Included new data member to change patch size in calorimeters trigger (Gustavo)
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSTrigger.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15 /* $Id$ */
16 /* $Log $ */
17
18 //_________________________________________________________________________  
19 //  Class for trigger analysis.
20 //  Digits are grouped in TRU's (Trigger Units). A TRU consist of 16x28 
21 //  crystals ordered fNTRUPhi x fNTRUZ. The algorithm searches all possible 
22 //  2x2 and nxn (n multiple of 4) crystal combinations per each TRU, adding the 
23 //  digits amplitude and  finding the maximum. Maxima are transformed in ADC 
24 //  time samples. Each time bin is compared to the trigger threshold until it is larger 
25 //  and then, triggers are set. Thresholds need to be fixed. 
26 //  Usage:
27 //
28 //  //Inside the event loop
29 //  AliEMCALTrigger *tr = new AliEMCALTrigger();//Init Trigger
30 //  tr->SetL0Threshold(100);
31 //  tr->SetL1JetLowPtThreshold(1000);
32 //  tr->SetL1JetHighPtThreshold(20000);
33 //  tr->Trigger(); //Execute Trigger
34 //  tr->Print(""); //Print result, with "deb" option all data members 
35 //  //are printed
36 //
37 //*-- Author: Gustavo Conesa & Yves Schutz (IFIC, CERN) 
38 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
39
40
41 // --- ROOT system ---
42 //#include "TMatrixD.h"
43
44 // --- ALIROOT system ---
45 #include "AliPHOS.h"
46 #include "AliPHOSTrigger.h" 
47 #include "AliPHOSGeometry.h"
48 #include "AliPHOSGetter.h" 
49 #include "AliTriggerInput.h"
50 //#include "AliLog.h"
51
52 ClassImp(AliPHOSTrigger)
53
54 //______________________________________________________________________
55 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger()
56   : AliTriggerDetector(),
57     f2x2MaxAmp(-1), f2x2CrystalPhi(-1),  f2x2CrystalEta(-1), f2x2SM(0),
58     fnxnMaxAmp(-1), fnxnCrystalPhi(-1),  fnxnCrystalEta(-1), fnxnSM(0),
59     fADCValuesHighnxn(0), fADCValuesLownxn(0),
60     fADCValuesHigh2x2(0), fADCValuesLow2x2(0), fDigitsList(0),
61     fL0Threshold(50), fL1JetLowPtThreshold(200), fL1JetHighPtThreshold(500),
62     fNTRU(8), fNTRUZ(2), fNTRUPhi(4),  fPatchSize(1), fSimulation(kTRUE)
63 {
64   //ctor
65   fADCValuesHighnxn = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
66   fADCValuesLownxn  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
67   fADCValuesHigh2x2 = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
68   fADCValuesLow2x2  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
69
70   SetName("PHOS");
71   CreateInputs();
72   
73   //Print("") ; 
74 }
75
76 //____________________________________________________________________________
77 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger(const AliPHOSTrigger & trig) : 
78   AliTriggerDetector(trig),
79   f2x2MaxAmp(trig.f2x2MaxAmp),
80   f2x2CrystalPhi(trig.f2x2CrystalPhi),
81   f2x2CrystalEta(trig.f2x2CrystalEta),
82   f2x2SM(trig.f2x2SM),
83   fnxnMaxAmp(trig.fnxnMaxAmp),
84   fnxnCrystalPhi(trig.fnxnCrystalPhi),
85   fnxnCrystalEta(trig.fnxnCrystalEta),
86   fnxnSM(trig.fnxnSM),
87   fADCValuesHighnxn(trig.fADCValuesHighnxn),
88   fADCValuesLownxn(trig.fADCValuesLownxn),
89   fADCValuesHigh2x2(trig.fADCValuesHigh2x2),
90   fADCValuesLow2x2(trig.fADCValuesLow2x2),
91   fDigitsList(trig.fDigitsList),
92   fL0Threshold(trig.fL0Threshold),
93   fL1JetLowPtThreshold(trig.fL1JetLowPtThreshold),
94   fL1JetHighPtThreshold(trig.fL1JetHighPtThreshold),
95   fNTRU(trig.fNTRU),
96   fNTRUZ(trig.fNTRUZ),
97   fNTRUPhi(trig.fNTRUPhi),
98   fPatchSize(trig.fPatchSize), fSimulation(trig.fSimulation)
99 {
100   // cpy ctor
101 }
102
103 //_________________________________________________________________________
104 AliPHOSTrigger & AliPHOSTrigger::operator = (const AliPHOSTrigger &)
105 {
106   Fatal("operator =", "no implemented");
107   return *this;
108 }
109
110 void AliPHOSTrigger::CreateInputs()
111 {
112    // inputs 
113    
114    // Do not create inputs again!!
115    if( fInputs.GetEntriesFast() > 0 ) return;
116    
117    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_L0",       "PHOS L0", 0x02 ) );
118    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetHPt_L1","PHOS Jet High Pt L1", 0x04 ) );
119    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetLPt_L1","PHOS Jet Low Pt L1", 0x08 ) );
120  
121 }
122
123 //____________________________________________________________________________
124 void AliPHOSTrigger::FillTRU(const TClonesArray * digits, const AliPHOSGeometry * geom, TClonesArray * ampmatrix, TClonesArray * timeRmatrix) const {
125
126   //Orders digits ampitudes list and times in fNTRU TRUs (28x16 crystals) 
127   //per module. Each TRU is a TMatrixD, and they are kept in TClonesArrays. 
128   //In a module, the number of TRU in phi is fNTRUPhi, and the number of 
129   //TRU in eta is fNTRUZ. 
130
131   //Check data members
132   
133   if(fNTRUZ*fNTRUPhi != fNTRU)
134     Error("FillTRU"," Wrong number of TRUS per Z or Phi");
135
136   //Initilize and declare variables
137   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
138   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi ;// 64/4=16
139   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ ;// 56/2=28
140   Int_t relid[4] ; 
141   Float_t amp   = -1;
142   Float_t timeR = -1;
143   Int_t id      = -1;
144
145   //List of TRU matrices initialized to 0.
146   for(Int_t k = 0; k < fNTRU*nModules ; k++){
147     TMatrixD  * amptrus   = new TMatrixD(nCrystalsPhi,nCrystalsZ) ;
148     TMatrixD  * timeRtrus = new TMatrixD(nCrystalsPhi,nCrystalsZ) ;
149     for(Int_t i = 0; i < nCrystalsPhi; i++){
150       for(Int_t j = 0; j < nCrystalsZ; j++){
151         (*amptrus)(i,j)   = 0.0;
152         (*timeRtrus)(i,j) = 0.0;
153       }
154     }
155     new((*ampmatrix)[k])   TMatrixD(*amptrus) ;
156     new((*timeRmatrix)[k]) TMatrixD(*timeRtrus) ; 
157   }
158   
159   AliPHOSDigit * dig ;
160  
161   //Digits loop to fill TRU matrices with amplitudes.
162
163   for(Int_t idig = 0 ; idig < digits->GetEntriesFast() ; idig++){
164     
165     dig    = static_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(idig)) ;
166     amp    = dig->GetEnergy() ;   // Energy of the digit 
167     id     = dig->GetId() ;    // Id label of the cell
168     timeR  = dig->GetTimeR() ; // Earliest time of the digit
169     geom->AbsToRelNumbering(id, relid) ;
170     //Transform digit number into 4 numbers
171     //relid[0] = module
172     //relid[1] = EMC (0) or CPV (-1)
173     //relid[2] = row <= 64 (fNPhi)
174     //relid[3] = column <= 56 (fNZ)
175     
176     if(relid[1] == 0){//Not CPV, Only EMC digits
177      
178       //Check to which TRU in the supermodule belongs the crystal. 
179       //Supermodules are divided in a TRU matrix of dimension 
180       //(fNTRUPhi,fNTRUZ).
181       //Each TRU is a crystal matrix of dimension (nCrystalsPhi,nCrystalsZ)
182       
183       //First calculate the row and column in the supermodule 
184       //of the TRU to which the crystal belongs.
185       Int_t col   = (relid[3]-1)/nCrystalsZ+1; 
186       Int_t row   = (relid[2]-1)/nCrystalsPhi+1;
187  
188       //Calculate label number of the TRU  
189       Int_t itru  = (row-1) + (col-1)*fNTRUPhi + (relid[0]-1)*fNTRU ;
190
191       //Fill TRU matrix with crystal values
192       TMatrixD * amptrus   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrix->At(itru)) ;
193       TMatrixD * timeRtrus = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRmatrix->At(itru)) ;
194
195       //Calculate row and column of the crystal inside the TRU with number itru
196       Int_t irow = (relid[2]-1) - (row-1) *  nCrystalsPhi;      
197       Int_t icol = (relid[3]-1) - (col-1) *  nCrystalsZ;
198       
199       (*amptrus)(irow,icol)   = amp ;
200       (*timeRtrus)(irow,icol) = timeR ;
201     }
202   }
203 }
204
205 //______________________________________________________________________
206 void AliPHOSTrigger::GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(const Int_t itru,const Int_t iphitru,const Int_t ietatru,Int_t &iphiMod,Int_t &ietaMod,const AliPHOSGeometry* geom) const 
207 {
208   // This method transforms the (eta,phi) index of a crystals in a 
209   // TRU matrix into Super Module (eta,phi) index.
210   
211   // Calculate in which row and column in which the TRU are 
212   // ordered in the SM
213   Int_t col = itru/ fNTRUPhi + 1;
214   Int_t row = itru - (col-1)*fNTRUPhi + 1;
215   
216   //Calculate the (eta,phi) index in SM
217   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi;
218   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ;
219   
220   iphiMod = nCrystalsPhi*(row-1) + iphitru + 1 ;
221   ietaMod = nCrystalsZ*(col-1) + ietatru + 1 ;
222
223 }
224 //____________________________________________________________________________
225 void AliPHOSTrigger::MakeSlidingCell(const TClonesArray * amptrus, const TClonesArray * timeRtrus, const Int_t imod, TMatrixD *ampmax2, TMatrixD *ampmaxn, const AliPHOSGeometry *geom){
226   //Sums energy of all possible 2x2 (L0) and nxn (L1) crystals per each TRU. 
227   //Fast signal in the experiment is given by 2x2 crystals, 
228   //for this reason we loop inside the TRU crystals by 2. 
229  
230   //Declare and initialize varibles
231   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi ;// 64/4=16
232   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ ;// 56/2=28
233   Float_t amp2 = 0 ;
234   Float_t ampn = 0 ; 
235   for(Int_t i = 0; i < 4; i++){
236     for(Int_t j = 0; j < fNTRU; j++){
237       (*ampmax2)(i,j) = -1;
238       (*ampmaxn)(i,j) = -1;
239     }
240   }
241
242   //Create matrix that will contain 2x2 amplitude sums
243   //used to calculate the nxn sums
244   TMatrixD  * tru2x2 = new TMatrixD(nCrystalsPhi/2,nCrystalsZ/2) ;
245   for(Int_t i = 0; i < nCrystalsPhi/2; i++)
246     for(Int_t j = 0; j < nCrystalsZ/2; j++)
247       (*tru2x2)(i,j) = 0.0;
248     
249   //Loop over all TRUS in a module
250   for(Int_t itru = 0 + (imod - 1) * fNTRU ; itru < imod*fNTRU ; itru++){
251     TMatrixD * amptru   = dynamic_cast<TMatrixD *>(amptrus->At(itru)) ;
252     TMatrixD * timeRtru = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRtrus->At(itru)) ;
253     Int_t mtru = itru-(imod-1)*fNTRU ; //Number of TRU in Module
254     
255     //Sliding 2x2, add 2x2 amplitudes (NOT OVERLAP)
256     for(Int_t irow = 0 ; irow <  nCrystalsPhi; irow += 2){ 
257       for(Int_t icol = 0 ; icol < nCrystalsZ ; icol += 2){
258         amp2 = (*amptru)(irow,icol)+(*amptru)(irow+1,icol)+
259           (*amptru)(irow,icol+1)+(*amptru)(irow+1,icol+1);
260         
261         //Fill new matrix with added 2x2 crystals for use in nxn sums
262         (*tru2x2)(irow/2,icol/2) = amp2 ;
263         //Select 2x2 maximum sums to select L0 
264         if(amp2 > (*ampmax2)(0,mtru)){
265           (*ampmax2)(0,mtru) = amp2 ; 
266           (*ampmax2)(1,mtru) = irow;
267           (*ampmax2)(2,mtru) = icol;
268         }
269       }
270     }
271
272     //Find most recent time in the selected 2x2 cell
273     (*ampmax2)(3,mtru) = 1 ;
274     Int_t row2 =  static_cast <Int_t> ((*ampmax2)(1,mtru));
275     Int_t col2 =  static_cast <Int_t> ((*ampmax2)(2,mtru));
276     for(Int_t i = 0; i<2; i++){
277       for(Int_t j = 0; j<2; j++){
278         if((*amptru)(row2+i,col2+j) > 0 &&  (*timeRtru)(row2+i,col2+j)> 0){       
279           if((*timeRtru)(row2+i,col2+j) <  (*ampmax2)(3,mtru)  )
280             (*ampmax2)(3,mtru) =  (*timeRtru)(row2+i,col2+j);
281         }
282       }
283     }
284
285     //Sliding nxn, add nxn amplitudes (OVERLAP)
286     if(fPatchSize > 0){
287       for(Int_t irow = 0 ; irow <  nCrystalsPhi/2; irow++){ 
288         for(Int_t icol = 0 ; icol < nCrystalsZ/2 ; icol++){
289           ampn = 0;
290           if( (irow+fPatchSize) < nCrystalsPhi/2 && (icol+fPatchSize) < nCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
291             for(Int_t i = 0 ; i <= fPatchSize ; i++)
292               for(Int_t j = 0 ; j <= fPatchSize ; j++)
293                 ampn += (*tru2x2)(irow+i,icol+j);
294             //Select nxn maximum sums to select L1 
295             if(ampn > (*ampmaxn)(0,mtru)){
296               (*ampmaxn)(0,mtru) = ampn ; 
297               (*ampmaxn)(1,mtru) = irow*2;
298               (*ampmaxn)(2,mtru) = icol*2;
299             }
300           }
301         }
302       }
303       
304       //Find most recent time in selected nxn cell
305       (*ampmaxn)(3,mtru) = 1 ;
306       Int_t rown =  static_cast <Int_t> ((*ampmaxn)(1,mtru));
307       Int_t coln =  static_cast <Int_t> ((*ampmaxn)(2,mtru));
308       for(Int_t i = 0; i<4*fPatchSize; i++){
309         for(Int_t j = 0; j<4*fPatchSize; j++){
310           if( (rown+i) < nCrystalsPhi && (coln+j) < nCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
311             if((*amptru)(rown+i,coln+j) > 0 &&  (*timeRtru)(rown+i,coln+j)> 0){
312               if((*timeRtru)(rown+i,coln+j) <  (*ampmaxn)(3,mtru)  )
313                 (*ampmaxn)(3,mtru) =  (*timeRtru)(rown+i,coln+j);
314             }
315           }
316         }
317       }
318     }
319     else {  
320         (*ampmaxn)(0,mtru) =  (*ampmax2)(0,mtru); 
321         (*ampmaxn)(1,mtru) =  (*ampmax2)(1,mtru);
322         (*ampmaxn)(2,mtru) =  (*ampmax2)(2,mtru);
323         (*ampmaxn)(3,mtru) =  (*ampmax2)(3,mtru);
324       }
325   }
326 }
327 //____________________________________________________________________________
328 void AliPHOSTrigger::Print(const Option_t * opt) const 
329 {
330
331   //Prints main parameters
332  
333   if(! opt)
334     return;
335   AliTriggerInput* in = 0x0 ;
336
337   printf( "             Maximum Amplitude after Sliding Crystal, \n") ; 
338   printf( "               -2x2 crystals sum (not overlapped): %10.2f, in Super Module %d\n",
339           f2x2MaxAmp,f2x2SM) ; 
340   printf( "               -2x2 from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", f2x2CrystalPhi, f2x2CrystalPhi+2, f2x2CrystalEta, f2x2CrystalEta+2) ; 
341
342   if(fPatchSize > 0){
343     printf( "             Patch Size, n x n: %d x %d cells\n",4*fPatchSize, 4*fPatchSize);
344     printf( "               -nxn crystals sum (overlapped)    : %10.2f, in Super Module %d\n",
345             fnxnMaxAmp,fnxnSM) ; 
346     printf( "               -nxn from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", fnxnCrystalPhi, fnxnCrystalPhi+4, fnxnCrystalEta, fnxnCrystalEta+4) ; 
347   }
348   printf( "             Threshold for LO %10.1f\n", 
349           fL0Threshold) ;  
350   
351   printf( "             Threshold for LO %10.2f\n", fL0Threshold) ;  
352   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_L0" );
353   if(in->GetValue())
354     printf( "             *** PHOS LO is set ***\n") ; 
355   
356   printf( "             Jet Low Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetLowPtThreshold) ;
357   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_JetLPt_L1" );
358   if(in->GetValue())
359     printf( "             *** PHOS Jet Low Pt for L1 is set ***\n") ;
360   
361   printf( "             Jet High Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetHighPtThreshold) ;  
362   in = (AliTriggerInput*) fInputs.FindObject( "PHOS_JetHPt_L1" );
363   if(in->GetValue())
364     printf( "              *** PHOS Jet High Pt for L1 is set ***\n") ;
365  
366 }
367
368 //____________________________________________________________________________
369 void AliPHOSTrigger::SetTriggers(const Int_t iMod, const TMatrixD * ampmax2, const TMatrixD * ampmaxn, const AliPHOSGeometry *geom)  
370 {
371   //Checks the 2x2 and nxn maximum amplitude per each TRU and compares 
372   //with the different L0 and L1 triggers thresholds
373
374   //Initialize variables
375   Float_t max2[] = {-1,-1,-1,-1} ;
376   Float_t maxn[] = {-1,-1,-1,-1} ;
377   Int_t   itru2  = -1 ;
378   Int_t   itrun  = -1 ;
379
380
381   //Find maximum summed amplitude of all the TRU 
382   //in a Module
383   for(Int_t i = 0 ; i < fNTRU ; i++){
384     if(max2[0] < (*ampmax2)(0,i) ){
385       max2[0] =  (*ampmax2)(0,i) ; // 2x2 summed max amplitude
386       max2[1] =  (*ampmax2)(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
387       max2[2] =  (*ampmax2)(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
388       max2[3] =  (*ampmax2)(3,i) ; // corresponding most recent time
389       itru2   = i ; // TRU number
390     }
391     if(maxn[0] < (*ampmaxn)(0,i) ){
392       maxn[0] =  (*ampmaxn)(0,i) ; // nxn summed max amplitude
393       maxn[1] =  (*ampmaxn)(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
394       maxn[2] =  (*ampmaxn)(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
395       maxn[3] =  (*ampmaxn)(3,i) ; // corresponding most recent time
396       itrun   = i ; // TRU number
397     }
398   }
399   
400   //Set max amplitude if larger than in other Modules
401   Float_t maxtimeR2 = -1 ;
402   Float_t maxtimeRn = -1 ;
403   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
404   AliPHOS * phos  = gime->PHOS();
405   Int_t nTimeBins = phos->GetRawFormatTimeBins() ;
406  
407   //Set max 2x2 amplitude and select L0 trigger
408   if(max2[0] > f2x2MaxAmp ){
409     f2x2MaxAmp  = max2[0] ;
410     f2x2SM      = iMod ;
411     maxtimeR2   = max2[3] ;
412     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(itru2,static_cast<Int_t>(max2[1]),static_cast<Int_t>(max2[2]),f2x2CrystalPhi,f2x2CrystalEta,geom) ;
413     
414     //Transform digit amplitude in Raw Samples
415     fADCValuesLow2x2  = new Int_t[nTimeBins];
416     fADCValuesHigh2x2 = new Int_t[nTimeBins];
417     
418     phos->RawSampledResponse(maxtimeR2, f2x2MaxAmp, fADCValuesHigh2x2, fADCValuesLow2x2) ; 
419     
420     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
421     //Set L0
422     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
423       if(fADCValuesHigh2x2[i] >= fL0Threshold          || fADCValuesLow2x2[i] >= fL0Threshold){
424         SetInput("PHOS_L0") ;
425         break;
426       }
427     }
428 //     for(Int_t i = 0 ; i < 256 ; i++)
429 //       if(fADCValuesLow2x2[i]!=0||fADCValuesHigh2x2[i]!=0)
430 //      cout<< "2x2 Time Bin "<<i
431 //          <<"; 2x2 Low Gain  "<<fADCValuesLow2x2[i]
432 //          <<"; 2x2 High Gain "<<fADCValuesHigh2x2[i]<<endl;
433   }
434
435   //Set max nxn amplitude and select L1 triggers
436   if(maxn[0] > fnxnMaxAmp ){
437     fnxnMaxAmp  = maxn[0] ;
438     fnxnSM      = iMod ;
439     maxtimeRn   = maxn[3] ;
440     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(itrun,static_cast<Int_t>(maxn[1]),static_cast<Int_t>(maxn[2]),fnxnCrystalPhi,fnxnCrystalEta,geom) ; 
441     
442     //Transform digit amplitude in Raw Samples
443     fADCValuesHighnxn = new Int_t[nTimeBins];
444     fADCValuesLownxn  = new Int_t[nTimeBins];
445     phos->RawSampledResponse(maxtimeRn, fnxnMaxAmp, fADCValuesHighnxn, fADCValuesLownxn) ;
446     
447     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
448     //SetL1 Low
449     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
450       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold  || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold){
451         SetInput("PHOS_JetLPt_L1") ;
452         break; 
453       }
454     }
455     //SetL1 High
456     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
457       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold){
458         SetInput("PHOS_JetHPt_L1") ;
459         break;
460       }
461     }
462 //     for(Int_t i = 0 ; i < 256 ; i++)
463 //       if(fADCValuesLownxn[i]!=0||fADCValuesHighnxn[i]!=0)
464 //      cout<< "nxn Time Bin "<<i
465 //          <<"; nxn Low Gain  "<<fADCValuesLownxn[i]
466 //          <<"; nxn High Gain "<<fADCValuesHighnxn[i]<<endl;
467   }
468 }
469
470 //____________________________________________________________________________
471 void AliPHOSTrigger::Trigger() 
472 {
473
474   //Main Method to select triggers.
475   AliRunLoader *rl = gAlice->GetRunLoader();
476   //Getter
477   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance( rl->GetFileName() ) ;
478   //AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
479
480   //Get Geometry
481   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
482    
483   //Define parameters
484   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
485
486   //Intialize data members each time the trigger is called in event loop
487   f2x2MaxAmp = -1; f2x2CrystalPhi = -1;  f2x2CrystalEta = -1;
488   fnxnMaxAmp = -1; fnxnCrystalPhi = -1;  fnxnCrystalEta = -1;
489
490   //Take the digits list if simulation
491   if(fSimulation)
492     fDigitsList = gime->Digits() ;
493   
494   if(!fDigitsList)
495     AliFatal("Digits not found !") ;
496   
497   //Fill TRU Matrix  
498   TClonesArray * amptrus   = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
499   TClonesArray * timeRtrus = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
500   FillTRU(fDigitsList,geom,amptrus, timeRtrus) ;
501
502   //Do Crystal Sliding and select Trigger
503   //Initialize varible that will contain maximum amplitudes and 
504   //its corresponding cell position in eta and phi, and time.
505   TMatrixD  * ampmax2 = new TMatrixD(4,fNTRU) ;
506   TMatrixD  * ampmaxn = new TMatrixD(4,fNTRU) ;
507
508   for(Int_t imod = 1 ; imod <= nModules ; imod++) {
509     //Do 2x2 and nxn sums, select maximums. 
510     MakeSlidingCell(amptrus, timeRtrus, imod, ampmax2, ampmaxn, geom);
511     //Set the trigger
512     SetTriggers(imod,ampmax2,ampmaxn, geom) ;
513   }
514 }