05-aug-2005 NvE Typos fixed in AliAttrib::GetCalFunction and AliAttrib::GetDecalFunct...
[u/mrichter/AliRoot.git] / RALICE / AliSignal.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 // $Id$
17
18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 // Class AliSignal
20 // Generic handling of (extrapolated) detector signals.
21 //
22 // The user can decide to store either calibrated or uncalibrated signals.
23 // Via the specification of a gain and offset or/and an explicit
24 // (de)calibration function both calibrated and uncalibrated signals
25 // can always be obtained. For details see the documentation of the
26 // memberfunction GetSignal() and the class AliAttrib.
27 // The explicit specification of a (de)calibration function offers the
28 // maximum flexibility and also allows automatic indication whether
29 // calibrated or uncalibrated data has been stored.
30 // The latter can be achieved by only specifying a calibration function
31 // (and no de-calibration function) in case uncalibrated data is stored,
32 // whereas in case of stored calibrated data the user should only
33 // provide a de-calibration function (and no calibration function).
34 //
35 // Note :
36 // ------
37 // Signal positions (r) and reference frames (f) are specified via
38 // SetPosition(r,f) under the following conventions :
39 //
40 // f="car" ==> r is Cartesian   (x,y,z)
41 // f="sph" ==> r is Spherical   (r,theta,phi)
42 // f="cyl" ==> r is Cylindrical (rho,phi,z)
43 //
44 // The same holds for SetPositionErrors().
45 //
46 // All angles are in radians.
47 //
48 // Example :
49 // ---------
50 //
51 // AliSignal s;
52 // s.SetName("Start counter");
53 // Float_t pos[3]={-1,25,7};
54 // Float_t err[3]={0.03,0.7,0.18};
55 // Float_t signal=120.8;
56 // Float_t error=1.73;
57 // Float_t offset=-12.78;
58 // Float_t gain=250;
59 // s.SetPosition(pos,"car");
60 // s.SetPositionErrors(err,"car");
61 // s.SetSignal(signal);
62 // s.SetSignalError(error);
63 // s.SetOffset(offset);
64 // s.SetGain(gain);
65 // Float_t loc[3],dr[3],sigma;
66 // s.GetPosition(loc,"sph");
67 // s.GetPositionErrors(dr,"sph");
68 // Float_t adc=s.GetSignal();
69 // Float_t sigma=s.GetSignalError();
70 //
71 // AliSignal q;    // In the example below a signal contains the
72 //                 // following data : timing, ADC and dE/dx
73 // q.SetNameTitle("Hybrid","Test for multiple signal data");
74 // q.SetPosition(pos,"car");
75 // q.SetPositionErrors(err,"car");
76 // signal=82.5; // e.g. signal time in ns
77 // error=2.01;
78 // offset=0.003;
79 // q.SetSlotName("TOF",1);
80 // q.SetSignal(signal,1);
81 // q.SetSignalError(error,1);
82 // q.SetOffset(offset,1);
83 // signal=268.1; // e.g. ADC value of signal
84 // error=3.75;
85 // gain=120.78;
86 // offset=1.5732;
87 // // Addressing via name specification instead of index 
88 // q.SetSlotName("ADC",2);
89 // q.SetSignal(signal,"ADC");
90 // q.SetSignalError(error,"ADC");
91 // q.SetGain(gain,"ADC");
92 // q.SetOffset(offset,"ADC");
93 // signal=23.7; // e.g. corresponding dE/dx value
94 // error=0.48;
95 // TF1 f=("calib","[0]*pow(x,2)+[1]"); // dE/dx calib. function
96 // f.SetParameter(0,3.285);
97 // f.SetParameter(1,-18.67);
98 // q.SetSlotName("dE/dx",3);
99 // q.SetCalFunction(&f,"dE/dx");
100 // q.SetSignal(signal,"dE/dx");
101 // q.SetSignalError(error,"dE/dx");
102 //
103 // // Signal retrieval with various (de)calibration modes
104 // Float_t tof=q.GetSignal("TOF");
105 // Float_t adc=q.GetSignal("ADC",1);
106 // Float_t dedx=q.GetSignal("dE/dx",3);
107 //
108 //--- Author: Nick van Eijndhoven 23-jan-1999 UU-SAP Utrecht
109 //- Modified: NvE $Date$ UU-SAP Utrecht
110 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
111
112 #include "AliSignal.h"
113 #include "AliTrack.h"
114 #include "Riostream.h"
115  
116 ClassImp(AliSignal) // Class implementation to enable ROOT I/O
117  
118 AliSignal::AliSignal() : TNamed(),AliPosition(),AliAttrib()
119 {
120 // Creation of an AliSignal object and initialisation of parameters.
121 // Several signal values (with errors) can be stored in different slots.
122 // If needed, the storage for values (and errors) will be expanded automatically
123 // when entering values and/or errors.
124  fSignals=0;
125  fDsignals=0;
126  fWaveforms=0;
127  fLinks=0;
128  fDevice=0;
129 }
130 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
131 AliSignal::~AliSignal()
132 {
133 // Destructor to delete dynamically allocated memory
134  if (fSignals)
135  {
136   delete fSignals;
137   fSignals=0;
138  }
139  if (fDsignals)
140  {
141   delete fDsignals;
142   fDsignals=0;
143  }
144  if (fWaveforms)
145  {
146   delete fWaveforms;
147   fWaveforms=0;
148  }
149  if (fLinks)
150  {
151   // Remove this signal from all related tracks
152   for (Int_t i=1; i<=fLinks->GetNobjects(); i++)
153   {
154    TObject* obj=fLinks->GetObject(i);
155    if (!obj) continue;
156    if (obj->InheritsFrom("AliTrack"))
157    {
158     AliTrack* tx=(AliTrack*)obj;
159     tx->RemoveSignal(*this);
160    }
161   }
162   delete fLinks;
163   fLinks=0;
164  }
165 }
166 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
167 AliSignal::AliSignal(const AliSignal& s) : TNamed(s),AliPosition(s),AliAttrib(s)
168 {
169 // Copy constructor
170  fSignals=0;
171  fDsignals=0;
172  fWaveforms=0;
173  fLinks=0;
174
175  // Don't copy the owning device pointer for the copy
176  fDevice=0;
177
178  Int_t n=s.GetNvalues();
179  Double_t val;
180  for (Int_t i=1; i<=n; i++)
181  {
182   val=s.GetSignal(i);
183   SetSignal(val,i);
184  } 
185
186  n=s.GetNerrors();
187  for (Int_t j=1; j<=n; j++)
188  {
189   val=s.GetSignalError(j);
190   SetSignalError(val,j);
191  }
192
193  n=s.GetNwaveforms();
194  for (Int_t k=1; k<=n; k++)
195  {
196   TH1F* hist=s.GetWaveform(k);
197   if (hist) SetWaveform(hist,k); 
198  }
199
200  TArrayI slotarr;
201  TArrayI posarr;
202  TObject* dum=0;
203  n=s.GetIndices(dum,slotarr,posarr);
204  Int_t slot,pos;
205  for (Int_t idx=0; idx<n; idx++)
206  {
207   slot=slotarr.At(idx);
208   pos=posarr.At(idx);
209   TObject* obj=s.GetLink(slot,pos);
210   if (obj) SetLink(obj,slot,pos); 
211  }
212 }
213 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
214 void AliSignal::Reset(Int_t mode)
215 {
216 // Reset all signal and position values and errors to 0.
217 //
218 // mode = 0 Reset position and all signal values and their errors to 0.
219 //          The waveform histograms are reset, but the calibration
220 //          constants (i.e. gains and offsets) are kept.
221 //        1 Reset position and delete the signal and error storage arrays.
222 //          Also the waveform histograms, gains and offset arrays are deleted.
223 //
224 // The default when invoking Reset() corresponds to mode=0.
225 //
226 // Note : In all cases the storage of the various links will be reset.
227 //        The UniqueID, name and title will NOT be reset.
228 //        In case the user wants to reset these attributes, this has to
229 //        be done explicitly via the SET facilities. 
230 //
231 // The usage of mode=0 allows to re-use the allocated memory for new
232 // signal (and error) values. This behaviour is preferable (i.e. faster)
233 // in case the various signals always contain the same number of values
234 // and have the same calibration constants.
235 // The usage of mode=1 is slower, but allows a more efficient memory
236 // occupation (and smaller output file size) in case the different
237 // signals have a variable number of values.
238 //
239 // For more specific actions see ResetPosition(), ResetSignals(),
240 // DeleteSignals(), ResetGain(), ResetOffset(), ResetLink(), ResetWaveform(),
241 // DeleteWaveform() and DeleteCalibrations().
242 //
243
244  if (mode<0 || mode>1)
245  {
246   cout << " *AliSignal::Reset* Invalid argument mode = " << mode << endl;
247   cout << " Default mode=0 will be used." << endl;
248   mode=0;
249  }
250
251  ResetPosition();
252  if (!mode)
253  {
254   ResetSignals();
255  }
256  else
257  {
258   DeleteSignals();
259   DeleteCalibrations();
260  }
261
262  if (fLinks) fLinks->Reset();
263  fDevice=0;
264 }
265 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
266 void AliSignal::ResetSignals(Int_t mode)
267 {
268 // Reset various signal data according to user selection.
269 //
270 // mode = 0 Reset all signal values and their errors to 0.
271 //        1 Reset only signal values
272 //        2 Reset only signal errors
273 //
274 // The default when invoking ResetSignals() corresponds to mode=0.
275 //
276 // Irrespective of the mode, the waveform histograms are reset.
277
278  if (mode<0 || mode>2)
279  {
280   cout << " *AliSignal::ResetSignals* Invalid argument mode = " << mode << endl;
281   cout << " Default mode=0 will be used." << endl;
282   mode=0;
283  }
284
285  if (fSignals && (mode==0 || mode==1))
286  {
287   for (Int_t i=0; i<fSignals->GetSize(); i++)
288   {
289    fSignals->AddAt(0,i);
290   }
291  }
292
293  if (fDsignals && (mode==0 || mode==2))
294  {
295   for (Int_t j=0; j<fDsignals->GetSize(); j++)
296   {
297    fDsignals->AddAt(0,j);
298   }
299  }
300
301  ResetWaveform(0);
302 }
303 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
304 void AliSignal::DeleteSignals(Int_t mode)
305 {
306 // Delete storage arrays of various signal data according to user selection.
307 //
308 // mode = 0 Delete arrays of both signal values and their errors.
309 //        1 Delete only signal values array
310 //        2 Delete only signal errors array
311 //
312 // The default when invoking DeleteSignals() corresponds to mode=0.
313 //
314 // Irrespective of the mode, the waveform histograms are deleted.
315
316  if (mode<0 || mode>2)
317  {
318   cout << " *AliSignal::DeleteSignals* Invalid argument mode = " << mode << endl;
319   cout << " Default mode=0 will be used." << endl;
320   mode=0;
321  }
322
323  if (fSignals && (mode==0 || mode==1))
324  {
325   delete fSignals;
326   fSignals=0;
327  }
328
329  if (fDsignals && (mode==0 || mode==2))
330  {
331   delete fDsignals;
332   fDsignals=0;
333  }
334
335  DeleteWaveform(0);
336 }
337 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
338 void AliSignal::SetSignal(Double_t sig,Int_t j)
339 {
340 // Store signal value for the j-th (default j=1) slot.
341 // Note : The first signal slot is at j=1.
342 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
343 // slots for signal values, the number of reserved slots for the
344 // signal values is increased automatically.
345
346  if (!fSignals)
347  {
348   fSignals=new TArrayF(j);
349   ResetSignals(1);
350  }
351
352  Int_t size=fSignals->GetSize();
353
354  if (j>size)
355  {
356   fSignals->Set(j);
357  }
358
359  fSignals->AddAt(float(sig),j-1);
360 }
361 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
362 void AliSignal::SetSignal(Double_t sig,TString name)
363 {
364 // Store signal value for the name-specified slot.
365 //
366 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
367 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
368 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
369 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
370 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
371
372  Int_t j=GetSlotIndex(name);
373  if (j>0) SetSignal(sig,j);
374 }
375 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
376 void AliSignal::AddSignal(Double_t sig,Int_t j)
377 {
378 // Add value to the signal of the j-th (default j=1) slot.
379 // Note : The first signal slot is at j=1.
380 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
381 // slots for signal values, the number of reserved slots for the
382 // signal values is increased automatically.
383
384  if (!fSignals)
385  {
386   fSignals=new TArrayF(j);
387   ResetSignals(1);
388  }
389
390  Int_t size=fSignals->GetSize();
391
392  if (j>size)
393  {
394   fSignals->Set(j);
395  }
396
397  Float_t sum=(fSignals->At(j-1))+sig;
398  fSignals->AddAt(sum,j-1);
399 }
400 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
401 void AliSignal::AddSignal(Double_t sig,TString name)
402 {
403 // Add value to the signal of the name-specified slot.
404 //
405 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
406 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
407 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
408 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
409 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
410
411  Int_t j=GetSlotIndex(name);
412  if (j>0) AddSignal(sig,j);
413 }
414 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
415 Float_t AliSignal::GetSignal(Int_t j,Int_t mode) const
416 {
417 // Provide signal value of the j-th (default j=1) slot.
418 // Note : The first signal slot is at j=1.
419 // In case no signal is present or the input argument "j" or "mode" is invalid,
420 // the value 0 is returned.
421 // The parameter "mode" allows for automatic (de)calibration of the signal
422 // (e.g. gain etc... correction or via explicit (de)calibration functions).
423 //
424 // mode = 0 : Just the j-th signal is returned.
425 //        1 : The j-th signal is corrected for the gain, offset, dead flag etc...
426 //            In case the j-th slot was marked dead, 0 is returned.
427 //            In case the gain value was not set, gain=1 will be assumed.
428 //            In case the gain value was 0, a signal value of 0 is returned.
429 //            In case the offset value was not set, offset=0 will be assumed.
430 //        2 : Same as mode=1 but gain, offset dead flag etc... are taken from
431 //            the AliDevice which owns this AliSignal object.
432 //            The corresponding AliDevice slot is obtained via matching of
433 //            the slotnames. In case this fails, the slotindex "j" of the
434 //            input argument will be used. 
435 //            In case this AliSignal object has no parent AliDevice, just
436 //            the j-th signal is returned (like with mode=0).
437 //        3 : The j-th signal is corrected using the corresponding calibration
438 //            function.
439 //            In case the j-th slot was marked dead, 0 is returned.
440 //            In case no calibration function is present, just the j-th signal
441 //            is returned (like with mode=0).
442 //        4 : Same as mode=3 but the calibration function is taken from
443 //            the AliDevice which owns this AliSignal object.
444 //            The corresponding AliDevice slot is obtained via matching of
445 //            the slotnames. In case this fails, the slotindex "j" of the
446 //            input argument will be used. 
447 //        5 : Same as mode=2 but in case no parent AliDevice is present
448 //            an automatic switch to mode=1 will be made.
449 //        6 : Same as mode=4 but in case no parent AliDevice is present
450 //            an automatic switch to mode=3 will be made.
451 //        7 : Same as mode=3 but in case no calibration function is present
452 //            an automatic switch to mode=4 will be made.
453 //
454 //       <0 : The corresponding de-correction or de-calibration is performed
455 //
456 // The corrected signal (sigc) is determined as follows :
457 //
458 //              sigc=(signal/gain)-offset 
459 //
460 // The de-corrected signal is determined as follows :
461 //
462 //              signal=(sigc+offset)*gain 
463 //
464 // The default is mode=0.
465
466  if (abs(mode)>7) return 0;
467
468  Int_t jcal=j;
469  Float_t sig=0;
470  Float_t gain=1;
471  Float_t offset=0;
472
473  AliSignal* sx=(AliSignal*)this;
474
475  TF1* f=0;
476  if (mode==7)
477  {
478   f=sx->GetCalFunction(jcal);
479   if (f)
480   {
481    mode=3;
482   }
483   else
484   {
485    mode=4;
486   } 
487  }
488  if (mode==-7)
489  {
490   f=sx->GetDecalFunction(jcal);
491   if (f)
492   {
493    mode=-3;
494   }
495   else
496   {
497    mode=-4;
498   } 
499  }
500
501  if (abs(mode)==2 || abs(mode)>=4)
502  {
503   sx=(AliSignal*)GetDevice();
504   if (sx)
505   {
506    TString name=GetSlotName(j);
507    if (strlen(name.Data())) jcal=sx->GetSlotIndex(name);
508    if (!jcal) jcal=j;
509   }
510  }
511  if (!sx && abs(mode)>=5) sx=(AliSignal*)this;
512  if (mode==5) mode=2;
513  if (mode==-5) mode=-2;
514  if (mode==6) mode=3;
515  if (mode==-6) mode=-3;
516
517  if (fSignals)
518  {
519   if (j>0 && j<=(fSignals->GetSize()))
520   {
521    sig=fSignals->At(j-1);
522
523    if (mode==0 || !sx) return sig;
524
525    // Check for the dead flag setting
526    if (sx->GetDeadValue(jcal)) return 0;
527
528    // (De)correct the signal for the gain and offset
529    if (abs(mode)==1 || abs(mode)==2)
530    {
531     if (sx->GetGainFlag(jcal)) gain=sx->GetGain(jcal);
532     if (sx->GetOffsetFlag(jcal)) offset=sx->GetOffset(jcal);
533
534     if (fabs(gain)>0.)
535     {
536      if (mode>0) sig=(sig/gain)-offset; // Gain and offset correction
537      if (mode<0) sig=(sig+offset)*gain; // Gain and offset de-correction
538     }
539     else
540     {
541      sig=0;
542     }
543     return sig;
544    }
545
546    // (De)calibrate the signal with the corresponding (de)calibration function
547    if (abs(mode)==3 || abs(mode)==4)
548    {
549     f=sx->GetCalFunction(jcal);
550     if (mode<0) f=sx->GetDecalFunction(jcal);
551     if (f) sig=f->Eval(sig);
552     return sig;
553    }
554   }
555   else
556   {
557    cout << " *AliSignal::GetSignal* Index j = " << j << " invalid." << endl;
558   } 
559  }
560  return sig;
561 }
562 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
563 Float_t AliSignal::GetSignal(TString name,Int_t mode) const
564 {
565 // Provide signal value of the name-specified slot.
566 // In case no signal is present, 0 is returned.
567 // The parameter "mode" allows for automatic (de)calibration of the signal
568 // (e.g. gain etc... correction or via explicit (de)calibration functions).
569 // For further details about the (de)calibration modes, please refer to the
570 // corresponding slot-index based memberfunction. 
571 //
572 // The default is mode=0.
573 //
574 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
575 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
576 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
577 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
578 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
579
580  Int_t j=GetSlotIndex(name);
581  Float_t val=0;
582  if (j>0) val=GetSignal(j,mode);
583  return val;
584 }
585 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
586 void AliSignal::SetSignalError(Double_t dsig,Int_t j)
587 {
588 // Store error on the signal for the j-th (default j=1) slot.
589 // Note : The first signal slot is at j=1.
590 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
591 // slots for signal error values, the number of reserved slots for the
592 // signal errors is increased automatically.
593
594  if (!fDsignals)
595  {
596   fDsignals=new TArrayF(j);
597   ResetSignals(2);
598  }
599
600  Int_t size=fDsignals->GetSize();
601
602  if (j>size)
603  {
604   fDsignals->Set(j);
605  }
606
607  fDsignals->AddAt(float(dsig),j-1);
608 }
609 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
610 void AliSignal::SetSignalError(Double_t dsig,TString name)
611 {
612 // Store error on the signal for the name-specified slot.
613 //
614 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
615 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
616 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
617 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
618 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
619
620  Int_t j=GetSlotIndex(name);
621  if (j>0) SetSignalError(dsig,j);
622 }
623 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
624 Float_t AliSignal::GetSignalError(Int_t j) const
625 {
626 // Provide error on the signal of the j-th (default j=1) slot.
627 // Note : The first signal slot is at j=1.
628 // In case no signal is present or the argument j is invalid, 0 is returned.
629  Float_t err=0;
630  if (fDsignals)
631  {
632   if (j>0 && j<=(fDsignals->GetSize()))
633   {
634    err=fDsignals->At(j-1);
635   }
636   else
637   {
638    cout << " *AliSignal::GetSignalError* Index j = " << j << " invalid." << endl;
639   } 
640  }
641  return err;
642 }
643 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
644 Float_t AliSignal::GetSignalError(TString name) const
645 {
646 // Provide error on the signal of the name-specified slot.
647 //
648 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
649 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
650 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
651 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
652 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
653
654  Int_t j=GetSlotIndex(name);
655  Float_t val=0;
656  if (j>0) val=GetSignalError(j);
657  return val;
658 }
659 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
660 void AliSignal::Data(TString f) const
661 {
662 // Provide all signal information within the coordinate frame f.
663
664  const char* name=GetName();
665  const char* title=GetTitle();
666
667  cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id : " << GetUniqueID();
668  if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
669  if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
670  cout << endl;
671  cout << "   Position";
672  AliPosition::Data(f);
673  if (fDevice)
674  {
675   const char* devname=fDevice->GetName();
676   const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
677   cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName()
678        << " Id : " << fDevice->GetUniqueID();
679   if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
680   if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
681   cout << endl;
682  }
683
684  // Provide an overview of the stored waveforms
685  ListWaveform(-1);
686
687  // Provide an overview of all the data and attribute slots
688  List(-1);
689
690 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
691 void AliSignal::List(Int_t j) const
692 {
693 // Provide signal information for the j-th slot.
694 // The first slot is at j=1.
695 // In case j=0 (default) the data of all slots will be listed.
696 // In case j=-1 the data of all slots will be listed, but the header
697 // information will be suppressed.
698
699  if (j<-1) 
700  {
701   cout << " *AliSignal::List* Invalid argument j = " << j << endl;
702   return;
703  }
704
705  if (j != -1)
706  {
707   const char* name=GetName();
708   const char* title=GetTitle();
709
710   cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id :" << GetUniqueID();
711   if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
712   if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
713   cout << endl;
714   if (fDevice)
715   {
716    const char* devname=fDevice->GetName();
717    const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
718    cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName();
719    if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
720    if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
721    cout << endl;
722   }
723  }
724
725  Int_t nvalues=GetNvalues();
726  Int_t nerrors=GetNerrors();
727  Int_t nlinkslots=0;
728  if (fLinks) nlinkslots=fLinks->GetMaxColumn();
729  Int_t ncalibs=GetNcalflags();
730  Int_t ncalfuncs=GetNcalfuncs();
731  Int_t ndecalfuncs=GetNdecalfuncs();
732
733  Int_t n=nvalues;
734  if (nerrors>n) n=nerrors;
735  if (nlinkslots>n) n=nlinkslots;
736  if (InheritsFrom("AliDevice"))
737  {
738   if (ncalibs>n) n=ncalibs;
739   if (ncalfuncs>n) n=ncalfuncs;
740   if (ndecalfuncs>n) n=ndecalfuncs;
741  }
742  
743  TObject* obj=0;
744  Int_t nrefs=0;
745  TArrayI posarr;
746  Int_t pos;
747
748  if (j<=0)
749  {
750   for (Int_t i=1; i<=n; i++)
751   {
752    cout << "   Slot : " << i;
753    if (i<=nvalues) cout << " Signal value : " << GetSignal(i);
754    if (i<=nerrors) cout << " error : " << GetSignalError(i);
755    AliAttrib::List(i);
756    cout << endl;
757    obj=0;
758    nrefs=GetIndices(obj,i,posarr);
759    for (Int_t k=0; k<nrefs; k++)
760    {
761     pos=posarr.At(k);
762     obj=GetLink(i,pos);
763     if (obj)
764     {
765      cout << "    Link at position " << pos << " to : " << obj->ClassName();
766      if (obj->InheritsFrom("TNamed"))
767      {
768       const char* lname=obj->GetName();
769       const char* ltitle=obj->GetTitle();
770       if (strlen(lname))  cout << " Name : " << lname;
771       if (strlen(ltitle)) cout << " Title : " << ltitle;
772      }
773      cout << endl;
774     }
775    }
776   }
777  }
778  else
779  {
780   if (j<=n)
781   {
782    cout << "   Slot : " << j;
783    if (j<=nvalues) cout << " Signal value : " << GetSignal(j);
784    if (j<=nerrors) cout << " error : " << GetSignalError(j);
785    AliAttrib::List(j);
786    cout << endl;
787    obj=0;
788    nrefs=GetIndices(obj,j,posarr);
789    for (Int_t kj=0; kj<nrefs; kj++)
790    {
791     pos=posarr.At(kj);
792     obj=GetLink(j,pos);
793     if (obj)
794     {
795      cout << "    Link at position " << pos << " to : " << obj->ClassName();
796      if (obj->InheritsFrom("TNamed"))
797      {
798       const char* lnamej=obj->GetName();
799       const char* ltitlej=obj->GetTitle();
800       if (strlen(lnamej))  cout << " Name : " << lnamej;
801       if (strlen(ltitlej)) cout << " Title : " << ltitlej;
802      }
803      cout << endl;
804     }
805    }
806   }
807  }
808
809 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
810 void AliSignal::List(TString name) const
811 {
812 // Provide signal information for the name-specified slot.
813 //
814 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
815 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
816 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
817 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
818 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
819
820  Int_t j=GetSlotIndex(name);
821  if (j>0) List(j);
822 }
823 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
824 void AliSignal::ListWaveform(Int_t j) const
825 {
826 // Provide information for the j-th waveform.
827 // The first waveform is at j=1.
828 // In case j=0 (default) the info of all waveforms will be listed.
829 // In case j=-1 the info of all waveforms will be listed, but the header
830 // information will be suppressed.
831
832  if (j<-1) 
833  {
834   cout << " *AliSignal::ListWaveform* Invalid argument j = " << j << endl;
835   return;
836  }
837
838  if (j != -1)
839  {
840   const char* name=GetName();
841   const char* title=GetTitle();
842
843   cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id :" << GetUniqueID();
844   if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
845   if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
846   cout << endl;
847   if (fDevice)
848   {
849    const char* devname=fDevice->GetName();
850    const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
851    cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName();
852    if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
853    if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
854    cout << endl;
855   }
856  }
857
858  Int_t n=GetNwaveforms();
859  TObject* obj=0;
860
861  if (j<=0)
862  {
863   for (Int_t i=1; i<=n; i++)
864   {
865    obj=GetWaveform(i);
866    if (obj)
867    {
868     const char* wfname=obj->GetName();
869     const char* wftitle=obj->GetTitle();
870     cout << "    Waveform " << i << " : " << obj->ClassName();
871     if (strlen(wfname))  cout << " Name : " << wfname;
872     if (strlen(wftitle)) cout << " Title : " << wftitle;
873     cout << endl;
874    }
875   }
876  }
877  else
878  {
879   if (j<=n)
880   {
881    obj=GetWaveform(j);
882    if (obj)
883    {
884     const char* wfnamej=obj->GetName();
885     const char* wftitlej=obj->GetTitle();
886     cout << "    Waveform " << j << " : " << obj->ClassName();
887     if (strlen(wfnamej))  cout << " Name : " << wfnamej;
888     if (strlen(wftitlej)) cout << " Title : " << wftitlej;
889     cout << endl;
890    }
891   }
892  }
893 }
894 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
895 Int_t AliSignal::GetNvalues() const
896 {
897 // Provide the number of values for this signal.
898  Int_t n=0;
899  if (fSignals) n=fSignals->GetSize();
900  return n;
901 }
902 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
903 Int_t AliSignal::GetNerrors() const
904 {
905 // Provide the number specified errors on the values for this signal.
906  Int_t n=0;
907  if (fDsignals) n=fDsignals->GetSize();
908  return n;
909 }
910 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
911 Int_t AliSignal::GetNwaveforms() const
912 {
913 // Provide the number of specified waveforms for this signal.
914 // Actually the return value is the highest index of the stored waveforms.
915 // This allows an index dependent meaning of waveform info (e.g. waveforms
916 // with various gain values).
917 // So, when all waveforms are stored in consequetive positions (e.g. 1,2,3),
918 // this memberfunction returns 3, being both the highest filled position
919 // and the actual number of waveforms.
920 // In case only waveforms are stored at positions 1,2,5,7 this memberfunction
921 // returns a value 7 whereas only 4 actual waveforms are present.
922 // This implies that when looping over the various waveform slots, one
923 // always has to check whether the returned pointer value is non-zero
924 // (which is a good practice anyhow).
925  Int_t n=-1;
926  if (fWaveforms) n=fWaveforms->GetLast();
927  return (n+1);
928 }
929 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
930 TH1F* AliSignal::GetWaveform(Int_t j) const
931 {
932 // Provide pointer to the j-th waveform histogram.
933  TH1F* waveform=0;
934  if (j <= GetNwaveforms()) waveform=(TH1F*)fWaveforms->At(j-1);
935  return waveform;
936 }
937 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
938 TH1F* AliSignal::GetWaveform(TString name) const
939 {
940 // Provide pointer to the waveform histogram with the specified name.
941 // In case no match is found, zero is returned.
942  Int_t n=GetNwaveforms();
943  TString str;
944  for (Int_t i=1; i<=n; i++)
945  {
946   TH1F* waveform=GetWaveform(i);
947   if (waveform)
948   {
949    str=waveform->GetName();
950    if (str == name) return waveform;
951   }
952  }
953  return 0; // No match found
954 }
955 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
956 Int_t AliSignal::GetWaveformIndex(TString name) const
957 {
958 // Provide index to the waveform histogram with the specified name.
959 // In case no match is found, zero is returned.
960  Int_t n=GetNwaveforms();
961  TString str;
962  for (Int_t i=1; i<=n; i++)
963  {
964   TH1F* waveform=GetWaveform(i);
965   if (waveform)
966   {
967    str=waveform->GetName();
968    if (str == name) return i;
969   }
970  }
971  return 0; // No match found
972 }
973 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
974 void AliSignal::SetWaveform(TH1F* waveform,Int_t j)
975 {
976 // Set the 1D waveform histogram for the j-th waveform.
977 //
978 // Notes :
979 //  The first waveform position at j=1.
980 //  j=1 is the default value.
981 //
982 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
983 // positions for the waveforms, the number of reserved positions for the waveforms
984 // is increased automatically.
985 //
986 // In case the histo pointer argument has the same value as the current waveform
987 // histogram pointer value, no action is taken since the user has already
988 // modified the actual histogram.
989 //
990 // In case the histo pointer argument is zero, the current waveform histogram
991 // is deleted and the pointer set to zero.
992 //
993 // In all other cases the current waveform histogram is deleted and a new
994 // copy of the input histogram is created which becomes the current waveform
995 // histogram.
996
997  if (j<1) return;
998
999  if (!fWaveforms)
1000  {
1001   fWaveforms=new TObjArray(j);
1002   fWaveforms->SetOwner();
1003  }
1004
1005  if (j > fWaveforms->GetSize()) fWaveforms->Expand(j);
1006
1007  TH1F* hcur=(TH1F*)fWaveforms->At(j-1);
1008  if (waveform != hcur)
1009  {
1010   if (hcur)
1011   {
1012    fWaveforms->Remove(hcur);
1013    delete hcur;
1014    hcur=0;
1015   }
1016   if (waveform)
1017   {
1018    hcur=new TH1F(*waveform);
1019    fWaveforms->AddAt(hcur,j-1);
1020   }
1021  } 
1022 }
1023 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1024 void AliSignal::ResetWaveform(Int_t j)
1025 {
1026 // Reset the histogram of the j-th (default j=1) waveform.
1027 // This memberfunction invokes TH1F::Reset() for the corresponding waveform(s).
1028 // To actually delete the histograms from memory, use DeleteWaveform().
1029 // Notes : The first position is at j=1.
1030 //         j=0 ==> All waveforms will be reset.
1031  
1032  if (!fWaveforms) return;
1033
1034  Int_t size=fWaveforms->GetSize();
1035
1036  if ((j>=0) && (j<=size))
1037  {
1038   if (j)
1039   {
1040    TH1F* hwave=(TH1F*)fWaveforms->At(j-1);
1041    if (hwave) hwave->Reset();
1042   }
1043   else
1044   {
1045    for (Int_t i=0; i<size; i++)
1046    {
1047     TH1F* hwave=(TH1F*)fWaveforms->At(i);
1048     if (hwave) hwave->Reset();
1049    }
1050   }
1051  }
1052  else
1053  {
1054   cout << " *AliSignal::ResetWaveform* Index j = " << j << " invalid." << endl;
1055   return;
1056  }
1057 }
1058 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1059 void AliSignal::ResetWaveform(TString name)
1060 {
1061 // Reset the waveform with the specified name.
1062  Int_t j=GetWaveformIndex(name);
1063  if (j>0) ResetWaveform(j);
1064 }
1065 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1066 void AliSignal::DeleteWaveform(Int_t j)
1067 {
1068 // Delete the histogram of the j-th (default j=1) waveform.
1069 // Notes : The first position is at j=1.
1070 //         j=0 ==> All waveforms will be deleted.
1071  
1072  if (!fWaveforms) return;
1073
1074  Int_t size=fWaveforms->GetSize();
1075
1076  if ((j>=0) && (j<=size))
1077  {
1078   if (j)
1079   {
1080    TH1F* hwave=(TH1F*)fWaveforms->At(j-1);
1081    if (hwave)
1082    {
1083     fWaveforms->Remove(hwave);
1084     delete hwave;
1085    }
1086   }
1087   else
1088   {
1089    delete fWaveforms;
1090    fWaveforms=0;
1091   }
1092  }
1093  else
1094  {
1095   cout << " *AliSignal::DeleteWaveform* Index j = " << j << " invalid." << endl;
1096   return;
1097  }
1098 }
1099 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1100 void AliSignal::DeleteWaveform(TString name)
1101 {
1102 // Delete the waveform with the specified name.
1103  Int_t j=GetWaveformIndex(name);
1104  if (j>0) DeleteWaveform(j);
1105 }
1106 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1107 Int_t AliSignal::GetNlinks(TObject* obj,Int_t j) const
1108 {
1109 // Provide the number of links to the specified object for the j-th slot.
1110 // If j=0 (default) all slots will be scanned for the specified object.
1111 // If obj=0 (default) all encountered objects for the specified slot will be counted.
1112 // So, invokation of the default GetNlinks() will return the total number of
1113 // all references to all sorts of stored objects.
1114  if (j<0)
1115  {
1116   cout << " *AliSignal::GetNlinks* Index j = " << j << " invalid." << endl;
1117   return 0;
1118  }
1119
1120  Int_t n=0;
1121  if (!j)
1122  {
1123   if (fLinks) n=fLinks->GetNrefs(obj);
1124  }
1125  else
1126  {
1127   TArrayI posarr;
1128   n=GetIndices(obj,j,posarr);
1129  }
1130  return n;
1131 }
1132 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1133 Int_t AliSignal::GetNlinks(TObject* obj,TString name) const
1134 {
1135 // Provide the number of links to the specified object for the name-spec. slot.
1136 // If obj=0 all encountered objects for the specified slot will be counted.
1137 //
1138 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1139 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1140 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1141 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1142 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1143
1144  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1145  Int_t n=0;
1146  if (j>0) n=GetNlinks(obj,j);
1147  return n;
1148 }
1149 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1150 TObject* AliSignal::GetLink(Int_t j,Int_t k) const
1151 {
1152 // Provide pointer of the object linked to the j-th slot at position k.
1153
1154  TObject* obj=0;
1155  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1156  if (fLinks) obj=fLinks->GetObject(k,j);
1157  return obj;
1158 }
1159 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1160 TObject* AliSignal::GetLink(TString name,Int_t k) const
1161 {
1162 // Provide pointer of the object linked to the name-spec. slot at position k.
1163 //
1164 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1165 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1166 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1167 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1168 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1169
1170  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1171  TObject* obj=0;
1172  if (j>0) obj=GetLink(j,k);
1173  return obj;
1174 }
1175 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1176 void AliSignal::SetLink(TObject* obj,Int_t j,Int_t k)
1177 {
1178 // Introduce a link (=pointer) to an object for the j-th slot at position k.
1179 // Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
1180 // that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
1181 // by the AliSignal object.
1182 //
1183 // Notes :
1184 //  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
1185 //  j=1 and k=1 are the default values.
1186 //
1187 // If needed, the storage area for the links is increased automatically.
1188 //
1189 // In case the pointer argument is zero, indeed a value of zero will be
1190 // stored at the specified position (k) for the specified slot (j).
1191 //
1192 // In principle any object derived from TObject can be referred to by this
1193 // mechanism.
1194 // However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
1195 // to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
1196 // is related (see AliTrack::AddSignal).
1197 // Therefore, in case the input argument "obj" points to an AliTrack (or derived)
1198 // object, the current signal is automatically related to this AliTrack
1199 // (or derived) object.
1200 // 
1201 // Please also have a look at the docs of the memberfunction ResetLink()
1202 // to prevent the situation of stored pointers to non-existent object. 
1203
1204  if (!fLinks && obj) fLinks=new AliObjMatrix();
1205
1206  if (!fLinks) return;
1207
1208  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1209  fLinks->EnterObject(k,j,obj);
1210  if (obj) 
1211  {
1212   if (obj->InheritsFrom("AliTrack"))
1213   {
1214    AliTrack* t=(AliTrack*)obj;
1215    t->AddSignal(*this);
1216   }
1217  }
1218 }
1219 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1220 void AliSignal::SetLink(TObject* obj,TString name,Int_t k)
1221 {
1222 // Introduce a link (=pointer) to an object for the name-spec. slot at position k.
1223 // Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
1224 // that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
1225 // by the AliSignal object.
1226 //
1227 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1228 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1229 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1230 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1231 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1232
1233  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1234  if (j>0) SetLink(obj,j,k);
1235 }
1236 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1237 void AliSignal::AddLink(TObject* obj,Int_t j)
1238 {
1239 // Introduce a link (=pointer) to an object for the j-th slot at the first
1240 // free position.
1241 // Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
1242 // that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
1243 // by the AliSignal object.
1244 //
1245 // Notes :
1246 //  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
1247 //  j=1 is the default value.
1248 //
1249 // If needed, the storage area for the links is increased automatically.
1250 //
1251 // In case the pointer argument is zero, no link will be added.
1252 //
1253 // In principle any object derived from TObject can be referred to by this
1254 // mechanism.
1255 // However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
1256 // to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
1257 // is related (see AliTrack::AddSignal).
1258 // Therefore, in case the input argument "obj" points to an AliTrack (or derived)
1259 // object, the current signal is automatically related to this AliTrack
1260 // (or derived) object.
1261 // 
1262 // Please also have a look at the docs of the memberfunction ResetLink()
1263 // to prevent the situation of stored pointers to non-existent object. 
1264
1265  if (!obj || j<=0) return;
1266
1267  if (!fLinks) fLinks=new AliObjMatrix();
1268
1269  TObject* dum=0;
1270  Int_t n=GetNlinks(dum,j);
1271  Int_t pos=1;
1272  for (Int_t k=1; k<=n; k++)
1273  {
1274   dum=GetLink(j,k);
1275   if (!dum) break;
1276   pos++;
1277  }
1278
1279  SetLink(obj,j,pos);
1280 }
1281 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1282 void AliSignal::AddLink(TObject* obj,TString name)
1283 {
1284 // Introduce a link (=pointer) to an object for the name-spec slot at the first
1285 // free position.
1286 // Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
1287 // that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
1288 // by the AliSignal object.
1289 //
1290 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1291 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1292 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1293 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1294 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1295
1296  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1297  if (j>0) AddLink(obj,j);
1298 }
1299 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1300 void AliSignal::ResetLink(Int_t j,Int_t k)
1301 {
1302 // Reset the link of the j-th slot at position k.
1303 //
1304 // Notes :
1305 //  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
1306 //  j=1 and k=1 are the default values.
1307 //
1308 //  This memberfunction is intended to reset only 1 specified link location.
1309 //  For extended functionality, please refer to the memberfuction ResetLinks().
1310 //
1311 // In general the user should take care of properly clearing the corresponding
1312 // pointer here when the referred object is deleted.
1313 // However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
1314 // to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
1315 // is related (see AliTrack::AddSignal).
1316 // As such, the AliTrack destructor already takes care of clearing the corresponding
1317 // links from the various AliSignal slots for all the AliSignal objects that were
1318 // related to that AliTrack. 
1319 // So, in case the link introduced via SetLink() is the pointer of an AliTrack object,
1320 // the user doesn't have to worry about clearing the corresponding AliTrack link from
1321 // the AliSignal object when the corresponding AliTrack object is deleted.
1322  
1323  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1324  if (fLinks) fLinks->RemoveObject(k,j);
1325 }
1326 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1327 void AliSignal::ResetLink(TString name,Int_t k)
1328 {
1329 // Reset the link of the name-specified slot at position k.
1330 //
1331 // This memberfunction is intended to reset only 1 specified link location.
1332 // For extended functionality, please refer to the memberfuction ResetLinks().
1333 //
1334 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1335 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1336 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1337 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1338 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1339
1340  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1341  if (j>0) ResetLink(j,k);
1342 }
1343 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1344 void AliSignal::ResetLinks(TObject* obj,Int_t j,Int_t k)
1345 {
1346 // Reset single or multiple link(s) according to user specified selections.
1347 //
1348 // A link is only reset if the stored reference matches the argument "obj".
1349 // In case obj=0 no check on the matching of the stored reference is performed
1350 // and the stored link is always reset in accordance with the other
1351 // selection criteria.
1352 //
1353 // In case the slot argument "j" is specified, only the links from that
1354 // specified slot will be deleted.
1355 // In case j=0 (default) no checking on the slot index is performed.
1356 //
1357 // In case the position argument "k" is specified, only the links from that
1358 // specified position will be deleted.
1359 // In case k=0 (default) no checking on the position index is performed.
1360 //
1361 // So, invokation of ResetLinks(obj) will remove all references to the
1362 // object "obj" from the total AliSignal, whereas ResetLinks(obj,j)
1363 // will remove all references to the object "obj" only from slot "j".
1364 //
1365 // Notes :
1366 // -------
1367 // The first slot is indicated as j=1, whereas the first position is at k=1.
1368 //
1369 // Invokation of ResetLinks(0,row,col) is equivalent to invoking the
1370 // memberfunction ResetLink(row,col).
1371 // Invoking the latter directly is slightly faster.
1372 //
1373 // Invokation of ResetLinks(0) will reset all stored references in this AliSignal.
1374 //
1375 // In general the user should take care of properly clearing the corresponding
1376 // pointer here when the referred object is deleted.
1377 // However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
1378 // to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
1379 // is related (see AliTrack::AddSignal).
1380 // As such, the AliTrack destructor already takes care of clearing the corresponding
1381 // links from the various AliSignal slots for all the AliSignal objects that were
1382 // related to that AliTrack. 
1383 // So, in case the link introduced via SetLink() is the pointer of an AliTrack object,
1384 // the user doesn't have to worry about clearing the corresponding AliTrack link from
1385 // the AliSignal object when the corresponding AliTrack object is deleted.
1386  
1387  if (!fLinks) return;
1388
1389  if (!obj && !j && !k)
1390  {
1391   fLinks->Reset();
1392  }
1393  else
1394  {
1395   // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1396   fLinks->RemoveObjects(obj,k,j);
1397  }
1398 }
1399 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1400 void AliSignal::ResetLinks(TObject* obj,TString name,Int_t k)
1401 {
1402 // Reset single or multiple link(s) according to user specified selections.
1403 //
1404 // A link is only reset if the stored reference matches the argument "obj".
1405 // In case obj=0 no check on the matching of the stored reference is performed
1406 // and the stored link is always reset in accordance with the other
1407 // selection criteria.
1408 //
1409 // In case the position argument "k" is specified, only the links from that
1410 // specified position will be deleted.
1411 // In case k=0 (default) no checking on the position index is performed.
1412 //
1413 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1414 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1415 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1416 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1417 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1418
1419  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1420  if (j>0) ResetLinks(obj,j,k);
1421 }
1422 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1423 Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TArrayI& js,TArrayI& ks) const
1424 {
1425 // Provide the slot and position indices of all the storage locations
1426 // of the specified object.
1427 // The slot (j) and pos. (k) indices are returned in the two separate TArrayI arrays
1428 // from which the (j,k) pairs can be obtained from the corresponding
1429 // array indices like (j,k)=(js.At(i),ks.At(i)).
1430 // The integer return argument represents the number of (j,k) pairs which
1431 // were encountered for the specified object.
1432 //
1433 // If obj=0 no object selection is performed and all (j,k) indices
1434 // of the stored references for all objects are returned.
1435 //
1436 // Notes :
1437 // -------
1438 // As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
1439 // 
1440 // This memberfunction always resets the two TArrayI arrays at the start.
1441 //
1442 // This memberfunction can only be used to obtain the (j,k) indices
1443 // of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
1444 // This means that in case the user has entered a TObjArray as object
1445 // (to increase the dimension of the resulting structure), the (j,k)
1446 // indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
1447 // actual objects contained in that TObjArray structure.
1448 //
1449  Int_t nrefs=0;
1450  js.Reset();
1451  ks.Reset();
1452  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1453  if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,ks,js);
1454  return nrefs;
1455 }
1456 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1457 Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,Int_t j,TArrayI& ks) const
1458 {
1459 // Provide the position indices of all the storage locations of the
1460 // specified object in the j-th slot of this AliSignal.
1461 // The position indices are returned in the TArrayI array.
1462 // The integer return argument represents the number of storage locations which
1463 // were encountered for the specified object in the j-th slot.
1464 //
1465 // If obj=0 no object selection is performed and all position indices
1466 // of the stored references for all objects of the j-th slot are returned.
1467 //
1468 // If j=0 all slots will be scanned and all position indices matching the
1469 // object selection are returned.
1470 // Note that in this case multiple appearances of the same position index
1471 // will only be recorded once in the returned TArrayI array.
1472 //
1473 // Notes :
1474 // -------
1475 // As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
1476 // 
1477 // This memberfunction always resets the TArrayI array at the start.
1478 //
1479 // This memberfunction can only be used to obtain the position indices
1480 // of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
1481 // This means that in case the user has entered a TObjArray as object
1482 // (to increase the dimension of the resulting structure), the position
1483 // indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
1484 // actual objects contained in that TObjArray structure.
1485 //
1486  Int_t nrefs=0;
1487  ks.Reset();
1488  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1489  if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,ks,j);
1490  return nrefs;
1491 }
1492 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1493 Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TString name,TArrayI& ks) const
1494 {
1495 // Provide the position indices of all the storage locations of the
1496 // specified object in the name-specified slot of this AliSignal.
1497 // The position indices are returned in the TArrayI array.
1498 // The integer return argument represents the number of storage locations which
1499 // were encountered for the specified object in the j-th slot.
1500 //
1501 // If obj=0 no object selection is performed and all position indices
1502 // of the stored references for all objects of the j-th slot are returned.
1503 //
1504 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1505 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1506 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1507 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1508 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1509
1510  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1511  Int_t n=0;
1512  if (j>0) n=GetIndices(obj,j,ks);
1513  return n;
1514 }
1515 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1516 Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TArrayI& js,Int_t k) const
1517 {
1518 // Provide the slot indices of all the storage locations of the
1519 // specified object for the k-th position in this AliSignal.
1520 // The slot indices are returned in the TArrayI array.
1521 // The integer return argument represents the number of storage locations which
1522 // were encountered for the specified object in the k-th position.
1523 //
1524 // If obj=0 no object selection is performed and all slot indices
1525 // of the stored references for all objects in the k-th position are returned.
1526 //
1527 // If k=0 all positions will be scanned and all slot indices matching the
1528 // object selection are returned.
1529 // Note that in this case multiple appearances of the same slot index
1530 // will only be recorded once in the returned TArrayI array.
1531 //
1532 // Notes :
1533 // -------
1534 // As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
1535 // 
1536 // This memberfunction always resets the TArrayI array at the start.
1537 //
1538 // This memberfunction can only be used to obtain the slot indices
1539 // of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
1540 // This means that in case the user has entered a TObjArray as object
1541 // (to increase the dimension of the resulting structure), the slot
1542 // indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
1543 // actual objects contained in that TObjArray structure.
1544 //
1545  Int_t nrefs=0;
1546  js.Reset();
1547  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1548  if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,k,js);
1549  return nrefs;
1550 }
1551 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1552 void AliSignal::SetSwapMode(Int_t swap)
1553 {
1554 // Set swapmode flag for the internal link storage.
1555 // In case for the stored links the maximum slot number differs considerably
1556 // from the maximum position number, it might be more efficient
1557 // (w.r.t. memory usage and/or output file size) to internally store the
1558 // link reference matrix with the rows and colums swapped.
1559 // This swapping is only related with the internal storage and as such
1560 // is completely hidden for the user.
1561 // At invokation of this memberfunction the default argument is swap=1.
1562 //
1563 // Note : The swap mode can only be set as long as no links are
1564 //        stored in the AliSignal (i.e. a new instance of AliSignal
1565 //        or after invokation of the Reset() or ResetLinks() function).
1566  
1567  if (!fLinks) fLinks=new AliObjMatrix();
1568  fLinks->SetSwapMode(swap);
1569 }
1570 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1571 Int_t AliSignal::GetSwapMode() const
1572 {
1573 // Provide swapmode flag of the link storage.
1574  Int_t swap=0; 
1575  if (fLinks) swap=fLinks->GetSwapMode();
1576  return swap;
1577 }
1578 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1579 void AliSignal::SetDevice(TObject* dev)
1580 {
1581 // Store the pointer to the device which owns this AliSignal object.
1582 // This memberfunction is meant for internal use in AliDevice.
1583  fDevice=dev;
1584 }
1585 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1586 AliDevice* AliSignal::GetDevice() const
1587 {
1588 // Provide the pointer to the device which owns this AliSignal object.
1589  return (AliDevice*)fDevice;
1590 }
1591 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1592 TObject* AliSignal::Clone(const char* name) const
1593 {
1594 // Make a deep copy of the current object and provide the pointer to the copy.
1595 // This memberfunction enables automatic creation of new objects of the
1596 // correct type depending on the object type, a feature which may be very useful
1597 // for containers when adding objects in case the container owns the objects.
1598 // This feature allows e.g. AliTrack to store either AliSignal objects or
1599 // objects derived from AliSignal via the AddSignal memberfunction, provided
1600 // these derived classes also have a proper Clone memberfunction. 
1601
1602  AliSignal* sig=new AliSignal(*this);
1603  if (name)
1604  {
1605   if (strlen(name)) sig->SetName(name);
1606  }
1607  return sig;
1608 }
1609 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////