PHOS/AliPHOSClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 /* $Log:
  19    1 October 2000. Yuri Kharlov:
  20      AreNeighbours()
  21      PPSD upper layer is considered if number of layers>1
  22
  23    18 October 2000. Yuri Kharlov:
  24      AliPHOSClusterizerv1()
  25      CPV clusterizing parameters added
  26
  27      MakeClusters()
  28      After first PPSD digit remove EMC digits only once
  29 */
  30 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  31 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  32 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  33 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  34 //  Results are stored in TreeR#, branches PHOSEmcRP (EMC recPoints),
  35 //  PHOSCpvRP (CPV RecPoints) and AliPHOSClusterizer (Clusterizer with all
  36 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  37 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  38 //  standalone mode.
  39 // Use Case:
  40 //  root [0] AliPHOSClusterizerv1 * cl = new AliPHOSClusterizerv1("galice.root")
  41 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  42 //               //reads gAlice from header file "..."
  43 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  44 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  45 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  46 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  47 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  48 //               //sets another title four output branches
  49 //  root [4] cl->SetEmcLocalMaxCut(0.03)
  50 //               //set clusterization parameters
  51 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  52 //               //once more finds RecPoints options are
  53 //               // deb - print number of found rec points
  54 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  55 //               // time - print benchmarking results
  56
  57 // --- ROOT system ---
  58
  59 #include "TROOT.h"
  60 #include "TFile.h"
  61 #include "TFolder.h"
  62 #include "TMath.h"
  63 #include "TMinuit.h"
  64 #include "TTree.h"
  65 #include "TSystem.h"
  66 #include "TBenchmark.h"
  67
  68 // --- Standard library ---
  69
  70 #include <iostream.h>
  71 #include <iomanip.h>
  72
  73 // --- AliRoot header files ---
  74
  75 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
  76 #include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
  77 #include "AliPHOSDigit.h"
  78 #include "AliPHOSDigitizer.h"
  79 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
  80 #include "AliPHOS.h"
  81 #include "AliPHOSPpsdRecPoint.h"
  82 #include "AliRun.h"
  83
  84 ClassImp(AliPHOSClusterizerv1)
  85
  86 //____________________________________________________________________________
  87   AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1():AliPHOSClusterizer()
  88 {
  89   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
  90   SetName("AliPHOSClusterizer");
  91   SetTitle("Version 1") ;
  92
  93   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
  94   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
  95
  96   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
  97   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;
  98   fPpsdClusteringThreshold = 0.0000002 ;
  99
 100   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
 101   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
 102
 103   fW0                      = 4.5 ;
 104   fW0CPV                   = 4.0 ;
 105
 106   fGeom  = 0 ;
 107
 108   fDigits = 0 ;
 109   fDigitizer = 0 ;
 110   fEmcRecPoints = 0 ;
 111   fCpvRecPoints = 0 ;
 112
 113   fIsInitialized = kFALSE ;
 114
 115 }
 116 //____________________________________________________________________________
 117 AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1(const char* headerFile,const char* digitsFile):AliPHOSClusterizer()
 118 {
 119   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
 120   SetName("AliPHOSClusterizer");
 121   SetTitle("Version 1") ;
 122
 123   fNumberOfCpvClusters     = 0 ;
 124   fNumberOfEmcClusters     = 0 ;
 125
 126   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
 127   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;
 128   fPpsdClusteringThreshold = 0.0000002 ;
 129
 130   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
 131   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
 132
 133   fW0                      = 4.5 ;
 134   fW0CPV                   = 4.0 ;
 135
 136   fToUnfold = kTRUE ;
 137
 138   fHeaderFileName = headerFile  ;
 139   fDigitsBranchTitle = digitsFile ;
 140
 141   TFile * file = (TFile*) gROOT->GetFile(fHeaderFileName.Data() ) ;
 142
 143   if(file == 0){
 144     if(fHeaderFileName.Contains("rfio")) // if we read file using HPSS
 145       file =    TFile::Open(fHeaderFileName.Data(),"update") ;
 146     else
 147       file = new TFile(fHeaderFileName.Data(),"update") ;
 148     gAlice = (AliRun *) file->Get("gAlice") ;
 149   }
 150
 151   AliPHOS * phos = (AliPHOS *) gAlice->GetDetector("PHOS") ;
 152   fGeom  = AliPHOSGeometry::GetInstance(phos->GetGeometry()->GetName(),phos->GetGeometry()->GetTitle() );
 153
 154   fDigits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",10) ;
 155   fDigitizer = new AliPHOSDigitizer() ;
 156   fEmcRecPoints = new TObjArray(200) ;
 157   fCpvRecPoints = new TObjArray(200) ;
 158   fEmcRecPoints->SetOwner();          // This lets Clear() really detete rec.points in array
 159   fCpvRecPoints->SetOwner();
 160
 161   if(!gMinuit) gMinuit = new TMinuit(100) ;
 162
 163   // add Task to //root/Tasks folder
 164   TTask * roottasks = (TTask*)gROOT->GetRootFolder()->FindObject("Tasks") ;
 165   roottasks->Add(this) ;
 166
 167
 168   fIsInitialized = kTRUE ;
 169
 170 }
 171 //____________________________________________________________________________
 172 void AliPHOSClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
 173 {
 174   // Steering function
 175
 176   if(!fIsInitialized) Init() ;
 177
 178   if(strstr(option,"tim"))
 179     gBenchmark->Start("PHOSClusterizer");
 180
 181   Int_t nEvents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
 182
 183   for(fEvent = 0;fEvent< nEvents; fEvent++){
 184     if(!ReadDigits())  //reads digits for event fEvent
 185       return;
 186     MakeClusters() ;
 187
 188     if(fToUnfold) MakeUnfolding() ;
 189     WriteRecPoints() ;
 190     if(strstr(option,"deb"))
 191       PrintRecPoints(option) ;
 192   }
 193
 194   if(strstr(option,"tim")){
 195     gBenchmark->Stop("PHOSClusterizer");
 196     cout << "AliPHOSClusterizer:" << endl ;
 197     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer") << " seconds for Clusterizing "
 198          <<  gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer")/nEvents << " seconds per event " << endl ;
 199     cout << endl ;
 200   }
 201
 202
 203 }
 204
 205 //____________________________________________________________________________
 206 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::FindFit(AliPHOSEmcRecPoint * emcRP, int * maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 207                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters)
 208 {
 209   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 210   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 211   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 212
 213   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 214   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 215   gMinuit->SetFCN(AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 216                                          // To set the address of the minimization function
 217
 218   TList * toMinuit = new TList();
 219   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 220   toMinuit->AddAt(fDigits,1) ;
 221
 222   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 223
 224   // filling initial values for fit parameters
 225   AliPHOSDigit * digit ;
 226
 227   Int_t ierflg  = 0;
 228   Int_t index   = 0 ;
 229   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 230
 231   Int_t iDigit ;
 232
 233
 234   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 235     digit = (AliPHOSDigit *) maxAt[iDigit];
 236
 237     Int_t relid[4] ;
 238     Float_t x ;
 239     Float_t z ;
 240     fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 241     fGeom->RelPosInModule(relid, x, z) ;
 242
 243     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 244
 245     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 246     index++ ;
 247     if(ierflg != 0){
 248       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : x = " << x << endl ;
 249       return kFALSE;
 250     }
 251     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 252     index++ ;
 253     if(ierflg != 0){
 254       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : z = " << z << endl ;
 255       return kFALSE;
 256     }
 257     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 258     index++ ;
 259     if(ierflg != 0){
 260       cout << "PHOS Unfolding>  Unable to set initial value for fit procedure : energy = " << energy << endl ;
 261       return kFALSE;
 262     }
 263   }
 264
 265   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 266                       //  depends on it.
 267   Double_t p1 = 1.0 ;
 268   Double_t p2 = 0.0 ;
 269
 270   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 271   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 272   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 273   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 274
 275   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 276
 277   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 278     cout << "PHOS Unfolding>  Fit not converged, cluster abandoned "<< endl ;
 279     return kFALSE ;
 280   }
 281   for(index = 0; index < nPar; index++){
 282     Double_t err ;
 283     Double_t val ;
 284     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 285     fitparameters[index] = val ;
 286    }
 287
 288   delete toMinuit ;
 289   return kTRUE;
 290
 291 }
 292
 293 //____________________________________________________________________________
 294 void AliPHOSClusterizerv1::Init()
 295 {
 296   //Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 297   if(!fIsInitialized){
 298     if(fHeaderFileName.IsNull())
 299       fHeaderFileName = "galice.root" ;
 300
 301
 302     TFile * file = (TFile*) gROOT->GetFile(fHeaderFileName.Data() ) ;
 303
 304     if(file == 0){
 305       file = new TFile(fHeaderFileName.Data(),"update") ;
 306       gAlice = (AliRun *) file->Get("gAlice") ;
 307     }
 308
 309     AliPHOS * phos = (AliPHOS *) gAlice->GetDetector("PHOS") ;
 310     fGeom  = AliPHOSGeometry::GetInstance(phos->GetGeometry()->GetName(),phos->GetGeometry()->GetTitle() );
 311
 312     fDigits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",10) ;
 313     fDigitizer = new AliPHOSDigitizer() ;
 314     fEmcRecPoints = new TObjArray(200) ;
 315     fCpvRecPoints = new TObjArray(200) ;
 316     fEmcRecPoints->SetOwner();          // This lets Clear() really detete rec.points in array
 317     fCpvRecPoints->SetOwner();
 318
 319     if(!gMinuit) gMinuit = new TMinuit(100) ;
 320
 321     // add Task to //root/Tasks folder
 322     TTask * roottasks = (TTask*)gROOT->GetRootFolder()->FindObject("Tasks") ;
 323     roottasks->Add(this) ;
 324
 325     fIsInitialized = kTRUE ;
 326   }
 327 }
 328 //____________________________________________________________________________
 329 Int_t AliPHOSClusterizerv1::AreNeighbours(AliPHOSDigit * d1, AliPHOSDigit * d2)const
 330 {
 331   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 332   //                                       = 1 are neighbour
 333   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 334   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 335   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 336   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 337
 338   Int_t rv = 0 ;
 339
 340   Int_t relid1[4] ;
 341   fGeom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 342
 343   Int_t relid2[4] ;
 344   fGeom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 345
 346   if ( (relid1[0] == relid2[0]) && (relid1[1]==relid2[1]) ) { // inside the same PHOS module and the same PPSD Module
 347     Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[2] - relid2[2] ) ;
 348     Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[3] - relid2[3] ) ;
 349
 350     if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 351       rv = 1 ;
 352     }
 353     else {
 354       if((relid2[2] > relid1[2]) && (relid2[3] > relid1[3]+1))
 355         rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 356     }
 357
 358   }
 359   else {
 360
 361     if( (relid1[0] < relid2[0]) || (relid1[1] < relid2[1]) )
 362       rv=2 ;
 363
 364   }
 365
 366   //Do NOT clusterize upper PPSD
 367   if( IsInPpsd(d1) && IsInPpsd(d2) &&
 368      relid1[1] > 0                 &&
 369      relid1[1] < fGeom->GetNumberOfPadsPhi()*fGeom->GetNumberOfPadsPhi() ) rv = 2 ;
 370
 371   return rv ;
 372 }
 373
 374
 375 //____________________________________________________________________________
 376 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInEmc(AliPHOSDigit * digit) const
 377 {
 378   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
 379
 380   Bool_t rv = kFALSE ;
 381
 382   Int_t relid[4] ;
 383   fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 384
 385   if ( relid[1] == 0  ) rv = kTRUE;
 386
 387   return rv ;
 388 }
 389
 390 //____________________________________________________________________________
 391 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInPpsd(AliPHOSDigit * digit) const
 392 {
 393   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-PPSD module
 394
 395   Bool_t rv = kFALSE ;
 396
 397   Int_t relid[4] ;
 398   fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 399
 400   if ( relid[1] > 0 && relid[0] > fGeom->GetNCPVModules() ) rv = kTRUE;
 401
 402   return rv ;
 403 }
 404
 405 //____________________________________________________________________________
 406 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInCpv(AliPHOSDigit * digit) const
 407 {
 408   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
 409
 410   Bool_t rv = kFALSE ;
 411
 412   Int_t relid[4] ;
 413   fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 414
 415   if ( relid[1] > 0 && relid[0] <= fGeom->GetNCPVModules() ) rv = kTRUE;
 416
 417   return rv ;
 418 }
 419 //____________________________________________________________________________
 420 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::ReadDigits()
 421  {
 422    // reads digitis with specified title from TreeD
 423
 424   fNumberOfEmcClusters  = 0 ;
 425   fNumberOfCpvClusters  = 0 ;
 426
 427   // Get Digits Tree header from file
 428   gAlice->GetEvent(fEvent) ;
 429   gAlice->SetEvent(fEvent) ;
 430
 431   TTree * treeD = gAlice->TreeD()  ;
 432
 433   if(treeD==0){
 434     char treeName[20];
 435     sprintf(treeName,"TreeD%d",fEvent);
 436     cout << "Error in AliPHOSClusterizerv1 : no "<<treeName << endl  ;
 437     cout << "    Do nothing " << endl ;
 438     return kFALSE ;
 439   }
 440
 441   TBranch * digitsBranch = 0;
 442   TBranch * digitizerBranch = 0;
 443
 444   TObjArray * branches = treeD->GetListOfBranches() ;
 445   Int_t ibranch;
 446   Bool_t phosNotFound = kTRUE ;
 447   Bool_t digitizerNotFound = kTRUE ;
 448
 449   for(ibranch = 0;ibranch <branches->GetEntries();ibranch++){
 450
 451     if(phosNotFound){
 452       digitsBranch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 453       if( fDigitsBranchTitle.CompareTo(digitsBranch->GetTitle())==0 )
 454         if( strcmp(digitsBranch->GetName(),"PHOS") == 0)
 455           phosNotFound = kFALSE ;
 456     }
 457
 458     if(digitizerNotFound){
 459       digitizerBranch = (TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 460       if( fDigitsBranchTitle.CompareTo(digitizerBranch->GetTitle()) == 0)
 461         if( strcmp(digitizerBranch->GetName(),"AliPHOSDigitizer") == 0)
 462           digitizerNotFound = kFALSE ;
 463     }
 464
 465   }
 466
 467   if(digitizerNotFound || phosNotFound){
 468     cout << "ERROR in AliPHOSClusterizerv1: " << endl ;
 469     cout << "      Can't find Branch with digits or Digitizer "<< endl ; ;
 470     cout << "      Do nothing" <<endl  ;
 471     return kFALSE ;
 472   }
 473
 474   digitsBranch->SetAddress(&fDigits) ;
 475   digitizerBranch->SetAddress(&fDigitizer) ;
 476
 477   digitsBranch->GetEntry(0) ;
 478   digitizerBranch->GetEntry(0) ;
 479
 480   fPedestal = fDigitizer->GetPedestal() ;
 481   fSlope    = fDigitizer->GetSlope() ;
 482   return kTRUE ;
 483 }
 484
 485 //____________________________________________________________________________
 486 void AliPHOSClusterizerv1::WriteRecPoints()
 487 {
 488   // Checks, if PHOSEmcRP etc. branches with given title already exist,
 489   // if yes exits without writing,
 490   // else creates new branches with given title
 491   // fills and writes into TreeR.
 492
 493   Int_t index ;
 494   //Evaluate poisition, dispersion and other RecPoint properties...
 495   for(index = 0; index < fEmcRecPoints->GetEntries(); index++)
 496     ((AliPHOSEmcRecPoint *)fEmcRecPoints->At(index))->EvalAll(fW0,fDigits) ;
 497
 498   fEmcRecPoints->Sort() ;
 499
 500   for(index = 0; index < fEmcRecPoints->GetEntries(); index++)
 501     ((AliPHOSEmcRecPoint *)fEmcRecPoints->At(index))->SetIndexInList(index) ;
 502
 503   fEmcRecPoints->Expand(fEmcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 504
 505   //Now the same for CPV
 506   for(index = 0; index < fCpvRecPoints->GetEntries(); index++)
 507     ((AliPHOSRecPoint *)fCpvRecPoints->At(index))->EvalAll(fW0CPV,fDigits)  ;
 508
 509   fCpvRecPoints->Sort() ;
 510
 511   for(index = 0; index < fCpvRecPoints->GetEntries(); index++)
 512     ((AliPHOSRecPoint *)fCpvRecPoints->At(index))->SetIndexInList(index) ;
 513
 514   fCpvRecPoints->Expand(fCpvRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 515
 516   if(gAlice->TreeR()==0)
 517     gAlice->MakeTree("R") ;
 518
 519
 520   //Check, if branches already exist
 521   TBranch * emcBranch = 0;
 522   TBranch * cpvBranch = 0;
 523   TBranch * clusterizerBranch = 0;
 524
 525   TObjArray * branches = gAlice->TreeR()->GetListOfBranches() ;
 526   Int_t ibranch;
 527   Bool_t emcNotFound = kTRUE ;
 528   Bool_t cpvNotFound = kTRUE ;
 529   Bool_t clusterizerNotFound = kTRUE ;
 530
 531   for(ibranch = 0;ibranch <branches->GetEntries();ibranch++){
 532
 533     if(emcNotFound){
 534       emcBranch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 535       if( fRecPointsBranchTitle.CompareTo(emcBranch->GetTitle())==0 ){
 536         if( strcmp(emcBranch->GetName(),"PHOSEmcRP") == 0) {
 537           emcNotFound = kFALSE ;
 538         }
 539       }
 540     }
 541     if(cpvNotFound){
 542       cpvBranch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 543       if( fRecPointsBranchTitle.CompareTo(cpvBranch->GetTitle())==0 ){
 544         if( strcmp(cpvBranch->GetName(),"PHOSCpvRP") == 0) {
 545           cpvNotFound = kFALSE ;
 546         }
 547       }
 548     }
 549
 550     if(clusterizerNotFound){
 551       clusterizerBranch = (TBranch *) branches->At(ibranch) ;
 552       if( fRecPointsBranchTitle.CompareTo(clusterizerBranch->GetTitle()) == 0){
 553         if( strcmp(clusterizerBranch->GetName(),"AliPHOSClusterizer") == 0) {
 554           clusterizerNotFound = kFALSE ;
 555         }
 556       }
 557     }
 558
 559   }
 560
 561   if(!(clusterizerNotFound && emcNotFound && cpvNotFound)){
 562     cout << "AliPHOSClusterizer error" << endl;
 563     cout << "       Branches PHOSEmcRP, PHOSCpvRP and AliPHOSClusterizer " << endl ;
 564     cout << "       with title '" << fRecPointsBranchTitle.Data() <<"' already exist" << endl ;
 565     cout << "       can not overwrite " << endl ;
 566     return ;
 567   }
 568
 569   //Make branches in TreeR for RecPoints and Clusterizer
 570   char * filename = 0;
 571   if(gSystem->Getenv("CONFIG_SPLIT_FILE")!=0){   //generating file name
 572     filename = new char[strlen(gAlice->GetBaseFile())+20] ;
 573     sprintf(filename,"%s/PHOS.Reco.root",gAlice->GetBaseFile()) ;
 574   }
 575
 576   //Make new branches
 577   TDirectory *cwd = gDirectory;
 578
 579   //First EMC
 580   Int_t bufferSize = 32000 ;
 581   Int_t splitlevel = 0 ;
 582   emcBranch = gAlice->TreeR()->Branch("PHOSEmcRP","TObjArray",&fEmcRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 583   emcBranch->SetTitle(fRecPointsBranchTitle.Data());
 584   if (filename) {
 585     emcBranch->SetFile(filename);
 586     TIter next( emcBranch->GetListOfBranches());
 587     TBranch * sb ;
 588     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 589       sb->SetFile(filename);
 590     }
 591     cwd->cd();
 592   }
 593
 594   //Now CPV branch
 595   cpvBranch = gAlice->TreeR()->Branch("PHOSCpvRP","TObjArray",&fCpvRecPoints,bufferSize,splitlevel);
 596   cpvBranch->SetTitle(fRecPointsBranchTitle.Data());
 597   if (filename) {
 598     cpvBranch->SetFile(filename);
 599     TIter next( cpvBranch->GetListOfBranches());
 600     TBranch * sb;
 601     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 602       sb->SetFile(filename);
 603     }
 604     cwd->cd();
 605   }
 606
 607   //And Finally  clusterizer branch
 608   AliPHOSClusterizerv1 * cl = this ;
 609   clusterizerBranch = gAlice->TreeR()->Branch("AliPHOSClusterizer","AliPHOSClusterizerv1",
 610                                               &cl,bufferSize,splitlevel);
 611   clusterizerBranch->SetTitle(fRecPointsBranchTitle.Data());
 612   if (filename) {
 613     clusterizerBranch->SetFile(filename);
 614     TIter next( clusterizerBranch->GetListOfBranches());
 615     TBranch * sb ;
 616     while ((sb=(TBranch*)next())) {
 617       sb->SetFile(filename);
 618     }
 619     cwd->cd();
 620   }
 621
 622
 623   emcBranch->Fill() ;
 624   cpvBranch->Fill() ;
 625   clusterizerBranch->Fill() ;
 626   gAlice->TreeR()->Write(0,kOverwrite) ;
 627
 628 }
 629
 630 //____________________________________________________________________________
 631 void AliPHOSClusterizerv1::MakeClusters()
 632 {
 633   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 634   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 635   fEmcRecPoints->Clear() ;
 636   fCpvRecPoints->Clear() ;
 637
 638
 639   // Clusterization starts
 640   TClonesArray * digits =  (TClonesArray*)fDigits->Clone() ;
 641
 642   TIter nextdigit(digits) ;
 643   AliPHOSDigit * digit ;
 644   Bool_t notremoved = kTRUE ;
 645
 646   while ( (digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the list of digits
 647     AliPHOSRecPoint * clu = 0 ;
 648
 649     TArrayI clusterdigitslist(1000) ;
 650     Int_t index ;
 651
 652     if (( IsInEmc (digit) && Calibrate(digit->GetAmp()) > fEmcClusteringThreshold  ) ||
 653         ( IsInPpsd(digit) && Calibrate(digit->GetAmp()) > fPpsdClusteringThreshold ) ||
 654         ( IsInCpv (digit) && Calibrate(digit->GetAmp()) > fCpvClusteringThreshold  ) ) {
 655
 656       Int_t iDigitInCluster = 0 ;
 657
 658       if  ( IsInEmc(digit) ) {
 659         // start a new EMC RecPoint
 660         if(fNumberOfEmcClusters >= fEmcRecPoints->GetSize()) fEmcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters+1) ;
 661         fEmcRecPoints->AddAt(new  AliPHOSEmcRecPoint(), fNumberOfEmcClusters) ;
 662         clu = (AliPHOSEmcRecPoint *) fEmcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ;
 663         fNumberOfEmcClusters++ ;
 664         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp())) ;
 665         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList() ;
 666         iDigitInCluster++ ;
 667         digits->Remove(digit) ;
 668
 669       } else {
 670
 671         // start a new PPSD/CPV cluster
 672         if(fNumberOfCpvClusters >= fCpvRecPoints->GetSize()) fCpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters+1);
 673         if(IsInPpsd(digit))
 674           fCpvRecPoints->AddAt(new AliPHOSPpsdRecPoint(),fNumberOfCpvClusters) ;
 675         else
 676           fCpvRecPoints->AddAt(new AliPHOSCpvRecPoint(), fNumberOfCpvClusters) ;
 677         clu =  (AliPHOSPpsdRecPoint *) fCpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters)  ;
 678         fNumberOfCpvClusters++ ;
 679
 680         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp()) ) ;
 681         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList()  ;
 682         iDigitInCluster++ ;
 683         digits->Remove(digit) ;
 684         nextdigit.Reset() ;
 685
 686         // Here we remove resting EMC digits, which cannot make cluster
 687
 688         if( notremoved ) {
 689           while( ( digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit() ) ) {
 690             if( IsInEmc(digit) )
 691               digits->Remove(digit) ;
 692             else
 693               break ;
 694           }
 695           notremoved = kFALSE ;
 696         }
 697
 698       } // else
 699
 700       nextdigit.Reset() ;
 701
 702       AliPHOSDigit * digitN ;
 703       index = 0 ;
 704       while (index < iDigitInCluster){ // scan over digits already in cluster
 705         digit =  (AliPHOSDigit*)fDigits->At(clusterdigitslist[index])  ;
 706         index++ ;
 707         while ( (digitN = (AliPHOSDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the reduced list of digits
 708           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 709           switch (ineb ) {
 710           case 0 :   // not a neighbour
 711             break ;
 712           case 1 :   // are neighbours
 713             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp() ) ) ;
 714             clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 715             iDigitInCluster++ ;
 716             digits->Remove(digitN) ;
 717             break ;
 718           case 2 :   // too far from each other
 719             goto endofloop;
 720           } // switch
 721
 722         } // while digitN
 723
 724       endofloop: ;
 725         nextdigit.Reset() ;
 726
 727       } // loop over cluster
 728
 729     } // energy theshold
 730
 731
 732   } // while digit
 733
 734   delete digits ;
 735
 736 }
 737
 738 //____________________________________________________________________________
 739 void AliPHOSClusterizerv1::MakeUnfolding()
 740 {
 741   // Unfolds clusters using the shape of an ElectroMagnetic shower
 742   // Performs unfolding of all EMC/CPV but NOT ppsd clusters
 743
 744   // Unfold first EMC clusters
 745   if(fNumberOfEmcClusters > 0){
 746
 747     Int_t nModulesToUnfold = fGeom->GetNModules() ;
 748
 749     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfEmcClusters ;
 750     Int_t index ;
 751     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
 752
 753       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = (AliPHOSEmcRecPoint *) fEmcRecPoints->At(index) ;
 754       if(emcRecPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 755         break ;
 756
 757       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 758       Int_t * maxAt = new Int_t[nMultipl] ;
 759       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 760       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fEmcLocMaxCut,fDigits) ;
 761
 762       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 763         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 764         fEmcRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 765         fEmcRecPoints->Compress() ;
 766         index-- ;
 767         fNumberOfEmcClusters -- ;
 768         numberofNotUnfolded-- ;
 769       }
 770
 771       delete[] maxAt ;
 772       delete[] maxAtEnergy ;
 773     }
 774   }
 775   // Unfolding of EMC clusters finished
 776
 777
 778   // Unfold now CPV clusters
 779   if(fNumberOfCpvClusters > 0){
 780
 781     Int_t nModulesToUnfold = fGeom->GetNCPVModules() ;
 782
 783     Int_t numberofCpvNotUnfolded = fNumberOfCpvClusters ;
 784     Int_t index ;
 785     for(index = 0 ; index < numberofCpvNotUnfolded ; index++){
 786
 787       AliPHOSRecPoint * recPoint = (AliPHOSRecPoint *) fCpvRecPoints->At(index) ;
 788
 789       if(recPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
 790         break ;
 791
 792       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = (AliPHOSEmcRecPoint*) recPoint ;
 793
 794       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ;
 795       Int_t * maxAt = new Int_t[nMultipl] ;
 796       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 797       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fCpvLocMaxCut,fDigits) ;
 798
 799       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 800         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 801         fCpvRecPoints->Remove(emcRecPoint);
 802         fCpvRecPoints->Compress() ;
 803         index-- ;
 804         numberofCpvNotUnfolded-- ;
 805         fNumberOfCpvClusters-- ;
 806       }
 807
 808       delete[] maxAt ;
 809       delete[] maxAtEnergy ;
 810     }
 811   }
 812   //Unfolding of Cpv clusters finished
 813
 814 }
 815
 816 //____________________________________________________________________________
 817 Double_t  AliPHOSClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 818 {
 819   // Shape of the shower (see PHOS TDR)
 820   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 821
 822   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 823   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 824   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 825   return shape ;
 826 }
 827
 828 //____________________________________________________________________________
 829 void  AliPHOSClusterizerv1::UnfoldCluster(AliPHOSEmcRecPoint * iniEmc,
 830                                                  Int_t nMax,
 831                                                  int * maxAt,
 832                                                  Float_t * maxAtEnergy)
 833 {
 834   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 835
 836   Int_t nPar = 3 * nMax ;
 837   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
 838
 839   Bool_t rv = FindFit(iniEmc, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
 840   if( !rv ) {
 841     // Fit failed, return and remove cluster
 842     delete[] fitparameters ;
 843     return ;
 844   }
 845
 846   // create ufolded rec points and fill them with new energy lists
 847   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with fit (without fluctuations): efit[]
 848   // and later correct this number in acordance with actual energy deposition
 849
 850   Int_t nDigits = iniEmc->GetMultiplicity() ;
 851   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
 852   Float_t xDigit,zDigit,distance ;
 853   Float_t xpar,zpar,epar  ;
 854   Int_t relid[4] ;
 855   AliPHOSDigit * digit ;
 856   Int_t * emcDigits = iniEmc->GetDigitsList() ;
 857
 858   Int_t iparam ;
 859   Int_t iDigit ;
 860   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 861     digit = (AliPHOSDigit*) fDigits->At(emcDigits[iDigit] ) ;
 862     fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 863     fGeom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 864     efit[iDigit] = 0;
 865
 866     iparam = 0 ;
 867     while(iparam < nPar ){
 868       xpar = fitparameters[iparam] ;
 869       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 870       epar = fitparameters[iparam+2] ;
 871       iparam += 3 ;
 872       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 873       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 874       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(distance) ;
 875     }
 876   }
 877
 878
 879   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
 880   // so that energy deposited in each cell is distributed betwin new clusters proportionally
 881   // to its contribution to efit
 882
 883   Float_t * emcEnergies = iniEmc->GetEnergiesList() ;
 884   Float_t ratio ;
 885
 886   iparam = 0 ;
 887   while(iparam < nPar ){
 888     xpar = fitparameters[iparam] ;
 889     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 890     epar = fitparameters[iparam+2] ;
 891     iparam += 3 ;
 892
 893     AliPHOSEmcRecPoint * emcRP ;
 894
 895     if(iniEmc->IsEmc()){ //create new entries in fEmcRecPoints...
 896
 897       if(fNumberOfEmcClusters >= fEmcRecPoints->GetSize())
 898         fEmcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters) ;
 899
 900       (*fEmcRecPoints)[fNumberOfEmcClusters] = new AliPHOSEmcRecPoint() ;
 901       emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) fEmcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters);
 902       fNumberOfEmcClusters++ ;
 903     }
 904     else{//create new entries in fCpvRecPoints
 905       if(fNumberOfCpvClusters >= fCpvRecPoints->GetSize())
 906         fCpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters) ;
 907
 908       (*fCpvRecPoints)[fNumberOfCpvClusters] = new AliPHOSCpvRecPoint() ;
 909       emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) fCpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters);
 910       fNumberOfCpvClusters++ ;
 911     }
 912
 913     Float_t eDigit ;
 914     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 915       digit = (AliPHOSDigit*) fDigits->At( emcDigits[iDigit] ) ;
 916       fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 917       fGeom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 918       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
 919       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
 920       ratio = epar * ShowerShape(distance) / efit[iDigit] ;
 921       eDigit = emcEnergies[iDigit] * ratio ;
 922       emcRP->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
 923     }
 924   }
 925
 926   delete[] fitparameters ;
 927   delete[] efit ;
 928
 929 }
 930
 931 //_____________________________________________________________________________
 932 void AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad, Double_t & fret, Double_t * x, Int_t iflag)
 933 {
 934   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 935   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 936
 937
 938   TList * toMinuit = (TList*) gMinuit->GetObjectFit() ;
 939
 940   AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint*) toMinuit->At(0)  ;
 941   TClonesArray * digits = (TClonesArray*)toMinuit->At(1)  ;
 942
 943
 944
 945   //  AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) gMinuit->GetObjectFit() ; // EmcRecPoint to fit
 946
 947   Int_t * emcDigits     = emcRP->GetDigitsList() ;
 948
 949   Int_t nOfDigits = emcRP->GetDigitsMultiplicity() ;
 950
 951   Float_t * emcEnergies = emcRP->GetEnergiesList() ;
 952
 953   AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
 954
 955   fret = 0. ;
 956   Int_t iparam ;
 957
 958   if(iflag == 2)
 959     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)
 960       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
 961
 962   Double_t efit ;
 963
 964   AliPHOSDigit * digit ;
 965   Int_t iDigit ;
 966
 967   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOfDigits ; iDigit++) {
 968
 969     digit = (AliPHOSDigit*) digits->At( emcDigits[iDigit] ) ;
 970
 971     Int_t relid[4] ;
 972     Float_t xDigit ;
 973     Float_t zDigit ;
 974
 975     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 976
 977     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
 978
 979      if(iflag == 2){  // calculate gradient
 980        Int_t iParam = 0 ;
 981        efit = 0 ;
 982        while(iParam < nPar ){
 983          Double_t distance = (xDigit - x[iParam]) * (xDigit - x[iParam]) ;
 984          iParam++ ;
 985          distance += (zDigit - x[iParam]) * (zDigit - x[iParam]) ;
 986          distance = TMath::Sqrt( distance ) ;
 987          iParam++ ;
 988          efit += x[iParam] * ShowerShape(distance) ;
 989          iParam++ ;
 990        }
 991        Double_t sum = 2. * (efit - emcEnergies[iDigit]) / emcEnergies[iDigit] ; // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 992        iParam = 0 ;
 993        while(iParam < nPar ){
 994          Double_t xpar = x[iParam] ;
 995          Double_t zpar = x[iParam+1] ;
 996          Double_t epar = x[iParam+2] ;
 997          Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
 998          Double_t shape = sum * ShowerShape(dr) ;
 999          Double_t r4 = dr*dr*dr*dr ;
1000          Double_t r295 = TMath::Power(dr,2.95) ;
1001          Double_t deriv =-4. * dr*dr * ( 2.32 / ( (2.32 + 0.26 * r4) * (2.32 + 0.26 * r4) ) +
1002                                          0.0316 * (1. + 0.0171 * r295) / ( ( 1. + 0.0652 * r295) * (1. + 0.0652 * r295) ) ) ;
1003
1004          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x
1005          iParam++ ;
1006          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z
1007          iParam++ ;
1008          Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy
1009          iParam++ ;
1010        }
1011      }
1012      efit = 0;
1013      iparam = 0 ;
1014
1015      while(iparam < nPar ){
1016        Double_t xpar = x[iparam] ;
1017        Double_t zpar = x[iparam+1] ;
1018        Double_t epar = x[iparam+2] ;
1019        iparam += 3 ;
1020        Double_t distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
1021        distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
1022        efit += epar * ShowerShape(distance) ;
1023      }
1024
1025      fret += (efit-emcEnergies[iDigit])*(efit-emcEnergies[iDigit])/emcEnergies[iDigit] ;
1026      // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
1027   }
1028
1029 }
1030
1031 //____________________________________________________________________________
1032 void AliPHOSClusterizerv1::Print(Option_t * option)const
1033 {
1034   // Prints the parameters of the clusterizer
1035   if(fIsInitialized){
1036
1037     // Print parameters
1038
1039     cout << "---------------"<< GetName() << " " << GetTitle()<< "-----------" << endl
1040          << "Clusterizing digits from the file: " << fHeaderFileName.Data() << endl
1041          << "                           Branch: " << fDigitsBranchTitle.Data() << endl
1042          << endl
1043          << "                       EMC Clustering threshold = " << fEmcClusteringThreshold << endl
1044          << "                       EMC Local Maximum cut    = " << fEmcLocMaxCut << endl
1045          << "                       EMC Logarothmic weight   = " << fW0 << endl
1046          << endl
1047          << "                       CPV Clustering threshold = " << fCpvClusteringThreshold << endl
1048          << "                       CPV Local Maximum cut    = " << fCpvLocMaxCut << endl
1049        << "                       CPV Logarothmic weight   = " << fW0CPV << endl
1050          << endl
1051          << "                      PPSD  Clustering threshold = " << fPpsdClusteringThreshold << endl;
1052     if(fToUnfold)
1053       cout << " Unfolding on " << endl ;
1054     else
1055       cout << " Unfolding off " << endl ;
1056
1057     cout << "------------------------------------------------------------------" <<endl ;
1058   }
1059   else
1060     cout << " AliPHOSClusterizerv1 not initialized " << endl ;
1061 }
1062 //____________________________________________________________________________
1063 void AliPHOSClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
1064 {
1065   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliPHOSClusterizer
1066
1067   cout << "AliPHOSClusterizerv1: " << endl ;
1068   cout << "       Found "<< fEmcRecPoints->GetEntriesFast() << " EMC Rec Points and "
1069            << fCpvRecPoints->GetEntriesFast() << " CPV RecPoints" << endl ;
1070
1071   if(strstr(option,"all")) {
1072     cout << "EMC clusters " << endl ;
1073     cout << "  Index    "
1074          << "  Ene(MeV) "
1075          << "  Multi    "
1076          << "  Module   "
1077          << "    X      "
1078          << "    Y      "
1079          << "    Z      "
1080          << " Lambda 1  "
1081          << " Lambda 2  "
1082          << " MaxEnergy "
1083          << " # of prim "
1084          << " Primaries list "      <<  endl;
1085
1086     Int_t index ;
1087     for (index = 0 ; index < fEmcRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1088       AliPHOSEmcRecPoint * rp = (AliPHOSEmcRecPoint * )fEmcRecPoints->At(index) ;
1089
1090       cout << setw(6) << rp->GetIndexInList() << "     ";
1091       cout << setw(6) << rp->GetEnergy()      << "     ";
1092       cout << setw(6) << rp->GetMultiplicity()<< "     ";
1093       cout << setw(6) << rp->GetPHOSMod()     << "     ";
1094
1095       TVector3  locpos;
1096       rp->GetLocalPosition(locpos);
1097       cout << setw(8) <<  locpos.X()          << "     ";
1098       cout << setw(8) <<  locpos.Y()          << "     ";
1099       cout << setw(8) <<  locpos.Z()          << "     ";
1100
1101       Float_t lambda[2];
1102       rp->GetElipsAxis(lambda);
1103       cout << setw(10)<<  lambda[0]           << "     ";
1104       cout << setw(10)<<  lambda[1]           << "     ";
1105
1106
1107       Int_t * primaries;
1108       Int_t nprimaries;
1109       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1110       cout << setw(8) <<    primaries         << "     ";
1111
1112       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
1113         cout << setw(4)  <<  primaries[iprimary] << " ";
1114       cout << endl;
1115     }
1116     cout << endl ;
1117
1118     //Now plot PCV/PPSD recPoints
1119     cout << "EMC clusters " << endl ;
1120     cout << "  Index    "
1121          << "  Multi    "
1122          << "  Module   "
1123          << "  Layer    "
1124          << "    X      "
1125          << "    Y      "
1126          << "    Z      "
1127          << " # of prim "
1128          << " Primaries list "      <<  endl;
1129
1130     for (index = 0 ; index < fEmcRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1131       AliPHOSRecPoint * rp = (AliPHOSRecPoint * )fCpvRecPoints->At(index) ;
1132       cout << setw(6) << rp->GetIndexInList() << "     ";
1133       cout << setw(6) << rp->GetPHOSMod()     << "     ";
1134
1135       if( (strcmp(rp->ClassName() , "AliPHOSPpsdRecPoint" )) == 0){
1136         AliPHOSPpsdRecPoint * ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint*) rp ;
1137         if(ppsd->GetUp())
1138           cout <<"        CPV     ";
1139         else
1140           cout <<"       PPSD     ";
1141       }
1142       else
1143         cout <<"        CPV     ";
1144
1145       TVector3  locpos;
1146       rp->GetLocalPosition(locpos);
1147       cout << setw(8) <<  locpos.X()          << "     ";
1148       cout << setw(8) <<  locpos.Y()          << "     ";
1149       cout << setw(8) <<  locpos.Z()          << "     ";
1150
1151       Int_t * primaries;
1152       Int_t nprimaries;
1153       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1154       cout << setw(8) <<    primaries         << "     ";
1155
1156       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
1157         cout << setw(4)  <<  primaries[iprimary] << " ";
1158       cout << endl;
1159     }
1160
1161
1162     cout << "-------------------------------------------------"<<endl ;
1163   }
1164 }
1165