RALICE/AliCalorimeter.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 // Class AliCalorimeter
  20 // Description of a modular calorimeter system.
  21 // A generic 2D geometry is used in which a module is identified by (row,col).
  22 // Obviously this geometry can be a matrix, but also any other regular
  23 // structure is supported, provided the user has adopted a proper convention
  24 // to uniquely address a module via the (row,col) indices.
  25 // Note : First module is identified as (1,1).
  26 //
  27 // This is the way to define and enter signals into a calorimeter :
  28 //
  29 //   AliCalorimeter cal;
  30 //
  31 //   cal.AddSignal(5,7,85.4);
  32 //   cal.AddSignal(5,7,25.9);
  33 //   cal.AddSignal(3,5,1000);
  34 //   cal.SetSignal(5,7,10.3);
  35 //   cal.Reset(3,5);             // Reset module (3,5) as being 'not fired'
  36 //                               // All module data are re-initialised.
  37 //   cal.SetEdgeOn(1,1);         // Declare module (1,1) as an 'edge module'
  38 //   cal.SetDead(8,3);
  39 //   cal.SetGain(2,8,3.2);
  40 //
  41 //   Float_t vec[3]={6,1,20};
  42 //   cal.SetPosition(2,8,vec,"car");
  43 //
  44 //   AliSignal s;
  45 //   Float_t loc[3]={-1,12,3};
  46 //   s.SetPosition(loc,"car");
  47 //   s.SetSignal(328);
  48 //   cal.AddVetoSignal(s); // Associate (extrapolated) signal as a veto
  49 //
  50 //   cal.Group(2);      // Group 'fired' modules into clusters
  51 //                      // Perform grouping over 2 rings around the center
  52 //   cal.Reset();       // Reset the complete calorimeter
  53 //                      // Normally to prepare for the next event data
  54 //                      // Note : Module gain, offset, edge and dead flags remain
  55 //
  56 //--- Author: Nick van Eijndhoven 13-jun-1997 UU-SAP Utrecht
  57 //- Modified: NvE $Date$ UU-SAP Utrecht
  58 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  59
  60 #include "AliCalorimeter.h"
  61 #include "Riostream.h"
  62
  63 ClassImp(AliCalorimeter) // Class implementation to enable ROOT I/O
  64
  65 AliCalorimeter::AliCalorimeter() : AliDevice()
  66 {
  67 // Default constructor, all parameters set to 0.
  68 // Create a calorimeter module matrix with fixed row and column size.
  69 // Note : Due to the dynamic size extension when signals are set,
  70 //        the  "edge modules" can NOT be marked automatically.
  71 //        This has to be done manually by the user via the SetEdgeOn()
  72 //        memberfunction.
  73  fNrows=0;
  74  fNcolumns=0;
  75  fSwap=0;
  76  fMatrix=0;
  77  fClusters=0;
  78  fHmodules=0;
  79  fHclusters=0;
  80  fVetos=0;
  81  fAttributes=0;
  82  fPositions=0;
  83 }
  84 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  85 AliCalorimeter::~AliCalorimeter()
  86 {
  87 // Destructor to delete memory allocated to the various arrays and matrices
  88  if (fClusters)
  89  {
  90   delete fClusters;
  91   fClusters=0;
  92  }
  93  if (fVetos)
  94  {
  95   delete fVetos;
  96   fVetos=0;
  97  }
  98  if (fHmodules)
  99  {
 100   delete fHmodules;
 101   fHmodules=0;
 102  }
 103  if (fHclusters)
 104  {
 105   delete fHclusters;
 106   fHclusters=0;
 107  }
 108  if (fMatrix)
 109  {
 110   delete fMatrix;
 111   fMatrix=0;
 112  }
 113  if (fPositions)
 114  {
 115   delete fPositions;
 116   fPositions=0;
 117  }
 118  if (fAttributes)
 119  {
 120   delete fAttributes;
 121   fAttributes=0;
 122  }
 123 }
 124 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 125 AliCalorimeter::AliCalorimeter(Int_t nrow,Int_t ncol) : AliDevice()
 126 {
 127 // Create a calorimeter module matrix with fixed row and column size.
 128 // The modules at the edges are automatically marked as "edge modules".
 129  fNrows=nrow;
 130  fNcolumns=ncol;
 131  fClusters=0;
 132
 133  fSwap=0;
 134  fMatrix=0;
 135  fPositions=0;
 136
 137  fAttributes=new TObjArray(nrow);
 138  fAttributes->SetOwner();
 139
 140  // Mark the edge modules
 141  for (Int_t row=1; row<=nrow; row++)
 142  {
 143   AliAttribObj* a=new AliAttribObj();
 144   if (row==1 || row==nrow)
 145   {
 146    for (Int_t col=1; col<=ncol; col++)
 147    {
 148     a->SetEdgeOn(col);
 149    }
 150   }
 151   else
 152   {
 153    a->SetEdgeOn(1);
 154    a->SetEdgeOn(ncol);
 155   }
 156   fAttributes->Add(a);
 157  }
 158
 159  fHmodules=0;
 160  fHclusters=0;
 161
 162  fVetos=0;
 163 }
 164 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 165 AliCalorimeter::AliCalorimeter(const AliCalorimeter& c) : AliDevice(c)
 166 {
 167 // Copy constructor
 168  fClusters=0;
 169  fVetos=0;
 170
 171  fAttributes=0;
 172
 173  fHmodules=0;
 174  fHclusters=0;
 175
 176  fMatrix=0;
 177  fPositions=0;
 178
 179  fNrows=c.fNrows;
 180  fNcolumns=c.fNcolumns;
 181
 182  fSwap=c.fSwap;
 183
 184  if (c.fPositions)
 185  {
 186   Int_t nrows=(c.fPositions)->GetMaxRow();
 187   Int_t ncols=(c.fPositions)->GetMaxColumn();
 188   for (Int_t irow=1; irow<=nrows; irow++)
 189   {
 190    for (Int_t icol=1; icol<=ncols; icol++)
 191    {
 192     AliPosition* p=(AliPosition*)(c.fPositions->GetObject(irow,icol));
 193     if (p) SetPosition(irow,icol,*p);
 194    }
 195   }
 196  }
 197
 198  Int_t size=0;
 199  if (c.fAttributes) size=c.fAttributes->GetSize();
 200  if (size)
 201  {
 202   fAttributes=new TObjArray(size);
 203   fAttributes->SetOwner();
 204   for (Int_t ia=0; ia<size; ia++)
 205   {
 206    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)(c.fAttributes->At(ia));
 207    if (a) fAttributes->AddAt(new AliAttribObj(*a),ia);
 208   }
 209  }
 210
 211  Int_t n=0;
 212  n=c.GetNclusters();
 213  if (n)
 214  {
 215   fClusters=new TObjArray();
 216   fClusters->SetOwner();
 217   for (Int_t icl=1; icl<=n; icl++)
 218   {
 219    AliCalcluster* cl=c.GetCluster(icl);
 220    if (cl) fClusters->Add(new AliCalcluster(*cl));
 221   }
 222  }
 223
 224  n=c.GetNvetos();
 225  for (Int_t iv=1; iv<=n; iv++)
 226  {
 227   AliSignal* s=c.GetVetoSignal(iv);
 228   if (s) AddVetoSignal(s);
 229  }
 230 }
 231 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 232 Int_t AliCalorimeter::GetNrows()
 233 {
 234 // Provide the number of rows for the calorimeter module matrix
 235  Int_t nrows=fNrows;
 236  if (!fMatrix) LoadMatrix();
 237  if (fMatrix && !nrows) nrows=fMatrix->GetMaxRow();
 238  return nrows;
 239 }
 240 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 241 Int_t AliCalorimeter::GetNcolumns()
 242 {
 243 // Provide the number of columns for the calorimeter module matrix
 244  Int_t ncols=fNcolumns;
 245  if (!fMatrix) LoadMatrix();
 246  if (fMatrix && !ncols) ncols=fMatrix->GetMaxColumn();
 247  return ncols;
 248 }
 249 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 250 void AliCalorimeter::SetSignal(Int_t row,Int_t col,Float_t sig)
 251 {
 252 // Set the signal for a certain calorimeter module.
 253
 254  // Check for (row,col) boundaries.
 255  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 256  {
 257   cout << " *AliCalorimeter::SetSignal* row,col : " << row << "," << col
 258        << " out of range." << endl;
 259   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 260   return;
 261  }
 262
 263  if (!fMatrix) LoadMatrix();
 264
 265  if (!fMatrix)
 266  {
 267   fMatrix=new AliObjMatrix();
 268   fMatrix->SetSwapMode(fSwap);
 269  }
 270
 271  AliCalmodule* mx=GetModule(row,col);
 272  if (mx) // Existing module
 273  {
 274   mx->SetSignal(sig);
 275  }
 276  else // Initialise for a new module
 277  {
 278   AliCalmodule m;
 279   m.SetRow(row);
 280   m.SetColumn(col);
 281   m.SetSignal(sig);
 282   AliPosition* r=0;
 283   if (fPositions) r=(AliPositionObj*)fPositions->GetObject(row,col);
 284   if (r) m.SetPosition(*r);
 285   if (fAttributes)
 286   {
 287    AliAttribObj* a=0;
 288    if (row <= fAttributes->GetSize()) a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 289    if (a)
 290    {
 291     if (a->GetGainFlag(col)) m.SetGain(a->GetGain(col));
 292     if (a->GetOffsetFlag(col)) m.SetOffset(a->GetOffset(col));
 293     if (a->GetDeadValue(col)) m.SetDead();
 294     if (a->GetEdgeValue(col)) m.SetEdgeValue(a->GetEdgeValue(col));
 295    }
 296   }
 297   AddHit(m);
 298   fMatrix->EnterObject(row,col,fHits->Last());
 299  }
 300 }
 301 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 302 void AliCalorimeter::AddSignal(Int_t row, Int_t col, Float_t sig)
 303 {
 304 // Add the signal to a certain calorimeter module.
 305
 306  // Check for (row,col) boundaries.
 307  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 308  {
 309   cout << " *AliCalorimeter::AddSignal* row,col : " << row << "," << col
 310        << " out of range." << endl;
 311   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 312   return;
 313  }
 314
 315   AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 316   if (!m) // initialise for new modules
 317   {
 318    SetSignal(row,col,sig);
 319   }
 320   else
 321   {
 322    m->AddSignal(sig);
 323   }
 324 }
 325 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 326 void AliCalorimeter::AddSignal(AliCalmodule* mod)
 327 {
 328 // Add the signal of module mod to the current calorimeter data.
 329 // This enables mixing of calorimeter data of various events.
 330 //
 331 // Note : The position and attributes according to the user provided data
 332 //        for the corresponding (row,col) location will be used.
 333 //        In case there is no user provided data present, the position and
 334 //        attributes of the first module added to the corresponding (row,col)
 335 //        location will be taken, except for the "edge" and "dead" indicators.
 336 //        The latter will then both be set to 0.
 337
 338  if (!mod) return;
 339
 340  Int_t row=mod->GetRow();
 341  Int_t col=mod->GetColumn();
 342  Float_t sig=mod->GetSignal();
 343
 344  // Check for (row,col) boundaries.
 345  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 346  {
 347   cout << " *AliCalorimeter::AddSignal* row,col : " << row << "," << col
 348        << " out of range." << endl;
 349   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 350   return;
 351  }
 352
 353  if (!fMatrix) LoadMatrix();
 354
 355  if (!fMatrix)
 356  {
 357   fMatrix=new AliObjMatrix();
 358   fMatrix->SetSwapMode(fSwap);
 359  }
 360
 361  AliCalmodule* mx=GetModule(row,col);
 362  if (!mx) // No module existed yet at this position
 363  {
 364   AliCalmodule m(*mod);
 365   AliPosition* r=0;
 366   if (fPositions) r=(AliPositionObj*)fPositions->GetObject(row,col);
 367   if (r) m.SetPosition(*r);
 368   // Don't take the dead and edge attributes from this module,
 369   // but from the calorimeter dbase, if present.
 370   m.SetEdgeOff();
 371   m.SetAlive();
 372   if (fAttributes)
 373   {
 374    AliAttribObj* a=0;
 375    if (row <= fAttributes->GetSize()) a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 376    if (a)
 377    {
 378     if (a->GetGainFlag(col)) m.SetGain(a->GetGain(col));
 379     if (a->GetOffsetFlag(col)) m.SetOffset(a->GetOffset(col));
 380     if (a->GetDeadValue(col)) m.SetDead();
 381     if (a->GetEdgeValue(col)) m.SetEdgeValue(a->GetEdgeValue(col));
 382    }
 383   }
 384   AddHit(m);
 385   fMatrix->EnterObject(row,col,fHits->Last());
 386  }
 387  else
 388  {
 389   mx->AddSignal(sig);
 390  }
 391 }
 392 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 393 void AliCalorimeter::Reset(Int_t row,Int_t col)
 394 {
 395 // Reset the signal for a certain calorimeter module.
 396 // Note : Module position and attributes remain unchanged.
 397
 398  // Check for (row,col) boundaries.
 399  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 400  {
 401   cout << " *AliCalorimeter::Reset* row,col : " << row << "," << col
 402        << " out of range." << endl;
 403   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 404   return;
 405  }
 406
 407  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 408  if (m)
 409  {
 410   RemoveHit(m);
 411   fMatrix->RemoveObject(row,col);
 412  }
 413 }
 414 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 415 void AliCalorimeter::Reset(Int_t mode)
 416 {
 417 // Reset the signals for the complete calorimeter.
 418 // Normally this is done to prepare for the data of the next event.
 419 //
 420 // mode = 0 : Swap mode, module positions and attributes remain unchanged.
 421 //        1 : Swap mode, module positions and attributes are cleared.
 422 //
 423 // The default is mode=0.
 424 //
 425 // Note : In the case of reading AliCalorimeter objects from a data file,
 426 //        one has to reset the AliCalorimeter object with mode=1
 427 //        (or explicitly delete it) before reading-in the next object
 428 //        in order to prevent memory leaks.
 429
 430  if (mode<0 || mode>1)
 431  {
 432   cout << " *AliCalorimeter::Reset* Wrong argument. mode = " << mode << endl;
 433   return;
 434  }
 435
 436  AliDevice::Reset(mode);
 437
 438  if (fClusters)
 439  {
 440   delete fClusters;
 441   fClusters=0;
 442  }
 443
 444  if (fVetos)
 445  {
 446   delete fVetos;
 447   fVetos=0;
 448  }
 449
 450  if (mode==1)
 451  {
 452   if (fMatrix)
 453   {
 454    delete fMatrix;
 455    fMatrix=0;
 456   }
 457   if (fPositions)
 458   {
 459    delete fPositions;
 460    fPositions=0;
 461   }
 462  }
 463  else
 464  {
 465   if (fMatrix) fMatrix->Reset();
 466  }
 467
 468  // Free memory allocated for the various arrays.
 469  if (mode==1)
 470  {
 471   if (fAttributes)
 472   {
 473    delete fAttributes;
 474    fAttributes=0;
 475   }
 476   if (fHmodules)
 477   {
 478    delete fHmodules;
 479    fHmodules=0;
 480   }
 481   if (fHclusters)
 482   {
 483    delete fHclusters;
 484    fHclusters=0;
 485   }
 486  }
 487 }
 488 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 489 Float_t AliCalorimeter::GetSignal(Int_t row,Int_t col,Int_t mode)
 490 {
 491 // Provide the signal of a certain calorimeter module.
 492 // In case the module was marked dead, 0 is returned.
 493 //
 494 // mode = 0 : Just the module signal is returned
 495 //        1 : The module signal is corrected for the gain and offset.
 496 //            In case the gain value was not set, gain=1 will be assumed.
 497 //            In case the gain value was 0, a signal value of 0 is returned.
 498 //            In case the offset value was not set, offset=0 will be assumed.
 499 //
 500 // The corrected signal (sigc) is determined as follows :
 501 //
 502 //              sigc=(signal/gain)-offset
 503 //
 504 // The default is mode=0.
 505
 506  // Check for (row,col) boundaries.
 507  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 508  {
 509   cout << " *AliCalorimeter::GetSignal* row,col : " << row << "," << col
 510        << " out of range." << endl;
 511   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 512   return 0;
 513  }
 514
 515  Float_t signal=0;
 516  Float_t gain=1;
 517  Float_t offset=0;
 518  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 519  if (m)
 520  {
 521   Int_t dead=m->GetDeadValue();
 522   if (!dead) signal=m->GetSignal();
 523
 524   if (mode==0 || dead) return signal;
 525
 526   // Correct the signal for the gain and offset
 527   if (GetGainFlag(row,col))
 528   {
 529    gain=GetGain(row,col);
 530   }
 531   else
 532   {
 533    if (m->GetGainFlag()) gain=m->GetGain();
 534   }
 535
 536   if (GetOffsetFlag(row,col))
 537   {
 538    offset=GetOffset(row,col);
 539   }
 540   else
 541   {
 542    if (m->GetOffsetFlag()) offset=m->GetOffset();
 543   }
 544
 545   if (fabs(gain)>0.)
 546   {
 547    signal=(signal/gain)-offset;
 548   }
 549   else
 550   {
 551    signal=0;
 552   }
 553  }
 554  return signal;
 555 }
 556 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 557 void AliCalorimeter::SetEdgeOn(Int_t row,Int_t col)
 558 {
 559 // Indicate a certain calorimeter module as 'edge module'.
 560
 561  // Check for (row,col) boundaries.
 562  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 563  {
 564   cout << " *AliCalorimeter::SetEdgeOn* row,col : " << row << "," << col
 565        << " out of range." << endl;
 566   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 567   return;
 568  }
 569
 570  if (!fAttributes)
 571  {
 572   fAttributes=new TObjArray(row);
 573   fAttributes->SetOwner();
 574  }
 575  else
 576  {
 577   if (row > fAttributes->GetSize()) fAttributes->Expand(row);
 578  }
 579
 580  AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 581  if (a)
 582  {
 583   a->SetEdgeOn(col);
 584  }
 585  else
 586  {
 587   a=new AliAttribObj();
 588   a->SetEdgeOn(col);
 589   fAttributes->AddAt(a,row-1);
 590  }
 591
 592  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 593  if (m) m->SetEdgeOn();
 594 }
 595 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 596 void AliCalorimeter::SetEdgeOff(Int_t row,Int_t col)
 597 {
 598 // Indicate a certain calorimeter module as 'non-edge module'.
 599
 600  // Check for (row,col) boundaries.
 601  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 602  {
 603   cout << " *AliCalorimeter::SetEdgeOff* row,col : " << row << "," << col
 604        << " out of range." << endl;
 605   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 606   return;
 607  }
 608
 609  // Only action on fAttributes in case an attribute is present at (row,col),
 610  // since by default a module has edge=0 unless explicitly set otherwise.
 611  if (fAttributes)
 612  {
 613   if (row <= fAttributes->GetSize())
 614   {
 615    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 616    if (a) a->SetEdgeOff(col);
 617   }
 618  }
 619
 620  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 621  if (m) m->SetEdgeOff();
 622 }
 623 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 624 void AliCalorimeter::SetDead(Int_t row,Int_t col)
 625 {
 626 // Indicate a certain calorimeter module as 'dead module'
 627
 628  // Check for (row,col) boundaries in case of a fixed size calorimeter
 629  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 630  {
 631   cout << " *AliCalorimeter::SetDead* row,col : " << row << "," << col
 632        << " out of range." << endl;
 633   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 634   return;
 635  }
 636
 637  // Make Attributes storage 1 row (and also 1 column) larger than needed
 638  // because the 'edge value' of the (future) surrounding modules has
 639  // to be updated as well.
 640  if (!fAttributes)
 641  {
 642   fAttributes=new TObjArray(row+1);
 643   fAttributes->SetOwner();
 644  }
 645  else
 646  {
 647   if (row >= fAttributes->GetSize()) fAttributes->Expand(row+1);
 648  }
 649
 650  AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 651  if (a)
 652  {
 653   a->SetDead(col);
 654  }
 655  else
 656  {
 657   a=new AliAttribObj();
 658   a->SetDead(col);
 659   fAttributes->AddAt(a,row-1);
 660  }
 661
 662  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 663  if (m) m->SetDead();
 664
 665  // Increase the 'edge value' of surrounding modules
 666  Int_t rlow=row-1;
 667  Int_t rup=row+1;
 668  Int_t clow=col-1;
 669  Int_t cup=col+1;
 670
 671  if (rlow < 1) rlow=row;
 672  if (clow < 1) clow=col;
 673
 674  for (Int_t i=rlow; i<=rup; i++)
 675  {
 676   for (Int_t j=clow; j<=cup; j++)
 677   {
 678    if (i!=row || j!=col) // No increase of edge value for the 'dead' module itself
 679    {
 680     AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(i-1);
 681     if (a)
 682     {
 683      a->IncreaseEdgeValue(j);
 684     }
 685     else
 686     {
 687     a=new AliAttribObj();
 688     a->SetEdgeOn(j);
 689     fAttributes->AddAt(a,i-1);
 690     }
 691
 692     AliCalmodule* m=GetModule(i,j);
 693     if (m) m->IncreaseEdgeValue();
 694    }
 695   }
 696  }
 697 }
 698 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 699 void AliCalorimeter::SetAlive(Int_t row,Int_t col)
 700 {
 701 // Indicate a certain calorimeter module as 'active module'.
 702
 703  // Check for (row,col) boundaries.
 704  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 705  {
 706   cout << " *AliCalorimeter::SetAlive* row,col : " << row << "," << col
 707        << " out of range." << endl;
 708   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 709   return;
 710  }
 711
 712  // Only action on fAttributes in case an attribute is present at (row,col),
 713  // since by default a module has dead=0 unless explicitly set otherwise.
 714  if (fAttributes)
 715  {
 716   if (row <= fAttributes->GetSize())
 717   {
 718    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 719    if (a) a->SetAlive(col);
 720   }
 721  }
 722
 723  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 724  if (m) m->SetAlive();
 725
 726  // Decrease the 'edge value' of surrounding modules
 727  Int_t rlow=row-1;
 728  Int_t rup=row+1;
 729  Int_t clow=col-1;
 730  Int_t cup=col+1;
 731
 732  if (rlow < 1) rlow=row;
 733  if (clow < 1) clow=col;
 734
 735  for (Int_t i=rlow; i<=rup; i++)
 736  {
 737   for (Int_t j=clow; j<=cup; j++)
 738   {
 739    if (i!=row || j!=col) // No decrease of edge value for the 'alive' module itself
 740    {
 741     if (i <= fAttributes->GetSize())
 742     {
 743      AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(i-1);
 744      if (a) a->DecreaseEdgeValue(j);
 745     }
 746     AliCalmodule* m=GetModule(i,j);
 747     if (m) m->DecreaseEdgeValue();
 748    }
 749   }
 750  }
 751 }
 752 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 753 void AliCalorimeter::SetGain(Int_t row,Int_t col,Float_t gain)
 754 {
 755 // Set the gain value for a certain calorimeter module.
 756 // See the memberfunction GetSignal() for a definition of the gain value.
 757
 758  // Check for (row,col) boundaries.
 759  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 760  {
 761   cout << " *AliCalorimeter::SetGain* row,col : " << row << "," << col
 762        << " out of range." << endl;
 763   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 764   return;
 765  }
 766
 767  if (!fAttributes)
 768  {
 769   fAttributes=new TObjArray(row);
 770   fAttributes->SetOwner();
 771  }
 772  else
 773  {
 774   if (row > fAttributes->GetSize()) fAttributes->Expand(row);
 775  }
 776
 777  AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 778  if (a)
 779  {
 780   a->SetGain(gain,col);
 781  }
 782  else
 783  {
 784   a=new AliAttribObj();
 785   a->SetGain(gain,col);
 786   fAttributes->AddAt(a,row-1);
 787  }
 788
 789  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 790  if (m) m->SetGain(gain);
 791 }
 792 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 793 void AliCalorimeter::SetOffset(Int_t row,Int_t col,Float_t offset)
 794 {
 795 // Set the offset value for a certain calorimeter module.
 796 // See the memberfunction GetSignal() for a definition of the offset value.
 797
 798  // Check for (row,col) boundaries.
 799  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 800  {
 801   cout << " *AliCalorimeter::SetOffset* row,col : " << row << "," << col
 802        << " out of range." << endl;
 803   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 804   return;
 805  }
 806
 807  if (!fAttributes)
 808  {
 809   fAttributes=new TObjArray(row);
 810   fAttributes->SetOwner();
 811  }
 812  else
 813  {
 814   if (row > fAttributes->GetSize()) fAttributes->Expand(row);
 815  }
 816
 817  AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 818  if (a)
 819  {
 820   a->SetOffset(offset,col);
 821  }
 822  else
 823  {
 824   a=new AliAttribObj();
 825   a->SetOffset(offset,col);
 826   fAttributes->AddAt(a,row-1);
 827  }
 828
 829  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 830  if (m) m->SetOffset(offset);
 831 }
 832 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 833 void AliCalorimeter::SetPosition(Int_t row,Int_t col,Float_t* vec,TString f)
 834 {
 835 // Set the position in user coordinates for a certain calorimeter module
 836  Ali3Vector r;
 837  r.SetVector(vec,f);
 838  SetPosition(row,col,r);
 839 }
 840 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 841 void AliCalorimeter::SetPosition(Int_t row,Int_t col,Ali3Vector& r)
 842 {
 843 // Set the position for a certain calorimeter module
 844
 845  // Check for (row,col) boundaries.
 846  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 847  {
 848   cout << " *AliCalorimeter::SetPosition* row,col : " << row << "," << col
 849        << " out of range." << endl;
 850   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 851   return;
 852  }
 853
 854  if (!fPositions)
 855  {
 856   fPositions=new AliObjMatrix();
 857   fPositions->SetOwner();
 858   fPositions->SetSwapMode(fSwap);
 859  }
 860
 861  AliPositionObj* p=(AliPositionObj*)fPositions->GetObject(row,col);
 862
 863  if (p)
 864  {
 865   p->Load(r);
 866  }
 867  else
 868  {
 869   p=new AliPositionObj();
 870   p->Load(r);
 871   fPositions->EnterObject(row,col,p);
 872  }
 873
 874  // Update the position of the calorimeter module itself as well if it exists
 875  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 876  if (m) m->SetPosition(r);
 877 }
 878 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 879 Int_t AliCalorimeter::GetEdgeValue(Int_t row,Int_t col)
 880 {
 881 // Provide the value of the edge flag of a certain module.
 882
 883  // Check for (row,col) boundaries.
 884  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 885  {
 886   cout << " *AliCalorimeter::GetEdgeValue* row,col : " << row << "," << col
 887        << " out of range." << endl;
 888   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 889   return 0;
 890  }
 891
 892  Int_t edge=0;
 893
 894  if (fAttributes)
 895  {
 896   if (row <= fAttributes->GetSize())
 897   {
 898    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 899    if (a)
 900    {
 901     if (col <= a->GetNcalflags())
 902     {
 903      edge=a->GetEdgeValue(col);
 904      return edge;
 905     }
 906    }
 907   }
 908  }
 909
 910  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 911  if (m) edge=m->GetEdgeValue();
 912  return edge;
 913 }
 914 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 915 Int_t AliCalorimeter::GetDeadValue(Int_t row,Int_t col)
 916 {
 917 // Provide the value of the dead flag of a certain module
 918
 919  // Check for (row,col) boundaries.
 920  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 921  {
 922   cout << " *AliCalorimeter::GetDeadValue* row,col : " << row << "," << col
 923        << " out of range." << endl;
 924   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 925   return 0;
 926  }
 927
 928  Int_t dead=0;
 929
 930  if (fAttributes)
 931  {
 932   if (row <= fAttributes->GetSize())
 933   {
 934    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 935    if (a)
 936    {
 937     if (col <= a->GetNcalflags())
 938     {
 939      dead=a->GetDeadValue(col);
 940      return dead;
 941     }
 942    }
 943   }
 944  }
 945
 946  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 947  if (m) dead=m->GetDeadValue();
 948  return dead;
 949 }
 950 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 951 Int_t AliCalorimeter::GetGainFlag(Int_t row,Int_t col)
 952 {
 953 // Provide the value of the gain flag of a certain module.
 954
 955  // Check for (row,col) boundaries.
 956  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 957  {
 958   cout << " *AliCalorimeter::GetGainFlag* row,col : " << row << "," << col
 959        << " out of range." << endl;
 960   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 961   return 0;
 962  }
 963
 964  Int_t gf=0;
 965
 966  if (fAttributes)
 967  {
 968   if (row <= fAttributes->GetSize())
 969   {
 970    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
 971    if (a)
 972    {
 973     if (col <= a->GetNcalflags())
 974     {
 975      gf=a->GetGainFlag(col);
 976      return gf;
 977     }
 978    }
 979   }
 980  }
 981
 982  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
 983  if (m) gf=m->GetGainFlag();
 984  return gf;
 985 }
 986 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 987 Int_t AliCalorimeter::GetOffsetFlag(Int_t row,Int_t col)
 988 {
 989 // Provide the value of the offset flag of a certain module.
 990
 991  // Check for (row,col) boundaries.
 992  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
 993  {
 994   cout << " *AliCalorimeter::GetOffsetFlag* row,col : " << row << "," << col
 995        << " out of range." << endl;
 996   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
 997   return 0;
 998  }
 999
1000  Int_t of=0;
1001
1002  if (fAttributes)
1003  {
1004   if (row <= fAttributes->GetSize())
1005   {
1006    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
1007    if (a)
1008    {
1009     if (col <= a->GetNcalflags())
1010     {
1011      of=a->GetOffsetFlag(col);
1012      return of;
1013     }
1014    }
1015   }
1016  }
1017
1018  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
1019  if (m) of=m->GetOffsetFlag();
1020  return of;
1021 }
1022 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1023 Float_t AliCalorimeter::GetGain(Int_t row,Int_t col)
1024 {
1025 // Provide the gain value of a certain module.
1026 // See the memberfunction GetSignal() for a definition of the gain value.
1027 //
1028 // In case the gain value is unknown, the value 0 will be returned.
1029
1030  // Check for (row,col) boundaries.
1031  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
1032  {
1033   cout << " *AliCalorimeter::GetGain* row,col : " << row << "," << col
1034        << " out of range." << endl;
1035   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
1036   return 0;
1037  }
1038
1039  Float_t gain=0;
1040
1041  if (fAttributes)
1042  {
1043   if (row <= fAttributes->GetSize())
1044   {
1045    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
1046    if (a)
1047    {
1048     if (col <= a->GetNcalflags())
1049     {
1050      if (a->GetGainFlag(col))
1051      {
1052       gain=a->GetGain(col);
1053       return gain;
1054      }
1055     }
1056    }
1057   }
1058  }
1059
1060  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
1061  if (m)
1062  {
1063   if (m->GetGainFlag())
1064   {
1065    gain=m->GetGain();
1066   }
1067  }
1068  return gain;
1069 }
1070 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1071 Float_t AliCalorimeter::GetOffset(Int_t row,Int_t col)
1072 {
1073 // Provide the offset value of a certain module.
1074 // See the memberfunction GetSignal() for a definition of the offset value.
1075 //
1076 // In case the offset value is unknown, the value 0 will be returned.
1077
1078  // Check for (row,col) boundaries.
1079  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
1080  {
1081   cout << " *AliCalorimeter::GetOffset* row,col : " << row << "," << col
1082        << " out of range." << endl;
1083   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
1084   return 0;
1085  }
1086
1087  Float_t offset=0;
1088
1089  if (fAttributes)
1090  {
1091   if (row <= fAttributes->GetSize())
1092   {
1093    AliAttribObj* a=(AliAttribObj*)fAttributes->At(row-1);
1094    if (a)
1095    {
1096     if (col <= a->GetNcalflags())
1097     {
1098      if (a->GetOffsetFlag(col))
1099      {
1100       offset=a->GetOffset(col);
1101       return offset;
1102      }
1103     }
1104    }
1105   }
1106  }
1107
1108  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
1109  if (m)
1110  {
1111   if (m->GetOffsetFlag())
1112   {
1113    offset=m->GetOffset();
1114   }
1115  }
1116  return offset;
1117 }
1118 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1119 void AliCalorimeter::GetPosition(Int_t row,Int_t col,Float_t* vec,TString f)
1120 {
1121 // Return the position in user coordinates for a certain calorimeter module
1122  vec[0]=0;
1123  vec[1]=0;
1124  vec[2]=0;
1125
1126  AliPosition* p=GetPosition(row,col);
1127  if (p) p->GetVector(vec,f);
1128 }
1129 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1130 AliPosition* AliCalorimeter::GetPosition(Int_t row,Int_t col)
1131 {
1132 // Access to the position of a certain calorimeter module.
1133
1134  // Check for (row,col) boundaries.
1135  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
1136  {
1137   cout << " *AliCalorimeter::GetPosition* row,col : " << row << "," << col
1138        << " out of range." << endl;
1139   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
1140   return 0;
1141  }
1142
1143  AliPositionObj* po=0;
1144  if (fPositions) po=(AliPositionObj*)fPositions->GetObject(row,col);
1145  if (po) return po;
1146
1147  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
1148  return m;
1149 }
1150 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1151 Float_t AliCalorimeter::GetClusteredSignal(Int_t row,Int_t col)
1152 {
1153 // Provide the module signal after clustering.
1154
1155  // Check for (row,col) boundaries.
1156  if (row<1 || col<1 || (fNrows && fNcolumns && (row>fNrows || col>fNcolumns)))
1157  {
1158   cout << " *AliCalorimeter::GetClusteredSignal* row,col : " << row << "," << col
1159        << " out of range." << endl;
1160   if (fNrows && fNcolumns) cout << " Nrows,Ncols = " << fNrows << "," << fNcolumns << endl;
1161   return 0;
1162  }
1163
1164  Float_t sig=0;
1165
1166  AliCalmodule* m=GetModule(row,col);
1167  if (m) sig=m->GetClusteredSignal();
1168
1169  return sig;
1170 }
1171 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1172 Int_t AliCalorimeter::GetNsignals() const
1173 {
1174 // Provide the number of modules that contain a signal
1175 // Note : The number of modules marked 'dead' but which had a signal
1176 //        are included.
1177  return GetNhits();
1178 }
1179 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1180 void AliCalorimeter::Group(Int_t n,Int_t mode)
1181 {
1182 // Group the individual modules into clusters.
1183 // Module signals of n rings around the central module will be grouped.
1184 // The grouping process will start with the module containing the highest signal
1185 // in an iterative way.
1186 // For this all fired modules are ordered w.r.t. decreasing signal.
1187 // The search mode for the module signal hierarchy can be specified by the user.
1188 //
1189 // mode = 1 : Search performed via the (row,col) structure of the matrix (SortM)
1190 //        2 : Search performed via the linear array of fired modules (SortA)
1191 //
1192 // See the docs of the memberfunctions SortM and SortA for additional details.
1193 //
1194 // Default values : n=1 mode=1.
1195
1196  if (mode<1 || mode>2)
1197  {
1198   cout << " *AliCalorimeter::Group* Invalid mode : " << mode << endl;
1199   cout << " Default value mode=1 will be used." << endl;
1200   mode=1;
1201  }
1202
1203  if (fClusters)
1204  {
1205   delete fClusters;
1206   fClusters=0;
1207  }
1208
1209  if (!fMatrix) LoadMatrix();
1210
1211  if (!fMatrix) return;
1212
1213  Int_t nsignals=GetNsignals();
1214  if (nsignals > 0) // Only continue if there are fired modules
1215  {
1216   if (GetNclusters() > 0) Ungroup(); // Restore unclustered situation if needed
1217
1218   // Order the modules with decreasing signal
1219   if (mode==1) SortM();
1220   if (mode==2) SortA();
1221
1222   Int_t nord=0;
1223   if (fOrdered) nord=fOrdered->GetEntries();
1224
1225   // Clustering of modules. Start with the highest signal.
1226   fClusters=new TObjArray();
1227   fClusters->SetOwner();
1228   Int_t row=0;
1229   Int_t col=0;
1230   AliCalcluster* c=0;
1231   for (Int_t i=0; i<nord; i++)
1232   {
1233    AliCalmodule* m=(AliCalmodule*)fOrdered->At(i);
1234    if (!m) continue;
1235
1236    row=m->GetRow();    // row number of cluster center
1237    col=m->GetColumn(); // column number of cluster center
1238
1239    // only use modules not yet used in a cluster
1240    if (m->GetClusteredSignal() > 0.)
1241    {
1242     Int_t edge=GetEdgeValue(row,col);
1243     c=new AliCalcluster();
1244     if (!edge) c->Start(*m);   // module to start the cluster if not on edge
1245     if (c->GetNmodules() > 0)  // cluster started successfully (no edge)
1246     {
1247      fClusters->Add(c);
1248      AddRing(row,col,n); // add signals of n rings around the center
1249     }
1250     else
1251     {
1252      if (c) delete c;
1253      c=0;
1254     }
1255    }
1256   }
1257  }
1258 }
1259 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1260 void AliCalorimeter::SortM()
1261 {
1262 // Order the modules with decreasing signal by looping over the (row,col) grid
1263 // of the matrix.
1264 // Modules which were declared as "Dead" will be rejected.
1265 // The gain etc... corrected module signals will be used in the ordering process.
1266 //
1267 // Note : This method may become slow for large, very finely granulated calorimeters.
1268 //
1269 // Very specific case :
1270 // ====================
1271 // In case of various overlapping showers of which the central modules have
1272 // EXACTLY the same signal this ordering procedure may have the following
1273 // advantages and disadvantages.
1274 //
1275 // Advantages :
1276 // ------------
1277 // * In case of multi-overlapping showers, the central shower will NOT
1278 //   be "eaten-up" from both sides, resulting in a slightly more accurate
1279 //   cluster signal.
1280 // * This method produces re-producable results, irrespective of the filling
1281 //   order of the matrix modules.
1282 //
1283 // Disadvantages :
1284 // ---------------
1285 // * In case of a very high occupancy, there might be a slight effect on the
1286 //   cluster signals depending on the geometrical location in the detector matrix.
1287
1288  if (fOrdered)
1289  {
1290   delete fOrdered;
1291   fOrdered=0;
1292  }
1293
1294  Int_t nrows=fMatrix->GetMaxRow();
1295  Int_t ncols=fMatrix->GetMaxColumn();
1296
1297  Float_t signal=0.;
1298  Int_t nord=0;
1299  for (Int_t irow=1; irow<=nrows; irow++) // loop over all modules of the matrix
1300  {
1301   for (Int_t icol=1; icol<=ncols; icol++)
1302   {
1303    AliCalmodule* m=(AliCalmodule*)fMatrix->GetObject(irow,icol);
1304    if (!m) continue;
1305
1306    signal=m->GetSignal(1,1);   // get the gain etc... corrected signal
1307    if (signal <= 0.) continue; // only take alive modules with a signal
1308
1309    if (nord == 0) // store the first module with a signal at the first ordered position
1310    {
1311     if (!fOrdered)
1312     {
1313      Int_t nhits=GetNhits();
1314      fOrdered=new TObjArray(nhits);
1315     }
1316     nord++;
1317     fOrdered->AddAt(m,nord-1);
1318     continue;
1319    }
1320
1321    for (Int_t j=0; j<=nord; j++) // put module in the right ordered position
1322    {
1323     if (j == nord) // module has smallest signal seen so far
1324     {
1325      nord++;
1326      fOrdered->AddAt(m,j); // add module at the end
1327      break; // go for next matrix module
1328     }
1329
1330     if (signal < ((AliCalmodule*)fOrdered->At(j))->GetSignal(1,1)) continue;
1331
1332     nord++;
1333     for (Int_t k=nord-1; k>j; k--) // create empty position
1334     {
1335      fOrdered->AddAt(fOrdered->At(k-1),k);
1336     }
1337     fOrdered->AddAt(m,j); // put module at empty position
1338     break; // go for next matrix module
1339    }
1340   }
1341  }
1342 }
1343 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1344 void AliCalorimeter::SortA()
1345 {
1346 // Order the modules with decreasing signal by looping over the linear array
1347 // of fired modules.
1348 // Modules which were declared as "Dead" will be rejected.
1349 // The gain etc... corrected module signals will be used in the ordering process.
1350 //
1351 // Note : This method is rather fast even for large, very finely granulated calorimeters.
1352 //
1353 // Very specific case :
1354 // ====================
1355 // In case of various overlapping showers of which the central modules have
1356 // EXACTLY the same signal this ordering procedure may have the following
1357 // advantages and disadvantages.
1358 //
1359 // Advantages :
1360 // ------------
1361 // * Even in case of a very high occupancy, the resulting cluster signals
1362 //   will in general NOT depend on the geometrical location in the detector matrix.
1363 //
1364 // Disadvantages :
1365 // ---------------
1366 // * In case of multi-overlapping showers, the central shower might be
1367 //   "eaten-up" from both sides, resulting in a slightly too low value
1368 //   of the resulting cluster signal.
1369 // * This method might produce results depending on the filling
1370 //   order of the matrix modules.
1371
1372  SortHits();
1373 }
1374 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1375 void AliCalorimeter::AddRing(Int_t row, Int_t col, Int_t n)
1376 {
1377 // Add module signals of 1 ring around (row,col) to current cluster.
1378 // The gain etc... corrected module signals will be used in this process.
1379 // The parameter n denotes the maximum number of rings around cluster center.
1380 // Note : This function is used recursively.
1381
1382  if (!fMatrix) return;
1383
1384  Int_t nrows=fMatrix->GetMaxRow();
1385  Int_t ncols=fMatrix->GetMaxColumn();
1386
1387  if (n >= 1) // Check if any rings left for recursive calls
1388  {
1389   Float_t signal=GetSignal(row,col,1); // Gain etc... corrected signal of (row,col) module
1390
1391   Int_t lrow=row-1; if (lrow < 1) lrow=1;         // row lowerbound for ring
1392   Int_t urow=row+1; if (urow > nrows) urow=nrows; // row upperbound for ring
1393   Int_t lcol=col-1; if (lcol < 1) lcol=1;         // col lowerbound for ring
1394   Int_t ucol=col+1; if (ucol > ncols) ucol=ncols; // row upperbound for ring
1395
1396   for (Int_t i=lrow; i<=urow; i++)
1397   {
1398    for (Int_t j=lcol; j<=ucol; j++)
1399    {
1400     // add module(i,j) to cluster if the signal <= signal(row,col)
1401     if (GetSignal(i,j,1) <= signal)
1402     {
1403      AliCalmodule* m=(AliCalmodule*)fMatrix->GetObject(i,j);
1404      if (m) ((AliCalcluster*)fClusters->At(GetNclusters()-1))->Add(*m);
1405     }
1406     AddRing(i,j,n-1); // Go for ring of modules around this (i,j) one
1407    }
1408   }
1409  }
1410 }
1411 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1412 Int_t AliCalorimeter::GetNclusters() const
1413 {
1414 // Provide the number of clusters
1415  Int_t nclu=0;
1416  if (fClusters) nclu=fClusters->GetEntries();
1417  return nclu;
1418 }
1419 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1420 AliCalcluster* AliCalorimeter::GetCluster(Int_t j) const
1421 {
1422 // Provide cluster number j
1423 // Note : j=1 denotes the first cluster
1424
1425  if (!fClusters) return 0;
1426
1427  if ((j >= 1) && (j <= GetNclusters()))
1428  {
1429   return (AliCalcluster*)fClusters->At(j-1);
1430  }
1431  else
1432  {
1433   cout << " *AliCalorimeter::GetCluster* cluster number : " << j
1434        << " out of range ==> 0 returned." << endl;
1435   return 0;
1436  }
1437 }
1438 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1439 AliCalmodule* AliCalorimeter::GetModule(Int_t j) const
1440 {
1441 // Provide 'fired' module number j
1442 // Note : j=1 denotes the first 'fired' module
1443
1444  AliCalmodule* m=(AliCalmodule*)GetHit(j);
1445  return m;
1446 }
1447 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1448 AliCalmodule* AliCalorimeter::GetModule(Int_t row,Int_t col)
1449 {
1450 // Provide access to module (row,col).
1451 // Note : first module is at (1,1).
1452
1453  AliCalmodule* m=0;
1454  if (!fMatrix) LoadMatrix();
1455  if (fMatrix) m=(AliCalmodule*)fMatrix->GetObject(row,col);
1456  return m;
1457 }
1458 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1459 TH2F* AliCalorimeter::DrawModules(Float_t thresh,Int_t mode)
1460 {
1461 // Provide a lego plot of the module signals.
1462 // The input parameter mode (default mode=0) has the same meaning as
1463 // specified in the memberfunction GetSignal(row,col,mode).
1464 // Only modules with a (corrected) signal value above the threshold
1465 // (default thresh=0) will be displayed.
1466
1467  Int_t nrows=fNrows;
1468  Int_t ncols=fNcolumns;
1469
1470  if (!fMatrix) LoadMatrix();
1471
1472  if (fMatrix && !nrows && !ncols)
1473  {
1474   nrows=fMatrix->GetMaxRow();
1475   ncols=fMatrix->GetMaxColumn();
1476  }
1477
1478  if (fHmodules)
1479  {
1480   fHmodules->Reset();
1481  }
1482  else
1483  {
1484   fHmodules=new TH2F("fHmodules","Module signals",
1485             ncols,0.5,float(ncols)+0.5,nrows,0.5,float(nrows)+0.5);
1486
1487   fHmodules->SetDirectory(0); // Suppress global character of histo pointer
1488  }
1489
1490  Int_t nmods=GetNsignals();
1491
1492  Int_t row,col;
1493  Float_t signal;
1494  Int_t dead;
1495  for (Int_t i=1; i<=nmods; i++)
1496  {
1497   AliCalmodule* m=(AliCalmodule*)fMatrix->GetObject(i);
1498   if (m)
1499   {
1500    row=m->GetRow();
1501    col=m->GetColumn();
1502    dead=m->GetDeadValue();
1503    signal=0;
1504    if (!dead) signal=GetSignal(row,col,mode);
1505    if (signal>thresh) fHmodules->Fill(float(col),float(row),signal);
1506   }
1507  }
1508
1509  fHmodules->Draw("lego");
1510  return fHmodules;
1511 }
1512 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1513 TH2F* AliCalorimeter::DrawClusters(Float_t thresh)
1514 {
1515 // Provide a lego plot of the cluster signals.
1516 // Only clusters with a signal value above the threshold (default thresh=0)
1517 // will be displayed.
1518
1519  Int_t nrows=fNrows;
1520  Int_t ncols=fNcolumns;
1521
1522  if (!fMatrix) LoadMatrix();
1523
1524  if (fMatrix && !nrows && !ncols)
1525  {
1526   nrows=fMatrix->GetMaxRow();
1527   ncols=fMatrix->GetMaxColumn();
1528  }
1529
1530  if (fHclusters)
1531  {
1532   fHclusters->Reset();
1533  }
1534  else
1535  {
1536   fHclusters=new TH2F("fHclusters","Cluster signals",
1537             ncols,0.5,float(ncols)+0.5,nrows,0.5,float(nrows)+0.5);
1538
1539   fHclusters->SetDirectory(0); // Suppress global character of histo pointer
1540  }
1541
1542  AliCalcluster* c;
1543  Int_t row,col;
1544  Float_t signal;
1545  for (Int_t i=0; i<GetNclusters(); i++)
1546  {
1547   c=(AliCalcluster*)fClusters->At(i);
1548   if (c)
1549   {
1550    row=c->GetRow();
1551    col=c->GetColumn();
1552    signal=c->GetSignal();
1553    if (signal>thresh) fHclusters->Fill(float(col),float(row),signal);
1554   }
1555  }
1556
1557  fHclusters->Draw("lego");
1558  return fHclusters;
1559 }
1560 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1561 void AliCalorimeter::Ungroup()
1562 {
1563 // Set the module signals back to the non-clustered situation
1564
1565  if (!fMatrix) LoadMatrix();
1566
1567  if (!fMatrix) return;
1568
1569  Int_t nsig=GetNsignals();
1570
1571  Float_t signal=0;
1572  for (Int_t j=1; j<=nsig; j++)
1573  {
1574   AliCalmodule* m=(AliCalmodule*)fMatrix->GetObject(j);
1575   if (m)
1576   {
1577    signal=m->GetSignal();
1578    m->SetClusteredSignal(signal);
1579   }
1580  }
1581 }
1582 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1583 void AliCalorimeter::AddVetoSignal(AliSignal& s)
1584 {
1585 // Associate an (extrapolated) AliSignal as veto to the calorimeter.
1586  if (!fVetos)
1587  {
1588   fVetos=new TObjArray();
1589   fVetos->SetOwner();
1590  }
1591
1592  AliSignal* sx=new AliSignal(s);
1593
1594  fVetos->Add(sx);
1595 }
1596 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1597 Int_t AliCalorimeter::GetNvetos() const
1598 {
1599 // Provide the number of veto signals associated to the calorimeter.
1600  Int_t nvetos=0;
1601  if (fVetos) nvetos=fVetos->GetEntries();
1602  return nvetos;
1603 }
1604 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1605 AliSignal* AliCalorimeter::GetVetoSignal(Int_t i) const
1606 {
1607 // Provide access to the i-th veto signal of this calorimeter
1608 // Note : The first hit corresponds to i=1
1609
1610  if (i>0 && i<=GetNvetos())
1611  {
1612   return (AliSignal*)fVetos->At(i-1);
1613  }
1614  else
1615  {
1616   cout << " *AliCalorimeter::GetVetoSignal* Signal number " << i
1617        << " out of range ==> 0 returned." << endl;
1618   return 0;
1619  }
1620 }
1621 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1622 void AliCalorimeter::SetMatrixSwapMode(Int_t swap)
1623 {
1624 // Set the swap mode for the module and position matrices.
1625 // At invokation of this memberfunction the default argument is swap=1.
1626 // For further details see the documentation of AliObjMatrix.
1627  if (swap==0 || swap==1)
1628  {
1629   fSwap=swap;
1630  }
1631  else
1632  {
1633   cout << " *AliCalorimeter::SetMatrixSwapMode* Invalid argument : swap = " << swap << endl;
1634  }
1635 }
1636 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1637 Int_t AliCalorimeter::GetMatrixSwapMode() const
1638 {
1639 // Provide the swap mode for the module and position matrices.
1640 // For further details see the documentation of AliObjMatrix.
1641  return fSwap;
1642 }
1643 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1644 void AliCalorimeter::LoadMatrix()
1645 {
1646 // Load the matrix lookup table of module pointers from the linear hit array.
1647  Int_t nhits=GetNhits();
1648
1649  if (!nhits) return;
1650
1651  fMatrix=new AliObjMatrix();
1652  fMatrix->SetSwapMode(fSwap);
1653
1654  Int_t row=0;
1655  Int_t col=0;
1656  for (Int_t i=1; i<=nhits; i++)
1657  {
1658   AliCalmodule* m=(AliCalmodule*)GetHit(i);
1659   if (m)
1660   {
1661    row=m->GetRow();
1662    col=m->GetColumn();
1663    fMatrix->EnterObject(row,col,m);
1664   }
1665  }
1666 }
1667 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1668 TObject* AliCalorimeter::Clone(const char* name) const
1669 {
1670 // Make a deep copy of the current object and provide the pointer to the copy.
1671 // This memberfunction enables automatic creation of new objects of the
1672 // correct type depending on the object type, a feature which may be very useful
1673 // for containers like AliEvent when adding objects in case the
1674 // container owns the objects.
1675
1676  AliCalorimeter* cal=new AliCalorimeter(*this);
1677  if (name)
1678  {
1679   if (strlen(name)) cal->SetName(name);
1680  }
1681  return cal;
1682 }
1683 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////