STEER/AliRun.cxx

   1 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   2 //                                                                           //
   3 //  Control class for Alice C++                                              //
   4 //  Only one single instance of this class exists.                           //
   5 //  The object is created in main program aliroot                            //
   6 //  and is pointed by the global gAlice.                                     //
   7 //                                                                           //
   8 //   -Supports the list of all Alice Detectors (fModules).                 //
   9 //   -Supports the list of particles (fParticles).                           //
  10 //   -Supports the Trees.                                                    //
  11 //   -Supports the geometry.                                                 //
  12 //   -Supports the event display.                                            //
  13 //Begin_Html
  14 /*
  15 <img src="picts/AliRunClass.gif">
  16 */
  17 //End_Html
  18 //Begin_Html
  19 /*
  20 <img src="picts/alirun.gif">
  21 */
  22 //End_Html
  23 //                                                                           //
  24 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include <TFile.h>
  27 #include <TRandom.h>
  28 #include <TBRIK.h>
  29 #include <TNode.h>
  30 #include <TCint.h>
  31 #include <TSystem.h>
  32
  33 #include "TParticle.h"
  34 #include "AliRun.h"
  35 #include "AliDisplay.h"
  36
  37 #include "AliCallf77.h"
  38
  39 #include <stdlib.h>
  40 #include <stdio.h>
  41 #include <string.h>
  42
  43 AliRun *gAlice;
  44
  45 static AliHeader *header;
  46
  47 #ifndef WIN32
  48
  49 # define rxgtrak rxgtrak_
  50 # define rxstrak rxstrak_
  51 # define rxkeep  rxkeep_
  52 # define rxouth  rxouth_
  53 #else
  54
  55 # define rxgtrak RXGTRAK
  56 # define rxstrak RXSTRAK
  57 # define rxkeep  RXKEEP
  58 # define rxouth  RXOUTH
  59 #endif
  60
  61 static TArrayF sEventEnergy;
  62 static TArrayF sSummEnergy;
  63 static TArrayF sSum2Energy;
  64
  65 ClassImp(AliRun)
  66
  67 //_____________________________________________________________________________
  68 AliRun::AliRun()
  69 {
  70   //
  71   // Default constructor for AliRun
  72   //
  73   header=&fHeader;
  74   fRun       = 0;
  75   fEvent     = 0;
  76   fCurrent   = -1;
  77   fModules = 0;
  78   fGenerator = 0;
  79   fTreeD     = 0;
  80   fTreeK     = 0;
  81   fTreeH     = 0;
  82   fTreeE     = 0;
  83   fTreeR     = 0;
  84   fParticles = 0;
  85   fGeometry  = 0;
  86   fDisplay   = 0;
  87   fField     = 0;
  88   fMC        = 0;
  89   fNdets     = 0;
  90   fImedia    = 0;
  91   fTrRmax    = 1.e10;
  92   fTrZmax    = 1.e10;
  93   fInitDone  = kFALSE;
  94   fLego      = 0;
  95   fPDGDB     = 0;        //Particle factory object!
  96 }
  97
  98 //_____________________________________________________________________________
  99 AliRun::AliRun(const char *name, const char *title)
 100   : TNamed(name,title)
 101 {
 102   //
 103   //  Constructor for the main processor.
 104   //  Creates the geometry
 105   //  Creates the list of Detectors.
 106   //  Creates the list of particles.
 107   //
 108   Int_t i;
 109
 110   gAlice     = this;
 111   fTreeD     = 0;
 112   fTreeK     = 0;
 113   fTreeH     = 0;
 114   fTreeE     = 0;
 115   fTreeR     = 0;
 116   fTrRmax    = 1.e10;
 117   fTrZmax    = 1.e10;
 118   fGenerator = 0;
 119   fInitDone  = kFALSE;
 120   fLego      = 0;
 121   fField     = 0;
 122
 123   gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,name);
 124   //
 125   // create the support list for the various Detectors
 126   fModules = new TObjArray(77);
 127   //
 128   // Create the TNode geometry for the event display
 129
 130   BuildSimpleGeometry();
 131
 132
 133   fNtrack=0;
 134   fHgwmk=0;
 135   fCurrent=-1;
 136   header=&fHeader;
 137   fRun       = 0;
 138   fEvent     = 0;
 139   //
 140   // Create the particle stack
 141   fParticles = new TClonesArray("TParticle",100);
 142
 143   fDisplay = 0;
 144   //
 145   // Create default mag field
 146   SetField();
 147   //
 148   fMC      = gMC;
 149   //
 150   // Prepare the tracking medium lists
 151   fImedia = new TArrayI(1000);
 152   for(i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
 153   //
 154   // Make particles
 155   fPDGDB     = TDatabasePDG::Instance();        //Particle factory object!
 156 }
 157
 158 //_____________________________________________________________________________
 159 AliRun::~AliRun()
 160 {
 161   //
 162   // Defaullt AliRun destructor
 163   //
 164   delete fImedia;
 165   delete fField;
 166   delete fMC;
 167   delete fGeometry;
 168   delete fDisplay;
 169   delete fGenerator;
 170   delete fLego;
 171   delete fTreeD;
 172   delete fTreeK;
 173   delete fTreeH;
 174   delete fTreeE;
 175   delete fTreeR;
 176   if (fModules) {
 177     fModules->Delete();
 178     delete fModules;
 179   }
 180   if (fParticles) {
 181     fParticles->Delete();
 182     delete fParticles;
 183   }
 184 }
 185
 186 //_____________________________________________________________________________
 187 void AliRun::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 188 {
 189   //
 190   //  Add a hit to detector id
 191   //
 192   TObjArray &dets = *fModules;
 193   if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 194 }
 195
 196 //_____________________________________________________________________________
 197 void AliRun::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 198 {
 199   //
 200   // Add digit to detector id
 201   //
 202   TObjArray &dets = *fModules;
 203   if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 204 }
 205
 206 //_____________________________________________________________________________
 207 void AliRun::Browse(TBrowser *b)
 208 {
 209   //
 210   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 211   // of the Root browser.
 212   // It displays the Root Trees and all detectors.
 213   //
 214   if (fTreeK) b->Add(fTreeK,fTreeK->GetName());
 215   if (fTreeH) b->Add(fTreeH,fTreeH->GetName());
 216   if (fTreeD) b->Add(fTreeD,fTreeD->GetName());
 217   if (fTreeE) b->Add(fTreeE,fTreeE->GetName());
 218   if (fTreeR) b->Add(fTreeR,fTreeR->GetName());
 219
 220   TIter next(fModules);
 221   AliModule *detector;
 222   while((detector = (AliModule*)next())) {
 223     b->Add(detector,detector->GetName());
 224   }
 225 }
 226
 227 //_____________________________________________________________________________
 228 void AliRun::Build()
 229 {
 230   //
 231   // Initialize Alice geometry
 232   // Dummy routine
 233   //
 234 }
 235
 236 //_____________________________________________________________________________
 237 void AliRun::BuildSimpleGeometry()
 238 {
 239   //
 240   // Create a simple TNode geometry used by Root display engine
 241   //
 242   // Initialise geometry
 243   //
 244   fGeometry = new TGeometry("AliceGeom","Galice Geometry for Hits");
 245   new TMaterial("void","Vacuum",0,0,0);  //Everything is void
 246   TBRIK *brik = new TBRIK("S_alice","alice volume","void",2000,2000,3000);
 247   brik->SetVisibility(0);
 248   new TNode("alice","alice","S_alice");
 249 }
 250
 251 //_____________________________________________________________________________
 252 void AliRun::CleanDetectors()
 253 {
 254   //
 255   // Clean Detectors at the end of event
 256   //
 257   TIter next(fModules);
 258   AliModule *detector;
 259   while((detector = (AliModule*)next())) {
 260     detector->FinishEvent();
 261   }
 262 }
 263
 264 //_____________________________________________________________________________
 265 void AliRun::CleanParents()
 266 {
 267   //
 268   // Clean Particles stack.
 269   // Set parent/daughter relations
 270   //
 271   TClonesArray &particles = *(gAlice->Particles());
 272   TParticle *part;
 273   int i;
 274   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
 275     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
 276     if(!part->TestBit(Daughters_Bit)) {
 277       part->SetFirstDaughter(-1);
 278       part->SetLastDaughter(-1);
 279     }
 280   }
 281 }
 282
 283 //_____________________________________________________________________________
 284 Int_t AliRun::DistancetoPrimitive(Int_t, Int_t)
 285 {
 286   //
 287   // Return the distance from the mouse to the AliRun object
 288   // Dummy routine
 289   //
 290   return 9999;
 291 }
 292
 293 //_____________________________________________________________________________
 294 void AliRun::DumpPart (Int_t i)
 295 {
 296   //
 297   // Dumps particle i in the stack
 298   //
 299   TClonesArray &particles = *fParticles;
 300   ((TParticle*) particles[i])->Print();
 301 }
 302
 303 //_____________________________________________________________________________
 304 void AliRun::DumpPStack ()
 305 {
 306   //
 307   // Dumps the particle stack
 308   //
 309   TClonesArray &particles = *fParticles;
 310   printf(
 311          "\n\n=======================================================================\n");
 312   for (Int_t i=0;i<fNtrack;i++)
 313     {
 314       printf("-> %d ",i); ((TParticle*) particles[i])->Print();
 315       printf("--------------------------------------------------------------\n");
 316     }
 317   printf(
 318          "\n=======================================================================\n\n");
 319 }
 320
 321 //_____________________________________________________________________________
 322 void AliRun::SetField(Int_t type, Int_t version, Float_t scale,
 323                       Float_t maxField, char* filename)
 324 {
 325   //
 326   //  Set magnetic field parameters
 327   //  type      Magnetic field transport flag 0=no field, 2=helix, 3=Runge Kutta
 328   //  version   Magnetic field map version (only 1 active now)
 329   //  scale     Scale factor for the magnetic field
 330   //  maxField  Maximum value for the magnetic field
 331
 332   //
 333   // --- Sanity check on mag field flags
 334   if(type<0 || type > 2) {
 335     Warning("SetField",
 336             "Invalid magnetic field flag: %5d; Helix tracking chosen instead\n"
 337            ,type);
 338     type=2;
 339   }
 340   if(fField) delete fField;
 341   if(version==1) {
 342     fField = new AliMagFC("Map1"," ",type,version,scale,maxField);
 343   } else if(version<=3) {
 344     fField = new AliMagFCM("Map2-3",filename,type,version,scale,maxField);
 345     fField->ReadField();
 346   } else {
 347     Warning("SetField","Invalid map %d\n",version);
 348   }
 349 }
 350
 351 //_____________________________________________________________________________
 352 void AliRun::FillTree()
 353 {
 354   //
 355   // Fills all AliRun TTrees
 356   //
 357   if (fTreeK) fTreeK->Fill();
 358   if (fTreeH) fTreeH->Fill();
 359   if (fTreeD) fTreeD->Fill();
 360   if (fTreeR) fTreeR->Fill();
 361 }
 362
 363 //_____________________________________________________________________________
 364 void AliRun::FinishPrimary()
 365 {
 366   //
 367   // Called  at the end of each primary track
 368   //
 369
 370   // This primary is finished, purify stack
 371   gAlice->PurifyKine();
 372
 373   // Write out hits if any
 374   if (gAlice->TreeH()) {
 375     gAlice->TreeH()->Fill();
 376   }
 377
 378   // Reset Hits info
 379   gAlice->ResetHits();
 380 }
 381
 382 //_____________________________________________________________________________
 383 void AliRun::FinishEvent()
 384 {
 385   //
 386   // Called at the end of the event.
 387   //
 388
 389   //Update the energy deposit tables
 390   Int_t i;
 391   for(i=0;i<sEventEnergy.GetSize();i++) {
 392     sSummEnergy[i]+=sEventEnergy[i];
 393     sSum2Energy[i]+=sEventEnergy[i]*sEventEnergy[i];
 394   }
 395   sEventEnergy.Reset();
 396
 397   // Clean detector information
 398   CleanDetectors();
 399
 400   // Write out the kinematics
 401   if (fTreeK) {
 402     CleanParents();
 403     fTreeK->Fill();
 404   }
 405
 406   // Write out the digits
 407   if (fTreeD) {
 408     fTreeD->Fill();
 409     ResetDigits();
 410   }
 411
 412   // Write out reconstructed clusters
 413   if (fTreeR) {
 414     fTreeR->Fill();
 415   }
 416
 417   // Write out the event Header information
 418   if (fTreeE) fTreeE->Fill();
 419
 420   // Reset stack info
 421   ResetStack();
 422
 423   // Write Tree headers
 424   Int_t ievent = fHeader.GetEvent();
 425   char hname[30];
 426   sprintf(hname,"TreeK%d",ievent);
 427   if (fTreeK) fTreeK->Write(hname);
 428   sprintf(hname,"TreeH%d",ievent);
 429   if (fTreeH) fTreeH->Write(hname);
 430   sprintf(hname,"TreeD%d",ievent);
 431   if (fTreeD) fTreeD->Write(hname);
 432   sprintf(hname,"TreeR%d",ievent);
 433   if (fTreeR) fTreeR->Write(hname);
 434 }
 435
 436 //_____________________________________________________________________________
 437 void AliRun::FinishRun()
 438 {
 439   //
 440   // Called at the end of the run.
 441   //
 442
 443   // Clean detector information
 444   TIter next(fModules);
 445   AliModule *detector;
 446   while((detector = (AliModule*)next())) {
 447     detector->FinishRun();
 448   }
 449
 450   //Output energy summary tables
 451   EnergySummary();
 452
 453   // file is retrieved from whatever tree
 454   TFile *File = 0;
 455   if (fTreeK) File = fTreeK->GetCurrentFile();
 456   if ((!File) && (fTreeH)) File = fTreeH->GetCurrentFile();
 457   if ((!File) && (fTreeD)) File = fTreeD->GetCurrentFile();
 458   if ((!File) && (fTreeE)) File = fTreeE->GetCurrentFile();
 459   if( NULL==File ) {
 460     Error("FinishRun","There isn't root file!");
 461     exit(1);
 462   }
 463   File->cd();
 464   fTreeE->Write();
 465
 466   // Clean tree information
 467   delete fTreeK; fTreeK = 0;
 468   delete fTreeH; fTreeH = 0;
 469   delete fTreeD; fTreeD = 0;
 470   delete fTreeR; fTreeR = 0;
 471   delete fTreeE; fTreeE = 0;
 472
 473   // Write AliRun info and all detectors parameters
 474   Write();
 475
 476   // Close output file
 477   File->Write();
 478   File->Close();
 479 }
 480
 481 //_____________________________________________________________________________
 482 void AliRun::FlagTrack(Int_t track)
 483 {
 484   //
 485   // Flags a track and all its family tree to be kept
 486   //
 487   int curr;
 488   TParticle *particle;
 489
 490   curr=track;
 491   while(1) {
 492     particle=(TParticle*)fParticles->UncheckedAt(curr);
 493
 494     // If the particle is flagged the three from here upward is saved already
 495     if(particle->TestBit(Keep_Bit)) return;
 496
 497     // Save this particle
 498     particle->SetBit(Keep_Bit);
 499
 500     // Move to father if any
 501     if((curr=particle->GetFirstMother())==-1) return;
 502   }
 503 }
 504
 505 //_____________________________________________________________________________
 506 void AliRun::EnergySummary()
 507 {
 508   //
 509   // Print summary of deposited energy
 510   //
 511
 512   Int_t ndep=0;
 513   Float_t edtot=0;
 514   Float_t ed, ed2;
 515   Int_t kn, i, left, j, id;
 516   const Float_t zero=0;
 517   Int_t ievent=fHeader.GetEvent()+1;
 518   //
 519   // Energy loss information
 520   if(ievent) {
 521     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 522     for(kn=1;kn<sEventEnergy.GetSize();kn++) {
 523       ed=sSummEnergy[kn];
 524       if(ed>0) {
 525         sEventEnergy[ndep]=kn;
 526         if(ievent>1) {
 527           ed=ed/ievent;
 528           ed2=sSum2Energy[kn];
 529           ed2=ed2/ievent;
 530           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,zero))/ed;
 531         } else
 532           ed2=99;
 533         sSummEnergy[ndep]=ed;
 534         sSum2Energy[ndep]=TMath::Min((Float_t) 99.,TMath::Max(ed2,zero));
 535         edtot+=ed;
 536         ndep++;
 537       }
 538     }
 539     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 540       left=ndep-kn*3;
 541       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 542         j=kn*3+i;
 543         id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
 544         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),sSummEnergy[j],sSum2Energy[j]);
 545       }
 546       printf("\n");
 547     }
 548     //
 549     // Relative energy loss in different detectors
 550     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 551     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 552     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 553       left=ndep-kn*5;
 554       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 555         j=kn*5+i;
 556         id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
 557         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*sSummEnergy[j]/edtot);
 558       }
 559       printf("\n");
 560     }
 561     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 562     printf("\n");
 563   }
 564   //
 565   // Reset the TArray's
 566   sEventEnergy.Set(0);
 567   sSummEnergy.Set(0);
 568   sSum2Energy.Set(0);
 569 }
 570
 571 //_____________________________________________________________________________
 572 AliModule *AliRun::GetModule(const char *name)
 573 {
 574   //
 575   // Return pointer to detector from name
 576   //
 577   return (AliModule*)fModules->FindObject(name);
 578 }
 579
 580 //_____________________________________________________________________________
 581 AliDetector *AliRun::GetDetector(const char *name)
 582 {
 583   //
 584   // Return pointer to detector from name
 585   //
 586   return (AliDetector*)fModules->FindObject(name);
 587 }
 588
 589 //_____________________________________________________________________________
 590 Int_t AliRun::GetModuleID(const char *name)
 591 {
 592   //
 593   // Return galice internal detector identifier from name
 594   //
 595   Int_t i=-1;
 596   TObject *mod=fModules->FindObject(name);
 597   if(mod) i=fModules->IndexOf(mod);
 598   return i;
 599 }
 600
 601 //_____________________________________________________________________________
 602 Int_t AliRun::GetEvent(Int_t event)
 603 {
 604   //
 605   // Connect the Trees Kinematics and Hits for event # event
 606   // Set branch addresses
 607   //
 608   fHeader.SetEvent(event);
 609
 610   // Reset existing structures
 611   ResetStack();
 612   ResetHits();
 613   ResetDigits();
 614
 615   // Delete Trees already connected
 616   if (fTreeK) delete fTreeK;
 617   if (fTreeH) delete fTreeH;
 618   if (fTreeD) delete fTreeD;
 619   if (fTreeR) delete fTreeR;
 620
 621   // Get Kine Tree from file
 622   char treeName[20];
 623   sprintf(treeName,"TreeK%d",event);
 624   fTreeK = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 625   if (fTreeK) fTreeK->SetBranchAddress("Particles", &fParticles);
 626   else    Error("GetEvent","cannot find Kine Tree for event:%d\n",event);
 627
 628   // Get Hits Tree header from file
 629   sprintf(treeName,"TreeH%d",event);
 630   fTreeH = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 631   if (!fTreeH) {
 632     Error("GetEvent","cannot find Hits Tree for event:%d\n",event);
 633   }
 634
 635   // Get Digits Tree header from file
 636   sprintf(treeName,"TreeD%d",event);
 637   fTreeD = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 638   if (!fTreeD) {
 639     printf("WARNING: cannot find Digits Tree for event:%d\n",event);
 640   }
 641
 642
 643   // Get Reconstruct Tree header from file
 644   sprintf(treeName,"TreeR%d",event);
 645   fTreeR = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 646   if (!fTreeR) {
 647     //    printf("WARNING: cannot find Reconstructed Tree for event:%d\n",event);
 648   }
 649
 650   // Set Trees branch addresses
 651   TIter next(fModules);
 652   AliModule *detector;
 653   while((detector = (AliModule*)next())) {
 654     detector->SetTreeAddress();
 655   }
 656
 657   if (fTreeK) fTreeK->GetEvent(0);
 658   fNtrack = Int_t (fParticles->GetEntries());
 659   return fNtrack;
 660 }
 661
 662 //_____________________________________________________________________________
 663 TGeometry *AliRun::GetGeometry()
 664 {
 665   //
 666   // Import Alice geometry from current file
 667   // Return pointer to geometry object
 668   //
 669   if (!fGeometry) fGeometry = (TGeometry*)gDirectory->Get("AliceGeom");
 670   //
 671   // Unlink and relink nodes in detectors
 672   // This is bad and there must be a better way...
 673   //
 674   TList *tnodes=fGeometry->GetListOfNodes();
 675   TNode *alice=(TNode*)tnodes->At(0);
 676   TList *gnodes=alice->GetListOfNodes();
 677
 678   TIter next(fModules);
 679   AliModule *detector;
 680   while((detector = (AliModule*)next())) {
 681     detector->SetTreeAddress();
 682     TList *dnodes=detector->Nodes();
 683     Int_t j;
 684     TNode *node, *node1;
 685     for ( j=0; j<dnodes->GetSize(); j++) {
 686       node = (TNode*) dnodes->At(j);
 687       node1 = (TNode*) gnodes->FindObject(node->GetName());
 688       dnodes->Remove(node);
 689       dnodes->AddAt(node1,j);
 690     }
 691   }
 692   return fGeometry;
 693 }
 694
 695 //_____________________________________________________________________________
 696 void AliRun::GetNextTrack(Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
 697                           Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t *polar,
 698                           Float_t &tof)
 699 {
 700   //
 701   // Return next track from stack of particles
 702   //
 703   const TVector3 *pol;
 704   fCurrent=-1;
 705   TParticle *track;
 706   for(Int_t i=fNtrack-1; i>=0; i--) {
 707     track=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(i);
 708     if(!track->TestBit(Done_Bit)) {
 709       //
 710       // The track has not yet been processed
 711       fCurrent=i;
 712       ipart=track->GetPdgCode();
 713       pmom[0]=track->Px();
 714       pmom[1]=track->Py();
 715       pmom[2]=track->Pz();
 716       e     =track->Energy();
 717       vpos[0]=track->Vx();
 718       vpos[1]=track->Vy();
 719       vpos[2]=track->Vz();
 720       pol = track->GetPolarisation();
 721       polar[0]=pol->X();
 722       polar[1]=pol->Y();
 723       polar[2]=pol->Z();
 724       tof=track->T();
 725       track->SetBit(Done_Bit);
 726       break;
 727     }
 728   }
 729   mtrack=fCurrent;
 730   //
 731   // stop and start timer when we start a primary track
 732   Int_t nprimaries = fHeader.GetNprimary();
 733   if (fCurrent >= nprimaries) return;
 734   if (fCurrent < nprimaries-1) {
 735     fTimer.Stop();
 736     track=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(fCurrent+1);
 737     //    track->SetProcessTime(fTimer.CpuTime());
 738   }
 739   fTimer.Start();
 740 }
 741
 742 //_____________________________________________________________________________
 743 Int_t AliRun::GetPrimary(Int_t track)
 744 {
 745   //
 746   // return number of primary that has generated track
 747   //
 748   int current, parent;
 749   TParticle *part;
 750   //
 751   parent=track;
 752   while (1) {
 753     current=parent;
 754     part = (TParticle *)fParticles->UncheckedAt(current);
 755     parent=part->GetFirstMother();
 756     if(parent<0) return current;
 757   }
 758 }
 759
 760 //_____________________________________________________________________________
 761 void AliRun::Init(const char *setup)
 762 {
 763   //
 764   // Initialize the Alice setup
 765   //
 766
 767   gROOT->LoadMacro(setup);
 768   gInterpreter->ProcessLine("Config();");
 769
 770   gMC->DefineParticles();  //Create standard MC particles
 771
 772   TObject *objfirst, *objlast;
 773
 774   fNdets = fModules->GetLast()+1;
 775
 776   //
 777   //=================Create Materials, geometry, histograms, etc
 778    TIter next(fModules);
 779    AliModule *detector;
 780    while((detector = (AliModule*)next())) {
 781       detector->SetTreeAddress();
 782       objlast = gDirectory->GetList()->Last();
 783
 784       // Initialise detector materials, geometry, histograms,etc
 785       detector->CreateMaterials();
 786       detector->CreateGeometry();
 787       detector->BuildGeometry();
 788       detector->Init();
 789
 790       // Add Detector histograms in Detector list of histograms
 791       if (objlast) objfirst = gDirectory->GetList()->After(objlast);
 792       else         objfirst = gDirectory->GetList()->First();
 793       while (objfirst) {
 794         detector->Histograms()->Add(objfirst);
 795         objfirst = gDirectory->GetList()->After(objfirst);
 796       }
 797    }
 798    SetTransPar(); //Read the cuts for all materials
 799
 800    MediaTable(); //Build the special IMEDIA table
 801
 802    //Close the geometry structure
 803    gMC->Ggclos();
 804
 805    //Initialise geometry deposition table
 806    sEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 807    sSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 808    sSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 809
 810    //Create the color table
 811    gMC->SetColors();
 812
 813    //Compute cross-sections
 814    gMC->Gphysi();
 815
 816    //Write Geometry object to current file.
 817    fGeometry->Write();
 818
 819    fInitDone = kTRUE;
 820 }
 821
 822 //_____________________________________________________________________________
 823 void AliRun::MediaTable()
 824 {
 825   //
 826   // Built media table to get from the media number to
 827   // the detector id
 828   //
 829   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 830   //  Int_t ibeg;
 831   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 832   AliModule *det;
 833   //
 834   // For all detectors
 835   for (kz=0;kz<fNdets;kz++) {
 836     // If detector is defined
 837     if((det=(AliModule*) dets[kz])) {
 838         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 839         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 840         // Find max and min material number
 841         if((idt=idtmed[nz])) {
 842           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 843           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 844         }
 845       }
 846       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 847         det->LoMedium() = 0;
 848         det->HiMedium() = 0;
 849       } else {
 850         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 851           Error("MediaTable","Increase fImedia from %d to %d",
 852                 fImedia->GetSize(),det->HiMedium());
 853           return;
 854         }
 855         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 856         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 857           (*fImedia)[lz]=kz;
 858         }
 859       }
 860     }
 861   }
 862   //
 863   // Print summary table
 864   printf(" Traking media ranges:\n");
 865   for(i=0;i<(fNdets-1)/6+1;i++) {
 866     for(k=0;k< (6<fNdets-i*6?6:fNdets-i*6);k++) {
 867       ind=i*6+k;
 868       det=(AliModule*)dets[ind];
 869       if(det)
 870         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 871                det->HiMedium());
 872       else
 873         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 874     }
 875     printf("\n");
 876   }
 877 }
 878
 879 //____________________________________________________________________________
 880 void AliRun::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 881 {
 882   //
 883   // Load the event generator
 884   //
 885   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 886 }
 887
 888 //____________________________________________________________________________
 889 void AliRun::SetTransPar(char* filename)
 890 {
 891   //
 892   // Read filename to set the transport parameters
 893   //
 894
 895
 896   const Int_t ncuts=10;
 897   const Int_t nflags=11;
 898   const Int_t npars=ncuts+nflags;
 899   const char pars[npars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 900                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 901                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 902                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 903   char line[256];
 904   char detName[7];
 905   char* filtmp;
 906   Float_t cut[ncuts];
 907   Int_t flag[nflags];
 908   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 909   FILE *lun;
 910   //
 911   // See whether the file is there
 912   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filename);
 913   lun=fopen(filtmp,"r");
 914   delete [] filtmp;
 915   if(!lun) {
 916     Warning("SetTransPar","File %s does not exist!\n",filename);
 917     return;
 918   }
 919   //
 920   printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 921   printf(" *%59s\n","*");
 922   printf(" *       Please check carefully what you are doing!%10s\n","*");
 923   printf(" *%59s\n","*");
 924   //
 925   while(1) {
 926     // Initialise cuts and flags
 927     for(i=0;i<ncuts;i++) cut[i]=-99;
 928     for(i=0;i<nflags;i++) flag[i]=-99;
 929     itmed=0;
 930     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 931     // Read up to the end of line excluded
 932     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 933     if(iret<0) {
 934       //End of file
 935       fclose(lun);
 936       printf(" *%59s\n","*");
 937       printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 938       return;
 939     }
 940     // Read the end of line
 941     fscanf(lun,"%*c");
 942     if(!iret) continue;
 943     if(line[0]=='*') continue;
 944     // Read the numbers
 945     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 946                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 947                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 948                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 949     if(!iret) continue;
 950     if(iret<0) {
 951       //reading error
 952       Warning("SetTransPar","Error reading file %s\n",filename);
 953       continue;
 954     }
 955     // Check that the module exist
 956     AliModule *mod = GetModule(detName);
 957     if(mod) {
 958       // Get the array of media numbers
 959       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 960       // Check that the tracking medium code is valid
 961       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 962         ktmed=idtmed[itmed];
 963         if(!ktmed) {
 964           Warning("SetTransPar","Invalid tracking medium code %d for %s\n",itmed,mod->GetName());
 965           continue;
 966         }
 967         // Set energy thresholds
 968         for(kz=0;kz<ncuts;kz++) {
 969           if(cut[kz]>=0) {
 970             printf(" *  %-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s\n",
 971                    pars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName());
 972             gMC->Gstpar(ktmed,pars[kz],cut[kz]);
 973           }
 974         }
 975         // Set transport mechanisms
 976         for(kz=0;kz<nflags;kz++) {
 977           if(flag[kz]>=0) {
 978             printf(" *  %-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s\n",
 979                    pars[ncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName());
 980             gMC->Gstpar(ktmed,pars[ncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 981           }
 982         }
 983       } else {
 984         Warning("SetTransPar","Invalid medium code %d *\n",itmed);
 985         continue;
 986       }
 987     } else {
 988       Warning("SetTransPar","Module %s not present\n",detName);
 989       continue;
 990     }
 991   }
 992 }
 993
 994 //_____________________________________________________________________________
 995 void AliRun::MakeTree(Option_t *option)
 996 {
 997   //
 998   //  Create the ROOT trees
 999   //  Loop on all detectors to create the Root branch (if any)
1000   //
1001
1002   //
1003   // Analyse options
1004   char *K = strstr(option,"K");
1005   char *H = strstr(option,"H");
1006   char *E = strstr(option,"E");
1007   char *D = strstr(option,"D");
1008   char *R = strstr(option,"R");
1009   //
1010   if (K && !fTreeK) fTreeK = new TTree("TK","Kinematics");
1011   if (H && !fTreeH) fTreeH = new TTree("TH","Hits");
1012   if (D && !fTreeD) fTreeD = new TTree("TD","Digits");
1013   if (E && !fTreeE) fTreeE = new TTree("TE","Header");
1014   if (R && !fTreeR) fTreeR = new TTree("TR","Reconstruction");
1015   if (fTreeH) fTreeH->SetAutoSave(1000000000); //no autosave
1016   //
1017   // Create a branch for hits/digits for each detector
1018   // Each branch is a TClonesArray. Each data member of the Hits classes
1019   // will be in turn a subbranch of the detector master branch
1020   TIter next(fModules);
1021   AliModule *detector;
1022   while((detector = (AliModule*)next())) {
1023      if (H || D || R) detector->MakeBranch(option);
1024   }
1025   //  Create a branch for particles
1026   if (fTreeK && K) fTreeK->Branch("Particles",&fParticles,4000);
1027
1028   //  Create a branch for Header
1029   if (fTreeE && E) fTreeE->Branch("Header","AliHeader",&header,4000);
1030 }
1031
1032 //_____________________________________________________________________________
1033 Int_t AliRun::PurifyKine(Int_t lastSavedTrack, Int_t nofTracks)
1034 {
1035   //
1036   // PurifyKine with external parameters
1037   //
1038   fHgwmk = lastSavedTrack;
1039   fNtrack = nofTracks;
1040   PurifyKine();
1041   return fHgwmk;
1042 }
1043
1044 //_____________________________________________________________________________
1045 void AliRun::PurifyKine()
1046 {
1047   //
1048   // Compress kinematic tree keeping only flagged particles
1049   // and renaming the particle id's in all the hits
1050   //
1051   TClonesArray &particles = *fParticles;
1052   int nkeep=fHgwmk+1, parent, i;
1053   TParticle *part, *partnew, *father;
1054   AliHit *OneHit;
1055   int *map = new int[particles.GetEntries()];
1056
1057   // Save in Header total number of tracks before compression
1058   fHeader.SetNtrack(fHeader.GetNtrack()+fNtrack-fHgwmk);
1059
1060   // Preset map, to be removed later
1061   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
1062     if(i<=fHgwmk) map[i]=i ; else map[i] = -99 ;}
1063   // Second pass, build map between old and new numbering
1064   for(i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
1065     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
1066     if(part->TestBit(Keep_Bit)) {
1067
1068       // This particle has to be kept
1069       map[i]=nkeep;
1070       if(i!=nkeep) {
1071
1072         // Old and new are different, have to copy
1073         partnew = (TParticle *)particles.UncheckedAt(nkeep);
1074         *partnew = *part;
1075       } else partnew = part;
1076
1077       // as the parent is always *before*, it must be already
1078       // in place. This is what we are checking anyway!
1079       if((parent=partnew->GetFirstMother())>fHgwmk) {
1080         if(map[parent]==-99) printf("map[%d] = -99!\n",parent);
1081         partnew->SetFirstMother(map[parent]);
1082       }
1083       nkeep++;
1084     }
1085   }
1086   fNtrack=nkeep;
1087
1088   // Fix daughters information
1089   for (i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
1090     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
1091     parent = part->GetFirstMother();
1092     father = (TParticle *)particles.UncheckedAt(parent);
1093     if(father->TestBit(Daughters_Bit)) {
1094
1095       if(i<father->GetFirstDaughter()) father->SetFirstDaughter(i);
1096       if(i>father->GetLastDaughter())  father->SetLastDaughter(i);
1097     } else {
1098       // Iitialise daughters info for first pass
1099       father->SetFirstDaughter(i);
1100       father->SetLastDaughter(i);
1101       father->SetBit(Daughters_Bit);
1102     }
1103   }
1104
1105   // Now loop on all detectors and reset the hits
1106   TIter next(fModules);
1107   AliModule *detector;
1108   while((detector = (AliModule*)next())) {
1109     if (!detector->Hits()) continue;
1110     TClonesArray &vHits=*(detector->Hits());
1111     if(vHits.GetEntries() != detector->GetNhits())
1112       printf("vHits.GetEntries()!=detector->GetNhits(): %d != %d\n",
1113              vHits.GetEntries(),detector->GetNhits());
1114     for (i=0; i<detector->GetNhits(); i++) {
1115       OneHit = (AliHit *)vHits.UncheckedAt(i);
1116       OneHit->SetTrack(map[OneHit->GetTrack()]);
1117     }
1118   }
1119
1120   fHgwmk=nkeep-1;
1121   particles.SetLast(fHgwmk);
1122   delete [] map;
1123 }
1124
1125 //_____________________________________________________________________________
1126 void AliRun::Reset(Int_t run, Int_t idevent)
1127 {
1128   //
1129   //  Reset all Detectors & kinematics & trees
1130   //
1131   ResetStack();
1132   ResetHits();
1133   ResetDigits();
1134
1135   // Initialise event header
1136   fHeader.Reset(run,idevent);
1137
1138   if(fTreeK) fTreeK->Reset();
1139   if(fTreeH) fTreeH->Reset();
1140   if(fTreeD) fTreeD->Reset();
1141   if(fTreeR) fTreeR->Reset();
1142 }
1143
1144 //_____________________________________________________________________________
1145 void AliRun::ResetDigits()
1146 {
1147   //
1148   //  Reset all Detectors digits
1149   //
1150   TIter next(fModules);
1151   AliModule *detector;
1152   while((detector = (AliModule*)next())) {
1153      detector->ResetDigits();
1154   }
1155 }
1156
1157 //_____________________________________________________________________________
1158 void AliRun::ResetHits()
1159 {
1160   //
1161   //  Reset all Detectors hits
1162   //
1163   TIter next(fModules);
1164   AliModule *detector;
1165   while((detector = (AliModule*)next())) {
1166      detector->ResetHits();
1167   }
1168 }
1169
1170 //_____________________________________________________________________________
1171 void AliRun::ResetPoints()
1172 {
1173   //
1174   // Reset all Detectors points
1175   //
1176   TIter next(fModules);
1177   AliModule *detector;
1178   while((detector = (AliModule*)next())) {
1179      detector->ResetPoints();
1180   }
1181 }
1182
1183 //_____________________________________________________________________________
1184 void AliRun::Run(Int_t nevent, const char *setup)
1185 {
1186   //
1187   // Main function to be called to process a galice run
1188   // example
1189   //    Root > gAlice.Run();
1190   // a positive number of events will cause the finish routine
1191   // to be called
1192   //
1193
1194   Int_t i, todo;
1195   // check if initialisation has been done
1196   if (!fInitDone) Init(setup);
1197
1198   // Create the Root Tree with one branch per detector
1199   if(!fEvent) {
1200     gAlice->MakeTree("KHDER");
1201   }
1202
1203   todo = TMath::Abs(nevent);
1204   for (i=0; i<todo; i++) {
1205   // Process one run (one run = one event)
1206      gAlice->Reset(fRun, fEvent);
1207      gMC->Gtrigi();
1208      gMC->Gtrigc();
1209      gMC->Gtrig();
1210      gAlice->FinishEvent();
1211      fEvent++;
1212   }
1213
1214   // End of this run, close files
1215   if(nevent>0) gAlice->FinishRun();
1216 }
1217
1218 //_____________________________________________________________________________
1219 void AliRun::RunLego(const char *setup,Int_t ntheta,Float_t themin,
1220                      Float_t themax,Int_t nphi,Float_t phimin,Float_t phimax,
1221                      Float_t rmin,Float_t rmax,Float_t zmax)
1222 {
1223   //
1224   // Generates lego plots of:
1225   //    - radiation length map phi vs theta
1226   //    - radiation length map phi vs eta
1227   //    - interaction length map
1228   //    - g/cm2 length map
1229   //
1230   //  ntheta    bins in theta, eta
1231   //  themin    minimum angle in theta (degrees)
1232   //  themax    maximum angle in theta (degrees)
1233   //  nphi      bins in phi
1234   //  phimin    minimum angle in phi (degrees)
1235   //  phimax    maximum angle in phi (degrees)
1236   //  rmin      minimum radius
1237   //  rmax      maximum radius
1238   //
1239   //
1240   //  The number of events generated = ntheta*nphi
1241   //  run input parameters in macro setup (default="Config.C")
1242   //
1243   //  Use macro "lego.C" to visualize the 3 lego plots in spherical coordinates
1244   //Begin_Html
1245   /*
1246     <img src="picts/AliRunLego1.gif">
1247   */
1248   //End_Html
1249   //Begin_Html
1250   /*
1251     <img src="picts/AliRunLego2.gif">
1252   */
1253   //End_Html
1254   //Begin_Html
1255   /*
1256     <img src="picts/AliRunLego3.gif">
1257   */
1258   //End_Html
1259   //
1260
1261   // check if initialisation has been done
1262   if (!fInitDone) Init(setup);
1263
1264   fLego = new AliLego("lego","lego");
1265   fLego->Init(ntheta,themin,themax,nphi,phimin,phimax,rmin,rmax,zmax);
1266   fLego->Run();
1267
1268   // Create only the Root event Tree
1269   gAlice->MakeTree("E");
1270
1271   // End of this run, close files
1272   gAlice->FinishRun();
1273 }
1274
1275 //_____________________________________________________________________________
1276 void AliRun::SetCurrentTrack(Int_t track)
1277 {
1278   //
1279   // Set current track number
1280   //
1281   fCurrent = track;
1282 }
1283
1284 //_____________________________________________________________________________
1285 void AliRun::SetTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
1286                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
1287                       const char *mecha, Int_t &ntr, Float_t weight)
1288 {
1289   //
1290   // Load a track on the stack
1291   //
1292   // done     0 if the track has to be transported
1293   //          1 if not
1294   // parent   identifier of the parent track. -1 for a primary
1295   // pdg    particle code
1296   // pmom     momentum GeV/c
1297   // vpos     position
1298   // polar    polarisation
1299   // tof      time of flight in seconds
1300   // mecha    production mechanism
1301   // ntr      on output the number of the track stored
1302   //
1303   TClonesArray &particles = *fParticles;
1304   TParticle *particle;
1305   Float_t mass;
1306   const Int_t firstdaughter=-1;
1307   const Int_t lastdaughter=-1;
1308   const Int_t KS=0;
1309   //  const Float_t tlife=0;
1310
1311   //
1312   // Here we get the static mass
1313   // For MC is ok, but a more sophisticated method could be necessary
1314   // if the calculated mass is required
1315   // also, this method is potentially dangerous if the mass
1316   // used in the MC is not the same of the PDG database
1317   //
1318   mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle(pdg)->Mass();
1319   Float_t e=TMath::Sqrt(mass*mass+pmom[0]*pmom[0]+
1320                         pmom[1]*pmom[1]+pmom[2]*pmom[2]);
1321
1322   //printf("Loading particle %s mass %f ene %f No %d ip %d pos %f %f %f mom %f %f %f KS %d m %s\n",
1323   //pname,mass,e,fNtrack,pdg,vpos[0],vpos[1],vpos[2],pmom[0],pmom[1],pmom[2],KS,mecha);
1324
1325   particle=new(particles[fNtrack]) TParticle(pdg,KS,parent,-1,firstdaughter,
1326                                              lastdaughter,pmom[0],pmom[1],pmom[2],
1327                                              e,vpos[0],vpos[1],vpos[2],tof);
1328   //                                         polar[0],polar[1],polar[2],tof,
1329   //                                         mecha,weight);
1330   ((TParticle*)particles[fNtrack])->SetPolarisation(TVector3(polar[0],polar[1],polar[2]));
1331   ((TParticle*)particles[fNtrack])->SetWeight(weight);
1332   if(!done) particle->SetBit(Done_Bit);
1333
1334   if(parent>=0) {
1335     particle=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(parent);
1336     particle->SetLastDaughter(fNtrack);
1337     if(particle->GetFirstDaughter()<0) particle->SetFirstDaughter(fNtrack);
1338   } else {
1339     //
1340     // This is a primary track. Set high water mark for this event
1341     fHgwmk=fNtrack;
1342     //
1343     // Set also number if primary tracks
1344     fHeader.SetNprimary(fHgwmk+1);
1345     fHeader.SetNtrack(fHgwmk+1);
1346   }
1347   ntr = fNtrack++;
1348 }
1349
1350 //_____________________________________________________________________________
1351 void AliRun::KeepTrack(const Int_t track)
1352 {
1353   //
1354   // flags a track to be kept
1355   //
1356   TClonesArray &particles = *fParticles;
1357   ((TParticle*)particles[track])->SetBit(Keep_Bit);
1358 }
1359
1360 //_____________________________________________________________________________
1361 void AliRun::StepManager(Int_t id) const
1362 {
1363   //
1364   // Called at every step during transport
1365   //
1366
1367   Int_t copy;
1368   //
1369   // --- If lego option, do it and leave
1370   if (fLego) {
1371     fLego->StepManager();
1372     return;
1373   }
1374   //Update energy deposition tables
1375   sEventEnergy[gMC->CurrentVol(0,copy)]+=gMC->Edep();
1376
1377   //Call the appropriate stepping routine;
1378   AliModule *det = (AliModule*)fModules->At(id);
1379   if(det) det->StepManager();
1380 }
1381
1382 //_____________________________________________________________________________
1383 void AliRun::ReadEuclid(const char* filnam, const AliModule *det, const char* topvol)
1384 {
1385   //
1386   //       read in the geometry of the detector in euclid file format
1387   //
1388   //        id_det : the detector identification (2=its,...)
1389   //        topvol : return parameter describing the name of the top
1390   //        volume of geometry.
1391   //
1392   //            author : m. maire
1393   //
1394   //     28.07.98
1395   //     several changes have been made by miroslav helbich
1396   //     subroutine is rewrited to follow the new established way of memory
1397   //     booking for tracking medias and rotation matrices.
1398   //     all used tracking media have to be defined first, for this you can use
1399   //     subroutine  greutmed.
1400   //     top volume is searched as only volume not positioned into another
1401   //
1402
1403   Int_t i, nvol, iret, itmed, irot, numed, npar, ndiv, iaxe;
1404   Int_t ndvmx, nr, flag;
1405   char key[5], card[77], natmed[21];
1406   char name[5], mother[5], shape[5], konly[5], volst[7000][5];
1407   char *filtmp;
1408   Float_t par[50];
1409   Float_t teta1, phi1, teta2, phi2, teta3, phi3, orig, step;
1410   Float_t xo, yo, zo;
1411   Int_t idrot[5000],istop[7000];
1412   FILE *lun;
1413   //
1414   // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
1415   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
1416   lun=fopen(filtmp,"r");
1417   delete [] filtmp;
1418   if(!lun) {
1419     printf(" *** GREUCL *** Could not open file %s\n",filnam);
1420     return;
1421   }
1422   //* --- definition of rotation matrix 0 ---
1423   TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
1424   idrot[0]=0;
1425   nvol=0;
1426  L10:
1427   for(i=0;i<77;i++) card[i]=0;
1428   iret=fscanf(lun,"%77[^\n]",card);
1429   if(iret<=0) goto L20;
1430   fscanf(lun,"%*c");
1431   //*
1432   strncpy(key,card,4);
1433   key[4]='\0';
1434   if (!strcmp(key,"TMED")) {
1435     sscanf(&card[5],"%d '%[^']'",&itmed,natmed);
1436     //Pad the string with blanks
1437     i=-1;
1438     while(natmed[++i]);
1439     while(i<20) natmed[i++]=' ';
1440     natmed[i]='\0';
1441     //
1442     gMC->Gckmat(idtmed[itmed],natmed);
1443     //*
1444   } else if (!strcmp(key,"ROTM")) {
1445     sscanf(&card[4],"%d %f %f %f %f %f %f",&irot,&teta1,&phi1,&teta2,&phi2,&teta3,&phi3);
1446     det->AliMatrix(idrot[irot],teta1,phi1,teta2,phi2,teta3,phi3);
1447     //*
1448   } else if (!strcmp(key,"VOLU")) {
1449     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, shape, &numed, &npar);
1450     if (npar>0) {
1451       for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
1452       fscanf(lun,"%*c");
1453     }
1454     gMC->Gsvolu( name, shape, idtmed[numed], par, npar);
1455     //*     save the defined volumes
1456     strcpy(volst[++nvol],name);
1457     istop[nvol]=1;
1458     //*
1459   } else if (!strcmp(key,"DIVN")) {
1460     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, mother, &ndiv, &iaxe);
1461     gMC->Gsdvn  ( name, mother, ndiv, iaxe );
1462     //*
1463   } else if (!strcmp(key,"DVN2")) {
1464     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d %f %d",name, mother, &ndiv, &iaxe, &orig, &numed);
1465     gMC->Gsdvn2( name, mother, ndiv, iaxe, orig,idtmed[numed]);
1466     //*
1467   } else if (!strcmp(key,"DIVT")) {
1468     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &numed, &ndvmx);
1469     gMC->Gsdvt ( name, mother, step, iaxe, idtmed[numed], ndvmx);
1470     //*
1471   } else if (!strcmp(key,"DVT2")) {
1472     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %f %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &orig, &numed, &ndvmx);
1473     gMC->Gsdvt2 ( name, mother, step, iaxe, orig, idtmed[numed], ndvmx );
1474     //*
1475   } else if (!strcmp(key,"POSI")) {
1476     sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']'", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly);
1477     //*** volume name cannot be the top volume
1478     for(i=1;i<=nvol;i++) {
1479       if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
1480     }
1481     //*
1482     gMC->Gspos  ( name, nr, mother, xo, yo, zo, idrot[irot], konly );
1483     //*
1484   } else if (!strcmp(key,"POSP")) {
1485     sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']' %d", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly, &npar);
1486     if (npar > 0) {
1487       for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
1488       fscanf(lun,"%*c");
1489     }
1490     //*** volume name cannot be the top volume
1491     for(i=1;i<=nvol;i++) {
1492       if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
1493     }
1494     //*
1495     gMC->Gsposp ( name, nr, mother, xo,yo,zo, idrot[irot], konly, par, npar);
1496   }
1497   //*
1498   if (strcmp(key,"END")) goto L10;
1499   //* find top volume in the geometry
1500   flag=0;
1501   for(i=1;i<=nvol;i++) {
1502     if (istop[i] && flag) {
1503       printf(" *** GREUCL *** warning: %s is another possible top volume\n",volst[i]);
1504     }
1505     if (istop[i] && !flag) {
1506       topvol=volst[i];
1507       printf(" *** GREUCL *** volume %s taken as a top volume\n",topvol);
1508       flag=1;
1509     }
1510   }
1511   if (!flag) {
1512     printf("*** GREUCL *** warning: top volume not found\n");
1513   }
1514   fclose (lun);
1515   //*
1516   //*     commented out only for the not cernlib version
1517   printf(" *** GREUCL *** file: %s is now read in\n",filnam);
1518   //
1519   return;
1520   //*
1521   L20:
1522   printf(" *** GREUCL *** reading error or premature end of file\n");
1523 }
1524
1525 //_____________________________________________________________________________
1526 void AliRun::ReadEuclidMedia(const char* filnam, const AliModule *det)
1527 {
1528   //
1529   //       read in the materials and tracking media for the detector
1530   //                   in euclid file format
1531   //
1532   //       filnam: name of the input file
1533   //       id_det: id_det is the detector identification (2=its,...)
1534   //
1535   //            author : miroslav helbich
1536   //
1537   Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max();
1538   Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ();
1539   Int_t end, i, iret, itmed;
1540   char key[5], card[130], natmed[21], namate[21];
1541   Float_t ubuf[50];
1542   char* filtmp;
1543   FILE *lun;
1544   Int_t imate;
1545   Int_t nwbuf, isvol, ifield, nmat;
1546   Float_t a, z, dens, radl, absl, fieldm, tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin;
1547   //
1548   end=strlen(filnam);
1549   for(i=0;i<end;i++) if(filnam[i]=='.') {
1550     end=i;
1551     break;
1552   }
1553   //
1554   // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
1555   printf("The file name is %s\n",filnam); //Debug
1556   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
1557   lun=fopen(filtmp,"r");
1558   delete [] filtmp;
1559   if(!lun) {
1560     Warning("ReadEuclidMedia","Could not open file %s\n",filnam);
1561     return;
1562   }
1563   //
1564   // Retrieve Mag Field parameters
1565   Int_t ISXFLD=gAlice->Field()->Integ();
1566   Float_t SXMGMX=gAlice->Field()->Max();
1567   //  TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
1568   //
1569  L10:
1570   for(i=0;i<130;i++) card[i]=0;
1571   iret=fscanf(lun,"%4s %[^\n]",key,card);
1572   if(iret<=0) goto L20;
1573   fscanf(lun,"%*c");
1574   //*
1575   //* read material
1576   if (!strcmp(key,"MATE")) {
1577     sscanf(card,"%d '%[^']' %f %f %f %f %f %d",&imate,namate,&a,&z,&dens,&radl,&absl,&nwbuf);
1578     if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
1579     //Pad the string with blanks
1580     i=-1;
1581     while(namate[++i]);
1582     while(i<20) namate[i++]=' ';
1583     namate[i]='\0';
1584     //
1585     det->AliMaterial(imate,namate,a,z,dens,radl,absl,ubuf,nwbuf);
1586     //* read tracking medium
1587   } else if (!strcmp(key,"TMED")) {
1588     sscanf(card,"%d '%[^']' %d %d %d %f %f %f %f %f %f %d",
1589            &itmed,natmed,&nmat,&isvol,&ifield,&fieldm,&tmaxfd,
1590            &stemax,&deemax,&epsil,&stmin,&nwbuf);
1591     if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
1592     if (ifield<0) ifield=isxfld;
1593     if (fieldm<0) fieldm=sxmgmx;
1594     //Pad the string with blanks
1595     i=-1;
1596     while(natmed[++i]);
1597     while(i<20) natmed[i++]=' ';
1598     natmed[i]='\0';
1599     //
1600     det->AliMedium(itmed,natmed,nmat,isvol,ISXFLD,SXMGMX,tmaxfd,
1601                    stemax,deemax,epsil,stmin,ubuf,nwbuf);
1602     //    (*fImedia)[idtmed[itmed]-1]=id_det;
1603     //*
1604   }
1605   //*
1606   if (strcmp(key,"END")) goto L10;
1607   fclose (lun);
1608   //*
1609   //*     commented out only for the not cernlib version
1610   Warning("ReadEuclidMedia","file: %s is now read in\n",filnam);
1611   //*
1612   return;
1613   //*
1614  L20:
1615   Warning("ReadEuclidMedia","reading error or premature end of file\n");
1616 }
1617
1618 //_____________________________________________________________________________
1619 void AliRun::Streamer(TBuffer &R__b)
1620 {
1621   //
1622   // Stream an object of class AliRun.
1623   //
1624   if (R__b.IsReading()) {
1625     Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
1626     TNamed::Streamer(R__b);
1627     if (!gAlice) gAlice = this;
1628     gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,"Run");
1629     R__b >> fNtrack;
1630     R__b >> fHgwmk;
1631     R__b >> fDebug;
1632     fHeader.Streamer(R__b);
1633     R__b >> fModules;
1634     R__b >> fParticles;
1635     R__b >> fField;
1636     //    R__b >> fMC;
1637     R__b >> fNdets;
1638     R__b >> fTrRmax;
1639     R__b >> fTrZmax;
1640     R__b >> fGenerator;
1641     R__b >> fPDGDB;        //Particle factory object!
1642   } else {
1643     R__b.WriteVersion(AliRun::IsA());
1644     TNamed::Streamer(R__b);
1645     R__b << fNtrack;
1646     R__b << fHgwmk;
1647     R__b << fDebug;
1648     fHeader.Streamer(R__b);
1649     R__b << fModules;
1650     R__b << fParticles;
1651     R__b << fField;
1652     //    R__b << fMC;
1653     R__b << fNdets;
1654     R__b << fTrRmax;
1655     R__b << fTrZmax;
1656     R__b << fGenerator;
1657     R__b << fPDGDB;        //Particle factory object!
1658   }
1659 }
1660
1661
1662 //_____________________________________________________________________________
1663 //
1664 //                 Interfaces to Fortran
1665 //
1666 //_____________________________________________________________________________
1667
1668 extern "C" void type_of_call  rxgtrak (Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1669                                        Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t &tof)
1670 {
1671   //
1672   //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by the
1673   //     modified version of GTREVE.
1674   //
1675   //              Track number in the ROOT stack. If MTRACK=0 no
1676   //      mtrack  more tracks are left in the stack to be
1677   //              transported.
1678   //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
1679   //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
1680   //      e       Particle energy in GeV
1681   //      vpos[3] Particle position
1682   //      tof     Particle time of flight in seconds
1683   //
1684   Float_t polar[3];
1685   Int_t pdg;
1686   gAlice->GetNextTrack(mtrack, pdg, pmom, e, vpos, polar, tof);
1687   ipart = gMC->IdFromPDG(pdg);
1688   mtrack++;
1689 }
1690
1691 //_____________________________________________________________________________
1692 extern "C" void type_of_call
1693 #ifndef WIN32
1694 rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1695                Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, Int_t &ntr, const int cmlen)
1696 #else
1697 rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1698          Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, const int cmlen,
1699          Int_t &ntr)
1700 #endif
1701 {
1702   //
1703   //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by GUKINE
1704   //     and GUSTEP.
1705   //
1706   //              Status of the track. If keep=0 the track is put
1707   //      keep    on the ROOT stack but it is not fetched for
1708   //              transport.
1709   //      parent  Parent track. If parent=0 the track is a primary.
1710   //              In GUSTEP the routine is normally called to store
1711   //              secondaries generated by the current track whose
1712   //              ROOT stack number is MTRACK (common SCKINE.
1713   //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
1714   //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
1715   //      vpos[3] Particle position
1716   //      tof     Particle time of flight in seconds
1717   //
1718   //      cmech   (CHARACTER*10) Particle origin. This field is user
1719   //              defined and it is not used inside the GALICE code.
1720   //      ntr     Number assigned to the particle in the ROOT stack.
1721   //
1722   char mecha[11];
1723   Float_t polar[3]={0.,0.,0.};
1724   for(int i=0; i<10 && i<cmlen; i++) mecha[i]=cmech[i];
1725   mecha[10]=0;
1726   Int_t pdg=gMC->PDGFromId(ipart);
1727   gAlice->SetTrack(keep, parent-1, pdg, pmom, vpos, polar, tof, mecha, ntr);
1728   ntr++;
1729 }
1730
1731 //_____________________________________________________________________________
1732 extern "C" void type_of_call  rxkeep(const Int_t &n)
1733 {
1734   if( NULL==gAlice ) exit(1);
1735
1736   if( n<=0 || n>gAlice->Particles()->GetEntries() )
1737     {
1738       printf("  Bad index n=%d must be 0<n<=%d\n",
1739              n,gAlice->Particles()->GetEntries());
1740       exit(1);
1741     }
1742
1743   ((TParticle*)(gAlice->Particles()->UncheckedAt(n-1)))->SetBit(Keep_Bit);
1744 }
1745
1746 //_____________________________________________________________________________
1747 extern "C" void type_of_call  rxouth ()
1748 {
1749   //
1750   // Called by Gtreve at the end of each primary track
1751   //
1752   gAlice->FinishPrimary();
1753 }
1754