TOF/AliTOFtrackerMI.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //-----------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                 //
  18 //   AliTOFtracker Class                                           //
  19 //   Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters   //
  20 //   and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters   //
  21 //                                                                 //
  22 //-----------------------------------------------------------------//
  23
  24 #include <Rtypes.h>
  25
  26 #include "TClonesArray.h"
  27 #include "TTree.h"
  28 #include "TTreeStream.h"
  29
  30 #include "AliESDEvent.h"
  31 #include "AliESDtrack.h"
  32
  33 #include "AliTOFRecoParam.h"
  34 #include "AliTOFReconstructor.h"
  35 #include "AliTOFcluster.h"
  36 #include "AliTOFGeometry.h"
  37 #include "AliTOFtrackerMI.h"
  38 #include "AliTOFtrack.h"
  39 #include "AliTOFpidESD.h"
  40
  41 class TGeoManager;
  42
  43 extern TGeoManager *gGeoManager;
  44
  45 ClassImp(AliTOFtrackerMI)
  46
  47 //_____________________________________________________________________________
  48 AliTOFtrackerMI::AliTOFtrackerMI():
  49   fRecoParam(0x0),
  50   fGeom(0x0),
  51   fPid(0x0),
  52   fN(0),
  53   fNseeds(0),
  54   fNseedsTOF(0),
  55   fngoodmatch(0),
  56   fnbadmatch(0),
  57   fnunmatch(0),
  58   fnmatch(0),
  59   fR(379.),
  60   fTOFHeigth(15.3),
  61   fdCut(3.),
  62   fDx(1.5),
  63   fDy(0),
  64   fDz(0),
  65   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  66   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
  67   fDebugStreamer(0x0)
  68  {
  69   //AliTOFtrackerMI main Ctor
  70
  71    fDy=AliTOFGeometry::XPad();
  72    fDz=AliTOFGeometry::ZPad();
  73    fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TOFdebug.root");
  74 }
  75
  76 //_____________________________________________________________________________
  77 AliTOFtrackerMI::~AliTOFtrackerMI(){
  78   //
  79   //
  80   //
  81   if (fDebugStreamer) {
  82     //fDebugStreamer->Close();
  83     delete fDebugStreamer;
  84   }
  85   delete fRecoParam;
  86   delete fGeom;
  87   delete fPid;
  88   if (fTracks){
  89     fTracks->Delete();
  90     delete fTracks;
  91     fTracks=0x0;
  92   }
  93   if (fSeeds){
  94     fSeeds->Delete();
  95     delete fSeeds;
  96     fSeeds=0x0;
  97   }
  98 }
  99
 100 //_____________________________________________________________________________
 101 Int_t AliTOFtrackerMI::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
 102   //
 103   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 104   //
 105
 106   // initialize RecoParam for current event
 107
 108   AliInfo("Initializing params for TOF... ");
 109
 110   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 111
 112   if (fRecoParam == 0x0) {
 113     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 114   }
 115   //fRecoParam->Dump();
 116   //if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
 117   //fRecoParam->PrintParameters();
 118
 119   Double_t parPID[2];
 120   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
 121   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
 122   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
 123
 124   //Initialise some counters
 125
 126   fNseeds=0;
 127   fNseedsTOF=0;
 128   fngoodmatch=0;
 129   fnbadmatch=0;
 130   fnunmatch=0;
 131   fnmatch=0;
 132
 133   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 134   fNseeds = ntrk;
 135   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
 136
 137
 138   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 139
 140   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 141     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 142     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
 143   }
 144
 145   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 146   CollectESD();
 147
 148   //First Step with Strict Matching Criterion
 149   //MatchTracks(kFALSE);
 150
 151   //Second Step with Looser Matching Criterion
 152   //MatchTracks(kTRUE);
 153   MatchTracksMI(kFALSE);  // assign track to clusters
 154   MatchTracksMI(kTRUE);   // assign clusters to esd
 155
 156   Info("PropagateBack","Number of matched tracks: %d",fnmatch);
 157   Info("PropagateBack","Number of good matched tracks: %d",fngoodmatch);
 158   Info("PropagateBack","Number of bad  matched tracks: %d",fnbadmatch);
 159
 160   //Update the matched ESD tracks
 161
 162   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 163     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 164     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 165
 166     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 167       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 168       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 169       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 170         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 171         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 172         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 173         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 174         t->SetTOFLabel(tlab);
 175
 176         // Check done:
 177         //       by calling the AliESDtrack::UpdateTrackParams,
 178         //       the current track parameters are changed
 179         //       and it could cause refit problems.
 180         //       We need to update only the following track parameters:
 181         //            the track length and expected times.
 182         //       Removed AliESDtrack::UpdateTrackParams call
 183         //       Called AliESDtrack::SetIntegratedTimes(...) and
 184         //       AliESDtrack::SetIntegratedLength() routines.
 185         /*
 186         AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 187         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout);
 188         delete track;
 189         */
 190
 191         Double_t times[10]; seed->GetIntegratedTimes(times);
 192         t->SetIntegratedTimes(times);
 193         t->SetIntegratedLength(seed->GetIntegratedLength());
 194         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 195         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 196         //
 197         // Make attention, please:
 198         //      AliESDtrack::fTOFInfo array does not be stored in the AliESDs.root file
 199         //      it is there only for a check during the reconstruction step.
 200         Float_t info[10];
 201         seed->GetTOFInfo(info);
 202         t->SetTOFInfo(info);
 203       }
 204     }
 205   }
 206
 207
 208   //Make TOF PID
 209   fPid->MakePID(event);
 210
 211   fSeeds->Clear();
 212   fTracks->Clear();
 213   return 0;
 214
 215 }
 216 //_________________________________________________________________________
 217 void AliTOFtrackerMI::CollectESD() {
 218    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 219
 220   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 221   Int_t c0=0;
 222   Int_t c1=0;
 223   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 224
 225     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 226     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 227
 228     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 229     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 230
 231     // TRD good tracks, already propagated at 371 cm
 232     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 233          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 234       if  ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 235         track->SetSeedIndex(i);
 236         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 237         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 238         fNseedsTOF++;
 239         c0++;
 240         delete track;
 241       }
 242     }
 243
 244     // Propagate the rest of TPCbp
 245     else {
 246       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) { // temporary solution
 247         track->SetSeedIndex(i);
 248         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 249         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 250         fNseedsTOF++;
 251         c1++;
 252       }
 253       delete track;
 254     }
 255   }
 256   //
 257   //
 258   printf("TRD\tOn\t%d\tOff\t%d\n",c0,c1);
 259
 260   // Sort according uncertainties on track position
 261   fTracks->Sort();
 262
 263 }
 264
 265
 266
 267
 268
 269
 270
 271 //
 272 //
 273 //_________________________________________________________________________
 274 void AliTOFtrackerMI::MatchTracks( Bool_t /*mLastStep*/){
 275   return;
 276 }
 277 //
 278 //
 279 //_________________________________________________________________________
 280 void AliTOFtrackerMI::MatchTracksMI(Bool_t mLastStep){
 281
 282   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 283   const Float_t kTofOffset   = 26;  // time offset
 284   const Float_t kMinQuality  = -6.; // minimal quality
 285   const Float_t kMaxQualityD = 1.;  // max delta quality if cluster used
 286   const Float_t kForbiddenR  = 0.1; // minimal PID according TPC
 287
 288   static const Double_t kMasses[]={
 289     0.000511, 0.105658, 0.139570, 0.493677, 0.938272, 1.875613
 290   };
 291
 292   Int_t nSteps=(Int_t)(fTOFHeigth/0.1);
 293
 294   //AliTOFcalib *calib = new AliTOFcalib(); // AdC
 295
 296   //PH Arrays (moved outside of the loop)
 297   Float_t * trackPos[4];
 298   for (Int_t ii=0; ii<4; ii++) trackPos[ii] = new Float_t[nSteps];
 299   Int_t * clind = new Int_t[fN];
 300
 301   // Some init
 302   const Int_t kNclusterMax = 1000; // related to fN value
 303   AliTOFcluster *clusters[kNclusterMax];
 304   Int_t         index[kNclusterMax];
 305   Float_t       quality[kNclusterMax];
 306   Float_t       dist3D[kNclusterMax][6];
 307   Double_t      times[kNclusterMax][6];
 308   Float_t       mintimedist[kNclusterMax];
 309   Float_t       likelihood[kNclusterMax];
 310   Float_t       length[kNclusterMax];
 311   Double_t      tpcpid[5];
 312   dist3D[0][0]=1;
 313
 314   for (Int_t i=0; i<fNseedsTOF; i++) {
 315
 316     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(i);
 317     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
 318     Bool_t hasTime = ( (t->GetStatus()& AliESDtrack::kTIME)>0) ? kTRUE:kFALSE;   // did we integrate time
 319     Float_t trdquality = t->GetTRDQuality();
 320     //
 321     // Normalize tpc pid
 322     //
 323     t->GetTPCpid(tpcpid);
 324     Double_t sumpid=0;
 325     for (Int_t ipid=0;ipid<5;ipid++){
 326       sumpid+=tpcpid[ipid];
 327     }
 328     for (Int_t ipid=0;ipid<5;ipid++){
 329       if (sumpid>0) tpcpid[ipid]/=sumpid;
 330       else{
 331         tpcpid[ipid]=0.2;
 332       }
 333     }
 334
 335     if (trdquality<0) continue; // no chance
 336     //
 337     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
 338     //
 339     //propagat track to the middle of TOF
 340     //
 341     Float_t xs = 379.2;  // should be defined in the TOF geometry
 342     Double_t ymax=xs*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 343     Bool_t skip=kFALSE;
 344     Double_t ysect=trackTOFin->GetYat(xs,skip);
 345     if (skip){
 346       xs = 373.;
 347       ymax=xs*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 348       ysect=trackTOFin->GetYat(xs,skip);
 349     }
 350     if (ysect > ymax) {
 351       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 352         continue;
 353       }
 354     } else if (ysect <-ymax) {
 355       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 356         continue;
 357       }
 358     }
 359     if(!trackTOFin->PropagateTo(xs)) {
 360       continue;
 361     }
 362     //
 363     // Determine a window around the track
 364     //
 365     Double_t x,par[5];
 366     trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 367     Double_t cov[15];
 368     trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 369
 370     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
 371       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",i));
 372       //delete trackTOFin;
 373       //continue;
 374     }
 375
 376     Float_t scalefact=3.;
 377     Double_t dphi=
 378       scalefact*
 379       ((5*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])) + 3.*fDy + 10.*TMath::Abs(par[2]))/fR);
 380     Double_t dz=
 381       scalefact*
 382       (5*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])) + 3.*fDz + 10.*TMath::Abs(par[3]));
 383
 384     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 385     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 386     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 387     Double_t z=par[1];
 388
 389     Int_t nc     =0;
 390     Int_t nfound =0;
 391     // find the clusters in the window of the track
 392
 393     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 394
 395       if (nc>=kNclusterMax) {
 396         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
 397         break;
 398       }
 399
 400       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 401       if (c->GetZ() > z+dz) break;
 402       //      if (c->IsUsed()) continue;
 403
 404       Double_t dph=TMath::Abs(c->GetPhi()-phi);
 405       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 406       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 407
 408       clind[nc] = k;
 409       nc++;
 410     }
 411
 412     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",i,nc));
 413
 414     //
 415     // select close clusters
 416     //
 417     Double_t mom=t->GetP();
 418     //    Bool_t dump = kTRUE;
 419     for (Int_t icl=0; icl<nc; icl++){
 420       Float_t distances[5];
 421
 422       index[nfound]=clind[icl];
 423       AliTOFcluster *cluster = fClusters[clind[icl]];
 424       GetLinearDistances(trackTOFin, cluster, distances);
 425       dist3D[nfound][0] = distances[4];
 426       dist3D[nfound][1] = distances[1];
 427       dist3D[nfound][2] = distances[2];
 428       // cut on distance
 429       if (TMath::Abs(dist3D[nfound][1])>20 || TMath::Abs(dist3D[nfound][2])>20) continue;
 430       //
 431       GetLikelihood(distances[1],distances[2],cov,trackTOFin, dist3D[nfound][3], dist3D[nfound][4]);
 432       //
 433       // cut on likelihood
 434       if (dist3D[nfound][3]*dist3D[nfound][4]<0.00000000000001) continue;  // log likelihood
 435       if (TMath::Log(dist3D[nfound][3]*dist3D[nfound][4])<-9) continue;  // log likelihood
 436       //
 437       clusters[nfound] = cluster;
 438       //
 439       //length and TOF updates
 440       trackTOFin->GetIntegratedTimes(times[nfound]);
 441       length[nfound] = trackTOFin->GetIntegratedLength();
 442       length[nfound]+=distances[4];
 443       mintimedist[nfound]=1000;
 444       Double_t tof2=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*cluster->GetTDC()+kTofOffset; // in ps
 445       // Float_t tgamma = TMath::Sqrt(cluster->GetR()*cluster->GetR()+cluster->GetZ()*cluster->GetZ())/0.03;  //time for "primary" gamma
 446       //if (trackTOFin->GetPt()<0.7 && TMath::Abs(tgamma-tof2)<350) continue;  // gamma conversion candidate - TEMPORARY
 447       for(Int_t j=0;j<=5;j++){
 448         Double_t mass=kMasses[j];
 449         times[nfound][j]+=distances[4]/3e-2*TMath::Sqrt(mom*mom+mass*mass)/mom;   // add time distance
 450         if ( TMath::Abs(times[nfound][j]-tof2)<mintimedist[nfound] && tpcpid[j]>kForbiddenR){
 451           mintimedist[nfound]=TMath::Abs(times[nfound][j]-tof2);
 452         }
 453       }
 454       //
 455       Float_t   liketime =  TMath::Exp(-mintimedist[nfound]/90.)+0.25*TMath::Exp(-mintimedist[nfound]/180.);
 456       if (!hasTime)  liketime=0.2;
 457       likelihood[nfound] = TMath::Log(dist3D[nfound][3]*dist3D[nfound][4]*liketime);
 458
 459       if (TMath::Log(dist3D[nfound][3]*dist3D[nfound][4])<-1){
 460         if (likelihood[nfound]<-9.) continue;
 461       }
 462       //
 463       nfound++;
 464     }
 465
 466     AliDebug(1,Form(" Number of track points for the track number %d: %d",i,nfound));
 467
 468     if (nfound == 0 ) {
 469       fnunmatch++;
 470       delete trackTOFin;
 471       continue;
 472     }
 473     //
 474     //choose the best cluster
 475     //
 476     //Float_t quality[kNclusterMax];
 477     //Int_t   index[kNclusterMax];
 478     for (Int_t kk=0; kk<kNclusterMax; kk++) quality[kk]=0;
 479     //
 480     AliTOFcluster * cgold=0;
 481     Int_t igold =-1;
 482     for (Int_t icl=0;icl<nfound;icl++){
 483       quality[icl] = dist3D[icl][3]*dist3D[icl][4];
 484     }
 485     TMath::Sort(nfound,quality,index,kTRUE);
 486     igold =  index[0];
 487     cgold =  clusters[igold];
 488     if (nfound>1 &&likelihood[index[1]]>likelihood[index[0]]){
 489       if ( quality[index[0]]<quality[index[1]]+0.5){
 490         igold = index[1];
 491         cgold =  clusters[igold];
 492       }
 493     }
 494     //
 495     //
 496     Float_t qualityGold = TMath::Log(0.0000001+(quality[igold]*(0.1+TMath::Exp(-mintimedist[igold]/80.))*(0.2+trdquality)));
 497     if (!mLastStep){
 498       if (cgold->GetQuality()<qualityGold) cgold->SetQuality(qualityGold);
 499       continue;
 500     }
 501     //
 502     if (mLastStep){
 503       //signed better cluster
 504       if (cgold->GetQuality()>qualityGold+kMaxQualityD) continue;
 505       if (2.*qualityGold-cgold->GetQuality()<kMinQuality) continue;
 506     }
 507
 508     Int_t inonfake=-1;
 509
 510     for (Int_t icl=0;icl<nfound;icl++){
 511       if (
 512           (clusters[index[icl]]->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 513           ||
 514           (clusters[index[icl]]->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 515           ||
 516           (clusters[index[icl]]->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 517           ) {
 518         inonfake = icl;
 519         break;
 520       }
 521     }
 522     fnmatch++;;
 523     if (inonfake==0) fngoodmatch++;
 524     else{
 525       fnbadmatch++;
 526     }
 527
 528     Int_t tlab[3];
 529     tlab[0]=cgold->GetLabel(0);
 530     tlab[1]=cgold->GetLabel(1);
 531     tlab[2]=cgold->GetLabel(2);
 532     //    Double_t tof2=25.*cgold->GetTDC()-350; // in ps
 533     Double_t tof2=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*cgold->GetTDC()+kTofOffset; // in ps
 534     Float_t tgamma = TMath::Sqrt(cgold->GetR()*cgold->GetR()+cgold->GetZ()*cgold->GetZ())/0.03;
 535     Float_t info[10]={dist3D[igold][0],
 536                       dist3D[igold][1],
 537                       dist3D[igold][2],
 538                       dist3D[igold][3],
 539                       dist3D[igold][4],
 540                       mintimedist[igold],
 541                       -1,
 542                       tgamma,
 543                       qualityGold,
 544                       cgold->GetQuality()};
 545     //    GetLinearDistances(trackTOFin,cgold,&info[6]);
 546     if (inonfake>=0){
 547       info[6] = inonfake;
 548       //      info[7] = mintimedist[index[inonfake]];
 549     }
 550     //
 551     //  Store quantities to be used for TOF Calibration
 552     Float_t tToT=cgold->GetToT(); // in ps
 553     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 554     Int_t ind[5];
 555     ind[0]=cgold->GetDetInd(0);
 556     ind[1]=cgold->GetDetInd(1);
 557     ind[2]=cgold->GetDetInd(2);
 558     ind[3]=cgold->GetDetInd(3);
 559     ind[4]=cgold->GetDetInd(4);
 560     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 561     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 562
 563     t->SetTOFInfo(info);
 564     t->SetTOFsignal(tof2);
 565     t->SetTOFcluster(cgold->GetIndex());
 566
 567     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 568                      i,
 569                      fnmatch-1,
 570                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 571                      tlab[0], tlab[1], tlab[2],
 572                      igold)); // AdC
 573
 574     AliTOFtrack *trackTOFout = new AliTOFtrack(*t);
 575     trackTOFout->PropagateTo(379.);
 576
 577     // Fill the track residual histograms.
 578     FillResiduals(trackTOFout,cgold,kFALSE);
 579
 580     t->UpdateTrackParams(trackTOFout,AliESDtrack::kTOFout);
 581     t->SetIntegratedLength(length[igold]);
 582     t->SetIntegratedTimes(times[igold]);
 583     t->SetTOFLabel(tlab);
 584     //
 585     delete trackTOFin;
 586     delete trackTOFout;
 587     //
 588   }
 589   //
 590   //
 591   //
 592   for (Int_t ii=0; ii<4; ii++) delete [] trackPos[ii];
 593   delete [] clind;
 594   //delete calib; // AdC
 595 }
 596 //_________________________________________________________________________
 597
 598 Int_t AliTOFtrackerMI::LoadClusters(TTree *cTree) {
 599   //--------------------------------------------------------------------
 600   //This function loads the TOF clusters
 601   //--------------------------------------------------------------------
 602
 603   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 604   if (!branch) {
 605     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 606     return 1;
 607   }
 608
 609   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 610   dummy.Clear();
 611   TClonesArray *clusters=&dummy;
 612   branch->SetAddress(&clusters);
 613
 614   cTree->GetEvent(0);
 615   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 616   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 617
 618   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 619     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 620
 621 //PH    fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 622     fClusters[i]=c; fN++;
 623
 624     //AliInfo(Form("%4i %4i  %f %f %f  %f %f   %2i %1i %2i %1i %2i",i, fClusters[i]->GetIndex(),fClusters[i]->GetZ(),fClusters[i]->GetR(),fClusters[i]->GetPhi(), fClusters[i]->GetTDC(),fClusters[i]->GetADC(),fClusters[i]->GetDetInd(0),fClusters[i]->GetDetInd(1),fClusters[i]->GetDetInd(2),fClusters[i]->GetDetInd(3),fClusters[i]->GetDetInd(4)));
 625     //AliInfo(Form("%i %f",i, fClusters[i]->GetZ()));
 626   }
 627
 628   //AliInfo(Form("Number of clusters: %d",fN));
 629
 630   return 0;
 631 }
 632 //_________________________________________________________________________
 633 void AliTOFtrackerMI::UnloadClusters() {
 634   //--------------------------------------------------------------------
 635   //This function unloads TOF clusters
 636   //--------------------------------------------------------------------
 637   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 638 //PH    delete fClusters[i];
 639     fClusters[i] = 0x0;
 640   }
 641   fN=0;
 642 }
 643
 644
 645
 646
 647 //_________________________________________________________________________
 648 Int_t AliTOFtrackerMI::InsertCluster(AliTOFcluster *c) {
 649   //--------------------------------------------------------------------
 650   //This function adds a cluster to the array of clusters sorted in Z
 651   //--------------------------------------------------------------------
 652   if (fN==kMaxCluster) {
 653     AliError("Too many clusters !");
 654     return 1;
 655   }
 656
 657   if (fN==0) {fClusters[fN++]=c; return 0;}
 658   Int_t i=FindClusterIndex(c->GetZ());
 659   memmove(fClusters+i+1 ,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTOFcluster*));
 660   fClusters[i]=c; fN++;
 661
 662   return 0;
 663 }
 664
 665 //_________________________________________________________________________
 666 Int_t AliTOFtrackerMI::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 667   //--------------------------------------------------------------------
 668   // This function returns the index of the nearest cluster
 669   //--------------------------------------------------------------------
 670   if (fN==0) return 0;
 671   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 672   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 673   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 674   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 675     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 676     else e=m;
 677   }
 678   return m;
 679 }
 680
 681 //_________________________________________________________________________
 682 Float_t AliTOFtrackerMI::GetLinearDistances(AliTOFtrack * track, AliTOFcluster *cluster, Float_t distances[5])
 683 {
 684   //
 685   // calclates distance between cluster and track
 686   // use linear aproximation
 687   //
 688   //const Float_t kRaddeg = 180/3.14159265358979312;
 689   const Float_t kRaddeg = TMath::RadToDeg();
 690   //
 691   //  Float_t tiltangle  = fGeom->GetAngles(cluster->fdetIndex[1],cluster->fdetIndex[2])/kRaddeg;  //tiltangle
 692   Int_t cind[5];
 693   cind[0]= cluster->GetDetInd(0);
 694   cind[1]= cluster->GetDetInd(1);
 695   cind[2]= cluster->GetDetInd(2);
 696   cind[3]= cluster->GetDetInd(3);
 697   cind[4]= cluster->GetDetInd(4);
 698   Float_t tiltangle  = AliTOFGeometry::GetAngles(cluster->GetDetInd(1),cluster->GetDetInd(2))/kRaddeg;  //tiltangle
 699
 700   Float_t cpos[3];  //cluster position
 701   Float_t cpos0[3];  //cluster position
 702   //  fGeom->GetPos(cluster->fdetIndex,cpos);
 703   //fGeom->GetPos(cluster->fdetIndex,cpos0);
 704   //
 705   fGeom->GetPos(cind,cpos);
 706   fGeom->GetPos(cind,cpos0);
 707
 708   Float_t phi = TMath::ATan2(cpos[1],cpos[0]);
 709   if(phi<0) phi=2.*TMath::Pi()+phi;
 710   //  Get the local angle in the sector philoc
 711   Float_t phiangle = (Int_t (phi*kRaddeg/20.) + 0.5)*20./kRaddeg;
 712   //
 713   Double_t v0[3];
 714   Double_t dir[3];
 715   track->GetXYZ(v0);
 716   track->GetPxPyPz(dir);
 717   dir[0]/=track->GetP();
 718   dir[1]/=track->GetP();
 719   dir[2]/=track->GetP();
 720   //
 721   //
 722   //rotate 0
 723   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle);
 724   Float_t cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 725   Float_t sinth  = TMath::Sin(tiltangle);
 726   Float_t costh  = TMath::Cos(tiltangle);
 727   //
 728   Float_t temp;
 729   temp    =  cpos[0]*cosphi+cpos[1]*sinphi;
 730   cpos[1] = -cpos[0]*sinphi+cpos[1]*cosphi;
 731   cpos[0] = temp;
 732   temp  =  v0[0]*cosphi+v0[1]*sinphi;
 733   v0[1] = -v0[0]*sinphi+v0[1]*cosphi;
 734   v0[0] = temp;
 735   //
 736   temp    =  cpos[0]*costh+cpos[2]*sinth;
 737   cpos[2] = -cpos[0]*sinth+cpos[2]*costh;
 738   cpos[0] = temp;
 739   temp   =  v0[0]*costh+v0[2]*sinth;
 740   v0[2]  = -v0[0]*sinth+v0[2]*costh;
 741   v0[0]  = temp;
 742   //
 743   //
 744   //rotate direction vector
 745   //
 746   temp   =  dir[0]*cosphi+dir[1]*sinphi;
 747   dir[1] = -dir[0]*sinphi+dir[1]*cosphi;
 748   dir[0] = temp;
 749   //
 750   temp   =  dir[0]*costh+dir[2]*sinth;
 751   dir[2] = -dir[0]*sinth+dir[2]*costh;
 752   dir[0] = temp;
 753   //
 754   Float_t v3[3];
 755   Float_t k = (cpos[0]-v0[0])/dir[0];
 756   v3[0] = v0[0]+k*dir[0];
 757   v3[1] = v0[1]+k*dir[1];
 758   v3[2] = v0[2]+k*dir[2];
 759   //
 760   distances[0] = v3[0]-cpos[0];
 761   distances[1] = v3[1]-cpos[1];
 762   distances[2] = v3[2]-cpos[2];
 763   distances[3] = TMath::Sqrt( distances[0]*distances[0]+distances[1]*distances[1]+distances[2]*distances[2]); //distance
 764   distances[4] = k;  //length
 765
 766   //
 767   // Debuging part of the matching
 768   //
 769   if (track->GetLabel()==cluster->GetLabel(0) ||
 770       track->GetLabel()==cluster->GetLabel(1) ||
 771       track->GetLabel()==cluster->GetLabel(2) ){
 772     TTreeSRedirector& cstream = *fDebugStreamer;
 773     Float_t tdc = cluster->GetTDC();
 774     cstream<<"Tracks"<<
 775       "TOF.="<<track<<
 776       "Cx="<<cpos0[0]<<
 777       "Cy="<<cpos0[1]<<
 778       "Cz="<<cpos0[2]<<
 779       "Dist="<<k<<
 780       "Dist0="<<distances[0]<<
 781       "Dist1="<<distances[1]<<
 782       "Dist2="<<distances[2]<<
 783       "TDC="<<tdc<<
 784       "\n";
 785   }
 786   return distances[3];
 787 }
 788
 789 //_________________________________________________________________________
 790 void    AliTOFtrackerMI::GetLikelihood(Float_t dy, Float_t dz, const Double_t *cov, AliTOFtrack * /*track*/, Float_t & py, Float_t &pz)
 791 {
 792   //
 793   //  get likelihood - track covariance taken
 794   //  75 % of gauss with expected sigma
 795   //  25 % of gauss with extended sigma
 796
 797   Double_t kMaxSigmaY  = 0.6;  // ~ 90% of TRD tracks
 798   Double_t kMaxSigmaZ  = 1.2;  // ~ 90% of TRD tracks
 799   Double_t kMeanSigmaY = 0.25; // mean TRD sigma
 800   Double_t kMeanSigmaZ = 0.5;  // mean TRD sigma
 801
 802
 803   Float_t normwidth, normd, p0,p1;
 804   Float_t sigmay = TMath::Max(TMath::Sqrt(cov[0]+kMeanSigmaY*kMeanSigmaY),kMaxSigmaY);
 805   Float_t sigmaz = TMath::Max(TMath::Sqrt(cov[2]+kMeanSigmaZ*kMeanSigmaZ),kMaxSigmaZ);
 806
 807   py=0;
 808   pz=0;
 809   //
 810   // py calculation   - 75% admixture of original sigma - 25% tails
 811   //
 812   normwidth = fDy/sigmay;
 813   normd     = dy/sigmay;
 814   p0 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd-normwidth*0.5));
 815   p1 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd+normwidth*0.5));
 816   py+= 0.75*(p1-p0);
 817   //
 818   normwidth = fDy/(3.*sigmay);
 819   normd     = dy/(3.*sigmay);
 820   p0 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd-normwidth*0.5));
 821   p1 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd+normwidth*0.5));
 822   py+= 0.25*(p1-p0);
 823   //
 824   // pz calculation   - 75% admixture of original sigma - 25% tails
 825   //
 826   normwidth = fDz/sigmaz;
 827   normd     = dz/sigmaz;
 828   p0 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd-normwidth*0.5));
 829   p1 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd+normwidth*0.5));
 830   pz+= 0.75*(p1-p0);
 831   //
 832   normwidth = fDz/(3.*sigmaz);
 833   normd     = dz/(3.*sigmaz);
 834   p0 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd-normwidth*0.5));
 835   p1 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd+normwidth*0.5));
 836   pz+= 0.25*(p1-p0);
 837 }
 838 //_________________________________________________________________________
 839
 840 void AliTOFtrackerMI::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 841 {
 842   //
 843   // Returns the TOF cluster array
 844   //
 845
 846   if (fN==0)
 847     arr = 0x0;
 848   else
 849     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 850
 851 }