]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - TPC/AliTPCComparison2.C
New script added tpcCalibTrain.sh
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCComparison2.C
1 /****************************************************************************
2  *           Very important, delicate and rather obscure macro.             *
3  *                                                                          *
4  *               Creates list of "trackable" tracks,                        *
5  *             sorts tracks for matching with the ITS,                      *
6  *             calculates efficiency, resolutions etc.                      *
7  *                                                                          *
8  *           Origin: I.Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch                 *
9  * with several nice improvements by: M.Ivanov, GSI, m.ivanov@gsi.de        *
10  ****************************************************************************/
11
12 #if !defined(__CINT__) || defined(__MAKECINT__)
13 #include<fstream.h>
14 #include<TROOT.h>
15 #include<TCanvas.h>
16 #include<TClassTable.h>
17 #include<TClonesArray.h>
18 #include<TFile.h>
19 #include<TFolder.h>
20 #include<TH1.h>
21 #include<TObject.h>
22 #include<TObjArray.h>
23 #include<TParticle.h>
24 #include<TTree.h>
25 #include <AliMagF.h>
26 #include <AliRun.h>
27 #include <AliTPCtracker.h>
28 #include <alles.h>
29 #endif
30
31 /*
32   multievent comparison of reconstructed tracks with "exact tracks" 
33   from silulation
34
35 */
36
37
38 struct GoodTrackTPC {
39   Int_t fEventN; //event number
40   Int_t lab;
41   Int_t code;
42   Float_t px,py,pz;
43   Float_t x,y,z;
44 };
45
46 enum tagprimary {kPrimaryCharged = 0x4000};
47
48 Int_t good_tracks(GoodTrackTPC *gt, Int_t max, Int_t firstev, Int_t eventn);
49
50 Int_t FindPrimaries(Int_t nparticles);
51
52 Int_t AliTPCComparison2(Int_t firstev=0, Int_t eventn=1) {
53
54   const Int_t MAX = 20000;
55   const Bool_t kOLD = kFALSE; // if tracking was done with a previous version
56   /***********************************************************************/
57
58   TFile *inkin = TFile::Open("rfio:galice.root");
59   //  if(gAlice)delete gAlice;   COMMENTED BECAUSE OF A BUG (IN COMPILED MODE)
60   gAlice = (AliRun*)inkin->Get("gAlice");
61   cout<<"AliRun object found on file "<<gAlice<<endl;
62   AliKalmanTrack::SetFieldMap(gAlice->Field());
63   inkin->Close();
64   /*
65     delete gAlice;  COMMENTED BECAUSE OF A BUG IN COMPILED MODE
66     gAlice = 0;
67   */
68   /***********************************************************************/
69   cerr<<"Doing comparison...\n";
70   Int_t i;
71   gBenchmark->Start("AliTPCComparison2");
72
73   TFile *cf=0; 
74   AliTPCParam *digp=0;
75   if(kOLD){
76     cf=TFile::Open("AliTPCclusters.root");
77     if (!cf->IsOpen()) {cerr<<"Can't open AliTPCclusters.root !\n"; return 1;}
78     digp= (AliTPCParam*)cf->Get("75x40_100x60_150x60");
79     if (!digp) { cerr<<"TPC parameters have not been found !\n"; return 2; }
80   }
81   ///////////
82   AliTPCtracker *tracker =0; 
83   TObjArray tarray(MAX);
84   AliTPCtrack *iotrack=0;
85   Int_t nentr= 0;
86   Int_t eventptr[1000];
87   TFile *tf=TFile::Open("AliTPCtracks.root");
88   TTree *tracktree=0;
89
90   eventptr[firstev]=0;
91   eventptr[firstev+1]=0;
92   for (Int_t event=firstev;event<eventn; event++){
93     cout<<"================================================"<<endl;
94     cout<<"Processing event "<<event<<endl;
95     cout<<"================================================"<<endl;
96     
97     char   tname[100];
98     if (eventn==-1) {
99       sprintf(tname,"TreeT_TPC");
100     }
101     else {
102       sprintf(tname,"TreeT_TPC_%d",event);
103     }
104   
105     // Load tracks
106     if (!tf->IsOpen()) {cerr<<"Can't open AliTPCtracks.root !\n"; return 3;}
107
108     tracktree=(TTree*)tf->Get(tname);
109     if (!tracktree) {cerr<<"Can't get a tree with TPC tracks !\n"; return 4;}
110     TBranch *tbranch=tracktree->GetBranch("tracks");
111     Int_t nentr0=(Int_t)tracktree->GetEntries();
112     nentr+=nentr0;
113     for (i=0; i<nentr0; i++) {
114       iotrack=new AliTPCtrack;
115       tbranch->SetAddress(&iotrack);
116       tracktree->GetEvent(i);
117       //      if(kOLD)tracker->CookLabel(iotrack,0.1);
118       tarray.AddLast(iotrack);
119     }   
120     eventptr[event+1] = nentr;  //store end of the event
121     delete tracker;
122     delete tracktree;
123   }
124   tf->Close();
125   if(kOLD)cf->Close();
126
127   GoodTrackTPC gt[MAX];
128
129   Int_t ngood=0;
130   ifstream in("good_tracks_tpc");
131   if (in) {
132     cerr<<"Reading good tracks...\n";
133     while (in>>gt[ngood].fEventN>>gt[ngood].lab>>gt[ngood].code>>
134            gt[ngood].px>>gt[ngood].py>>gt[ngood].pz>>
135            gt[ngood].x >>gt[ngood].y >>gt[ngood].z) {
136       ngood++;
137       cerr<<ngood<<"\r";
138       //cout<<ngood<<"\r";
139       if (ngood==MAX) {
140         cerr<<"Too many good tracks !\n";
141         break;
142       }
143     }
144     cout<<endl;
145     if (!in.eof()) cerr<<"Read error (good_tracks_tpc) !\n";
146   } else {
147     cerr<<"Marking good tracks (this will take a while)...\n";
148     ngood=good_tracks(gt,45000,firstev,eventn); 
149     printf("Goood %d\n", ngood);
150     ofstream out("good_tracks_tpc");
151     if (out) {
152       cout<<"File good_tracks_tpc opened\n";
153       for (Int_t ngd=0; ngd<ngood; ngd++) {
154         out<<gt[ngd].fEventN<<' '<<gt[ngd].lab<<' '<<gt[ngd].code<<' '<<
155           gt[ngd].px<<' '<<gt[ngd].py<<' '<<gt[ngd].pz<<' '<<
156           gt[ngd].x <<' '<<gt[ngd].y <<' '<<gt[ngd].z <<endl;
157       }
158     } else cerr<<"Can not open file (good_tracks_tpc) !\n";
159     out<<flush;
160     out.close();
161
162     ofstream out2("good_tracks_tpc_par");
163
164     if (out2) {
165       //cout<<"File good_tracks_tpc opened\n";
166       for (Int_t ngd=0; ngd<ngood; ngd++) {
167         Float_t pt =  TMath::Sqrt(gt[ngd].px*gt[ngd].px+gt[ngd].py*gt[ngd].py);
168         Float_t angle = 0;
169         if (TMath::Abs(pt)>0.01) angle = gt[ngd].pz/pt;
170         out2<<gt[ngd].fEventN<<"\t"<<gt[ngd].lab<<"\t"<<gt[ngd].code<<"\t"<<
171          pt<<"\t"<<angle<<"\t"<<endl;
172       }
173     } else cerr<<"Can not open file (good_tracks_tpc) !\n";
174     out2<<flush;
175     out2.close();
176
177   }
178   cerr<<"Number of good tracks : "<<ngood<<endl;
179   cout<<"Number of good tracks : "<<ngood<<endl;
180   if(ngood==0)return 5;
181   TH1F *hp=new TH1F("hp","PHI resolution",50,-20.,20.); hp->SetFillColor(4);
182   TH1F *hl=new TH1F("hl","LAMBDA resolution",50,-20,20);hl->SetFillColor(4);
183   TH1F *hpt=new TH1F("hpt","Relative Pt resolution",30,-10.,10.); 
184   hpt->SetFillColor(2); 
185   TH1F *hmpt=new TH1F("hmpt","Relative Pt resolution (pt>4GeV/c)",30,-60,60); 
186   hmpt->SetFillColor(6);
187
188   AliTPCtrack *trk=(AliTPCtrack*)tarray.UncheckedAt(0);
189
190   Double_t pmin=0.1*(100/0.299792458/0.2/trk->GetConvConst());
191   Double_t pmax=6.0+pmin;
192
193   TH1F *hgood=new TH1F("hgood","Good tracks",30,pmin,pmax);    
194   TH1F *hfound=new TH1F("hfound","Found tracks",30,pmin,pmax);
195   TH1F *hfake=new TH1F("hfake","Fake tracks",30,pmin,pmax);
196   TH1F *hg=new TH1F("hg","",30,pmin,pmax); //efficiency for good tracks
197   hg->SetLineColor(4); hg->SetLineWidth(2);
198   TH1F *hf=new TH1F("hf","Efficiency for fake tracks",30,pmin,pmax);
199   hf->SetFillColor(1); hf->SetFillStyle(3013); hf->SetLineWidth(2);
200
201   TH1F *he =new TH1F("he","dE/dX for pions with 0.4<p<0.5 GeV/c",50,0.,100.);
202   TH2F *hep=new TH2F("hep","dE/dX vs momentum",50,0.,2.,50,0.,250.);
203   hep->SetMarkerStyle(8);
204   hep->SetMarkerSize(0.4);
205
206   Int_t mingood=ngood;
207   Int_t track_notfound[MAX], itrack_notfound=0;
208   Int_t track_fake[MAX], itrack_fake=0;
209   Int_t track_multifound[MAX], track_multifound_n[MAX], itrack_multifound=0;
210   while (ngood--) {
211     Int_t lab=gt[ngood].lab,tlab=-1;
212     Float_t ptg=
213       TMath::Sqrt(gt[ngood].px*gt[ngood].px + gt[ngood].py*gt[ngood].py);
214
215     if (ptg<pmin) continue;  //  Should be 1e-33 instead pmin?
216
217     hgood->Fill(ptg);
218     Int_t ievent = gt[ngood].fEventN;
219
220     AliTPCtrack *track=0;
221     for (i=eventptr[ievent]; i<eventptr[ievent+1]; i++) {
222
223       track=(AliTPCtrack*)tarray.UncheckedAt(i);
224       tlab=track->GetLabel();
225       if (lab==TMath::Abs(tlab)) break;
226     }
227     if (i==eventptr[ievent+1]) {
228       track_notfound[itrack_notfound++]=lab;
229       continue;
230     }
231       
232     Int_t micount=0;
233     Int_t mi;
234     AliTPCtrack * mitrack;
235     for (mi=eventptr[ievent]; mi<eventptr[ievent+1]; mi++) {
236
237       mitrack=(AliTPCtrack*)tarray.UncheckedAt(mi);          
238       if (lab==TMath::Abs(mitrack->GetLabel())) micount++;
239     }
240     if (micount>1) {
241       track_multifound[itrack_multifound]=lab;
242       track_multifound_n[itrack_multifound]=micount;
243       itrack_multifound++;
244     }
245       
246     //
247     Double_t xk=gt[ngood].x;
248     if (!track) continue;
249     //    printf("Track =%p\n",track);
250     track->PropagateTo(xk);
251
252     if (lab==tlab) hfound->Fill(ptg);
253     else { 
254       track_fake[itrack_fake++]=lab;
255       hfake->Fill(ptg); 
256     }
257     Double_t par[5]; track->GetExternalParameters(xk,par);
258     Float_t phi=TMath::ASin(par[2]) + track->GetAlpha();
259     if (phi<-TMath::Pi()) phi+=2*TMath::Pi();
260     if (phi>=TMath::Pi()) phi-=2*TMath::Pi();
261     Float_t lam=TMath::ATan(par[3]); 
262     Float_t pt_1=TMath::Abs(par[4]);
263
264     if (TMath::Abs(gt[ngood].code)==11 && ptg>4.) {
265       hmpt->Fill((pt_1 - 1/ptg)/(1/ptg)*100.);
266     } 
267     //else 
268     {
269       Float_t phig=TMath::ATan2(gt[ngood].py,gt[ngood].px);
270       hp->Fill((phi - phig)*1000.);
271
272       Float_t lamg=TMath::ATan2(gt[ngood].pz,ptg);
273       hl->Fill((lam - lamg)*1000.);
274
275       hpt->Fill((pt_1 - 1/ptg)/(1/ptg)*100.);
276     }
277
278     Float_t mom=1./(pt_1*TMath::Cos(lam));
279     Float_t dedx=track->GetdEdx();
280     hep->Fill(mom,dedx,1.);
281     if (TMath::Abs(gt[ngood].code)==211)
282       if (mom>0.4 && mom<0.5) {
283         he->Fill(dedx,1.);
284       }
285
286   }
287
288   cout<<"\nList of Not found tracks :\n";
289   for ( i = 0; i< itrack_notfound; i++){
290     cout<<track_notfound[i]<<"\t";
291     if ((i%5)==4) cout<<"\n";
292   }
293   cout<<"\nList of fake  tracks :\n";
294   for ( i = 0; i< itrack_fake; i++){
295     cout<<track_fake[i]<<"\t";
296     if ((i%5)==4) cout<<"\n";
297   }
298   cout<<"\nList of multiple found tracks :\n";
299   for ( i=0; i<itrack_multifound; i++) {
300     cout<<"id.   "<<track_multifound[i]
301         <<"     found - "<<track_multifound_n[i]<<"times\n";
302   }
303   
304   Stat_t ng=hgood->GetEntries(), nf=hfound->GetEntries();
305   if (ng!=0) cerr<<"\n\nIntegral efficiency is about "<<nf/ng*100.<<" %\n";
306   if (ng!=0) cout<<"\n\nIntegral efficiency is about "<<nf/ng*100.<<" %\n";
307   cout<<"Total number of found tracks ="<<nentr<<endl;
308   cout<<"Total number of \"good\" tracks ="
309       <<mingood<<"   (selected for comparison: "<<ng<<')'<<endl<<endl;
310
311    
312   gStyle->SetOptStat(111110);
313   gStyle->SetOptFit(1);
314
315   TCanvas *c1=new TCanvas("c1","",0,0,700,850);
316
317   TPad *p1=new TPad("p1","",0,0.3,.5,.6); p1->Draw();
318   p1->cd(); p1->SetFillColor(42); p1->SetFrameFillColor(10); 
319   hp->SetFillColor(4);  hp->SetXTitle("(mrad)"); hp->Fit("gaus"); c1->cd();
320
321   TPad *p2=new TPad("p2","",0.5,.3,1,.6); p2->Draw(); 
322   p2->cd(); p2->SetFillColor(42); p2->SetFrameFillColor(10);
323   hl->SetXTitle("(mrad)"); hl->Fit("gaus"); c1->cd();
324
325   TPad *p3=new TPad("p3","",0,0,0.5,0.3); p3->Draw();
326   p3->cd(); p3->SetFillColor(42); p3->SetFrameFillColor(10); 
327   hpt->SetXTitle("(%)"); hpt->Fit("gaus"); c1->cd();
328
329   TPad *p4=new TPad("p4","",0.5,0,1,0.3); p4->Draw();
330   p4->cd(); p4->SetFillColor(42); p4->SetFrameFillColor(10);
331   hmpt->SetXTitle("(%)"); hmpt->Fit("gaus"); c1->cd();
332
333   TPad *p5=new TPad("p5","",0,0.6,1,1); p5->Draw(); p5->cd(); 
334   p5->SetFillColor(41); p5->SetFrameFillColor(10);
335   hfound->Sumw2(); hgood->Sumw2(); hfake->Sumw2();
336   hg->Divide(hfound,hgood,1,1.,"b");
337   hf->Divide(hfake,hgood,1,1.,"b");
338   hg->SetMaximum(1.4);
339   hg->SetYTitle("Tracking efficiency");
340   hg->SetXTitle("Pt (GeV/c)");
341   hg->Draw();
342
343   TLine *line1 = new TLine(pmin,1.0,pmax,1.0); line1->SetLineStyle(4);
344   line1->Draw("same");
345   TLine *line2 = new TLine(pmin,0.9,pmax,0.9); line2->SetLineStyle(4);
346   line2->Draw("same");
347
348   hf->SetFillColor(1);
349   hf->SetFillStyle(3013);
350   hf->SetLineColor(2);
351   hf->SetLineWidth(2);
352   hf->Draw("histsame");
353   TText *text = new TText(0.461176,0.248448,"Fake tracks");
354   text->SetTextSize(0.05);
355   text->Draw();
356   text = new TText(0.453919,1.11408,"Good tracks");
357   text->SetTextSize(0.05);
358   text->Draw();
359
360
361
362   TCanvas *c2=new TCanvas("c2","",320,32,530,590);
363
364   TPad *p6=new TPad("p6","",0.,0.,1.,.5); p6->Draw();
365   p6->cd(); p6->SetFillColor(42); p6->SetFrameFillColor(10); 
366   he->SetFillColor(2); he->SetFillStyle(3005);  
367   he->SetXTitle("Arbitrary Units"); 
368   he->Fit("gaus"); c2->cd();
369
370   TPad *p7=new TPad("p7","",0.,0.5,1.,1.); p7->Draw(); 
371   p7->cd(); p7->SetFillColor(42); p7->SetFrameFillColor(10);
372   hep->SetXTitle("p (Gev/c)"); hep->SetYTitle("dE/dX (Arb. Units)"); 
373   hep->Draw(); c1->cd();
374
375   gBenchmark->Stop("AliTPCComparison2");
376   gBenchmark->Show("AliTPCComparison2");
377
378
379   return 0;
380 }
381
382
383 Int_t good_tracks(GoodTrackTPC *gt, Int_t max, Int_t firstev, Int_t eventn) {
384   //eventn  - number of events in file
385
386   TFile *file=TFile::Open("galice.root");
387   if (!file->IsOpen()) {cerr<<"Can't open galice.root !\n"; exit(4);}
388   //  delete gAlice; gAlice = 0;
389   if (!(gAlice=(AliRun*)file->Get("gAlice"))) {
390     cerr<<"gAlice have not been found on galice.root !\n";
391     exit(5);
392   }
393
394   TFile *fdigit = TFile::Open("digits.root");
395   file->cd();
396
397   AliTPC *TPC=(AliTPC*)gAlice->GetDetector("TPC");
398   Int_t ver = TPC->IsVersion(); 
399   cerr<<"TPC version "<<ver<<" has been found !\n";
400
401   AliTPCParam *digp=(AliTPCParam*)file->Get("75x40_100x60");
402   if(digp){
403     cerr<<"2 pad-lenght geom hits with 3 pad-length geom digits...\n";
404     delete digp;
405     digp = new AliTPCParamSR();
406    }
407    else
408    {
409      digp =(AliTPCParam*)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60");
410    }
411
412   if (!digp) { cerr<<"TPC parameters have not been found !\n"; exit(6); }
413   TPC->SetParam(digp);
414
415   Int_t nrow_up=digp->GetNRowUp();
416   Int_t nrows=digp->GetNRowLow()+nrow_up;
417   Int_t zero=digp->GetZeroSup();
418   Int_t gap=Int_t(0.125*nrows), shift=Int_t(0.5*gap);
419   Int_t good_number=Int_t(0.4*nrows);
420
421   Int_t nt=0;  //reset counter
422   char treeName[100];  //declare event identifier
423        
424   for (Int_t event=firstev;event<eventn;event++){
425     Int_t np=gAlice->GetEvent(event);
426     Int_t nopr = FindPrimaries(np);
427     cout<<"function good_tracks -- event "<<event<<", Charged primaries:"<<nopr<<"\n";
428
429     Int_t *good=new Int_t[np];
430     for (Int_t ii=0; ii<np; ii++) good[ii]=0;
431      
432      
433     Int_t sectors_by_rows=0;
434     TTree *TD=0;
435     AliSimDigits da, *digits=&da;
436     Int_t *count=0;
437     switch (ver) {
438     case 1:
439       {
440         TFile *cf=TFile::Open("AliTPCclusters.root");
441         if (!cf->IsOpen()){cerr<<"Can't open AliTPCclusters.root !\n";exit(5);}
442         AliTPCClustersArray *ca=new AliTPCClustersArray;
443         ca->Setup(digp);
444         ca->SetClusterType("AliTPCcluster");
445         ca->ConnectTree("TreeC_TPC_0");
446         Int_t nrows=Int_t(ca->GetTree()->GetEntries());
447         for (Int_t n=0; n<nrows; n++) {
448           AliSegmentID *s=ca->LoadEntry(n);
449           Int_t sec,row;
450           digp->AdjustSectorRow(s->GetID(),sec,row);
451           AliTPCClustersRow &clrow = *ca->GetRow(sec,row);
452           Int_t ncl=clrow.GetArray()->GetEntriesFast();
453           while (ncl--) {
454             AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)clrow[ncl];
455             Int_t lab=c->GetLabel(0);
456             if (lab<0) continue; //noise cluster
457             lab=TMath::Abs(lab);
458             if (sec>=digp->GetNInnerSector())
459               if (row==nrow_up-1    ) good[lab]|=0x1000;
460             if (sec>=digp->GetNInnerSector())
461               if (row==nrow_up-1-gap) good[lab]|=0x800;
462             good[lab]++;
463           }
464           ca->ClearRow(sec,row);
465         }
466         delete ca;
467         cf->Close();
468       }
469       break;
470     case 2:
471       {
472         sprintf(treeName,"TreeD_75x40_100x60_150x60_%d",event);  
473         TD=(TTree*)fdigit->Get(treeName); // To be revised according to
474                                           // NewIO schema M.Kowalski
475         TD->GetBranch("Segment")->SetAddress(&digits);
476         count = new Int_t[np];
477         Int_t i;
478         for (i=0; i<np; i++) count[i]=0;
479         sectors_by_rows=(Int_t)TD->GetEntries();
480         for (i=0; i<sectors_by_rows; i++) {
481           if (!TD->GetEvent(i)) continue;
482           Int_t sec,row;
483           digp->AdjustSectorRow(digits->GetID(),sec,row);
484           digits->First();
485           digits->ExpandTrackBuffer();
486           do { //Many thanks to J.Chudoba who noticed this
487             Int_t it=digits->CurrentRow(), ip=digits->CurrentColumn();
488             //            Short_t dig = digits->GetDigit(it,ip);
489             Short_t dig = digits->CurrentDigit();
490
491             Int_t idx0=digits->GetTrackIDFast(it,ip,0)-2; 
492             Int_t idx1=digits->GetTrackIDFast(it,ip,1)-2;
493             Int_t idx2=digits->GetTrackIDFast(it,ip,2)-2;
494             if (idx0>=0 && dig>=zero && idx0<np ) count[idx0]+=1;   //background events - higher track ID's
495             if (idx1>=0 && dig>=zero && idx1<np ) count[idx1]+=1;
496             if (idx2>=0 && dig>=zero && idx2<np ) count[idx2]+=1;
497           } while (digits->Next());
498           for (Int_t j=0; j<np; j++) {
499             if (count[j]>1) {
500               if (sec>=digp->GetNInnerSector())
501                 if (row==nrow_up-1    ) good[j]|=0x4000;
502               if (sec>=digp->GetNInnerSector())
503                 if (row==nrow_up-1-gap) good[j]|=0x1000;
504
505               if (sec>=digp->GetNInnerSector())
506                 if (row==nrow_up-1-shift) good[j]|=0x2000;
507               if (sec>=digp->GetNInnerSector())
508                 if (row==nrow_up-1-gap-shift) good[j]|=0x800;
509               good[j]++;
510             }
511             count[j]=0;
512           }
513
514         }
515         delete[] count;
516         delete TD; //Thanks to Mariana Bondila
517       }
518       break;
519     default:
520       cerr<<"Invalid TPC version !\n";
521       file->Close();
522       exit(7);
523     }
524   
525     /** select tracks which are "good" enough **/
526     //printf("\t %d \n",np);
527     for (Int_t i=0; i<np; i++) {
528       if ((good[i]&0x5000) != 0x5000)
529         if ((good[i]&0x2800) != 0x2800) continue;
530       if ((good[i]&0x7FF ) < good_number) continue;
531
532       TParticle *p = (TParticle*)gAlice->Particle(i);
533
534       if (p->Pt()<0.100) continue;
535       if (TMath::Abs(p->Pz()/p->Pt())>0.999) continue;
536       //  THIS IS GOOD IF YOU WANT SECONDARIES
537         Int_t j=p->GetFirstMother();
538         if (j>=0) {
539         TParticle *pp = (TParticle*)gAlice->Particle(j);
540         //if (!(pp->TestBit(kPrimaryCharged))) continue; //only one decay is allowed
541         }
542       
543         if(!(p->TestBit(kPrimaryCharged)))continue; // only primaries
544         //      printf("1");
545   
546       gt[nt].fEventN=event;
547       gt[nt].lab=i;
548       gt[nt].code=p->GetPdgCode();
549       gt[nt].px=0.; gt[nt].py=0.; gt[nt].pz=0.;
550       gt[nt].x=0.; gt[nt].y=0.; gt[nt].z=0.;
551       nt++;
552       if (nt==max) {cerr<<"Too many good tracks !\n"; break;}
553       cerr<<np-i<<"        \r";    
554     }
555
556     /** check if there is also information at the entrance of the TPC **/
557     TTree *TH=gAlice->TreeH(); np=(Int_t)TH->GetEntries();
558     cout<<endl;
559     for (Int_t i=0; i<np; i++) {
560       TPC->ResetHits();
561       TH->GetEvent(i);
562       AliTPChit *phit = (AliTPChit*)TPC->FirstHit(-1);
563       for ( ; phit; phit=(AliTPChit*)TPC->NextHit() ) {
564         if (phit->fQ !=0. ) continue;
565
566         Double_t px=phit->X(), py=phit->Y(), pz=phit->Z();
567
568         if ((phit=(AliTPChit*)TPC->NextHit())==0) break;
569         if (phit->fQ != 0.) continue;
570
571         Double_t x=phit->X(), y=phit->Y(), z=phit->Z();
572         if (TMath::Sqrt(x*x+y*y)>90.) continue;
573
574         Int_t j, lab=phit->Track();
575         for (j=0; j<nt; j++) {if (gt[j].fEventN==event && gt[j].lab==lab) break;}
576         if (j==nt) continue;         
577         //printf("1-");
578         // (px,py,pz) - in global coordinate system, (x,y,z) - in local !
579         gt[j].px=px; gt[j].py=py; gt[j].pz=pz;
580         Float_t cs,sn; digp->AdjustCosSin(phit->fSector,cs,sn);
581         gt[j].x = x*cs + y*sn;
582         gt[j].y =-x*sn + y*cs;
583         gt[j].z = z;
584       }
585       cerr<<np-i<<"        \r";
586     }
587     //printf("\n%d\n",nt);
588     cout<<endl;
589     delete[] good;
590   }             // ///         loop on events
591   delete gAlice; gAlice=0;
592
593   file->Close();
594   gBenchmark->Stop("AliTPCComparison2");
595   gBenchmark->Show("AliTPCComparison2");   
596   return nt;
597
598 }
599
600 Int_t FindPrimaries(Int_t nparticles){
601
602   // cuts:
603   Double_t vertcut = 0.001;
604   Double_t decacut = 3.;
605   Double_t timecut = 0.;
606   Int_t nprch1=0;
607   TParticle * part = gAlice->Particle(0);
608   Double_t xori = part->Vx();
609   Double_t yori = part->Vy();
610   Double_t zori = part->Vz();
611   for(Int_t iprim = 0; iprim<nparticles; iprim++){   //loop on  tracks
612
613     part = gAlice->Particle(iprim);
614     Double_t ptot=TMath::Sqrt(part->Px()*part->Px()+part->Py()*part->Py()+part->Pz()*part->Pz());
615     if (ptot<0.01) continue;
616     char *xxx=strstr(part->GetName(),"XXX");
617     if(xxx)continue;
618
619     TParticlePDG *ppdg = part->GetPDG();
620     if(TMath::Abs(ppdg->Charge())!=3)continue;  // only charged (no quarks)
621
622     Double_t dist=TMath::Sqrt((part->Vx()-xori)*(part->Vx()-xori)+(part->Vy()-yori)*(part->Vy()-yori)+(part->Vz()-zori)*(part->Vz()-zori));
623     if(dist>vertcut)continue;  // cut on the vertex
624
625     if(part->T()>timecut)continue;
626
627     //Double_t ptot=TMath::Sqrt(part->Px()*part->Px()+part->Py()*part->Py()+part->Pz()*part->Pz());
628     if(ptot==(TMath::Abs(part->Pz())))continue; // no beam particles
629
630     Bool_t prmch = kTRUE;   // candidate primary track
631     Int_t fidau=part->GetFirstDaughter();  // cut on daughters
632     Int_t lasdau=0;
633     Int_t ndau=0;
634     if(fidau>=0){
635       lasdau=part->GetLastDaughter();
636       ndau=lasdau-fidau+1;
637     }
638     if(ndau>0){
639       for(Int_t j=fidau;j<=lasdau;j++){
640         TParticle *dau=gAlice->Particle(j);
641         Double_t distd=TMath::Sqrt((dau->Vx()-xori)*(dau->Vx()-xori)+(dau->Vy()-yori)*(dau->Vy()-yori)+(dau->Vz()-zori)*(dau->Vz()-zori));
642         if(distd<decacut)prmch=kFALSE;  // eliminate if the decay is near the vertex
643       }
644     }
645
646     if(prmch){
647       nprch1++;
648       part->SetBit(kPrimaryCharged);
649     }
650   }
651
652   return nprch1;
653 }
654