TOF/AliTOFtrackerV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TObjArray.h>
  34 #include <TTree.h>
  35 #include <TFile.h>
  36 #include <TH1F.h>
  37 #include <TH2F.h>
  38 #include <TSeqCollection.h>
  39
  40 #include "AliESDtrack.h"
  41 #include "AliESDEvent.h"
  42 #include "AliESDpid.h"
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliTrackPointArray.h"
  45 #include "AliGeomManager.h"
  46 #include "AliCDBManager.h"
  47
  48 #include "AliTOFRecoParam.h"
  49 #include "AliTOFReconstructor.h"
  50 #include "AliTOFcluster.h"
  51 #include "AliTOFGeometry.h"
  52 #include "AliTOFtrackerV1.h"
  53 #include "AliTOFtrack.h"
  54
  55 extern TROOT *gROOT;
  56
  57 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
  58
  59 //_____________________________________________________________________________
  60 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
  61   fkRecoParam(0x0),
  62   fN(0),
  63   fNseeds(0),
  64   fNseedsTOF(0),
  65   fngoodmatch(0),
  66   fnbadmatch(0),
  67   fnunmatch(0),
  68   fnmatch(0),
  69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  70   fSeeds(new TObjArray(100)),
  71   fHDigClusMap(0x0),
  72   fHDigNClus(0x0),
  73   fHDigClusTime(0x0),
  74   fHDigClusToT(0x0),
  75   fHRecNClus(0x0),
  76   fHRecChi2(0x0),
  77   fHRecDistZ(0x0),
  78   fHRecSigYVsP(0x0),
  79   fHRecSigZVsP(0x0),
  80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
  82  {
  83   //AliTOFtrackerV1 main Ctor
  84
  85    InitCheckHists();
  86
  87 }
  88 //_____________________________________________________________________________
  89 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
  90   //
  91   // Dtor
  92   //
  93
  94   SaveCheckHists();
  95
  96   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
  97     delete fkRecoParam;
  98   }
  99   delete fHDigClusMap;
 100   delete fHDigNClus;
 101   delete fHDigClusTime;
 102   delete fHDigClusToT;
 103   delete fHRecNClus;
 104   delete fHRecChi2;
 105   delete fHRecDistZ;
 106   delete fHRecSigYVsP;
 107   delete fHRecSigZVsP;
 108   delete fHRecSigYVsPWin;
 109   delete fHRecSigZVsPWin;
 110   if (fTracks){
 111     fTracks->Delete();
 112     delete fTracks;
 113     fTracks=0x0;
 114   }
 115   if (fSeeds){
 116     fSeeds->Delete();
 117     delete fSeeds;
 118     fSeeds=0x0;
 119   }
 120 }
 121 //_____________________________________________________________________________
 122 void AliTOFtrackerV1::GetPidSettings(AliESDpid *esdPID) {
 123   //
 124   // Sets TOF resolution from RecoParams
 125   //
 126   if (fkRecoParam)
 127     esdPID->GetTOFResponse().SetTimeResolution(fkRecoParam->GetTimeResolution());
 128   else
 129     AliWarning("fkRecoParam not yet set; cannot set PID settings");
 130 }
 131 //_____________________________________________________________________________
 132 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent * const event) {
 133   //
 134   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 135   //
 136
 137   // initialize RecoParam for current event
 138   AliDebug(1,"Initializing params for TOF");
 139
 140   fkRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 141
 142   if (fkRecoParam == 0x0) {
 143     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 144   }
 145   //fkRecoParam->Dump();
 146   //if(fkRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fkRecoParam=fkRecoParam->GetPbPbparam();
 147   //fkRecoParam->PrintParameters();
 148
 149   //Initialise some counters
 150
 151   fNseeds=0;
 152   fNseedsTOF=0;
 153   fngoodmatch=0;
 154   fnbadmatch=0;
 155   fnunmatch=0;
 156   fnmatch=0;
 157
 158   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 159   fNseeds = ntrk;
 160
 161   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 162   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++)
 163     fSeeds->AddLast(event->GetTrack(i));
 164
 165   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 166   CollectESD();
 167
 168   //Matching Step
 169   MatchTracks();
 170
 171   AliInfo(Form("Number of matched tracks = %d (good = %d, bad = %d)",fnmatch,fngoodmatch,fnbadmatch));
 172
 173   //Update the matched ESD tracks
 174
 175   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 176     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 177     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->At(i);
 178
 179     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 180       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 181       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 182       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 183         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 184         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 185         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 186         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 187         t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 188         t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 189         t->SetTOFsignalDx(seed->GetTOFsignalDx());
 190         t->SetTOFDeltaBC(seed->GetTOFDeltaBC());
 191         t->SetTOFL0L1(seed->GetTOFL0L1());
 192         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 193         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 194         t->SetTOFLabel(tlab);
 195
 196         Double_t alphaA = (Double_t)t->GetAlpha();
 197         Double_t xA = (Double_t)t->GetX();
 198         Double_t yA = (Double_t)t->GetY();
 199         Double_t zA = (Double_t)t->GetZ();
 200         Double_t p1A = (Double_t)t->GetSnp();
 201         Double_t p2A = (Double_t)t->GetTgl();
 202         Double_t p3A = (Double_t)t->GetSigned1Pt();
 203         const Double_t *covA = (Double_t*)t->GetCovariance();
 204
 205         // Make attention, please:
 206         //      AliESDtrack::fTOFInfo array does not be stored in the AliESDs.root file
 207         //      it is there only for a check during the reconstruction step.
 208         Float_t info[10]={0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 209         seed->GetTOFInfo(info);
 210         t->SetTOFInfo(info);
 211         AliDebug(2,Form(" distance=%f; residual in the pad reference frame: dX=%f, dZ=%f", info[0],info[1],info[2]));
 212
 213         // Check done:
 214         //       by calling the AliESDtrack::UpdateTrackParams,
 215         //       the current track parameters are changed
 216         //       and it could cause refit problems.
 217         //       We need to update only the following track parameters:
 218         //            the track length and expected times.
 219         //       Removed AliESDtrack::UpdateTrackParams call
 220         //       Called AliESDtrack::SetIntegratedTimes(...) and
 221         //       AliESDtrack::SetIntegratedLength() routines.
 222         /*
 223           AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 224           t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout); // to be checked - AdC
 225           delete track;
 226           Double_t time[10]; t->GetIntegratedTimes(time);
 227         */
 228
 229         Double_t time[10]; seed->GetIntegratedTimes(time);
 230         t->SetIntegratedTimes(time);
 231
 232         Double_t length =  seed->GetIntegratedLength();
 233         t->SetIntegratedLength(length);
 234
 235         Double_t alphaB = (Double_t)t->GetAlpha();
 236         Double_t xB = (Double_t)t->GetX();
 237         Double_t yB = (Double_t)t->GetY();
 238         Double_t zB = (Double_t)t->GetZ();
 239         Double_t p1B = (Double_t)t->GetSnp();
 240         Double_t p2B = (Double_t)t->GetTgl();
 241         Double_t p3B = (Double_t)t->GetSigned1Pt();
 242         const Double_t *covB = (Double_t*)t->GetCovariance();
 243         AliDebug(2,"Track params -now(before)-:");
 244         AliDebug(2,Form("    X: %f(%f), Y: %f(%f), Z: %f(%f) --- alpha: %f(%f)",
 245                         xB,xA,
 246                         yB,yA,
 247                         zB,zA,
 248                         alphaB,alphaA));
 249         AliDebug(2,Form("    p1: %f(%f), p2: %f(%f), p3: %f(%f)",
 250                         p1B,p1A,
 251                         p2B,p2A,
 252                         p3B,p3A));
 253         AliDebug(2,Form("    cov1: %f(%f), cov2: %f(%f), cov3: %f(%f)"
 254                         " cov4: %f(%f), cov5: %f(%f), cov6: %f(%f)"
 255                         " cov7: %f(%f), cov8: %f(%f), cov9: %f(%f)"
 256                         " cov10: %f(%f), cov11: %f(%f), cov12: %f(%f)"
 257                         " cov13: %f(%f), cov14: %f(%f), cov15: %f(%f)",
 258                         covB[0],covA[0],
 259                         covB[1],covA[1],
 260                         covB[2],covA[2],
 261                         covB[3],covA[3],
 262                         covB[4],covA[4],
 263                         covB[5],covA[5],
 264                         covB[6],covA[6],
 265                         covB[7],covA[7],
 266                         covB[8],covA[8],
 267                         covB[9],covA[9],
 268                         covB[10],covA[10],
 269                         covB[11],covA[11],
 270                         covB[12],covA[12],
 271                         covB[13],covA[13],
 272                         covB[14],covA[14]
 273                         ));
 274         AliDebug(3,Form(" %6d  %f %f %f %f %f %6d %3d %f  %f %f %f %f %f",
 275                         i,
 276                         t->GetTOFsignalRaw(),
 277                         t->GetTOFsignal(),
 278                         t->GetTOFsignalToT(),
 279                         t->GetTOFsignalDz(),
 280                         t->GetTOFsignalDx(),
 281                         t->GetTOFCalChannel(),
 282                         t->GetTOFcluster(),
 283                         t->GetIntegratedLength(),
 284                         time[0], time[1], time[2], time[3], time[4]
 285                         )
 286                  );
 287       }
 288     }
 289   }
 290
 291   fSeeds->Clear();
 292   fTracks->Delete();
 293   return 0;
 294
 295 }
 296 //_________________________________________________________________________
 297 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
 298    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 299
 300   Int_t seedsTOF1=0;
 301   Int_t seedsTOF2=0;
 302
 303   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 304   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 305
 306     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->At(i);
 307     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 308
 309     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 310     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 311
 312     // TRD 'good' tracks, already propagated at 371 cm
 313     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 314          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 315       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 316
 317         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 318                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 319                         x, (Float_t)track->GetX()));
 320
 321         track->SetSeedIndex(i);
 322         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 323         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 324         fNseedsTOF++;
 325         seedsTOF1++;
 326       }
 327       delete track;
 328     }
 329
 330     // Propagate the rest of TPCbp
 331     else {
 332       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 333
 334         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 335                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 336                         x, (Float_t)track->GetX()));
 337
 338         track->SetSeedIndex(i);
 339         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 340         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 341         fNseedsTOF++;
 342         seedsTOF2++;
 343       }
 344       delete track;
 345     }
 346   }
 347
 348   AliInfo(Form("Number of TOF seeds = %d (Type 1 = %d, Type 2 = %d)",fNseedsTOF,seedsTOF1,seedsTOF2));
 349
 350   // Sort according uncertainties on track position
 351   fTracks->Sort();
 352
 353 }
 354 //_________________________________________________________________________
 355 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
 356   //
 357   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 358   //
 359
 360
 361   // Parameters regulating the reconstruction
 362   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 363   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 364
 365   const Float_t kTimeOffset = 0.; // time offset for tracking algorithm [ps]
 366
 367   const Int_t kncmax = 100;
 368   Float_t sensRadius = fkRecoParam->GetSensRadius();
 369   Float_t scaleFact   = fkRecoParam->GetWindowScaleFact();
 370   Float_t dyMax=fkRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 371   Float_t dzMax=fkRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 372   Double_t maxChi2=fkRecoParam->GetMaxChi2();
 373   Bool_t timeWalkCorr    = fkRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 374   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 375   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 376   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 377   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 378   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 379   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 380   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 381
 382
 383   //The matching loop
 384   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 385
 386     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 387     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->At(track->GetSeedIndex());
 388     //if ( t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 389     if ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) continue;
 390     AliTOFtrack *trackTOFin = new AliTOFtrack(*track);
 391
 392     // Determine a window around the track
 393     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 394     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 395
 396     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
 397       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",iseed));
 398       //delete trackTOFin;
 399       //continue;
 400     }
 401
 402     Double_t z    = par[1];
 403     Double_t dz   = scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])+dZ*dZ/12.);
 404     Double_t dphi = scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])+dY*dY/12.)/sensRadius;
 405
 406     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 407     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 408     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 409
 410     //upper limit on window's size.
 411     if (dz> dzMax) dz=dzMax;
 412     if (dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 413
 414     // find the clusters inside the selected window
 415     Int_t nc=0;
 416     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
 417     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
 418     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 419       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 420       //      if(nc>kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow) */
 421       if (nc>=kncmax) {
 422         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
 423         break; /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 424       }
 425       if (c->GetZ() > z+dz) break;
 426       if (c->IsUsed()) continue;
 427       if (!c->GetStatus()) {
 428         AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 429         continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 430       }
 431       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
 432       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 433       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
 434       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 435       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 436       clusters[nc]=c;
 437       index[nc] = k;
 438       nc++;
 439     }
 440
 441     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",iseed,nc));
 442
 443     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
 444
 445     Float_t  xTOF = sensRadius;
 446     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 447     Bool_t skip = kFALSE;
 448     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
 449     if (skip) break;
 450     if (ysect > ymax) {
 451       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 452         break;
 453       }
 454     } else if (ysect <-ymax) {
 455       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 456         break;
 457       }
 458     }
 459     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
 460       break;
 461     }
 462
 463
 464     AliTOFcluster *bestCluster=0;
 465     Double_t bestChi2=maxChi2;
 466     Int_t idclus=-1;
 467     //    for (Int_t i=0; i<nc; i++){ /* R+ fix (unsafe) */
 468     for (Int_t i=0; i<nc && i<kncmax; i++){ /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 469       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters
 470       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c);
 471       if (chi2 >= bestChi2) continue;
 472       bestChi2=chi2;
 473       bestCluster=c;
 474       idclus=index[i];
 475     }
 476
 477     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track
 478       fnunmatch++;
 479       delete trackTOFin;
 480       continue;
 481     }
 482
 483     fnmatch++;
 484
 485     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 486                      iseed,
 487                      fnmatch-1,
 488                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 489                      bestCluster->GetLabel(0),
 490                      bestCluster->GetLabel(1),
 491                      bestCluster->GetLabel(2),
 492                      idclus)); // AdC
 493
 494     bestCluster->Use();
 495     if (
 496         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 497         ||
 498         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 499         ||
 500         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 501         ) {
 502       fngoodmatch++;
 503        AliDebug(2,Form(" track label good %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 504
 505     }
 506     else{
 507       fnbadmatch++;
 508       AliDebug(2,Form(" track label bad %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 509     }
 510
 511     //Propagate the track to the best matched cluster
 512     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
 513
 514     // Fill the track residual histograms.
 515     FillResiduals(trackTOFin,bestCluster,kFALSE);
 516
 517     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
 518     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 519     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm - in the ALICE RF -
 520     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle); // from ALICE/tracking RF to pad RF (1)
 521     dzTW=-dzTW; // from ALICE/tracking RF to pad RF (2)
 522     if (tiltangle!=0.) AliDebug(2,Form(" rho_track = %f --- rho_cluster = %f ",trackTOFin->GetX(),bestCluster->GetX()));
 523
 524     //update the ESD track and delete the TOFtrack
 525     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
 526
 527     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 528     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
 529     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 530     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+kTimeOffset; // RAW time,in ps
 531     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 532     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
 533
 534     Float_t deltaY = trackTOFin->GetY()-bestCluster->GetY();
 535     t->SetTOFsignalDx(deltaY);
 536
 537     t->SetTOFDeltaBC(bestCluster->GetDeltaBC());
 538     t->SetTOFL0L1(bestCluster->GetL0L1Latency());
 539
 540     Float_t distR = (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX())*
 541       (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX());
 542     distR+=deltaY*deltaY;
 543     distR+=dzTW*dzTW;
 544     distR = TMath::Sqrt(distR);
 545     Float_t info[10] = {distR, deltaY, dzTW,
 546                         0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 547     t->SetTOFInfo(info);
 548
 549     Int_t ind[5];
 550     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
 551     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
 552     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
 553     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
 554     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
 555     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 556     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 557
 558     // keep track of the track labels in the matched cluster
 559     Int_t tlab[3];
 560     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
 561     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
 562     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
 563     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %6d = ",bestCluster->GetTDC()));
 564     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+kTimeOffset; // in ps
 565     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 566     Double_t tofcorr=tof;
 567     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
 568     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 569     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 570     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 571     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 572     t->SetTOFLabel(tlab);
 573
 574     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f  corrected time: %f",rawTime,dzTW,tofcorr));
 575
 576     Double_t mom=t->GetP();
 577     AliDebug(2,Form(" Momentum for track %d -> %f", iseed,mom));
 578     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 579     fHRecNClus->Fill(nc);
 580     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
 581     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
 582     if (cov[0]>=0.)
 583       fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 584     else
 585       fHRecSigYVsP->Fill(mom,-TMath::Sqrt(-cov[0]));
 586     if (cov[2]>=0.)
 587       fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 588     else
 589       fHRecSigZVsP->Fill(mom,-TMath::Sqrt(-cov[2]));
 590     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 591     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 592
 593     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 594     // no longer there - all info is in the ESDs now
 595
 596     delete trackTOFin;
 597   }
 598
 599 }
 600 //_________________________________________________________________________
 601 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
 602   //--------------------------------------------------------------------
 603   //This function loads the TOF clusters
 604   //--------------------------------------------------------------------
 605
 606   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 607   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 608   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 609   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 610   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 611
 612   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 613   if (!branch) {
 614     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 615     return 1;
 616   }
 617
 618   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 619   dummy.Clear();
 620   TClonesArray *clusters=&dummy;
 621   branch->SetAddress(&clusters);
 622
 623   cTree->GetEvent(0);
 624   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 625   fHDigNClus->Fill(nc);
 626
 627   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 628
 629   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 630     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 631 //PH    fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 632     fClusters[i]=c; fN++;
 633
 634   // Fill Digits QA histos
 635
 636     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 637     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 638     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 639     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 640     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 641
 642     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 643     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 644
 645     Int_t stripOffset = 0;
 646     switch (iplate) {
 647     case 0:
 648       stripOffset = 0;
 649       break;
 650     case 1:
 651       stripOffset = nStripC;
 652       break;
 653     case 2:
 654       stripOffset = nStripC+nStripB;
 655       break;
 656     case 3:
 657       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 658       break;
 659     case 4:
 660       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 661       break;
 662     default:
 663       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 664       break;
 665     };
 666     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 667     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 668     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 669     fHDigClusTime->Fill(time);
 670     fHDigClusToT->Fill(tot);
 671   }
 672
 673
 674   return 0;
 675 }
 676 //_________________________________________________________________________
 677 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
 678   //--------------------------------------------------------------------
 679   //This function unloads TOF clusters
 680   //--------------------------------------------------------------------
 681   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 682 //PH    delete fClusters[i];
 683     fClusters[i] = 0x0;
 684   }
 685   fN=0;
 686 }
 687
 688 //_________________________________________________________________________
 689 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 690   //--------------------------------------------------------------------
 691   // This function returns the index of the nearest cluster
 692   //--------------------------------------------------------------------
 693   //MOD
 694   //Here we need to get the Z in the tracking system
 695
 696   if (fN==0) return 0;
 697   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 698   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 699   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 700   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 701     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 702     else e=m;
 703   }
 704   return m;
 705 }
 706
 707 //_________________________________________________________________________
 708 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 709 {
 710   // Get track space point with index i
 711   // Coordinates are in the global system
 712   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 713   Float_t xyz[3];
 714   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
 715   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 716   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 717   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 718   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 719   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 720   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 721   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 722   Float_t cov[6];
 723   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 724   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 725   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 726   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 727   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 728   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 729   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 730
 731   // Detector numbering scheme
 732   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 733   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 734   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 735   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 736   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 737
 738   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 739   if (isector >= nSector)
 740     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 741   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 742   if (iplate >= nPlate)
 743     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 744   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 745
 746   Int_t stripOffset = 0;
 747   switch (iplate) {
 748   case 0:
 749     stripOffset = 0;
 750     break;
 751   case 1:
 752     stripOffset = nStripC;
 753     break;
 754   case 2:
 755     stripOffset = nStripC+nStripB;
 756     break;
 757   case 3:
 758     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 759     break;
 760   case 4:
 761     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 762     break;
 763   default:
 764     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 765     break;
 766   };
 767
 768   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 769                stripOffset +
 770                istrip;
 771   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 772   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 773   return kTRUE;
 774 }
 775 //_________________________________________________________________________
 776 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
 777
 778   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 779
 780   TDirectory *dir = gDirectory;
 781   TFile *logFileTOF = 0;
 782
 783   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 784   int n = list->GetEntries();
 785   Bool_t isThere=kFALSE;
 786   for(int i=0; i<n; i++) {
 787     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 788     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 789       isThere=kTRUE;
 790       break;
 791     }
 792   }
 793
 794   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 795   logFileTOF->cd();
 796
 797   //Digits "QA"
 798   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 799   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 800   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 801   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 802
 803   //Reco "QA"
 804   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 805   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
 806   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
 807   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 808   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 809   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 810   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 811
 812   dir->cd();
 813
 814 }
 815
 816 //_________________________________________________________________________
 817 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
 818
 819   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 820
 821   TDirectory *dir = gDirectory;
 822   TFile *logFile = 0;
 823   TFile *logFileTOF = 0;
 824
 825   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 826   int n = list->GetEntries();
 827   for(int i=0; i<n; i++) {
 828     logFile = (TFile*)list->At(i);
 829     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
 830   }
 831
 832   Bool_t isThere=kFALSE;
 833   for(int i=0; i<n; i++) {
 834     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 835     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 836       isThere=kTRUE;
 837       break;
 838     }
 839   }
 840
 841   if(!isThere) {
 842           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 843           return;
 844   }
 845   logFile->cd();
 846   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 847   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 848   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 849   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 850   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 851   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
 852   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
 853   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 854   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 855   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 856   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 857   logFile->Flush();
 858
 859   dir->cd();
 860
 861   }
 862 //_________________________________________________________________________
 863 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) const {
 864
 865   //dummy, for the moment
 866   Float_t tofcorr=0.;
 867   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 868     tofcorr=tof;
 869     //place here the actual correction
 870   }else{
 871     tofcorr=tof;
 872   }
 873   return tofcorr;
 874 }
 875 //_________________________________________________________________________
 876 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(const AliESDEvent * const event) const {
 877
 878   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 879
 880   return event->GetT0();
 881 }
 882 //_________________________________________________________________________
 883 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 884
 885   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 886   {
 887     //place T0 algo here...
 888   }
 889   return 0.;
 890 }
 891 //_________________________________________________________________________
 892
 893 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 894 {
 895   //
 896   // Returns the TOF cluster array
 897   //
 898
 899   if (fN==0)
 900     arr = 0x0;
 901   else
 902     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 903
 904 }