197e09062c472f68f4b44a5e46bca8dbfc33877a
[u/mrichter/AliRoot.git] / STEER / AliSimulation.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 //                                                                           //
20 // class for running generation, simulation and digitization                 //
21 //                                                                           //
22 // Hits, sdigits and digits are created for all detectors by typing:         //
23 //                                                                           //
24 //   AliSimulation sim;                                                      //
25 //   sim.Run();                                                              //
26 //                                                                           //
27 // The Run method returns kTRUE in case of successful execution.             //
28 // The number of events can be given as argument to the Run method or it     //
29 // can be set by                                                             //
30 //                                                                           //
31 //   sim.SetNumberOfEvents(n);                                               //
32 //                                                                           //
33 // The name of the configuration file can be passed as argument to the       //
34 // AliSimulation constructor or can be specified by                          //
35 //                                                                           //
36 //   sim.SetConfigFile("...");                                               //
37 //                                                                           //
38 // The generation of particles and the simulation of detector hits can be    //
39 // switched on or off by                                                     //
40 //                                                                           //
41 //   sim.SetRunGeneration(kTRUE);   // generation of primary particles       //
42 //   sim.SetRunSimulation(kFALSE);  // but no tracking                       //
43 //                                                                           //
44 // For which detectors sdigits and digits will be created, can be steered    //
45 // by                                                                        //
46 //                                                                           //
47 //   sim.SetMakeSDigits("ALL");     // make sdigits for all detectors        //
48 //   sim.SetMakeDigits("ITS TPC");  // make digits only for ITS and TPC      //
49 //                                                                           //
50 // The argument is a (case sensitive) string with the names of the           //
51 // detectors separated by a space. An empty string ("") can be used to       //
52 // disable the creation of sdigits or digits. The special string "ALL"       //
53 // selects all available detectors. This is the default.                     //
54 //                                                                           //
55 // The creation of digits from hits instead of from sdigits can be selected  //
56 // by                                                                        //
57 //                                                                           //
58 //   sim.SetMakeDigitsFromHits("TRD");                                       //
59 //                                                                           //
60 // The argument is again a string with the selected detectors. Be aware that //
61 // this feature is not available for all detectors and that merging is not   //
62 // possible, when digits are created directly from hits.                     //
63 //                                                                           //
64 // Background events can be merged by calling                                //
65 //                                                                           //
66 //   sim.MergeWith("background/galice.root", 2);                             //
67 //                                                                           //
68 // The first argument is the file name of the background galice file. The    //
69 // second argument is the number of signal events per background event.      //
70 // By default this number is calculated from the number of available         //
71 // background events. MergeWith can be called several times to merge more    //
72 // than two event streams. It is assumed that the sdigits were already       //
73 // produced for the background events.                                       //
74 //                                                                           //
75 // The output of raw data can be switched on by calling                      //
76 //                                                                           //
77 //   sim.SetWriteRawData("MUON");   // write raw data for MUON               //
78 //                                                                           //
79 // The default output format of the raw data are DDL files. They are         //
80 // converted to a DATE file, if a file name is given as second argument.     //
81 // For this conversion the program "dateStream" is required. If the file     //
82 // name has the extension ".root", the DATE file is converted to a root      //
83 // file. The program "alimdc" is used for this purpose. For the conversion   //
84 // to DATE and root format the two conversion programs have to be installed. //
85 // Only the raw data in the final format is kept if the third argument is    //
86 // kTRUE.                                                                    //
87 //                                                                           //
88 // The methods RunSimulation, RunSDigitization, RunDigitization,             //
89 // RunHitsDigitization and WriteRawData can be used to run only parts of     //
90 // the full simulation chain. The creation of raw data DDL files and their   //
91 // conversion to the DATE or root format can be run directly by calling      //
92 // the methods WriteRawFiles, ConvertRawFilesToDate and ConvertDateToRoot.   //
93 //                                                                           //
94 // The default number of events per file, which is usually set in the        //
95 // config file, can be changed for individual detectors and data types       //
96 // by calling                                                                //
97 //                                                                           //
98 //   sim.SetEventsPerFile("PHOS", "Reconstructed Points", 3);                //
99 //                                                                           //
100 // The first argument is the detector, the second one the data type and the  //
101 // last one the number of events per file. Valid data types are "Hits",      //
102 // "Summable Digits", "Digits", "Reconstructed Points" and "Tracks".         //
103 // The number of events per file has to be set before the simulation of      //
104 // hits. Otherwise it has no effect.                                         //
105 //                                                                           //
106 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
107
108 #include <TVirtualMCApplication.h>
109 #include <TGeoManager.h>
110 #include <TObjString.h>
111 #include <TSystem.h>
112 #include <TFile.h>
113 #include <TROOT.h>
114
115 #include "AliCodeTimer.h"
116 #include "AliCDBStorage.h"
117 #include "AliCDBEntry.h"
118 #include "AliCDBManager.h"
119 #include "AliGeomManager.h"
120 #include "AliAlignObj.h"
121 #include "AliCentralTrigger.h"
122 #include "AliDAQ.h"
123 #include "AliDigitizer.h"
124 #include "AliGenerator.h"
125 #include "AliLog.h"
126 #include "AliModule.h"
127 #include "AliRun.h"
128 #include "AliRunDigitizer.h"
129 #include "AliRunLoader.h"
130 #include "AliSimulation.h"
131 #include "AliVertexGenFile.h"
132 #include "AliCentralTrigger.h"
133 #include "AliCTPRawData.h"
134 #include "AliRawReaderFile.h"
135 #include "AliRawReaderRoot.h"
136 #include "AliRawReaderDate.h"
137 #include "AliESD.h"
138 #include "AliHeader.h"
139 #include "AliGenEventHeader.h"
140 #include "AliMC.h"
141 #include "AliHLTSimulation.h"
142 #include "AliSysInfo.h"
143 #include "AliMagF.h"
144 #include "AliGRPObject.h"
145
146 ClassImp(AliSimulation)
147
148 AliSimulation *AliSimulation::fgInstance = 0;
149 const char* AliSimulation::fgkDetectorName[AliSimulation::fgkNDetectors] = {"ITS", "TPC", "TRD", "TOF", "PHOS", "HMPID", "EMCAL", "MUON", "FMD", "ZDC", "PMD", "T0", "VZERO", "ACORDE", "HLT"};
150
151 //_____________________________________________________________________________
152 AliSimulation::AliSimulation(const char* configFileName,
153                              const char* name, const char* title) :
154   TNamed(name, title),
155
156   fRunGeneration(kTRUE),
157   fRunSimulation(kTRUE),
158   fLoadAlignFromCDB(kTRUE),
159   fLoadAlObjsListOfDets("ALL"),
160   fMakeSDigits("ALL"),
161   fMakeDigits("ALL"),
162   fMakeTrigger(""),
163   fMakeDigitsFromHits(""),
164   fWriteRawData(""),
165   fRawDataFileName(""),
166   fDeleteIntermediateFiles(kFALSE),
167   fWriteSelRawData(kFALSE),
168   fStopOnError(kFALSE),
169
170   fNEvents(1),
171   fConfigFileName(configFileName),
172   fGAliceFileName("galice.root"),
173   fEventsPerFile(),
174   fBkgrdFileNames(NULL),
175   fAlignObjArray(NULL),
176   fUseBkgrdVertex(kTRUE),
177   fRegionOfInterest(kFALSE),
178   fCDBUri(""),
179   fSpecCDBUri(),
180   fRun(-1),
181   fSeed(0),
182   fInitCDBCalled(kFALSE),
183   fInitRunNumberCalled(kFALSE),
184   fSetRunNumberFromDataCalled(kFALSE),
185   fEmbeddingFlag(kFALSE),
186   fQADetectors("ALL"),                  
187   fQATasks("ALL"),      
188   fQASteer(NULL), 
189   fRunQA(kTRUE), 
190   fRunHLT("default"),
191   fWriteGRPEntry(kTRUE)
192 {
193 // create simulation object with default parameters
194   fgInstance = this;
195   SetGAliceFile("galice.root");
196   
197 // for QA
198         fQASteer = new AliQADataMakerSteer("sim") ; 
199         fQASteer->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
200         fQATasks = Form("%d %d %d", AliQA::kHITS, AliQA::kSDIGITS, AliQA::kDIGITS) ; 
201         fQASteer->SetTasks(fQATasks) ;  
202 }
203
204 //_____________________________________________________________________________
205 AliSimulation::AliSimulation(const AliSimulation& sim) :
206   TNamed(sim),
207
208   fRunGeneration(sim.fRunGeneration),
209   fRunSimulation(sim.fRunSimulation),
210   fLoadAlignFromCDB(sim.fLoadAlignFromCDB),
211   fLoadAlObjsListOfDets(sim.fLoadAlObjsListOfDets),
212   fMakeSDigits(sim.fMakeSDigits),
213   fMakeDigits(sim.fMakeDigits),
214   fMakeTrigger(sim.fMakeTrigger),
215   fMakeDigitsFromHits(sim.fMakeDigitsFromHits),
216   fWriteRawData(sim.fWriteRawData),
217   fRawDataFileName(""),
218   fDeleteIntermediateFiles(kFALSE),
219   fWriteSelRawData(kFALSE),
220   fStopOnError(sim.fStopOnError),
221
222   fNEvents(sim.fNEvents),
223   fConfigFileName(sim.fConfigFileName),
224   fGAliceFileName(sim.fGAliceFileName),
225   fEventsPerFile(),
226   fBkgrdFileNames(NULL),
227   fAlignObjArray(NULL),
228   fUseBkgrdVertex(sim.fUseBkgrdVertex),
229   fRegionOfInterest(sim.fRegionOfInterest),
230   fCDBUri(sim.fCDBUri),
231   fSpecCDBUri(),
232   fRun(-1),
233   fSeed(0),
234   fInitCDBCalled(sim.fInitCDBCalled),
235   fInitRunNumberCalled(sim.fInitRunNumberCalled),
236   fSetRunNumberFromDataCalled(sim.fSetRunNumberFromDataCalled),
237   fEmbeddingFlag(sim.fEmbeddingFlag),
238   fQADetectors(sim.fQADetectors),                  
239         fQATasks(sim.fQATasks), 
240         fQASteer(sim.fQASteer), 
241   fRunQA(sim.fRunQA), 
242   fRunHLT(sim.fRunHLT),
243   fWriteGRPEntry(sim.fWriteGRPEntry)
244 {
245 // copy constructor
246
247   for (Int_t i = 0; i < sim.fEventsPerFile.GetEntriesFast(); i++) {
248     if (!sim.fEventsPerFile[i]) continue;
249     fEventsPerFile.Add(sim.fEventsPerFile[i]->Clone());
250   }
251
252   fBkgrdFileNames = new TObjArray;
253   for (Int_t i = 0; i < sim.fBkgrdFileNames->GetEntriesFast(); i++) {
254     if (!sim.fBkgrdFileNames->At(i)) continue;
255     fBkgrdFileNames->Add(sim.fBkgrdFileNames->At(i)->Clone());
256   }
257
258   for (Int_t i = 0; i < sim.fSpecCDBUri.GetEntriesFast(); i++) {
259     if (sim.fSpecCDBUri[i]) fSpecCDBUri.Add(sim.fSpecCDBUri[i]->Clone());
260   }
261   fgInstance = this;
262 }
263
264 //_____________________________________________________________________________
265 AliSimulation& AliSimulation::operator = (const AliSimulation& sim)
266 {
267 // assignment operator
268
269   this->~AliSimulation();
270   new(this) AliSimulation(sim);
271   return *this;
272 }
273
274 //_____________________________________________________________________________
275 AliSimulation::~AliSimulation()
276 {
277 // clean up
278
279   fEventsPerFile.Delete();
280 //  if(fAlignObjArray) fAlignObjArray->Delete(); // fAlignObjArray->RemoveAll() ???
281 //  delete fAlignObjArray; fAlignObjArray=0;
282
283   if (fBkgrdFileNames) {
284     fBkgrdFileNames->Delete();
285     delete fBkgrdFileNames;
286   }
287
288   fSpecCDBUri.Delete();
289   if (fgInstance==this) fgInstance = 0;
290
291         delete fQASteer ; 
292         
293   AliCodeTimer::Instance()->Print();
294 }
295
296
297 //_____________________________________________________________________________
298 void AliSimulation::SetNumberOfEvents(Int_t nEvents)
299 {
300 // set the number of events for one run
301
302   fNEvents = nEvents;
303 }
304
305 //_____________________________________________________________________________
306 void AliSimulation::InitCDB()
307 {
308 // activate a default CDB storage
309 // First check if we have any CDB storage set, because it is used 
310 // to retrieve the calibration and alignment constants
311
312   if (fInitCDBCalled) return;
313   fInitCDBCalled = kTRUE;
314
315   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
316   if (man->IsDefaultStorageSet())
317   {
318     AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
319     AliWarning("Default CDB storage has been already set !");
320     AliWarning(Form("Ignoring the default storage declared in AliSimulation: %s",fCDBUri.Data()));
321     AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
322     fCDBUri = man->GetDefaultStorage()->GetURI();
323   }
324   else {
325     if (fCDBUri.Length() > 0) 
326     {
327         AliDebug(2,"!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
328         AliDebug(2, Form("Default CDB storage is set to: %s", fCDBUri.Data()));
329         AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
330     } else {
331         fCDBUri="local://$ALICE_ROOT";
332         AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
333         AliWarning("Default CDB storage not yet set !!!!");
334         AliWarning(Form("Setting it now to: %s", fCDBUri.Data()));
335         AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
336                 
337     }
338     man->SetDefaultStorage(fCDBUri);
339   }
340
341   // Now activate the detector specific CDB storage locations
342   for (Int_t i = 0; i < fSpecCDBUri.GetEntriesFast(); i++) {
343     TObject* obj = fSpecCDBUri[i];
344     if (!obj) continue;
345     AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
346     AliDebug(2, Form("Specific CDB storage for %s is set to: %s",obj->GetName(),obj->GetTitle()));
347     AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
348     man->SetSpecificStorage(obj->GetName(), obj->GetTitle());
349   }
350       
351 }
352
353 //_____________________________________________________________________________
354 void AliSimulation::InitRunNumber(){
355 // check run number. If not set, set it to 0 !!!!
356   
357   if (fInitRunNumberCalled) return;
358   fInitRunNumberCalled = kTRUE;
359   
360   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
361   if (man->GetRun() >= 0)
362   {
363         AliFatal(Form("Run number cannot be set in AliCDBManager before start of simulation: "
364                         "Use external variable DC_RUN or AliSimulation::SetRun()!"));
365   }
366     
367   if(fRun >= 0) {
368         AliDebug(2,"!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
369         AliDebug(2, Form("Setting CDB run number to: %d",fRun));
370         AliDebug(2, "!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
371   } else {
372         fRun=0;
373         AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
374         AliWarning("Run number not yet set !!!!");
375         AliWarning(Form("Setting it now to: %d", fRun));
376         AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
377         
378   }
379   man->SetRun(fRun);
380
381   man->Print();
382
383 }
384
385 //_____________________________________________________________________________
386 void AliSimulation::SetCDBLock() {
387   // Set CDB lock: from now on it is forbidden to reset the run number
388   // or the default storage or to activate any further storage!
389   
390   AliCDBManager::Instance()->SetLock(1);
391 }
392
393 //_____________________________________________________________________________
394 void AliSimulation::SetDefaultStorage(const char* uri) {
395 // Store the desired default CDB storage location
396 // Activate it later within the Run() method
397
398   fCDBUri = uri;
399
400 }
401
402 //_____________________________________________________________________________
403 void AliSimulation::SetSpecificStorage(const char* calibType, const char* uri) {
404 // Store a detector-specific CDB storage location
405 // Activate it later within the Run() method
406
407   AliCDBPath aPath(calibType);
408   if(!aPath.IsValid()){
409         AliError(Form("Not a valid path: %s", calibType));
410         return;
411   }
412
413   TObject* obj = fSpecCDBUri.FindObject(calibType);
414   if (obj) fSpecCDBUri.Remove(obj);
415   fSpecCDBUri.Add(new TNamed(calibType, uri));
416
417 }
418
419 //_____________________________________________________________________________
420 void AliSimulation::SetRunNumber(Int_t run)
421 {
422 // sets run number
423 // Activate it later within the Run() method
424
425         fRun = run;
426 }
427
428 //_____________________________________________________________________________
429 void AliSimulation::SetSeed(Int_t seed)
430 {
431 // sets seed number
432 // Activate it later within the Run() method
433
434         fSeed = seed;
435 }
436
437 //_____________________________________________________________________________
438 Bool_t AliSimulation::SetRunNumberFromData()
439 {
440   // Set the CDB manager run number
441   // The run number is retrieved from gAlice
442
443     if (fSetRunNumberFromDataCalled) return kTRUE;
444     fSetRunNumberFromDataCalled = kTRUE;    
445   
446     AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
447     Int_t runData = -1, runCDB = -1;
448   
449     AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
450     if (!runLoader) return kFALSE;
451     else {
452         runData = runLoader->GetAliRun()->GetHeader()->GetRun();
453         delete runLoader;
454     }
455   
456     runCDB = man->GetRun();
457     if(runCDB >= 0) {
458         if (runCDB != runData) {
459                 AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");
460                 AliWarning(Form("A run number was previously set in AliCDBManager: %d !", runCDB));
461                 AliWarning(Form("It will be replaced with the run number got from run header: %d !", runData));
462                 AliWarning("!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!");    
463         }
464         
465     }
466       
467     man->SetRun(runData);
468     fRun = runData;
469     
470     if(man->GetRun() < 0) {
471         AliError("Run number not properly initalized!");
472         return kFALSE;
473     }
474   
475     man->Print();
476     
477     return kTRUE;
478 }
479
480 //_____________________________________________________________________________
481 void AliSimulation::SetConfigFile(const char* fileName)
482 {
483 // set the name of the config file
484
485   fConfigFileName = fileName;
486 }
487
488 //_____________________________________________________________________________
489 void AliSimulation::SetGAliceFile(const char* fileName)
490 {
491 // set the name of the galice file
492 // the path is converted to an absolute one if it is relative
493
494   fGAliceFileName = fileName;
495   if (!gSystem->IsAbsoluteFileName(fGAliceFileName)) {
496     char* absFileName = gSystem->ConcatFileName(gSystem->WorkingDirectory(),
497                                                 fGAliceFileName);
498     fGAliceFileName = absFileName;
499     delete[] absFileName;
500   }
501
502   AliDebug(2, Form("galice file name set to %s", fileName));
503 }
504
505 //_____________________________________________________________________________
506 void AliSimulation::SetEventsPerFile(const char* detector, const char* type, 
507                                      Int_t nEvents)
508 {
509 // set the number of events per file for the given detector and data type
510 // ("Hits", "Summable Digits", "Digits", "Reconstructed Points" or "Tracks")
511
512   TNamed* obj = new TNamed(detector, type);
513   obj->SetUniqueID(nEvents);
514   fEventsPerFile.Add(obj);
515 }
516
517 //_____________________________________________________________________________
518 Bool_t AliSimulation::MisalignGeometry(AliRunLoader *runLoader)
519 {
520   // Read the alignment objects from CDB.
521   // Each detector is supposed to have the
522   // alignment objects in DET/Align/Data CDB path.
523   // All the detector objects are then collected,
524   // sorted by geometry level (starting from ALIC) and
525   // then applied to the TGeo geometry.
526   // Finally an overlaps check is performed.
527
528   if (!AliGeomManager::GetGeometry() || !AliGeomManager::GetGeometry()->IsClosed()) {
529     AliError("Can't apply the misalignment! Geometry is not loaded or it is still opened!");
530     return kFALSE;
531   }  
532   
533   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
534   InitCDB();
535 //  if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
536   SetCDBLock();
537     
538   Bool_t delRunLoader = kFALSE;
539   if (!runLoader) {
540     runLoader = LoadRun("READ");
541     if (!runLoader) return kFALSE;
542     delRunLoader = kTRUE;
543   }
544   
545   // Export ideal geometry 
546   if(!gAlice->IsRootGeometry()) AliGeomManager::GetGeometry()->Export("geometry.root");
547
548   // Load alignment data from CDB and apply to geometry through AliGeomManager
549   if(fLoadAlignFromCDB){
550     
551     TString detStr = fLoadAlObjsListOfDets;
552     TString loadAlObjsListOfDets = "";
553     
554     TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
555     for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
556       AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
557       if (!det || !det->IsActive()) continue;
558       if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
559         //add det to list of dets to be aligned from CDB
560         loadAlObjsListOfDets += det->GetName();
561         loadAlObjsListOfDets += " ";
562       }
563     } // end loop over detectors
564     loadAlObjsListOfDets.Prepend("GRP "); //add alignment objects for non-sensitive modules
565     AliGeomManager::ApplyAlignObjsFromCDB(loadAlObjsListOfDets.Data());
566   }else{
567     // Check if the array with alignment objects was
568     // provided by the user. If yes, apply the objects
569     // to the present TGeo geometry
570     if (fAlignObjArray) {
571       if (AliGeomManager::ApplyAlignObjsToGeom(*fAlignObjArray) == kFALSE) {
572         AliError("The misalignment of one or more volumes failed!"
573                  "Compare the list of simulated detectors and the list of detector alignment data!");
574         if (delRunLoader) delete runLoader;
575         return kFALSE;
576       }
577     }
578   }
579
580   // Update the internal geometry of modules (ITS needs it)
581   TString detStr = fLoadAlObjsListOfDets;
582   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
583   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
584
585     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
586     if (!det || !det->IsActive()) continue;
587     if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
588       det->UpdateInternalGeometry();
589     }
590   } // end loop over detectors
591
592
593   if (delRunLoader) delete runLoader;
594
595   return kTRUE;
596 }
597
598 //_____________________________________________________________________________
599 void AliSimulation::MergeWith(const char* fileName, Int_t nSignalPerBkgrd)
600 {
601 // add a file with background events for merging
602
603   TObjString* fileNameStr = new TObjString(fileName);
604   fileNameStr->SetUniqueID(nSignalPerBkgrd);
605   if (!fBkgrdFileNames) fBkgrdFileNames = new TObjArray;
606   fBkgrdFileNames->Add(fileNameStr);
607 }
608
609 void AliSimulation::EmbedInto(const char* fileName, Int_t nSignalPerBkgrd)
610 {
611 // add a file with background events for embeddin
612   MergeWith(fileName, nSignalPerBkgrd);
613   fEmbeddingFlag = kTRUE;
614 }
615
616 //_____________________________________________________________________________
617 Bool_t AliSimulation::Run(Int_t nEvents)
618 {
619 // run the generation, simulation and digitization
620
621  
622   AliCodeTimerAuto("")
623   
624   // Load run number and seed from environmental vars
625   ProcessEnvironmentVars();
626
627   gRandom->SetSeed(fSeed);
628    
629   if (nEvents > 0) fNEvents = nEvents;
630
631   // generation and simulation -> hits
632   if (fRunGeneration) {
633     if (!RunSimulation()) if (fStopOnError) return kFALSE;
634   }
635            
636   // initialize CDB storage from external environment
637   // (either CDB manager or AliSimulation setters),
638   // if not already done in RunSimulation()
639   InitCDB();
640   
641   // Set run number in CDBManager from data 
642   // From this point on the run number must be always loaded from data!
643   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
644   
645   // Set CDB lock: from now on it is forbidden to reset the run number
646   // or the default storage or to activate any further storage!
647   SetCDBLock();
648
649   // If RunSimulation was not called, load the geometry and misalign it
650   if (!AliGeomManager::GetGeometry()) {
651     // Initialize the geometry manager
652     AliGeomManager::LoadGeometry("geometry.root");
653     
654 //    // Check that the consistency of symbolic names for the activated subdetectors
655 //    // in the geometry loaded by AliGeomManager
656 //    AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
657 //    if (!runLoader) return kFALSE;
658 //
659 //    TString detsToBeChecked = "";
660 //    TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
661 //    for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
662 //      AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
663 //      if (!det || !det->IsActive()) continue;
664 //      detsToBeChecked += det->GetName();
665 //      detsToBeChecked += " ";
666 //    } // end loop over detectors
667 //    if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT(detsToBeChecked.Data()))
668     if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT("ALL"))
669         AliFatalClass("Current loaded geometry differs in the definition of symbolic names!");
670         
671     if (!AliGeomManager::GetGeometry()) if (fStopOnError) return kFALSE;
672     // Misalign geometry
673     if(!MisalignGeometry()) if (fStopOnError) return kFALSE;
674   }
675
676
677   // hits -> summable digits
678   AliSysInfo::AddStamp("Start_sdigitization");
679   if (!fMakeSDigits.IsNull()) {
680     if (!RunSDigitization(fMakeSDigits)) if (fStopOnError) return kFALSE;
681  
682   }
683   AliSysInfo::AddStamp("Stop_sdigitization");
684   
685   AliSysInfo::AddStamp("Start_digitization");  
686   // summable digits -> digits  
687   if (!fMakeDigits.IsNull()) {
688     if (!RunDigitization(fMakeDigits, fMakeDigitsFromHits)) {
689       if (fStopOnError) return kFALSE;
690     }
691    }
692   AliSysInfo::AddStamp("Stop_digitization");
693
694   
695   
696   // hits -> digits
697   if (!fMakeDigitsFromHits.IsNull()) {
698     if (fBkgrdFileNames && (fBkgrdFileNames->GetEntriesFast() > 0)) {
699       AliWarning(Form("Merging and direct creation of digits from hits " 
700                  "was selected for some detectors. "
701                  "No merging will be done for the following detectors: %s",
702                  fMakeDigitsFromHits.Data()));
703     }
704     if (!RunHitsDigitization(fMakeDigitsFromHits)) {
705       if (fStopOnError) return kFALSE;
706     }
707   }
708
709   
710   
711   // digits -> trigger
712   if (!RunTrigger(fMakeTrigger,fMakeDigits)) {
713     if (fStopOnError) return kFALSE;
714   }
715
716   
717   
718   // digits -> raw data
719   if (!fWriteRawData.IsNull()) {
720     if (!WriteRawData(fWriteRawData, fRawDataFileName, 
721                       fDeleteIntermediateFiles,fWriteSelRawData)) {
722       if (fStopOnError) return kFALSE;
723     }
724   }
725
726   
727   // run HLT simulation on simulated digit data if raw data is not
728   // simulated, otherwise its called as part of WriteRawData
729   if (!fRunHLT.IsNull() && fWriteRawData.IsNull()) {
730     if (!RunHLT()) {
731       if (fStopOnError) return kFALSE;
732     }
733   }
734   
735   //QA
736         if (fRunQA) {
737                 Bool_t rv = RunQA() ; 
738                 if (!rv)
739                         if (fStopOnError) 
740                                 return kFALSE ;         
741         }
742
743   // Cleanup of CDB manager: cache and active storages!
744   AliCDBManager::Instance()->ClearCache();
745
746   return kTRUE;
747 }
748
749 //_____________________________________________________________________________
750 Bool_t AliSimulation::RunTrigger(const char* config, const char* detectors)
751 {
752   // run the trigger
753
754   AliCodeTimerAuto("")
755
756   // initialize CDB storage from external environment
757   // (either CDB manager or AliSimulation setters),
758   // if not already done in RunSimulation()
759   InitCDB();
760   
761   // Set run number in CDBManager from data 
762   // From this point on the run number must be always loaded from data!
763   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
764   
765   // Set CDB lock: from now on it is forbidden to reset the run number
766   // or the default storage or to activate any further storage!
767   SetCDBLock();
768    
769    AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
770    if (!runLoader) return kFALSE;
771    TString trconfiguration = config;
772
773    if (trconfiguration.IsNull()) {
774      if (strcmp(gAlice->GetTriggerDescriptor(),"")) {
775        trconfiguration = gAlice->GetTriggerDescriptor();
776      }
777      else
778        AliWarning("No trigger descriptor is specified. Loading the one that is in the CDB.");
779    }
780
781    runLoader->MakeTree( "GG" );
782    AliCentralTrigger* aCTP = runLoader->GetTrigger();
783    // Load Configuration
784    if (!aCTP->LoadConfiguration( trconfiguration ))
785      return kFALSE;
786
787    // digits -> trigger
788    if( !aCTP->RunTrigger( runLoader , detectors ) ) {
789       if (fStopOnError) {
790         //  delete aCTP;
791         return kFALSE;
792       }
793    }
794
795    delete runLoader;
796
797    return kTRUE;
798 }
799
800 //_____________________________________________________________________________
801 Bool_t AliSimulation::WriteTriggerRawData()
802 {
803   // Writes the CTP (trigger) DDL raw data
804   // Details of the format are given in the
805   // trigger TDR - pages 134 and 135.
806   AliCTPRawData writer;
807   writer.RawData();
808
809   return kTRUE;
810 }
811
812 //_____________________________________________________________________________
813 Bool_t AliSimulation::RunSimulation(Int_t nEvents)
814 {
815 // run the generation and simulation
816
817   AliCodeTimerAuto("")
818
819   // initialize CDB storage and run number from external environment
820   // (either CDB manager or AliSimulation setters)
821   InitCDB();
822   InitRunNumber();
823   SetCDBLock();
824   
825   if (!gAlice) {
826     AliError("no gAlice object. Restart aliroot and try again.");
827     return kFALSE;
828   }
829   if (gAlice->Modules()->GetEntries() > 0) {
830     AliError("gAlice was already run. Restart aliroot and try again.");
831     return kFALSE;
832   }
833
834   AliInfo(Form("initializing gAlice with config file %s",
835           fConfigFileName.Data()));
836   StdoutToAliInfo(StderrToAliError(
837     gAlice->Init(fConfigFileName.Data());
838   ););
839   
840   // Get the trigger descriptor string
841   // Either from AliSimulation or from
842   // gAlice
843   if (fMakeTrigger.IsNull()) {
844     if (strcmp(gAlice->GetTriggerDescriptor(),""))
845       fMakeTrigger = gAlice->GetTriggerDescriptor();
846   }
847   else
848     gAlice->SetTriggerDescriptor(fMakeTrigger.Data());
849
850   // Set run number in CDBManager
851   AliInfo(Form("Run number: %d",AliCDBManager::Instance()->GetRun()));
852
853   AliRunLoader* runLoader = gAlice->GetRunLoader();
854   if (!runLoader) {
855              AliError(Form("gAlice has no run loader object. "
856                              "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
857              return kFALSE;
858   }
859   SetGAliceFile(runLoader->GetFileName());
860       
861   // Misalign geometry
862 #if ROOT_VERSION_CODE < 331527
863   AliGeomManager::SetGeometry(gGeoManager);
864   
865   // Check that the consistency of symbolic names for the activated subdetectors
866   // in the geometry loaded by AliGeomManager
867   TString detsToBeChecked = "";
868   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
869   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
870     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
871     if (!det || !det->IsActive()) continue;
872     detsToBeChecked += det->GetName();
873     detsToBeChecked += " ";
874   } // end loop over detectors
875   if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT(detsToBeChecked.Data()))
876     AliFatalClass("Current loaded geometry differs in the definition of symbolic names!");
877   MisalignGeometry(runLoader);
878 #endif
879
880 //   AliRunLoader* runLoader = gAlice->GetRunLoader();
881 //   if (!runLoader) {
882 //     AliError(Form("gAlice has no run loader object. "
883 //                   "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
884 //     return kFALSE;
885 //   }
886 //   SetGAliceFile(runLoader->GetFileName());
887
888   if (!gAlice->Generator()) {
889     AliError(Form("gAlice has no generator object. "
890                   "Check your config file: %s", fConfigFileName.Data()));
891     return kFALSE;
892   }
893
894   // Write GRP entry corresponding to the setting found in Cofig.C
895   if (fWriteGRPEntry)
896     WriteGRPEntry();
897
898   if (nEvents <= 0) nEvents = fNEvents;
899
900   // get vertex from background file in case of merging
901   if (fUseBkgrdVertex &&
902       fBkgrdFileNames && (fBkgrdFileNames->GetEntriesFast() > 0)) {
903     Int_t signalPerBkgrd = GetNSignalPerBkgrd(nEvents);
904     const char* fileName = ((TObjString*)
905                             (fBkgrdFileNames->At(0)))->GetName();
906     AliInfo(Form("The vertex will be taken from the background "
907                  "file %s with nSignalPerBackground = %d", 
908                  fileName, signalPerBkgrd));
909     AliVertexGenFile* vtxGen = new AliVertexGenFile(fileName, signalPerBkgrd);
910     gAlice->Generator()->SetVertexGenerator(vtxGen);
911   }
912
913   if (!fRunSimulation) {
914     gAlice->Generator()->SetTrackingFlag(0);
915   }
916
917   // set the number of events per file for given detectors and data types
918   for (Int_t i = 0; i < fEventsPerFile.GetEntriesFast(); i++) {
919     if (!fEventsPerFile[i]) continue;
920     const char* detName = fEventsPerFile[i]->GetName();
921     const char* typeName = fEventsPerFile[i]->GetTitle();
922     TString loaderName(detName);
923     loaderName += "Loader";
924     AliLoader* loader = runLoader->GetLoader(loaderName);
925     if (!loader) {
926       AliError(Form("RunSimulation", "no loader for %s found\n"
927                     "Number of events per file not set for %s %s", 
928                     detName, typeName, detName));
929       continue;
930     }
931     AliDataLoader* dataLoader = 
932       loader->GetDataLoader(typeName);
933     if (!dataLoader) {
934       AliError(Form("no data loader for %s found\n"
935                     "Number of events per file not set for %s %s", 
936                     typeName, detName, typeName));
937       continue;
938     }
939     dataLoader->SetNumberOfEventsPerFile(fEventsPerFile[i]->GetUniqueID());
940     AliDebug(1, Form("number of events per file set to %d for %s %s",
941                      fEventsPerFile[i]->GetUniqueID(), detName, typeName));
942   }
943
944   AliInfo("running gAlice");
945   AliSysInfo::AddStamp("Start_simulation");
946   StdoutToAliInfo(StderrToAliError(
947     gAlice->Run(nEvents);
948   ););
949   AliSysInfo::AddStamp("Stop_simulation");
950   delete runLoader;
951
952   return kTRUE;
953 }
954
955 //_____________________________________________________________________________
956 Bool_t AliSimulation::RunSDigitization(const char* detectors)
957 {
958 // run the digitization and produce summable digits
959   static Int_t eventNr=0;
960   AliCodeTimerAuto("")
961
962   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
963   InitCDB();
964   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
965   SetCDBLock();
966   
967   AliRunLoader* runLoader = LoadRun();
968   if (!runLoader) return kFALSE;
969
970   TString detStr = detectors;
971   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
972   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
973     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
974     if (!det || !det->IsActive()) continue;
975     if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
976       AliInfo(Form("creating summable digits for %s", det->GetName()));
977       AliCodeTimerAuto(Form("creating summable digits for %s", det->GetName()));
978       det->Hits2SDigits();
979       AliSysInfo::AddStamp(Form("Digit_%s_%d",det->GetName(),eventNr), 0,1, eventNr);
980     }
981   }
982
983   if ((detStr.CompareTo("ALL") != 0) && !detStr.IsNull()) {
984     AliError(Form("the following detectors were not found: %s",
985                   detStr.Data()));
986     if (fStopOnError) return kFALSE;
987   }
988   eventNr++;
989   delete runLoader;
990
991   return kTRUE;
992 }
993
994
995 //_____________________________________________________________________________
996 Bool_t AliSimulation::RunDigitization(const char* detectors, 
997                                       const char* excludeDetectors)
998 {
999 // run the digitization and produce digits from sdigits
1000
1001   AliCodeTimerAuto("")
1002
1003   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
1004   InitCDB();
1005   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
1006   SetCDBLock();
1007   
1008   while (AliRunLoader::GetRunLoader()) delete AliRunLoader::GetRunLoader();
1009   if (gAlice) delete gAlice;
1010   gAlice = NULL;
1011
1012   Int_t nStreams = 1;
1013   if (fBkgrdFileNames) nStreams = fBkgrdFileNames->GetEntriesFast() + 1;
1014   Int_t signalPerBkgrd = GetNSignalPerBkgrd();
1015   AliRunDigitizer* manager = new AliRunDigitizer(nStreams, signalPerBkgrd);
1016   // manager->SetEmbeddingFlag(fEmbeddingFlag);
1017   manager->SetInputStream(0, fGAliceFileName.Data());
1018   for (Int_t iStream = 1; iStream < nStreams; iStream++) {
1019     const char* fileName = ((TObjString*)
1020                             (fBkgrdFileNames->At(iStream-1)))->GetName();
1021     manager->SetInputStream(iStream, fileName);
1022   }
1023
1024   TString detStr = detectors;
1025   TString detExcl = excludeDetectors;
1026   manager->GetInputStream(0)->ImportgAlice();
1027   AliRunLoader* runLoader = 
1028     AliRunLoader::GetRunLoader(manager->GetInputStream(0)->GetFolderName());
1029   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
1030   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
1031     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
1032     if (!det || !det->IsActive()) continue;
1033     if (IsSelected(det->GetName(), detStr) && 
1034         !IsSelected(det->GetName(), detExcl)) {
1035       AliDigitizer* digitizer = det->CreateDigitizer(manager);
1036       
1037       if (!digitizer) {
1038         AliError(Form("no digitizer for %s", det->GetName()));
1039         if (fStopOnError) return kFALSE;
1040       } else {
1041         digitizer->SetRegionOfInterest(fRegionOfInterest);
1042       }
1043     }
1044   }
1045
1046   if ((detStr.CompareTo("ALL") != 0) && !detStr.IsNull()) {
1047     AliError(Form("the following detectors were not found: %s", 
1048                   detStr.Data()));
1049     if (fStopOnError) return kFALSE;
1050   }
1051
1052   if (!manager->GetListOfTasks()->IsEmpty()) {
1053     AliInfo("executing digitization");
1054     manager->Exec("");
1055   }
1056
1057   delete manager;
1058
1059   return kTRUE;
1060 }
1061
1062 //_____________________________________________________________________________
1063 Bool_t AliSimulation::RunHitsDigitization(const char* detectors)
1064 {
1065 // run the digitization and produce digits from hits
1066
1067   AliCodeTimerAuto("")
1068
1069   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
1070   InitCDB();
1071   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
1072   SetCDBLock();
1073   
1074   AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
1075   if (!runLoader) return kFALSE;
1076
1077   TString detStr = detectors;
1078   TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
1079   for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
1080     AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
1081     if (!det || !det->IsActive()) continue;
1082     if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
1083       AliInfo(Form("creating digits from hits for %s", det->GetName()));
1084       det->Hits2Digits();
1085     }
1086   }
1087
1088   if ((detStr.CompareTo("ALL") != 0) && !detStr.IsNull()) {
1089     AliError(Form("the following detectors were not found: %s", 
1090                   detStr.Data()));
1091     if (fStopOnError) return kFALSE;
1092   }
1093
1094   return kTRUE;
1095 }
1096
1097 //_____________________________________________________________________________
1098 Bool_t AliSimulation::WriteRawData(const char* detectors, 
1099                                    const char* fileName,
1100                                    Bool_t deleteIntermediateFiles,
1101                                    Bool_t selrawdata)
1102 {
1103 // convert the digits to raw data
1104 // First DDL raw data files for the given detectors are created.
1105 // If a file name is given, the DDL files are then converted to a DATE file.
1106 // If deleteIntermediateFiles is true, the DDL raw files are deleted 
1107 // afterwards.
1108 // If the file name has the extension ".root", the DATE file is converted
1109 // to a root file.
1110 // If deleteIntermediateFiles is true, the DATE file is deleted afterwards.
1111 // 'selrawdata' flag can be used to enable writing of detectors raw data
1112 // accoring to the trigger cluster.
1113
1114   AliCodeTimerAuto("")
1115   
1116   TString detStr = detectors;
1117   if (!WriteRawFiles(detStr.Data())) {
1118     if (fStopOnError) return kFALSE;
1119   }
1120
1121   // run HLT simulation on simulated DDL raw files
1122   // and produce HLT ddl raw files to be included in date/root file
1123   if (IsSelected("HLT", detStr) && !fRunHLT.IsNull()) {
1124     if (!RunHLT()) {
1125       if (fStopOnError) return kFALSE;
1126     }
1127   }
1128
1129   TString dateFileName(fileName);
1130   if (!dateFileName.IsNull()) {
1131     Bool_t rootOutput = dateFileName.EndsWith(".root");
1132     if (rootOutput) dateFileName += ".date";
1133     TString selDateFileName;
1134     if (selrawdata) {
1135       selDateFileName = "selected.";
1136       selDateFileName+= dateFileName;
1137     }
1138     if (!ConvertRawFilesToDate(dateFileName,selDateFileName)) {
1139       if (fStopOnError) return kFALSE;
1140     }
1141     if (deleteIntermediateFiles) {
1142       AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
1143       if (runLoader) for (Int_t iEvent = 0; 
1144                           iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1145         char command[256];
1146         sprintf(command, "rm -r raw%d", iEvent);
1147         gSystem->Exec(command);
1148       }
1149     }
1150
1151     if (rootOutput) {
1152       if (!ConvertDateToRoot(dateFileName, fileName)) {
1153         if (fStopOnError) return kFALSE;
1154       }
1155       if (deleteIntermediateFiles) {
1156         gSystem->Unlink(dateFileName);
1157       }
1158       if (selrawdata) {
1159         TString selFileName = "selected.";
1160         selFileName        += fileName;
1161         if (!ConvertDateToRoot(selDateFileName, selFileName)) {
1162           if (fStopOnError) return kFALSE;
1163         }
1164         if (deleteIntermediateFiles) {
1165           gSystem->Unlink(selDateFileName);
1166         }
1167       }
1168     }
1169   }
1170
1171   return kTRUE;
1172 }
1173
1174 //_____________________________________________________________________________
1175 Bool_t AliSimulation::WriteRawFiles(const char* detectors)
1176 {
1177 // convert the digits to raw data DDL files
1178
1179   AliCodeTimerAuto("")
1180   
1181   AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
1182   if (!runLoader) return kFALSE;
1183
1184   // write raw data to DDL files
1185   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1186     AliInfo(Form("processing event %d", iEvent));
1187     runLoader->GetEvent(iEvent);
1188     TString baseDir = gSystem->WorkingDirectory();
1189     char dirName[256];
1190     sprintf(dirName, "raw%d", iEvent);
1191     gSystem->MakeDirectory(dirName);
1192     if (!gSystem->ChangeDirectory(dirName)) {
1193       AliError(Form("couldn't change to directory %s", dirName));
1194       if (fStopOnError) return kFALSE; else continue;
1195     }
1196
1197     ofstream runNbFile(Form("run%u",runLoader->GetHeader()->GetRun()));
1198     runNbFile.close();
1199
1200     TString detStr = detectors;
1201     if (IsSelected("HLT", detStr)) {
1202       // Do nothing. "HLT" will be removed from detStr and HLT raw
1203       // data files are generated in RunHLT.
1204     }
1205
1206     TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
1207     for (Int_t iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
1208       AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
1209       if (!det || !det->IsActive()) continue;
1210       if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
1211         AliInfo(Form("creating raw data from digits for %s", det->GetName()));
1212         det->Digits2Raw();
1213       }
1214     }
1215
1216     if (!WriteTriggerRawData())
1217       if (fStopOnError) return kFALSE;
1218
1219     gSystem->ChangeDirectory(baseDir);
1220     if ((detStr.CompareTo("ALL") != 0) && !detStr.IsNull()) {
1221       AliError(Form("the following detectors were not found: %s", 
1222                     detStr.Data()));
1223       if (fStopOnError) return kFALSE;
1224     }
1225   }
1226
1227   delete runLoader;
1228   
1229   return kTRUE;
1230 }
1231
1232 //_____________________________________________________________________________
1233 Bool_t AliSimulation::ConvertRawFilesToDate(const char* dateFileName,
1234                                             const char* selDateFileName)
1235 {
1236 // convert raw data DDL files to a DATE file with the program "dateStream"
1237 // The second argument is not empty when the user decides to write
1238 // the detectors raw data according to the trigger cluster.
1239
1240   AliCodeTimerAuto("")
1241   
1242   char* path = gSystem->Which(gSystem->Getenv("PATH"), "dateStream");
1243   if (!path) {
1244     AliError("the program dateStream was not found");
1245     if (fStopOnError) return kFALSE;
1246   } else {
1247     delete[] path;
1248   }
1249
1250   AliRunLoader* runLoader = LoadRun("READ");
1251   if (!runLoader) return kFALSE;
1252
1253   AliInfo(Form("converting raw data DDL files to DATE file %s", dateFileName));
1254   Bool_t selrawdata = kFALSE;
1255   if (strcmp(selDateFileName,"") != 0) selrawdata = kTRUE;
1256
1257   char command[256];
1258   // Note the option -s. It is used in order to avoid
1259   // the generation of SOR/EOR events.
1260   sprintf(command, "dateStream -c -s -D -o %s -# %d -C -run %d", 
1261           dateFileName, runLoader->GetNumberOfEvents(),runLoader->GetHeader()->GetRun());
1262   FILE* pipe = gSystem->OpenPipe(command, "w");
1263
1264   Int_t selEvents = 0;
1265   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1266
1267     UInt_t detectorPattern = 0;
1268     runLoader->GetEvent(iEvent);
1269     if (!runLoader->LoadTrigger()) {
1270       AliCentralTrigger *aCTP = runLoader->GetTrigger();
1271       detectorPattern = aCTP->GetClusterMask();
1272       // Check if the event was triggered by CTP
1273       if (selrawdata) {
1274         if (aCTP->GetClassMask()) selEvents++;
1275       }
1276     }
1277     else {
1278       AliWarning("No trigger can be loaded! Some fields in the event header will be empty !");
1279       if (selrawdata) {
1280         AliWarning("No trigger can be loaded! Writing of selected raw data is abandoned !");
1281         selrawdata = kFALSE;
1282       }
1283     }
1284
1285     fprintf(pipe, "GDC DetectorPattern %u\n", detectorPattern);
1286     Float_t ldc = 0;
1287     Int_t prevLDC = -1;
1288
1289     // loop over detectors and DDLs
1290     for (Int_t iDet = 0; iDet < AliDAQ::kNDetectors; iDet++) {
1291       for (Int_t iDDL = 0; iDDL < AliDAQ::NumberOfDdls(iDet); iDDL++) {
1292
1293         Int_t ddlID = AliDAQ::DdlID(iDet,iDDL);
1294         Int_t ldcID = Int_t(ldc + 0.0001);
1295         ldc += AliDAQ::NumberOfLdcs(iDet) / AliDAQ::NumberOfDdls(iDet);
1296
1297         char rawFileName[256];
1298         sprintf(rawFileName, "raw%d/%s", 
1299                 iEvent, AliDAQ::DdlFileName(iDet,iDDL));
1300
1301         // check existence and size of raw data file
1302         FILE* file = fopen(rawFileName, "rb");
1303         if (!file) continue;
1304         fseek(file, 0, SEEK_END);
1305         unsigned long size = ftell(file);
1306         fclose(file);
1307         if (!size) continue;
1308
1309         if (ldcID != prevLDC) {
1310           fprintf(pipe, " LDC Id %d\n", ldcID);
1311           prevLDC = ldcID;
1312         }
1313         fprintf(pipe, "  Equipment Id %d Payload %s\n", ddlID, rawFileName);
1314       }
1315     }
1316   }
1317
1318   Int_t result = gSystem->ClosePipe(pipe);
1319
1320   if (!(selrawdata && selEvents > 0)) {
1321     delete runLoader;
1322     return (result == 0);
1323   }
1324
1325   AliInfo(Form("converting selected by trigger cluster raw data DDL files to DATE file %s", selDateFileName));
1326   
1327   sprintf(command, "dateStream -c -s -D -o %s -# %d -C -run %d", 
1328           selDateFileName,selEvents,runLoader->GetHeader()->GetRun());
1329   FILE* pipe2 = gSystem->OpenPipe(command, "w");
1330
1331   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1332
1333     // Get the trigger decision and cluster
1334     UInt_t detectorPattern = 0;
1335     TString detClust;
1336     runLoader->GetEvent(iEvent);
1337     if (!runLoader->LoadTrigger()) {
1338       AliCentralTrigger *aCTP = runLoader->GetTrigger();
1339       if (aCTP->GetClassMask() == 0) continue;
1340       detectorPattern = aCTP->GetClusterMask();
1341       detClust = AliDAQ::ListOfTriggeredDetectors(detectorPattern);
1342       AliInfo(Form("List of detectors to be read out: %s",detClust.Data()));
1343     }
1344
1345     fprintf(pipe2, "GDC DetectorPattern %u\n", detectorPattern);
1346     Float_t ldc = 0;
1347     Int_t prevLDC = -1;
1348
1349     // loop over detectors and DDLs
1350     for (Int_t iDet = 0; iDet < AliDAQ::kNDetectors; iDet++) {
1351       // Write only raw data from detectors that
1352       // are contained in the trigger cluster(s)
1353       if (!IsSelected(AliDAQ::DetectorName(iDet),detClust)) continue;
1354
1355       for (Int_t iDDL = 0; iDDL < AliDAQ::NumberOfDdls(iDet); iDDL++) {
1356
1357         Int_t ddlID = AliDAQ::DdlID(iDet,iDDL);
1358         Int_t ldcID = Int_t(ldc + 0.0001);
1359         ldc += AliDAQ::NumberOfLdcs(iDet) / AliDAQ::NumberOfDdls(iDet);
1360
1361         char rawFileName[256];
1362         sprintf(rawFileName, "raw%d/%s", 
1363                 iEvent, AliDAQ::DdlFileName(iDet,iDDL));
1364
1365         // check existence and size of raw data file
1366         FILE* file = fopen(rawFileName, "rb");
1367         if (!file) continue;
1368         fseek(file, 0, SEEK_END);
1369         unsigned long size = ftell(file);
1370         fclose(file);
1371         if (!size) continue;
1372
1373         if (ldcID != prevLDC) {
1374           fprintf(pipe2, " LDC Id %d\n", ldcID);
1375           prevLDC = ldcID;
1376         }
1377         fprintf(pipe2, "  Equipment Id %d Payload %s\n", ddlID, rawFileName);
1378       }
1379     }
1380   }
1381
1382   Int_t result2 = gSystem->ClosePipe(pipe2);
1383
1384   delete runLoader;
1385   return ((result == 0) && (result2 == 0));
1386 }
1387
1388 //_____________________________________________________________________________
1389 Bool_t AliSimulation::ConvertDateToRoot(const char* dateFileName,
1390                                         const char* rootFileName)
1391 {
1392 // convert a DATE file to a root file with the program "alimdc"
1393
1394   // ALIMDC setup
1395   const Int_t kDBSize = 2000000000;
1396   const Int_t kTagDBSize = 1000000000;
1397   const Bool_t kFilter = kFALSE;
1398   const Int_t kCompression = 1;
1399
1400   char* path = gSystem->Which(gSystem->Getenv("PATH"), "alimdc");
1401   if (!path) {
1402     AliError("the program alimdc was not found");
1403     if (fStopOnError) return kFALSE;
1404   } else {
1405     delete[] path;
1406   }
1407
1408   AliInfo(Form("converting DATE file %s to root file %s", 
1409                dateFileName, rootFileName));
1410
1411   const char* rawDBFS[2] = { "/tmp/mdc1", "/tmp/mdc2" };
1412   const char* tagDBFS    = "/tmp/mdc1/tags";
1413
1414   // User defined file system locations
1415   if (gSystem->Getenv("ALIMDC_RAWDB1")) 
1416     rawDBFS[0] = gSystem->Getenv("ALIMDC_RAWDB1");
1417   if (gSystem->Getenv("ALIMDC_RAWDB2")) 
1418     rawDBFS[1] = gSystem->Getenv("ALIMDC_RAWDB2");
1419   if (gSystem->Getenv("ALIMDC_TAGDB")) 
1420     tagDBFS = gSystem->Getenv("ALIMDC_TAGDB");
1421
1422   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",rawDBFS[0]));
1423   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",rawDBFS[1]));
1424   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",tagDBFS));
1425
1426   gSystem->Exec(Form("mkdir %s",rawDBFS[0]));
1427   gSystem->Exec(Form("mkdir %s",rawDBFS[1]));
1428   gSystem->Exec(Form("mkdir %s",tagDBFS));
1429
1430   Int_t result = gSystem->Exec(Form("alimdc %d %d %d %d %s", 
1431                                     kDBSize, kTagDBSize, kFilter, kCompression, dateFileName));
1432   gSystem->Exec(Form("mv %s/*.root %s", rawDBFS[0], rootFileName));
1433
1434   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",rawDBFS[0]));
1435   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",rawDBFS[1]));
1436   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s",tagDBFS));
1437
1438   return (result == 0);
1439 }
1440
1441
1442 //_____________________________________________________________________________
1443 AliRunLoader* AliSimulation::LoadRun(const char* mode) const
1444 {
1445 // delete existing run loaders, open a new one and load gAlice
1446
1447   while (AliRunLoader::GetRunLoader()) delete AliRunLoader::GetRunLoader();
1448   AliRunLoader* runLoader = 
1449     AliRunLoader::Open(fGAliceFileName.Data(), 
1450                        AliConfig::GetDefaultEventFolderName(), mode);
1451   if (!runLoader) {
1452     AliError(Form("no run loader found in file %s", fGAliceFileName.Data()));
1453     return NULL;
1454   }
1455   runLoader->LoadgAlice();
1456   runLoader->LoadHeader();
1457   gAlice = runLoader->GetAliRun();
1458   if (!gAlice) {
1459     AliError(Form("no gAlice object found in file %s", 
1460                   fGAliceFileName.Data()));
1461     return NULL;
1462   }
1463   return runLoader;
1464 }
1465
1466 //_____________________________________________________________________________
1467 Int_t AliSimulation::GetNSignalPerBkgrd(Int_t nEvents) const
1468 {
1469 // get or calculate the number of signal events per background event
1470
1471   if (!fBkgrdFileNames) return 1;
1472   Int_t nBkgrdFiles = fBkgrdFileNames->GetEntriesFast();
1473   if (nBkgrdFiles == 0) return 1;
1474
1475   // get the number of signal events
1476   if (nEvents <= 0) {
1477     AliRunLoader* runLoader = 
1478         AliRunLoader::Open(fGAliceFileName.Data(), "SIGNAL");
1479     if (!runLoader) return 1;
1480     
1481     nEvents = runLoader->GetNumberOfEvents();
1482     delete runLoader;
1483   }
1484
1485   Int_t result = 0;
1486   for (Int_t iBkgrdFile = 0; iBkgrdFile < nBkgrdFiles; iBkgrdFile++) {
1487     // get the number of background events
1488     const char* fileName = ((TObjString*)
1489                             (fBkgrdFileNames->At(iBkgrdFile)))->GetName();
1490     AliRunLoader* runLoader =
1491       AliRunLoader::Open(fileName, "BKGRD");
1492     if (!runLoader) continue;
1493     Int_t nBkgrdEvents = runLoader->GetNumberOfEvents();
1494     delete runLoader;
1495   
1496     // get or calculate the number of signal per background events
1497     Int_t nSignalPerBkgrd = fBkgrdFileNames->At(iBkgrdFile)->GetUniqueID();
1498     if (nSignalPerBkgrd <= 0) {
1499       nSignalPerBkgrd = (nEvents-1) / nBkgrdEvents + 1;
1500     } else if (result && (result != nSignalPerBkgrd)) {
1501       AliInfo(Form("the number of signal events per background event "
1502                    "will be changed from %d to %d for stream %d", 
1503                    nSignalPerBkgrd, result, iBkgrdFile+1));
1504       nSignalPerBkgrd = result;
1505     }
1506
1507     if (!result) result = nSignalPerBkgrd;
1508     if (nSignalPerBkgrd * nBkgrdEvents < nEvents) {
1509       AliWarning(Form("not enough background events (%d) for %d signal events "
1510                       "using %d signal per background events for stream %d",
1511                       nBkgrdEvents, nEvents, nSignalPerBkgrd, iBkgrdFile+1));
1512     }
1513   }
1514
1515   return result;
1516 }
1517
1518 //_____________________________________________________________________________
1519 Bool_t AliSimulation::IsSelected(TString detName, TString& detectors) const
1520 {
1521 // check whether detName is contained in detectors
1522 // if yes, it is removed from detectors
1523
1524   // check if all detectors are selected
1525   if ((detectors.CompareTo("ALL") == 0) ||
1526       detectors.BeginsWith("ALL ") ||
1527       detectors.EndsWith(" ALL") ||
1528       detectors.Contains(" ALL ")) {
1529     detectors = "ALL";
1530     return kTRUE;
1531   }
1532
1533   // search for the given detector
1534   Bool_t result = kFALSE;
1535   if ((detectors.CompareTo(detName) == 0) ||
1536       detectors.BeginsWith(detName+" ") ||
1537       detectors.EndsWith(" "+detName) ||
1538       detectors.Contains(" "+detName+" ")) {
1539     detectors.ReplaceAll(detName, "");
1540     result = kTRUE;
1541   }
1542
1543   // clean up the detectors string
1544   while (detectors.Contains("  ")) detectors.ReplaceAll("  ", " ");
1545   while (detectors.BeginsWith(" ")) detectors.Remove(0, 1);
1546   while (detectors.EndsWith(" ")) detectors.Remove(detectors.Length()-1, 1);
1547
1548   return result;
1549 }
1550
1551 //_____________________________________________________________________________
1552 Bool_t AliSimulation::ConvertRaw2SDigits(const char* rawDirectory, const char* esdFileName) 
1553 {
1554 //
1555 // Steering routine  to convert raw data in directory rawDirectory/ to fake SDigits. 
1556 // These can be used for embedding of MC tracks into RAW data using the standard 
1557 // merging procedure.
1558 //
1559 // If an ESD file is given the reconstructed vertex is taken from it and stored in the event header.
1560 //
1561     if (!gAlice) {
1562         AliError("no gAlice object. Restart aliroot and try again.");
1563         return kFALSE;
1564     }
1565     if (gAlice->Modules()->GetEntries() > 0) {
1566         AliError("gAlice was already run. Restart aliroot and try again.");
1567         return kFALSE;
1568     }
1569     
1570     AliInfo(Form("initializing gAlice with config file %s",fConfigFileName.Data()));
1571     StdoutToAliInfo(StderrToAliError(gAlice->Init(fConfigFileName.Data());););
1572 //
1573 //  Initialize CDB     
1574     InitCDB();
1575     //AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
1576     //man->SetRun(0); // Should this come from rawdata header ?
1577     
1578     Int_t iDet;
1579     //
1580     // Get the runloader
1581     AliRunLoader* runLoader = gAlice->GetRunLoader();
1582     //
1583     // Open esd file if available
1584     TFile* esdFile = TFile::Open(esdFileName);
1585     Bool_t esdOK = (esdFile != 0);
1586     AliESD* esd = new AliESD;
1587     TTree* treeESD = 0;
1588     if (esdOK) {
1589         treeESD = (TTree*) esdFile->Get("esdTree");
1590         if (!treeESD) {
1591             AliWarning("No ESD tree found");
1592             esdOK = kFALSE;
1593         } else {
1594             treeESD->SetBranchAddress("ESD", &esd);
1595         }
1596     }
1597     //
1598     // Create the RawReader
1599     TString fileName(rawDirectory);
1600     AliRawReader* rawReader = 0x0;
1601     if (fileName.EndsWith("/")) {
1602       rawReader = new AliRawReaderFile(fileName);
1603     } else if (fileName.EndsWith(".root")) {
1604       rawReader = new AliRawReaderRoot(fileName);
1605     } else if (!fileName.IsNull()) {
1606       rawReader = new AliRawReaderDate(fileName);
1607     }
1608 //     if (!fEquipIdMap.IsNull() && fRawReader)
1609 //       fRawReader->LoadEquipmentIdsMap(fEquipIdMap);
1610     //
1611     // Get list of detectors
1612     TObjArray* detArray = runLoader->GetAliRun()->Detectors();
1613     //
1614     // Get Header
1615     AliHeader* header = runLoader->GetHeader();
1616     //
1617     TString detStr = fMakeSDigits;
1618     // Event loop
1619     Int_t nev = 0;
1620     while(kTRUE) {
1621         if (!(rawReader->NextEvent())) break;
1622         //
1623         // Detector loop
1624         for (iDet = 0; iDet < detArray->GetEntriesFast(); iDet++) {
1625             AliModule* det = (AliModule*) detArray->At(iDet);
1626             if (!det || !det->IsActive()) continue;
1627             if (IsSelected(det->GetName(), detStr)) {
1628               AliInfo(Form("Calling Raw2SDigits for %s\n", det->GetName()));
1629               det->Raw2SDigits(rawReader);
1630               rawReader->Reset();
1631             }
1632         } // detectors
1633
1634
1635         //
1636         //  If ESD information available obtain reconstructed vertex and store in header.
1637         if (esdOK) {
1638             treeESD->GetEvent(nev);
1639             const AliESDVertex* esdVertex = esd->GetPrimaryVertex();
1640             Double_t position[3];
1641             esdVertex->GetXYZ(position);
1642             AliGenEventHeader* mcHeader = new  AliGenEventHeader("ESD");
1643             TArrayF mcV;
1644             mcV.Set(3);
1645             for (Int_t i = 0; i < 3; i++) mcV[i] = position[i];
1646             mcHeader->SetPrimaryVertex(mcV);
1647             header->Reset(0,nev);
1648             header->SetGenEventHeader(mcHeader);
1649             printf("***** Saved vertex %f %f %f \n", position[0], position[1], position[2]);
1650         }
1651         nev++;
1652 //
1653 //      Finish the event
1654         runLoader->TreeE()->Fill();
1655         runLoader->SetNextEvent();
1656     } // events
1657  
1658     delete rawReader;
1659 //
1660 //  Finish the run 
1661     runLoader->CdGAFile();
1662     runLoader->WriteHeader("OVERWRITE");
1663     runLoader->WriteRunLoader();
1664
1665     return kTRUE;
1666 }
1667
1668 //_____________________________________________________________________________
1669 Int_t AliSimulation::GetDetIndex(const char* detector)
1670 {
1671   // return the detector index corresponding to detector
1672   Int_t index = -1 ; 
1673   for (index = 0; index < fgkNDetectors ; index++) {
1674     if ( strcmp(detector, fgkDetectorName[index]) == 0 )
1675           break ; 
1676   }     
1677   return index ; 
1678 }
1679
1680 //_____________________________________________________________________________
1681 Bool_t AliSimulation::RunHLT()
1682 {
1683   // Run the HLT simulation
1684   // HLT simulation is implemented in HLT/sim/AliHLTSimulation
1685   // Disabled if fRunHLT is empty, default vaule is "default".
1686   // AliSimulation::SetRunHLT can be used to set the options for HLT simulation
1687   // The default simulation depends on the HLT component libraries and their
1688   // corresponding agents which define components and chains to run. See
1689   // http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt-current/
1690   // http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt-current/classAliHLTModuleAgent.html
1691   //
1692   // The libraries to be loaded can be specified as an option.
1693   // <pre>
1694   // AliSimulation sim;
1695   // sim.SetRunHLT("libAliHLTSample.so");
1696   // </pre>
1697   // will only load <tt>libAliHLTSample.so</tt>
1698
1699   // Other available options:
1700   // \li loglevel=<i>level</i> <br>
1701   //     logging level for this processing
1702   // \li alilog=off
1703   //     disable redirection of log messages to AliLog class
1704   // \li config=<i>macro</i>
1705   //     configuration macro
1706   // \li chains=<i>configuration</i>
1707   //     comma separated list of configurations to be run during simulation
1708   // \li rawfile=<i>file</i>
1709   //     source for the RawReader to be created, the default is <i>./</i> if
1710   //     raw data is simulated
1711
1712   int iResult=0;
1713   AliRunLoader* pRunLoader = LoadRun("READ");
1714   if (!pRunLoader) return kFALSE;
1715
1716   // initialize CDB storage, run number, set CDB lock
1717   InitCDB();
1718   if (!SetRunNumberFromData()) if (fStopOnError) return kFALSE;
1719   SetCDBLock();
1720   
1721   // load the library dynamically
1722   gSystem->Load(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY);
1723
1724   // check for the library version
1725   AliHLTSimulationGetLibraryVersion_t fctVersion=(AliHLTSimulationGetLibraryVersion_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_GET_LIBRARY_VERSION));
1726   if (!fctVersion) {
1727     AliError(Form("can not load library %s", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY));
1728     return kFALSE;
1729   }
1730   if (fctVersion()!= ALIHLTSIMULATION_LIBRARY_VERSION) {
1731     AliError(Form("%s version does not match: compiled for version %d, loaded %d", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_LIBRARY_VERSION, fctVersion()));
1732     return kFALSE;
1733   }
1734
1735   // print compile info
1736   typedef void (*CompileInfo)( char*& date, char*& time);
1737   CompileInfo fctInfo=(CompileInfo)gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, "CompileInfo");
1738   if (fctInfo) {
1739     Char_t* date=0;
1740     Char_t* time=0;
1741     (*fctInfo)(date,time);
1742     if (!date) {date=new Char_t[8]; strcpy(date,"unknown");}
1743     if (!time) {time=new Char_t[8]; strcpy(time,"unknown");}
1744     AliInfo(Form("%s build on %s (%s)", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, date, time));
1745     delete date;
1746     delete time;
1747   } else {
1748     AliInfo(Form("no build info available for %s", ALIHLTSIMULATION_LIBRARY));
1749   }
1750
1751   // create instance of the HLT simulation
1752   AliHLTSimulationCreateInstance_t fctCreate=(AliHLTSimulationCreateInstance_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_CREATE_INSTANCE));
1753   AliHLTSimulation* pHLT=NULL;
1754   if (fctCreate==NULL || (pHLT=(fctCreate()))==NULL) {
1755     AliError(Form("can not create instance of HLT simulation (creator %p)", fctCreate));
1756     return kFALSE;    
1757   }
1758
1759   // init the HLT simulation
1760   TString options;
1761   if (fRunHLT.CompareTo("default")!=0) options=fRunHLT;
1762   TString detStr = fWriteRawData;
1763   if (!IsSelected("HLT", detStr)) {
1764     options+=" writerawfiles=";
1765   } else {
1766     options+=" writerawfiles=HLT";
1767   }
1768
1769   if (!detStr.IsNull() && !options.Contains("rawfile=")) {
1770     // as a matter of fact, HLT will run reconstruction and needs the RawReader
1771     // in order to get detector data. By default, RawReaderFile is used to read
1772     // the already simulated ddl files. Date and Root files from the raw data
1773     // are generated after the HLT simulation.
1774     options+=" rawfile=./";
1775   }
1776
1777   AliHLTSimulationInit_t fctInit=(AliHLTSimulationInit_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_INIT));
1778   if (fctInit==NULL || (iResult=(fctInit(pHLT, pRunLoader, options.Data())))<0) {
1779     AliError(Form("can not init HLT simulation: error %d (init %p)", iResult, fctInit));
1780   } else {
1781     // run the HLT simulation
1782     AliHLTSimulationRun_t fctRun=(AliHLTSimulationRun_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_RUN));
1783     if (fctRun==NULL || (iResult=(fctRun(pHLT, pRunLoader)))<0) {
1784       AliError(Form("can not run HLT simulation: error %d (run %p)", iResult, fctRun));
1785     }
1786   }
1787
1788   // delete the instance
1789   AliHLTSimulationDeleteInstance_t fctDelete=(AliHLTSimulationDeleteInstance_t)(gSystem->DynFindSymbol(ALIHLTSIMULATION_LIBRARY, ALIHLTSIMULATION_DELETE_INSTANCE));
1790   if (fctDelete==NULL || fctDelete(pHLT)<0) {
1791     AliError(Form("can not delete instance of HLT simulation (creator %p)", fctDelete));
1792   }
1793   pHLT=NULL;
1794
1795   return iResult>=0?kTRUE:kFALSE;
1796 }
1797
1798 //_____________________________________________________________________________
1799 Bool_t AliSimulation::RunQA()
1800 {
1801         // run the QA on summable hits, digits or digits
1802         
1803   if(!gAlice) return kFALSE;
1804         fQASteer->SetRunLoader(gAlice->GetRunLoader()) ;
1805
1806         TString detectorsw("") ;  
1807         Bool_t rv = kTRUE ; 
1808         detectorsw = fQASteer->Run(fQADetectors.Data()) ; 
1809         if ( detectorsw.IsNull() ) 
1810                 rv = kFALSE ; 
1811   else 
1812     fQASteer->EndOfCycle(detectorsw) ; 
1813         return rv ; 
1814 }
1815
1816 //_____________________________________________________________________________
1817 Bool_t AliSimulation::SetRunQA(TString detAndAction) 
1818 {
1819         // Allows to run QA for a selected set of detectors
1820         // and a selected set of tasks among HITS, SDIGITS and DIGITS
1821         // all selected detectors run the same selected tasks
1822         
1823         if (!detAndAction.Contains(":")) {
1824                 AliError( Form("%s is a wrong syntax, use \"DetectorList:ActionList\" \n", detAndAction.Data()) ) ;
1825                 fRunQA = kFALSE ;
1826                 return kFALSE ;                 
1827         }
1828         Int_t colon = detAndAction.Index(":") ; 
1829         fQADetectors = detAndAction(0, colon) ; 
1830         if (fQADetectors.Contains("ALL") )
1831                 fQADetectors = Form("%s %s", fMakeDigits.Data(), fMakeDigitsFromHits.Data()) ; 
1832                 fQATasks   = detAndAction(colon+1, detAndAction.Sizeof() ) ; 
1833         if (fQATasks.Contains("ALL") ) {
1834                 fQATasks = Form("%d %d %d", AliQA::kHITS, AliQA::kSDIGITS, AliQA::kDIGITS) ; 
1835         } else {
1836                 fQATasks.ToUpper() ; 
1837                 TString tempo("") ; 
1838                 if ( fQATasks.Contains("HIT") ) 
1839                         tempo = Form("%d ", AliQA::kHITS) ; 
1840                 if ( fQATasks.Contains("SDIGIT") ) 
1841                         tempo += Form("%d ", AliQA::kSDIGITS) ; 
1842                 if ( fQATasks.Contains("DIGIT") ) 
1843                         tempo += Form("%d ", AliQA::kDIGITS) ; 
1844                 fQATasks = tempo ; 
1845                 if (fQATasks.IsNull()) {
1846                         AliInfo("No QA requested\n")  ;
1847                         fRunQA = kFALSE ;
1848                         return kTRUE ; 
1849                 }
1850         }       
1851         TString tempo(fQATasks) ; 
1852     tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kHITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kHITS))        ;
1853     tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kSDIGITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kSDIGITS)) ;        
1854     tempo.ReplaceAll(Form("%d", AliQA::kDIGITS), AliQA::GetTaskName(AliQA::kDIGITS)) ;  
1855         AliInfo( Form("QA will be done on \"%s\" for \"%s\"\n", fQADetectors.Data(), tempo.Data()) ) ;  
1856         fRunQA = kTRUE ;
1857         fQASteer->SetActiveDetectors(fQADetectors) ; 
1858         fQASteer->SetTasks(fQATasks) ; 
1859         return kTRUE; 
1860
1861
1862 //_____________________________________________________________________________
1863 void AliSimulation::ProcessEnvironmentVars()
1864 {
1865 // Extract run number and random generator seed from env variables
1866
1867     AliInfo("Processing environment variables");
1868     
1869     // Random Number seed
1870     
1871     // first check that seed is not already set
1872     if (fSeed == 0) {
1873         if (gSystem->Getenv("CONFIG_SEED")) {
1874                 fSeed = atoi(gSystem->Getenv("CONFIG_SEED"));
1875         }
1876     } else {
1877         if (gSystem->Getenv("CONFIG_SEED")) {
1878                 AliInfo(Form("Seed for random number generation already set (%d)"
1879                              ": CONFIG_SEED variable ignored!", fSeed));
1880         }
1881     }
1882    
1883     AliInfo(Form("Seed for random number generation = %d ", fSeed)); 
1884
1885     // Run Number
1886     
1887     // first check that run number is not already set
1888     if(fRun < 0) {    
1889         if (gSystem->Getenv("DC_RUN")) {
1890                 fRun = atoi(gSystem->Getenv("DC_RUN"));
1891         }
1892     } else {
1893         if (gSystem->Getenv("DC_RUN")) {
1894                 AliInfo(Form("Run number already set (%d): DC_RUN variable ignored!", fRun));
1895         }
1896     }
1897     
1898     AliInfo(Form("Run number = %d", fRun)); 
1899 }
1900
1901 //---------------------------------------------------------------------
1902
1903 void AliSimulation::WriteGRPEntry()
1904 {
1905   // Get the necessary information from galice (generator, trigger etc) and
1906   // write a GRP entry corresponding to the settings in the Config.C used
1907   // note that Hall probes and Cavern and Surface Atmos pressures are not simulated.
1908
1909
1910   AliInfo("Writing global run parameters entry into the OCDB");
1911
1912   AliGRPObject* grpObj = new AliGRPObject();
1913
1914   grpObj->SetRunType("PHYSICS");
1915   grpObj->SetTimeStart(0);
1916   grpObj->SetTimeEnd(9999);
1917
1918   const AliGenerator *gen = gAlice->Generator();
1919   if (gen) {
1920     grpObj->SetBeamEnergy(gen->GetEnergyCMS());
1921     TString projectile;
1922     Int_t a,z;
1923     gen->GetProjectile(projectile,a,z);
1924     TString target;
1925     gen->GetTarget(target,a,z);
1926     TString beamType = projectile + "-" + target;
1927     beamType.ReplaceAll(" ","");
1928     if (!beamType.CompareTo("-")) {
1929
1930         grpObj->SetBeamType("UNKNOWN");
1931     }
1932     else {
1933         grpObj->SetBeamType(beamType);
1934     }
1935   }
1936   else {
1937     AliWarning("Unknown beam type and energy! Setting energy to 0");
1938     grpObj->SetBeamEnergy(0);
1939     grpObj->SetBeamType("UNKNOWN");
1940   }
1941
1942   UInt_t detectorPattern  = 0;
1943   Int_t nDets = 0;
1944   TObjArray *detArray = gAlice->Detectors();
1945   for (Int_t iDet = 0; iDet < AliDAQ::kNDetectors-1; iDet++) {
1946     if (detArray->FindObject(AliDAQ::OfflineModuleName(iDet))) {
1947       detectorPattern |= (1 << iDet);
1948       nDets++;
1949     }
1950   }
1951   // CTP
1952   if (!fMakeTrigger.IsNull() || strcmp(gAlice->GetTriggerDescriptor(),""))
1953     detectorPattern |= (1 << AliDAQ::DetectorID("TRG"));
1954
1955   // HLT
1956   if (!fRunHLT.IsNull())
1957     detectorPattern |= (1 << AliDAQ::kHLTId);
1958
1959   grpObj->SetNumberOfDetectors((Char_t)nDets);
1960   grpObj->SetDetectorMask((Int_t)detectorPattern);
1961   grpObj->SetLHCPeriod("LHC08c");
1962   grpObj->SetLHCState("STABLE_BEAMS");
1963   grpObj->SetLHCLuminosity(0,(AliGRPObject::Stats)0);
1964   grpObj->SetBeamIntensity(0,(AliGRPObject::Stats)0);
1965
1966   AliMagF *field = gAlice->Field();
1967   Float_t solenoidField = TMath::Abs(field->SolenoidField());
1968   Float_t factor = field->Factor();
1969   Float_t l3current = TMath::Abs(factor)*solenoidField*30000./5.;
1970   grpObj->SetL3Current(l3current,(AliGRPObject::Stats)0);
1971   
1972   if (factor > 0) {
1973     grpObj->SetL3Polarity(0);
1974     grpObj->SetDipolePolarity(0);
1975   }
1976   else {
1977     grpObj->SetL3Polarity(1);
1978     grpObj->SetDipolePolarity(1);
1979   }
1980
1981   if (TMath::Abs(factor) != 0)
1982     grpObj->SetDipoleCurrent(6000,(AliGRPObject::Stats)0);
1983   else 
1984     grpObj->SetDipoleCurrent(0,(AliGRPObject::Stats)0);
1985
1986   grpObj->SetCavernTemperature(0,(AliGRPObject::Stats)0);
1987   
1988   //grpMap->Add(new TObjString("fCavernPressure"),new TObjString("0")); ---> not inserted in simulation with the new object, since it is now an AliDCSSensor
1989
1990   // Now store the entry in OCDB
1991   AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
1992
1993   AliCDBId id("GRP/GRP/Data", man->GetRun(), man->GetRun(), 1, 1);
1994   AliCDBMetaData *metadata= new AliCDBMetaData();
1995
1996   metadata->SetResponsible("alice-off@cern.ch");
1997   metadata->SetComment("Automatically produced GRP entry for Monte Carlo");
1998  
1999   man->Put(grpObj,id,metadata);
2000 }
2001
2002