TOF/AliTOFtrackerV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TTree.h>
  34 #include <TFile.h>
  35 #include <TH1F.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TSeqCollection.h>
  38
  39 #include "AliESDtrack.h"
  40 #include "AliESDEvent.h"
  41 #include "AliLog.h"
  42 #include "AliTrackPointArray.h"
  43 #include "AliGeomManager.h"
  44 #include "AliCDBManager.h"
  45
  46 #include "AliTOFRecoParam.h"
  47 #include "AliTOFReconstructor.h"
  48 #include "AliTOFcluster.h"
  49 #include "AliTOFGeometry.h"
  50 #include "AliTOFtrackerV1.h"
  51 #include "AliTOFtrack.h"
  52 #include "AliTOFpidESD.h"
  53
  54 extern TROOT *gROOT;
  55
  56 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
  57
  58 //_____________________________________________________________________________
  59 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
  60   fRecoParam(0x0),
  61   fPid(0x0),
  62   fN(0),
  63   fNseeds(0),
  64   fNseedsTOF(0),
  65   fngoodmatch(0),
  66   fnbadmatch(0),
  67   fnunmatch(0),
  68   fnmatch(0),
  69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  70   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
  71   fHDigClusMap(0x0),
  72   fHDigNClus(0x0),
  73   fHDigClusTime(0x0),
  74   fHDigClusToT(0x0),
  75   fHRecNClus(0x0),
  76   fHRecChi2(0x0),
  77   fHRecDistZ(0x0),
  78   fHRecSigYVsP(0x0),
  79   fHRecSigZVsP(0x0),
  80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
  82  {
  83   //AliTOFtrackerV1 main Ctor
  84
  85    InitCheckHists();
  86
  87 }
  88 //_____________________________________________________________________________
  89 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1(const AliTOFtrackerV1 &t):
  90   AliTracker(),
  91   fRecoParam(0x0),
  92   fPid(0x0),
  93   fN(0),
  94   fNseeds(0),
  95   fNseedsTOF(0),
  96   fngoodmatch(0),
  97   fnbadmatch(0),
  98   fnunmatch(0),
  99   fnmatch(0),
 100   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
 101   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
 102   fHDigClusMap(0x0),
 103   fHDigNClus(0x0),
 104   fHDigClusTime(0x0),
 105   fHDigClusToT(0x0),
 106   fHRecNClus(0x0),
 107   fHRecChi2(0x0),
 108   fHRecDistZ(0x0),
 109   fHRecSigYVsP(0x0),
 110   fHRecSigZVsP(0x0),
 111   fHRecSigYVsPWin(0x0),
 112   fHRecSigZVsPWin(0x0)
 113  {
 114   //AliTOFtrackerV1 copy Ctor
 115
 116   fNseeds=t.fNseeds;
 117   fNseeds=t.fNseeds;
 118   fNseedsTOF=t.fNseedsTOF;
 119   fngoodmatch=t.fngoodmatch;
 120   fnbadmatch=t.fnbadmatch;
 121   fnunmatch=t.fnunmatch;
 122   fnmatch=t.fnmatch;
 123   fRecoParam=t.fRecoParam;
 124   fPid=t.fPid;
 125   fSeeds=t.fSeeds;
 126   fTracks=t.fTracks;
 127   fN=t.fN;
 128 }
 129
 130 //_____________________________________________________________________________
 131 AliTOFtrackerV1& AliTOFtrackerV1::operator=(const AliTOFtrackerV1 &t)
 132 {
 133   //AliTOFtrackerV1 assignment operator
 134
 135   this->fNseeds=t.fNseeds;
 136   this->fNseedsTOF=t.fNseedsTOF;
 137   this->fngoodmatch=t.fngoodmatch;
 138   this->fnbadmatch=t.fnbadmatch;
 139   this->fnunmatch=t.fnunmatch;
 140   this->fnmatch=t.fnmatch;
 141   this->fRecoParam = t.fRecoParam;
 142   this->fPid = t.fPid;
 143   this->fSeeds=t.fSeeds;
 144   this->fTracks=t.fTracks;
 145   this->fN=t.fN;
 146   return *this;
 147
 148 }
 149 //_____________________________________________________________________________
 150 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
 151   //
 152   // Dtor
 153   //
 154
 155   SaveCheckHists();
 156
 157   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
 158     delete fRecoParam;
 159   }
 160   delete fPid;
 161   delete fHDigClusMap;
 162   delete fHDigNClus;
 163   delete fHDigClusTime;
 164   delete fHDigClusToT;
 165   delete fHRecNClus;
 166   delete fHRecChi2;
 167   delete fHRecDistZ;
 168   delete fHRecSigYVsP;
 169   delete fHRecSigZVsP;
 170   delete fHRecSigYVsPWin;
 171   delete fHRecSigZVsPWin;
 172   if (fTracks){
 173     fTracks->Delete();
 174     delete fTracks;
 175     fTracks=0x0;
 176   }
 177   if (fSeeds){
 178     fSeeds->Delete();
 179     delete fSeeds;
 180     fSeeds=0x0;
 181   }
 182 }
 183 //_____________________________________________________________________________
 184 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
 185   //
 186   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 187   //
 188
 189   // initialize RecoParam for current event
 190
 191   AliInfo("Initializing params for TOF... ");
 192
 193   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 194
 195   if (fRecoParam == 0x0) {
 196     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 197   }
 198   //fRecoParam->Dump();
 199   if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
 200   //fRecoParam->PrintParameters();
 201
 202   Double_t parPID[2];
 203   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
 204   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
 205   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
 206
 207   //Initialise some counters
 208
 209   fNseeds=0;
 210   fNseedsTOF=0;
 211   fngoodmatch=0;
 212   fnbadmatch=0;
 213   fnunmatch=0;
 214   fnmatch=0;
 215
 216   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 217   fNseeds = ntrk;
 218   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
 219
 220
 221   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 222
 223   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 224     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 225     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
 226   }
 227
 228   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 229   CollectESD();
 230
 231   //Matching Step
 232   MatchTracks();
 233
 234   AliInfo(Form("Number of matched tracks: %d",fnmatch));
 235   AliInfo(Form("Number of good matched tracks: %d",fngoodmatch));
 236   AliInfo(Form("Number of bad  matched tracks: %d",fnbadmatch));
 237
 238   //Update the matched ESD tracks
 239
 240   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 241     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 242     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 243     if(seed->GetTOFsignal()>0){
 244       t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 245       t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 246       t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 247       t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 248       t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 249       t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 250       Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 251       t->SetTOFLabel(tlab);
 252       AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 253       t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout);
 254       delete track;
 255     }
 256   }
 257
 258   //Handle Time Zero information
 259
 260   Double_t timeZero=0.;
 261   Double_t timeZeroMax=99999.;
 262   Bool_t usetimeZero     = fRecoParam->UseTimeZero();
 263   Bool_t timeZeroFromT0  = fRecoParam->GetTimeZerofromT0();
 264   Bool_t timeZeroFromTOF = fRecoParam->GetTimeZerofromTOF();
 265
 266   AliDebug(1,Form("Use Time Zero?: %d",usetimeZero));
 267   AliDebug(1,Form("Time Zero from T0? : %d",timeZeroFromT0));
 268   AliDebug(1,Form("Time Zero From TOF? : %d",timeZeroFromTOF));
 269
 270   if(usetimeZero){
 271     if(timeZeroFromT0){
 272       timeZero=GetTimeZerofromT0(event);
 273     }
 274     if(timeZeroFromTOF && (timeZero>timeZeroMax || !timeZeroFromT0)){
 275       timeZero=GetTimeZerofromTOF(event);
 276     }
 277   }
 278   AliDebug(2,Form("time Zero used in PID: %f",timeZero));
 279   //Make TOF PID
 280   fPid->MakePID(event,timeZero);
 281
 282   fSeeds->Clear();
 283   fTracks->Clear();
 284   return 0;
 285
 286 }
 287 //_________________________________________________________________________
 288 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
 289    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 290
 291   Int_t seedsTOF1=0;
 292   Int_t seedsTOF2=0;
 293
 294   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 295   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 296
 297     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 298     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 299
 300     // TRD 'good' tracks, already propagated at 372 cm
 301
 302     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 303     Double_t x = track->GetX(); //New
 304
 305     if (((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 306          ( x >= AliTOFGeometry::RinTOF()) ){
 307       track->SetSeedIndex(i);
 308       t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout);
 309       new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 310       fNseedsTOF++;
 311       seedsTOF1++;
 312       delete track;
 313     }
 314
 315     // Propagate the rest of TPCbp
 316
 317     else {
 318       if(track->PropagateToInnerTOF()){
 319         track->SetSeedIndex(i);
 320         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout);
 321         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 322         fNseedsTOF++;
 323         seedsTOF2++;
 324       }
 325       delete track;
 326     }
 327   }
 328
 329   AliInfo(Form("Number of TOF seeds %i",fNseedsTOF));
 330   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 1 %i",seedsTOF1));
 331   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 2 %i",seedsTOF2));
 332
 333   // Sort according uncertainties on track position
 334   fTracks->Sort();
 335
 336 }
 337 //_________________________________________________________________________
 338 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
 339   //
 340   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 341   //
 342
 343
 344   // Parameters regulating the reconstruction
 345   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 346   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 347
 348   const Int_t kncmax = 100;
 349   Float_t sensRadius = fRecoParam->GetSensRadius();
 350   Float_t scaleFact   = fRecoParam->GetWindowScaleFact();
 351   Float_t dyMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 352   Float_t dzMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 353   Double_t maxChi2=fRecoParam->GetMaxChi2();
 354   Bool_t timeWalkCorr    = fRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 355   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 356   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 357   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 358   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 359   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 360   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 361   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 362
 363
 364   //The matching loop
 365
 366   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 367
 368     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 369     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
 370     if(t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 371     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
 372
 373     // Determine a window around the track
 374     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 375     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 376
 377     Double_t z    = par[1];
 378     Double_t dz   =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(cov[2]+dZ*dZ/12.);
 379     Double_t dphi =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(cov[0]+dY*dY/12.)/sensRadius;
 380
 381     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 382     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 383     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 384
 385     //upper limit on window's size.
 386     if(dz> dzMax) dz=dzMax;
 387     if(dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 388
 389
 390     // find the clusters inside the selected window
 391     Int_t nc=0;
 392     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
 393     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
 394     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 395       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 396       if(nc>kncmax)break;
 397       if(c->GetZ() > z+dz) break;
 398       if(c->IsUsed()) continue;
 399       if(!c->GetStatus()) {
 400               AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 401               continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 402       }
 403       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
 404       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 405       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
 406       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 407       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 408       clusters[nc]=c;
 409       index[nc] = k;
 410       nc++;
 411     }
 412
 413     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
 414
 415     Float_t  xTOF = sensRadius;
 416     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 417     Bool_t skip = kFALSE;
 418     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
 419     if (skip) break;
 420     if (ysect > ymax) {
 421       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 422         break;
 423       }
 424     } else if (ysect <-ymax) {
 425       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 426         break;
 427       }
 428     }
 429     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
 430       break;
 431     }
 432
 433
 434     AliTOFcluster *bestCluster=0;
 435     Double_t bestChi2=maxChi2;
 436     Int_t idclus=-1;
 437     for (Int_t i=0; i<nc; i++){
 438       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters
 439       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c);
 440       if (chi2 >= bestChi2) continue;
 441       bestChi2=chi2;
 442       bestCluster=c;
 443       idclus=index[i];
 444     }
 445
 446     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track
 447       fnunmatch++;
 448       delete trackTOFin;
 449       continue;
 450     }
 451
 452     fnmatch++;
 453
 454     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 455                      iseed,
 456                      fnmatch-1,
 457                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 458                      bestCluster->GetLabel(0),
 459                      bestCluster->GetLabel(1),
 460                      bestCluster->GetLabel(2),
 461                      idclus)); // AdC
 462
 463     bestCluster->Use();
 464     if (
 465         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 466         ||
 467         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 468         ||
 469         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 470         ) {
 471       fngoodmatch++;
 472        AliDebug(2,Form(" track label good %5i",trackTOFin->GetLabel()));
 473
 474     }
 475     else{
 476       fnbadmatch++;
 477       AliDebug(2,Form(" track label bad %5i",trackTOFin->GetLabel()));
 478     }
 479
 480     //Propagate the track to the best matched cluster
 481     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
 482
 483
 484     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
 485     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 486     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm
 487     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle);
 488
 489     //update the ESD track and delete the TOFtrack
 490     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
 491     delete trackTOFin;
 492
 493     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 494     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
 495     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 496     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+32; // RAW time,in ps
 497     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 498     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
 499     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f time: %f = ",rawTime,dzTW));
 500     Int_t ind[5];
 501     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
 502     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
 503     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
 504     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
 505     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
 506     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 507     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 508
 509     // keep track of the track labels in the matched cluster
 510     Int_t tlab[3];
 511     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
 512     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
 513     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
 514     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %i = ",bestCluster->GetTDC()));
 515     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+32; // in ps
 516     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 517     Double_t tofcorr=tof;
 518     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
 519     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 520     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 521     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 522     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 523     t->SetTOFLabel(tlab);
 524
 525     Double_t mom=t->GetP();
 526     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 527     fHRecNClus->Fill(nc);
 528     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
 529     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
 530     fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 531     fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 532     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 533     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 534
 535     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 536     // no longer there - all info is in the ESDs now
 537
 538   }
 539
 540 }
 541 //_________________________________________________________________________
 542 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
 543   //--------------------------------------------------------------------
 544   //This function loads the TOF clusters
 545   //--------------------------------------------------------------------
 546
 547   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 548   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 549   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 550   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 551   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 552
 553   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 554   if (!branch) {
 555     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 556     return 1;
 557   }
 558
 559   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 560   dummy.Clear();
 561   TClonesArray *clusters=&dummy;
 562   branch->SetAddress(&clusters);
 563
 564   cTree->GetEvent(0);
 565   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 566   fHDigNClus->Fill(nc);
 567
 568   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 569
 570   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 571     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 572     fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 573
 574   // Fill Digits QA histos
 575
 576     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 577     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 578     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 579     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 580     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 581
 582     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 583     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 584
 585     Int_t stripOffset = 0;
 586     switch (iplate) {
 587     case 0:
 588       stripOffset = 0;
 589       break;
 590     case 1:
 591       stripOffset = nStripC;
 592       break;
 593     case 2:
 594       stripOffset = nStripC+nStripB;
 595       break;
 596     case 3:
 597       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 598       break;
 599     case 4:
 600       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 601       break;
 602     default:
 603       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 604       break;
 605     };
 606     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 607     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 608     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 609     fHDigClusTime->Fill(time);
 610     fHDigClusToT->Fill(tot);
 611   }
 612
 613
 614   return 0;
 615 }
 616 //_________________________________________________________________________
 617 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
 618   //--------------------------------------------------------------------
 619   //This function unloads TOF clusters
 620   //--------------------------------------------------------------------
 621   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 622     delete fClusters[i];
 623     fClusters[i] = 0x0;
 624   }
 625   fN=0;
 626 }
 627
 628 //_________________________________________________________________________
 629 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 630   //--------------------------------------------------------------------
 631   // This function returns the index of the nearest cluster
 632   //--------------------------------------------------------------------
 633   //MOD
 634   //Here we need to get the Z in the tracking system
 635
 636   if (fN==0) return 0;
 637   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 638   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 639   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 640   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 641     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 642     else e=m;
 643   }
 644   return m;
 645 }
 646
 647 //_________________________________________________________________________
 648 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 649 {
 650   // Get track space point with index i
 651   // Coordinates are in the global system
 652   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 653   Float_t xyz[3];
 654   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
 655   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 656   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 657   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 658   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 659   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 660   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 661   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 662   Float_t cov[6];
 663   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 664   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 665   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 666   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 667   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 668   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 669   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 670
 671   // Detector numbering scheme
 672   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 673   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 674   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 675   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 676   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 677
 678   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 679   if (isector >= nSector)
 680     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 681   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 682   if (iplate >= nPlate)
 683     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 684   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 685
 686   Int_t stripOffset = 0;
 687   switch (iplate) {
 688   case 0:
 689     stripOffset = 0;
 690     break;
 691   case 1:
 692     stripOffset = nStripC;
 693     break;
 694   case 2:
 695     stripOffset = nStripC+nStripB;
 696     break;
 697   case 3:
 698     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 699     break;
 700   case 4:
 701     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 702     break;
 703   default:
 704     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 705     break;
 706   };
 707
 708   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 709                stripOffset +
 710                istrip;
 711   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 712   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 713   return kTRUE;
 714 }
 715 //_________________________________________________________________________
 716 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
 717
 718   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 719
 720   TDirectory *dir = gDirectory;
 721   TFile *logFileTOF = 0;
 722
 723   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 724   int n = list->GetEntries();
 725   Bool_t isThere=kFALSE;
 726   for(int i=0; i<n; i++) {
 727     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 728     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 729       isThere=kTRUE;
 730       break;
 731     }
 732   }
 733
 734   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 735   logFileTOF->cd();
 736
 737   //Digits "QA"
 738   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 739   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 740   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 741   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 742
 743   //Reco "QA"
 744   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 745   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
 746   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
 747   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 748   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 749   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 750   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 751
 752   dir->cd();
 753
 754 }
 755
 756 //_________________________________________________________________________
 757 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
 758
 759   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 760
 761   TDirectory *dir = gDirectory;
 762   TFile *logFile = 0;
 763   TFile *logFileTOF = 0;
 764
 765   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 766   int n = list->GetEntries();
 767   for(int i=0; i<n; i++) {
 768     logFile = (TFile*)list->At(i);
 769     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
 770   }
 771
 772   Bool_t isThere=kFALSE;
 773   for(int i=0; i<n; i++) {
 774     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 775     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 776       isThere=kTRUE;
 777       break;
 778     }
 779   }
 780
 781   if(!isThere) {
 782           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 783           return;
 784   }
 785   logFile->cd();
 786   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 787   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 788   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 789   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 790   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 791   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
 792   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
 793   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 794   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 795   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 796   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 797   logFile->Flush();
 798
 799   dir->cd();
 800
 801   }
 802 //_________________________________________________________________________
 803 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) {
 804
 805   //dummy, for the moment
 806   Float_t tofcorr=0.;
 807   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 808     tofcorr=tof;
 809     //place here the actual correction
 810   }else{
 811     tofcorr=tof;
 812   }
 813   return tofcorr;
 814 }
 815 //_________________________________________________________________________
 816 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(AliESDEvent *event) const {
 817
 818   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 819
 820   return event->GetT0();
 821 }
 822 //_________________________________________________________________________
 823 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 824
 825   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 826   {
 827     //place T0 algo here...
 828   }
 829   return 0.;
 830 }
 831 //_________________________________________________________________________
 832
 833 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 834 {
 835   //
 836   // Returns the TOF cluster array
 837   //
 838
 839   if (fN==0)
 840     arr = 0x0;
 841   else
 842     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 843
 844 }