TOF/AliTOFtrackerV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TTree.h>
  34 #include <TFile.h>
  35 #include <TH1F.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TSeqCollection.h>
  38
  39 #include "AliESDtrack.h"
  40 #include "AliESDEvent.h"
  41 #include "AliLog.h"
  42 #include "AliTrackPointArray.h"
  43 #include "AliGeomManager.h"
  44 #include "AliCDBManager.h"
  45
  46 #include "AliTOFRecoParam.h"
  47 #include "AliTOFReconstructor.h"
  48 #include "AliTOFcluster.h"
  49 #include "AliTOFGeometry.h"
  50 #include "AliTOFtrackerV1.h"
  51 #include "AliTOFtrack.h"
  52 #include "AliTOFpidESD.h"
  53
  54 extern TROOT *gROOT;
  55
  56 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
  57
  58 //_____________________________________________________________________________
  59 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
  60   fRecoParam(0x0),
  61   fPid(0x0),
  62   fN(0),
  63   fNseeds(0),
  64   fNseedsTOF(0),
  65   fngoodmatch(0),
  66   fnbadmatch(0),
  67   fnunmatch(0),
  68   fnmatch(0),
  69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  70   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
  71   fHDigClusMap(0x0),
  72   fHDigNClus(0x0),
  73   fHDigClusTime(0x0),
  74   fHDigClusToT(0x0),
  75   fHRecNClus(0x0),
  76   fHRecChi2(0x0),
  77   fHRecDistZ(0x0),
  78   fHRecSigYVsP(0x0),
  79   fHRecSigZVsP(0x0),
  80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
  82  {
  83   //AliTOFtrackerV1 main Ctor
  84
  85    InitCheckHists();
  86
  87 }
  88 //_____________________________________________________________________________
  89 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
  90   //
  91   // Dtor
  92   //
  93
  94   SaveCheckHists();
  95
  96   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
  97     delete fRecoParam;
  98   }
  99   delete fPid;
 100   delete fHDigClusMap;
 101   delete fHDigNClus;
 102   delete fHDigClusTime;
 103   delete fHDigClusToT;
 104   delete fHRecNClus;
 105   delete fHRecChi2;
 106   delete fHRecDistZ;
 107   delete fHRecSigYVsP;
 108   delete fHRecSigZVsP;
 109   delete fHRecSigYVsPWin;
 110   delete fHRecSigZVsPWin;
 111   if (fTracks){
 112     fTracks->Delete();
 113     delete fTracks;
 114     fTracks=0x0;
 115   }
 116   if (fSeeds){
 117     fSeeds->Delete();
 118     delete fSeeds;
 119     fSeeds=0x0;
 120   }
 121 }
 122 //_____________________________________________________________________________
 123 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
 124   //
 125   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 126   //
 127
 128   // initialize RecoParam for current event
 129
 130   AliInfo("Initializing params for TOF... ");
 131
 132   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 133
 134   if (fRecoParam == 0x0) {
 135     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 136   }
 137   //fRecoParam->Dump();
 138   //if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
 139   //fRecoParam->PrintParameters();
 140
 141   Double_t parPID[2];
 142   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
 143   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
 144   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
 145
 146   //Initialise some counters
 147
 148   fNseeds=0;
 149   fNseedsTOF=0;
 150   fngoodmatch=0;
 151   fnbadmatch=0;
 152   fnunmatch=0;
 153   fnmatch=0;
 154
 155   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 156   fNseeds = ntrk;
 157   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
 158
 159
 160   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 161
 162   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 163     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 164     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
 165   }
 166
 167   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 168   CollectESD();
 169
 170   //Matching Step
 171   MatchTracks();
 172
 173   AliInfo(Form("Number of matched tracks: %d",fnmatch));
 174   AliInfo(Form("Number of good matched tracks: %d",fngoodmatch));
 175   AliInfo(Form("Number of bad  matched tracks: %d",fnbadmatch));
 176
 177   //Update the matched ESD tracks
 178
 179   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 180     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 181     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 182
 183     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 184       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 185       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 186       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 187         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 188         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 189         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 190         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 191         t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 192         t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 193         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 194         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 195         t->SetTOFLabel(tlab);
 196         AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 197         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout); // to be checked - AdC
 198         delete track;
 199
 200         Double_t time[10]; t->GetIntegratedTimes(time);
 201         AliDebug(1,Form(" %6d  %f %f %f %f %6d %3d %f  %f %f %f %f %f",
 202                         i,
 203                         t->GetTOFsignalRaw(),
 204                         t->GetTOFsignal(),
 205                         t->GetTOFsignalToT(),
 206                         t->GetTOFsignalDz(),
 207                         t->GetTOFCalChannel(),
 208                         t->GetTOFcluster(),
 209                         t->GetIntegratedLength(),
 210                         time[0], time[1], time[2], time[3], time[4]
 211                         )
 212                  );
 213       }
 214     }
 215   }
 216
 217   //Handle Time Zero information
 218
 219   Double_t timeZero=0.;
 220   Double_t timeZeroMax=99999.;
 221   Bool_t usetimeZero     = fRecoParam->UseTimeZero();
 222   Bool_t timeZeroFromT0  = fRecoParam->GetTimeZerofromT0();
 223   Bool_t timeZeroFromTOF = fRecoParam->GetTimeZerofromTOF();
 224
 225   AliDebug(1,Form("Use Time Zero?: %d",usetimeZero));
 226   AliDebug(1,Form("Time Zero from T0? : %d",timeZeroFromT0));
 227   AliDebug(1,Form("Time Zero From TOF? : %d",timeZeroFromTOF));
 228
 229   if(usetimeZero){
 230     if(timeZeroFromT0){
 231       timeZero=GetTimeZerofromT0(event);
 232     }
 233     if(timeZeroFromTOF && (timeZero>timeZeroMax || !timeZeroFromT0)){
 234       timeZero=GetTimeZerofromTOF(event);
 235     }
 236   }
 237   AliDebug(2,Form("time Zero used in PID: %f",timeZero));
 238   //Make TOF PID
 239   fPid->MakePID(event,timeZero);
 240
 241   fSeeds->Clear();
 242   fTracks->Clear();
 243   return 0;
 244
 245 }
 246 //_________________________________________________________________________
 247 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
 248    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 249
 250   Int_t seedsTOF1=0;
 251   Int_t seedsTOF2=0;
 252
 253   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 254   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 255
 256     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 257     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 258
 259     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 260     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 261
 262     // TRD 'good' tracks, already propagated at 371 cm
 263     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 264          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 265       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 266
 267         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 268                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 269                         x, (Float_t)track->GetX()));
 270
 271         track->SetSeedIndex(i);
 272         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 273         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 274         fNseedsTOF++;
 275         seedsTOF1++;
 276       }
 277       delete track;
 278     }
 279
 280     // Propagate the rest of TPCbp
 281     else {
 282       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 283
 284         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 285                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 286                         x, (Float_t)track->GetX()));
 287
 288         track->SetSeedIndex(i);
 289         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 290         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 291         fNseedsTOF++;
 292         seedsTOF2++;
 293       }
 294       delete track;
 295     }
 296   }
 297
 298   AliInfo(Form("Number of TOF seeds %d",fNseedsTOF));
 299   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 1 %d",seedsTOF1));
 300   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 2 %d",seedsTOF2));
 301
 302   // Sort according uncertainties on track position
 303   fTracks->Sort();
 304
 305 }
 306 //_________________________________________________________________________
 307 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
 308   //
 309   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 310   //
 311
 312
 313   // Parameters regulating the reconstruction
 314   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 315   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 316
 317   const Float_t kTimeOffset = 32.; // time offset for tracking algorithm [ps]
 318
 319   const Int_t kncmax = 100;
 320   Float_t sensRadius = fRecoParam->GetSensRadius();
 321   Float_t scaleFact   = fRecoParam->GetWindowScaleFact();
 322   Float_t dyMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 323   Float_t dzMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 324   Double_t maxChi2=fRecoParam->GetMaxChi2();
 325   Bool_t timeWalkCorr    = fRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 326   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 327   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 328   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 329   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 330   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 331   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 332   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 333
 334
 335   //The matching loop
 336   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 337
 338     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 339     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
 340     //if ( t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 341     if ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) continue;
 342     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
 343
 344     // Determine a window around the track
 345     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 346     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 347
 348     Double_t z    = par[1];
 349     Double_t dz   =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(cov[2]+dZ*dZ/12.);
 350     Double_t dphi =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(cov[0]+dY*dY/12.)/sensRadius;
 351
 352     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 353     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 354     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 355
 356     //upper limit on window's size.
 357     if(dz> dzMax) dz=dzMax;
 358     if(dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 359
 360
 361     // find the clusters inside the selected window
 362     Int_t nc=0;
 363     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
 364     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
 365     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 366       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 367       //      if(nc>kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow) */
 368       if(nc>=kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 369       if(c->GetZ() > z+dz) break;
 370       if(c->IsUsed()) continue;
 371       if(!c->GetStatus()) {
 372               AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 373               continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 374       }
 375       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
 376       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 377       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
 378       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 379       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 380       clusters[nc]=c;
 381       index[nc] = k;
 382       nc++;
 383     }
 384
 385     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
 386
 387     Float_t  xTOF = sensRadius;
 388     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 389     Bool_t skip = kFALSE;
 390     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
 391     if (skip) break;
 392     if (ysect > ymax) {
 393       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 394         break;
 395       }
 396     } else if (ysect <-ymax) {
 397       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 398         break;
 399       }
 400     }
 401     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
 402       break;
 403     }
 404
 405
 406     AliTOFcluster *bestCluster=0;
 407     Double_t bestChi2=maxChi2;
 408     Int_t idclus=-1;
 409     //    for (Int_t i=0; i<nc; i++){ /* R+ fix (unsafe) */
 410     for (Int_t i=0; i<nc && i<kncmax; i++){ /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 411       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters
 412       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c);
 413       if (chi2 >= bestChi2) continue;
 414       bestChi2=chi2;
 415       bestCluster=c;
 416       idclus=index[i];
 417     }
 418
 419     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track
 420       fnunmatch++;
 421       delete trackTOFin;
 422       continue;
 423     }
 424
 425     fnmatch++;
 426
 427     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 428                      iseed,
 429                      fnmatch-1,
 430                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 431                      bestCluster->GetLabel(0),
 432                      bestCluster->GetLabel(1),
 433                      bestCluster->GetLabel(2),
 434                      idclus)); // AdC
 435
 436     bestCluster->Use();
 437     if (
 438         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 439         ||
 440         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 441         ||
 442         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 443         ) {
 444       fngoodmatch++;
 445        AliDebug(2,Form(" track label good %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 446
 447     }
 448     else{
 449       fnbadmatch++;
 450       AliDebug(2,Form(" track label bad %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 451     }
 452
 453     //Propagate the track to the best matched cluster
 454     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
 455
 456     // Fill the track residual histograms.
 457     FillResiduals(trackTOFin,bestCluster,kFALSE);
 458
 459     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
 460     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 461     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm - in the ALICE RF -
 462     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle); // from ALICE/tracking RF to pad RF (1)
 463     dzTW=-dzTW; // from ALICE/tracking RF to pad RF (2)
 464     if (tiltangle!=0.) AliDebug(2,Form(" rho_track = %f --- rho_cluster = %f ",trackTOFin->GetX(),bestCluster->GetX()));
 465
 466     //update the ESD track and delete the TOFtrack
 467     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
 468
 469     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 470     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
 471     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 472     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+kTimeOffset; // RAW time,in ps
 473     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 474     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
 475
 476     Int_t ind[5];
 477     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
 478     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
 479     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
 480     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
 481     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
 482     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 483     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 484
 485     // keep track of the track labels in the matched cluster
 486     Int_t tlab[3];
 487     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
 488     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
 489     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
 490     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %6d = ",bestCluster->GetTDC()));
 491     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+kTimeOffset; // in ps
 492     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 493     Double_t tofcorr=tof;
 494     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
 495     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 496     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 497     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 498     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 499     t->SetTOFLabel(tlab);
 500
 501     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f  corrected time: %f",rawTime,dzTW,tofcorr));
 502
 503     Double_t mom=t->GetP();
 504     AliDebug(1,Form(" Momentum for track %d -> %f", iseed,mom));
 505     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 506     fHRecNClus->Fill(nc);
 507     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
 508     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
 509     fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 510     fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 511     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 512     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 513
 514     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 515     // no longer there - all info is in the ESDs now
 516
 517     delete trackTOFin;
 518   }
 519
 520 }
 521 //_________________________________________________________________________
 522 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
 523   //--------------------------------------------------------------------
 524   //This function loads the TOF clusters
 525   //--------------------------------------------------------------------
 526
 527   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 528   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 529   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 530   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 531   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 532
 533   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 534   if (!branch) {
 535     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 536     return 1;
 537   }
 538
 539   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 540   dummy.Clear();
 541   TClonesArray *clusters=&dummy;
 542   branch->SetAddress(&clusters);
 543
 544   cTree->GetEvent(0);
 545   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 546   fHDigNClus->Fill(nc);
 547
 548   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 549
 550   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 551     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 552     fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 553
 554   // Fill Digits QA histos
 555
 556     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 557     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 558     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 559     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 560     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 561
 562     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 563     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 564
 565     Int_t stripOffset = 0;
 566     switch (iplate) {
 567     case 0:
 568       stripOffset = 0;
 569       break;
 570     case 1:
 571       stripOffset = nStripC;
 572       break;
 573     case 2:
 574       stripOffset = nStripC+nStripB;
 575       break;
 576     case 3:
 577       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 578       break;
 579     case 4:
 580       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 581       break;
 582     default:
 583       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 584       break;
 585     };
 586     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 587     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 588     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 589     fHDigClusTime->Fill(time);
 590     fHDigClusToT->Fill(tot);
 591   }
 592
 593
 594   return 0;
 595 }
 596 //_________________________________________________________________________
 597 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
 598   //--------------------------------------------------------------------
 599   //This function unloads TOF clusters
 600   //--------------------------------------------------------------------
 601   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 602     delete fClusters[i];
 603     fClusters[i] = 0x0;
 604   }
 605   fN=0;
 606 }
 607
 608 //_________________________________________________________________________
 609 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 610   //--------------------------------------------------------------------
 611   // This function returns the index of the nearest cluster
 612   //--------------------------------------------------------------------
 613   //MOD
 614   //Here we need to get the Z in the tracking system
 615
 616   if (fN==0) return 0;
 617   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 618   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 619   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 620   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 621     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 622     else e=m;
 623   }
 624   return m;
 625 }
 626
 627 //_________________________________________________________________________
 628 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 629 {
 630   // Get track space point with index i
 631   // Coordinates are in the global system
 632   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 633   Float_t xyz[3];
 634   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
 635   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 636   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 637   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 638   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 639   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 640   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 641   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 642   Float_t cov[6];
 643   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 644   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 645   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 646   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 647   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 648   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 649   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 650
 651   // Detector numbering scheme
 652   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 653   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 654   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 655   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 656   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 657
 658   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 659   if (isector >= nSector)
 660     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 661   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 662   if (iplate >= nPlate)
 663     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 664   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 665
 666   Int_t stripOffset = 0;
 667   switch (iplate) {
 668   case 0:
 669     stripOffset = 0;
 670     break;
 671   case 1:
 672     stripOffset = nStripC;
 673     break;
 674   case 2:
 675     stripOffset = nStripC+nStripB;
 676     break;
 677   case 3:
 678     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 679     break;
 680   case 4:
 681     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 682     break;
 683   default:
 684     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 685     break;
 686   };
 687
 688   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 689                stripOffset +
 690                istrip;
 691   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 692   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 693   return kTRUE;
 694 }
 695 //_________________________________________________________________________
 696 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
 697
 698   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 699
 700   TDirectory *dir = gDirectory;
 701   TFile *logFileTOF = 0;
 702
 703   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 704   int n = list->GetEntries();
 705   Bool_t isThere=kFALSE;
 706   for(int i=0; i<n; i++) {
 707     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 708     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 709       isThere=kTRUE;
 710       break;
 711     }
 712   }
 713
 714   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 715   logFileTOF->cd();
 716
 717   //Digits "QA"
 718   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 719   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 720   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 721   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 722
 723   //Reco "QA"
 724   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 725   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
 726   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
 727   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 728   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 729   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 730   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 731
 732   dir->cd();
 733
 734 }
 735
 736 //_________________________________________________________________________
 737 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
 738
 739   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 740
 741   TDirectory *dir = gDirectory;
 742   TFile *logFile = 0;
 743   TFile *logFileTOF = 0;
 744
 745   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 746   int n = list->GetEntries();
 747   for(int i=0; i<n; i++) {
 748     logFile = (TFile*)list->At(i);
 749     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
 750   }
 751
 752   Bool_t isThere=kFALSE;
 753   for(int i=0; i<n; i++) {
 754     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 755     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 756       isThere=kTRUE;
 757       break;
 758     }
 759   }
 760
 761   if(!isThere) {
 762           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 763           return;
 764   }
 765   logFile->cd();
 766   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 767   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 768   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 769   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 770   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 771   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
 772   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
 773   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 774   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 775   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 776   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 777   logFile->Flush();
 778
 779   dir->cd();
 780
 781   }
 782 //_________________________________________________________________________
 783 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) {
 784
 785   //dummy, for the moment
 786   Float_t tofcorr=0.;
 787   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 788     tofcorr=tof;
 789     //place here the actual correction
 790   }else{
 791     tofcorr=tof;
 792   }
 793   return tofcorr;
 794 }
 795 //_________________________________________________________________________
 796 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(AliESDEvent *event) const {
 797
 798   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 799
 800   return event->GetT0();
 801 }
 802 //_________________________________________________________________________
 803 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 804
 805   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 806   {
 807     //place T0 algo here...
 808   }
 809   return 0.;
 810 }
 811 //_________________________________________________________________________
 812
 813 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 814 {
 815   //
 816   // Returns the TOF cluster array
 817   //
 818
 819   if (fN==0)
 820     arr = 0x0;
 821   else
 822     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 823
 824 }