STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <RVersion.h>
  25 #include <TBrowser.h>
  26 #include <TClonesArray.h>
  27 #include <TGeoManager.h>
  28 #include <TStopwatch.h>
  29 #include <TSystem.h>
  30 #include <TVirtualMC.h>
  31
  32 #include "AliLog.h"
  33 #include "AliDetector.h"
  34 #include "AliGenerator.h"
  35 #include "AliHeader.h"
  36 #include "AliLego.h"
  37 #include "AliMC.h"
  38 #include "AliMCQA.h"
  39 #include "AliRun.h"
  40 #include "AliStack.h"
  41 #include "AliMagF.h"
  42 #include "AliTrackReference.h"
  43
  44
  45 ClassImp(AliMC)
  46
  47 //_______________________________________________________________________
  48 AliMC::AliMC() :
  49   fGenerator(0),
  50   fEventEnergy(0),
  51   fSummEnergy(0),
  52   fSum2Energy(0),
  53   fTrRmax(1.e10),
  54   fTrZmax(1.e10),
  55   fRDecayMax(1.e10),
  56   fRDecayMin(-1.),
  57   fDecayPdg(0),
  58   fImedia(0),
  59   fTransParName("\0"),
  60   fMCQA(0),
  61   fHitLists(0),
  62   fTrackReferences(0)
  63
  64 {
  65   //default constructor
  66   DecayLimits();
  67 }
  68
  69 //_______________________________________________________________________
  70 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  71   TVirtualMCApplication(name, title),
  72   fGenerator(0),
  73   fEventEnergy(0),
  74   fSummEnergy(0),
  75   fSum2Energy(0),
  76   fTrRmax(1.e10),
  77   fTrZmax(1.e10),
  78   fRDecayMax(1.e10),
  79   fRDecayMin(-1.),
  80   fDecayPdg(0),
  81   fImedia(new TArrayI(1000)),
  82   fTransParName("\0"),
  83   fMCQA(0),
  84   fHitLists(new TList()),
  85   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
  86 {
  87   //constructor
  88   // Set transport parameters
  89   SetTransPar();
  90   DecayLimits();
  91   // Prepare the tracking medium lists
  92   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
  93 }
  94
  95 //_______________________________________________________________________
  96 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
  97   TVirtualMCApplication(mc),
  98   fGenerator(0),
  99   fEventEnergy(0),
 100   fSummEnergy(0),
 101   fSum2Energy(0),
 102   fTrRmax(1.e10),
 103   fTrZmax(1.e10),
 104   fRDecayMax(1.e10),
 105   fRDecayMin(-1.),
 106   fDecayPdg(0),
 107   fImedia(0),
 108   fTransParName("\0"),
 109   fMCQA(0),
 110   fHitLists(0),
 111   fTrackReferences(0)
 112 {
 113   //
 114   // Copy constructor for AliMC
 115   //
 116   mc.Copy(*this);
 117 }
 118
 119 //_______________________________________________________________________
 120 AliMC::~AliMC()
 121 {
 122   //destructor
 123   delete fGenerator;
 124   delete fImedia;
 125   delete fMCQA;
 126   delete fHitLists;
 127   // Delete track references
 128   if (fTrackReferences) {
 129     fTrackReferences->Delete();
 130     delete fTrackReferences;
 131     fTrackReferences     = 0;
 132   }
 133
 134 }
 135
 136 //_______________________________________________________________________
 137 void AliMC::Copy(TObject &) const
 138 {
 139   //dummy Copy function
 140   AliFatal("Not implemented!");
 141 }
 142
 143 //_______________________________________________________________________
 144 void  AliMC::ConstructGeometry()
 145 {
 146   //
 147   // Either load geometry from file or create it through usual
 148   // loop on detectors. In the first case the method
 149   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 150   // at InitGeometry().
 151   //
 152
 153   if(gAlice->IsRootGeometry()){
 154     // Load geometry
 155     const char *geomfilename = gAlice->GetGeometryFileName();
 156     if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 157       AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s\n\n",geomfilename));
 158       TGeoManager::Import(geomfilename);
 159     }else{
 160       AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 161       return;
 162     }
 163   }else{
 164     // Create modules, materials, geometry
 165     TStopwatch stw;
 166     TIter next(gAlice->Modules());
 167     AliModule *detector;
 168     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 169     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 170       stw.Start();
 171       // Initialise detector materials and geometry
 172       detector->CreateMaterials();
 173       detector->CreateGeometry();
 174       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 175                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 176     }
 177   }
 178
 179 }
 180
 181 //_______________________________________________________________________
 182 void  AliMC::ConstructOpGeometry()
 183 {
 184   //
 185   // Loop all detector modules and call DefineOpticalProperties() method
 186   //
 187
 188   TIter next(gAlice->Modules());
 189   AliModule *detector;
 190   AliInfo("Optical properties definition");
 191   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 192     // Initialise detector optical properties
 193     detector->DefineOpticalProperties();
 194   }
 195 }
 196
 197 //_______________________________________________________________________
 198 void  AliMC::InitGeometry()
 199 {
 200   //
 201   // Initialize detectors
 202   //
 203
 204   AliInfo("Initialisation:");
 205   TStopwatch stw;
 206   TIter next(gAlice->Modules());
 207   AliModule *detector;
 208   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 209     stw.Start();
 210     // Initialise detector geometry
 211     if(gAlice->IsRootGeometry()) detector->CreateMaterials();
 212     detector->Init();
 213     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 214                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 215   }
 216 }
 217
 218 //_______________________________________________________________________
 219 void  AliMC::SetAllAlignableVolumes()
 220 {
 221   //
 222   // Add alignable volumes (TGeoPNEntries) looping on all
 223   // active modules
 224   //
 225
 226   AliInfo(Form("Setting entries for all alignable volumes of active detectors"));
 227   AliModule *detector;
 228   TIter next(gAlice->Modules());
 229   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 230     detector->AddAlignableVolumes();
 231   }
 232 }
 233
 234 //_______________________________________________________________________
 235 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 236 {
 237   //
 238   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 239   //
 240
 241   Generator()->Generate();
 242 }
 243
 244 //_______________________________________________________________________
 245 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 246 {
 247   //
 248   // Load the event generator
 249   //
 250   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 251 }
 252
 253 //_______________________________________________________________________
 254 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 255 {
 256   //
 257   // Load the event generator
 258   //
 259   if(fGenerator) {
 260     if(generator) {
 261       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 262                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()));
 263     }
 264     else {
 265       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 266                       fGenerator->GetName()));
 267     }
 268   }
 269   fGenerator = generator;
 270 }
 271
 272 //_______________________________________________________________________
 273 void AliMC::FinishRun()
 274 {
 275   // Clean generator information
 276   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 277   fGenerator->FinishRun();
 278
 279   //Output energy summary tables
 280   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 281   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 282 }
 283
 284 //_______________________________________________________________________
 285 void AliMC::BeginPrimary()
 286 {
 287   //
 288   // Called  at the beginning of each primary track
 289   //
 290
 291   // Reset Hits info
 292   ResetHits();
 293   ResetTrackReferences();
 294
 295 }
 296
 297 //_______________________________________________________________________
 298 void AliMC::PreTrack()
 299 {
 300   // Actions before the track's transport
 301      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 302      AliModule *module;
 303
 304      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 305        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 306          module->PreTrack();
 307
 308      fMCQA->PreTrack();
 309 }
 310
 311 //_______________________________________________________________________
 312 void AliMC::Stepping()
 313 {
 314   //
 315   // Called at every step during transport
 316   //
 317
 318   Int_t id = DetFromMate(gMC->CurrentMedium());
 319   if (id < 0) return;
 320
 321
 322   if ( gMC->IsNewTrack()            &&
 323        gMC->TrackTime() == 0.       &&
 324        fRDecayMin >= 0.             &&
 325        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 326        gMC->TrackPid() == fDecayPdg )
 327   {
 328       FixParticleDecaytime();
 329   }
 330
 331
 332
 333   //
 334   // --- If lego option, do it and leave
 335   if (gAlice->Lego())
 336     gAlice->Lego()->StepManager();
 337   else {
 338     Int_t copy;
 339     //Update energy deposition tables
 340     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 341     //
 342     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 343     if (gMC->IsTrackDisappeared()) {
 344         if (gMC->Etot()>0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber());
 345     }
 346
 347     //Call the appropriate stepping routine;
 348     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 349     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 350       if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) fMCQA->StepManager(id);
 351       det->StepManager();
 352     }
 353   }
 354 }
 355
 356 //_______________________________________________________________________
 357 void AliMC::EnergySummary()
 358 {
 359   //
 360   // Print summary of deposited energy
 361   //
 362
 363   Int_t ndep=0;
 364   Float_t edtot=0;
 365   Float_t ed, ed2;
 366   Int_t kn, i, left, j, id;
 367   const Float_t kzero=0;
 368   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 369   //
 370   // Energy loss information
 371   if(ievent) {
 372     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 373     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 374       ed=fSummEnergy[kn];
 375       if(ed>0) {
 376         fEventEnergy[ndep]=kn;
 377         if(ievent>1) {
 378           ed=ed/ievent;
 379           ed2=fSum2Energy[kn];
 380           ed2=ed2/ievent;
 381           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 382         } else
 383           ed2=99;
 384         fSummEnergy[ndep]=ed;
 385         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 386         edtot+=ed;
 387         ndep++;
 388       }
 389     }
 390     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 391       left=ndep-kn*3;
 392       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 393         j=kn*3+i;
 394         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 395         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 396       }
 397       printf("\n");
 398     }
 399     //
 400     // Relative energy loss in different detectors
 401     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 402     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 403     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 404       left=ndep-kn*5;
 405       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 406         j=kn*5+i;
 407         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 408         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 409       }
 410       printf("\n");
 411     }
 412     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 413     printf("\n");
 414   }
 415   //
 416   // Reset the TArray's
 417   //  fEventEnergy.Set(0);
 418   //  fSummEnergy.Set(0);
 419   //  fSum2Energy.Set(0);
 420 }
 421
 422 //_____________________________________________________________________________
 423 void AliMC::BeginEvent()
 424 {
 425   //
 426   // Clean-up previous event
 427   // Energy scores
 428   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 429   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 430   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 431   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 432   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 433   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 434   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 435
 436     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 437
 438   /*******************************/
 439   /*   Clean after eventual      */
 440   /*   previous event            */
 441   /*******************************/
 442
 443
 444   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 445   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 446   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 447   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 448
 449   fEventEnergy.Reset();
 450     // Clean detector information
 451
 452   if (runloader->Stack())
 453     runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 454   else
 455     runloader->MakeStack();//or make a new one
 456
 457   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 458    {
 459      AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 460      runloader->MakeTree("K");
 461    }
 462
 463   AliDebug(1, "gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 464   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 465                                      //because we don't have guarantee that
 466                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 467                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 468   //
 469   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 470   //
 471
 472   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 473     gAlice->GetEventNrInRun());
 474 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 475
 476   if(gAlice->Lego())
 477    {
 478     gAlice->Lego()->BeginEvent();
 479     return;
 480    }
 481
 482
 483   AliDebug(1, "ResetHits()");
 484   ResetHits();
 485
 486   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 487   runloader->MakeTree("H");
 488
 489   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
 490   runloader->MakeTrackRefsContainer();//for insurance
 491
 492
 493   //create new branches and SetAdresses
 494   TIter next(gAlice->Modules());
 495   AliModule *detector;
 496   while((detector = (AliModule*)next()))
 497    {
 498     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 499     detector->MakeBranch("H");
 500     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranchTR()",detector->GetName()));
 501     detector->MakeBranchTR();
 502     AliDebug(2, Form("%s->SetTreeAddress()",detector->GetName()));
 503     detector->SetTreeAddress();
 504    }
 505   // make branch for AliRun track References
 506   TTree * treeTR = runloader->TreeTR();
 507   if (treeTR){
 508     // make branch for central track references
 509     if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
 510     TBranch *branch;
 511     branch = treeTR->Branch("AliRun",&fTrackReferences);
 512     branch->SetAddress(&fTrackReferences);
 513   }
 514   //
 515 }
 516
 517 //_______________________________________________________________________
 518 void AliMC::ResetHits()
 519 {
 520   //
 521   //  Reset all Detectors hits
 522   //
 523   TIter next(gAlice->Modules());
 524   AliModule *detector;
 525   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 526      detector->ResetHits();
 527   }
 528 }
 529
 530 //_______________________________________________________________________
 531 void AliMC::PostTrack()
 532 {
 533   // Posts tracks for each module
 534   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 535   AliModule *module;
 536
 537   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 538     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 539       module->PostTrack();
 540 }
 541
 542 //_______________________________________________________________________
 543 void AliMC::FinishPrimary()
 544 {
 545   //
 546   // Called  at the end of each primary track
 547   //
 548   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 549   //  static Int_t count=0;
 550   //  const Int_t times=10;
 551   // This primary is finished, purify stack
 552 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
 553   if (!(gMC->SecondariesAreOrdered()))
 554        runloader->Stack()->ReorderKine();
 555 #endif
 556   runloader->Stack()->PurifyKine();
 557
 558   TIter next(gAlice->Modules());
 559   AliModule *detector;
 560   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 561     detector->FinishPrimary();
 562     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 563     if(loader)
 564      {
 565        TTree* treeH = loader->TreeH();
 566        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 567      }
 568   }
 569
 570   // Write out track references if any
 571   if (runloader->TreeTR()) runloader->TreeTR()->Fill();
 572 }
 573
 574 //_______________________________________________________________________
 575 void AliMC::FinishEvent()
 576 {
 577   //
 578   // Called at the end of the event.
 579   //
 580
 581   //
 582
 583   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 584
 585   TIter next(gAlice->Modules());
 586   AliModule *detector;
 587   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 588     detector->FinishEvent();
 589   }
 590
 591   //Update the energy deposit tables
 592   Int_t i;
 593   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 594    {
 595     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 596     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 597    }
 598
 599   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 600
 601   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 602   AliStack* stack = runloader->Stack();
 603   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 604    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 605     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
 606     return;//never reached
 607    }
 608   // Update Header information
 609   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 610   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 611
 612
 613   // Write out the kinematics
 614   if (!gAlice->Lego()) stack->FinishEvent();
 615
 616   // Write out the event Header information
 617   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 618   if (treeE)
 619    {
 620       header->SetStack(stack);
 621       treeE->Fill();
 622    }
 623   else
 624    {
 625     AliError("Can not get TreeE from RL");
 626    }
 627
 628   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 629    {
 630      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 631      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 632      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 633    }
 634
 635   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 636   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 637   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 638   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
 639   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 640   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 641   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 642 }
 643
 644 //_______________________________________________________________________
 645 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 646 {
 647   // Calculates field "b" at point "x"
 648     gAlice->Field(x,b);
 649 }
 650
 651 //_______________________________________________________________________
 652 void AliMC::Init()
 653 {
 654   // MC initialization
 655
 656    //=================Create Materials and geometry
 657    gMC->Init();
 658    //Set alignable volumes for the whole geometry
 659    SetAllAlignableVolumes();
 660    //Read the cuts for all materials
 661    ReadTransPar();
 662    //Build the special IMEDIA table
 663    MediaTable();
 664
 665    //Compute cross-sections
 666    gMC->BuildPhysics();
 667
 668    //Initialise geometry deposition table
 669    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 670    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 671    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 672
 673    //
 674    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 675
 676    // Register MC in configuration
 677    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 678
 679 }
 680
 681 //_______________________________________________________________________
 682 void AliMC::MediaTable()
 683 {
 684   //
 685   // Built media table to get from the media number to
 686   // the detector id
 687   //
 688
 689   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 690   //  Int_t ibeg;
 691   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 692   AliModule *det;
 693   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 694   //
 695   // For all detectors
 696   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 697     // If detector is defined
 698     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 699         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 700         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 701
 702         // Find max and min material number
 703         if((idt=idtmed[nz])) {
 704           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 705           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 706         }
 707       }
 708       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 709         det->LoMedium() = 0;
 710         det->HiMedium() = 0;
 711       } else {
 712         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 713           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
 714                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
 715           return;
 716         }
 717         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 718         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 719           (*fImedia)[lz]=kz;
 720         }
 721       }
 722     }
 723   }
 724   //
 725   // Print summary table
 726   AliInfo("Tracking media ranges:");
 727   ToAliInfo(
 728   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 729     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 730       ind=i*6+k;
 731       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 732       if(det)
 733         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 734                det->HiMedium());
 735       else
 736         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 737     }
 738     printf("\n");
 739   }
 740   )
 741 }
 742
 743 //_______________________________________________________________________
 744 void AliMC::ReadTransPar()
 745 {
 746   //
 747   // Read filename to set the transport parameters
 748   //
 749
 750
 751   const Int_t kncuts=10;
 752   const Int_t knflags=11;
 753   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 754   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 755                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 756                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 757                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 758   char line[256];
 759   char detName[7];
 760   char* filtmp;
 761   Float_t cut[kncuts];
 762   Int_t flag[knflags];
 763   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 764   FILE *lun;
 765   //
 766   // See whether the file is there
 767   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 768   lun=fopen(filtmp,"r");
 769   delete [] filtmp;
 770   if(!lun) {
 771     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
 772     return;
 773   }
 774   //
 775   while(1) {
 776     // Initialise cuts and flags
 777     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 778     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 779     itmed=0;
 780     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 781     // Read up to the end of line excluded
 782     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 783     if(iret<0) {
 784       //End of file
 785       fclose(lun);
 786       return;
 787     }
 788     // Read the end of line
 789     fscanf(lun,"%*c");
 790     if(!iret) continue;
 791     if(line[0]=='*') continue;
 792     // Read the numbers
 793     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 794                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 795                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 796                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 797     if(!iret) continue;
 798     if(iret<0) {
 799       //reading error
 800       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
 801       continue;
 802     }
 803     // Check that the module exist
 804     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 805     if(mod) {
 806       // Get the array of media numbers
 807       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 808       // Check that the tracking medium code is valid
 809       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 810         ktmed=idtmed[itmed];
 811         if(!ktmed) {
 812           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
 813           continue;
 814         }
 815         // Set energy thresholds
 816         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 817           if(cut[kz]>=0) {
 818             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
 819                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
 820             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 821           }
 822         }
 823         // Set transport mechanisms
 824         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 825           if(flag[kz]>=0) {
 826             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
 827                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
 828             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 829           }
 830         }
 831       } else {
 832         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
 833         continue;
 834       }
 835     } else {
 836       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
 837       continue;
 838     }
 839   }
 840 }
 841
 842 //_______________________________________________________________________
 843 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 844 {
 845   //
 846   // Sets the file name for transport parameters
 847   //
 848   fTransParName = filename;
 849 }
 850
 851 //_______________________________________________________________________
 852 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 853 {
 854   //
 855   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 856   // of the Root browser.
 857   // It displays the Root Trees and all detectors.
 858   //
 859   //detectors are in folders anyway
 860   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 861 }
 862
 863 //_______________________________________________________________________
 864 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 865 {
 866   //
 867   //  Add a hit to detector id
 868   //
 869   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 870   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 871 }
 872
 873 //_______________________________________________________________________
 874 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 875 {
 876   //
 877   // Add digit to detector id
 878   //
 879   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 880   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 881 }
 882
 883 //_______________________________________________________________________
 884 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 885   //
 886   // Returns current track
 887   //
 888   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 889 }
 890
 891 //_______________________________________________________________________
 892 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 893 {
 894   //
 895   // Dumps particle i in the stack
 896   //
 897   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 898    if (runloader->Stack())
 899     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 900 }
 901
 902 //_______________________________________________________________________
 903 void AliMC::DumpPStack () const
 904 {
 905   //
 906   // Dumps the particle stack
 907   //
 908   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 909    if (runloader->Stack())
 910     runloader->Stack()->DumpPStack();
 911 }
 912
 913 //_______________________________________________________________________
 914 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 915   //
 916   // Returns number of tracks in stack
 917   //
 918   Int_t ntracks = -1;
 919   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 920    if (runloader->Stack())
 921      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
 922    return ntracks;
 923 }
 924
 925 //_______________________________________________________________________
 926 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
 927 {
 928   //
 929   // return number of primary that has generated track
 930   //
 931   Int_t nprimary = -999;
 932   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 933   if (runloader->Stack())
 934     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
 935   return nprimary;
 936 }
 937
 938 //_______________________________________________________________________
 939 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
 940 {
 941   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
 942   // the remaping done by PurifyKine
 943   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 944   if (runloader)
 945    if (runloader->Stack())
 946     return runloader->Stack()->Particle(i);
 947   return 0x0;
 948 }
 949
 950 //_______________________________________________________________________
 951 TObjArray* AliMC::Particles() const {
 952   //
 953   // Returns pointer to Particles array
 954   //
 955   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 956   if (runloader)
 957    if (runloader->Stack())
 958     return runloader->Stack()->Particles();
 959   return 0x0;
 960 }
 961
 962 //_______________________________________________________________________
 963 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
 964                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
 965                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 966 {
 967 // Delegate to stack
 968 //
 969   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 970   if (runloader)
 971     if (runloader->Stack())
 972       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
 973                                     mech, ntr, weight, is);
 974 }
 975
 976 //_______________________________________________________________________
 977 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
 978                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
 979                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
 980                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
 981                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 982 {
 983   // Delegate to stack
 984   //
 985   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 986   if (runloader)
 987     if (runloader->Stack())
 988       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
 989                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
 990 }
 991
 992 //_______________________________________________________________________
 993 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
 994 {
 995     //
 996     // Set high water mark for last track in event
 997   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 998   if (runloader)
 999     if (runloader->Stack())
1000       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
1001 }
1002
1003 //_______________________________________________________________________
1004 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
1005 {
1006   //
1007   // Delegate to stack
1008   //
1009   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1010   if (runloader)
1011     if (runloader->Stack())
1012       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
1013 }
1014
1015 //_______________________________________________________________________
1016 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
1017 {
1018   // Delegate to stack
1019   //
1020   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1021   if (runloader)
1022     if (runloader->Stack())
1023       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
1024 }
1025
1026 //_______________________________________________________________________
1027 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
1028 {
1029   //
1030   // Set current track number
1031   //
1032   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1033   if (runloader)
1034     if (runloader->Stack())
1035       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1036 }
1037
1038 //_______________________________________________________________________
1039 void  AliMC::AddTrackReference(Int_t label){
1040   //
1041   // add a trackrefernce to the list
1042   if (!fTrackReferences) {
1043     AliError("Container trackrefernce not active");
1044     return;
1045   }
1046   Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
1047   TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1048   new(lref[nref]) AliTrackReference(label);
1049 }
1050
1051
1052
1053 //_______________________________________________________________________
1054 void AliMC::ResetTrackReferences()
1055 {
1056   //
1057   //  Reset all  references
1058   //
1059   if (fTrackReferences)   fTrackReferences->Clear();
1060
1061   TIter next(gAlice->Modules());
1062   AliModule *detector;
1063   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1064      detector->ResetTrackReferences();
1065   }
1066 }
1067
1068 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1069 {
1070   //
1071   // Remapping track reference
1072   // Called at finish primary
1073   //
1074   if (!fTrackReferences) return;
1075   Int_t nEntries = fTrackReferences->GetEntries();
1076   for (Int_t i=0; i < nEntries; i++){
1077       AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTrackReferences->UncheckedAt(i));
1078       if (ref) {
1079           Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1080           if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1081           else {
1082               ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1083               fTrackReferences->RemoveAt(i);
1084           }
1085       } // if ref
1086   }
1087   fTrackReferences->Compress();
1088 }
1089
1090 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1091 {
1092     //
1093     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1094     //
1095
1096     TLorentzVector p;
1097     gMC->TrackMomentum(p);
1098     Double_t tmin, tmax;
1099     Double_t b;
1100
1101     // Transverse velocity
1102     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1103
1104     if ((b = gAlice->Field()->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1105
1106         // Radius of helix
1107
1108         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1109
1110         // Revolution frequency
1111
1112         Double_t omega = vt / rho;
1113
1114         // Maximum and minimum decay time
1115         //
1116         // Check for curlers first
1117         if (fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2. > 1.) return;
1118
1119         //
1120
1121         tmax  = TMath::ACos(1. - fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1122         tmin  = TMath::ACos(1. - fRDecayMin * fRDecayMin / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1123     } else {
1124         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1125         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1126     }
1127
1128     //
1129     // Dial t using the two limits
1130     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1131     //
1132     //
1133     // Force decay time in transport code
1134     //
1135     gMC->ForceDecayTime(t / 2.99792458e10);
1136 }