New format of the GRP object (Chiara)
[u/mrichter/AliRoot.git] / STEER / AliSimulation.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 //                                                                           //
20 // class for running generation, simulation and digitization                 //
21 //                                                                           //
22 // Hits, sdigits and digits are created for all detectors by typing:         //
23 //                                                                           //
24 //   AliSimulation sim;                                                      //
25 //   sim.Run();                                                              //
26 //                                                                           //
27 // The Run method returns kTRUE in case of successful execution.             //
28 // The number of events can be given as argument to the Run method or it     //
29 // can be set by                                                             //
30 //                                                                           //
31 //   sim.SetNumberOfEvents(n);                                               //
32 //                                                                           //
33 // The name of the configuration file can be passed as argument to the       //
34 // AliSimulation constructor or can be specified by                          //
35 //                                                                           //
36 //   sim.SetConfigFile("...");                                               //
37 //                                                                           //
38 // The generation of particles and the simulation of detector hits can be    //
39 // switched on or off by                                                     //
40 //                                                                           //
41 //   sim.SetRunGeneration(kTRUE);   // generation of primary particles       //
42 //   sim.SetRunSimulation(kFALSE);  // but no tracking                       //
43 //                                                                           //
44 // For which detectors sdigits and digits will be created, can be steered    //
45 // by                                                                        //
46 //                                                                           //
47 //   sim.SetMakeSDigits("ALL");     // make sdigits for all detectors        //
48 //   sim.SetMakeDigits("ITS TPC");  // make digits only for ITS and TPC      //
49 //                                                                           //
50 // The argument is a (case sensitive) string with the names of the           //
51 // detectors separated by a space. An empty string ("") can be used to       //
52 // disable the creation of sdigits or digits. The special string "ALL"       //
53 // selects all available detectors. This is the default.                     //
54 //                                                                           //
55 // The creation of digits from hits instead of from sdigits can be selected  //
56 // by                                                                        //
57 //                                                                           //
58 //   sim.SetMakeDigitsFromHits("TRD");                                       //
59 //                                                                           //
60 // The argument is again a string with the selected detectors. Be aware that //
61 // this feature is not available for all detectors and that merging is not   //
62 // possible, when digits are created directly from hits.                     //
63 //                                                                           //
64 // Background events can be merged by calling                                //
65 //                                                                           //
66 //   sim.MergeWith("background/galice.root", 2);                             //
67 //                                                                           //
68 // The first argument is the file name of the background galice file. The    //
69 // second argument is the number of signal events per background event.      //
70 // By default this number is calculated from the number of available         //
71 // background events. MergeWith can be called several times to merge more    //
72 // than two event streams. It is assumed that the sdigits were already       //
73 // produced for the background events.                                       //
74 //                                                                           //
75 // The output of raw data can be switched on by calling                      //
76 //                                                                           //
77 //   sim.SetWriteRawData("MUON");   // write raw data for MUON               //
78 //                                                                           //
79 // The default output format of the raw data are DDL files. They are         //
80 // converted to a DATE file, if a file name is given as second argument.     //
81 // For this conversion the program "dateStream" is required. If the file     //
82 // name has the extension ".root", the DATE file is converted to a root      //
83 // file. The program "alimdc" is used for this purpose. For the conversion   //
84 // to DATE and root format the two conversion programs have to be installed. //
85 // Only the raw data in the final format is kept if the third argument is    //
86 // kTRUE.                                                                    //
87 //                                                                           //
88 // The methods RunSimulation, RunSDigitization, RunDigitization,             //
89 // RunHitsDigitization and WriteRawData can be used to run only parts of     //
90 // the full simulation chain. The creation of raw data DDL files and their   //
91 // conversion to the DATE or root format can be run directly by calling      //
92 // the methods WriteRawFiles, ConvertRawFilesToDate and ConvertDateToRoot.   //
93 //                                                                           //
94 // The default number of events per file, which is usually set in the        //
95 // config file, can be changed for individual detectors and data types       //
96 // by calling                                                                //
97 //                                                                           //
98 //   sim.SetEventsPerFile("PHOS", "Reconstructed Points", 3);                //
99 //                                                                           //
100 // The first argument is the detector, the second one the data type and the  //
101 // last one the number of events per file. Valid data types are "Hits",      //
102 // "Summable Digits", "Digits", "Reconstructed Points" and "Tracks".         //
103 // The number of events per file has to be set before the simulation of      //
104 // hits. Otherwise it has no effect.                                         //
105 //                                                                           //
106 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
107
108 #include <TVirtualMCApplication.h>
109 #include <TGeoManager.h>
110 #include <TObjString.h>
111 #include <TSystem.h>
112 #include <TFile.h>
113 #include <TROOT.h>
114
115 #include "AliCodeTimer.h"
116 #include "AliCDBStorage.h"
117 #include "AliCDBEntry.h"
118 #include "AliCDBManager.h"
119 #include "AliGeomManager.h"
120 #include "AliAlignObj.h"
121 #include "AliCentralTrigger.h"
122 #include "AliDAQ.h"
123 #include "AliDigitizer.h"
124 #include "AliGenerator.h"
125 #include "AliLog.h"
126 #include "AliModule.h"
127 #include "AliRun.h"
128 #include "AliRunDigitizer.h"
129 #include "AliRunLoader.h"
130 #include "AliSimulation.h"
131 #include "AliVertexGenFile.h"
132 #include "AliCentralTrigger.h"
133 #include "AliCTPRawData.h"
134 #include "AliRawReaderFile.h"
135 #include "AliRawReaderRoot.h"
136 #include "AliRawReaderDate.h"
137 #include "AliESD.h"
138 #include "AliHeader.h"
139 #include "AliGenEventHeader.h"
140 #include "AliMC.h"
141 #include "AliHLTSimulation.h"
142 #include "AliSysInfo.h"
143 #include "AliMagF.h"
144 #include "AliGRPObject.h"
145
146 ClassImp(AliSimulation)
147
148 AliSimulation *AliSimulation::fgInstance = 0;
149 const char* AliSimulation::fgkDetectorName[AliSimulation::fgkNDetectors] = {"ITS", "TPC", "TRD", "TOF", "PHOS", "HMPID", "EMCAL", "MUON", "FMD", "ZDC", "PMD", "T0", "VZERO", "ACORDE", "HLT"};
150
151 //_____________________________________________________________________________
152 AliSimulation::AliSimulation(const char* configFileName,
153                              const char* name, const char* title) :
154   TNamed(name, title),
155
156   fRunGeneration(kTRUE),
157   fRunSimulation(kTRUE),
158   fLoadAlignFromCDB(kTRUE),
159   fLoadAlObjsListOfDets("ALL"),
160   fMakeSDigits("ALL"),
161   fMakeDigits("ALL"),
162   fMakeTrigger(""),
163   fMakeDigitsFromHits(""),
164   fWriteRawData(""),
165   fRawDataFileName(""),
166   fDeleteIntermediateFiles(kFALSE),
167   fWriteSelRawData(kFALSE),
168   fStopOnError(kFALSE),
169
170   fNEvents(1),
171   fConfigFileName(configFileName),
172   fGAliceFileName("galice.root"),
173   fEventsPerFile(),
174   fBkgrdFileNames(NULL),
175   fAlignObjArray(NULL),
176   fUseBkgrdVertex(kTRUE),
177   fRegionOfInterest(kFALSE),
178   fCDBUri(""),
179   fSpecCDBUri(),
180   fRun(-1),
181   fSeed(0),
182   fInitCDBCalled(kFALSE),
183   fInitRunNumberCalled(kFALSE),
184   fSetRunNumberFromDataCalled(kFALSE),
185   fEmbeddingFlag(kFALSE),
186   fQADetectors("ALL"),                  
187   fQATasks("ALL"),      
188   fQASteer(NULL), 
189   fRunQA(kTRUE), 
190   fRunHLT("default"),
191   fWriteGRPEntry(kTRUE)
192 {
193 // create simulation object with default parameters
194   fgInstance = this;
195   SetGAliceFile("galice.root");
196   
197 // for QA
198         fQASteer = new AliQADataMakerSteer("sim") ; 
199         fQASteer->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
200         fQATasks = Form("%d %d %d", AliQA::kHITS, AliQA::kSDIGITS, AliQA::kDIGITS) ; 
201         fQASteer->SetTasks(fQATasks) ;  
202 }
203
204 //_____________________________________________________________________________
205 AliSimulation::AliSimulation(const AliSimulation& sim) :
206   TNamed(sim),
207
208   fRunGeneration(sim.fRunGeneration),
209   fRunSimulation(sim.fRunSimulation),
210   fLoadAlignFromCDB(sim.fLoadAlignFromCDB),
211   fLoadAlObjsListOfDets(sim.fLoadAlObjsListOfDets),
212   fMakeSDigits(sim.fMakeSDigits),
213   fMakeDigits(sim.fMakeDigits),
214   fMakeTrigger(sim.fMakeTrigger),
215   fMakeDigitsFromHits(sim.fMakeDigitsFromHits),
216   fWriteRawData(sim.fWriteRawData),
217   fRawDataFileName(""),
218   fDeleteIntermediateFiles(kFALSE),
219   fWriteSelRawData(kFALSE),
220   fStopOnError(sim.fStopOnError),
221
222   fNEvents(sim.fNEvents),
223   fConfigFileName(sim.fConfigFileName),
224   fGAliceFileName(sim.fGAliceFileName),
225   fEventsPerFile(),
226   fBkgrdFileNames(NULL),
227   fAlignObjArray(NULL),
228   fUseBkgrdVertex(sim.fUseBkgrdVertex),
229   fRegionOfInterest(sim.fRegionOfInterest),
230   fCDBUri(sim.fCDBUri),
231   fSpecCDBUri(),
232   fRun(-1),
233   fSeed(0),
234   fInitCDBCalled(sim.fInitCDBCalled),
235   fInitRunNumberCalled(sim.fInitRunNumberCalled),
236   fSetRunNumberFromDataCalled(sim.fSetRunNumberFromDataCalled),
237   fEmbeddingFlag(sim.fEmbeddingFlag),
238   fQADetectors(sim.fQADetectors),                  
239         fQATasks(sim.fQATasks), 
240         fQASteer(sim.fQASteer), 
241   fRunQA(sim.fRunQA), 
242   fRunHLT(sim.fRunHLT),
243   fWriteGRPEntry(sim.fWriteGRPEntry)
244 {
245 // copy constructor
246
247   for (Int_t i = 0; i < sim.fEventsPerFile.GetEntriesFast(); i++) {
248     if (!sim.fEventsPerFile[i]) continue;
249     fEventsPerFile.Add(sim.fEventsPerFile[i]->Clone());
250   }
251
252   fBkgrdFileNames = new TObjArray;
253   for (Int_t i = 0; i < sim.fBkgrdFileNames->GetEntriesFast(); i++) {
254     if (!sim.fBkgrdFileNames->At(i)) continue;
255     fBkgrdFileNames->Add(sim.fBkgrdFileNames->At(i)->Clone());
256   }
257
258   for (Int_t i = 0; i < sim.fSpecCDBUri.GetEntriesFast(); i++) {
259     if (sim.fSpecCDBUri[i]) fSpecCDBUri.Add(sim.fSpecCDBUri[i]->Clone());
260   }
261   fgInstance = this;
262 }
263
264 //_____________________________________________________________________________
265 AliSimulation& AliSimulation::operator = (const AliSimulation& sim)
266 {
267 // assignment operator
268
269   this->~AliSimulation();
270   new(this) AliSimulation(sim);
271   return *this;
272 }
273
274 //_____________________________________________________________________________
275 AliSimulation::~AliSimulation()
276 {
277 // clean up
278
279   fEventsPerFile.Delete();
280 //  if(fAlignObjArray) fAlignObjArray->Delete(); // fAlignObjArray->RemoveAll() ???
281 //  delete fAlignObjArray; fAlignObjArray=0;
282
283   if (fBkgrdFileNames) {
284     fBkgrdFileNames->Delete();
285     delete fBkgrdFileNames;
286   }
287
288   fSpecCDBUri.Delete();
289   if (fgInstance==this) fgInstance = 0;
290
291         delete fQASteer ; 
292         
293   AliCodeTimer::Instance()->Print();
294 }
295
296
297 //_____________________________________________________________________________
298 void AliSimulation::SetNumberOfEvents(Int_t nEvents)
299 {
300 // set the number of events for one run
301
302   fNEvents = nEvents;
303 }
304
305 //_____________________________________________________________________________
306 void AliSimulation::InitCDB()
307 {
308 // activate a default CDB storage
309 // First check if we have any CDB storage set, because it is used 
310 // to retrieve the calibration and alignment constants
311
312   if (fInitCDBCalled) return;
313   fInitCDBCalled = kTRUE;
314
315   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
316   if (man->IsDefaultStorageSet())
317   {
318     AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
319     AliWarning("Default CDB storage has been already set !");
320     AliWarning(Form("Ignoring the default storage declared in AliSimulation: %s",fCDBUri.Data()));
321     AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
322     fCDBUri = man->GetDefaultStorage()->GetURI();
323   }
324   else {
325     if (fCDBUri.Length() > 0) 
326     {
327         AliDebug(2,"!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
328         AliDebug(2, Form("Default CDB storage is set to: %s", fCDBUri.Data()));
329         AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
330     } else {
331         fCDBUri="local://$ALICE_ROOT";
332         AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
333         AliWarning("Default CDB storage not yet set !!!!");
334         AliWarning(Form("Setting it now to: %s", fCDBUri.Data()));
335         AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
336                 
337     }
338     man->SetDefaultStorage(fCDBUri);
339   }
340
341   // Now activate the detector specific CDB storage locations
342   for (Int_t i = 0; i < fSpecCDBUri.GetEntriesFast(); i++) {
343     TObject* obj = fSpecCDBUri[i];
344     if (!obj) continue;
345     AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
346     AliDebug(2, Form("Specific CDB storage for %s is set to: %s",obj->GetName(),obj->GetTitle()));
347     AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
348     man->SetSpecificStorage(obj->GetName(), obj->GetTitle());
349   }
350       
351 }
352
353 //_____________________________________________________________________________
354 void AliSimulation::InitRunNumber(){
355 // check run number. If not set, set it to 0 !!!!
356   
357   if (fInitRunNumberCalled) return;
358   fInitRunNumberCalled = kTRUE;
359   
360   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
361   if (man->GetRun() >= 0)
362   {
363         AliFatal(Form("Run number cannot be set in AliCDBManager before start of simulation: "
364                         "Use external variable DC_RUN or AliSimulation::SetRun()!"));
365   }
366     
367   if(fRun >= 0) {
368         AliDebug(2,"!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
369         AliDebug(2, Form("Setting CDB run number to: %d",fRun));
370         AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
371   } else {
372         fRun=0;
373         AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
374         AliWarning("Run number not yet set !!!!");
375         AliWarning(Form("Setting it now to: %d", fRun));
376         AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
377         
378   }
379   man->SetRun(fRun);
380
381   man->Print();
382
383 }
384
385 //_____________________________________________________________________________
386 void AliSimulation::SetCDBLock() {
387   // Set CDB lock: from now on it is forbidden to reset the run number
388   // or the default storage or to activate any further storage!
389   
390   AliCDBManager::Instance()->SetLock(1);
391 }
392
393 //_____________________________________________________________________________
394 void AliSimulation::SetDefaultStorage(const char* uri) {
395 // Store the desired default CDB storage location
396 // Activate it later within the Run() method
397
398   fCDBUri = uri;
399
400 }
401
402 //_____________________________________________________________________________
403 void AliSimulation::SetSpecificStorage(const char* calibType, const char* uri) {
404 // Store a detector-specific CDB storage location
405 // Activate it later within the Run() method
406
407   AliCDBPath aPath(calibType);
408   if(!aPath.IsValid()){
409         AliError(Form("Not a valid path: %s", calibType));
410         return;
411   }
412
413   TObject* obj = fSpecCDBUri.FindObject(calibType);
414   if (obj) fSpecCDBUri.Remove(obj);
415   fSpecCDBUri.Add(new TNamed(calibType, uri));
416
417 }
418
419 //_____________________________________________________________________________
420 void AliSimulation::SetRunNumber(Int_t run)
421 {
422 // sets run number
423 // Activate it later within the Run() method
424
425         fRun = run;
426 }
427
428 //_____________________________________________________________________________
429 void AliSimulation::SetSeed(Int_t seed)
430 {
431 // sets seed number
432 // Activate it later within the Run() method
433
434         fSeed = seed;
435 }
436
437 //_____________________________________________________________________________
438 Bool_t AliSimulation::SetRunNumberFromData()
439 {
440   // Set the CDB manager run number
441   // The run number is retrieved from gAlice
442
443     if (fSetRunNumberFromDataCalled) return kTRUE;
444     fSetRunNumberFromDataCalled = kTRUE;    
445   
446     AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
447     Int_t runData = -1, runCDB = -1;
448   
449     AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
450     if (!runLoader) return kFALSE;
451     else {
452         runData = runLoader->GetAliRun()->GetHeader()->GetRun();
453         delete runLoader;
454     }
455   
456     runCDB = man->GetRun();
457     if(runCDB >= 0) {
458         if (runCDB != runData) {
459                 AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
460                 AliWarning(Form("A run number was previously set in AliCDBManager: %d !", runCDB));
461                 AliWarning(Form("It will be replaced with the run number got from run header: %d !", runData));
462                 AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");    
463         }
464         
465     }
466       
467     man->SetRun(runData);
468     fRun = runData;
469     
470     if(man->GetRun() < 0) {
471         AliError("Run number not properly initalized!");
472         return kFALSE;
473     }
474   
475     man->Print();
476     
477     return kTRUE;
478 }
479
480 //_____________________________________________________________________________
481 void AliSimulation::SetConfigFile(const char* fileName)
482 {
483 // set the name of the config file
484
485   fConfigFileName = fileName;
486 }
487
488 //_____________________________________________________________________________
489 void AliSimulation::SetGAliceFile(const char* fileName)
490 {
491 // set the name of the galice file
492 // the path is converted to an absolute one if it is relative
493
494   fGAliceFileName = fileName;
495   if (!gSystem->IsAbsoluteFileName(fGAliceFileName)) {
496     char* absFileName = gSystem->ConcatFileName(gSystem->WorkingDirectory(),
497                                                 fGAliceFileName);
498     fGAliceFileName = absFileName;
499     delete[] absFileName;
500   }
501
502   AliDebug(2, Form("galice file name set to %s", fileName));
503 }
504
505 //_____________________________________________________________________________
506 void AliSimulation::SetEventsPerFile(const char* detector, const char* type, 
507                                      Int_t nEvents)
508 {
509 // set the number of events per file for the given detector and data type
510 // ("Hits", "Summable Digits", "Digits", "Reconstructed Points" or "Tracks")
511
512   TNamed* obj = new TNamed(detector, type);
513   obj->SetUniqueID(nEvents);
514   fEventsPerFile.Add(obj);
515 }
516
517 //_____________________________________________________________________________
518 Bool_t AliSimulation::MisalignGeometry(AliRunLoader *runLoader)
519 {
520   // Read the alignment objects from CDB.
521   // Each detector is supposed to have the
522   // alignment objects in DET/Align/Data CDB path.
523   // All the detector objects are then collected,
524   // sorted by geometry level (starting from ALIC) and
525   // then applied to the TGeo geometry.
526   // Finally an overlaps check is performed.
527
528   if (!AliGeomManager::GetGeometry() || !AliGeomManager::GetGeometry()->IsClosed()) {
529     AliError("Can't apply the misalignment! Geometry is not loaded or it is still opened!");
530     return kFALSE;
531   }  
532   
533   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
534   InitCDB();
535 //  if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
536   SetCDBLock();
537     
538   Bool_t delRunLoader = kFALSE;
539   if (!runLoader) {
540     runLoader = LoadRun("READ");
541     if (!runLoader) return kFALSE;
542     delRunLoader = kTRUE;
543   }
544   
545   // Export ideal geometry 
546   if(!gAlice->IsRootGeometry()) AliGeomManager::GetGeometry()->Export("geometry.root");
547
548   // Load alignment data from CDB and apply to geometry through AliGeomManager
549   if(fLoadAlignFromCDB){
550     
551     TString detStr = fLoadAlObjsListOfDets;
552     TString loadAlObjsListOfDets = "";
553     
554     TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
555     for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
556       AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
557       if (!det || !det->IsActive()) continue;
558       if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
559         //add det to list of dets to be aligned from CDB
560         loadAlObjsListOfDets += det->GetName();
561         loadAlObjsListOfDets += " ";
562       }
563     } // end loop over detectors
564     loadAlObjsListOfDets.Prepend("GRP "); //add alignment objects for non-sensitive modules
565     AliGeomManager::ApplyAlignObjsFromCDB(loadAlObjsListOfDets.Data());
566   }else{
567     // Check if the array with alignment objects was
568     // provided by the user. If yes, apply the objects
569     // to the present TGeo geometry
570     if (fAlignObjArray) {
571       if (AliGeomManager::ApplyAlignObjsToGeom(*fAlignObjArray) == kFALSE) {
572         AliError("The misalignment of one or more volumes failed!"
573                  "Compare the list of simulated detectors and the list of detector alignment data!");
574         if (delRunLoader) delete runLoader;
575         return kFALSE;
576       }
577     }
578   }
579
580   // Update the internal geometry of modules (ITS needs it)
581   TString detStr = fLoadAlObjsListOfDets;
582   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
583   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
584
585     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
586     if (!det || !det->IsActive()) continue;
587     if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
588       det->UpdateInternalGeometry();
589     }
590   } // end loop over detectors
591
592
593   if (delRunLoader) delete runLoader;
594
595   return kTRUE;
596 }
597
598 //_____________________________________________________________________________
599 void AliSimulation::MergeWith(const char* fileName, Int_t nSignalPerBkgrd)
600 {
601 // add a file with background events for merging
602
603   TObjString* fileNameStr = new TObjString(fileName);
604   fileNameStr->SetUniqueID(nSignalPerBkgrd);
605   if (!fBkgrdFileNames) fBkgrdFileNames = new TObjArray;
606   fBkgrdFileNames->Add(fileNameStr);
607 }
608
609 void AliSimulation::EmbedInto(const char* fileName, Int_t nSignalPerBkgrd)
610 {
611 // add a file with background events for embeddin
612   MergeWith(fileName, nSignalPerBkgrd);
613   fEmbeddingFlag = kTRUE;
614 }
615
616 //_____________________________________________________________________________
617 Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
618 {
619 // run the generation, simulation and digitization
620
621  
622   AliCodeTimerAuto("")
623   
624   // Load run number and seed from environmental vars
625   ProcessEnvironmentVars();
626
627   gRandom->SetSeed(fSeed);
628    
629   if (nEvents > 0) fNEvents = nEvents;
630
631   // generation and simulation -> hits
632   if (fRunGeneration) {
633     if (!RunSimulation()) if (fStopOnError) return kFALSE;
634   }
635            
636   // initialize CDB storage from external environment
637   // (either CDB manager or AliSimulation setters),
638   // if not already done in RunSimulation()
639   InitCDB();
640   
641   // Set run number in CDBManager from data 
642   // From this point on the run number must be always loaded from data!
643   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
644   
645   // Set CDB lock: from now on it is forbidden to reset the run number
646   // or the default storage or to activate any further storage!
647   SetCDBLock();
648
649   // If RunSimulation was not called, load the geometry and misalign it
650   if (!AliGeomManager::GetGeometry()) {
651     // Initialize the geometry manager
652     AliGeomManager::LoadGeometry("geometry.root");
653     
654 //    // Check that the consistency of symbolic names for the activated subdetectors
655 //    // in the geometry loaded by AliGeomManager
656 //    AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
657 //    if (!runLoader) return kFALSE;
658 //
659 //    TString detsToBeChecked = "";
660 //    TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
661 //    for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
662 //      AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
663 //      if (!det || !det->IsActive()) continue;
664 //      detsToBeChecked += det->GetName();
665 //      detsToBeChecked += " ";
666 //    } // end loop over detectors
667 //    if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT(detsToBeChecked.Data()))
668     if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT("ALL"))
669         AliFatalClass("Current loaded geometry differs in the definition of symbolic names!");
670         
671     if (!AliGeomManager::GetGeometry()) if (fStopOnError) return kFALSE;
672     // Misalign geometry
673     if(!MisalignGeometry()) if (fStopOnError) return kFALSE;
674   }
675
676
677   // hits -> summable digits
678   AliSysInfo::AddStamp("Start_sdigitization");
679   if (!fMakeSDigits.IsNull()) {
680     if (!RunSDigitization(fMakeSDigits)) if (fStopOnError) return kFALSE;
681  
682   }
683   AliSysInfo::AddStamp("Stop_sdigitization");
684   
685   AliSysInfo::AddStamp("Start_digitization");  
686   // summable digits -> digits  
687   if (!fMakeDigits.IsNull()) {
688     if (!RunDigitization(fMakeDigits, fMakeDigitsFromHits)) {
689       if (fStopOnError) return kFALSE;
690     }
691    }
692   AliSysInfo::AddStamp("Stop_digitization");
693
694   
695   
696   // hits -> digits
697   if (!fMakeDigitsFromHits.IsNull()) {
698     if (fBkgrdFileNames && (fBkgrdFileNames->GetEntriesFast() > 0)) {
699       AliWarning(Form("Merging and direct creation of digits from hits " 
700                  "was selected for some detectors. "
701                  "No merging will be done for the following detectors: %s",
702                  fMakeDigitsFromHits.Data()));
703     }
704     if (!RunHitsDigitization(fMakeDigitsFromHits)) {
705       if (fStopOnError) return kFALSE;
706     }
707   }
708
709   
710   
711   // digits -> trigger
712   if (!RunTrigger(fMakeTrigger,fMakeDigits)) {
713     if (fStopOnError) return kFALSE;
714   }
715
716   
717   
718   // digits -> raw data
719   if (!fWriteRawData.IsNull()) {
720     if (!WriteRawData(fWriteRawData, fRawDataFileName, 
721                       fDeleteIntermediateFiles,fWriteSelRawData)) {
722       if (fStopOnError) return kFALSE;
723     }
724   }
725
726   
727   
728   // run HLT simulation
729   if (!fRunHLT.IsNull()) {
730     if (!RunHLT()) {
731       if (fStopOnError) return kFALSE;
732     }
733   }
734   
735   //QA
736         if (fRunQA) {
737                 Bool_t rv = RunQA() ; 
738                 if (!rv)
739                         if (fStopOnError) 
740                                 return kFALSE ;         
741         }
742
743   // Cleanup of CDB manager: cache and active storages!
744   AliCDBManager::Instance()->ClearCache();
745
746   return kTRUE;
747 }
748
749 //_____________________________________________________________________________
750 Bool_t AliSimulation::RunTrigger(const char* config, const char* detectors)
751 {
752   // run the trigger
753
754   AliCodeTimerAuto("")
755
756   // initialize CDB storage from external environment
757   // (either CDB manager or AliSimulation setters),
758   // if not already done in RunSimulation()
759   InitCDB();
760   
761   // Set run number in CDBManager from data 
762   // From this point on the run number must be always loaded from data!
763   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
764   
765   // Set CDB lock: from now on it is forbidden to reset the run number
766   // or the default storage or to activate any further storage!
767   SetCDBLock();
768    
769    AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
770    if (!runLoader) return kFALSE;
771    TString trconfiguration = config;
772
773    if (trconfiguration.IsNull()) {
774      if (gAlice->GetTriggerDescriptor() != "") {
775        trconfiguration = gAlice->GetTriggerDescriptor();
776      }
777      else
778        AliWarning("No trigger descriptor is specified. Loading the one that is in the CDB.");
779    }
780
781    runLoader->MakeTree( "GG" );
782    AliCentralTrigger* aCTP = runLoader->GetTrigger();
783    // Load Configuration
784    if (!aCTP->LoadConfiguration( trconfiguration ))
785      return kFALSE;
786
787    // digits -> trigger
788    if( !aCTP->RunTrigger( runLoader , detectors ) ) {
789       if (fStopOnError) {
790         //  delete aCTP;
791         return kFALSE;
792       }
793    }
794
795    delete runLoader;
796
797    return kTRUE;
798 }
799
800 //_____________________________________________________________________________
801 Bool_t AliSimulation::WriteTriggerRawData()
802 {
803   // Writes the CTP (trigger) DDL raw data
804   // Details of the format are given in the
805   // trigger TDR - pages 134 and 135.
806   AliCTPRawData writer;
807   writer.RawData();
808
809   return kTRUE;
810 }
811
812 //_____________________________________________________________________________
813 Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
814 {
815 // run the generation and simulation
816
817   AliCodeTimerAuto("")
818
819   // initialize CDB storage and run number from external environment
820   // (either CDB manager or AliSimulation setters)
821   InitCDB();
822   InitRunNumber();
823   SetCDBLock();
824   
825   if (!gAlice) {
826     AliError("no gAlice object. Restart aliroot and try again.");
827     return kFALSE;
828   }
829   if (gAlice->Modules()->GetEntries() > 0) {
830     AliError("gAlice was already run. Restart aliroot and try again.");
831     return kFALSE;
832   }
833
834   AliInfo(Form("initializing gAlice with config file %s",
835           fConfigFileName.Data()));
836   StdoutToAliInfo(StderrToAliError(
837     gAlice->Init(fConfigFileName.Data());
838   ););
839   
840   // Get the trigger descriptor string
841   // Either from AliSimulation or from
842   // gAlice
843   if (fMakeTrigger.IsNull()) {
844     if (gAlice->GetTriggerDescriptor() != "")
845       fMakeTrigger = gAlice->GetTriggerDescriptor();
846   }
847   else
848     gAlice->SetTriggerDescriptor(fMakeTrigger.Data());
849
850   // Set run number in CDBManager
851   AliInfo(Form("Run number: %d",AliCDBManager::Instance()->GetRun()));
852
853   AliRunLoader* runLoader = gAlice->GetRunLoader();
854   if (!runLoader) {
855              AliError(Form("gAlice has no run loader object. "
856                              "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
857              return kFALSE;
858   }
859   SetGAliceFile(runLoader->GetFileName());
860       
861   // Misalign geometry
862 #if ROOT_VERSION_CODE < 331527
863   AliGeomManager::SetGeometry(gGeoManager);
864   
865   // Check that the consistency of symbolic names for the activated subdetectors
866   // in the geometry loaded by AliGeomManager
867   TString detsToBeChecked = "";
868   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
869   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
870     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
871     if (!det || !det->IsActive()) continue;
872     detsToBeChecked += det->GetName();
873     detsToBeChecked += " ";
874   } // end loop over detectors
875   if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT(detsToBeChecked.Data()))
876     AliFatalClass("Current loaded geometry differs in the definition of symbolic names!");
877   MisalignGeometry(runLoader);
878 #endif
879
880 //   AliRunLoader* runLoader = gAlice->GetRunLoader();
881 //   if (!runLoader) {
882 //     AliError(Form("gAlice has no run loader object. "
883 //                   "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
884 //     return kFALSE;
885 //   }
886 //   SetGAliceFile(runLoader->GetFileName());
887
888   if (!gAlice->Generator()) {
889     AliError(Form("gAlice has no generator object. "
890                   "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
891     return kFALSE;
892   }
893
894   // Write GRP entry corresponding to the setting found in Cofig.C
895   if (fWriteGRPEntry)
896     WriteGRPEntry();
897
898   if (nEvents <= 0) nEvents = fNEvents;
899
900   // get vertex from background file in case of merging
901   if (fUseBkgrdVertex &&
902       fBkgrdFileNames && (fBkgrdFileNames->GetEntriesFast() > 0)) {
903     Int_t signalPerBkgrd = GetNSignalPerBkgrd(nEvents);
904     const char* fileName = ((TObjString*)
905                             (fBkgrdFileNames->At(0)))->GetName();
906     AliInfo(Form("The vertex will be taken from the background "
907                  "file %s with nSignalPerBackground = %d", 
908                  fileName, signalPerBkgrd));
909     AliVertexGenFile* vtxGen = new AliVertexGenFile(fileName, signalPerBkgrd);
910     gAlice->Generator()->SetVertexGenerator(vtxGen);
911   }
912
913   if (!fRunSimulation) {
914     gAlice->Generator()->SetTrackingFlag(0);
915   }
916
917   // set the number of events per file for given detectors and data types
918   for (Int_t i = 0; i < fEventsPerFile.GetEntriesFast(); i++) {
919     if (!fEventsPerFile[i]) continue;
920     const char* detName = fEventsPerFile[i]->GetName();
921     const char* typeName = fEventsPerFile[i]->GetTitle();
922     TString loaderName(detName);
923     loaderName += "Loader";
924     AliLoader* loader = runLoader->GetLoader(loaderName);
925     if (!loader) {
926       AliError(Form("RunSimulation", "no loader for %s found\n"
927                     "Number of events per file not set for %s %s", 
928                     detName, typeName, detName));
929       continue;
930     }
931     AliDataLoader* dataLoader = 
932       loader->GetDataLoader(typeName);
933     if (!dataLoader) {
934       AliError(Form("no data loader for %s found\n"
935                     "Number of events per file not set for %s %s", 
936                     typeName, detName, typeName));
937       continue;
938     }
939     dataLoader->SetNumberOfEventsPerFile(fEventsPerFile[i]->GetUniqueID());
940     AliDebug(1, Form("number of events per file set to %d for %s %s",
941                      fEventsPerFile[i]->GetUniqueID(), detName, typeName));
942   }
943
944   AliInfo("running gAlice");
945   AliSysInfo::AddStamp("Start_simulation");
946   StdoutToAliInfo(StderrToAliError(
947     gAlice->Run(nEvents);
948   ););
949   AliSysInfo::AddStamp("Stop_simulation");
950   delete runLoader;
951
952   return kTRUE;
953 }
954
955 //_____________________________________________________________________________
956 Bool_t AliSimulation::RunSDigitization(const char* detectors)
957 {
958 // run the digitization and produce summable digits
959   static Int_t eventNr=0;
960   AliCodeTimerAuto("")
961
962   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
963   InitCDB();
964   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
965   SetCDBLock();
966   
967   AliRunLoader* runLoader = LoadRun();
968   if (!runLoader) return kFALSE;
969
970   TString detStr = detectors;
971   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
972   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
973     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
974     if (!det || !det->IsActive()) continue;
975     if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
976       AliInfo(Form("creating summable digits for %s", det->GetName()));
977       AliCodeTimerAuto(Form("creating summable digits for %s", det->GetName()));
978       det->Hits2SDigits();
979       AliSysInfo::AddStamp(Form("Digit_%s_%d",det->GetName(),eventNr), 0,1, eventNr);
980     }
981   }
982
983   if ((detStr.CompareTo("ALL") != 0) && !detStr.IsNull()) {
984     AliError(Form("the following detectors were not found: %s",
985                   detStr.Data()));
986     if (fStopOnError) return kFALSE;
987   }
988   eventNr++;
989   delete runLoader;
990
991   return kTRUE;
992 }
993
994
995 //_____________________________________________________________________________
996 Bool_t AliSimulation::RunDigitization(const char* detectors, 
997                                       const char* excludeDetectors)
998 {
999 // run the digitization and produce digits from sdigits
1000
1001   AliCodeTimerAuto("")
1002
1003   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
1004   InitCDB();
1005   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
1006   SetCDBLock();
1007   
1008   while (AliRunLoader::GetRunLoader()) delete AliRunLoader::GetRunLoader();
1009   if (gAlice) delete gAlice;
1010   gAlice = NULL;
1011
1012   Int_t nStreams = 1;
1013   if (fBkgrdFileNames) nStreams = fBkgrdFileNames->GetEntriesFast() + 1;
1014   Int_t signalPerBkgrd = GetNSignalPerBkgrd();
1015   AliRunDigitizer* manager = new AliRunDigitizer(nStreams, signalPerBkgrd);
1016   // manager->SetEmbeddingFlag(fEmbeddingFlag);
1017   manager->SetInputStream(0, fGAliceFileName.Data());
1018   for (Int_t iStream = 1; iStream < nStreams; iStream++) {
1019     const char* fileName = ((TObjString*)
1020                             (fBkgrdFileNames->At(iStream-1)))->GetName();
1021     manager->SetInputStream(iStream, fileName);
1022   }
1023
1024   TString detStr = detectors;
1025   TString detExcl = excludeDetectors;
1026   manager->GetInputStream(0)->ImportgAlice();
1027   AliRunLoader* runLoader = 
1028     AliRunLoader::GetRunLoader(manager->GetInputStream(0)->GetFolderName());
1029   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
1030   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
1031     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
1032     if (!det || !det->IsActive()) continue;
1033     if (IsSelected(det->GetName(), detStr) && 
1034         !IsSelected(det->GetName(), detExcl)) {
1035       AliDigitizer* digitizer = det->CreateDigitizer(manager);
1036       
1037       if (!digitizer) {
1038         AliError(Form("no digitizer for %s", det->GetName()));
1039         if (fStopOnError) return kFALSE;
1040       } else {
1041         digitizer->SetRegionOfInterest(fRegionOfInterest);
1042       }
1043     }
1044   }
1045
1046   if ((detStr.CompareTo("ALL") != 0) && !detStr.IsNull()) {
1047     AliError(Form("the following detectors were not found: %s", 
1048                   detStr.Data()));
1049     if (fStopOnError) return kFALSE;
1050   }
1051
1052   if (!manager->GetListOfTasks()->IsEmpty()) {
1053     AliInfo("executing digitization");
1054     manager->Exec("");
1055   }
1056
1057   delete manager;
1058
1059   return kTRUE;
1060 }
1061
1062 //_____________________________________________________________________________
1063 Bool_t AliSimulation::RunHitsDigitization(const char* detectors)
1064 {
1065 // run the digitization and produce digits from hits
1066
1067   AliCodeTimerAuto("")
1068
1069   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
1070   InitCDB();
1071   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
1072   SetCDBLock();
1073   
1074   AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
1075   if (!runLoader) return kFALSE;
1076
1077   TString detStr = detectors;
1078   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
1079   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
1080     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
1081     if (!det || !det->IsActive()) continue;
1082     if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
1083       AliInfo(Form("creating digits from hits for %s", det->GetName()));
1084       det->Hits2Digits();
1085     }
1086   }
1087
1088   if ((detStr.CompareTo("ALL") != 0) && !detStr.IsNull()) {
1089     AliError(Form("the following detectors were not found: %s", 
1090                   detStr.Data()));
1091     if (fStopOnError) return kFALSE;
1092   }
1093
1094   delete runLoader;
1095   //PH Temporary fix to avoid interference with the PHOS loder/getter
1096   //PH The problem has to be solved in more general way 09/06/05
1097
1098   return kTRUE;
1099 }
1100
1101 //_____________________________________________________________________________
1102 Bool_t AliSimulation::WriteRawData(const char* detectors, 
1103                                    const char* fileName,
1104                                    Bool_t deleteIntermediateFiles,
1105                                    Bool_t selrawdata)
1106 {
1107 // convert the digits to raw data
1108 // First DDL raw data files for the given detectors are created.
1109 // If a file name is given, the DDL files are then converted to a DATE file.
1110 // If deleteIntermediateFiles is true, the DDL raw files are deleted 
1111 // afterwards.
1112 // If the file name has the extension ".root", the DATE file is converted
1113 // to a root file.
1114 // If deleteIntermediateFiles is true, the DATE file is deleted afterwards.
1115 // 'selrawdata' flag can be used to enable writing of detectors raw data
1116 // accoring to the trigger cluster.
1117
1118   AliCodeTimerAuto("")
1119   
1120   TString detStr = detectors;
1121   if (IsSelected("HLT", detStr))
1122   {
1123         // Do nothing. "HLT" will be removed from detStr because the HLT raw
1124         // data files are generated in RunHLT.
1125   }
1126
1127   if (!WriteRawFiles(detStr.Data())) {
1128     if (fStopOnError) return kFALSE;
1129   }
1130
1131   TString dateFileName(fileName);
1132   if (!dateFileName.IsNull()) {
1133     Bool_t rootOutput = dateFileName.EndsWith(".root");
1134     if (rootOutput) dateFileName += ".date";
1135     TString selDateFileName;
1136     if (selrawdata) {
1137       selDateFileName = "selected.";
1138       selDateFileName+= dateFileName;
1139     }
1140     if (!ConvertRawFilesToDate(dateFileName,selDateFileName)) {
1141       if (fStopOnError) return kFALSE;
1142     }
1143     if (deleteIntermediateFiles) {
1144       AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
1145       if (runLoader) for (Int_t iEvent = 0; 
1146                           iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1147         char command[256];
1148         sprintf(command, "rm -r raw%d", iEvent);
1149         gSystem->Exec(command);
1150       }
1151     }
1152
1153     if (rootOutput) {
1154       if (!ConvertDateToRoot(dateFileName, fileName)) {
1155         if (fStopOnError) return kFALSE;
1156       }
1157       if (deleteIntermediateFiles) {
1158         gSystem->Unlink(dateFileName);
1159       }
1160       if (selrawdata) {
1161         TString selFileName = "selected.";
1162         selFileName        += fileName;
1163         if (!ConvertDateToRoot(selDateFileName, selFileName)) {
1164           if (fStopOnError) return kFALSE;
1165         }
1166         if (deleteIntermediateFiles) {
1167           gSystem->Unlink(selDateFileName);
1168         }
1169       }
1170     }
1171   }
1172
1173   return kTRUE;
1174 }
1175
1176 //_____________________________________________________________________________
1177 Bool_t AliSimulation::WriteRawFiles(const char* detectors)
1178 {
1179 // convert the digits to raw data DDL files
1180
1181   AliCodeTimerAuto("")
1182   
1183   AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
1184   if (!runLoader) return kFALSE;
1185
1186   // write raw data to DDL files
1187   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1188     AliInfo(Form("processing event %d", iEvent));
1189     runLoader->GetEvent(iEvent);
1190     TString baseDir = gSystem->WorkingDirectory();
1191     char dirName[256];
1192     sprintf(dirName, "raw%d", iEvent);
1193     gSystem->MakeDirectory(dirName);
1194     if (!gSystem->ChangeDirectory(dirName)) {
1195       AliError(Form("couldn't change to directory %s", dirName));
1196       if (fStopOnError) return kFALSE; else continue;
1197     }
1198
1199     ofstream runNbFile(Form("run%u",runLoader->GetHeader()->GetRun()));
1200     runNbFile.close();
1201
1202     TString detStr = detectors;
1203     TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
1204     for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
1205       AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
1206       if (!det || !det->IsActive()) continue;
1207       if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
1208         AliInfo(Form("creating raw data from digits for %s", det->GetName()));
1209         det->Digits2Raw();
1210       }
1211     }
1212
1213     if (!WriteTriggerRawData())
1214       if (fStopOnError) return kFALSE;
1215
1216     gSystem->ChangeDirectory(baseDir);
1217     if ((detStr.CompareTo("ALL") != 0) && !detStr.IsNull()) {
1218       AliError(Form("the following detectors were not found: %s", 
1219                     detStr.Data()));
1220       if (fStopOnError) return kFALSE;
1221     }
1222   }
1223
1224   delete runLoader;
1225   
1226   return kTRUE;
1227 }
1228
1229 //_____________________________________________________________________________
1230 Bool_t AliSimulation::ConvertRawFilesToDate(const char* dateFileName,
1231                                             const char* selDateFileName)
1232 {
1233 // convert raw data DDL files to a DATE file with the program "dateStream"
1234 // The second argument is not empty when the user decides to write
1235 // the detectors raw data according to the trigger cluster.
1236
1237   AliCodeTimerAuto("")
1238   
1239   char* path = gSystem->Which(gSystem->Getenv("PATH"), "dateStream");
1240   if (!path) {
1241     AliError("the program dateStream was not found");
1242     if (fStopOnError) return kFALSE;
1243   } else {
1244     delete[] path;
1245   }
1246
1247   AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
1248   if (!runLoader) return kFALSE;
1249
1250   AliInfo(Form("converting raw data DDL files to DATE file %s", dateFileName));
1251   Bool_t selrawdata = kFALSE;
1252   if (strcmp(selDateFileName,"") != 0) selrawdata = kTRUE;
1253
1254   char command[256];
1255   // Note the option -s. It is used in order to avoid
1256   // the generation of SOR/EOR events.
1257   sprintf(command, "dateStream -c -s -D -o %s -# %d -C -run %d", 
1258           dateFileName, runLoader->GetNumberOfEvents(),runLoader->GetHeader()->GetRun());
1259   FILE* pipe = gSystem->OpenPipe(command, "w");
1260
1261   Int_t selEvents = 0;
1262   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1263
1264     UInt_t detectorPattern = 0;
1265     runLoader->GetEvent(iEvent);
1266     if (!runLoader->LoadTrigger()) {
1267       AliCentralTrigger *aCTP = runLoader->GetTrigger();
1268       detectorPattern = aCTP->GetClusterMask();
1269       // Check if the event was triggered by CTP
1270       if (selrawdata) {
1271         if (aCTP->GetClassMask()) selEvents++;
1272       }
1273     }
1274     else {
1275       AliWarning("No trigger can be loaded! Some fields in the event header will be empty !");
1276       if (selrawdata) {
1277         AliWarning("No trigger can be loaded! Writing of selected raw data is abandoned !");
1278         selrawdata = kFALSE;
1279       }
1280     }
1281
1282     fprintf(pipe, "GDC DetectorPattern %u\n", detectorPattern);
1283     Float_t ldc = 0;
1284     Int_t prevLDC = -1;
1285
1286     // loop over detectors and DDLs
1287     for (Int_t iDet = 0; iDet < AliDAQ::kNDetectors; iDet++) {
1288       for (Int_t iDDL = 0; iDDL < AliDAQ::NumberOfDdls(iDet); iDDL++) {
1289
1290         Int_t ddlID = AliDAQ::DdlID(iDet,iDDL);
1291         Int_t ldcID = Int_t(ldc + 0.0001);
1292         ldc += AliDAQ::NumberOfLdcs(iDet) / AliDAQ::NumberOfDdls(iDet);
1293
1294         char rawFileName[256];
1295         sprintf(rawFileName, "raw%d/%s", 
1296                 iEvent, AliDAQ::DdlFileName(iDet,iDDL));
1297
1298         // check existence and size of raw data file
1299         FILE* file = fopen(rawFileName, "rb");
1300         if (!file) continue;
1301         fseek(file, 0, SEEK_END);
1302         unsigned long size = ftell(file);
1303         fclose(file);
1304         if (!size) continue;
1305
1306         if (ldcID != prevLDC) {
1307           fprintf(pipe, " LDC Id %d\n", ldcID);
1308           prevLDC = ldcID;
1309         }
1310         fprintf(pipe, "  Equipment Id %d Payload %s\n", ddlID, rawFileName);
1311       }
1312     }
1313   }
1314
1315   Int_t result = gSystem->ClosePipe(pipe);
1316
1317   if (!(selrawdata && selEvents > 0)) {
1318     delete runLoader;
1319     return (result == 0);
1320   }
1321
1322   AliInfo(Form("converting selected by trigger cluster raw data DDL files to DATE file %s", selDateFileName));
1323   
1324   sprintf(command, "dateStream -c -s -D -o %s -# %d -C -run %d", 
1325           selDateFileName,selEvents,runLoader->GetHeader()->GetRun());
1326   FILE* pipe2 = gSystem->OpenPipe(command, "w");
1327
1328   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1329
1330     // Get the trigger decision and cluster
1331     UInt_t detectorPattern = 0;
1332     TString detClust;
1333     runLoader->GetEvent(iEvent);
1334     if (!runLoader->LoadTrigger()) {
1335       AliCentralTrigger *aCTP = runLoader->GetTrigger();
1336       if (aCTP->GetClassMask() == 0) continue;
1337       detectorPattern = aCTP->GetClusterMask();
1338       detClust = AliDAQ::ListOfTriggeredDetectors(detectorPattern);
1339       AliInfo(Form("List of detectors to be read out: %s",detClust.Data()));
1340     }
1341
1342     fprintf(pipe2, "GDC DetectorPattern %u\n", detectorPattern);
1343     Float_t ldc = 0;
1344     Int_t prevLDC = -1;
1345
1346     // loop over detectors and DDLs
1347     for (Int_t iDet = 0; iDet < AliDAQ::kNDetectors; iDet++) {
1348       // Write only raw data from detectors that
1349       // are contained in the trigger cluster(s)
1350       if (!IsSelected(AliDAQ::DetectorName(iDet),detClust)) continue;
1351
1352       for (Int_t iDDL = 0; iDDL < AliDAQ::NumberOfDdls(iDet); iDDL++) {
1353
1354         Int_t ddlID = AliDAQ::DdlID(iDet,iDDL);
1355         Int_t ldcID = Int_t(ldc + 0.0001);
1356         ldc += AliDAQ::NumberOfLdcs(iDet) / AliDAQ::NumberOfDdls(iDet);
1357
1358         char rawFileName[256];
1359         sprintf(rawFileName, "raw%d/%s", 
1360                 iEvent, AliDAQ::DdlFileName(iDet,iDDL));
1361
1362         // check existence and size of raw data file
1363         FILE* file = fopen(rawFileName, "rb");
1364         if (!file) continue;
1365         fseek(file, 0, SEEK_END);
1366         unsigned long size = ftell(file);
1367         fclose(file);
1368         if (!size) continue;
1369
1370         if (ldcID != prevLDC) {
1371           fprintf(pipe2, " LDC Id %d\n", ldcID);
1372           prevLDC = ldcID;
1373         }
1374         fprintf(pipe2, "  Equipment Id %d Payload %s\n", ddlID, rawFileName);
1375       }
1376     }
1377   }
1378
1379   Int_t result2 = gSystem->ClosePipe(pipe2);
1380
1381   delete runLoader;
1382   return ((result == 0) && (result2 == 0));
1383 }
1384
1385 //_____________________________________________________________________________
1386 Bool_t AliSimulation::ConvertDateToRoot(const char* dateFileName,
1387                                         const char* rootFileName)
1388 {
1389 // convert a DATE file to a root file with the program "alimdc"
1390
1391   // ALIMDC setup
1392   const Int_t kDBSize = 2000000000;
1393   const Int_t kTagDBSize = 1000000000;
1394   const Bool_t kFilter = kFALSE;
1395   const Int_t kCompression = 1;
1396
1397   char* path = gSystem->Which(gSystem->Getenv("PATH"), "alimdc");
1398   if (!path) {
1399     AliError("the program alimdc was not found");
1400     if (fStopOnError) return kFALSE;
1401   } else {
1402     delete[] path;
1403   }
1404
1405   AliInfo(Form("converting DATE file %s to root file %s", 
1406                dateFileName, rootFileName));
1407
1408   const char* rawDBFS[2] = { "/tmp/mdc1", "/tmp/mdc2" };
1409   const char* tagDBFS    = "/tmp/mdc1/tags";
1410
1411   // User defined file system locations
1412   if (gSystem->Getenv("ALIMDC_RAWDB1")) 
1413     rawDBFS[0] = gSystem->Getenv("ALIMDC_RAWDB1");
1414   if (gSystem->Getenv("ALIMDC_RAWDB2")) 
1415     rawDBFS[1] = gSystem->Getenv("ALIMDC_RAWDB2");
1416   if (gSystem->Getenv("ALIMDC_TAGDB")) 
1417     tagDBFS = gSystem->Getenv("ALIMDC_TAGDB");
1418
1419   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",rawDBFS[0]));
1420   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",rawDBFS[1]));
1421   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",tagDBFS));
1422
1423   gSystem->Exec(Form("mkdir %s",rawDBFS[0]));
1424   gSystem->Exec(Form("mkdir %s",rawDBFS[1]));
1425   gSystem->Exec(Form("mkdir %s",tagDBFS));
1426
1427   Int_t result = gSystem->Exec(Form("alimdc %d %d %d %d %s", 
1428                                     kDBSize, kTagDBSize, kFilter, kCompression, dateFileName));
1429   gSystem->Exec(Form("mv %s/*.root %s", rawDBFS[0], rootFileName));
1430
1431   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",rawDBFS[0]));
1432   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",rawDBFS[1]));
1433   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",tagDBFS));
1434
1435   return (result == 0);
1436 }
1437
1438
1439 //_____________________________________________________________________________
1440 AliRunLoader* AliSimulation::LoadRun(const char* mode) const
1441 {
1442 // delete existing run loaders, open a new one and load gAlice
1443
1444   while (AliRunLoader::GetRunLoader()) delete AliRunLoader::GetRunLoader();
1445   AliRunLoader* runLoader = 
1446     AliRunLoader::Open(fGAliceFileName.Data(), 
1447                        AliConfig::GetDefaultEventFolderName(), mode);
1448   if (!runLoader) {
1449     AliError(Form("no run loader found in file %s", fGAliceFileName.Data()));
1450     return NULL;
1451   }
1452   runLoader->LoadgAlice();
1453   runLoader->LoadHeader();
1454   gAlice = runLoader->GetAliRun();
1455   if (!gAlice) {
1456     AliError(Form("no gAlice object found in file %s", 
1457                   fGAliceFileName.Data()));
1458     return NULL;
1459   }
1460   return runLoader;
1461 }
1462
1463 //_____________________________________________________________________________
1464 Int_t AliSimulation::GetNSignalPerBkgrd(Int_t nEvents) const
1465 {
1466 // get or calculate the number of signal events per background event
1467
1468   if (!fBkgrdFileNames) return 1;
1469   Int_t nBkgrdFiles = fBkgrdFileNames->GetEntriesFast();
1470   if (nBkgrdFiles == 0) return 1;
1471
1472   // get the number of signal events
1473   if (nEvents <= 0) {
1474     AliRunLoader* runLoader = 
1475         AliRunLoader::Open(fGAliceFileName.Data(), "SIGNAL");
1476     if (!runLoader) return 1;
1477     
1478     nEvents = runLoader->GetNumberOfEvents();
1479     delete runLoader;
1480   }
1481
1482   Int_t result = 0;
1483   for (Int_t iBkgrdFile = 0; iBkgrdFile < nBkgrdFiles; iBkgrdFile++) {
1484     // get the number of background events
1485     const char* fileName = ((TObjString*)
1486                             (fBkgrdFileNames->At(iBkgrdFile)))->GetName();
1487     AliRunLoader* runLoader =
1488       AliRunLoader::Open(fileName, "BKGRD");
1489     if (!runLoader) continue;
1490     Int_t nBkgrdEvents = runLoader->GetNumberOfEvents();
1491     delete runLoader;
1492   
1493     // get or calculate the number of signal per background events
1494     Int_t nSignalPerBkgrd = fBkgrdFileNames->At(iBkgrdFile)->GetUniqueID();
1495     if (nSignalPerBkgrd <= 0) {
1496       nSignalPerBkgrd = (nEvents-1) / nBkgrdEvents + 1;
1497     } else if (result && (result != nSignalPerBkgrd)) {
1498       AliInfo(Form("the number of signal events per background event "
1499                    "will be changed from %d to %d for stream %d", 
1500                    nSignalPerBkgrd, result, iBkgrdFile+1));
1501       nSignalPerBkgrd = result;
1502     }
1503
1504     if (!result) result = nSignalPerBkgrd;
1505     if (nSignalPerBkgrd * nBkgrdEvents < nEvents) {
1506       AliWarning(Form("not enough background events (%d) for %d signal events "
1507                       "using %d signal per background events for stream %d",
1508                       nBkgrdEvents, nEvents, nSignalPerBkgrd, iBkgrdFile+1));
1509     }
1510   }
1511
1512   return result;
1513 }
1514
1515 //_____________________________________________________________________________
1516 Bool_t AliSimulation::IsSelected(TString detName, TString& detectors) const
1517 {
1518 // check whether detName is contained in detectors
1519 // if yes, it is removed from detectors
1520
1521   // check if all detectors are selected
1522   if ((detectors.CompareTo("ALL") == 0) ||
1523       detectors.BeginsWith("ALL ") ||
1524       detectors.EndsWith(" ALL") ||
1525       detectors.Contains(" ALL ")) {
1526     detectors = "ALL";
1527     return kTRUE;
1528   }
1529
1530   // search for the given detector
1531   Bool_t result = kFALSE;
1532   if ((detectors.CompareTo(detName) == 0) ||
1533       detectors.BeginsWith(detName+" ") ||
1534       detectors.EndsWith(" "+detName) ||
1535       detectors.Contains(" "+detName+" ")) {
1536     detectors.ReplaceAll(detName, "");
1537     result = kTRUE;
1538   }
1539
1540   // clean up the detectors string
1541   while (detectors.Contains("  ")) detectors.ReplaceAll("  ", " ");
1542   while (detectors.BeginsWith(" ")) detectors.Remove(0, 1);
1543   while (detectors.EndsWith(" ")) detectors.Remove(detectors.Length()-1, 1);
1544
1545   return result;
1546 }
1547
1548 //_____________________________________________________________________________
1549 Bool_t AliSimulation::ConvertRaw2SDigits(const char* rawDirectory, const char* esdFileName) 
1550 {
1551 //
1552 // Steering routine  to convert raw data in directory rawDirectory/ to fake SDigits. 
1553 // These can be used for embedding of MC tracks into RAW data using the standard 
1554 // merging procedure.
1555 //
1556 // If an ESD file is given the reconstructed vertex is taken from it and stored in the event header.
1557 //
1558     if (!gAlice) {
1559         AliError("no gAlice object. Restart aliroot and try again.");
1560         return kFALSE;
1561     }
1562     if (gAlice->Modules()->GetEntries() > 0) {
1563         AliError("gAlice was already run. Restart aliroot and try again.");
1564         return kFALSE;
1565     }
1566     
1567     AliInfo(Form("initializing gAlice with config file %s",fConfigFileName.Data()));
1568     StdoutToAliInfo(StderrToAliError(gAlice->Init(fConfigFileName.Data());););
1569 //
1570 //  Initialize CDB     
1571     InitCDB();
1572     //AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
1573     //man->SetRun(0); // Should this come from rawdata header ?
1574     
1575     Int_t iDet;
1576     //
1577     // Get the runloader
1578     AliRunLoader* runLoader = gAlice->GetRunLoader();
1579     //
1580     // Open esd file if available
1581     TFile* esdFile = TFile::Open(esdFileName);
1582     Bool_t esdOK = (esdFile != 0);
1583     AliESD* esd = new AliESD;
1584     TTree* treeESD = 0;
1585     if (esdOK) {
1586         treeESD = (TTree*) esdFile->Get("esdTree");
1587         if (!treeESD) {
1588             AliWarning("No ESD tree found");
1589             esdOK = kFALSE;
1590         } else {
1591             treeESD->SetBranchAddress("ESD", &esd);
1592         }
1593     }
1594     //
1595     // Create the RawReader
1596     TString fileName(rawDirectory);
1597     AliRawReader* rawReader = 0x0;
1598     if (fileName.EndsWith("/")) {
1599       rawReader = new AliRawReaderFile(fileName);
1600     } else if (fileName.EndsWith(".root")) {
1601       rawReader = new AliRawReaderRoot(fileName);
1602     } else if (!fileName.IsNull()) {
1603       rawReader = new AliRawReaderDate(fileName);
1604     }
1605 //     if (!fEquipIdMap.IsNull() && fRawReader)
1606 //       fRawReader->LoadEquipmentIdsMap(fEquipIdMap);
1607     //
1608     // Get list of detectors
1609     TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
1610     //
1611     // Get Header
1612     AliHeader* header = runLoader->GetHeader();
1613     //
1614     TString detStr = fMakeSDigits;
1615     // Event loop
1616     Int_t nev = 0;
1617     while(kTRUE) {
1618         if (!(rawReader->NextEvent())) break;
1619         //
1620         // Detector loop
1621         for (iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
1622             AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
1623             if (!det || !det->IsActive()) continue;
1624             if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
1625               AliInfo(Form("Calling Raw2SDigits for %s\n", det->GetName()));
1626               det->Raw2SDigits(rawReader);
1627               rawReader->Reset();
1628             }
1629         } // detectors
1630
1631
1632         //
1633         //  If ESD information available obtain reconstructed vertex and store in header.
1634         if (esdOK) {
1635             treeESD->GetEvent(nev);
1636             const AliESDVertex* esdVertex = esd->GetPrimaryVertex();
1637             Double_t position[3];
1638             esdVertex->GetXYZ(position);
1639             AliGenEventHeader* mcHeader = new  AliGenEventHeader("ESD");
1640             TArrayF mcV;
1641             mcV.Set(3);
1642             for (Int_t i = 0; i < 3; i++) mcV[i] = position[i];
1643             mcHeader->SetPrimaryVertex(mcV);
1644             header->Reset(0,nev);
1645             header->SetGenEventHeader(mcHeader);
1646             printf("***** Saved vertex %f %f %f \n", position[0], position[1], position[2]);
1647         }
1648         nev++;
1649 //
1650 //      Finish the event
1651         runLoader->TreeE()->Fill();
1652         runLoader->SetNextEvent();
1653     } // events
1654  
1655     delete rawReader;
1656 //
1657 //  Finish the run 
1658     runLoader->CdGAFile();
1659     runLoader->WriteHeader("OVERWRITE");
1660     runLoader->WriteRunLoader();
1661
1662     return kTRUE;
1663 }
1664
1665 //_____________________________________________________________________________
1666 Int_t AliSimulation::GetDetIndex(const char* detector)
1667 {
1668   // return the detector index corresponding to detector
1669   Int_t index = -1 ; 
1670   for (index = 0; index < fgkNDetectors ; index++) {
1671     if ( strcmp(detector, fgkDetectorName[index]) == 0 )
1672           break ; 
1673   }     
1674   return index ; 
1675 }
1676
1677 //_____________________________________________________________________________
1678 Bool_t AliSimulation::RunHLT()
1679 {
1680   // Run the HLT simulation
1681   // HLT simulation is implemented in HLT/sim/AliHLTSimulation
1682   // Disabled if fRunHLT is empty, default vaule is "default".
1683   // AliSimulation::SetRunHLT can be used to set the options for HLT simulation
1684   // The default simulation depends on the HLT component libraries and their
1685   // corresponding agents which define components and chains to run. See
1686   // http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt/
1687   // http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt/classAliHLTModuleAgent.html
1688   //
1689   // The libraries to be loaded can be specified as an option.
1690   // <pre>
1691   // AliSimulation sim;
1692   // sim.SetRunHLT("libAliHLTSample.so");
1693   // </pre>
1694   // will only load <tt>libAliHLTSample.so</tt>
1695
1696   // Other available options:
1697   // \li loglevel=<i>level</i> <br>
1698   //     logging level for this processing
1699   // \li alilog=off
1700   //     disable redirection of log messages to AliLog class
1701   // \li config=<i>macro</i>
1702   //     configuration macro
1703   // \li localrec=<i>configuration</i>
1704   //     comma separated list of configurations to be run during simulation
1705
1706   int iResult=0;
1707   AliRunLoader* pRunLoader = LoadRun("READ");
1708   if (!pRunLoader) return kFALSE;
1709
1710   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
1711   InitCDB();
1712   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
1713   SetCDBLock();
1714   
1715   // load the library dynamically
1716   gSystem->Load(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY);
1717
1718   // check for the library version
1719   AliHLTSimulationGetLibraryVersion_t fctVersion=(AliHLTSimulationGetLibraryVersion_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_GET_LIBRARY_VERSION));
1720   if (!fctVersion) {
1721     AliError(Form("can not load library %s", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY));
1722     return kFALSE;
1723   }
1724   if (fctVersion()!= ALIHLTSIMULATION_LIBRARY_VERSION) {
1725     AliError(Form("%s version does not match: compiled for version %d, loaded %d", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_LIBRARY_VERSION, fctVersion()));
1726     return kFALSE;
1727   }
1728
1729   // print compile info
1730   typedef void (*CompileInfo)( char*& date, char*& time);
1731   CompileInfo fctInfo=(CompileInfo)gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, "CompileInfo");
1732   if (fctInfo) {
1733     char* date="";
1734     char* time="";
1735     (*fctInfo)(date, time);
1736     if (!date) date="unknown";
1737     if (!time) time="unknown";
1738     AliInfo(Form("%s build on %s (%s)", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, date, time));
1739   } else {
1740     AliInfo(Form("no build info available for %s", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY));
1741   }
1742
1743   // create instance of the HLT simulation
1744   AliHLTSimulationCreateInstance_t fctCreate=(AliHLTSimulationCreateInstance_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_CREATE_INSTANCE));
1745   AliHLTSimulation* pHLT=NULL;
1746   if (fctCreate==NULL || (pHLT=(fctCreate()))==NULL) {
1747     AliError(Form("can not create instance of HLT simulation (creator %p)", fctCreate));
1748     return kFALSE;    
1749   }
1750
1751   // init the HLT simulation
1752   TString options;
1753   if (fRunHLT.CompareTo("default")!=0) options=fRunHLT;
1754   if (!IsSelected("HLT", fWriteRawData)) {
1755     options+=" writerawfiles=";
1756   } else {
1757     options+=" writerawfiles=HLT";
1758   }
1759   AliHLTSimulationInit_t fctInit=(AliHLTSimulationInit_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_INIT));
1760   if (fctInit==NULL || (iResult=(fctInit(pHLT, pRunLoader, options.Data())))<0) {
1761     AliError(Form("can not init HLT simulation: error %d (init %p)", iResult, fctInit));
1762   } else {
1763     // run the HLT simulation
1764     AliHLTSimulationRun_t fctRun=(AliHLTSimulationRun_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_RUN));
1765     if (fctRun==NULL || (iResult=(fctRun(pHLT, pRunLoader)))<0) {
1766       AliError(Form("can not run HLT simulation: error %d (run %p)", iResult, fctRun));
1767     }
1768   }
1769
1770   // delete the instance
1771   AliHLTSimulationDeleteInstance_t fctDelete=(AliHLTSimulationDeleteInstance_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_DELETE_INSTANCE));
1772   if (fctDelete==NULL || fctDelete(pHLT)<0) {
1773     AliError(Form("can not delete instance of HLT simulation (creator %p)", fctDelete));
1774   }
1775   pHLT=NULL;
1776
1777   return iResult>=0?kTRUE:kFALSE;
1778 }
1779
1780 //_____________________________________________________________________________
1781 Bool_t AliSimulation::RunQA()
1782 {
1783         // run the QA on summable hits, digits or digits
1784         
1785         fQASteer->SetRunLoader(gAlice->GetRunLoader()) ;
1786
1787         TString detectorsw("") ;  
1788         Bool_t rv = kTRUE ; 
1789         detectorsw = fQASteer->Run(fQADetectors.Data()) ; 
1790         if ( detectorsw.IsNull() ) 
1791                 rv = kFALSE ; 
1792         return rv ; 
1793 }
1794
1795 //_____________________________________________________________________________
1796 Bool_t AliSimulation::SetRunQA(TString detAndAction) 
1797 {
1798         // Allows to run QA for a selected set of detectors
1799         // and a selected set of tasks among HITS, SDIGITS and DIGITS
1800         // all selected detectors run the same selected tasks
1801         
1802         if (!detAndAction.Contains(":")) {
1803                 AliError( Form("%s is a wrong syntax, use \"DetectorList:ActionList\" \n", detAndAction.Data()) ) ;
1804                 fRunQA = kFALSE ;
1805                 return kFALSE ;                 
1806         }
1807         Int_t colon = detAndAction.Index(":") ; 
1808         fQADetectors = detAndAction(0, colon) ; 
1809         if (fQADetectors.Contains("ALL") )
1810                 fQADetectors = Form("%s %s", fMakeDigits.Data(), fMakeDigitsFromHits.Data()) ; 
1811                 fQATasks   = detAndAction(colon+1, detAndAction.Sizeof() ) ; 
1812         if (fQATasks.Contains("ALL") ) {
1813                 fQATasks = Form("%d %d %d", AliQA::kHITS, AliQA::kSDIGITS, AliQA::kDIGITS) ; 
1814         } else {
1815                 fQATasks.ToUpper() ; 
1816                 TString tempo("") ; 
1817                 if ( fQATasks.Contains("HIT") ) 
1818                         tempo = Form("%d ", AliQA::kHITS) ; 
1819                 if ( fQATasks.Contains("SDIGIT") ) 
1820                         tempo += Form("%d ", AliQA::kSDIGITS) ; 
1821                 if ( fQATasks.Contains("DIGIT") ) 
1822                         tempo += Form("%d ", AliQA::kDIGITS) ; 
1823                 fQATasks = tempo ; 
1824                 if (fQATasks.IsNull()) {
1825                         AliInfo("No QA requested\n")  ;
1826                         fRunQA = kFALSE ;
1827                         return kTRUE ; 
1828                 }
1829         }       
1830         TString tempo(fQATasks) ; 
1831     tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kHITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kHITS))        ;
1832     tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kSDIGITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kSDIGITS)) ;        
1833     tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kDIGITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kDIGITS)) ;  
1834         AliInfo( Form("QA will be done on \"%s\" for \"%s\"\n", fQADetectors.Data(), tempo.Data()) ) ;  
1835         fRunQA = kTRUE ;
1836         fQASteer->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
1837         fQASteer->SetTasks(fQATasks) ; 
1838         return kTRUE; 
1839
1840
1841 //_____________________________________________________________________________
1842 void AliSimulation::ProcessEnvironmentVars()
1843 {
1844 // Extract run number and random generator seed from env variables
1845
1846     AliInfo("Processing environment variables");
1847     
1848     // Random Number seed
1849     
1850     // first check that seed is not already set
1851     if (fSeed == 0) {
1852         if (gSystem->Getenv("CONFIG_SEED")) {
1853                 fSeed = atoi(gSystem->Getenv("CONFIG_SEED"));
1854         }
1855     } else {
1856         if (gSystem->Getenv("CONFIG_SEED")) {
1857                 AliInfo(Form("Seed for random number generation already set (%d)"
1858                              ": CONFIG_SEED variable ignored!", fSeed));
1859         }
1860     }
1861    
1862     AliInfo(Form("Seed for random number generation = %d ", fSeed)); 
1863
1864     // Run Number
1865     
1866     // first check that run number is not already set
1867     if(fRun < 0) {    
1868         if (gSystem->Getenv("DC_RUN")) {
1869                 fRun = atoi(gSystem->Getenv("DC_RUN"));
1870         }
1871     } else {
1872         if (gSystem->Getenv("DC_RUN")) {
1873                 AliInfo(Form("Run number already set (%d): DC_RUN variable ignored!", fRun));
1874         }
1875     }
1876     
1877     AliInfo(Form("Run number = %d", fRun)); 
1878 }
1879
1880 //---------------------------------------------------------------------
1881
1882 void AliSimulation::WriteGRPEntry()
1883 {
1884   // Get the necessary information from galice (generator, trigger etc) and
1885   // write a GRP entry corresponding to the settings in the Config.C used
1886   // note that Hall probes and Cavern and Surface Atmos pressures are not simulated.
1887
1888
1889   AliInfo("Writing global run parameters entry into the OCDB");
1890
1891   AliGRPObject* grpObj = new AliGRPObject();
1892
1893   grpObj->SetRunType("PHYSICS");
1894   grpObj->SetTimeStart(0);
1895   grpObj->SetTimeEnd(9999);
1896
1897   const AliGenerator *gen = gAlice->Generator();
1898   if (gen) {
1899     grpObj->SetBeamEnergy(gen->GetEnergyCMS());
1900     TString projectile;
1901     Int_t a,z;
1902     gen->GetProjectile(projectile,a,z);
1903     TString target;
1904     gen->GetTarget(target,a,z);
1905     TString beamType = projectile + "-" + target;
1906     if (!beamType.CompareTo("-")) {
1907
1908         grpObj->SetBeamType("UNKNOWN");
1909     }
1910     else {
1911         grpObj->SetBeamType(beamType);
1912     }
1913   }
1914   else {
1915     AliWarning("Unknown beam type and energy! Setting energy to 0");
1916     grpObj->SetBeamEnergy(0);
1917     grpObj->SetBeamType("UNKNOWN");
1918   }
1919
1920   UInt_t detectorPattern  = 0;
1921   Int_t nDets = 0;
1922   TObjArray *detArray = gAlice->Detectors();
1923   for (Int_t iDet = 0; iDet < AliDAQ::kNDetectors-1; iDet++) {
1924     if (detArray->FindObject(AliDAQ::OfflineModuleName(iDet))) {
1925       detectorPattern |= (1 << iDet);
1926       nDets++;
1927     }
1928   }
1929   // HLT
1930   if (!fRunHLT.IsNull())
1931     detectorPattern |= (1 << AliDAQ::kHLTId);
1932
1933   grpObj->SetNumberOfDetectors((Char_t)nDets);
1934   grpObj->SetDetectorMask((Int_t)detectorPattern);
1935   grpObj->SetLHCPeriod("LHC08c");
1936   grpObj->SetLHCState("STABLE_BEAMS");
1937   grpObj->SetLHCLuminosity(0,(AliGRPObject::Stats)0);
1938   grpObj->SetBeamIntensity(0,(AliGRPObject::Stats)0);
1939
1940   AliMagF *field = gAlice->Field();
1941   Float_t solenoidField = TMath::Abs(field->SolenoidField());
1942   Float_t factor = field->Factor();
1943   Float_t l3current = TMath::Abs(factor)*solenoidField*30000./5.;
1944   grpObj->SetL3Current(l3current,(AliGRPObject::Stats)0);
1945   
1946   if (factor > 0) {
1947     grpObj->SetL3Polarity(0);
1948     grpObj->SetDipolePolarity(0);
1949   }
1950   else {
1951     grpObj->SetL3Polarity(1);
1952     grpObj->SetDipolePolarity(1);
1953   }
1954
1955   if (TMath::Abs(factor) != 0)
1956     grpObj->SetDipoleCurrent(6000,(AliGRPObject::Stats)0);
1957   else 
1958     grpObj->SetDipoleCurrent(0,(AliGRPObject::Stats)0);
1959
1960   grpObj->SetCavernTemperature(0,(AliGRPObject::Stats)0);
1961   
1962   //grpMap->Add(new TObjString("fCavernPressure"),new TObjString("0")); ---> not inserted in simulation with the new object, since it is now an AliDCSSensor
1963
1964   // Now store the entry in OCDB
1965   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
1966
1967   AliCDBId id("GRP/GRP/Data", man->GetRun(), man->GetRun());
1968   AliCDBMetaData *metadata= new AliCDBMetaData();
1969
1970   metadata->SetResponsible("alice-off@cern.ch");
1971   metadata->SetComment("Automatically produced GRP entry for Monte Carlo");
1972  
1973   man->Put(grpObj,id,metadata);
1974 }
1975
1976