Split: fix refs to AddTaskPhysicsSelection.C
[u/mrichter/AliRoot.git] / PWGLF / STRANGENESS / LambdaK0PbPb / MainStreamAnalysis / run.C
1 // #include <iostream>
2 // #include "AliAnalysisManager.h"
3 // #include "AliESDInputHandler.h"
4 // #include "AliMCEventHandler.h"
5 // #include "AliAnalysisGrid.h"
6 // #include "AliCentralitySelectionTask.h"
7 // #include "AliAnalysisCentralitySelector.h"
8 // #include "AliAnalysisTaskPerformanceStrange.h"
9 // #include "TString.h"
10 // #include "TChain.h"
11 // #include "TAlienCollection.h"
12 // #include <fstream>
13 // #include "TObjString.h"
14 // #include "TIterator.h"
15 // #include "TGrid.h"
16 // #include "TROOT.h"
17
18 // #include "CreateAlienHandler.C"
19 // #include 
20
21 using namespace std;
22
23 enum { kMyRunModeLocal = 0, kMyRunModeCAF, kMyRunModeGRID};
24
25 TList * listToLoad = new TList(); // Additional classes to be loaded, see InitAndLoadLibs
26
27 TChain * GetAnalysisChain(const char * incollection);
28 void InitAndLoadLibs(Int_t runMode=kMyRunModeLocal, Int_t workers=0,Bool_t debug=0) ;
29
30 void run(const char * data, const char * passOrPath, Long64_t nev = -1, Long64_t offset = 0, Bool_t debug = kFALSE, Int_t runMode = 2, Bool_t isMC = 0, Bool_t usePID = kTRUE, const char* option = "",TString customSuffix = "", Int_t workers = -1, const char * gridMode="full", Int_t binMin=0, Int_t binMax = 10)
31 {
32   // runMode:
33   //
34   // 0 local 
35   // 1 proof
36   // 2 grid
37
38   if (nev < 0)
39     nev = 1234567890;
40   InitAndLoadLibs(runMode,workers,debug);
41
42   // Create the analysis manager
43   AliAnalysisManager * mgr = new AliAnalysisManager;
44
45   // Add ESD handler
46   AliESDInputHandler* esdH = new AliESDInputHandler;
47   // Do I need any of this? 
48   // esdH->SetInactiveBranches("AliESDACORDE FMD ALIESDTZERO ALIESDZDC AliRawDataErrorLogs CaloClusters Cascades EMCALCells EMCALTrigger ESDfriend Kinks AliESDTZERO ALIESDACORDE MuonTracks TrdTracks");
49   mgr->SetInputEventHandler(esdH);
50
51   if(isMC) {
52     AliMCEventHandler* handler = new AliMCEventHandler;
53     handler->SetPreReadMode(AliMCEventHandler::kLmPreRead);
54     mgr->SetMCtruthEventHandler(handler);
55   }
56
57
58   // If we are running on grid, we need the alien handler
59   if (runMode == kMyRunModeGRID) {
60     // Create and configure the alien handler plugin
61     TGrid::Connect("alien://");// Why do I need this? Without a get a bus error...
62         gROOT->LoadMacro("CreateAlienHandler.C");
63     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(data, listToLoad, gridMode, isMC);  
64     if (!alienHandler) {
65       cout << "Cannot create alien handler" << endl;    
66       exit(1);
67     }
68     mgr->SetGridHandler(alienHandler);  
69   }
70   
71   // PID task
72   gROOT->ProcessLine(".L $ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPIDResponse.C");
73   AddTaskPIDResponse(isMC,kTRUE);
74   //AddTaskPIDResponse();
75
76
77   // Physics selection
78   gROOT->ProcessLine(".L $ALICE_ROOT/OADB/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
79   AliPhysicsSelectionTask * physicsSelectionTask = AddTaskPhysicsSelection(isMC,kTRUE,0);
80
81   // Centrality
82   gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/OADB/macros/AddTaskCentrality.C");
83   AliCentralitySelectionTask *taskCentrality = AddTaskCentrality();
84   //taskCentrality->SetPass(2);
85   if(isMC) taskCentrality->SetMCInput();
86
87   AliAnalysisCentralitySelector * centrSelector = new AliAnalysisCentralitySelector();
88   centrSelector->SetIsMC(isMC);
89   centrSelector->SetCentralityEstimator("V0M"); // Todo: add parameter to macro?
90
91   // Parse option strings
92   TString optionStr(option);
93   
94   // remove SAVE option if set
95   Bool_t doSave = kFALSE;
96
97   if (optionStr.Contains("SAVE"))
98     {
99       optionStr = optionStr(0,optionStr.Index("SAVE")) + optionStr(optionStr.Index("SAVE")+4, optionStr.Length());
100       doSave = kTRUE;
101     }
102   TString pathsuffix = "";
103   // Not used, but may be useful
104   Bool_t useMCKinematics = isMC;
105   if (optionStr.Contains("NOMCKIN")) {
106     cout << ">>>> Ignoring MC kinematics" << endl;
107     useMCKinematics=kFALSE;
108     pathsuffix+="_NOMCKIN";
109   }
110   
111   gROOT->ProcessLine(".L AddTaskLambdaK0PbPb.C");
112   Int_t nbin = 0; // will contain the number of centrality bins
113   AliAnalysisTaskPerformanceStrange ** task = AddTaskLambdaK0PbPb("lambdak0.root", centrSelector, nbin, binMin, binMax,isMC); // FIXME also pass cuts, centrality bin type selection(5,10% percentiles, ranges...)
114   // configure task
115   //  else if (iAODanalysis) task->SetAnalysisType("AOD");
116   // FIXME: add options to macro
117   // FIXME: put physics selection inside the task
118   cout << nbin << endl;
119   
120   for(Int_t ibin = 0; ibin < nbin; ibin++){
121     cout << "ibin " << ibin << "  "<< endl;//task[ibin] << endl;
122     
123     task[ibin]->SetAnalysisType("ESD");
124     cout << "1" << endl;
125     task[ibin]->SetAnalysisMC(isMC); // 0 or 1
126     cout << "2" << endl;
127     task[ibin]->SetCollidingSystems(1); // 0 =pp, 1=AA
128     cout << "3" << endl;
129     task[ibin]->SetAnalysisCut("no");
130     cout << "4" << endl;
131     task[ibin]->SetQASelector(kFALSE);
132     cout<< "5" << endl;
133     if(usePID) 
134       task[ibin]->SetUsePID("withPID"); // withPID or withoutPID
135     else
136       task[ibin]->SetUsePID("withoutPID"); // withPID or withoutPID
137         task[ibin]->SetArmenterosCut(0.2);
138     cout << "6" << endl;
139   }
140
141   // Init and run the analy
142   if (!mgr->InitAnalysis()) return;
143
144   mgr->PrintStatus();
145   
146   if (runMode == kMyRunModeLocal ) {
147     // If running in local mode, create chain of ESD files
148     cout << "RUNNING LOCAL, CHAIN" << endl;    
149     TChain * chain = GetAnalysisChain(data);
150     //    chain->Print();
151     mgr->StartAnalysis("local",chain,nev);
152   } else if (runMode == kMyRunModeCAF) {
153     mgr->StartAnalysis("proof",TString(passOrPath)+data+"#esdTree",nev);
154   } else if (runMode == kMyRunModeGRID) {
155     mgr->StartAnalysis("grid");
156   } else {
157     cout << "ERROR: unknown run mode" << endl;        
158   }
159
160   pathsuffix += customSuffix;
161
162   if (doSave) MoveOutput(data, pathsuffix.Data());
163
164   
165 }
166
167 void MoveOutput(const char * data, const char * suffix = ""){
168
169   //  TString path("output10bins/");
170   TString path("output10binsNew/");
171   path = path + TString(data).Tokenize("/")->Last()->GetName() + suffix;
172   
173   TString fileName = "lambdak0.root";
174   gSystem->mkdir(path, kTRUE);
175   gSystem->Rename(fileName, path + "/" + fileName);
176   for(Int_t ibin = 0; ibin < 20; ibin++){
177     TString fileBin = fileName;
178     fileBin.ReplaceAll(".root",Form("_%2.2d.root",ibin));
179     gSystem->Rename(fileBin, path + "/" + fileBin);    
180   }
181   
182   gSystem->Rename("event_stat.root", path + "/event_stat.root");      
183   gSystem->Rename("EventStat_temp.root", path + "/EventStat_temp.root");      
184   Printf(">>>>> Moved files to %s", path.Data());
185 }  
186
187
188
189 TChain * GetAnalysisChain(const char * incollection){
190   // Builds a chain of esd files
191   // incollection can be
192   // - a single root file
193   // - an xml collection of files on alien
194   // - a ASCII containing a list of local root files
195
196   TChain* analysisChain = 0;
197   // chain
198   analysisChain = new TChain("esdTree");
199   if (TString(incollection).Contains(".root")){
200     analysisChain->Add(incollection);
201   }
202   else if (TString(incollection).Contains("xml")){
203     TGrid::Connect("alien://");
204     TGridCollection * coll = TAlienCollection::Open (incollection);
205     while(coll->Next()){
206       analysisChain->Add(TString("alien://")+coll->GetLFN());
207     }
208   } else {
209     ifstream file_collect(incollection);
210     TString line;
211     while (line.ReadLine(file_collect) ) {
212       analysisChain->Add(line.Data());
213     }
214   }
215   analysisChain->GetListOfFiles()->Print();
216
217   return analysisChain;
218 }
219
220
221 void InitAndLoadLibs(Int_t runMode, Int_t workers,Bool_t debug) {
222   // Loads libs and par files + custom task and classes (the order is important)
223   // listToLoad->Add(new TObjString("$ALICE_ROOT/STEER/AliCentrality.cxx")); // FIXME: why do I have to load it?!?
224   listToLoad->Add(new TObjString("AliAnalysisCentralitySelector.cxx"));
225   listToLoad->Add(new TObjString("AliAnalysisTaskPerformanceStrange.cxx"));
226
227   if (runMode == kMyRunModeCAF)
228     {
229       cout << "Init in CAF mode" << endl;
230     
231       gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
232       Char_t* alienuser = gSystem->Getenv("alien_API_USER");
233       TProof * p = TProof::Open(alienuser!=0 ? Form("%s@alice-caf.cern.ch",alienuser) : "alice-caf.cern.ch", workers>0 ? Form("workers=%d",workers) : "");
234       //TProof * p = TProof::Open("skaf.saske.sk", workers>0 ? Form("workers=%d",workers) : "");    
235       p->Exec("TObject *o = gEnv->GetTable()->FindObject(\"Proof.UseMergers\"); gEnv->GetTable()->Remove(o);", kTRUE); // avoid submerging
236       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-18-AN");
237       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-20-AN");
238       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-21-AN");
239       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-28-AN");
240       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-31-AN");
241       //      gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-33-AN");
242       //      gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v5-02-04-AN");
243       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v5-02-08pA-AN");
244         gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v5-03-01-AN");
245
246       // Enable the needed package
247       // FIXME: what if I don't want to use par files?
248       gSystem->AddIncludePath("-I${ALICE_ROOT}/include/");
249       gSystem->AddIncludePath("-I${ALICE_ROOT}/STEER/");
250       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/STEERBase");
251       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/STEERBase");
252       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ESD");
253       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ESD");
254       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/AOD");
255       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/AOD");
256       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSIS");
257       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSIS");
258       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSISalice");
259       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSISalice");
260       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/CORRFW");
261       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/CORRFW");
262       // gProof->UploadPackage("~/Desktop/OADB");//FIXME
263       // gProof->EnablePackage("~/Desktop/OADB");//FIXME
264       
265     }
266   else
267     {
268       cout << "Init in Local or Grid mode" << endl;
269       gSystem->Load("libCore");
270       gSystem->Load("libTree");
271       gSystem->Load("libGeom");
272       gSystem->Load("libVMC");
273       gSystem->Load("libPhysics");
274       gSystem->Load("libSTEERBase");
275       gSystem->Load("libESD");
276       gSystem->Load("libAOD");
277       gSystem->Load("libANALYSIS");
278       gSystem->Load("libANALYSISalice");   
279
280       // gSystem->Load("libVMC");
281       gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
282       gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/STEER");
283     }
284   // Load helper classes
285   TIterator * iter = listToLoad->MakeIterator();
286   TObjString * name = 0;
287   while ((name = (TObjString *)iter->Next())) {
288     gSystem->ExpandPathName(name->String());
289     cout << name->String().Data() << endl;
290     if (runMode == kMyRunModeCAF) {
291       gProof->Load(name->String()+(debug?"++g":"+"));   
292     } else {
293       gROOT->LoadMacro(name->String()+(debug?"++g":"+"));   
294     }
295   }
296
297 }