.so cleanup: removed from gSystem->Load()
[u/mrichter/AliRoot.git] / PWGCF / EBYE / macros / runBalanceFunctionPID.C
1 // run.C
2 //
3 // Template run macro for AliBasicTask.cxx/.h with example layout of
4 // physics selections and options, in macro and task.
5 //
6 // Author: Arvinder Palaha
7 //
8 class AliAnalysisGrid;
9 class AliAnalysisTaskBF;
10 class AliBalance;
11
12 //Centrality stuff
13 Int_t binfirst = 0;  //where do we start numbering bins
14 Int_t binlast = 8;  //where do we stop numbering bins
15 const Int_t numberOfCentralityBins = 9;
16 Float_t centralityArray[numberOfCentralityBins+1] = {0.,5.,10.,20.,30.,40.,50.,60.,70.,80.}; // in centrality percentile
17
18 //Systematic studies
19 const Int_t numberOfSyst = 13;
20 Float_t vZ[numberOfSyst]     = {10.,12.,6.,8.,10.,10.,10.,10.,10.,10.,10.,10.,10.};     // global Vertex Z cut
21 Float_t DCAxy[numberOfSyst]  = {-1.,2.4,2.4,2.4,2.2,2.0,1.8,2.4,2.4,2.4,2.4,2.4,2.4};   // DCA xy cut (afterburner, -1 = w/o additional cut)
22 Float_t DCAz[numberOfSyst]   = {-1.,3.2,3.2,3.2,3.0,2.8,2.6,3.2,3.2,3.2,3.2,3.2,3.2};   // DCA z cut (afterburner, -1 = w/o additional cut)
23 Float_t ptMin[numberOfSyst]  = {0.3,0.3,0.3,0.3,0.3,0.3,0.3,1.5,5.0,0.3,0.3,0.3,0.3};   // pt cuts
24 Float_t ptMax[numberOfSyst]  = {1.5,1.5,1.5,1.5,1.5,1.5,1.5,5.0,10.0,10.0,1.5,1.5,1.5}; // pt cuts
25 Float_t etaMin[numberOfSyst] = {-0.8,-0.8,-0.8,-0.8,-0.8,-0.8,-0.8,-0.8,-0.8,-0.8,-1.0,-0.6,-0.4}; // eta cuts
26 Float_t etaMax[numberOfSyst] = {0.8,0.8,0.8,0.8,0.8,0.8,0.8,0.8,0.8,0.8,1.0,0.6,0.4};   // eta cuts
27 Bool_t kUsePID = kTRUE;
28
29 //______________________________________________________________________________
30 void runBalanceFunction(
31          const char* runtype = "local", // local, proof or grid
32          const char *gridmode = "", // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit", "terminate" or ""). Full & Test work for proof
33          const Int_t bunchN = 0,
34          const bool bAOD = 1, // 1 = AOD ANALYSIS, 0 = ESD ANALYSIS
35          const bool bMCtruth = 0, // 1 = MCEvent handler is on (MC truth), 0 = MCEvent handler is off (MC reconstructed/real data)
36          const bool bMCphyssel = 0, // 1 = looking at MC truth or reconstructed, 0 = looking at real data
37          const Long64_t nentries = 50000, // for local and proof mode, ignored in grid mode. Set to 1234567890 for all events.
38          const Long64_t firstentry = 0, // for local and proof mode, ignored in grid mode
39          TString proofdataset = "bunchPROOF", // path to dataset on proof cluster, for proof analysis
40          const char *proofcluster = "miweber@alice-caf.cern.ch", // which proof cluster to use in proof mode
41          const char *taskname = "BF_S3_pion_TOF" // sets name of grid generated macros
42          )
43 {
44     // check run type
45     if(runtype != "local" && runtype != "proof" && runtype != "grid"){
46         Printf("\n\tIncorrect run option, check first argument of run macro");
47         Printf("\tint runtype = local, proof or grid\n");
48         return;
49     }
50     Printf("%s analysis chosen",runtype);
51   
52     // load libraries
53     gSystem->Load("libCore");
54     gSystem->Load("libGeom");
55     gSystem->Load("libVMC");
56     gSystem->Load("libPhysics");
57     gSystem->Load("libTree");
58     gSystem->Load("libSTEERBase");
59     gSystem->Load("libESD");
60     gSystem->Load("libAOD");
61     gSystem->Load("libANALYSIS");
62     gSystem->Load("libANALYSISalice");
63     gSystem->Load("libEventMixing");
64     gSystem->Load("libPWGCFebye");
65
66     // additional
67
68     //compile standalone stuff
69     //gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGCF/EBYE/BalanceFunction/AliBalance.cxx++g");
70     //gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWGCF/EBYE/BalanceFunction/AliAnalysisTaskBF.cxx++g");
71
72     // add aliroot indlude path
73     //gROOT->ProcessLine(".include $PWD/.");
74     //gROOT->ProcessLine(Form(".include %s/include",gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT")));
75
76     gROOT->SetStyle("Plain");
77
78     // analysis manager
79     AliAnalysisManager* mgr = new AliAnalysisManager(Form("%s%i",taskname,bunchN));
80     
81     if(runtype == "grid") {
82       // create the alien handler and attach it to the manager
83       AliAnalysisGrid *plugin = CreateAlienHandler(bAOD,bunchN,Form("%s%i",taskname,bunchN), gridmode, proofcluster, Form("%s_%d.txt",proofdataset.Data(),bunchN)); 
84       mgr->SetGridHandler(plugin);
85     }
86
87     // input handler (ESD or AOD)
88     AliVEventHandler* inputH = NULL;
89     if(!bAOD){
90       inputH = new AliESDInputHandler();
91     }
92     else{
93       inputH = new AliAODInputHandler();
94     }
95     mgr->SetInputEventHandler(inputH);
96
97     //===================================================//
98     TChain *chain;
99     if(gridmode=="") {
100       chain = new TChain("aodTree"); // "esdTree" or "aodTree"
101       //chain->Add( "POINT TO YOUR LOCAL ESD" );
102       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/1/AliAOD.root");
103       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/2/AliAOD.root");
104       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/3/AliAOD.root");
105       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/4/AliAOD.root");
106       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/5/AliAOD.root");
107       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/6/AliAOD.root");
108       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/7/AliAOD.root");
109       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/8/AliAOD.root");
110       chain -> Add("/glusterfs/alice1/alice3/alisrm/PbPbPID/AODsData/9/AliAOD.root");
111     }
112     //===================================================//
113     
114     
115     
116     // mc event handler
117     if(bMCtruth) {
118         AliMCEventHandler* mchandler = new AliMCEventHandler();
119         // Not reading track references
120         mchandler->SetReadTR(kFALSE);
121         mgr->SetMCtruthEventHandler(mchandler);
122     }   
123
124     //AOD output handler
125     if(bAOD){
126       AliAODHandler* aodoutHandler = new AliAODHandler();
127       aodoutHandler->SetOutputFileName("aod.root");
128       mgr->SetOutputEventHandler(aodoutHandler); 
129     }
130
131     // === Physics Selection Task ===
132     //
133     // In SelectCollisionCandidate(), default is kMB, so the task UserExec() 
134     // function is only called for these events.
135     // Options are:
136     //    kMB             Minimum Bias trigger
137     //    kMBNoTRD        Minimum bias trigger where the TRD is not read out
138     //    kMUON           Muon trigger
139     //    kHighMult       High-Multiplicity Trigger
140     //    kUserDefined    For manually defined trigger selection
141     //
142     // Multiple options possible with the standard AND/OR operators && and ||
143     // These all have the usual offline SPD or V0 selections performed.
144     //
145     // With a pointer to the physics selection object using physSelTask->GetPhysicsSelection(),
146     // one can manually set the selected and background classes using:
147     //    AddCollisionTriggerClass("+CINT1B-ABCE-NOPF-ALL")
148     //    AddBGTriggerClass("+CINT1A-ABCE-NOPF-ALL");
149     //
150     // One can also specify multiple classes at once, or require a class to NOT
151     // trigger, for e.g.
152     //    AddBGTriggerClass("+CSMBA-ABCE-NOPF-ALL -CSMBB-ABCE-NOPF-ALL");
153     //
154     // NOTE that manually setting the physics selection overrides the standard
155     // selection, so it must be done in completeness.
156     //
157     // ALTERNATIVELY, one can make the physics selection inside the task
158     // UserExec().
159     // For this case, comment out the task->SelectCol.... line, 
160     // and see AliBasicTask.cxx UserExec() function for details on this.
161
162     //gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
163     //AliPhysicsSelectionTask *physSelTask = AddTaskPhysicsSelection(bMCphyssel);
164     //if(!physSelTask) { Printf("no physSelTask"); return; }
165     //AliPhysicsSelection *physSel = physSelTask->GetPhysicsSelection();
166     //physSel->AddCollisionTriggerClass("+CINT1B-ABCE-NOPF-ALL");// #3119 #769");
167                 
168     // create task
169
170     //Add the centrality determination task and the physics selection 
171
172     // (only on ESD level, in AODs centrality is already in header and events are selected)
173     if(!bAOD){
174       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskCentrality.C");
175       AliCentralitySelectionTask *taskCentrality = AddTaskCentrality();
176
177       // Add physics selection task (NOT needed for AODs)
178       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
179       AliPhysicsSelectionTask* physSelTask = AddTaskPhysicsSelection(bMCphyssel);
180       //Add the PID response
181       //if(kUsePID) {
182       //gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPIDResponse.C");
183       //AddTaskPIDResponse(bMCphyssel); 
184       //}
185  
186     }
187      
188     if(kUsePID) {
189       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPIDResponse.C");
190       AddTaskPIDResponse(bMCphyssel); 
191     }
192
193     //Add the BF task (all centralities)
194     gROOT->LoadMacro("AddTaskBalanceCentralityTrain.C"); 
195     AliAnalysisTaskBF *task = AddTaskBalanceCentralityTrain(0.,100.,kTRUE,"V0M",vZ[0],DCAxy[0],DCAz[0],ptMin[0],ptMax[0],etaMin[0],etaMax[0],-1,-1);
196     
197     // enable debug printouts
198     //mgr->SetDebugLevel(2);
199     //mgr->SetUseProgressBar(1,100);
200     if (!mgr->InitAnalysis()) return;
201     mgr->PrintStatus();
202   
203     // start analysis
204     Printf("Starting Analysis....");
205     if(runtype == "local")
206       mgr->StartAnalysis(runtype,chain);
207     else
208       mgr->StartAnalysis(runtype,nentries,firstentry);
209 }
210
211
212
213 //______________________________________________________________________________
214 AliAnalysisGrid* CreateAlienHandler(Bool_t bAOD, Int_t bunchN, const char *taskname, const char *gridmode, const char *proofcluster, const char *proofdataset)
215 {
216     AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
217     // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
218     plugin->SetRunMode(gridmode);
219
220     // Set versions of used packages
221     plugin->SetAPIVersion("V1.1x");
222     plugin->SetROOTVersion("v5-33-02b");
223     plugin->SetAliROOTVersion("v5-03-19-AN");
224
225     // Declare input data to be processed.
226
227     // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.
228     // Define production directory LFN
229     plugin->SetGridDataDir("/alice/data/2010/LHC10h/");
230     // On real reconstructed data:
231     // plugin->SetGridDataDir("/alice/data/2009/LHC09d");
232
233     // Set data search pattern
234     //plugin->SetDataPattern("*ESDs.root"); // THIS CHOOSES ALL PASSES
235     // Data pattern for reconstructed data
236     if(!bAOD){
237       plugin->SetDataPattern("*ESDs/pass2/*ESDs.root"); // CHECK LATEST PASS OF DATA SET IN ALIENSH
238     } 
239     else{
240       plugin->SetDataPattern("*ESDs/pass2/AOD049/*/AliAOD.root");
241     }
242
243     plugin->SetRunPrefix("000");   // real data
244     // ...then add run numbers to be considered
245     //plugin->SetRunRange(114917,115322);
246
247     if(bunchN==0){
248       plugin->AddRunNumber(137366);
249     }
250     
251     //bunch1
252     else if(bunchN == 1){
253       plugin->AddRunNumber(139510);
254       plugin->AddRunNumber(139507);
255       plugin->AddRunNumber(139505);
256       plugin->AddRunNumber(139503); 
257       plugin->AddRunNumber(139465); 
258       plugin->AddRunNumber(139438);
259       plugin->AddRunNumber(139437);
260       plugin->AddRunNumber(139360); 
261       plugin->AddRunNumber(139329);
262       plugin->AddRunNumber(139328); 
263     }
264
265     //bunch2
266     else if(bunchN == 2){
267       plugin->AddRunNumber(139314); 
268       plugin->AddRunNumber(139310);
269       plugin->AddRunNumber(139309); 
270       plugin->AddRunNumber(139173); 
271       plugin->AddRunNumber(139107); 
272       plugin->AddRunNumber(139105); 
273       plugin->AddRunNumber(139038); 
274       plugin->AddRunNumber(139037); 
275       plugin->AddRunNumber(139036); 
276       plugin->AddRunNumber(139029); 
277       plugin->AddRunNumber(139028); 
278       plugin->AddRunNumber(138872); 
279       plugin->AddRunNumber(138871); 
280       plugin->AddRunNumber(138870); 
281       plugin->AddRunNumber(138837); 
282       plugin->AddRunNumber(138732); 
283       plugin->AddRunNumber(138730);
284       plugin->AddRunNumber(138666);
285       plugin->AddRunNumber(138662); 
286       plugin->AddRunNumber(138653); 
287     }
288
289     else if(bunchN == 3){
290       plugin->AddRunNumber(138652);
291       plugin->AddRunNumber(138638);
292       plugin->AddRunNumber(138624); 
293       plugin->AddRunNumber(138621); 
294       plugin->AddRunNumber(138583); 
295       plugin->AddRunNumber(138582); 
296       plugin->AddRunNumber(138579); 
297       plugin->AddRunNumber(138578);
298       plugin->AddRunNumber(138534);
299       plugin->AddRunNumber(138469); 
300     }
301
302     else if(bunchN == 4){
303       
304       plugin->AddRunNumber(138442);
305       plugin->AddRunNumber(138439);
306       plugin->AddRunNumber(138438);
307       plugin->AddRunNumber(138396); 
308       plugin->AddRunNumber(138364); 
309       plugin->AddRunNumber(138275); 
310       plugin->AddRunNumber(138225); 
311       plugin->AddRunNumber(138201);
312       plugin->AddRunNumber(138197); 
313       plugin->AddRunNumber(138192); 
314     }
315
316     else if(bunchN == 5){
317
318       plugin->AddRunNumber(138190);
319       plugin->AddRunNumber(137848); 
320       plugin->AddRunNumber(137844); 
321       plugin->AddRunNumber(137752); 
322       plugin->AddRunNumber(137751); 
323       plugin->AddRunNumber(137724); 
324       plugin->AddRunNumber(137722); 
325       plugin->AddRunNumber(137718); 
326       plugin->AddRunNumber(137704); 
327       plugin->AddRunNumber(137693);
328     }
329
330     else if(bunchN == 6){
331
332       plugin->AddRunNumber(137692); 
333       plugin->AddRunNumber(137691); 
334       plugin->AddRunNumber(137686); 
335       plugin->AddRunNumber(137685); 
336       plugin->AddRunNumber(137639); 
337       plugin->AddRunNumber(137638);
338       plugin->AddRunNumber(137608); 
339       plugin->AddRunNumber(137595);
340       plugin->AddRunNumber(137549);
341       plugin->AddRunNumber(137546); 
342
343     }
344
345     else if(bunchN == 7){
346
347       plugin->AddRunNumber(137544); 
348       plugin->AddRunNumber(137541); 
349       plugin->AddRunNumber(137539); 
350       plugin->AddRunNumber(137531); 
351       plugin->AddRunNumber(137530); 
352       plugin->AddRunNumber(137443); 
353       plugin->AddRunNumber(137441); 
354       plugin->AddRunNumber(137440); 
355       plugin->AddRunNumber(137439); 
356       plugin->AddRunNumber(137434); 
357
358     }
359
360     else if(bunchN == 8){
361
362       plugin->AddRunNumber(137432); 
363       plugin->AddRunNumber(137431); 
364       plugin->AddRunNumber(137430); 
365       plugin->AddRunNumber(137366); 
366       plugin->AddRunNumber(137243); 
367       plugin->AddRunNumber(137236);
368       plugin->AddRunNumber(137235);
369       plugin->AddRunNumber(137232); 
370       plugin->AddRunNumber(137231); 
371       plugin->AddRunNumber(137162); 
372       plugin->AddRunNumber(137161);
373     }
374
375     else{
376
377       stderr<<"BUNCH NOT THERE"<<endl;
378       return NULL;
379
380     }
381
382
383     //plugin->AddRunList("139510, 139507, 139505, 139503, 139465, 139438, 139437, 139360, 139329, 139328, 139314, 139310, 139309, 139173, 139107, 139105, 139038, 139037, 139036, 139029, 139028, 138872, 138871, 138870, 138837, 138732, 138730, 138666, 138662, 138653, 138652, 138638, 138624, 138621, 138583, 138582, 138579, 138578, 138534, 138469, 138442, 138439, 138438, 138396, 138364, 138275, 138225, 138201, 138197, 138192, 138190, 137848, 137844, 137752, 137751, 137724, 137722, 137718, 137704, 137693, 137692, 137691, 137686, 137685, 137639, 137638, 137608, 137595, 137549, 137546, 137544, 137541, 137539, 137531, 137530, 137443, 137441, 137440, 137439, 137434, 137432, 137431, 137430, 137366, 137243, 137236, 137235, 137232, 137231, 137162, 137161");
384
385
386
387
388
389     plugin->SetNrunsPerMaster(1);
390     plugin->SetOutputToRunNo();
391     // comment out the next line when using the "terminate" option, unless
392     // you want separate merged files for each run
393     plugin->SetMergeViaJDL();
394
395     // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)
396     // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())
397     // XML collections added via this method can be combined with the first method if
398     // the content is compatible (using or not tags)
399     //   plugin->AddDataFile("tag.xml");
400     //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");
401
402     // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
403     plugin->SetGridWorkingDir(taskname);
404
405     // Declare alien output directory. Relative to working directory.
406     plugin->SetGridOutputDir("out"); // In this case will be $HOME/taskname/out
407
408    // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
409     // using ACLiC on the worker nodes.
410     // plugin->SetAnalysisSource("AliBalance.cxx AliAnalysisTaskBF.cxx");
411
412     // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
413     // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
414     //plugin->AddIncludePath("-I.");
415     plugin->SetAdditionalLibs("libPWGCFebye.so");
416     //plugin->SetAdditionalLibs("AliBalance.cxx AliBalance.h AliAnalysisTaskBF.cxx AliAnalysisTaskBF.h");
417
418      // Declare the output file names separated by blancs.
419     // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)
420     // To only save certain files, use SetDefaultOutputs(kFALSE), and then
421     // SetOutputFiles("list.root other.filename") to choose which files to save
422     plugin->SetDefaultOutputs();
423     //plugin->SetOutputFiles("list.root");
424
425     // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
426     plugin->SetAnalysisMacro(Form("%s.C",taskname));
427
428     // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
429     plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(100);
430
431     // Optionally modify the executable name (default analysis.sh)
432     plugin->SetExecutable(Form("%s.sh",taskname));
433
434     // set number of test files to use in "test" mode
435     plugin->SetNtestFiles(1);
436
437     // Optionally resubmit threshold.
438     plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);
439
440     // Optionally set time to live (default 30000 sec)
441     plugin->SetTTL(90000);
442
443     // Optionally set input format (default xml-single)
444     plugin->SetInputFormat("xml-single");
445
446     // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
447     plugin->SetJDLName(Form("%s.jdl",taskname));
448
449     // Optionally modify job price (default 1)
450     plugin->SetPrice(1);      
451
452     // Optionally modify split mode (default 'se')    
453     plugin->SetSplitMode("se");
454
455     //plugin->SetUseSubmitPolicy();
456     //plugin->SetKeepLogs();
457     
458     //----------------------------------------------------------
459     //---      PROOF MODE SPECIFIC SETTINGS         ------------
460     //---------------------------------------------------------- 
461     // Proof cluster
462     plugin->SetProofCluster(proofcluster);
463     // Dataset to be used   
464     plugin->SetProofDataSet(proofdataset);
465     // May need to reset proof. Supported modes: 0-no reset, 1-soft, 2-hard
466     plugin->SetProofReset(0);
467     // May limit number of workers
468     plugin->SetNproofWorkers(0);
469     // May limit the number of workers per slave
470     plugin->SetNproofWorkersPerSlave(1);   
471     // May use a specific version of root installed in proof
472     plugin->SetRootVersionForProof("current");
473     // May set the aliroot mode. Check http://aaf.cern.ch/node/83 
474     plugin->SetAliRootMode("default"); // Loads AF libs by default
475     // May request ClearPackages (individual ClearPackage not supported)
476     plugin->SetClearPackages(kFALSE);
477     // Plugin test mode works only providing a file containing test file locations, used in "local" mode also
478     plugin->SetFileForTestMode("files.txt"); // file should contain path name to a local directory containg *ESDs.root etc
479     // Request connection to alien upon connection to grid
480     plugin->SetProofConnectGrid(kFALSE);
481
482     plugin->Print();
483
484     return plugin;
485 }
486
487