PWG2/SPECTRA/LambdaK0PbPb/run.C

   1 // #include <iostream>
   2 // #include "AliAnalysisManager.h"
   3 // #include "AliESDInputHandler.h"
   4 // #include "AliMCEventHandler.h"
   5 // #include "AliAnalysisGrid.h"
   6 // #include "AliCentralitySelectionTask.h"
   7 // #include "AliAnalysisCentralitySelector.h"
   8 // #include "AliAnalysisTaskPerformanceStrange.h"
   9 // #include "TString.h"
  10 // #include "TChain.h"
  11 // #include "TAlienCollection.h"
  12 // #include <fstream>
  13 // #include "TObjString.h"
  14 // #include "TIterator.h"
  15 // #include "TGrid.h"
  16 // #include "TROOT.h"
  17
  18 // #include "CreateAlienHandler.C"
  19 // #include
  20
  21 using namespace std;
  22
  23 enum { kMyRunModeLocal = 0, kMyRunModeCAF, kMyRunModeGRID};
  24
  25 TList * listToLoad = new TList(); // Additional classes to be loaded, see InitAndLoadLibs
  26
  27 TChain * GetAnalysisChain(const char * incollection);
  28 void InitAndLoadLibs(Int_t runMode=kMyRunModeLocal, Int_t workers=0,Bool_t debug=0) ;
  29
  30 void run(const char * data, const char * passOrPath, Long64_t nev = -1, Long64_t offset = 0, Bool_t debug = kFALSE, Int_t runMode = 0, Bool_t isMC = 0, Bool_t usePID = kTRUE, const char* option = "",TString customSuffix = "", Int_t workers = -1, const char * gridMode="full")
  31 {
  32   // runMode:
  33   //
  34   // 0 local
  35   // 1 proof
  36   // 2 grid
  37
  38   if (nev < 0)
  39     nev = 1234567890;
  40   InitAndLoadLibs(runMode,workers,debug);
  41
  42   // Create the analysis manager
  43   AliAnalysisManager * mgr = new AliAnalysisManager;
  44
  45   // Add ESD handler
  46   AliESDInputHandler* esdH = new AliESDInputHandler;
  47   // Do I need any of this?
  48   // esdH->SetInactiveBranches("AliESDACORDE FMD ALIESDTZERO ALIESDZDC AliRawDataErrorLogs CaloClusters Cascades EMCALCells EMCALTrigger ESDfriend Kinks AliESDTZERO ALIESDACORDE MuonTracks TrdTracks");
  49   mgr->SetInputEventHandler(esdH);
  50
  51   if(isMC) {
  52     AliMCEventHandler* handler = new AliMCEventHandler;
  53     handler->SetPreReadMode(AliMCEventHandler::kLmPreRead);
  54     mgr->SetMCtruthEventHandler(handler);
  55   }
  56
  57
  58   // If we are running on grid, we need the alien handler
  59   if (runMode == kMyRunModeGRID) {
  60     // Create and configure the alien handler plugin
  61     TGrid::Connect("alien://");// Why do I need this? Without a get a bus error...
  62     //    gROOT->LoadMacro("CreateAlienHandler.C");
  63     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(data, listToLoad, gridMode, isMC);
  64     if (!alienHandler) {
  65       cout << "Cannot create alien handler" << endl;
  66       exit(1);
  67     }
  68     mgr->SetGridHandler(alienHandler);
  69   }
  70
  71
  72   // Physics selection
  73   gROOT->ProcessLine(".L $ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
  74   AliPhysicsSelectionTask * physicsSelectionTask = AddTaskPhysicsSelection(isMC);
  75
  76   // Centrality
  77   gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskCentrality.C");
  78   AliCentralitySelectionTask *taskCentrality = AddTaskCentrality();
  79
  80   AliAnalysisCentralitySelector * centrSelector = new AliAnalysisCentralitySelector();
  81   centrSelector->SetIsMC(isMC);
  82   centrSelector->SetCentralityEstimator("V0M"); // Todo: add parameter to macro?
  83
  84   // Parse option strings
  85   TString optionStr(option);
  86
  87   // remove SAVE option if set
  88   Bool_t doSave = kFALSE;
  89
  90   if (optionStr.Contains("SAVE"))
  91     {
  92       optionStr = optionStr(0,optionStr.Index("SAVE")) + optionStr(optionStr.Index("SAVE")+4, optionStr.Length());
  93       doSave = kTRUE;
  94     }
  95   TString pathsuffix = "";
  96   // Not used, but may be useful
  97   Bool_t useMCKinematics = isMC;
  98   if (optionStr.Contains("NOMCKIN")) {
  99     cout << ">>>> Ignoring MC kinematics" << endl;
 100     useMCKinematics=kFALSE;
 101     pathsuffix+="_NOMCKIN";
 102   }
 103
 104   gROOT->ProcessLine(".L AddTaskLambdaK0PbPb.C");
 105   Int_t nbin = 0; // will contain the number of centrality bins
 106   AliAnalysisTaskPerformanceStrange ** task = AddTaskLambdaK0PbPb("lambdak0.root", centrSelector, nbin); // FIXME also pass cuts, centrality bin type selection(5,10% percentiles, ranges...)
 107   // configure task
 108   //  else if (iAODanalysis) task->SetAnalysisType("AOD");
 109   // FIXME: add options to macro
 110   // FIXME: put physics selection inside the task
 111   cout << nbin << endl;
 112
 113   for(Int_t ibin = 0; ibin < nbin; ibin++){
 114     cout << "ibin " << ibin << "  "<< endl;//task[ibin] << endl;
 115
 116     task[ibin]->SetAnalysisType("ESD");
 117     cout << "1" << endl;
 118     task[ibin]->SetAnalysisMC(isMC); // 0 or 1
 119     cout << "2" << endl;
 120     task[ibin]->SetCollidingSystems(1); // 0 =pp, 1=AA
 121     cout << "3" << endl;
 122     task[ibin]->SetAnalysisCut("no");
 123     cout << "4" << endl;
 124     if(usePID)
 125       task[ibin]->SetUsePID("withPID"); // withPID or withoutPID
 126     else
 127       task[ibin]->SetUsePID("withoutPID"); // withPID or withoutPID
 128     cout << "5" << endl;
 129   }
 130
 131   // Init and run the analy
 132   if (!mgr->InitAnalysis()) return;
 133
 134   mgr->PrintStatus();
 135
 136   if (runMode == kMyRunModeLocal ) {
 137     // If running in local mode, create chain of ESD files
 138     cout << "RUNNING LOCAL, CHAIN" << endl;
 139     TChain * chain = GetAnalysisChain(data);
 140     //    chain->Print();
 141     mgr->StartAnalysis("local",chain,nev);
 142   } else if (runMode == kMyRunModeCAF) {
 143     mgr->StartAnalysis("proof",TString(passOrPath)+TString(data)+"#esdTree",nev);
 144   } else if (runMode == kMyRunModeGRID) {
 145     mgr->StartAnalysis("grid");
 146   } else {
 147     cout << "ERROR: unknown run mode" << endl;
 148   }
 149
 150   pathsuffix += customSuffix;
 151
 152   if (doSave) MoveOutput(data, pathsuffix.Data());
 153
 154
 155 }
 156
 157 void MoveOutput(const char * data, const char * suffix = ""){
 158
 159   TString path("output/");
 160   path = path + TString(data).Tokenize("/")->Last()->GetName() + suffix;
 161
 162   TString fileName = "lambdak0.root";
 163   gSystem->mkdir(path, kTRUE);
 164   gSystem->Rename(fileName, path + "/" + fileName);
 165   for(Int_t ibin = 0; ibin < 20; ibin++){
 166     TString fileBin = fileName;
 167     fileBin.ReplaceAll(".root",Form("_%2.2d.root",ibin));
 168     gSystem->Rename(fileBin, path + "/" + fileBin);
 169   }
 170
 171   gSystem->Rename("event_stat.root", path + "/event_stat.root");
 172   gSystem->Rename("EventStat_temp.root", path + "/EventStat_temp.root");
 173   Printf(">>>>> Moved files to %s", path.Data());
 174 }
 175
 176
 177
 178 TChain * GetAnalysisChain(const char * incollection){
 179   // Builds a chain of esd files
 180   // incollection can be
 181   // - a single root file
 182   // - an xml collection of files on alien
 183   // - a ASCII containing a list of local root files
 184
 185   TChain* analysisChain = 0;
 186   // chain
 187   analysisChain = new TChain("esdTree");
 188   if (TString(incollection).Contains(".root")){
 189     analysisChain->Add(incollection);
 190   }
 191   else if (TString(incollection).Contains("xml")){
 192     TGrid::Connect("alien://");
 193     TGridCollection * coll = TAlienCollection::Open (incollection);
 194     while(coll->Next()){
 195       analysisChain->Add(TString("alien://")+coll->GetLFN());
 196     }
 197   } else {
 198     ifstream file_collect(incollection);
 199     TString line;
 200     while (line.ReadLine(file_collect) ) {
 201       analysisChain->Add(line.Data());
 202     }
 203   }
 204   analysisChain->GetListOfFiles()->Print();
 205
 206   return analysisChain;
 207 }
 208
 209
 210 void InitAndLoadLibs(Int_t runMode, Int_t workers,Bool_t debug) {
 211   // Loads libs and par files + custom task and classes (the order is important)
 212   listToLoad->Add(new TObjString("$ALICE_ROOT/STEER/AliCentrality.cxx")); // FIXME: why do I have to load it?!?
 213   listToLoad->Add(new TObjString("AliAnalysisCentralitySelector.cxx"));
 214   listToLoad->Add(new TObjString("AliAnalysisTaskPerformanceStrange.cxx"));
 215
 216   if (runMode == kMyRunModeCAF)
 217     {
 218       cout << "Init in CAF mode" << endl;
 219
 220       gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
 221       TProof * p = TProof::Open("alice-caf.cern.ch", workers>0 ? Form("workers=%d",workers) : "");
 222       //TProof * p = TProof::Open("skaf.saske.sk", workers>0 ? Form("workers=%d",workers) : "");
 223       p->Exec("TObject *o = gEnv->GetTable()->FindObject(\"Proof.UseMergers\"); gEnv->GetTable()->Remove(o);", kTRUE); // avoid submerging
 224       gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-13-AN");
 225
 226
 227       // Enable the needed package
 228       // FIXME: what if I don't want to use par files?
 229       gSystem->AddIncludePath("-I${ALICE_ROOT}/include/");
 230       gSystem->AddIncludePath("-I${ALICE_ROOT}/STEER/");
 231       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/STEERBase");
 232       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/STEERBase");
 233       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ESD");
 234       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ESD");
 235       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/AOD");
 236       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/AOD");
 237       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSIS");
 238       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSIS");
 239       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSISalice");
 240       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSISalice");
 241       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/CORRFW");
 242       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/CORRFW");
 243       // gProof->UploadPackage("~/Desktop/OADB");//FIXME
 244       // gProof->EnablePackage("~/Desktop/OADB");//FIXME
 245
 246     }
 247   else
 248     {
 249       cout << "Init in Local or Grid mode" << endl;
 250       gSystem->Load("libCore.so");
 251       gSystem->Load("libTree.so");
 252       gSystem->Load("libGeom.so");
 253       gSystem->Load("libVMC.so");
 254       gSystem->Load("libPhysics.so");
 255       gSystem->Load("libSTEERBase");
 256       gSystem->Load("libESD");
 257       gSystem->Load("libAOD");
 258       gSystem->Load("libANALYSIS");
 259       gSystem->Load("libANALYSISalice");
 260
 261       // gSystem->Load("libVMC");
 262       gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
 263       gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/STEER");
 264     }
 265   // Load helper classes
 266   TIterator * iter = listToLoad->MakeIterator();
 267   TObjString * name = 0;
 268   while ((name = (TObjString *)iter->Next())) {
 269     gSystem->ExpandPathName(name->String());
 270     cout << name->String().Data() << endl;
 271     if (runMode == kMyRunModeCAF) {
 272       gProof->Load(name->String()+(debug?"++g":"+"));
 273     } else {
 274       gROOT->LoadMacro(name->String()+(debug?"++g":"+"));
 275     }
 276   }
 277
 278 }