PWGPP/CalibMacros/CPass1/runCPass1.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 # Script to run:
   4 #    1. reconstruction
   5 #    2. calibration
   6 #
   7 # Files assumed to be in working directory:
   8 # recCPass1.C          - reconstruction macro
   9 # runCalibTrain.C     - calibration/filtering macro
  10 # Arguments (run locally):
  11 #    1  - raw data file name
  12 #    2  - number of events to be processed
  13 #    3  - run number
  14
  15 # example:
  16 # runCPass1.sh raw.root  50  104892
  17
  18 #ALIEN setting
  19 # $1 = raw input filename
  20 runNum=`echo $1 | cut -d "/" -f 6 | sed 's/^0*//'`
  21
  22 if [ $# -eq 1 ]; then
  23     # alien Setup
  24     nEvents=99999999
  25     ocdbPath="raw://"
  26     triggerOptions="?Trigger=kCalibBarrel"
  27 fi
  28
  29 if [ $# -ge 4 ]; then
  30     # local setup
  31     nEvents=$2
  32     runNum=$3
  33     ocdbPath=$4
  34     triggerOptions="?Trigger=kCalibBarrel"
  35 fi
  36
  37 if [ $# -eq 5 ]; then
  38     # local setup in case we specify the trigger mask
  39     triggerOptions=$5
  40 fi
  41
  42 CHUNKNAME="$1"
  43
  44 if [ "${CHUNKNAME:0:1}" = "/" ]; then
  45     FILENAME=${CHUNKNAME##*/}
  46
  47     if [ -f "$FILENAME" ]; then
  48         # locally downloaded chunk
  49         CHUNKNAME="`pwd`/$FILENAME"
  50     else
  51         # one chunk from alien (nodownload option to the collection)
  52         CHUNKNAME="alien://$CHUNKNAME"
  53     fi
  54 fi
  55
  56 if [ -f "wn.xml" ]; then
  57     # several chunks accessed remotely
  58     CHUNKNAME="collection://wn.xml"
  59 fi
  60
  61 echo "* ************************"
  62 echo "* runCPass1.sh $*"
  63 echo "* Chunk name: $CHUNKNAME"
  64 echo "* Run number: $runNum"
  65 echo "* nEvents: $nEvents"
  66 echo "* runNum: $runNum"
  67 echo "* ocdbPath: $ocdbPath"
  68 echo "* triggerOptions: $triggerOptions"
  69 echo "* ************************"
  70
  71 mkdir Barrel OuterDet
  72
  73 if [ -f Run0_999999999_v3_s0.root ]; then
  74     echo "* TPC correction file found"
  75
  76     mkdir -p TPC/Calib/Correction
  77     mv Run0_999999999_v3_s0.root TPC/Calib/Correction/
  78
  79     for DIR in Barrel OuterDet; do
  80         mkdir -p $DIR/TPC/Calib/Correction
  81         ln -s ../../../../TPC/Calib/Correction/Run0_999999999_v3_s0.root $DIR/TPC/Calib/Correction/Run0_999999999_v3_s0.root
  82     done
  83 fi
  84
  85 echo "* PATH: $PATH"
  86 echo "* LD_LIBRARY_PATH: $LD_LIBRARY_PATH"
  87 echo
  88
  89 if [ "$2" == "OCDB" ]; then
  90     export OCDB_SNAPSHOT_CREATE="kTRUE"
  91     export OCDB_SNAPSHOT_FILENAME="OCDB.root"
  92
  93     echo "* Running AliRoot to generate the OCDB based on $CHUNKNAME"
  94
  95     echo "OCDB/recCPass1.C" >&2
  96     time aliroot -l -b -q recCPass1.C\(\"$CHUNKNAME\"\) &> rec.log
  97     exitcode=$?
  98     echo "Exit code: $exitcode"
  99
 100     echo "* Reconstruction ran in fake mode to create OCDB.root, exiting quickly now"
 101     touch OCDB.generating.job
 102
 103     if [ -f OCDB.root ]; then
 104         echo "* OCDB.root was indeed produced"
 105     else
 106         echo "* Error: OCDB.root was NOT generated !!!"
 107         exit 1
 108     fi
 109
 110     exit $exitcode
 111 fi
 112
 113 for COMMON_FILE in wn.xml localOCDBaccessConfig.C AddTaskTPCCalib.C OCDB.root QAtrain_duo.C; do
 114     if [ -f $COMMON_FILE ]; then
 115         ln -s ../$COMMON_FILE Barrel/$COMMON_FILE
 116         ln -s ../$COMMON_FILE OuterDet/$COMMON_FILE
 117     fi
 118 done
 119
 120 for BARREL_FILE in recCPass1.C runCalibTrain.C; do
 121     ln -s ../$BARREL_FILE Barrel/$BARREL_FILE
 122 done
 123
 124 for OUTER_FILE in recCPass1_OuterDet.C; do
 125     ln -s ../$OUTER_FILE OuterDet/$OUTER_FILE
 126 done
 127
 128 ####################################   Barrel   #######################################
 129
 130 cd Barrel
 131
 132 echo "* Running AliRoot to reconstruct barrel of $CHUNKNAME"
 133
 134 echo executing aliroot -l -b -q "recCPass1.C(\"$CHUNKNAME\",$nEvents,\"$ocdbPath\",\"$triggerOptions\")"
 135 time aliroot -l -b -q "recCPass1.C(\"$CHUNKNAME\",$nEvents,\"$ocdbPath\",\"$triggerOptions\")" &> ../rec.log
 136 exitcode=$?
 137 echo "Exit code: $exitcode"
 138
 139 if [ $exitcode -ne 0 ]; then
 140     exit $exitcode
 141 fi
 142
 143 mv syswatch.log ../syswatch_rec_Barrel.log
 144
 145 echo "* Running AliRoot to make calibration..."
 146
 147 echo executing aliroot -l -b -q "runCalibTrain.C($runNum,\"AliESDs.root\",\"$ocdbPath\")"
 148 time aliroot -l -b -q "runCalibTrain.C($runNum,\"AliESDs.root\",\"$ocdbPath\")" &> ../calib.log
 149 exitcode=$?
 150 echo "Exit code: $exitcode"
 151
 152 if [ $exitcode -ne 0 ]; then
 153     exit $exitcode
 154 fi
 155
 156 mv syswatch.log ../syswatch_calib.log
 157
 158 if [ -f QAtrain_duo.C ]; then
 159     echo "* Running the QA train (barrel) ..."
 160
 161     echo executing aliroot -b -q "QAtrain_duo.C(\"_barrel\",$runNum,\"wn.xml\",0,\"$ocdbPath\")"
 162     time aliroot -b -q "QAtrain_duo.C(\"_barrel\",$runNum,\"wn.xml\",0,\"$ocdbPath\")" &> ../qa_barrel.log
 163
 164     exitcode=$?
 165     echo "Exit code: $exitcode"
 166
 167     if [ $exitcode -ne 0 ]; then
 168         exit $exitcode
 169     fi
 170
 171     for file in *.stat; do
 172         mv $file ../$file.qa_barrel
 173     done
 174 fi
 175
 176 mv AliESDs.root ../AliESDs_Barrel.root
 177 mv AliESDfriends.root ../AliESDfriends_Barrel.root
 178
 179 for file in AliESDfriends_v1.root QAresults_barrel.root EventStat_temp_barrel.root AODtpITS.root; do
 180     if [ -f "$file" ]; then
 181         mv "$file" ../
 182     fi
 183 done
 184
 185 ####################################   Outer   #######################################
 186
 187 cd ../OuterDet
 188
 189 echo "* Running AliRoot to reconstruct outer of $CHUNKNAME"
 190
 191 echo executing aliroot -l -b -q "recCPass1_OuterDet.C(\"$CHUNKNAME\", $nEvents, \"$ocdbPath\")"
 192 time aliroot -l -b -q "recCPass1_OuterDet.C(\"$CHUNKNAME\", $nEvents, \"$ocdbPath\")" &> ../rec_Outer.log
 193 exitcode=$?
 194 echo "Exit code: $exitcode"
 195
 196 if [ $exitcode -ne 0 ]; then
 197     exit $exitcode
 198 fi
 199
 200 mv syswatch.log ../syswatch_rec_Outer.log
 201
 202 if [ -f QAtrain_duo.C ]; then
 203     echo "* Running the QA train (outer) ..."
 204
 205     echo executing aliroot -b -q "QAtrain_duo.C(\"_outer\",$runNum,\"wn.xml\",0,\"$ocdbPath\")"
 206     time aliroot -b -q "QAtrain_duo.C(\"_outer\",$runNum,\"wn.xml\",0,\"$ocdbPath\")" &> ../qa_outer.log
 207
 208     exitcode=$?
 209     echo "Exit code: $exitcode"
 210
 211     if [ $exitcode -ne 0 ]; then
 212         exit $exitcode
 213     fi
 214
 215     for file in *.stat ; do
 216         mv $file ../$file.qa_outer
 217     done
 218 fi
 219
 220 mv AliESDs.root ../AliESDs_Outer.root
 221 mv AliESDfriends.root ../AliESDfriends_Outer.root
 222
 223 for file in QAresults_outer.root EventStat_temp_outer.root; do
 224     if [ -f "$file" ]; then
 225         mv "$file" ../
 226     fi
 227 done
 228
 229 exit $exitcode