TOF/AliTOFtrackerV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TTree.h>
  34 #include <TFile.h>
  35 #include <TH1F.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TSeqCollection.h>
  38
  39 #include "AliESDtrack.h"
  40 #include "AliESDEvent.h"
  41 #include "AliLog.h"
  42 #include "AliTrackPointArray.h"
  43 #include "AliGeomManager.h"
  44 #include "AliCDBManager.h"
  45
  46 #include "AliTOFRecoParam.h"
  47 #include "AliTOFReconstructor.h"
  48 #include "AliTOFcluster.h"
  49 #include "AliTOFGeometry.h"
  50 #include "AliTOFtrackerV1.h"
  51 #include "AliTOFtrack.h"
  52 #include "AliTOFpidESD.h"
  53
  54 extern TROOT *gROOT;
  55
  56 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
  57
  58 //_____________________________________________________________________________
  59 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
  60   fRecoParam(0x0),
  61   fPid(0x0),
  62   fN(0),
  63   fNseeds(0),
  64   fNseedsTOF(0),
  65   fngoodmatch(0),
  66   fnbadmatch(0),
  67   fnunmatch(0),
  68   fnmatch(0),
  69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  70   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
  71   fHDigClusMap(0x0),
  72   fHDigNClus(0x0),
  73   fHDigClusTime(0x0),
  74   fHDigClusToT(0x0),
  75   fHRecNClus(0x0),
  76   fHRecChi2(0x0),
  77   fHRecDistZ(0x0),
  78   fHRecSigYVsP(0x0),
  79   fHRecSigZVsP(0x0),
  80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
  82  {
  83   //AliTOFtrackerV1 main Ctor
  84
  85    InitCheckHists();
  86
  87 }
  88 //_____________________________________________________________________________
  89 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
  90   //
  91   // Dtor
  92   //
  93
  94   SaveCheckHists();
  95
  96   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
  97     delete fRecoParam;
  98   }
  99   delete fPid;
 100   delete fHDigClusMap;
 101   delete fHDigNClus;
 102   delete fHDigClusTime;
 103   delete fHDigClusToT;
 104   delete fHRecNClus;
 105   delete fHRecChi2;
 106   delete fHRecDistZ;
 107   delete fHRecSigYVsP;
 108   delete fHRecSigZVsP;
 109   delete fHRecSigYVsPWin;
 110   delete fHRecSigZVsPWin;
 111   if (fTracks){
 112     fTracks->Delete();
 113     delete fTracks;
 114     fTracks=0x0;
 115   }
 116   if (fSeeds){
 117     fSeeds->Delete();
 118     delete fSeeds;
 119     fSeeds=0x0;
 120   }
 121 }
 122 //_____________________________________________________________________________
 123 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
 124   //
 125   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 126   //
 127
 128   // initialize RecoParam for current event
 129
 130   AliInfo("Initializing params for TOF... ");
 131
 132   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 133
 134   if (fRecoParam == 0x0) {
 135     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 136   }
 137   //fRecoParam->Dump();
 138   //if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
 139   //fRecoParam->PrintParameters();
 140
 141   Double_t parPID[2];
 142   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
 143   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
 144   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
 145
 146   //Initialise some counters
 147
 148   fNseeds=0;
 149   fNseedsTOF=0;
 150   fngoodmatch=0;
 151   fnbadmatch=0;
 152   fnunmatch=0;
 153   fnmatch=0;
 154
 155   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 156   fNseeds = ntrk;
 157   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
 158
 159
 160   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 161
 162   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 163     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 164     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
 165   }
 166
 167   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 168   CollectESD();
 169
 170   //Matching Step
 171   MatchTracks();
 172
 173   AliInfo(Form("Number of matched tracks: %d",fnmatch));
 174   AliInfo(Form("Number of good matched tracks: %d",fngoodmatch));
 175   AliInfo(Form("Number of bad  matched tracks: %d",fnbadmatch));
 176
 177   //Update the matched ESD tracks
 178
 179   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 180     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 181     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 182
 183     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 184       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 185       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 186       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 187         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 188         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 189         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 190         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 191         t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 192         t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 193         t->SetTOFsignalDx(seed->GetTOFsignalDx());
 194         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 195         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 196         t->SetTOFLabel(tlab);
 197
 198         Float_t info[10]={0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 199         seed->GetTOFInfo(info);
 200         t->SetTOFInfo(info);
 201         AliDebug(2,Form(" distance=%f; residual in the pad reference frame: dX=%f, dZ=%f", info[0],info[1],info[2]));
 202
 203         AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 204         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout); // to be checked - AdC
 205         delete track;
 206
 207         Double_t time[10]; t->GetIntegratedTimes(time);
 208         AliDebug(2,Form(" %6d  %f %f %f %f % %6d %3d %f  %f %f %f %f %f",
 209                         i,
 210                         t->GetTOFsignalRaw(),
 211                         t->GetTOFsignal(),
 212                         t->GetTOFsignalToT(),
 213                         t->GetTOFsignalDz(),
 214                         t->GetTOFsignalDx(),
 215                         t->GetTOFCalChannel(),
 216                         t->GetTOFcluster(),
 217                         t->GetIntegratedLength(),
 218                         time[0], time[1], time[2], time[3], time[4]
 219                         )
 220                  );
 221       }
 222     }
 223   }
 224
 225   //Handle Time Zero information
 226
 227   Double_t timeZero=0.;
 228   Double_t timeZeroMax=99999.;
 229   Bool_t usetimeZero     = fRecoParam->UseTimeZero();
 230   Bool_t timeZeroFromT0  = fRecoParam->GetTimeZerofromT0();
 231   Bool_t timeZeroFromTOF = fRecoParam->GetTimeZerofromTOF();
 232
 233   AliDebug(2,Form("Use Time Zero?: %d",usetimeZero));
 234   AliDebug(2,Form("Time Zero from T0? : %d",timeZeroFromT0));
 235   AliDebug(2,Form("Time Zero From TOF? : %d",timeZeroFromTOF));
 236
 237   if(usetimeZero){
 238     if(timeZeroFromT0){
 239       timeZero=GetTimeZerofromT0(event);
 240     }
 241     if(timeZeroFromTOF && (timeZero>timeZeroMax || !timeZeroFromT0)){
 242       timeZero=GetTimeZerofromTOF(event);
 243     }
 244   }
 245   AliDebug(2,Form("time Zero used in PID: %f",timeZero));
 246   //Make TOF PID
 247   fPid->MakePID(event,timeZero);
 248
 249   fSeeds->Clear();
 250   fTracks->Clear();
 251   return 0;
 252
 253 }
 254 //_________________________________________________________________________
 255 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
 256    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 257
 258   Int_t seedsTOF1=0;
 259   Int_t seedsTOF2=0;
 260
 261   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 262   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 263
 264     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 265     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 266
 267     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 268     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 269
 270     // TRD 'good' tracks, already propagated at 371 cm
 271     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 272          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 273       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 274
 275         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 276                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 277                         x, (Float_t)track->GetX()));
 278
 279         track->SetSeedIndex(i);
 280         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 281         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 282         fNseedsTOF++;
 283         seedsTOF1++;
 284       }
 285       delete track;
 286     }
 287
 288     // Propagate the rest of TPCbp
 289     else {
 290       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 291
 292         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 293                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 294                         x, (Float_t)track->GetX()));
 295
 296         track->SetSeedIndex(i);
 297         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 298         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 299         fNseedsTOF++;
 300         seedsTOF2++;
 301       }
 302       delete track;
 303     }
 304   }
 305
 306   AliInfo(Form("Number of TOF seeds %d",fNseedsTOF));
 307   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 1 %d",seedsTOF1));
 308   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 2 %d",seedsTOF2));
 309
 310   // Sort according uncertainties on track position
 311   fTracks->Sort();
 312
 313 }
 314 //_________________________________________________________________________
 315 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
 316   //
 317   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 318   //
 319
 320
 321   // Parameters regulating the reconstruction
 322   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 323   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 324
 325   const Float_t kTimeOffset = 32.; // time offset for tracking algorithm [ps]
 326
 327   const Int_t kncmax = 100;
 328   Float_t sensRadius = fRecoParam->GetSensRadius();
 329   Float_t scaleFact   = fRecoParam->GetWindowScaleFact();
 330   Float_t dyMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 331   Float_t dzMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 332   Double_t maxChi2=fRecoParam->GetMaxChi2();
 333   Bool_t timeWalkCorr    = fRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 334   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 335   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 336   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 337   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 338   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 339   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 340   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 341
 342
 343   //The matching loop
 344   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 345
 346     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 347     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
 348     //if ( t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 349     if ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) continue;
 350     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
 351
 352     // Determine a window around the track
 353     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 354     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 355
 356     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
 357       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",iseed));
 358       //delete trackTOFin;
 359       //continue;
 360     }
 361
 362     Double_t z    = par[1];
 363     Double_t dz   =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])+dZ*dZ/12.);
 364     Double_t dphi =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])+dY*dY/12.)/sensRadius;
 365
 366     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 367     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 368     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 369
 370     //upper limit on window's size.
 371     if(dz> dzMax) dz=dzMax;
 372     if(dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 373
 374     // find the clusters inside the selected window
 375     Int_t nc=0;
 376     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
 377     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
 378     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 379       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 380       //      if(nc>kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow) */
 381       if (nc>=kncmax) {
 382         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
 383         break; /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 384       }
 385       if(c->GetZ() > z+dz) break;
 386       if(c->IsUsed()) continue;
 387       if(!c->GetStatus()) {
 388         AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 389         continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 390       }
 391       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
 392       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 393       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
 394       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 395       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 396       clusters[nc]=c;
 397       index[nc] = k;
 398       nc++;
 399     }
 400
 401     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",iseed,nc));
 402
 403     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
 404
 405     Float_t  xTOF = sensRadius;
 406     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 407     Bool_t skip = kFALSE;
 408     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
 409     if (skip) break;
 410     if (ysect > ymax) {
 411       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 412         break;
 413       }
 414     } else if (ysect <-ymax) {
 415       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 416         break;
 417       }
 418     }
 419     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
 420       break;
 421     }
 422
 423
 424     AliTOFcluster *bestCluster=0;
 425     Double_t bestChi2=maxChi2;
 426     Int_t idclus=-1;
 427     //    for (Int_t i=0; i<nc; i++){ /* R+ fix (unsafe) */
 428     for (Int_t i=0; i<nc && i<kncmax; i++){ /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 429       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters
 430       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c);
 431       if (chi2 >= bestChi2) continue;
 432       bestChi2=chi2;
 433       bestCluster=c;
 434       idclus=index[i];
 435     }
 436
 437     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track
 438       fnunmatch++;
 439       delete trackTOFin;
 440       continue;
 441     }
 442
 443     fnmatch++;
 444
 445     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 446                      iseed,
 447                      fnmatch-1,
 448                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 449                      bestCluster->GetLabel(0),
 450                      bestCluster->GetLabel(1),
 451                      bestCluster->GetLabel(2),
 452                      idclus)); // AdC
 453
 454     bestCluster->Use();
 455     if (
 456         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 457         ||
 458         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 459         ||
 460         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 461         ) {
 462       fngoodmatch++;
 463        AliDebug(2,Form(" track label good %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 464
 465     }
 466     else{
 467       fnbadmatch++;
 468       AliDebug(2,Form(" track label bad %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 469     }
 470
 471     //Propagate the track to the best matched cluster
 472     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
 473
 474     // Fill the track residual histograms.
 475     FillResiduals(trackTOFin,bestCluster,kFALSE);
 476
 477     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
 478     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 479     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm - in the ALICE RF -
 480     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle); // from ALICE/tracking RF to pad RF (1)
 481     dzTW=-dzTW; // from ALICE/tracking RF to pad RF (2)
 482     if (tiltangle!=0.) AliDebug(2,Form(" rho_track = %f --- rho_cluster = %f ",trackTOFin->GetX(),bestCluster->GetX()));
 483
 484     //update the ESD track and delete the TOFtrack
 485     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
 486
 487     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 488     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
 489     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 490     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+kTimeOffset; // RAW time,in ps
 491     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 492     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
 493
 494     Float_t deltaY = trackTOFin->GetY()-bestCluster->GetY();
 495     t->SetTOFsignalDx(deltaY);
 496
 497     Float_t distR = (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX())*
 498       (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX());
 499     distR+=deltaY*deltaY;
 500     distR+=dzTW*dzTW;
 501     distR = TMath::Sqrt(distR);
 502     Float_t info[10] = {distR, deltaY, dzTW,
 503                         0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 504     t->SetTOFInfo(info);
 505
 506     Int_t ind[5];
 507     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
 508     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
 509     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
 510     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
 511     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
 512     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 513     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 514
 515     // keep track of the track labels in the matched cluster
 516     Int_t tlab[3];
 517     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
 518     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
 519     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
 520     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %6d = ",bestCluster->GetTDC()));
 521     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+kTimeOffset; // in ps
 522     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 523     Double_t tofcorr=tof;
 524     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
 525     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 526     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 527     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 528     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 529     t->SetTOFLabel(tlab);
 530
 531     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f  corrected time: %f",rawTime,dzTW,tofcorr));
 532
 533     Double_t mom=t->GetP();
 534     AliDebug(2,Form(" Momentum for track %d -> %f", iseed,mom));
 535     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 536     fHRecNClus->Fill(nc);
 537     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
 538     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
 539     fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 540     fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 541     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 542     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 543
 544     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 545     // no longer there - all info is in the ESDs now
 546
 547     delete trackTOFin;
 548   }
 549
 550 }
 551 //_________________________________________________________________________
 552 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
 553   //--------------------------------------------------------------------
 554   //This function loads the TOF clusters
 555   //--------------------------------------------------------------------
 556
 557   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 558   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 559   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 560   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 561   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 562
 563   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 564   if (!branch) {
 565     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 566     return 1;
 567   }
 568
 569   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 570   dummy.Clear();
 571   TClonesArray *clusters=&dummy;
 572   branch->SetAddress(&clusters);
 573
 574   cTree->GetEvent(0);
 575   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 576   fHDigNClus->Fill(nc);
 577
 578   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 579
 580   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 581     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 582     fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 583
 584   // Fill Digits QA histos
 585
 586     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 587     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 588     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 589     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 590     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 591
 592     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 593     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 594
 595     Int_t stripOffset = 0;
 596     switch (iplate) {
 597     case 0:
 598       stripOffset = 0;
 599       break;
 600     case 1:
 601       stripOffset = nStripC;
 602       break;
 603     case 2:
 604       stripOffset = nStripC+nStripB;
 605       break;
 606     case 3:
 607       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 608       break;
 609     case 4:
 610       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 611       break;
 612     default:
 613       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 614       break;
 615     };
 616     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 617     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 618     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 619     fHDigClusTime->Fill(time);
 620     fHDigClusToT->Fill(tot);
 621   }
 622
 623
 624   return 0;
 625 }
 626 //_________________________________________________________________________
 627 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
 628   //--------------------------------------------------------------------
 629   //This function unloads TOF clusters
 630   //--------------------------------------------------------------------
 631   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 632     delete fClusters[i];
 633     fClusters[i] = 0x0;
 634   }
 635   fN=0;
 636 }
 637
 638 //_________________________________________________________________________
 639 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 640   //--------------------------------------------------------------------
 641   // This function returns the index of the nearest cluster
 642   //--------------------------------------------------------------------
 643   //MOD
 644   //Here we need to get the Z in the tracking system
 645
 646   if (fN==0) return 0;
 647   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 648   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 649   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 650   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 651     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 652     else e=m;
 653   }
 654   return m;
 655 }
 656
 657 //_________________________________________________________________________
 658 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 659 {
 660   // Get track space point with index i
 661   // Coordinates are in the global system
 662   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 663   Float_t xyz[3];
 664   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
 665   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 666   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 667   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 668   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 669   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 670   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 671   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 672   Float_t cov[6];
 673   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 674   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 675   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 676   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 677   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 678   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 679   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 680
 681   // Detector numbering scheme
 682   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 683   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 684   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 685   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 686   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 687
 688   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 689   if (isector >= nSector)
 690     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 691   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 692   if (iplate >= nPlate)
 693     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 694   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 695
 696   Int_t stripOffset = 0;
 697   switch (iplate) {
 698   case 0:
 699     stripOffset = 0;
 700     break;
 701   case 1:
 702     stripOffset = nStripC;
 703     break;
 704   case 2:
 705     stripOffset = nStripC+nStripB;
 706     break;
 707   case 3:
 708     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 709     break;
 710   case 4:
 711     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 712     break;
 713   default:
 714     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 715     break;
 716   };
 717
 718   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 719                stripOffset +
 720                istrip;
 721   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 722   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 723   return kTRUE;
 724 }
 725 //_________________________________________________________________________
 726 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
 727
 728   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 729
 730   TDirectory *dir = gDirectory;
 731   TFile *logFileTOF = 0;
 732
 733   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 734   int n = list->GetEntries();
 735   Bool_t isThere=kFALSE;
 736   for(int i=0; i<n; i++) {
 737     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 738     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 739       isThere=kTRUE;
 740       break;
 741     }
 742   }
 743
 744   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 745   logFileTOF->cd();
 746
 747   //Digits "QA"
 748   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 749   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 750   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 751   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 752
 753   //Reco "QA"
 754   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 755   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
 756   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
 757   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 758   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 759   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 760   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 761
 762   dir->cd();
 763
 764 }
 765
 766 //_________________________________________________________________________
 767 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
 768
 769   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 770
 771   TDirectory *dir = gDirectory;
 772   TFile *logFile = 0;
 773   TFile *logFileTOF = 0;
 774
 775   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 776   int n = list->GetEntries();
 777   for(int i=0; i<n; i++) {
 778     logFile = (TFile*)list->At(i);
 779     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
 780   }
 781
 782   Bool_t isThere=kFALSE;
 783   for(int i=0; i<n; i++) {
 784     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 785     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 786       isThere=kTRUE;
 787       break;
 788     }
 789   }
 790
 791   if(!isThere) {
 792           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 793           return;
 794   }
 795   logFile->cd();
 796   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 797   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 798   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 799   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 800   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 801   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
 802   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
 803   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 804   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 805   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 806   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 807   logFile->Flush();
 808
 809   dir->cd();
 810
 811   }
 812 //_________________________________________________________________________
 813 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) {
 814
 815   //dummy, for the moment
 816   Float_t tofcorr=0.;
 817   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 818     tofcorr=tof;
 819     //place here the actual correction
 820   }else{
 821     tofcorr=tof;
 822   }
 823   return tofcorr;
 824 }
 825 //_________________________________________________________________________
 826 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(AliESDEvent *event) const {
 827
 828   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 829
 830   return event->GetT0();
 831 }
 832 //_________________________________________________________________________
 833 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 834
 835   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 836   {
 837     //place T0 algo here...
 838   }
 839   return 0.;
 840 }
 841 //_________________________________________________________________________
 842
 843 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 844 {
 845   //
 846   // Returns the TOF cluster array
 847   //
 848
 849   if (fN==0)
 850     arr = 0x0;
 851   else
 852     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 853
 854 }