PWG3/vertexingHF/RunAnalysisAODVertexingHF.C

   1 class AliAnalysisGrid;\r
   2 \r
   3 void RunAnalysisAODVertexingHF()\r
   4 {\r
   5   //\r
   6   // Test macro for AliAnalysisTaskSE's for heavy-flavour candidates\r
   7   // It has the structure of a Analysis Train:\r
   8   // - in this macro, change things related to running mode\r
   9   //   and input preparation \r
  10   // - add your task using a AddTaskXXX macro \r
  11   //\r
  12   // A.Dainese, andrea.dainese@lnl.infn.it\r
  13   // "grid" mode added by R.Bala, bala@to.infn.it\r
  14   //\r
  15 \r
  16   gSystem->SetIncludePath("-I- -I$ROOTSYS/include -I$ALICE_ROOT -I$ALICE_ROOT/include -I$ALICE_ROOT/ITS -I$ALICE_ROOT/TPC -I$ALICE_ROOT/CONTAINERS -I$ALICE_ROOT/STEER -I$ALICE_ROOT/TRD -I$ALICE_ROOT/macros -I$ALICE_ROOT/ANALYSIS -I$ALICE_ROOT/PWG3 -I$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF -g"); \r
  17   //\r
  18   TString analysisMode = "grid"; // "local", "grid", or "proof"\r
  19   TString inputMode    = "list"; // "list", "xml", or "dataset"\r
  20   Long64_t nentries=1234567890,firstentry=0;\r
  21   Bool_t useParFiles=kFALSE;\r
  22   Bool_t useAlienPlugin=kTRUE;\r
  23   TString pluginmode="test";\r
  24   TString loadMacroPath="$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/";\r
  25   //TString loadMacroPath="./"; // this is normally needed for CAF\r
  26   //\r
  27 \r
  28   if(analysisMode=="grid") {\r
  29     // Connect to AliEn\r
  30     TGrid::Connect("alien://");\r
  31   } else if(analysisMode=="proof") {\r
  32     // Connect to the PROOF cluster\r
  33     if(inputMode!="dataset") {printf("Input mode must be dataset, for proof analysis\n"); return;}\r
  34     gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy","2");\r
  35     TProof::Open("alicecaf");\r
  36     //TProof::Reset("alicecaf");\r
  37   }\r
  38 \r
  39 \r
  40   // AliRoot libraries\r
  41   if(analysisMode=="local" || analysisMode=="grid") {\r
  42     TString loadLibraries="LoadLibraries.C"; loadLibraries.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
  43     gROOT->LoadMacro(loadLibraries.Data());\r
  44     LoadLibraries(useParFiles);\r
  45   } else if (analysisMode=="proof") {\r
  46     gSystem->Load("libTree.so");\r
  47     gSystem->Load("libGeom.so");\r
  48     gSystem->Load("libPhysics.so");\r
  49     gSystem->Load("libVMC.so");    \r
  50     // Enable the needed packages\r
  51     //gProof->ClearPackages();\r
  52     TString parDir="/afs/cern.ch/user/d/dainesea/code/";\r
  53     TString parFile;\r
  54     if(!useParFiles) {\r
  55       gProof->UploadPackage("AF-v4-17");\r
  56       gProof->EnablePackage("AF-v4-17");\r
  57       // --- Enable the PWG3vertexingHF Package\r
  58       parFile="PWG3vertexingHF.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  59       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  60       gProof->EnablePackage("PWG3vertexingHF");\r
  61     } else {\r
  62       // --- Enable the STEERBase Package\r
  63       parFile="STEERBase.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  64       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  65       gProof->EnablePackage("STEERBase");\r
  66       // --- Enable the ESD Package\r
  67       parFile="ESD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  68       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  69       gProof->EnablePackage("ESD");\r
  70       // --- Enable the AOD Package\r
  71       parFile="AOD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  72       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  73       gProof->EnablePackage("AOD");\r
  74       // --- Enable the ANALYSIS Package\r
  75       parFile="ANALYSIS.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  76       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  77       gProof->EnablePackage("ANALYSIS");\r
  78       // --- Enable the ANALYSISalice Package\r
  79       parFile="ANALYSISalice.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  80       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  81       gProof->EnablePackage("ANALYSISalice");\r
  82       // --- Enable the CORRFW Package\r
  83       parFile="CORRFW.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  84       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  85       gProof->EnablePackage("CORRFW");\r
  86       // --- Enable the PWG3base Package\r
  87       parFile="PWG3base.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  88       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  89       gProof->EnablePackage("PWG3base");\r
  90       // --- Enable the PWG3vertexingHF Package\r
  91       parFile="PWG3vertexingHF.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  92       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  93       gProof->EnablePackage("PWG3vertexingHF");\r
  94       // --- Enable the JETAN Package\r
  95       parFile="JETAN.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  96       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  97       gProof->EnablePackage("JETAN");\r
  98       // --- Enable the PWG3muon Package\r
  99       parFile="PWG3muon.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
 100       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
 101       gProof->EnablePackage("PWG3muon");\r
 102       // --- Enable the PWG4PartCorrBase Package\r
 103       parFile="PWG4PartCorrBase.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
 104       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
 105       gProof->EnablePackage("PWG4PartCorrBase");\r
 106       // --- Enable the PWG4PartCorrDep Package\r
 107       parFile="PWG4PartCorrDep.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
 108       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
 109       gProof->EnablePackage("PWG4PartCorrDep");\r
 110     }\r
 111     gProof->ShowEnabledPackages(); // show a list of enabled packages\r
 112   }\r
 113 \r
 114 \r
 115   // Create Alien plugin, if requested\r
 116   if(useAlienPlugin) {  \r
 117     if(analysisMode!="grid") {printf("Analysis mode must be grid, to use alien plugin\n"); return;}\r
 118     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(pluginmode,useParFiles);  \r
 119     if(!alienHandler) return;\r
 120   }\r
 121 \r
 122 \r
 123   //-------------------------------------------------------------------\r
 124   // Prepare input\r
 125   TChain *chainAOD = 0;\r
 126   TString dataset; // for proof\r
 127 \r
 128   if(!useAlienPlugin) {\r
 129     TString makeAODInputChain="MakeAODInputChain.C"; makeAODInputChain.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 130     if(inputMode=="list") {\r
 131       // Local files\r
 132       gROOT->LoadMacro(makeAODInputChain.Data());\r
 133       chainAOD = MakeAODInputChain();// with this it reads ./AliAOD.root and ./AliAOD.VertexingHF.root\r
 134       //chainAOD = MakeAODInputChain("alien:///alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/180100/",1,1);\r
 135     } else if(inputMode=="xml") {\r
 136       // xml\r
 137       gROOT->LoadMacro(makeAODInputChain.Data());\r
 138       chainAOD = MakeAODInputChain("collection_aod.xml","collection_aodHF.xml");\r
 139     } else if(inputMode=="dataset") {\r
 140       // CAF dataset\r
 141       //gProof->ShowDataSets();\r
 142       dataset="/ITS/dainesea/AODVertexingHF_LHC08x_180100";\r
 143     }\r
 144   }\r
 145 \r
 146   // Create the analysis manager\r
 147   AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("My Manager","My Manager");\r
 148   mgr->SetDebugLevel(10);\r
 149   // Connect plug-in to the analysis manager\r
 150   if(useAlienPlugin) mgr->SetGridHandler(alienHandler);\r
 151 \r
 152 \r
 153   // Input\r
 154   AliAODInputHandler *inputHandler = new AliAODInputHandler();\r
 155   if(analysisMode=="proof") inputHandler->AddFriend("AliAOD.VertexingHF.root");\r
 156   mgr->SetInputEventHandler(inputHandler);\r
 157   //-------------------------------------------------------------------\r
 158 \r
 159   \r
 160   //-------------------------------------------------------------------\r
 161   // Analysis tasks (wagons of the train)   \r
 162   //\r
 163   TString taskName;\r
 164 \r
 165   taskName="AddTaskCompareHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 166   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 167   AliAnalysisTaskSECompareHF *cmpTask = AddTaskCompareHF();\r
 168   \r
 169   taskName="AddTaskD0Mass.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 170   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 171   AliAnalysisTaskSED0Mass *d0massTask = AddTaskD0Mass();\r
 172 \r
 173   \r
 174   taskName="AddTaskDplus.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 175   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 176   AliAnalysisTaskSEDplus *dplusTask = AddTaskDplus();\r
 177   \r
 178   //taskName="AddTaskSelectHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 179   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 180   //AliAnalysisTaskSESelectHF *seleTask = AddTaskSelectHF();\r
 181 \r
 182   taskName="AddTaskBkgLikeSignD0.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 183   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 184   AliAnalysisTaskSEBkgLikeSignD0 *lsD0Task = AddTaskBkgLikeSignD0();\r
 185 \r
 186   taskName="AddTaskBkgLikeSignJPSI.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 187   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 188   AliAnalysisTaskSEBkgLikeSignJPSI *lsJPSITask = AddTaskBkgLikeSignJPSI();\r
 189 \r
 190   taskName="AddTaskBtoJPSItoEle.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 191   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 192   AliAnalysisTaskSEBtoJPSItoEle *jpsiTask = AddTaskBtoJPSItoEle();\r
 193 \r
 194   taskName="AddTaskCFMultiVarMultiStep.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 195   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 196   AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep *cfmvmsTask = AddTaskCFMultiVarMultiStep();\r
 197 \r
 198   taskName="AddTaskCharmFraction.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 199   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 200   // The task is added several times with different settings:\r
 201   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskSignal   = AddTaskCharmFraction("d0D0_Signal.root");\r
 202   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskNoMCSel  = AddTaskCharmFraction("d0D0NoMCSel.root",kFALSE,kTRUE,kFALSE);\r
 203   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskNoMCSel  = AddTaskCharmFraction("d0D0NoMCSel_SideBand.root",kTRUE,kTRUE,kFALSE);\r
 204   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskPureBack = AddTaskCharmFraction("d0D0_PureBack.root",kFALSE,kTRUE,kTRUE,kTRUE,kFALSE,kTRUE,kTRUE,kFALSE,kTRUE);\r
 205   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskFromB    = AddTaskCharmFraction("d0D0_FromB.root",kFALSE,kTRUE,kTRUE,kFALSE,kTRUE);\r
 206 \r
 207   // attach a private task (not committed)\r
 208   // (the files MyTask.h MyTask.cxx AddMyTask.C have to be declared in plugin\r
 209   // configuration, see below)\r
 210   /*\r
 211   if(analysisMode.Data()=="proof") {\r
 212     gProof->LoadMacro("MyTask.cxx++g");\r
 213   } else {\r
 214     gROOT->LoadMacro("MyTask.cxx++g");\r
 215   }\r
 216   gROOT->LoadMacro("AddMyTask.C");\r
 217   MyTask *myTask = AddMyTask();\r
 218   */\r
 219 \r
 220   //-------------------------------------------------------------------\r
 221 \r
 222   //\r
 223   // Run the analysis\r
 224   //    \r
 225   if(chainAOD) printf("CHAIN HAS %d ENTRIES\n",(Int_t)chainAOD->GetEntries());\r
 226 \r
 227   if(!mgr->InitAnalysis()) return;\r
 228   mgr->PrintStatus();\r
 229   if(analysisMode=="grid" && !useAlienPlugin) analysisMode="local";\r
 230   if(analysisMode!="proof") {\r
 231     mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),chainAOD,nentries,firstentry);\r
 232   } else {\r
 233     // proof\r
 234     mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),dataset.Data(),nentries,firstentry);\r
 235   }\r
 236 \r
 237   return;\r
 238 }\r
 239 //_____________________________________________________________________________\r
 240 //\r
 241 AliAnalysisGrid* CreateAlienHandler(TString pluginmode="test",Bool_t useParFiles=kFALSE)\r
 242 {\r
 243   // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.\r
 244   // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then\r
 245   //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.\r
 246    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;\r
 247    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();\r
 248    // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")\r
 249    plugin->SetRunMode(pluginmode.Data());\r
 250    plugin->SetUser("dainesea");\r
 251    plugin->SetNtestFiles(1);\r
 252    // Set versions of used packages\r
 253    plugin->SetAPIVersion("V2.4");\r
 254    plugin->SetROOTVersion("v5-24-00");\r
 255    plugin->SetAliROOTVersion("v4-18-01-AN");\r
 256    // Declare input data to be processed.\r
 257    // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.\r
 258    // Define production directory LFN\r
 259    //plugin->SetGridDataDir("/alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/");\r
 260    //plugin->SetGridDataDir("/alice/cern.ch/user/m/mgheata/analysisESD/output_train_default_28May2009_09h33/");\r
 261    plugin->SetGridDataDir("/alice/sim/PDC_09/LHC09a6/AOD/");\r
 262    // Set data search pattern\r
 263    plugin->SetDataPattern("AliAOD.root");\r
 264    plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");\r
 265    // ...then add run numbers to be considered\r
 266    //plugin->AddRunNumber(529007);\r
 267    //  or\r
 268    //plugin->SetRunRange(529000,529007);\r
 269    // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)\r
 270    // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())\r
 271    // XML collections added via this method can be combined with the first method if\r
 272    // the content is compatible (using or not tags)\r
 273    //plugin->AddDataFile("/alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/collection/collection_aod_lhc08w.xml");\r
 274    //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");\r
 275    // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.\r
 276    plugin->SetGridWorkingDir("work");\r
 277    // Declare alien output directory. Relative to working directory.\r
 278    plugin->SetGridOutputDir("output"); // In this case will be $HOME/work/output\r
 279    // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime\r
 280    // using ACLiC on the worker nodes.\r
 281    //plugin->SetAnalysisSource("MyTask.cxx");\r
 282    // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be\r
 283    // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.\r
 284    plugin->SetAdditionalLibs("libPWG3vertexingHF.so libPWG3base.so libPWG3muon.so libPWG4PartCorrBase.so libPWG4PartCorrDep.so MakeAODInputChain.C"/* MyTask.cxx MyTask.h" */);\r
 285    // use par files\r
 286    if(useParFiles) {\r
 287      plugin->EnablePackage("STEERBase.par");\r
 288      plugin->EnablePackage("ESD.par");\r
 289      plugin->EnablePackage("AOD.par");\r
 290      plugin->EnablePackage("ANALYSIS.par");\r
 291      plugin->EnablePackage("ANALYSISalice.par");\r
 292      plugin->EnablePackage("CORRFW.par");\r
 293      plugin->EnablePackage("PWG3base.par");\r
 294      plugin->EnablePackage("PWG3vertexingHF.par");\r
 295      plugin->EnablePackage("PWG3muon.par");\r
 296      plugin->EnablePackage("PWG4PartCorrBase.par");\r
 297      plugin->EnablePackage("PWG4PartCorrDep.par");\r
 298    }\r
 299    plugin->AddIncludePath("-I- -I$ROOTSYS/include -I$ALICE_ROOT -I$ALICE_ROOT/include -I$ALICE_ROOT/ITS -I$ALICE_ROOT/TPC -I$ALICE_ROOT/CONTAINERS -I$ALICE_ROOT/STEER -I$ALICE_ROOT/TRD -I$ALICE_ROOT/macros -I$ALICE_ROOT/ANALYSIS -I$ALICE_ROOT/PWG3 -I$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF -g");\r
 300    // Declare the output file names separated by blancs.\r
 301    // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)\r
 302    plugin->SetDefaultOutputs(kTRUE);\r
 303    //plugin->SetOutputFiles("output.root CmpHF.root CmpHFnt.root D0InvMass.root InvMassDplus.root InvMassDplus_nt1.root InvMassDplus_nt2.root");\r
 304    // Optionally define the files to be archived.\r
 305    //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:*.root@ALICE::NIHAM::File");\r
 306    plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr");\r
 307    // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)\r
 308    plugin->SetAnalysisMacro("AnalysisHF.C");\r
 309    // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)\r
 310    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(5);\r
 311    // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.\r
 312    //plugin->SetMaxInitFailed(5);\r
 313    // Optionally resubmit threshold.\r
 314    //plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);\r
 315    // Optionally set time to live (default 30000 sec)\r
 316    //plugin->SetTTL(20000);\r
 317    // Optionally set input format (default xml-single)\r
 318    plugin->SetInputFormat("xml-single");\r
 319    // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)\r
 320    plugin->SetJDLName("TaskHF.jdl");\r
 321    // Optionally modify job price (default 1)\r
 322    //plugin->SetPrice(1);      \r
 323    // Optionally modify split mode (default 'se')    \r
 324    plugin->SetSplitMode("se");\r
 325    // Optionally set the preferred SE    \r
 326    plugin->SetPreferedSE("ALICE::Torino::DPM");\r
 327    \r
 328    return plugin;\r
 329 }\r