prevent running if CDB snapshot setting failed
[u/mrichter/AliRoot.git] / STEER / STEER / AliMC.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 // This class is extracted from the AliRun class
19 // and contains all the MC-related functionality
20 // The number of dependencies has to be reduced...
21 // Author: F.Carminati
22 //         Federico.Carminati@cern.ch
23
24 #include <string.h>
25
26 #include <RVersion.h>
27 #include <TArrayI.h>
28 #include <TClonesArray.h>
29 #include <TFile.h>
30 #include <TGeoGlobalMagField.h>
31 #include <TGeoManager.h>
32 #include <TParticle.h>
33 #include <TROOT.h>
34 #include <TStopwatch.h>
35 #include <TSystem.h>
36 #include <TVirtualMC.h>
37 #include <TMCVerbose.h>
38 #include <TTree.h>
39  
40 #include "AliCDBEntry.h"
41 #include "AliCDBManager.h"
42 #include "AliCDBStorage.h"
43 #include "AliDetector.h"
44 #include "AliGenerator.h"
45 #include "AliGeomManager.h"
46 #include "AliHeader.h"
47 #include "AliHit.h"
48 #include "AliLego.h"
49 #include "AliLog.h"
50 #include "AliMC.h"
51 #include "AliMagF.h"
52 #include "AliRun.h"
53 #include "AliSimulation.h"
54 #include "AliStack.h"
55 #include "AliTrackReference.h"
56 #include "AliTransportMonitor.h"
57
58 using std::endl;
59 using std::cout;
60 ClassImp(AliMC)
61
62 //_______________________________________________________________________
63 AliMC::AliMC() :
64   fGenerator(0),
65   fSaveRndmStatus(kFALSE),
66   fSaveRndmEventStatus(kFALSE),
67   fReadRndmStatus(kFALSE),
68   fUseMonitoring(kFALSE),
69   fRndmFileName("random.root"),
70   fEventEnergy(0),
71   fSummEnergy(0),
72   fSum2Energy(0),
73   fTrRmax(1.e10),
74   fTrZmax(1.e10),
75   fRDecayMax(1.e10),
76   fRDecayMin(-1.),
77   fDecayPdg(0),
78   fImedia(0),
79   fTransParName("\0"),
80   fMonitor(0),
81   fHitLists(0),
82   fTmpTreeTR(0),
83   fTmpFileTR(0),
84   fTrackReferences(),
85   fTmpTrackReferences()
86
87 {
88   //default constructor
89   DecayLimits();
90 }
91
92 //_______________________________________________________________________
93 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
94   TVirtualMCApplication(name, title),
95   fGenerator(0),
96   fSaveRndmStatus(kFALSE),
97   fSaveRndmEventStatus(kFALSE),
98   fReadRndmStatus(kFALSE),
99   fUseMonitoring(kFALSE),
100   fRndmFileName("random.root"),
101   fEventEnergy(0),
102   fSummEnergy(0),
103   fSum2Energy(0),
104   fTrRmax(1.e10),
105   fTrZmax(1.e10),
106   fRDecayMax(1.e10),
107   fRDecayMin(-1.),
108   fDecayPdg(0),
109   fImedia(new TArrayI(1000)),
110   fTransParName("\0"),
111   fMonitor(0),
112   fHitLists(new TList()),
113   fTmpTreeTR(0),
114   fTmpFileTR(0),
115   fTrackReferences("AliTrackReference", 100),
116   fTmpTrackReferences("AliTrackReference", 100)
117 {
118   //constructor
119   // Set transport parameters
120   SetTransPar();
121   DecayLimits();
122   // Prepare the tracking medium lists
123   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
124 }
125
126 //_______________________________________________________________________
127 AliMC::~AliMC()
128 {
129   //destructor
130   delete fGenerator;
131   delete fImedia;
132   delete fHitLists;
133   delete fMonitor;
134   // Delete track references
135 }
136
137 //_______________________________________________________________________
138 void  AliMC::ConstructGeometry() 
139 {
140   //
141   // Either load geometry from file or create it through usual
142   // loop on detectors. In the first case the method
143   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
144   // at InitGeometry().
145   //
146
147   if(AliSimulation::Instance()->IsGeometryFromFile()){ //load geometry either from CDB or from file
148     if(IsGeometryFromCDB()){
149       AliInfo("Loading geometry from CDB default storage");
150       AliCDBPath path("GRP","Geometry","Data");
151       AliCDBEntry *entry=AliCDBManager::Instance()->Get(path.GetPath());
152       if(!entry) AliFatal("Unable to load geometry from CDB!");
153       entry->SetOwner(0);
154       gGeoManager = (TGeoManager*) entry->GetObject();
155       if (!gGeoManager) AliFatal("TGeoManager object not found in the specified CDB entry!");
156     }else{
157       // Load geometry
158       const char *geomfilename = AliSimulation::Instance()->GetGeometryFile();
159       if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
160         AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s",geomfilename));
161         TGeoManager::Import(geomfilename);
162       }else{
163         AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
164         return;
165       }
166     }
167     TVirtualMC::GetMC()->SetRootGeometry();
168   }else{
169     // Create modules, materials, geometry
170     if (!gGeoManager) new TGeoManager("ALICE", "ALICE geometry");
171     TStopwatch stw;
172     TIter next(gAlice->Modules());
173     AliModule *detector;
174     AliDebug(1, "Geometry creation:");
175     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
176       stw.Start();
177       // Initialise detector materials and geometry
178       detector->CreateMaterials();
179       detector->CreateGeometry();
180       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
181                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
182     }
183   }
184   
185 }
186
187 //_______________________________________________________________________
188 Bool_t  AliMC::MisalignGeometry() 
189 {
190   // Call misalignment code if AliSimulation object was defined.
191   
192   if(!AliSimulation::Instance()->IsGeometryFromFile()){
193     //Set alignable volumes for the whole geometry
194     SetAllAlignableVolumes();
195   }
196   // Misalign geometry via AliSimulation instance
197   if (!AliSimulation::Instance()) return kFALSE;
198   AliGeomManager::SetGeometry(gGeoManager);
199   if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT("ALL"))
200     AliFatal("Current loaded geometry differs in the definition of symbolic names!");
201   
202   return AliSimulation::Instance()->MisalignGeometry(AliRunLoader::Instance());
203 }   
204
205 //_______________________________________________________________________
206 void  AliMC::ConstructOpGeometry() 
207 {
208   //
209   // Loop all detector modules and call DefineOpticalProperties() method 
210   //
211
212   TIter next(gAlice->Modules());
213   AliModule *detector;
214   AliInfo("Optical properties definition");
215   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
216     // Initialise detector geometry
217     if(AliSimulation::Instance()->IsGeometryFromFile()) detector->CreateMaterials();
218     // Initialise detector optical properties
219     detector->DefineOpticalProperties();
220   }  
221 }
222
223 #include <TPDGCode.h>
224 //_______________________________________________________________________
225 void  AliMC::AddParticles()
226 {
227   //
228   // Add particles (not present in Geant3 or Geant4)
229   //
230   
231   cout << "########## AliMC::AddParticles"  << endl;
232
233   //Hypertriton
234   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010010030, "HyperTriton", kPTHadron, 2.99131 , 1.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, kFALSE);
235   //Anti-Hypertriton
236   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010010030, "AntiHyperTriton", kPTHadron, 2.99131 , 1.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, kFALSE);
237
238   //Hyper hydrogen 4
239   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010010040, "Hyperhydrog4", kPTHadron, 3.931 , 1.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 4, kFALSE);
240   //Anti-Hyper hydrogen 4
241   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010010040, "AntiHyperhydrog4", kPTHadron, 3.931 , 1.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 4, kFALSE);
242
243   //Hyper helium 4
244   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010020040, "Hyperhelium4", kPTHadron, 3.929 , 2.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 4, kFALSE);
245   //Anti-Hyper helium 4
246   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010020040, "AntiHyperhelium4", kPTHadron, 3.929 , 2.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 4, kFALSE);
247
248   //Lambda-Neutron 
249   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010000020, "LambdaNeutron", kPTNeutron, 2.054 , 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
250
251   //Anti-Lambda-Neutron
252   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010000020, "AntiLambdaNeutron", kPTNeutron, 2.054 , 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
253
254   //H-Dibaryon
255   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1020000020, "Hdibaryon", kPTNeutron, 2.23, 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
256   //Anti-H-Dibaryon
257   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1020000020, "AntiHdibaryon", kPTNeutron, 2.23, 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
258
259   //Xi-Proton
260   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1030000020, "Xi0Proton", kPTHadron, 2.248 , 1.0, 1.333e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
261
262   //Anti-Xi-Proton
263   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1030000020, "AntiXi0Proton", kPTHadron, 2.248 , 1.0, 1.333e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
264   
265   //Lambda-Neutron-Neutron
266   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010000030, "LambdaNeutronNeutron", kPTNeutron, 2.982 , 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
267   
268   //Anti-Lambda-Neutron-Neutron
269   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010000030, "AntiLambdaNeutronNeutron", kPTNeutron, 2.982 , 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
270   
271   //Resonances not in Generators
272   // f0(980) assume 70 MeV as width (PDG: 40 to 100 MeV)
273   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(9010221, "f0_980", kPTNeutron, 0.98 , 0.0, 9.403e-24,"Hadron", 7e-2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, kTRUE);
274
275   // f2(1270) (PDG: width = 185 MeV)
276   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(225, "f2_1270", kPTNeutron, 1.275 , 0.0, 3.558e-24,"Hadron", 0.185, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, kTRUE);
277
278   // Define the 2- and 3-body phase space decay for the Hyper-Triton
279   Int_t mode[6][3];                  
280   Float_t bratio[6];
281
282   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
283      bratio[kz] = 0.;
284      mode[kz][0] = 0;
285      mode[kz][1] = 0;
286      mode[kz][2] = 0;
287   }
288   bratio[0] = 50.;
289   mode[0][0] = 1000020030; // Helium3 
290   mode[0][1] = -211; // negative pion
291   
292   bratio[1] = 50.;
293   mode[1][0] = 1000010020; // deuteron 
294   mode[1][1] = 2212; // proton
295   mode[1][2] = -211; // negative pion
296
297   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010010030,bratio,mode);
298
299
300
301   // Define the 2- and 3-body phase space decay for the Anti-Hyper-Triton
302   Int_t amode[6][3];                  
303   Float_t abratio[6];
304
305   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
306      abratio[kz] = 0.;
307      amode[kz][0] = 0;
308      amode[kz][1] = 0;
309      amode[kz][2] = 0;
310   }
311   abratio[0] = 50.;
312   amode[0][0] = -1000020030; // anti- Helium3 
313   amode[0][1] = 211; // positive pion
314   abratio[1] = 50.;
315   amode[1][0] = -1000010020; // anti-deuteron 
316   amode[1][1] = -2212; // anti-proton
317   amode[1][2] = 211; // positive pion
318
319   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010010030,abratio,amode);
320   
321   ////// ----------Hypernuclei with Mass=4 ----------- //////////
322   
323    // Define the 2- and 3-body phase space decay for the Hyper Hydrogen 4
324    
325   Int_t mode3[6][3];                  
326   Float_t bratio3[6];
327
328   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
329      bratio3[kz] = 0.;
330      mode3[kz][0] = 0;
331      mode3[kz][1] = 0;
332      mode3[kz][2] = 0;
333   }
334   bratio3[0] = 50.;
335   mode3[0][0] = 1000020040; // Helium4 
336   mode3[0][1] = -211; // negative pion
337   
338   bratio3[1] = 50.;
339   mode3[1][0] = 1000010030; // tritium
340   mode3[1][1] = 2212; // proton
341   mode3[1][2] = -211; // negative pion
342
343   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010010040,bratio3,mode3);
344
345
346   // Define the 2- and 3-body phase space decay for the Hyper Hydrogen 4
347   Int_t amode3[6][3];                  
348   Float_t abratio3[6];
349
350   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
351      abratio3[kz] = 0.;
352      amode3[kz][0] = 0;
353      amode3[kz][1] = 0;
354      amode3[kz][2] = 0;
355   }
356   abratio3[0] = 50.;
357   amode3[0][0] = -1000020040; // anti- Helium4 
358   amode3[0][1] = 211; // positive pion
359   abratio3[1] = 50.;
360   amode3[1][0] = -1000010030; // anti-tritium
361   amode3[1][1] = -2212; // anti-proton
362   amode3[1][2] = 211; // positive pion
363
364   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010010040,abratio3,amode3);
365   
366   
367    // Define the 3-body phase space decay for the Hyper Helium 4
368   Int_t mode4[6][3];                  
369   Float_t bratio4[6];
370
371   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
372      bratio4[kz] = 0.;
373      mode4[kz][0] = 0;
374      mode4[kz][1] = 0;
375      mode4[kz][2] = 0;
376   }
377   bratio4[0] = 100.;
378   mode4[0][0] = 1000020030; // Helium3 
379   mode4[0][1] = -211; // negative pion
380   mode4[0][2] = 2212; // proton
381   
382   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010020040,bratio4,mode4);
383
384
385   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-Hyper Helium 4
386   Int_t amode4[6][3];                  
387   Float_t abratio4[6];
388
389   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
390      abratio4[kz] = 0.;
391      amode4[kz][0] = 0;
392      amode4[kz][1] = 0;
393      amode4[kz][2] = 0;
394   }
395   abratio4[0] = 100.;
396   amode4[0][0] = -1000020030; // anti-Helium 3
397   amode4[0][1] = 211; // positive pion
398   amode4[0][2] = -2212; // anti proton
399
400   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010020040,abratio4,amode4);
401
402   
403   // Define the 2-body phase space decay for the Lambda-neutron boundstate
404   Int_t mode1[6][3];                  
405   Float_t bratio1[6];
406
407   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
408      bratio1[kz] = 0.;
409      mode1[kz][0] = 0;
410      mode1[kz][1] = 0;
411      mode1[kz][2] = 0;
412   }
413   bratio1[0] = 100.;
414   mode1[0][0] = 1000010020; // deuteron 
415   mode1[0][1] = -211; // negative pion
416
417   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010000020,bratio1,mode1);
418
419
420   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-Lambda-neutron boundstate
421   Int_t amode1[6][3];                  
422   Float_t abratio1[6];
423
424   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
425      abratio1[kz] = 0.;
426      amode1[kz][0] = 0;
427      amode1[kz][1] = 0;
428      amode1[kz][2] = 0;
429   }
430   abratio1[0] = 100.;
431   amode1[0][0] = -1000010020; // anti-deuteron 
432   amode1[0][1] = 211; // positive pion
433
434   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010000020,abratio1,amode1);
435
436   // Define the 2-body phase space decay for the H-Dibaryon
437   Int_t mode2[6][3];                  
438   Float_t bratio2[6];
439
440   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
441      bratio2[kz] = 0.;
442      mode2[kz][0] = 0;
443      mode2[kz][1] = 0;
444      mode2[kz][2] = 0;
445   }
446   bratio2[0] = 100.;
447   mode2[0][0] = 3122; // Lambda 
448   mode2[0][1] = 2212; // proton
449   mode2[0][2] = -211; // negative pion
450
451   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1020000020,bratio2,mode2);
452
453   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-H-Dibaryon
454   Int_t amode2[6][3];                  
455   Float_t abratio2[6];
456
457   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
458      abratio2[kz] = 0.;
459      amode2[kz][0] = 0;
460      amode2[kz][1] = 0;
461      amode2[kz][2] = 0;
462   }
463   abratio2[0] = 100.;
464   amode2[0][0] = -3122; // anti-deuteron 
465   amode2[0][1] = -2212; // anti-proton
466   amode2[0][2] = 211; // positive pion
467
468   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1020000020,abratio2,amode2);
469
470   // Define the 2-body phase space decay for the Xi0P
471   Int_t mode5[6][3];
472   Float_t bratio5[6];
473   
474   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
475     bratio5[kz] = 0.;
476     mode5[kz][0] = 0;
477     mode5[kz][1] = 0;
478     mode5[kz][2] = 0;
479   }
480   bratio5[0] = 100.;
481   mode5[0][0] = 3122; // Lambda
482   mode5[0][1] = 2212; // proton
483   
484   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1030000020,bratio5,mode5);
485   
486   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-Xi0P
487   Int_t amode5[6][3];
488   Float_t abratio5[6];
489
490   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
491     abratio5[kz] = 0.;
492     amode5[kz][0] = 0;
493     amode5[kz][1] = 0;
494     amode5[kz][2] = 0;
495   }
496   abratio5[0] = 100.;
497   amode5[0][0] = -3122; // anti-Lambda
498   amode5[0][1] = -2212; // anti-proton
499   
500   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1030000020,abratio5,amode5);
501   
502   // Define the 2-body phase space decay for the Lambda-Neutron-Neutron
503   Int_t mode6[6][3];
504   Float_t bratio6[6];
505
506   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
507     bratio6[kz] = 0.;
508     mode6[kz][0] = 0;
509     mode6[kz][1] = 0;
510     mode6[kz][2] = 0;
511   }
512   bratio6[0] = 100.;
513   mode6[0][0] = 1000010030; // triton
514   mode6[0][1] = -211; // pion
515   
516   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010000030,bratio6,mode6);
517   
518   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-Lambda-Neutron-Neutron
519   Int_t amode6[6][3];
520   Float_t abratio6[6];
521   
522   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
523     abratio6[kz] = 0.;
524     amode6[kz][0] = 0;
525     amode6[kz][1] = 0;
526     amode6[kz][2] = 0;
527   }
528   abratio6[0] = 100.;
529   amode6[0][0] = -1000010030; // anti-triton
530   amode6[0][1] = 211; // pion
531   
532   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010000030,abratio6,amode6);
533
534   ///////////////////////////////////////////////////////////////////
535   
536   // Define the 2-body phase space decay for the f0(980)
537 //  Int_t mode[6][3];
538 //  Float_t bratio[6];
539
540   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
541     bratio[kz] = 0.;
542     mode[kz][0] = 0;
543     mode[kz][1] = 0;
544     mode[kz][2] = 0;
545   }
546   bratio[0] = 100.;
547   mode[0][0] = 211; // pion
548   mode[0][1] = -211; // pion
549   
550   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(9010221,bratio,mode);
551
552     // Define the 2-body phase space decay for the f2(1270)
553 //  Int_t mode[6][3];
554 //  Float_t bratio[6];
555
556   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
557     bratio[kz] = 0.;
558     mode[kz][0] = 0;
559     mode[kz][1] = 0;
560     mode[kz][2] = 0;
561   }
562   bratio[0] = 100.;
563   mode[0][0] = 211; // pion
564   mode[0][1] = -211; // pion
565   
566   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(225,bratio,mode);
567
568   // Lambda1520/Lambda1520bar
569
570   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(3124, "Lambda1520", kPTNeutron, 1.5195 , 0.0, 4.22e-23,"Hadron", 0.0156, 3, -1, 0, 0, 0, 0, 3, 0, kTRUE);
571   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-3124, "Lambda1520bar", kPTNeutron, 1.5195 , 0.0, 4.22e-23,"Hadron", 0.0156, 3, -1, 0, 0, 0, 0, 3, 0, kTRUE);
572
573   // Lambda1520 decay modes
574
575   // L(1520) -> p K-
576   bratio[0] = 0.223547;
577   mode[0][0] = 2212;
578   mode[0][1] = -321;
579
580   // L(1520) -> n K0
581   bratio[1] = 0.223547;
582   mode[1][0] = 2112;
583   mode[1][1] = -311;
584
585   // L(1520) -> Sigma+ pi-
586   bratio[2] = 0.139096;
587   mode[2][0] = 3222;
588   mode[2][1] = -211;
589
590   // L(1520) -> Sigma0 pi0
591   bratio[3] = 0.139096;
592   mode[3][0] = 3212;
593   mode[3][1] = 111;
594
595   // L(1520) -> Sigma- pi+
596   bratio[4] = 0.139096;
597   mode[4][0] = 3112;
598   mode[4][1] = 211;
599
600   // The other decay modes are neglected
601   bratio[5] = 0.;
602   mode[5][0] = 0;
603   mode[5][1] = 0;
604
605   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(3124,bratio,mode);
606
607   // Lambda1520bar decay modes
608
609   // L(1520)bar -> p- K+
610   bratio[0] = 0.223547;
611   mode[0][0] = -2212;
612   mode[0][1] = 321;
613
614   // L(1520)bar -> nbar K0bar
615   bratio[1] = 0.223547;
616   mode[1][0] = -2112;
617   mode[1][1] = 311;
618
619   // L(1520)bar -> Sigmabar- pi+
620   bratio[2] = 0.139096;
621   mode[2][0] = -3222;
622   mode[2][1] = 211;
623
624   // L(1520)bar -> Sigma0bar pi0
625   bratio[3] = 0.139096;
626   mode[3][0] = -3212;
627   mode[3][1] = 111;
628
629   // L(1520)bar -> Sigmabar+ pi-
630   bratio[4] = 0.139096;
631   mode[4][0] = -3112;
632   mode[4][1] = -211;
633
634   // The other decay modes are neglected
635   bratio[5] = 0.;
636   mode[5][0] = 0;
637   mode[5][1] = 0;
638
639   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-3124,bratio,mode);
640
641   // --------------------------------------------------------------------
642 }  
643   
644 //_______________________________________________________________________
645 void  AliMC::InitGeometry()
646
647   //
648   // Initialize detectors
649   //
650
651   AliInfo("Initialisation:");
652   TStopwatch stw;
653   TIter next(gAlice->Modules());
654   AliModule *detector;
655   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
656     stw.Start();
657     detector->Init();
658     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
659                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
660   }
661 }
662
663 //_______________________________________________________________________
664 void AliMC::SetGeometryFromCDB()
665 {
666   // Set the loading of geometry from cdb instead of creating it
667   // A default CDB storage needs to be set before this method is called
668   if(AliCDBManager::Instance()->IsDefaultStorageSet() &&
669      AliCDBManager::Instance()->GetRun() >= 0)
670     AliSimulation::Instance()->SetGeometryFile("*OCDB*");
671   else
672     AliError("Loading of geometry from CDB ignored. First set a default CDB storage!");
673 }
674
675 //_______________________________________________________________________
676 Bool_t AliMC::IsGeometryFromCDB() const
677 {
678   return (strcmp(AliSimulation::Instance()->GetGeometryFile(),"*OCDB*")==0);
679 }
680
681 //_______________________________________________________________________
682 void  AliMC::SetAllAlignableVolumes()
683
684   //
685   // Add alignable volumes (TGeoPNEntries) looping on all
686   // active modules
687   //
688
689   AliInfo(Form("Setting entries for all alignable volumes of active detectors"));
690   AliModule *detector;
691   TIter next(gAlice->Modules());
692   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
693     detector->AddAlignableVolumes();
694   }
695 }
696
697 //_______________________________________________________________________
698 void  AliMC::GeneratePrimaries() 
699
700   //
701   // Generate primary particles and fill them in the stack.
702   //
703
704   Generator()->Generate();
705 }
706
707 //_______________________________________________________________________
708 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
709 {
710   //
711   // Load the event generator
712   //
713   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
714 }
715
716 //_______________________________________________________________________
717 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
718 {
719   //
720   // Load the event generator
721   //
722   if(fGenerator) {
723     if(generator) {
724       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
725                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()));
726     }
727     else {
728       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
729                       fGenerator->GetName()));
730     }
731   }
732   fGenerator = generator;
733 }
734
735 //_______________________________________________________________________
736 void AliMC::FinishRun()
737 {
738   // Clean generator information
739   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
740   fGenerator->FinishRun();
741   
742   // Monitoring information
743   if (fMonitor) {
744     fMonitor->Print();
745     fMonitor->Export("timing.root");
746   }  
747
748   //Output energy summary tables
749   AliDebug(1, "EnergySummary()");
750   ToAliDebug(1, EnergySummary());
751 }
752
753 //_______________________________________________________________________
754 void AliMC::BeginPrimary()
755 {
756   //
757   // Called  at the beginning of each primary track
758   //
759   
760   // Reset Hits info
761   ResetHits();
762   ResetTrackReferences();
763 }
764
765 //_______________________________________________________________________
766 void AliMC::PreTrack()
767 {
768   // Actions before the track's transport
769
770      //verbose.PreTrack();
771
772      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
773      AliModule *module;
774
775      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
776        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
777          module->PreTrack();
778 }
779
780 //_______________________________________________________________________
781 void AliMC::Stepping() 
782 {
783   //
784   // Called at every step during transport
785   //
786   //verbose.Stepping();
787
788   Int_t id = DetFromMate(TVirtualMC::GetMC()->CurrentMedium());
789   if (id < 0) return;
790
791
792   if ( TVirtualMC::GetMC()->IsNewTrack()            && 
793        TVirtualMC::GetMC()->TrackTime() == 0.       &&
794        fRDecayMin >= 0.             &&  
795        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
796        TVirtualMC::GetMC()->TrackPid() == fDecayPdg ) 
797   {
798       FixParticleDecaytime();
799   } 
800     
801   // --- If monitoring timing was requested, monitor the step
802   if (fUseMonitoring) {
803     if (!fMonitor) {
804       fMonitor = new AliTransportMonitor(TVirtualMC::GetMC()->NofVolumes()+1);
805       fMonitor->Start();
806     }  
807     if (TVirtualMC::GetMC()->IsNewTrack() || TVirtualMC::GetMC()->TrackTime() == 0. || TVirtualMC::GetMC()->TrackStep()<1.1E-10) {
808       fMonitor->DummyStep();
809     } else {
810     // Normal stepping
811       Int_t copy;
812       Int_t volId = TVirtualMC::GetMC()->CurrentVolID(copy);
813       Int_t pdg = TVirtualMC::GetMC()->TrackPid();
814       TLorentzVector xyz, pxpypz;
815       TVirtualMC::GetMC()->TrackPosition(xyz);
816       TVirtualMC::GetMC()->TrackMomentum(pxpypz);
817       fMonitor->StepInfo(volId, pdg, pxpypz.E(), xyz.X(), xyz.Y(), xyz.Z());
818     }  
819   }
820   //
821   // --- If lego option, do it and leave 
822   if (AliSimulation::Instance()->Lego())
823     AliSimulation::Instance()->Lego()->StepManager();
824   else {
825     Int_t copy;
826     //Update energy deposition tables
827     AddEnergyDeposit(TVirtualMC::GetMC()->CurrentVolID(copy),TVirtualMC::GetMC()->Edep());
828     //
829     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
830
831     if (TVirtualMC::GetMC()->IsTrackDisappeared() && !(TVirtualMC::GetMC()->IsTrackAlive())) {      
832         if (TVirtualMC::GetMC()->Etot() > 0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber(), 
833                                                 AliTrackReference::kDisappeared);
834         
835
836     }
837
838     //Call the appropriate stepping routine;
839     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
840     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
841       det->StepManager();
842     }
843   }
844 }
845
846 //_______________________________________________________________________
847 void AliMC::EnergySummary()
848 {
849   //e
850   // Print summary of deposited energy
851   //
852
853   Int_t ndep=0;
854   Float_t edtot=0;
855   Float_t ed, ed2;
856   Int_t kn, i, left, j, id;
857   const Float_t kzero=0;
858   Int_t ievent=AliRunLoader::Instance()->GetHeader()->GetEvent()+1;
859   //
860   // Energy loss information
861   if(ievent) {
862     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
863     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
864       ed=fSummEnergy[kn];
865       if(ed>0) {
866         fEventEnergy[ndep]=kn;
867         if(ievent>1) {
868           ed=ed/ievent;
869           ed2=fSum2Energy[kn];
870           ed2=ed2/ievent;
871           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
872         } else 
873           ed2=99;
874         fSummEnergy[ndep]=ed;
875         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
876         edtot+=ed;
877         ndep++;
878       }
879     }
880     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
881       left=ndep-kn*3;
882       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
883         j=kn*3+i;
884         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
885         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",TVirtualMC::GetMC()->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
886       }
887       printf("\n");
888     }
889     //
890     // Relative energy loss in different detectors
891     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
892     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
893     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
894       left=ndep-kn*5;
895       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
896         j=kn*5+i;
897         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
898         printf(" %s %10.3f%%;",TVirtualMC::GetMC()->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
899       }
900       printf("\n");
901     }
902     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*"); 
903     printf("\n");
904   }
905   //
906   // Reset the TArray's
907   //  fEventEnergy.Set(0);
908   //  fSummEnergy.Set(0);
909   //  fSum2Energy.Set(0);
910 }
911 #include <TFile.h>
912 //_____________________________________________________________________________
913 void AliMC::BeginEvent()
914 {
915   //
916   // Clean-up previous event
917   // Energy scores
918   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
919   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
920   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
921   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
922   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
923   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
924   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
925
926   AliRunLoader *runloader=AliRunLoader::Instance();
927
928   /*******************************/    
929   /*   Clean after eventual      */
930   /*   previous event            */
931   /*******************************/    
932
933   
934   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
935   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
936   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,  
937   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
938      
939   fEventEnergy.Reset();  
940     // Clean detector information
941   
942   if (runloader->Stack())
943       runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
944   else
945       runloader->MakeStack();//or make a new one
946   
947   // Random engine status
948   //
949   
950   if ( fSaveRndmStatus || fSaveRndmEventStatus) {
951     TString fileName="random";
952     if ( fSaveRndmEventStatus ) {
953       fileName += "Evt";
954       fileName += gAlice->GetEventNrInRun();
955     }
956     fileName += ".root";
957        
958     // write ROOT random engine status
959     cout << "Saving random engine status in " << fileName.Data() << endl;
960     TFile f(fileName.Data(),"RECREATE");
961     gRandom->Write(fileName.Data());
962   }     
963
964   if ( fReadRndmStatus ) {
965     //read ROOT random engine status
966     cout << "Reading random engine status from " << fRndmFileName.Data() << endl;
967     TFile f(fRndmFileName.Data());
968     gRandom->Read(fRndmFileName.Data());    
969   }       
970
971   if(AliSimulation::Instance()->Lego() == 0x0)
972   { 
973       AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
974       runloader->MakeTree("K");
975   }
976   
977   AliDebug(1, "TVirtualMC::GetMC()->SetStack(fRunLoader->Stack())");
978   TVirtualMC::GetMC()->SetStack(runloader->Stack());//Was in InitMC - but was moved here 
979                                      //because we don't have guarantee that 
980                                      //stack pointer is not going to change from event to event
981                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
982   //
983   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
984   //
985     
986   runloader->GetHeader()->Reset(AliCDBManager::Instance()->GetRun(),gAlice->GetEvNumber(),
987                                 gAlice->GetEventNrInRun());
988 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
989
990   if(AliSimulation::Instance()->Lego()) 
991   {
992       AliSimulation::Instance()->Lego()->BeginEvent();
993       return;
994   }
995   
996
997   AliDebug(1, "ResetHits()");
998   ResetHits();
999   
1000   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
1001   runloader->MakeTree("H");
1002   
1003
1004
1005   MakeTmpTrackRefsTree();
1006   //create new branches and SetAdresses
1007   TIter next(gAlice->Modules());
1008   AliModule *detector;
1009   while((detector = (AliModule*)next()))
1010    {
1011        AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
1012        detector->MakeBranch("H"); 
1013    }
1014 }
1015
1016 //_______________________________________________________________________
1017 void AliMC::ResetHits()
1018 {
1019   //
1020   //  Reset all Detectors hits
1021   //
1022   TIter next(gAlice->Modules());
1023   AliModule *detector;
1024   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1025      detector->ResetHits();
1026   }
1027 }
1028
1029 //_______________________________________________________________________
1030 void AliMC::ResetDigits()
1031 {
1032   //
1033   //  Reset all Detectors digits
1034   //
1035   TIter next(gAlice->Modules());
1036   AliModule *detector;
1037   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1038      detector->ResetDigits();
1039   }
1040 }
1041
1042 //_______________________________________________________________________
1043 void AliMC::ResetSDigits()
1044 {
1045   //
1046   //  Reset all Detectors digits
1047   //
1048   TIter next(gAlice->Modules());
1049   AliModule *detector;
1050   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1051      detector->ResetSDigits();
1052   }
1053 }
1054
1055 //_______________________________________________________________________
1056 void AliMC::PostTrack()
1057 {
1058   // Posts tracks for each module
1059
1060   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
1061   AliModule *module;
1062   
1063   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
1064     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
1065       module->PostTrack();
1066 }
1067
1068 //_______________________________________________________________________
1069 void AliMC::FinishPrimary()
1070 {
1071   //
1072   // Called  at the end of each primary track
1073   //
1074
1075   AliRunLoader *runloader=AliRunLoader::Instance();
1076   //  static Int_t count=0;
1077   //  const Int_t times=10;
1078   // This primary is finished, purify stack
1079 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
1080   if (!(TVirtualMC::GetMC()->SecondariesAreOrdered())) {
1081       if (runloader->Stack()->ReorderKine()) RemapHits();
1082   }
1083 #endif
1084   if (runloader->Stack()->PurifyKine()) RemapHits();
1085   
1086   TIter next(gAlice->Modules());
1087   AliModule *detector;
1088   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1089     detector->FinishPrimary();
1090     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
1091     if(loader)
1092      {
1093        TTree* treeH = loader->TreeH();
1094        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
1095      }
1096   }
1097
1098   // Write out track references if any
1099   if (fTmpTreeTR) fTmpTreeTR->Fill();
1100 }
1101
1102 void AliMC::RemapHits()
1103 {
1104 //    
1105 // Remaps the track labels of the hits
1106     AliRunLoader *runloader=AliRunLoader::Instance();
1107     AliStack* stack = runloader->Stack();
1108     TList* hitLists = GetHitLists();
1109     TIter next(hitLists);
1110     TCollection *hitList;
1111     
1112     while((hitList = dynamic_cast<TCollection*>(next()))) {
1113         TIter nexthit(hitList);
1114         AliHit *hit;
1115         while((hit = dynamic_cast<AliHit*>(nexthit()))) {
1116             hit->SetTrack(stack->TrackLabel(hit->GetTrack()));
1117         }
1118     }
1119     
1120     // 
1121     // This for detectors which have a special mapping mechanism
1122     // for hits, such as TPC and TRD
1123     //
1124
1125     
1126     TObjArray* modules = gAlice->Modules();
1127     TIter nextmod(modules);
1128     AliModule *module;
1129     while((module = (AliModule*) nextmod())) {
1130         AliDetector* det = dynamic_cast<AliDetector*> (module);
1131         if (det) det->RemapTrackHitIDs(stack->TrackLabelMap());
1132     }
1133     //
1134     RemapTrackReferencesIDs(stack->TrackLabelMap());
1135 }
1136
1137 //_______________________________________________________________________
1138 void AliMC::FinishEvent()
1139 {
1140   //
1141   // Called at the end of the event.
1142   //
1143     
1144   if(AliSimulation::Instance()->Lego()) AliSimulation::Instance()->Lego()->FinishEvent();
1145
1146   TIter next(gAlice->Modules());
1147   AliModule *detector;
1148   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1149     detector->FinishEvent();
1150   }
1151
1152   //Update the energy deposit tables
1153   Int_t i;
1154   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++) 
1155    {
1156     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
1157     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
1158    }
1159
1160   AliRunLoader *runloader=AliRunLoader::Instance();
1161
1162   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
1163   AliStack* stack = runloader->Stack();
1164   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
1165    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
1166     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
1167     return;//never reached
1168    }  
1169   // Update Header information 
1170   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
1171   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());  
1172   header->SetTimeStamp(AliSimulation::Instance()->GenerateTimeStamp());
1173
1174   // Write out the kinematics
1175   if (!AliSimulation::Instance()->Lego()) stack->FinishEvent();
1176
1177   // Synchronize the TreeTR with TreeK
1178   if (fTmpTreeTR) ReorderAndExpandTreeTR();
1179    
1180   // Write out the event Header information
1181   TTree* treeE = runloader->TreeE();
1182   if (treeE) 
1183    {
1184       header->SetStack(stack);
1185       treeE->Fill();
1186    }
1187   else
1188    {
1189     AliError("Can not get TreeE from RL");
1190    }
1191   
1192   if(AliSimulation::Instance()->Lego() == 0x0)
1193    {
1194      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
1195      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
1196      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
1197    }
1198    
1199   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1200   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1201   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1202   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
1203   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1204   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1205   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1206 }
1207
1208 //_______________________________________________________________________
1209 void AliMC::Init()
1210 {
1211   // MC initialization
1212
1213
1214    //=================Create Materials and geometry
1215    TVirtualMC::GetMC()->Init();
1216   // Set alignable volumes for the whole geometry (with old root)
1217 #if ROOT_VERSION_CODE < 331527
1218   SetAllAlignableVolumes();
1219 #endif
1220    //Read the cuts for all materials
1221    ReadTransPar();
1222    //Build the special IMEDIA table
1223    MediaTable();
1224
1225    //Compute cross-sections
1226    TVirtualMC::GetMC()->BuildPhysics();
1227    
1228    //Initialise geometry deposition table
1229    fEventEnergy.Set(TVirtualMC::GetMC()->NofVolumes()+1);
1230    fSummEnergy.Set(TVirtualMC::GetMC()->NofVolumes()+1);
1231    fSum2Energy.Set(TVirtualMC::GetMC()->NofVolumes()+1);
1232
1233    // Register MC in configuration 
1234    AliConfig::Instance()->Add(TVirtualMC::GetMC());
1235 }
1236
1237 //_______________________________________________________________________
1238 void AliMC::MediaTable()
1239 {
1240   //
1241   // Built media table to get from the media number to
1242   // the detector id
1243   //
1244
1245   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
1246   //  Int_t ibeg;
1247   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
1248   AliModule *det;
1249   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
1250   //
1251   // For all detectors
1252   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
1253     // If detector is defined
1254     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
1255         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed()); 
1256         for(nz=0;nz<100;nz++) {
1257             
1258         // Find max and min material number
1259         if((idt=idtmed[nz])) {
1260           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
1261           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
1262         }
1263       }
1264       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
1265         det->LoMedium() = 0;
1266         det->HiMedium() = 0;
1267       } else {
1268         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
1269           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
1270                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
1271           return;
1272         }
1273         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
1274         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
1275           (*fImedia)[lz]=kz;
1276         }
1277       }
1278     }
1279   }
1280   //
1281   // Print summary table
1282   AliInfo("Tracking media ranges:");
1283   ToAliInfo(
1284   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
1285     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
1286       ind=i*6+k;
1287       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
1288       if(det)
1289         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
1290                det->HiMedium());
1291       else
1292         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
1293     }
1294     printf("\n");
1295   }
1296             );
1297 }
1298
1299 //_______________________________________________________________________
1300 void AliMC::ReadTransPar()
1301 {
1302   //
1303   // Read filename to set the transport parameters
1304   //
1305
1306
1307   const Int_t kncuts=10;
1308   const Int_t knflags=12;
1309   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
1310   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
1311                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
1312                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
1313                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL","STRA"};
1314   char line[256];
1315   char detName[7];
1316   char* filtmp;
1317   Float_t cut[kncuts];
1318   Int_t flag[knflags];
1319   Int_t i, itmed, iret, jret, ktmed, kz;
1320   FILE *lun;
1321   //
1322   // See whether the file is there
1323   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
1324   lun=fopen(filtmp,"r");
1325   delete [] filtmp;
1326   if(!lun) {
1327     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
1328     return;
1329   }
1330   //
1331   while(1) {
1332     // Initialise cuts and flags
1333     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
1334     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
1335     itmed=0;
1336     memset(line,0,256);
1337     // Read up to the end of line excluded
1338     iret=fscanf(lun,"%255[^\n]",line);
1339     if(iret<0) {
1340       //End of file
1341       fclose(lun);
1342       return;
1343     }
1344     // Read the end of line
1345     jret = fscanf(lun,"%*c");
1346     if(!iret) continue;
1347     if(line[0]=='*') continue;
1348     // Read the numbers
1349     iret=sscanf(line,"%6s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
1350                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
1351                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
1352                 &flag[8],&flag[9],&flag[10],&flag[11]);
1353     if(!iret) continue;
1354     if(iret<0) {
1355       //reading error
1356       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
1357       continue;
1358     }
1359     // Check that the module exist
1360     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
1361     if(mod) {
1362       // Get the array of media numbers
1363       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
1364       // Check that the tracking medium code is valid
1365       if(0<=itmed && itmed < 100) {
1366         ktmed=idtmed[itmed];
1367         if(!ktmed) {
1368           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
1369           continue;
1370         }
1371         // Set energy thresholds
1372         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
1373           if(cut[kz]>=0) {
1374             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
1375                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
1376             TVirtualMC::GetMC()->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
1377           }
1378         }
1379         // Set transport mechanisms
1380         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
1381           if(flag[kz]>=0) {
1382             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
1383                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
1384             TVirtualMC::GetMC()->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
1385           }
1386         }
1387       } else {
1388         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
1389         continue;
1390       }
1391     } else {
1392       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
1393       continue;
1394     }
1395   }
1396 }
1397
1398 //_______________________________________________________________________
1399 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
1400 {
1401   //
1402   // Sets the file name for transport parameters
1403   //
1404   fTransParName = filename;
1405 }
1406
1407 //_______________________________________________________________________
1408 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
1409 {
1410   //
1411   //  Add a hit to detector id
1412   //
1413   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
1414   if(dets[id]) static_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
1415 }
1416
1417 //_______________________________________________________________________
1418 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
1419 {
1420   //
1421   // Add digit to detector id
1422   //
1423   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
1424   if(dets[id]) static_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
1425 }
1426
1427 //_______________________________________________________________________
1428 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
1429   //
1430   // Returns current track
1431   //
1432   return AliRunLoader::Instance()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
1433 }
1434
1435 //_______________________________________________________________________
1436 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
1437 {
1438   //
1439   // Dumps particle i in the stack
1440   //
1441   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1442    if (runloader->Stack())
1443     runloader->Stack()->DumpPart(i);
1444 }
1445
1446 //_______________________________________________________________________
1447 void AliMC::DumpPStack () const
1448 {
1449   //
1450   // Dumps the particle stack
1451   //
1452   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1453    if (runloader->Stack())
1454     runloader->Stack()->DumpPStack();
1455 }
1456
1457 //_______________________________________________________________________
1458 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
1459   //
1460   // Returns number of tracks in stack
1461   //
1462   Int_t ntracks = -1;
1463   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1464    if (runloader->Stack())
1465      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
1466    return ntracks;
1467 }
1468
1469 //_______________________________________________________________________
1470 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
1471 {
1472   //
1473   // return number of primary that has generated track
1474   //
1475   Int_t nprimary = -999;
1476   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1477   if (runloader->Stack())
1478     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
1479   return nprimary;
1480 }
1481  
1482 //_______________________________________________________________________
1483 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
1484 {
1485   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
1486   // the remaping done by PurifyKine
1487   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1488   if (runloader)
1489    if (runloader->Stack())
1490     return runloader->Stack()->Particle(i);
1491   return 0x0;   
1492 }
1493
1494 //_______________________________________________________________________
1495 const TObjArray* AliMC::Particles() const {
1496   //
1497   // Returns pointer to Particles array
1498   //
1499   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1500   if (runloader)
1501    if (runloader->Stack())
1502     return runloader->Stack()->Particles();
1503   return 0x0;
1504 }
1505
1506 //_______________________________________________________________________
1507 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, const Float_t *pmom,
1508                       const Float_t *vpos, const Float_t *polar, Float_t tof,
1509                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1510
1511 // Delegate to stack
1512 //
1513   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1514   if (runloader)
1515     if (runloader->Stack())
1516       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
1517                                     mech, ntr, weight, is);
1518 }
1519
1520 //_______________________________________________________________________
1521 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
1522                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
1523                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
1524                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
1525                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1526
1527   // Delegate to stack
1528   //
1529   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1530   if (runloader)
1531     if (runloader->Stack())
1532       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
1533                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
1534 }
1535
1536 //_______________________________________________________________________
1537 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
1538 {
1539     //
1540     // Set high water mark for last track in event
1541   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1542   if (runloader)
1543     if (runloader->Stack())
1544       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
1545 }
1546
1547 //_______________________________________________________________________
1548 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
1549
1550   //
1551   // Delegate to stack
1552   //
1553   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1554   if (runloader)
1555     if (runloader->Stack())
1556       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
1557 }
1558  
1559 //_______________________________________________________________________
1560 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
1561 {
1562   // Delegate to stack
1563   //
1564   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1565   if (runloader)
1566     if (runloader->Stack())
1567       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
1568 }
1569
1570 //_______________________________________________________________________
1571 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
1572
1573   //
1574   // Set current track number
1575   //
1576   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1577   if (runloader)
1578     if (runloader->Stack())
1579       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track); 
1580 }
1581
1582 //_______________________________________________________________________
1583 AliTrackReference*  AliMC::AddTrackReference(Int_t label, Int_t id) 
1584 {
1585   //
1586   // add a trackrefernce to the list
1587   Int_t primary = GetPrimary(label);
1588   Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
1589
1590   Int_t nref = fTmpTrackReferences.GetEntriesFast();
1591   return new(fTmpTrackReferences[nref]) AliTrackReference(label, id);
1592 }
1593
1594
1595
1596 //_______________________________________________________________________
1597 void AliMC::ResetTrackReferences()
1598 {
1599   //
1600   //  Reset all  references
1601   //
1602     fTmpTrackReferences.Clear();
1603 }
1604
1605 //_______________________________________________________________________
1606 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(const Int_t *map)
1607 {
1608   // 
1609   // Remapping track reference
1610   // Called at finish primary
1611   //
1612     
1613   Int_t nEntries = fTmpTrackReferences.GetEntries();
1614   for (Int_t i=0; i < nEntries; i++){
1615       AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTmpTrackReferences.UncheckedAt(i));
1616       if (ref) {
1617           Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1618           if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1619           else {
1620               ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1621               fTmpTrackReferences.RemoveAt(i);  
1622           }      
1623       } // if ref
1624   }
1625   fTmpTrackReferences.Compress();
1626 }
1627
1628 //_______________________________________________________________________
1629 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1630 {
1631     //
1632     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1633     //
1634
1635     TLorentzVector p;
1636     TVirtualMC::GetMC()->TrackMomentum(p);
1637     Double_t tmin, tmax;
1638     Double_t b;
1639
1640     // Transverse velocity 
1641     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1642     
1643     if ((b = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1644
1645         // Radius of helix
1646         
1647         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1648         
1649         // Revolution frequency
1650         
1651         Double_t omega = vt / rho;
1652         
1653         // Maximum and minimum decay time
1654         //
1655         // Check for curlers first
1656         const Double_t kOvRhoSqr2 = 1./(rho*TMath::Sqrt(2.));
1657         if (fRDecayMax * kOvRhoSqr2 > 1.) return;
1658         
1659         //
1660  
1661         tmax  = TMath::ACos((1.-fRDecayMax*kOvRhoSqr2)*(1.+fRDecayMax*kOvRhoSqr2)) / omega;   // [ct]
1662         tmin  = TMath::ACos((1.-fRDecayMin*kOvRhoSqr2)*(1.+fRDecayMin*kOvRhoSqr2)) / omega;   // [ct]
1663     } else {
1664         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct] 
1665         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1666     }
1667     
1668     //
1669     // Dial t using the two limits
1670     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1671     //
1672     //
1673     // Force decay time in transport code
1674     //
1675     TVirtualMC::GetMC()->ForceDecayTime(t / 2.99792458e10);
1676 }
1677
1678 void AliMC::MakeTmpTrackRefsTree()
1679 {
1680     // Make the temporary track reference tree
1681     fTmpFileTR = new TFile("TrackRefsTmp.root", "recreate");
1682     fTmpTreeTR = new TTree("TreeTR", "Track References");
1683     TClonesArray* pRef = &fTmpTrackReferences;
1684     fTmpTreeTR->Branch("TrackReferences", &pRef, 4000);
1685 }
1686
1687 //_______________________________________________________________________
1688 void AliMC::ReorderAndExpandTreeTR()
1689 {
1690 //
1691 //  Reorder and expand the temporary track reference tree in order to match the kinematics tree
1692 //
1693
1694     AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
1695 //
1696 //  TreeTR
1697     AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
1698     rl->MakeTrackRefsContainer(); 
1699     TTree * treeTR = rl->TreeTR();
1700         // make branch for central track references
1701         TClonesArray* pRef = &fTrackReferences;
1702         treeTR->Branch("TrackReferences", &pRef);
1703
1704     AliStack* stack  = rl->Stack();
1705     Int_t np = stack->GetNprimary();
1706     Int_t nt = fTmpTreeTR->GetEntries();
1707     //
1708     // Loop over tracks and find the secondaries with the help of the kine tree
1709     Int_t ifills = 0;
1710     Int_t it = 0;
1711     for (Int_t ip = np - 1; ip > -1; ip--) {
1712         TParticle *part = stack->Particle(ip);
1713         //printf("Particle %5d %5d %5d %5d %5d \n", ip, part->GetPdgCode(), part->GetFirstMother(), part->GetFirstDaughter(), part->GetLastDaughter());
1714         
1715         // Skip primaries that have not been transported
1716         Int_t dau1  = part->GetFirstDaughter();
1717         Int_t dau2  = -1;
1718         if (!part->TestBit(kTransportBit)) continue;
1719         //
1720         fTmpTreeTR->GetEntry(it++);
1721         Int_t nh = fTmpTrackReferences.GetEntries();
1722         // Determine range of secondaries produced by this primary
1723         if (dau1 > -1) {
1724             Int_t inext = ip - 1;
1725             while (dau2 < 0) {
1726                 if (inext >= 0) {
1727                     part = stack->Particle(inext);
1728                     dau2 =  part->GetFirstDaughter();
1729                     if (!(part->TestBit(kTransportBit)) || dau2 == -1 || dau2 < np) {
1730 //                  if (dau2 == -1 || dau2 < np) {
1731                         dau2 = -1;
1732                     } else {
1733                         dau2--;
1734                     }
1735                 } else {
1736                     dau2 = stack->GetNtrack() - 1;
1737                 }
1738                 inext--;
1739             } // find upper bound
1740         }  // dau2 < 0
1741 //      printf("Check (1) %5d %5d %5d %5d %5d \n", ip, np, it, dau1, dau2);
1742         // 
1743         // Loop over reference hits and find secondary label
1744         for (Int_t id = dau1; (id <= dau2) && (dau1 > -1); id++) {
1745             for (Int_t ih = 0; ih < nh; ih++) {
1746                 AliTrackReference* tr = (AliTrackReference*) fTmpTrackReferences.At(ih);
1747                 Int_t label = tr->Label();
1748                 // Skip primaries
1749                 if (label == ip) continue;
1750                 if (label > dau2 || label < dau1) 
1751                     AliWarning(Form("Track Reference Label out of range !: %5d %5d %5d \n", label, dau1, dau2));
1752                 if (label == id) {
1753                     // secondary found
1754                     Int_t nref =  fTrackReferences.GetEntriesFast();
1755                     new(fTrackReferences[nref]) AliTrackReference(*tr);
1756                 }
1757             } // hits
1758             treeTR->Fill();
1759             fTrackReferences.Clear();
1760             ifills++;
1761         } // daughters
1762     } // tracks
1763     //
1764     // Now loop again and write the primaries
1765     it = nt - 1;
1766     for (Int_t ip = 0; ip < np; ip++) {
1767         TParticle* part = stack->Particle(ip);
1768 //      if ((part->GetFirstDaughter() == -1 && part->GetStatusCode() <= 1) || part->GetFirstDaughter() >= np) 
1769         if (part->TestBit(kTransportBit))
1770         {
1771             // Skip particles that have not been transported
1772             fTmpTreeTR->GetEntry(it--);
1773             Int_t nh = fTmpTrackReferences.GetEntries();
1774             // 
1775             // Loop over reference hits and find primary labels
1776             for (Int_t ih = 0; ih < nh; ih++) {
1777                 AliTrackReference* tr = (AliTrackReference*)  fTmpTrackReferences.At(ih);
1778                 Int_t label = tr->Label();
1779                 if (label == ip) {
1780                     Int_t nref = fTrackReferences.GetEntriesFast();
1781                     new(fTrackReferences[nref]) AliTrackReference(*tr);
1782                 }
1783             } 
1784         }
1785         treeTR->Fill();
1786         fTrackReferences.Clear();
1787         ifills++;
1788     } // tracks
1789     // Check
1790     if (ifills != stack->GetNtrack()) 
1791         AliWarning(Form("Number of entries in TreeTR (%5d) unequal to TreeK (%5d) \n", ifills, stack->GetNtrack()));
1792 //
1793 //  Clean-up
1794     delete fTmpTreeTR;
1795     fTmpFileTR->Close();
1796     delete fTmpFileTR;
1797     fTmpTrackReferences.Clear();
1798     gSystem->Exec("rm -rf TrackRefsTmp.root");
1799 }
1800