8591b18d0a16228f8255db537d67895bdb85f6a0
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPC.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /*
17 $Log$
18 Revision 1.66  2003/02/11 16:54:07  hristov
19 Updated AliTrackReference class (S.Radomski)
20
21 Revision 1.65  2002/11/21 22:43:32  alibrary
22 Removing AliMC and AliMCProcess
23
24 Revision 1.64  2002/10/23 07:17:33  alibrary
25 Introducing Riostream.h
26
27 Revision 1.63  2002/10/14 14:57:42  hristov
28 Merging the VirtualMC branch to the main development branch (HEAD)
29
30 Revision 1.54.4.3  2002/10/11 08:34:48  hristov
31 Updating VirtualMC to v3-09-02
32
33 Revision 1.62  2002/09/23 09:22:56  hristov
34 The address of the TrackReferences is set (M.Ivanov)
35
36 Revision 1.61  2002/09/10 07:06:42  kowal2
37 Corrected for the memory leak. Thanks to J. Chudoba and M. Ivanov
38
39 Revision 1.60  2002/06/12 14:56:56  kowal2
40 Added track length to the reference hits
41
42 Revision 1.59  2002/06/05 15:37:31  kowal2
43 Added cross-talk from the wires beyond the first and the last rows
44
45 Revision 1.58  2002/05/27 14:33:14  hristov
46 The new class AliTrackReference used (M.Ivanov)
47
48 Revision 1.57  2002/05/07 17:23:11  kowal2
49 Linear gain inefficiency instead of the step one at the wire edges.
50
51 Revision 1.56  2002/04/04 16:26:33  kowal2
52 Digits (Sdigits) go to separate files now.
53
54 Revision 1.55  2002/03/29 06:57:45  kowal2
55 Restored backward compatibility to use the hits from Dec. 2000 production.
56
57 Revision 1.54  2002/03/18 17:59:13  kowal2
58 Chnges in the pad geometry - 3 pad lengths introduced.
59
60 Revision 1.53  2002/02/25 11:02:56  kowal2
61 Changes towards speeding up the code. Thanks to Marian Ivanov.
62
63 Revision 1.52  2002/02/18 09:26:09  kowal2
64 Removed compiler warning
65
66 Revision 1.51  2002/01/21 17:13:21  kowal2
67 New track hits using root containers. Setting active sectors added.
68
69 Revision 1.50  2001/12/06 14:16:19  kowal2
70 meaningfull printouts
71
72 Revision 1.49  2001/11/30 11:55:37  hristov
73 Noise table created in Hits2SDigits (M.Ivanov)
74
75 Revision 1.48  2001/11/24 16:10:21  kowal2
76 Faster algorithms.
77
78 Revision 1.47  2001/11/19 10:25:34  kowal2
79 Nearest integer instead of integer when converting to ADC counts
80
81 Revision 1.46  2001/11/07 06:47:12  kowal2
82 Removed printouts
83
84 Revision 1.45  2001/11/03 13:33:48  kowal2
85 Updated algorithms in Hits2SDigits, SDigits2Digits,
86 Hits2ExactClusters.
87 Added method Merge
88
89 Revision 1.44  2001/08/30 09:28:48  hristov
90 TTree names are explicitly set via SetName(name) and then Write() is called
91
92 Revision 1.43  2001/07/28 12:02:54  hristov
93 Branch split level set to 99
94
95 Revision 1.42  2001/07/28 11:38:52  hristov
96 Loop variable declared once
97
98 Revision 1.41  2001/07/28 10:53:50  hristov
99 Digitisation done according to the general scheme (M.Ivanov)
100
101 Revision 1.40  2001/07/27 13:03:14  hristov
102 Default Branch split level set to 99
103
104 Revision 1.39  2001/07/26 09:09:34  kowal2
105 Hits2Reco method added
106
107 Revision 1.38  2001/07/20 14:32:43  kowal2
108 Processing of many events possible now
109
110 Revision 1.37  2001/06/12 07:17:18  kowal2
111 Hits2SDigits method implemented (summable digits)
112
113 Revision 1.36  2001/05/16 14:57:25  alibrary
114 New files for folders and Stack
115
116 Revision 1.35  2001/05/08 16:02:22  kowal2
117 Updated material specifications
118
119 Revision 1.34  2001/05/08 15:00:15  hristov
120 Corrections for tracking in arbitrary magnenetic field. Changes towards a concept of global Alice track. Back propagation of reconstructed tracks (Yu.Belikov)
121
122 Revision 1.33  2001/04/03 12:40:43  kowal2
123 Removed printouts
124
125 Revision 1.32  2001/03/12 17:47:36  hristov
126 Changes needed on Sun with CC 5.0
127
128 Revision 1.31  2001/03/12 08:21:50  kowal2
129 Corrected C++ bug in the material definitions
130
131 Revision 1.30  2001/03/01 17:34:47  kowal2
132 Correction due to the accuracy problem
133
134 Revision 1.29  2001/02/28 16:34:40  kowal2
135 Protection against nonphysical values of the avalanche size,
136 10**6 is the maximum
137
138 Revision 1.28  2001/01/26 19:57:19  hristov
139 Major upgrade of AliRoot code
140
141 Revision 1.27  2001/01/13 17:29:33  kowal2
142 Sun compiler correction
143
144 Revision 1.26  2001/01/10 07:59:43  kowal2
145 Corrections to load points from the noncompressed hits.
146
147 Revision 1.25  2000/11/02 07:25:31  kowal2
148 Changes due to the new hit structure.
149 Memory leak removed.
150
151 Revision 1.24  2000/10/05 16:06:09  kowal2
152 Forward declarations. Changes due to a new class AliComplexCluster.
153
154 Revision 1.23  2000/10/02 21:28:18  fca
155 Removal of useless dependecies via forward declarations
156
157 Revision 1.22  2000/07/10 20:57:39  hristov
158 Update of TPC code and macros by M.Kowalski
159
160 Revision 1.19.2.4  2000/06/26 07:39:42  kowal2
161 Changes to obey the coding rules
162
163 Revision 1.19.2.3  2000/06/25 08:38:41  kowal2
164 Splitted from AliTPCtracking
165
166 Revision 1.19.2.2  2000/06/16 12:59:28  kowal2
167 Changed parameter settings
168
169 Revision 1.19.2.1  2000/06/09 07:15:07  kowal2
170
171 Defaults loaded automatically (hard-wired)
172 Optional parameters can be set via macro called in the constructor
173
174 Revision 1.19  2000/04/18 19:00:59  fca
175 Small bug fixes to TPC files
176
177 Revision 1.18  2000/04/17 09:37:33  kowal2
178 removed obsolete AliTPCDigitsDisplay.C
179
180 Revision 1.17.2.2  2000/04/10 08:15:12  kowal2
181
182 New, experimental data structure from M. Ivanov
183 New tracking algorithm
184 Different pad geometry for different sectors
185 Digitization rewritten
186
187 Revision 1.17.2.1  2000/04/10 07:56:53  kowal2
188 Not used anymore - removed
189
190 Revision 1.17  2000/01/19 17:17:30  fca
191 Introducing a list of lists of hits -- more hits allowed for detector now
192
193 Revision 1.16  1999/11/05 09:29:23  fca
194 Accept only signals > 0
195
196 Revision 1.15  1999/10/08 06:26:53  fca
197 Removed ClustersIndex - not used anymore
198
199 Revision 1.14  1999/09/29 09:24:33  fca
200 Introduction of the Copyright and cvs Log
201
202 */
203
204 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
205 //                                                                           //
206 //  Time Projection Chamber                                                  //
207 //  This class contains the basic functions for the Time Projection Chamber  //
208 //  detector. Functions specific to one particular geometry are              //
209 //  contained in the derived classes                                         //
210 //                                                                           //
211 //Begin_Html
212 /*
213 <img src="picts/AliTPCClass.gif">
214 */
215 //End_Html
216 //                                                                           //
217 //                                                                          //
218 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
219
220 //
221
222 #include <TMath.h>
223 #include <TRandom.h>
224 #include <TVector.h>
225 #include <TMatrix.h>
226 #include <TGeometry.h>
227 #include <TNode.h>
228 #include <TTUBS.h>
229 #include <TObjectTable.h>
230 #include "TParticle.h"
231 #include "AliTPC.h"
232 #include <TFile.h>  
233 #include <TROOT.h>
234 #include <TSystem.h>     
235 #include "AliRun.h"
236 #include <Riostream.h>
237 #include <stdlib.h>
238 #include <Riostream.h>
239 #include "AliMagF.h"
240 #include "AliTrackReference.h"
241
242
243 #include "AliTPCParamSR.h"
244 #include "AliTPCPRF2D.h"
245 #include "AliTPCRF1D.h"
246 #include "AliDigits.h"
247 #include "AliSimDigits.h"
248 #include "AliTPCTrackHits.h"
249 #include "AliTPCTrackHitsV2.h"
250 #include "AliPoints.h"
251 #include "AliArrayBranch.h"
252
253
254 #include "AliTPCDigitsArray.h"
255 #include "AliComplexCluster.h"
256 #include "AliClusters.h"
257 #include "AliTPCClustersRow.h"
258 #include "AliTPCClustersArray.h"
259
260 #include "AliTPCcluster.h"
261 #include "AliTPCclusterer.h"
262 #include "AliTPCtracker.h"
263
264 #include <TInterpreter.h>
265 #include <TTree.h>
266
267
268
269 ClassImp(AliTPC) 
270
271 //_____________________________________________________________________________
272 // helper class for fast matrix and vector manipulation - no range checking
273 // origin - Marian Ivanov
274
275 class AliTPCFastMatrix : public TMatrix {
276 public :
277   AliTPCFastMatrix(Int_t row_lwb, Int_t row_upb, Int_t col_lwb, Int_t col_upb);
278   inline Float_t & UncheckedAt(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
279   inline Float_t   UncheckedAtFast(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
280 };
281
282 AliTPCFastMatrix::AliTPCFastMatrix(Int_t row_lwb, Int_t row_upb, Int_t col_lwb, Int_t col_upb):
283   TMatrix(row_lwb, row_upb,col_lwb,col_upb)
284    {
285    };
286 //_____________________________________________________________________________
287 class AliTPCFastVector : public TVector {
288 public :
289   AliTPCFastVector(Int_t size);
290   virtual ~AliTPCFastVector(){;}
291   inline Float_t & UncheckedAt(Int_t index) const  {return  fElements[index];} //fast acces  
292   
293 };
294
295 AliTPCFastVector::AliTPCFastVector(Int_t size):TVector(size){
296 };
297
298 //_____________________________________________________________________________
299 AliTPC::AliTPC()
300 {
301   //
302   // Default constructor
303   //
304   fIshunt   = 0;
305   fHits     = 0;
306   fDigits   = 0;
307   fNsectors = 0;
308   fDigitsArray = 0;
309   fClustersArray = 0;
310   fDefaults = 0;
311   fTrackHits = 0; 
312   fTrackHitsOld = 0;   
313   fHitType = 2; //default CONTAINERS - based on ROOT structure 
314   fTPCParam = 0;    
315   fNoiseTable = 0;
316   fActiveSectors =0;
317
318 }
319  
320 //_____________________________________________________________________________
321 AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
322       : AliDetector(name,title)
323 {
324   //
325   // Standard constructor
326   //
327
328   //
329   // Initialise arrays of hits and digits 
330   fHits     = new TClonesArray("AliTPChit",  176);
331   gAlice->AddHitList(fHits); 
332   fDigitsArray = 0;
333   fClustersArray= 0;
334   fDefaults = 0;
335   //
336   fTrackHits = new AliTPCTrackHitsV2;  
337   fTrackHits->SetHitPrecision(0.002);
338   fTrackHits->SetStepPrecision(0.003);  
339   fTrackHits->SetMaxDistance(100);
340
341   fTrackHitsOld = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
342   fTrackHitsOld->SetHitPrecision(0.002);
343   fTrackHitsOld->SetStepPrecision(0.003);  
344   fTrackHitsOld->SetMaxDistance(100); 
345
346   fNoiseTable =0;
347
348   fHitType = 2;
349   fActiveSectors = 0;
350   //
351   // Initialise counters
352   fNsectors = 0;
353
354   //
355   fIshunt     =  0;
356   //
357   // Initialise color attributes
358   SetMarkerColor(kYellow);
359
360   //
361   //  Set TPC parameters
362   //
363
364
365   if (!strcmp(title,"Default")) {       
366     fTPCParam = new AliTPCParamSR;
367   } else {
368     cerr<<"AliTPC warning: in Config.C you must set non-default parameters\n";
369     fTPCParam=0;
370   }
371
372 }
373
374 //_____________________________________________________________________________
375 AliTPC::~AliTPC()
376 {
377   //
378   // TPC destructor
379   //
380
381   fIshunt   = 0;
382   delete fHits;
383   delete fDigits;
384   delete fTPCParam;
385   delete fTrackHits; //MI 15.09.2000
386   delete fTrackHitsOld; //MI 10.12.2001
387   if (fNoiseTable) delete [] fNoiseTable;
388
389 }
390
391 //_____________________________________________________________________________
392 void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
393 {
394   //
395   // Add a hit to the list
396   //
397   //  TClonesArray &lhits = *fHits;
398   //  new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
399   if (fHitType&1){
400     TClonesArray &lhits = *fHits;
401     new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
402   }
403   if (fHitType>1)
404    AddHit2(track,vol,hits);
405 }
406
407 void  AliTPC::AddTrackReference(Int_t label, TVirtualMC *vMC){
408   //
409   // add a trackrefernce to the list
410   if (!fTrackReferences) {
411     cerr<<"Container trackrefernce not active\n";
412     return;
413   }
414   Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
415   TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
416   new(lref[nref]) AliTrackReference(label, vMC);
417 }
418  
419 //_____________________________________________________________________________
420 void AliTPC::BuildGeometry()
421 {
422
423   //
424   // Build TPC ROOT TNode geometry for the event display
425   //
426   TNode *nNode, *nTop;
427   TTUBS *tubs;
428   Int_t i;
429   const int kColorTPC=19;
430   char name[5], title[25];
431   const Double_t kDegrad=TMath::Pi()/180;
432   const Double_t kRaddeg=180./TMath::Pi();
433
434
435   Float_t innerOpenAngle = fTPCParam->GetInnerAngle();
436   Float_t outerOpenAngle = fTPCParam->GetOuterAngle();
437
438   Float_t innerAngleShift = fTPCParam->GetInnerAngleShift();
439   Float_t outerAngleShift = fTPCParam->GetOuterAngleShift();
440
441   Int_t nLo = fTPCParam->GetNInnerSector()/2;
442   Int_t nHi = fTPCParam->GetNOuterSector()/2;  
443
444   const Double_t kloAng = (Double_t)TMath::Nint(innerOpenAngle*kRaddeg);
445   const Double_t khiAng = (Double_t)TMath::Nint(outerOpenAngle*kRaddeg);
446   const Double_t kloAngSh = (Double_t)TMath::Nint(innerAngleShift*kRaddeg);
447   const Double_t khiAngSh = (Double_t)TMath::Nint(outerAngleShift*kRaddeg);  
448
449
450   const Double_t kloCorr = 1/TMath::Cos(0.5*kloAng*kDegrad);
451   const Double_t khiCorr = 1/TMath::Cos(0.5*khiAng*kDegrad);
452
453   Double_t rl,ru;
454   
455
456   //
457   // Get ALICE top node
458   //
459
460   nTop=gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
461
462   //  inner sectors
463
464   rl = fTPCParam->GetInnerRadiusLow();
465   ru = fTPCParam->GetInnerRadiusUp();
466  
467
468   for(i=0;i<nLo;i++) {
469     sprintf(name,"LS%2.2d",i);
470     name[4]='\0';
471     sprintf(title,"TPC low sector %3d",i);
472     title[24]='\0';
473     
474     tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*kloCorr,ru*kloCorr,250.,
475                      kloAng*(i-0.5)+kloAngSh,kloAng*(i+0.5)+kloAngSh);
476     tubs->SetNumberOfDivisions(1);
477     nTop->cd();
478     nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
479     nNode->SetLineColor(kColorTPC);
480     fNodes->Add(nNode);
481   }
482
483   // Outer sectors
484
485   rl = fTPCParam->GetOuterRadiusLow();
486   ru = fTPCParam->GetOuterRadiusUp();
487
488   for(i=0;i<nHi;i++) {
489     sprintf(name,"US%2.2d",i);
490     name[4]='\0';
491     sprintf(title,"TPC upper sector %d",i);
492     title[24]='\0';
493     tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*khiCorr,ru*khiCorr,250,
494                      khiAng*(i-0.5)+khiAngSh,khiAng*(i+0.5)+khiAngSh);
495     tubs->SetNumberOfDivisions(1);
496     nTop->cd();
497     nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
498     nNode->SetLineColor(kColorTPC);
499     fNodes->Add(nNode);
500   }
501
502 }    
503
504 //_____________________________________________________________________________
505 Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
506 {
507   //
508   // Calculate distance from TPC to mouse on the display
509   // Dummy procedure
510   //
511   return 9999;
512 }
513
514 void AliTPC::Clusters2Tracks(TFile *of) {
515   //-----------------------------------------------------------------
516   // This is a track finder.
517   //-----------------------------------------------------------------
518   AliTPCtracker tracker(fTPCParam);
519   tracker.Clusters2Tracks(gFile,of);
520 }
521
522 //_____________________________________________________________________________
523 void AliTPC::CreateMaterials()
524 {
525   //-----------------------------------------------
526   // Create Materials for for TPC simulations
527   //-----------------------------------------------
528
529   //-----------------------------------------------------------------
530   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
531   //-----------------------------------------------------------------
532
533   Int_t iSXFLD=gAlice->Field()->Integ();
534   Float_t sXMGMX=gAlice->Field()->Max();
535
536   Float_t amat[5]; // atomic numbers
537   Float_t zmat[5]; // z
538   Float_t wmat[5]; // proportions
539
540   Float_t density;
541   Float_t apure[2];
542
543
544   //***************** Gases *************************
545   
546   //-------------------------------------------------
547   // pure gases
548   //-------------------------------------------------
549
550   // Neon
551
552
553   amat[0]= 20.18;
554   zmat[0]= 10.;  
555   density = 0.0009;
556  
557   apure[0]=amat[0];
558
559   AliMaterial(20,"Ne",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
560
561   // Argon
562
563   amat[0]= 39.948;
564   zmat[0]= 18.;  
565   density = 0.001782;  
566
567   apure[1]=amat[0];
568
569   AliMaterial(21,"Ar",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
570  
571
572   //--------------------------------------------------------------
573   // gases - compounds
574   //--------------------------------------------------------------
575
576   Float_t amol[3];
577
578   // CO2
579
580   amat[0]=12.011;
581   amat[1]=15.9994;
582
583   zmat[0]=6.;
584   zmat[1]=8.;
585
586   wmat[0]=1.;
587   wmat[1]=2.;
588
589   density=0.001977;
590
591   amol[0] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
592
593   AliMixture(10,"CO2",amat,zmat,density,-2,wmat);
594   
595   // CF4
596
597   amat[0]=12.011;
598   amat[1]=18.998;
599
600   zmat[0]=6.;
601   zmat[1]=9.;
602  
603   wmat[0]=1.;
604   wmat[1]=4.;
605  
606   density=0.003034;
607
608   amol[1] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
609
610   AliMixture(11,"CF4",amat,zmat,density,-2,wmat); 
611
612
613   // CH4
614
615   amat[0]=12.011;
616   amat[1]=1.;
617
618   zmat[0]=6.;
619   zmat[1]=1.;
620
621   wmat[0]=1.;
622   wmat[1]=4.;
623
624   density=0.000717;
625
626   amol[2] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
627
628   AliMixture(12,"CH4",amat,zmat,density,-2,wmat);
629
630   //----------------------------------------------------------------
631   // gases - mixtures, ID >= 20 pure gases, <= 10 ID < 20 -compounds
632   //----------------------------------------------------------------
633
634   char namate[21]; 
635   density = 0.;
636   Float_t am=0;
637   Int_t nc;
638   Float_t rho,absl,X0,buf[1];
639   Int_t nbuf;
640   Float_t a,z;
641
642   for(nc = 0;nc<fNoComp;nc++)
643     {
644     
645       // retrive material constants
646       
647       gMC->Gfmate((*fIdmate)[fMixtComp[nc]],namate,a,z,rho,X0,absl,buf,nbuf);
648
649       amat[nc] = a;
650       zmat[nc] = z;
651
652       Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
653  
654       am += fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? apure[nnc] : amol[nnc]); 
655       density += fMixtProp[nc]*rho;  // density of the mixture
656       
657     }
658
659   // mixture proportions by weight!
660
661   for(nc = 0;nc<fNoComp;nc++)
662     {
663
664       Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
665
666       wmat[nc] = fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? 
667                  apure[nnc] : amol[nnc])/am;
668
669     } 
670
671   // Drift gases 1 - nonsensitive, 2 - sensitive
672
673   AliMixture(31,"Drift gas 1",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
674   AliMixture(32,"Drift gas 2",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
675
676
677   // Air
678
679   amat[0] = 14.61;
680   zmat[0] = 7.3;
681   density = 0.001205;
682
683   AliMaterial(24,"Air",amat[0],zmat[0],density,999.,999.); 
684
685
686   //----------------------------------------------------------------------
687   //               solid materials
688   //----------------------------------------------------------------------
689
690
691   // Kevlar C14H22O2N2
692
693   amat[0] = 12.011;
694   amat[1] = 1.;
695   amat[2] = 15.999;
696   amat[3] = 14.006;
697
698   zmat[0] = 6.;
699   zmat[1] = 1.;
700   zmat[2] = 8.;
701   zmat[3] = 7.;
702
703   wmat[0] = 14.;
704   wmat[1] = 22.;
705   wmat[2] = 2.;
706   wmat[3] = 2.;
707
708   density = 1.45;
709
710   AliMixture(34,"Kevlar",amat,zmat,density,-4,wmat);  
711
712   // NOMEX
713
714   amat[0] = 12.011;
715   amat[1] = 1.;
716   amat[2] = 15.999;
717   amat[3] = 14.006;
718
719   zmat[0] = 6.;
720   zmat[1] = 1.;
721   zmat[2] = 8.;
722   zmat[3] = 7.;
723
724   wmat[0] = 14.;
725   wmat[1] = 22.;
726   wmat[2] = 2.;
727   wmat[3] = 2.;
728
729   density = 0.03;
730
731   
732   AliMixture(35,"NOMEX",amat,zmat,density,-4,wmat);
733
734   // Makrolon C16H18O3
735
736   amat[0] = 12.011;
737   amat[1] = 1.;
738   amat[2] = 15.999;
739
740   zmat[0] = 6.;
741   zmat[1] = 1.;
742   zmat[2] = 8.;
743
744   wmat[0] = 16.;
745   wmat[1] = 18.;
746   wmat[2] = 3.;
747   
748   density = 1.2;
749
750   AliMixture(36,"Makrolon",amat,zmat,density,-3,wmat);
751   
752   // Mylar C5H4O2
753
754   amat[0]=12.011;
755   amat[1]=1.;
756   amat[2]=15.9994;
757
758   zmat[0]=6.;
759   zmat[1]=1.;
760   zmat[2]=8.;
761
762   wmat[0]=5.;
763   wmat[1]=4.;
764   wmat[2]=2.; 
765
766   density = 1.39;
767   
768   AliMixture(37, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat); 
769
770   // SiO2 - used later for the glass fiber
771
772   amat[0]=28.086;
773   amat[1]=15.9994;
774
775   zmat[0]=14.;
776   zmat[1]=8.;
777
778   wmat[0]=1.;
779   wmat[1]=2.;
780
781
782   AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz (rho=2.2)
783
784   // Al
785
786   amat[0] = 26.98;
787   zmat[0] = 13.;
788
789   density = 2.7;
790
791   AliMaterial(40,"Al",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
792
793   // Si
794
795   amat[0] = 28.086;
796   zmat[0] = 14.;
797
798   density = 2.33;
799
800   AliMaterial(41,"Si",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
801
802   // Cu
803
804   amat[0] = 63.546;
805   zmat[0] = 29.;
806
807   density = 8.96;
808
809   AliMaterial(42,"Cu",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
810
811   // Tedlar C2H3F
812
813   amat[0] = 12.011;
814   amat[1] = 1.;
815   amat[2] = 18.998;
816
817   zmat[0] = 6.;
818   zmat[1] = 1.;
819   zmat[2] = 9.;
820
821   wmat[0] = 2.;
822   wmat[1] = 3.; 
823   wmat[2] = 1.;
824
825   density = 1.71;
826
827   AliMixture(43, "Tedlar",amat,zmat,density,-3,wmat);  
828
829
830   // Plexiglas  C5H8O2
831
832   amat[0]=12.011;
833   amat[1]=1.;
834   amat[2]=15.9994;
835
836   zmat[0]=6.;
837   zmat[1]=1.;
838   zmat[2]=8.;
839
840   wmat[0]=5.;
841   wmat[1]=8.;
842   wmat[2]=2.;
843
844   density=1.18;
845
846   AliMixture(44,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
847
848   // Epoxy - C14 H20 O3
849
850   
851   amat[0]=12.011;
852   amat[1]=1.;
853   amat[2]=15.9994;
854
855   zmat[0]=6.;
856   zmat[1]=1.;
857   zmat[2]=8.;
858
859   wmat[0]=14.;
860   wmat[1]=20.;
861   wmat[2]=3.;
862
863   density=1.25;
864
865   AliMixture(45,"Epoxy",amat,zmat,density,-3,wmat);
866
867   // Carbon
868
869   amat[0]=12.011;
870   zmat[0]=6.;
871   density= 2.265;
872
873   AliMaterial(46,"C",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
874
875   // get epoxy
876
877   gMC->Gfmate((*fIdmate)[45],namate,amat[1],zmat[1],rho,X0,absl,buf,nbuf);
878
879   // Carbon fiber
880
881   wmat[0]=0.644; // by weight!
882   wmat[1]=0.356;
883
884   density=0.5*(1.25+2.265);
885
886   AliMixture(47,"Cfiber",amat,zmat,density,2,wmat);
887
888   // get SiO2
889
890   gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,X0,absl,buf,nbuf); 
891
892   wmat[0]=0.725; // by weight!
893   wmat[1]=0.275;
894
895   density=1.7;
896
897   AliMixture(39,"G10",amat,zmat,density,2,wmat);
898
899  
900
901
902   //----------------------------------------------------------
903   // tracking media for gases
904   //----------------------------------------------------------
905
906   AliMedium(0, "Air", 24, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .01, .1);
907   AliMedium(1, "Drift gas 1", 31, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
908   AliMedium(2, "Drift gas 2", 32, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
909   AliMedium(3,"CO2",10,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001); 
910
911   //-----------------------------------------------------------  
912   // tracking media for solids
913   //-----------------------------------------------------------
914   
915   AliMedium(4,"Al",40,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
916   AliMedium(5,"Kevlar",34,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
917   AliMedium(6,"Nomex",35,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
918   AliMedium(7,"Makrolon",36,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
919   AliMedium(8,"Mylar",37,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
920   AliMedium(9,"Tedlar",43,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
921   AliMedium(10,"Cu",42,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
922   AliMedium(11,"Si",41,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
923   AliMedium(12,"G10",39,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
924   AliMedium(13,"Plexiglas",44,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
925   AliMedium(14,"Epoxy",45,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
926   AliMedium(15,"Cfiber",47,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
927     
928 }
929
930 void AliTPC::GenerNoise(Int_t tablesize)
931 {
932   //
933   //Generate table with noise
934   //
935   if (fTPCParam==0) {
936     // error message
937     fNoiseDepth=0;
938     return;
939   }
940   if (fNoiseTable)  delete[] fNoiseTable;
941   fNoiseTable = new Float_t[tablesize];
942   fNoiseDepth = tablesize; 
943   fCurrentNoise =0; //!index of the noise in  the noise table 
944   
945   Float_t norm = fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac();
946   for (Int_t i=0;i<tablesize;i++) fNoiseTable[i]= gRandom->Gaus(0,norm);      
947 }
948
949 Float_t AliTPC::GetNoise()
950 {
951   // get noise from table
952   //  if ((fCurrentNoise%10)==0) 
953   //  fCurrentNoise= gRandom->Rndm()*fNoiseDepth;
954   if (fCurrentNoise>=fNoiseDepth) fCurrentNoise=0;
955   return fNoiseTable[fCurrentNoise++];
956   //gRandom->Gaus(0, fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
957 }
958
959
960 Bool_t  AliTPC::IsSectorActive(Int_t sec)
961 {
962   //
963   // check if the sector is active
964   if (!fActiveSectors) return kTRUE;
965   else return fActiveSectors[sec]; 
966 }
967
968 void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t * sectors, Int_t n)
969 {
970   // activate interesting sectors
971   if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
972   fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
973   for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
974   for (Int_t i=0;i<n;i++) 
975     if ((sectors[i]>=0) && sectors[i]<fTPCParam->GetNSector())  fActiveSectors[sectors[i]]=kTRUE;
976     
977 }
978
979 void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
980 {
981   //
982   // activate sectors which were hitted by tracks 
983   //loop over tracks
984   if (fHitType==0) return;  // if Clones hit - not short volume ID information
985   if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
986   fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
987   if (flag) {
988     for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kTRUE;
989     return;
990   }
991   for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
992   TBranch * branch=0;
993   if (fHitType>1) branch = gAlice->TreeH()->GetBranch("TPC2");
994   else branch = gAlice->TreeH()->GetBranch("TPC");
995   Stat_t ntracks = gAlice->TreeH()->GetEntries();
996   // loop over all hits
997   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
998     ResetHits();
999     //
1000     if (fTrackHits && fHitType&4) {
1001       TBranch * br1 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
1002       TBranch * br2 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
1003       br1->GetEvent(track);
1004       br2->GetEvent(track);
1005       Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
1006       for (Int_t j=0;j<fTrackHits->GetNVolumes(); j++)
1007         fActiveSectors[volumes[j]]=kTRUE;
1008     }
1009     
1010     //
1011     if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
1012       TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
1013       br->GetEvent(track);
1014       AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
1015       for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
1016         fActiveSectors[((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID] =kTRUE;
1017       } 
1018     }    
1019   }
1020   
1021 }  
1022
1023
1024
1025
1026 void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of, Int_t eventnumber)
1027 {
1028   //-----------------------------------------------------------------
1029   // This is a simple cluster finder.
1030   //-----------------------------------------------------------------
1031   AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of,eventnumber);
1032 }
1033
1034 extern Double_t SigmaY2(Double_t, Double_t, Double_t);
1035 extern Double_t SigmaZ2(Double_t, Double_t);
1036 //_____________________________________________________________________________
1037 void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of, Int_t eventn)
1038 {
1039   //--------------------------------------------------------
1040   // TPC simple cluster generator from hits
1041   // obtained from the TPC Fast Simulator
1042   // The point errors are taken from the parametrization
1043   //--------------------------------------------------------
1044
1045   //-----------------------------------------------------------------
1046   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1047   //-----------------------------------------------------------------
1048   // Adopted to Marian's cluster data structure by I.Belikov, CERN,
1049   // Jouri.Belikov@cern.ch
1050   //----------------------------------------------------------------
1051   
1052   /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1053   //
1054   //---------------------------------------------------------------------
1055   //   ALICE TPC Cluster Parameters
1056   //--------------------------------------------------------------------
1057        
1058   
1059
1060   // Cluster width in rphi
1061   const Float_t kACrphi=0.18322;
1062   const Float_t kBCrphi=0.59551e-3;
1063   const Float_t kCCrphi=0.60952e-1;
1064   // Cluster width in z
1065   const Float_t kACz=0.19081;
1066   const Float_t kBCz=0.55938e-3;
1067   const Float_t kCCz=0.30428;
1068
1069   TDirectory *savedir=gDirectory; 
1070
1071   if (!of->IsOpen()) {
1072      cerr<<"AliTPC::Hits2Clusters(): output file not open !\n";
1073      return;
1074   }
1075
1076   //if(fDefaults == 0) SetDefaults();
1077
1078   Float_t sigmaRphi,sigmaZ,clRphi,clZ;
1079   //
1080   TParticle *particle; // pointer to a given particle
1081   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
1082   Int_t sector;
1083   Int_t ipart;
1084   Float_t xyz[5];
1085   Float_t pl,pt,tanth,rpad,ratio;
1086   Float_t cph,sph;
1087   
1088   //---------------------------------------------------------------
1089   //  Get the access to the tracks 
1090   //---------------------------------------------------------------
1091   
1092   TTree *tH = gAlice->TreeH();
1093   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
1094
1095   //Switch to the output file
1096   of->cd();
1097
1098   char   cname[100];
1099
1100   sprintf(cname,"TreeC_TPC_%d",eventn);
1101
1102   fTPCParam->Write(fTPCParam->GetTitle());
1103   AliTPCClustersArray carray;
1104   carray.Setup(fTPCParam);
1105   carray.SetClusterType("AliTPCcluster");
1106   carray.MakeTree();
1107
1108   Int_t nclusters=0; //cluster counter
1109   
1110   //------------------------------------------------------------
1111   // Loop over all sectors (72 sectors for 20 deg
1112   // segmentation for both lower and upper sectors)
1113   // Sectors 0-35 are lower sectors, 0-17 z>0, 17-35 z<0
1114   // Sectors 36-71 are upper sectors, 36-53 z>0, 54-71 z<0
1115   //
1116   // First cluster for sector 0 starts at "0"
1117   //------------------------------------------------------------
1118    
1119   for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++){
1120     //MI change
1121     fTPCParam->AdjustCosSin(isec,cph,sph);
1122     
1123     //------------------------------------------------------------
1124     // Loop over tracks
1125     //------------------------------------------------------------
1126     
1127     for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
1128       ResetHits();
1129       tH->GetEvent(track);
1130       //
1131       //  Get number of the TPC hits
1132       //     
1133        tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
1134
1135       // Loop over hits
1136       //
1137        while(tpcHit){
1138  
1139          if (tpcHit->fQ == 0.) {
1140            tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
1141            continue; //information about track (I.Belikov)
1142          }
1143         sector=tpcHit->fSector; // sector number
1144
1145        if(sector != isec){
1146          tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
1147          continue; 
1148        }
1149         ipart=tpcHit->Track();
1150         particle=gAlice->Particle(ipart);
1151         pl=particle->Pz();
1152         pt=particle->Pt();
1153         if(pt < 1.e-9) pt=1.e-9;
1154         tanth=pl/pt;
1155         tanth = TMath::Abs(tanth);
1156         rpad=TMath::Sqrt(tpcHit->X()*tpcHit->X() + tpcHit->Y()*tpcHit->Y());
1157         ratio=0.001*rpad/pt; // pt must be in MeV/c - historical reason
1158
1159         //   space-point resolutions
1160         
1161         sigmaRphi=SigmaY2(rpad,tanth,pt);
1162         sigmaZ   =SigmaZ2(rpad,tanth   );
1163         
1164         //   cluster widths
1165         
1166         clRphi=kACrphi-kBCrphi*rpad*tanth+kCCrphi*ratio*ratio;
1167         clZ=kACz-kBCz*rpad*tanth+kCCz*tanth*tanth;
1168         
1169         // temporary protection
1170         
1171         if(sigmaRphi < 0.) sigmaRphi=0.4e-3;
1172         if(sigmaZ < 0.) sigmaZ=0.4e-3;
1173         if(clRphi < 0.) clRphi=2.5e-3;
1174         if(clZ < 0.) clZ=2.5e-5;
1175         
1176         //
1177         
1178         //
1179         // smearing --> rotate to the 1 (13) or to the 25 (49) sector,
1180         // then the inaccuracy in a X-Y plane is only along Y (pad row)!
1181         //
1182         Float_t xprim= tpcHit->X()*cph + tpcHit->Y()*sph;
1183         Float_t yprim=-tpcHit->X()*sph + tpcHit->Y()*cph;
1184         xyz[0]=gRandom->Gaus(yprim,TMath::Sqrt(sigmaRphi));   // y
1185           Float_t alpha=(isec < fTPCParam->GetNInnerSector()) ?
1186           fTPCParam->GetInnerAngle() : fTPCParam->GetOuterAngle();
1187           Float_t ymax=xprim*TMath::Tan(0.5*alpha);
1188           if (TMath::Abs(xyz[0])>ymax) xyz[0]=yprim; 
1189         xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->Z(),TMath::Sqrt(sigmaZ)); // z
1190           if (TMath::Abs(xyz[1])>fTPCParam->GetZLength()) xyz[1]=tpcHit->Z(); 
1191         xyz[2]=sigmaRphi;                                     // fSigmaY2
1192         xyz[3]=sigmaZ;                                        // fSigmaZ2
1193         xyz[4]=tpcHit->fQ;                                    // q
1194
1195         AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(sector,tpcHit->fPadRow);
1196         if (!clrow) clrow=carray.CreateRow(sector,tpcHit->fPadRow);     
1197
1198         Int_t tracks[3]={tpcHit->Track(), -1, -1};
1199         AliTPCcluster cluster(tracks,xyz);
1200
1201         clrow->InsertCluster(&cluster); nclusters++;
1202
1203         tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
1204         
1205
1206       } // end of loop over hits
1207
1208     }   // end of loop over tracks
1209
1210     Int_t nrows=fTPCParam->GetNRow(isec);
1211     for (Int_t irow=0; irow<nrows; irow++) {
1212         AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(isec,irow);
1213         if (!clrow) continue;
1214         carray.StoreRow(isec,irow);
1215         carray.ClearRow(isec,irow);
1216     }
1217
1218   } // end of loop over sectors  
1219
1220   cerr<<"Number of made clusters : "<<nclusters<<"                        \n";
1221   carray.GetTree()->SetName(cname);
1222   carray.GetTree()->Write();
1223
1224   savedir->cd(); //switch back to the input file
1225   
1226 } // end of function
1227
1228 //_________________________________________________________________
1229 void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
1230 {
1231   //--------------------------------------------------------
1232   //calculate exact cross point of track and given pad row
1233   //resulting values are expressed in "digit" coordinata
1234   //--------------------------------------------------------
1235
1236   //-----------------------------------------------------------------
1237   // Origin: Marian Ivanov  GSI Darmstadt, m.ivanov@gsi.de
1238   //-----------------------------------------------------------------
1239   //
1240   if (fClustersArray==0){    
1241     return;
1242   }
1243   //
1244   TParticle *particle; // pointer to a given particle
1245   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
1246   //  Int_t sector,nhits;
1247   Int_t ipart;
1248   const Int_t kcmaxhits=30000;
1249   AliTPCFastVector * xxxx = new AliTPCFastVector(kcmaxhits*4);
1250   AliTPCFastVector & xxx = *xxxx;
1251   Int_t maxhits = kcmaxhits;
1252   //construct array for each padrow
1253   for (Int_t i=0; i<fTPCParam->GetNRow(isec);i++) 
1254     fClustersArray->CreateRow(isec,i);
1255   
1256   //---------------------------------------------------------------
1257   //  Get the access to the tracks 
1258   //---------------------------------------------------------------
1259   
1260   TTree *tH = gAlice->TreeH();
1261   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
1262   Int_t npart = gAlice->GetNtrack();
1263   //MI change
1264   TBranch * branch=0;
1265   if (fHitType>1) branch = tH->GetBranch("TPC2");
1266   else branch = tH->GetBranch("TPC");
1267
1268   //------------------------------------------------------------
1269   // Loop over tracks
1270   //------------------------------------------------------------
1271
1272   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){ 
1273     Bool_t isInSector=kTRUE;
1274     ResetHits();
1275      isInSector = TrackInVolume(isec,track);
1276     if (!isInSector) continue;
1277     //MI change
1278     branch->GetEntry(track); // get next track
1279     //
1280     //  Get number of the TPC hits and a pointer
1281     //  to the particles
1282     // Loop over hits
1283     //
1284     Int_t currentIndex=0;
1285     Int_t lastrow=-1;  //last writen row
1286
1287     //M.I. changes
1288
1289     tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
1290     while(tpcHit){
1291       
1292       Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
1293       if(sector != isec){
1294         tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
1295         continue; 
1296       }
1297
1298       ipart=tpcHit->Track();
1299       if (ipart<npart) particle=gAlice->Particle(ipart);
1300       
1301       //find row number
1302
1303       Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
1304       Int_t    index[3]={1,isec,0};
1305       Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;     
1306       if (currentrow<0) {tpcHit = (AliTPChit*)NextHit(); continue;}
1307       if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
1308       if (currentrow==lastrow){
1309         if ( currentIndex>=maxhits){
1310           maxhits+=kcmaxhits;
1311           xxx.ResizeTo(4*maxhits);
1312         }     
1313         xxx(currentIndex*4)=x[0];
1314         xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
1315         xxx(currentIndex*4+2)=x[2];     
1316         xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
1317         currentIndex++; 
1318       }
1319       else 
1320         if (currentIndex>2){
1321           Float_t sumx=0;
1322           Float_t sumx2=0;
1323           Float_t sumx3=0;
1324           Float_t sumx4=0;
1325           Float_t sumy=0;
1326           Float_t sumxy=0;
1327           Float_t sumx2y=0;
1328           Float_t sumz=0;
1329           Float_t sumxz=0;
1330           Float_t sumx2z=0;
1331           Float_t sumq=0;
1332           for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
1333             Float_t x,x2,x3,x4;
1334             x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
1335             x2*=x;
1336             x3*=x2;
1337             x4*=x3;
1338             sumx+=x;
1339             sumx2+=x2;
1340             sumx3+=x3;
1341             sumx4+=x4;
1342             sumy+=xxx(index*4+1);
1343             sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
1344             sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
1345             sumz+=xxx(index*4+2);
1346             sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
1347             sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;   
1348             sumq+=xxx(index*4+3);
1349           }
1350           Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(isec,lastrow)-1)/2;
1351           Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
1352             sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
1353           
1354           Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
1355             sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
1356           Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
1357             sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
1358           
1359           Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
1360             sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
1361           Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
1362             sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
1363           
1364           if (TMath::Abs(det)<0.00001){
1365              tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
1366             continue;
1367           }
1368         
1369           Float_t y=detay/det+centralPad;
1370           Float_t z=detaz/det;  
1371           Float_t by=detby/det; //y angle
1372           Float_t bz=detbz/det; //z angle
1373           sumy/=Float_t(currentIndex);
1374           sumz/=Float_t(currentIndex);
1375
1376           AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(isec,lastrow));
1377           if (row!=0) {
1378             AliComplexCluster* cl = new((AliComplexCluster*)row->Append()) AliComplexCluster ;
1379             //    AliComplexCluster cl;
1380             cl->fX=z;
1381             cl->fY=y;
1382             cl->fQ=sumq;
1383             cl->fSigmaX2=bz;
1384             cl->fSigmaY2=by;
1385             cl->fTracks[0]=ipart;
1386           }
1387           currentIndex=0;
1388           lastrow=currentrow;
1389         } //end of calculating cluster for given row
1390         
1391         
1392       tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
1393     } // end of loop over hits
1394   }   // end of loop over tracks 
1395   //write padrows to tree 
1396   for (Int_t ii=0; ii<fTPCParam->GetNRow(isec);ii++) {
1397     fClustersArray->StoreRow(isec,ii);    
1398     fClustersArray->ClearRow(isec,ii);        
1399   }
1400   xxxx->Delete();
1401  
1402 }
1403
1404
1405
1406 //__
1407 void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t eventnumber)  
1408 {
1409   //create digits from summable digits
1410   GenerNoise(500000); //create teble with noise
1411   char  sname[100];
1412   char  dname[100];
1413   sprintf(sname,"TreeS_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
1414   sprintf(dname,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
1415
1416   //conect tree with sSDigits
1417   TTree *t;
1418   if (gAlice->GetTreeDFile()) {
1419     t = (TTree *)gAlice->GetTreeDFile()->Get(sname); 
1420   } else {
1421     t = (TTree *)gDirectory->Get(sname); 
1422   }
1423   if (!t) {
1424     cerr<<"TPC tree with sdigits not found"<<endl;
1425     return;
1426   }
1427   AliSimDigits digarr, *dummy=&digarr;
1428   t->GetBranch("Segment")->SetAddress(&dummy);
1429   Stat_t nentries = t->GetEntries();
1430
1431   // set zero suppression
1432
1433   fTPCParam->SetZeroSup(2);
1434
1435   // get zero suppression
1436
1437   Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
1438
1439   //make tree with digits 
1440   
1441   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
1442   arr->SetClass("AliSimDigits");
1443   arr->Setup(fTPCParam);
1444 // Note that methods arr->MakeTree have different signatures
1445   if (gAlice->GetTreeDFile()) {
1446     arr->MakeTree(gAlice->GetTreeDFile());
1447   } else {
1448     arr->MakeTree(fDigitsFile);
1449   }
1450   
1451   AliTPCParam * par =fTPCParam;
1452
1453   //Loop over segments of the TPC
1454
1455   for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
1456     t->GetEvent(n);
1457     Int_t sec, row;
1458     if (!par->AdjustSectorRow(digarr.GetID(),sec,row)) {
1459       cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr.GetID()<<endl;
1460       continue;
1461     }
1462     if (!IsSectorActive(sec)) continue;
1463     AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
1464     Int_t nrows = digrow->GetNRows();
1465     Int_t ncols = digrow->GetNCols();
1466
1467     digrow->ExpandBuffer();
1468     digarr.ExpandBuffer();
1469     digrow->ExpandTrackBuffer();
1470     digarr.ExpandTrackBuffer();
1471
1472     
1473     Short_t * pamp0 = digarr.GetDigits();
1474     Int_t   * ptracks0 = digarr.GetTracks();
1475     Short_t * pamp1 = digrow->GetDigits();
1476     Int_t   * ptracks1 = digrow->GetTracks();
1477     Int_t  nelems =nrows*ncols;
1478     Int_t saturation = fTPCParam->GetADCSat();
1479     //use internal structure of the AliDigits - for speed reason
1480     //if you cahnge implementation
1481     //of the Alidigits - it must be rewriten -
1482     for (Int_t i= 0; i<nelems; i++){
1483       //      Float_t q = *pamp0;
1484       //q/=16.;  //conversion faktor
1485       //Float_t noise= GetNoise(); 
1486       //q+=noise;      
1487       //q= TMath::Nint(q);
1488       Float_t q = TMath::Nint(Float_t(*pamp0)/16.+GetNoise());
1489       if (q>zerosup){
1490         if (q>saturation) q=saturation;      
1491         *pamp1=(Short_t)q;
1492         //if (ptracks0[0]==0)
1493         //  ptracks1[0]=1;
1494         //else
1495         ptracks1[0]=ptracks0[0];        
1496         ptracks1[nelems]=ptracks0[nelems];
1497         ptracks1[2*nelems]=ptracks0[2*nelems];
1498       }
1499       pamp0++;
1500       pamp1++;
1501       ptracks0++;
1502       ptracks1++;        
1503     }
1504
1505     arr->StoreRow(sec,row);
1506     arr->ClearRow(sec,row);   
1507     // cerr<<sec<<"\t"<<row<<"\n";   
1508   }  
1509
1510     
1511   //write results
1512
1513   
1514   arr->GetTree()->SetName(dname);  
1515   arr->GetTree()->AutoSave();  
1516   delete arr;
1517 }
1518 //_________________________________________
1519 void AliTPC::Merge(TTree * intree, Int_t *mask, Int_t nin, Int_t outid)
1520 {
1521   
1522   //intree - pointer to array of trees with s digits
1523   //mask   - mask for each 
1524   //nin    - number of inputs
1525   //outid  - event  number of the output event
1526
1527   //create digits from summable digits 
1528   //conect tree with sSDigits
1529
1530     
1531   AliSimDigits ** digarr = new AliSimDigits*[nin];
1532   for (Int_t i1=0;i1<nin; i1++){
1533     digarr[i1]=0;
1534     intree[i1].GetBranch("Segment")->SetAddress(&digarr[i1]);
1535   }
1536   Stat_t nentries = intree[0].GetEntries();
1537   
1538   //make tree with digits   
1539   char  dname[100];
1540   sprintf(dname,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),outid);
1541   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
1542   arr->SetClass("AliSimDigits");
1543   arr->Setup(fTPCParam);
1544   arr->MakeTree(fDigitsFile);  
1545
1546   // set zero suppression
1547
1548   fTPCParam->SetZeroSup(2);
1549
1550   // get zero suppression
1551
1552   Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
1553
1554
1555   AliTPCParam * par =fTPCParam;
1556
1557   //Loop over segments of the TPC
1558   for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
1559     
1560     for (Int_t i=0;i<nin; i++){ 
1561       //connect proper digits
1562       intree[i].GetEvent(n);      
1563       digarr[i]->ExpandBuffer();
1564       digarr[i]->ExpandTrackBuffer();
1565     }      
1566     Int_t sec, row;
1567     if (!par->AdjustSectorRow(digarr[0]->GetID(),sec,row)) {
1568       cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr[0]->GetID()<<endl;
1569       continue;
1570     }
1571
1572     AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
1573     Int_t nrows = digrow->GetNRows();
1574     Int_t ncols = digrow->GetNCols();
1575
1576     digrow->ExpandBuffer();
1577     digrow->ExpandTrackBuffer();
1578    
1579     for (Int_t rows=0;rows<nrows; rows++){
1580       for (Int_t col=0;col<ncols; col++){
1581         Float_t q=0;
1582         Int_t label[1000]; // i hope no more than 300 events merged
1583         Int_t labptr = 0;
1584         // looop over digits
1585         for (Int_t i=0;i<nin; i++){ 
1586           q  += digarr[i]->GetDigitFast(rows,col);
1587           for (Int_t tr=0;tr<3;tr++) {
1588             Int_t lab = digarr[i]->GetTrackIDFast(rows,col,tr);
1589             if ( lab > 1) {
1590               label[labptr]=lab+mask[i]-2;
1591               labptr++;
1592             }
1593           }
1594         }
1595         //add noise
1596         q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()*16); 
1597         
1598         q/=16;  //conversion faktor
1599         q=(Short_t)q;
1600
1601         if (q> zerosup){
1602
1603           if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();
1604           digrow->SetDigitFast((Short_t)q,rows,col);  
1605           for (Int_t tr=0;tr<3;tr++){
1606             if (tr<labptr)
1607               ((AliSimDigits*)digrow)->SetTrackIDFast(label[tr],rows,col,tr);
1608             else
1609               ((AliSimDigits*)digrow)->SetTrackIDFast(-1,rows,col,tr);
1610           }
1611         }
1612       } 
1613      }         
1614       arr->StoreRow(sec,row);
1615
1616       arr->ClearRow(sec,row);   
1617  
1618   }  
1619   
1620   delete digarr;
1621   arr->GetTree()->SetName(dname); 
1622   arr->GetTree()->Write(); 
1623  
1624   delete arr;  
1625   
1626 }
1627
1628 /*_________________________________________
1629 void AliTPC::SDigits2Digits(Int_t eventnumber)
1630 {
1631
1632
1633   cerr<<"Digitizing TPC...\n";
1634
1635   Hits2Digits(eventnumber);
1636    
1637     
1638   //write results
1639
1640   //  char treeName[100];
1641
1642   //  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
1643   
1644   //  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(treeName);  
1645 }
1646 */
1647 //__________________________________________________________________
1648 void AliTPC::SetDefaults(){
1649
1650    
1651    cerr<<"Setting default parameters...\n";
1652
1653   // Set response functions
1654
1655   AliTPCParamSR *param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60");
1656   if(param){
1657     printf("You are using 2 pad-length geom hits with 3 pad-lenght geom digits...\n");
1658     delete param;
1659     param = new AliTPCParamSR();
1660   }
1661   else {
1662     param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60");
1663   }
1664   if(!param){
1665     printf("No TPC parameters found\n");
1666     exit(4);
1667   }
1668
1669
1670   AliTPCPRF2D    * prfinner   = new AliTPCPRF2D;
1671   AliTPCPRF2D    * prfouter1   = new AliTPCPRF2D;
1672   AliTPCPRF2D    * prfouter2   = new AliTPCPRF2D;  
1673   AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE);
1674   rf->SetGauss(param->GetZSigma(),param->GetZWidth(),1.);
1675   rf->SetOffset(3*param->GetZSigma());
1676   rf->Update();
1677   
1678   TDirectory *savedir=gDirectory;
1679   TFile *f=TFile::Open("$ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root");
1680   if (!f->IsOpen()) { 
1681     cerr<<"Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !\n" ;
1682      exit(3);
1683   }
1684   prfinner->Read("prf_07504_Gati_056068_d02");
1685   prfouter1->Read("prf_10006_Gati_047051_d03");
1686   prfouter2->Read("prf_15006_Gati_047051_d03");  
1687   f->Close();
1688   savedir->cd();
1689
1690   param->SetInnerPRF(prfinner);
1691   param->SetOuter1PRF(prfouter1); 
1692   param->SetOuter2PRF(prfouter2);
1693   param->SetTimeRF(rf);
1694
1695   // set fTPCParam
1696
1697   SetParam(param);
1698
1699
1700   fDefaults = 1;
1701
1702 }
1703 //__________________________________________________________________  
1704 void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)  
1705
1706  //----------------------------------------------------
1707  // Loop over all sectors for a single event
1708  //----------------------------------------------------
1709
1710
1711   if(fDefaults == 0) SetDefaults();  // check if the parameters are set
1712   GenerNoise(500000); //create teble with noise
1713
1714   //setup TPCDigitsArray 
1715
1716   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
1717
1718   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
1719   arr->SetClass("AliSimDigits");
1720   arr->Setup(fTPCParam);
1721 // Note that methods arr->MakeTree have different signatures
1722   if (gAlice->GetTreeDFile()) {
1723     arr->MakeTree(gAlice->GetTreeDFile());
1724   } else {
1725     arr->MakeTree(fDigitsFile);
1726   }
1727   SetDigitsArray(arr);
1728
1729   fDigitsSwitch=0; // standard digits
1730
1731   cerr<<"Digitizing TPC -- normal digits...\n";
1732
1733   for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec); 
1734    
1735   // write results
1736
1737   char treeName[100];
1738
1739   sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
1740   
1741   GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName);  
1742   GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave();  
1743
1744
1745 }
1746
1747
1748
1749 //__________________________________________________________________
1750 void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)  
1751
1752
1753   //-----------------------------------------------------------
1754   //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
1755   //-----------------------------------------------------------
1756
1757  //----------------------------------------------------
1758  // Loop over all sectors for a single event
1759  //----------------------------------------------------
1760
1761
1762   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
1763   GenerNoise(500000); //create table with noise
1764   //setup TPCDigitsArray 
1765
1766   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
1767
1768   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
1769   arr->SetClass("AliSimDigits");
1770   arr->Setup(fTPCParam);
1771 // Note that methods arr->MakeTree have different signatures
1772   if (gAlice->GetTreeSFile()) {
1773     arr->MakeTree(gAlice->GetTreeSFile());
1774   } else {
1775     arr->MakeTree(fDigitsFile);
1776   }
1777   SetDigitsArray(arr);
1778
1779   cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
1780
1781   fDigitsSwitch=1; // summable digits
1782   
1783     // set zero suppression to "0"
1784
1785   fTPCParam->SetZeroSup(0);
1786
1787  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
1788
1789
1790   // write results
1791
1792   char treeName[100];
1793
1794   sprintf(treeName,"TreeS_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
1795   
1796   GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName); 
1797   GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave(); 
1798
1799 }
1800
1801
1802
1803 //__________________________________________________________________
1804 void AliTPC::Hits2SDigits()  
1805
1806
1807   //-----------------------------------------------------------
1808   //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
1809   //-----------------------------------------------------------
1810
1811  //----------------------------------------------------
1812  // Loop over all sectors for a single event
1813  //----------------------------------------------------
1814   //MI change - for pp run
1815   Int_t eventnumber = gAlice->GetEvNumber();
1816
1817   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
1818   GenerNoise(500000); //create table with noise
1819
1820   //setup TPCDigitsArray 
1821
1822   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
1823
1824   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
1825   arr->SetClass("AliSimDigits");
1826   arr->Setup(fTPCParam);
1827 // Note that methods arr->MakeTree have different signatures
1828   if (gAlice->GetTreeSFile()) {
1829     arr->MakeTree(gAlice->GetTreeSFile());
1830   } else {
1831     arr->MakeTree(fDigitsFile);
1832   }
1833   SetDigitsArray(arr);
1834
1835   cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
1836
1837   //  fDigitsSwitch=1; // summable digits  -for the moment direct
1838
1839   for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
1840
1841
1842   // write results
1843   char treeName[100];
1844
1845   sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
1846   
1847   GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName); 
1848   GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave(); 
1849
1850 }
1851
1852
1853 //_____________________________________________________________________________
1854 void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
1855 {
1856   //-------------------------------------------------------------------
1857   // TPC conversion from hits to digits.
1858   //------------------------------------------------------------------- 
1859
1860   //-----------------------------------------------------------------
1861   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1862   //-----------------------------------------------------------------
1863
1864   //-------------------------------------------------------
1865   //  Get the access to the track hits
1866   //-------------------------------------------------------
1867
1868   // check if the parameters are set - important if one calls this method
1869   // directly, not from the Hits2Digits
1870
1871   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
1872
1873   TTree *tH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
1874   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
1875
1876   if( ntracks > 0){
1877
1878   //------------------------------------------- 
1879   //  Only if there are any tracks...
1880   //-------------------------------------------
1881
1882     TObjArray **row;
1883     
1884     //printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
1885
1886       Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
1887
1888       row= new TObjArray* [nrows+2]; // 2 extra rows for cross talk
1889     
1890       MakeSector(isec,nrows,tH,ntracks,row);
1891
1892       //--------------------------------------------------------
1893       //   Digitize this sector, row by row
1894       //   row[i] is the pointer to the TObjArray of AliTPCFastVectors,
1895       //   each one containing electrons accepted on this
1896       //   row, assigned into tracks
1897       //--------------------------------------------------------
1898
1899       Int_t i;
1900
1901       if (fDigitsArray->GetTree()==0) fDigitsArray->MakeTree(fDigitsFile);
1902
1903       for (i=0;i<nrows;i++){
1904
1905         AliDigits * dig = fDigitsArray->CreateRow(isec,i); 
1906
1907         DigitizeRow(i,isec,row);
1908
1909         fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
1910
1911         Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
1912         if (gDebug > 10) printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);        
1913         
1914         fDigitsArray->ClearRow(isec,i);  
1915
1916    
1917        } // end of the sector digitization
1918
1919       for(i=0;i<nrows+2;i++){
1920         row[i]->Delete();  
1921         delete row[i];   
1922       }
1923       
1924        delete [] row; // delete the array of pointers to TObjArray-s
1925         
1926   } // ntracks >0
1927
1928 } // end of Hits2DigitsSector
1929
1930
1931 //_____________________________________________________________________________
1932 void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
1933 {
1934   //-----------------------------------------------------------
1935   // Single row digitization, coupling from the neighbouring
1936   // rows taken into account
1937   //-----------------------------------------------------------
1938
1939   //-----------------------------------------------------------------
1940   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1941   // Modified: Marian Ivanov GSI Darmstadt, m.ivanov@gsi.de
1942   //-----------------------------------------------------------------
1943  
1944
1945   Float_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
1946   //  Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
1947   fCurrentIndex[1]= isec;
1948   
1949
1950   Int_t nofPads = fTPCParam->GetNPads(isec,irow);
1951   Int_t nofTbins = fTPCParam->GetMaxTBin();
1952   Int_t indexRange[4];
1953   //
1954   //  Integrated signal for this row
1955   //  and a single track signal
1956   //    
1957
1958   AliTPCFastMatrix *m1 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
1959   AliTPCFastMatrix *m2 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
1960   //
1961   AliTPCFastMatrix &total  = *m1;
1962
1963   //  Array of pointers to the label-signal list
1964
1965   Int_t nofDigits = nofPads*nofTbins; // number of digits for this row
1966   Float_t  **pList = new Float_t* [nofDigits]; 
1967
1968   Int_t lp;
1969   Int_t i1;   
1970   for(lp=0;lp<nofDigits;lp++)pList[lp]=0; // set all pointers to NULL
1971   //
1972   //calculate signal 
1973   //
1974   //Int_t row1 = TMath::Max(irow-fTPCParam->GetNCrossRows(),0);
1975   //Int_t row2 = TMath::Min(irow+fTPCParam->GetNCrossRows(),nrows-1);
1976   Int_t row1=irow;
1977   Int_t row2=irow+2; 
1978   for (Int_t row= row1;row<=row2;row++){
1979     Int_t nTracks= rows[row]->GetEntries();
1980     for (i1=0;i1<nTracks;i1++){
1981       fCurrentIndex[2]= row;
1982       fCurrentIndex[3]=irow+1;
1983       if (row==irow+1){
1984         m2->Zero();  // clear single track signal matrix
1985         Float_t trackLabel = GetSignal(rows[row],i1,m2,m1,indexRange); 
1986         GetList(trackLabel,nofPads,m2,indexRange,pList);
1987       }
1988       else   GetSignal(rows[row],i1,0,m1,indexRange);
1989     }
1990   }
1991          
1992   Int_t tracks[3];
1993
1994   AliDigits *dig = fDigitsArray->GetRow(isec,irow);
1995   Int_t gi=-1;
1996   Float_t fzerosup = zerosup+0.5;
1997   for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
1998     Float_t *pq = &(total.UncheckedAt(0,it));
1999     for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
2000       gi++;
2001       Float_t q=*pq;      
2002       pq++;
2003       if(fDigitsSwitch == 0){
2004         q+=GetNoise();
2005         if(q <=fzerosup) continue; // do not fill zeros
2006         q = TMath::Nint(q);
2007         if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
2008
2009       }
2010
2011       else {
2012        if(q <= 0.) continue; // do not fill zeros
2013        if(q>2000.) q=2000.;
2014        q *= 16.;
2015        q = TMath::Nint(q);
2016       }
2017
2018       //
2019       //  "real" signal or electronic noise (list = -1)?
2020       //    
2021
2022       for(Int_t j1=0;j1<3;j1++){
2023         tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -2;
2024       }
2025
2026 //Begin_Html
2027 /*
2028   <A NAME="AliDigits"></A>
2029   using of AliDigits object
2030 */
2031 //End_Html
2032       dig->SetDigitFast((Short_t)q,it,ip);
2033       if (fDigitsArray->IsSimulated())
2034         {
2035          ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[0],it,ip,0);
2036          ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[1],it,ip,1);
2037          ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[2],it,ip,2);
2038         }
2039      
2040     
2041     } // end of loop over time buckets
2042   }  // end of lop over pads 
2043
2044   //
2045   //  This row has been digitized, delete nonused stuff
2046   //
2047
2048   for(lp=0;lp<nofDigits;lp++){
2049     if(pList[lp]) delete [] pList[lp];
2050   }
2051   
2052   delete [] pList;
2053
2054   delete m1;
2055   delete m2;
2056   //  delete m3;
2057
2058 } // end of DigitizeRow
2059
2060 //_____________________________________________________________________________
2061
2062 Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, 
2063              AliTPCFastMatrix *m1, AliTPCFastMatrix *m2,Int_t *indexRange)
2064 {
2065
2066   //---------------------------------------------------------------
2067   //  Calculates 2-D signal (pad,time) for a single track,
2068   //  returns a pointer to the signal matrix and the track label 
2069   //  No digitization is performed at this level!!!
2070   //---------------------------------------------------------------
2071
2072   //-----------------------------------------------------------------
2073   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
2074   // Modified: Marian Ivanov 
2075   //-----------------------------------------------------------------
2076
2077   AliTPCFastVector *tv;
2078
2079   tv = (AliTPCFastVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
2080   AliTPCFastVector &v = *tv;
2081   
2082   Float_t label = v(0);
2083   Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]-1)-1)/2;
2084
2085   Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/4;
2086   indexRange[0]=9999; // min pad
2087   indexRange[1]=-1; // max pad
2088   indexRange[2]=9999; //min time
2089   indexRange[3]=-1; // max time
2090
2091   AliTPCFastMatrix &signal = *m1;
2092   AliTPCFastMatrix &total = *m2;
2093   //
2094   //  Loop over all electrons
2095   //
2096   for(Int_t nel=0; nel<nElectrons; nel++){
2097     Int_t idx=nel*4;
2098     Float_t aval =  v(idx+4);
2099     Float_t eltoadcfac=aval*fTPCParam->GetTotalNormFac(); 
2100     Float_t xyz[3]={v(idx+1),v(idx+2),v(idx+3)};
2101     Int_t n = ((AliTPCParamSR*)fTPCParam)->CalcResponseFast(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
2102
2103     Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(0);  
2104     Float_t *weight = & (fTPCParam->GetResWeight(0));
2105
2106     if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){       
2107        Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
2108
2109          if (pad>=0){
2110          Int_t time=index[2];    
2111          Float_t qweight = *(weight)*eltoadcfac;
2112          
2113          if (m1!=0) signal.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
2114          total.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
2115          if (indexRange[0]>pad) indexRange[0]=pad;
2116          if (indexRange[1]<pad) indexRange[1]=pad;
2117          if (indexRange[2]>time) indexRange[2]=time;
2118          if (indexRange[3]<time) indexRange[3]=time;
2119
2120          index+=3;
2121          weight++;      
2122
2123        }         
2124     }
2125   } // end of loop over electrons
2126   
2127   return label; // returns track label when finished
2128 }
2129
2130 //_____________________________________________________________________________
2131 void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,AliTPCFastMatrix *m,
2132                      Int_t *indexRange, Float_t **pList)
2133 {
2134   //----------------------------------------------------------------------
2135   //  Updates the list of tracks contributing to digits for a given row
2136   //----------------------------------------------------------------------
2137
2138   //-----------------------------------------------------------------
2139   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
2140   //-----------------------------------------------------------------
2141
2142   AliTPCFastMatrix &signal = *m;
2143
2144   // lop over nonzero digits
2145
2146   for(Int_t it=indexRange[2];it<indexRange[3]+1;it++){
2147     for(Int_t ip=indexRange[0];ip<indexRange[1]+1;ip++){
2148
2149
2150         // accept only the contribution larger than 500 electrons (1/2 s_noise)
2151
2152         if(signal(ip,it)<0.5) continue; 
2153
2154
2155         Int_t globalIndex = it*np+ip; // globalIndex starts from 0!
2156         
2157         if(!pList[globalIndex]){
2158         
2159           // 
2160           // Create new list (6 elements - 3 signals and 3 labels),
2161           //
2162
2163           pList[globalIndex] = new Float_t [6];
2164
2165           // set list to -1 
2166
2167           *pList[globalIndex] = -1.;
2168           *(pList[globalIndex]+1) = -1.;
2169           *(pList[globalIndex]+2) = -1.;
2170           *(pList[globalIndex]+3) = -1.;
2171           *(pList[globalIndex]+4) = -1.;
2172           *(pList[globalIndex]+5) = -1.;
2173
2174
2175           *pList[globalIndex] = label;
2176           *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
2177         }
2178         else{
2179
2180           // check the signal magnitude
2181
2182           Float_t highest = *(pList[globalIndex]+3);
2183           Float_t middle = *(pList[globalIndex]+4);
2184           Float_t lowest = *(pList[globalIndex]+5);
2185
2186           //
2187           //  compare the new signal with already existing list
2188           //
2189
2190           if(signal(ip,it)<lowest) continue; // neglect this track
2191
2192           //
2193
2194           if (signal(ip,it)>highest){
2195             *(pList[globalIndex]+5) = middle;
2196             *(pList[globalIndex]+4) = highest;
2197             *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
2198
2199             *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
2200             *(pList[globalIndex]+1) = *pList[globalIndex];
2201             *pList[globalIndex] = label;
2202           }
2203           else if (signal(ip,it)>middle){
2204             *(pList[globalIndex]+5) = middle;
2205             *(pList[globalIndex]+4) = signal(ip,it);
2206
2207             *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
2208             *(pList[globalIndex]+1) = label;
2209           }
2210           else{
2211             *(pList[globalIndex]+5) = signal(ip,it);
2212             *(pList[globalIndex]+2) = label;
2213           }
2214         }
2215
2216     } // end of loop over pads
2217   } // end of loop over time bins
2218
2219
2220
2221 }//end of GetList
2222 //___________________________________________________________________
2223 void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
2224                         Stat_t ntracks,TObjArray **row)
2225 {
2226
2227   //-----------------------------------------------------------------
2228   // Prepares the sector digitization, creates the vectors of
2229   // tracks for each row of this sector. The track vector
2230   // contains the track label and the position of electrons.
2231   //-----------------------------------------------------------------
2232
2233   //-----------------------------------------------------------------
2234   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
2235   //-----------------------------------------------------------------
2236
2237   Float_t gasgain = fTPCParam->GetGasGain();
2238   Int_t i;
2239   Float_t xyz[4]; 
2240
2241   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit    
2242   //MI change
2243   TBranch * branch=0;
2244   if (fHitType>1) branch = TH->GetBranch("TPC2");
2245   else branch = TH->GetBranch("TPC");
2246
2247  
2248   //----------------------------------------------
2249   // Create TObjArray-s, one for each row,
2250   // each TObjArray will store the AliTPCFastVectors
2251   // of electrons, one AliTPCFastVectors per each track.
2252   //---------------------------------------------- 
2253     
2254   Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows+2]; // electron counter for each row
2255   AliTPCFastVector **tracks = new AliTPCFastVector* [nrows+2]; //pointers to the track vectors
2256
2257   for(i=0; i<nrows+2; i++){
2258     row[i] = new TObjArray;
2259     nofElectrons[i]=0;
2260     tracks[i]=0;
2261   }
2262
2263  
2264
2265   //--------------------------------------------------------------------
2266   //  Loop over tracks, the "track" contains the full history
2267   //--------------------------------------------------------------------
2268
2269   Int_t previousTrack,currentTrack;
2270   previousTrack = -1; // nothing to store so far!
2271
2272   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
2273     Bool_t isInSector=kTRUE;
2274     ResetHits();
2275     isInSector = TrackInVolume(isec,track);
2276     if (!isInSector) continue;
2277     //MI change
2278     branch->GetEntry(track); // get next track
2279
2280     //M.I. changes
2281
2282     tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
2283
2284     //--------------------------------------------------------------
2285     //  Loop over hits
2286     //--------------------------------------------------------------
2287
2288
2289     while(tpcHit){
2290       
2291       Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
2292       if(sector != isec){
2293         tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
2294         continue; 
2295       }
2296
2297         currentTrack = tpcHit->Track(); // track number
2298
2299
2300         if(currentTrack != previousTrack){
2301                           
2302            // store already filled fTrack
2303               
2304            for(i=0;i<nrows+2;i++){
2305              if(previousTrack != -1){
2306                if(nofElectrons[i]>0){
2307                  AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
2308                  v(0) = previousTrack;
2309                  tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
2310                  row[i]->Add(tracks[i]);                     
2311                }
2312                else{
2313                  delete tracks[i]; // delete empty AliTPCFastVector
2314                  tracks[i]=0;
2315                }
2316              }
2317
2318              nofElectrons[i]=0;
2319              tracks[i] = new AliTPCFastVector(481); // AliTPCFastVectors for the next fTrack
2320
2321            } // end of loop over rows
2322                
2323            previousTrack=currentTrack; // update track label 
2324         }
2325            
2326         Int_t qI = (Int_t) (tpcHit->fQ); // energy loss (number of electrons)
2327
2328        //---------------------------------------------------
2329        //  Calculate the electron attachment probability
2330        //---------------------------------------------------
2331
2332
2333         Float_t time = 1.e6*(fTPCParam->GetZLength()-TMath::Abs(tpcHit->Z()))
2334                                                         /fTPCParam->GetDriftV(); 
2335         // in microseconds!     
2336         Float_t attProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
2337           fTPCParam->GetOxyCont()*time; //  fraction! 
2338    
2339         //-----------------------------------------------
2340         //  Loop over electrons
2341         //-----------------------------------------------
2342         Int_t index[3];
2343         index[1]=isec;
2344         for(Int_t nel=0;nel<qI;nel++){
2345           // skip if electron lost due to the attachment
2346           if((gRandom->Rndm(0)) < attProb) continue; // electron lost!
2347           xyz[0]=tpcHit->X();
2348           xyz[1]=tpcHit->Y();
2349           xyz[2]=tpcHit->Z();   
2350           //
2351           // protection for the nonphysical avalanche size (10**6 maximum)
2352           //  
2353           Double_t rn=TMath::Max(gRandom->Rndm(0),1.93e-22);
2354           xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(rn)); 
2355           index[0]=1;
2356           
2357           TransportElectron(xyz,index);    
2358           Int_t rowNumber;
2359           fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); 
2360           // row 0 - cross talk from the innermost row
2361           // row fNRow+1 cross talk from the outermost row
2362           rowNumber = index[2]+1; 
2363           //transform position to local digit coordinates
2364           //relative to nearest pad row 
2365           if ((rowNumber<0)||rowNumber>fTPCParam->GetNRow(isec)+1) continue;
2366           Float_t x1,y1;
2367           if (isec <fTPCParam->GetNInnerSector()) {
2368             x1 = xyz[1]*fTPCParam->GetInnerPadPitchWidth();
2369             y1 = fTPCParam->GetYInner(rowNumber);
2370           }
2371           else{
2372             x1=xyz[1]*fTPCParam->GetOuterPadPitchWidth();
2373             y1 = fTPCParam->GetYOuter(rowNumber);
2374           }
2375           // gain inefficiency at the wires edges - linear
2376           x1=TMath::Abs(x1);
2377           y1-=1.;
2378           if(x1>y1) xyz[3]*=TMath::Max(1.e-6,(y1-x1+1.));       
2379        
2380           nofElectrons[rowNumber]++;      
2381           //----------------------------------
2382           // Expand vector if necessary
2383           //----------------------------------
2384           if(nofElectrons[rowNumber]>120){
2385             Int_t range = tracks[rowNumber]->GetNrows();
2386             if((nofElectrons[rowNumber])>(range-1)/4){
2387         
2388               tracks[rowNumber]->ResizeTo(range+400); // Add 100 electrons
2389             }
2390           }
2391           
2392           AliTPCFastVector &v = *tracks[rowNumber];
2393           Int_t idx = 4*nofElectrons[rowNumber]-3;
2394           Real_t * position = &(((AliTPCFastVector&)v).UncheckedAt(idx)); //make code faster
2395           memcpy(position,xyz,4*sizeof(Float_t));
2396  
2397         } // end of loop over electrons
2398
2399         tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
2400         
2401       } // end of loop over hits
2402     } // end of loop over tracks
2403
2404     //
2405     //   store remaining track (the last one) if not empty
2406     //
2407
2408      for(i=0;i<nrows+2;i++){
2409        if(nofElectrons[i]>0){
2410           AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
2411           v(0) = previousTrack;
2412           tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
2413           row[i]->Add(tracks[i]);  
2414         }
2415         else{
2416           delete tracks[i];
2417           tracks[i]=0;
2418         }  
2419       }  
2420
2421           delete [] tracks;
2422           delete [] nofElectrons;
2423  
2424
2425 } // end of MakeSector
2426
2427
2428 //_____________________________________________________________________________
2429 void AliTPC::Init()
2430 {
2431   //
2432   // Initialise TPC detector after definition of geometry
2433   //
2434   Int_t i;
2435   //
2436   if(fDebug) {
2437     printf("\n%s: ",ClassName());
2438     for(i=0;i<35;i++) printf("*");
2439     printf(" TPC_INIT ");
2440     for(i=0;i<35;i++) printf("*");
2441     printf("\n%s: ",ClassName());
2442     //
2443     for(i=0;i<80;i++) printf("*");
2444     printf("\n");
2445   }
2446 }
2447
2448 //_____________________________________________________________________________
2449 void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option, const char *file)
2450 {
2451   //
2452   // Create Tree branches for the TPC.
2453   //
2454   Int_t buffersize = 4000;
2455   char branchname[10];
2456   sprintf(branchname,"%s",GetName());
2457
2458   AliDetector::MakeBranch(option,file);
2459
2460   const char *d = strstr(option,"D");
2461
2462   if (fDigits   && gAlice->TreeD() && d) {
2463       MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
2464                        branchname, &fDigits, buffersize, file);
2465   }     
2466
2467   if (fHitType>1) MakeBranch2(option,file); // MI change 14.09.2000
2468 }
2469  
2470 //_____________________________________________________________________________
2471 void AliTPC::ResetDigits()
2472 {
2473   //
2474   // Reset number of digits and the digits array for this detector
2475   //
2476   fNdigits   = 0;
2477   if (fDigits)   fDigits->Clear();
2478 }
2479
2480 //_____________________________________________________________________________
2481 void AliTPC::SetSecAL(Int_t sec)
2482 {
2483   //---------------------------------------------------
2484   // Activate/deactivate selection for lower sectors
2485   //---------------------------------------------------
2486
2487   //-----------------------------------------------------------------
2488   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
2489   //-----------------------------------------------------------------
2490
2491   fSecAL = sec;
2492 }
2493
2494 //_____________________________________________________________________________
2495 void AliTPC::SetSecAU(Int_t sec)
2496 {
2497   //----------------------------------------------------
2498   // Activate/deactivate selection for upper sectors
2499   //---------------------------------------------------
2500
2501   //-----------------------------------------------------------------
2502   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
2503   //-----------------------------------------------------------------
2504
2505   fSecAU = sec;
2506 }
2507
2508 //_____________________________________________________________________________
2509 void AliTPC::SetSecLows(Int_t s1,Int_t s2,Int_t s3,Int_t s4,Int_t s5, Int_t s6)
2510 {
2511   //----------------------------------------
2512   // Select active lower sectors
2513   //----------------------------------------
2514
2515   //-----------------------------------------------------------------
2516   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
2517   //-----------------------------------------------------------------
2518
2519   fSecLows[0] = s1;
2520   fSecLows[1] = s2;
2521   fSecLows[2] = s3;
2522   fSecLows[3] = s4;
2523   fSecLows[4] = s5;
2524   fSecLows[5] = s6;
2525 }
2526
2527 //_____________________________________________________________________________
2528 void AliTPC::SetSecUps(Int_t s1,Int_t s2,Int_t s3,Int_t s4,Int_t s5, Int_t s6,
2529                        Int_t s7, Int_t s8 ,Int_t s9 ,Int_t s10, 
2530                        Int_t s11 , Int_t s12)
2531 {
2532   //--------------------------------
2533   // Select active upper sectors
2534   //--------------------------------
2535
2536   //-----------------------------------------------------------------
2537   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
2538   //-----------------------------------------------------------------
2539
2540   fSecUps[0] = s1;
2541   fSecUps[1] = s2;
2542   fSecUps[2] = s3;
2543   fSecUps[3] = s4;
2544   fSecUps[4] = s5;
2545   fSecUps[5] = s6;
2546   fSecUps[6] = s7;
2547   fSecUps[7] = s8;
2548   fSecUps[8] = s9;
2549   fSecUps[9] = s10;
2550   fSecUps[10] = s11;
2551   fSecUps[11] = s12;
2552 }
2553
2554 //_____________________________________________________________________________
2555 void AliTPC::SetSens(Int_t sens)
2556 {
2557
2558   //-------------------------------------------------------------
2559   // Activates/deactivates the sensitive strips at the center of
2560   // the pad row -- this is for the space-point resolution calculations
2561   //-------------------------------------------------------------
2562
2563   //-----------------------------------------------------------------
2564   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
2565   //-----------------------------------------------------------------
2566
2567   fSens = sens;
2568 }
2569
2570  
2571 void AliTPC::SetSide(Float_t side=0.)
2572 {
2573   // choice of the TPC side
2574
2575   fSide = side;
2576  
2577 }
2578 //____________________________________________________________________________
2579 void AliTPC::SetGasMixt(Int_t nc,Int_t c1,Int_t c2,Int_t c3,Float_t p1,
2580                            Float_t p2,Float_t p3)
2581 {
2582
2583   // gax mixture definition
2584
2585  fNoComp = nc;
2586  
2587  fMixtComp[0]=c1;
2588  fMixtComp[1]=c2;
2589  fMixtComp[2]=c3;
2590
2591  fMixtProp[0]=p1;
2592  fMixtProp[1]=p2;
2593  fMixtProp[2]=p3; 
2594  
2595  
2596 }
2597 //_____________________________________________________________________________
2598
2599 void AliTPC::TransportElectron(Float_t *xyz, Int_t *index)
2600 {
2601   //
2602   // electron transport taking into account:
2603   // 1. diffusion, 
2604   // 2.ExB at the wires
2605   // 3. nonisochronity
2606   //
2607   // xyz and index must be already transformed to system 1
2608   //
2609
2610   fTPCParam->Transform1to2(xyz,index);
2611   
2612   //add diffusion
2613   Float_t driftl=xyz[2];
2614   if(driftl<0.01) driftl=0.01;
2615   driftl=TMath::Sqrt(driftl);
2616   Float_t sigT = driftl*(fTPCParam->GetDiffT());
2617   Float_t sigL = driftl*(fTPCParam->GetDiffL());
2618   xyz[0]=gRandom->Gaus(xyz[0],sigT);
2619   xyz[1]=gRandom->Gaus(xyz[1],sigT);
2620   xyz[2]=gRandom->Gaus(xyz[2],sigL);
2621
2622   // ExB
2623   
2624   if (fTPCParam->GetMWPCReadout()==kTRUE){
2625     Float_t dx = fTPCParam->Transform2to2NearestWire(xyz,index);
2626     xyz[1]+=dx*(fTPCParam->GetOmegaTau());
2627   }
2628   //add nonisochronity (not implemented yet)  
2629 }
2630   
2631 ClassImp(AliTPCdigit)
2632  
2633 //_____________________________________________________________________________
2634 AliTPCdigit::AliTPCdigit(Int_t *tracks, Int_t *digits):
2635   AliDigit(tracks)
2636 {
2637   //
2638   // Creates a TPC digit object
2639   //
2640   fSector     = digits[0];
2641   fPadRow     = digits[1];
2642   fPad        = digits[2];
2643   fTime       = digits[3];
2644   fSignal     = digits[4];
2645 }
2646
2647  
2648 ClassImp(AliTPChit)
2649  
2650 //_____________________________________________________________________________
2651 AliTPChit::AliTPChit(Int_t shunt, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits):
2652 AliHit(shunt,track)
2653 {
2654   //
2655   // Creates a TPC hit object
2656   //
2657   fSector     = vol[0];
2658   fPadRow     = vol[1];
2659   fX          = hits[0];
2660   fY          = hits[1];
2661   fZ          = hits[2];
2662   fQ          = hits[3];
2663 }
2664  
2665
2666 //________________________________________________________________________
2667 // Additional code because of the AliTPCTrackHitsV2
2668
2669 void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char *file)
2670 {
2671   //
2672   // Create a new branch in the current Root Tree
2673   // The branch of fHits is automatically split
2674   // MI change 14.09.2000
2675   if (fHitType<2) return;
2676   char branchname[10];
2677   sprintf(branchname,"%s2",GetName());  
2678   //
2679   // Get the pointer to the header
2680   const char *cH = strstr(option,"H");
2681   //
2682   if (fTrackHits   && gAlice->TreeH() && cH && fHitType&4) {    
2683     //    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
2684     //                                             gAlice->TreeH(),fBufferSize,99);
2685     //TBranch * branch = 
2686     gAlice->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
2687                                                    fBufferSize,99);
2688
2689     // gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
2690     if (GetDebug()>1) 
2691       printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
2692     const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
2693     if (GetDebug())
2694       printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
2695     Publish(folder,&fTrackHits,branchname);
2696     if (file) {
2697         TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
2698         TDirectory *wd = gDirectory;
2699         b->SetFile(file);
2700         TIter next( b->GetListOfBranches());
2701         while ((b=(TBranch*)next())) {
2702           b->SetFile(file);
2703         }
2704         wd->cd(); 
2705         if (GetDebug()>1) 
2706               cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
2707     }
2708   }     
2709
2710   if (fTrackHitsOld   && gAlice->TreeH() && cH && fHitType&2) {    
2711     AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHitsOld, 
2712                                                    gAlice->TreeH(),fBufferSize,99);
2713     //TBranch * branch = gAlice->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
2714     //                                                     fBufferSize,99);
2715
2716     gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
2717     if (GetDebug()>1) 
2718       printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
2719     const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
2720     if (GetDebug())
2721       printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
2722     Publish(folder,&fTrackHitsOld,branchname);
2723     if (file) {
2724         TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
2725         TDirectory *wd = gDirectory;
2726         b->SetFile(file);
2727         TIter next( b->GetListOfBranches());
2728         while ((b=(TBranch*)next())) {
2729           b->SetFile(file);
2730         }
2731         wd->cd(); 
2732         if (GetDebug()>1) 
2733               cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
2734     }
2735   }     
2736 }
2737
2738 void AliTPC::SetTreeAddress()
2739 {
2740   if (fHitType<=1) AliDetector::SetTreeAddress();
2741   if (fHitType>1) SetTreeAddress2();
2742 }
2743
2744 void AliTPC::SetTreeAddress2()
2745 {
2746   //
2747   // Set branch address for the TrackHits Tree
2748   // 
2749   TBranch *branch;
2750   char branchname[20];
2751   sprintf(branchname,"%s2",GetName());
2752   //
2753   // Branch address for hit tree
2754   TTree *treeH = gAlice->TreeH();
2755   if ((treeH)&&(fHitType&4)) {
2756     branch = treeH->GetBranch(branchname);
2757     if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHits);
2758   }
2759   if ((treeH)&&(fHitType&2)) {
2760     branch = treeH->GetBranch(branchname);
2761     if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
2762   }
2763   //set address to TREETR
2764   TTree *treeTR = gAlice->TreeTR();
2765   if (treeTR && fTrackReferences) {
2766     branch = treeTR->GetBranch(GetName());
2767     if (branch) branch->SetAddress(&fTrackReferences);
2768   }
2769
2770
2771 }
2772
2773 void AliTPC::FinishPrimary()
2774 {
2775   if (fTrackHits &&fHitType&4)      fTrackHits->FlushHitStack();  
2776   if (fTrackHitsOld && fHitType&2)  fTrackHitsOld->FlushHitStack();  
2777 }
2778
2779
2780 void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
2781
2782   //
2783   // add hit to the list  
2784   Int_t rtrack;
2785   if (fIshunt) {
2786     int primary = gAlice->GetPrimary(track);
2787     gAlice->Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
2788     rtrack=primary;
2789   } else {
2790     rtrack=track;
2791     gAlice->FlagTrack(track);
2792   }  
2793   //AliTPChit *hit = (AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(fNhits-1);
2794   //if (hit->fTrack!=rtrack)
2795   //  cout<<"bad track number\n";
2796   if (fTrackHits && fHitType&4) 
2797     fTrackHits->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
2798                              hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
2799   if (fTrackHitsOld &&fHitType&2 ) 
2800     fTrackHitsOld->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
2801                              hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
2802   
2803 }
2804
2805 void AliTPC::ResetHits()
2806 {
2807   if (fHitType&1) AliDetector::ResetHits();
2808   if (fHitType>1) ResetHits2();
2809 }
2810
2811 void AliTPC::ResetHits2()
2812 {
2813   //
2814   //reset hits
2815   if (fTrackHits && fHitType&4) fTrackHits->Clear();
2816   if (fTrackHitsOld && fHitType&2) fTrackHitsOld->Clear();
2817
2818 }   
2819
2820 AliHit* AliTPC::FirstHit(Int_t track)
2821 {
2822   if (fHitType>1) return FirstHit2(track);
2823   return AliDetector::FirstHit(track);
2824 }
2825 AliHit* AliTPC::NextHit()
2826 {
2827   if (fHitType>1) return NextHit2();
2828   
2829   return AliDetector::NextHit();
2830 }
2831
2832 AliHit* AliTPC::FirstHit2(Int_t track)
2833 {
2834   //
2835   // Initialise the hit iterator
2836   // Return the address of the first hit for track
2837   // If track>=0 the track is read from disk
2838   // while if track<0 the first hit of the current
2839   // track is returned
2840   // 
2841   if(track>=0) {
2842     gAlice->ResetHits();
2843     gAlice->TreeH()->GetEvent(track);
2844   }
2845   //
2846   if (fTrackHits && fHitType&4) {
2847     fTrackHits->First();
2848     return fTrackHits->GetHit();
2849   }
2850   if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
2851     fTrackHitsOld->First();
2852     return fTrackHitsOld->GetHit();
2853   }
2854
2855   else return 0;
2856 }
2857
2858 AliHit* AliTPC::NextHit2()
2859 {
2860   //
2861   //Return the next hit for the current track
2862
2863
2864   if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
2865     fTrackHitsOld->Next();
2866     return fTrackHitsOld->GetHit();
2867   }
2868   if (fTrackHits) {
2869     fTrackHits->Next();
2870     return fTrackHits->GetHit();
2871   }
2872   else 
2873     return 0;
2874 }
2875
2876 void AliTPC::LoadPoints(Int_t)
2877 {
2878   //
2879   Int_t a = 0;
2880   /*  if(fHitType==1) return AliDetector::LoadPoints(a);
2881   LoadPoints2(a);
2882   */
2883   if(fHitType==1) AliDetector::LoadPoints(a);
2884   else LoadPoints2(a);
2885    
2886   // LoadPoints3(a);
2887
2888 }
2889
2890
2891 void AliTPC::RemapTrackHitIDs(Int_t *map)
2892 {
2893   if (!fTrackHits) return;
2894   
2895   if (fTrackHitsOld && fHitType&2){
2896     AliObjectArray * arr = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
2897     for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
2898       AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
2899       info->fTrackID = map[info->fTrackID];
2900     }
2901   }
2902   if (fTrackHitsOld && fHitType&4){
2903     TClonesArray * arr = fTrackHits->GetArray();;
2904     for (Int_t i=0;i<arr->GetEntriesFast();i++){
2905       AliTrackHitsParamV2 * info = (AliTrackHitsParamV2 *)(arr->At(i));
2906       info->fTrackID = map[info->fTrackID];
2907     }
2908   }
2909 }
2910
2911 Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
2912 {
2913   //return bool information - is track in given volume
2914   //load only part of the track information 
2915   //return true if current track is in volume
2916   //
2917   //  return kTRUE;
2918   if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
2919     TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
2920     br->GetEvent(track);
2921     AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
2922     for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
2923       if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==id) return kTRUE;
2924     } 
2925   }
2926
2927   if (fTrackHits && fHitType&4) {
2928     TBranch * br1 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
2929     TBranch * br2 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
2930     br2->GetEvent(track);
2931     br1->GetEvent(track);    
2932     Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
2933     Int_t nvolumes = fTrackHits->GetNVolumes();
2934     if (!volumes && nvolumes>0) {
2935       printf("Problematic track\t%d\t%d",track,nvolumes);
2936       return kFALSE;
2937     }
2938     for (Int_t j=0;j<nvolumes; j++)
2939       if (volumes[j]==id) return kTRUE;    
2940   }
2941
2942   if (fHitType&1) {
2943     TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fSector");
2944     br->GetEvent(track);
2945     for (Int_t j=0;j<fHits->GetEntriesFast();j++){
2946       if (  ((AliTPChit*)fHits->At(j))->fSector==id) return kTRUE;
2947     } 
2948   }
2949   return kFALSE;  
2950
2951 }
2952
2953 //_____________________________________________________________________________
2954 void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
2955 {
2956   //
2957   // Store x, y, z of all hits in memory
2958   //
2959   if (fTrackHits == 0 && fTrackHitsOld==0) return;
2960   //
2961   Int_t nhits =0;
2962   if (fHitType&4) nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
2963   if (fHitType&2) nhits = fTrackHitsOld->GetEntriesFast();
2964   
2965   if (nhits == 0) return;
2966   Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
2967   if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
2968   AliHit *ahit;
2969   //
2970   Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
2971   Int_t *limi=new Int_t[tracks];
2972   Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
2973   for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
2974     ntrk[i]=0;
2975     coor[i]=0;
2976     limi[i]=0;
2977   }
2978   //
2979   AliPoints *points = 0;
2980   Float_t *fp=0;
2981   Int_t trk;
2982   Int_t chunk=nhits/4+1;
2983   //
2984   // Loop over all the hits and store their position
2985   //
2986   ahit = FirstHit2(-1);
2987   while (ahit){
2988     trk=ahit->GetTrack();
2989     if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
2990       //
2991       // Initialise a new track
2992       fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
2993       if(coor[trk]) {
2994         memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
2995         delete [] coor[trk];
2996       }
2997       limi[trk]+=chunk;
2998       coor[trk] = fp;
2999     } else {
3000       fp = coor[trk];
3001     }
3002     fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
3003     fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
3004     fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
3005     ntrk[trk]++;
3006     ahit = NextHit2();
3007   }
3008
3009
3010
3011   //
3012   for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
3013     if(ntrk[trk]) {
3014       points = new AliPoints();
3015       points->SetMarkerColor(GetMarkerColor());
3016       points->SetMarkerSize(GetMarkerSize());
3017       points->SetDetector(this);
3018       points->SetParticle(trk);
3019       points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle());
3020       fPoints->AddAt(points,trk);
3021       delete [] coor[trk];
3022       coor[trk]=0;
3023     }
3024   }
3025   delete [] coor;
3026   delete [] ntrk;
3027   delete [] limi;
3028 }
3029
3030
3031 //_____________________________________________________________________________
3032 void AliTPC::LoadPoints3(Int_t)
3033 {
3034   //
3035   // Store x, y, z of all hits in memory
3036   // - only intersection point with pad row
3037   if (fTrackHits == 0) return;
3038   //
3039   Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
3040   if (nhits == 0) return;
3041   Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
3042   if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(2*tracks);
3043   fPoints->Expand(2*tracks);
3044   AliHit *ahit;
3045   //
3046   Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
3047   Int_t *limi=new Int_t[tracks];
3048   Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
3049   for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
3050     ntrk[i]=0;
3051     coor[i]=0;
3052     limi[i]=0;
3053   }
3054   //
3055   AliPoints *points = 0;
3056   Float_t *fp=0;
3057   Int_t trk;
3058   Int_t chunk=nhits/4+1;
3059   //
3060   // Loop over all the hits and store their position
3061   //
3062   ahit = FirstHit2(-1);
3063   //for (Int_t hit=0;hit<nhits;hit++) {
3064
3065   Int_t lastrow = -1;
3066   while (ahit){
3067     //    ahit = (AliHit*)fHits->UncheckedAt(hit);
3068     trk=ahit->GetTrack(); 
3069     Float_t  x[3]={ahit->X(),ahit->Y(),ahit->Z()};
3070     Int_t    index[3]={1,((AliTPChit*)ahit)->fSector,0};
3071     Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;
3072     if (currentrow!=lastrow){
3073       lastrow = currentrow;
3074       //later calculate intersection point           
3075       if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
3076         //
3077         // Initialise a new track
3078         fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
3079         if(coor[trk]) {
3080           memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
3081           delete [] coor[trk];
3082         }
3083         limi[trk]+=chunk;
3084         coor[trk] = fp;
3085       } else {
3086         fp = coor[trk];
3087       }
3088       fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
3089       fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
3090       fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
3091       ntrk[trk]++;
3092     }
3093     ahit = NextHit2();
3094   }
3095   
3096   //
3097   for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
3098     if(ntrk[trk]) {
3099       points = new AliPoints();
3100       points->SetMarkerColor(GetMarkerColor()+1);
3101       points->SetMarkerStyle(5);
3102       points->SetMarkerSize(0.2);
3103       points->SetDetector(this);
3104       points->SetParticle(trk);
3105       //      points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle()20);
3106       points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],30);
3107       fPoints->AddAt(points,tracks+trk);
3108       delete [] coor[trk];
3109       coor[trk]=0;
3110     }
3111   }
3112   delete [] coor;
3113   delete [] ntrk;
3114   delete [] limi;
3115 }
3116
3117
3118
3119 void AliTPC::FindTrackHitsIntersection(TClonesArray * arr)
3120 {
3121
3122   //
3123   //fill clones array with intersection of current point with the
3124   //middle of the row
3125   Int_t sector;
3126   Int_t ipart;
3127   
3128   const Int_t kcmaxhits=30000;
3129   AliTPCFastVector * xxxx = new AliTPCFastVector(kcmaxhits*4);
3130   AliTPCFastVector & xxx = *xxxx;
3131   Int_t maxhits = kcmaxhits;
3132       
3133   //
3134   AliTPChit * tpcHit=0;
3135   tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit2(-1);
3136   Int_t currentIndex=0;
3137   Int_t lastrow=-1;  //last writen row
3138
3139   while (tpcHit){
3140     if (tpcHit==0) continue;
3141     sector=tpcHit->fSector; // sector number
3142     ipart=tpcHit->Track();
3143     
3144     //find row number
3145     
3146     Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
3147     Int_t    index[3]={1,sector,0};
3148     Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;       
3149     if (currentrow<0) continue;
3150     if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
3151     if (currentrow==lastrow){
3152       if ( currentIndex>=maxhits){
3153         maxhits+=kcmaxhits;
3154         xxx.ResizeTo(4*maxhits);
3155       }     
3156       xxx(currentIndex*4)=x[0];
3157       xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
3158       xxx(currentIndex*4+2)=x[2];       
3159       xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
3160       currentIndex++;   
3161     }
3162     else 
3163       if (currentIndex>2){
3164         Float_t sumx=0;
3165         Float_t sumx2=0;
3166         Float_t sumx3=0;
3167         Float_t sumx4=0;
3168         Float_t sumy=0;
3169         Float_t sumxy=0;
3170         Float_t sumx2y=0;
3171         Float_t sumz=0;
3172         Float_t sumxz=0;
3173         Float_t sumx2z=0;
3174         Float_t sumq=0;
3175         for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
3176           Float_t x,x2,x3,x4;
3177           x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
3178           x2*=x;
3179           x3*=x2;
3180           x4*=x3;
3181           sumx+=x;
3182           sumx2+=x2;
3183           sumx3+=x3;
3184           sumx4+=x4;
3185           sumy+=xxx(index*4+1);
3186           sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
3187           sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
3188           sumz+=xxx(index*4+2);
3189           sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
3190           sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;     
3191           sumq+=xxx(index*4+3);
3192         }
3193         Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(sector,lastrow)-1)/2;
3194         Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
3195           sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
3196         
3197         Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
3198           sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
3199         Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
3200           sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
3201         
3202         Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
3203           sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
3204         Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
3205           sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
3206         
3207         Float_t y=detay/det+centralPad;
3208         Float_t z=detaz/det;    
3209         Float_t by=detby/det; //y angle
3210         Float_t bz=detbz/det; //z angle
3211         sumy/=Float_t(currentIndex);
3212         sumz/=Float_t(currentIndex);
3213         
3214         AliComplexCluster cl;
3215         cl.fX=z;
3216         cl.fY=y;
3217         cl.fQ=sumq;
3218         cl.fSigmaX2=bz;
3219         cl.fSigmaY2=by;
3220         cl.fTracks[0]=ipart;
3221         
3222         AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(sector,lastrow));
3223         if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
3224         currentIndex=0;
3225         lastrow=currentrow;
3226       } //end of calculating cluster for given row
3227                 
3228   } // end of loop over hits
3229   xxxx->Delete();
3230
3231 }
3232 //_______________________________________________________________________________
3233 void AliTPC::Digits2Reco(Int_t firstevent,Int_t lastevent)
3234 {
3235   // produces rec points from digits and writes them on the root file
3236   // AliTPCclusters.root
3237
3238   TDirectory *cwd = gDirectory;
3239
3240
3241   AliTPCParamSR *dig=(AliTPCParamSR *)gDirectory->Get("75x40_100x60");
3242   if(dig){
3243     printf("You are running 2 pad-length geom hits with 3 pad-length geom digits\n");
3244     delete dig;
3245     dig = new AliTPCParamSR();
3246   }
3247   else
3248   {
3249    dig=(AliTPCParamSR *)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60"); 
3250   }
3251   if(!dig){
3252    printf("No TPC parameters found\n");
3253    exit(3);
3254   }
3255    
3256   SetParam(dig);
3257   cout<<"AliTPC::Digits2Reco: TPC parameteres have been set"<<endl; 
3258   TFile *out;
3259   if(!gSystem->Getenv("CONFIG_FILE")){
3260     out=TFile::Open("AliTPCclusters.root","recreate");
3261   }
3262   else {
3263     const char *tmp1;
3264     const char *tmp2;
3265     char tmp3[80];
3266     tmp1=gSystem->Getenv("CONFIG_FILE_PREFIX");
3267     tmp2=gSystem->Getenv("CONFIG_OUTDIR");
3268     sprintf(tmp3,"%s%s/AliTPCclusters.root",tmp1,tmp2);
3269     out=TFile::Open(tmp3,"recreate");
3270   }
3271
3272   TStopwatch timer;
3273   cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points begins"<<endl;
3274   timer.Start();
3275   cwd->cd();
3276   for(Int_t iev=firstevent;iev<lastevent+1;iev++){
3277
3278     printf("Processing event %d\n",iev);
3279     Digits2Clusters(out,iev);
3280   }
3281   cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points ended"<<endl;
3282   timer.Stop();
3283   timer.Print();
3284   out->Close();
3285   cwd->cd(); 
3286
3287
3288 }
3289
3290 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
3291 AliTPCParam* AliTPC::LoadTPCParam(TFile *file) {
3292 //
3293 // load TPC paarmeters from a given file or create new if the object
3294 // is not found there
3295 //
3296   char paramName[50];
3297   sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
3298   AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)file->Get(paramName);
3299   if (paramTPC) {
3300     cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
3301   } else {
3302     cerr<<"TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)."
3303         <<endl;    
3304     paramTPC = new AliTPCParamSR;
3305   }
3306   return paramTPC;
3307
3308 // the older version of parameters can be accessed with this code.
3309 // In some cases, we have old parameters saved in the file but 
3310 // digits were created with new parameters, it can be distinguish 
3311 // by the name of TPC TreeD. The code here is just for the case 
3312 // we would need to compare with old data, uncomment it if needed.
3313 //
3314 //  char paramName[50];
3315 //  sprintf(paramName,"75x40_100x60");
3316 //  AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)in->Get(paramName);
3317 //  if (paramTPC) {
3318 //    cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
3319 //  } else {
3320 //    sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
3321 //    paramTPC=(AliTPCParam*)in->Get(paramName);
3322 //    if (paramTPC) {
3323 //      cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
3324 //    } else {
3325 //      cerr<<"TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)."
3326 //          <<endl;    
3327 //      paramTPC = new AliTPCParamSR;
3328 //    }
3329 //  }
3330 //  return paramTPC;
3331
3332 }
3333