gBenchmark->Start("PHOSClusterizer");
 239
 240   if(strstr(option,"print")) {
 241     Print() ;
 242     return ;
 243   }
 244
 245   MakeClusters() ;
 246
 247   AliDebug(2,Form(" ---- Printing clusters (%d)\n",
 248                   fEMCRecPoints->GetEntries()));
 249   if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>1)
 250     fEMCRecPoints->Print();
 251
 252   if(fToUnfold)
 253     MakeUnfolding();
 254
 255   WriteRecPoints();
 256
 257   if(strstr(option,"deb"))
 258     PrintRecPoints(option) ;
 259
 260   if(strstr(option,"tim")){
 261     gBenchmark->Stop("PHOSClusterizer");
 262     AliInfo(Form("took %f seconds for Clusterizing\n",
 263                  gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer")));
 264   }
 265 }
 266
 267 //____________________________________________________________________________
 268 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::FindFit(AliPHOSEmcRecPoint * emcRP, AliPHOSDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 269                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 270 {
 271   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 272   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 273   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 274
 275
 276   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 277   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 278   gMinuit->SetFCN(AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 279                                          // To set the address of the minimization function
 280
 281   TList * toMinuit = new TList();
 282   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 283   toMinuit->AddAt(fDigitsArr,1) ;
 284   toMinuit->AddAt(fGeom,2) ;
 285
 286   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 287
 288   // filling initial values for fit parameters
 289   AliPHOSDigit * digit ;
 290
 291   Int_t ierflg  = 0;
 292   Int_t index   = 0 ;
 293   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 294
 295   Int_t iDigit ;
 296
 297   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 298     digit = maxAt[iDigit];
 299
 300     Int_t relid[4] ;
 301     Float_t x = 0.;
 302     Float_t z = 0.;
 303     fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 304     fGeom->RelPosInModule(relid, x, z) ;
 305
 306     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 307
 308     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 309     index++ ;
 310     if(ierflg != 0){
 311       Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : x = %f\n", x ) ;
 312       return kFALSE;
 313     }
 314     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 315     index++ ;
 316     if(ierflg != 0){
 317        Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : z =%f\n", z ) ;
 318       return kFALSE;
 319     }
 320     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 321     index++ ;
 322     if(ierflg != 0){
 323       Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : energy = %f\n", energy ) ;
 324       return kFALSE;
 325     }
 326   }
 327
 328   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 329                       //  depends on it.
 330   Double_t p1 = 1.0 ;
 331   Double_t p2 = 0.0 ;
 332
 333   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 334   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 335   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 336   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 337
 338   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 339
 340   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 341     Warning("FindFit", "PHOS Unfolding fit not converged, cluster abandoned\n" );
 342     return kFALSE ;
 343   }
 344   for(index = 0; index < nPar; index++){
 345     Double_t err ;
 346     Double_t val ;
 347     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 348     fitparameters[index] = val ;
 349    }
 350
 351   delete toMinuit ;
 352   return kTRUE;
 353
 354 }
 355
 356
 357 //____________________________________________________________________________
 358 void AliPHOSClusterizerv1::Init()
 359 {
 360   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 361   // Attach the Clusterizer task to the list of PHOS tasks
 362
 363   fEmcCrystals = fGeom->GetNModules() *  fGeom->GetNCristalsInModule() ;
 364
 365   if(!gMinuit)
 366     gMinuit = new TMinuit(100);
 367
 368   if (!fgCalibData)
 369     fgCalibData = new AliPHOSCalibData(-1); //use AliCDBManager's run number
 370   if (fgCalibData->GetCalibDataEmc() == 0)
 371     AliFatal("Calibration parameters for PHOS EMC not found. Stop reconstruction.\n");
 372
 373 }
 374
 375 //____________________________________________________________________________
 376 void AliPHOSClusterizerv1::InitParameters()
 377 {
 378
 379   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
 380   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
 381
 382   const AliPHOSRecoParam* parEmc = AliPHOSReconstructor::GetRecoParamEmc();
 383   if(!parEmc) AliFatal("Reconstruction parameters for EMC not set!");
 384
 385   const AliPHOSRecoParam* parCpv = AliPHOSReconstructor::GetRecoParamCpv();
 386   if(!parCpv) AliFatal("Reconstruction parameters for CPV not set!");
 387
 388   fCpvClusteringThreshold  = parCpv->GetClusteringThreshold();
 389   fEmcClusteringThreshold  = parEmc->GetClusteringThreshold();
 390
 391   fEmcLocMaxCut            = parEmc->GetLocalMaxCut();
 392   fCpvLocMaxCut            = parCpv->GetLocalMaxCut();
 393
 394   fW0                      = parEmc->GetLogWeight();
 395   fW0CPV                   = parCpv->GetLogWeight();
 396
 397   fEmcTimeGate             = 1.e-6 ;
 398
 399   fToUnfold                = parEmc->ToUnfold() ;
 400
 401   fWrite                   = kTRUE ;
 402 }
 403
 404 //____________________________________________________________________________
 405 Int_t AliPHOSClusterizerv1::AreNeighbours(AliPHOSDigit * d1, AliPHOSDigit * d2)const
 406 {
 407   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 408   //                                       = 1 are neighbour
 409   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 410   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 411   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 412   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 413
 414   Int_t rv = 0 ;
 415
 416   Int_t relid1[4] ;
 417   fGeom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 418
 419   Int_t relid2[4] ;
 420   fGeom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 421
 422   if ( (relid1[0] == relid2[0]) && (relid1[1]==relid2[1]) ) { // inside the same PHOS module
 423     Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[2] - relid2[2] ) ;
 424     Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[3] - relid2[3] ) ;
 425
 426     if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){   //At least common vertex
 427       //    if (( relid1[2]==relid2[2] && coldiff <= 1 )  || ( relid1[3]==relid2[3] &&  rowdiff <= 1 )){ //common side
 428       if((relid1[1] != 0) || (TMath::Abs(d1->GetTime() - d2->GetTime() ) < fEmcTimeGate))
 429       rv = 1 ;
 430     }
 431     else {
 432       if((relid2[2] > relid1[2]) && (relid2[3] > relid1[3]+1))
 433         rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 434     }
 435
 436   }
 437   else {
 438
 439     if( (relid1[0] < relid2[0]) || (relid1[1] != relid2[1]) )
 440       rv=2 ;
 441
 442   }
 443
 444   return rv ;
 445 }
 446 //____________________________________________________________________________
 447 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInEmc(AliPHOSDigit * digit) const
 448 {
 449   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
 450
 451   Bool_t rv = kFALSE ;
 452
 453   Int_t nEMC = fGeom->GetNModules()*fGeom->GetNPhi()*fGeom->GetNZ();
 454
 455   if(digit->GetId() <= nEMC )   rv = kTRUE;
 456
 457   return rv ;
 458 }
 459
 460 //____________________________________________________________________________
 461 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInCpv(AliPHOSDigit * digit) const
 462 {
 463   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
 464
 465   Bool_t rv = kFALSE ;
 466
 467   Int_t nEMC = fGeom->GetNModules()*fGeom->GetNPhi()*fGeom->GetNZ();
 468
 469   if(digit->GetId() > nEMC )   rv = kTRUE;
 470
 471   return rv ;
 472 }
 473
 474 //____________________________________________________________________________
 475 void AliPHOSClusterizerv1::WriteRecPoints()
 476 {
 477
 478   // Creates new branches with given title
 479   // fills and writes into TreeR.
 480
 481   Int_t index ;
 482   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties..
 483   Int_t nEmc = fEMCRecPoints->GetEntriesFast();
 484   Float_t emcMinE= AliPHOSReconstructor::GetRecoParamEmc()->GetMinE(); //Minimal digit energy
 485   for(index = 0; index < nEmc; index++){
 486     AliPHOSEmcRecPoint * rp =
 487       dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( fEMCRecPoints->At(index) );
 488     rp->Purify(emcMinE) ;
 489     if(rp->GetMultiplicity()==0){
 490       fEMCRecPoints->RemoveAt(index) ;
 491       delete rp ;
 492       continue;
 493     }
 494
 495     // No vertex is available now, calculate corrections in PID
 496     rp->EvalAll(fW0,fDigitsArr) ;
 497     TVector3 fakeVtx(0.,0.,0.) ;
 498     rp->EvalAll(fW0,fakeVtx,fDigitsArr) ;
 499     rp->EvalLocal2TrackingCSTransform();
 500   }
 501   fEMCRecPoints->Compress() ;
 502   fEMCRecPoints->Sort() ;
 503   //  fEMCRecPoints->Expand(fEMCRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 504   for(index = 0; index < fEMCRecPoints->GetEntries(); index++){
 505     dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( fEMCRecPoints->At(index) )->SetIndexInList(index) ;
 506   }
 507
 508   //For each rec.point set the distance to the nearest bad crystal (BVP)
 509   SetDistancesToBadChannels();
 510
 511   //Now the same for CPV
 512   for(index = 0; index < fCPVRecPoints->GetEntries(); index++){
 513     AliPHOSCpvRecPoint * rp = dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( fCPVRecPoints->At(index) );
 514     rp->EvalAll(fW0CPV,fDigitsArr) ;
 515     rp->EvalLocal2TrackingCSTransform();
 516   }
 517   fCPVRecPoints->Sort() ;
 518
 519   for(index = 0; index < fCPVRecPoints->GetEntries(); index++)
 520     dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( fCPVRecPoints->At(index) )->SetIndexInList(index) ;
 521
 522   fCPVRecPoints->Expand(fCPVRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 523
 524   if(fWrite){ //We write TreeR
 525     fTreeR->Fill();
 526   }
 527 }
 528
 529 //____________________________________________________________________________
 530 void AliPHOSClusterizerv1::MakeClusters()
 531 {
 532   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 533   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 534
 535   TClonesArray * digitsC =  static_cast<TClonesArray*>( fDigitsArr->Clone() ) ;
 536
 537   // Clusterization starts
 538
 539   TIter nextdigit(digitsC) ;
 540   AliPHOSDigit * digit ;
 541   Bool_t notremoved = kTRUE ;
 542
 543   while ( (digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit()) ) ) { // scan over the list of digitsC
 544
 545
 546     AliPHOSRecPoint * clu = 0 ;
 547
 548     TArrayI clusterdigitslist(1500) ;
 549     Int_t index ;
 550
 551     if (( IsInEmc(digit) &&  digit->GetEnergy() > fEmcClusteringThreshold ) ||
 552         ( IsInCpv(digit) &&  digit->GetEnergy() > fCpvClusteringThreshold ) ) {
 553       Int_t iDigitInCluster = 0 ;
 554
 555       if  ( IsInEmc(digit) ) {
 556         // start a new EMC RecPoint
 557         if(fNumberOfEmcClusters >= fEMCRecPoints->GetSize())
 558           fEMCRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters+1) ;
 559
 560         fEMCRecPoints->AddAt(new  AliPHOSEmcRecPoint(""), fNumberOfEmcClusters) ;
 561         clu = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( fEMCRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ) ;
 562         fNumberOfEmcClusters++ ;
 563         clu->AddDigit(*digit, digit->GetEnergy()) ;
 564         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList() ;
 565         iDigitInCluster++ ;
 566         digitsC->Remove(digit) ;
 567
 568       } else {
 569
 570         // start a new CPV cluster
 571         if(fNumberOfCpvClusters >= fCPVRecPoints->GetSize())
 572           fCPVRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters+1);
 573
 574         fCPVRecPoints->AddAt(new AliPHOSCpvRecPoint(""), fNumberOfCpvClusters) ;
 575
 576         clu =  dynamic_cast<AliPHOSCpvRecPoint *>( fCPVRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters) ) ;
 577         fNumberOfCpvClusters++ ;
 578         clu->AddDigit(*digit, digit->GetEnergy())  ;
 579         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList()  ;
 580         iDigitInCluster++ ;
 581         digitsC->Remove(digit) ;
 582         nextdigit.Reset() ;
 583
 584         // Here we remove remaining EMC digits, which cannot make a cluster
 585
 586         if( notremoved ) {
 587           while( ( digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit() ) ) ) {
 588             if( IsInEmc(digit) )
 589               digitsC->Remove(digit) ;
 590             else
 591               break ;
 592           }
 593           notremoved = kFALSE ;
 594         }
 595
 596       } // else
 597
 598       nextdigit.Reset() ;
 599
 600       AliPHOSDigit * digitN ;
 601       index = 0 ;
 602       while (index < iDigitInCluster){ // scan over digits already in cluster
 603         digit =  dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( fDigitsArr->At(clusterdigitslist[index]) )  ;
 604         index++ ;
 605         while ( (digitN = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( nextdigit() ) ) ) { // scan over the reduced list of digits
 606           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 607           switch (ineb ) {
 608           case 0 :   // not a neighbour
 609             break ;
 610           case 1 :   // are neighbours
 611             clu->AddDigit(*digitN, digitN->GetEnergy());
 612             clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 613             iDigitInCluster++ ;
 614             digitsC->Remove(digitN) ;
 615             break ;
 616           case 2 :   // too far from each other
 617             goto endofloop;
 618           } // switch
 619
 620         } // while digitN
 621
 622       endofloop: ;
 623         nextdigit.Reset() ;
 624
 625       } // loop over cluster
 626
 627     } // energy theshold
 628
 629
 630   } // while digit
 631
 632   delete digitsC ;
 633
 634 }
 635
 636 //____________________________________________________________________________
 637 void AliPHOSClusterizerv1::MakeUnfolding()
 638 {
 639   // Unfolds clusters using the shape of an ElectroMagnetic shower
 640   // Performs unfolding of all EMC/CPV clusters
 641
 642   // Unfold first EMC clusters
 643   if(fNumberOfEmcClusters > 0){
 644
 645     Int_t nModulesToUnfold = fGeom->GetNModules() ;
 646
 647     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfEmcClusters ;
 648     Int_t index ;
 649     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
 650
 651       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( fEMCRecPoints->At(index) ) ;
 652       if(emcRecPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 653         break ;
 654
 655       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 656       AliPHOSDigit ** maxAt = new AliPHOSDigit*[nMultipl] ;
 657       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 658       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fEmcLocMaxCut,fDigitsArr) ;
 659
 660       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 661         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 662
 663         fEMCRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 664         fEMCRecPoints->Compress() ;
 665         index-- ;
 666         fNumberOfEmcClusters -- ;
 667         numberofNotUnfolded-- ;
 668       }
 669       else{
 670         emcRecPoint->SetNExMax(1) ; //Only one local maximum
 671       }
 672
 673       delete[] maxAt ;
 674       delete[] maxAtEnergy ;
 675     }
 676   }
 677   // Unfolding of EMC clusters finished
 678
 679
 680   // Unfold now CPV clusters
 681   if(fNumberOfCpvClusters > 0){
 682
 683     Int_t nModulesToUnfold = fGeom->GetNModules() ;
 684
 685     Int_t numberofCpvNotUnfolded = fNumberOfCpvClusters ;
 686     Int_t index ;
 687     for(index = 0 ; index < numberofCpvNotUnfolded ; index++){
 688
 689       AliPHOSRecPoint * recPoint = dynamic_cast<AliPHOSRecPoint *>( fCPVRecPoints->At(index) ) ;
 690
 691       if(recPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 692         break ;
 693
 694       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint*>(recPoint) ;
 695
 696       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 697       AliPHOSDigit ** maxAt = new AliPHOSDigit*[nMultipl] ;
 698       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 699       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fCpvLocMaxCut,fDigitsArr) ;
 700
 701       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 702         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 703         fCPVRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 704         fCPVRecPoints->Compress() ;
 705         index-- ;
 706         numberofCpvNotUnfolded-- ;
 707         fNumberOfCpvClusters-- ;
 708       }
 709
 710       delete[] maxAt ;
 711       delete[] maxAtEnergy ;
 712     }
 713   }
 714   //Unfolding of Cpv clusters finished
 715
 716 }
 717
 718 //____________________________________________________________________________
 719 Double_t  AliPHOSClusterizerv1::ShowerShape(Double_t x, Double_t z)
 720 {
 721   // Shape of the shower (see PHOS TDR)
 722   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 723
 724   //for the moment we neglect dependence on the incident angle.
 725
 726   Double_t r2    = x*x + z*z ;
 727   Double_t r4    = r2*r2 ;
 728   Double_t r295  = TMath::Power(r2, 2.95/2.) ;
 729   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 730   return shape ;
 731 }
 732
 733 //____________________________________________________________________________
 734 void  AliPHOSClusterizerv1::UnfoldCluster(AliPHOSEmcRecPoint * iniEmc,
 735                                           Int_t nMax,
 736                                           AliPHOSDigit ** maxAt,
 737                                           Float_t * maxAtEnergy)
 738 {
 739   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 740
 741   Int_t nPar = 3 * nMax ;
 742   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
 743
 744   Bool_t rv = FindFit(iniEmc, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
 745
 746   if( !rv ) {
 747     // Fit failed, return and remove cluster
 748     iniEmc->SetNExMax(-1) ;
 749     delete[] fitparameters ;
 750     return ;
 751   }
 752
 753   // create ufolded rec points and fill them with new energy lists
 754   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with fit (without fluctuations): efit[]
 755   // and later correct this number in acordance with actual energy deposition
 756
 757   Int_t nDigits = iniEmc->GetMultiplicity() ;
 758   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
 759   Float_t xDigit=0.,zDigit=0. ;
 760   Float_t xpar=0.,zpar=0.,epar=0.  ;
 761   Int_t relid[4] ;
 762   AliPHOSDigit * digit = 0 ;
 763   Int_t * emcDigits = iniEmc->GetDigitsList() ;
 764
 765   TVector3 vIncid ;
 766
 767   Int_t iparam ;
 768   Int_t iDigit ;
 769   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 770     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( fDigitsArr->At(emcDigits[iDigit] ) ) ;
 771     fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 772     fGeom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 773     efit[iDigit] = 0;
 774
 775     iparam = 0 ;
 776     while(iparam < nPar ){
 777       xpar = fitparameters[iparam] ;
 778       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 779       epar = fitparameters[iparam+2] ;
 780       iparam += 3 ;
 781 //      fGeom->GetIncidentVector(fVtx,relid[0],xpar,zpar,vIncid) ;
 782 //      efit[iDigit] += epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar,vIncid) ;
 783       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar) ;
 784     }
 785   }
 786
 787   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
 788   // so that energy deposited in each cell is distributed betwin new clusters proportionally
 789   // to its contribution to efit
 790
 791   Float_t * emcEnergies = iniEmc->GetEnergiesList() ;
 792   Float_t ratio ;
 793
 794   iparam = 0 ;
 795   while(iparam < nPar ){
 796     xpar = fitparameters[iparam] ;
 797     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 798     epar = fitparameters[iparam+2] ;
 799     iparam += 3 ;
 800 //    fGeom->GetIncidentVector(fVtx,iniEmc->GetPHOSMod(),xpar,zpar,vIncid) ;
 801
 802     AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = 0 ;
 803
 804     if(iniEmc->IsEmc()){ //create new entries in fEMCRecPoints...
 805
 806       if(fNumberOfEmcClusters >= fEMCRecPoints->GetSize())
 807         fEMCRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters) ;
 808
 809       (*fEMCRecPoints)[fNumberOfEmcClusters] = new AliPHOSEmcRecPoint("") ;
 810       emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( fEMCRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ) ;
 811       fNumberOfEmcClusters++ ;
 812       emcRP->SetNExMax((Int_t)nPar/3) ;
 813     }
 814     else{//create new entries in fCPVRecPoints
 815       if(fNumberOfCpvClusters >= fCPVRecPoints->GetSize())
 816         fCPVRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters) ;
 817
 818       (*fCPVRecPoints)[fNumberOfCpvClusters] = new AliPHOSCpvRecPoint("") ;
 819       emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( fCPVRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters) ) ;
 820       fNumberOfCpvClusters++ ;
 821     }
 822
 823     Float_t eDigit ;
 824     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 825       digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( fDigitsArr->At( emcDigits[iDigit] ) ) ;
 826       fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 827       fGeom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 828 //      ratio = epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar,vIncid) / efit[iDigit] ;
 829       ratio = epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar) / efit[iDigit] ;
 830       eDigit = emcEnergies[iDigit] * ratio ;
 831       emcRP->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
 832     }
 833   }
 834
 835   delete[] fitparameters ;
 836   delete[] efit ;
 837
 838 }
 839
 840 //_____________________________________________________________________________
 841 void AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad, Double_t & fret, Double_t * x, Int_t iflag)
 842 {
 843   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 844   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 845
 846   TList * toMinuit = dynamic_cast<TList*>( gMinuit->GetObjectFit() ) ;
 847
 848   AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint*>( toMinuit->At(0) )  ;
 849   TClonesArray * digits = dynamic_cast<TClonesArray*>( toMinuit->At(1) )  ;
 850   // A bit buggy way to get an access to the geometry
 851   // To be revised!
 852   AliPHOSGeometry *geom = dynamic_cast<AliPHOSGeometry *>(toMinuit->At(2));
 853
 854 //  TVector3 * vtx = dynamic_cast<TVector3*>(toMinuit->At(3)) ;  //Vertex position
 855
 856   //  AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = dynamic_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>( gMinuit->GetObjectFit() ) ; // EmcRecPoint to fit
 857
 858   Int_t * emcDigits     = emcRP->GetDigitsList() ;
 859
 860   Int_t nOdigits = emcRP->GetDigitsMultiplicity() ;
 861
 862   Float_t * emcEnergies = emcRP->GetEnergiesList() ;
 863
 864 //  TVector3 vInc ;
 865   fret = 0. ;
 866   Int_t iparam ;
 867
 868   if(iflag == 2)
 869     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)
 870       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
 871
 872   Double_t efit ;
 873
 874   AliPHOSDigit * digit ;
 875   Int_t iDigit ;
 876
 877   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOdigits ; iDigit++) {
 878
 879     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At( emcDigits[iDigit] ) );
 880
 881     Int_t relid[4] ;
 882     Float_t xDigit ;
 883     Float_t zDigit ;
 884
 885     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 886
 887     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 888
 889      if(iflag == 2){  // calculate gradient
 890        Int_t iParam = 0 ;
 891        efit = 0 ;
 892        while(iParam < nPar ){
 893          Double_t dx = (xDigit - x[iParam]) ;
 894          iParam++ ;
 895          Double_t dz = (zDigit - x[iParam]) ;
 896          iParam++ ;
 897 //         fGeom->GetIncidentVector(*vtx,emcRP->GetPHOSMod(),x[iParam-2],x[iParam-1],vInc) ;
 898 //         efit += x[iParam] * ShowerShape(dx,dz,vInc) ;
 899          efit += x[iParam] * ShowerShape(dx,dz) ;
 900          iParam++ ;
 901        }
 902        Double_t sum = 2. * (efit - emcEnergies[iDigit]) / emcEnergies[iDigit] ; // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 903        iParam = 0 ;
 904        while(iParam < nPar ){
 905          Double_t xpar = x[iParam] ;
 906          Double_t zpar = x[iParam+1] ;
 907          Double_t epar = x[iParam+2] ;
 908 //         fGeom->GetIncidentVector(*vtx,emcRP->GetPHOSMod(),xpar,zpar,vInc) ;
 909          Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
 910 //         Double_t shape = sum * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar,vInc) ;
 911          Double_t shape = sum * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar) ;
 912 //DP: No incident angle dependence in gradient yet!!!!!!
 913          Double_t r4 = dr*dr*dr*dr ;
 914          Double_t r295 = TMath::Power(dr,2.95) ;
 915          Double_t deriv =-4. * dr*dr * ( 2.32 / ( (2.32 + 0.26 * r4) * (2.32 + 0.26 * r4) ) +
 916                                          0.0316 * (1. + 0.0171 * r295) / ( ( 1. + 0.0652 * r295) * (1. + 0.0652 * r295) ) ) ;
 917
 918          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x
 919          iParam++ ;
 920          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z
 921          iParam++ ;
 922          Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy
 923          iParam++ ;
 924        }
 925      }
 926      efit = 0;
 927      iparam = 0 ;
 928
 929      while(iparam < nPar ){
 930        Double_t xpar = x[iparam] ;
 931        Double_t zpar = x[iparam+1] ;
 932        Double_t epar = x[iparam+2] ;
 933        iparam += 3 ;
 934 //       fGeom->GetIncidentVector(*vtx,emcRP->GetPHOSMod(),xpar,zpar,vInc) ;
 935 //       efit += epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar,vInc) ;
 936        efit += epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar) ;
 937      }
 938
 939      fret += (efit-emcEnergies[iDigit])*(efit-emcEnergies[iDigit])/emcEnergies[iDigit] ;
 940      // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 941   }
 942
 943 }
 944
 945 //____________________________________________________________________________
 946 void AliPHOSClusterizerv1::Print(const Option_t *)const
 947 {
 948   // Print clusterizer parameters
 949
 950   TString message ;
 951   TString taskName(GetName()) ;
 952   taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
 953
 954   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ) {
 955     // Print parameters
 956     message  = "\n--------------- %s %s -----------\n" ;
 957     message += "Clusterizing digits from the file: %s\n" ;
 958     message += "                           Branch: %s\n" ;
 959     message += "                       EMC Clustering threshold = %f\n" ;
 960     message += "                       EMC Local Maximum cut    = %f\n" ;
 961     message += "                       EMC Logarothmic weight   = %f\n" ;
 962     message += "                       CPV Clustering threshold = %f\n" ;
 963     message += "                       CPV Local Maximum cut    = %f\n" ;
 964     message += "                       CPV Logarothmic weight   = %f\n" ;
 965     if(fToUnfold)
 966       message += " Unfolding on\n" ;
 967     else
 968       message += " Unfolding off\n" ;
 969
 970     message += "------------------------------------------------------------------" ;
 971   }
 972   else
 973     message = " AliPHOSClusterizerv1 not initialized " ;
 974
 975   AliInfo(Form("%s, %s %s %s %s %s %s %s %s %s %s", message.Data(),
 976        taskName.Data(),
 977        GetTitle(),
 978        taskName.Data(),
 979        GetName(),
 980        fEmcClusteringThreshold,
 981        fEmcLocMaxCut,
 982        fW0,
 983        fCpvClusteringThreshold,
 984        fCpvLocMaxCut,
 985        fW0CPV )) ;
 986 }
 987 //____________________________________________________________________________
 988 void AliPHOSClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
 989 {
 990   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliPHOSClusterizer
 991
 992   AliInfo(Form("\nFound %d EMC RecPoints and %d CPV RecPoints",
 993                fEMCRecPoints->GetEntriesFast(),
 994                fCPVRecPoints->GetEntriesFast() ))  ;
 995
 996   if(strstr(option,"all")) {
 997     printf("\n EMC clusters \n") ;
 998     printf("Index    Ene(MeV) Multi Module     X    Y   Z    Lambdas_1  Lambda_2  # of prim  Primaries list\n") ;
 999     Int_t index ;
1000     for (index = 0 ; index < fEMCRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1001       AliPHOSEmcRecPoint * rp = (AliPHOSEmcRecPoint * )fEMCRecPoints->At(index) ;
1002       TVector3  locpos;
1003       rp->GetLocalPosition(locpos);
1004       Float_t lambda[2];
1005       rp->GetElipsAxis(lambda);
1006       Int_t * primaries;
1007       Int_t nprimaries;
1008       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1009       printf("\n%6d  %8.2f  %3d     %2d     %4.1f   %4.1f   %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
1010               rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(), rp->GetPHOSMod(),
1011               locpos.X(), locpos.Y(), locpos.Z(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
1012
1013       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
1014         printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
1015       }
1016       printf("\n") ;
1017     }
1018
1019     //Now plot CPV recPoints
1020     printf("\n CPV clusters \n") ;
1021     printf("Index    Ene(MeV) Module     X     Y    Z  \n") ;
1022     for (index = 0 ; index < fCPVRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1023       AliPHOSCpvRecPoint * rp = (AliPHOSCpvRecPoint * )fCPVRecPoints->At(index) ;
1024
1025       TVector3  locpos;
1026       rp->GetLocalPosition(locpos);
1027
1028       printf("\n%6d  %8.2f  %2d     %4.1f    %4.1f %4.1f \n",
1029              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetPHOSMod(),
1030              locpos.X(), locpos.Y(), locpos.Z()) ;
1031     }
1032   }
1033 }
1034
1035
1036 //____________________________________________________________________________
1037 void AliPHOSClusterizerv1::SetDistancesToBadChannels()
1038 {
1039   //For each EMC rec. point set the distance to the nearest bad crystal.
1040   //Author: Boris Polichtchouk
1041
1042   if(!fgCalibData->GetNumOfEmcBadChannels()) return;
1043   AliInfo(Form("%d bad channel(s) found.\n",fgCalibData->GetNumOfEmcBadChannels()));
1044
1045   Int_t badIds[8000];
1046   fgCalibData->EmcBadChannelIds(badIds);
1047
1048   AliPHOSEmcRecPoint* rp;
1049
1050   TMatrixF gmat;
1051   TVector3 gposRecPoint; // global (in ALICE frame) position of rec. point
1052   TVector3 gposBadChannel; // global position of bad crystal
1053   TVector3 dR;
1054
1055   Float_t dist,minDist;
1056
1057   for(Int_t iRP=0; iRP<fEMCRecPoints->GetEntries(); iRP++){
1058     rp = (AliPHOSEmcRecPoint*)fEMCRecPoints->At(iRP);
1059     minDist = 1.e+07;
1060
1061     for(Int_t iBad=0; iBad<fgCalibData->GetNumOfEmcBadChannels(); iBad++) {
1062       rp->GetGlobalPosition(gposRecPoint,gmat);
1063       fGeom->RelPosInAlice(badIds[iBad],gposBadChannel);
1064       AliDebug(2,Form("BC position:[%.3f,%.3f,%.3f], RP position:[%.3f,%.3f,%.3f]. E=%.3f\n",
1065                       gposBadChannel.X(),gposBadChannel.Y(),gposBadChannel.Z(),
1066                       gposRecPoint.X(),gposRecPoint.Y(),gposRecPoint.Z(),rp->GetEnergy()));
1067       dR = gposBadChannel-gposRecPoint;
1068       dist = dR.Mag();
1069       if(dist<minDist) minDist = dist;
1070     }
1071
1072     rp->SetDistanceToBadCrystal(minDist);
1073   }
1074
1075 }