STEER/AliVertexerTracks.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-2003, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //-----------------------------------------------------------------
  17 //    Implementation of the vertexer from tracks
  18 //
  19 // Origin: AliITSVertexerTracks
  20 //         A.Dainese, Padova,
  21 //         andrea.dainese@pd.infn.it
  22 //         M.Masera,  Torino,
  23 //         massimo.masera@to.infn.it
  24 // Moved to STEER and adapted to ESD tracks:
  25 //         F.Prino,  Torino, prino@to.infn.it
  26 //-----------------------------------------------------------------
  27
  28 //---- Root headers --------
  29 #include <TSystem.h>
  30 #include <TClonesArray.h>
  31 #include <TDirectory.h>
  32 #include <TFile.h>
  33 //---- AliRoot headers -----
  34 #include "AliStrLine.h"
  35 #include "AliExternalTrackParam.h"
  36 #include "AliNeutralTrackParam.h"
  37 #include "AliVEvent.h"
  38 #include "AliVTrack.h"
  39 #include "AliESDtrack.h"
  40 #include "AliVertexerTracks.h"
  41
  42 ClassImp(AliVertexerTracks)
  43
  44
  45 //----------------------------------------------------------------------------
  46 AliVertexerTracks::AliVertexerTracks():
  47 TObject(),
  48 fVert(),
  49 fCurrentVertex(0),
  50 fMode(0),
  51 fFieldkG(-999.),
  52 fTrkArraySel(),
  53 fIdSel(0),
  54 fTrksToSkip(0),
  55 fNTrksToSkip(0),
  56 fConstraint(kFALSE),
  57 fOnlyFitter(kFALSE),
  58 fMinTracks(1),
  59 fMinClusters(5),
  60 fDCAcut(0.1),
  61 fDCAcutIter0(0.1),
  62 fNSigma(3.),
  63 fMaxd0z0(0.5),
  64 fMinDetFitter(100.),
  65 fMaxTgl(1000.),
  66 fITSrefit(kTRUE),
  67 fITSpureSA(kFALSE),
  68 fFiducialR(3.),
  69 fFiducialZ(30.),
  70 fnSigmaForUi00(1.5),
  71 fAlgo(1),
  72 fAlgoIter0(4)
  73 {
  74 //
  75 // Default constructor
  76 //
  77   SetVtxStart();
  78   SetVtxStartSigma();
  79 }
  80 //----------------------------------------------------------------------------
  81 AliVertexerTracks::AliVertexerTracks(Double_t fieldkG):
  82 TObject(),
  83 fVert(),
  84 fCurrentVertex(0),
  85 fMode(0),
  86 fFieldkG(fieldkG),
  87 fTrkArraySel(),
  88 fIdSel(0),
  89 fTrksToSkip(0),
  90 fNTrksToSkip(0),
  91 fConstraint(kFALSE),
  92 fOnlyFitter(kFALSE),
  93 fMinTracks(1),
  94 fMinClusters(5),
  95 fDCAcut(0.1),
  96 fDCAcutIter0(0.1),
  97 fNSigma(3.),
  98 fMaxd0z0(0.5),
  99 fMinDetFitter(100.),
 100 fMaxTgl(1000.),
 101 fITSrefit(kTRUE),
 102 fITSpureSA(kFALSE),
 103 fFiducialR(3.),
 104 fFiducialZ(30.),
 105 fnSigmaForUi00(1.5),
 106 fAlgo(1),
 107 fAlgoIter0(4)
 108 {
 109 //
 110 // Standard constructor
 111 //
 112   SetVtxStart();
 113   SetVtxStartSigma();
 114 }
 115 //-----------------------------------------------------------------------------
 116 AliVertexerTracks::~AliVertexerTracks()
 117 {
 118   // Default Destructor
 119   // The objects pointed by the following pointer are not owned
 120   // by this class and are not deleted
 121   fCurrentVertex = 0;
 122   if(fTrksToSkip) { delete [] fTrksToSkip; fTrksToSkip=NULL; }
 123   if(fIdSel) { delete [] fIdSel; fIdSel=NULL; }
 124 }
 125 //----------------------------------------------------------------------------
 126 AliESDVertex* AliVertexerTracks::FindPrimaryVertex(const AliVEvent *vEvent)
 127 {
 128 //
 129 // Primary vertex for current ESD or AOD event
 130 // (Two iterations:
 131 //  1st with 5*fNSigma*sigma cut w.r.t. to initial vertex
 132 //      + cut on sqrt(d0d0+z0z0) if fConstraint=kFALSE
 133 //  2nd with fNSigma*sigma cut w.r.t. to vertex found in 1st iteration)
 134 //
 135   fCurrentVertex = 0;
 136
 137   TString evtype = vEvent->IsA()->GetName();
 138   Bool_t inputAOD = ((evtype=="AliAODEvent") ? kTRUE : kFALSE);
 139
 140   if(inputAOD && fMode==1) {
 141     printf("Error : AliVertexerTracks: no TPC-only vertex from AOD\n");
 142     TooFewTracks();
 143     return fCurrentVertex;
 144   }
 145
 146   // accept 1-track case only if constraint is available
 147   if(!fConstraint && fMinTracks==1) fMinTracks=2;
 148
 149   // read tracks from AlivEvent
 150   Int_t nTrks = (Int_t)vEvent->GetNumberOfTracks();
 151   if(nTrks<fMinTracks) {
 152     TooFewTracks();
 153     return fCurrentVertex;
 154   }
 155   //
 156
 157   TDirectory * olddir = gDirectory;
 158   TFile *f = 0;
 159   if(nTrks>500) f = new TFile("VertexerTracks.root","recreate");
 160   TObjArray trkArrayOrig(nTrks);
 161   UShort_t *idOrig = new UShort_t[nTrks];
 162
 163   Int_t nTrksOrig=0;
 164   AliExternalTrackParam *t=0;
 165   // loop on tracks
 166   for(Int_t i=0; i<nTrks; i++) {
 167     AliVTrack *track = (AliVTrack*)vEvent->GetTrack(i);
 168     // check tracks to skip
 169     Bool_t skipThis = kFALSE;
 170     for(Int_t j=0; j<fNTrksToSkip; j++) {
 171       if(track->GetID()==fTrksToSkip[j]) {
 172         AliDebug(1,Form("skipping track: %d",i));
 173         skipThis = kTRUE;
 174       }
 175     }
 176     if(skipThis) continue;
 177
 178     // skip pure ITS SA tracks (default)
 179     if(!fITSpureSA && (track->GetStatus()&AliESDtrack::kITSpureSA)) continue;
 180     // or use only pure ITS SA tracks
 181     if(fITSpureSA && !(track->GetStatus()&AliESDtrack::kITSpureSA)) continue;
 182
 183     // kITSrefit
 184     if(fMode==0 && fITSrefit && !(track->GetStatus()&AliESDtrack::kITSrefit)) continue;
 185
 186     if(!inputAOD) {  // ESD
 187       AliESDtrack* esdt = (AliESDtrack*)track;
 188       if(esdt->GetNcls(fMode) < fMinClusters) continue;
 189       if(fMode==0) {        // ITS mode
 190         Double_t x,p[5],cov[15];
 191         esdt->GetExternalParameters(x,p);
 192         esdt->GetExternalCovariance(cov);
 193         t = new AliExternalTrackParam(x,esdt->GetAlpha(),p,cov);
 194       } else if(fMode==1) { // TPC mode
 195         t = (AliExternalTrackParam*)esdt->GetTPCInnerParam();
 196         if(!t) continue;
 197         Double_t radius = 2.8; //something less than the beam pipe radius
 198         if(!PropagateTrackTo(t,radius)) continue;
 199       }
 200     } else {          // AOD (only ITS mode)
 201       Int_t ncls0=0;
 202       for(Int_t l=0;l<6;l++) if(TESTBIT(track->GetITSClusterMap(),l)) ncls0++;
 203       if(ncls0 < fMinClusters) continue;
 204       t = new AliExternalTrackParam(track);
 205     }
 206     trkArrayOrig.AddLast(t);
 207     idOrig[nTrksOrig]=(UShort_t)track->GetID();
 208     nTrksOrig++;
 209   } // end loop on tracks
 210
 211   // call method that will reconstruct the vertex
 212   FindPrimaryVertex(&trkArrayOrig,idOrig);
 213
 214   if(fMode==0) trkArrayOrig.Delete();
 215   delete [] idOrig; idOrig=NULL;
 216
 217   if(f) {
 218     f->Close(); delete f; f = NULL;
 219     gSystem->Unlink("VertexerTracks.root");
 220     olddir->cd();
 221   }
 222
 223   // set vertex ID for tracks used in the fit
 224   // (only for ESD)
 225   if(!inputAOD) {
 226     Int_t nIndices = fCurrentVertex->GetNIndices();
 227     UShort_t *indices = fCurrentVertex->GetIndices();
 228     for(Int_t ind=0; ind<nIndices; ind++) {
 229       AliESDtrack *esdt = (AliESDtrack*)vEvent->GetTrack(indices[ind]);
 230       esdt->SetVertexID(-1);
 231     }
 232   }
 233
 234   return fCurrentVertex;
 235 }
 236 //----------------------------------------------------------------------------
 237 AliESDVertex* AliVertexerTracks::FindPrimaryVertex(const TObjArray *trkArrayOrig,
 238                                                    UShort_t *idOrig)
 239 {
 240 //
 241 // Primary vertex using the AliExternalTrackParam's in the TObjArray.
 242 // idOrig must contain the track IDs from AliESDtrack::GetID()
 243 // (Two iterations:
 244 //  1st with 5*fNSigma*sigma cut w.r.t. to initial vertex
 245 //      + cut on sqrt(d0d0+z0z0) if fConstraint=kFALSE
 246 //  2nd with fNSigma*sigma cut w.r.t. to vertex found in 1st iteration)
 247 //
 248   fCurrentVertex = 0;
 249
 250   // accept 1-track case only if constraint is available
 251   if(!fConstraint && fMinTracks==1) fMinTracks=2;
 252
 253   // read tracks from array
 254   Int_t nTrksOrig = (Int_t)trkArrayOrig->GetEntriesFast();
 255   AliDebug(1,Form("Initial number of tracks: %d",nTrksOrig));
 256   if(nTrksOrig<fMinTracks) {
 257     AliDebug(1,"TooFewTracks");
 258     TooFewTracks();
 259     return fCurrentVertex;
 260   }
 261
 262   // If fConstraint=kFALSE
 263   // run VertexFinder(1) to get rough estimate of initVertex (x,y)
 264   if(!fConstraint) {
 265     // fill fTrkArraySel, for VertexFinder()
 266     fIdSel = new UShort_t[nTrksOrig];
 267     PrepareTracks(*trkArrayOrig,idOrig,0);
 268     if(fIdSel) { delete [] fIdSel; fIdSel=NULL; }
 269     Double_t cutsave = fDCAcut;
 270     fDCAcut = fDCAcutIter0;
 271     // vertex finder
 272     switch (fAlgoIter0) {
 273     case 1: StrLinVertexFinderMinDist(1); break;
 274     case 2: StrLinVertexFinderMinDist(0); break;
 275     case 3: HelixVertexFinder();          break;
 276     case 4: VertexFinder(1);              break;
 277     case 5: VertexFinder(0);              break;
 278     default: printf("Wrong algorithm\n"); break;
 279     }
 280     fDCAcut = cutsave;
 281     if(fVert.GetNContributors()>0) {
 282       fVert.GetXYZ(fNominalPos);
 283       fNominalPos[0] = fVert.GetXv();
 284       fNominalPos[1] = fVert.GetYv();
 285       fNominalPos[2] = fVert.GetZv();
 286       AliDebug(1,Form("No mean vertex: VertexFinder gives (%f, %f, %f)",fNominalPos[0],fNominalPos[1],fNominalPos[2]));
 287     } else {
 288       fNominalPos[0] = 0.;
 289       fNominalPos[1] = 0.;
 290       fNominalPos[2] = 0.;
 291       AliDebug(1,"No mean vertex and VertexFinder failed");
 292     }
 293   }
 294
 295   // TWO ITERATIONS:
 296   //
 297   // ITERATION 1
 298   // propagate tracks to fNominalPos vertex
 299   // preselect them:
 300   // if(constraint) reject for |d0|>5*fNSigma*sigma w.r.t. fNominal... vertex
 301   // else  reject for |d0|\oplus|z0| > 5 mm w.r.t. fNominal... vertex
 302   // ITERATION 2
 303   // propagate tracks to best between initVertex and fCurrentVertex
 304   // preselect tracks (reject for |d0|>fNSigma*sigma w.r.t. best
 305   //                   between initVertex and fCurrentVertex)
 306   for(Int_t iter=1; iter<=2; iter++) {
 307     if(fOnlyFitter && iter==1) continue;
 308     if(fIdSel) { delete [] fIdSel; fIdSel=NULL; }
 309     fIdSel = new UShort_t[nTrksOrig];
 310     Int_t nTrksSel = PrepareTracks(*trkArrayOrig,idOrig,iter);
 311     AliDebug(1,Form("N tracks selected in iteration %d: %d",iter,nTrksSel));
 312     if(nTrksSel < fMinTracks) {
 313       TooFewTracks();
 314       return fCurrentVertex;
 315     }
 316
 317     // vertex finder
 318     if(!fOnlyFitter) {
 319       if(nTrksSel==1) {
 320         AliDebug(1,"Just one track");
 321         OneTrackVertFinder();
 322       } else {
 323         switch (fAlgo) {
 324         case 1: StrLinVertexFinderMinDist(1); break;
 325         case 2: StrLinVertexFinderMinDist(0); break;
 326         case 3: HelixVertexFinder();          break;
 327         case 4: VertexFinder(1);              break;
 328         case 5: VertexFinder(0);              break;
 329         default: printf("Wrong algorithm"); break;
 330         }
 331       }
 332       AliDebug(1," Vertex finding completed");
 333     }
 334
 335     // vertex fitter
 336     VertexFitter();
 337   } // end loop on the two iterations
 338
 339
 340   // set indices of used tracks
 341   UShort_t *indices = 0;
 342   if(fCurrentVertex->GetNContributors()>0) {
 343     Int_t nIndices = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast();
 344     indices = new UShort_t[nIndices];
 345     for(Int_t jj=0; jj<nIndices; jj++)
 346       indices[jj] = fIdSel[jj];
 347     fCurrentVertex->SetIndices(nIndices,indices);
 348   }
 349   if (indices) {delete [] indices; indices=NULL;}
 350   //
 351
 352   // set vertex title
 353   TString title="VertexerTracksNoConstraint";
 354   if(fConstraint) {
 355     title="VertexerTracksWithConstraint";
 356     if(fOnlyFitter) title.Append("OnlyFitter");
 357   }
 358   fCurrentVertex->SetTitle(title.Data());
 359   //
 360
 361   AliDebug(1,Form("xyz: %f %f %f; nc %d",fCurrentVertex->GetXv(),fCurrentVertex->GetYv(),fCurrentVertex->GetZv(),fCurrentVertex->GetNContributors()));
 362
 363   // clean up
 364   delete [] fIdSel; fIdSel=NULL;
 365   fTrkArraySel.Delete();
 366   if(fTrksToSkip) { delete [] fTrksToSkip; fTrksToSkip=NULL; }
 367   //
 368
 369   return fCurrentVertex;
 370 }
 371 //------------------------------------------------------------------------
 372 Double_t AliVertexerTracks::GetDeterminant3X3(Double_t matr[][3])
 373 {
 374   //
 375   Double_t det=matr[0][0]*matr[1][1]*matr[2][2]-matr[0][0]*matr[1][2]*matr[2][1]-matr[0][1]*matr[1][0]*matr[2][2]+matr[0][1]*matr[1][2]*matr[2][0]+matr[0][2]*matr[1][0]*matr[2][1]-matr[0][2]*matr[1][1]*matr[2][0];
 376  return det;
 377 }
 378 //-------------------------------------------------------------------------
 379 void AliVertexerTracks::GetStrLinDerivMatrix(const Double_t *p0,const Double_t *p1,Double_t (*m)[3],Double_t *d)
 380 {
 381   //
 382   Double_t x12=p0[0]-p1[0];
 383   Double_t y12=p0[1]-p1[1];
 384   Double_t z12=p0[2]-p1[2];
 385   Double_t kk=x12*x12+y12*y12+z12*z12;
 386   m[0][0]=2-2/kk*x12*x12;
 387   m[0][1]=-2/kk*x12*y12;
 388   m[0][2]=-2/kk*x12*z12;
 389   m[1][0]=-2/kk*x12*y12;
 390   m[1][1]=2-2/kk*y12*y12;
 391   m[1][2]=-2/kk*y12*z12;
 392   m[2][0]=-2/kk*x12*z12;
 393   m[2][1]=-2*y12*z12;
 394   m[2][2]=2-2/kk*z12*z12;
 395   d[0]=2*p0[0]-2/kk*p0[0]*x12*x12-2/kk*p0[2]*x12*z12-2/kk*p0[1]*x12*y12;
 396   d[1]=2*p0[1]-2/kk*p0[1]*y12*y12-2/kk*p0[0]*x12*y12-2/kk*p0[2]*z12*y12;
 397   d[2]=2*p0[2]-2/kk*p0[2]*z12*z12-2/kk*p0[0]*x12*z12-2/kk*p0[1]*z12*y12;
 398
 399 }
 400 //--------------------------------------------------------------------------
 401 void AliVertexerTracks::GetStrLinDerivMatrix(const Double_t *p0,const Double_t *p1,const Double_t *sigmasq,Double_t (*m)[3],Double_t *d)
 402 {
 403   //
 404   Double_t x12=p1[0]-p0[0];
 405   Double_t y12=p1[1]-p0[1];
 406   Double_t z12=p1[2]-p0[2];
 407
 408   Double_t den= x12*x12*sigmasq[1]*sigmasq[2]+y12*y12*sigmasq[0]*sigmasq[2]+z12*z12*sigmasq[0]*sigmasq[1];
 409
 410   Double_t kk= 2*(x12*x12/sigmasq[0]+y12*y12/sigmasq[1]+z12*z12/sigmasq[2]);
 411
 412   Double_t cc[3];
 413   cc[0]=-x12/sigmasq[0];
 414   cc[1]=-y12/sigmasq[1];
 415   cc[2]=-z12/sigmasq[2];
 416
 417   Double_t ww=(-p0[0]*x12*sigmasq[1]*sigmasq[2]-p0[1]*y12*sigmasq[0]*sigmasq[2]-p0[2]*z12*sigmasq[0]*sigmasq[1])/den;
 418
 419   Double_t ss= -p0[0]*cc[0]-p0[1]*cc[1]-p0[2]*cc[2];
 420
 421   Double_t aa[3];
 422   aa[0]=x12*sigmasq[1]*sigmasq[2]/den;
 423   aa[1]=y12*sigmasq[0]*sigmasq[2]/den;
 424   aa[2]=z12*sigmasq[0]*sigmasq[1]/den;
 425
 426   m[0][0]=aa[0]*(aa[0]*kk+2*cc[0])+2*cc[0]*aa[0]+2/sigmasq[0];
 427   m[0][1]=aa[1]*(aa[0]*kk+2*cc[0])+2*cc[1]*aa[0];
 428   m[0][2]=aa[2]*(aa[0]*kk+2*cc[0])+2*cc[2]*aa[0];
 429
 430   m[1][0]=aa[0]*(aa[1]*kk+2*cc[1])+2*cc[0]*aa[1];
 431   m[1][1]=aa[1]*(aa[1]*kk+2*cc[1])+2*cc[1]*aa[1]+2/sigmasq[1];
 432   m[1][2]=aa[2]*(aa[1]*kk+2*cc[1])+2*cc[2]*aa[1];
 433
 434   m[2][0]=aa[0]*(aa[2]*kk+2*cc[2])+2*cc[0]*aa[2];
 435   m[2][1]=aa[1]*(aa[2]*kk+2*cc[2])+2*cc[1]*aa[2];
 436   m[2][2]=aa[2]*(aa[2]*kk+2*cc[2])+2*cc[2]*aa[2]+2/sigmasq[2];
 437
 438   d[0]=-ww*(aa[0]*kk+2*cc[0])-2*ss*aa[0]+2*p0[0]/sigmasq[0];
 439   d[1]=-ww*(aa[1]*kk+2*cc[1])-2*ss*aa[1]+2*p0[1]/sigmasq[1];
 440   d[2]=-ww*(aa[2]*kk+2*cc[2])-2*ss*aa[2]+2*p0[2]/sigmasq[2];
 441
 442   }
 443 //--------------------------------------------------------------------------
 444 Double_t AliVertexerTracks::GetStrLinMinDist(const Double_t *p0,const Double_t *p1,const Double_t *x0)
 445 {
 446   //
 447   Double_t x12=p0[0]-p1[0];
 448   Double_t y12=p0[1]-p1[1];
 449   Double_t z12=p0[2]-p1[2];
 450   Double_t x10=p0[0]-x0[0];
 451   Double_t y10=p0[1]-x0[1];
 452   Double_t z10=p0[2]-x0[2];
 453   //  return ((x10*x10+y10*y10+z10*z10)*(x12*x12+y12*y12+z12*z12)-(x10*x12+y10*y12+z10*z12)*(x10*x12+y10*y12+z10*z12))/(x12*x12+y12*y12+z12*z12);
 454   return ((y10*z12-z10*y12)*(y10*z12-z10*y12)+
 455           (z10*x12-x10*z12)*(z10*x12-x10*z12)+
 456           (x10*y12-y10*x12)*(x10*y12-y10*x12))
 457     /(x12*x12+y12*y12+z12*z12);
 458 }
 459 //---------------------------------------------------------------------------
 460 void AliVertexerTracks::OneTrackVertFinder()
 461 {
 462   // find vertex for events with 1 track, using DCA to nominal beam axis
 463   AliDebug(1,Form("Number of prepared tracks =%d - Call OneTrackVertFinder",fTrkArraySel.GetEntries()));
 464   AliExternalTrackParam *track1;
 465   track1 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(0);
 466   Double_t alpha=track1->GetAlpha();
 467   Double_t mindist = TMath::Cos(alpha)*fNominalPos[0]+TMath::Sin(alpha)*fNominalPos[1];
 468   Double_t pos[3],dir[3];
 469   track1->GetXYZAt(mindist,GetFieldkG(),pos);
 470   track1->GetPxPyPzAt(mindist,GetFieldkG(),dir);
 471   AliStrLine *line1 = new AliStrLine(pos,dir);
 472   Double_t p1[3]={fNominalPos[0],fNominalPos[1],0.};
 473   Double_t p2[3]={fNominalPos[0],fNominalPos[1],10.};
 474   AliStrLine *zeta=new AliStrLine(p1,p2,kTRUE);
 475   Double_t crosspoint[3]={0.,0.,0.};
 476   Double_t sigma=999.;
 477   Int_t nContrib=-1;
 478   Int_t retcode = zeta->Cross(line1,crosspoint);
 479   if(retcode>=0){
 480     sigma=line1->GetDistFromPoint(crosspoint);
 481     nContrib=1;
 482   }
 483   delete zeta;
 484   delete line1;
 485   fVert.SetXYZ(crosspoint);
 486   fVert.SetDispersion(sigma);
 487   fVert.SetNContributors(nContrib);
 488 }
 489 //---------------------------------------------------------------------------
 490 void AliVertexerTracks::HelixVertexFinder()
 491 {
 492   // Get estimate of vertex position in (x,y) from tracks DCA
 493
 494
 495   Double_t initPos[3];
 496   initPos[2] = 0.;
 497   for(Int_t i=0;i<2;i++)initPos[i]=fNominalPos[i];
 498
 499   Int_t nacc = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast();
 500
 501   Double_t aver[3]={0.,0.,0.};
 502   Double_t averquad[3]={0.,0.,0.};
 503   Double_t sigmaquad[3]={0.,0.,0.};
 504   Double_t sigma=0;
 505   Int_t ncombi = 0;
 506   AliExternalTrackParam *track1;
 507   AliExternalTrackParam *track2;
 508   Double_t distCA;
 509   Double_t x;
 510   Double_t alpha, cs, sn;
 511   Double_t crosspoint[3];
 512   for(Int_t i=0; i<nacc; i++){
 513     track1 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(i);
 514
 515
 516     for(Int_t j=i+1; j<nacc; j++){
 517       track2 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(j);
 518
 519       distCA=track2->PropagateToDCA(track1,GetFieldkG());
 520       if(fDCAcut<=0 ||(fDCAcut>0&&distCA<fDCAcut)){
 521         x=track1->GetX();
 522         alpha=track1->GetAlpha();
 523         cs=TMath::Cos(alpha); sn=TMath::Sin(alpha);
 524         Double_t x1=x*cs - track1->GetY()*sn;
 525         Double_t y1=x*sn + track1->GetY()*cs;
 526         Double_t z1=track1->GetZ();
 527
 528         Double_t sx1=sn*sn*track1->GetSigmaY2(), sy1=cs*cs*track1->GetSigmaY2();
 529         x=track2->GetX();
 530         alpha=track2->GetAlpha();
 531         cs=TMath::Cos(alpha); sn=TMath::Sin(alpha);
 532         Double_t x2=x*cs - track2->GetY()*sn;
 533         Double_t y2=x*sn + track2->GetY()*cs;
 534         Double_t z2=track2->GetZ();
 535         Double_t sx2=sn*sn*track2->GetSigmaY2(), sy2=cs*cs*track2->GetSigmaY2();
 536         Double_t sz1=track1->GetSigmaZ2(), sz2=track2->GetSigmaZ2();
 537         Double_t wx1=sx2/(sx1+sx2), wx2=1.- wx1;
 538         Double_t wy1=sy2/(sy1+sy2), wy2=1.- wy1;
 539         Double_t wz1=sz2/(sz1+sz2), wz2=1.- wz1;
 540         crosspoint[0]=wx1*x1 + wx2*x2;
 541         crosspoint[1]=wy1*y1 + wy2*y2;
 542         crosspoint[2]=wz1*z1 + wz2*z2;
 543
 544         ncombi++;
 545         for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aver[jj]+=crosspoint[jj];
 546         for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)averquad[jj]+=(crosspoint[jj]*crosspoint[jj]);
 547       }
 548     }
 549
 550   }
 551   if(ncombi>0){
 552     for(Int_t jj=0;jj<3;jj++){
 553       initPos[jj] = aver[jj]/ncombi;
 554       averquad[jj]/=ncombi;
 555       sigmaquad[jj]=averquad[jj]-initPos[jj]*initPos[jj];
 556       sigma+=sigmaquad[jj];
 557     }
 558     sigma=TMath::Sqrt(TMath::Abs(sigma));
 559   }
 560   else {
 561     Warning("HelixVertexFinder","Finder did not succed");
 562     sigma=999;
 563   }
 564   fVert.SetXYZ(initPos);
 565   fVert.SetDispersion(sigma);
 566   fVert.SetNContributors(ncombi);
 567 }
 568 //----------------------------------------------------------------------------
 569 Int_t AliVertexerTracks::PrepareTracks(const TObjArray &trkArrayOrig,
 570                                        const UShort_t *idOrig,
 571                                        Int_t optImpParCut)
 572 {
 573 //
 574 // Propagate tracks to initial vertex position and store them in a TObjArray
 575 //
 576   AliDebug(1," PrepareTracks()");
 577
 578   Int_t nTrksOrig = (Int_t)trkArrayOrig.GetEntriesFast();
 579   Int_t nTrksSel = 0;
 580   Double_t maxd0rphi;
 581   Double_t sigmaCurr[3];
 582   Double_t normdistx,normdisty;
 583   Double_t d0z0[2],covd0z0[3];
 584   Double_t sigmad0;
 585
 586   AliESDVertex *initVertex = new AliESDVertex(fNominalPos,fNominalCov,1,1);
 587
 588   if(!fTrkArraySel.IsEmpty()) fTrkArraySel.Delete();
 589
 590   AliExternalTrackParam *track=0;
 591
 592   // loop on tracks
 593   for(Int_t i=0; i<nTrksOrig; i++) {
 594     AliExternalTrackParam *trackOrig=(AliExternalTrackParam*)trkArrayOrig.At(i);
 595     if(trackOrig->Charge()!=0) { // normal tracks
 596       track = new AliExternalTrackParam(*(AliExternalTrackParam*)trkArrayOrig.At(i));
 597     } else { // neutral tracks (from a V0)
 598       track = new AliNeutralTrackParam(*(AliNeutralTrackParam*)trkArrayOrig.At(i));
 599     }
 600
 601     // tgl cut
 602     if(TMath::Abs(track->GetTgl())>fMaxTgl) {
 603       AliDebug(1,Form(" rejecting track with tgl = %f",track->GetTgl()));
 604       delete track; continue;
 605     }
 606
 607     Bool_t propagateOK = kFALSE, cutond0z0 = kTRUE;
 608     // propagate track to vertex
 609     if(optImpParCut<2 || fOnlyFitter) { // optImpParCut==1 or 0
 610       propagateOK = track->PropagateToDCA(initVertex,GetFieldkG(),100.,d0z0,covd0z0);
 611     } else {              // optImpParCut==2
 612       fCurrentVertex->GetSigmaXYZ(sigmaCurr);
 613       normdistx = TMath::Abs(fCurrentVertex->GetXv()-fNominalPos[0])/TMath::Sqrt(sigmaCurr[0]*sigmaCurr[0]+fNominalCov[0]);
 614       normdisty = TMath::Abs(fCurrentVertex->GetYv()-fNominalPos[1])/TMath::Sqrt(sigmaCurr[1]*sigmaCurr[1]+fNominalCov[2]);
 615       AliDebug(1,Form("normdistx %f  %f    %f",fCurrentVertex->GetXv(),fNominalPos[0],TMath::Sqrt(sigmaCurr[0]*sigmaCurr[0]+fNominalCov[0])));
 616       AliDebug(1,Form("normdisty %f  %f    %f",fCurrentVertex->GetYv(),fNominalPos[1],TMath::Sqrt(sigmaCurr[1]*sigmaCurr[1]+fNominalCov[2])));
 617       AliDebug(1,Form("sigmaCurr %f %f    %f",sigmaCurr[0],sigmaCurr[1],TMath::Sqrt(fNominalCov[0])+TMath::Sqrt(fNominalCov[2])));
 618       if(normdistx < 3. && normdisty < 3. &&
 619          (sigmaCurr[0]+sigmaCurr[1])<(TMath::Sqrt(fNominalCov[0])+TMath::Sqrt(fNominalCov[2]))) {
 620         propagateOK = track->PropagateToDCA(fCurrentVertex,GetFieldkG(),100.,d0z0,covd0z0);
 621       } else {
 622         propagateOK = track->PropagateToDCA(initVertex,GetFieldkG(),100.,d0z0,covd0z0);
 623         if(fConstraint) cutond0z0=kFALSE;
 624       }
 625     }
 626
 627     if(!propagateOK) {
 628       AliDebug(1,"     rejected");
 629       delete track; continue;
 630     }
 631
 632     sigmad0 = TMath::Sqrt(covd0z0[0]);
 633     maxd0rphi = fNSigma*sigmad0;
 634     if(optImpParCut==1) maxd0rphi *= 5.;
 635     maxd0rphi = TMath::Min(maxd0rphi,fFiducialR);
 636     //sigmad0z0 = TMath::Sqrt(covd0z0[0]+covd0z0[2]);
 637
 638     AliDebug(1,Form("trk %d; id %d; |d0| = %f;  d0 cut = %f; |z0| = %f; |d0|oplus|z0| = %f; d0z0 cut = %f",i,(Int_t)idOrig[i],TMath::Abs(d0z0[0]),maxd0rphi,TMath::Abs(d0z0[1]),TMath::Sqrt(d0z0[0]*d0z0[0]+d0z0[1]*d0z0[1]),fMaxd0z0));
 639
 640
 641     //---- track selection based on impact parameters ----//
 642
 643     // always reject tracks outside fiducial volume
 644     if(TMath::Abs(d0z0[0])>fFiducialR || TMath::Abs(d0z0[1])>fFiducialZ) {
 645       AliDebug(1,"     rejected");
 646       delete track; continue;
 647     }
 648
 649     // during iterations 1 and 2 , reject tracks with d0rphi > maxd0rphi
 650     if(optImpParCut>0 && TMath::Abs(d0z0[0])>maxd0rphi) {
 651       AliDebug(1,"     rejected");
 652       delete track; continue;
 653     }
 654
 655     // if fConstraint=kFALSE, during iterations 1 and 2 ||
 656     // if fConstraint=kTRUE, during iteration 2,
 657     // select tracks with d0oplusz0 < fMaxd0z0
 658     if((!fConstraint && optImpParCut>0 && fVert.GetNContributors()>0) ||
 659        ( fConstraint && optImpParCut==2 && cutond0z0)) {
 660       if(nTrksOrig>=3 &&
 661          TMath::Sqrt(d0z0[0]*d0z0[0]+d0z0[1]*d0z0[1])>fMaxd0z0) {
 662         AliDebug(1,"     rejected");
 663         delete track; continue;
 664       }
 665     }
 666
 667     // track passed all selections
 668     fTrkArraySel.AddLast(track);
 669     fIdSel[nTrksSel] = idOrig[i];
 670     nTrksSel++;
 671   } // end loop on tracks
 672
 673   delete initVertex;
 674
 675   return nTrksSel;
 676 }
 677 //----------------------------------------------------------------------------
 678 Bool_t AliVertexerTracks::PropagateTrackTo(AliExternalTrackParam *track,
 679                                            Double_t xToGo) {
 680   //----------------------------------------------------------------
 681   // COPIED from AliTracker
 682   //
 683   // Propagates the track to the plane X=xk (cm).
 684   //
 685   //  Origin: Marian Ivanov,  Marian.Ivanov@cern.ch
 686   //----------------------------------------------------------------
 687
 688   const Double_t kEpsilon = 0.00001;
 689   Double_t xpos = track->GetX();
 690   Double_t dir = (xpos<xToGo) ? 1. : -1.;
 691   Double_t maxStep = 5;
 692   Double_t maxSnp = 0.8;
 693   //
 694   while ( (xToGo-xpos)*dir > kEpsilon){
 695     Double_t step = dir*TMath::Min(TMath::Abs(xToGo-xpos), maxStep);
 696     Double_t x    = xpos+step;
 697     Double_t xyz0[3],xyz1[3];
 698     track->GetXYZ(xyz0);   //starting global position
 699
 700     if(!track->GetXYZAt(x,GetFieldkG(),xyz1)) return kFALSE;   // no prolongation
 701     xyz1[2]+=kEpsilon; // waiting for bug correction in geo
 702
 703     if(TMath::Abs(track->GetSnpAt(x,GetFieldkG())) >= maxSnp) return kFALSE;
 704     if(!track->PropagateTo(x,GetFieldkG()))  return kFALSE;
 705
 706     if(TMath::Abs(track->GetSnp()) >= maxSnp) return kFALSE;
 707     track->GetXYZ(xyz0);   // global position
 708     Double_t alphan = TMath::ATan2(xyz0[1], xyz0[0]);
 709     //
 710     Double_t ca=TMath::Cos(alphan-track->GetAlpha()),
 711       sa=TMath::Sin(alphan-track->GetAlpha());
 712     Double_t sf=track->GetSnp(), cf=TMath::Sqrt((1.-sf)*(1.+sf));
 713     Double_t sinNew =  sf*ca - cf*sa;
 714     if(TMath::Abs(sinNew) >= maxSnp) return kFALSE;
 715     if(!track->Rotate(alphan)) return kFALSE;
 716
 717     xpos = track->GetX();
 718   }
 719   return kTRUE;
 720 }
 721 //---------------------------------------------------------------------------
 722 AliESDVertex* AliVertexerTracks::RemoveTracksFromVertex(AliESDVertex *inVtx,
 723                                                         const TObjArray *trkArray,
 724                                                         UShort_t *id,
 725                                                         const Float_t *diamondxy) const
 726 {
 727 //
 728 // Removes tracks in trksTree from fit of inVtx
 729 //
 730
 731   if(!strstr(inVtx->GetTitle(),"VertexerTracksWithConstraint")) {
 732     printf("ERROR: primary vertex has no constraint: cannot remove tracks");
 733     return 0x0;
 734   }
 735   if(!strstr(inVtx->GetTitle(),"VertexerTracksWithConstraintOnlyFitter"))
 736     printf("WARNING: result of tracks' removal will be only approximately correct");
 737
 738   TMatrixD rv(3,1);
 739   rv(0,0) = inVtx->GetXv();
 740   rv(1,0) = inVtx->GetYv();
 741   rv(2,0) = inVtx->GetZv();
 742   TMatrixD vV(3,3);
 743   Double_t cov[6];
 744   inVtx->GetCovMatrix(cov);
 745   vV(0,0) = cov[0];
 746   vV(0,1) = cov[1]; vV(1,0) = cov[1];
 747   vV(1,1) = cov[2];
 748   vV(0,2) = cov[3]; vV(2,0) = cov[3];
 749   vV(1,2) = cov[4]; vV(2,1) = cov[4];
 750   vV(2,2) = cov[5];
 751
 752   TMatrixD sumWi(TMatrixD::kInverted,vV);
 753   TMatrixD sumWiri(sumWi,TMatrixD::kMult,rv);
 754
 755   Int_t nUsedTrks = inVtx->GetNIndices();
 756   Double_t chi2 = inVtx->GetChi2();
 757
 758   AliExternalTrackParam *track = 0;
 759   Int_t ntrks = (Int_t)trkArray->GetEntriesFast();
 760   for(Int_t i=0;i<ntrks;i++) {
 761     track = (AliExternalTrackParam*)trkArray->At(i);
 762     if(!inVtx->UsesTrack(id[i])) {
 763       printf("track %d was not used in vertex fit",id[i]);
 764       continue;
 765     }
 766     Double_t alpha = track->GetAlpha();
 767     Double_t xl = diamondxy[0]*TMath::Cos(alpha)+diamondxy[1]*TMath::Sin(alpha);
 768     track->PropagateTo(xl,GetFieldkG());
 769     // vector of track global coordinates
 770     TMatrixD ri(3,1);
 771     // covariance matrix of ri
 772     TMatrixD wWi(3,3);
 773
 774     // get space point from track
 775     if(!TrackToPoint(track,ri,wWi)) continue;
 776
 777     TMatrixD wWiri(wWi,TMatrixD::kMult,ri);
 778
 779     sumWi -= wWi;
 780     sumWiri -= wWiri;
 781
 782     // track contribution to chi2
 783     TMatrixD deltar = rv; deltar -= ri;
 784     TMatrixD wWideltar(wWi,TMatrixD::kMult,deltar);
 785     Double_t chi2i = deltar(0,0)*wWideltar(0,0)+
 786                      deltar(1,0)*wWideltar(1,0)+
 787                      deltar(2,0)*wWideltar(2,0);
 788     // remove from total chi2
 789     chi2 -= chi2i;
 790
 791     nUsedTrks--;
 792     if(nUsedTrks<2) {
 793       printf("Trying to remove too many tracks!");
 794       return 0x0;
 795     }
 796   }
 797
 798   TMatrixD rvnew(3,1);
 799   TMatrixD vVnew(3,3);
 800
 801   // new inverted of weights matrix
 802   TMatrixD invsumWi(TMatrixD::kInverted,sumWi);
 803   vVnew = invsumWi;
 804   // new position of primary vertex
 805   rvnew.Mult(vVnew,sumWiri);
 806
 807   Double_t position[3];
 808   position[0] = rvnew(0,0);
 809   position[1] = rvnew(1,0);
 810   position[2] = rvnew(2,0);
 811   cov[0] = vVnew(0,0);
 812   cov[1] = vVnew(0,1);
 813   cov[2] = vVnew(1,1);
 814   cov[3] = vVnew(0,2);
 815   cov[4] = vVnew(1,2);
 816   cov[5] = vVnew(2,2);
 817
 818   // store data in the vertex object
 819   AliESDVertex *outVtx = new AliESDVertex(position,cov,chi2,nUsedTrks+1); // the +1 is for the constraint
 820   outVtx->SetTitle(inVtx->GetTitle());
 821   UShort_t *inindices = inVtx->GetIndices();
 822   Int_t nIndices = nUsedTrks;
 823   UShort_t *outindices = new UShort_t[nIndices];
 824   Int_t j=0;
 825   for(Int_t k=0; k<inVtx->GetNIndices(); k++) {
 826     Bool_t copyindex=kTRUE;
 827     for(Int_t l=0; l<ntrks; l++) {
 828       if(inindices[k]==id[l]) copyindex=kFALSE;
 829     }
 830     if(copyindex) {
 831       outindices[j] = inindices[k]; j++;
 832     }
 833   }
 834   outVtx->SetIndices(nIndices,outindices);
 835   if (outindices) delete [] outindices;
 836
 837   /*
 838     printf("Vertex before removing tracks:");
 839     inVtx->PrintStatus();
 840     inVtx->PrintIndices();
 841     printf("Vertex after removing tracks:");
 842     outVtx->PrintStatus();
 843     outVtx->PrintIndices();
 844   */
 845
 846   return outVtx;
 847 }
 848 //---------------------------------------------------------------------------
 849 AliESDVertex* AliVertexerTracks::RemoveConstraintFromVertex(AliESDVertex *inVtx,
 850                                                      Float_t *diamondxyz,
 851                                                      Float_t *diamondcov) const
 852 {
 853 //
 854 // Removes diamond constraint from fit of inVtx
 855 //
 856
 857   if(!strstr(inVtx->GetTitle(),"VertexerTracksWithConstraint")) {
 858     printf("ERROR: primary vertex has no constraint: cannot remove it\n");
 859     return 0x0;
 860   }
 861   if(inVtx->GetNContributors()<3) {
 862     printf("ERROR: primary vertex has less than 2 tracks: cannot remove contraint\n");
 863     return 0x0;
 864   }
 865
 866   // diamond constraint
 867   TMatrixD vVb(3,3);
 868   vVb(0,0) = diamondcov[0];
 869   vVb(0,1) = diamondcov[1];
 870   vVb(0,2) = 0.;
 871   vVb(1,0) = diamondcov[1];
 872   vVb(1,1) = diamondcov[2];
 873   vVb(1,2) = 0.;
 874   vVb(2,0) = 0.;
 875   vVb(2,1) = 0.;
 876   vVb(2,2) = diamondcov[5];
 877   TMatrixD vVbInv(TMatrixD::kInverted,vVb);
 878   TMatrixD rb(3,1);
 879   rb(0,0) = diamondxyz[0];
 880   rb(1,0) = diamondxyz[1];
 881   rb(2,0) = diamondxyz[2];
 882   TMatrixD vVbInvrb(vVbInv,TMatrixD::kMult,rb);
 883
 884   // input vertex
 885   TMatrixD rv(3,1);
 886   rv(0,0) = inVtx->GetXv();
 887   rv(1,0) = inVtx->GetYv();
 888   rv(2,0) = inVtx->GetZv();
 889   TMatrixD vV(3,3);
 890   Double_t cov[6];
 891   inVtx->GetCovMatrix(cov);
 892   vV(0,0) = cov[0];
 893   vV(0,1) = cov[1]; vV(1,0) = cov[1];
 894   vV(1,1) = cov[2];
 895   vV(0,2) = cov[3]; vV(2,0) = cov[3];
 896   vV(1,2) = cov[4]; vV(2,1) = cov[4];
 897   vV(2,2) = cov[5];
 898   TMatrixD vVInv(TMatrixD::kInverted,vV);
 899   TMatrixD vVInvrv(vVInv,TMatrixD::kMult,rv);
 900
 901
 902   TMatrixD sumWi = vVInv - vVbInv;
 903
 904
 905   TMatrixD sumWiri = vVInvrv - vVbInvrb;
 906
 907   TMatrixD rvnew(3,1);
 908   TMatrixD vVnew(3,3);
 909
 910   // new inverted of weights matrix
 911   TMatrixD invsumWi(TMatrixD::kInverted,sumWi);
 912   vVnew = invsumWi;
 913   // new position of primary vertex
 914   rvnew.Mult(vVnew,sumWiri);
 915
 916   Double_t position[3];
 917   position[0] = rvnew(0,0);
 918   position[1] = rvnew(1,0);
 919   position[2] = rvnew(2,0);
 920   cov[0] = vVnew(0,0);
 921   cov[1] = vVnew(0,1);
 922   cov[2] = vVnew(1,1);
 923   cov[3] = vVnew(0,2);
 924   cov[4] = vVnew(1,2);
 925   cov[5] = vVnew(2,2);
 926
 927
 928   Double_t chi2 = inVtx->GetChi2();
 929
 930   // diamond constribution to chi2
 931   TMatrixD deltar = rv; deltar -= rb;
 932   TMatrixD vVbInvdeltar(vVbInv,TMatrixD::kMult,deltar);
 933   Double_t chi2b = deltar(0,0)*vVbInvdeltar(0,0)+
 934                    deltar(1,0)*vVbInvdeltar(1,0)+
 935                    deltar(2,0)*vVbInvdeltar(2,0);
 936   // remove from total chi2
 937   chi2 -= chi2b;
 938
 939   // store data in the vertex object
 940   AliESDVertex *outVtx = new AliESDVertex(position,cov,chi2,inVtx->GetNContributors()-1);
 941   outVtx->SetTitle("VertexerTracksNoConstraint");
 942   UShort_t *inindices = inVtx->GetIndices();
 943   Int_t nIndices = inVtx->GetNIndices();
 944   outVtx->SetIndices(nIndices,inindices);
 945
 946   return outVtx;
 947 }
 948 //---------------------------------------------------------------------------
 949 void AliVertexerTracks::SetCuts(Double_t *cuts)
 950 {
 951 //
 952 //  Cut values
 953 //
 954   SetDCAcut(cuts[0]);
 955   SetDCAcutIter0(cuts[1]);
 956   SetMaxd0z0(cuts[2]);
 957   if(fMode==0 && cuts[3]<0) SetITSrefitNotRequired();
 958   SetMinClusters((Int_t)(TMath::Abs(cuts[3])));
 959   SetMinTracks((Int_t)(cuts[4]));
 960   SetNSigmad0(cuts[5]);
 961   SetMinDetFitter(cuts[6]);
 962   SetMaxTgl(cuts[7]);
 963   SetFiducialRZ(cuts[8],cuts[9]);
 964   fAlgo=(Int_t)(cuts[10]);
 965   fAlgoIter0=(Int_t)(cuts[11]);
 966
 967   return;
 968 }
 969 //---------------------------------------------------------------------------
 970 void AliVertexerTracks::SetITSMode(Double_t dcacut,
 971                                    Double_t dcacutIter0,
 972                                    Double_t maxd0z0,
 973                                    Int_t minCls,
 974                                    Int_t mintrks,
 975                                    Double_t nsigma,
 976                                    Double_t mindetfitter,
 977                                    Double_t maxtgl,
 978                                    Double_t fidR,
 979                                    Double_t fidZ,
 980                                    Int_t finderAlgo,
 981                                    Int_t finderAlgoIter0)
 982 {
 983 //
 984 //  Cut values for ITS mode
 985 //
 986   fMode = 0;
 987   if(minCls>0) {
 988     SetITSrefitRequired();
 989   } else {
 990     SetITSrefitNotRequired();
 991   }
 992   SetDCAcut(dcacut);
 993   SetDCAcutIter0(dcacutIter0);
 994   SetMaxd0z0(maxd0z0);
 995   SetMinClusters(TMath::Abs(minCls));
 996   SetMinTracks(mintrks);
 997   SetNSigmad0(nsigma);
 998   SetMinDetFitter(mindetfitter);
 999   SetMaxTgl(maxtgl);
1000   SetFiducialRZ(fidR,fidZ);
1001   fAlgo=finderAlgo;
1002   fAlgoIter0=finderAlgoIter0;
1003
1004   return;
1005 }
1006 //---------------------------------------------------------------------------
1007 void AliVertexerTracks::SetTPCMode(Double_t dcacut,
1008                                    Double_t dcacutIter0,
1009                                    Double_t maxd0z0,
1010                                    Int_t minCls,
1011                                    Int_t mintrks,
1012                                    Double_t nsigma,
1013                                    Double_t mindetfitter,
1014                                    Double_t maxtgl,
1015                                    Double_t fidR,
1016                                    Double_t fidZ,
1017                                    Int_t finderAlgo,
1018                                    Int_t finderAlgoIter0)
1019 {
1020 //
1021 //  Cut values for TPC mode
1022 //
1023   fMode = 1;
1024   SetITSrefitNotRequired();
1025   SetDCAcut(dcacut);
1026   SetDCAcutIter0(dcacutIter0);
1027   SetMaxd0z0(maxd0z0);
1028   SetMinClusters(minCls);
1029   SetMinTracks(mintrks);
1030   SetNSigmad0(nsigma);
1031   SetMinDetFitter(mindetfitter);
1032   SetMaxTgl(maxtgl);
1033   SetFiducialRZ(fidR,fidZ);
1034   fAlgo=finderAlgo;
1035   fAlgoIter0=finderAlgoIter0;
1036
1037   return;
1038 }
1039 //---------------------------------------------------------------------------
1040 void AliVertexerTracks::SetSkipTracks(Int_t n,const Int_t *skipped)
1041 {
1042 //
1043 // Mark the tracks not to be used in the vertex reconstruction.
1044 // Tracks are identified by AliESDtrack::GetID()
1045 //
1046   fNTrksToSkip = n;  fTrksToSkip = new Int_t[n];
1047   for(Int_t i=0;i<n;i++) fTrksToSkip[i] = skipped[i];
1048   return;
1049 }
1050 //---------------------------------------------------------------------------
1051 void  AliVertexerTracks::SetVtxStart(AliESDVertex *vtx)
1052 {
1053 //
1054 // Set initial vertex knowledge
1055 //
1056   vtx->GetXYZ(fNominalPos);
1057   vtx->GetCovMatrix(fNominalCov);
1058   SetConstraintOn();
1059   return;
1060 }
1061 //---------------------------------------------------------------------------
1062 void AliVertexerTracks::StrLinVertexFinderMinDist(Int_t optUseWeights)
1063 {
1064   AliExternalTrackParam *track1;
1065   const Int_t knacc = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast();
1066   AliStrLine **linarray = new AliStrLine* [knacc];
1067   for(Int_t i=0; i<knacc; i++){
1068     track1 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(i);
1069     Double_t alpha=track1->GetAlpha();
1070     Double_t mindist = TMath::Cos(alpha)*fNominalPos[0]+TMath::Sin(alpha)*fNominalPos[1];
1071     Double_t pos[3],dir[3],sigmasq[3];
1072     track1->GetXYZAt(mindist,GetFieldkG(),pos);
1073     track1->GetPxPyPzAt(mindist,GetFieldkG(),dir);
1074     sigmasq[0]=TMath::Sin(alpha)*TMath::Sin(alpha)*track1->GetSigmaY2();
1075     sigmasq[1]=TMath::Cos(alpha)*TMath::Cos(alpha)*track1->GetSigmaY2();
1076     sigmasq[2]=track1->GetSigmaZ2();
1077     TMatrixD ri(3,1);
1078     TMatrixD wWi(3,3);
1079     if(!TrackToPoint(track1,ri,wWi)) {optUseWeights=kFALSE;printf("WARNING\n");}
1080     Double_t wmat[9];
1081     Int_t iel=0;
1082     for(Int_t ia=0;ia<3;ia++){
1083       for(Int_t ib=0;ib<3;ib++){
1084         wmat[iel]=wWi(ia,ib);
1085         iel++;
1086       }
1087     }
1088     linarray[i] = new AliStrLine(pos,sigmasq,wmat,dir);
1089   }
1090   fVert=TrackletVertexFinder(linarray,knacc,optUseWeights);
1091   for(Int_t i=0; i<knacc; i++) delete linarray[i];
1092   delete [] linarray;
1093 }
1094 //---------------------------------------------------------------------------
1095 AliESDVertex AliVertexerTracks::TrackletVertexFinder(const TClonesArray *lines, Int_t optUseWeights)
1096 {
1097   // Calculate the point at minimum distance to prepared tracks (TClonesArray)
1098   const Int_t knacc = (Int_t)lines->GetEntriesFast();
1099   AliStrLine** lines2 = new AliStrLine* [knacc];
1100   for(Int_t i=0; i<knacc; i++){
1101     lines2[i]= (AliStrLine*)lines->At(i);
1102   }
1103   AliESDVertex vert = TrackletVertexFinder(lines2,knacc,optUseWeights);
1104   delete [] lines2;
1105   return vert;
1106 }
1107
1108 //---------------------------------------------------------------------------
1109 AliESDVertex AliVertexerTracks::TrackletVertexFinder(AliStrLine **lines, const Int_t knacc, Int_t optUseWeights)
1110 {
1111   // Calculate the point at minimum distance to prepared tracks (array of AliStrLine)
1112
1113   Double_t initPos[3]={0.,0.,0.};
1114
1115   Double_t (*vectP0)[3]=new Double_t [knacc][3]();
1116   Double_t (*vectP1)[3]=new Double_t [knacc][3]();
1117
1118   Double_t sum[3][3];
1119   Double_t dsum[3]={0,0,0};
1120   TMatrixD sumWi(3,3);
1121   for(Int_t i=0;i<3;i++){
1122     for(Int_t j=0;j<3;j++){
1123       sum[i][j]=0;
1124       sumWi(i,j)=0.;
1125     }
1126   }
1127
1128   for(Int_t i=0; i<knacc; i++){
1129     AliStrLine *line1 = lines[i];
1130     Double_t p0[3],cd[3],sigmasq[3];
1131     Double_t wmat[9];
1132     if(!line1) { printf("ERROR %d %d\n",i,knacc); continue; }
1133     line1->GetP0(p0);
1134     line1->GetCd(cd);
1135     line1->GetSigma2P0(sigmasq);
1136     line1->GetWMatrix(wmat);
1137     TMatrixD wWi(3,3);
1138     Int_t iel=0;
1139     for(Int_t ia=0;ia<3;ia++){
1140       for(Int_t ib=0;ib<3;ib++){
1141         wWi(ia,ib)=wmat[iel];
1142         iel++;
1143       }
1144     }
1145
1146     sumWi+=wWi;
1147
1148     Double_t p1[3]={p0[0]+cd[0],p0[1]+cd[1],p0[2]+cd[2]};
1149     vectP0[i][0]=p0[0];
1150     vectP0[i][1]=p0[1];
1151     vectP0[i][2]=p0[2];
1152     vectP1[i][0]=p1[0];
1153     vectP1[i][1]=p1[1];
1154     vectP1[i][2]=p1[2];
1155
1156     Double_t matr[3][3];
1157     Double_t dknow[3];
1158     if(optUseWeights==0)GetStrLinDerivMatrix(p0,p1,matr,dknow);
1159     else GetStrLinDerivMatrix(p0,p1,sigmasq,matr,dknow);
1160
1161
1162     for(Int_t iii=0;iii<3;iii++){
1163       dsum[iii]+=dknow[iii];
1164       for(Int_t lj=0;lj<3;lj++) sum[iii][lj]+=matr[iii][lj];
1165     }
1166   }
1167
1168   TMatrixD invsumWi(TMatrixD::kInverted,sumWi);
1169   Double_t covmatrix[6];
1170   covmatrix[0] = invsumWi(0,0);
1171   covmatrix[1] = invsumWi(0,1);
1172   covmatrix[2] = invsumWi(1,1);
1173   covmatrix[3] = invsumWi(0,2);
1174   covmatrix[4] = invsumWi(1,2);
1175   covmatrix[5] = invsumWi(2,2);
1176
1177   Double_t vett[3][3];
1178   Double_t det=GetDeterminant3X3(sum);
1179   Double_t sigma=0;
1180
1181   if(TMath::Abs(det) > kAlmost0){
1182     for(Int_t zz=0;zz<3;zz++){
1183       for(Int_t ww=0;ww<3;ww++){
1184         for(Int_t kk=0;kk<3;kk++) vett[ww][kk]=sum[ww][kk];
1185       }
1186       for(Int_t kk=0;kk<3;kk++) vett[kk][zz]=dsum[kk];
1187       initPos[zz]=GetDeterminant3X3(vett)/det;
1188     }
1189
1190
1191     for(Int_t i=0; i<knacc; i++){
1192       Double_t p0[3]={0,0,0},p1[3]={0,0,0};
1193       for(Int_t ii=0;ii<3;ii++){
1194         p0[ii]=vectP0[i][ii];
1195         p1[ii]=vectP1[i][ii];
1196       }
1197       sigma+=GetStrLinMinDist(p0,p1,initPos);
1198     }
1199
1200     if(sigma>0.) {sigma=TMath::Sqrt(sigma);}else{sigma=999;}
1201   }else{
1202     sigma=999;
1203   }
1204   AliESDVertex theVert(initPos,covmatrix,99999.,knacc);
1205   theVert.SetDispersion(sigma);
1206   delete [] vectP0;
1207   delete [] vectP1;
1208   return theVert;
1209 }
1210
1211 //---------------------------------------------------------------------------
1212 Bool_t AliVertexerTracks::TrackToPoint(AliExternalTrackParam *t,
1213                                        TMatrixD &ri,TMatrixD &wWi,
1214                                        Bool_t uUi3by3) const
1215 {
1216 //
1217 // Extract from the AliExternalTrackParam the global coordinates ri and covariance matrix
1218 // wWi of the space point that it represents (to be used in VertexFitter())
1219 //
1220
1221
1222   Double_t rotAngle = t->GetAlpha();
1223   if(rotAngle<0.) rotAngle += 2.*TMath::Pi();
1224   Double_t cosRot = TMath::Cos(rotAngle);
1225   Double_t sinRot = TMath::Sin(rotAngle);
1226
1227   ri(0,0) = t->GetX()*cosRot-t->GetY()*sinRot;
1228   ri(1,0) = t->GetX()*sinRot+t->GetY()*cosRot;
1229   ri(2,0) = t->GetZ();
1230
1231
1232
1233   if(!uUi3by3) {
1234     // matrix to go from global (x,y,z) to local (y,z);
1235     TMatrixD qQi(2,3);
1236     qQi(0,0) = -sinRot;
1237     qQi(0,1) = cosRot;
1238     qQi(0,2) = 0.;
1239     qQi(1,0) = 0.;
1240     qQi(1,1) = 0.;
1241     qQi(1,2) = 1.;
1242
1243     // covariance matrix of local (y,z) - inverted
1244     TMatrixD uUi(2,2);
1245     uUi(0,0) = t->GetSigmaY2();
1246     uUi(0,1) = t->GetSigmaZY();
1247     uUi(1,0) = t->GetSigmaZY();
1248     uUi(1,1) = t->GetSigmaZ2();
1249     //printf(" Ui :");
1250     //printf(" %f   %f",uUi(0,0),uUi(0,1));
1251     //printf(" %f   %f",uUi(1,0),uUi(1,1));
1252
1253     if(uUi.Determinant() <= 0.) return kFALSE;
1254     TMatrixD uUiInv(TMatrixD::kInverted,uUi);
1255
1256     // weights matrix: wWi = qQiT * uUiInv * qQi
1257     TMatrixD uUiInvQi(uUiInv,TMatrixD::kMult,qQi);
1258     TMatrixD m(qQi,TMatrixD::kTransposeMult,uUiInvQi);
1259     wWi = m;
1260   } else {
1261     if(fVert.GetNContributors()<1) AliFatal("Vertex from finder is empty");
1262     // matrix to go from global (x,y,z) to local (x,y,z);
1263     TMatrixD qQi(3,3);
1264     qQi(0,0) = cosRot;
1265     qQi(0,1) = sinRot;
1266     qQi(0,2) = 0.;
1267     qQi(1,0) = -sinRot;
1268     qQi(1,1) = cosRot;
1269     qQi(1,2) = 0.;
1270     qQi(2,0) = 0.;
1271     qQi(2,1) = 0.;
1272     qQi(2,2) = 1.;
1273
1274     // covariance of fVert along the track
1275     Double_t p[3],pt,ptot;
1276     t->GetPxPyPz(p);
1277     pt = TMath::Sqrt(p[0]*p[0]+p[1]*p[1]);
1278     ptot = TMath::Sqrt(pt*pt+p[2]*p[2]);
1279     Double_t cphi = p[0]/pt;               //cos(phi)=px/pt
1280     Double_t sphi = p[1]/pt;               //sin(phi)=py/pt
1281     Double_t clambda = pt/ptot;            //cos(lambda)=pt/ptot
1282     Double_t slambda = p[2]/ptot;            //sin(lambda)=pz/ptot
1283     Double_t covfVert[6];
1284     fVert.GetCovMatrix(covfVert);
1285     Double_t covfVertalongt =
1286        covfVert[0]*cphi*cphi*clambda*clambda
1287       +covfVert[1]*2.*cphi*sphi*clambda*clambda
1288       +covfVert[3]*2.*cphi*clambda*slambda
1289       +covfVert[2]*sphi*sphi*clambda*clambda
1290       +covfVert[4]*2.*sphi*clambda*slambda
1291       +covfVert[5]*slambda*slambda;
1292     // covariance matrix of local (x,y,z) - inverted
1293     TMatrixD uUi(3,3);
1294     uUi(0,0) = covfVertalongt * fnSigmaForUi00 * fnSigmaForUi00;
1295     AliDebug(1,Form("=====> sqrtUi00 cm  %f",TMath::Sqrt(uUi(0,0))));
1296     uUi(0,1) = 0.;
1297     uUi(0,2) = 0.;
1298     uUi(1,0) = 0.;
1299     uUi(1,1) = t->GetSigmaY2();
1300     uUi(1,2) = t->GetSigmaZY();
1301     uUi(2,0) = 0.;
1302     uUi(2,1) = t->GetSigmaZY();
1303     uUi(2,2) = t->GetSigmaZ2();
1304     //printf(" Ui :\n");
1305     //printf(" %f   %f\n",uUi(0,0),uUi(0,1));
1306     //printf(" %f   %f\n",uUi(1,0),uUi(1,1));
1307
1308     if(uUi.Determinant() <= 0.) return kFALSE;
1309     TMatrixD uUiInv(TMatrixD::kInverted,uUi);
1310
1311     // weights matrix: wWi = qQiT * uUiInv * qQi
1312     TMatrixD uUiInvQi(uUiInv,TMatrixD::kMult,qQi);
1313     TMatrixD m(qQi,TMatrixD::kTransposeMult,uUiInvQi);
1314     wWi = m;
1315   }
1316
1317
1318   return kTRUE;
1319 }
1320 //---------------------------------------------------------------------------
1321 void AliVertexerTracks::TooFewTracks()
1322 {
1323 //
1324 // When the number of tracks is < fMinTracks,
1325 // deal with vertices not found and prepare to exit
1326 //
1327   AliDebug(1,"TooFewTracks");
1328
1329   Double_t pos[3],err[3];
1330   pos[0] = fNominalPos[0];
1331   err[0] = TMath::Sqrt(fNominalCov[0]);
1332   pos[1] = fNominalPos[1];
1333   err[1] = TMath::Sqrt(fNominalCov[2]);
1334   pos[2] = fNominalPos[2];
1335   err[2] = TMath::Sqrt(fNominalCov[5]);
1336   Int_t    ncontr = (err[0]>1. ? -1 : -3);
1337   if(fCurrentVertex) { delete fCurrentVertex; fCurrentVertex=0; }
1338   fCurrentVertex = new AliESDVertex(pos,err);
1339   fCurrentVertex->SetNContributors(ncontr);
1340
1341   if(fConstraint) {
1342     fCurrentVertex->SetTitle("VertexerTracksWithConstraint");
1343   } else {
1344     fCurrentVertex->SetTitle("VertexerTracksNoConstraint");
1345   }
1346
1347   if(!fTrkArraySel.IsEmpty()) fTrkArraySel.Delete();
1348   if(fIdSel) {delete [] fIdSel; fIdSel=NULL;}
1349   if(fTrksToSkip) {delete [] fTrksToSkip; fTrksToSkip=NULL;}
1350
1351   return;
1352 }
1353 //---------------------------------------------------------------------------
1354 void AliVertexerTracks::VertexFinder(Int_t optUseWeights)
1355 {
1356
1357   // Get estimate of vertex position in (x,y) from tracks DCA
1358
1359   Double_t initPos[3];
1360   initPos[2] = 0.;
1361   for(Int_t i=0;i<2;i++)initPos[i]=fNominalPos[i];
1362   Int_t nacc = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast();
1363   Double_t aver[3]={0.,0.,0.};
1364   Double_t aversq[3]={0.,0.,0.};
1365   Double_t sigmasq[3]={0.,0.,0.};
1366   Double_t sigma=0;
1367   Int_t ncombi = 0;
1368   AliExternalTrackParam *track1;
1369   AliExternalTrackParam *track2;
1370   Double_t pos[3],dir[3];
1371   Double_t alpha,mindist;
1372
1373   for(Int_t i=0; i<nacc; i++){
1374     track1 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(i);
1375     alpha=track1->GetAlpha();
1376     mindist = TMath::Cos(alpha)*fNominalPos[0]+TMath::Sin(alpha)*fNominalPos[1];
1377     track1->GetXYZAt(mindist,GetFieldkG(),pos);
1378     track1->GetPxPyPzAt(mindist,GetFieldkG(),dir);
1379     AliStrLine *line1 = new AliStrLine(pos,dir);
1380
1381    //    AliStrLine *line1 = new AliStrLine();
1382    //    track1->ApproximateHelixWithLine(mindist,GetFieldkG(),line1);
1383
1384     for(Int_t j=i+1; j<nacc; j++){
1385       track2 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(j);
1386       alpha=track2->GetAlpha();
1387       mindist = TMath::Cos(alpha)*fNominalPos[0]+TMath::Sin(alpha)*fNominalPos[1];
1388       track2->GetXYZAt(mindist,GetFieldkG(),pos);
1389       track2->GetPxPyPzAt(mindist,GetFieldkG(),dir);
1390       AliStrLine *line2 = new AliStrLine(pos,dir);
1391     //      AliStrLine *line2 = new AliStrLine();
1392     //  track2->ApproximateHelixWithLine(mindist,GetFieldkG(),line2);
1393       Double_t distCA=line2->GetDCA(line1);
1394       //printf("%d   %d   %f\n",i,j,distCA);
1395        if(fDCAcut<=0 || (fDCAcut>0&&distCA<fDCAcut)){
1396         Double_t pnt1[3],pnt2[3],crosspoint[3];
1397
1398         if(optUseWeights<=0){
1399           Int_t retcode = line2->Cross(line1,crosspoint);
1400           if(retcode>=0){
1401             ncombi++;
1402             for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aver[jj]+=crosspoint[jj];
1403             for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aversq[jj]+=(crosspoint[jj]*crosspoint[jj]);
1404           }
1405         }
1406         if(optUseWeights>0){
1407           Int_t retcode = line1->CrossPoints(line2,pnt1,pnt2);
1408           if(retcode>=0){
1409             Double_t cs, sn;
1410             alpha=track1->GetAlpha();
1411             cs=TMath::Cos(alpha); sn=TMath::Sin(alpha);
1412             Double_t sx1=sn*sn*track1->GetSigmaY2(), sy1=cs*cs*track1->GetSigmaY2();
1413             alpha=track2->GetAlpha();
1414             cs=TMath::Cos(alpha); sn=TMath::Sin(alpha);
1415             Double_t sx2=sn*sn*track2->GetSigmaY2(), sy2=cs*cs*track2->GetSigmaY2();
1416             Double_t sz1=track1->GetSigmaZ2(), sz2=track2->GetSigmaZ2();
1417             Double_t wx1=sx2/(sx1+sx2), wx2=1.- wx1;
1418             Double_t wy1=sy2/(sy1+sy2), wy2=1.- wy1;
1419             Double_t wz1=sz2/(sz1+sz2), wz2=1.- wz1;
1420             crosspoint[0]=wx1*pnt1[0] + wx2*pnt2[0];
1421             crosspoint[1]=wy1*pnt1[1] + wy2*pnt2[1];
1422             crosspoint[2]=wz1*pnt1[2] + wz2*pnt2[2];
1423
1424             ncombi++;
1425             for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aver[jj]+=crosspoint[jj];
1426             for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aversq[jj]+=(crosspoint[jj]*crosspoint[jj]);
1427           }
1428         }
1429       }
1430       delete line2;
1431     }
1432     delete line1;
1433   }
1434   if(ncombi>0){
1435     for(Int_t jj=0;jj<3;jj++){
1436       initPos[jj] = aver[jj]/ncombi;
1437       //printf("%f\n",initPos[jj]);
1438       aversq[jj]/=ncombi;
1439       sigmasq[jj]=aversq[jj]-initPos[jj]*initPos[jj];
1440       sigma+=sigmasq[jj];
1441     }
1442     sigma=TMath::Sqrt(TMath::Abs(sigma));
1443   }
1444   else {
1445     Warning("VertexFinder","Finder did not succed");
1446     sigma=999;
1447   }
1448   fVert.SetXYZ(initPos);
1449   fVert.SetDispersion(sigma);
1450   fVert.SetNContributors(ncombi);
1451 }
1452 //---------------------------------------------------------------------------
1453 void AliVertexerTracks::VertexFitter()
1454 {
1455 //
1456 // The optimal estimate of the vertex position is given by a "weighted
1457 // average of tracks positions".
1458 // Original method: V. Karimaki, CMS Note 97/0051
1459 //
1460   Bool_t useConstraint = fConstraint;
1461   Double_t initPos[3];
1462   if(!fOnlyFitter) {
1463     fVert.GetXYZ(initPos);
1464   } else {
1465     initPos[0]=fNominalPos[0];
1466     initPos[1]=fNominalPos[1];
1467     initPos[2]=fNominalPos[2];
1468   }
1469
1470   Int_t nTrksSel = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntries();
1471   if(nTrksSel==1) useConstraint=kTRUE;
1472   AliDebug(1,"--- VertexFitter(): start");
1473   AliDebug(1,Form(" Number of tracks in array: %d\n",nTrksSel));
1474   AliDebug(1,Form(" Minimum # tracks required in fit: %d\n",fMinTracks));
1475   AliDebug(1,Form(" Vertex position after finder: %f,%f,%f\n",initPos[0],initPos[1],initPos[2]));
1476   if(useConstraint) AliDebug(1,Form(" This vertex will be used in fit: (%f+-%f,%f+-%f)\n",fNominalPos[0],TMath::Sqrt(fNominalCov[0]),fNominalPos[1],TMath::Sqrt(fNominalCov[2])));
1477
1478   // special treatment for few-tracks fits (e.g. secondary vertices)
1479   Bool_t uUi3by3 = kFALSE; if(nTrksSel<5 && !useConstraint) uUi3by3 = kTRUE;
1480
1481   Int_t i,j,k,step=0;
1482   TMatrixD rv(3,1);
1483   TMatrixD vV(3,3);
1484   rv(0,0) = initPos[0];
1485   rv(1,0) = initPos[1];
1486   rv(2,0) = 0.;
1487   Double_t xlStart,alpha;
1488   Int_t nTrksUsed;
1489   Double_t chi2,chi2i,chi2b;
1490   AliExternalTrackParam *t = 0;
1491   Int_t failed = 0;
1492
1493   // initial vertex covariance matrix
1494   TMatrixD vVb(3,3);
1495   vVb(0,0) = fNominalCov[0];
1496   vVb(0,1) = fNominalCov[1];
1497   vVb(0,2) = 0.;
1498   vVb(1,0) = fNominalCov[1];
1499   vVb(1,1) = fNominalCov[2];
1500   vVb(1,2) = 0.;
1501   vVb(2,0) = 0.;
1502   vVb(2,1) = 0.;
1503   vVb(2,2) = fNominalCov[5];
1504   TMatrixD vVbInv(TMatrixD::kInverted,vVb);
1505   TMatrixD rb(3,1);
1506   rb(0,0) = fNominalPos[0];
1507   rb(1,0) = fNominalPos[1];
1508   rb(2,0) = fNominalPos[2];
1509   TMatrixD vVbInvrb(vVbInv,TMatrixD::kMult,rb);
1510
1511
1512   // 2 steps:
1513   // 1st - estimate of vtx using all tracks
1514   // 2nd - estimate of global chi2
1515   for(step=0; step<2; step++) {
1516     AliDebug(1,Form(" step = %d\n",step));
1517     chi2 = 0.;
1518     nTrksUsed = 0;
1519
1520     if(step==1) { initPos[0]=rv(0,0); initPos[0]=rv(1,0); }
1521
1522     TMatrixD sumWiri(3,1);
1523     TMatrixD sumWi(3,3);
1524     for(i=0; i<3; i++) {
1525       sumWiri(i,0) = 0.;
1526       for(j=0; j<3; j++) sumWi(j,i) = 0.;
1527     }
1528
1529     // mean vertex constraint
1530     if(useConstraint) {
1531       for(i=0;i<3;i++) {
1532         sumWiri(i,0) += vVbInvrb(i,0);
1533         for(k=0;k<3;k++) sumWi(i,k) += vVbInv(i,k);
1534       }
1535       // chi2
1536       TMatrixD deltar = rv; deltar -= rb;
1537       TMatrixD vVbInvdeltar(vVbInv,TMatrixD::kMult,deltar);
1538       chi2b = deltar(0,0)*vVbInvdeltar(0,0)+
1539               deltar(1,0)*vVbInvdeltar(1,0)+
1540               deltar(2,0)*vVbInvdeltar(2,0);
1541       chi2 += chi2b;
1542     }
1543
1544     // loop on tracks
1545     for(k=0; k<nTrksSel; k++) {
1546       // get track from track array
1547       t = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(k);
1548       alpha = t->GetAlpha();
1549       xlStart = initPos[0]*TMath::Cos(alpha)+initPos[1]*TMath::Sin(alpha);
1550       // to vtxSeed (from finder)
1551       t->PropagateTo(xlStart,GetFieldkG());
1552
1553       // vector of track global coordinates
1554       TMatrixD ri(3,1);
1555       // covariance matrix of ri
1556       TMatrixD wWi(3,3);
1557
1558       // get space point from track
1559       if(!TrackToPoint(t,ri,wWi,uUi3by3)) continue;
1560       TMatrixD wWiri(wWi,TMatrixD::kMult,ri);
1561
1562       // track chi2
1563       TMatrixD deltar = rv; deltar -= ri;
1564       TMatrixD wWideltar(wWi,TMatrixD::kMult,deltar);
1565       chi2i = deltar(0,0)*wWideltar(0,0)+
1566               deltar(1,0)*wWideltar(1,0)+
1567               deltar(2,0)*wWideltar(2,0);
1568
1569       // add to total chi2
1570       chi2 += chi2i;
1571
1572       sumWiri += wWiri;
1573       sumWi   += wWi;
1574
1575       nTrksUsed++;
1576     } // end loop on tracks
1577
1578     if(nTrksUsed < fMinTracks) {
1579       failed=1;
1580       continue;
1581     }
1582
1583     Double_t determinant = sumWi.Determinant();
1584     if(determinant < fMinDetFitter)  {
1585       AliDebug(1,Form("det(V) = %f (<%f)\n",determinant,fMinDetFitter));
1586       failed=1;
1587       continue;
1588     }
1589
1590     if(step==0) {
1591       // inverted of weights matrix
1592       TMatrixD invsumWi(TMatrixD::kInverted,sumWi);
1593       vV = invsumWi;
1594       // position of primary vertex
1595       rv.Mult(vV,sumWiri);
1596     }
1597   } // end loop on the 2 steps
1598
1599   if(failed) {
1600     TooFewTracks();
1601     return;
1602   }
1603
1604   Double_t position[3];
1605   position[0] = rv(0,0);
1606   position[1] = rv(1,0);
1607   position[2] = rv(2,0);
1608   Double_t covmatrix[6];
1609   covmatrix[0] = vV(0,0);
1610   covmatrix[1] = vV(0,1);
1611   covmatrix[2] = vV(1,1);
1612   covmatrix[3] = vV(0,2);
1613   covmatrix[4] = vV(1,2);
1614   covmatrix[5] = vV(2,2);
1615
1616   // for correct chi2/ndf, count constraint as additional "track"
1617   if(fConstraint) nTrksUsed++;
1618   // store data in the vertex object
1619   if(fCurrentVertex) { delete fCurrentVertex; fCurrentVertex=0; }
1620   fCurrentVertex = new AliESDVertex(position,covmatrix,chi2,nTrksUsed);
1621
1622   AliDebug(1," Vertex after fit:");
1623   AliDebug(1,Form("xyz: %f %f %f; nc %d",fCurrentVertex->GetXv(),fCurrentVertex->GetYv(),fCurrentVertex->GetZv(),fCurrentVertex->GetNContributors()));
1624   AliDebug(1,"--- VertexFitter(): finish\n");
1625
1626
1627   return;
1628 }
1629 //----------------------------------------------------------------------------
1630 AliESDVertex* AliVertexerTracks::VertexForSelectedTracks(const TObjArray *trkArray,
1631                                                          UShort_t *id,
1632                                                          Bool_t optUseFitter,
1633                                                          Bool_t optPropagate,
1634                                                          Bool_t optUseDiamondConstraint)
1635 {
1636 //
1637 // Return vertex from tracks (AliExternalTrackParam) in array
1638 //
1639   fCurrentVertex = 0;
1640   // set optUseDiamondConstraint=TRUE only if you are reconstructing the
1641   // primary vertex!
1642   if(optUseDiamondConstraint) {
1643     SetConstraintOn();
1644   } else {
1645     SetConstraintOff();
1646   }
1647
1648   // get tracks and propagate them to initial vertex position
1649   fIdSel = new UShort_t[(Int_t)trkArray->GetEntriesFast()];
1650   Int_t nTrksSel = PrepareTracks(*trkArray,id,0);
1651   if((!optUseDiamondConstraint && nTrksSel<TMath::Max(2,fMinTracks)) ||
1652      (optUseDiamondConstraint && nTrksSel<1)) {
1653     TooFewTracks();
1654     return fCurrentVertex;
1655   }
1656
1657   // vertex finder
1658   if(nTrksSel==1) {
1659     AliDebug(1,"Just one track");
1660     OneTrackVertFinder();
1661   } else {
1662     switch (fAlgo) {
1663       case 1: StrLinVertexFinderMinDist(1); break;
1664       case 2: StrLinVertexFinderMinDist(0); break;
1665       case 3: HelixVertexFinder();          break;
1666       case 4: VertexFinder(1);              break;
1667       case 5: VertexFinder(0);              break;
1668       default: printf("Wrong algorithm\n"); break;
1669     }
1670   }
1671   AliDebug(1," Vertex finding completed\n");
1672
1673   // vertex fitter
1674   if(optUseFitter) {
1675     VertexFitter();
1676   } else {
1677     Double_t position[3]={fVert.GetXv(),fVert.GetYv(),fVert.GetZv()};
1678     Double_t covmatrix[6];
1679     fVert.GetCovMatrix(covmatrix);
1680     Double_t chi2=99999.;
1681     Int_t    nTrksUsed=fVert.GetNContributors();
1682     fCurrentVertex = new AliESDVertex(position,covmatrix,chi2,nTrksUsed);
1683   }
1684   fCurrentVertex->SetDispersion(fVert.GetDispersion());
1685
1686
1687   // set indices of used tracks and propagate track to found vertex
1688   UShort_t *indices = 0;
1689   Double_t d0z0[2],covd0z0[3];
1690   AliExternalTrackParam *t = 0;
1691   if(fCurrentVertex->GetNContributors()>0) {
1692     indices = new UShort_t[fTrkArraySel.GetEntriesFast()];
1693     for(Int_t jj=0; jj<(Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast(); jj++) {
1694       indices[jj] = fIdSel[jj];
1695       t = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(jj);
1696       if(optPropagate && optUseFitter) {
1697         if(TMath::Sqrt(fCurrentVertex->GetXv()*fCurrentVertex->GetXv()+fCurrentVertex->GetYv()*fCurrentVertex->GetYv())<3.) {
1698           t->PropagateToDCA(fCurrentVertex,GetFieldkG(),100.,d0z0,covd0z0);
1699           AliDebug(1,Form("Track %d propagated to found vertex",jj));
1700         } else {
1701           AliWarning("Found vertex outside beam pipe!");
1702         }
1703       }
1704     }
1705     fCurrentVertex->SetIndices(fCurrentVertex->GetNContributors(),indices);
1706   }
1707
1708   // clean up
1709   if (indices) {delete [] indices; indices=NULL;}
1710   delete [] fIdSel; fIdSel=NULL;
1711   fTrkArraySel.Delete();
1712
1713   return fCurrentVertex;
1714 }
1715 //----------------------------------------------------------------------------
1716 AliESDVertex* AliVertexerTracks::VertexForSelectedESDTracks(TObjArray *trkArray,
1717                                                             Bool_t optUseFitter,
1718                                                             Bool_t optPropagate,
1719                                                             Bool_t optUseDiamondConstraint)
1720
1721 {
1722 //
1723 // Return vertex from array of ESD tracks
1724 //
1725
1726   Int_t nTrks = (Int_t)trkArray->GetEntriesFast();
1727   UShort_t *id = new UShort_t[nTrks];
1728
1729   AliESDtrack *esdt = 0;
1730   for(Int_t i=0; i<nTrks; i++){
1731     esdt = (AliESDtrack*)trkArray->At(i);
1732     id[i] = (UShort_t)esdt->GetID();
1733   }
1734
1735   VertexForSelectedTracks(trkArray,id,optUseFitter,optPropagate,optUseDiamondConstraint);
1736
1737   delete [] id; id=NULL;
1738
1739   return fCurrentVertex;
1740 }
1741 //--------------------------------------------------------------------------