PWG3/vertexingHF/RunAnalysisAODVertexingHF.C

   1 class AliAnalysisGrid;
   2 class AliAnalysisAlien;
   3
   4 void RunAnalysisAODVertexingHF()
   5 {
   6   //
   7   // Test macro for AliAnalysisTaskSE's for heavy-flavour candidates
   8   // It has the structure of a Analysis Train:
   9   // - in this macro, change things related to running mode
  10   //   and input preparation
  11   // - add your task using a AddTaskXXX macro
  12   //
  13   // A.Dainese, andrea.dainese@lnl.infn.it
  14   // "grid" mode added by R.Bala, bala@to.infn.it
  15   //
  16
  17
  18   gSystem->SetIncludePath("-I. -I$ROOTSYS/include -I$ALICE_ROOT -I$ALICE_ROOT/include -I$ALICE_ROOT/ITS -I$ALICE_ROOT/TPC -I$ALICE_ROOT/CONTAINERS -I$ALICE_ROOT/STEER -I$ALICE_ROOT/TRD -I$ALICE_ROOT/macros -I$ALICE_ROOT/ANALYSIS  -I$ALICE_ROOT/OADB -I$ALICE_ROOT/PWG3 -I$ALICE_ROOT/PWG3/base -I$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF -g");
  19   //
  20   TString trainName = "D2H";
  21   TString analysisMode = "grid"; // "local", "grid", or "proof"
  22   TString inputMode    = "list"; // "list", "xml", or "dataset"
  23   Long64_t nentries=123567890,firstentry=0;
  24   Bool_t useParFiles=kFALSE;
  25   Bool_t useAlienPlugin=kTRUE;
  26   TString pluginmode="full";
  27   Bool_t saveProofToAlien=kFALSE;
  28   TString proofOutdir = "";
  29   TString loadMacroPath="$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/macros/";
  30   //TString loadMacroPath="./"; // this is normally needed for CAF
  31   //
  32
  33   if(analysisMode=="grid") {
  34     // Connect to AliEn
  35     TGrid::Connect("alien://");
  36   } else if(analysisMode=="proof") {
  37     // Connect to the PROOF cluster
  38     if(inputMode!="dataset") {printf("Input mode must be dataset, for proof analysis\n"); return;}
  39     gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy","2");
  40     TProof::Open("alicecaf");
  41     //TProof::Reset("alicecaf");
  42     if(saveProofToAlien) {
  43       TGrid::Connect("alien://");
  44       if(gGrid) {
  45         TString homedir = gGrid->GetHomeDirectory();
  46         TString workdir = homedir + trainName;
  47         if(!gGrid->Cd(workdir)) {
  48           gGrid->Cd(homedir);
  49           if(gGrid->Mkdir(workdir)) {
  50             gGrid->Cd(trainName);
  51             ::Info("VertexingTrain::Connect()", "Directory %s created", gGrid->Pwd());
  52           }
  53         }
  54         gGrid->Mkdir("proof_output");
  55         gGrid->Cd("proof_output");
  56         proofOutdir = Form("alien://%s", gGrid->Pwd());
  57       }
  58     }
  59   }
  60
  61
  62   // AliRoot libraries
  63   if(analysisMode=="local" || analysisMode=="grid") {
  64     TString loadLibraries="LoadLibraries.C"; loadLibraries.Prepend(loadMacroPath.Data());
  65     gROOT->LoadMacro(loadLibraries.Data());
  66     LoadLibraries(useParFiles);
  67   } else if (analysisMode=="proof") {
  68     gSystem->Load("libTree.so");
  69     gSystem->Load("libGeom.so");
  70     gSystem->Load("libPhysics.so");
  71     gSystem->Load("libVMC.so");
  72     gSystem->Load("libMinuit.so");
  73     // Enable the needed packages
  74     //gProof->ClearPackages();
  75     TString parDir="/afs/cern.ch/user/d/dainesea/code/";
  76     TString parFile;
  77     if(!useParFiles) {
  78       gProof->UploadPackage("AF-v4-17");
  79       gProof->EnablePackage("AF-v4-17");
  80       // --- Enable the PWG3vertexingHF Package
  81       parFile="PWG3vertexingHF.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
  82       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
  83       gProof->EnablePackage("PWG3vertexingHF");
  84     } else {
  85       // --- Enable the STEERBase Package
  86       parFile="STEERBase.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
  87       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
  88       gProof->EnablePackage("STEERBase");
  89       // --- Enable the ESD Package
  90       parFile="ESD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
  91       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
  92       gProof->EnablePackage("ESD");
  93       // --- Enable the AOD Package
  94       parFile="AOD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
  95       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
  96       gProof->EnablePackage("AOD");
  97       // --- Enable the ANALYSIS Package
  98       parFile="ANALYSIS.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
  99       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
 100       gProof->EnablePackage("ANALYSIS");
 101       // --- Enable the ANALYSISalice Package
 102       parFile="ANALYSISalice.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
 103       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
 104       gProof->EnablePackage("ANALYSISalice");
 105       // --- Enable the CORRFW Package
 106       parFile="CORRFW.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
 107       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
 108       gProof->EnablePackage("CORRFW");
 109       // --- Enable the PWG3base Package
 110       parFile="PWG3base.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
 111       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
 112       gProof->EnablePackage("PWG3base");
 113       // --- Enable the PWG3vertexingHF Package
 114       parFile="PWG3vertexingHF.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
 115       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
 116       gProof->EnablePackage("PWG3vertexingHF");
 117       // --- Enable the PWG3muon Package
 118       parFile="PWG3muon.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());
 119       gProof->UploadPackage(parFile.Data());
 120       gProof->EnablePackage("PWG3muon");
 121     }
 122     gProof->ShowEnabledPackages(); // show a list of enabled packages
 123   }
 124
 125
 126   // Create Alien plugin, if requested
 127   if(useAlienPlugin) {
 128     if(analysisMode!="grid") {printf("Analysis mode must be grid, to use alien plugin\n"); return;}
 129     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(pluginmode,useParFiles);
 130     if(!alienHandler) return;
 131   }
 132
 133
 134   //-------------------------------------------------------------------
 135   // Prepare input
 136   TChain *chainAOD = 0;
 137   TString dataset; // for proof
 138
 139   if(!useAlienPlugin) {
 140     TString makeAODInputChain="../MakeAODInputChain.C"; makeAODInputChain.Prepend(loadMacroPath.Data());
 141     if(inputMode=="list") {
 142       // Local files
 143       gROOT->LoadMacro(makeAODInputChain.Data());
 144       chainAOD = MakeAODInputChain();// with this it reads ./AliAOD.root and ./AliAOD.VertexingHF.root
 145       //chainAOD = MakeAODInputChain("alien:///alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/180100/",1,1);
 146       printf("ENTRIES %d\n",chainAOD->GetEntries());
 147     } else if(inputMode=="xml") {
 148       // xml
 149       gROOT->LoadMacro(makeAODInputChain.Data());
 150       chainAOD = MakeAODInputChain("collection_aod.xml","collection_aodHF.xml");
 151     } else if(inputMode=="dataset") {
 152       // CAF dataset
 153       //gProof->ShowDataSets();
 154       dataset="/ITS/dainesea/AODVertexingHF_LHC08x_180100";
 155     }
 156   }
 157
 158   // Create the analysis manager
 159   AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("My Manager","My Manager");
 160   mgr->SetDebugLevel(10);
 161   // Connect plug-in to the analysis manager
 162   if(useAlienPlugin) mgr->SetGridHandler(alienHandler);
 163
 164   // Input
 165   AliAODInputHandler *inputHandler = new AliAODInputHandler();
 166   if(analysisMode=="proof" ) {
 167     inputHandler->AddFriend("./AliAOD.VertexingHF.root");
 168     //inputHandler->AddFriend("deltas/AliAOD.VertexingHF.root");
 169     if(saveProofToAlien) mgr->SetSpecialOutputLocation(proofOutdir);
 170   }
 171   mgr->SetInputEventHandler(inputHandler);
 172   //-------------------------------------------------------------------
 173
 174
 175   //-------------------------------------------------------------------
 176   // Analysis tasks (wagons of the train)
 177   //
 178   // First add the task for the PID response setting
 179   gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPIDResponse.C");
 180   AliAnalysisTaskSE *setupTask = AddTaskPIDResponse(kFALSE,kTRUE);
 181
 182   TString taskName;
 183
 184   ////// ADD THE FULL D2H TRAIN
 185   /*taskName="../AddD2HTrain.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 186   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 187   Bool_t readMC=kFALSE;
 188   AddD2HTrain(readMC);//,1,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0);*/
 189
 190   ////// OR ADD INDIVIDUAL TASKS
 191
 192
 193   /*  taskName="AddTaskCompareHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 194     gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 195     AliAnalysisTaskSECompareHF *cmpTask = AddTaskCompareHF();
 196   */
 197     taskName="AddTaskD0Mass.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 198     gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 199     AliAnalysisTaskSED0Mass *d0massTask = AddTaskD0Mass();
 200     AliAnalysisTaskSED0Mass *d0massLikeSignTask = AddTaskD0Mass(1);
 201     /*
 202     taskName="AddTaskDplus.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 203     gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 204     AliAnalysisTaskSEDplus *dplusTask = AddTaskDplus();
 205
 206     taskName="AddTaskDs.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 207     gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 208     AliAnalysisTaskSEDs *dsTask = AddTaskDs();
 209
 210     //taskName="AddTaskSelectHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 211     //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 212     //AliAnalysisTaskSESelectHF *seleTask = AddTaskSelectHF();
 213
 214     taskName="AddTaskBkgLikeSignD0.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 215     gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 216     AliAnalysisTaskSEBkgLikeSignD0 *lsD0Task = AddTaskBkgLikeSignD0();
 217
 218     taskName="AddTaskCFMultiVarMultiStep.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 219     gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 220     AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep *cfmvmsTask = AddTaskCFMultiVarMultiStep();
 221
 222
 223     taskName="AddTaskSECharmFraction.C";
 224     taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
 225     gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
 226     Int_t switchMC[5]={0,0,0,0,0};
 227     Int_t ppPbPb=1;// 0 for pp, 1 for PbPb, used to siwtch on/off the removal of daughters from the primary vertex
 228     AliAnalysisTaskSECharmFraction *cFractTask = AddTaskSECharmFraction("standard",switchMC,readMC,kTRUE,kFALSE,"D0toKpiCharmFractCuts.root","c",ppPbPb);
 229     // arguments: filename,switchMC,readmc,usepid,likesign,cutfilename,containerprefix
 230
 231
 232     // attach a private task (not committed)
 233     // (the files MyTask.h MyTask.cxx AddMyTask.C have to be declared in plugin
 234     // configuration, see below)
 235
 236     if(analysisMode.Data()=="proof") {
 237     gProof->LoadMacro("MyTask.cxx++g");
 238     } else {
 239     gROOT->LoadMacro("MyTask.cxx++g");
 240     }
 241     gROOT->LoadMacro("AddMyTask.C");
 242     MyTask *myTask = AddMyTask();
 243
 244
 245     if(analysisMode.Data()=="proof") {
 246     gProof->LoadMacro("AliDStarJets.cxx++g");
 247     } else {
 248     gROOT->LoadMacro("AliDStarJets.cxx++g");
 249     }
 250     gROOT->LoadMacro("AddTaskDStarJets.C");
 251     AliDStarJets *myTask = AddTaskDStarJets();
 252   */
 253   //-------------------------------------------------------------------
 254
 255   //
 256   // Run the analysis
 257   //
 258   if(chainAOD) printf("CHAIN HAS %d ENTRIES\n",(Int_t)chainAOD->GetEntries());
 259
 260   if(!mgr->InitAnalysis()) return;
 261   mgr->PrintStatus();
 262   if(analysisMode=="grid" && !useAlienPlugin) analysisMode="local";
 263   if(analysisMode!="proof") {
 264     mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),chainAOD,nentries,firstentry);
 265   } else {
 266     // proof
 267     mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),dataset.Data(),nentries,firstentry);
 268   }
 269
 270   return;
 271 }
 272 //_____________________________________________________________________________
 273 //
 274 AliAnalysisGrid* CreateAlienHandler(TString pluginmode="test",Bool_t useParFiles=kFALSE)
 275 {
 276   // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.
 277   // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then
 278   //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.
 279    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
 280    // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
 281    plugin->SetRunMode(pluginmode.Data());
 282    plugin->SetUser();
 283    // Set versions of used packages
 284    plugin->SetAPIVersion("V1.1x");
 285    plugin->SetROOTVersion();
 286    plugin->SetAliROOTVersion();
 287
 288    gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddGoodRuns.C");
 289
 290    // Declare input data to be processed.
 291    //************************************************
 292    // Set data search pattern for DATA
 293    //************************************************
 294    plugin->SetGridDataDir("/alice/data/2010/LHC10d"); // specify LHC period
 295    plugin->SetDataPattern("pass2/AOD018/*AliAOD.root"); // specify reco pass and AOD set
 296    plugin->SetFriendChainName("./AliAOD.VertexingHF.root");
 297    // OR plugin->SetFriendChainName("deltas/AliAOD.VertexingHF.root");
 298    // Adds only the good runs from the Monalisa Run Condition Table
 299    // More than one period can be added but the period name has to be removed from GridDataDir (to be tested)
 300    Int_t totruns=0;
 301    //totruns += AddGoodRuns(plugin,"LHC10b"); // specify LHC period
 302    //totruns += AddGoodRuns(plugin,"LHC10c"); // specify LHC period
 303    totruns += AddGoodRuns(plugin,"LHC10d"); // specify LHC period
 304    plugin->SetNrunsPerMaster(totruns);
 305
 306    //************************************************
 307    // Set data search pattern for MONTECARLO
 308    //************************************************
 309    /*
 310    plugin->SetGridDataDir("/alice/sim/LHC10d3"); // specify MC sample
 311    plugin->SetDataPattern("AOD005/*AliAOD.root"); // specify AOD set
 312    plugin->SetFriendChainName("./AliAOD.VertexingHF.root");
 313    // OR plugin->SetFriendChainName("deltas/AliAOD.VertexingHF.root");
 314    // Adds only the good runs from the Monalisa Run Condition Table
 315    // More than one period can be added!
 316    Int_t totruns=0;
 317    totruns += AddGoodRuns(plugin,"LHC10b","LHC10d3"); // specify LHC period for anchor runs; and the name of the MC production
 318    //totruns += AddGoodRuns(plugin,"LHC10c","LHC10f7"); // specify LHC period for anchor runs;  and the name of the MC production
 319    //totruns += AddGoodRuns(plugin,"LHC10d","LHC10f7"); // specify LHC period for anchor runs;  and the name of the MC production
 320    plugin->SetNrunsPerMaster(totruns);
 321    */
 322    //
 323    // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
 324    plugin->SetGridWorkingDir("myHFanalysis");
 325    // Declare alien output directory. Relative to working directory.
 326    plugin->SetGridOutputDir("output"); // In this case will be $HOME/work/output
 327    // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
 328    // using ACLiC on the worker nodes.
 329    //plugin->SetAnalysisSource("AliDStarJets.cxx");
 330    // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
 331    // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
 332    plugin->SetAdditionalLibs("libPWG3base.so libPWG3vertexingHF.so");
 333    // use par files
 334    if(useParFiles) {
 335      plugin->EnablePackage("STEERBase.par");
 336      plugin->EnablePackage("ESD.par");
 337      plugin->EnablePackage("AOD.par");
 338      plugin->EnablePackage("ANALYSIS.par");
 339      plugin->EnablePackage("OADB.par");
 340      plugin->EnablePackage("ANALYSISalice.par");
 341      plugin->EnablePackage("CORRFW.par");
 342      plugin->EnablePackage("PWG3base.par");
 343      plugin->EnablePackage("PWG3vertexingHF.par");
 344    }
 345    plugin->AddIncludePath("-I. -I$ROOTSYS/include -I$ALICE_ROOT -I$ALICE_ROOT/include -I$ALICE_ROOT/ITS -I$ALICE_ROOT/TPC -I$ALICE_ROOT/CONTAINERS -I$ALICE_ROOT/STEER -I$ALICE_ROOT/TRD -I$ALICE_ROOT/macros -I$ALICE_ROOT/ANALYSIS  -I$ALICE_ROOT/OADB -I$ALICE_ROOT/PWG3 -I$ALICE_ROOT/PWG3/base -I$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF -g");
 346
 347    plugin->SetDefaultOutputs(kTRUE);
 348    // merging via jdl
 349    plugin->SetMergeViaJDL(kTRUE);
 350    plugin->SetOneStageMerging(kFALSE);
 351    plugin->SetMaxMergeStages(2);
 352
 353    // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
 354    plugin->SetAnalysisMacro("AnalysisHF.C");
 355    // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
 356    // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
 357    plugin->SetJDLName("TaskHF.jdl");
 358
 359    return plugin;
 360 }