]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - PWGHF/vertexingHF/macros/AddTaskCFVertexingHFLctoV0bachelorTMVA.C
Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot
[u/mrichter/AliRoot.git] / PWGHF / vertexingHF / macros / AddTaskCFVertexingHFLctoV0bachelorTMVA.C
1 const Double_t ymin  = -1.2 ;
2 const Double_t ymax  =  1.2 ;
3 const Double_t cosminTS = -1.05;
4 const Double_t cosmaxTS =  1.05;
5 const Double_t cosmin = 0.7;
6 const Double_t cosmax =  1.02;
7 const Double_t cTmin = 0;  // micron
8 const Double_t cTmax = 300;  // micron
9 const Double_t dcamin = 0;  // micron
10 const Double_t dcamax = 600;  // micron
11 const Double_t d0xd0min = -80000;  // micron
12 const Double_t d0xd0max = 100000;  // micron
13 const Double_t phimin = 0.0;  
14 const Int_t    mintrackrefsTPC = 2 ;
15 const Int_t    mintrackrefsITS = 3 ;
16 const Int_t    charge  = 1 ;
17 const Int_t    minclustersTPC = 50 ;
18 // cuts
19 const Double_t ptmin = 0.1;
20 const Double_t ptmax = 9999.;
21 const Double_t etamin = -0.9;
22 const Double_t etamax = 0.9;
23 const Double_t zmin = -15;
24 const Double_t zmax = 15;
25 const Int_t    minITSClusters = 5;
26
27 const Float_t centmin_0_10 = 0.;
28 const Float_t centmax_0_10 = 10.;
29 const Float_t centmin_10_60 = 10.;
30 const Float_t centmax_10_60 = 60.;
31 const Float_t centmin_60_100 = 60.;
32 const Float_t centmax_60_100 = 100.;
33 const Float_t centmax = 100.;
34 const Float_t fakemin = -0.5;
35 const Float_t fakemax = 2.5.;
36 const Float_t cosminXY = 0.95;
37 const Float_t cosmaxXY = 1.0;
38 const Float_t normDecLXYmin = 0;
39 const Float_t normDecLXYmax = 20;
40 const Float_t multmin_0_20 = 0;
41 const Float_t multmax_0_20 = 20;
42 const Float_t multmin_20_50 = 20;
43 const Float_t multmax_20_50 = 50;
44 const Float_t multmin_50_80 = 50;
45 const Float_t multmax_50_80 = 80;
46 const Float_t multmin_80_100 = 80;
47 const Float_t multmax_80_100 = 100;
48 const Float_t multmin_100_400 = 100;
49 const Float_t multmax_100_400 = 400;
50
51
52 //----------------------------------------------------
53
54 AliCFTaskVertexingHF *AddTaskCFVertexingHFLctoV0bachelorTMVA(const char* cutFile = "CutsLc2pK0STMVA_20140311.root", 
55                                                              TString cutObjectName = "LctoV0AnalysisCuts", 
56                                                              TString suffix = "TMVA", 
57                                                              Int_t configuration = AliCFTaskVertexingHF::kCheetah, 
58                                                              Bool_t isKeepDfromB = kTRUE, 
59                                                              Bool_t isKeepDfromBOnly = kFALSE, 
60                                                              Int_t pdgCode = 4122, 
61                                                              Char_t isSign = 2, 
62                                                              Bool_t useWeight = kFALSE, 
63                                                              Bool_t useFlatPtWeight = kFALSE, 
64                                                              Bool_t useZWeight = kFALSE, 
65                                                              Bool_t useNchWeight = kFALSE, 
66                                                              Bool_t useNtrkWeight = kFALSE, 
67                                                              TString estimatorFilename="", 
68                                                              Int_t multiplicityEstimator = AliCFTaskVertexingHF::kNtrk10, 
69                                                              Bool_t isPPData = kFALSE, 
70                                                              Bool_t isPPbData = kFALSE, 
71                                                              Double_t refMult = 9.26, 
72                                                              Bool_t isFineNtrkBin = kFALSE) 
73 {
74   printf("Adding CF task using cuts from file %s\n",cutFile);
75   if (configuration == AliCFTaskVertexingHF::kSnail){
76     printf("The configuration is set to be SLOW --> all the variables will be used to fill the CF\n");
77   }
78   else if (configuration == AliCFTaskVertexingHF::kCheetah){
79     printf("The configuration is set to be FAST --> using only pt, y, ct, phi, zvtx, centrality, fake, multiplicity to fill the CF\n");
80   }
81   else{
82     printf("The configuration is not defined! returning\n");
83     return;
84   }
85                
86   gSystem->Sleep(2000);
87
88   // isSign = 0 --> D* only
89   // isSign = 1 --> D*bar only
90   // isSign = 2 --> D* + D*bar
91
92   TString expected;
93   if (isSign == 0 && pdgCode < 0){
94     AliError(Form("Error setting PDG code (%d) and sign (0 --> D* only): they are not compatible, returning"));
95     return 0x0;
96   }
97   else if (isSign == 1 && pdgCode > 0){
98     AliError(Form("Error setting PDG code (%d) and sign (1 --> D*bar only): they are not compatible, returning"));
99     return 0x0;
100   }
101   else if (isSign > 2 || isSign < 0){
102     AliError(Form("Sign not valid (%d, possible values are 0, 1, 2), returning"));
103     return 0x0;
104   }
105
106   TFile* fileCuts = TFile::Open(cutFile);
107   if(!fileCuts || (fileCuts && !fileCuts->IsOpen())){ 
108     AliError("Wrong cut file");
109     return 0x0;
110   }
111
112   AliRDHFCutsLctoV0 *cutsLcTMVA = (AliRDHFCutsLctoV0*)fileCuts->Get(cutObjectName.Data());
113         
114   // check that the fKeepD0fromB flag is set to true when the fKeepD0fromBOnly flag is true
115   //  for now the binning is the same than for all D's
116   if (isKeepDfromBOnly) isKeepDfromB = true;
117         
118   Double_t ptmin_0_6;
119   Double_t ptmax_0_6;
120   Double_t ptmin_6_8;
121   Double_t ptmax_6_8;
122   Double_t ptmin_8_16;
123   Double_t ptmax_8_16;
124   Double_t ptmin_16_24;
125   Double_t ptmax_16_24;
126         
127   ptmin_0_6 =  0.0 ;
128   ptmax_0_6 =  6.0 ;
129   ptmin_6_8 =  6.0 ;
130   ptmax_6_8 =  8.0 ;
131   ptmin_8_16 =  8.0 ;
132   ptmax_8_16 =  16.0 ;
133   ptmin_16_24 =  16.0 ;
134   ptmax_16_24 =  24.0 ;
135
136   //CONTAINER DEFINITION
137   Info("AliCFTaskVertexingHF","SETUP CONTAINER");
138   const Double_t phimax = 2*TMath::Pi();
139   UInt_t nstep = 10; //number of selection steps: MC with limited acceptance, MC, Acceptance, Vertex, Refit, Reco (no cuts), RecoAcceptance, RecoITSClusters (RecoAcceptance included), RecoPPR (RecoAcceptance+RecoITSCluster included), RecoPID 
140
141   //const UInt_t ipT, iy, icosThetaStar, ipTpi, ipTk, icT, idca, id0xd0, ipointing, iphi, izvtx, icent, ifake, ipointingXY, iNormDecayLXY, imult;
142   const Int_t nbiny  = 24 ; //bins in y
143   const Int_t nbincosThetaStar  = 42 ; //bins in cosThetaStar 
144   const Int_t nbincT  = 15 ; //bins in cT
145   const Int_t nbindca  = 20 ; //bins in dca
146   const Int_t nbind0xd0  = 90 ; //bins in d0xd0
147   const Int_t nbinpointing  = 50 ; //bins in cosPointingAngle
148   const Int_t nbinphi  = 18 ; //bins in Phi
149   const Int_t nbinzvtx  = 30 ; //bins in z vertex
150   const Int_t nbincent = 28;  //bins in centrality
151   const Int_t nbincent_0_10 = 4;  //bins in centrality between 0 and 10
152   const Int_t nbincent_10_60 = 20;  //bins in centrality between 10 and 60
153   const Int_t nbincent_60_100 = 4;  //bins in centrality between 60 and 100
154   const Int_t nbinfake = 3;  //bins in fake
155   const Int_t nbinpointingXY = 50;  //bins in cosPointingAngleXY
156   const Int_t nbinnormDecayLXY = 20;  //bins in NormDecayLengthXY
157   const Int_t nbinmult = 49;  //bins in multiplicity (total number)
158   const Int_t nbinmult_0_20 = 20; //bins in multiplicity between 0 and 20
159   const Int_t nbinmult_20_50 = 15; //bins in multiplicity between 20 and 50
160   const Int_t nbinmult_50_80 = 10; //bins in multiplicity between 50 and 80
161   const Int_t nbinmult_80_100 = 4; //bins in multiplicity between 80 and 100
162   const Int_t nbinmult_100_400 = 3; //bins in multiplicity between 100 and 400
163   if(isPPbData) nbinmult += nbinmult_100_400;
164
165
166   //the sensitive variables, their indices
167
168   const Int_t nvarTot   = 16 ; //number of variables on the grid:pt, y, cosThetaStar, pTpi, pTk, cT, dca, d0pi, d0K, d0xd0, cosPointingAngle, phi, z, centrality, fake, cosPointingAngleXY, normDecayLengthXY, multiplicity
169
170   // variables' indices
171   const UInt_t ipT = 0;
172   const UInt_t iy  = 1;
173   const UInt_t icosThetaStar  = 2;
174   const UInt_t ipTpi  = 3;
175   const UInt_t ipTk  = 4;
176   const UInt_t icT  = 5;
177   const UInt_t idca  = 6;
178   const UInt_t id0xd0  = 7;
179   const UInt_t ipointing  = 8;
180   const UInt_t iphi  = 9;
181   const UInt_t izvtx  = 10;
182   const UInt_t icent = 11;
183   const UInt_t ifake = 12;
184   const UInt_t ipointingXY = 13;
185   const UInt_t inormDecayLXY = 14;
186   const UInt_t imult = 15;
187         
188   //Setting the bins: pt, ptPi, and ptK are considered seprately because for them you can either define the binning by hand, or using the cuts file
189         
190   //arrays for the number of bins in each dimension
191   Int_t iBin[nvarTot];
192                 
193   const Int_t nbinpt = cutsLcTMVA->GetNPtBins(); // bins in pT
194   iBin[ipT] = nbinpt;
195   iBin[ipTpi] = nbinpt;
196   iBin[ipTk] = nbinpt;
197   Double_t *binLimpT = new Double_t[iBin[ipT]+1];
198   Double_t *binLimpTpi = new Double_t[iBin[ipTpi]+1];
199   Double_t *binLimpTk = new Double_t[iBin[ipTk]+1];
200   // values for bin lower bounds
201   Float_t* floatbinLimpT = cutsLcTMVA->GetPtBinLimits();
202   for (Int_t ibin0 = 0 ; ibin0<iBin[ipT]+1; ibin0++){
203     binLimpT[ibin0] = (Double_t)floatbinLimpT[ibin0];
204     binLimpTpi[ibin0] = (Double_t)floatbinLimpT[ibin0];
205     binLimpTk[ibin0] = (Double_t)floatbinLimpT[ibin0];
206   }
207   for(Int_t i=0; i<=nbinpt; i++) printf("binLimpT[%d]=%f\n",i,binLimpT[i]);  
208         
209   printf("pT: nbin (from cuts file) = %d\n",nbinpt);
210
211   // Fine Ntrk binning setting
212   Double_t *binLimmultFine;
213   Int_t nbinmultTmp = nbinmult;
214   if (isFineNtrkBin) {
215     Int_t nbinLimmultFine = 100;
216     if (isPPbData) nbinLimmultFine = 200;
217     const UInt_t nbinMultFine = nbinLimmultFine;
218     binLimmultFine = new Double_t[nbinMultFine+1];
219     for (Int_t ibin0 = 0; ibin0 < nbinMultFine+1; ibin0++) {
220       binLimmultFine[ibin0] = ibin0;
221     }
222     nbinmultTmp = nbinLimmultFine;
223   }
224   const Int_t nbinmultTot = nbinmultTmp;
225
226   // defining now the binning for the other variables:
227         
228   AliLog::SetClassDebugLevel("AliCFManager",AliLog::kInfo);
229
230   iBin[iy] = nbiny;
231   iBin[icosThetaStar] = nbincosThetaStar;
232   iBin[icT] = nbincT;
233   iBin[idca] = nbindca;
234   iBin[id0xd0] = nbind0xd0;
235   iBin[ipointing] = nbinpointing;
236   iBin[iphi] = nbinphi;
237   iBin[izvtx] = nbinzvtx;
238   iBin[icent] = nbincent;
239   iBin[ifake] = nbinfake;
240   iBin[ipointingXY] = nbinpointingXY;
241   iBin[inormDecayLXY] = nbinnormDecayLXY;
242   iBin[imult] = nbinmultTot;
243         
244   //arrays for lower bounds :
245   Double_t *binLimy = new Double_t[iBin[iy]+1];
246   Double_t *binLimcosThetaStar = new Double_t[iBin[icosThetaStar]+1];
247   Double_t *binLimcT = new Double_t[iBin[icT]+1];
248   Double_t *binLimdca = new Double_t[iBin[idca]+1];
249   Double_t *binLimd0xd0 = new Double_t[iBin[id0xd0]+1];
250   Double_t *binLimpointing = new Double_t[iBin[ipointing]+1];
251   Double_t *binLimphi = new Double_t[iBin[iphi]+1];
252   Double_t *binLimzvtx = new Double_t[iBin[izvtx]+1];
253   Double_t *binLimcent = new Double_t[iBin[icent]+1];
254   Double_t *binLimfake = new Double_t[iBin[ifake]+1];
255   Double_t *binLimpointingXY = new Double_t[iBin[ipointingXY]+1];
256   Double_t *binLimnormDecayLXY = new Double_t[iBin[inormDecayLXY]+1];
257   Double_t *binLimmult = new Double_t[iBin[imult]+1];
258
259
260   // y
261   for(Int_t i=0; i<=nbiny; i++) binLimy[i] = (Double_t)ymin  + (ymax-ymin)  /nbiny*(Double_t)i ;
262
263   // cosThetaStar
264   for(Int_t i=0; i<=nbincosThetaStar; i++) binLimcosThetaStar[i] = (Double_t)cosminTS  + (cosmaxTS-cosminTS)  /nbincosThetaStar*(Double_t)i ;
265         
266   // cT
267   for(Int_t i=0; i<=nbincT; i++) binLimcT[i] = (Double_t)cTmin  + (cTmax-cTmin)  /nbincT*(Double_t)i ;
268
269   // dca
270   for(Int_t i=0; i<=nbindca; i++) binLimdca[i] = (Double_t)dcamin  + (dcamax-dcamin)  /nbindca*(Double_t)i ;
271
272   // d0xd0
273   for(Int_t i=0; i<=nbind0xd0; i++) binLimd0xd0[i] = (Double_t)d0xd0min  + (d0xd0max-d0xd0min)  /nbind0xd0*(Double_t)i ;
274
275   // cosPointingAngle
276   for(Int_t i=0; i<=nbinpointing; i++) binLimpointing[i] = (Double_t)cosmin  + (cosmax-cosmin)  /nbinpointing*(Double_t)i ;
277
278   // Phi
279   for(Int_t i=0; i<=nbinphi; i++) binLimphi[i] = (Double_t)phimin  + (phimax-phimin)  /nbinphi*(Double_t)i ;
280
281   // z Primary Vertex
282   for(Int_t i=0; i<=nbinzvtx; i++) {
283     binLimzvtx[i] = (Double_t)zmin  + (zmax-zmin)  /nbinzvtx*(Double_t)i ;
284   }
285
286   // centrality
287   for(Int_t i=0; i<=nbincent_0_10; i++) binLimcent[i] = (Double_t)centmin_0_10 + (centmax_0_10-centmin_0_10)/nbincent_0_10*(Double_t)i ; 
288   if (binLimcent[nbincent_0_10] != centmin_10_60)  {
289     Error("AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep","Calculated bin lim for cent - 1st range - differs from expected!\n");
290   }
291   for(Int_t i=0; i<=nbincent_10_60; i++) binLimcent[i+nbincent_0_10] = (Double_t)centmin_10_60 + (centmax_10_60-centmin_10_60)/nbincent_10_60*(Double_t)i ;
292   if (binLimcent[nbincent_0_10+nbincent_10_60] != centmin_60_100)  {
293     Error("AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep","Calculated bin lim for cent - 2st range - differs from expected!\n");
294   }
295   for(Int_t i=0; i<=nbincent_60_100; i++) binLimcent[i+nbincent_0_10+nbincent_10_60] = (Double_t)centmin_60_100 + (centmax_60_100-centmin_60_100)/nbincent_60_100*(Double_t)i ;
296
297   // fake
298   for(Int_t i=0; i<=nbinfake; i++) {
299     binLimfake[i] = (Double_t)fakemin  + (fakemax-fakemin)/nbinfake * (Double_t)i;
300   }
301
302   // cosPointingAngleXY
303   for(Int_t i=0; i<=nbinpointingXY; i++) binLimpointingXY[i] = (Double_t)cosminXY  + (cosmaxXY-cosminXY)  /nbinpointingXY*(Double_t)i ;
304
305   // normDecayLXY
306   for(Int_t i=0; i<=nbinnormDecayLXY; i++) binLimnormDecayLXY[i] = (Double_t)normDecLXYmin  + (normDecLXYmax-normDecLXYmin)  /nbinnormDecayLXY*(Double_t)i ;
307
308
309   // multiplicity
310   for(Int_t i=0; i<=nbinmult_0_20; i++) binLimmult[i] = (Double_t)multmin_0_20 + (multmax_0_20-multmin_0_20)/nbinmult_0_20*(Double_t)i ; 
311   if (binLimmult[nbinmult_0_20] != multmin_20_50)  {
312     Error("AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep","Calculated bin lim for mult - 1st range - differs from expected!\n");
313   }
314   for(Int_t i=0; i<=nbinmult_20_50; i++) binLimmult[i+nbinmult_0_20] = (Double_t)multmin_20_50 + (multmax_20_50-multmin_20_50)/nbinmult_20_50*(Double_t)i ; 
315   if (binLimmult[nbinmult_0_20+nbinmult_20_50] != multmin_50_80)  {
316     Error("AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep","Calculated bin lim for mult - 2nd range - differs from expected!\n");
317   }
318   for(Int_t i=0; i<=nbinmult_50_80; i++) binLimmult[i+nbinmult_0_20+nbinmult_20_50] = (Double_t)multmin_50_80 + (multmax_50_80-multmin_50_80)/nbinmult_50_80*(Double_t)i ; 
319   if (binLimmult[nbinmult_0_20+nbinmult_20_50+nbinmult_50_80] != multmin_80_100)  {
320     Error("AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep","Calculated bin lim for mult - 3rd range - differs from expected!\n");
321   }
322   for(Int_t i=0; i<=nbinmult_80_100; i++) binLimmult[i+nbinmult_0_20+nbinmult_20_50+nbinmult_50_80] = (Double_t)multmin_80_100 + (multmax_80_100-multmin_80_100)/nbinmult_80_100*(Double_t)i ; 
323   if (binLimmult[nbinmult_0_20+nbinmult_20_50+nbinmult_50_80+nbinmult_80_100] != multmin_100_400) {
324     Error("AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep","Calculated bin lim for mult - 4th range - differs from expected!\n");
325   }
326   if(isPPbData){
327     for (Int_t i = 0; i<=nbinmult_100_400; i++) binLimmult[i+nbinmult_0_20+nbinmult_20_50+nbinmult_50_80+nbinmult_80_100] = (Double_t)multmin_100_400 + (multmax_100_400-multmin_100_400)/nbinmult_100_400*(Double_t)i ;
328   }
329
330   //one "container" for MC
331   TString nameContainer="";
332   if(!isKeepDfromB) {
333     nameContainer = "CFHFccontainer0";
334   }
335   else  if(isKeepDfromBOnly){
336     nameContainer = "CFHFccontainer0DfromB";
337   }
338   else  {
339     nameContainer = "CFHFccontainer0allD";        
340   }
341   nameContainer += suffix;
342   //Setting up the container grid... 
343
344   AliCFContainer* container;
345
346   if (configuration == AliCFTaskVertexingHF::kSnail){
347     container = new AliCFContainer(nameContainer,"container for tracks",nstep,nvarTot,iBin);
348     //setting the bin limits
349     printf("pt\n");
350     container -> SetBinLimits(ipT, binLimpT);
351     printf("y\n");
352     container -> SetBinLimits(iy, binLimy);
353     printf("cts\n");
354     container -> SetBinLimits(icosThetaStar, binLimcosThetaStar);
355     printf("ptPi\n");
356     container -> SetBinLimits(ipTpi, binLimpTpi);
357     printf("ptK\n");
358     container -> SetBinLimits(ipTk, binLimpTk);
359     printf("cT\n");
360     container -> SetBinLimits(icT, binLimcT);
361     printf("dca\n");
362     container -> SetBinLimits(idca, binLimdca);
363     printf("d0xd0\n");
364     container -> SetBinLimits(id0xd0, binLimd0xd0);
365     printf("pointing\n");
366     container -> SetBinLimits(ipointing, binLimpointing);
367     printf("phi\n");
368     container -> SetBinLimits(iphi, binLimphi);
369     printf("z\n");
370     container -> SetBinLimits(izvtx, binLimzvtx);
371     printf("cent\n");
372     container -> SetBinLimits(icent, binLimcent);
373     printf("fake\n");
374     container -> SetBinLimits(ifake, binLimfake);
375     printf("pointingXY\n");
376     container -> SetBinLimits(ipointingXY, binLimpointingXY);
377     printf("normDecayLXY\n");
378     container -> SetBinLimits(inormDecayLXY, binLimnormDecayLXY);
379     printf("multiplicity\n");
380                 
381     if (isFineNtrkBin) container->SetBinLimits(imult, binLimmultFine);
382     else               container->SetBinLimits(imult, binLimmult);
383
384     container -> SetVarTitle(ipT,"pt");
385     container -> SetVarTitle(iy,"y");
386     container -> SetVarTitle(icosThetaStar, "cosThetaStar");
387     container -> SetVarTitle(ipTpi, "ptpi");
388     container -> SetVarTitle(ipTk, "ptK");
389     container -> SetVarTitle(icT, "ct");
390     container -> SetVarTitle(idca, "dca");
391     container -> SetVarTitle(id0xd0, "d0xd0");
392     container -> SetVarTitle(ipointing, "pointing");
393     container -> SetVarTitle(iphi, "phi");
394     container -> SetVarTitle(izvtx, "zvtx");
395     container -> SetVarTitle(icent, "centrality");
396     container -> SetVarTitle(ifake, "fake");
397     container -> SetVarTitle(ipointingXY, "piointingXY");
398     container -> SetVarTitle(inormDecayLXY, "normDecayLXY");
399     container -> SetVarTitle(imult, "multiplicity");
400   }
401   else if (configuration == AliCFTaskVertexingHF::kCheetah){
402     //arrays for the number of bins in each dimension
403     const Int_t nvar = 8;
404
405     const UInt_t ipTFast = 0;
406     const UInt_t iyFast = 1;
407     const UInt_t icTFast = 2;
408     const UInt_t iphiFast = 3;
409     const UInt_t izvtxFast = 4;
410     const UInt_t icentFast = 5;
411     const UInt_t ifakeFast = 6;
412     const UInt_t imultFast = 7;
413
414     Int_t iBinFast[nvar];
415     iBinFast[ipTFast] = iBin[ipT];
416     iBinFast[iyFast] = iBin[iy];
417     iBinFast[icTFast] = iBin[icT];
418     iBinFast[iphiFast] = iBin[iphi];
419     iBinFast[izvtxFast] = iBin[izvtx];
420     iBinFast[icentFast] = iBin[icent];
421     iBinFast[ifakeFast] = iBin[ifake];
422     iBinFast[imultFast] = iBin[imult];
423
424     container = new AliCFContainer(nameContainer,"container for tracks", nstep, nvar, iBinFast);
425     printf("pt\n");
426     container -> SetBinLimits(ipTFast, binLimpT);
427     printf("y\n");
428     container -> SetBinLimits(iyFast, binLimy);
429     printf("ct\n");
430     container -> SetBinLimits(icTFast, binLimcT);
431     printf("phi\n");
432     container -> SetBinLimits(iphiFast, binLimphi);
433     printf("zvtx\n");
434     container -> SetBinLimits(izvtxFast, binLimzvtx);
435     printf("centrality\n");
436     container -> SetBinLimits(icentFast, binLimcent);
437     printf("fake\n");
438     container -> SetBinLimits(ifakeFast, binLimfake);
439     printf("multiplicity\n");
440     if(isFineNtrkBin) container -> SetBinLimits(imultFast, binLimmultFine);
441     else              container -> SetBinLimits(imultFast, binLimmult);
442
443     container -> SetVarTitle(ipTFast, "pt");
444     container -> SetVarTitle(iyFast, "y");
445     container -> SetVarTitle(icTFast, "ct");
446     container -> SetVarTitle(iphiFast, "phi");
447     container -> SetVarTitle(izvtxFast, "zvtx");
448     container -> SetVarTitle(icentFast, "centrality");
449     container -> SetVarTitle(ifakeFast, "fake");
450     container -> SetVarTitle(imultFast, "multiplicity");
451   }
452
453   container -> SetStepTitle(0, "MCLimAcc");
454   container -> SetStepTitle(1, "MC");
455   container -> SetStepTitle(2, "MCAcc");
456   container -> SetStepTitle(3, "RecoVertex");
457   container -> SetStepTitle(4, "RecoRefit");
458   container -> SetStepTitle(5, "Reco");
459   container -> SetStepTitle(6, "RecoAcc");
460   container -> SetStepTitle(7, "RecoITSCluster");
461   container -> SetStepTitle(8, "RecoCuts");
462   container -> SetStepTitle(9, "RecoPID");
463
464   //return container;
465
466   //CREATE THE  CUTS -----------------------------------------------
467         
468   // Gen-Level kinematic cuts
469   AliCFTrackKineCuts *mcKineCuts = new AliCFTrackKineCuts("mcKineCuts","MC-level kinematic cuts");
470         
471   //Particle-Level cuts:  
472   AliCFParticleGenCuts* mcGenCuts = new AliCFParticleGenCuts("mcGenCuts","MC particle generation cuts");
473   Bool_t useAbsolute = kTRUE;
474   if (isSign != 2){
475     useAbsolute = kFALSE;
476   }
477   mcGenCuts->SetRequirePdgCode(pdgCode, useAbsolute);  // kTRUE set in order to include D0_bar
478   mcGenCuts->SetAODMC(1); //special flag for reading MC in AOD tree (important)
479         
480   // Acceptance cuts:
481   AliCFAcceptanceCuts* accCuts = new AliCFAcceptanceCuts("accCuts", "Acceptance cuts");
482   AliCFTrackKineCuts *kineAccCuts = new AliCFTrackKineCuts("kineAccCuts","Kine-Acceptance cuts");
483   kineAccCuts->SetPtRange(ptmin, ptmax);
484   kineAccCuts->SetEtaRange(etamin, etamax);
485
486   // Rec-Level kinematic cuts
487   AliCFTrackKineCuts *recKineCuts = new AliCFTrackKineCuts("recKineCuts", "rec-level kine cuts");
488         
489   AliCFTrackQualityCuts *recQualityCuts = new AliCFTrackQualityCuts("recQualityCuts", "rec-level quality cuts");
490         
491   AliCFTrackIsPrimaryCuts *recIsPrimaryCuts = new AliCFTrackIsPrimaryCuts("recIsPrimaryCuts", "rec-level isPrimary cuts");
492         
493   printf("CREATE MC KINE CUTS\n");
494   TObjArray* mcList = new TObjArray(0) ;
495   mcList->AddLast(mcKineCuts);
496   mcList->AddLast(mcGenCuts);
497         
498   printf("CREATE ACCEPTANCE CUTS\n");
499   TObjArray* accList = new TObjArray(0) ;
500   accList->AddLast(kineAccCuts);
501
502   printf("CREATE RECONSTRUCTION CUTS\n");
503   TObjArray* recList = new TObjArray(0) ;   // not used!! 
504   recList->AddLast(recKineCuts);
505   recList->AddLast(recQualityCuts);
506   recList->AddLast(recIsPrimaryCuts);
507         
508   TObjArray* emptyList = new TObjArray(0);
509
510   //CREATE THE INTERFACE TO CORRECTION FRAMEWORK USED IN THE TASK
511   printf("CREATE INTERFACE AND CUTS\n");
512   AliCFManager* man = new AliCFManager() ;
513   man->SetParticleContainer(container);
514   man->SetParticleCutsList(0 , mcList); // MC, Limited Acceptance
515   man->SetParticleCutsList(1 , mcList); // MC
516   man->SetParticleCutsList(2 , accList); // Acceptance 
517   man->SetParticleCutsList(3 , emptyList); // Vertex 
518   man->SetParticleCutsList(4 , emptyList); // Refit 
519   man->SetParticleCutsList(5 , emptyList); // AOD
520   man->SetParticleCutsList(6 , emptyList); // AOD in Acceptance
521   man->SetParticleCutsList(7 , emptyList); // AOD with required n. of ITS clusters
522   man->SetParticleCutsList(8 , emptyList); // AOD Reco (PPR cuts implemented in Task)
523   man->SetParticleCutsList(9 , emptyList); // AOD Reco PID
524         
525   // Get the pointer to the existing analysis manager via the static access method.
526   //==============================================================================
527   AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
528   if (!mgr) {
529     ::Error("AddTaskCompareHF", "No analysis manager to connect to.");
530     return NULL;
531   }   
532   //CREATE THE TASK
533   printf("CREATE TASK\n");
534
535   // create the task
536   AliCFTaskVertexingHF *task = new AliCFTaskVertexingHF("AliCFTaskVertexingHF", cutsLcTMVA);
537   task->SetConfiguration(configuration);
538   task->SetFillFromGenerated(kFALSE);
539   task->SetCFManager(man); //here is set the CF manager
540   task->SetDecayChannel(22);
541   task->SetUseCascadeTaskForLctoV0bachelor(kTRUE);
542   task->SetUseAdditionalCuts(kTRUE);
543   task->SetUseCutsForTMVA(kFALSE);
544   task->SetUseFlatPtWeight(useFlatPtWeight); 
545   task->SetUseWeight(useWeight);
546   task->SetUseZWeight(useZWeight);
547   task->SetSign(isSign);
548   task->SetCentralitySelection(kFALSE);
549   task->SetFakeSelection(0);
550   //  task->SetRejectCandidateIfNotFromQuark(kTRUE); // put to false if you want to keep HIJING D0!!
551   task->SetRejectCandidateIfNotFromQuark(kFALSE); // put to false if you want to keep HIJING D0!!
552   task->SetUseMCVertex(kFALSE); // put to true if you want to do studies on pp
553   //task->SetPtWeightsFromDataPbPb276overLHC12a17a();
554   task->SetCutOnMomConservation(0.0000005);
555
556   if (isKeepDfromB && !isKeepDfromBOnly) task->SetDselection(2);
557   if (isKeepDfromB && isKeepDfromBOnly) task->SetDselection(1); 
558
559   TF1* funcWeight = 0x0;
560   if (task->GetUseWeight()) {
561     funcWeight = (TF1*)fileCuts->Get("funcWeight");
562     if (funcWeight == 0x0){
563       Printf("FONLL Weights will be used");
564     }
565     else {
566       task->SetWeightFunction(funcWeight);
567       Printf("User-defined Weights will be used. The function being:");
568       task->GetWeightFunction()->Print();
569     }
570   }
571
572   if (useNchWeight || useNtrkWeight){
573     TH1F *hNchPrimaries;
574     TH1F *hNchMeasured;         
575     if (isPPbData) hNchPrimaries = (TH1F*)fileCuts->Get("hNtrUnCorrEvWithCandWeight");
576     else hNchPrimaries = (TH1F*)fileCuts->Get("hGenPrimaryParticlesInelGt0");
577     hNchMeasured = (TH1F*)fileCuts->Get("hNchMeasured");
578     if(hNchPrimaries) {
579       task->SetUseNchWeight(kTRUE);
580       task->SetMCNchHisto(hNchPrimaries);
581       if(isPPbData) task->SetUseNchTrackletsWeight();
582     } else {
583       AliFatal("Histogram for multiplicity weights not found");
584       return 0x0;
585     }
586     if(hNchMeasured) task->SetMeasuredNchHisto(hNchMeasured);
587     if(useNtrkWeight) task->SetUseNchTrackletsWeight();
588   }
589
590   task->SetMultiplicityEstimator(multiplicityEstimator);
591   if(estimatorFilename.EqualTo("") ) {
592     printf("Estimator file not provided, multiplicity corrected histograms will not be filled\n");
593     task->SetUseZvtxCorrectedNtrkEstimator(kFALSE);
594   } else{
595     TFile* fileEstimator=TFile::Open(estimatorFilename.Data());
596     if(!fileEstimator)  {
597       AliFatal("File with multiplicity estimator not found"); 
598       return;
599     }      
600     task->SetUseZvtxCorrectedNtrkEstimator(kTRUE);
601     task->SetReferenceMultiplcity(refMult);
602           
603     if (isPPbData) {  //load multiplicity estimators for pPb
604       task->SetIsPPbData(kTRUE);
605       const Char_t* periodNames[2] = {"LHC13b", "LHC13c"};
606       TProfile *multEstimatorAvg[2];
607       for (Int_t ip=0; ip < 2; ip++) {
608         multEstimatorAvg[ip] = (TProfile*)(fileEstimator->Get(Form("SPDmult10_%s",periodNames[ip]))->Clone(Form("SPDmult10_%s_clone",periodNames[ip])));    
609         if (!multEstimatorAvg[ip]) {
610           AliFatal(Form("Multiplicity estimator for %s not found! Please check your estimator file",periodNames[ip]));
611           return;               
612         }
613       }
614       task->SetMultiplVsZProfileLHC13b(multEstimatorAvg[0]);
615       task->SetMultiplVsZProfileLHC13c(multEstimatorAvg[1]);
616             
617     } else {    //load multiplicity estimators for pp
618       const Char_t* periodNames[4] = {"LHC10b", "LHC10c", "LHC10d", "LHC10e"};
619       TProfile* multEstimatorAvg[4];                       
620             
621       for(Int_t ip=0; ip<4; ip++) {
622         multEstimatorAvg[ip] = (TProfile*)(fileEstimator->Get(Form("SPDmult10_%s",periodNames[ip]))->Clone(Form("SPDmult10_%s_clone",periodNames[ip])));  
623         if (!multEstimatorAvg[ip]) {
624           AliFatal(Form("Multiplicity estimator for %s not found! Please check your estimator file",periodNames[ip]));
625           return;               
626         }  
627       }
628       task->SetMultiplVsZProfileLHC10b(multEstimatorAvg[0]);
629       task->SetMultiplVsZProfileLHC10c(multEstimatorAvg[1]);
630       task->SetMultiplVsZProfileLHC10d(multEstimatorAvg[2]);
631       task->SetMultiplVsZProfileLHC10e(multEstimatorAvg[3]);
632     }
633   }
634   Printf("***************** CONTAINER SETTINGS *****************");       
635   Printf("decay channel = %d", (Int_t)task->GetDecayChannel());
636   Printf("FillFromGenerated = %d", (Int_t)task->GetFillFromGenerated());
637   Printf("Dselection = %d", (Int_t)task->GetDselection());
638   Printf("UseWeight = %d", (Int_t)task->GetUseWeight());
639   if (task->GetUseWeight()) {
640     if(funcWeight) Printf("User-defined Weight function");
641     else Printf("FONLL will be used for the weights");
642   }
643
644   Printf("Use Nch weight = %d", (Int_t)task->GetUseNchWeight());
645   Printf("Sign = %d", (Int_t)task->GetSign());
646   Printf("Centrality selection = %d", (Int_t)task->GetCentralitySelection());
647   Printf("Fake selection = %d", (Int_t)task->GetFakeSelection());
648   Printf("RejectCandidateIfNotFromQuark selection = %d", (Int_t)task->GetRejectCandidateIfNotFromQuark());
649   Printf("UseMCVertex selection = %d", (Int_t)task->GetUseMCVertex());
650   Printf("UseCascadeTask = %d", (Int_t)task->GetUseCascadeTaskForLctoV0bachelor());
651   Printf("***************END CONTAINER SETTINGS *****************\n");
652
653
654   //-----------------------------------------------------------//
655   //   create correlation matrix for unfolding - only eta-pt   //
656   //-----------------------------------------------------------//
657
658   Bool_t AcceptanceUnf = kTRUE; // unfold at acceptance level, otherwise PPR
659
660   Int_t thnDim[4];
661         
662   //first half  : reconstructed 
663   //second half : MC
664
665   thnDim[0] = iBin[0];
666   thnDim[2] = iBin[0];
667   thnDim[1] = iBin[1];
668   thnDim[3] = iBin[1];
669
670   TString nameCorr="";
671   if(!isKeepDfromB) {
672     nameCorr="CFHFcorr0";
673   }
674   else  if(isKeepDfromBOnly){
675     nameCorr= "CFHFcorr0KeepDfromBOnly";
676   }
677   else  {
678     nameCorr="CFHFcorr0allD";
679
680   }
681   nameCorr += suffix;
682
683   THnSparseD* correlation = new THnSparseD(nameCorr,"THnSparse with correlations",4,thnDim);
684   Double_t** binEdges = new Double_t[2];
685
686   // set bin limits
687
688   binEdges[0]= binLimpT;
689   binEdges[1]= binLimy;
690
691   correlation->SetBinEdges(0,binEdges[0]);
692   correlation->SetBinEdges(2,binEdges[0]);
693
694   correlation->SetBinEdges(1,binEdges[1]);
695   correlation->SetBinEdges(3,binEdges[1]);
696
697   correlation->Sumw2();
698   
699   // correlation matrix ready
700   //------------------------------------------------//
701
702   task->SetCorrelationMatrix(correlation); // correlation matrix for unfolding
703         
704   // Create and connect containers for input/output
705         
706   // ------ input data ------
707   AliAnalysisDataContainer *cinput0  = mgr->GetCommonInputContainer();
708         
709   // ----- output data -----
710         
711   TString outputfile = AliAnalysisManager::GetCommonFileName();
712   TString output1name="", output2name="", output3name="",output4name="", output5name="";
713   output2name=nameContainer;
714   output3name=nameCorr;
715   output4name= "Cuts";
716   output5name= "coutProfDst";
717   if(!isKeepDfromB) {
718     outputfile += ":PWG3_D2H_CFtaskLctoK0SpCascade";
719     output1name="CFHFchist0";
720     output3name+="_cOnly";
721     output4name+="_cOnly";
722     output5name+="_cOnly";
723   }
724   else  if(isKeepDfromBOnly){
725     outputfile += ":PWG3_D2H_CFtaskLctoK0SpCascadeKeepDfromBOnly";
726     output1name="CFHFchist0DfromB";
727     output3name+="_bOnly";
728     output4name+="_bOnly";
729     output5name+="_bOnly";
730   }
731   else{
732     outputfile += ":PWG3_D2H_CFtaskLctoK0SpCascadeKeepDfromB";
733     output1name="CFHFchist0allD";
734     output3name+="_all";
735     output4name+="_all";
736     output5name+="_all";
737   }
738
739   outputfile += suffix;
740   output1name += suffix;
741   output4name += suffix;
742   output5name += suffix;
743
744   //now comes user's output objects :
745   // output TH1I for event counting
746   AliAnalysisDataContainer *coutput1 = mgr->CreateContainer(output1name, TH1I::Class(),AliAnalysisManager::kOutputContainer,outputfile.Data());
747   // output Correction Framework Container (for acceptance & efficiency calculations)
748   AliAnalysisDataContainer *coutput2 = mgr->CreateContainer(output2name, AliCFContainer::Class(),AliAnalysisManager::kOutputContainer,outputfile.Data());
749   // Unfolding - correlation matrix
750   AliAnalysisDataContainer *coutput3 = mgr->CreateContainer(output3name, THnSparseD::Class(),AliAnalysisManager::kOutputContainer,outputfile.Data());
751   // cuts
752   AliAnalysisDataContainer *coutput4 = mgr->CreateContainer(output4name, AliRDHFCuts::Class(),AliAnalysisManager::kOutputContainer, outputfile.Data());
753   // estimators list
754   AliAnalysisDataContainer *coutput5 = mgr->CreateContainer(output5name, TList::Class(),AliAnalysisManager::kOutputContainer, outputfile.Data());
755
756   mgr->AddTask(task);
757         
758   mgr->ConnectInput(task,0,mgr->GetCommonInputContainer());
759   mgr->ConnectOutput(task,1,coutput1);
760   mgr->ConnectOutput(task,2,coutput2);
761   mgr->ConnectOutput(task,3,coutput3);
762   mgr->ConnectOutput(task,4,coutput4);
763   mgr->ConnectOutput(task,5,coutput5);
764   return task;
765         
766 }