TOF/AliTOFtrackerV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TObjArray.h>
  34 #include <TTree.h>
  35 #include <TFile.h>
  36 #include <TH1F.h>
  37 #include <TH2F.h>
  38 #include <TSeqCollection.h>
  39
  40 #include "AliESDtrack.h"
  41 #include "AliESDEvent.h"
  42 #include "AliESDpid.h"
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliTrackPointArray.h"
  45 #include "AliGeomManager.h"
  46 #include "AliCDBManager.h"
  47
  48 #include "AliTOFRecoParam.h"
  49 #include "AliTOFReconstructor.h"
  50 #include "AliTOFcluster.h"
  51 #include "AliTOFGeometry.h"
  52 #include "AliTOFtrackerV1.h"
  53 #include "AliTOFtrack.h"
  54
  55 extern TROOT *gROOT;
  56
  57 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
  58
  59 //_____________________________________________________________________________
  60 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
  61   fkRecoParam(0x0),
  62   fN(0),
  63   fNseeds(0),
  64   fNseedsTOF(0),
  65   fngoodmatch(0),
  66   fnbadmatch(0),
  67   fnunmatch(0),
  68   fnmatch(0),
  69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  70   fSeeds(new TObjArray(100)),
  71   fHDigClusMap(0x0),
  72   fHDigNClus(0x0),
  73   fHDigClusTime(0x0),
  74   fHDigClusToT(0x0),
  75   fHRecNClus(0x0),
  76   fHRecChi2(0x0),
  77   fHRecDistZ(0x0),
  78   fHRecSigYVsP(0x0),
  79   fHRecSigZVsP(0x0),
  80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
  82  {
  83    //AliTOFtrackerV1 main Ctor
  84
  85    for (Int_t ii=0; ii<kMaxCluster; ii++) fClusters[ii]=0x0;
  86
  87    InitCheckHists();
  88
  89 }
  90 //_____________________________________________________________________________
  91 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
  92   //
  93   // Dtor
  94   //
  95
  96   SaveCheckHists();
  97
  98   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
  99     delete fkRecoParam;
 100   }
 101   delete fHDigClusMap;
 102   delete fHDigNClus;
 103   delete fHDigClusTime;
 104   delete fHDigClusToT;
 105   delete fHRecNClus;
 106   delete fHRecChi2;
 107   delete fHRecDistZ;
 108   delete fHRecSigYVsP;
 109   delete fHRecSigZVsP;
 110   delete fHRecSigYVsPWin;
 111   delete fHRecSigZVsPWin;
 112   if (fTracks){
 113     fTracks->Delete();
 114     delete fTracks;
 115     fTracks=0x0;
 116   }
 117   if (fSeeds){
 118     fSeeds->Delete();
 119     delete fSeeds;
 120     fSeeds=0x0;
 121   }
 122
 123
 124   for (Int_t ii=0; ii<kMaxCluster; ii++)
 125     if (fClusters[ii]) fClusters[ii]->Delete();
 126
 127 }
 128 //_____________________________________________________________________________
 129 void AliTOFtrackerV1::GetPidSettings(AliESDpid *esdPID) {
 130   //
 131   // Sets TOF resolution from RecoParams
 132   //
 133   if (fkRecoParam)
 134     esdPID->GetTOFResponse().SetTimeResolution(fkRecoParam->GetTimeResolution());
 135   else
 136     AliWarning("fkRecoParam not yet set; cannot set PID settings");
 137 }
 138 //_____________________________________________________________________________
 139 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent * const event) {
 140   //
 141   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 142   //
 143
 144   // initialize RecoParam for current event
 145   AliDebug(1,"Initializing params for TOF");
 146
 147   fkRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 148
 149   if (fkRecoParam == 0x0) {
 150     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 151   }
 152   //fkRecoParam->Dump();
 153   //if(fkRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fkRecoParam=fkRecoParam->GetPbPbparam();
 154   //fkRecoParam->PrintParameters();
 155
 156   //Initialise some counters
 157
 158   fNseeds=0;
 159   fNseedsTOF=0;
 160   fngoodmatch=0;
 161   fnbadmatch=0;
 162   fnunmatch=0;
 163   fnmatch=0;
 164
 165   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 166   fNseeds = ntrk;
 167
 168   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 169   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++)
 170     fSeeds->AddLast(event->GetTrack(i));
 171
 172   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 173   CollectESD();
 174
 175   //Matching Step
 176   MatchTracks();
 177
 178   AliInfo(Form("Number of matched tracks = %d (good = %d, bad = %d)",fnmatch,fngoodmatch,fnbadmatch));
 179
 180   //Update the matched ESD tracks
 181
 182   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 183     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 184     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->At(i);
 185
 186     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 187       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 188       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 189       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 190         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 191         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 192         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 193         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 194         t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 195         t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 196         t->SetTOFsignalDx(seed->GetTOFsignalDx());
 197         t->SetTOFDeltaBC(seed->GetTOFDeltaBC());
 198         t->SetTOFL0L1(seed->GetTOFL0L1());
 199         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 200         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 201         t->SetTOFLabel(tlab);
 202
 203         Double_t alphaA = (Double_t)t->GetAlpha();
 204         Double_t xA = (Double_t)t->GetX();
 205         Double_t yA = (Double_t)t->GetY();
 206         Double_t zA = (Double_t)t->GetZ();
 207         Double_t p1A = (Double_t)t->GetSnp();
 208         Double_t p2A = (Double_t)t->GetTgl();
 209         Double_t p3A = (Double_t)t->GetSigned1Pt();
 210         const Double_t *covA = (Double_t*)t->GetCovariance();
 211
 212         // Make attention, please:
 213         //      AliESDtrack::fTOFInfo array does not be stored in the AliESDs.root file
 214         //      it is there only for a check during the reconstruction step.
 215         Float_t info[10]={0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 216         seed->GetTOFInfo(info);
 217         t->SetTOFInfo(info);
 218         AliDebug(2,Form(" distance=%f; residual in the pad reference frame: dX=%f, dZ=%f", info[0],info[1],info[2]));
 219
 220         // Check done:
 221         //       by calling the AliESDtrack::UpdateTrackParams,
 222         //       the current track parameters are changed
 223         //       and it could cause refit problems.
 224         //       We need to update only the following track parameters:
 225         //            the track length and expected times.
 226         //       Removed AliESDtrack::UpdateTrackParams call
 227         //       Called AliESDtrack::SetIntegratedTimes(...) and
 228         //       AliESDtrack::SetIntegratedLength() routines.
 229         /*
 230           AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 231           t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout); // to be checked - AdC
 232           delete track;
 233           Double_t time[10]; t->GetIntegratedTimes(time);
 234         */
 235
 236         Double_t time[10]; seed->GetIntegratedTimes(time);
 237         t->SetIntegratedTimes(time);
 238
 239         Double_t length =  seed->GetIntegratedLength();
 240         t->SetIntegratedLength(length);
 241
 242         Double_t alphaB = (Double_t)t->GetAlpha();
 243         Double_t xB = (Double_t)t->GetX();
 244         Double_t yB = (Double_t)t->GetY();
 245         Double_t zB = (Double_t)t->GetZ();
 246         Double_t p1B = (Double_t)t->GetSnp();
 247         Double_t p2B = (Double_t)t->GetTgl();
 248         Double_t p3B = (Double_t)t->GetSigned1Pt();
 249         const Double_t *covB = (Double_t*)t->GetCovariance();
 250         AliDebug(2,"Track params -now(before)-:");
 251         AliDebug(2,Form("    X: %f(%f), Y: %f(%f), Z: %f(%f) --- alpha: %f(%f)",
 252                         xB,xA,
 253                         yB,yA,
 254                         zB,zA,
 255                         alphaB,alphaA));
 256         AliDebug(2,Form("    p1: %f(%f), p2: %f(%f), p3: %f(%f)",
 257                         p1B,p1A,
 258                         p2B,p2A,
 259                         p3B,p3A));
 260         AliDebug(2,Form("    cov1: %f(%f), cov2: %f(%f), cov3: %f(%f)"
 261                         " cov4: %f(%f), cov5: %f(%f), cov6: %f(%f)"
 262                         " cov7: %f(%f), cov8: %f(%f), cov9: %f(%f)"
 263                         " cov10: %f(%f), cov11: %f(%f), cov12: %f(%f)"
 264                         " cov13: %f(%f), cov14: %f(%f), cov15: %f(%f)",
 265                         covB[0],covA[0],
 266                         covB[1],covA[1],
 267                         covB[2],covA[2],
 268                         covB[3],covA[3],
 269                         covB[4],covA[4],
 270                         covB[5],covA[5],
 271                         covB[6],covA[6],
 272                         covB[7],covA[7],
 273                         covB[8],covA[8],
 274                         covB[9],covA[9],
 275                         covB[10],covA[10],
 276                         covB[11],covA[11],
 277                         covB[12],covA[12],
 278                         covB[13],covA[13],
 279                         covB[14],covA[14]
 280                         ));
 281         AliDebug(3,Form(" %6d  %f %f %f %f %f %6d %3d %f  %f %f %f %f %f",
 282                         i,
 283                         t->GetTOFsignalRaw(),
 284                         t->GetTOFsignal(),
 285                         t->GetTOFsignalToT(),
 286                         t->GetTOFsignalDz(),
 287                         t->GetTOFsignalDx(),
 288                         t->GetTOFCalChannel(),
 289                         t->GetTOFcluster(),
 290                         t->GetIntegratedLength(),
 291                         time[0], time[1], time[2], time[3], time[4]
 292                         )
 293                  );
 294       }
 295     }
 296   }
 297
 298   fSeeds->Clear();
 299   fTracks->Delete();
 300   return 0;
 301
 302 }
 303 //_________________________________________________________________________
 304 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
 305    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 306
 307   Int_t seedsTOF1=0;
 308   Int_t seedsTOF2=0;
 309
 310   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 311   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 312
 313     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->At(i);
 314     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 315
 316     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 317     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 318
 319     // TRD 'good' tracks, already propagated at 371 cm
 320     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 321          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 322       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 323
 324         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 325                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 326                         x, (Float_t)track->GetX()));
 327
 328         track->SetSeedIndex(i);
 329         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 330         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 331         fNseedsTOF++;
 332         seedsTOF1++;
 333       }
 334       delete track;
 335     }
 336
 337     // Propagate the rest of TPCbp
 338     else {
 339       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 340
 341         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 342                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 343                         x, (Float_t)track->GetX()));
 344
 345         track->SetSeedIndex(i);
 346         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 347         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 348         fNseedsTOF++;
 349         seedsTOF2++;
 350       }
 351       delete track;
 352     }
 353   }
 354
 355   AliInfo(Form("Number of TOF seeds = %d (Type 1 = %d, Type 2 = %d)",fNseedsTOF,seedsTOF1,seedsTOF2));
 356
 357   // Sort according uncertainties on track position
 358   fTracks->Sort();
 359
 360 }
 361 //_________________________________________________________________________
 362 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
 363   //
 364   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 365   //
 366
 367
 368   // Parameters regulating the reconstruction
 369   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 370   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 371
 372   const Float_t kTimeOffset = 0.; // time offset for tracking algorithm [ps]
 373
 374   const Int_t kncmax = 100;
 375   Float_t sensRadius = fkRecoParam->GetSensRadius();
 376   Float_t scaleFact   = fkRecoParam->GetWindowScaleFact();
 377   Float_t dyMax=fkRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 378   Float_t dzMax=fkRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 379   Double_t maxChi2=fkRecoParam->GetMaxChi2();
 380   Bool_t timeWalkCorr    = fkRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 381   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 382   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 383   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 384   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 385   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 386   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 387   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 388
 389
 390   //The matching loop
 391   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 392
 393     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 394     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->At(track->GetSeedIndex());
 395     //if ( t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 396     if ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) continue;
 397     AliTOFtrack *trackTOFin = new AliTOFtrack(*track);
 398
 399     // Determine a window around the track
 400     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 401     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 402
 403     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
 404       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",iseed));
 405       //delete trackTOFin;
 406       //continue;
 407     }
 408
 409     Double_t z    = par[1];
 410     Double_t dz   = scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])+dZ*dZ/12.);
 411     Double_t dphi = scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])+dY*dY/12.)/sensRadius;
 412
 413     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 414     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 415     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 416
 417     //upper limit on window's size.
 418     if (dz> dzMax) dz=dzMax;
 419     if (dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 420
 421     // find the clusters inside the selected window
 422     Int_t nc=0;
 423     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
 424     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
 425     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 426       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 427       //      if(nc>kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow) */
 428       if (nc>=kncmax) {
 429         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
 430         break; /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 431       }
 432       if (c->GetZ() > z+dz) break;
 433       if (c->IsUsed()) continue;
 434       if (!c->GetStatus()) {
 435         AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 436         continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 437       }
 438       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
 439       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 440       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
 441       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 442       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 443       clusters[nc]=c;
 444       index[nc] = k;
 445       nc++;
 446     }
 447
 448     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",iseed,nc));
 449
 450     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
 451
 452     Float_t  xTOF = sensRadius;
 453     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 454     Bool_t skip = kFALSE;
 455     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
 456     if (skip) break;
 457     if (ysect > ymax) {
 458       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 459         break;
 460       }
 461     } else if (ysect <-ymax) {
 462       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 463         break;
 464       }
 465     }
 466     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
 467       break;
 468     }
 469
 470
 471     AliTOFcluster *bestCluster=0;
 472     Double_t bestChi2=maxChi2;
 473     Int_t idclus=-1;
 474     //    for (Int_t i=0; i<nc; i++){ /* R+ fix (unsafe) */
 475     for (Int_t i=0; i<nc && i<kncmax; i++){ /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 476       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters
 477       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c);
 478       if (chi2 >= bestChi2) continue;
 479       bestChi2=chi2;
 480       bestCluster=c;
 481       idclus=index[i];
 482     }
 483
 484     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track
 485       fnunmatch++;
 486       delete trackTOFin;
 487       continue;
 488     }
 489
 490     fnmatch++;
 491
 492     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 493                      iseed,
 494                      fnmatch-1,
 495                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 496                      bestCluster->GetLabel(0),
 497                      bestCluster->GetLabel(1),
 498                      bestCluster->GetLabel(2),
 499                      idclus)); // AdC
 500
 501     bestCluster->Use();
 502     if (
 503         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 504         ||
 505         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 506         ||
 507         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 508         ) {
 509       fngoodmatch++;
 510        AliDebug(2,Form(" track label good %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 511
 512     }
 513     else{
 514       fnbadmatch++;
 515       AliDebug(2,Form(" track label bad %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 516     }
 517
 518     //Propagate the track to the best matched cluster
 519     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
 520
 521     // Fill the track residual histograms.
 522     FillResiduals(trackTOFin,bestCluster,kFALSE);
 523
 524     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
 525     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 526     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm - in the ALICE RF -
 527     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle); // from ALICE/tracking RF to pad RF (1)
 528     dzTW=-dzTW; // from ALICE/tracking RF to pad RF (2)
 529     if (tiltangle!=0.) AliDebug(2,Form(" rho_track = %f --- rho_cluster = %f ",trackTOFin->GetX(),bestCluster->GetX()));
 530
 531     //update the ESD track and delete the TOFtrack
 532     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
 533
 534     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 535     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
 536     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 537     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+kTimeOffset; // RAW time,in ps
 538     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 539     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
 540
 541     Float_t deltaY = trackTOFin->GetY()-bestCluster->GetY();
 542     t->SetTOFsignalDx(deltaY);
 543
 544     t->SetTOFDeltaBC(bestCluster->GetDeltaBC());
 545     t->SetTOFL0L1(bestCluster->GetL0L1Latency());
 546
 547     Float_t distR = (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX())*
 548       (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX());
 549     distR+=deltaY*deltaY;
 550     distR+=dzTW*dzTW;
 551     distR = TMath::Sqrt(distR);
 552     Float_t info[10] = {distR, deltaY, dzTW,
 553                         0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 554     t->SetTOFInfo(info);
 555
 556     Int_t ind[5];
 557     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
 558     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
 559     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
 560     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
 561     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
 562     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 563     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 564
 565     // keep track of the track labels in the matched cluster
 566     Int_t tlab[3];
 567     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
 568     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
 569     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
 570     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %6d = ",bestCluster->GetTDC()));
 571     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+kTimeOffset; // in ps
 572     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 573     Double_t tofcorr=tof;
 574     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
 575     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 576     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 577     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 578     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 579     t->SetTOFLabel(tlab);
 580
 581     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f  corrected time: %f",rawTime,dzTW,tofcorr));
 582
 583     Double_t mom=t->GetP();
 584     AliDebug(2,Form(" Momentum for track %d -> %f", iseed,mom));
 585     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 586     fHRecNClus->Fill(nc);
 587     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
 588     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
 589     if (cov[0]>=0.)
 590       fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 591     else
 592       fHRecSigYVsP->Fill(mom,-TMath::Sqrt(-cov[0]));
 593     if (cov[2]>=0.)
 594       fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 595     else
 596       fHRecSigZVsP->Fill(mom,-TMath::Sqrt(-cov[2]));
 597     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 598     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 599
 600     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 601     // no longer there - all info is in the ESDs now
 602
 603     delete trackTOFin;
 604   }
 605
 606 }
 607 //_________________________________________________________________________
 608 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
 609   //--------------------------------------------------------------------
 610   //This function loads the TOF clusters
 611   //--------------------------------------------------------------------
 612
 613   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 614   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 615   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 616   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 617   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 618
 619   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 620   if (!branch) {
 621     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 622     return 1;
 623   }
 624
 625   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 626   dummy.Clear();
 627   TClonesArray *clusters=&dummy;
 628   branch->SetAddress(&clusters);
 629
 630   cTree->GetEvent(0);
 631   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 632   fHDigNClus->Fill(nc);
 633
 634   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 635
 636   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 637     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 638 //PH    fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 639     fClusters[i]=c; fN++;
 640
 641   // Fill Digits QA histos
 642
 643     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 644     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 645     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 646     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 647     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 648
 649     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 650     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 651
 652     Int_t stripOffset = 0;
 653     switch (iplate) {
 654     case 0:
 655       stripOffset = 0;
 656       break;
 657     case 1:
 658       stripOffset = nStripC;
 659       break;
 660     case 2:
 661       stripOffset = nStripC+nStripB;
 662       break;
 663     case 3:
 664       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 665       break;
 666     case 4:
 667       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 668       break;
 669     default:
 670       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 671       break;
 672     };
 673     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 674     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 675     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 676     fHDigClusTime->Fill(time);
 677     fHDigClusToT->Fill(tot);
 678   }
 679
 680
 681   return 0;
 682 }
 683 //_________________________________________________________________________
 684 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
 685   //--------------------------------------------------------------------
 686   //This function unloads TOF clusters
 687   //--------------------------------------------------------------------
 688   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 689 //PH    delete fClusters[i];
 690     fClusters[i] = 0x0;
 691   }
 692   fN=0;
 693 }
 694
 695 //_________________________________________________________________________
 696 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 697   //--------------------------------------------------------------------
 698   // This function returns the index of the nearest cluster
 699   //--------------------------------------------------------------------
 700   //MOD
 701   //Here we need to get the Z in the tracking system
 702
 703   if (fN==0) return 0;
 704   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 705   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 706   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 707   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 708     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 709     else e=m;
 710   }
 711   return m;
 712 }
 713
 714 //_________________________________________________________________________
 715 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 716 {
 717   // Get track space point with index i
 718   // Coordinates are in the global system
 719   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 720   Float_t xyz[3];
 721   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
 722   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 723   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 724   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 725   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 726   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 727   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 728   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 729   Float_t cov[6];
 730   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 731   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 732   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 733   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 734   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 735   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 736   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 737
 738   // Detector numbering scheme
 739   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 740   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 741   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 742   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 743   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 744
 745   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 746   if (isector >= nSector)
 747     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 748   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 749   if (iplate >= nPlate)
 750     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 751   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 752
 753   Int_t stripOffset = 0;
 754   switch (iplate) {
 755   case 0:
 756     stripOffset = 0;
 757     break;
 758   case 1:
 759     stripOffset = nStripC;
 760     break;
 761   case 2:
 762     stripOffset = nStripC+nStripB;
 763     break;
 764   case 3:
 765     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 766     break;
 767   case 4:
 768     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 769     break;
 770   default:
 771     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 772     break;
 773   };
 774
 775   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 776                stripOffset +
 777                istrip;
 778   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 779   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 780   return kTRUE;
 781 }
 782 //_________________________________________________________________________
 783 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
 784
 785   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 786
 787   TDirectory *dir = gDirectory;
 788   TFile *logFileTOF = 0;
 789
 790   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 791   int n = list->GetEntries();
 792   Bool_t isThere=kFALSE;
 793   for(int i=0; i<n; i++) {
 794     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 795     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 796       isThere=kTRUE;
 797       break;
 798     }
 799   }
 800
 801   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 802   logFileTOF->cd();
 803
 804   //Digits "QA"
 805   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 806   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 807   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 808   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 809
 810   //Reco "QA"
 811   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 812   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
 813   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
 814   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 815   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 816   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 817   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 818
 819   dir->cd();
 820
 821 }
 822
 823 //_________________________________________________________________________
 824 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
 825
 826   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 827
 828   TDirectory *dir = gDirectory;
 829   TFile *logFile = 0;
 830   TFile *logFileTOF = 0;
 831
 832   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 833   int n = list->GetEntries();
 834   for(int i=0; i<n; i++) {
 835     logFile = (TFile*)list->At(i);
 836     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
 837   }
 838
 839   Bool_t isThere=kFALSE;
 840   for(int i=0; i<n; i++) {
 841     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 842     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 843       isThere=kTRUE;
 844       break;
 845     }
 846   }
 847
 848   if(!isThere) {
 849           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 850           return;
 851   }
 852   logFile->cd();
 853   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 854   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 855   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 856   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 857   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 858   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
 859   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
 860   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 861   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 862   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 863   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 864   logFile->Flush();
 865
 866   dir->cd();
 867
 868   }
 869 //_________________________________________________________________________
 870 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) const {
 871
 872   //dummy, for the moment
 873   Float_t tofcorr=0.;
 874   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 875     tofcorr=tof;
 876     //place here the actual correction
 877   }else{
 878     tofcorr=tof;
 879   }
 880   return tofcorr;
 881 }
 882 //_________________________________________________________________________
 883 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(const AliESDEvent * const event) const {
 884
 885   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 886
 887   return event->GetT0();
 888 }
 889 //_________________________________________________________________________
 890 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 891
 892   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 893   {
 894     //place T0 algo here...
 895   }
 896   return 0.;
 897 }
 898 //_________________________________________________________________________
 899
 900 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 901 {
 902   //
 903   // Returns the TOF cluster array
 904   //
 905
 906   if (fN==0)
 907     arr = 0x0;
 908   else
 909     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 910
 911 }