Coding convention obeyed
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSClusterizerv1.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 /* $Log:
19    1 October 2000. Yuri Kharlov:
20      AreNeighbours()
21      PPSD upper layer is considered if number of layers>1
22
23    18 October 2000. Yuri Kharlov:
24      AliPHOSClusterizerv1()
25      CPV clusterizing parameters added
26
27      MakeClusters()
28      After first PPSD digit remove EMC digits only once
29 */
30 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
31 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
32 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and 
33 //  unfolds the clusters having several local maxima.  
34 //  Results are stored in TreeR#, branches PHOSEmcRP (EMC recPoints),
35 //  PHOSCpvRP (CPV RecPoints) and AliPHOSClusterizer (Clusterizer with all 
36 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
37 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in 
38 //  standalone mode.
39 // Use Case:
40 //  root [0] AliPHOSClusterizerv1 * cl = new AliPHOSClusterizerv1("galice.root", "recpointsname", "digitsname")  
41 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
42 //               // reads gAlice from header file "galice.root", uses digits stored in the branch names "digitsname" (default = "Default")
43 //               // and saves recpoints in branch named "recpointsname" (default = "digitsname")                       
44 //  root [1] cl->ExecuteTask()  
45 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
46 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2") 
47 //               //sets another title for Digitis (input) branch
48 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")  
49 //               //sets another title four output branches
50 //  root [4] cl->SetEmcLocalMaxCut(0.03)  
51 //               //set clusterization parameters
52 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")  
53 //               //once more finds RecPoints options are 
54 //               // deb - print number of found rec points
55 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics 
56 //               // time - print benchmarking results
57
58 // --- ROOT system ---
59
60 #include "TROOT.h" 
61 #include "TFile.h" 
62 #include "TFolder.h" 
63 #include "TMath.h" 
64 #include "TMinuit.h"
65 #include "TTree.h" 
66 #include "TSystem.h" 
67 #include "TBenchmark.h"
68
69 // --- Standard library ---
70
71 // --- AliRoot header files ---
72 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
73 #include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
74 #include "AliPHOSDigit.h"
75 #include "AliPHOSDigitizer.h"
76 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
77 #include "AliPHOS.h"
78 #include "AliPHOSGetter.h"
79 #include "AliRun.h"
80 #include "AliPHOSCalibrManager.h"
81 #include "AliPHOSCalibrationData.h"
82
83 ClassImp(AliPHOSClusterizerv1)
84   
85 //____________________________________________________________________________
86   AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1() : AliPHOSClusterizer()
87 {
88   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
89   
90   InitParameters() ; 
91   fDefaultInit = kTRUE ; 
92 }
93
94 //____________________________________________________________________________
95 AliPHOSClusterizerv1::AliPHOSClusterizerv1(const char* headerFile,const char* name, const Bool_t toSplit)
96 :AliPHOSClusterizer(headerFile, name, toSplit)
97 {
98   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
99   
100   InitParameters() ;
101   Init() ;
102   fDefaultInit = kFALSE ; 
103
104 }
105
106 //____________________________________________________________________________
107   AliPHOSClusterizerv1::~AliPHOSClusterizerv1()
108 {
109   // dtor
110
111   delete fPedestals ;
112   delete fGains ;
113
114   fSplitFile = 0 ; 
115
116 }
117
118 //____________________________________________________________________________
119 const TString AliPHOSClusterizerv1::BranchName() const 
120 {  
121   // Returns branch name of the AliPHOSClusterizer
122
123   TString branchName(GetName() ) ;
124   branchName.Remove(branchName.Index(Version())-1) ;
125   return branchName ;
126 }
127  
128 //____________________________________________________________________________
129 Float_t  AliPHOSClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp, Int_t absId) const
130
131   // Returns energy value in the cell absId with the digit amplitude amp
132
133   if(fPedestals || fGains ){  //use calibration data
134     if(!fPedestals || !fGains ){
135       Error("Calibrate","Either Pedestals of Gains not set!") ;
136       return 0 ;
137     }
138     Float_t en=(amp - fPedestals->Data(absId))*fGains->Data(absId) ;
139     if(en>0)
140       return en ;
141     else
142       return 0. ;
143   }
144   else{ //simulation
145     if(absId <= fEmcCrystals) //calibrate as EMC 
146       return fADCpedestalEmc + amp*fADCchanelEmc ;        
147     else //calibrate as CPV
148       return fADCpedestalCpv+ amp*fADCchanelCpv ;       
149   }
150 }
151
152 //____________________________________________________________________________
153 void AliPHOSClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
154 {
155   // Steering method
156   if( strcmp(GetName(), "")== 0 ) 
157     Init() ;
158
159   if(strstr(option,"tim"))
160     gBenchmark->Start("PHOSClusterizer"); 
161   
162   if(strstr(option,"print"))
163     Print("") ; 
164
165   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
166   if(gime->BranchExists("RecPoints"))
167     return ;
168
169   //test, if this is real data:
170   TBranch * eh = gAlice->TreeE()->GetBranch("AliPHOSBeamTestEvent") ;
171   if(eh){ //Read CalibrationData
172     AliPHOSCalibrManager * cmngr=AliPHOSCalibrManager::GetInstance() ;
173     if(!cmngr){ //not defined yet
174       cmngr=AliPHOSCalibrManager::GetInstance("PHOSBTCalibration.root") ;
175     } 
176     if(fPedestals)
177       delete fPedestals ;
178     fPedestals = new AliPHOSCalibrationData("Pedestals",fCalibrVersion) ;
179     cmngr->ReadFromRoot(*fPedestals,fCalibrRun) ;
180     if(fGains)
181       delete fGains ;
182     fGains = new AliPHOSCalibrationData("Gains",fCalibrVersion) ;
183     cmngr->ReadFromRoot(*fGains,fCalibrRun) ;
184   }
185
186   Int_t nevents = gime->MaxEvent() ;
187   Int_t ievent ;
188   
189   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
190     gime->Event(ievent,"D") ;
191     Int_t pattern = gime->EventPattern() ;
192     if(pattern){
193             printf("pattern %d \n",pattern) ;
194       if(!fPatterns){
195         Error("Exec","Patterns for reconstruction of events are not set, use SetPatterns() ") ;
196         return ;
197       }
198       Bool_t skip = kTRUE ;
199       Int_t npat = fPatterns->GetSize() ;
200       for(Int_t i = 0; i<npat;i++)
201         if(pattern==fPatterns->At(i)){
202           skip = kFALSE ;
203           break ;
204         }
205       if(skip)
206         continue ;
207     }
208
209     if(ievent == 0)
210       GetCalibrationParameters() ;
211     
212     fNumberOfEmcClusters  = fNumberOfCpvClusters  = 0 ;
213             
214     MakeClusters() ;
215     
216     if(fToUnfold)             
217       MakeUnfolding() ;
218
219     WriteRecPoints(ievent) ;
220
221     if(strstr(option,"deb"))  
222       PrintRecPoints(option) ;
223
224     //increment the total number of digits per run 
225     fRecPointsInRun += gime->EmcRecPoints()->GetEntriesFast() ;  
226     fRecPointsInRun += gime->CpvRecPoints()->GetEntriesFast() ;  
227  }
228   
229   if(strstr(option,"tim")){
230     gBenchmark->Stop("PHOSClusterizer");
231     Info("Exec", "  took %f seconds for Clusterizing %f seconds per event \n",
232          gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer"), 
233          gBenchmark->GetCpuTime("PHOSClusterizer")/nevents ) ; 
234   }
235 }
236
237 //____________________________________________________________________________
238 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::FindFit(AliPHOSEmcRecPoint * emcRP, AliPHOSDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
239                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
240
241   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima 
242   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
243   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
244
245   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
246   TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
247   
248
249   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
250   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
251   gMinuit->SetFCN(AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;  
252                                          // To set the address of the minimization function 
253
254   TList * toMinuit = new TList();
255   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
256   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
257   
258   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
259
260   // filling initial values for fit parameters
261   AliPHOSDigit * digit ;
262
263   Int_t ierflg  = 0; 
264   Int_t index   = 0 ;
265   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
266
267   Int_t iDigit ;
268
269   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ; 
270
271   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
272     digit = maxAt[iDigit]; 
273
274     Int_t relid[4] ;
275     Float_t x = 0.;
276     Float_t z = 0.;
277     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
278     geom->RelPosInModule(relid, x, z) ;
279
280     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
281
282     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
283     index++ ;   
284     if(ierflg != 0){ 
285       Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : x = %f\n", x ) ;
286       return kFALSE;
287     }
288     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
289     index++ ;   
290     if(ierflg != 0){
291        Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : z =%f\n", z ) ;
292       return kFALSE;
293     }
294     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
295     index++ ;   
296     if(ierflg != 0){
297       Warning("FindFit", "PHOS Unfolding unable to set initial value for fit procedure : energy = %f\n", energy ) ;      
298       return kFALSE;
299     }
300   }
301
302   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
303                       //  depends on it. 
304   Double_t p1 = 1.0 ;
305   Double_t p2 = 0.0 ;
306
307   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls  
308   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient  
309   gMinuit->SetMaxIterations(5);
310   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
311
312   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize 
313
314   if(ierflg == 4){  // Minimum not found   
315     Warning("FindFit", "PHOS Unfolding fit not converged, cluster abandoned\n" );      
316     return kFALSE ;
317   }            
318   for(index = 0; index < nPar; index++){
319     Double_t err ;
320     Double_t val ;
321     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
322     fitparameters[index] = val ;
323    }
324
325   delete toMinuit ;
326   return kTRUE;
327
328 }
329
330 //____________________________________________________________________________
331 void AliPHOSClusterizerv1::GetCalibrationParameters() 
332 {
333   // Get calibration parameters from AliPHOSDigitizer
334
335   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
336
337   const TTask * task = gime->Digitizer(BranchName()) ;
338   if(strcmp(task->IsA()->GetName(),"AliPHOSDigitizer")==0){
339     const AliPHOSDigitizer * dig = static_cast<const AliPHOSDigitizer *>(task) ;
340
341     fADCchanelEmc   = dig->GetEMCchannel() ;
342     fADCpedestalEmc = dig->GetEMCpedestal();
343     
344     fADCchanelCpv   = dig->GetCPVchannel() ;
345     fADCpedestalCpv = dig->GetCPVpedestal() ; 
346   }
347   else{
348  ;
349 //    fCalibrationDB = gime->CalibrationDB();
350   }
351 }
352
353 //____________________________________________________________________________
354 void AliPHOSClusterizerv1::Init()
355 {
356   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
357   // Attach the Clusterizer task to the list of PHOS tasks
358   
359   if ( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
360     SetTitle("galice.root") ;
361
362   TString branchname = GetName() ;
363   branchname.Remove(branchname.Index(Version())-1) ;
364
365   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(),branchname.Data(), fToSplit ) ; 
366   if ( gime == 0 ) {
367     Error("Init", "Could not obtain the Getter object !") ;  
368     return ;
369   } 
370
371   fSplitFile = 0 ;
372   if(fToSplit){
373     // construct the name of the file as /path/EMCAL.SDigits.root
374     //First - extract full path if necessary
375     TString fileName(GetTitle()) ;
376     Ssiz_t islash = fileName.Last('/') ;
377     if(islash<fileName.Length())
378       fileName.Remove(islash+1,fileName.Length()) ;
379     else
380       fileName="" ;
381     // Next - append the file name 
382     fileName+="PHOS.RecData." ;
383     if((strcmp(branchname.Data(),"Default")!=0)&&(strcmp(branchname.Data(),"")!=0)){
384       fileName+=branchname ;
385       fileName+="." ;
386     }
387     fileName+="root" ;
388     // Finally - check if the file already opened or open the file
389     fSplitFile = static_cast<TFile*>(gROOT->GetFile(fileName.Data()));   
390     if(!fSplitFile)
391       fSplitFile =  TFile::Open(fileName.Data(),"update") ;
392   }
393
394
395     
396   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
397   fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
398
399   if(!gMinuit) 
400     gMinuit = new TMinuit(100) ;
401
402   gime->PostClusterizer(this) ;
403   gime->PostRecPoints(branchname) ;
404   
405 }
406
407 //____________________________________________________________________________
408 void AliPHOSClusterizerv1::InitParameters()
409 {
410   // Set initial parameters for clusterization
411
412   fNumberOfCpvClusters     = 0 ; 
413   fNumberOfEmcClusters     = 0 ; 
414   
415   fCpvClusteringThreshold  = 0.0;
416   fEmcClusteringThreshold  = 0.2;   
417   
418   fEmcLocMaxCut            = 0.03 ;
419   fCpvLocMaxCut            = 0.03 ;
420   
421   fW0                      = 4.5 ;
422   fW0CPV                   = 4.0 ;
423
424   fEmcTimeGate             = 1.e-8 ; 
425   
426   fToUnfold                = kTRUE ;
427
428   fPurifyThreshold         = 0.012 ;
429   
430   fPedestals = 0 ;
431   fGains     = 0 ;
432   fCalibrVersion= "v1" ;
433   fCalibrRun = 1 ;
434   fPatterns  = 0 ;
435
436   TString clusterizerName( GetName()) ;
437   if (clusterizerName.IsNull() ) 
438     clusterizerName = "Default" ; 
439   clusterizerName.Append(":") ; 
440   clusterizerName.Append(Version()) ; 
441   SetName(clusterizerName) ;
442   fRecPointsInRun          = 0 ;
443
444
445 }
446
447 //____________________________________________________________________________
448 Int_t AliPHOSClusterizerv1::AreNeighbours(AliPHOSDigit * d1, AliPHOSDigit * d2)const
449 {
450   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching 
451   //                                       = 1 are neighbour
452   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
453   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex 
454   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster 
455   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster  
456
457   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ;
458
459   Int_t rv = 0 ; 
460
461   Int_t relid1[4] ; 
462   geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ; 
463
464   Int_t relid2[4] ; 
465   geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ; 
466  
467   if ( (relid1[0] == relid2[0]) && (relid1[1]==relid2[1]) ) { // inside the same PHOS module 
468     Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[2] - relid2[2] ) ;  
469     Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[3] - relid2[3] ) ;  
470     
471     if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
472       if((relid1[1] != 0) || (TMath::Abs(d1->GetTime() - d2->GetTime() ) < fEmcTimeGate))
473       rv = 1 ; 
474     }
475     else {
476       if((relid2[2] > relid1[2]) && (relid2[3] > relid1[3]+1)) 
477         rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further 
478     }
479
480   } 
481   else {
482     
483     if( (relid1[0] < relid2[0]) || (relid1[1] != relid2[1]) )  
484       rv=2 ;
485
486   }
487
488   return rv ; 
489 }
490
491
492 //____________________________________________________________________________
493 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInEmc(AliPHOSDigit * digit) const
494 {
495   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
496  
497   Bool_t rv = kFALSE ; 
498   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ;
499
500   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();  
501
502   if(digit->GetId() <= nEMC )   rv = kTRUE; 
503
504   return rv ; 
505 }
506
507 //____________________________________________________________________________
508 Bool_t AliPHOSClusterizerv1::IsInCpv(AliPHOSDigit * digit) const
509 {
510   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
511  
512   Bool_t rv = kFALSE ; 
513   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ;
514
515   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
516
517   if(digit->GetId() > nEMC )   rv = kTRUE;
518
519   return rv ; 
520 }
521
522 //____________________________________________________________________________
523 void AliPHOSClusterizerv1::WriteRecPoints(Int_t event)
524 {
525
526   // Creates new branches with given title
527   // fills and writes into TreeR.
528   
529   
530   AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
531   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ; 
532   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ; 
533   TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
534   TTree * treeR ;
535   
536   if(fToSplit){
537     if(!fSplitFile)
538       return ;
539     fSplitFile->cd() ;
540     TString name("TreeR") ;
541     name += event ; 
542     treeR = dynamic_cast<TTree*>(fSplitFile->Get(name)); 
543   }
544   else{
545     treeR = gAlice->TreeR();
546   }
547   
548   if(!treeR){
549     if(fSplitFile)
550       gAlice->MakeTree("R", fSplitFile);
551     else
552       gAlice->MakeTree("R", gROOT->GetFile(GetTitle()));
553     treeR = gAlice->TreeR() ;
554   }
555
556   Int_t index ;
557   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties...
558   for(index = 0; index < emcRecPoints->GetEntries(); index++){
559     AliPHOSEmcRecPoint * emcrp = static_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>(emcRecPoints->At(index)) ;
560     emcrp->Purify(fPurifyThreshold) ; 
561     if(emcrp->GetMultiplicity())
562       emcrp->EvalAll(fW0,digits) ;
563     else
564       emcRecPoints->Remove(emcrp) ;
565  }
566
567   emcRecPoints->Compress() ;  
568   emcRecPoints->Sort() ;
569   for(index = 0; index < emcRecPoints->GetEntries(); index++)
570     ((AliPHOSEmcRecPoint *)emcRecPoints->At(index))->SetIndexInList(index) ;
571   
572   emcRecPoints->Expand(emcRecPoints->GetEntriesFast()) ; 
573   
574   //Now the same for CPV
575   for(index = 0; index < cpvRecPoints->GetEntries(); index++)
576     ((AliPHOSRecPoint *)cpvRecPoints->At(index))->EvalAll(fW0CPV,digits)  ;
577   
578   cpvRecPoints->Sort() ;
579   
580   for(index = 0; index < cpvRecPoints->GetEntries(); index++)
581     ((AliPHOSRecPoint *)cpvRecPoints->At(index))->SetIndexInList(index) ;
582   
583   cpvRecPoints->Expand(cpvRecPoints->GetEntriesFast()) ;
584   
585   Int_t bufferSize = 32000 ;    
586   Int_t splitlevel = 0 ;
587  
588   //First EMC
589   TBranch * emcBranch = treeR->Branch("PHOSEmcRP","TObjArray",&emcRecPoints,bufferSize,splitlevel);
590   emcBranch->SetTitle(BranchName());
591     
592   //Now CPV branch
593   TBranch * cpvBranch = treeR->Branch("PHOSCpvRP","TObjArray",&cpvRecPoints,bufferSize,splitlevel);
594   cpvBranch->SetTitle(BranchName());
595     
596   //And Finally  clusterizer branch
597   AliPHOSClusterizerv1 * cl = this ;
598   TBranch * clusterizerBranch = treeR->Branch("AliPHOSClusterizer","AliPHOSClusterizerv1",
599                                               &cl,bufferSize,splitlevel);
600   clusterizerBranch->SetTitle(BranchName());
601
602   emcBranch        ->Fill() ;
603   cpvBranch        ->Fill() ;
604   clusterizerBranch->Fill() ;
605
606   treeR->AutoSave() ; 
607   if(gAlice->TreeR()!=treeR)
608     treeR->Delete();
609 }
610
611 //____________________________________________________________________________
612 void AliPHOSClusterizerv1::MakeClusters()
613 {
614   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
615   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
616
617   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
618
619   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints(BranchName()) ; 
620   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints(BranchName()) ; 
621   emcRecPoints->Delete() ;
622   cpvRecPoints->Delete() ;
623   
624   TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
625    if ( !digits ) {
626    Fatal("MakeClusters", "Digits with name %s not found !", BranchName().Data() ) ;  
627   } 
628   TClonesArray * digitsC =  (TClonesArray*)digits->Clone() ;
629   
630  
631   // Clusterization starts  
632
633   TIter nextdigit(digitsC) ; 
634   AliPHOSDigit * digit ; 
635   Bool_t notremoved = kTRUE ;
636
637   while ( (digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the list of digitsC
638     AliPHOSRecPoint * clu = 0 ; 
639
640     TArrayI clusterdigitslist(1500) ;   
641     Int_t index ;
642    // cout << "digit " << digit << " " << Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) << endl ;
643
644     if (( IsInEmc (digit) && Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) > fEmcClusteringThreshold  ) || 
645         ( IsInCpv (digit) && Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) > fCpvClusteringThreshold  ) ) {
646       Int_t iDigitInCluster = 0 ; 
647       
648       if  ( IsInEmc(digit) ) {   
649         // start a new EMC RecPoint
650         if(fNumberOfEmcClusters >= emcRecPoints->GetSize()) 
651           emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters+1) ;
652         
653         emcRecPoints->AddAt(new  AliPHOSEmcRecPoint(""), fNumberOfEmcClusters) ;
654         clu = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters) ; 
655         fNumberOfEmcClusters++ ; 
656         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId())) ; 
657         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList() ;  
658         iDigitInCluster++ ; 
659         digitsC->Remove(digit) ; 
660
661       } else { 
662         
663         // start a new CPV cluster
664         if(fNumberOfCpvClusters >= cpvRecPoints->GetSize()) 
665           cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters+1);
666
667         cpvRecPoints->AddAt(new AliPHOSCpvRecPoint(""), fNumberOfCpvClusters) ;
668
669         clu =  (AliPHOSCpvRecPoint *) cpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters)  ;  
670         fNumberOfCpvClusters++ ; 
671         clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()) ) ;     
672         clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digit->GetIndexInList()  ; 
673         iDigitInCluster++ ; 
674         digitsC->Remove(digit) ; 
675         nextdigit.Reset() ;
676         
677         // Here we remove remaining EMC digits, which cannot make a cluster
678         
679         if( notremoved ) { 
680           while( ( digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit() ) ) {
681             if( IsInEmc(digit) ) 
682               digitsC->Remove(digit) ;
683             else 
684               break ;
685           }
686           notremoved = kFALSE ;
687         }
688         
689       } // else        
690       
691       nextdigit.Reset() ;
692       
693       AliPHOSDigit * digitN ; 
694       index = 0 ;
695       while (index < iDigitInCluster){ // scan over digits already in cluster 
696         digit =  (AliPHOSDigit*)digits->At(clusterdigitslist[index])  ;      
697         index++ ; 
698         while ( (digitN = (AliPHOSDigit *)nextdigit()) ) { // scan over the reduced list of digits 
699           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
700           switch (ineb ) {
701           case 0 :   // not a neighbour
702             break ;
703           case 1 :   // are neighbours 
704             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp(), digitN->GetId() ) ) ;
705             clusterdigitslist[iDigitInCluster] = digitN->GetIndexInList() ; 
706             iDigitInCluster++ ; 
707             digitsC->Remove(digitN) ;
708             break ;
709           case 2 :   // too far from each other
710             goto endofloop;   
711           } // switch
712           
713         } // while digitN
714         
715       endofloop: ;
716         nextdigit.Reset() ; 
717         
718       } // loop over cluster     
719
720     } // energy theshold  
721
722     
723   } // while digit
724
725   delete digitsC ;
726
727 }
728
729 //____________________________________________________________________________
730 void AliPHOSClusterizerv1::MakeUnfolding()
731 {
732   // Unfolds clusters using the shape of an ElectroMagnetic shower
733   // Performs unfolding of all EMC/CPV clusters
734
735   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
736   
737
738   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
739   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints(BranchName()) ; 
740   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints(BranchName()) ; 
741   TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
742   
743   // Unfold first EMC clusters 
744   if(fNumberOfEmcClusters > 0){
745
746     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ; 
747
748     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfEmcClusters ; 
749     Int_t index ;   
750     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
751       
752       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcRecPoints->At(index) ;
753       if(emcRecPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
754         break ;
755       
756       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ; 
757       AliPHOSDigit ** maxAt = new AliPHOSDigit*[nMultipl] ;
758       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
759       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fEmcLocMaxCut,digits) ;
760       
761       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0       
762         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
763         if(emcRecPoint->GetNExMax()!=-1){ //Do not remove clusters which failed to unfold
764           emcRecPoints->Remove(emcRecPoint); 
765           emcRecPoints->Compress() ;
766           index-- ;
767           fNumberOfEmcClusters -- ;
768           numberofNotUnfolded-- ;
769         }
770       }
771       else
772         emcRecPoint->SetNExMax(1) ; //Only one local maximum
773       
774       delete[] maxAt ; 
775       delete[] maxAtEnergy ; 
776     }
777   } 
778   // Unfolding of EMC clusters finished
779
780
781   // Unfold now CPV clusters
782   if(fNumberOfCpvClusters > 0){
783     
784     Int_t nModulesToUnfold = geom->GetNModules() ;
785
786     Int_t numberofCpvNotUnfolded = fNumberOfCpvClusters ;     
787     Int_t index ;   
788     for(index = 0 ; index < numberofCpvNotUnfolded ; index++){
789       
790       AliPHOSRecPoint * recPoint = (AliPHOSRecPoint *) cpvRecPoints->At(index) ;
791
792       if(recPoint->GetPHOSMod()> nModulesToUnfold)
793         break ;
794       
795       AliPHOSEmcRecPoint * emcRecPoint = (AliPHOSEmcRecPoint*) recPoint ; 
796       
797       Int_t nMultipl = emcRecPoint->GetMultiplicity() ; 
798       AliPHOSDigit ** maxAt = new AliPHOSDigit*[nMultipl] ;
799       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
800       Int_t nMax = emcRecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fCpvLocMaxCut,digits) ;
801       
802       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0       
803         UnfoldCluster(emcRecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
804         cpvRecPoints->Remove(emcRecPoint); 
805         cpvRecPoints->Compress() ;
806         index-- ;
807         numberofCpvNotUnfolded-- ;
808         fNumberOfCpvClusters-- ;
809       }
810       
811       delete[] maxAt ; 
812       delete[] maxAtEnergy ; 
813     } 
814   }
815   //Unfolding of Cpv clusters finished
816   
817 }
818
819 //____________________________________________________________________________
820 Double_t  AliPHOSClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
821
822   // Shape of the shower (see PHOS TDR)
823   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
824
825   Double_t r4    = r*r*r*r ;
826   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
827   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
828   return shape ;
829 }
830
831 //____________________________________________________________________________
832 void  AliPHOSClusterizerv1::UnfoldCluster(AliPHOSEmcRecPoint * iniEmc, 
833                                                  Int_t nMax, 
834                                                  AliPHOSDigit ** maxAt, 
835                                                  Float_t * maxAtEnergy)
836
837   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers 
838
839   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
840
841   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
842   const TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
843   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ; 
844   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ; 
845
846   Int_t nPar = 3 * nMax ;
847   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
848
849   Bool_t rv = FindFit(iniEmc, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
850   if( !rv ) {
851     // Fit failed, return 
852     iniEmc->SetNExMax(-1) ;
853     delete[] fitparameters ; 
854     return ;
855   }
856
857   // create ufolded rec points and fill them with new energy lists
858   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with fit (without fluctuations): efit[]
859   // and later correct this number in acordance with actual energy deposition
860
861   Int_t nDigits = iniEmc->GetMultiplicity() ;  
862   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
863   Float_t xDigit=0.,zDigit=0.,distance=0. ;
864   Float_t xpar=0.,zpar=0.,epar=0.  ;
865   Int_t relid[4] ;
866   AliPHOSDigit * digit = 0 ;
867   Int_t * emcDigits = iniEmc->GetDigitsList() ;
868
869   Int_t iparam ;
870   Int_t iDigit ;
871   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
872     digit = (AliPHOSDigit*) digits->At(emcDigits[iDigit] ) ;   
873     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
874     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
875     efit[iDigit] = 0;
876
877     iparam = 0 ;    
878     while(iparam < nPar ){
879       xpar = fitparameters[iparam] ;
880       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
881       epar = fitparameters[iparam+2] ;
882       iparam += 3 ;
883       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
884       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
885       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(distance) ;
886     }
887   }
888   
889
890   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
891   // so that energy deposited in each cell is distributed betwin new clusters proportionally
892   // to its contribution to efit
893
894   Float_t * emcEnergies = iniEmc->GetEnergiesList() ;
895   Float_t ratio ;
896
897   iparam = 0 ;
898   while(iparam < nPar ){
899     xpar = fitparameters[iparam] ;
900     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
901     epar = fitparameters[iparam+2] ;
902     iparam += 3 ;    
903     
904     AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = 0 ;  
905
906     if(iniEmc->IsEmc()){ //create new entries in fEmcRecPoints...
907       
908       if(fNumberOfEmcClusters >= emcRecPoints->GetSize())
909         emcRecPoints->Expand(2*fNumberOfEmcClusters) ;
910       
911       (*emcRecPoints)[fNumberOfEmcClusters] = new AliPHOSEmcRecPoint("") ;
912       emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcRecPoints->At(fNumberOfEmcClusters);
913       fNumberOfEmcClusters++ ;
914       emcRP->SetNExMax((Int_t)nPar/3) ;
915     }
916     else{//create new entries in fCpvRecPoints
917       if(fNumberOfCpvClusters >= cpvRecPoints->GetSize())
918         cpvRecPoints->Expand(2*fNumberOfCpvClusters) ;
919       
920       (*cpvRecPoints)[fNumberOfCpvClusters] = new AliPHOSCpvRecPoint("") ;
921       emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) cpvRecPoints->At(fNumberOfCpvClusters);
922       fNumberOfCpvClusters++ ;
923     }
924     
925     Float_t eDigit ;
926     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
927       digit = (AliPHOSDigit*) digits->At( emcDigits[iDigit] ) ; 
928       geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
929       geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
930       distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
931       distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
932       ratio = epar * ShowerShape(distance) / efit[iDigit] ; 
933       eDigit = emcEnergies[iDigit] * ratio ;
934       emcRP->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
935     }   
936   }
937  
938   delete[] fitparameters ; 
939   delete[] efit ; 
940   
941 }
942
943 //_____________________________________________________________________________
944 void AliPHOSClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad, Double_t & fret, Double_t * x, Int_t iflag)
945 {
946   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
947   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
948
949   TList * toMinuit = (TList*) gMinuit->GetObjectFit() ;
950
951   AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint*) toMinuit->At(0)  ;
952   TClonesArray * digits = (TClonesArray*)toMinuit->At(1)  ;
953
954
955   
956   //  AliPHOSEmcRecPoint * emcRP = (AliPHOSEmcRecPoint *) gMinuit->GetObjectFit() ; // EmcRecPoint to fit
957
958   Int_t * emcDigits     = emcRP->GetDigitsList() ;
959
960   Int_t nOdigits = emcRP->GetDigitsMultiplicity() ; 
961
962   Float_t * emcEnergies = emcRP->GetEnergiesList() ;
963
964   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ; 
965   fret = 0. ;     
966   Int_t iparam ;
967
968   if(iflag == 2)
969     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)    
970       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
971   
972   Double_t efit ;    
973
974   AliPHOSDigit * digit ;
975   Int_t iDigit ;
976
977   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOdigits ; iDigit++) {
978
979     digit = (AliPHOSDigit*) digits->At( emcDigits[iDigit] ) ; 
980
981     Int_t relid[4] ;
982     Float_t xDigit ;
983     Float_t zDigit ;
984
985     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
986
987     geom->RelPosInModule(relid, xDigit, zDigit) ;
988
989      if(iflag == 2){  // calculate gradient
990        Int_t iParam = 0 ;
991        efit = 0 ;
992        while(iParam < nPar ){
993          Double_t distance = (xDigit - x[iParam]) * (xDigit - x[iParam]) ;
994          iParam++ ; 
995          distance += (zDigit - x[iParam]) * (zDigit - x[iParam]) ; 
996          distance = TMath::Sqrt( distance ) ; 
997          iParam++ ;      
998          efit += x[iParam] * ShowerShape(distance) ;
999          iParam++ ;
1000        }
1001        Double_t sum=0 ; 
1002        if(emcEnergies[iDigit] > 0)
1003         sum = 2. * (efit - emcEnergies[iDigit]) / emcEnergies[iDigit] ; 
1004        // Here we assume, that sigma = sqrt(E) 
1005        iParam = 0 ;
1006        while(iParam < nPar ){
1007          Double_t xpar = x[iParam] ;
1008          Double_t zpar = x[iParam+1] ;
1009          Double_t epar = x[iParam+2] ;
1010          Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
1011          Double_t shape = sum * ShowerShape(dr) ;
1012          Double_t r4 = dr*dr*dr*dr ;
1013          Double_t r295 = TMath::Power(dr,2.95) ;
1014          Double_t deriv =-4. * dr*dr * ( 2.32 / ( (2.32 + 0.26 * r4) * (2.32 + 0.26 * r4) ) +
1015                                          0.0316 * (1. + 0.0171 * r295) / ( ( 1. + 0.0652 * r295) * (1. + 0.0652 * r295) ) ) ;
1016          
1017          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x    
1018          iParam++ ; 
1019          Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z         
1020          iParam++ ; 
1021          Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy             
1022          iParam++ ; 
1023        }
1024      }
1025      efit = 0;
1026      iparam = 0 ;
1027
1028      while(iparam < nPar ){
1029        Double_t xpar = x[iparam] ;
1030        Double_t zpar = x[iparam+1] ;
1031        Double_t epar = x[iparam+2] ;
1032        iparam += 3 ;
1033        Double_t distance = (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar)  ;
1034        distance =  TMath::Sqrt(distance) ;
1035        efit += epar * ShowerShape(distance) ;
1036      }
1037
1038      if(emcEnergies[iDigit] > 0) //for the case if rounding error
1039        fret += (efit-emcEnergies[iDigit])*(efit-emcEnergies[iDigit])/
1040                emcEnergies[iDigit] ; 
1041      // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
1042   }
1043
1044 }
1045
1046 //____________________________________________________________________________
1047 void AliPHOSClusterizerv1::Print(Option_t * option)const
1048 {
1049   // Print clusterizer parameters
1050
1051   TString message ; 
1052   TString taskName(GetName()) ; 
1053   taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
1054   
1055   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ) {  
1056     // Print parameters
1057     message  = "\n--------------- %s %s -----------\n" ; 
1058     message += "Clusterizing digits from the file: %s\n" ;
1059     message += "                           Branch: %s\n" ; 
1060     message += "                       EMC Clustering threshold = %f\n" ; 
1061     message += "                       EMC Local Maximum cut    = %f\n" ; 
1062     message += "                       EMC Logarothmic weight   = %f\n" ;
1063     message += "                       CPV Clustering threshold = %f\n" ;
1064     message += "                       CPV Local Maximum cut    = %f\n" ;
1065     message += "                       CPV Logarothmic weight   = %f\n" ;
1066     if(fToUnfold)
1067       message += " Unfolding on\n" ;
1068     else
1069       message += " Unfolding off\n" ;
1070     
1071     message += "------------------------------------------------------------------" ;
1072   }
1073   else 
1074     message = " AliPHOSClusterizerv1 not initialized " ;
1075   
1076   Info("Print", message.Data(),  
1077        taskName.Data(), 
1078        GetTitle(),
1079        taskName.Data(), 
1080        GetName(), 
1081        fEmcClusteringThreshold, 
1082        fEmcLocMaxCut, 
1083        fW0, 
1084        fCpvClusteringThreshold, 
1085        fCpvLocMaxCut, 
1086        fW0CPV ) ; 
1087 }
1088
1089
1090 //____________________________________________________________________________
1091 void AliPHOSClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
1092 {
1093   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliPHOSClusterizer
1094
1095   TObjArray * emcRecPoints = AliPHOSGetter::GetInstance()->EmcRecPoints(BranchName()) ; 
1096   TObjArray * cpvRecPoints = AliPHOSGetter::GetInstance()->CpvRecPoints(BranchName()) ; 
1097
1098   if(strstr(option,"deb")){
1099     printf("event %d, found %d EmcRecPoints and %d CPV RecPoints \n",
1100            gAlice->GetEvNumber(), 
1101            emcRecPoints->GetEntriesFast(),
1102            cpvRecPoints->GetEntriesFast()) ; 
1103   }
1104     
1105   
1106   if(strstr(option,"all")) {
1107     printf("\nEMC clusters\n" );
1108     printf("Index    Ene(MeV) Multi Module     X     Y   Z  Lambda 1 Lambda 2  # of prim  Primaries list\n" );      
1109     Int_t index ;
1110     for (index = 0 ; index < emcRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1111       AliPHOSEmcRecPoint * rp = (AliPHOSEmcRecPoint * )emcRecPoints->At(index) ; 
1112       TVector3  locpos;  
1113       rp->GetLocalPosition(locpos);
1114       Float_t lambda[2]; 
1115       rp->GetElipsAxis(lambda);
1116       Int_t * primaries; 
1117       Int_t nprimaries;
1118       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1119       printf("\n%6d  %8.2f  %3d     %2d     %4.1f    %4.1f %4.1f %4f  %4f    %2d     : ", 
1120               rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(), rp->GetPHOSMod(), 
1121               locpos.X(), locpos.Y(), locpos.Z(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ; 
1122       
1123       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
1124         printf("%d ", primaries[iprimary] ) ; 
1125       }
1126     }      
1127     //Now plot CPV recPoints
1128     printf("\n CPV RecPoints \n") ;
1129     printf("Index    Ene(MeV) Module     X     Y   Z  # of prim  Primaries list\n") ;      
1130     for (index = 0 ; index < cpvRecPoints->GetEntries() ; index++) {
1131         AliPHOSRecPoint * rp = (AliPHOSRecPoint * )cpvRecPoints->At(index) ; 
1132         
1133         TVector3  locpos;  
1134         rp->GetLocalPosition(locpos);
1135         
1136         Int_t * primaries; 
1137         Int_t nprimaries ; 
1138         primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1139         printf("\n%6d  %8.2f  %2d     %4.1f    %4.1f %4.1f %2d     : ", 
1140                 rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetPHOSMod(), 
1141                 locpos.X(), locpos.Y(), locpos.Z(), nprimaries) ; 
1142         primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
1143         for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
1144           printf("%d ", primaries[iprimary] ) ; 
1145         }
1146       }
1147   }
1148 }
1149