TOF/AliTOFtracker.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtracker Class                                                //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TSeqCollection.h>
  33 #include <TClonesArray.h>
  34 #include <TGeoManager.h>
  35 #include <TTree.h>
  36 #include <TFile.h>
  37 #include <TH2F.h>
  38
  39 #include "AliGeomManager.h"
  40 #include "AliESDtrack.h"
  41 #include "AliESDEvent.h"
  42 #include "AliLog.h"
  43 #include "AliTrackPointArray.h"
  44 #include "AliCDBManager.h"
  45
  46 #include "AliTOFpidESD.h"
  47 #include "AliTOFRecoParam.h"
  48 #include "AliTOFReconstructor.h"
  49 #include "AliTOFcluster.h"
  50 #include "AliTOFGeometry.h"
  51 #include "AliTOFtracker.h"
  52 #include "AliTOFtrack.h"
  53
  54 extern TGeoManager *gGeoManager;
  55 extern TROOT *gROOT;
  56
  57 ClassImp(AliTOFtracker)
  58
  59 //_____________________________________________________________________________
  60 AliTOFtracker::AliTOFtracker():
  61   fRecoParam(0x0),
  62   fGeom(0x0),
  63   fPid(0x0),
  64   fN(0),
  65   fNseeds(0),
  66   fNseedsTOF(0),
  67   fngoodmatch(0),
  68   fnbadmatch(0),
  69   fnunmatch(0),
  70   fnmatch(0),
  71   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  72   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
  73   fHDigClusMap(0x0),
  74   fHDigNClus(0x0),
  75   fHDigClusTime(0x0),
  76   fHDigClusToT(0x0),
  77   fHRecNClus(0x0),
  78   fHRecDist(0x0),
  79   fHRecSigYVsP(0x0),
  80   fHRecSigZVsP(0x0),
  81   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  82   fHRecSigZVsPWin(0x0),
  83   fCalTree(0x0),
  84   fIch(-1),
  85   fToT(-1.),
  86   fTime(-1.),
  87   fExpTimePi(-1.),
  88   fExpTimeKa(-1.),
  89   fExpTimePr(-1.)
  90  {
  91   //AliTOFtracker main Ctor
  92
  93    // Gettimg the geometry
  94    fGeom= new AliTOFGeometry();
  95
  96    InitCheckHists();
  97
  98 }
  99 //_____________________________________________________________________________
 100 AliTOFtracker::~AliTOFtracker() {
 101   //
 102   // Dtor
 103   //
 104
 105   SaveCheckHists();
 106
 107   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
 108     delete fRecoParam;
 109   }
 110   delete fGeom;
 111   delete fPid;
 112   delete fHDigClusMap;
 113   delete fHDigNClus;
 114   delete fHDigClusTime;
 115   delete fHDigClusToT;
 116   delete fHRecNClus;
 117   delete fHRecDist;
 118   delete fHRecSigYVsP;
 119   delete fHRecSigZVsP;
 120   delete fHRecSigYVsPWin;
 121   delete fHRecSigZVsPWin;
 122   delete fCalTree;
 123   if (fTracks){
 124     fTracks->Delete();
 125     delete fTracks;
 126     fTracks=0x0;
 127   }
 128   if (fSeeds){
 129     fSeeds->Delete();
 130     delete fSeeds;
 131     fSeeds=0x0;
 132   }
 133
 134 }
 135 //_____________________________________________________________________________
 136 Int_t AliTOFtracker::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
 137   //
 138   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 139   //
 140
 141   // initialize RecoParam for current event
 142
 143   AliInfo("Initializing params for TOF... ");
 144
 145   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 146
 147   if (fRecoParam == 0x0) {
 148     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 149   }
 150   //fRecoParam->Dump();
 151   //if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
 152   //fRecoParam->PrintParameters();
 153
 154   Double_t parPID[2];
 155   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
 156   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
 157   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
 158
 159   //Initialise some counters
 160
 161   fNseeds=0;
 162   fNseedsTOF=0;
 163   fngoodmatch=0;
 164   fnbadmatch=0;
 165   fnunmatch=0;
 166   fnmatch=0;
 167
 168   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 169   fNseeds = ntrk;
 170   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
 171
 172
 173   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 174
 175   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 176     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 177     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
 178   }
 179
 180   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 181   CollectESD();
 182
 183   //First Step with Strict Matching Criterion
 184   MatchTracks(kFALSE);
 185
 186   //Second Step with Looser Matching Criterion
 187   MatchTracks(kTRUE);
 188
 189   AliInfo(Form("Number of matched tracks: %d",fnmatch));
 190   AliInfo(Form("Number of good matched tracks: %d",fngoodmatch));
 191   AliInfo(Form("Number of bad  matched tracks: %d",fnbadmatch));
 192
 193   //Update the matched ESD tracks
 194
 195   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 196     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 197     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 198     if(seed->GetTOFsignal()>0){
 199       t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 200       t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 201       t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 202       t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 203       t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 204       t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 205       Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 206       t->SetTOFLabel(tlab);
 207       AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 208       t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout);
 209       delete track;
 210     }
 211   }
 212
 213   //Handle Time Zero information
 214
 215   Double_t timeZero=0.;
 216   Double_t timeZeroMax=99999.;
 217   Bool_t usetimeZero     = fRecoParam->UseTimeZero();
 218   Bool_t timeZeroFromT0  = fRecoParam->GetTimeZerofromT0();
 219   Bool_t timeZeroFromTOF = fRecoParam->GetTimeZerofromTOF();
 220
 221   AliDebug(1,Form("Use Time Zero?: %d",usetimeZero));
 222   AliDebug(1,Form("Time Zero from T0? : %d",timeZeroFromT0));
 223   AliDebug(1,Form("Time Zero From TOF? : %d",timeZeroFromTOF));
 224
 225   if(usetimeZero){
 226     if(timeZeroFromT0){
 227       timeZero=GetTimeZerofromT0(event);
 228     }
 229     if(timeZeroFromTOF && (timeZero>timeZeroMax || !timeZeroFromT0)){
 230       timeZero=GetTimeZerofromTOF(event);
 231     }
 232   }
 233   AliDebug(2,Form("time Zero used in PID: %f",timeZero));
 234   //Make TOF PID
 235   fPid->MakePID(event,timeZero);
 236
 237   fSeeds->Clear();
 238   fTracks->Clear();
 239   return 0;
 240
 241 }
 242 //_________________________________________________________________________
 243 void AliTOFtracker::CollectESD() {
 244    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 245
 246   Int_t seedsTOF1=0;
 247   Int_t seedsTOF2=0;
 248
 249   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 250   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 251
 252     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 253     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 254
 255     // TRD 'good' tracks, already propagated at 372 cm
 256
 257     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 258     Double_t x = track->GetX(); //New
 259     if (((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 260          ( x >= AliTOFGeometry::RinTOF()) ){
 261       track->SetSeedIndex(i);
 262       t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout);
 263       new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 264       fNseedsTOF++;
 265       seedsTOF1++;
 266       delete track;
 267     }
 268
 269     // Propagate the rest of TPCbp
 270
 271     else {
 272       if(track->PropagateToInnerTOF()){
 273         track->SetSeedIndex(i);
 274         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout);
 275         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 276         fNseedsTOF++;
 277         seedsTOF2++;
 278       }
 279       delete track;
 280     }
 281   }
 282
 283   AliInfo(Form("Number of TOF seeds %i",fNseedsTOF));
 284   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 1 %i",seedsTOF1));
 285   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 2 %i",seedsTOF2));
 286
 287   // Sort according uncertainties on track position
 288   fTracks->Sort();
 289
 290 }
 291 //_________________________________________________________________________
 292 void AliTOFtracker::MatchTracks( Bool_t mLastStep){
 293
 294
 295   // Parameters used/regulating the reconstruction
 296
 297   static Float_t corrLen=0.75;
 298   static Float_t detDepth=15.3;
 299   static Float_t padDepth=0.5;
 300
 301   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 302   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 303
 304   Float_t sensRadius = fRecoParam->GetSensRadius();
 305   Float_t stepSize   = fRecoParam->GetStepSize();
 306   Float_t scaleFact   = fRecoParam->GetWindowScaleFact();
 307   Float_t dyMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 308   Float_t dzMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 309   Float_t dCut=fRecoParam->GetDistanceCut();
 310   Double_t maxChi2=fRecoParam->GetMaxChi2TRD();
 311   Bool_t timeWalkCorr    = fRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 312   if(!mLastStep){
 313     AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 314     AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 315     AliDebug(1,Form("TOF step size: %f",stepSize));
 316     AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 317     AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 318     AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 319     AliDebug(1,Form("TOF distance Cut: %f",dCut));
 320     AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 321     AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 322   }
 323   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 324
 325
 326   // Get the number of propagation steps
 327
 328   Int_t nSteps=(Int_t)(detDepth/stepSize);
 329
 330   //PH Arrays (moved outside of the loop)
 331
 332   Float_t * trackPos[4];
 333   for (Int_t ii=0; ii<4; ii++) trackPos[ii] = new Float_t[nSteps];
 334   Int_t * clind = new Int_t[fN];
 335
 336   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 337
 338     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 339     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
 340     if(t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 341     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
 342
 343     // Some init
 344
 345     Int_t         index[10000];
 346     Float_t        dist[10000];
 347     Float_t       distZ[10000];
 348     Float_t       cxpos[10000];
 349     Float_t       crecL[10000];
 350     TGeoHMatrix   global[1000];
 351
 352     // Determine a window around the track
 353
 354     Double_t x,par[5];
 355     trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 356     Double_t cov[15];
 357     trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 358
 359     Double_t dphi=
 360       scaleFact*
 361       ((5*TMath::Sqrt(cov[0]) + 0.5*dY + 2.5*TMath::Abs(par[2]))/sensRadius);
 362     Double_t dz=
 363        scaleFact*
 364        (5*TMath::Sqrt(cov[2]) + 0.5*dZ + 2.5*TMath::Abs(par[3]));
 365
 366     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 367     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 368     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 369     Double_t z=par[1];
 370
 371     //upper limit on window's size.
 372
 373     if(dz> dzMax) dz=dzMax;
 374     if(dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 375
 376
 377     Int_t nc=0;
 378
 379     // find the clusters in the window of the track
 380
 381     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 382
 383       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 384       if (c->GetZ() > z+dz) break;
 385       if (c->IsUsed()) continue;
 386
 387       if (!c->GetStatus()) {
 388               AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 389               continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 390       }
 391
 392       Double_t dph=TMath::Abs(c->GetPhi()-phi);
 393       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 394       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 395
 396       Double_t yc=(c->GetPhi() - trackTOFin->GetAlpha())*c->GetR();
 397       Double_t p[2]={yc, c->GetZ()};
 398       Double_t cov2[3]= {dY*dY/12., 0., dZ*dZ/12.};
 399       if (trackTOFin->AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov2) > maxChi2)continue;
 400
 401       clind[nc] = k;
 402       Char_t path[100];
 403       Int_t ind[5];
 404       ind[0]=c->GetDetInd(0);
 405       ind[1]=c->GetDetInd(1);
 406       ind[2]=c->GetDetInd(2);
 407       ind[3]=c->GetDetInd(3);
 408       ind[4]=c->GetDetInd(4);
 409       fGeom->GetVolumePath(ind,path);
 410       gGeoManager->cd(path);
 411       global[nc] = *gGeoManager->GetCurrentMatrix();
 412       nc++;
 413     }
 414
 415     //start fine propagation
 416
 417     Int_t nStepsDone = 0;
 418     for( Int_t istep=0; istep<nSteps; istep++){
 419
 420       Float_t xs=AliTOFGeometry::RinTOF()+istep*0.1;
 421       Double_t ymax=xs*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 422
 423       Bool_t skip=kFALSE;
 424       Double_t ysect=trackTOFin->GetYat(xs,skip);
 425       if (skip) break;
 426       if (ysect > ymax) {
 427         if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 428           break;
 429         }
 430       } else if (ysect <-ymax) {
 431         if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 432           break;
 433         }
 434       }
 435
 436       if(!trackTOFin->PropagateTo(xs)) {
 437         break;
 438       }
 439
 440       nStepsDone++;
 441
 442       // store the running point (Globalrf) - fine propagation
 443
 444       Double_t r[3];
 445       trackTOFin->GetXYZ(r);
 446       trackPos[0][istep]= (Float_t) r[0];
 447       trackPos[1][istep]= (Float_t) r[1];
 448       trackPos[2][istep]= (Float_t) r[2];
 449       trackPos[3][istep]= trackTOFin->GetIntegratedLength();
 450     }
 451
 452
 453     Int_t nfound = 0;
 454     Bool_t accept = kFALSE;
 455     Bool_t isInside =kFALSE;
 456     for (Int_t istep=0; istep<nStepsDone; istep++) {
 457
 458       Float_t ctrackPos[3];
 459
 460       ctrackPos[0]= trackPos[0][istep];
 461       ctrackPos[1]= trackPos[1][istep];
 462       ctrackPos[2]= trackPos[2][istep];
 463
 464       //now see whether the track matches any of the TOF clusters
 465
 466       Float_t dist3d[3];
 467       accept=kFALSE;
 468       for (Int_t i=0; i<nc; i++){
 469         isInside=fGeom->IsInsideThePad(global[i],ctrackPos,dist3d);
 470
 471         if( mLastStep){
 472           Float_t xLoc=dist3d[0];
 473           Float_t rLoc=TMath::Sqrt(dist3d[1]*dist3d[1]+dist3d[2]*dist3d[2]);
 474           accept = (TMath::Abs(xLoc)<padDepth*0.5 && rLoc<dCut);
 475         }
 476         else{
 477           accept = isInside;
 478         }
 479         if(accept){
 480           dist[nfound]=TMath::Sqrt(dist3d[0]*dist3d[0]+dist3d[1]*dist3d[1]+dist3d[2]*dist3d[2]);
 481           distZ[nfound]=dist3d[2];
 482           crecL[nfound]=trackPos[3][istep];
 483           index[nfound]=clind[i]; // store cluster id
 484           cxpos[nfound]=AliTOFGeometry::RinTOF()+istep*0.1; //store prop.radius
 485           nfound++;
 486           if(accept &&!mLastStep)break;
 487         }//end if accept
 488       } //end for on the clusters
 489       if(accept &&!mLastStep)break;
 490     } //end for on the steps
 491
 492
 493
 494     if (nfound == 0 ) {
 495       fnunmatch++;
 496       delete trackTOFin;
 497       continue;
 498     }
 499
 500     fnmatch++;
 501
 502     // now choose the cluster to be matched with the track.
 503
 504     Int_t idclus=-1;
 505     Float_t  recL = 0.;
 506     Float_t  xpos=0.;
 507     Float_t  mindist=1000.;
 508     Float_t  mindistZ=0.;
 509     for (Int_t iclus= 0; iclus<nfound;iclus++){
 510       if (dist[iclus]< mindist){
 511         mindist = dist[iclus];
 512         mindistZ = distZ[iclus];
 513         xpos = cxpos[iclus];
 514         idclus =index[iclus];
 515         recL=crecL[iclus]+corrLen*0.5;
 516       }
 517     }
 518
 519
 520     AliTOFcluster *c=fClusters[idclus];
 521
 522     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 523                      iseed,
 524                      fnmatch-1,
 525                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 526                      c->GetLabel(0), c->GetLabel(1), c->GetLabel(2),
 527                      idclus)); // AdC
 528
 529     c->Use();
 530
 531     // Track length correction for matching Step 2
 532
 533     if(mLastStep){
 534       Float_t rc=TMath::Sqrt(c->GetR()*c->GetR() + c->GetZ()*c->GetZ());
 535       Float_t rt=TMath::Sqrt(trackPos[0][70]*trackPos[0][70]
 536                              +trackPos[1][70]*trackPos[1][70]
 537                              +trackPos[2][70]*trackPos[2][70]);
 538       Float_t dlt=rc-rt;
 539       recL=trackPos[3][70]+dlt;
 540     }
 541
 542     if (
 543         (c->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 544         ||
 545         (c->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 546         ||
 547         (c->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 548         ) {
 549       fngoodmatch++;
 550
 551        AliDebug(2,Form(" track label good %5i",trackTOFin->GetLabel()));
 552
 553     }
 554     else{
 555       fnbadmatch++;
 556
 557       AliDebug(2,Form(" track label  bad %5i",trackTOFin->GetLabel()));
 558
 559     }
 560
 561     delete trackTOFin;
 562
 563     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 564     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*c->GetToT()*1E-3; // in ns
 565     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 566     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDCRAW()+32; // RAW time,in ps
 567     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 568     t->SetTOFsignalDz(mindistZ);
 569     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f, z distance: %f time: %f = ",rawTime,mindistZ));
 570     Int_t ind[5];
 571     ind[0]=c->GetDetInd(0);
 572     ind[1]=c->GetDetInd(1);
 573     ind[2]=c->GetDetInd(2);
 574     ind[3]=c->GetDetInd(3);
 575     ind[4]=c->GetDetInd(4);
 576     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 577     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 578
 579     // keep track of the track labels in the matched cluster
 580     Int_t tlab[3];
 581     tlab[0]=c->GetLabel(0);
 582     tlab[1]=c->GetLabel(1);
 583     tlab[2]=c->GetLabel(2);
 584     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %i = ",c->GetTDC()));
 585     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC()+32; // in ps
 586     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 587     Double_t tofcorr=tof;
 588     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(mindistZ,tof);
 589     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 590     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 591     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 592     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 593
 594     //Tracking info
 595     Double_t time[AliPID::kSPECIES]; t->GetIntegratedTimes(time);
 596     Double_t mom=t->GetP();
 597     for(Int_t j=0;j<AliPID::kSPECIES;j++){
 598       Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 599       time[j]+=(recL-trackPos[3][0])/3e-2*TMath::Sqrt(mom*mom+mass*mass)/mom;
 600     }
 601
 602     AliTOFtrack *trackTOFout = new AliTOFtrack(*t);
 603     trackTOFout->PropagateTo(xpos);
 604     t->UpdateTrackParams(trackTOFout,AliESDtrack::kTOFout);
 605     t->SetIntegratedLength(recL);
 606     t->SetIntegratedTimes(time);
 607     t->SetTOFLabel(tlab);
 608
 609
 610     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 611     fHRecNClus->Fill(nc);
 612     fHRecDist->Fill(mindist);
 613     fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 614     fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 615     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 616     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 617
 618     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 619
 620     if ( !((t->GetStatus() & AliESDtrack::kTIME)==0 )){
 621       fIch=calindex;
 622       fToT=tToT;
 623       fTime=rawTime;
 624       fExpTimePi=time[2];
 625       fExpTimeKa=time[3];
 626       fExpTimePr=time[4];
 627       fCalTree->Fill();
 628     }
 629     delete trackTOFout;
 630   }
 631   for (Int_t ii=0; ii<4; ii++) delete [] trackPos[ii];
 632   delete [] clind;
 633
 634 }
 635 //_________________________________________________________________________
 636 Int_t AliTOFtracker::LoadClusters(TTree *cTree) {
 637   //--------------------------------------------------------------------
 638   //This function loads the TOF clusters
 639   //--------------------------------------------------------------------
 640
 641   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 642   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 643   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 644   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 645   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 646
 647   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 648   if (!branch) {
 649     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 650     return 1;
 651   }
 652
 653   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 654   dummy.Clear();
 655   TClonesArray *clusters=&dummy;
 656   branch->SetAddress(&clusters);
 657
 658   cTree->GetEvent(0);
 659   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 660   fHDigNClus->Fill(nc);
 661
 662   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 663
 664   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 665     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 666     fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 667
 668   // Fill Digits QA histos
 669
 670     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 671     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 672     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 673     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 674     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 675
 676     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 677     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 678
 679     Int_t stripOffset = 0;
 680     switch (iplate) {
 681     case 0:
 682       stripOffset = 0;
 683       break;
 684     case 1:
 685       stripOffset = nStripC;
 686       break;
 687     case 2:
 688       stripOffset = nStripC+nStripB;
 689       break;
 690     case 3:
 691       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 692       break;
 693     case 4:
 694       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 695       break;
 696     default:
 697       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 698       break;
 699     };
 700     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 701     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 702     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 703     fHDigClusTime->Fill(time);
 704     fHDigClusToT->Fill(tot);
 705
 706   }
 707
 708
 709   return 0;
 710 }
 711 //_________________________________________________________________________
 712 void AliTOFtracker::UnloadClusters() {
 713   //--------------------------------------------------------------------
 714   //This function unloads TOF clusters
 715   //--------------------------------------------------------------------
 716   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 717     delete fClusters[i];
 718     fClusters[i] = 0x0;
 719   }
 720   fN=0;
 721 }
 722
 723 //_________________________________________________________________________
 724 Int_t AliTOFtracker::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 725   //--------------------------------------------------------------------
 726   // This function returns the index of the nearest cluster
 727   //--------------------------------------------------------------------
 728   if (fN==0) return 0;
 729   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 730   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 731   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 732   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 733     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 734     else e=m;
 735   }
 736   return m;
 737 }
 738
 739 //_________________________________________________________________________
 740 Bool_t AliTOFtracker::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 741 {
 742   // Get track space point with index i
 743   // Coordinates are in the global system
 744   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 745   Float_t xyz[3];
 746   xyz[0] = cl->GetR()*TMath::Cos(cl->GetPhi());
 747   xyz[1] = cl->GetR()*TMath::Sin(cl->GetPhi());
 748   xyz[2] = cl->GetZ();
 749   Float_t phiangle = (Int_t(cl->GetPhi()*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 750   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 751   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 752   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 753   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 754   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 755   Float_t cov[6];
 756   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 757   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 758   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 759   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 760   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 761   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 762   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 763
 764   // Detector numbering scheme
 765   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 766   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 767   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 768   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 769   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 770
 771   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 772   if (isector >= nSector)
 773     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 774   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 775   if (iplate >= nPlate)
 776     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 777   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 778
 779   Int_t stripOffset = 0;
 780   switch (iplate) {
 781   case 0:
 782     stripOffset = 0;
 783     break;
 784   case 1:
 785     stripOffset = nStripC;
 786     break;
 787   case 2:
 788     stripOffset = nStripC+nStripB;
 789     break;
 790   case 3:
 791     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 792     break;
 793   case 4:
 794     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 795     break;
 796   default:
 797     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 798     break;
 799   };
 800
 801   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 802                stripOffset +
 803                istrip;
 804   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 805   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 806   return kTRUE;
 807 }
 808 //_________________________________________________________________________
 809 void AliTOFtracker::InitCheckHists() {
 810
 811   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 812
 813
 814   TDirectory *dir = gDirectory;
 815   TFile *logFileTOF = 0;
 816
 817   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 818   int n = list->GetEntries();
 819   Bool_t isThere=kFALSE;
 820   for(int i=0; i<n; i++) {
 821     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 822     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 823       isThere=kTRUE;
 824       break;
 825     }
 826   }
 827
 828   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 829   logFileTOF->cd();
 830
 831   fCalTree = new TTree("CalTree", "Tree for TOF calibration");
 832   fCalTree->Branch("TOFchannelindex",&fIch,"iTOFch/I");
 833   fCalTree->Branch("ToT",&fToT,"TOFToT/F");
 834   fCalTree->Branch("TOFtime",&fTime,"TOFtime/F");
 835   fCalTree->Branch("PionExpTime",&fExpTimePi,"PiExpTime/F");
 836   fCalTree->Branch("KaonExpTime",&fExpTimeKa,"KaExpTime/F");
 837   fCalTree->Branch("ProtonExpTime",&fExpTimePr,"PrExpTime/F");
 838
 839   //Digits "QA"
 840   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 841   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 842   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 843   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 844
 845   //Reco "QA"
 846   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 847   fHRecDist=new TH1F("TOFRec_Dist", "",50,0.5,10.5);
 848   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 849   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 850   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 851   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 852
 853   dir->cd();
 854
 855 }
 856
 857 //_________________________________________________________________________
 858 void AliTOFtracker::SaveCheckHists() {
 859
 860   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 861
 862   TDirectory *dir = gDirectory;
 863   TFile *logFileTOF = 0;
 864
 865   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 866   int n = list->GetEntries();
 867   Bool_t isThere=kFALSE;
 868   for(int i=0; i<n; i++) {
 869     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 870     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 871       isThere=kTRUE;
 872       break;
 873     }
 874   }
 875
 876   if(!isThere) {
 877           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 878           return;
 879   }
 880   logFileTOF->cd();
 881   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 882   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 883   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 884   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 885   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 886   fHRecDist->Write(fHRecDist->GetName(), TObject::kOverwrite);
 887   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 888   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 889   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 890   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 891   fCalTree->Write(fCalTree->GetName(),TObject::kOverwrite);
 892   logFileTOF->Flush();
 893
 894   dir->cd();
 895   }
 896 //_________________________________________________________________________
 897 Float_t AliTOFtracker::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) {
 898
 899   //dummy, for the moment
 900   Float_t tofcorr=0.;
 901   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 902     tofcorr=tof;
 903     //place here the actual correction
 904   }else{
 905     tofcorr=tof;
 906   }
 907   return tofcorr;
 908 }
 909 //_________________________________________________________________________
 910 Float_t AliTOFtracker::GetTimeZerofromT0(AliESDEvent *event) const {
 911
 912   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 913
 914   return event->GetT0();
 915 }
 916 //_________________________________________________________________________
 917 Float_t AliTOFtracker::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 918
 919   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 920   {
 921     //place T0 algo here...
 922   }
 923   return 0.;
 924 }
 925 //_________________________________________________________________________
 926
 927 void AliTOFtracker::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 928 {
 929   //
 930   // Returns the TOF cluster array
 931   //
 932
 933   if (fN==0)
 934     arr = 0x0;
 935   else
 936     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 937
 938 }