STEER/AliGenInfo.C

   1 /**************************************************************************
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   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  18 /*
  19
  20 Origin: marian.ivanov@cern.ch
  21
  22 Macro to generate comples MC information - used for Comparison later on
  23 How to use it?
  24
  25 .L $ALICE_ROOT/STEER/AliGenInfo.C+
  26 AliGenInfoMaker *t = new AliGenInfoMaker("galice.root","genTracks.root",0,0)
  27 t->Exec();
  28
  29 */
  30
  31 #if !defined(__CINT__) || defined(__MAKECINT__)
  32 #include <stdio.h>
  33 #include <string.h>
  34 //ROOT includes
  35 #include "Rtypes.h"
  36 #include "TFile.h"
  37 #include "TTree.h"
  38 #include "TChain.h"
  39 #include "TCut.h"
  40 #include "TString.h"
  41 #include "TBenchmark.h"
  42 #include "TStopwatch.h"
  43 #include "TParticle.h"
  44 #include "TSystem.h"
  45 #include "TTimer.h"
  46 #include "TVector3.h"
  47 #include "TH1F.h"
  48 #include "TH2F.h"
  49 #include "TCanvas.h"
  50 #include "TPad.h"
  51 #include "TF1.h"
  52 #include "TView.h"
  53 #include "TGeometry.h"
  54 #include "TPolyLine3D.h"
  55
  56 //ALIROOT includes
  57 #include "AliRun.h"
  58 #include "AliStack.h"
  59 #include "AliSimDigits.h"
  60 #include "AliTPCParam.h"
  61 #include "AliTPC.h"
  62 #include "AliTPCLoader.h"
  63 #include "AliDetector.h"
  64 #include "AliTrackReference.h"
  65 #include "AliTPCParamSR.h"
  66 #include "AliTracker.h"
  67 #include "AliMagF.h"
  68 #include "AliHelix.h"
  69 #include "AliPoints.h"
  70
  71 #endif
  72 #include "AliGenInfo.h"
  73 //
  74 //
  75
  76 AliTPCParam * GetTPCParam(){
  77   AliTPCParamSR * par = new AliTPCParamSR;
  78   par->Update();
  79   return par;
  80 }
  81
  82
  83 //_____________________________________________________________________________
  84 Float_t TPCBetheBloch(Float_t bg)
  85 {
  86   //
  87   // Bethe-Bloch energy loss formula
  88   //
  89   const Double_t kp1=0.76176e-1;
  90   const Double_t kp2=10.632;
  91   const Double_t kp3=0.13279e-4;
  92   const Double_t kp4=1.8631;
  93   const Double_t kp5=1.9479;
  94
  95   Double_t dbg = (Double_t) bg;
  96
  97   Double_t beta = dbg/TMath::Sqrt(1.+dbg*dbg);
  98
  99   Double_t aa = TMath::Power(beta,kp4);
 100   Double_t bb = TMath::Power(1./dbg,kp5);
 101
 102   bb=TMath::Log(kp3+bb);
 103
 104   return ((Float_t)((kp2-aa-bb)*kp1/aa));
 105 }
 106
 107 AliPointsMI::AliPointsMI(){
 108   fN=0;
 109   fX=0;
 110   fY=0;
 111   fZ=0;
 112   fCapacity = 0;
 113   fLabel0=0;
 114   fLabel1=0;
 115 }
 116
 117
 118 AliPointsMI::AliPointsMI(Int_t n, Float_t *x,Float_t *y, Float_t *z){
 119   //
 120   //
 121   fN=n;
 122   fCapacity = 1000+2*n;
 123   fX= new Float_t[n];
 124   fY= new Float_t[n];
 125   fZ= new Float_t[n];
 126   memcpy(fX,x,n*sizeof(Float_t));
 127   memcpy(fY,y,n*sizeof(Float_t));
 128   memcpy(fZ,z,n*sizeof(Float_t));
 129   fLabel0=0;
 130   fLabel1=0;
 131 }
 132
 133 void AliPointsMI::Reset()
 134 {
 135   fN=0;
 136 }
 137
 138 void AliPointsMI::Reset(AliDetector * det, Int_t particle){
 139   //
 140   // write points from detector points
 141   //
 142   Reset();
 143   if (!det) return;
 144   TObjArray *array = det->Points();
 145   if (!array) return;
 146   for (Int_t i=0;i<array->GetEntriesFast();i++){
 147     AliPoints * points = (AliPoints*) array->At(i);
 148     if (!points) continue;
 149     if (points->GetIndex()!=particle) continue;
 150     Int_t npoints = points->GetN();
 151     if (npoints<2) continue;
 152     Int_t delta = npoints/100;
 153     if (delta<1) delta=1;
 154     if (delta>10) delta=10;
 155     Int_t mypoints = npoints/delta;
 156     //
 157     fN = mypoints;
 158     if (fN>fCapacity){
 159       fCapacity = 1000+2*fN;
 160       delete []fX;
 161       delete []fY;
 162       delete []fZ;
 163       fX = new Float_t[fCapacity];
 164       fY = new Float_t[fCapacity];
 165       fZ = new Float_t[fCapacity];
 166     }
 167     Float_t *xyz = points->GetP();
 168     for (Int_t ipoint=0;ipoint<mypoints;ipoint++){
 169       Int_t index = 3*ipoint*delta;
 170       fX[ipoint]=0;
 171       fY[ipoint]=0;
 172       fZ[ipoint]=0;
 173       if (index+2<npoints*3){
 174         fX[ipoint] = xyz[index];
 175         fY[ipoint] = xyz[index+1];
 176         fZ[ipoint] = xyz[index+2];
 177       }
 178     }
 179   }
 180   fLabel0 = particle;
 181 }
 182
 183
 184 AliPointsMI::~AliPointsMI(){
 185   fN=0;
 186   fCapacity =0;
 187   delete[] fX;
 188   delete[]fY;
 189   delete []fZ;
 190   fX=0;fY=0;fZ=0;
 191 }
 192
 193
 194
 195
 196
 197 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 198 AliMCInfo::AliMCInfo()
 199 {
 200   fTPCReferences  = new TClonesArray("AliTrackReference",10);
 201   fITSReferences  = new TClonesArray("AliTrackReference",10);
 202   fTRDReferences  = new TClonesArray("AliTrackReference",10);
 203   fTOFReferences  = new TClonesArray("AliTrackReference",10);
 204   fTRdecay.SetTrack(-1);
 205   fCharge = 0;
 206 }
 207
 208 AliMCInfo::~AliMCInfo()
 209 {
 210   if (fTPCReferences) {
 211     delete fTPCReferences;
 212   }
 213   if (fITSReferences){
 214     delete fITSReferences;
 215   }
 216   if (fTRDReferences){
 217     delete fTRDReferences;
 218   }
 219   if (fTOFReferences){
 220     delete fTOFReferences;
 221   }
 222
 223 }
 224
 225
 226
 227 void AliMCInfo::Update()
 228 {
 229   //
 230   //
 231   fMCtracks =1;
 232   if (!fTPCReferences) {
 233     fNTPCRef =0;
 234     return;
 235   }
 236   Float_t direction=1;
 237   //Float_t rlast=0;
 238   fNTPCRef = fTPCReferences->GetEntriesFast();
 239   fNITSRef = fITSReferences->GetEntriesFast();
 240   fNTRDRef = fTRDReferences->GetEntriesFast();
 241   fNTOFRef = fTOFReferences->GetEntriesFast();
 242
 243   for (Int_t iref =0;iref<fTPCReferences->GetEntriesFast();iref++){
 244     AliTrackReference * ref = (AliTrackReference *) fTPCReferences->At(iref);
 245     //Float_t r = (ref->X()*ref->X()+ref->Y()*ref->Y());
 246     Float_t newdirection = ref->X()*ref->Px()+ref->Y()*ref->Py(); //inside or outside
 247     if (iref==0) direction = newdirection;
 248     if ( newdirection*direction<0){
 249       //changed direction
 250       direction = newdirection;
 251       fMCtracks+=1;
 252     }
 253     //rlast=r;
 254   }
 255   //
 256   // decay info
 257   fTPCdecay=kFALSE;
 258   if (fTRdecay.GetTrack()>0){
 259     fDecayCoord[0] = fTRdecay.X();
 260     fDecayCoord[1] = fTRdecay.Y();
 261     fDecayCoord[2] = fTRdecay.Z();
 262     if ( (fTRdecay.R()<250)&&(fTRdecay.R()>85) && (TMath::Abs(fTRdecay.Z())<250) ){
 263       fTPCdecay=kTRUE;
 264     }
 265     else{
 266       fDecayCoord[0] = 0;
 267       fDecayCoord[1] = 0;
 268       fDecayCoord[2] = 0;
 269     }
 270   }
 271   //
 272   //
 273   //digits information update
 274   fRowsWithDigits    = fTPCRow.RowsOn();
 275   fRowsWithDigitsInn = fTPCRow.RowsOn(63); // 63 = number of inner rows
 276   fRowsTrackLength   = fTPCRow.Last() - fTPCRow.First();
 277   //
 278   //
 279   // calculate primary ionization per cm
 280   if (fParticle.GetPDG()){
 281     fMass = fParticle.GetMass();
 282     fCharge = fParticle.GetPDG()->Charge();
 283     if (fTPCReferences->GetEntriesFast()>0){
 284       fTrackRef = *((AliTrackReference*)fTPCReferences->At(0));
 285     }
 286     if (fMass>0){
 287       Float_t p = TMath::Sqrt(fTrackRef.Px()*fTrackRef.Px()+
 288                               fTrackRef.Py()*fTrackRef.Py()+
 289                               fTrackRef.Pz()*fTrackRef.Pz());
 290       if (p>0.001){
 291         Float_t betagama = p /fMass;
 292         fPrim = TPCBetheBloch(betagama);
 293       }else fPrim=0;
 294     }
 295   }else{
 296     fMass =0;
 297     fPrim =0;
 298   }
 299 }
 300
 301 /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 302 /*
 303 void AliGenV0Info::Update()
 304 {
 305   fMCPd[0] = fMCd.fParticle.Px();
 306   fMCPd[1] = fMCd.fParticle.Py();
 307   fMCPd[2] = fMCd.fParticle.Pz();
 308   fMCPd[3] = fMCd.fParticle.P();
 309   //
 310   fMCX[0]  = fMCd.fParticle.Vx();
 311   fMCX[1]  = fMCd.fParticle.Vy();
 312   fMCX[2]  = fMCd.fParticle.Vz();
 313   fMCR       = TMath::Sqrt( fMCX[0]*fMCX[0]+fMCX[1]*fMCX[1]);
 314   //
 315   fPdg[0]    = fMCd.fParticle.GetPdgCode();
 316   fPdg[1]    = fMCm.fParticle.GetPdgCode();
 317   //
 318   fLab[0]    = fMCd.fParticle.GetUniqueID();
 319   fLab[1]    = fMCm.fParticle.GetUniqueID();
 320   //
 321 }
 322 */
 323
 324 void AliGenV0Info::Update(Float_t vertex[3])
 325 {
 326   fMCPd[0] = fMCd.fParticle.Px();
 327   fMCPd[1] = fMCd.fParticle.Py();
 328   fMCPd[2] = fMCd.fParticle.Pz();
 329   fMCPd[3] = fMCd.fParticle.P();
 330   //
 331   fMCX[0]  = fMCd.fParticle.Vx();
 332   fMCX[1]  = fMCd.fParticle.Vy();
 333   fMCX[2]  = fMCd.fParticle.Vz();
 334   fMCR       = TMath::Sqrt( fMCX[0]*fMCX[0]+fMCX[1]*fMCX[1]);
 335   //
 336   fPdg[0]    = fMCd.fParticle.GetPdgCode();
 337   fPdg[1]    = fMCm.fParticle.GetPdgCode();
 338   //
 339   fLab[0]    = fMCd.fParticle.GetUniqueID();
 340   fLab[1]    = fMCm.fParticle.GetUniqueID();
 341   //
 342   //
 343   //
 344   Double_t x1[3],p1[3];
 345   TParticle & pdaughter = fMCd.fParticle;
 346   x1[0] = pdaughter.Vx();
 347   x1[1] = pdaughter.Vy();
 348   x1[2] = pdaughter.Vz();
 349   p1[0] = pdaughter.Px();
 350   p1[1] = pdaughter.Py();
 351   p1[2] = pdaughter.Pz();
 352   Double_t sign = (pdaughter.GetPDG()->Charge()>0)? -1:1;
 353   AliHelix dhelix1(x1,p1,sign);
 354   //
 355   //
 356   Double_t x2[3],p2[3];
 357   //
 358   TParticle & pmother = fMCm.fParticle;
 359   x2[0] = pmother.Vx();
 360   x2[1] = pmother.Vy();
 361   x2[2] = pmother.Vz();
 362   p2[0] = pmother.Px();
 363   p2[1] = pmother.Py();
 364   p2[2] = pmother.Pz();
 365   //
 366   //
 367   sign = (pmother.GetPDG()->Charge()>0) ? -1:1;
 368   AliHelix mhelix(x2,p2,sign);
 369
 370   //
 371   //
 372   //
 373   //find intersection linear
 374   //
 375   Double_t distance1, distance2;
 376   Double_t phase[2][2],radius[2];
 377   Int_t  points = dhelix1.GetRPHIintersections(mhelix, phase, radius);
 378   Double_t delta1=10000,delta2=10000;
 379   if (points>0){
 380     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
 381     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
 382     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
 383   }
 384   else{
 385     fInvMass=-1;
 386     return;
 387   }
 388   if (points==2){
 389     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
 390     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
 391     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
 392   }
 393   distance1 = TMath::Min(delta1,delta2);
 394   //
 395   //find intersection parabolic
 396   //
 397   points = dhelix1.GetRPHIintersections(mhelix, phase, radius);
 398   delta1=10000,delta2=10000;
 399
 400   if (points>0){
 401     dhelix1.ParabolicDCA(mhelix,phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
 402   }
 403   if (points==2){
 404     dhelix1.ParabolicDCA(mhelix,phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
 405   }
 406
 407   distance2 = TMath::Min(delta1,delta2);
 408   //
 409   if (delta1<delta2){
 410     //get V0 info
 411     dhelix1.Evaluate(phase[0][0],fMCXr);
 412     dhelix1.GetMomentum(phase[0][0],fMCPdr);
 413     mhelix.GetMomentum(phase[0][1],fMCPm);
 414     dhelix1.GetAngle(phase[0][0],mhelix,phase[0][1],fMCAngle);
 415     fMCRr = TMath::Sqrt(radius[0]);
 416   }
 417   else{
 418     dhelix1.Evaluate(phase[1][0],fMCXr);
 419     dhelix1.GetMomentum(phase[1][0],fMCPdr);
 420     mhelix.GetMomentum(phase[1][1],fMCPm);
 421     dhelix1.GetAngle(phase[1][0],mhelix,phase[1][1],fMCAngle);
 422     fMCRr = TMath::Sqrt(radius[1]);
 423   }
 424   //
 425   //
 426   fMCDist1 = TMath::Sqrt(distance1);
 427   fMCDist2 = TMath::Sqrt(distance2);
 428   //
 429   //
 430   //
 431   Float_t v[3] = {fMCXr[0]-vertex[0],fMCXr[1]-vertex[1],fMCXr[2]-vertex[2]};
 432   //Float_t v[3] = {fMCXr[0],fMCXr[1],fMCXr[2]};
 433   Float_t p[3] = {fMCPdr[0]+fMCPm[0], fMCPdr[1]+fMCPm[1],fMCPdr[2]+fMCPm[2]};
 434   Float_t vnorm2 = v[0]*v[0]+v[1]*v[1];
 435   Float_t vnorm3 = TMath::Sqrt(v[2]*v[2]+vnorm2);
 436   vnorm2 = TMath::Sqrt(vnorm2);
 437   Float_t pnorm2 = p[0]*p[0]+p[1]*p[1];
 438   Float_t pnorm3 = TMath::Sqrt(p[2]*p[2]+pnorm2);
 439   pnorm2 = TMath::Sqrt(pnorm2);
 440   //
 441   fPointAngleFi = (v[0]*p[0]+v[1]*p[1])/(vnorm2*pnorm2);
 442   fPointAngleTh = (v[2]*p[2]+vnorm2*pnorm2)/(vnorm3*pnorm3);
 443   fPointAngle   = (v[0]*p[0]+v[1]*p[1]+v[2]*p[2])/(vnorm3*pnorm3);
 444   Double_t mass1 = fMCd.fMass;
 445   Double_t mass2 = fMCm.fMass;
 446
 447
 448   Double_t e1    = TMath::Sqrt(mass1*mass1+
 449                               fMCPd[0]*fMCPd[0]+
 450                               fMCPd[1]*fMCPd[1]+
 451                               fMCPd[2]*fMCPd[2]);
 452   Double_t e2    = TMath::Sqrt(mass2*mass2+
 453                               fMCPm[0]*fMCPm[0]+
 454                               fMCPm[1]*fMCPm[1]+
 455                               fMCPm[2]*fMCPm[2]);
 456
 457   fInvMass =
 458     (fMCPm[0]+fMCPd[0])*(fMCPm[0]+fMCPd[0])+
 459     (fMCPm[1]+fMCPd[1])*(fMCPm[1]+fMCPd[1])+
 460     (fMCPm[2]+fMCPd[2])*(fMCPm[2]+fMCPd[2]);
 461
 462   //  fInvMass = TMath::Sqrt((e1+e2)*(e1+e2)-fInvMass);
 463   fInvMass = (e1+e2)*(e1+e2)-fInvMass;
 464   if (fInvMass>0) fInvMass = TMath::Sqrt(fInvMass);
 465
 466
 467 }
 468
 469
 470
 471 /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 472 void AliGenKinkInfo::Update()
 473 {
 474   fMCPd[0] = fMCd.fParticle.Px();
 475   fMCPd[1] = fMCd.fParticle.Py();
 476   fMCPd[2] = fMCd.fParticle.Pz();
 477   fMCPd[3] = fMCd.fParticle.P();
 478   //
 479   fMCX[0]  = fMCd.fParticle.Vx();
 480   fMCX[1]  = fMCd.fParticle.Vy();
 481   fMCX[2]  = fMCd.fParticle.Vz();
 482   fMCR       = TMath::Sqrt( fMCX[0]*fMCX[0]+fMCX[1]*fMCX[1]);
 483   //
 484   fPdg[0]    = fMCd.fParticle.GetPdgCode();
 485   fPdg[1]    = fMCm.fParticle.GetPdgCode();
 486   //
 487   fLab[0]    = fMCd.fParticle.GetUniqueID();
 488   fLab[1]    = fMCm.fParticle.GetUniqueID();
 489   //
 490   //
 491   //
 492   Double_t x1[3],p1[3];
 493   TParticle & pdaughter = fMCd.fParticle;
 494   x1[0] = pdaughter.Vx();
 495   x1[1] = pdaughter.Vy();
 496   x1[2] = pdaughter.Vz();
 497   p1[0] = pdaughter.Px();
 498   p1[1] = pdaughter.Py();
 499   p1[2] = pdaughter.Pz();
 500   Double_t sign = (pdaughter.GetPDG()->Charge()>0)? -1:1;
 501   AliHelix dhelix1(x1,p1,sign);
 502   //
 503   //
 504   Double_t x2[3],p2[3];
 505   //
 506   TParticle & pmother = fMCm.fParticle;
 507   x2[0] = pmother.Vx();
 508   x2[1] = pmother.Vy();
 509   x2[2] = pmother.Vz();
 510   p2[0] = pmother.Px();
 511   p2[1] = pmother.Py();
 512   p2[2] = pmother.Pz();
 513   //
 514   AliTrackReference & pdecay = fMCm.fTRdecay;
 515   x2[0] = pdecay.X();
 516   x2[1] = pdecay.Y();
 517   x2[2] = pdecay.Z();
 518   p2[0] = pdecay.Px();
 519   p2[1] = pdecay.Py();
 520   p2[2] = pdecay.Pz();
 521   //
 522   sign = (pmother.GetPDG()->Charge()>0) ? -1:1;
 523   AliHelix mhelix(x2,p2,sign);
 524
 525   //
 526   //
 527   //
 528   //find intersection linear
 529   //
 530   Double_t distance1, distance2;
 531   Double_t phase[2][2],radius[2];
 532   Int_t  points = dhelix1.GetRPHIintersections(mhelix, phase, radius);
 533   Double_t delta1=10000,delta2=10000;
 534   if (points>0){
 535     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
 536     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
 537     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
 538   }
 539   if (points==2){
 540     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
 541     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
 542     dhelix1.LinearDCA(mhelix,phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
 543   }
 544   distance1 = TMath::Min(delta1,delta2);
 545   //
 546   //find intersection parabolic
 547   //
 548   points = dhelix1.GetRPHIintersections(mhelix, phase, radius);
 549   delta1=10000,delta2=10000;
 550
 551   if (points>0){
 552     dhelix1.ParabolicDCA(mhelix,phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
 553   }
 554   if (points==2){
 555     dhelix1.ParabolicDCA(mhelix,phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
 556   }
 557
 558   distance2 = TMath::Min(delta1,delta2);
 559   //
 560   if (delta1<delta2){
 561     //get V0 info
 562     dhelix1.Evaluate(phase[0][0],fMCXr);
 563     dhelix1.GetMomentum(phase[0][0],fMCPdr);
 564     mhelix.GetMomentum(phase[0][1],fMCPm);
 565     dhelix1.GetAngle(phase[0][0],mhelix,phase[0][1],fMCAngle);
 566     fMCRr = TMath::Sqrt(radius[0]);
 567   }
 568   else{
 569     dhelix1.Evaluate(phase[1][0],fMCXr);
 570     dhelix1.GetMomentum(phase[1][0],fMCPdr);
 571     mhelix.GetMomentum(phase[1][1],fMCPm);
 572     dhelix1.GetAngle(phase[1][0],mhelix,phase[1][1],fMCAngle);
 573     fMCRr = TMath::Sqrt(radius[1]);
 574   }
 575   //
 576   //
 577   fMCDist1 = TMath::Sqrt(distance1);
 578   fMCDist2 = TMath::Sqrt(distance2);
 579
 580 }
 581
 582
 583 Float_t AliGenKinkInfo::GetQt(){
 584   //
 585   //
 586   Float_t momentumd = TMath::Sqrt(fMCPd[0]*fMCPd[0]+fMCPd[1]*fMCPd[1]+fMCPd[2]*fMCPd[2]);
 587   return TMath::Sin(fMCAngle[2])*momentumd;
 588 }
 589
 590
 591
 592
 593 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 594
 595 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 596 //
 597 // End of implementation of the class AliMCInfo
 598 //
 599 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 600
 601
 602
 603 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 604 digitRow::digitRow()
 605 {
 606   Reset();
 607 }
 608 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 609 digitRow & digitRow::operator=(const digitRow &digOld)
 610 {
 611   for (Int_t i = 0; i<kgRowBytes; i++) fDig[i] = digOld.fDig[i];
 612   return (*this);
 613 }
 614 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 615 void digitRow::SetRow(Int_t row)
 616 {
 617   if (row >= 8*kgRowBytes) {
 618     cerr<<"digitRow::SetRow: index "<<row<<" out of bounds."<<endl;
 619     return;
 620   }
 621   Int_t iC = row/8;
 622   Int_t iB = row%8;
 623   SETBIT(fDig[iC],iB);
 624 }
 625
 626 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 627 Bool_t digitRow::TestRow(Int_t row)
 628 {
 629 //
 630 // return kTRUE if row is on
 631 //
 632   Int_t iC = row/8;
 633   Int_t iB = row%8;
 634   return TESTBIT(fDig[iC],iB);
 635 }
 636 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 637 Int_t digitRow::RowsOn(Int_t upto)
 638 {
 639 //
 640 // returns number of rows with a digit
 641 // count only rows less equal row number upto
 642 //
 643   Int_t total = 0;
 644   for (Int_t i = 0; i<kgRowBytes; i++) {
 645     for (Int_t j = 0; j < 8; j++) {
 646       if (i*8+j > upto) return total;
 647       if (TESTBIT(fDig[i],j))  total++;
 648     }
 649   }
 650   return total;
 651 }
 652 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 653 void digitRow::Reset()
 654 {
 655 //
 656 // resets all rows to zero
 657 //
 658   for (Int_t i = 0; i<kgRowBytes; i++) {
 659     fDig[i] <<= 8;
 660   }
 661 }
 662 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 663 Int_t digitRow::Last()
 664 {
 665 //
 666 // returns the last row number with a digit
 667 // returns -1 if now digits
 668 //
 669   for (Int_t i = kgRowBytes-1; i>=0; i--) {
 670     for (Int_t j = 7; j >= 0; j--) {
 671       if TESTBIT(fDig[i],j) return i*8+j;
 672     }
 673   }
 674   return -1;
 675 }
 676 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 677 Int_t digitRow::First()
 678 {
 679 //
 680 // returns the first row number with a digit
 681 // returns -1 if now digits
 682 //
 683   for (Int_t i = 0; i<kgRowBytes; i++) {
 684     for (Int_t j = 0; j < 8; j++) {
 685       if (TESTBIT(fDig[i],j)) return i*8+j;
 686     }
 687   }
 688   return -1;
 689 }
 690
 691 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 692 //
 693 // end of implementation of a class digitRow
 694 //
 695 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 696
 697 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 698 AliGenInfoMaker::AliGenInfoMaker()
 699 {
 700   Reset();
 701 }
 702
 703 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 704 AliGenInfoMaker::AliGenInfoMaker(const char * fnGalice, const char* fnRes,
 705                                    Int_t nEvents, Int_t firstEvent)
 706 {
 707   Reset();
 708   fFirstEventNr = firstEvent;
 709   fEventNr = firstEvent;
 710   fNEvents = nEvents;
 711   //   fFnRes = fnRes;
 712   sprintf(fFnRes,"%s",fnRes);
 713   //
 714   fLoader = AliRunLoader::Open(fnGalice);
 715   if (gAlice){
 716     delete gAlice->GetRunLoader();
 717     delete gAlice;
 718     gAlice = 0x0;
 719   }
 720   if (fLoader->LoadgAlice()){
 721     cerr<<"Error occured while l"<<endl;
 722   }
 723   Int_t nall = fLoader->GetNumberOfEvents();
 724   if (nEvents==0) {
 725     nEvents =nall;
 726     fNEvents=nall;
 727     fFirstEventNr=0;
 728   }
 729
 730   if (nall<=0){
 731     cerr<<"no events available"<<endl;
 732     fEventNr = 0;
 733     return;
 734   }
 735   if (firstEvent+nEvents>nall) {
 736     fEventNr = nall-firstEvent;
 737     cerr<<"restricted number of events availaible"<<endl;
 738   }
 739   AliMagF * magf = gAlice->Field();
 740   AliTracker::SetFieldMap(magf,0);
 741 }
 742
 743
 744 AliMCInfo * AliGenInfoMaker::MakeInfo(UInt_t i)
 745 {
 746   //
 747   if (i<fNParticles) {
 748     if (fGenInfo[i]) return  fGenInfo[i];
 749     fGenInfo[i] = new AliMCInfo;
 750     fNInfos++;
 751     return fGenInfo[i];
 752   }
 753   else
 754     return 0;
 755 }
 756
 757 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 758 void AliGenInfoMaker::Reset()
 759 {
 760   fEventNr = 0;
 761   fNEvents = 0;
 762   fTreeGenTracks = 0;
 763   fFileGenTracks = 0;
 764   fGenInfo = 0;
 765   fNInfos  = 0;
 766   //
 767   //
 768   fDebug = 0;
 769   fVPrim[0] = -1000.;
 770   fVPrim[1] = -1000.;
 771   fVPrim[2] = -1000.;
 772   fParamTPC = 0;
 773 }
 774 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 775 AliGenInfoMaker::~AliGenInfoMaker()
 776 {
 777
 778   if (fLoader){
 779     fLoader->UnloadgAlice();
 780     gAlice = 0;
 781     delete fLoader;
 782   }
 783 }
 784
 785 Int_t  AliGenInfoMaker::SetIO()
 786 {
 787   //
 788   //
 789   CreateTreeGenTracks();
 790   if (!fTreeGenTracks) return 1;
 791   //  AliTracker::SetFieldFactor();
 792
 793   fParamTPC = GetTPCParam();
 794   //
 795   return 0;
 796 }
 797
 798 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 799 Int_t AliGenInfoMaker::SetIO(Int_t eventNr)
 800 {
 801   //
 802   //
 803   // SET INPUT
 804   fLoader->SetEventNumber(eventNr);
 805   //
 806   fLoader->LoadHeader();
 807   fLoader->LoadKinematics();
 808   fStack = fLoader->Stack();
 809   //
 810   fLoader->LoadTrackRefs();
 811   fLoader->LoadHits();
 812   fTreeTR = fLoader->TreeTR();
 813   //
 814   AliTPCLoader * tpcl = (AliTPCLoader*)fLoader->GetLoader("TPCLoader");
 815   tpcl->LoadDigits();
 816   fTreeD = tpcl->TreeD();
 817   return 0;
 818 }
 819
 820 Int_t AliGenInfoMaker::CloseIOEvent()
 821 {
 822   fLoader->UnloadHeader();
 823   fLoader->UnloadKinematics();
 824   fLoader->UnloadTrackRefs();
 825   AliTPCLoader * tpcl = (AliTPCLoader*)fLoader->GetLoader("TPCLoader");
 826   tpcl->UnloadDigits();
 827   return 0;
 828 }
 829
 830 Int_t AliGenInfoMaker::CloseIO()
 831 {
 832   fLoader->UnloadgAlice();
 833   return 0;
 834 }
 835
 836
 837
 838 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 839 Int_t AliGenInfoMaker::Exec(Int_t nEvents, Int_t firstEventNr)
 840 {
 841   fNEvents = nEvents;
 842   fFirstEventNr = firstEventNr;
 843   return Exec();
 844 }
 845
 846 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 847 Int_t AliGenInfoMaker::Exec()
 848 {
 849   TStopwatch timer;
 850   timer.Start();
 851   Int_t status =SetIO();
 852   if (status>0) return status;
 853   //
 854
 855   for (fEventNr = fFirstEventNr; fEventNr < fFirstEventNr+fNEvents;
 856        fEventNr++) {
 857     SetIO(fEventNr);
 858     fNParticles = fStack->GetNtrack();
 859     //
 860     fGenInfo = new AliMCInfo*[fNParticles];
 861     for (UInt_t i = 0; i<fNParticles; i++) {
 862       fGenInfo[i]=0;
 863     }
 864     //
 865     cout<<"Start to process event "<<fEventNr<<endl;
 866     cout<<"\tfNParticles = "<<fNParticles<<endl;
 867     if (fDebug>2) cout<<"\n\n\n\tStart loop over TreeTR"<<endl;
 868     if (TreeTRLoop()>0) return 1;
 869     //
 870     if (fDebug>2) cout<<"\n\n\n\tStart loop over TreeD"<<endl;
 871     if (TreeDLoop()>0) return 1;
 872     //
 873     if (fDebug>2) cout<<"\n\n\n\tStart loop over TreeK"<<endl;
 874     if (TreeKLoop()>0) return 1;
 875     if (fDebug>2) cout<<"\tEnd loop over TreeK"<<endl;
 876     //
 877     if (BuildKinkInfo()>0) return 1;
 878     if (BuildV0Info()>0) return 1;
 879     //if (BuildHitLines()>0) return 1;
 880     if (fDebug>2) cout<<"\tEnd loop over TreeK"<<endl;
 881     //
 882     for (UInt_t i = 0; i<fNParticles; i++) {
 883       if (fGenInfo[i]) delete fGenInfo[i];
 884     }
 885     delete []fGenInfo;
 886     CloseIOEvent();
 887   }
 888   //
 889   CloseIO();
 890   CloseOutputFile();
 891
 892   cerr<<"Exec finished"<<endl;
 893
 894   timer.Stop();
 895   timer.Print();
 896   return 0;
 897 }
 898 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 899 void AliGenInfoMaker::CreateTreeGenTracks()
 900 {
 901   fFileGenTracks = TFile::Open(fFnRes,"RECREATE");
 902   if (!fFileGenTracks) {
 903     cerr<<"Error in CreateTreeGenTracks: cannot open file "<<fFnRes<<endl;
 904     return;
 905   }
 906   fTreeGenTracks = new TTree("genTracksTree","genTracksTree");
 907   AliMCInfo * info = new AliMCInfo;
 908   fTreeGenTracks->Branch("MC","AliMCInfo",&info);
 909   delete info;
 910   //
 911   AliGenKinkInfo *kinkinfo = new AliGenKinkInfo;
 912   fTreeKinks = new TTree("genKinksTree","genKinksTree");
 913   fTreeKinks->Branch("MC","AliGenKinkInfo",&kinkinfo);
 914   delete kinkinfo;
 915   //
 916   AliGenV0Info *v0info = new AliGenV0Info;
 917   fTreeV0 = new TTree("genV0Tree","genV0Tree");
 918   fTreeV0->Branch("MC","AliGenV0Info",&v0info);
 919   delete v0info;
 920   //
 921   //
 922   AliPointsMI * points0 = new AliPointsMI;
 923   AliPointsMI * points1 = new AliPointsMI;
 924   AliPointsMI * points2 = new AliPointsMI;
 925   fTreeHitLines = new TTree("HitLines","HitLines");
 926   fTreeHitLines->Branch("TPC.","AliPointsMI",&points0,32000,10);
 927   fTreeHitLines->Branch("TRD.","AliPointsMI",&points1,32000,10);
 928   fTreeHitLines->Branch("ITS.","AliPointsMI",&points2,32000,10);
 929   Int_t label=0;
 930   fTreeHitLines->Branch("Label",&label,"label/I");
 931   //
 932   fTreeGenTracks->AutoSave();
 933   fTreeKinks->AutoSave();
 934   fTreeV0->AutoSave();
 935   fTreeHitLines->AutoSave();
 936 }
 937 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 938 void AliGenInfoMaker::CloseOutputFile()
 939 {
 940   if (!fFileGenTracks) {
 941     cerr<<"File "<<fFnRes<<" not found as an open file."<<endl;
 942     return;
 943   }
 944   fFileGenTracks->cd();
 945   fTreeGenTracks->Write();
 946   delete fTreeGenTracks;
 947   fTreeKinks->Write();
 948   delete fTreeKinks;
 949   fTreeV0->Write();
 950   delete fTreeV0;
 951
 952   fFileGenTracks->Close();
 953   delete fFileGenTracks;
 954   return;
 955 }
 956
 957 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 958 Int_t AliGenInfoMaker::TreeKLoop()
 959 {
 960 //
 961 // open the file with treeK
 962 // loop over all entries there and save information about some tracks
 963 //
 964
 965   AliStack * stack = fStack;
 966   if (!stack) {cerr<<"Stack was not found!\n"; return 1;}
 967
 968   if (fDebug > 0) {
 969     cout<<"There are "<<fNParticles<<" primary and secondary particles in event "
 970         <<fEventNr<<endl;
 971   }
 972   Int_t  ipdg = 0;
 973   TParticlePDG *ppdg = 0;
 974   // not all generators give primary vertex position. Take the vertex
 975   // of the particle 0 as primary vertex.
 976   TDatabasePDG  pdg; //get pdg table
 977   //thank you very much root for this
 978   TBranch * br = fTreeGenTracks->GetBranch("MC");
 979   TParticle *particle = stack->ParticleFromTreeK(0);
 980   fVPrim[0] = particle->Vx();
 981   fVPrim[1] = particle->Vy();
 982   fVPrim[2] = particle->Vz();
 983   for (UInt_t iParticle = 0; iParticle < fNParticles; iParticle++) {
 984     // load only particles with TR
 985     AliMCInfo * info = GetInfo(iParticle);
 986     if (!info) continue;
 987     //////////////////////////////////////////////////////////////////////
 988     info->fLabel = iParticle;
 989     //
 990     info->fParticle = *(stack->Particle(iParticle));
 991     info->fVDist[0] = info->fParticle.Vx()-fVPrim[0];
 992     info->fVDist[1] = info->fParticle.Vy()-fVPrim[1];
 993     info->fVDist[2] = info->fParticle.Vz()-fVPrim[2];
 994     info->fVDist[3] = TMath::Sqrt(info->fVDist[0]*info->fVDist[0]+
 995                                   info->fVDist[1]*info->fVDist[1]+info->fVDist[2]*info->fVDist[2]);
 996     //
 997     //
 998     ipdg = info->fParticle.GetPdgCode();
 999     info->fPdg = ipdg;
1000     ppdg = pdg.GetParticle(ipdg);
1001     info->fEventNr = fEventNr;
1002     info->Update();
1003     //////////////////////////////////////////////////////////////////////
1004     br->SetAddress(&info);
1005     fTreeGenTracks->Fill();
1006   }
1007   fTreeGenTracks->AutoSave();
1008   if (fDebug > 2) cerr<<"end of TreeKLoop"<<endl;
1009   return 0;
1010 }
1011
1012
1013 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1014 Int_t  AliGenInfoMaker::BuildKinkInfo()
1015 {
1016   //
1017   // Build tree with Kink Information
1018   //
1019   AliStack * stack = fStack;
1020   if (!stack) {cerr<<"Stack was not found!\n"; return 1;}
1021
1022   if (fDebug > 0) {
1023     cout<<"There are "<<fNParticles<<" primary and secondary particles in event "
1024         <<fEventNr<<endl;
1025   }
1026   //  Int_t  ipdg = 0;
1027   //TParticlePDG *ppdg = 0;
1028   // not all generators give primary vertex position. Take the vertex
1029   // of the particle 0 as primary vertex.
1030   TDatabasePDG  pdg; //get pdg table
1031   //thank you very much root for this
1032   TBranch * br = fTreeKinks->GetBranch("MC");
1033   //
1034   AliGenKinkInfo * kinkinfo = new AliGenKinkInfo;
1035   //
1036   for (UInt_t iParticle = 0; iParticle < fNParticles; iParticle++) {
1037     // load only particles with TR
1038     AliMCInfo * info = GetInfo(iParticle);
1039     if (!info) continue;
1040     if (info->fCharge==0) continue;
1041     if (info->fTRdecay.P()<0.13) continue;  //momenta cut
1042     if (info->fTRdecay.R()>500)  continue;  //R cut - decay outside barrel
1043     TParticle & particle = info->fParticle;
1044     Int_t first = particle.GetDaughter(0);
1045     if (first ==0) continue;
1046
1047     Int_t last = particle.GetDaughter(1);
1048     if (last ==0) last=first;
1049     AliMCInfo * info2 =  0;
1050     AliMCInfo * dinfo =  0;
1051
1052     for (Int_t id2=first;id2<=last;id2++){
1053       info2 = GetInfo(id2);
1054       if (!info2) continue;
1055       TParticle &p2 = info2->fParticle;
1056       Double_t r = TMath::Sqrt(p2.Vx()*p2.Vx()+p2.Vy()*p2.Vy());
1057       if ( TMath::Abs(info->fTRdecay.R()-r)>0.01) continue;
1058       if (!(p2.GetPDG())) continue;
1059       dinfo =info2;
1060
1061       kinkinfo->fMCm = (*info);
1062       kinkinfo->fMCd = (*dinfo);
1063       if (kinkinfo->fMCm.fParticle.GetPDG()==0 ||  kinkinfo->fMCd.fParticle.GetPDG()==0) continue;
1064       kinkinfo->Update();
1065       br->SetAddress(&kinkinfo);
1066       fTreeKinks->Fill();
1067     }
1068     /*
1069     if (dinfo){
1070       kinkinfo->fMCm = (*info);
1071       kinkinfo->fMCd = (*dinfo);
1072       kinkinfo->Update();
1073       br->SetAddress(&kinkinfo);
1074       fTreeKinks->Fill();
1075     }
1076     */
1077   }
1078   fTreeGenTracks->AutoSave();
1079   if (fDebug > 2) cerr<<"end of Kink Loop"<<endl;
1080   return 0;
1081 }
1082
1083
1084 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1085 Int_t  AliGenInfoMaker::BuildV0Info()
1086 {
1087   //
1088   // Build tree with V0 Information
1089   //
1090   AliStack * stack = fStack;
1091   if (!stack) {cerr<<"Stack was not found!\n"; return 1;}
1092
1093   if (fDebug > 0) {
1094     cout<<"There are "<<fNParticles<<" primary and secondary particles in event "
1095         <<fEventNr<<endl;
1096   }
1097   //  Int_t  ipdg = 0;
1098   //TParticlePDG *ppdg = 0;
1099   // not all generators give primary vertex position. Take the vertex
1100   // of the particle 0 as primary vertex.
1101   TDatabasePDG  pdg; //get pdg table
1102   //thank you very much root for this
1103   TBranch * br = fTreeV0->GetBranch("MC");
1104   //
1105   AliGenV0Info * v0info = new AliGenV0Info;
1106   //
1107   //
1108   for (UInt_t iParticle = 0; iParticle < fNParticles; iParticle++) {
1109     // load only particles with TR
1110     AliMCInfo * info = GetInfo(iParticle);
1111     if (!info) continue;
1112     if (info->fCharge==0) continue;
1113     //
1114     //
1115     TParticle & particle = info->fParticle;
1116     Int_t mother = particle.GetMother(0);
1117     if (mother <=0) continue;
1118     //
1119     TParticle * motherparticle = stack->Particle(mother);
1120     if (!motherparticle) continue;
1121     //
1122     Int_t last = motherparticle->GetDaughter(1);
1123     if (last==(int)iParticle) continue;
1124     AliMCInfo * info2 =  info;
1125     AliMCInfo * dinfo =  GetInfo(last);
1126     if (!dinfo) continue;
1127     if (!dinfo->fParticle.GetPDG()) continue;
1128     if (!info2->fParticle.GetPDG()) continue;
1129     if (dinfo){
1130       v0info->fMCm = (*info);
1131       v0info->fMCd = (*dinfo);
1132       v0info->fMotherP = (*motherparticle);
1133       v0info->Update(fVPrim);
1134       br->SetAddress(&v0info);
1135       fTreeV0->Fill();
1136     }
1137   }
1138   fTreeV0->AutoSave();
1139   if (fDebug > 2) cerr<<"end of V0 Loop"<<endl;
1140   return 0;
1141 }
1142
1143
1144
1145
1146 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1147 Int_t AliGenInfoMaker::BuildHitLines()
1148 {
1149
1150 //
1151 // open the file with treeK
1152 // loop over all entries there and save information about some tracks
1153 //
1154
1155   AliStack * stack = fStack;
1156   if (!stack) {cerr<<"Stack was not found!\n"; return 1;}
1157
1158   if (fDebug > 0) {
1159     cout<<"There are "<<fNParticles<<" primary and secondary particles in event "
1160         <<fEventNr<<endl;
1161   }
1162   Int_t  ipdg = 0;
1163   // TParticlePDG *ppdg = 0;
1164   // not all generators give primary vertex position. Take the vertex
1165   // of the particle 0 as primary vertex.
1166   TDatabasePDG  pdg; //get pdg table
1167   //thank you very much root for this
1168   AliPointsMI *tpcp = new AliPointsMI;
1169   AliPointsMI *trdp = new AliPointsMI;
1170   AliPointsMI *itsp = new AliPointsMI;
1171   Int_t label =0;
1172   //
1173   TBranch * brtpc = fTreeHitLines->GetBranch("TPC.");
1174   TBranch * brtrd = fTreeHitLines->GetBranch("TRD.");
1175   TBranch * brits = fTreeHitLines->GetBranch("ITS.");
1176   TBranch * brlabel = fTreeHitLines->GetBranch("Label");
1177   brlabel->SetAddress(&label);
1178   brtpc->SetAddress(&tpcp);
1179   brtrd->SetAddress(&trdp);
1180   brits->SetAddress(&itsp);
1181   //
1182   AliDetector *dtpc = gAlice->GetDetector("TPC");
1183   AliDetector *dtrd = gAlice->GetDetector("TRD");
1184   AliDetector *dits = gAlice->GetDetector("ITS");
1185
1186   for (UInt_t iParticle = 0; iParticle < fNParticles; iParticle++) {
1187     // load only particles with TR
1188     AliMCInfo * info = GetInfo(iParticle);
1189     if (!info) continue;
1190     Int_t primpart = info->fPrimPart;
1191     ipdg = info->fParticle.GetPdgCode();
1192     label = iParticle;
1193     //
1194     gAlice->ResetHits();
1195     tpcp->Reset();
1196     itsp->Reset();
1197     trdp->Reset();
1198     tpcp->fLabel1 = ipdg;
1199     trdp->fLabel1 = ipdg;
1200     itsp->fLabel1 = ipdg;
1201     if (dtpc->TreeH()->GetEvent(primpart)){
1202       dtpc->LoadPoints(primpart);
1203       tpcp->Reset(dtpc,iParticle);
1204     }
1205     if (dtrd->TreeH()->GetEvent(primpart)){
1206       dtrd->LoadPoints(primpart);
1207       trdp->Reset(dtrd,iParticle);
1208     }
1209     if (dits->TreeH()->GetEvent(primpart)){
1210       dits->LoadPoints(primpart);
1211       itsp->Reset(dits,iParticle);
1212     }
1213     //
1214     fTreeHitLines->Fill();
1215     dtpc->ResetPoints();
1216     dtrd->ResetPoints();
1217     dits->ResetPoints();
1218   }
1219   delete tpcp;
1220   delete trdp;
1221   delete itsp;
1222   fTreeHitLines->AutoSave();
1223   if (fDebug > 2) cerr<<"end of TreeKLoop"<<endl;
1224   return 0;
1225 }
1226
1227
1228 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1229 Int_t AliGenInfoMaker::TreeDLoop()
1230 {
1231   //
1232   // open the file with treeD
1233   // loop over all entries there and save information about some tracks
1234   //
1235
1236   Int_t nInnerSector = fParamTPC->GetNInnerSector();
1237   Int_t rowShift = 0;
1238   Int_t zero=fParamTPC->GetZeroSup()+6;
1239   //
1240   //
1241   AliSimDigits digitsAddress, *digits=&digitsAddress;
1242   fTreeD->GetBranch("Segment")->SetAddress(&digits);
1243
1244   Int_t sectorsByRows=(Int_t)fTreeD->GetEntries();
1245   if (fDebug > 1) cout<<"\tsectorsByRows = "<<sectorsByRows<<endl;
1246   for (Int_t i=0; i<sectorsByRows; i++) {
1247     if (!fTreeD->GetEvent(i)) continue;
1248     Int_t sec,row;
1249     fParamTPC->AdjustSectorRow(digits->GetID(),sec,row);
1250     if (fDebug > 1) cout<<sec<<' '<<row<<"                          \r";
1251     // here I expect that upper sectors follow lower sectors
1252     if (sec > nInnerSector) rowShift = fParamTPC->GetNRowLow();
1253     //
1254     digits->ExpandTrackBuffer();
1255     digits->First();
1256     do {
1257       Int_t iRow=digits->CurrentRow();
1258       Int_t iColumn=digits->CurrentColumn();
1259       Short_t digitValue = digits->CurrentDigit();
1260       if (digitValue >= zero) {
1261         Int_t label;
1262         for (Int_t j = 0; j<3; j++) {
1263           //      label = digits->GetTrackID(iRow,iColumn,j);
1264           label = digits->GetTrackIDFast(iRow,iColumn,j)-2;
1265           if (label >= (Int_t)fNParticles) { //don't label from bakground event
1266             continue;
1267           }
1268           if (label >= 0 && label <= (Int_t)fNParticles) {
1269             if (fDebug > 6 ) {
1270               cout<<"Inner loop: sector, iRow, iColumn, label, value, row "
1271                   <<sec<<" "
1272                   <<iRow<<" "<<iColumn<<" "<<label<<" "<<digitValue
1273                   <<" "<<row<<endl;
1274             }
1275             AliMCInfo * info = GetInfo(label);
1276             if (info){
1277               info->fTPCRow.SetRow(row+rowShift);
1278             }
1279           }
1280         }
1281       }
1282     } while (digits->Next());
1283   }
1284
1285   if (fDebug > 2) cerr<<"end of TreeDLoop"<<endl;
1286   return 0;
1287 }
1288
1289
1290 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1291 Int_t AliGenInfoMaker::TreeTRLoop()
1292 {
1293   //
1294   // loop over TrackReferences and store the first one for each track
1295   //
1296   TTree * treeTR = fTreeTR;
1297   Int_t nPrimaries = (Int_t) treeTR->GetEntries();
1298   if (fDebug > 1) cout<<"There are "<<nPrimaries<<" entries in TreeTR"<<endl;
1299   //
1300   //
1301   //track references for TPC
1302   TClonesArray* TPCArrayTR = new TClonesArray("AliTrackReference");
1303   TClonesArray* ITSArrayTR = new TClonesArray("AliTrackReference");
1304   TClonesArray* TRDArrayTR = new TClonesArray("AliTrackReference");
1305   TClonesArray* TOFArrayTR = new TClonesArray("AliTrackReference");
1306   TClonesArray* RunArrayTR = new TClonesArray("AliTrackReference");
1307   //
1308   if (treeTR->GetBranch("TPC"))    treeTR->GetBranch("TPC")->SetAddress(&TPCArrayTR);
1309   if (treeTR->GetBranch("ITS"))    treeTR->GetBranch("ITS")->SetAddress(&ITSArrayTR);
1310   if (treeTR->GetBranch("TRD"))    treeTR->GetBranch("TRD")->SetAddress(&TRDArrayTR);
1311   if (treeTR->GetBranch("TOF"))    treeTR->GetBranch("TOF")->SetAddress(&TOFArrayTR);
1312   if (treeTR->GetBranch("AliRun")) treeTR->GetBranch("AliRun")->SetAddress(&RunArrayTR);
1313   //
1314   //
1315   //
1316   for (Int_t iPrimPart = 0; iPrimPart<nPrimaries; iPrimPart++) {
1317     treeTR->GetEntry(iPrimPart);
1318     //
1319     // Loop over TPC references
1320     //
1321     for (Int_t iTrackRef = 0; iTrackRef < TPCArrayTR->GetEntriesFast(); iTrackRef++) {
1322       AliTrackReference *trackRef = (AliTrackReference*)TPCArrayTR->At(iTrackRef);
1323       //
1324       if (trackRef->TestBit(BIT(2))){
1325         //if decay
1326         if (trackRef->P()<fgTPCPtCut) continue;
1327         Int_t label = trackRef->GetTrack();
1328         AliMCInfo * info = GetInfo(label);
1329         if (!info) info = MakeInfo(label);
1330         info->fTRdecay = *trackRef;
1331       }
1332       //
1333       if (trackRef->P()<fgTPCPtCut) continue;
1334       Int_t label = trackRef->GetTrack();
1335       AliMCInfo * info = GetInfo(label);
1336       if (!info) info = MakeInfo(label);
1337       if (!info) continue;
1338       info->fPrimPart =  iPrimPart;
1339       TClonesArray & arr = *(info->fTPCReferences);
1340       new (arr[arr.GetEntriesFast()]) AliTrackReference(*trackRef);
1341     }
1342     //
1343     // Loop over ITS references
1344     //
1345     for (Int_t iTrackRef = 0; iTrackRef < ITSArrayTR->GetEntriesFast(); iTrackRef++) {
1346       AliTrackReference *trackRef = (AliTrackReference*)ITSArrayTR->At(iTrackRef);
1347       //
1348       //
1349       if (trackRef->P()<fgTPCPtCut) continue;
1350       Int_t label = trackRef->GetTrack();
1351       AliMCInfo * info = GetInfo(label);
1352       if ( (!info) && trackRef->Pt()<fgITSPtCut) continue;
1353       if (!info) info = MakeInfo(label);
1354       if (!info) continue;
1355       info->fPrimPart =  iPrimPart;
1356       TClonesArray & arr = *(info->fITSReferences);
1357       new (arr[arr.GetEntriesFast()]) AliTrackReference(*trackRef);
1358     }
1359     //
1360     // Loop over TRD references
1361     //
1362     for (Int_t iTrackRef = 0; iTrackRef < TRDArrayTR->GetEntriesFast(); iTrackRef++) {
1363       AliTrackReference *trackRef = (AliTrackReference*)TRDArrayTR->At(iTrackRef);
1364       //
1365       if (trackRef->P()<fgTPCPtCut) continue;
1366       Int_t label = trackRef->GetTrack();
1367       AliMCInfo * info = GetInfo(label);
1368       if ( (!info) && trackRef->Pt()<fgTRDPtCut) continue;
1369       if (!info) info = MakeInfo(label);
1370       if (!info) continue;
1371       info->fPrimPart =  iPrimPart;
1372       TClonesArray & arr = *(info->fTRDReferences);
1373       new (arr[arr.GetEntriesFast()]) AliTrackReference(*trackRef);
1374     }
1375     //
1376     // Loop over TOF references
1377     //
1378     for (Int_t iTrackRef = 0; iTrackRef < TOFArrayTR->GetEntriesFast(); iTrackRef++) {
1379       AliTrackReference *trackRef = (AliTrackReference*)TOFArrayTR->At(iTrackRef);
1380       Int_t label = trackRef->GetTrack();
1381       AliMCInfo * info = GetInfo(label);
1382       if (!info){
1383         if (trackRef->Pt()<fgTPCPtCut) continue;
1384         if ( (!info) && trackRef->Pt()<fgTOFPtCut) continue;
1385       }
1386       if (!info) info = MakeInfo(label);
1387       if (!info) continue;
1388       info->fPrimPart =  iPrimPart;
1389       TClonesArray & arr = *(info->fTOFReferences);
1390       new (arr[arr.GetEntriesFast()]) AliTrackReference(*trackRef);
1391     }
1392     //
1393     // get dacay position
1394     for (Int_t iTrackRef = 0; iTrackRef < RunArrayTR->GetEntriesFast(); iTrackRef++) {
1395       AliTrackReference *trackRef = (AliTrackReference*)RunArrayTR->At(iTrackRef);
1396       //
1397       Int_t label = trackRef->GetTrack();
1398       AliMCInfo * info = GetInfo(label);
1399       if (!info) continue;
1400       if (!trackRef->TestBit(BIT(2))) continue;  //if not decay
1401       //      if (TMath::Abs(trackRef.X());
1402       info->fTRdecay = *trackRef;
1403     }
1404   }
1405   //
1406   TPCArrayTR->Delete();
1407   delete  TPCArrayTR;
1408   TRDArrayTR->Delete();
1409   delete  TRDArrayTR;
1410   TOFArrayTR->Delete();
1411   delete  TOFArrayTR;
1412
1413   ITSArrayTR->Delete();
1414   delete  ITSArrayTR;
1415   RunArrayTR->Delete();
1416   delete  RunArrayTR;
1417   //
1418   return 0;
1419 }
1420
1421 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1422 Float_t AliGenInfoMaker::TR2LocalX(AliTrackReference *trackRef,
1423                                     AliTPCParam *paramTPC) {
1424
1425   Float_t x[3] = { trackRef->X(),trackRef->Y(),trackRef->Z()};
1426   Int_t index[4];
1427   paramTPC->Transform0to1(x,index);
1428   paramTPC->Transform1to2(x,index);
1429   return x[0];
1430 }
1431 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1432
1433
1434
1435 TH1F * AliComparisonDraw::DrawXY(const char * chx, const char *chy, const char* selection,
1436                 const char * quality, Int_t nbins, Float_t minx, Float_t maxx, Float_t miny, Float_t maxy, Int_t nBinsRes)
1437 {
1438   //
1439   Double_t* bins = CreateLogBins(nbins, minx, maxx);
1440   TH2F* hRes2 = new TH2F("hRes2", "residuals", nbins, minx, maxx, nBinsRes, miny, maxy);
1441   char cut[1000];
1442   sprintf(cut,"%s&&%s",selection,quality);
1443   char expression[1000];
1444   sprintf(expression,"%s:%s>>hRes2",chy,chx);
1445   fTree->Draw(expression, cut, "groff");
1446   TH1F* hMean=0;
1447   TH1F* hRes = CreateResHisto(hRes2, &hMean);
1448   AliLabelAxes(hRes, chx, chy);
1449   //
1450   delete hRes2;
1451   delete[] bins;
1452   fRes  = hRes;
1453   fMean = hMean;
1454   return hRes;
1455 }
1456
1457 TH1F * AliComparisonDraw::DrawLogXY(const char * chx, const char *chy, const char* selection,
1458                                     const char * quality, Int_t nbins, Float_t minx, Float_t maxx, Float_t miny, Float_t maxy, Int_t nBinsRes)
1459 {
1460   //
1461   Double_t* bins = CreateLogBins(nbins, minx, maxx);
1462   TH2F* hRes2 = new TH2F("hRes2", "residuals", nbins, bins, nBinsRes, miny, maxy);
1463   char cut[1000];
1464   sprintf(cut,"%s&&%s",selection,quality);
1465   char expression[1000];
1466   sprintf(expression,"%s:%s>>hRes2",chy,chx);
1467   fTree->Draw(expression, cut, "groff");
1468   TH1F* hMean=0;
1469   TH1F* hRes = CreateResHisto(hRes2, &hMean);
1470   AliLabelAxes(hRes, chx, chy);
1471   //
1472   delete hRes2;
1473   delete[] bins;
1474   fRes  = hRes;
1475   fMean = hMean;
1476   return hRes;
1477 }
1478
1479 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1480 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1481 TH1F * AliComparisonDraw::Eff(const char *variable, const char* selection, const char * quality,
1482                               Int_t nbins, Float_t min, Float_t max)
1483 {
1484   //
1485   //
1486   TH1F* hGen = new TH1F("hGen", "gen. tracks", nbins, min, max);
1487   TH1F* hRec = new TH1F("hRec", "rec. tracks", nbins, min, max);
1488   char inputGen[1000];
1489   sprintf(inputGen,"%s>>hGen", variable);
1490   fTree->Draw(inputGen, selection, "groff");
1491   char selectionRec[256];
1492   sprintf(selectionRec, "%s && %s", selection, quality);
1493   char inputRec[1000];
1494   sprintf(inputRec,"%s>>hRec", variable);
1495   fTree->Draw(inputRec, selectionRec, "groff");
1496   //
1497   TH1F* hEff = CreateEffHisto(hGen, hRec);
1498   AliLabelAxes(hEff, variable, "#epsilon [%]");
1499   fRes = hEff;
1500   delete hRec;
1501   delete hGen;
1502   return hEff;
1503 }
1504
1505
1506
1507 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1508 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1509 TH1F * AliComparisonDraw::EffLog(const char *variable, const char* selection, const char * quality,
1510                               Int_t nbins, Float_t min, Float_t max)
1511 {
1512   //
1513   //
1514   Double_t* bins = CreateLogBins(nbins, min, max);
1515   TH1F* hGen = new TH1F("hGen", "gen. tracks", nbins, bins);
1516   TH1F* hRec = new TH1F("hRec", "rec. tracks", nbins, bins);
1517   char inputGen[1000];
1518   sprintf(inputGen,"%s>>hGen", variable);
1519   fTree->Draw(inputGen, selection, "groff");
1520   char selectionRec[256];
1521   sprintf(selectionRec, "%s && %s", selection, quality);
1522   char inputRec[1000];
1523   sprintf(inputRec,"%s>>hRec", variable);
1524   fTree->Draw(inputRec, selectionRec, "groff");
1525   //
1526   TH1F* hEff = CreateEffHisto(hGen, hRec);
1527   AliLabelAxes(hEff, variable, "#epsilon [%]");
1528   fRes = hEff;
1529   delete hRec;
1530   delete hGen;
1531   delete[] bins;
1532   return hEff;
1533 }
1534
1535
1536 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1537 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1538
1539 Double_t* AliComparisonDraw::CreateLogBins(Int_t nBins, Double_t xMin, Double_t xMax)
1540 {
1541   Double_t* bins = new Double_t[nBins+1];
1542   bins[0] = xMin;
1543   Double_t factor = pow(xMax/xMin, 1./nBins);
1544   for (Int_t i = 1; i <= nBins; i++)
1545     bins[i] = factor * bins[i-1];
1546   return bins;
1547 }
1548
1549
1550
1551
1552 void AliComparisonDraw::AliLabelAxes(TH1* histo, const char* xAxisTitle, const char* yAxisTitle)
1553 {
1554   //
1555   histo->GetXaxis()->SetTitle(xAxisTitle);
1556   histo->GetYaxis()->SetTitle(yAxisTitle);
1557 }
1558
1559
1560 TH1F* AliComparisonDraw::CreateEffHisto(TH1F* hGen, TH1F* hRec)
1561 {
1562   //
1563   Int_t nBins = hGen->GetNbinsX();
1564   TH1F* hEff = (TH1F*) hGen->Clone("hEff");
1565   hEff->SetTitle("");
1566   hEff->SetStats(kFALSE);
1567   hEff->SetMinimum(0.);
1568   hEff->SetMaximum(110.);
1569   //
1570   for (Int_t iBin = 0; iBin <= nBins; iBin++) {
1571     Double_t nGen = hGen->GetBinContent(iBin);
1572     Double_t nRec = hRec->GetBinContent(iBin);
1573     if (nGen > 0) {
1574       Double_t eff = nRec/nGen;
1575       hEff->SetBinContent(iBin, 100. * eff);
1576       Double_t error = sqrt((eff*(1.-eff)+0.01) / nGen);
1577       //      if (error == 0) error = sqrt(0.1/nGen);
1578       //
1579       if (error == 0) error = 0.0001;
1580       hEff->SetBinError(iBin, 100. * error);
1581     } else {
1582       hEff->SetBinContent(iBin, 100. * 0.5);
1583       hEff->SetBinError(iBin, 100. * 0.5);
1584     }
1585   }
1586   return hEff;
1587 }
1588
1589
1590
1591 TH1F* AliComparisonDraw::CreateResHisto(TH2F* hRes2, TH1F **phMean,  Bool_t drawBinFits,
1592                      Bool_t overflowBinFits)
1593 {
1594   TVirtualPad* currentPad = gPad;
1595   TAxis* axis = hRes2->GetXaxis();
1596   Int_t nBins = axis->GetNbins();
1597   TH1F* hRes, *hMean;
1598   if (axis->GetXbins()->GetSize()){
1599     hRes = new TH1F("hRes", "", nBins, axis->GetXbins()->GetArray());
1600     hMean = new TH1F("hMean", "", nBins, axis->GetXbins()->GetArray());
1601   }
1602   else{
1603     hRes = new TH1F("hRes", "", nBins, axis->GetXmin(), axis->GetXmax());
1604     hMean = new TH1F("hMean", "", nBins, axis->GetXmin(), axis->GetXmax());
1605
1606   }
1607   hRes->SetStats(false);
1608   hRes->SetOption("E");
1609   hRes->SetMinimum(0.);
1610   //
1611   hMean->SetStats(false);
1612   hMean->SetOption("E");
1613
1614   // create the fit function
1615   //TKFitGaus* fitFunc = new TKFitGaus("resFunc");
1616   //   TF1 * fitFunc = new TF1("G","[3]+[0]*exp(-(x-[1])*(x-[1])/(2.*[2]*[2]))",-3,3);
1617   TF1 * fitFunc = new TF1("G","[0]*exp(-(x-[1])*(x-[1])/(2.*[2]*[2]))",-3,3);
1618
1619   fitFunc->SetLineWidth(2);
1620   fitFunc->SetFillStyle(0);
1621   // create canvas for fits
1622   TCanvas* canBinFits = NULL;
1623   Int_t nPads = (overflowBinFits) ? nBins+2 : nBins;
1624   Int_t nx = Int_t(sqrt(nPads-1.));// + 1;
1625   Int_t ny = (nPads-1) / nx + 1;
1626   if (drawBinFits) {
1627     canBinFits = (TCanvas*)gROOT->FindObject("canBinFits");
1628     if (canBinFits) delete canBinFits;
1629     canBinFits = new TCanvas("canBinFits", "fits of bins", 200, 100, 500, 700);
1630     canBinFits->Divide(nx, ny);
1631   }
1632
1633   // loop over x bins and fit projection
1634   Int_t dBin = ((overflowBinFits) ? 1 : 0);
1635   for (Int_t bin = 1-dBin; bin <= nBins+dBin; bin++) {
1636     if (drawBinFits) canBinFits->cd(bin + dBin);
1637     TH1D* hBin = hRes2->ProjectionY("hBin", bin, bin);
1638     //
1639     if (hBin->GetEntries() > 5) {
1640       fitFunc->SetParameters(hBin->GetMaximum(),hBin->GetMean(),hBin->GetRMS());
1641       hBin->Fit(fitFunc,"s");
1642       Double_t sigma = TMath::Abs(fitFunc->GetParameter(2));
1643
1644       if (sigma > 0.){
1645         hRes->SetBinContent(bin, TMath::Abs(fitFunc->GetParameter(2)));
1646         hMean->SetBinContent(bin, fitFunc->GetParameter(1));
1647       }
1648       else{
1649         hRes->SetBinContent(bin, 0.);
1650         hMean->SetBinContent(bin,0);
1651       }
1652       hRes->SetBinError(bin, fitFunc->GetParError(2));
1653       hMean->SetBinError(bin, fitFunc->GetParError(1));
1654
1655       //
1656       //
1657
1658     } else {
1659       hRes->SetBinContent(bin, 0.);
1660       hRes->SetBinError(bin, 0.);
1661       hMean->SetBinContent(bin, 0.);
1662       hMean->SetBinError(bin, 0.);
1663     }
1664
1665
1666     if (drawBinFits) {
1667       char name[256];
1668       if (bin == 0) {
1669         sprintf(name, "%s < %.4g", axis->GetTitle(), axis->GetBinUpEdge(bin));
1670       } else if (bin == nBins+1) {
1671         sprintf(name, "%.4g < %s", axis->GetBinLowEdge(bin), axis->GetTitle());
1672       } else {
1673         sprintf(name, "%.4g < %s < %.4g", axis->GetBinLowEdge(bin),
1674                 axis->GetTitle(), axis->GetBinUpEdge(bin));
1675       }
1676       canBinFits->cd(bin + dBin);
1677       hBin->SetTitle(name);
1678       hBin->SetStats(kTRUE);
1679       hBin->DrawCopy("E");
1680       canBinFits->Update();
1681       canBinFits->Modified();
1682       canBinFits->Update();
1683     }
1684
1685     delete hBin;
1686   }
1687
1688   delete fitFunc;
1689   currentPad->cd();
1690   *phMean = hMean;
1691   return hRes;
1692 }
1693
1694
1695 void   AliComparisonDraw::DrawFriend2D(const char * chx, const char *chy, const char* selection, TTree * tfriend)
1696 {
1697
1698 }
1699
1700
1701 void   AliComparisonDraw::GetPoints3D(const char * label, const char * chpoints, const char* selection, TTree * tpoints, Int_t color,Float_t rmin){
1702   //
1703   //
1704   if (!fPoints) fPoints = new TObjArray;
1705   if (tpoints->GetIndex()==0) tpoints->BuildIndex("Label","Label");
1706   AliPointsMI * points = new AliPointsMI;
1707   TBranch * br = tpoints->GetBranch(chpoints);
1708   br->SetAddress(&points);
1709   Int_t npoints = fTree->Draw(label,selection);
1710   Float_t xyz[30000];
1711   rmin*=rmin;
1712   for (Int_t i=0;i<npoints;i++){
1713     Int_t index = (Int_t)fTree->GetV1()[i];
1714     tpoints->GetEntryWithIndex(index,index);
1715     if (points->fN<2) continue;
1716     Int_t goodpoints=0;
1717     for (Int_t i=0;i<points->fN; i++){
1718       xyz[goodpoints*3]   = points->fX[i];
1719       xyz[goodpoints*3+1] = points->fY[i];
1720       xyz[goodpoints*3+2] = points->fZ[i];
1721       if ( points->fX[i]*points->fX[i]+points->fY[i]*points->fY[i]>rmin) goodpoints++;
1722     }
1723     TPolyMarker3D * marker = new TPolyMarker3D(goodpoints,xyz);
1724     //    marker->SeWidth(1);
1725     marker->SetMarkerColor(color);
1726     marker->SetMarkerStyle(1);
1727     fPoints->AddLast(marker);
1728   }
1729 }
1730
1731 void AliComparisonDraw::Draw3D(Int_t min, Int_t max){
1732   if (!fPoints) return;
1733   Int_t npoints = fPoints->GetEntriesFast();
1734   max = TMath::Min(npoints,max);
1735   min = TMath::Min(npoints,min);
1736
1737   for (Int_t i =min; i<max;i++){
1738     TObject * obj = fPoints->At(i);
1739     if (obj) obj->Draw();
1740   }
1741 }
1742
1743 void AliComparisonDraw:: SavePoints(const char* name)
1744 {
1745   char fname[25];
1746   sprintf(fname,"TH_%s.root",name);
1747   TFile f(fname,"new");
1748   fPoints->Write("Tracks",TObject::kSingleKey);
1749   f.Close();
1750   sprintf(fname,"TH%s.gif",name);
1751   fCanvas->SaveAs(fname);
1752 }
1753
1754 void   AliComparisonDraw::InitView(){
1755   //
1756   //
1757   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::Open();
1758   rl->GetEvent(0);
1759   rl->CdGAFile();
1760   //
1761   fCanvas = new TCanvas("cdisplay", "Cluster display",0,0,700,730);
1762   fView   = new TView(1);
1763   fView->SetRange(-330,-360,-330, 360,360, 330);
1764   fCanvas->Clear();
1765   fCanvas->SetFillColor(1);
1766   fCanvas->SetTheta(90.);
1767   fCanvas->SetPhi(0.);
1768   //
1769   TGeometry *geom =(TGeometry*)gDirectory->Get("AliceGeom");
1770   geom->Draw("same");
1771
1772 }