PHOS/AliPHOSDigitizer.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 /* History of cvs commits:
  19  *
  20  * $Log: AliPHOSDigitizer.cxx,v $
  21  * Revision 1.104  2007/12/18 09:08:18  hristov
  22  * Splitting of the QA maker into simulation and reconstruction dependent parts (Yves)
  23  *
  24  * Revision 1.103  2007/11/07 11:25:06  schutz
  25  * Comment out the QA checking before starting digitization
  26  *
  27  * Revision 1.102  2007/10/19 18:04:29  schutz
  28  * The standalone QA data maker is called from AliSimulation and AliReconstruction outside the event loop; i.e. re-reading the data. The QA data making in the event loop has been commented out.
  29  *
  30  * Revision 1.101  2007/10/14 21:08:10  schutz
  31  * Introduced the checking of QA results from previous step before entering the event loop
  32  *
  33  * Revision 1.100  2007/10/10 09:05:10  schutz
  34  * Changing name QualAss to QA
  35  *
  36  * Revision 1.99  2007/09/30 17:08:20  schutz
  37  * Introducing the notion of QA data acquisition cycle (needed by online)
  38  *
  39  * Revision 1.98  2007/09/26 14:22:17  cvetan
  40  * Important changes to the reconstructor classes. Complete elimination of the run-loaders, which are now steered only from AliReconstruction. Removal of the corresponding Reconstruct() and FillESD() methods.
  41  *
  42  * Revision 1.97  2007/08/07 14:12:03  kharlov
  43  * Quality assurance added (Yves Schutz)
  44  *
  45  * Revision 1.96  2007/04/28 10:43:36  policheh
  46  * Dead channels simulation: digit energy sets to 0.
  47  *
  48  * Revision 1.95  2007/04/10 07:20:52  kharlov
  49  * Decalibration should use the same CDB as calibration in AliPHOSClusterizerv1
  50  *
  51  * Revision 1.94  2007/02/01 10:34:47  hristov
  52  * Removing warnings on Solaris x86
  53  *
  54  * Revision 1.93  2006/10/17 13:17:01  kharlov
  55  * Replace AliInfo by AliDebug
  56  *
  57  * Revision 1.92  2006/08/28 10:01:56  kharlov
  58  * Effective C++ warnings fixed (Timur Pocheptsov)
  59  *
  60  * Revision 1.91  2006/04/29 20:25:30  hristov
  61  * Decalibration is implemented (Yu.Kharlov)
  62  *
  63  * Revision 1.90  2006/04/22 10:30:17  hristov
  64  * Add fEnergy to AliPHOSDigit and operate with EMC amplitude in energy units (Yu.Kharlov)
  65  *
  66  * Revision 1.89  2006/04/11 15:22:59  hristov
  67  * run number in query set to -1: forces AliCDBManager to use its run number (A.Colla)
  68  *
  69  * Revision 1.88  2006/03/13 14:05:43  kharlov
  70  * Calibration objects for EMC and CPV
  71  *
  72  * Revision 1.87  2005/08/24 15:33:49  kharlov
  73  * Calibration data for raw digits
  74  *
  75  * Revision 1.86  2005/07/12 20:07:35  hristov
  76  * Changes needed to run simulation and reconstrruction in the same AliRoot session
  77  *
  78  * Revision 1.85  2005/05/28 14:19:04  schutz
  79  * Compilation warnings fixed by T.P.
  80  *
  81  */
  82
  83 //_________________________________________________________________________
  84 //*-- Author :  Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  85 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  86 // This TTask performs digitization of Summable digits (in the PHOS case it is just
  87 // the sum of contributions from all primary particles into a given cell).
  88 // In addition it performs mixing of summable digits from different events.
  89 // The name of the TTask is also the title of the branch that will contain
  90 // the created SDigits
  91 // The title of the TTAsk is the name of the file that contains the hits from
  92 // which the SDigits are created
  93 //
  94 // For each event two branches are created in TreeD:
  95 //   "PHOS" - list of digits
  96 //   "AliPHOSDigitizer" - AliPHOSDigitizer with all parameters used in digitization
  97 //
  98 // Note, that one can set a title for new digits branch, and repeat digitization with
  99 // another set of parameters.
 100 //
 101 // Use case:
 102 // root[0] AliPHOSDigitizer * d = new AliPHOSDigitizer() ;
 103 // root[1] d->ExecuteTask()
 104 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
 105 //                       //Digitizes SDigitis in all events found in file galice.root
 106 //
 107 // root[2] AliPHOSDigitizer * d1 = new AliPHOSDigitizer("galice1.root") ;
 108 //                       // Will read sdigits from galice1.root
 109 // root[3] d1->MixWith("galice2.root")
 110 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
 111 //                       // Reads another set of sdigits from galice2.root
 112 // root[3] d1->MixWith("galice3.root")
 113 //                       // Reads another set of sdigits from galice3.root
 114 // root[4] d->ExecuteTask("deb timing")
 115 //                       // Reads SDigits from files galice1.root, galice2.root ....
 116 //                       // mixes them and stores produced Digits in file galice1.root
 117 //                       // deb - prints number of produced digits
 118 //                       // deb all - prints list of produced digits
 119 //                       // timing  - prints time used for digitization
 120 //
 121
 122 // --- ROOT system ---
 123 #include "TTree.h"
 124 #include "TSystem.h"
 125 #include "TBenchmark.h"
 126 #include "TRandom.h"
 127 #include "TMath.h"
 128
 129 // --- Standard library ---
 130
 131 // --- AliRoot header files ---
 132 #include <TGeoManager.h>
 133 #include "AliLog.h"
 134 #include "AliRunDigitizer.h"
 135 #include "AliPHOSDigit.h"
 136 #include "AliPHOSDigitizer.h"
 137 #include "AliPHOSGeometry.h"
 138 #include "AliPHOSTick.h"
 139 #include "AliPHOSSimParam.h"
 140 #include "AliPHOSCalibData.h"
 141 #include "AliRunLoader.h"
 142 #include "AliPHOSLoader.h"
 143
 144 ClassImp(AliPHOSDigitizer)
 145
 146
 147 //____________________________________________________________________________
 148 AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer() :
 149   AliDigitizer("",""),
 150   fDefaultInit(kTRUE),
 151   fDigitsInRun(0),
 152   fInit(kFALSE),
 153   fInput(0),
 154   fInputFileNames(0x0),
 155   fEventNames(0x0),
 156   fEmcCrystals(0),
 157   fEventFolderName(""),
 158   fFirstEvent(0),
 159   fLastEvent(0),
 160   fcdb(0x0),
 161   fEventCounter(0)
 162 {
 163   // ctor
 164   InitParameters() ;
 165   fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
 166 }
 167
 168 //____________________________________________________________________________
 169 AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(TString alirunFileName,
 170                                    TString eventFolderName):
 171   AliDigitizer("PHOS"+AliConfig::Instance()->GetDigitizerTaskName(), alirunFileName),
 172   fDefaultInit(kFALSE),
 173   fDigitsInRun(0),
 174   fInit(kFALSE),
 175   fInput(0),
 176   fInputFileNames(0x0),
 177   fEventNames(0x0),
 178   fEmcCrystals(0),
 179   fEventFolderName(eventFolderName),
 180   fFirstEvent(0),
 181   fLastEvent(0),
 182   fcdb(0x0),
 183   fEventCounter(0)
 184 {
 185   // ctor
 186   InitParameters() ;
 187   Init() ;
 188   fDefaultInit = kFALSE ;
 189   fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
 190   fcdb = new AliPHOSCalibData(-1);
 191 }
 192
 193 //____________________________________________________________________________
 194 AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(const AliPHOSDigitizer & d) :
 195   AliDigitizer(d),
 196   fDefaultInit(d.fDefaultInit),
 197   fDigitsInRun(d.fDigitsInRun),
 198   fInit(d.fInit),
 199   fInput(d.fInput),
 200   fInputFileNames(0x0),//?
 201   fEventNames(0x0),//?
 202   fEmcCrystals(d.fEmcCrystals),
 203   fEventFolderName(d.fEventFolderName),
 204   fFirstEvent(d.fFirstEvent),
 205   fLastEvent(d.fLastEvent),
 206   fcdb (0x0),
 207   fEventCounter(0)
 208 {
 209   // copyy ctor
 210   SetName(d.GetName()) ;
 211   SetTitle(d.GetTitle()) ;
 212   fcdb = new AliPHOSCalibData(-1);
 213 }
 214
 215 //____________________________________________________________________________
 216 AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(AliRunDigitizer * rd) :
 217   AliDigitizer(rd,"PHOS"+AliConfig::Instance()->GetDigitizerTaskName()),
 218   fDefaultInit(kFALSE),
 219   fDigitsInRun(0),
 220   fInit(kFALSE),
 221   fInput(0),
 222   fInputFileNames(0x0),
 223   fEventNames(0x0),
 224   fEmcCrystals(0),
 225   fEventFolderName(fManager->GetInputFolderName(0)),
 226   fFirstEvent(0),
 227   fLastEvent(0),
 228   fcdb (0x0),
 229   fEventCounter(0)
 230
 231 {
 232   // ctor Init() is called by RunDigitizer
 233   fManager = rd ;
 234   SetTitle(dynamic_cast<AliStream*>(fManager->GetInputStream(0))->GetFileName(0));
 235   InitParameters() ;
 236   fDefaultInit = kFALSE ;
 237   fcdb = new AliPHOSCalibData(-1);
 238 }
 239
 240 //____________________________________________________________________________
 241   AliPHOSDigitizer::~AliPHOSDigitizer()
 242 {
 243   // dtor
 244   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fEventFolderName) ;
 245   if(rl){
 246     AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 247     phosLoader->CleanDigitizer() ;
 248   }
 249
 250   delete [] fInputFileNames ;
 251   delete [] fEventNames ;
 252
 253   if(fcdb){ delete fcdb ; fcdb=0;}
 254
 255 }
 256
 257 //____________________________________________________________________________
 258 void AliPHOSDigitizer::Digitize(Int_t event)
 259 {
 260
 261   // Makes the digitization of the collected summable digits.
 262   //  It first creates the array of all PHOS modules
 263   //  filled with noise (different for EMC, and CPV) and
 264   //  then adds contributions from SDigits.
 265   // This design avoids scanning over the list of digits to add
 266   // contribution to new SDigits only.
 267
 268
 269   Bool_t toMakeNoise = kTRUE ; //Do not create noisy digits if merge with real data
 270
 271   //First stream
 272   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fEventFolderName) ;
 273   AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 274
 275   Int_t readEvent = event ;
 276   if (fManager)
 277     readEvent = dynamic_cast<AliStream*>(fManager->GetInputStream(0))->GetCurrentEventNumber() ;
 278   AliDebug(1,Form("Adding event %d from input stream 0 %s %s",
 279                   readEvent, GetTitle(), fEventFolderName.Data())) ;
 280   rl->GetEvent(readEvent) ;
 281   phosLoader->CleanSDigits() ;
 282   phosLoader->LoadSDigits("READ") ;
 283
 284   //Prepare Output
 285   TClonesArray * digits = phosLoader->Digits() ;
 286   if( !digits ) {
 287     phosLoader->MakeDigitsArray() ;
 288     digits = phosLoader->Digits() ;
 289   }
 290
 291   digits->Clear() ;
 292
 293   //
 294   const AliPHOSGeometry *geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
 295   //Making digits with noise, first EMC
 296   //Check which PHOS modules are present
 297   Bool_t isPresent[5] ;
 298   TString volpath ;
 299   Int_t nmod=0 ;
 300   for(Int_t i=0; i<5; i++){
 301     volpath = "/ALIC_1/PHOS_";
 302     volpath += i+1;
 303     if (gGeoManager->CheckPath(volpath.Data())) {
 304       isPresent[i]=1 ;
 305       nmod++ ;
 306     }
 307     else{
 308       isPresent[i]=0 ;
 309     }
 310   }
 311
 312   Int_t nEMC = nmod*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 313
 314   Int_t nCPV ;
 315   Int_t absID ;
 316
 317   //check if CPV exists
 318   Bool_t isCPVpresent=0 ;
 319   for(Int_t i=1; i<=5 && !isCPVpresent; i++){
 320     volpath = "/ALIC_1/PHOS_";
 321     volpath += i;
 322     volpath += "/PCPV_1";
 323     if (gGeoManager->CheckPath(volpath.Data()))
 324       isCPVpresent=1 ;
 325   }
 326
 327   if(isCPVpresent){
 328     nCPV = nEMC + geom->GetNumberOfCPVPadsZ() * geom->GetNumberOfCPVPadsPhi() * nmod ;
 329   }
 330   else{
 331      nCPV = nEMC ;
 332   }
 333
 334   digits->Expand(nCPV) ;
 335
 336   //take all the inputs to add together and load the SDigits
 337   TObjArray * sdigArray = new TObjArray(fInput) ;
 338   sdigArray->AddAt(phosLoader->SDigits(), 0) ;
 339
 340   for(Int_t i = 1 ; i < fInput ; i++){
 341     TString tempo(fEventNames[i]) ;
 342     tempo += i ;
 343     AliRunLoader* rl2 = AliRunLoader::GetRunLoader(tempo) ;
 344     if(!rl2){
 345       rl2 = AliRunLoader::Open(fInputFileNames[i], tempo) ;
 346       if (!rl2) {
 347         Fatal("AliPHOSDigitizer", "Could not find the Run Loader for %s - %s",fInputFileNames[i].Data(), tempo.Data()) ;
 348         return ;
 349       }
 350       rl2->LoadHeader();
 351     }
 352     AliPHOSLoader * phosLoader2 = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl2->GetLoader("PHOSLoader"));
 353
 354     if(fManager){
 355       readEvent = dynamic_cast<AliStream*>(fManager->GetInputStream(i))->GetCurrentEventNumber() ;
 356     }
 357     TClonesArray * digs ;
 358     if(AliPHOSSimParam::GetInstance()->IsStreamDigits(i)){ //This is Digits Stream
 359       AliInfo(Form("Adding event %d from input stream %d %s %s",
 360                  readEvent, i, fInputFileNames[i].Data(), tempo.Data())) ;
 361        rl2->GetEvent(readEvent) ;
 362        phosLoader2->CleanDigits() ;
 363        phosLoader2->LoadDigits("READ") ;
 364        digs = phosLoader2->Digits() ;
 365        toMakeNoise=0 ; //Do not add noise, it is already in stream
 366     }
 367     else{
 368       AliInfo(Form("Adding event %d (SDigits) from input stream %d %s %s",
 369                  readEvent, i, fInputFileNames[i].Data(), tempo.Data())) ;
 370        rl2->GetEvent(readEvent) ;
 371        phosLoader2->CleanSDigits() ;
 372        phosLoader2->LoadSDigits("READ") ;
 373        digs = phosLoader2->SDigits() ;
 374     }
 375     sdigArray->AddAt(digs, i) ;
 376   }
 377
 378   //Find the first crystal with signal
 379   Int_t nextSig = 200000 ;
 380   TClonesArray * sdigits ;
 381   for(Int_t i = 0 ; i < fInput ; i++){
 382     sdigits = dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i)) ;
 383     if ( !sdigits->GetEntriesFast() )
 384       continue ;
 385     Int_t curNext = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>(sdigits->At(0))->GetId() ;
 386     if(curNext < nextSig)
 387       nextSig = curNext ;
 388   }
 389
 390   TArrayI index(fInput) ;
 391   index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
 392
 393   AliPHOSDigit * digit ;
 394   AliPHOSDigit * curSDigit ;
 395
 396 //  TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliPHOSTick",1000) ;
 397
 398   //Put Noise contribution
 399   Double_t apdNoise = 0. ;
 400   if(toMakeNoise)
 401      apdNoise = AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetAPDNoise() ;
 402
 403   Int_t emcpermod=geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 404   Int_t idigit= 0;
 405   for(Int_t imod=0; imod<5; imod++){
 406     if(!isPresent[imod])
 407       continue ;
 408     Int_t firstAbsId=imod*emcpermod+1 ;
 409     Int_t lastAbsId =(imod+1)*emcpermod ;
 410     for(absID = firstAbsId ; absID <= lastAbsId ; absID++){
 411       Float_t noise = gRandom->Gaus(0.,apdNoise) ;
 412       new((*digits)[idigit]) AliPHOSDigit( -1, absID, noise, TimeOfNoise() ) ;
 413       //look if we have to add signal?
 414       digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(idigit)) ;
 415       idigit++ ;
 416
 417       if(absID==nextSig){
 418       //Add SDigits from all inputs
 419 //      ticks->Clear() ;
 420 //      Int_t contrib = 0 ;
 421
 422 //New Timing model is necessary
 423 //      Float_t a = digit->GetEnergy() ;
 424 //      Float_t b = TMath::Abs( a / fTimeSignalLength) ;
 425 //      //Mark the beginning of the signal
 426 //      new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(digit->GetTime(),0, b);
 427 //      //Mark the end of the signal
 428 //      new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 429
 430 // Calculate time as time of the largest digit
 431         Float_t time = digit->GetTime() ;
 432         Float_t eTime= digit->GetEnergy() ;
 433
 434         //loop over inputs
 435         for(Int_t i = 0 ; i < fInput ; i++){
 436           if( dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 437             curSDigit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->At(index[i])) ;
 438           else
 439             curSDigit = 0 ;
 440           //May be several digits will contribute from the same input
 441           while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){
 442             //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
 443             Int_t primaryoffset ;
 444             if(fManager)
 445               primaryoffset = fManager->GetMask(i) ;
 446             else
 447               primaryoffset = 10000000*i ;
 448             curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
 449
 450 //New Timing model is necessary
 451 //        a = curSDigit->GetEnergy() ;
 452 //        b = a /fTimeSignalLength ;
 453 //        new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(curSDigit->GetTime(),0, b);
 454 //        new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 455           if(curSDigit->GetEnergy()>eTime){
 456             eTime=curSDigit->GetEnergy() ;
 457             time=curSDigit->GetTime() ;
 458           }
 459
 460             *digit += *curSDigit ;  //add energies
 461
 462             index[i]++ ;
 463             if( dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 464               curSDigit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->At(index[i])) ;
 465             else
 466               curSDigit = 0 ;
 467           }
 468         }
 469
 470         //calculate and set time
 471 //New Timing model is necessary
 472 //      Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
 473         digit->SetTime(time) ;
 474
 475         //Find next signal module
 476         nextSig = 200000 ;
 477         for(Int_t i = 0 ; i < fInput ; i++){
 478           sdigits = dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i)) ;
 479           Int_t curNext = nextSig ;
 480           if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] ){
 481             curNext = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>(sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
 482           }
 483           if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
 484         }
 485       }
 486     }
 487   }
 488
 489   //distretize energy if necessary
 490   if(AliPHOSSimParam::GetInstance()->IsEDigitizationOn()){
 491     Float_t adcW=AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetADCchannelW() ;
 492     for(Int_t i = 0 ; i < nEMC ; i++){
 493       digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ;
 494       digit->SetEnergy(adcW*ceil(digit->GetEnergy()/adcW)) ;
 495     }
 496   }
 497
 498   //Apply Fast decalibration if necessary
 499   if(AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetFastDecalibration()>0.){
 500     Float_t res=AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetFastDecalibration() ;
 501     for(Int_t i = 0 ; i < nEMC ; i++){
 502       digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ;
 503       digit->SetEnergy(gRandom->Gaus(1.,res)*digit->GetEnergy()) ;
 504     }
 505   }
 506
 507
 508 //  ticks->Delete() ;
 509 //  delete ticks ;
 510
 511   //Now CPV digits (different noise and no timing)
 512   Int_t cpvpermod = geom->GetNumberOfCPVPadsZ() * geom->GetNumberOfCPVPadsPhi() ;
 513   Int_t nEMCtotal=emcpermod*5 ;
 514   Float_t cpvNoise = AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetCPVNoise() ;
 515   if(isCPVpresent){  //CPV is present in current geometry
 516     for(Int_t imod=0; imod<5; imod++){ //module is present in current geometry
 517       if(!isPresent[imod])
 518         continue ;
 519       Int_t firstAbsId=nEMCtotal+imod*cpvpermod+1 ;
 520       Int_t lastAbsId =nEMCtotal+(imod+1)*cpvpermod ;
 521       for(absID = firstAbsId; absID <= lastAbsId; absID++){
 522         Float_t noise = gRandom->Gaus(0., cpvNoise) ;
 523         new((*digits)[idigit]) AliPHOSDigit( -1,absID,noise, TimeOfNoise() ) ;
 524         idigit++ ;
 525         //look if we have to add signal?
 526         if(absID==nextSig){
 527           digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(idigit-1)) ;
 528           //Add SDigits from all inputs
 529           for(Int_t i = 0 ; i < fInput ; i++){
 530              if( dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 531                curSDigit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->At(index[i])) ;
 532              else
 533                curSDigit = 0 ;
 534
 535              //May be several digits will contribute from the same input
 536              while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){
 537                //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
 538                Int_t primaryoffset ;
 539                if(fManager)
 540                  primaryoffset = fManager->GetMask(i) ;
 541                else
 542                  primaryoffset = 10000000*i ;
 543                curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
 544
 545                //add energies
 546                *digit += *curSDigit ;
 547                index[i]++ ;
 548                if( dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 549                  curSDigit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->At(index[i]) ) ;
 550                else
 551                  curSDigit = 0 ;
 552              }
 553           }
 554
 555           //Find next signal module
 556           nextSig = 200000 ;
 557           for(Int_t i = 0 ; i < fInput ; i++){
 558             sdigits = dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i)) ;
 559             Int_t curNext = nextSig ;
 560             if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] )
 561               curNext = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>( sdigits->At(index[i]) )->GetId() ;
 562             if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
 563           }
 564
 565         }
 566       }
 567     }
 568   }
 569
 570   delete sdigArray ; //We should not delete its contents
 571
 572   Int_t relId[4];
 573
 574   //set amplitudes in bad channels to zero
 575
 576   for(Int_t i = 0 ; i <digits->GetEntriesFast(); i++){
 577     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ;
 578     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(),relId);
 579     if(relId[1] == 0) // Emc
 580       if(fcdb->IsBadChannelEmc(relId[0],relId[3],relId[2])) digit->SetEnergy(0.);
 581   }
 582
 583   //remove digits below thresholds
 584   Float_t emcThreshold = AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetEmcDigitsThreshold() ;
 585   for(Int_t i = 0 ; i < nEMC ; i++){
 586     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ;
 587
 588     if(digit->GetEnergy() < emcThreshold){
 589       digits->RemoveAt(i) ;
 590       continue ;
 591     }
 592     Float_t tres = TimeResolution(digit->GetEnergy()) ;
 593     digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(), tres) ) ;
 594   }
 595
 596   Float_t cpvDigitThreshold = AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetCpvDigitsThreshold() ;
 597   for(Int_t i = nEMC; i < nCPV ; i++){
 598     if( dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(digits->At(i))->GetEnergy() < cpvDigitThreshold )
 599       digits->RemoveAt(i) ;
 600   }
 601
 602   digits->Compress() ;
 603
 604   Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ;
 605   digits->Expand(ndigits) ;
 606
 607
 608   //Set indexes in list of digits and make true digitization of the energy
 609   for (Int_t i = 0 ; i < ndigits ; i++) {
 610     digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ;
 611     digit->SetIndexInList(i) ;
 612     if(digit->GetId() > fEmcCrystals){ //digitize CPV only
 613       digit->SetAmp(DigitizeCPV(digit->GetEnergy(),digit->GetId()) ) ;
 614     }
 615   }
 616
 617 }
 618
 619 //____________________________________________________________________________
 620 void AliPHOSDigitizer::DecalibrateEMC(AliPHOSDigit *digit)
 621 {
 622   // Decalibrate EMC digit, i.e. change its energy by a factor read from CDB
 623
 624   const AliPHOSGeometry *geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
 625
 626   //Determine rel.position of the cell absolute ID
 627   Int_t relId[4];
 628   geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(),relId);
 629   Int_t module=relId[0];
 630   Int_t row   =relId[2];
 631   Int_t column=relId[3];
 632   Float_t decalibration = fcdb->GetADCchannelEmc(module,column,row);
 633   Float_t energy = digit->GetEnergy() / decalibration;
 634   digit->SetEnergy(energy);
 635 }
 636 //____________________________________________________________________________
 637 Int_t AliPHOSDigitizer::DigitizeCPV(Float_t charge, Int_t absId)
 638 {
 639   // Returns digitized value of the CPV charge in a pad absId
 640
 641   const AliPHOSGeometry *geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
 642
 643   //Determine rel.position of the cell absId
 644   Int_t relId[4];
 645   geom->AbsToRelNumbering(absId,relId);
 646   Int_t module=relId[0];
 647   Int_t row   =relId[2];
 648   Int_t column=relId[3];
 649
 650   Int_t channel = 0;
 651
 652   if(absId > fEmcCrystals){ //digitize CPV only
 653
 654     //reading calibration data for cell absId.
 655     Float_t adcPedestalCpv = fcdb->GetADCpedestalCpv(module,column,row);
 656     Float_t adcChanelCpv   = fcdb->GetADCchannelCpv( module,column,row);
 657
 658     channel = (Int_t) TMath::Ceil((charge - adcPedestalCpv)/adcChanelCpv) ;
 659     Int_t nMax = AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetNADCcpv() ;
 660     if(channel > nMax ) channel = nMax ;
 661   }
 662   return channel ;
 663 }
 664
 665 //____________________________________________________________________________
 666 void AliPHOSDigitizer::Exec(Option_t *option)
 667 {
 668   // Steering method to process digitization for events
 669   // in the range from fFirstEvent to fLastEvent.
 670   // This range is optionally set by SetEventRange().
 671   // if fLastEvent=-1, then process events until the end.
 672   // by default fLastEvent = fFirstEvent (process only one event)
 673
 674   if (!fInit) { // to prevent overwrite existing file
 675     AliError(Form("Give a version name different from %s",
 676                   fEventFolderName.Data() )) ;
 677     return ;
 678   }
 679
 680   if (strstr(option,"print")) {
 681     Print();
 682     return ;
 683   }
 684
 685  if(strstr(option,"tim"))
 686      gBenchmark->Start("PHOSDigitizer");
 687
 688   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fEventFolderName) ;
 689   AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 690
 691   // Post Digitizer to the white board
 692   phosLoader->PostDigitizer(this) ;
 693
 694   if (fLastEvent == -1)
 695     fLastEvent = rl->GetNumberOfEvents() - 1 ;
 696   else if (fManager)
 697     fLastEvent = fFirstEvent ;
 698
 699   Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
 700
 701   Int_t ievent ;
 702
 703   for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
 704     fEventCounter++ ;
 705
 706     Digitize(ievent) ; //Add prepared SDigits to digits and add the noise
 707
 708     WriteDigits() ;
 709
 710     if(strstr(option,"deb"))
 711       PrintDigits(option);
 712
 713     //increment the total number of Digits per run
 714     fDigitsInRun += phosLoader->Digits()->GetEntriesFast() ;
 715  }
 716
 717   phosLoader->CleanDigitizer();
 718
 719   if(strstr(option,"tim")){
 720     gBenchmark->Stop("PHOSDigitizer");
 721     TString message ;
 722     message = "  took %f seconds for Digitizing %f seconds per event\n" ;
 723     AliInfo(Form( message.Data(),
 724          gBenchmark->GetCpuTime("PHOSDigitizer"),
 725          gBenchmark->GetCpuTime("PHOSDigitizer")/nEvents ));
 726   }
 727 }
 728 //____________________________________________________________________________
 729 Float_t AliPHOSDigitizer::TimeResolution(Float_t e){
 730   //calculate TOF resolution using beam-test resutls
 731   Float_t a=AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetTOFa() ;
 732   Float_t b=AliPHOSSimParam::GetInstance()->GetTOFb() ;
 733   return TMath::Sqrt(a*a+b*b/e) ;
 734 }
 735
 736 ////____________________________________________________________________________
 737 //Float_t AliPHOSDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks) const
 738 //{
 739 //  // Returns the shortest time among all time ticks
 740 //
 741 //  ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
 742 //  TIter it(ticks) ;
 743 //  AliPHOSTick * ctick = (AliPHOSTick *) it.Next() ;
 744 //  Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 745 //
 746 //  AliPHOSTick * t ;
 747 //  while((t=(AliPHOSTick*) it.Next())){
 748 //    if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
 749 //      *ctick+=*t ;
 750 //    else
 751 //      return time ;
 752 //
 753 //    time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 754 //  }
 755 //  return time ;
 756 //}
 757
 758 //____________________________________________________________________________
 759 Bool_t AliPHOSDigitizer::Init()
 760 {
 761   // Makes all memory allocations
 762   fInit = kTRUE ;
 763
 764   AliPHOSGeometry *geom;
 765   if (!(geom = AliPHOSGeometry::GetInstance()))
 766         geom = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP","");
 767 //   const AliPHOSGeometry *geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
 768
 769   fEmcCrystals = geom->GetNModules() * geom->GetNCristalsInModule() ;
 770
 771   fFirstEvent = 0 ;
 772   fLastEvent = fFirstEvent ;
 773   if (fManager)
 774     fInput = fManager->GetNinputs() ;
 775   else
 776     fInput           = 1 ;
 777
 778   fInputFileNames  = new TString[fInput] ;
 779   fEventNames      = new TString[fInput] ;
 780   fInputFileNames[0] = GetTitle() ;
 781   fEventNames[0]     = fEventFolderName.Data() ;
 782   Int_t index ;
 783   for (index = 1 ; index < fInput ; index++) {
 784     fInputFileNames[index] = dynamic_cast<AliStream*>(fManager->GetInputStream(index))->GetFileName(0);
 785     TString tempo = fManager->GetInputFolderName(index) ;
 786     fEventNames[index] = tempo.Remove(tempo.Length()-1) ; // strip of the stream number added by fManager
 787   }
 788
 789   //to prevent cleaning of this object while GetEvent is called
 790   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fEventFolderName) ;
 791   if(!rl){
 792     rl = AliRunLoader::Open(GetTitle(), fEventFolderName) ;
 793   }
 794   AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 795   phosLoader->GetDigitsDataLoader()->GetBaseTaskLoader()->SetDoNotReload(kTRUE);
 796
 797   return fInit ;
 798 }
 799
 800 //____________________________________________________________________________
 801 void AliPHOSDigitizer::InitParameters()
 802 {
 803   // Set initial parameters Digitizer
 804
 805   fDigitsInRun  = 0 ;
 806   SetEventRange(0,-1) ;
 807
 808 }
 809
 810 //__________________________________________________________________
 811 void AliPHOSDigitizer::Print(const Option_t *)const
 812 {
 813   // Print Digitizer's parameters
 814   AliInfo(Form("\n------------------- %s -------------", GetName() )) ;
 815   if( strcmp(fEventFolderName.Data(), "") != 0 ){
 816     printf(" Writing Digits to branch with title  %s\n", fEventFolderName.Data()) ;
 817
 818     Int_t nStreams ;
 819     if (fManager)
 820       nStreams =  GetNInputStreams() ;
 821     else
 822       nStreams = fInput ;
 823
 824     Int_t index = 0 ;
 825     for (index = 0 ; index < nStreams ; index++) {
 826       TString tempo(fEventNames[index]) ;
 827       tempo += index ;
 828       printf ("Adding SDigits from %s \n", fInputFileNames[index].Data()) ;
 829     }
 830
 831  //   printf("\nWith following parameters:\n") ;
 832  //   printf("  Electronics noise in EMC (fPinNoise)    = %f GeV\n", fPinNoise ) ;
 833  //   printf("  Threshold  in EMC  (fEMCDigitThreshold) = %f GeV\n", fEMCDigitThreshold ) ;
 834  //   printf("  Noise in CPV (fCPVNoise)                = %f aux units\n", fCPVNoise ) ;
 835  //   printf("  Threshold in CPV (fCPVDigitThreshold)   = %f aux units\n",fCPVDigitThreshold ) ;
 836     printf(" ---------------------------------------------------\n") ;
 837   }
 838   else
 839     AliInfo(Form("AliPHOSDigitizer not initialized" )) ;
 840
 841 }
 842
 843 //__________________________________________________________________
 844  void AliPHOSDigitizer::PrintDigits(Option_t * option)
 845 {
 846   // Print a table of digits
 847
 848
 849   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fEventFolderName) ;
 850   AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 851   TClonesArray * digits = phosLoader->Digits() ;
 852   const AliPHOSGeometry *geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
 853
 854   AliInfo(Form("%d", digits->GetEntriesFast())) ;
 855   printf("\nevent %d", gAlice->GetEvNumber()) ;
 856   printf("\n       Number of entries in Digits list %d", digits->GetEntriesFast() )  ;
 857
 858
 859   if(strstr(option,"all")||strstr(option,"EMC")){
 860     //loop over digits
 861     AliPHOSDigit * digit;
 862     printf("\nEMC digits (with primaries):\n")  ;
 863     printf("\n   Id  Amplitude    Time          Index Nprim: Primaries list \n") ;
 864     Int_t maxEmc = geom->GetNModules()*geom->GetNCristalsInModule() ;
 865     Int_t index ;
 866     for (index = 0 ; (index < digits->GetEntriesFast()) &&
 867            (dynamic_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(index))->GetId() <= maxEmc) ; index++) {
 868       digit = (AliPHOSDigit * )  digits->At(index) ;
 869       if(digit->GetNprimary() == 0)
 870         continue;
 871 //       printf("%6d  %8d    %6.5e %4d      %2d :",
 872 //            digit->GetId(), digit->GetAmp(), digit->GetTime(), digit->GetIndexInList(), digit->GetNprimary()) ;  // YVK
 873       printf("%6d  %.4f    %6.5e %4d      %2d :",
 874               digit->GetId(), digit->GetEnergy(), digit->GetTime(), digit->GetIndexInList(), digit->GetNprimary()) ;
 875       Int_t iprimary;
 876       for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++) {
 877         printf("%d ",digit->GetPrimary(iprimary+1) ) ;
 878       }
 879       printf("\n") ;
 880     }
 881   }
 882
 883   if(strstr(option,"all")||strstr(option,"CPV")){
 884
 885     //loop over CPV digits
 886     AliPHOSDigit * digit;
 887     printf("\nCPV digits (with primaries):\n")  ;
 888     printf("\n   Id  Amplitude    Time          Index Nprim: Primaries list \n") ;
 889     Int_t maxEmc = geom->GetNModules()*geom->GetNCristalsInModule() ;
 890     Int_t index ;
 891     for (index = 0 ; index < digits->GetEntriesFast(); index++) {
 892       digit = (AliPHOSDigit * )  digits->At(index) ;
 893       if(digit->GetId() > maxEmc){
 894         printf("%6d  %8d    %4d      %2d :",
 895                 digit->GetId(), digit->GetAmp(), digit->GetIndexInList(), digit->GetNprimary()) ;
 896         Int_t iprimary;
 897         for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++) {
 898           printf("%d ",digit->GetPrimary(iprimary+1) ) ;
 899         }
 900         printf("\n") ;
 901       }
 902     }
 903   }
 904
 905 }
 906
 907 //__________________________________________________________________
 908 Float_t AliPHOSDigitizer::TimeOfNoise(void) const
 909 {  // Calculates the time signal generated by noise
 910   //PH  Info("TimeOfNoise", "Change me") ;
 911   return gRandom->Rndm() * 1.28E-5;
 912 }
 913
 914 //__________________________________________________________________
 915 void AliPHOSDigitizer::Unload()
 916 {
 917
 918   Int_t i ;
 919   for(i = 1 ; i < fInput ; i++){
 920     TString tempo(fEventNames[i]) ;
 921     tempo += i ;
 922     AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(tempo) ;
 923     AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 924     phosLoader->UnloadSDigits() ;
 925   }
 926
 927   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fEventFolderName) ;
 928   AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 929   phosLoader->UnloadDigits() ;
 930 }
 931
 932 //____________________________________________________________________________
 933 void AliPHOSDigitizer::WriteDigits()
 934 {
 935
 936   // Makes TreeD in the output file.
 937   // Check if branch already exists:
 938   //   if yes, exit without writing: ROOT TTree does not support overwriting/updating of
 939   //      already existing branches.
 940   //   else creates branch with Digits, named "PHOS", title "...",
 941   //      and branch "AliPHOSDigitizer", with the same title to keep all the parameters
 942   //      and names of files, from which digits are made.
 943
 944   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fEventFolderName) ;
 945   AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 946
 947   const TClonesArray * digits = phosLoader->Digits() ;
 948   TTree * treeD = phosLoader->TreeD();
 949   if(!treeD){
 950     phosLoader->MakeTree("D");
 951     treeD = phosLoader->TreeD();
 952   }
 953
 954   // -- create Digits branch
 955   Int_t bufferSize = 32000 ;
 956   TBranch * digitsBranch = treeD->Branch("PHOS","TClonesArray",&digits,bufferSize);
 957   digitsBranch->SetTitle(fEventFolderName);
 958   digitsBranch->Fill() ;
 959
 960   phosLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
 961   phosLoader->WriteDigitizer("OVERWRITE");
 962
 963   Unload() ;
 964
 965 }