TPC/AliTPCcalibDButil.h

   1 #ifndef ALITPCCALIBDBUTIL_H
   2 #define ALITPCCALIBDBUTIL_H
   3
   4 /* Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   5  * See cxx source for full Copyright notice                               */
   6
   7 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   8 //                                                                           //
   9 // Class providing the calculation of derived quantities (mean,rms,fits,...) //
  10 //       of calibration entries                                              //
  11 //                                                                           //
  12 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  13
  14 #include <TObject.h>
  15 #include <TArrayI.h>
  16 #include <TVectorDfwd.h>
  17 #include <TVectorFfwd.h>
  18 #include <TMatrixDfwd.h>
  19
  20 class TGraph;
  21 class TMap;
  22 class AliDCSSensorArray;
  23 class AliTPCcalibDB;
  24 class AliTPCCalPad;
  25 class AliTPCCalROC;
  26 class AliTPCmapper;
  27 class AliTPCCalibRaw;
  28 class AliCDBEntry;
  29 class AliDCSSensor;
  30 class AliDCSSensorArray;
  31 class AliTPCSensorTempArray;
  32 class AliTPCdataQA;
  33 class TGraphErrors;
  34 class TTreeSRedirector;
  35 class AliTPCCalROC;
  36
  37
  38 class AliTPCcalibDButil : public TObject
  39 {
  40 public:
  41   AliTPCcalibDButil();
  42   virtual ~AliTPCcalibDButil();
  43
  44   void UpdateFromCalibDB();
  45   //data processing functions
  46   void ProcessCEdata(const char* fitFormula, TVectorD &fitResultsA, TVectorD &fitResultsC,
  47                      Int_t &noutliersCE, Double_t & chi2A, Double_t &chi2C, AliTPCCalPad * const outCE=0);
  48   void ProcessCEgraphs(TVectorD &vecTEntries, TVectorD &vecTMean, TVectorD &vecTRMS, TVectorD &vecTMedian,
  49                        TVectorD &vecQEntries, TVectorD &vecQMean, TVectorD &vecQRMS, TVectorD &vecQMedian,
  50                        Float_t &driftTimeA, Float_t &driftTimeC );
  51   void ProcessNoiseData(TVectorD &vNoiseMean, TVectorD &vNoiseMeanSenRegions,
  52                         TVectorD &vNoiseRMS, TVectorD &vNoiseRMSSenRegions,
  53                         Int_t &nonMaskedZero, Int_t &nNaN);
  54   void ProcessPulser(TVectorD &vMeanTime);
  55   void ProcessALTROConfig(Int_t &nMasked);
  56   void ProcessGoofie(TVectorD & vecEntries, TVectorD & vecMedian, TVectorD &vecMean, TVectorD &vecRMS);
  57
  58   //processing functions using reference data
  59   void ProcessPedestalVariations(TVectorF &pedestalDeviations);
  60   void ProcessNoiseVariations(TVectorF &noiseDeviations);
  61   void ProcessPulserVariations(TVectorF &pulserQdeviations, Float_t &varQMean, Int_t &npadsOutOneTB, Int_t &npadsOffAdd);
  62
  63   //getter preprocess information
  64   Int_t GetNPulserOutliers() const {return fNpulserOutliers;}
  65   Float_t GetMeanAltro(const AliTPCCalROC *roc, const Int_t row, const Int_t pad, AliTPCCalROC * const rocOut=0x0);
  66   AliTPCCalPad *GetPulserOutlierMap() const {return fPulserOutlier;}
  67
  68   //getters ref data
  69   TMap *GetReferenceMap() const {return fRefMap;}
  70   Int_t GetReferenceRun(const char* type) const;
  71   const char* GetRefValidity() const {return fRefValidity.Data();}
  72
  73   AliTPCCalPad* GetRefPadNoise() const {return fRefPadNoise;}
  74   AliTPCCalPad* GetRefPedestals() const {return fRefPedestals;}
  75   AliTPCCalPad* GetRefPedestalMasked() const {return fRefPedestalMasked;}
  76   AliTPCCalPad* GetRefPulserTmean() const {return fRefPulserTmean;}
  77   AliTPCCalPad* GetRefPulserTrms() const {return fRefPulserTrms;}
  78   AliTPCCalPad* GetRefPulserQmean() const {return fRefPulserQmean;}
  79   AliTPCCalPad* GetRefPulserOutlier() const {return fRefPulserOutlier;}
  80   AliTPCCalPad* GetRefPulserMasked() const {return fRefPulserMasked;}
  81   AliTPCCalPad* GetRefCETmean() const {return fRefCETmean;}
  82   AliTPCCalPad* GetRefCETrms() const {return fRefCETrms;}
  83   AliTPCCalPad* GetRefCEQmean() const {return fRefCEQmean;}
  84   AliTPCCalPad* GetRefCEMasked() const {return fRefCEMasked;}
  85   AliTPCCalPad* GetRefALTROFPED() const {return fRefALTROFPED;}
  86   AliTPCCalPad* GetRefALTROZsThr() const {return fRefALTROZsThr;}
  87   AliTPCCalPad* GetRefALTROAcqStart() const {return fRefALTROAcqStart;}
  88   AliTPCCalPad* GetRefALTROAcqStop() const {return fRefALTROAcqStop;}
  89   AliTPCCalPad* GetRefALTROMasked() const {return fRefALTROMasked;}
  90
  91
  92   //setters for pad by pad information
  93   void SetPulserData(AliTPCCalPad * const tmean, AliTPCCalPad * const trms=0x0, AliTPCCalPad * const qmean=0x0)
  94                 {fPulserTmean=tmean; fPulserTrms=trms; fPulserQmean=qmean;}
  95   void SetCEData(AliTPCCalPad *const tmean, AliTPCCalPad *const trms=0x0, AliTPCCalPad *const qmean=0x0)
  96                 {fCETmean=tmean; fCETrms=trms; fCEQmean=qmean;}
  97   void SetNoisePedestal(AliTPCCalPad *const noise, AliTPCCalPad *const pedestal=0x0)
  98                 {fPadNoise=noise; fPedestals=pedestal;}
  99   void SetALTROData(AliTPCCalPad *const masked)
 100                 {fALTROMasked=masked;}
 101   void SetGoofieArray(AliDCSSensorArray *const arr) {fGoofieArray=arr;}
 102
 103   //setters for pad by pad information
 104   void SetRefFile(const char* filename);
 105   void SetReferenceRun(Int_t run=-1);
 106   void UpdateRefDataFromOCDB();
 107   void SetRefPulserData(AliTPCCalPad *const tmean, AliTPCCalPad *const trms=0x0, AliTPCCalPad *const qmean=0x0)
 108                 {fRefPulserTmean=tmean; fRefPulserTrms=trms; fRefPulserQmean=qmean;}
 109   void SetRefCEData(AliTPCCalPad *const tmean, AliTPCCalPad *const trms=0x0, AliTPCCalPad *const qmean=0x0)
 110                 {fRefCETmean=tmean; fRefCETrms=trms; fRefCEQmean=qmean;}
 111   void SetRefNoisePedestal(AliTPCCalPad *const noise, AliTPCCalPad *const pedestal=0x0)
 112                 {fRefPadNoise=noise; fRefPedestals=pedestal;}
 113   void SetRefALTROData(AliTPCCalPad *const masked)
 114                 {fRefALTROMasked=masked;}
 115
 116   //creation of derived pad by pad calibration data
 117   AliTPCCalPad *CreatePadTime0(Int_t model, Double_t &gyA, Double_t &gyC, Double_t &chi2A, Double_t &chi2C);
 118   //
 119   // create outlyer maps
 120   //
 121   AliTPCCalPad *CreateCEOutlyerMap(Int_t &noutliersCE, AliTPCCalPad * const ceOut=0, Float_t minSignal=10, Float_t cutTrmsMin=0.9, Float_t cutTrmsMax=1.2, Float_t cutMaxDistT=0.7);
 122   AliTPCCalPad *CreatePulserOutlyerMap(Int_t &noutliersPulser, AliTPCCalPad * const pulserOut=0, Float_t cutTime=3, Float_t cutnRMSQ=5, Float_t cutnRMSrms=5);
 123   //
 124   AliTPCCalPad *CreatePadTime0CE(TVectorD &fitResultsA, TVectorD&fitResultsC, Int_t &nOut, Double_t &chi2A, Double_t &chi2C, const char *dumpfile=0);
 125   //
 126
 127   void UpdatePulserOutlierMap();
 128   void UpdateRefPulserOutlierMap();
 129   void PulserOutlierMap(AliTPCCalPad *pulOut, const AliTPCCalPad *pulT, const AliTPCCalPad *pulQ);
 130
 131   const char* GetGUIRefTreeDefaultName();
 132
 133   Bool_t CreateGUIRefTree(const char* filename="");
 134   //
 135   // graph tools
 136   //
 137   static Double_t GetLaserTime0(Int_t run, Int_t timeStamp, Int_t deltaT, Int_t side);
 138   static TGraph* FilterGraphMedian(TGraph * const graph, Float_t sigmaCut, Double_t &medianY);
 139   static TGraph* FilterGraphMedianAbs(TGraph * graph, Float_t cut, Double_t &medianY);
 140   static TGraphErrors* FilterGraphMedianErr(TGraphErrors * graph, Float_t sigmaCut,Double_t &medianY);
 141   //
 142   static void Sort(TGraph *graph);
 143   static void SmoothGraph(TGraph *graph, Double_t delta);
 144   static Int_t     GetNearest(TGraph *graph, Double_t xref, Double_t &dx, Double_t &y);
 145   static Double_t EvalGraphConst(TGraph * const graph, Double_t xref);
 146   //
 147   // Filter sensors
 148   //
 149   static Float_t FilterSensor(AliDCSSensor * sensor, Double_t ymin, Double_t ymax, Double_t maxdy, Double_t sigmaCut);
 150   //
 151   // Filter AliRelAlignmentKalman - Alignment/Drift velocity
 152   //
 153   static TMatrixD* MakeStatRelKalman(TObjArray * const array, Float_t minFraction, Int_t minStat, Float_t maxvd);
 154   static TObjArray *SmoothRelKalman(TObjArray * const array,const TMatrixD & stat, Bool_t direction, Float_t sigmaCut);
 155   static TObjArray *SmoothRelKalman(TObjArray * const arrayP, TObjArray * const arrayM);
 156   static void FilterCE(Double_t deltaT=100, Double_t cutAbs=10, Double_t cutSigma=4., TTreeSRedirector * const pcstream=0);
 157   static void FilterTracks(Int_t run, Double_t cutSigma=20., TTreeSRedirector * const pcstream=0);
 158   static Float_t FilterTemperature(AliTPCSensorTempArray *tempArray, Double_t ymin=15, Double_t ymax=22, Double_t sigmaCut=5);
 159
 160   static   void FilterGoofie(AliDCSSensorArray * goofieArray, Double_t deltaT=2, Double_t cutSigma=4.,  Double_t minVdn=8.5, Double_t maxVdn=9.05, TTreeSRedirector * const pcstream=0);
 161   static Double_t  GetTriggerOffsetTPC(Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=86400, Double_t deltaTLaser=3600, Int_t valType=0);
 162   static Double_t  GetVDriftTPC(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=86400, Double_t deltaTLaser=3600, Int_t valType=0);
 163   static Double_t  GetVDriftTPCLaserTracks(Double_t &dist,Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=43200, Int_t side=2);
 164   static Double_t  GetVDriftTPCCE(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=43200, Int_t side=2);
 165   static Double_t  GetVDriftTPCITS(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp);
 166   static Double_t  GetTime0TPCITS(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp);
 167   Int_t MakeRunList(Int_t startRun, Int_t stopRun); // find the list of usable runs
 168   Int_t FindRunTPC(Int_t    itime, Bool_t debug=kFALSE);
 169
 170  AliTPCCalPad* GetRefCalPad(AliCDBEntry *entry, const char* objName);
 171   AliTPCCalPad* GetRefCalPad(AliCDBEntry *entry);
 172   AliTPCCalPad* GetAltroMasked(const char* cdbPath, const char* name);
 173   Bool_t HasRefChanged(const char *cdbPath);
 174   Int_t GetCurrentReferenceRun(const char* type) const;
 175   AliCDBEntry* GetRefEntry(const char* cdbPath);
 176
 177 private:
 178   AliTPCcalibDB *fCalibDB;            //pointer to calibDB object
 179   AliTPCCalPad  *fPadNoise;           //noise information
 180   AliTPCCalPad  *fPedestals;          //pedestal information
 181   AliTPCCalPad  *fPulserTmean;        //pulser mean time information
 182   AliTPCCalPad  *fPulserTrms;         //pulser rms time information
 183   AliTPCCalPad  *fPulserQmean;        //pulser mean q information
 184   AliTPCCalPad  *fPulserOutlier;      //pulser outlier map
 185   AliTPCCalPad  *fCETmean;            //central electrode mean time information
 186   AliTPCCalPad  *fCETrms;             //central electrode rms time information
 187   AliTPCCalPad  *fCEQmean;            //central electrode mean q information
 188   AliTPCCalPad  *fALTROMasked;        //ALTRO masked channels information
 189   //
 190   AliTPCCalibRaw *fCalibRaw;          //raw calibration object
 191   //
 192   AliTPCdataQA   *fDataQA;            //data qa
 193   //reference data
 194   TMap *fRefMap;                        // latest map to reference information
 195   TMap *fCurrentRefMap;                 // reference data map of entries currently loaded
 196   TString fRefValidity;                 // validity range of reference data
 197   //
 198   AliTPCCalPad  *fRefPadNoise;           //Reference noise information
 199   AliTPCCalPad  *fRefPedestals;          //Reference pedestal information
 200   AliTPCCalPad  *fRefPedestalMasked;     //Reference masked channels in pedestal run
 201   AliTPCCalPad  *fRefPulserTmean;        //Reference pulser mean time information
 202   AliTPCCalPad  *fRefPulserTrms;         //Reference pulser rms time information
 203   AliTPCCalPad  *fRefPulserQmean;        //Reference pulser mean q information
 204   AliTPCCalPad  *fRefPulserOutlier;      //Reference pulser outlier map
 205   AliTPCCalPad  *fRefPulserMasked;       //Reference masked channels in pulser run
 206   AliTPCCalPad  *fRefCETmean;            //Reference central electrode mean time information
 207   AliTPCCalPad  *fRefCETrms;             //Reference central electrode rms time information
 208   AliTPCCalPad  *fRefCEQmean;            //Reference central electrode mean q information
 209   AliTPCCalPad  *fRefCEMasked;           //Reference masked channels in laser run
 210   AliTPCCalPad  *fRefALTROFPED;          //Reference fixed pedestal value
 211   AliTPCCalPad  *fRefALTROZsThr;         //Reference zero suppression threshol
 212   AliTPCCalPad  *fRefALTROAcqStart;      //Reference accquistion start time bin
 213   AliTPCCalPad  *fRefALTROAcqStop;       //Reference accquistion stop time bin
 214   AliTPCCalPad  *fRefALTROMasked;        //Reference ALTRO masked channels information
 215   //
 216   AliTPCCalibRaw *fRefCalibRaw;          //Reference raw calibration object
 217   //
 218   AliTPCdataQA   *fRefDataQA;            //Reference data QA
 219   //
 220   AliDCSSensorArray* fGoofieArray;    //Goofie Data
 221   //
 222   AliTPCmapper  *fMapper;             //TPC mapping handler
 223   Int_t fNpulserOutliers;             //number of outliers from Pulser calibration
 224
 225   Float_t fIrocTimeOffset;               //timing offset between IROC and OROC in timebins
 226   Float_t fCETmaxLimitAbs;               //maximum variation in CE data before pads will be treated as outliers
 227   Float_t fPulTmaxLimitAbs;              //maximum variation of Pulser Signals (time) before pads will be treated as outliers
 228   Float_t fPulQmaxLimitAbs;              //maximum variation of Pulser Signals (charge) before pads will be treated as outliers
 229   Float_t fPulQminLimit;                 //minimum charge value for Pulser Signals before pads will be treated as outliers
 230
 231   //
 232   // helpers to get the run number for given time stamps
 233   //
 234   // filters
 235
 236   TArrayI fRuns;                         // run list with OCDB info
 237   TArrayI fRunsStart;                    // start time for given run
 238   TArrayI fRunsStop;                     // stop time for given run
 239
 240   AliTPCcalibDButil (const AliTPCcalibDButil& );
 241   AliTPCcalibDButil& operator= (const AliTPCcalibDButil& );
 242
 243
 244   ClassDef(AliTPCcalibDButil,0)
 245 };
 246
 247
 248 #endif