PHOS/AliPHOSTrigger.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 /* $Log $ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //  Class for trigger analysis.
  20 //  Digits are grouped in TRU's (Trigger Units). A TRU consist of 16x28
  21 //  crystals ordered fNTRUPhi x fNTRUZ. The algorithm searches all possible
  22 //  2x2 and nxn (n multiple of 4) crystal combinations per each TRU, adding the
  23 //  digits amplitude and  finding the maximum. Maxima are transformed in ADC
  24 //  time samples. Each time bin is compared to the trigger threshold until it is larger
  25 //  and then, triggers are set. Thresholds need to be fixed.
  26 //  Usage:
  27 //
  28 //  //Inside the event loop
  29 //  AliEMCALTrigger *tr = new AliEMCALTrigger();//Init Trigger
  30 //  tr->SetL0Threshold(100);
  31 //  tr->SetL1JetLowPtThreshold(1000);
  32 //  tr->SetL1JetHighPtThreshold(20000);
  33 //  tr->Trigger(); //Execute Trigger
  34 //  tr->Print(""); //Print result, with "deb" option all data members
  35 //  //are printed
  36 //
  37 //*-- Author: Gustavo Conesa & Yves Schutz (IFIC, CERN)
  38 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  39
  40
  41 // --- ROOT system ---
  42 //#include "TMatrixD.h"
  43
  44 // --- ALIROOT system ---
  45 #include "AliPHOS.h"
  46 #include "AliPHOSTrigger.h"
  47 #include "AliPHOSGeometry.h"
  48 #include "AliPHOSGetter.h"
  49 #include "AliTriggerInput.h"
  50 //#include "AliLog.h"
  51
  52 ClassImp(AliPHOSTrigger)
  53
  54 //______________________________________________________________________
  55 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger()
  56   : AliTriggerDetector(),
  57     f2x2MaxAmp(-1), f2x2CrystalPhi(-1),  f2x2CrystalEta(-1), f2x2SM(0),
  58     fnxnMaxAmp(-1), fnxnCrystalPhi(-1),  fnxnCrystalEta(-1), fnxnSM(0),
  59     fADCValuesHighnxn(0), fADCValuesLownxn(0),
  60     fADCValuesHigh2x2(0), fADCValuesLow2x2(0), fDigitsList(0),
  61     fL0Threshold(50), fL1JetLowPtThreshold(200), fL1JetHighPtThreshold(500),
  62     fNTRU(8), fNTRUZ(2), fNTRUPhi(4),  fPatchSize(1), fSimulation(kTRUE)
  63 {
  64   //ctor
  65   fADCValuesHighnxn = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  66   fADCValuesLownxn  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  67   fADCValuesHigh2x2 = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  68   fADCValuesLow2x2  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  69
  70   SetName("PHOS");
  71   CreateInputs();
  72
  73   //Print("") ;
  74 }
  75
  76 //____________________________________________________________________________
  77 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger(const AliPHOSTrigger & trig) :
  78   AliTriggerDetector(trig),
  79   f2x2MaxAmp(trig.f2x2MaxAmp),
  80   f2x2CrystalPhi(trig.f2x2CrystalPhi),
  81   f2x2CrystalEta(trig.f2x2CrystalEta),
  82   f2x2SM(trig.f2x2SM),
  83   fnxnMaxAmp(trig.fnxnMaxAmp),
  84   fnxnCrystalPhi(trig.fnxnCrystalPhi),
  85   fnxnCrystalEta(trig.fnxnCrystalEta),
  86   fnxnSM(trig.fnxnSM),
  87   fADCValuesHighnxn(trig.fADCValuesHighnxn),
  88   fADCValuesLownxn(trig.fADCValuesLownxn),
  89   fADCValuesHigh2x2(trig.fADCValuesHigh2x2),
  90   fADCValuesLow2x2(trig.fADCValuesLow2x2),
  91   fDigitsList(trig.fDigitsList),
  92   fL0Threshold(trig.fL0Threshold),
  93   fL1JetLowPtThreshold(trig.fL1JetLowPtThreshold),
  94   fL1JetHighPtThreshold(trig.fL1JetHighPtThreshold),
  95   fNTRU(trig.fNTRU),
  96   fNTRUZ(trig.fNTRUZ),
  97   fNTRUPhi(trig.fNTRUPhi),
  98   fPatchSize(trig.fPatchSize), fSimulation(trig.fSimulation)
  99 {
 100   // cpy ctor
 101 }
 102
 103 //_________________________________________________________________________
 104 AliPHOSTrigger & AliPHOSTrigger::operator = (const AliPHOSTrigger &)
 105 {
 106   Fatal("operator =", "no implemented");
 107   return *this;
 108 }
 109
 110 void AliPHOSTrigger::CreateInputs()
 111 {
 112    // inputs
 113
 114    // Do not create inputs again!!
 115    if( fInputs.GetEntriesFast() > 0 ) return;
 116
 117    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_L0",       "PHOS L0", 0x02 ) );
 118    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetHPt_L1","PHOS Jet High Pt L1", 0x04 ) );
 119    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetLPt_L1","PHOS Jet Low Pt L1", 0x08 ) );
 120
 121 }
 122
 123 //____________________________________________________________________________
 124 void AliPHOSTrigger::FillTRU(const TClonesArray * digits, const AliPHOSGeometry * geom, TClonesArray * ampmatrix, TClonesArray * timeRmatrix) const {
 125
 126   //Orders digits ampitudes list and times in fNTRU TRUs (28x16 crystals)
 127   //per module. Each TRU is a TMatrixD, and they are kept in TClonesArrays.
 128   //In a module, the number of TRU in phi is fNTRUPhi, and the number of
 129   //TRU in eta is fNTRUZ.
 130
 131   //Check data members
 132
 133   if(fNTRUZ*fNTRUPhi != fNTRU)
 134     Error("FillTRU"," Wrong number of TRUS per Z or Phi");
 135
 136   //Initilize and declare variables
 137   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
 138   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi ;// 64/4=16
 139   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ ;// 56/2=28
 140   Int_t relid[4] ;
 141   Float_t amp   = -1;
 142   Float_t timeR = -1;
 143   Int_t id      = -1;
 144
 145   //List of TRU matrices initialized to 0.
 146   for(Int_t k = 0; k < fNTRU*nModules ; k++){
 147     TMatrixD  * amptrus   = new TMatrixD(nCrystalsPhi,nCrystalsZ) ;
 148     TMatrixD  * timeRtrus = new TMatrixD(nCrystalsPhi,nCrystalsZ) ;
 149     for(Int_t i = 0; i < nCrystalsPhi; i++){
 150       for(Int_t j = 0; j < nCrystalsZ; j++){
 151         (*amptrus)(i,j)   = 0.0;
 152         (*timeRtrus)(i,j) = 0.0;
 153       }
 154     }
 155     new((*ampmatrix)[k])   TMatrixD(*amptrus) ;
 156     new((*timeRmatrix)[k]) TMatrixD(*timeRtrus) ;
 157   }
 158
 159   AliPHOSDigit * dig ;
 160
 161   //Digits loop to fill TRU matrices with amplitudes.
 162
 163   for(Int_t idig = 0 ; idig < digits->GetEntriesFast() ; idig++){
 164
 165     dig    = static_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(idig)) ;
 166     amp    = dig->GetEnergy() ;   // Energy of the digit
 167     id     = dig->GetId() ;    // Id label of the cell
 168     timeR  = dig->GetTimeR() ; // Earliest time of the digit
 169     geom->AbsToRelNumbering(id, relid) ;
 170     //Transform digit number into 4 numbers
 171     //relid[0] = module
 172     //relid[1] = EMC (0) or CPV (-1)
 173     //relid[2] = row <= 64 (fNPhi)
 174     //relid[3] = column <= 56 (fNZ)
 175
 176     if(relid[1] == 0){//Not CPV, Only EMC digits
 177
 178       //Check to which TRU in the supermodule belongs the crystal.
 179       //Supermodules are divided in a TRU matrix of dimension
 180       //(fNTRUPhi,fNTRUZ).
 181       //Each TRU is a crystal matrix of dimension (nCrystalsPhi,nCrystalsZ)
 182
 183       //First calculate the row and column in the supermodule
 184       //of the TRU to which the crystal belongs.
 185       Int_t col   = (relid[3]-1)/nCrystalsZ+1;
 186       Int_t row   = (relid[2]-1)/nCrystalsPhi+1;
 187
 188       //Calculate label number of the TRU
 189       Int_t itru  = (row-1) + (col-1)*fNTRUPhi + (relid[0]-1)*fNTRU ;
 190
 191       //Fill TRU matrix with crystal values
 192       TMatrixD * amptrus   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrix->At(itru)) ;
 193       TMatrixD * timeRtrus = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRmatrix->At(itru)) ;
 194
 195       //Calculate row and column of the crystal inside the TRU with number itru
 196       Int_t irow = (relid[2]-1) - (row-1) *  nCrystalsPhi;
 197       Int_t icol = (relid[3]-1) - (col-1) *  nCrystalsZ;
 198
 199       (*amptrus)(irow,icol)   = amp ;
 200       (*timeRtrus)(irow,icol) = timeR ;
 201     }
 202   }
 203 }
 204
 205 //______________________________________________________________________
 206 void AliPHOSTrigger::GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(const Int_t itru,const Int_t iphitru,const Int_t ietatru,Int_t &iphiMod,Int_t &ietaMod,const AliPHOSGeometry* geom) const
 207 {
 208   // This method transforms the (eta,phi) index of a crystals in a
 209   // TRU matrix into Super Module (eta,phi) index.
 210
 211   // Calculate in which row and column in which the TRU are
 212   // ordered in the SM
 213   Int_t col = itru/ fNTRUPhi + 1;
 214   Int_t row = itru - (col-1)*fNTRUPhi + 1;
 215
 216   //Calculate the (eta,phi) index in SM
 217   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi;
 218   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ;
 219
 220   iphiMod = nCrystalsPhi*(row-1) + iphitru + 1 ;
 221   ietaMod = nCrystalsZ*(col-1) + ietatru + 1 ;
 222
 223 }
 224 //____________________________________________________________________________
 225 void AliPHOSTrigger::MakeSlidingCell(const TClonesArray * amptrus, const TClonesArray * timeRtrus, const Int_t imod, TMatrixD *ampmax2, TMatrixD *ampmaxn, const AliPHOSGeometry *geom){
 226   //Sums energy of all possible 2x2 (L0) and nxn (L1) crystals per each TRU.
 227   //Fast signal in the experiment is given by 2x2 crystals,
 228   //for this reason we loop inside the TRU crystals by 2.
 229
 230   //Declare and initialize varibles
 231   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi ;// 64/4=16
 232   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ ;// 56/2=28
 233   Float_t amp2 = 0 ;
 234   Float_t ampn = 0 ;
 235   for(Int_t i = 0; i < 4; i++){
 236     for(Int_t j = 0; j < fNTRU; j++){
 237       (*ampmax2)(i,j) = -1;
 238       (*ampmaxn)(i,j) = -1;
 239     }
 240   }
 241
 242   //Create matrix that will contain 2x2 amplitude sums
 243   //used to calculate the nxn sums
 244   TMatrixD  * tru2x2 = new TMatrixD(nCrystalsPhi/2,nCrystalsZ/2) ;
 245   for(Int_t i = 0; i < nCrystalsPhi/2; i++)
 246     for(Int_t j = 0; j < nCrystalsZ/2; j++)
 247       (*tru2x2)(i,j) = 0.0;
 248
 249   //Loop over all TRUS in a module
 250   for(Int_t itru = 0 + (imod - 1) * fNTRU ; itru < imod*fNTRU ; itru++){
 251     TMatrixD * amptru   = dynamic_cast<TMatrixD *>(amptrus->At(itru)) ;
 252     TMatrixD * timeRtru = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRtrus->At(itru)) ;
 253     Int_t mtru = itru-(imod-1)*fNTRU ; //Number of TRU in Module
 254
 255     //Sliding 2x2, add 2x2 amplitudes (NOT OVERLAP)
 256     for(Int_t irow = 0 ; irow <  nCrystalsPhi; irow += 2){
 257       for(Int_t icol = 0 ; icol < nCrystalsZ ; icol += 2){
 258         amp2 = (*amptru)(irow,icol)+(*amptru)(irow+1,icol)+
 259           (*amptru)(irow,icol+1)+(*amptru)(irow+1,icol+1);
 260
 261         //Fill new matrix with added 2x2 crystals for use in nxn sums
 262         (*tru2x2)(irow/2,icol/2) = amp2 ;
 263         //Select 2x2 maximum sums to select L0
 264         if(amp2 > (*ampmax2)(0,mtru)){
 265           (*ampmax2)(0,mtru) = amp2 ;
 266           (*ampmax2)(1,mtru) = irow;
 267           (*ampmax2)(2,mtru) = icol;
 268         }
 269       }
 270     }
 271
 272     //Find most recent time in the selected 2x2 cell
 273     (*ampmax2)(3,mtru) = 1 ;
 274     Int_t row2 =  static_cast <Int_t> ((*ampmax2)(1,mtru));
 275     Int_t col2 =  static_cast <Int_t> ((*ampmax2)(2,mtru));
 276     for(Int_t i = 0; i<2; i++){
 277       for(Int_t j = 0; j<2; j++){
 278         if((*amptru)(row2+i,col2+j) > 0 &&  (*timeRtru)(row2+i,col2+j)> 0){
 279           if((*timeRtru)(row2+i,col2+j) <  (*ampmax2)(3,mtru)  )
 280             (*ampmax2)(3,mtru) =  (*timeRtru)(row2+i,col2+j);
 281         }
 282       }
 283     }
 284
 285     //Sliding nxn, add nxn amplitudes (OVERLAP)
 286     if(fPatchSize > 0){
 287       for(Int_t irow = 0 ; irow <  nCrystalsPhi/2; irow++){
 288         for(Int_t icol = 0 ; icol < nCrystalsZ/2 ; icol++){
 289           ampn = 0;
 290           if( (irow+fPatchSize) < nCrystalsPhi/2 && (icol+fPatchSize) < nCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
 291             for(Int_t i = 0 ; i <= fPatchSize ; i++)
 292               for(Int_t j = 0 ; j <= fPatchSize ; j++)
 293                 ampn += (*tru2x2)(irow+i,icol+j);
 294             //Select nxn maximum sums to select L1
 295             if(ampn > (*ampmaxn)(0,mtru)){
 296               (*ampmaxn)(0,mtru) = ampn ;
 297               (*ampmaxn)(1,mtru) = irow*2;
 298               (*ampmaxn)(2,mtru) = icol*2;
 299             }
 300           }
 301         }
 302       }
 303
 304       //Find most recent time in selected nxn cell
 305       (*ampmaxn)(3,mtru) = 1 ;
 306       Int_t rown =  static_cast <Int_t> ((*ampmaxn)(1,mtru));
 307       Int_t coln =  static_cast <Int_t> ((*ampmaxn)(2,mtru));
 308       for(Int_t i = 0; i<4*fPatchSize; i++){
 309         for(Int_t j = 0; j<4*fPatchSize; j++){
 310           if( (rown+i) < nCrystalsPhi && (coln+j) < nCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
 311             if((*amptru)(rown+i,coln+j) > 0 &&  (*timeRtru)(rown+i,coln+j)> 0){
 312               if((*timeRtru)(rown+i,coln+j) <  (*ampmaxn)(3,mtru)  )
 313                 (*ampmaxn)(3,mtru) =  (*timeRtru)(rown+i,coln+j);
 314             }
 315           }
 316         }
 317       }
 318     }
 319     else {
 320         (*ampmaxn)(0,mtru) =  (*ampmax2)(0,mtru);
 321         (*ampmaxn)(1,mtru) =  (*ampmax2)(1,mtru);
 322         (*ampmaxn)(2,mtru) =  (*ampmax2)(2,mtru);
 323         (*ampmaxn)(3,mtru) =  (*ampmax2)(3,mtru);
 324       }
 325   }
 326 }
 327 //____________________________________________________________________________
 328 void AliPHOSTrigger::Print(const Option_t * opt) const
 329 {
 330
 331   //Prints main parameters
 332
 333   if(! opt)
 334     return;
 335   AliTriggerInput* in = 0x0 ;
 336
 337   printf( "             Maximum Amplitude after Sliding Crystal, \n") ;
 338   printf( "               -2x2 crystals sum (not overlapped): %10.2f, in Super Module %d\n",
 339           f2x2MaxAmp,f2x2SM) ;
 340   printf( "               -2x2 from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", f2x2CrystalPhi, f2x2CrystalPhi+2, f2x2CrystalEta, f2x2CrystalEta+2) ;
 341
 342   if(fPatchSize > 0){
 343     printf( "             Patch Size, n x n: %d x %d cells\n",4*fPatchSize, 4*fPatchSize);
 344     printf( "               -nxn crystals sum (overlapped)    : %10.2f, in Super Module %d\n",
 345             fnxnMaxAmp,fnxnSM) ;
 346     printf( "               -nxn from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", fnxnCrystalPhi, fnxnCrystalPhi+4, fnxnCrystalEta, fnxnCrystalEta+4) ;
 347   }
 348   printf( "             Threshold for LO %10.1f\n",
 349           fL0Threshold) ;
 350
 351   printf( "             Threshold for LO %10.2f\n", fL0Threshold) ;
 352   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_L0" );
 353   if(in->GetValue())
 354     printf( "             *** PHOS LO is set ***\n") ;
 355
 356   printf( "             Jet Low Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetLowPtThreshold) ;
 357   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_JetLPt_L1" );
 358   if(in->GetValue())
 359     printf( "             *** PHOS Jet Low Pt for L1 is set ***\n") ;
 360
 361   printf( "             Jet High Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetHighPtThreshold) ;
 362   in = (AliTriggerInput*) fInputs.FindObject( "PHOS_JetHPt_L1" );
 363   if(in->GetValue())
 364     printf( "              *** PHOS Jet High Pt for L1 is set ***\n") ;
 365
 366 }
 367
 368 //____________________________________________________________________________
 369 void AliPHOSTrigger::SetTriggers(const Int_t iMod, const TMatrixD * ampmax2, const TMatrixD * ampmaxn, const AliPHOSGeometry *geom)
 370 {
 371   //Checks the 2x2 and nxn maximum amplitude per each TRU and compares
 372   //with the different L0 and L1 triggers thresholds
 373
 374   //Initialize variables
 375   Float_t max2[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 376   Float_t maxn[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 377   Int_t   itru2  = -1 ;
 378   Int_t   itrun  = -1 ;
 379
 380
 381   //Find maximum summed amplitude of all the TRU
 382   //in a Module
 383   for(Int_t i = 0 ; i < fNTRU ; i++){
 384     if(max2[0] < (*ampmax2)(0,i) ){
 385       max2[0] =  (*ampmax2)(0,i) ; // 2x2 summed max amplitude
 386       max2[1] =  (*ampmax2)(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 387       max2[2] =  (*ampmax2)(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 388       max2[3] =  (*ampmax2)(3,i) ; // corresponding most recent time
 389       itru2   = i ; // TRU number
 390     }
 391     if(maxn[0] < (*ampmaxn)(0,i) ){
 392       maxn[0] =  (*ampmaxn)(0,i) ; // nxn summed max amplitude
 393       maxn[1] =  (*ampmaxn)(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 394       maxn[2] =  (*ampmaxn)(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 395       maxn[3] =  (*ampmaxn)(3,i) ; // corresponding most recent time
 396       itrun   = i ; // TRU number
 397     }
 398   }
 399
 400   //Set max amplitude if larger than in other Modules
 401   Float_t maxtimeR2 = -1 ;
 402   Float_t maxtimeRn = -1 ;
 403   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 404   AliPHOS * phos  = gime->PHOS();
 405   Int_t nTimeBins = phos->GetRawFormatTimeBins() ;
 406
 407   //Set max 2x2 amplitude and select L0 trigger
 408   if(max2[0] > f2x2MaxAmp ){
 409     f2x2MaxAmp  = max2[0] ;
 410     f2x2SM      = iMod ;
 411     maxtimeR2   = max2[3] ;
 412     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(itru2,static_cast<Int_t>(max2[1]),static_cast<Int_t>(max2[2]),f2x2CrystalPhi,f2x2CrystalEta,geom) ;
 413
 414     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 415     fADCValuesLow2x2  = new Int_t[nTimeBins];
 416     fADCValuesHigh2x2 = new Int_t[nTimeBins];
 417
 418     phos->RawSampledResponse(maxtimeR2, f2x2MaxAmp, fADCValuesHigh2x2, fADCValuesLow2x2) ;
 419
 420     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 421     //Set L0
 422     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 423       if(fADCValuesHigh2x2[i] >= fL0Threshold          || fADCValuesLow2x2[i] >= fL0Threshold){
 424         SetInput("PHOS_L0") ;
 425         break;
 426       }
 427     }
 428 //     for(Int_t i = 0 ; i < 256 ; i++)
 429 //       if(fADCValuesLow2x2[i]!=0||fADCValuesHigh2x2[i]!=0)
 430 //      cout<< "2x2 Time Bin "<<i
 431 //          <<"; 2x2 Low Gain  "<<fADCValuesLow2x2[i]
 432 //          <<"; 2x2 High Gain "<<fADCValuesHigh2x2[i]<<endl;
 433   }
 434
 435   //Set max nxn amplitude and select L1 triggers
 436   if(maxn[0] > fnxnMaxAmp ){
 437     fnxnMaxAmp  = maxn[0] ;
 438     fnxnSM      = iMod ;
 439     maxtimeRn   = maxn[3] ;
 440     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(itrun,static_cast<Int_t>(maxn[1]),static_cast<Int_t>(maxn[2]),fnxnCrystalPhi,fnxnCrystalEta,geom) ;
 441
 442     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 443     fADCValuesHighnxn = new Int_t[nTimeBins];
 444     fADCValuesLownxn  = new Int_t[nTimeBins];
 445     phos->RawSampledResponse(maxtimeRn, fnxnMaxAmp, fADCValuesHighnxn, fADCValuesLownxn) ;
 446
 447     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 448     //SetL1 Low
 449     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 450       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold  || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold){
 451         SetInput("PHOS_JetLPt_L1") ;
 452         break;
 453       }
 454     }
 455     //SetL1 High
 456     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 457       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold){
 458         SetInput("PHOS_JetHPt_L1") ;
 459         break;
 460       }
 461     }
 462 //     for(Int_t i = 0 ; i < 256 ; i++)
 463 //       if(fADCValuesLownxn[i]!=0||fADCValuesHighnxn[i]!=0)
 464 //      cout<< "nxn Time Bin "<<i
 465 //          <<"; nxn Low Gain  "<<fADCValuesLownxn[i]
 466 //          <<"; nxn High Gain "<<fADCValuesHighnxn[i]<<endl;
 467   }
 468 }
 469
 470 //____________________________________________________________________________
 471 void AliPHOSTrigger::Trigger()
 472 {
 473
 474   //Main Method to select triggers.
 475   AliRunLoader *rl = gAlice->GetRunLoader();
 476   //Getter
 477   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance( rl->GetFileName() ) ;
 478   //AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 479
 480   //Get Geometry
 481   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 482
 483   //Define parameters
 484   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
 485
 486   //Intialize data members each time the trigger is called in event loop
 487   f2x2MaxAmp = -1; f2x2CrystalPhi = -1;  f2x2CrystalEta = -1;
 488   fnxnMaxAmp = -1; fnxnCrystalPhi = -1;  fnxnCrystalEta = -1;
 489
 490   //Take the digits list if simulation
 491   if(fSimulation)
 492     fDigitsList = gime->Digits() ;
 493
 494   if(!fDigitsList)
 495     AliFatal("Digits not found !") ;
 496
 497   //Fill TRU Matrix
 498   TClonesArray * amptrus   = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 499   TClonesArray * timeRtrus = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 500   FillTRU(fDigitsList,geom,amptrus, timeRtrus) ;
 501
 502   //Do Crystal Sliding and select Trigger
 503   //Initialize varible that will contain maximum amplitudes and
 504   //its corresponding cell position in eta and phi, and time.
 505   TMatrixD  * ampmax2 = new TMatrixD(4,fNTRU) ;
 506   TMatrixD  * ampmaxn = new TMatrixD(4,fNTRU) ;
 507
 508   for(Int_t imod = 1 ; imod <= nModules ; imod++) {
 509     //Do 2x2 and nxn sums, select maximums.
 510     MakeSlidingCell(amptrus, timeRtrus, imod, ampmax2, ampmaxn, geom);
 511     //Set the trigger
 512     SetTriggers(imod,ampmax2,ampmaxn, geom) ;
 513   }
 514 }