STEER/AliAODHandler.cxx

   1
   2 /**************************************************************************
   3  * Copyright(c) 1998-2007, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   4  *                                                                        *
   5  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   6  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   7  *                                                                        *
   8  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   9  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  10  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  11  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  12  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  13  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  14  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  15  **************************************************************************/
  16
  17 /* $Id$ */
  18
  19 //-------------------------------------------------------------------------
  20 //     Implementation of the Virtual Event Handler Interface for AOD
  21 //     Author: Andreas Morsch, CERN
  22 //-------------------------------------------------------------------------
  23
  24
  25 #include <TTree.h>
  26 #include <TFile.h>
  27 #include <TString.h>
  28 #include <TList.h>
  29 #include <TROOT.h>
  30
  31 #include "AliLog.h"
  32 #include "AliAODHandler.h"
  33 #include "AliAODEvent.h"
  34 #include "AliAODTracklets.h"
  35 #include "AliStack.h"
  36 #include "AliAODMCParticle.h"
  37 #include "AliAODMCHeader.h"
  38 #include "AliMCEventHandler.h"
  39 #include "AliMCEvent.h"
  40 #include "AliGenEventHeader.h"
  41 #include "AliGenHijingEventHeader.h"
  42 #include "AliGenDPMjetEventHeader.h"
  43 #include "AliGenPythiaEventHeader.h"
  44 #include "AliGenCocktailEventHeader.h"
  45 #include "AliCodeTimer.h"
  46 #include "AliAODBranchReplicator.h"
  47 #include "Riostream.h"
  48
  49 ClassImp(AliAODHandler)
  50
  51 //______________________________________________________________________________
  52 AliAODHandler::AliAODHandler() :
  53     AliVEventHandler(),
  54     fIsStandard(kTRUE),
  55     fFillAOD(kTRUE),
  56     fFillAODRun(kTRUE),
  57     fNeedsHeaderReplication(kFALSE),
  58     fNeedsTracksBranchReplication(kFALSE),
  59     fNeedsVerticesBranchReplication(kFALSE),
  60     fNeedsV0sBranchReplication(kFALSE),
  61     fNeedsCascadesBranchReplication(kFALSE),
  62     fNeedsTrackletsBranchReplication(kFALSE),
  63     fNeedsPMDClustersBranchReplication(kFALSE),
  64     fNeedsJetsBranchReplication(kFALSE),
  65     fNeedsFMDClustersBranchReplication(kFALSE),
  66     fNeedsCaloClustersBranchReplication(kFALSE),
  67     fNeedsMCParticlesBranchReplication(kFALSE),
  68     fNeedsDimuonsBranchReplication(kFALSE),
  69     fAODIsReplicated(kFALSE),
  70     fAODEvent(NULL),
  71     fMCEventH(NULL),
  72     fTreeA(NULL),
  73     fFileA(NULL),
  74     fFileName(""),
  75     fExtensions(NULL),
  76     fFilters(NULL)
  77 {
  78   // default constructor
  79 }
  80
  81 //______________________________________________________________________________
  82 AliAODHandler::AliAODHandler(const char* name, const char* title):
  83     AliVEventHandler(name, title),
  84     fIsStandard(kTRUE),
  85     fFillAOD(kTRUE),
  86     fFillAODRun(kTRUE),
  87     fNeedsHeaderReplication(kFALSE),
  88     fNeedsTracksBranchReplication(kFALSE),
  89     fNeedsVerticesBranchReplication(kFALSE),
  90     fNeedsV0sBranchReplication(kFALSE),
  91     fNeedsCascadesBranchReplication(kFALSE),
  92     fNeedsTrackletsBranchReplication(kFALSE),
  93     fNeedsPMDClustersBranchReplication(kFALSE),
  94     fNeedsJetsBranchReplication(kFALSE),
  95     fNeedsFMDClustersBranchReplication(kFALSE),
  96     fNeedsCaloClustersBranchReplication(kFALSE),
  97     fNeedsMCParticlesBranchReplication(kFALSE),
  98     fNeedsDimuonsBranchReplication(kFALSE),
  99     fAODIsReplicated(kFALSE),
 100     fAODEvent(NULL),
 101     fMCEventH(NULL),
 102     fTreeA(NULL),
 103     fFileA(NULL),
 104     fFileName(""),
 105     fExtensions(NULL),
 106     fFilters(NULL)
 107 {
 108 // Normal constructor.
 109 }
 110
 111 //______________________________________________________________________________
 112 AliAODHandler::~AliAODHandler()
 113 {
 114  // Destructor.
 115   if (fAODEvent) delete fAODEvent;
 116   if(fFileA){
 117     // is already handled in TerminateIO
 118     fFileA->Close();
 119     delete fFileA;
 120     fTreeA = 0;
 121   }
 122   if (fTreeA) delete fTreeA;
 123   if (fExtensions) {fExtensions->Delete(); delete fExtensions;}
 124   if (fFilters)    {fFilters->Delete();    delete fFilters;}
 125 }
 126
 127 //______________________________________________________________________________
 128 Bool_t AliAODHandler::Init(Option_t* opt)
 129 {
 130   // Initialize IO
 131   //
 132   // Create the AODevent object
 133
 134   Bool_t createStdAOD = fIsStandard || fFillAOD;
 135   if(!fAODEvent && createStdAOD){
 136     fAODEvent = new AliAODEvent();
 137     if (fIsStandard)
 138       fAODEvent->CreateStdContent();
 139   }
 140   //
 141   // File opening according to execution mode
 142   TString option(opt);
 143   option.ToLower();
 144   if (createStdAOD) {
 145     TDirectory *owd = gDirectory;
 146     if (option.Contains("proof")) {
 147       // proof
 148       // Merging via files. Need to access analysis manager via interpreter.
 149       gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisDataContainer *c_common_out = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetCommonOutputContainer();"));
 150       gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->OpenProofFile(c_common_out, \"RECREATE\");"));
 151       fFileA = gFile;
 152     } else {
 153       // local and grid
 154       fFileA = new TFile(fFileName.Data(), "RECREATE");
 155     }
 156     CreateTree(1);
 157     owd->cd();
 158   }
 159   if (fExtensions) {
 160      TIter next(fExtensions);
 161      AliAODExtension *ext;
 162      while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->Init(option);
 163   }
 164   if (fFilters) {
 165      TIter nextf(fFilters);
 166      AliAODExtension *filteredAOD;
 167      while ((filteredAOD=(AliAODExtension*)nextf())) {
 168         filteredAOD->SetEvent(fAODEvent);
 169         filteredAOD->Init(option);
 170      }
 171   }
 172   return kTRUE;
 173 }
 174
 175 //______________________________________________________________________________
 176 void AliAODHandler::Print(Option_t* opt) const
 177 {
 178   // Print info about this object
 179
 180   cout << opt << Form("IsStandard %d filename=%s",fIsStandard,fFileName.Data()) << endl;
 181
 182   if ( fExtensions )
 183   {
 184     cout << opt << fExtensions->GetEntries() << " extensions :" << endl;
 185     PrintExtensions(*fExtensions);
 186   }
 187   if ( fFilters )
 188   {
 189     cout << opt << fFilters->GetEntries() << " filters :" << endl;
 190     PrintExtensions(*fFilters);
 191   }
 192 }
 193
 194 //______________________________________________________________________________
 195 void AliAODHandler::PrintExtensions(const TObjArray& array) const
 196 {
 197   // Show the list of aod extensions
 198   TIter next(&array);
 199   AliAODExtension* ext(0x0);
 200   while ( ( ext = static_cast<AliAODExtension*>(next()) ) )
 201   {
 202     ext->Print("   ");
 203   }
 204 }
 205
 206 //______________________________________________________________________________
 207 void AliAODHandler::StoreMCParticles(){
 208
 209   //
 210   // Remap the labels from ESD stack and store
 211   // the AODMCParticles, makes only sense if we have
 212   // the mcparticles branch
 213   // has to be done here since we cannot know in advance
 214   // which particles are needed (e.g. by the tracks etc.)
 215   //
 216   // Particles have been selected by AliMCEventhanlder->SelectParticle()
 217   // To use the MCEventhandler here we need to set it from the outside
 218   // can vanish when Handler go to the ANALYSISalice library
 219   //
 220   // The Branch booking for mcParticles and mcHeader has to happen
 221   // in an external task for now since the AODHandler does not have access
 222   // the AnalysisManager. For the same reason the pointer t o the MCEventH
 223   // has to passed to the AOD Handler by this task
 224   // (doing this in the steering macro would not work on PROOF)
 225
 226   if (!fAODEvent) return;
 227   TClonesArray *mcarray = (TClonesArray*)fAODEvent->FindListObject(AliAODMCParticle::StdBranchName());
 228   if(!mcarray)return;
 229
 230   AliAODMCHeader *mcHeader = (AliAODMCHeader*)fAODEvent->FindListObject(AliAODMCHeader::StdBranchName());
 231   if(!mcHeader)return;
 232
 233   // Get the MC Infos.. Handler needs to be set before
 234   // while adding the branch
 235   // This needs to be done, not to depend on the AnalysisManager
 236
 237   if(!fMCEventH)return;
 238   if(!fMCEventH->MCEvent())return;
 239   AliStack *pStack = fMCEventH->MCEvent()->Stack();
 240   if(!pStack)return;
 241
 242   fMCEventH->CreateLabelMap();
 243
 244   //
 245   // Get the Event Header
 246   //
 247
 248   AliHeader* header = fMCEventH->MCEvent()->Header();
 249    // get the MC vertex
 250   AliGenEventHeader* genHeader = 0;
 251   if (header) genHeader = header->GenEventHeader();
 252   if (genHeader) {
 253       TArrayF vtxMC(3);
 254       genHeader->PrimaryVertex(vtxMC);
 255       mcHeader->SetVertex(vtxMC[0],vtxMC[1],vtxMC[2]);
 256
 257       // we search the MCEventHeaders first
 258       // Two cases, cocktail or not...
 259       AliGenCocktailEventHeader* genCocktailHeader = dynamic_cast<AliGenCocktailEventHeader*>(genHeader);
 260       if(genCocktailHeader){
 261           // we have a coktail header
 262           mcHeader->AddGeneratorName(genHeader->GetName());
 263           // Loop from the back so that the first one sets the process type
 264           TList* headerList = genCocktailHeader->GetHeaders();
 265           for(int i = headerList->GetEntries()-1;i>=0;--i){
 266               AliGenEventHeader *headerEntry = dynamic_cast<AliGenEventHeader*>(headerList->At(i));
 267               SetMCHeaderInfo(mcHeader,headerEntry);
 268           }
 269       }
 270       else{
 271           // No Cocktail just take the first one
 272           SetMCHeaderInfo(mcHeader,genHeader);
 273       }
 274   }
 275
 276
 277
 278
 279
 280   // Store the AliAODParticlesMC
 281   AliMCEvent* mcEvent = fMCEventH->MCEvent();
 282
 283   Int_t np    = mcEvent->GetNumberOfTracks();
 284   Int_t nprim = mcEvent->GetNumberOfPrimaries();
 285
 286
 287   Int_t j = 0;
 288   TClonesArray& l = *mcarray;
 289
 290   for(int i = 0; i < np; ++i){
 291       if(fMCEventH->IsParticleSelected(i)){
 292           Int_t flag = 0;
 293           AliMCParticle* mcpart =  (AliMCParticle*) mcEvent->GetTrack(i);
 294           if(i<nprim)flag |= AliAODMCParticle::kPrimary;
 295
 296           if(mcEvent->IsPhysicalPrimary(i))flag |= AliAODMCParticle::kPhysicalPrim;
 297
 298           if(fMCEventH->GetNewLabel(i)!=j){
 299               AliError(Form("MISMATCH New label %d j: %d",fMCEventH->GetNewLabel(i),j));
 300           }
 301
 302           AliAODMCParticle mcpart_tmp(mcpart,i,flag);
 303
 304           mcpart_tmp.SetStatus(mcpart->Particle()->GetStatusCode());
 305           //
 306           Int_t d0 =  mcpart_tmp.GetDaughter(0);
 307           Int_t d1 =  mcpart_tmp.GetDaughter(1);
 308           Int_t m =   mcpart_tmp.GetMother();
 309
 310           // other than for the track labels, negative values mean
 311           // no daughter/mother so preserve it
 312
 313           if(d0<0 && d1<0){
 314               // no first daughter -> no second daughter
 315               // nothing to be done
 316               // second condition not needed just for sanity check at the end
 317               mcpart_tmp.SetDaughter(0,d0);
 318               mcpart_tmp.SetDaughter(1,d1);
 319           } else if(d1 < 0 && d0 >= 0) {
 320               // Only one daughter
 321               // second condition not needed just for sanity check at the end
 322               if(fMCEventH->IsParticleSelected(d0)){
 323                   mcpart_tmp.SetDaughter(0,fMCEventH->GetNewLabel(d0));
 324               } else {
 325                   mcpart_tmp.SetDaughter(0,-1);
 326               }
 327               mcpart_tmp.SetDaughter(1,d1);
 328           }
 329           else if (d0 > 0 && d1 > 0 ){
 330               // we have two or more daughters loop on the stack to see if they are
 331               // selected
 332               Int_t d0_tmp = -1;
 333               Int_t d1_tmp = -1;
 334               for(int id = d0; id<=d1;++id){
 335                   if(fMCEventH->IsParticleSelected(id)){
 336                       if(d0_tmp==-1){
 337                           // first time
 338                           d0_tmp = fMCEventH->GetNewLabel(id);
 339                           d1_tmp = d0_tmp; // this is to have the same schema as on the stack i.e. with one daugther d0 and d1 are the same
 340                       }
 341                       else d1_tmp = fMCEventH->GetNewLabel(id);
 342                   }
 343               }
 344               mcpart_tmp.SetDaughter(0,d0_tmp);
 345               mcpart_tmp.SetDaughter(1,d1_tmp);
 346           } else {
 347               AliError(Form("Unxpected indices %d %d",d0,d1));
 348           }
 349
 350           if(m<0){
 351               mcpart_tmp.SetMother(m);
 352           } else {
 353               if(fMCEventH->IsParticleSelected(m))mcpart_tmp.SetMother(fMCEventH->GetNewLabel(m));
 354               else AliError(Form("PROBLEM Mother not selected %d \n", m));
 355           }
 356
 357           new (l[j++]) AliAODMCParticle(mcpart_tmp);
 358
 359       }
 360   }
 361   AliInfo(Form("AliAODHandler::StoreMCParticles: Selected %d (Primaries %d / total %d) after validation \n",
 362                j,nprim,np));
 363
 364   // Set the labels in the AOD output...
 365   // Remapping
 366
 367   // AODTracks
 368   TClonesArray* tracks = fAODEvent->GetTracks();
 369   if(tracks){
 370     for(int it = 0; it < fAODEvent->GetNTracks();++it){
 371       AliAODTrack *track = fAODEvent->GetTrack(it);
 372
 373       Int_t sign = 1;
 374       Int_t label = track->GetLabel();
 375       if(label<0){ // preserve the sign for later usage
 376         label *= -1;
 377         sign  = -1;
 378       }
 379
 380       if (label >= AliMCEvent::BgLabelOffset()) label =  mcEvent->BgLabelToIndex(label);
 381       if(label > np || track->GetLabel() == 0){
 382         AliWarning(Form("Wrong ESD track label %5d (%5d)",track->GetLabel(), label));
 383       }
 384       if(fMCEventH->GetNewLabel(label) == 0){
 385         AliWarning(Form("New label not found for %5d (%5d)",track->GetLabel(), label));
 386       }
 387       track->SetLabel(sign*fMCEventH->GetNewLabel(label));
 388     }
 389   }
 390
 391   // AOD calo cluster
 392   TClonesArray *clusters = fAODEvent->GetCaloClusters();
 393   if(clusters){
 394     for (Int_t iClust = 0;iClust < fAODEvent->GetNumberOfCaloClusters(); ++iClust) {
 395       AliAODCaloCluster * cluster = fAODEvent->GetCaloCluster(iClust);
 396       UInt_t nLabel    = cluster->GetNLabels();
 397       // Ugly but do not want to fragment memory by creating
 398       // new Int_t (nLabel)
 399       Int_t* labels    = const_cast<Int_t*>(cluster->GetLabels());
 400       if (labels){
 401         for(UInt_t i = 0;i < nLabel;++i){
 402           labels[i] = fMCEventH->GetNewLabel(cluster->GetLabelAt(i));
 403         }
 404       }
 405       //      cluster->SetLabels(labels,nLabel);
 406     }// iClust
 407   }// clusters
 408
 409   // AOD tracklets
 410   AliAODTracklets *tracklets = fAODEvent->GetTracklets();
 411   if(tracklets){
 412     for(int it = 0;it < tracklets->GetNumberOfTracklets();++it){
 413       int label0 = tracklets->GetLabel(it,0);
 414       int label1 = tracklets->GetLabel(it,1);
 415       if(label0>=0)label0 = fMCEventH->GetNewLabel(label0);
 416       if(label1>=0)label1 = fMCEventH->GetNewLabel(label1);
 417       tracklets->SetLabel(it,0,label0);
 418       tracklets->SetLabel(it,1,label1);
 419     }
 420   }
 421
 422 }
 423
 424 //______________________________________________________________________________
 425 Bool_t AliAODHandler::FinishEvent()
 426 {
 427   // Fill data structures
 428   if(fFillAOD && fFillAODRun && fAODEvent){
 429       fAODEvent->MakeEntriesReferencable();
 430       fTreeA->BranchRef();
 431       FillTree();
 432   }
 433
 434   if (fFillAOD && fFillAODRun) {
 435       if (fExtensions) {
 436           TIter next(fExtensions);
 437           AliAODExtension *ext;
 438           while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->FinishEvent();
 439       }
 440       if (fFilters) {
 441           TIter nextf(fFilters);
 442           AliAODExtension *ext;
 443           while ((ext=(AliAODExtension*)nextf())) {
 444               ext->FinishEvent();
 445           }
 446       }
 447   }
 448   if (fIsStandard) fAODEvent->ResetStd();
 449   if (fAODEvent) {
 450     TClonesArray *mcarray = (TClonesArray*)fAODEvent->FindListObject(AliAODMCParticle::StdBranchName());
 451     if(mcarray) mcarray->Delete();
 452
 453     AliAODMCHeader *mcHeader = (AliAODMCHeader*)fAODEvent->FindListObject(AliAODMCHeader::StdBranchName());
 454     if(mcHeader) mcHeader->Reset();
 455   }
 456   // Reset AOD replication flag
 457   fAODIsReplicated = kFALSE;
 458   return kTRUE;
 459 }
 460
 461 //______________________________________________________________________________
 462 Bool_t AliAODHandler::Terminate()
 463 {
 464   // Terminate
 465   AddAODtoTreeUserInfo();
 466   if (fExtensions) {
 467     TIter next(fExtensions);
 468     AliAODExtension *ext;
 469     while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->GetTree()->GetUserInfo()->Add(ext->GetAOD());
 470   }
 471   return kTRUE;
 472 }
 473
 474 //______________________________________________________________________________
 475 Bool_t AliAODHandler::TerminateIO()
 476 {
 477   // Terminate IO
 478   if (fFileA) {
 479     fFileA->Write();
 480     fFileA->Close();
 481     delete fFileA;
 482     fFileA = 0;
 483     // When closing the file, the tree is also deleted.
 484     fTreeA = 0;
 485   }
 486   if (fExtensions) {
 487     TIter next(fExtensions);
 488     AliAODExtension *ext;
 489     while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->TerminateIO();
 490   }
 491   if (fFilters) {
 492     TIter nextf(fFilters);
 493     AliAODExtension *ext;
 494     while ((ext=(AliAODExtension*)nextf())) ext->TerminateIO();
 495   }
 496   return kTRUE;
 497 }
 498
 499 //______________________________________________________________________________
 500 void AliAODHandler::CreateTree(Int_t flag)
 501 {
 502     // Creates the AOD Tree
 503     fTreeA = new TTree("aodTree", "AliAOD tree");
 504     fTreeA->Branch(fAODEvent->GetList());
 505     if (flag == 0) fTreeA->SetDirectory(0);
 506 }
 507
 508 //______________________________________________________________________________
 509 void AliAODHandler::FillTree()
 510 {
 511
 512     // Fill the AOD Tree
 513     fTreeA->Fill();
 514 }
 515
 516 //______________________________________________________________________________
 517 void AliAODHandler::AddAODtoTreeUserInfo()
 518 {
 519   // Add aod event to tree user info
 520   if (fTreeA) fTreeA->GetUserInfo()->Add(fAODEvent);
 521   // Now the tree owns our fAODEvent...
 522   fAODEvent = 0;
 523 }
 524
 525 //______________________________________________________________________________
 526 void AliAODHandler::AddBranch(const char* cname, void* addobj, const char* filename)
 527 {
 528     // Add a new branch to the aod. Added optional filename parameter if the
 529     // branch should be written to a separate file.
 530     if (strlen(filename)) {
 531        AliAODExtension *ext = AddExtension(filename);
 532        ext->AddBranch(cname, addobj);
 533        return;
 534     } else {
 535        // Add branch to all filters
 536       if (fFilters) {
 537          TIter next(fFilters);
 538          AliAODExtension *ext;
 539          while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->AddBranch(cname, addobj);
 540       }
 541     }
 542     TDirectory *owd = gDirectory;
 543     if (fFileA) {
 544       fFileA->cd();
 545     }
 546     char** apointer = (char**) addobj;
 547     TObject* obj = (TObject*) *apointer;
 548
 549     fAODEvent->AddObject(obj);
 550
 551     const Int_t kSplitlevel = 99; // default value in TTree::Branch()
 552     const Int_t kBufsize = 32000; // default value in TTree::Branch()
 553
 554     if (!fTreeA->FindBranch(obj->GetName())) {
 555       // Do the same as if we book via
 556       // TTree::Branch(TCollection*)
 557
 558       fTreeA->Bronch(obj->GetName(), cname, fAODEvent->GetList()->GetObjectRef(obj),
 559                      kBufsize, kSplitlevel - 1);
 560     }
 561     owd->cd();
 562 }
 563
 564 //______________________________________________________________________________
 565 AliAODExtension *AliAODHandler::AddExtension(const char *filename, const char *title)
 566 {
 567 // Add an AOD extension with some branches in a different file.
 568
 569    TString fname(filename);
 570    if (!fname.EndsWith(".root")) fname += ".root";
 571    if (!fExtensions) {
 572       fExtensions = new TObjArray();
 573       fExtensions->SetOwner();
 574    }
 575    AliAODExtension *ext = (AliAODExtension*)fExtensions->FindObject(fname);
 576    if (!ext) {
 577       ext = new AliAODExtension(fname, title);
 578       fExtensions->Add(ext);
 579    }
 580    return ext;
 581 }
 582
 583 //______________________________________________________________________________
 584 AliAODExtension *AliAODHandler::GetExtension(const char *filename) const
 585 {
 586 // Getter for AOD extensions via file name.
 587    if (!fExtensions) return NULL;
 588    return (AliAODExtension*)fExtensions->FindObject(filename);
 589 }
 590
 591 //______________________________________________________________________________
 592 AliAODExtension *AliAODHandler::AddFilteredAOD(const char *filename, const char *filtername)
 593 {
 594 // Add an AOD extension that can write only AOD events that pass a user filter.
 595    if (!fFilters) {
 596       fFilters = new TObjArray();
 597       fFilters->SetOwner();
 598    }
 599    AliAODExtension *filter = (AliAODExtension*)fFilters->FindObject(filename);
 600    if (!filter) {
 601       filter = new AliAODExtension(filename, filtername, kTRUE);
 602       fFilters->Add(filter);
 603    }
 604    return filter;
 605 }
 606
 607 //______________________________________________________________________________
 608 AliAODExtension *AliAODHandler::GetFilteredAOD(const char *filename) const
 609 {
 610 // Getter for AOD filters via file name.
 611    if (!fFilters) return NULL;
 612    return (AliAODExtension*)fFilters->FindObject(filename);
 613 }
 614
 615 //______________________________________________________________________________
 616 void AliAODHandler::SetOutputFileName(const char* fname)
 617 {
 618 // Set file name.
 619    fFileName = fname;
 620 }
 621
 622 //______________________________________________________________________________
 623 const char *AliAODHandler::GetOutputFileName()
 624 {
 625 // Get file name.
 626    return fFileName.Data();
 627 }
 628
 629 //______________________________________________________________________________
 630 const char *AliAODHandler::GetExtraOutputs() const
 631 {
 632 // Get extra outputs as a string separated by commas.
 633    static TString eoutputs;
 634    eoutputs = "";
 635    TObject *obj;
 636    if (fExtensions) {
 637       TIter next1(fExtensions);
 638       while ((obj=next1())) {
 639          if (!eoutputs.IsNull()) eoutputs += ",";
 640          eoutputs += obj->GetName();
 641       }
 642    }
 643    if (fFilters) {
 644       TIter next2(fFilters);
 645       while ((obj=next2())) {
 646          if (!eoutputs.IsNull()) eoutputs += ",";
 647          eoutputs += obj->GetName();
 648       }
 649    }
 650    return eoutputs.Data();
 651 }
 652
 653 //______________________________________________________________________________
 654 void  AliAODHandler::SetMCHeaderInfo(AliAODMCHeader *mcHeader,AliGenEventHeader *genHeader){
 655
 656
 657   // Utility function to cover different cases for the AliGenEventHeader
 658   // Needed since different ProcessType and ImpactParamter are not
 659   // in the base class...
 660   // We don't encode process types for event cocktails yet
 661   // could be done e.g. by adding offsets depnding on the generator
 662
 663   mcHeader->AddGeneratorName(genHeader->GetName());
 664   if(!genHeader)return;
 665   AliGenPythiaEventHeader *pythiaGenHeader = dynamic_cast<AliGenPythiaEventHeader*>(genHeader);
 666     if (pythiaGenHeader) {
 667       mcHeader->SetEventType(pythiaGenHeader->ProcessType());
 668       mcHeader->SetPtHard(pythiaGenHeader->GetPtHard());
 669       return;
 670     }
 671
 672     AliGenDPMjetEventHeader* dpmJetGenHeader = dynamic_cast<AliGenDPMjetEventHeader*>(genHeader);
 673
 674   if (dpmJetGenHeader){
 675     mcHeader->SetEventType(dpmJetGenHeader->ProcessType());
 676     return;
 677   }
 678
 679   AliGenHijingEventHeader* hijingGenHeader = dynamic_cast<AliGenHijingEventHeader*>(genHeader);
 680   if(hijingGenHeader){
 681     mcHeader->SetImpactParameter(hijingGenHeader->ImpactParameter());
 682     return;
 683   }
 684
 685   AliWarning(Form("MC Eventheader not known: %s",genHeader->GetName()));
 686
 687 }
 688
 689 ClassImp(AliAODExtension)
 690
 691 //-------------------------------------------------------------------------
 692 //     Support class for AOD extensions. This is created by the user analysis
 693 //     that requires a separate file for some AOD branches. The name of the
 694 //     AliAODExtension object is the file name where the AOD branches will be
 695 //     stored.
 696 //-------------------------------------------------------------------------
 697
 698 //______________________________________________________________________________
 699 AliAODExtension::AliAODExtension() : TNamed(),
 700 fAODEvent(0), fTreeE(0), fFileE(0), fNtotal(0), fNpassed(0),
 701 fSelected(kFALSE), fRepFiMap(0x0), fRepFiList(0x0), fEnableReferences(kTRUE), fObjectList(0x0)
 702 {
 703   // default ctor
 704 }
 705
 706 //______________________________________________________________________________
 707 AliAODExtension::AliAODExtension(const char* name, const char* title, Bool_t isfilter)
 708                 :TNamed(name,title),
 709                  fAODEvent(0),
 710                  fTreeE(0),
 711                  fFileE(0),
 712                  fNtotal(0),
 713                  fNpassed(0),
 714                  fSelected(kFALSE),
 715 fRepFiMap(0x0),
 716 fRepFiList(0x0),
 717 fEnableReferences(kTRUE),
 718 fObjectList(0x0)
 719 {
 720 // Constructor.
 721   if (isfilter) {
 722     TObject::SetBit(kFilteredAOD);
 723     printf("####### Added AOD filter %s\n", name);
 724   } else printf("####### Added AOD extension %s\n", name);
 725 }
 726
 727 //______________________________________________________________________________
 728 AliAODExtension::~AliAODExtension()
 729 {
 730 // Destructor.
 731   if(fFileE){
 732     // is already handled in TerminateIO
 733     fFileE->Close();
 734     delete fFileE;
 735     fTreeE = 0;
 736     fAODEvent = 0;
 737   }
 738   if (fTreeE) delete fTreeE;
 739   if (fRepFiMap) fRepFiMap->DeleteAll();
 740   delete fRepFiMap; // the map is owner
 741   delete fRepFiList; // the list is not
 742   delete fObjectList; // not owner
 743 }
 744
 745 //______________________________________________________________________________
 746 void AliAODExtension::AddBranch(const char* cname, void* addobj)
 747 {
 748     // Add a new branch to the aod
 749 //    if (IsFilteredAOD()) {
 750 //       Error("AddBranch", "Not allowed to add branched to filtered AOD's.");
 751 //       return;
 752 //    }
 753   AliCodeTimerAuto(GetName(),0);
 754
 755     if (!fAODEvent) {
 756        char type[20];
 757        gROOT->ProcessLine(Form("TString s_tmp; AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetAnalysisTypeString(s_tmp); sprintf((char*)%p, \"%%s\", s_tmp.Data());", type));
 758        Init(type);
 759     }
 760     TDirectory *owd = gDirectory;
 761     if (fFileE) {
 762       fFileE->cd();
 763     }
 764     char** apointer = (char**) addobj;
 765     TObject* obj = (TObject*) *apointer;
 766
 767     fAODEvent->AddObject(obj);
 768
 769     const Int_t kSplitlevel = 99; // default value in TTree::Branch()
 770     const Int_t kBufsize = 32000; // default value in TTree::Branch()
 771
 772     if (!fTreeE->FindBranch(obj->GetName())) {
 773       // Do the same as if we book via
 774       // TTree::Branch(TCollection*)
 775       fTreeE->Bronch(obj->GetName(), cname, fAODEvent->GetList()->GetObjectRef(obj),
 776                      kBufsize, kSplitlevel - 1);
 777     }
 778     owd->cd();
 779 }
 780
 781 //______________________________________________________________________________
 782 Bool_t AliAODExtension::FinishEvent()
 783 {
 784 // Fill current event.
 785   fNtotal++;
 786   if (!IsFilteredAOD()) {
 787     fAODEvent->MakeEntriesReferencable();
 788     fTreeE->Fill();
 789     return kTRUE;
 790   }
 791   // Filtered AOD. Fill only if event is selected.
 792   if (!fSelected) return kTRUE;
 793
 794   TIter next(fRepFiList);
 795
 796   AliAODBranchReplicator* repfi;
 797
 798   while ( ( repfi = static_cast<AliAODBranchReplicator*>(next()) ) )
 799   {
 800     repfi->ReplicateAndFilter(*fAODEvent);
 801   }
 802   fNpassed++;
 803   fTreeE->Fill();
 804   fSelected = kFALSE; // so that next event will not be selected unless demanded
 805   return kTRUE;
 806 }
 807
 808 //______________________________________________________________________________
 809 Bool_t AliAODExtension::Init(Option_t *option)
 810 {
 811 // Initialize IO.
 812   AliCodeTimerAuto(GetName(),0);
 813
 814   if(!fAODEvent)
 815   {
 816     fAODEvent = new AliAODEvent();
 817   }
 818
 819   TDirectory *owd = gDirectory;
 820   TString opt(option);
 821   opt.ToLower();
 822   if (opt.Contains("proof")) {
 823     // proof
 824     // Merging via files. Need to access analysis manager via interpreter.
 825     gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisDataContainer *c_common_out = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetCommonOutputContainer();"));
 826     gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->OpenProofFile(c_common_out, \"RECREATE\", \"%s\");", fName.Data()));
 827     fFileE = gFile;
 828   } else {
 829     fFileE = new TFile(GetName(), "RECREATE");
 830   }
 831   fTreeE = new TTree("aodTree", "AliAOD tree");
 832
 833   delete fObjectList;
 834   fObjectList = new TList;
 835   fObjectList->SetOwner(kFALSE); // be explicit we're not the owner...
 836   TIter next(fAODEvent->GetList());
 837   TObject* o;
 838
 839   while ( ( o = next() ) )
 840   {
 841     if ( fRepFiMap )
 842     {
 843       TObject* specified = fRepFiMap->FindObject(o->GetName());
 844       if (specified)
 845       {
 846         AliAODBranchReplicator* repfi = dynamic_cast<AliAODBranchReplicator*>(fRepFiMap->GetValue(o->GetName()));
 847         if ( repfi )
 848         {
 849           TList* replicatedList = repfi->GetList();
 850           if (replicatedList)
 851           {
 852             AliAODEvent::AssignIDtoCollection(replicatedList);
 853             TIter nextRep(replicatedList);
 854             TObject* objRep;
 855             while ( ( objRep = nextRep() ) )
 856             {
 857               if (!fObjectList->FindObject(objRep))
 858               {
 859                 fObjectList->Add(objRep);
 860               }
 861             }
 862           }
 863           else
 864           {
 865             AliError(Form("replicatedList from %s is null !",repfi->GetName()));
 866           }
 867         }
 868       }
 869       else
 870       {
 871         fObjectList->Add(o);
 872       }
 873     }
 874     else
 875     {
 876       // no replicator / filter map created, so works as before, i.e.
 877       // assume we copy everything.
 878       fObjectList->Add(o);
 879     }
 880   }
 881
 882   next.Reset();
 883
 884   while ( ( o = next() ) )
 885   {
 886     TObject* out = fObjectList->FindObject(o->GetName());
 887     AliInfo(Form("OBJECT IN %20s %p -> OUT %p %s",o->GetName(),o,out,((out!=o && out) ? "REPLICATED":"-")));
 888   }
 889
 890   if (fEnableReferences) fTreeE->BranchRef();
 891
 892   fTreeE->Branch(fObjectList);
 893
 894   owd->cd();
 895
 896   return kTRUE;
 897 }
 898
 899 //______________________________________________________________________________
 900 void AliAODExtension::Print(Option_t* opt) const
 901 {
 902   // Print info about this extension
 903
 904   cout << opt << Form("AliAODExtension - %s - %s",GetName(),GetTitle()) << endl;
 905   cout << opt << opt << Form("References are %s enabled",fEnableReferences ? "" : "not") << endl;
 906
 907   TIter next(fRepFiMap);
 908   TObjString* s;
 909
 910   TString skipped;
 911
 912   while ( ( s = static_cast<TObjString*>(next()) ) )
 913   {
 914     AliAODBranchReplicator* br = static_cast<AliAODBranchReplicator*>(fRepFiMap->GetValue(s->String().Data()));
 915     if ( !br )
 916     {
 917       skipped += s->String();
 918       skipped += ' ';
 919     }
 920   }
 921
 922   if ( skipped.Length() )
 923   {
 924     cout << opt << opt << "Branches that will be skipped altogether : " << skipped.Data() << endl;
 925   }
 926
 927   next.Reset();
 928
 929   while ( ( s = static_cast<TObjString*>(next()) ) )
 930   {
 931     AliAODBranchReplicator* br = static_cast<AliAODBranchReplicator*>(fRepFiMap->GetValue(s->String().Data()));
 932
 933     if (br)
 934     {
 935       cout << opt << opt << "Branch " << s->String()
 936       << " will be filtered by class " << br->ClassName() << endl;
 937     }
 938   }
 939 }
 940
 941 //______________________________________________________________________________
 942 void AliAODExtension::SetEvent(AliAODEvent *event)
 943 {
 944 // Connects to an external event
 945    if (!IsFilteredAOD()) {
 946       Error("SetEvent", "Not allowed to set external event for filtered AOD's");
 947       return;
 948    }
 949    // Use the copy constructor or assignment operator to synchronize with external event.
 950 //   AliAODEvent &other = *event;
 951 //   if (!fAODEvent)     fAODEvent = new AliAODEvent(other);
 952 //   else if (fSelected) *fAODEvent = other;
 953    fAODEvent = event;
 954 }
 955
 956 //______________________________________________________________________________
 957 Bool_t AliAODExtension::TerminateIO()
 958 {
 959   // Terminate IO
 960   if (TObject::TestBit(kFilteredAOD))
 961     printf("AOD Filter %s: events processed: %d   passed: %d\n", GetName(), fNtotal, fNpassed);
 962   else
 963     printf("AOD extension %s: events processed: %d\n", GetName(), fNtotal);
 964   if (fFileE) {
 965     fFileE->Write();
 966     fFileE->Close();
 967     delete fFileE;
 968     fFileE = 0;
 969     fTreeE = 0;
 970     fAODEvent = 0;
 971   }
 972   return kTRUE;
 973 }
 974
 975 //______________________________________________________________________________
 976 void AliAODExtension::FilterBranch(const char* branchName, AliAODBranchReplicator* repfi)
 977 {
 978   // Specify a filter/replicator for a given branch
 979   //
 980   // If repfi=0x0, this will disable the branch (in the output) completely.
 981   //
 982   // repfi is adopted by this class, i.e. user should not delete it.
 983   //
 984   // WARNING : branch name must be exact.
 985   //
 986   // See also the documentation for AliAODBranchReplicator class.
 987   //
 988
 989   if (!fRepFiMap)
 990   {
 991     fRepFiMap = new TMap;
 992     fRepFiMap->SetOwnerKeyValue(kTRUE,kTRUE);
 993     fRepFiList = new TList;
 994     fRepFiList->SetOwner(kFALSE);
 995   }
 996
 997   fRepFiMap->Add(new TObjString(branchName),repfi);
 998
 999   if (repfi && !fRepFiList->FindObject(repfi))
1000   {
1001     // insure we get unique and non-null replicators in this list
1002     fRepFiList->Add(repfi);
1003   }
1004 }