STEER/AliRun.cxx

   1 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   2 //                                                                           //
   3 //  Control class for Alice C++                                              //
   4 //  Only one single instance of this class exists.                           //
   5 //  The object is created in main program aliroot                            //
   6 //  and is pointed by the global gAlice.                                     //
   7 //                                                                           //
   8 //   -Supports the list of all Alice Detectors (fModules).                 //
   9 //   -Supports the list of particles (fParticles).                           //
  10 //   -Supports the Trees.                                                    //
  11 //   -Supports the geometry.                                                 //
  12 //   -Supports the event display.                                            //
  13 //Begin_Html
  14 /*
  15 <img src="gif/AliRunClass.gif">
  16 */
  17 //End_Html
  18 //Begin_Html
  19 /*
  20 <img src="gif/alirun.gif">
  21 */
  22 //End_Html
  23 //                                                                           //
  24 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include <TFile.h>
  27 #include <TRandom.h>
  28 #include <TBRIK.h>
  29 #include <TNode.h>
  30 #include <AliMC.h>
  31 #include <TCint.h>
  32 #include <TSystem.h>
  33
  34 #include "GParticle.h"
  35 #include "AliRun.h"
  36 #include "AliModule.h"
  37 #include "AliDisplay.h"
  38
  39 #include "AliCallf77.h"
  40
  41 #include <stdlib.h>
  42 #include <stdio.h>
  43 #include <string.h>
  44
  45 AliRun *gAlice;
  46
  47 static AliHeader *header;
  48
  49 #ifndef WIN32
  50
  51 # define rxgtrak rxgtrak_
  52 # define rxstrak rxstrak_
  53 # define rxkeep  rxkeep_
  54 # define rxouth  rxouth_
  55 # define sxpart  sxpart_
  56 #else
  57
  58 # define rxgtrak RXGTRAK
  59 # define rxstrak RXSTRAK
  60 # define rxkeep  RXKEEP
  61 # define rxouth  RXOUTH
  62 # define sxpart  SXPART
  63 #endif
  64
  65 static TArrayF sEventEnergy;
  66 static TArrayF sSummEnergy;
  67 static TArrayF sSum2Energy;
  68
  69 extern "C" void type_of_call sxpart();
  70
  71 ClassImp(AliRun)
  72
  73 //_____________________________________________________________________________
  74 AliRun::AliRun()
  75 {
  76   //
  77   // Default constructor for AliRun
  78   //
  79   header=&fHeader;
  80   fRun       = 0;
  81   fEvent     = 0;
  82   fCurrent   = -1;
  83   fModules = 0;
  84   fGenerator = 0;
  85   fTreeD     = 0;
  86   fTreeK     = 0;
  87   fTreeH     = 0;
  88   fTreeE     = 0;
  89   fTreeR     = 0;
  90   fParticles = 0;
  91   fGeometry  = 0;
  92   fDisplay   = 0;
  93   fField     = 0;
  94   fMC        = 0;
  95   fNdets     = 0;
  96   fImedia    = 0;
  97   fTrRmax    = 1.e10;
  98   fTrZmax    = 1.e10;
  99   fIdtmed    = 0;
 100   fInitDone  = kFALSE;
 101   fLego      = 0;
 102 }
 103
 104 //_____________________________________________________________________________
 105 AliRun::AliRun(const char *name, const char *title)
 106   : TNamed(name,title)
 107 {
 108   //
 109   //  Constructor for the main processor.
 110   //  Creates the geometry
 111   //  Creates the list of Detectors.
 112   //  Creates the list of particles.
 113   //
 114   Int_t i;
 115
 116   gAlice     = this;
 117   fTreeD     = 0;
 118   fTreeK     = 0;
 119   fTreeH     = 0;
 120   fTreeE     = 0;
 121   fTreeR     = 0;
 122   fTrRmax    = 1.e10;
 123   fTrZmax    = 1.e10;
 124   fGenerator = 0;
 125   fInitDone  = kFALSE;
 126   fLego      = 0;
 127   fField     = 0;
 128
 129   gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,name);
 130   //
 131   // create the support list for the various Detectors
 132   fModules = new TObjArray(77);
 133   //
 134   // Create the TNode geometry for the event display
 135
 136   BuildSimpleGeometry();
 137
 138
 139   fNtrack=0;
 140   fHgwmk=0;
 141   fCurrent=-1;
 142   header=&fHeader;
 143   fRun       = 0;
 144   fEvent     = 0;
 145   //
 146   // Create the particle stack
 147   fParticles = new TClonesArray("GParticle",100);
 148
 149   fDisplay = 0;
 150   //
 151   // Create default mag field
 152   SetField();
 153   //
 154   fMC      = AliMC::GetMC();
 155   //
 156   //---------------Load detector names
 157
 158   fNdets=21;
 159   strcpy(fDnames[0],"BODY");
 160   strcpy(fDnames[1],"NULL");
 161   strcpy(fDnames[2],"ITS");
 162   strcpy(fDnames[3],"MAG");
 163   strcpy(fDnames[4],"TPC");
 164   strcpy(fDnames[5],"TOF");
 165   strcpy(fDnames[6],"PMD");
 166   strcpy(fDnames[7],"PHOS");
 167   strcpy(fDnames[8],"ZDC");
 168   strcpy(fDnames[9],"FMD");
 169   strcpy(fDnames[10],"RICH");
 170   strcpy(fDnames[11],"MUON");
 171   strcpy(fDnames[12],"FRAME");
 172   strcpy(fDnames[13],"TRD");
 173   strcpy(fDnames[14],"NULL");
 174   strcpy(fDnames[15],"CASTOR");
 175   strcpy(fDnames[16],"ABSO");
 176   strcpy(fDnames[17],"SHIL");
 177   strcpy(fDnames[18],"DIPO");
 178   strcpy(fDnames[19],"HALL");
 179   strcpy(fDnames[20],"PIPE");
 180
 181   //
 182   // Prepare the tracking medium lists
 183   fImedia = new TArrayI(1000);
 184   for(i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
 185   fIdtmed = new Int_t[fNdets*100];
 186   for(i=0;i<fNdets*100;i++) fIdtmed[i]=0;
 187 }
 188
 189 //_____________________________________________________________________________
 190 AliRun::~AliRun()
 191 {
 192   //
 193   // Defaullt AliRun destructor
 194   //
 195   delete [] fIdtmed;
 196   delete fImedia;
 197   delete fField;
 198   delete fMC;
 199   delete fGeometry;
 200   delete fDisplay;
 201   delete fGenerator;
 202   delete fLego;
 203   delete fTreeD;
 204   delete fTreeK;
 205   delete fTreeH;
 206   delete fTreeE;
 207   delete fTreeR;
 208   if (fModules) {
 209     fModules->Delete();
 210     delete fModules;
 211   }
 212   if (fParticles) {
 213     fParticles->Delete();
 214     delete fParticles;
 215   }
 216 }
 217
 218 //_____________________________________________________________________________
 219 void AliRun::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 220 {
 221   //
 222   //  Add a hit to detector id
 223   //
 224   TObjArray &dets = *fModules;
 225   if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 226 }
 227
 228 //_____________________________________________________________________________
 229 void AliRun::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 230 {
 231   //
 232   // Add digit to detector id
 233   //
 234   TObjArray &dets = *fModules;
 235   if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 236 }
 237
 238 //_____________________________________________________________________________
 239 void AliRun::Browse(TBrowser *b)
 240 {
 241   //
 242   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 243   // of the Root browser.
 244   // It displays the Root Trees and all detectors.
 245   //
 246   if (fTreeK) b->Add(fTreeK,fTreeK->GetName());
 247   if (fTreeH) b->Add(fTreeH,fTreeH->GetName());
 248   if (fTreeD) b->Add(fTreeD,fTreeD->GetName());
 249   if (fTreeE) b->Add(fTreeE,fTreeE->GetName());
 250   if (fTreeR) b->Add(fTreeR,fTreeR->GetName());
 251
 252   TIter next(fModules);
 253   AliModule *detector;
 254   while((detector = (AliModule*)next())) {
 255     b->Add(detector,detector->GetName());
 256   }
 257 }
 258
 259 //_____________________________________________________________________________
 260 void AliRun::Build()
 261 {
 262   //
 263   // Initialize Alice geometry
 264   // Dummy routine
 265   //
 266 }
 267
 268 //_____________________________________________________________________________
 269 void AliRun::BuildSimpleGeometry()
 270 {
 271   //
 272   // Create a simple TNode geometry used by Root display engine
 273   //
 274   // Initialise geometry
 275   //
 276   fGeometry = new TGeometry("AliceGeom","Galice Geometry for Hits");
 277   new TMaterial("void","Vacuum",0,0,0);  //Everything is void
 278   TBRIK *brik = new TBRIK("S_alice","alice volume","void",2000,2000,3000);
 279   brik->SetVisibility(0);
 280   new TNode("alice","alice","S_alice");
 281 }
 282
 283 //_____________________________________________________________________________
 284 void AliRun::CleanDetectors()
 285 {
 286   //
 287   // Clean Detectors at the end of event
 288   //
 289   TIter next(fModules);
 290   AliModule *detector;
 291   while((detector = (AliModule*)next())) {
 292     detector->FinishEvent();
 293   }
 294 }
 295
 296 //_____________________________________________________________________________
 297 void AliRun::CleanParents()
 298 {
 299   //
 300   // Clean Particles stack.
 301   // Set parent/child relations
 302   //
 303   TClonesArray &particles = *(gAlice->Particles());
 304   GParticle *part;
 305   int i;
 306   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
 307     part = (GParticle *)particles.UncheckedAt(i);
 308     if(!part->TestBit(Children_Bit)) {
 309       part->SetFirstChild(-1);
 310       part->SetLastChild(-1);
 311     }
 312   }
 313 }
 314
 315 //_____________________________________________________________________________
 316 Int_t AliRun::DistancetoPrimitive(Int_t, Int_t)
 317 {
 318   //
 319   // Return the distance from the mouse to the AliRun object
 320   // Dummy routine
 321   //
 322   return 9999;
 323 }
 324
 325 //_____________________________________________________________________________
 326 void AliRun::DumpPart (Int_t i)
 327 {
 328   //
 329   // Dumps particle i in the stack
 330   //
 331   TClonesArray &particles = *fParticles;
 332   ((GParticle*) particles[i])->Dump();
 333 }
 334
 335 //_____________________________________________________________________________
 336 void AliRun::DumpPStack ()
 337 {
 338   //
 339   // Dumps the particle stack
 340   //
 341   TClonesArray &particles = *fParticles;
 342   printf(
 343          "\n\n=======================================================================\n");
 344   for (Int_t i=0;i<fNtrack;i++)
 345     {
 346       printf("-> %d ",i); ((GParticle*) particles[i])->Dump();
 347       printf("--------------------------------------------------------------\n");
 348     }
 349   printf(
 350          "\n=======================================================================\n\n");
 351 }
 352
 353 //_____________________________________________________________________________
 354 void AliRun::SetField(Int_t type, Int_t version, Float_t scale,
 355                       Float_t maxField, char* filename)
 356 {
 357   //
 358   //  Set magnetic field parameters
 359   //  type      Magnetic field transport flag 0=no field, 2=helix, 3=Runge Kutta
 360   //  version   Magnetic field map version (only 1 active now)
 361   //  scale     Scale factor for the magnetic field
 362   //  maxField  Maximum value for the magnetic field
 363
 364   //
 365   // --- Sanity check on mag field flags
 366   if(type<0 || type > 2) {
 367     printf(" Invalid magnetic field flag: %5d; Helix tracking chosen instead\n"
 368            ,type);
 369     type=2;
 370   }
 371   if(fField) delete fField;
 372   if(version==1) {
 373     fField = new AliMagFC("Map1"," ",type,version,scale,maxField);
 374   } else if(version<=3) {
 375     fField = new AliMagFCM("Map2-3",filename,type,version,scale,maxField);
 376     fField->ReadField();
 377   } else {
 378     printf("Invalid map %d\n",version);
 379   }
 380 }
 381
 382 //_____________________________________________________________________________
 383 void AliRun::FillTree()
 384 {
 385   //
 386   // Fills all AliRun TTrees
 387   //
 388   if (fTreeK) fTreeK->Fill();
 389   if (fTreeH) fTreeH->Fill();
 390   if (fTreeD) fTreeD->Fill();
 391   if (fTreeR) fTreeR->Fill();
 392 }
 393
 394 //_____________________________________________________________________________
 395 void AliRun::FinishPrimary()
 396 {
 397   //
 398   // Called  at the end of each primary track
 399   //
 400
 401   // This primary is finished, purify stack
 402   gAlice->PurifyKine();
 403
 404   // Write out hits if any
 405   if (gAlice->TreeH()) {
 406     gAlice->TreeH()->Fill();
 407   }
 408
 409   // Reset Hits info
 410   gAlice->ResetHits();
 411 }
 412
 413 //_____________________________________________________________________________
 414 void AliRun::FinishEvent()
 415 {
 416   //
 417   // Called at the end of the event.
 418   //
 419
 420   //Update the energy deposit tables
 421   Int_t i;
 422   for(i=0;i<sEventEnergy.GetSize();i++) {
 423     sSummEnergy[i]+=sEventEnergy[i];
 424     sSum2Energy[i]+=sEventEnergy[i]*sEventEnergy[i];
 425   }
 426   sEventEnergy.Reset();
 427
 428   // Clean detector information
 429   CleanDetectors();
 430
 431   // Write out the kinematics
 432   if (fTreeK) {
 433     CleanParents();
 434     fTreeK->Fill();
 435   }
 436
 437   // Write out the digits
 438   if (fTreeD) {
 439     fTreeD->Fill();
 440     ResetDigits();
 441   }
 442
 443   // Write out reconstructed clusters
 444   if (fTreeR) {
 445     fTreeR->Fill();
 446   }
 447
 448   // Write out the event Header information
 449   if (fTreeE) fTreeE->Fill();
 450
 451   // Reset stack info
 452   ResetStack();
 453
 454   // Write Tree headers
 455   Int_t ievent = fHeader.GetEvent();
 456   char hname[30];
 457   sprintf(hname,"TreeK%d",ievent);
 458   if (fTreeK) fTreeK->Write(hname);
 459   sprintf(hname,"TreeH%d",ievent);
 460   if (fTreeH) fTreeH->Write(hname);
 461   sprintf(hname,"TreeD%d",ievent);
 462   if (fTreeD) fTreeD->Write(hname);
 463   sprintf(hname,"TreeR%d",ievent);
 464   if (fTreeR) fTreeR->Write(hname);
 465 }
 466
 467 //_____________________________________________________________________________
 468 void AliRun::FinishRun()
 469 {
 470   //
 471   // Called at the end of the run.
 472   //
 473
 474   // Clean detector information
 475   TIter next(fModules);
 476   AliModule *detector;
 477   while((detector = (AliModule*)next())) {
 478     detector->FinishRun();
 479   }
 480
 481   //Output energy summary tables
 482   EnergySummary();
 483
 484   // file is retrieved from whatever tree
 485   TFile *File = 0;
 486   if (fTreeK) File = fTreeK->GetCurrentFile();
 487   if ((!File) && (fTreeH)) File = fTreeH->GetCurrentFile();
 488   if ((!File) && (fTreeD)) File = fTreeD->GetCurrentFile();
 489   if ((!File) && (fTreeE)) File = fTreeE->GetCurrentFile();
 490   if( NULL==File ) {
 491     Error("FinishRun","There isn't root file!");
 492     exit(1);
 493   }
 494   File->cd();
 495   fTreeE->Write();
 496
 497   // Clean tree information
 498   delete fTreeK; fTreeK = 0;
 499   delete fTreeH; fTreeH = 0;
 500   delete fTreeD; fTreeD = 0;
 501   delete fTreeR; fTreeR = 0;
 502   delete fTreeE; fTreeE = 0;
 503
 504   // Write AliRun info and all detectors parameters
 505   Write();
 506
 507   // Close output file
 508   File->Write();
 509   File->Close();
 510 }
 511
 512 //_____________________________________________________________________________
 513 void AliRun::FlagTrack(Int_t track)
 514 {
 515   //
 516   // Flags a track and all its family tree to be kept
 517   //
 518   int curr;
 519   GParticle *particle;
 520
 521   curr=track;
 522   while(1) {
 523     particle=(GParticle*)fParticles->UncheckedAt(curr);
 524
 525     // If the particle is flagged the three from here upward is saved already
 526     if(particle->TestBit(Keep_Bit)) return;
 527
 528     // Save this particle
 529     particle->SetBit(Keep_Bit);
 530
 531     // Move to father if any
 532     if((curr=particle->GetParent())==-1) return;
 533   }
 534 }
 535
 536 //_____________________________________________________________________________
 537 void AliRun::EnergySummary()
 538 {
 539   //
 540   // Print summary of deposited energy
 541   //
 542
 543   AliMC* pMC = AliMC::GetMC();
 544
 545   Int_t ndep=0;
 546   Float_t edtot=0;
 547   Float_t ed, ed2;
 548   Int_t kn, i, left, j, id;
 549   const Float_t zero=0;
 550   Int_t ievent=fHeader.GetEvent()+1;
 551   //
 552   // Energy loss information
 553   if(ievent) {
 554     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 555     for(kn=1;kn<sEventEnergy.GetSize();kn++) {
 556       ed=sSummEnergy[kn];
 557       if(ed>0) {
 558         sEventEnergy[ndep]=kn;
 559         if(ievent>1) {
 560           ed=ed/ievent;
 561           ed2=sSum2Energy[kn];
 562           ed2=ed2/ievent;
 563           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,zero))/ed;
 564         } else
 565           ed2=99;
 566         sSummEnergy[ndep]=ed;
 567         sSum2Energy[ndep]=TMath::Min((Float_t) 99.,TMath::Max(ed2,zero));
 568         edtot+=ed;
 569         ndep++;
 570       }
 571     }
 572     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 573       left=ndep-kn*3;
 574       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 575         j=kn*3+i;
 576         id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
 577         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",pMC->VolName(id),sSummEnergy[j],sSum2Energy[j]);
 578       }
 579       printf("\n");
 580     }
 581     //
 582     // Relative energy loss in different detectors
 583     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 584     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 585     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 586       left=ndep-kn*5;
 587       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 588         j=kn*5+i;
 589         id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
 590         printf(" %s %10.3f%%;",pMC->VolName(id),100*sSummEnergy[j]/edtot);
 591       }
 592       printf("\n");
 593     }
 594     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 595     printf("\n");
 596   }
 597   //
 598   // Reset the TArray's
 599   sEventEnergy.Set(0);
 600   sSummEnergy.Set(0);
 601   sSum2Energy.Set(0);
 602 }
 603
 604 //_____________________________________________________________________________
 605 AliModule *AliRun::GetModule(const char *name)
 606 {
 607   //
 608   // Return pointer to detector from name
 609   //
 610   return (AliModule*)fModules->FindObject(name);
 611 }
 612
 613 //_____________________________________________________________________________
 614 AliDetector *AliRun::GetDetector(const char *name)
 615 {
 616   //
 617   // Return pointer to detector from name
 618   //
 619   return (AliDetector*)fModules->FindObject(name);
 620 }
 621
 622 //_____________________________________________________________________________
 623 Int_t AliRun::GetModuleID(const char *name)
 624 {
 625   //
 626   // Return galice internal detector identifier from name
 627   //
 628   Int_t i;
 629   for(i=0;i<fNdets;i++) if(!strcmp(fDnames[i],name)) {
 630     return i;
 631   }
 632   printf(" * GetDetectorID * Detector %s not found: returning -1\n",name);
 633   return -1;
 634 }
 635
 636 //_____________________________________________________________________________
 637 Int_t AliRun::GetEvent(Int_t event)
 638 {
 639   //
 640   // Connect the Trees Kinematics and Hits for event # event
 641   // Set branch addresses
 642   //
 643   fHeader.SetEvent(event);
 644
 645   // Reset existing structures
 646   ResetStack();
 647   ResetHits();
 648   ResetDigits();
 649
 650   // Delete Trees already connected
 651   if (fTreeK) delete fTreeK;
 652   if (fTreeH) delete fTreeH;
 653   if (fTreeD) delete fTreeD;
 654   if (fTreeR) delete fTreeR;
 655
 656   // Get Kine Tree from file
 657   char treeName[20];
 658   sprintf(treeName,"TreeK%d",event);
 659   fTreeK = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 660   if (fTreeK) fTreeK->SetBranchAddress("Particles", &fParticles);
 661   else        printf("ERROR: cannot find Kine Tree for event:%d\n",event);
 662
 663   // Get Hits Tree header from file
 664   sprintf(treeName,"TreeH%d",event);
 665   fTreeH = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 666   if (!fTreeH) {
 667     printf("ERROR: cannot find Hits Tree for event:%d\n",event);
 668     return 0;
 669   }
 670
 671   // Get Digits Tree header from file
 672   sprintf(treeName,"TreeD%d",event);
 673   fTreeD = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 674   if (!fTreeD) {
 675     printf("WARNING: cannot find Digits Tree for event:%d\n",event);
 676   }
 677
 678
 679   // Get Reconstruct Tree header from file
 680   sprintf(treeName,"TreeR%d",event);
 681   fTreeR = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 682   if (!fTreeR) {
 683     //    printf("WARNING: cannot find Reconstructed Tree for event:%d\n",event);
 684   }
 685
 686   // Set Trees branch addresses
 687   TIter next(fModules);
 688   AliModule *detector;
 689   while((detector = (AliModule*)next())) {
 690     detector->SetTreeAddress();
 691   }
 692
 693   if (fTreeK) fTreeK->GetEvent(0);
 694   fNtrack = Int_t (fParticles->GetEntries());
 695   return fNtrack;
 696 }
 697
 698 //_____________________________________________________________________________
 699 TGeometry *AliRun::GetGeometry()
 700 {
 701   //
 702   // Import Alice geometry from current file
 703   // Return pointer to geometry object
 704   //
 705   if (!fGeometry) fGeometry = (TGeometry*)gDirectory->Get("AliceGeom");
 706   //
 707   // Unlink and relink nodes in detectors
 708   // This is bad and there must be a better way...
 709   //
 710   TList *tnodes=fGeometry->GetListOfNodes();
 711   TNode *alice=(TNode*)tnodes->At(0);
 712   TList *gnodes=alice->GetListOfNodes();
 713
 714   TIter next(fModules);
 715   AliModule *detector;
 716   while((detector = (AliModule*)next())) {
 717     detector->SetTreeAddress();
 718     TList *dnodes=detector->Nodes();
 719     Int_t j;
 720     TNode *node, *node1;
 721     for ( j=0; j<dnodes->GetSize(); j++) {
 722       node = (TNode*) dnodes->At(j);
 723       node1 = (TNode*) gnodes->FindObject(node->GetName());
 724       dnodes->Remove(node);
 725       dnodes->AddAt(node1,j);
 726     }
 727   }
 728   return fGeometry;
 729 }
 730
 731 //_____________________________________________________________________________
 732 void AliRun::GetNextTrack(Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
 733                           Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t *polar,
 734                           Float_t &tof)
 735 {
 736   //
 737   // Return next track from stack of particles
 738   //
 739   fCurrent=-1;
 740   GParticle *track;
 741   for(Int_t i=fNtrack-1; i>=0; i--) {
 742     track=(GParticle*) fParticles->UncheckedAt(i);
 743     if(!track->TestBit(Done_Bit)) {
 744       //
 745       // The track has not yet been processed
 746       fCurrent=i;
 747       ipart=track->GetKF();
 748       pmom[0]=track->GetPx();
 749       pmom[1]=track->GetPy();
 750       pmom[2]=track->GetPz();
 751       e     =track->GetEnergy();
 752       vpos[0]=track->GetVx();
 753       vpos[1]=track->GetVy();
 754       vpos[2]=track->GetVz();
 755       polar[0]=track->GetPolx();
 756       polar[1]=track->GetPoly();
 757       polar[2]=track->GetPolz();
 758       tof=track->GetTime();
 759       track->SetBit(Done_Bit);
 760       break;
 761     }
 762   }
 763   mtrack=fCurrent;
 764   //
 765   // stop and start timer when we start a primary track
 766   Int_t nprimaries = fHeader.GetNprimary();
 767   if (fCurrent >= nprimaries) return;
 768   if (fCurrent < nprimaries-1) {
 769     fTimer.Stop();
 770     track=(GParticle*) fParticles->UncheckedAt(fCurrent+1);
 771     track->SetProcessTime(fTimer.CpuTime());
 772   }
 773   fTimer.Start();
 774 }
 775
 776 //_____________________________________________________________________________
 777 Int_t AliRun::GetPrimary(Int_t track)
 778 {
 779   //
 780   // return number of primary that has generated track
 781   //
 782   int current, parent;
 783   GParticle *part;
 784   //
 785   parent=track;
 786   while (1) {
 787     current=parent;
 788     part = (GParticle *)fParticles->UncheckedAt(current);
 789     parent=part->GetParent();
 790     if(parent<0) return current;
 791   }
 792 }
 793
 794 //_____________________________________________________________________________
 795 void AliRun::Init(const char *setup)
 796 {
 797   //
 798   // Initialize the Alice setup
 799   //
 800
 801   gROOT->LoadMacro(setup);
 802   gInterpreter->ProcessLine("Config();");
 803
 804   AliMC* pMC = AliMC::GetMC();
 805
 806   pMC->Gpart();  //Create standard Geant particles
 807   sxpart();        //Define additional particles
 808
 809   TObject *objfirst, *objlast;
 810
 811   //
 812   //=================Create Materials, geometry, histograms, etc
 813    TIter next(fModules);
 814    AliModule *detector;
 815    while((detector = (AliModule*)next())) {
 816       detector->SetTreeAddress();
 817       objlast = gDirectory->GetList()->Last();
 818
 819       // Initialise detector materials, geometry, histograms,etc
 820       detector->CreateMaterials();
 821       detector->CreateGeometry();
 822       detector->BuildGeometry();
 823       detector->Init();
 824
 825       // Add Detector histograms in Detector list of histograms
 826       if (objlast) objfirst = gDirectory->GetList()->After(objlast);
 827       else         objfirst = gDirectory->GetList()->First();
 828       while (objfirst) {
 829         detector->Histograms()->Add(objfirst);
 830         objfirst = gDirectory->GetList()->After(objfirst);
 831       }
 832    }
 833    SetTransPar(); //Read the cuts for all materials
 834
 835    MediaTable(); //Build the special IMEDIA table
 836
 837    //Close the geometry structure
 838    pMC->Ggclos();
 839
 840    //Initialise geometry deposition table
 841    sEventEnergy.Set(pMC->NofVolumes()+1);
 842    sSummEnergy.Set(pMC->NofVolumes()+1);
 843    sSum2Energy.Set(pMC->NofVolumes()+1);
 844
 845    //Create the color table
 846    pMC->SetColors();
 847
 848    //Compute cross-sections
 849    pMC->Gphysi();
 850
 851    //Write Geometry object to current file.
 852    fGeometry->Write();
 853
 854    fInitDone = kTRUE;
 855 }
 856
 857 //_____________________________________________________________________________
 858 void AliRun::MediaTable()
 859 {
 860   //
 861   // Built media table to get from the media number to
 862   // the detector id
 863   //
 864   Int_t kz, ibeg, nz, idt, lz, i, k, ind;
 865   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 866   AliModule *det;
 867   //
 868   // For all detectors
 869   for (kz=0;kz<fNdets;kz++) {
 870     // If detector is defined
 871     if((det=(AliModule*) dets[kz])) {
 872       ibeg=100*kz-1;
 873       for(nz=ibeg==-1?1:0;nz<100;nz++) {
 874         // Find max and min material number
 875         if((idt=fIdtmed[ibeg+nz])) {
 876           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 877           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 878         }
 879       }
 880       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 881         det->LoMedium() = 0;
 882         det->HiMedium() = 0;
 883       } else {
 884         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 885           Error("MediaTable","Increase fImedia");
 886           return;
 887         }
 888         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 889         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 890           (*fImedia)[lz]=kz;
 891         }
 892       }
 893     }
 894   }
 895   //
 896   // Print summary table
 897   printf(" Traking media ranges:\n");
 898   for(i=0;i<(fNdets-1)/6+1;i++) {
 899     for(k=0;k< (6<fNdets-i*6?6:fNdets-i*6);k++) {
 900       ind=i*6+k;
 901       det=(AliModule*)dets[ind];
 902       if(det)
 903         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 904                det->HiMedium());
 905       else
 906         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 907     }
 908     printf("\n");
 909   }
 910 }
 911
 912 //____________________________________________________________________________
 913 void AliRun::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 914 {
 915   //
 916   // Load the event generator
 917   //
 918   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 919 }
 920
 921 //____________________________________________________________________________
 922 void AliRun::SetTransPar(char* filename)
 923 {
 924   //
 925   // Read filename to set the transport parameters
 926   //
 927
 928   AliMC* pMC = AliMC::GetMC();
 929
 930   const Int_t ncuts=10;
 931   const Int_t nflags=11;
 932   const Int_t npars=ncuts+nflags;
 933   const char pars[npars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 934                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 935                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 936                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 937   char line[256];
 938   char* filtmp;
 939   Float_t cut[ncuts];
 940   Int_t flag[nflags];
 941   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 942   FILE *lun;
 943   //
 944   // See whether the file is there
 945   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filename);
 946   lun=fopen(filtmp,"r");
 947   delete [] filtmp;
 948   if(!lun) {
 949     printf(" * AliRun::SetTransPar * file %s does not exist!\n",filename);
 950     return;
 951   }
 952   //
 953   printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 954   printf(" *%59s\n","*");
 955   printf(" *       Please check carefully what you are doing!%10s\n","*");
 956   printf(" *%59s\n","*");
 957   //
 958   while(1) {
 959     // Initialise cuts and flags
 960     for(i=0;i<ncuts;i++) cut[i]=-99;
 961     for(i=0;i<nflags;i++) flag[i]=-99;
 962     itmed=0;
 963     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 964     // Read up to the end of line excluded
 965     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 966     if(iret<0) {
 967       //End of file
 968       fclose(lun);
 969       printf(" *%59s\n","*");
 970       printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 971       return;
 972     }
 973     // Read the end of line
 974     fscanf(lun,"%*c");
 975     if(!iret) continue;
 976     if(line[0]=='*') continue;
 977     // Read the numbers
 978     iret=sscanf(line,"%d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 979                 &itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],&cut[9],
 980                 &flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],&flag[8],
 981                 &flag[9],&flag[10]);
 982     if(!iret) continue;
 983     if(iret<0) {
 984       //reading error
 985       printf(" *   Error reading file %s\n",filename);
 986       continue;
 987     }
 988     // Check that the tracking medium code is valid
 989     if(0<itmed && itmed < 100*fNdets) {
 990       ktmed=fIdtmed[itmed-1];
 991       if(!ktmed) {
 992         printf(" *     Invalid tracking medium code %d *\n",itmed);
 993         continue;
 994       }
 995       // Set energy thresholds
 996       for(kz=0;kz<ncuts;kz++) {
 997         if(cut[kz]>=0) {
 998           printf(" *  %-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d  *\n",pars[kz],cut[kz],itmed);
 999           pMC->Gstpar(ktmed,pars[kz],cut[kz]);
1000         }
1001       }
1002       // Set transport mechanisms
1003       for(kz=0;kz<nflags;kz++) {
1004         if(flag[kz]>=0) {
1005           printf(" *  %-6s set to %10d for tracking medium code %4d  *\n",pars[ncuts+kz],flag[kz],itmed);
1006           pMC->Gstpar(ktmed,pars[ncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
1007         }
1008       }
1009     } else {
1010       printf(" *     Invalid tracking medium code %d *\n",itmed);
1011       continue;
1012     }
1013   }
1014 }
1015
1016 //_____________________________________________________________________________
1017 void AliRun::MakeTree(Option_t *option)
1018 {
1019   //
1020   //  Create the ROOT trees
1021   //  Loop on all detectors to create the Root branch (if any)
1022   //
1023
1024   //
1025   // Analyse options
1026   char *K = strstr(option,"K");
1027   char *H = strstr(option,"H");
1028   char *E = strstr(option,"E");
1029   char *D = strstr(option,"D");
1030   char *R = strstr(option,"R");
1031   //
1032   if (K && !fTreeK) fTreeK = new TTree("TK","Kinematics");
1033   if (H && !fTreeH) fTreeH = new TTree("TH","Hits");
1034   if (D && !fTreeD) fTreeD = new TTree("TD","Digits");
1035   if (E && !fTreeE) fTreeE = new TTree("TE","Header");
1036   if (R && !fTreeR) fTreeR = new TTree("TR","Reconstruction");
1037   if (fTreeH) fTreeH->SetAutoSave(1000000000); //no autosave
1038   //
1039   // Create a branch for hits/digits for each detector
1040   // Each branch is a TClonesArray. Each data member of the Hits classes
1041   // will be in turn a subbranch of the detector master branch
1042   TIter next(fModules);
1043   AliModule *detector;
1044   while((detector = (AliModule*)next())) {
1045      if (H || D || R) detector->MakeBranch(option);
1046   }
1047   //  Create a branch for particles
1048   if (fTreeK && K) fTreeK->Branch("Particles",&fParticles,4000);
1049
1050   //  Create a branch for Header
1051   if (fTreeE && E) fTreeE->Branch("Header","AliHeader",&header,4000);
1052 }
1053
1054 //_____________________________________________________________________________
1055 Int_t AliRun::PurifyKine(Int_t lastSavedTrack, Int_t nofTracks)
1056 {
1057   //
1058   // PurifyKine with external parameters
1059   //
1060   fHgwmk = lastSavedTrack;
1061   fNtrack = nofTracks;
1062   PurifyKine();
1063   return fHgwmk;
1064 }
1065
1066 //_____________________________________________________________________________
1067 void AliRun::PurifyKine()
1068 {
1069   //
1070   // Compress kinematic tree keeping only flagged particles
1071   // and renaming the particle id's in all the hits
1072   //
1073   TClonesArray &particles = *fParticles;
1074   int nkeep=fHgwmk+1, parent, i;
1075   GParticle *part, *partnew, *father;
1076   AliHit *OneHit;
1077   int *map = new int[particles.GetEntries()];
1078
1079   // Save in Header total number of tracks before compression
1080   fHeader.SetNtrack(fHeader.GetNtrack()+fNtrack-fHgwmk);
1081
1082   // Preset map, to be removed later
1083   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
1084     if(i<=fHgwmk) map[i]=i ; else map[i] = -99 ;}
1085   // Second pass, build map between old and new numbering
1086   for(i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
1087     part = (GParticle *)particles.UncheckedAt(i);
1088     if(part->TestBit(Keep_Bit)) {
1089
1090       // This particle has to be kept
1091       map[i]=nkeep;
1092       if(i!=nkeep) {
1093
1094         // Old and new are different, have to copy
1095         partnew = (GParticle *)particles.UncheckedAt(nkeep);
1096         *partnew = *part;
1097       } else partnew = part;
1098
1099       // as the parent is always *before*, it must be already
1100       // in place. This is what we are checking anyway!
1101       if((parent=partnew->GetParent())>fHgwmk) {
1102         if(map[parent]==-99) printf("map[%d] = -99!\n",parent);
1103         partnew->SetParent(map[parent]);
1104       }
1105       nkeep++;
1106     }
1107   }
1108   fNtrack=nkeep;
1109
1110   // Fix children information
1111   for (i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
1112     part = (GParticle *)particles.UncheckedAt(i);
1113     parent = part->GetParent();
1114     father = (GParticle *)particles.UncheckedAt(parent);
1115     if(father->TestBit(Children_Bit)) {
1116
1117       if(i<father->GetFirstChild()) father->SetFirstChild(i);
1118       if(i>father->GetLastChild())  father->SetLastChild(i);
1119     } else {
1120       // Iitialise children info for first pass
1121       father->SetFirstChild(i);
1122       father->SetLastChild(i);
1123       father->SetBit(Children_Bit);
1124     }
1125   }
1126
1127   // Now loop on all detectors and reset the hits
1128   TIter next(fModules);
1129   AliModule *detector;
1130   while((detector = (AliModule*)next())) {
1131     if (!detector->Hits()) continue;
1132     TClonesArray &vHits=*(detector->Hits());
1133     if(vHits.GetEntries() != detector->GetNhits())
1134       printf("vHits.GetEntries()!=detector->GetNhits(): %d != %d\n",
1135              vHits.GetEntries(),detector->GetNhits());
1136     for (i=0; i<detector->GetNhits(); i++) {
1137       OneHit = (AliHit *)vHits.UncheckedAt(i);
1138       OneHit->SetTrack(map[OneHit->GetTrack()]);
1139     }
1140   }
1141
1142   fHgwmk=nkeep-1;
1143   particles.SetLast(fHgwmk);
1144   delete [] map;
1145 }
1146
1147 //_____________________________________________________________________________
1148 void AliRun::Reset(Int_t run, Int_t idevent)
1149 {
1150   //
1151   //  Reset all Detectors & kinematics & trees
1152   //
1153   ResetStack();
1154   ResetHits();
1155   ResetDigits();
1156
1157   // Initialise event header
1158   fHeader.Reset(run,idevent);
1159
1160   if(fTreeK) fTreeK->Reset();
1161   if(fTreeH) fTreeH->Reset();
1162   if(fTreeD) fTreeD->Reset();
1163 }
1164
1165 //_____________________________________________________________________________
1166 void AliRun::ResetDigits()
1167 {
1168   //
1169   //  Reset all Detectors digits
1170   //
1171   TIter next(fModules);
1172   AliModule *detector;
1173   while((detector = (AliModule*)next())) {
1174      detector->ResetDigits();
1175   }
1176 }
1177
1178 //_____________________________________________________________________________
1179 void AliRun::ResetHits()
1180 {
1181   //
1182   //  Reset all Detectors hits
1183   //
1184   TIter next(fModules);
1185   AliModule *detector;
1186   while((detector = (AliModule*)next())) {
1187      detector->ResetHits();
1188   }
1189 }
1190
1191 //_____________________________________________________________________________
1192 void AliRun::ResetPoints()
1193 {
1194   //
1195   // Reset all Detectors points
1196   //
1197   TIter next(fModules);
1198   AliModule *detector;
1199   while((detector = (AliModule*)next())) {
1200      detector->ResetPoints();
1201   }
1202 }
1203
1204 //_____________________________________________________________________________
1205 void AliRun::Run(Int_t nevent, const char *setup)
1206 {
1207   //
1208   // Main function to be called to process a galice run
1209   // example
1210   //    Root > gAlice.Run();
1211   // a positive number of events will cause the finish routine
1212   // to be called
1213   //
1214
1215   Int_t i, todo;
1216   // check if initialisation has been done
1217   if (!fInitDone) Init(setup);
1218
1219   AliMC* pMC = AliMC::GetMC();
1220
1221   // Create the Root Tree with one branch per detector
1222   if(!fEvent) {
1223     gAlice->MakeTree("KHDER");
1224   }
1225
1226   todo = TMath::Abs(nevent);
1227   for (i=0; i<todo; i++) {
1228   // Process one run (one run = one event)
1229      gAlice->Reset(fRun, fEvent);
1230      pMC->Gtrigi();
1231      pMC->Gtrigc();
1232      pMC->Gtrig();
1233      gAlice->FinishEvent();
1234      fEvent++;
1235   }
1236
1237   // End of this run, close files
1238   if(nevent>0) gAlice->FinishRun();
1239 }
1240
1241 //_____________________________________________________________________________
1242 void AliRun::RunLego(const char *setup,Int_t ntheta,Float_t themin,
1243                      Float_t themax,Int_t nphi,Float_t phimin,Float_t phimax,
1244                      Float_t rmin,Float_t rmax,Float_t zmax)
1245 {
1246   //
1247   // Generates lego plots of:
1248   //    - radiation length map phi vs theta
1249   //    - radiation length map phi vs eta
1250   //    - interaction length map
1251   //    - g/cm2 length map
1252   //
1253   //  ntheta    bins in theta, eta
1254   //  themin    minimum angle in theta (degrees)
1255   //  themax    maximum angle in theta (degrees)
1256   //  nphi      bins in phi
1257   //  phimin    minimum angle in phi (degrees)
1258   //  phimax    maximum angle in phi (degrees)
1259   //  rmin      minimum radius
1260   //  rmax      maximum radius
1261   //
1262   //
1263   //  The number of events generated = ntheta*nphi
1264   //  run input parameters in macro setup (default="Config.C")
1265   //
1266   //  Use macro "lego.C" to visualize the 3 lego plots in spherical coordinates
1267   //Begin_Html
1268   /*
1269     <img src="gif/AliRunLego1.gif">
1270   */
1271   //End_Html
1272   //Begin_Html
1273   /*
1274     <img src="gif/AliRunLego2.gif">
1275   */
1276   //End_Html
1277   //Begin_Html
1278   /*
1279     <img src="gif/AliRunLego3.gif">
1280   */
1281   //End_Html
1282   //
1283
1284   // check if initialisation has been done
1285   if (!fInitDone) Init(setup);
1286
1287   fLego = new AliLego("lego","lego");
1288   fLego->Init(ntheta,themin,themax,nphi,phimin,phimax,rmin,rmax,zmax);
1289   fLego->Run();
1290
1291   // Create only the Root event Tree
1292   gAlice->MakeTree("E");
1293
1294   // End of this run, close files
1295   gAlice->FinishRun();
1296 }
1297
1298 //_____________________________________________________________________________
1299 void AliRun::SetCurrentTrack(Int_t track)
1300 {
1301   //
1302   // Set current track number
1303   //
1304   fCurrent = track;
1305 }
1306
1307 //_____________________________________________________________________________
1308 void AliRun::SetTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t ipart, Float_t *pmom,
1309                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
1310                       const char *mecha, Int_t &ntr, Float_t weight)
1311 {
1312   //
1313   // Load a track on the stack
1314   //
1315   // done     0 if the track has to be transported
1316   //          1 if not
1317   // parent   identifier of the parent track. -1 for a primary
1318   // ipart    particle code
1319   // pmom     momentum GeV/c
1320   // vpos     position
1321   // polar    polarisation
1322   // tof      time of flight in seconds
1323   // mecha    production mechanism
1324   // ntr      on output the number of the track stored
1325   //
1326   TClonesArray &particles = *fParticles;
1327   GParticle *particle;
1328   Float_t mass;
1329   char pname[21];
1330   const Int_t firstchild=-1;
1331   const Int_t lastchild=-1;
1332   const Int_t KS=0;
1333   const Float_t tlife=0;
1334
1335   AliMC::GetMC()->GetParticle(ipart,pname,mass);
1336   Float_t e=TMath::Sqrt(mass*mass+pmom[0]*pmom[0]+
1337                         pmom[1]*pmom[1]+pmom[2]*pmom[2]);
1338
1339   //printf("Loading particle %s mass %f ene %f No %d ip %d pos %f %f %f mom %f %f %f KS %d m %s\n",
1340   //pname,mass,e,fNtrack,ipart,vpos[0],vpos[1],vpos[2],pmom[0],pmom[1],pmom[2],KS,mecha);
1341
1342   particle=new(particles[fNtrack]) GParticle(KS,ipart,parent,firstchild,
1343                                              lastchild,pmom[0],pmom[1],pmom[2],
1344                                              e,mass,vpos[0],vpos[1],vpos[2],
1345                                              polar[0],polar[1],polar[2],tof,
1346                                              tlife,mecha,weight);
1347   if(!done) particle->SetBit(Done_Bit);
1348
1349   if(parent>=0) {
1350     particle=(GParticle*) fParticles->UncheckedAt(parent);
1351     particle->SetLastChild(fNtrack);
1352     if(particle->GetFirstChild()<0) particle->SetFirstChild(fNtrack);
1353   } else {
1354     //
1355     // This is a primary track. Set high water mark for this event
1356     fHgwmk=fNtrack;
1357     //
1358     // Set also number if primary tracks
1359     fHeader.SetNprimary(fHgwmk+1);
1360     fHeader.SetNtrack(fHgwmk+1);
1361   }
1362   ntr = fNtrack++;
1363 }
1364
1365 //_____________________________________________________________________________
1366 void AliRun::KeepTrack(const Int_t track)
1367 {
1368   //
1369   // flags a track to be kept
1370   //
1371   TClonesArray &particles = *fParticles;
1372   ((GParticle*)particles[track])->SetBit(Keep_Bit);
1373 }
1374
1375 //_____________________________________________________________________________
1376 void AliRun::StepManager(Int_t id) const
1377 {
1378   //
1379   // Called at every step during transport
1380   //
1381
1382   AliMC* pMC = AliMC::GetMC();
1383
1384   Int_t copy;
1385   //
1386   // --- If lego option, do it and leave
1387   if (fLego) {
1388     fLego->StepManager();
1389     return;
1390   }
1391   //Update energy deposition tables
1392   sEventEnergy[pMC->CurrentVol(0,copy)]+=pMC->Edep();
1393
1394   //Call the appropriate stepping routine;
1395   AliModule *det = (AliModule*)fModules->At(id);
1396   if(det) det->StepManager();
1397 }
1398
1399 //_____________________________________________________________________________
1400 void AliRun::ReadEuclid(const char* filnam, Int_t id_det, const char* topvol)
1401 {
1402   //
1403   //       read in the geometry of the detector in euclid file format
1404   //
1405   //        id_det : the detector identification (2=its,...)
1406   //        topvol : return parameter describing the name of the top
1407   //        volume of geometry.
1408   //
1409   //            author : m. maire
1410   //
1411   //     28.07.98
1412   //     several changes have been made by miroslav helbich
1413   //     subroutine is rewrited to follow the new established way of memory
1414   //     booking for tracking medias and rotation matrices.
1415   //     all used tracking media have to be defined first, for this you can use
1416   //     subroutine  greutmed.
1417   //     top volume is searched as only volume not positioned into another
1418   //
1419
1420   AliMC* pMC = AliMC::GetMC();
1421
1422   Int_t i, nvol, iret, itmed, irot, numed, npar, ndiv, iaxe;
1423   Int_t ndvmx, nr, flag;
1424   char key[5], card[77], natmed[21];
1425   char name[5], mother[5], shape[5], konly[5], volst[7000][5];
1426   char *filtmp;
1427   Float_t par[50];
1428   Float_t teta1, phi1, teta2, phi2, teta3, phi3, orig, step;
1429   Float_t xo, yo, zo;
1430   Int_t idrot[5000],istop[7000];
1431   FILE *lun;
1432   AliModule *det;
1433   //
1434   TObjArray &dets = *fModules;
1435   if(!dets[id_det]) {
1436     printf(" *** GREUTMED *** Detector %d not defined\n",id_det);
1437     return;
1438   } else {
1439     det = (AliModule*) dets[id_det];
1440   }
1441   //
1442   // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
1443   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
1444   lun=fopen(filtmp,"r");
1445   delete [] filtmp;
1446   if(!lun) {
1447     printf(" *** GREUCL *** Could not open file %s\n",filnam);
1448     return;
1449   }
1450   //* --- definition of rotation matrix 0 ---
1451   idrot[0]=0;
1452   nvol=0;
1453  L10:
1454   for(i=0;i<77;i++) card[i]=0;
1455   iret=fscanf(lun,"%77[^\n]",card);
1456   if(iret<=0) goto L20;
1457   fscanf(lun,"%*c");
1458   //*
1459   strncpy(key,card,4);
1460   key[4]='\0';
1461   if (!strcmp(key,"TMED")) {
1462     sscanf(&card[5],"%d '%[^']'",&itmed,natmed);
1463     //Pad the string with blanks
1464     i=-1;
1465     while(natmed[++i]);
1466     while(i<20) natmed[i++]=' ';
1467     natmed[i]='\0';
1468     //
1469     pMC->Gckmat(fIdtmed[itmed+id_det*100-1],natmed);
1470     //*
1471   } else if (!strcmp(key,"ROTM")) {
1472     sscanf(&card[4],"%d %f %f %f %f %f %f",&irot,&teta1,&phi1,&teta2,&phi2,&teta3,&phi3);
1473     det->AliMatrix(idrot[irot],teta1,phi1,teta2,phi2,teta3,phi3);
1474     //*
1475   } else if (!strcmp(key,"VOLU")) {
1476     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, shape, &numed, &npar);
1477     if (npar>0) {
1478       for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
1479       fscanf(lun,"%*c");
1480     }
1481     pMC->Gsvolu( name, shape, fIdtmed[numed+id_det*100-1], par, npar);
1482     //*     save the defined volumes
1483     strcpy(volst[++nvol],name);
1484     istop[nvol]=1;
1485     //*
1486   } else if (!strcmp(key,"DIVN")) {
1487     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, mother, &ndiv, &iaxe);
1488     pMC->Gsdvn  ( name, mother, ndiv, iaxe );
1489     //*
1490   } else if (!strcmp(key,"DVN2")) {
1491     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d %f %d",name, mother, &ndiv, &iaxe, &orig, &numed);
1492     pMC->Gsdvn2( name, mother, ndiv, iaxe, orig,fIdtmed[numed+id_det*100-1]);
1493     //*
1494   } else if (!strcmp(key,"DIVT")) {
1495     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &numed, &ndvmx);
1496     pMC->Gsdvt ( name, mother, step, iaxe, fIdtmed[numed+id_det*100-1], ndvmx);
1497     //*
1498   } else if (!strcmp(key,"DVT2")) {
1499     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %f %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &orig, &numed, &ndvmx);
1500     pMC->Gsdvt2 ( name, mother, step, iaxe, orig, fIdtmed[numed+id_det*100-1], ndvmx );
1501     //*
1502   } else if (!strcmp(key,"POSI")) {
1503     sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']'", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly);
1504     //*** volume name cannot be the top volume
1505     for(i=1;i<=nvol;i++) {
1506       if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
1507     }
1508     //*
1509     pMC->Gspos  ( name, nr, mother, xo, yo, zo, idrot[irot], konly );
1510     //*
1511   } else if (!strcmp(key,"POSP")) {
1512     sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']' %d", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly, &npar);
1513     if (npar > 0) {
1514       for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
1515       fscanf(lun,"%*c");
1516     }
1517     //*** volume name cannot be the top volume
1518     for(i=1;i<=nvol;i++) {
1519       if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
1520     }
1521     //*
1522     pMC->Gsposp ( name, nr, mother, xo,yo,zo, idrot[irot], konly, par, npar);
1523   }
1524   //*
1525   if (strcmp(key,"END")) goto L10;
1526   //* find top volume in the geometry
1527   flag=0;
1528   for(i=1;i<=nvol;i++) {
1529     if (istop[i] && flag) {
1530       printf(" *** GREUCL *** warning: %s is another possible top volume\n",volst[i]);
1531     }
1532     if (istop[i] && !flag) {
1533       topvol=volst[i];
1534       printf(" *** GREUCL *** volume %s taken as a top volume\n",topvol);
1535       flag=1;
1536     }
1537   }
1538   if (!flag) {
1539     printf("*** GREUCL *** warning: top volume not found\n");
1540   }
1541   fclose (lun);
1542   //*
1543   //*     commented out only for the not cernlib version
1544   printf(" *** GREUCL *** file: %s is now read in\n",filnam);
1545   //
1546   return;
1547   //*
1548   L20:
1549   printf(" *** GREUCL *** reading error or premature end of file\n");
1550 }
1551
1552 //_____________________________________________________________________________
1553 void AliRun::ReadEuclidMedia(const char* filnam, Int_t id_det)
1554 {
1555   //
1556   //       read in the materials and tracking media for the detector
1557   //                   in euclid file format
1558   //
1559   //       filnam: name of the input file
1560   //       id_det: id_det is the detector identification (2=its,...)
1561   //
1562   //            author : miroslav helbich
1563   //
1564   Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max();
1565   Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ();
1566   Int_t end, i, iret, itmed;
1567   char key[5], card[130], natmed[21], namate[21];
1568   Float_t ubuf[50];
1569   char* filtmp;
1570   FILE *lun;
1571   Int_t imate;
1572   Int_t nwbuf, isvol, ifield, nmat;
1573   Float_t a, z, dens, radl, absl, fieldm, tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin;
1574   AliModule* det;
1575 //
1576   TObjArray &dets = *fModules;
1577   if(!dets[id_det]) {
1578     printf(" *** GREUTMED *** Detector %d not defined\n",id_det);
1579     return;
1580   } else {
1581     det = (AliModule*) dets[id_det];
1582   }
1583   end=strlen(filnam);
1584   for(i=0;i<end;i++) if(filnam[i]=='.') {
1585     end=i;
1586     break;
1587   }
1588   //
1589   // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
1590   printf("The file name is %s\n",filnam); //Debug
1591   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
1592   lun=fopen(filtmp,"r");
1593   delete [] filtmp;
1594   if(!lun) {
1595     printf(" *** GREUTMED *** Could not open file %s\n",filnam);
1596     return;
1597   }
1598   //
1599   // Retrieve Mag Field parameters
1600   Int_t ISXFLD=gAlice->Field()->Integ();
1601   Float_t SXMGMX=gAlice->Field()->Max();
1602   //
1603  L10:
1604   for(i=0;i<130;i++) card[i]=0;
1605   iret=fscanf(lun,"%4s %[^\n]",key,card);
1606   if(iret<=0) goto L20;
1607   fscanf(lun,"%*c");
1608   //*
1609   //* read material
1610   if (!strcmp(key,"MATE")) {
1611     sscanf(card,"%d '%[^']' %f %f %f %f %f %d",&imate,namate,&a,&z,&dens,&radl,&absl,&nwbuf);
1612     if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
1613     //Pad the string with blanks
1614     i=-1;
1615     while(namate[++i]);
1616     while(i<20) namate[i++]=' ';
1617     namate[i]='\0';
1618     //
1619     det->AliMaterial(imate,namate,a,z,dens,radl,absl,ubuf,nwbuf);
1620     //* read tracking medium
1621   } else if (!strcmp(key,"TMED")) {
1622     sscanf(card,"%d '%[^']' %d %d %d %f %f %f %f %f %f %d",
1623            &itmed,natmed,&nmat,&isvol,&ifield,&fieldm,&tmaxfd,
1624            &stemax,&deemax,&epsil,&stmin,&nwbuf);
1625     if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
1626     if (ifield<0) ifield=isxfld;
1627     if (fieldm<0) fieldm=sxmgmx;
1628     //Pad the string with blanks
1629     i=-1;
1630     while(natmed[++i]);
1631     while(i<20) natmed[i++]=' ';
1632     natmed[i]='\0';
1633     //
1634     det->AliMedium(itmed+id_det*100,natmed,nmat,isvol,ISXFLD,SXMGMX,tmaxfd,
1635                    stemax,deemax,epsil,stmin,ubuf,nwbuf);
1636     (*fImedia)[fIdtmed[itmed+id_det*100-1]-1]=id_det;
1637     //*
1638   }
1639   //*
1640   if (strcmp(key,"END")) goto L10;
1641   fclose (lun);
1642   //*
1643   //*     commented out only for the not cernlib version
1644   printf(" *** GREUTMED *** file: %s is now read in\n",filnam);
1645   //*
1646   return;
1647   //*
1648  L20:
1649   printf(" *** GREUTMED *** reading error or premature end of file\n");
1650 }
1651
1652 //_____________________________________________________________________________
1653 void AliRun::Streamer(TBuffer &R__b)
1654 {
1655   //
1656   // Stream an object of class AliRun.
1657   //
1658   if (R__b.IsReading()) {
1659     Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
1660     TNamed::Streamer(R__b);
1661     if (!gAlice) gAlice = this;
1662     gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,"Run");
1663     R__b >> fNtrack;
1664     R__b >> fHgwmk;
1665     R__b >> fDebug;
1666     fHeader.Streamer(R__b);
1667     R__b >> fModules;
1668     R__b >> fParticles;
1669     R__b >> fField;
1670     //    R__b >> fMC;
1671     R__b >> fNdets;
1672     R__b >> fTrRmax;
1673     R__b >> fTrZmax;
1674     R__b >> fGenerator;
1675   } else {
1676     R__b.WriteVersion(AliRun::IsA());
1677     TNamed::Streamer(R__b);
1678     R__b << fNtrack;
1679     R__b << fHgwmk;
1680     R__b << fDebug;
1681     fHeader.Streamer(R__b);
1682     R__b << fModules;
1683     R__b << fParticles;
1684     R__b << fField;
1685     //    R__b << fMC;
1686     R__b << fNdets;
1687     R__b << fTrRmax;
1688     R__b << fTrZmax;
1689     R__b << fGenerator;
1690   }
1691 }
1692
1693
1694 //_____________________________________________________________________________
1695 //
1696 //                 Interfaces to Fortran
1697 //
1698 //_____________________________________________________________________________
1699
1700 extern "C" void type_of_call  rxgtrak (Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1701                                        Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t &tof)
1702 {
1703   //
1704   //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by the
1705   //     modified version of GTREVE.
1706   //
1707   //              Track number in the ROOT stack. If MTRACK=0 no
1708   //      mtrack  more tracks are left in the stack to be
1709   //              transported.
1710   //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
1711   //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
1712   //      e       Particle energy in GeV
1713   //      vpos[3] Particle position
1714   //      tof     Particle time of flight in seconds
1715   //
1716   Float_t polar[3];
1717   gAlice->GetNextTrack(mtrack, ipart, pmom, e, vpos, polar, tof);
1718   mtrack++;
1719 }
1720
1721 //_____________________________________________________________________________
1722 extern "C" void type_of_call
1723 #ifndef WIN32
1724 rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1725                Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, Int_t &ntr, const int cmlen)
1726 #else
1727 rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1728          Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, const int cmlen,
1729          Int_t &ntr)
1730 #endif
1731 {
1732   //
1733   //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by GUKINE
1734   //     and GUSTEP.
1735   //
1736   //              Status of the track. If keep=0 the track is put
1737   //      keep    on the ROOT stack but it is not fetched for
1738   //              transport.
1739   //      parent  Parent track. If parent=0 the track is a primary.
1740   //              In GUSTEP the routine is normally called to store
1741   //              secondaries generated by the current track whose
1742   //              ROOT stack number is MTRACK (common SCKINE.
1743   //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
1744   //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
1745   //      vpos[3] Particle position
1746   //      tof     Particle time of flight in seconds
1747   //
1748   //      cmech   (CHARACTER*10) Particle origin. This field is user
1749   //              defined and it is not used inside the GALICE code.
1750   //      ntr     Number assigned to the particle in the ROOT stack.
1751   //
1752   char mecha[11];
1753   Float_t polar[3]={0.,0.,0.};
1754   for(int i=0; i<10 && i<cmlen; i++) mecha[i]=cmech[i];
1755   mecha[10]=0;
1756   gAlice->SetTrack(keep, parent-1, ipart, pmom, vpos, polar, tof, mecha, ntr);
1757   ntr++;
1758 }
1759
1760 //_____________________________________________________________________________
1761 extern "C" void type_of_call  rxkeep(const Int_t &n)
1762 {
1763   if( NULL==gAlice ) exit(1);
1764
1765   if( n<=0 || n>gAlice->Particles()->GetEntries() )
1766     {
1767       printf("  Bad index n=%d must be 0<n<=%d\n",
1768              n,gAlice->Particles()->GetEntries());
1769       exit(1);
1770     }
1771
1772   ((GParticle*)(gAlice->Particles()->UncheckedAt(n-1)))->SetBit(Keep_Bit);
1773 }
1774
1775 //_____________________________________________________________________________
1776 extern "C" void type_of_call  rxouth ()
1777 {
1778   //
1779   // Called by Gtreve at the end of each primary track
1780   //
1781   gAlice->FinishPrimary();
1782 }
1783