Memory leak in AliPHOSRawFitterv0 is fixed.
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSRawDigiProducer.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 2007, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.      *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
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8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 //This class produces PHOS digits of one event
19 //using AliPHOSRawFitter. 
20 //
21 //   For example:
22 //   TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",100);
23 //   AliRawReader* rawReader = new AliRawReaderDate("2006run2211.raw");
24 //   AliPHOSRawDecoder dc(rawReader);
25 //   while (rawReader->NextEvent()) {
26 //     AliPHOSRawDigiProducer producer;
27 //     producer.MakeDigits(digits,&dc);
28 //   }
29
30 // Author: Boris Polichtchouk
31
32 // --- ROOT system ---
33 #include "TClonesArray.h"
34
35 // --- AliRoot header files ---
36 #include "AliPHOSRawDigiProducer.h"
37 #include "AliPHOSRawFitterv0.h"
38 #include "AliPHOSGeometry.h"
39 #include "AliPHOSDigit.h"
40 #include "AliPHOSCalibData.h"
41 #include "AliPHOSPulseGenerator.h"
42 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
43 #include "AliLog.h"
44
45 ClassImp(AliPHOSRawDigiProducer)
46
47 AliPHOSCalibData * AliPHOSRawDigiProducer::fgCalibData  = 0 ; 
48
49 //--------------------------------------------------------------------------------------
50 AliPHOSRawDigiProducer::AliPHOSRawDigiProducer():
51   TObject(),
52   fEmcMinE(0.),
53   fCpvMinE(0.),
54   fSampleQualityCut(1.),
55   fEmcCrystals(0),
56   fGeom(0),
57   fPulseGenerator(0),
58   fRawReader(0),
59   fRawStream(0)
60 {
61   // Default constructor
62
63   fGeom=AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
64   if(!fGeom) fGeom = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP");
65
66   fEmcCrystals=fGeom->GetNCristalsInModule()*fGeom->GetNModules() ;
67   fPulseGenerator = new AliPHOSPulseGenerator();
68   GetCalibrationParameters() ; 
69
70 }
71 //--------------------------------------------------------------------------------------
72 AliPHOSRawDigiProducer::AliPHOSRawDigiProducer(AliRawReader *rawReader,
73                                                AliAltroMapping **mapping):
74   TObject(),
75   fEmcMinE(0.),
76   fCpvMinE(0.),
77   fSampleQualityCut(1.),
78   fEmcCrystals(0),
79   fGeom(0),
80   fPulseGenerator(0),
81   fRawReader(rawReader),
82   fRawStream(0)
83 {
84   // Default constructor
85
86   fGeom=AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
87   if(!fGeom) fGeom = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP");
88
89   fEmcCrystals=fGeom->GetNCristalsInModule()*fGeom->GetNModules() ;
90   fPulseGenerator = new AliPHOSPulseGenerator();
91   GetCalibrationParameters() ; 
92
93   fRawStream = new AliCaloRawStreamV3(rawReader,"PHOS",mapping);
94
95 }
96 //--------------------------------------------------------------------------------------
97 AliPHOSRawDigiProducer::AliPHOSRawDigiProducer(const AliPHOSRawDigiProducer &dp):
98   TObject(),
99   fEmcMinE(0.),
100   fCpvMinE(0.),
101   fSampleQualityCut(1.),
102   fEmcCrystals(0),
103   fGeom(0),
104   fPulseGenerator(0),
105   fRawReader(0),
106   fRawStream(0)
107 {                                                          
108   // Copy constructor
109
110   fEmcMinE = dp.fEmcMinE ;
111   fCpvMinE = dp.fCpvMinE ;
112   fSampleQualityCut = dp.fSampleQualityCut;
113   fEmcCrystals = dp.fEmcCrystals ;
114   fPulseGenerator = new AliPHOSPulseGenerator();
115   fGeom = dp.fGeom ;
116 }
117 //--------------------------------------------------------------------------------------
118 AliPHOSRawDigiProducer& AliPHOSRawDigiProducer::operator= (const AliPHOSRawDigiProducer &dp)
119 {
120   // Assign operator
121
122   if(&dp == this) return *this;
123
124   fEmcMinE = dp.fEmcMinE ;
125   fCpvMinE = dp.fCpvMinE ;
126   fSampleQualityCut = dp.fSampleQualityCut ;
127   fEmcCrystals = dp.fEmcCrystals ;
128   fGeom = dp.fGeom ;
129   if(fPulseGenerator) delete fPulseGenerator ;
130   fPulseGenerator = new AliPHOSPulseGenerator();
131   return  *this;
132
133 //--------------------------------------------------------------------------------------
134 AliPHOSRawDigiProducer::~AliPHOSRawDigiProducer()
135 {
136   // Destructor
137   if(fPulseGenerator) delete fPulseGenerator ;
138   fPulseGenerator=0 ;
139   delete fRawStream;
140 }
141 //--------------------------------------------------------------------------------------
142 void AliPHOSRawDigiProducer::MakeDigits(TClonesArray *digits, AliPHOSRawFitterv0* fitter) 
143 {
144   //Makes the job.
145   //TClonesArray *digits and raw data fitter should be provided by calling function.
146
147   digits->Clear();
148  
149   Int_t iDigit=0 ;
150   Int_t relId[4], absId=-1, caloFlag=-1;
151
152   const Double_t baseLine=1. ; //Minimal energy of digit in ADC ch. 
153   const Double_t highLowDiff=2.; //Maximal difference between High and Low channels in LG adc channels 
154
155   //Temporary array for LowGain digits
156   TClonesArray tmpLG("AliPHOSDigit",10000) ;
157   Int_t ilgDigit=0 ;
158
159   //Let fitter subtract pedestals in case of ZS
160   fitter->SetCalibData(fgCalibData) ;
161   
162   while (fRawStream->NextDDL()) {
163     while (fRawStream->NextChannel()) {
164       relId[0] = fRawStream->GetModule() + 1; // counts from 1 to 5
165       relId[1] = 0;
166       relId[2] = fRawStream->GetCellX()  + 1; // counts from 1 to 64
167       relId[3] = fRawStream->GetCellZ()  + 1; // counts from 1 to 56
168       caloFlag = fRawStream->GetCaloFlag();   // 0=LG, 1=HG, 2=TRU
169       fGeom->RelToAbsNumbering(relId, absId);
170
171       Int_t nBunches = 0;
172       while (fRawStream->NextBunch()) {
173         nBunches++;
174         if (nBunches > 1) continue;
175         const UShort_t *sig = fRawStream->GetSignals();
176         Int_t sigStart  = fRawStream->GetStartTimeBin();
177         Int_t sigLength = fRawStream->GetBunchLength();
178         fitter->SetChannelGeo(relId[0],relId[2],relId[3],caloFlag);
179         fitter->Eval(sig,sigStart,sigLength);
180       } // End of NextBunch()
181
182       fitter->SetNBunches(nBunches);
183       
184       Double_t energy = fitter->GetEnergy() ; 
185       Double_t time   = fitter->GetTime() ;
186       if(energy<=baseLine) //in ADC channels
187         continue ;
188
189       //remove digits with bad shape. Fitter should calculate quality so that 
190       //in default case quality [0,1], while larger values of quality mean somehow 
191       //corrupted samples, 999 means obviously corrupted sample.
192       //It is difficult to fit samples with overflow (even setting cut on overflow values)
193       //because too few points are left to fit. So we do not evaluate samples with overflow
194
195       if(fitter->GetSignalQuality() > fSampleQualityCut && !(fitter->IsOverflow()))
196         continue ;
197       
198 //       energy = CalibrateE(energy,relId,lowGainFlag) ;
199 //       time   = CalibrateT(time,relId,lowGainFlag) ;
200       
201       if(energy <= 0.) 
202         continue;
203       
204       if (caloFlag == AliCaloRawStreamV3::kLowGain) {
205         new(tmpLG[ilgDigit]) AliPHOSDigit(-1,absId,(Float_t)energy,(Float_t)time);
206         ilgDigit++ ; 
207       }
208       else if (caloFlag == AliCaloRawStreamV3::kHighGain) {
209         if(fitter->IsOverflow()) //Keep this digit to replace it by Low Gain later.
210           //If there is no LogGain it wil be removed by cut on Min E
211           new((*digits)[iDigit]) AliPHOSDigit(-1,absId,-1.f,(Float_t)time);
212         else
213           new((*digits)[iDigit]) AliPHOSDigit(-1,absId,(Float_t)energy,(Float_t)time);
214         iDigit++;
215       }
216     } // End of NextChannel()
217
218     //Now scan created LG and HG digits and keep only those which appeared in both lists 
219     //replace energy of HighGain digits only if there is overflow
220     //negative energy (overflow)
221     digits->Sort() ;
222     tmpLG.Sort() ;
223     Int_t iLG = 0;
224     Int_t nLG1 = tmpLG.GetEntriesFast()-1 ;
225     
226     for(Int_t iDig=0 ; iDig < digits->GetEntriesFast() ; iDig++) { 
227       AliPHOSDigit * digHG = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(digits->At(iDig)) ;
228       if (!digHG) continue;
229       AliPHOSDigit * digLG = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(tmpLG.At(iLG)) ;
230       while(digLG && iLG<nLG1 && digHG->GetId()> digLG->GetId()){
231         iLG++ ;
232         digLG = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(tmpLG.At(iLG)) ;
233       }
234       absId=digHG->GetId() ;
235       fGeom->AbsToRelNumbering(absId,relId) ;
236  
237       if(digLG && digHG->GetId() == digLG->GetId()){ //we found pair
238         if(digHG->GetEnergy()<0.){ //This is overflow in HG
239           digHG->SetTime(digLG->GetTime()) ;
240           digHG->SetEnergy(digLG->GetEnergy()) ;
241         }
242         else{ //Make approximate comparison of HG and LG energies
243           Double_t de = (digHG->GetEnergy()-digLG->GetEnergy()) ; 
244           if(TMath::Abs(de)>CalibrateE(double(highLowDiff),relId,1)){ //too strong difference, remove digit
245             digits->RemoveAt(iDig) ;
246           }
247         }
248       }
249       else{ //no pair - remove
250         // temporary fix for dead LG channels
251         if(relId[2]%2==1 && relId[3]%16==4) 
252           continue ;
253         if(digHG->GetEnergy()>CalibrateE(double(5.),relId,1)) //One can not always find LG with Amp<5 ADC ch.
254           digits->RemoveAt(iDig) ;                                                                                                            
255       }
256     }
257   } // End of NextDDL()
258
259   CleanDigits(digits) ;
260   
261 }
262 //____________________________________________________________________________
263 Double_t AliPHOSRawDigiProducer::CalibrateE(Double_t amp, Int_t* relId, Bool_t isLowGain)
264 {
265   // Convert EMC LG amplitude to HG (multipli by ~16)
266   // Calibration parameters are taken from calibration data base 
267   if(fgCalibData){ 
268     Int_t   module = relId[0];  
269     Int_t   column = relId[3];
270     Int_t   row    = relId[2];
271     if(relId[1]==0) { // this is EMC 
272       if(isLowGain){
273         amp*= fgCalibData->GetHighLowRatioEmc(module,column,row);
274       }
275       return amp ;         
276     }         
277   }          
278   return 0;        
279 }
280 //____________________________________________________________________________
281 Double_t AliPHOSRawDigiProducer::CalibrateT(Double_t time, Int_t * relId, Bool_t /* isLowGain */)
282 {
283   //Calibrate time
284   time*=fPulseGenerator->GetRawFormatTimeTrigger() ;
285   if(fgCalibData){
286     Int_t   module = relId[0];
287     Int_t   column = relId[3];
288     Int_t   row    = relId[2];
289     if(relId[1]==0) { // this is EMC
290       time += fgCalibData->GetTimeShiftEmc(module,column,row);                   
291       return time ;             
292     }
293   }
294  
295   return -999.;
296 }
297 //____________________________________________________________________________
298 void AliPHOSRawDigiProducer::CleanDigits(TClonesArray * digits)
299 {
300   // remove digits with amplitudes below threshold.
301   // remove digits in bad channels
302   // sort digits with icreasing AbsId
303   
304   //remove digits in bad map and below threshold
305   Bool_t isBadMap = 0 ;
306   if(fgCalibData->GetNumOfEmcBadChannels()){
307     isBadMap=1 ;
308   }
309   
310   for(Int_t i=0; i<digits->GetEntriesFast(); i++){
311     AliPHOSDigit * digit = static_cast<AliPHOSDigit*>(digits->At(i)) ;
312     if(!digit)
313       continue  ;
314     if ( (IsInEMC(digit) && digit->GetEnergy() < fEmcMinE) ||
315          (IsInCPV(digit) && digit->GetEnergy() < fCpvMinE) ){
316       digits->RemoveAt(i) ;
317       continue ;
318     }
319     if(isBadMap){ //check bad map now
320       Int_t relid[4] ;
321       fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ; 
322       if(fgCalibData->IsBadChannelEmc(relid[0],relid[3],relid[2])){
323         digits->RemoveAt(i) ;
324       }
325     }
326   }
327
328   //Compress, sort and set indexes
329   digits->Compress() ;
330 //  digits->Sort(); already sorted earlier
331   for (Int_t i = 0 ; i < digits->GetEntriesFast() ; i++) { 
332     AliPHOSDigit *digit = static_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ; 
333     digit->SetIndexInList(i) ;     
334   }
335 }
336 //____________________________________________________________________________
337 Bool_t AliPHOSRawDigiProducer::IsInEMC(AliPHOSDigit * digit) const
338 {
339   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
340   return digit->GetId() <= fEmcCrystals ;
341
342 }
343
344 //____________________________________________________________________________
345 Bool_t AliPHOSRawDigiProducer::IsInCPV(AliPHOSDigit * digit) const
346 {
347   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
348   return digit->GetId() > fEmcCrystals ;
349 }
350 //____________________________________________________________________________
351 void AliPHOSRawDigiProducer::GetCalibrationParameters() 
352 {
353   // Set calibration parameters:
354   // if calibration database exists, they are read from database,
355   // otherwise, reconstruction stops in the constructor of AliPHOSCalibData
356   //
357   // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction, for example: 
358   // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
359
360   if (!fgCalibData){
361     fgCalibData = new AliPHOSCalibData(-1); //use AliCDBManager's run number
362   }
363   if (fgCalibData->GetCalibDataEmc() == 0)
364     AliFatal("Calibration parameters for PHOS EMC not found. Stop reconstruction.\n");
365   if (fgCalibData->GetCalibDataCpv() == 0)
366     AliFatal("Calibration parameters for PHOS CPV not found. Stop reconstruction.\n");
367 }