Elaborating split mode to write data only to the split files
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSDigitizer.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 //_________________________________________________________________________
19 //*-- Author :  Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute) 
20 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
21 // This TTask performs digitization of Summable digits (in the PHOS case it is just
22 // the sum of contributions from all primary particles into a given cell). 
23 // In addition it performs mixing of summable digits from different events.
24 // The name of the TTask is also the title of the branch that will contain 
25 // the created SDigits
26 // The title of the TTAsk is the name of the file that contains the hits from
27 // which the SDigits are created
28 //
29 // For each event two branches are created in TreeD:
30 //   "PHOS" - list of digits
31 //   "AliPHOSDigitizer" - AliPHOSDigitizer with all parameters used in digitization
32 //
33 // Note, that one can set a title for new digits branch, and repeat digitization with
34 // another set of parameters.
35 //
36 // Use case:
37 // root[0] AliPHOSDigitizer * d = new AliPHOSDigitizer() ;
38 // root[1] d->ExecuteTask()             
39 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
40 //                       //Digitizes SDigitis in all events found in file galice.root 
41 //
42 // root[2] AliPHOSDigitizer * d1 = new AliPHOSDigitizer("galice1.root") ;  
43 //                       // Will read sdigits from galice1.root
44 // root[3] d1->MixWith("galice2.root")       
45 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
46 //                       // Reads another set of sdigits from galice2.root
47 // root[3] d1->MixWith("galice3.root")       
48 //                       // Reads another set of sdigits from galice3.root
49 // root[4] d->ExecuteTask("deb timing")    
50 //                       // Reads SDigits from files galice1.root, galice2.root ....
51 //                       // mixes them and stores produced Digits in file galice1.root          
52 //                       // deb - prints number of produced digits
53 //                       // deb all - prints list of produced digits
54 //                       // timing  - prints time used for digitization
55 //
56
57 // --- ROOT system ---
58 #include "TFile.h"
59 #include "TTree.h"
60 #include "TSystem.h"
61 #include "TROOT.h"
62 #include "TFolder.h"
63 #include "TObjString.h"
64 #include "TGeometry.h"
65 #include "TBenchmark.h"
66
67 // --- Standard library ---
68 #include <iomanip.h>
69
70 // --- AliRoot header files ---
71
72 #include "AliRun.h"
73 #include "AliHeader.h"
74 #include "AliStream.h"
75 #include "AliRunDigitizer.h"
76 #include "AliPHOSDigit.h"
77 #include "AliPHOS.h"
78 #include "AliPHOSGetter.h"
79 #include "AliPHOSDigitizer.h"
80 #include "AliPHOSSDigitizer.h"
81 #include "AliPHOSGeometry.h"
82 #include "AliPHOSTick.h"
83
84 ClassImp(AliPHOSDigitizer)
85
86
87 //____________________________________________________________________________ 
88   AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer() 
89 {
90   // ctor
91   InitParameters() ; 
92   fDefaultInit = kTRUE ;
93   fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
94  
95   // fHitsFileName    = "" ;
96   // fSDigitsFileName = "" ; 
97  }
98
99 //____________________________________________________________________________ 
100 AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(const char *headerFile, const char * name, const Bool_t toSplit)
101 {
102   // ctor
103
104   SetTitle(headerFile) ;
105   SetName(name) ;
106   fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
107   fSplitFile= 0 ; 
108   InitParameters() ; 
109   fToSplit = toSplit ;
110   Init() ;
111   fDefaultInit = kFALSE ; 
112   //  fSDigitsFileName = headerFile ; 
113   //  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
114   //  gime->Event(0, "S") ; 
115   //  fHitsFileName = gime->SDigitizer()->GetTitle() ; 
116 }
117
118 //____________________________________________________________________________ 
119 AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(AliRunDigitizer * ard):AliDigitizer(ard)
120 {
121   // ctor
122   SetTitle(ard->GetInputFileName(0,0)) ;
123   InitParameters() ; 
124   fDefaultInit = kFALSE ; 
125   fSplitFile   = 0 ; 
126
127   if (ard->GetOutputFile()) {
128     SetName(ard->GetOutputFile().Data());
129     fToSplit = kTRUE ;
130   } else {
131     SetName("Default") ;
132     fToSplit = kFALSE ;
133   }
134
135 //   fSDigitsFileName = fManager->GetInputFileName(0, 0) ;
136 //   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(fSDigitsFileName, GetName()) ; 
137 //   gime->Event(0,"S") ; 
138 //  fHitsFileName = gime->SDigitizer()->GetTitle() ; 
139   
140 }
141
142 //____________________________________________________________________________ 
143   AliPHOSDigitizer::~AliPHOSDigitizer()
144 {
145   // dtor
146   // fDefaultInit = kTRUE if Digitizer created by default ctor (to get just the parameters)
147   
148 //   if (!fDefaultInit) {
149 //     AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
150  
151 //    // remove the task from the folder list
152 //    gime->RemoveTask("S",GetName()) ;
153 //    gime->RemoveTask("D",GetName()) ;
154    
155 //    // remove the Digits from the folder list
156 //    gime->RemoveObjects("D", GetName()) ;
157    
158 //    // remove the SDigits from the folder list
159 //    gime->RemoveSDigits() ;
160    
161 //    // Delete gAlice
162 //    gime->CloseFile() ; 
163    
164    fSplitFile = 0 ; 
165    // }
166 }
167
168 //____________________________________________________________________________
169 void AliPHOSDigitizer::Digitize(const Int_t event) 
170
171   
172   // Makes the digitization of the collected summable digits.
173   //  It first creates the array of all PHOS modules
174   //  filled with noise (different for EMC, CPV and PPSD) and
175   //  then adds contributions from SDigits. 
176   // This design avoids scanning over the list of digits to add 
177   // contribution to new SDigits only.
178
179   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
180   TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ; 
181
182   digits->Clear() ;
183
184   const AliPHOSGeometry *geom = gime->PHOSGeometry() ; 
185   //Making digits with noise, first EMC
186   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
187   
188   Int_t nCPV ;
189   Int_t absID ;
190   TString name      =  geom->GetName() ;
191   
192   nCPV = nEMC + geom->GetNumberOfCPVPadsZ()*geom->GetNumberOfCPVPadsPhi()*
193     geom->GetNModules() ;
194
195   digits->Expand(nCPV) ;
196
197   // get first the sdigitizer from the tasks list (must have same name as the digitizer)
198   const AliPHOSSDigitizer * sDigitizer = gime->SDigitizer(GetName()); 
199   if ( !sDigitizer) {
200     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::Digitize -> SDigitizer with name " << GetName() << " not found " << endl ; 
201     abort() ; 
202   }
203     
204   // loop through the sdigits posted to the White Board and add them to the noise
205   TCollection * folderslist = gime->SDigitsFolder()->GetListOfFolders() ; 
206   TIter next(folderslist) ; 
207   TFolder * folder = 0 ; 
208   TClonesArray * sdigits = 0 ;
209   Int_t input = 0 ;
210   TObjArray * sdigArray = new TObjArray(2) ;
211   while ( (folder = (TFolder*)next()) ) { 
212     if ( (sdigits = (TClonesArray*)folder->FindObject(GetName()) ) ) {
213       TString fileName(folder->GetName()) ;
214       fileName.ReplaceAll("_","/") ;
215 //       cout << "INFO: AliPHOSDigitizer::Digitize -> Adding SDigits " 
216 //         << GetName() << " from " << fileName << endl ; 
217       sdigArray->AddAt(sdigits, input) ;
218       input++ ;
219     }
220   }
221
222   //Find the first crystall with signal
223   Int_t nextSig = 200000 ; 
224   Int_t i;
225   for(i=0; i<input; i++){
226     sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
227     if ( !sdigits->GetEntriesFast() )
228       continue ; 
229     Int_t curNext = ((AliPHOSDigit *)sdigits->At(0))->GetId() ;
230      if(curNext < nextSig) 
231        nextSig = curNext ;
232   }
233
234   TArrayI index(input) ;
235   index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
236
237   AliPHOSDigit * digit ;
238   AliPHOSDigit * curSDigit ;
239
240   TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliPHOSTick",1000) ;
241
242   //Put Noise contribution
243   for(absID = 1; absID <= nEMC; absID++){
244     Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fPinNoise) ; 
245     new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
246     //look if we have to add signal?
247     digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(absID-1) ;
248  
249     if(absID==nextSig){
250       //Add SDigits from all inputs 
251       ticks->Clear() ;
252       Int_t contrib = 0 ;
253       Float_t a = digit->GetAmp() ;
254       Float_t b = TMath::Abs( a /fTimeSignalLength) ;
255       //Mark the beginnign of the signal
256       new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(digit->GetTime(),0, b);  
257       //Mark the end of the ignal     
258       new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b); 
259
260       //loop over inputs
261       for(i=0; i<input; i++){
262         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
263           curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;         
264         else
265           curSDigit = 0 ;
266         //May be several digits will contribute from the same input
267         while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){           
268           //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
269           Int_t primaryoffset ;
270           if(fManager)
271             primaryoffset = fManager->GetMask(i) ; 
272           else
273             primaryoffset = 10000000*i ;
274           curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
275           
276           a = curSDigit->GetAmp() ;
277           b = a /fTimeSignalLength ;
278           new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(curSDigit->GetTime(),0, b);  
279           new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b); 
280
281           *digit = *digit + *curSDigit ;  //add energies
282
283           index[i]++ ;
284           if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
285             curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;       
286           else
287             curSDigit = 0 ;
288         }
289       }
290
291       //calculate and set time
292       Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
293       digit->SetTime(time) ;
294
295       //Find next signal module
296       nextSig = 200000 ;
297       for(i=0; i<input; i++){
298         sdigits = ((TClonesArray *)sdigArray->At(i)) ;
299         Int_t curNext = nextSig ;
300         if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] ){
301           curNext = ((AliPHOSDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
302           
303         }
304         if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
305       }
306     }
307   }
308   
309   ticks->Delete() ;
310   delete ticks ;
311
312
313   //Now CPV digits (different noise and no timing)
314   for(absID = nEMC+1; absID <= nCPV; absID++){
315     Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fCPVNoise) ; 
316     new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
317     //look if we have to add signal?
318     if(absID==nextSig){
319       digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(absID-1) ;
320       //Add SDigits from all inputs
321       for(i=0; i<input; i++){
322         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
323           curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;         
324         else
325           curSDigit = 0 ;
326
327         //May be several digits will contribute from the same input
328         while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){           
329           //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
330           Int_t primaryoffset ;
331           if(fManager)
332             primaryoffset = fManager->GetMask(i) ; 
333           else
334             primaryoffset = 10000000*i ;
335           curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
336
337           //add energies
338           *digit = *digit + *curSDigit ;  
339           index[i]++ ;
340           if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
341             curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;       
342           else
343             curSDigit = 0 ;
344         }
345       }
346
347       //Find next signal module
348       nextSig = 200000 ;
349       for(i=0; i<input; i++){
350         sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
351         Int_t curNext = nextSig ;
352         if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] )
353           curNext = ((AliPHOSDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
354         if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
355       }
356       
357     }
358   }
359   delete sdigArray ; //We should not delete its contents
360   
361   
362   
363   //remove digits below thresholds
364   for(i = 0; i < nEMC ; i++){
365     digit = (AliPHOSDigit*) digits->At(i) ;
366     if(sDigitizer->Calibrate( digit->GetAmp() ) < fEMCDigitThreshold)
367       digits->RemoveAt(i) ;
368     else
369       digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
370   }
371
372
373   for(i = nEMC; i < nCPV ; i++)
374     if(sDigitizer->Calibrate(((AliPHOSDigit*)digits->At(i))->GetAmp()) < fCPVDigitThreshold)
375       digits->RemoveAt(i) ;
376     
377   digits->Compress() ;  
378   
379   Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ;
380   digits->Expand(ndigits) ;
381
382   //Set indexes in list of digits and make true digitization of the energy
383   for (i = 0 ; i < ndigits ; i++) { 
384     AliPHOSDigit * digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(i) ; 
385     digit->SetIndexInList(i) ;     
386     Float_t energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
387     digit->SetAmp(DigitizeEnergy(energy,digit->GetId()) ) ;
388   }
389
390 }
391 //____________________________________________________________________________
392 Int_t AliPHOSDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t absId)
393 {
394   Int_t chanel ;
395   if(absId <= fEmcCrystals){ //digitize as EMC 
396     chanel = (Int_t) TMath::Ceil((energy - fADCpedestalEmc)/fADCchanelEmc) ;       
397     if(chanel > fNADCemc ) chanel =  fNADCemc ;
398   }
399   else{ //Digitize as CPV
400     chanel = (Int_t) TMath::Ceil((energy - fADCpedestalCpv)/fADCchanelCpv) ;       
401     if(chanel > fNADCcpv ) chanel =  fNADCcpv ;
402   }
403   return chanel ;
404 }
405 //____________________________________________________________________________
406 void AliPHOSDigitizer::Exec(Option_t *option) 
407
408   // Managing method
409
410   if(strcmp(GetName(), "") == 0 )   
411     Init() ;
412   if (strstr(option,"print")) {
413     Print("");
414     return ; 
415   }
416   
417   if(strstr(option,"tim"))
418     gBenchmark->Start("PHOSDigitizer");
419
420   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
421   
422   Int_t nevents ;
423   
424   TTree * treeD ;
425   
426   if(fManager){
427     treeD = fManager->GetTreeD() ;
428     nevents = 1 ;    // Will process only one event
429     
430     //Check, if this branch already exits
431     if (treeD) { 
432       TObjArray * lob = (TObjArray*)treeD->GetListOfBranches() ;
433       TIter next(lob) ; 
434       TBranch * branch = 0 ;  
435       Bool_t phosfound = kFALSE, digitizerfound = kFALSE ; 
436       
437       while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!phosfound || !digitizerfound) ) {
438         if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOS")==0) && 
439              (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) ) 
440           phosfound = kTRUE ;
441         
442         else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSDigitizer")==0) && 
443                   (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) ) 
444           digitizerfound = kTRUE ; 
445       }
446       
447       if ( phosfound ) {
448         cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer -> Digits branch with name " << GetName() 
449              << " already exits" << endl ;
450         return ; 
451       }   
452       if ( digitizerfound ) {
453         cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer -> Digitizer branch with name " << GetName() 
454              << " already exits" << endl ;
455         return ; 
456       }
457     }   
458   }
459   else { //PHOS standalone
460     if(gime->BranchExists("Digits") ) 
461       return ;
462     nevents=gime->MaxEvent() ;
463   }
464   
465   Int_t ievent ;
466   
467   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
468   
469     if(fManager){
470
471       Int_t input ;
472       for(input = 0 ; input < fManager->GetNinputs(); input ++){
473         TTree * treeS = fManager->GetInputTreeS(input) ;
474         if(!treeS){
475           cerr << "AliPHOSDigitizer::Exec -> No Input " << endl ;
476           return ;
477         }
478         gime->ReadTreeS(treeS,input) ;
479       }
480
481     }
482     else
483       gime->Event(ievent,"S") ;
484     
485     Digitize(ievent) ; //Add prepared SDigits to digits and add the noise
486     
487     WriteDigits(ievent) ;
488     
489     if(strstr(option,"deb"))
490       PrintDigits(option);
491     
492     //increment the total number of Digits per run 
493     fDigitsInRun += gime->Digits()->GetEntriesFast() ;  
494   }
495    
496   if(strstr(option,"tim")){
497     gBenchmark->Stop("PHOSDigitizer");
498     cout << "AliPHOSDigitizer:" << endl ;
499     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("PHOSDigitizer") << " seconds for Digitizing " 
500          <<  gBenchmark->GetCpuTime("PHOSDigitizer")/nevents << " seconds per event " << endl ;
501     cout << endl ;
502   }
503   
504 }
505
506 //____________________________________________________________________________ 
507 Float_t AliPHOSDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks) 
508 { // 
509   ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
510   TIter it(ticks) ;
511   AliPHOSTick * ctick = (AliPHOSTick *) it.Next() ;
512   Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;    
513
514   AliPHOSTick * t ;  
515   while((t=(AliPHOSTick*) it.Next())){
516     if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
517       *ctick+=*t ;
518     else
519       return time ;
520
521     time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;    
522   }
523   return time ;
524 }
525
526 //____________________________________________________________________________ 
527 Bool_t AliPHOSDigitizer::Init()
528 {
529   // Makes all memory allocations
530
531   if( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
532     SetTitle("galice.root") ;
533
534   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(), GetName(), fToSplit) ; 
535   if ( gime == 0 ) {
536     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ; 
537     return kFALSE;
538   } 
539   
540   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
541
542   fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
543   
544   // Post Digits to the white board
545   gime->PostDigits(GetName() ) ;   
546   
547   // Post Digitizer to the white board
548   gime->PostDigitizer(this) ;
549
550   fSplitFile = 0 ;
551   if(fToSplit){
552     // construct the name of the file as /path/PHOS.SDigits.root
553     //First - extract full path if necessary
554     TString digitsFileName(GetTitle()) ;
555     Ssiz_t islash = digitsFileName.Last('/') ;
556     if(islash<digitsFileName.Length())
557       digitsFileName.Remove(islash+1,digitsFileName.Length()) ;
558     else
559       digitsFileName="" ;
560     // Next - append the file name 
561     digitsFileName+="PHOS.Digits." ;
562     if((strcmp(GetName(),"Default")!=0)&&(strcmp(GetName(),"")!=0)){
563       digitsFileName+=GetName() ;
564       digitsFileName+="." ;
565     }
566     digitsFileName+="root" ;
567     // Finally - check if the file already opened or open the file
568     fSplitFile = static_cast<TFile*>(gROOT->GetFile(digitsFileName.Data()));   
569     if(!fSplitFile)
570       fSplitFile =  TFile::Open(digitsFileName.Data(),"update") ;
571   }
572   
573   //Mark that we will use current header file
574   if(!fManager){
575     gime->PostSDigits(GetName(),GetTitle()) ;
576     gime->PostSDigitizer(GetName(),GetTitle()) ;
577   }
578   return kTRUE ;
579 }
580
581 //____________________________________________________________________________ 
582 void AliPHOSDigitizer::InitParameters()
583 {
584   fPinNoise           = 0.004 ;
585   fEMCDigitThreshold  = 0.012 ;
586   fCPVNoise           = 0.01;
587   fCPVDigitThreshold  = 0.09 ;
588   fTimeResolution     = 0.5e-9 ;
589   fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
590   fDigitsInRun  = 0 ; 
591   fADCchanelEmc = 0.0015;        // width of one ADC channel in GeV
592   fADCpedestalEmc = 0.005 ;      //
593   fNADCemc = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in EMC ADC
594
595   fADCchanelCpv = 0.0012 ;          // width of one ADC channel in CPV 'popugais'
596   fADCpedestalCpv = 0.012 ;         // 
597   fNADCcpv = (Int_t) TMath::Power(2,12);      // number of channels in CPV ADC
598
599   fTimeThreshold = 0.001*10000000 ; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
600     
601 }
602
603 //__________________________________________________________________
604 void AliPHOSDigitizer::MixWith(const char* headerFile)
605 {
606   // Allows to produce digits by superimposing background and signal event.
607   // It is assumed, that headers file with SIGNAL events is opened in 
608   // the constructor. 
609   // Sets the BACKGROUND event, with which the SIGNAL event is to be mixed 
610   // Thus we avoid writing (changing) huge and expensive 
611   // backgound files: all output will be writen into SIGNAL, i.e. 
612   // opened in constructor file. 
613   //
614   // One can open as many files to mix with as one needs.
615   // However only Sdigits with the same name (i.e. constructed with the same SDigitizer)
616   // can be mixed.
617
618   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
619     Init() ;
620
621   if(fManager){
622     cout << "Can not use this method under AliRunDigitizer " << endl ;
623     return ;
624   }
625   
626   // check if the specified SDigits do not already exist on the White Board:
627   // //Folders/RunMC/Event/Data/PHOS/SDigits/headerFile/sdigitsname
628
629   TString path = "Folders/RunMC/Event/Data/PHOS/SDigits" ; 
630   path += headerFile ; 
631   path += "/" ; 
632   path += GetName() ;
633   if ( gROOT->FindObjectAny(path.Data()) ) {
634     cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer::MixWith -> Entry already exists, do not add" << endl ;
635     return;
636   }
637
638   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
639   gime->PostSDigits(GetName(),headerFile) ;
640   
641   // check if the requested file is already open or exist and if SDigits Branch exist
642   TFile * file = (TFile*)gROOT->FindObject(headerFile); 
643   if ( !file ) { 
644     file = new TFile(headerFile, "READ") ; 
645     if (!file) { 
646       cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::MixWith -> File " << headerFile << " does not exist!" << endl ; 
647       return ; 
648     }
649   }
650   
651 }
652
653 // //__________________________________________________________________
654 // void AliPHOSDigitizer::SetSplitFile(const TString splitFileName)
655 // {
656 //   // Diverts the Digits in a file separate from the hits file
657   
658 //   // I guess it is not going to work if we do merging
659 // //   if (fManager) {
660 // //     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> Not yet available in case of merging activated " << endl ;  
661 // //     return ; 
662 // //   }
663
664 //   cout << "AliPHOSDigitizer::SetSplitFile " << gDirectory->GetName() << endl ;  
665 //   cout << "AliPHOSDigitizer::SetSplitFile " << gAlice->GetTreeDFileName() << endl ;  
666 //   cout << "AliPHOSDigitizer::SetSplitFile " <<  splitFileName.Data() << endl ;
667   
668 //   SetTitle(splitFileName) ; 
669
670 //   TDirectory * cwd = gDirectory ;
671 //   if ( !(gAlice->GetTreeDFileName() == splitFileName) ) {
672 //     if (gAlice->GetTreeDFile() )  
673 //       gAlice->GetTreeDFile()->Close() ; 
674 //   }
675
676 //   fSplitFile = gAlice->InitTreeFile("D",splitFileName.Data());
677 //   fSplitFile->cd() ; 
678 //   gAlice->Write(0, TObject::kOverwrite);
679
680 //   TTree *treeE  = gAlice->TreeE();
681 //   if (!treeE) {
682 //     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> No TreeE found "<<endl;
683 //     abort() ;
684 //   }      
685   
686 //   // copy TreeE
687 //   AliHeader *header = new AliHeader();
688 //   treeE->SetBranchAddress("Header", &header);
689 //   treeE->SetBranchStatus("*",1);
690 //   TTree *treeENew =  treeE->CloneTree();
691 //   treeENew->Write(0, TObject::kOverwrite);
692   
693 //   // copy AliceGeom
694 //   TGeometry *AliceGeom = static_cast<TGeometry*>(cwd->Get("AliceGeom"));
695 //   if (!AliceGeom) {
696 //     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> AliceGeom was not found in the input file "<<endl;
697 //     abort() ;
698 //     }
699 //   AliceGeom->Write(0, TObject::kOverwrite);
700   
701 //   gAlice->MakeTree("D",fSplitFile);
702 //   cwd->cd() ; 
703 //   cout << "INFO: AliPHOSDigitizer::SetSPlitMode -> Digits will be stored in " << splitFileName.Data() << endl ; 
704 // }
705
706 //__________________________________________________________________
707 void AliPHOSDigitizer::Print(Option_t* option)const {
708   // Print Digitizer's parameters
709   if( strcmp(GetName(), "") != 0 ){
710
711
712     cout << "------------------- "<< GetName() << " -------------" << endl ;
713
714     const Int_t nStreams = GetNInputStreams() ; 
715     if (nStreams) {
716       Int_t index = 0 ;  
717       for (index = 0 ; index < nStreams ; index++)  
718         cout << "Adding SDigits " << GetName() << " from " <<  fManager->GetInputFileName(index, 0) << endl ; 
719       
720       cout << endl ;
721       cout << "Writing digits to " <<   fManager->GetInputFileName(0, 0) << endl ;   
722     } else { 
723 //       AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;  
724 //       gime->Folder("sdigits")  ;
725 //       cout << "Digitizing sDigits from file(s): " <<endl ;
726 //       TCollection * folderslist = gime->Folder("sdigits")->GetListOfFolders() ; 
727 //       TIter next(folderslist) ; 
728 //       TFolder * folder = 0 ; 
729       
730 //       while ( (folder = (TFolder*)next()) ) {
731 //      if ( folder->FindObject(GetName())  ) 
732       //    cout << "Adding SDigits " << GetName() << " from " << GetSDigitsFileName() << endl ; 
733 //      }
734       cout << endl ;
735       cout << "Writing digits to " << GetTitle() << endl ;
736     }    
737     cout << endl ;
738     cout << "With following parameters: " << endl ;
739     cout << "     Electronics noise in EMC (fPinNoise) = " << fPinNoise << endl ;
740     cout << "  Threshold  in EMC  (fEMCDigitThreshold) = " << fEMCDigitThreshold  << endl ; ;
741     cout << "                 Noise in CPV (fCPVNoise) = " << fCPVNoise << endl ; 
742     cout << "    Threshold in CPV (fCPVDigitThreshold) = " << fCPVDigitThreshold << endl ; 
743     cout << "---------------------------------------------------" << endl ;
744   }
745   else
746     cout << "AliPHOSDigitizer not initialized " << endl ;
747   
748 }
749
750 //__________________________________________________________________
751 void AliPHOSDigitizer::PrintDigits(Option_t * option){
752   // Print a table of digits
753
754   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
755   TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
756
757   cout << "AliPHOSDigitiser: event " << gAlice->GetEvNumber() << endl ;
758   cout << "       Number of entries in Digits list " << digits->GetEntriesFast() << endl ;
759   cout << endl ;
760   if(strstr(option,"all")||strstr(option,"EMC")){
761     
762     //loop over digits
763     AliPHOSDigit * digit;
764     cout << "EMC digits (with primaries): " << endl ;
765     cout << "Digit Id     Amplitude   Index       Nprim  Primaries list " <<  endl;      
766     Int_t maxEmc = gime->PHOSGeometry()->GetNModules()*gime->PHOSGeometry()->GetNCristalsInModule() ;
767     Int_t index ;
768     for (index = 0 ; (index < digits->GetEntriesFast()) && 
769          (((AliPHOSDigit * )  digits->At(index))->GetId() <= maxEmc) ; index++) {
770       digit = (AliPHOSDigit * )  digits->At(index) ;
771       if(digit->GetNprimary() == 0) continue;
772       cout << setw(6)  <<  digit->GetId() << "   "  <<  setw(10)  <<  digit->GetAmp() <<   "    "  
773            << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "    "   
774            << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"    ";
775       
776       Int_t iprimary;
777       for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
778         cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << "    ";
779       cout << endl;      
780     }    
781     cout << endl;
782   }
783
784   if(strstr(option,"all")||strstr(option,"CPV")){
785     
786     //loop over CPV digits
787     AliPHOSDigit * digit;
788     cout << "CPV digits: " << endl ;
789     cout << "Digit Id     Amplitude   Index       Nprim  Primaries list " <<  endl;      
790     Int_t maxEmc = gime->PHOSGeometry()->GetNModules()*gime->PHOSGeometry()->GetNCristalsInModule() ;
791     Int_t index ;
792     for (index = 0 ; index < digits->GetEntriesFast(); index++) {
793       digit = (AliPHOSDigit * )  digits->At(index) ;
794       if(digit->GetId() > maxEmc){
795         cout << setw(6)  <<  digit->GetId() << "   "  <<        setw(10)  <<  digit->GetAmp() <<   "    "  
796              << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "    "   
797              << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"    ";
798         
799         Int_t iprimary;
800         for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
801           cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << "    ";
802         cout << endl;    
803       }    
804     }
805   }
806
807 }
808
809 // //__________________________________________________________________
810 // void AliPHOSDigitizer::SetSDigitsBranch(const char* title)
811 // {
812 //   // we set title (comment) of the SDigits branch in the first! header file
813 //   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
814 //     Init() ;
815
816 //   AliPHOSGetter::GetInstance()->SDigits()->SetName(title) ; 
817  
818 // }
819 //__________________________________________________________________
820 Float_t AliPHOSDigitizer::TimeOfNoise(void)
821 {  // Calculates the time signal generated by noise
822   //to be rewritten, now returns just big number
823   return 1. ;
824
825 }
826 // //____________________________________________________________________________
827 // void AliPHOSDigitizer::Reset() 
828 // { 
829 //   // sets current event number to the first simulated event
830
831 //   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
832 //     Init() ;
833
834 //  //  Int_t inputs ;
835 // //   for(inputs = 0; inputs < fNinputs ;inputs++)
836 // //       fIevent->AddAt(-1, inputs ) ;
837   
838 // }
839
840 //____________________________________________________________________________
841 void AliPHOSDigitizer::WriteDigits(Int_t event)
842 {
843
844   // Makes TreeD in the output file. 
845   // Check if branch already exists: 
846   //   if yes, exit without writing: ROOT TTree does not support overwriting/updating of 
847   //      already existing branches. 
848   //   else creates branch with Digits, named "PHOS", title "...",
849   //      and branch "AliPHOSDigitizer", with the same title to keep all the parameters
850   //      and names of files, from which digits are made.
851
852   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
853   const TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ; 
854   TTree * treeD ;
855   
856   if(fManager) 
857     treeD = fManager->GetTreeD() ;
858   else {
859     if((gAlice->TreeD() == 0) || (fSplitFile))  // we should not create TreeD if it is already here
860       gAlice->MakeTree("D", fSplitFile);       // We overwrite TreeD in split file in the case of second reconstruction
861     if(fSplitFile)
862       fSplitFile->cd() ;
863     treeD = gAlice->TreeD();
864   }
865   
866   // -- create Digits branch
867   Int_t bufferSize = 32000 ;    
868   TBranch * digitsBranch = treeD->Branch("PHOS",&digits,bufferSize);
869   digitsBranch->SetTitle(GetName());
870   
871   // -- Create Digitizer branch
872   Int_t splitlevel = 0 ;
873   const AliPHOSDigitizer * d = gime->Digitizer(GetName()) ;
874   TBranch * digitizerBranch = treeD->Branch("AliPHOSDigitizer", "AliPHOSDigitizer", &d,bufferSize,splitlevel); 
875   digitizerBranch->SetTitle(GetName());
876
877   digitsBranch->Fill() ;
878   digitizerBranch->Fill() ; 
879   treeD->AutoSave() ; 
880 }