STEER/AliRun.cxx

   1 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   2 //                                                                           //
   3 //  Control class for Alice C++                                              //
   4 //  Only one single instance of this class exists.                           //
   5 //  The object is created in main program aliroot                            //
   6 //  and is pointed by the global gAlice.                                     //
   7 //                                                                           //
   8 //   -Supports the list of all Alice Detectors (fModules).                 //
   9 //   -Supports the list of particles (fParticles).                           //
  10 //   -Supports the Trees.                                                    //
  11 //   -Supports the geometry.                                                 //
  12 //   -Supports the event display.                                            //
  13 //Begin_Html
  14 /*
  15 <img src="picts/AliRunClass.gif">
  16 */
  17 //End_Html
  18 //Begin_Html
  19 /*
  20 <img src="picts/alirun.gif">
  21 */
  22 //End_Html
  23 //                                                                           //
  24 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include <TFile.h>
  27 #include <TRandom.h>
  28 #include <TBRIK.h>
  29 #include <TNode.h>
  30 #include <TCint.h>
  31 #include <TSystem.h>
  32 #include <TObjectTable.h>
  33
  34 #include "TParticle.h"
  35 #include "AliRun.h"
  36 #include "AliDisplay.h"
  37
  38 #include "AliCallf77.h"
  39
  40 #include <stdlib.h>
  41 #include <stdio.h>
  42 #include <string.h>
  43
  44 AliRun *gAlice;
  45
  46 static AliHeader *header;
  47
  48 #ifndef WIN32
  49
  50 # define rxgtrak rxgtrak_
  51 # define rxstrak rxstrak_
  52 # define rxkeep  rxkeep_
  53 # define rxouth  rxouth_
  54 #else
  55
  56 # define rxgtrak RXGTRAK
  57 # define rxstrak RXSTRAK
  58 # define rxkeep  RXKEEP
  59 # define rxouth  RXOUTH
  60 #endif
  61
  62 static TArrayF sEventEnergy;
  63 static TArrayF sSummEnergy;
  64 static TArrayF sSum2Energy;
  65
  66 ClassImp(AliRun)
  67
  68 //_____________________________________________________________________________
  69 AliRun::AliRun()
  70 {
  71   //
  72   // Default constructor for AliRun
  73   //
  74   header=&fHeader;
  75   fRun       = 0;
  76   fEvent     = 0;
  77   fCurrent   = -1;
  78   fModules = 0;
  79   fGenerator = 0;
  80   fTreeD     = 0;
  81   fTreeK     = 0;
  82   fTreeH     = 0;
  83   fTreeE     = 0;
  84   fTreeR     = 0;
  85   fParticles = 0;
  86   fGeometry  = 0;
  87   fDisplay   = 0;
  88   fField     = 0;
  89   fMC        = 0;
  90   fNdets     = 0;
  91   fImedia    = 0;
  92   fTrRmax    = 1.e10;
  93   fTrZmax    = 1.e10;
  94   fInitDone  = kFALSE;
  95   fLego      = 0;
  96   fPDGDB     = 0;        //Particle factory object!
  97 }
  98
  99 //_____________________________________________________________________________
 100 AliRun::AliRun(const char *name, const char *title)
 101   : TNamed(name,title)
 102 {
 103   //
 104   //  Constructor for the main processor.
 105   //  Creates the geometry
 106   //  Creates the list of Detectors.
 107   //  Creates the list of particles.
 108   //
 109   Int_t i;
 110
 111   gAlice     = this;
 112   fTreeD     = 0;
 113   fTreeK     = 0;
 114   fTreeH     = 0;
 115   fTreeE     = 0;
 116   fTreeR     = 0;
 117   fTrRmax    = 1.e10;
 118   fTrZmax    = 1.e10;
 119   fGenerator = 0;
 120   fInitDone  = kFALSE;
 121   fLego      = 0;
 122   fField     = 0;
 123
 124   gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,name);
 125   //
 126   // create the support list for the various Detectors
 127   fModules = new TObjArray(77);
 128   //
 129   // Create the TNode geometry for the event display
 130
 131   BuildSimpleGeometry();
 132
 133
 134   fNtrack=0;
 135   fHgwmk=0;
 136   fCurrent=-1;
 137   header=&fHeader;
 138   fRun       = 0;
 139   fEvent     = 0;
 140   //
 141   // Create the particle stack
 142   fParticles = new TClonesArray("TParticle",100);
 143
 144   fDisplay = 0;
 145   //
 146   // Create default mag field
 147   SetField();
 148   //
 149   fMC      = gMC;
 150   //
 151   // Prepare the tracking medium lists
 152   fImedia = new TArrayI(1000);
 153   for(i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
 154   //
 155   // Make particles
 156   fPDGDB     = TDatabasePDG::Instance();        //Particle factory object!
 157 }
 158
 159 //_____________________________________________________________________________
 160 AliRun::~AliRun()
 161 {
 162   //
 163   // Defaullt AliRun destructor
 164   //
 165   delete fImedia;
 166   delete fField;
 167   delete fMC;
 168   delete fGeometry;
 169   delete fDisplay;
 170   delete fGenerator;
 171   delete fLego;
 172   delete fTreeD;
 173   delete fTreeK;
 174   delete fTreeH;
 175   delete fTreeE;
 176   delete fTreeR;
 177   if (fModules) {
 178     fModules->Delete();
 179     delete fModules;
 180   }
 181   if (fParticles) {
 182     fParticles->Delete();
 183     delete fParticles;
 184   }
 185 }
 186
 187 //_____________________________________________________________________________
 188 void AliRun::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 189 {
 190   //
 191   //  Add a hit to detector id
 192   //
 193   TObjArray &dets = *fModules;
 194   if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 195 }
 196
 197 //_____________________________________________________________________________
 198 void AliRun::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 199 {
 200   //
 201   // Add digit to detector id
 202   //
 203   TObjArray &dets = *fModules;
 204   if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 205 }
 206
 207 //_____________________________________________________________________________
 208 void AliRun::Browse(TBrowser *b)
 209 {
 210   //
 211   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 212   // of the Root browser.
 213   // It displays the Root Trees and all detectors.
 214   //
 215   if (fTreeK) b->Add(fTreeK,fTreeK->GetName());
 216   if (fTreeH) b->Add(fTreeH,fTreeH->GetName());
 217   if (fTreeD) b->Add(fTreeD,fTreeD->GetName());
 218   if (fTreeE) b->Add(fTreeE,fTreeE->GetName());
 219   if (fTreeR) b->Add(fTreeR,fTreeR->GetName());
 220
 221   TIter next(fModules);
 222   AliModule *detector;
 223   while((detector = (AliModule*)next())) {
 224     b->Add(detector,detector->GetName());
 225   }
 226 }
 227
 228 //_____________________________________________________________________________
 229 void AliRun::Build()
 230 {
 231   //
 232   // Initialize Alice geometry
 233   // Dummy routine
 234   //
 235 }
 236
 237 //_____________________________________________________________________________
 238 void AliRun::BuildSimpleGeometry()
 239 {
 240   //
 241   // Create a simple TNode geometry used by Root display engine
 242   //
 243   // Initialise geometry
 244   //
 245   fGeometry = new TGeometry("AliceGeom","Galice Geometry for Hits");
 246   new TMaterial("void","Vacuum",0,0,0);  //Everything is void
 247   TBRIK *brik = new TBRIK("S_alice","alice volume","void",2000,2000,3000);
 248   brik->SetVisibility(0);
 249   new TNode("alice","alice","S_alice");
 250 }
 251
 252 //_____________________________________________________________________________
 253 void AliRun::CleanDetectors()
 254 {
 255   //
 256   // Clean Detectors at the end of event
 257   //
 258   TIter next(fModules);
 259   AliModule *detector;
 260   while((detector = (AliModule*)next())) {
 261     detector->FinishEvent();
 262   }
 263 }
 264
 265 //_____________________________________________________________________________
 266 void AliRun::CleanParents()
 267 {
 268   //
 269   // Clean Particles stack.
 270   // Set parent/daughter relations
 271   //
 272   TClonesArray &particles = *(gAlice->Particles());
 273   TParticle *part;
 274   int i;
 275   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
 276     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
 277     if(!part->TestBit(Daughters_Bit)) {
 278       part->SetFirstDaughter(-1);
 279       part->SetLastDaughter(-1);
 280     }
 281   }
 282 }
 283
 284 //_____________________________________________________________________________
 285 Int_t AliRun::DistancetoPrimitive(Int_t, Int_t)
 286 {
 287   //
 288   // Return the distance from the mouse to the AliRun object
 289   // Dummy routine
 290   //
 291   return 9999;
 292 }
 293
 294 //_____________________________________________________________________________
 295 void AliRun::DumpPart (Int_t i)
 296 {
 297   //
 298   // Dumps particle i in the stack
 299   //
 300   TClonesArray &particles = *fParticles;
 301   ((TParticle*) particles[i])->Print();
 302 }
 303
 304 //_____________________________________________________________________________
 305 void AliRun::DumpPStack ()
 306 {
 307   //
 308   // Dumps the particle stack
 309   //
 310   TClonesArray &particles = *fParticles;
 311   printf(
 312          "\n\n=======================================================================\n");
 313   for (Int_t i=0;i<fNtrack;i++)
 314     {
 315       printf("-> %d ",i); ((TParticle*) particles[i])->Print();
 316       printf("--------------------------------------------------------------\n");
 317     }
 318   printf(
 319          "\n=======================================================================\n\n");
 320 }
 321
 322 //_____________________________________________________________________________
 323 void AliRun::SetField(Int_t type, Int_t version, Float_t scale,
 324                       Float_t maxField, char* filename)
 325 {
 326   //
 327   //  Set magnetic field parameters
 328   //  type      Magnetic field transport flag 0=no field, 2=helix, 3=Runge Kutta
 329   //  version   Magnetic field map version (only 1 active now)
 330   //  scale     Scale factor for the magnetic field
 331   //  maxField  Maximum value for the magnetic field
 332
 333   //
 334   // --- Sanity check on mag field flags
 335   if(type<0 || type > 2) {
 336     Warning("SetField",
 337             "Invalid magnetic field flag: %5d; Helix tracking chosen instead\n"
 338            ,type);
 339     type=2;
 340   }
 341   if(fField) delete fField;
 342   if(version==1) {
 343     fField = new AliMagFC("Map1"," ",type,version,scale,maxField);
 344   } else if(version<=3) {
 345     fField = new AliMagFCM("Map2-3",filename,type,version,scale,maxField);
 346     fField->ReadField();
 347   } else {
 348     Warning("SetField","Invalid map %d\n",version);
 349   }
 350 }
 351
 352 //_____________________________________________________________________________
 353 void AliRun::FillTree()
 354 {
 355   //
 356   // Fills all AliRun TTrees
 357   //
 358   if (fTreeK) fTreeK->Fill();
 359   if (fTreeH) fTreeH->Fill();
 360   if (fTreeD) fTreeD->Fill();
 361   if (fTreeR) fTreeR->Fill();
 362 }
 363
 364 //_____________________________________________________________________________
 365 void AliRun::FinishPrimary()
 366 {
 367   //
 368   // Called  at the end of each primary track
 369   //
 370
 371   static Int_t count=0;
 372   const Int_t times=10;
 373   // This primary is finished, purify stack
 374   gAlice->PurifyKine();
 375
 376   // Write out hits if any
 377   if (gAlice->TreeH()) {
 378     gAlice->TreeH()->Fill();
 379   }
 380
 381   // Reset Hits info
 382   gAlice->ResetHits();
 383
 384   //
 385   //  if(++count%times==1) gObjectTable->Print();
 386 }
 387
 388 //_____________________________________________________________________________
 389 void AliRun::FinishEvent()
 390 {
 391   //
 392   // Called at the end of the event.
 393   //
 394
 395   //Update the energy deposit tables
 396   Int_t i;
 397   for(i=0;i<sEventEnergy.GetSize();i++) {
 398     sSummEnergy[i]+=sEventEnergy[i];
 399     sSum2Energy[i]+=sEventEnergy[i]*sEventEnergy[i];
 400   }
 401   sEventEnergy.Reset();
 402
 403   // Clean detector information
 404   CleanDetectors();
 405
 406   // Write out the kinematics
 407   if (fTreeK) {
 408     CleanParents();
 409     fTreeK->Fill();
 410   }
 411
 412   // Write out the digits
 413   if (fTreeD) {
 414     fTreeD->Fill();
 415     ResetDigits();
 416   }
 417
 418   // Write out reconstructed clusters
 419   if (fTreeR) {
 420     fTreeR->Fill();
 421   }
 422
 423   // Write out the event Header information
 424   if (fTreeE) fTreeE->Fill();
 425
 426   // Reset stack info
 427   ResetStack();
 428
 429   // Write Tree headers
 430   //  Int_t ievent = fHeader.GetEvent();
 431   //  char hname[30];
 432   //  sprintf(hname,"TreeK%d",ievent);
 433   if (fTreeK) fTreeK->Write();
 434   //  sprintf(hname,"TreeH%d",ievent);
 435   if (fTreeH) fTreeH->Write();
 436   //  sprintf(hname,"TreeD%d",ievent);
 437   if (fTreeD) fTreeD->Write();
 438   //  sprintf(hname,"TreeR%d",ievent);
 439   if (fTreeR) fTreeR->Write();
 440 }
 441
 442 //_____________________________________________________________________________
 443 void AliRun::FinishRun()
 444 {
 445   //
 446   // Called at the end of the run.
 447   //
 448
 449   // Clean detector information
 450   TIter next(fModules);
 451   AliModule *detector;
 452   while((detector = (AliModule*)next())) {
 453     detector->FinishRun();
 454   }
 455
 456   //Output energy summary tables
 457   EnergySummary();
 458
 459   // file is retrieved from whatever tree
 460   TFile *File = 0;
 461   if (fTreeK) File = fTreeK->GetCurrentFile();
 462   if ((!File) && (fTreeH)) File = fTreeH->GetCurrentFile();
 463   if ((!File) && (fTreeD)) File = fTreeD->GetCurrentFile();
 464   if ((!File) && (fTreeE)) File = fTreeE->GetCurrentFile();
 465   if( NULL==File ) {
 466     Error("FinishRun","There isn't root file!");
 467     exit(1);
 468   }
 469   File->cd();
 470   fTreeE->Write();
 471
 472   // Clean tree information
 473   delete fTreeK; fTreeK = 0;
 474   delete fTreeH; fTreeH = 0;
 475   delete fTreeD; fTreeD = 0;
 476   delete fTreeR; fTreeR = 0;
 477   delete fTreeE; fTreeE = 0;
 478
 479   // Write AliRun info and all detectors parameters
 480   Write();
 481
 482   // Close output file
 483   File->Write();
 484   File->Close();
 485 }
 486
 487 //_____________________________________________________________________________
 488 void AliRun::FlagTrack(Int_t track)
 489 {
 490   //
 491   // Flags a track and all its family tree to be kept
 492   //
 493   int curr;
 494   TParticle *particle;
 495
 496   curr=track;
 497   while(1) {
 498     particle=(TParticle*)fParticles->UncheckedAt(curr);
 499
 500     // If the particle is flagged the three from here upward is saved already
 501     if(particle->TestBit(Keep_Bit)) return;
 502
 503     // Save this particle
 504     particle->SetBit(Keep_Bit);
 505
 506     // Move to father if any
 507     if((curr=particle->GetFirstMother())==-1) return;
 508   }
 509 }
 510
 511 //_____________________________________________________________________________
 512 void AliRun::EnergySummary()
 513 {
 514   //
 515   // Print summary of deposited energy
 516   //
 517
 518   Int_t ndep=0;
 519   Float_t edtot=0;
 520   Float_t ed, ed2;
 521   Int_t kn, i, left, j, id;
 522   const Float_t zero=0;
 523   Int_t ievent=fHeader.GetEvent()+1;
 524   //
 525   // Energy loss information
 526   if(ievent) {
 527     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 528     for(kn=1;kn<sEventEnergy.GetSize();kn++) {
 529       ed=sSummEnergy[kn];
 530       if(ed>0) {
 531         sEventEnergy[ndep]=kn;
 532         if(ievent>1) {
 533           ed=ed/ievent;
 534           ed2=sSum2Energy[kn];
 535           ed2=ed2/ievent;
 536           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,zero))/ed;
 537         } else
 538           ed2=99;
 539         sSummEnergy[ndep]=ed;
 540         sSum2Energy[ndep]=TMath::Min((Float_t) 99.,TMath::Max(ed2,zero));
 541         edtot+=ed;
 542         ndep++;
 543       }
 544     }
 545     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 546       left=ndep-kn*3;
 547       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 548         j=kn*3+i;
 549         id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
 550         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),sSummEnergy[j],sSum2Energy[j]);
 551       }
 552       printf("\n");
 553     }
 554     //
 555     // Relative energy loss in different detectors
 556     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 557     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 558     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 559       left=ndep-kn*5;
 560       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 561         j=kn*5+i;
 562         id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
 563         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*sSummEnergy[j]/edtot);
 564       }
 565       printf("\n");
 566     }
 567     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 568     printf("\n");
 569   }
 570   //
 571   // Reset the TArray's
 572   sEventEnergy.Set(0);
 573   sSummEnergy.Set(0);
 574   sSum2Energy.Set(0);
 575 }
 576
 577 //_____________________________________________________________________________
 578 AliModule *AliRun::GetModule(const char *name)
 579 {
 580   //
 581   // Return pointer to detector from name
 582   //
 583   return (AliModule*)fModules->FindObject(name);
 584 }
 585
 586 //_____________________________________________________________________________
 587 AliDetector *AliRun::GetDetector(const char *name)
 588 {
 589   //
 590   // Return pointer to detector from name
 591   //
 592   return (AliDetector*)fModules->FindObject(name);
 593 }
 594
 595 //_____________________________________________________________________________
 596 Int_t AliRun::GetModuleID(const char *name)
 597 {
 598   //
 599   // Return galice internal detector identifier from name
 600   //
 601   Int_t i=-1;
 602   TObject *mod=fModules->FindObject(name);
 603   if(mod) i=fModules->IndexOf(mod);
 604   return i;
 605 }
 606
 607 //_____________________________________________________________________________
 608 Int_t AliRun::GetEvent(Int_t event)
 609 {
 610   //
 611   // Connect the Trees Kinematics and Hits for event # event
 612   // Set branch addresses
 613   //
 614
 615   // Reset existing structures
 616   ResetStack();
 617   ResetHits();
 618   ResetDigits();
 619
 620   // Delete Trees already connected
 621   if (fTreeK) delete fTreeK;
 622   if (fTreeH) delete fTreeH;
 623   if (fTreeD) delete fTreeD;
 624   if (fTreeR) delete fTreeR;
 625
 626   // Get header from file
 627   if(fTreeE) fTreeE->GetEntry(event);
 628   else Error("GetEvent","Cannot file Header Tree\n");
 629
 630   // Get Kine Tree from file
 631   char treeName[20];
 632   sprintf(treeName,"TreeK%d",event);
 633   fTreeK = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 634   if (fTreeK) fTreeK->SetBranchAddress("Particles", &fParticles);
 635   else    Error("GetEvent","cannot find Kine Tree for event:%d\n",event);
 636
 637   // Get Hits Tree header from file
 638   sprintf(treeName,"TreeH%d",event);
 639   fTreeH = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 640   if (!fTreeH) {
 641     Error("GetEvent","cannot find Hits Tree for event:%d\n",event);
 642   }
 643
 644   // Get Digits Tree header from file
 645   sprintf(treeName,"TreeD%d",event);
 646   fTreeD = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 647   if (!fTreeD) {
 648     printf("WARNING: cannot find Digits Tree for event:%d\n",event);
 649   }
 650
 651
 652   // Get Reconstruct Tree header from file
 653   sprintf(treeName,"TreeR%d",event);
 654   fTreeR = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 655   if (!fTreeR) {
 656     //    printf("WARNING: cannot find Reconstructed Tree for event:%d\n",event);
 657   }
 658
 659   // Set Trees branch addresses
 660   TIter next(fModules);
 661   AliModule *detector;
 662   while((detector = (AliModule*)next())) {
 663     detector->SetTreeAddress();
 664   }
 665
 666   if (fTreeK) fTreeK->GetEvent(0);
 667   fNtrack = Int_t (fParticles->GetEntries());
 668   return fNtrack;
 669 }
 670
 671 //_____________________________________________________________________________
 672 TGeometry *AliRun::GetGeometry()
 673 {
 674   //
 675   // Import Alice geometry from current file
 676   // Return pointer to geometry object
 677   //
 678   if (!fGeometry) fGeometry = (TGeometry*)gDirectory->Get("AliceGeom");
 679   //
 680   // Unlink and relink nodes in detectors
 681   // This is bad and there must be a better way...
 682   //
 683   TList *tnodes=fGeometry->GetListOfNodes();
 684   TNode *alice=(TNode*)tnodes->At(0);
 685   TList *gnodes=alice->GetListOfNodes();
 686
 687   TIter next(fModules);
 688   AliModule *detector;
 689   while((detector = (AliModule*)next())) {
 690     detector->SetTreeAddress();
 691     TList *dnodes=detector->Nodes();
 692     Int_t j;
 693     TNode *node, *node1;
 694     for ( j=0; j<dnodes->GetSize(); j++) {
 695       node = (TNode*) dnodes->At(j);
 696       node1 = (TNode*) gnodes->FindObject(node->GetName());
 697       dnodes->Remove(node);
 698       dnodes->AddAt(node1,j);
 699     }
 700   }
 701   return fGeometry;
 702 }
 703
 704 //_____________________________________________________________________________
 705 void AliRun::GetNextTrack(Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
 706                           Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t *polar,
 707                           Float_t &tof)
 708 {
 709   //
 710   // Return next track from stack of particles
 711   //
 712   TVector3 pol;
 713   fCurrent=-1;
 714   TParticle *track;
 715   for(Int_t i=fNtrack-1; i>=0; i--) {
 716     track=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(i);
 717     if(!track->TestBit(Done_Bit)) {
 718       //
 719       // The track has not yet been processed
 720       fCurrent=i;
 721       ipart=track->GetPdgCode();
 722       pmom[0]=track->Px();
 723       pmom[1]=track->Py();
 724       pmom[2]=track->Pz();
 725       e     =track->Energy();
 726       vpos[0]=track->Vx();
 727       vpos[1]=track->Vy();
 728       vpos[2]=track->Vz();
 729       track->GetPolarisation(pol);
 730       polar[0]=pol.X();
 731       polar[1]=pol.Y();
 732       polar[2]=pol.Z();
 733       tof=track->T();
 734       track->SetBit(Done_Bit);
 735       break;
 736     }
 737   }
 738   mtrack=fCurrent;
 739   //
 740   // stop and start timer when we start a primary track
 741   Int_t nprimaries = fHeader.GetNprimary();
 742   if (fCurrent >= nprimaries) return;
 743   if (fCurrent < nprimaries-1) {
 744     fTimer.Stop();
 745     track=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(fCurrent+1);
 746     //    track->SetProcessTime(fTimer.CpuTime());
 747   }
 748   fTimer.Start();
 749 }
 750
 751 //_____________________________________________________________________________
 752 Int_t AliRun::GetPrimary(Int_t track)
 753 {
 754   //
 755   // return number of primary that has generated track
 756   //
 757   int current, parent;
 758   TParticle *part;
 759   //
 760   parent=track;
 761   while (1) {
 762     current=parent;
 763     part = (TParticle *)fParticles->UncheckedAt(current);
 764     parent=part->GetFirstMother();
 765     if(parent<0) return current;
 766   }
 767 }
 768
 769 //_____________________________________________________________________________
 770 void AliRun::Init(const char *setup)
 771 {
 772   //
 773   // Initialize the Alice setup
 774   //
 775
 776   gROOT->LoadMacro(setup);
 777   gInterpreter->ProcessLine("Config();");
 778
 779   gMC->DefineParticles();  //Create standard MC particles
 780
 781   TObject *objfirst, *objlast;
 782
 783   fNdets = fModules->GetLast()+1;
 784
 785   //
 786   //=================Create Materials, geometry, histograms, etc
 787    TIter next(fModules);
 788    AliModule *detector;
 789    while((detector = (AliModule*)next())) {
 790       detector->SetTreeAddress();
 791       objlast = gDirectory->GetList()->Last();
 792
 793       // Initialise detector materials, geometry, histograms,etc
 794       detector->CreateMaterials();
 795       detector->CreateGeometry();
 796       detector->BuildGeometry();
 797       detector->Init();
 798
 799       // Add Detector histograms in Detector list of histograms
 800       if (objlast) objfirst = gDirectory->GetList()->After(objlast);
 801       else         objfirst = gDirectory->GetList()->First();
 802       while (objfirst) {
 803         detector->Histograms()->Add(objfirst);
 804         objfirst = gDirectory->GetList()->After(objfirst);
 805       }
 806    }
 807    SetTransPar(); //Read the cuts for all materials
 808
 809    MediaTable(); //Build the special IMEDIA table
 810
 811    //Close the geometry structure
 812    gMC->Ggclos();
 813
 814    //Initialise geometry deposition table
 815    sEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 816    sSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 817    sSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 818
 819    //Create the color table
 820    gMC->SetColors();
 821
 822    //Compute cross-sections
 823    gMC->Gphysi();
 824
 825    //Write Geometry object to current file.
 826    fGeometry->Write();
 827
 828    fInitDone = kTRUE;
 829 }
 830
 831 //_____________________________________________________________________________
 832 void AliRun::MediaTable()
 833 {
 834   //
 835   // Built media table to get from the media number to
 836   // the detector id
 837   //
 838   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 839   //  Int_t ibeg;
 840   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 841   AliModule *det;
 842   //
 843   // For all detectors
 844   for (kz=0;kz<fNdets;kz++) {
 845     // If detector is defined
 846     if((det=(AliModule*) dets[kz])) {
 847         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 848         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 849         // Find max and min material number
 850         if((idt=idtmed[nz])) {
 851           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 852           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 853         }
 854       }
 855       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 856         det->LoMedium() = 0;
 857         det->HiMedium() = 0;
 858       } else {
 859         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 860           Error("MediaTable","Increase fImedia from %d to %d",
 861                 fImedia->GetSize(),det->HiMedium());
 862           return;
 863         }
 864         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 865         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 866           (*fImedia)[lz]=kz;
 867         }
 868       }
 869     }
 870   }
 871   //
 872   // Print summary table
 873   printf(" Traking media ranges:\n");
 874   for(i=0;i<(fNdets-1)/6+1;i++) {
 875     for(k=0;k< (6<fNdets-i*6?6:fNdets-i*6);k++) {
 876       ind=i*6+k;
 877       det=(AliModule*)dets[ind];
 878       if(det)
 879         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 880                det->HiMedium());
 881       else
 882         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 883     }
 884     printf("\n");
 885   }
 886 }
 887
 888 //____________________________________________________________________________
 889 void AliRun::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 890 {
 891   //
 892   // Load the event generator
 893   //
 894   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 895 }
 896
 897 //____________________________________________________________________________
 898 void AliRun::SetTransPar(char* filename)
 899 {
 900   //
 901   // Read filename to set the transport parameters
 902   //
 903
 904
 905   const Int_t ncuts=10;
 906   const Int_t nflags=11;
 907   const Int_t npars=ncuts+nflags;
 908   const char pars[npars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 909                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 910                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 911                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 912   char line[256];
 913   char detName[7];
 914   char* filtmp;
 915   Float_t cut[ncuts];
 916   Int_t flag[nflags];
 917   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 918   FILE *lun;
 919   //
 920   // See whether the file is there
 921   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filename);
 922   lun=fopen(filtmp,"r");
 923   delete [] filtmp;
 924   if(!lun) {
 925     Warning("SetTransPar","File %s does not exist!\n",filename);
 926     return;
 927   }
 928   //
 929   printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 930   printf(" *%59s\n","*");
 931   printf(" *       Please check carefully what you are doing!%10s\n","*");
 932   printf(" *%59s\n","*");
 933   //
 934   while(1) {
 935     // Initialise cuts and flags
 936     for(i=0;i<ncuts;i++) cut[i]=-99;
 937     for(i=0;i<nflags;i++) flag[i]=-99;
 938     itmed=0;
 939     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 940     // Read up to the end of line excluded
 941     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 942     if(iret<0) {
 943       //End of file
 944       fclose(lun);
 945       printf(" *%59s\n","*");
 946       printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 947       return;
 948     }
 949     // Read the end of line
 950     fscanf(lun,"%*c");
 951     if(!iret) continue;
 952     if(line[0]=='*') continue;
 953     // Read the numbers
 954     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 955                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 956                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 957                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 958     if(!iret) continue;
 959     if(iret<0) {
 960       //reading error
 961       Warning("SetTransPar","Error reading file %s\n",filename);
 962       continue;
 963     }
 964     // Check that the module exist
 965     AliModule *mod = GetModule(detName);
 966     if(mod) {
 967       // Get the array of media numbers
 968       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 969       // Check that the tracking medium code is valid
 970       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 971         ktmed=idtmed[itmed];
 972         if(!ktmed) {
 973           Warning("SetTransPar","Invalid tracking medium code %d for %s\n",itmed,mod->GetName());
 974           continue;
 975         }
 976         // Set energy thresholds
 977         for(kz=0;kz<ncuts;kz++) {
 978           if(cut[kz]>=0) {
 979             printf(" *  %-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s\n",
 980                    pars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName());
 981             gMC->Gstpar(ktmed,pars[kz],cut[kz]);
 982           }
 983         }
 984         // Set transport mechanisms
 985         for(kz=0;kz<nflags;kz++) {
 986           if(flag[kz]>=0) {
 987             printf(" *  %-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s\n",
 988                    pars[ncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName());
 989             gMC->Gstpar(ktmed,pars[ncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 990           }
 991         }
 992       } else {
 993         Warning("SetTransPar","Invalid medium code %d *\n",itmed);
 994         continue;
 995       }
 996     } else {
 997       Warning("SetTransPar","Module %s not present\n",detName);
 998       continue;
 999     }
1000   }
1001 }
1002
1003 //_____________________________________________________________________________
1004 void AliRun::MakeTree(Option_t *option)
1005 {
1006   //
1007   //  Create the ROOT trees
1008   //  Loop on all detectors to create the Root branch (if any)
1009   //
1010
1011   //
1012   // Analyse options
1013   char *K = strstr(option,"K");
1014   char *H = strstr(option,"H");
1015   char *E = strstr(option,"E");
1016   char *D = strstr(option,"D");
1017   char *R = strstr(option,"R");
1018   //
1019   if (K && !fTreeK) fTreeK = new TTree("TreeK0","Kinematics");
1020   if (H && !fTreeH) fTreeH = new TTree("TreeH0","Hits");
1021   if (D && !fTreeD) fTreeD = new TTree("TreeD0","Digits");
1022   if (E && !fTreeE) fTreeE = new TTree("TE","Header");
1023   if (R && !fTreeR) fTreeR = new TTree("TreeR0","Reconstruction");
1024   if (fTreeH) fTreeH->SetAutoSave(1000000000); //no autosave
1025   //
1026   // Create a branch for hits/digits for each detector
1027   // Each branch is a TClonesArray. Each data member of the Hits classes
1028   // will be in turn a subbranch of the detector master branch
1029   TIter next(fModules);
1030   AliModule *detector;
1031   while((detector = (AliModule*)next())) {
1032      if (H || D || R) detector->MakeBranch(option);
1033   }
1034   //  Create a branch for particles
1035   if (fTreeK && K) fTreeK->Branch("Particles",&fParticles,4000);
1036
1037   //  Create a branch for Header
1038   if (fTreeE && E) fTreeE->Branch("Header","AliHeader",&header,4000);
1039 }
1040
1041 //_____________________________________________________________________________
1042 Int_t AliRun::PurifyKine(Int_t lastSavedTrack, Int_t nofTracks)
1043 {
1044   //
1045   // PurifyKine with external parameters
1046   //
1047   fHgwmk = lastSavedTrack;
1048   fNtrack = nofTracks;
1049   PurifyKine();
1050   return fHgwmk;
1051 }
1052
1053 //_____________________________________________________________________________
1054 void AliRun::PurifyKine()
1055 {
1056   //
1057   // Compress kinematic tree keeping only flagged particles
1058   // and renaming the particle id's in all the hits
1059   //
1060   TClonesArray &particles = *fParticles;
1061   int nkeep=fHgwmk+1, parent, i;
1062   TParticle *part, *partnew, *father;
1063   AliHit *OneHit;
1064   int *map = new int[particles.GetEntries()];
1065
1066   // Save in Header total number of tracks before compression
1067   fHeader.SetNtrack(fHeader.GetNtrack()+fNtrack-fHgwmk);
1068
1069   // Preset map, to be removed later
1070   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
1071     if(i<=fHgwmk) map[i]=i ; else map[i] = -99 ;}
1072   // Second pass, build map between old and new numbering
1073   for(i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
1074     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
1075     if(part->TestBit(Keep_Bit)) {
1076
1077       // This particle has to be kept
1078       map[i]=nkeep;
1079       if(i!=nkeep) {
1080
1081         // Old and new are different, have to copy
1082         partnew = (TParticle *)particles.UncheckedAt(nkeep);
1083         *partnew = *part;
1084       } else partnew = part;
1085
1086       // as the parent is always *before*, it must be already
1087       // in place. This is what we are checking anyway!
1088       if((parent=partnew->GetFirstMother())>fHgwmk) {
1089         if(map[parent]==-99) printf("map[%d] = -99!\n",parent);
1090         partnew->SetFirstMother(map[parent]);
1091       }
1092       nkeep++;
1093     }
1094   }
1095   fNtrack=nkeep;
1096
1097   // Fix daughters information
1098   for (i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
1099     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
1100     parent = part->GetFirstMother();
1101     father = (TParticle *)particles.UncheckedAt(parent);
1102     if(father->TestBit(Daughters_Bit)) {
1103
1104       if(i<father->GetFirstDaughter()) father->SetFirstDaughter(i);
1105       if(i>father->GetLastDaughter())  father->SetLastDaughter(i);
1106     } else {
1107       // Iitialise daughters info for first pass
1108       father->SetFirstDaughter(i);
1109       father->SetLastDaughter(i);
1110       father->SetBit(Daughters_Bit);
1111     }
1112   }
1113
1114   // Now loop on all detectors and reset the hits
1115   TIter next(fModules);
1116   AliModule *detector;
1117   while((detector = (AliModule*)next())) {
1118     if (!detector->Hits()) continue;
1119     TClonesArray &vHits=*(detector->Hits());
1120     if(vHits.GetEntries() != detector->GetNhits())
1121       printf("vHits.GetEntries()!=detector->GetNhits(): %d != %d\n",
1122              vHits.GetEntries(),detector->GetNhits());
1123     for (i=0; i<detector->GetNhits(); i++) {
1124       OneHit = (AliHit *)vHits.UncheckedAt(i);
1125       OneHit->SetTrack(map[OneHit->GetTrack()]);
1126     }
1127   }
1128
1129   fHgwmk=nkeep-1;
1130   particles.SetLast(fHgwmk);
1131   delete [] map;
1132 }
1133
1134 //_____________________________________________________________________________
1135 void AliRun::Reset(Int_t run, Int_t idevent)
1136 {
1137   //
1138   //  Reset all Detectors & kinematics & trees
1139   //
1140   char hname[30];
1141   //
1142   ResetStack();
1143   ResetHits();
1144   ResetDigits();
1145
1146   // Initialise event header
1147   fHeader.Reset(run,idevent);
1148
1149   if(fTreeK) {
1150     fTreeK->Reset();
1151     sprintf(hname,"TreeK%d",idevent);
1152     fTreeK->SetName(hname);
1153   }
1154   if(fTreeH) {
1155     fTreeH->Reset();
1156     sprintf(hname,"TreeH%d",idevent);
1157     fTreeH->SetName(hname);
1158   }
1159   if(fTreeD) {
1160     fTreeD->Reset();
1161     sprintf(hname,"TreeD%d",idevent);
1162     fTreeD->SetName(hname);
1163   }
1164   if(fTreeR) {
1165     fTreeR->Reset();
1166     sprintf(hname,"TreeR%d",idevent);
1167     fTreeR->SetName(hname);
1168   }
1169 }
1170
1171 //_____________________________________________________________________________
1172 void AliRun::ResetDigits()
1173 {
1174   //
1175   //  Reset all Detectors digits
1176   //
1177   TIter next(fModules);
1178   AliModule *detector;
1179   while((detector = (AliModule*)next())) {
1180      detector->ResetDigits();
1181   }
1182 }
1183
1184 //_____________________________________________________________________________
1185 void AliRun::ResetHits()
1186 {
1187   //
1188   //  Reset all Detectors hits
1189   //
1190   TIter next(fModules);
1191   AliModule *detector;
1192   while((detector = (AliModule*)next())) {
1193      detector->ResetHits();
1194   }
1195 }
1196
1197 //_____________________________________________________________________________
1198 void AliRun::ResetPoints()
1199 {
1200   //
1201   // Reset all Detectors points
1202   //
1203   TIter next(fModules);
1204   AliModule *detector;
1205   while((detector = (AliModule*)next())) {
1206      detector->ResetPoints();
1207   }
1208 }
1209
1210 //_____________________________________________________________________________
1211 void AliRun::Run(Int_t nevent, const char *setup)
1212 {
1213   //
1214   // Main function to be called to process a galice run
1215   // example
1216   //    Root > gAlice.Run();
1217   // a positive number of events will cause the finish routine
1218   // to be called
1219   //
1220
1221   Int_t i, todo;
1222   // check if initialisation has been done
1223   if (!fInitDone) Init(setup);
1224
1225   // Create the Root Tree with one branch per detector
1226   if(!fEvent) {
1227     gAlice->MakeTree("KHDER");
1228   }
1229
1230   todo = TMath::Abs(nevent);
1231   for (i=0; i<todo; i++) {
1232   // Process one run (one run = one event)
1233      gAlice->Reset(fRun, fEvent);
1234      gMC->Gtrigi();
1235      gMC->Gtrigc();
1236      gMC->Gtrig();
1237      gAlice->FinishEvent();
1238      fEvent++;
1239   }
1240
1241   // End of this run, close files
1242   if(nevent>0) gAlice->FinishRun();
1243 }
1244
1245 //_____________________________________________________________________________
1246 void AliRun::RunLego(const char *setup,Int_t ntheta,Float_t themin,
1247                      Float_t themax,Int_t nphi,Float_t phimin,Float_t phimax,
1248                      Float_t rmin,Float_t rmax,Float_t zmax)
1249 {
1250   //
1251   // Generates lego plots of:
1252   //    - radiation length map phi vs theta
1253   //    - radiation length map phi vs eta
1254   //    - interaction length map
1255   //    - g/cm2 length map
1256   //
1257   //  ntheta    bins in theta, eta
1258   //  themin    minimum angle in theta (degrees)
1259   //  themax    maximum angle in theta (degrees)
1260   //  nphi      bins in phi
1261   //  phimin    minimum angle in phi (degrees)
1262   //  phimax    maximum angle in phi (degrees)
1263   //  rmin      minimum radius
1264   //  rmax      maximum radius
1265   //
1266   //
1267   //  The number of events generated = ntheta*nphi
1268   //  run input parameters in macro setup (default="Config.C")
1269   //
1270   //  Use macro "lego.C" to visualize the 3 lego plots in spherical coordinates
1271   //Begin_Html
1272   /*
1273     <img src="picts/AliRunLego1.gif">
1274   */
1275   //End_Html
1276   //Begin_Html
1277   /*
1278     <img src="picts/AliRunLego2.gif">
1279   */
1280   //End_Html
1281   //Begin_Html
1282   /*
1283     <img src="picts/AliRunLego3.gif">
1284   */
1285   //End_Html
1286   //
1287
1288   // check if initialisation has been done
1289   if (!fInitDone) Init(setup);
1290
1291   fLego = new AliLego("lego","lego");
1292   fLego->Init(ntheta,themin,themax,nphi,phimin,phimax,rmin,rmax,zmax);
1293   fLego->Run();
1294
1295   // Create only the Root event Tree
1296   gAlice->MakeTree("E");
1297
1298   // End of this run, close files
1299   gAlice->FinishRun();
1300 }
1301
1302 //_____________________________________________________________________________
1303 void AliRun::SetCurrentTrack(Int_t track)
1304 {
1305   //
1306   // Set current track number
1307   //
1308   fCurrent = track;
1309 }
1310
1311 //_____________________________________________________________________________
1312 void AliRun::SetTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
1313                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
1314                       const char *mecha, Int_t &ntr, Float_t weight)
1315 {
1316   //
1317   // Load a track on the stack
1318   //
1319   // done     0 if the track has to be transported
1320   //          1 if not
1321   // parent   identifier of the parent track. -1 for a primary
1322   // pdg    particle code
1323   // pmom     momentum GeV/c
1324   // vpos     position
1325   // polar    polarisation
1326   // tof      time of flight in seconds
1327   // mecha    production mechanism
1328   // ntr      on output the number of the track stored
1329   //
1330   TClonesArray &particles = *fParticles;
1331   TParticle *particle;
1332   Float_t mass;
1333   const Int_t firstdaughter=-1;
1334   const Int_t lastdaughter=-1;
1335   const Int_t KS=0;
1336   //  const Float_t tlife=0;
1337
1338   //
1339   // Here we get the static mass
1340   // For MC is ok, but a more sophisticated method could be necessary
1341   // if the calculated mass is required
1342   // also, this method is potentially dangerous if the mass
1343   // used in the MC is not the same of the PDG database
1344   //
1345   mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle(pdg)->Mass();
1346   Float_t e=TMath::Sqrt(mass*mass+pmom[0]*pmom[0]+
1347                         pmom[1]*pmom[1]+pmom[2]*pmom[2]);
1348
1349   //printf("Loading particle %s mass %f ene %f No %d ip %d pos %f %f %f mom %f %f %f KS %d m %s\n",
1350   //pname,mass,e,fNtrack,pdg,vpos[0],vpos[1],vpos[2],pmom[0],pmom[1],pmom[2],KS,mecha);
1351
1352   particle=new(particles[fNtrack]) TParticle(pdg,KS,parent,-1,firstdaughter,
1353                                              lastdaughter,pmom[0],pmom[1],pmom[2],
1354                                              e,vpos[0],vpos[1],vpos[2],tof);
1355   //                                         polar[0],polar[1],polar[2],tof,
1356   //                                         mecha,weight);
1357   ((TParticle*)particles[fNtrack])->SetPolarisation(TVector3(polar[0],polar[1],polar[2]));
1358   ((TParticle*)particles[fNtrack])->SetWeight(weight);
1359   if(!done) particle->SetBit(Done_Bit);
1360
1361   if(parent>=0) {
1362     particle=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(parent);
1363     particle->SetLastDaughter(fNtrack);
1364     if(particle->GetFirstDaughter()<0) particle->SetFirstDaughter(fNtrack);
1365   } else {
1366     //
1367     // This is a primary track. Set high water mark for this event
1368     fHgwmk=fNtrack;
1369     //
1370     // Set also number if primary tracks
1371     fHeader.SetNprimary(fHgwmk+1);
1372     fHeader.SetNtrack(fHgwmk+1);
1373   }
1374   ntr = fNtrack++;
1375 }
1376
1377 //_____________________________________________________________________________
1378 void AliRun::KeepTrack(const Int_t track)
1379 {
1380   //
1381   // flags a track to be kept
1382   //
1383   TClonesArray &particles = *fParticles;
1384   ((TParticle*)particles[track])->SetBit(Keep_Bit);
1385 }
1386
1387 //_____________________________________________________________________________
1388 void AliRun::StepManager(Int_t id) const
1389 {
1390   //
1391   // Called at every step during transport
1392   //
1393
1394   Int_t copy;
1395   //
1396   // --- If lego option, do it and leave
1397   if (fLego) {
1398     fLego->StepManager();
1399     return;
1400   }
1401   //Update energy deposition tables
1402   sEventEnergy[gMC->CurrentVolID(copy)]+=gMC->Edep();
1403
1404   //Call the appropriate stepping routine;
1405   AliModule *det = (AliModule*)fModules->At(id);
1406   if(det) det->StepManager();
1407 }
1408
1409 //_____________________________________________________________________________
1410 void AliRun::ReadEuclid(const char* filnam, const AliModule *det, const char* topvol)
1411 {
1412   //
1413   //       read in the geometry of the detector in euclid file format
1414   //
1415   //        id_det : the detector identification (2=its,...)
1416   //        topvol : return parameter describing the name of the top
1417   //        volume of geometry.
1418   //
1419   //            author : m. maire
1420   //
1421   //     28.07.98
1422   //     several changes have been made by miroslav helbich
1423   //     subroutine is rewrited to follow the new established way of memory
1424   //     booking for tracking medias and rotation matrices.
1425   //     all used tracking media have to be defined first, for this you can use
1426   //     subroutine  greutmed.
1427   //     top volume is searched as only volume not positioned into another
1428   //
1429
1430   Int_t i, nvol, iret, itmed, irot, numed, npar, ndiv, iaxe;
1431   Int_t ndvmx, nr, flag;
1432   char key[5], card[77], natmed[21];
1433   char name[5], mother[5], shape[5], konly[5], volst[7000][5];
1434   char *filtmp;
1435   Float_t par[50];
1436   Float_t teta1, phi1, teta2, phi2, teta3, phi3, orig, step;
1437   Float_t xo, yo, zo;
1438   Int_t idrot[5000],istop[7000];
1439   FILE *lun;
1440   //
1441   // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
1442   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
1443   lun=fopen(filtmp,"r");
1444   delete [] filtmp;
1445   if(!lun) {
1446     printf(" *** GREUCL *** Could not open file %s\n",filnam);
1447     return;
1448   }
1449   //* --- definition of rotation matrix 0 ---
1450   TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
1451   idrot[0]=0;
1452   nvol=0;
1453  L10:
1454   for(i=0;i<77;i++) card[i]=0;
1455   iret=fscanf(lun,"%77[^\n]",card);
1456   if(iret<=0) goto L20;
1457   fscanf(lun,"%*c");
1458   //*
1459   strncpy(key,card,4);
1460   key[4]='\0';
1461   if (!strcmp(key,"TMED")) {
1462     sscanf(&card[5],"%d '%[^']'",&itmed,natmed);
1463     //Pad the string with blanks
1464     i=-1;
1465     while(natmed[++i]);
1466     while(i<20) natmed[i++]=' ';
1467     natmed[i]='\0';
1468     //
1469     gMC->Gckmat(idtmed[itmed],natmed);
1470     //*
1471   } else if (!strcmp(key,"ROTM")) {
1472     sscanf(&card[4],"%d %f %f %f %f %f %f",&irot,&teta1,&phi1,&teta2,&phi2,&teta3,&phi3);
1473     det->AliMatrix(idrot[irot],teta1,phi1,teta2,phi2,teta3,phi3);
1474     //*
1475   } else if (!strcmp(key,"VOLU")) {
1476     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, shape, &numed, &npar);
1477     if (npar>0) {
1478       for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
1479       fscanf(lun,"%*c");
1480     }
1481     gMC->Gsvolu( name, shape, idtmed[numed], par, npar);
1482     //*     save the defined volumes
1483     strcpy(volst[++nvol],name);
1484     istop[nvol]=1;
1485     //*
1486   } else if (!strcmp(key,"DIVN")) {
1487     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, mother, &ndiv, &iaxe);
1488     gMC->Gsdvn  ( name, mother, ndiv, iaxe );
1489     //*
1490   } else if (!strcmp(key,"DVN2")) {
1491     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d %f %d",name, mother, &ndiv, &iaxe, &orig, &numed);
1492     gMC->Gsdvn2( name, mother, ndiv, iaxe, orig,idtmed[numed]);
1493     //*
1494   } else if (!strcmp(key,"DIVT")) {
1495     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &numed, &ndvmx);
1496     gMC->Gsdvt ( name, mother, step, iaxe, idtmed[numed], ndvmx);
1497     //*
1498   } else if (!strcmp(key,"DVT2")) {
1499     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %f %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &orig, &numed, &ndvmx);
1500     gMC->Gsdvt2 ( name, mother, step, iaxe, orig, idtmed[numed], ndvmx );
1501     //*
1502   } else if (!strcmp(key,"POSI")) {
1503     sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']'", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly);
1504     //*** volume name cannot be the top volume
1505     for(i=1;i<=nvol;i++) {
1506       if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
1507     }
1508     //*
1509     gMC->Gspos  ( name, nr, mother, xo, yo, zo, idrot[irot], konly );
1510     //*
1511   } else if (!strcmp(key,"POSP")) {
1512     sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']' %d", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly, &npar);
1513     if (npar > 0) {
1514       for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
1515       fscanf(lun,"%*c");
1516     }
1517     //*** volume name cannot be the top volume
1518     for(i=1;i<=nvol;i++) {
1519       if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
1520     }
1521     //*
1522     gMC->Gsposp ( name, nr, mother, xo,yo,zo, idrot[irot], konly, par, npar);
1523   }
1524   //*
1525   if (strcmp(key,"END")) goto L10;
1526   //* find top volume in the geometry
1527   flag=0;
1528   for(i=1;i<=nvol;i++) {
1529     if (istop[i] && flag) {
1530       printf(" *** GREUCL *** warning: %s is another possible top volume\n",volst[i]);
1531     }
1532     if (istop[i] && !flag) {
1533       topvol=volst[i];
1534       printf(" *** GREUCL *** volume %s taken as a top volume\n",topvol);
1535       flag=1;
1536     }
1537   }
1538   if (!flag) {
1539     printf("*** GREUCL *** warning: top volume not found\n");
1540   }
1541   fclose (lun);
1542   //*
1543   //*     commented out only for the not cernlib version
1544   printf(" *** GREUCL *** file: %s is now read in\n",filnam);
1545   //
1546   return;
1547   //*
1548   L20:
1549   printf(" *** GREUCL *** reading error or premature end of file\n");
1550 }
1551
1552 //_____________________________________________________________________________
1553 void AliRun::ReadEuclidMedia(const char* filnam, const AliModule *det)
1554 {
1555   //
1556   //       read in the materials and tracking media for the detector
1557   //                   in euclid file format
1558   //
1559   //       filnam: name of the input file
1560   //       id_det: id_det is the detector identification (2=its,...)
1561   //
1562   //            author : miroslav helbich
1563   //
1564   Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max();
1565   Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ();
1566   Int_t end, i, iret, itmed;
1567   char key[5], card[130], natmed[21], namate[21];
1568   Float_t ubuf[50];
1569   char* filtmp;
1570   FILE *lun;
1571   Int_t imate;
1572   Int_t nwbuf, isvol, ifield, nmat;
1573   Float_t a, z, dens, radl, absl, fieldm, tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin;
1574   //
1575   end=strlen(filnam);
1576   for(i=0;i<end;i++) if(filnam[i]=='.') {
1577     end=i;
1578     break;
1579   }
1580   //
1581   // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
1582   printf("The file name is %s\n",filnam); //Debug
1583   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
1584   lun=fopen(filtmp,"r");
1585   delete [] filtmp;
1586   if(!lun) {
1587     Warning("ReadEuclidMedia","Could not open file %s\n",filnam);
1588     return;
1589   }
1590   //
1591   // Retrieve Mag Field parameters
1592   Int_t ISXFLD=gAlice->Field()->Integ();
1593   Float_t SXMGMX=gAlice->Field()->Max();
1594   //  TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
1595   //
1596  L10:
1597   for(i=0;i<130;i++) card[i]=0;
1598   iret=fscanf(lun,"%4s %[^\n]",key,card);
1599   if(iret<=0) goto L20;
1600   fscanf(lun,"%*c");
1601   //*
1602   //* read material
1603   if (!strcmp(key,"MATE")) {
1604     sscanf(card,"%d '%[^']' %f %f %f %f %f %d",&imate,namate,&a,&z,&dens,&radl,&absl,&nwbuf);
1605     if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
1606     //Pad the string with blanks
1607     i=-1;
1608     while(namate[++i]);
1609     while(i<20) namate[i++]=' ';
1610     namate[i]='\0';
1611     //
1612     det->AliMaterial(imate,namate,a,z,dens,radl,absl,ubuf,nwbuf);
1613     //* read tracking medium
1614   } else if (!strcmp(key,"TMED")) {
1615     sscanf(card,"%d '%[^']' %d %d %d %f %f %f %f %f %f %d",
1616            &itmed,natmed,&nmat,&isvol,&ifield,&fieldm,&tmaxfd,
1617            &stemax,&deemax,&epsil,&stmin,&nwbuf);
1618     if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
1619     if (ifield<0) ifield=isxfld;
1620     if (fieldm<0) fieldm=sxmgmx;
1621     //Pad the string with blanks
1622     i=-1;
1623     while(natmed[++i]);
1624     while(i<20) natmed[i++]=' ';
1625     natmed[i]='\0';
1626     //
1627     det->AliMedium(itmed,natmed,nmat,isvol,ISXFLD,SXMGMX,tmaxfd,
1628                    stemax,deemax,epsil,stmin,ubuf,nwbuf);
1629     //    (*fImedia)[idtmed[itmed]-1]=id_det;
1630     //*
1631   }
1632   //*
1633   if (strcmp(key,"END")) goto L10;
1634   fclose (lun);
1635   //*
1636   //*     commented out only for the not cernlib version
1637   Warning("ReadEuclidMedia","file: %s is now read in\n",filnam);
1638   //*
1639   return;
1640   //*
1641  L20:
1642   Warning("ReadEuclidMedia","reading error or premature end of file\n");
1643 }
1644
1645 //_____________________________________________________________________________
1646 void AliRun::Streamer(TBuffer &R__b)
1647 {
1648   //
1649   // Stream an object of class AliRun.
1650   //
1651   if (R__b.IsReading()) {
1652     Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
1653     TNamed::Streamer(R__b);
1654     if (!gAlice) gAlice = this;
1655     gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,"Run");
1656     fTreeE = (TTree*)gDirectory->Get("TE");
1657     if (fTreeE) fTreeE->SetBranchAddress("Header", &header);
1658     else    Error("Streamer","cannot find Header Tree\n");
1659     R__b >> fNtrack;
1660     R__b >> fHgwmk;
1661     R__b >> fDebug;
1662     fHeader.Streamer(R__b);
1663     R__b >> fModules;
1664     R__b >> fParticles;
1665     R__b >> fField;
1666     //    R__b >> fMC;
1667     R__b >> fNdets;
1668     R__b >> fTrRmax;
1669     R__b >> fTrZmax;
1670     R__b >> fGenerator;
1671     if(R__v>1) {
1672       R__b >> fPDGDB;        //Particle factory object!
1673       fTreeE->GetEntry(0);
1674     } else {
1675       fHeader.SetEvent(0);
1676       fPDGDB     = TDatabasePDG::Instance();        //Particle factory object!
1677     }
1678   } else {
1679     R__b.WriteVersion(AliRun::IsA());
1680     TNamed::Streamer(R__b);
1681     R__b << fNtrack;
1682     R__b << fHgwmk;
1683     R__b << fDebug;
1684     fHeader.Streamer(R__b);
1685     R__b << fModules;
1686     R__b << fParticles;
1687     R__b << fField;
1688     //    R__b << fMC;
1689     R__b << fNdets;
1690     R__b << fTrRmax;
1691     R__b << fTrZmax;
1692     R__b << fGenerator;
1693     R__b << fPDGDB;        //Particle factory object!
1694   }
1695 }
1696
1697
1698 //_____________________________________________________________________________
1699 //
1700 //                 Interfaces to Fortran
1701 //
1702 //_____________________________________________________________________________
1703
1704 extern "C" void type_of_call  rxgtrak (Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1705                                        Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t *polar,
1706                                        Float_t &tof)
1707 {
1708   //
1709   //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by the
1710   //     modified version of GTREVE.
1711   //
1712   //              Track number in the ROOT stack. If MTRACK=0 no
1713   //      mtrack  more tracks are left in the stack to be
1714   //              transported.
1715   //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
1716   //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
1717   //      e       Particle energy in GeV
1718   //      vpos[3] Particle position
1719   //      tof     Particle time of flight in seconds
1720   //
1721   Int_t pdg;
1722   gAlice->GetNextTrack(mtrack, pdg, pmom, e, vpos, polar, tof);
1723   ipart = gMC->IdFromPDG(pdg);
1724   mtrack++;
1725 }
1726
1727 //_____________________________________________________________________________
1728 extern "C" void type_of_call
1729 #ifndef WIN32
1730 rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1731                Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, Int_t &ntr, const int cmlen)
1732 #else
1733 rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1734          Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, const int cmlen,
1735          Int_t &ntr)
1736 #endif
1737 {
1738   //
1739   //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by GUKINE
1740   //     and GUSTEP.
1741   //
1742   //              Status of the track. If keep=0 the track is put
1743   //      keep    on the ROOT stack but it is not fetched for
1744   //              transport.
1745   //      parent  Parent track. If parent=0 the track is a primary.
1746   //              In GUSTEP the routine is normally called to store
1747   //              secondaries generated by the current track whose
1748   //              ROOT stack number is MTRACK (common SCKINE.
1749   //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
1750   //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
1751   //      vpos[3] Particle position
1752   //      tof     Particle time of flight in seconds
1753   //
1754   //      cmech   (CHARACTER*10) Particle origin. This field is user
1755   //              defined and it is not used inside the GALICE code.
1756   //      ntr     Number assigned to the particle in the ROOT stack.
1757   //
1758   char mecha[11];
1759   Float_t polar[3]={0.,0.,0.};
1760   for(int i=0; i<10 && i<cmlen; i++) mecha[i]=cmech[i];
1761   mecha[10]=0;
1762   Int_t pdg=gMC->PDGFromId(ipart);
1763   gAlice->SetTrack(keep, parent-1, pdg, pmom, vpos, polar, tof, mecha, ntr);
1764   ntr++;
1765 }
1766
1767 //_____________________________________________________________________________
1768 extern "C" void type_of_call  rxkeep(const Int_t &n)
1769 {
1770   if( NULL==gAlice ) exit(1);
1771
1772   if( n<=0 || n>gAlice->Particles()->GetEntries() )
1773     {
1774       printf("  Bad index n=%d must be 0<n<=%d\n",
1775              n,gAlice->Particles()->GetEntries());
1776       exit(1);
1777     }
1778
1779   ((TParticle*)(gAlice->Particles()->UncheckedAt(n-1)))->SetBit(Keep_Bit);
1780 }
1781
1782 //_____________________________________________________________________________
1783 extern "C" void type_of_call  rxouth ()
1784 {
1785   //
1786   // Called by Gtreve at the end of each primary track
1787   //
1788   gAlice->FinishPrimary();
1789 }
1790