TPC/AliTPCCalibPedestal.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17 /* $Id$ */
  18
  19
  20 //Root includes
  21 #include <TH1F.h>
  22 #include <TH2F.h>
  23 #include <TString.h>
  24 #include <TMath.h>
  25 #include <TF1.h>
  26 #include <TRandom.h>
  27 #include <TDirectory.h>
  28 #include <TFile.h>
  29 #include <TMap.h>
  30 //AliRoot includes
  31 #include "AliRawReader.h"
  32 #include "AliRawReaderRoot.h"
  33 #include "AliRawReaderDate.h"
  34 #include "AliTPCRawStream.h"
  35 #include "AliTPCCalROC.h"
  36 #include "AliTPCROC.h"
  37 #include "AliMathBase.h"
  38 #include "TTreeStream.h"
  39 #include "AliTPCRawStreamFast.h"
  40
  41 //date
  42 #include "event.h"
  43
  44 //header file
  45 #include "AliTPCCalibPedestal.h"
  46
  47
  48 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  49 //          Implementation of the TPC pedestal and noise calibration
  50 //
  51 //   Origin: Jens Wiechula, Marian Ivanov   J.Wiechula@gsi.de, Marian.Ivanov@cern.ch
  52 //
  53 //
  54 // *************************************************************************************
  55 // *                                Class Description                                  *
  56 // *************************************************************************************
  57 //
  58 // Working principle:
  59 // ------------------
  60 // Raw pedestal data is processed by calling one of the ProcessEvent(...) functions
  61 // (see below). These in the end call the Update(...) function, where the data is filled
  62 // into histograms.
  63 //
  64 // For each ROC one TH2F histo (ROC channel vs. ADC channel) is created when
  65 // it is filled for the first time (GetHistoPedestal(ROC,kTRUE)). All histos are stored in the
  66 // TObjArray fHistoPedestalArray.
  67 //
  68 // For a fast filling of the histogram the corresponding bin number of the channel and ADC channel
  69 // is computed by hand and the histogram array is accessed directly via its pointer.
  70 // ATTENTION: Doing so the the entry counter of the histogram is not increased
  71 //            this means that e.g. the colz draw option gives an empty plot unless
  72 //          calling 'histo->SetEntries(1)' before drawing.
  73 //
  74 // After accumulating the desired statistics the Analyse() function has to be called.
  75 // Whithin this function the pedestal and noise values are calculated for each pad, using
  76 // the fast gaus fit function  AliMathBase::FitGaus(...), and the calibration
  77 // storage classes (AliTPCCalROC) are filled for each ROC.
  78 // The calibration information is stored in the TObjArrays fCalRocArrayPedestal and fCalRocArrayRMS;
  79 //
  80 //
  81 //
  82 // User interface for filling data:
  83 // --------------------------------
  84 //
  85 // To Fill information one of the following functions can be used:
  86 //
  87 // Bool_t ProcessEvent(eventHeaderStruct *event);
  88 //   - process Date event
  89 //   - use AliTPCRawReaderDate and call ProcessEvent(AliRawReader *rawReader)
  90 //
  91 // Bool_t ProcessEvent(AliRawReader *rawReader);
  92 //  - process AliRawReader event
  93 //   - use AliTPCRawStream to loop over data and call ProcessEvent(AliTPCRawStream *rawStream)
  94 //
  95 // Bool_t ProcessEvent(AliTPCRawStream *rawStream);
  96 //   - process event from AliTPCRawStream
  97 //   - call Update function for signal filling
  98 //
  99 // Int_t Update(const Int_t isector, const Int_t iRow, const Int_t
 100 //              iPad,  const Int_t iTimeBin, const Float_t signal);
 101 //   - directly  fill signal information (sector, row, pad, time bin, pad)
 102 //     to the reference histograms
 103 //
 104 // It is also possible to merge two independently taken calibrations using the function
 105 //
 106 // void Merge(AliTPCCalibPedestal *ped)
 107 //   - copy histograms in 'ped' if the do not exist in this instance
 108 //   - Add histograms in 'ped' to the histograms in this instance if the allready exist
 109 //   - After merging call Analyse again!
 110 //
 111 //
 112 //
 113 // -- example: filling data using root raw data:
 114 // void fillPedestal(Char_t *filename)
 115 // {
 116 //    rawReader = new AliRawReaderRoot(fileName);
 117 //    if ( !rawReader ) return;
 118 //    AliTPCCalibPedestal *calib = new AliTPCCalibPedestal;
 119 //    while (rawReader->NextEvent()){
 120 //      calib->ProcessEvent(rawReader);
 121 //    }
 122 //    calib->Analyse();
 123 //    calib->DumpToFile("PedestalData.root");
 124 //    delete rawReader;
 125 //    delete calib;
 126 // }
 127 //
 128 //
 129 // What kind of information is stored and how to retrieve them:
 130 // ------------------------------------------------------------
 131 //
 132 // - Accessing the 'Reference Histograms' (pedestal distribution histograms):
 133 //
 134 // TH2F *GetHistoPedestal(Int_t sector);
 135 //
 136 // - Accessing the calibration storage objects:
 137 //
 138 // AliTPCCalROC *GetCalRocPedestal(Int_t sector);  - for the pedestal values, mean from gaus fit
 139 // AliTPCCalROC *GetCalRocSigma(Int_t sector);     - for the Noise values, sigma from guas fit
 140 // AliTPCCalROC *GetCalRocMean(Int_t sector);  - for the pedestal values, truncated mean
 141 // AliTPCCalROC *GetCalRocRMS(Int_t sector);     - for the Noise values, rms from truncated mean
 142 //
 143 // example for visualisation:
 144 // if the file "PedestalData.root" was created using the above example one could do the following:
 145 //
 146 // TFile filePedestal("PedestalData.root")
 147 // AliTPCCalibPedestal *ped = (AliTPCCalibPedestal*)filePedestal->Get("AliTPCCalibPedestal");
 148 // ped->GetCalRocPedestal(0)->Draw("colz");
 149 // ped->GetCalRocRMS(0)->Draw("colz");
 150 //
 151 // or use the AliTPCCalPad functionality:
 152 // AliTPCCalPad padPedestal(ped->GetCalPadPedestal());
 153 // AliTPCCalPad padNoise(ped->GetCalPadRMS());
 154 // padPedestal->MakeHisto2D()->Draw("colz");  //Draw A-Side Pedestal Information
 155 // padNoise->MakeHisto2D()->Draw("colz");  //Draw A-Side Noise Information
 156 //
 157 /*
 158  example: fill pedestal with gausschen noise
 159  AliTPCCalibPedestal ped;
 160  ped.TestEvent();
 161  ped.Analyse();
 162  //Draw output;
 163  TCanvas* c1 = new TCanvas;
 164  c1->Divide(1,2);
 165  c1->cd(1);
 166  ped.GetHistoPedestal(0)->SetEntries(1); //needed in order for colz to work, reason: fast filling does not increase the entries counter
 167  ped.GetHistoPedestal(0)->Draw("colz");
 168  c1->cd(2);
 169  ped.GetHistoPedestal(36)->SetEntries(1); //needed in order for colz to work, reason: fast filling does not increase the entries counter
 170  ped.GetHistoPedestal(36)->Draw("colz");
 171  TCanvas* c2 = new TCanvas;
 172  c2->Divide(2,2);
 173  c2->cd(1);
 174  ped.GetCalRocPedestal(0)->Draw("colz");
 175  c2->cd(2);
 176  ped.GetCalRocRMS(0)->Draw("colz");
 177  c2->cd(3);
 178  ped.GetCalRocPedestal(36)->Draw("colz");
 179  c2->cd(4);
 180  ped.GetCalRocRMS(36)->Draw("colz");
 181 */
 182 //
 183 // Time dependent pedestals:
 184 //
 185 // If wished there is the possibility to calculate for each channel and time bin
 186 // the mean pedestal [pedestals(t)]. This is done by
 187 //
 188 // 1) setting SetTimeAnalysis(kTRUE),
 189 // 2) processing the data by looping over the events using ProcessEvent(..)
 190 // 3) calling the Analyse() and AnalyseTime(nevents) functions (providing nevents)
 191 // 4) getting the pedestals(t) using   TArrayF **timePed = calibPedestal.GetTimePedestals();
 192 // 5) looking at values using   timePed[row][pad].At(timebin)
 193 //
 194 // This functionality is intended to be used on an LDC bu the detector algorithm
 195 // (TPCPEDESTALda) to generate a data set used for configuration of the pattern
 196 // memory for baseline subtraction in the ALTROs. Later the information should also
 197 // be stored as reference data.
 198 //
 199
 200
 201 ClassImp(AliTPCCalibPedestal)
 202
 203 AliTPCCalibPedestal::AliTPCCalibPedestal() :
 204   AliTPCCalibRawBase(),
 205   fAdcMin(1),
 206   fAdcMax(100),
 207   fAnaMeanDown(0.),
 208   fAnaMeanUp(1.),
 209   fTimeAnalysis(kFALSE),
 210   fCalRocArrayPedestal(72),
 211   fCalRocArraySigma(72),
 212   fHistoPedestalArray(72),
 213   fTimeSignal(NULL),
 214   fCalRocArrayMean(72),
 215   fCalRocArrayRMS(72)
 216 {
 217   //
 218   // default constructor
 219   //
 220   SetNameTitle("AliTPCCalibPedestal","AliTPCCalibPedestal");
 221   fFirstTimeBin=60;
 222   fLastTimeBin=1000;
 223 }
 224
 225
 226 //_____________________________________________________________________
 227 AliTPCCalibPedestal::AliTPCCalibPedestal(const AliTPCCalibPedestal &ped) :
 228   AliTPCCalibRawBase(ped),
 229   fAdcMin(ped.GetAdcMin()),
 230   fAdcMax(ped.GetAdcMax()),
 231   fAnaMeanDown(ped.fAnaMeanDown),
 232   fAnaMeanUp(ped.fAnaMeanUp),
 233   fTimeAnalysis(ped.fTimeAnalysis),
 234   fCalRocArrayPedestal(72),
 235   fCalRocArraySigma(72),
 236   fHistoPedestalArray(72),
 237   fTimeSignal(ped.fTimeSignal),
 238   fCalRocArrayMean(72),
 239   fCalRocArrayRMS(72)
 240 {
 241   //
 242   // copy constructor
 243   //
 244   for (Int_t iSec = 0; iSec < 72; ++iSec){
 245     const AliTPCCalROC *calPed = (AliTPCCalROC*)ped.fCalRocArrayPedestal.UncheckedAt(iSec);
 246     const AliTPCCalROC *calRMS = (AliTPCCalROC*)ped.fCalRocArrayRMS.UncheckedAt(iSec);
 247     const TH2F         *hPed   = (TH2F*)ped.fHistoPedestalArray.UncheckedAt(iSec);
 248
 249     if ( calPed != 0x0 ) fCalRocArrayPedestal.AddAt(new AliTPCCalROC(*calPed), iSec);
 250     if ( calRMS != 0x0 ) fCalRocArrayRMS.AddAt(new AliTPCCalROC(*calRMS), iSec);
 251
 252     if ( hPed != 0x0 ){
 253       TH2F *hNew = new TH2F(*hPed);
 254       hNew->SetDirectory(0);
 255       fHistoPedestalArray.AddAt(hNew,iSec);
 256     }
 257   }
 258 }
 259 AliTPCCalibPedestal::AliTPCCalibPedestal(const TMap *config):
 260   AliTPCCalibRawBase(),
 261   fAdcMin(1),
 262   fAdcMax(100),
 263   fAnaMeanDown(0.),
 264   fAnaMeanUp(1.),
 265   fTimeAnalysis(kFALSE),
 266   fCalRocArrayPedestal(72),
 267   fCalRocArraySigma(72),
 268   fHistoPedestalArray(72),
 269   fTimeSignal(NULL),
 270   fCalRocArrayMean(72),
 271   fCalRocArrayRMS(72)
 272 {
 273  //
 274  // This constructor uses a TMap for setting some parametes
 275  //
 276   SetNameTitle("AliTPCCalibPedestal","AliTPCCalibPedestal");
 277   fFirstTimeBin=60;
 278   fLastTimeBin=1000;
 279   if (config->GetValue("FirstTimeBin")) fFirstTimeBin = ((TObjString*)config->GetValue("FirstTimeBin"))->GetString().Atoi();
 280   if (config->GetValue("LastTimeBin"))  fLastTimeBin = ((TObjString*)config->GetValue("LastTimeBin"))->GetString().Atoi();
 281   if (config->GetValue("AdcMin"))       fAdcMin = ((TObjString*)config->GetValue("AdcMin"))->GetString().Atoi();
 282   if (config->GetValue("AdcMax"))       fAdcMax = ((TObjString*)config->GetValue("AdcMax"))->GetString().Atoi();
 283   if (config->GetValue("TimeAnalysis")) SetTimeAnalysis(((TObjString*)config->GetValue("TimeAnalysis"))->GetString().Atoi());
 284 }
 285
 286
 287 //_____________________________________________________________________
 288 AliTPCCalibPedestal& AliTPCCalibPedestal::operator = (const  AliTPCCalibPedestal &source)
 289 {
 290   //
 291   // assignment operator
 292   //
 293   if (&source == this) return *this;
 294   new (this) AliTPCCalibPedestal(source);
 295
 296   return *this;
 297 }
 298
 299
 300 //_____________________________________________________________________
 301 AliTPCCalibPedestal::~AliTPCCalibPedestal()
 302 {
 303   //
 304   // destructor
 305   //
 306
 307   fCalRocArrayPedestal.Delete();
 308   fCalRocArrayRMS.Delete();
 309   fCalRocArraySigma.Delete();
 310   fHistoPedestalArray.Delete();
 311
 312   if ( fTimeSignal ) {
 313     for (Int_t i = 0; i < 159; i++) {
 314       delete [] fTimeSignal[i];
 315       fTimeSignal[i] = 0;
 316     }
 317     delete [] fTimeSignal;
 318     fTimeSignal = 0;
 319   }
 320
 321   // do not delete fMapping, because we do not own it.
 322
 323 }
 324
 325
 326 //_____________________________________________________________________
 327 void AliTPCCalibPedestal::SetTimeAnalysis(Bool_t time)
 328 {
 329   //
 330   // Use time dependent analysis: Pedestals are analysed as a function
 331   // of the drift time. There is one mean value generated for each time
 332   // bin and each channel. It can be used as reference data and for
 333   // configuration of the ALTRO pattern memory for baseline subtraction.
 334   //
 335   // ATTENTION: Use only on LDC in TPCPEDESTALda! On a LDC we get data
 336   // only from one sector. For the full TPC we would need a lot of
 337   // memory (36*159*140*1024*4bytes = 3.3GB)!
 338   //
 339
 340   fTimeAnalysis = time;
 341
 342   if ( !fTimeAnalysis ) return;
 343
 344   // prepare array for one sector (159*140*1024*4bytes = 92MB):
 345   fTimeSignal = new TArrayF*[159];
 346   for (Int_t i = 0; i < 159; i++) {  // padrows
 347     fTimeSignal[i] = new TArrayF[140];
 348     for (Int_t j = 0; j < 140; j++) {  // pads per row
 349       fTimeSignal[i][j].Set(1024);
 350       for (Int_t k = 0; k < 1024; k++) {  // time bins per pad
 351         fTimeSignal[i][j].AddAt(0., k);
 352       }
 353     }
 354   }
 355 }
 356
 357
 358 //_____________________________________________________________________
 359 Int_t AliTPCCalibPedestal::Update(const Int_t icsector,
 360                                   const Int_t icRow,
 361                                   const Int_t icPad,
 362                                   const Int_t icTimeBin,
 363                                   const Float_t csignal)
 364 {
 365   //
 366   // Signal filling method
 367   //
 368   if (icRow<0) return 0;
 369   if (icPad<0) return 0;
 370   if (icTimeBin<0) return 0;
 371
 372   // Time dependent pedestals
 373   if ( fTimeAnalysis ) {
 374     if ( icsector < 36 ) // IROC
 375       fTimeSignal[icRow][icPad].AddAt(fTimeSignal[icRow][icPad].At(icTimeBin)+csignal, icTimeBin);
 376     else
 377       fTimeSignal[icRow+63][icPad].AddAt(fTimeSignal[icRow+63][icPad].At(icTimeBin)+csignal, icTimeBin);
 378   }
 379   //return if we are out of the specified time bin or adc range
 380   if ( (icTimeBin>fLastTimeBin) || (icTimeBin<fFirstTimeBin) ) return 0;
 381   if ( ((Int_t)csignal>fAdcMax) || ((Int_t)csignal<fAdcMin)  ) return 0;
 382
 383   Int_t iChannel  = fROC->GetRowIndexes(icsector)[icRow]+icPad; //  global pad position in sector
 384
 385   // fast filling method
 386   // Attention: the entry counter of the histogram is not increased
 387   //            this means that e.g. the colz draw option gives an empty plot
 388   Int_t bin = (iChannel+1)*(fAdcMax-fAdcMin+2)+((Int_t)csignal-fAdcMin+1);
 389
 390   GetHistoPedestal(icsector,kTRUE)->GetArray()[bin]++;
 391
 392   return 0;
 393 }
 394
 395
 396 //_____________________________________________________________________
 397 Bool_t AliTPCCalibPedestal::TestEvent()
 398 {
 399   //
 400   //  Test event loop
 401   // fill one oroc and one iroc with random gaus
 402   //
 403
 404   gRandom->SetSeed(0);
 405
 406   for (UInt_t iSec=0; iSec<72; ++iSec){
 407     if (iSec%36>0) continue;
 408     for (UInt_t iRow=0; iRow < fROC->GetNRows(iSec); ++iRow){
 409       for (UInt_t iPad=0; iPad < fROC->GetNPads(iSec,iRow); ++iPad){
 410         for (UInt_t iTimeBin=0; iTimeBin<1024; ++iTimeBin){
 411           Float_t signal=(Int_t)(iRow+3+gRandom->Gaus(0,.7));
 412           if ( signal>0 )Update(iSec,iRow,iPad,iTimeBin,signal);
 413         }
 414       }
 415     }
 416   }
 417   return kTRUE;
 418 }
 419
 420
 421 //_____________________________________________________________________
 422 TH2F* AliTPCCalibPedestal::GetHisto(Int_t sector, TObjArray *arr,
 423                                     Int_t nbinsY, Float_t ymin, Float_t ymax,
 424                                     const Char_t *type, Bool_t force)
 425 {
 426     //
 427     // return pointer to Q histogram
 428     // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
 429     //
 430     if ( !force || arr->UncheckedAt(sector) )
 431         return (TH2F*)arr->UncheckedAt(sector);
 432
 433     // if we are forced and histogram doesn't yes exist create it
 434     Char_t name[255], title[255];
 435
 436     sprintf(name,"hCalib%s%.2d",type,sector);
 437     sprintf(title,"%s calibration histogram sector %.2d;ADC channel;Channel (pad)",type,sector);
 438
 439     // new histogram with Q calib information. One value for each pad!
 440     TH2F* hist = new TH2F(name,title,
 441                           nbinsY, ymin, ymax,
 442                           fROC->GetNChannels(sector),0,fROC->GetNChannels(sector)
 443                          );
 444     hist->SetDirectory(0);
 445     arr->AddAt(hist,sector);
 446     return hist;
 447 }
 448
 449
 450 //_____________________________________________________________________
 451 TH2F* AliTPCCalibPedestal::GetHistoPedestal(Int_t sector, Bool_t force)
 452 {
 453     //
 454     // return pointer to T0 histogram
 455     // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
 456     //
 457     TObjArray *arr = &fHistoPedestalArray;
 458     return GetHisto(sector, arr, fAdcMax-fAdcMin, fAdcMin, fAdcMax, "Pedestal", force);
 459 }
 460
 461
 462 //_____________________________________________________________________
 463 AliTPCCalROC* AliTPCCalibPedestal::GetCalRoc(Int_t sector, TObjArray* arr, Bool_t force)
 464 {
 465     //
 466     // return pointer to ROC Calibration
 467     // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
 468     //
 469     if ( !force || arr->UncheckedAt(sector) )
 470         return (AliTPCCalROC*)arr->UncheckedAt(sector);
 471
 472     // if we are forced and the histogram doesn't yet exist create it
 473
 474     // new AliTPCCalROC for T0 information. One value for each pad!
 475     AliTPCCalROC *croc = new AliTPCCalROC(sector);
 476     arr->AddAt(croc,sector);
 477     return croc;
 478 }
 479
 480
 481 //_____________________________________________________________________
 482 AliTPCCalROC* AliTPCCalibPedestal::GetCalRocPedestal(Int_t sector, Bool_t force)
 483 {
 484     //
 485     // return pointer to ROC with Pedestal data
 486     // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
 487     //
 488     TObjArray *arr = &fCalRocArrayPedestal;
 489     return GetCalRoc(sector, arr, force);
 490 }
 491
 492
 493 //_____________________________________________________________________
 494 AliTPCCalROC* AliTPCCalibPedestal::GetCalRocSigma(Int_t sector, Bool_t force)
 495 {
 496     //
 497     // return pointer to  ROC with signal witdth in sigma
 498     // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
 499     //
 500     TObjArray *arr = &fCalRocArraySigma;
 501     return GetCalRoc(sector, arr, force);
 502 }
 503 //_____________________________________________________________________
 504 AliTPCCalROC* AliTPCCalibPedestal::GetCalRocMean(Int_t sector, Bool_t force)
 505 {
 506   //
 507     // return pointer to ROC with signal mean information
 508     // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
 509   //
 510   TObjArray *arr = &fCalRocArrayMean;
 511   return GetCalRoc(sector, arr, force);
 512 }
 513
 514 //_____________________________________________________________________
 515 AliTPCCalROC* AliTPCCalibPedestal::GetCalRocRMS(Int_t sector, Bool_t force)
 516 {
 517   //
 518     // return pointer to signal width ROC Calibration
 519     // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
 520   //
 521   TObjArray *arr = &fCalRocArrayRMS;
 522   return GetCalRoc(sector, arr, force);
 523 }
 524
 525
 526 //_____________________________________________________________________
 527 void AliTPCCalibPedestal::Merge(AliTPCCalibPedestal * const ped)
 528 {
 529   //
 530   //  Merge reference histograms of sig to the current AliTPCCalibSignal
 531   //
 532   MergeBase(ped);
 533   // merge histograms
 534   for (Int_t iSec=0; iSec<72; ++iSec){
 535     TH2F *hRefPedMerge   = ped->GetHistoPedestal(iSec);
 536
 537     if ( hRefPedMerge ){
 538       TDirectory *dir = hRefPedMerge->GetDirectory(); hRefPedMerge->SetDirectory(0);
 539       TH2F *hRefPed   = GetHistoPedestal(iSec);
 540       if ( hRefPed ) hRefPed->Add(hRefPedMerge);
 541       else {
 542         TH2F *hist = new TH2F(*hRefPedMerge);
 543         hist->SetDirectory(0);
 544         fHistoPedestalArray.AddAt(hist, iSec);
 545       }
 546       hRefPedMerge->SetDirectory(dir);
 547     }
 548   }
 549
 550   // merge array
 551   // ...
 552
 553 }
 554
 555 //_____________________________________________________________________
 556 Long64_t AliTPCCalibPedestal::Merge(TCollection * const list)
 557 {
 558   //
 559   // Merge all objects of this type in list
 560   //
 561
 562   Long64_t nmerged=1;
 563
 564   TIter next(list);
 565   AliTPCCalibPedestal *ce=0;
 566   TObject *o=0;
 567
 568   while ( (o=next()) ){
 569     ce=dynamic_cast<AliTPCCalibPedestal*>(o);
 570     if (ce){
 571       Merge(ce);
 572       ++nmerged;
 573     }
 574   }
 575
 576   return nmerged;
 577 }
 578
 579 //_____________________________________________________________________
 580 void AliTPCCalibPedestal::Analyse()
 581 {
 582   //
 583   //  Calculate calibration constants
 584   //
 585
 586   Int_t nbinsAdc = fAdcMax-fAdcMin;
 587
 588   TVectorD param(4);
 589   TMatrixD dummy(3,3);
 590
 591   TH1F *hChannel=new TH1F("hChannel","hChannel",nbinsAdc,fAdcMin,fAdcMax);
 592
 593   Float_t *arrayhP=0;
 594
 595   for (Int_t iSec=0; iSec<72; ++iSec){
 596     TH2F *hP = GetHistoPedestal(iSec);
 597     if ( !hP ) continue;
 598
 599     AliTPCCalROC *rocPedestal = GetCalRocPedestal(iSec,kTRUE);
 600     AliTPCCalROC *rocSigma    = GetCalRocSigma(iSec,kTRUE);
 601     AliTPCCalROC *rocMean     = GetCalRocMean(iSec,kTRUE);
 602     AliTPCCalROC *rocRMS      = GetCalRocRMS(iSec,kTRUE);
 603
 604     arrayhP = hP->GetArray();
 605     UInt_t nChannels = fROC->GetNChannels(iSec);
 606
 607     for (UInt_t iChannel=0; iChannel<nChannels; ++iChannel){
 608       Int_t offset = (nbinsAdc+2)*(iChannel+1)+1;
 609       //calculate mean and sigma using a gaus fit
 610       //Double_t ret =
 611       AliMathBase::FitGaus(arrayhP+offset,nbinsAdc,fAdcMin,fAdcMax,&param,&dummy);
 612       // if the fitting failed set noise and pedestal to 0
 613       // is now done in AliMathBase::FitGaus !
 614 //       if ( ret == -4 ) {
 615 //      param[1]=0;
 616 //      param[2]=0;
 617 //       }
 618       if ( param[1]<fAdcMin || param[1]>fAdcMax ){
 619         param[1]=0;
 620         param[2]=0;
 621       }
 622       rocPedestal->SetValue(iChannel,param[1]);
 623       rocSigma->SetValue(iChannel,param[2]);
 624       //calculate mean and RMS using a truncated means
 625       hChannel->Set(nbinsAdc+2,arrayhP+offset-1);
 626       hChannel->SetEntries(param[3]);
 627       param[1]=0;
 628       param[2]=0;
 629       if ( param[3]>0 ) AliMathBase::TruncatedMean(hChannel,&param,fAnaMeanDown,fAnaMeanUp);
 630       rocMean->SetValue(iChannel,param[1]);
 631       rocRMS->SetValue(iChannel,param[2]);
 632     }
 633   }
 634   delete hChannel;
 635 }
 636
 637
 638 //_____________________________________________________________________
 639 void AliTPCCalibPedestal::AnalyseTime(Int_t nevents)
 640 {
 641   //
 642   // Calculate for each channel and time bin the mean pedestal. This
 643   // is used on LDC by TPCPEDESTALda to generate data used for configuration
 644   // of the pattern memory for baseline subtraction in the ALTROs.
 645   //
 646
 647   if ( nevents <= 0 ) return;
 648   if ( fTimeAnalysis ) {
 649     for (Int_t i = 0; i < 159; i++) {  // padrows
 650       for (Int_t j = 0; j < 140; j++) {  // pads per row
 651         for (Int_t k = 0; k < 1024; k++) {  // time bins per pad
 652           fTimeSignal[i][j].AddAt(fTimeSignal[i][j].At(k)/(Float_t)nevents, k);
 653         }
 654       }
 655     }
 656   }
 657 }