89d9eba92d5e9c7eb0ed980320693d210340e579
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCcalibTime.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /*
17 Comments to be written here:
18
19 1. What do we calibrate.
20
21   Time dependence of gain and drift velocity in order to account for changes in: temperature, pressure, gas composition.
22
23   AliTPCcalibTime *calibTime = new AliTPCcalibTime("cosmicTime","cosmicTime",0, 1213.9e+06, 1213.96e+06, 0.04e+04, 0.04e+04);
24
25 */
26
27 #include "Riostream.h"
28 #include "TDatabasePDG.h"
29 #include "TGraphErrors.h"
30 #include "TH1F.h"
31 #include "THnSparse.h"
32 #include "TList.h"
33 #include "TMath.h"
34 #include "TTimeStamp.h"
35 #include "TTree.h"
36 #include "TVectorD.h"
37 //#include "TChain.h"
38 //#include "TFile.h"
39
40 #include "AliDCSSensor.h"
41 #include "AliDCSSensorArray.h"
42 #include "AliESDEvent.h"
43 #include "AliESDInputHandler.h"
44 #include "AliESDVertex.h"
45 #include "AliESDfriend.h"
46 #include "AliLog.h"
47 #include "AliRelAlignerKalman.h"
48 #include "AliTPCCalROC.h"
49 #include "AliTPCParam.h"
50 #include "AliTPCTracklet.h"
51 #include "AliTPCcalibDB.h"
52 #include "AliTPCcalibLaser.h"
53 #include "AliTPCcalibTime.h"
54 #include "AliTPCclusterMI.h"
55 #include "AliTPCseed.h"
56 #include "AliTrackPointArray.h"
57 #include "AliTracker.h"
58 #include "AliKFVertex.h"
59 #include <AliLog.h>
60
61 ClassImp(AliTPCcalibTime)
62
63
64 AliTPCcalibTime::AliTPCcalibTime() 
65   :AliTPCcalibBase(),  
66    fMemoryMode(1), // 0 -do not fill THnSparse with residuals  1- fill only important QA THn 2 - Fill all THnsparse for calibration
67    fLaser(0),       // pointer to laser calibration
68    fDz(0),          // current delta z
69    fCutMaxD(3),        // maximal distance in rfi ditection
70    fCutMaxDz(25),      // maximal distance in rfi ditection
71    fCutTheta(0.03),    // maximal distan theta
72    fCutMinDir(-0.99),  // direction vector products
73    fCutTracks(2500),
74    fArrayLaserA(0),      //laser  fit parameters C
75    fArrayLaserC(0),      //laser  fit parameters A
76    fArrayDz(0),          //NEW! Tmap of V drifts for different triggers
77    fAlignITSTPC(0),      //alignemnt array ITS TPC match
78    fAlignTRDTPC(0),      //alignemnt array TRD TPC match 
79    fAlignTOFTPC(0),      //alignemnt array TOF TPC match
80    fTimeKalmanBin(60*15), //time bin width for kalman - 15 minutes default
81    fTimeBins(0),
82    fTimeStart(0),
83    fTimeEnd(0),
84    fPtBins(0),
85    fPtStart(0),
86    fPtEnd(0),
87    fVdriftBins(0),
88    fVdriftStart(0),
89    fVdriftEnd(0),
90    fRunBins(0),
91    fRunStart(0),
92    fRunEnd(0)
93 {  
94   //
95   // default constructor
96   //
97   AliInfo("Default Constructor");  
98   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
99     fHistVdriftLaserA[i]=0;
100     fHistVdriftLaserC[i]=0;
101   }
102   for (Int_t i=0;i<10;i++) {
103     fCosmiMatchingHisto[i]=0;
104   }
105   //
106   for (Int_t i=0;i<5;i++) {
107     fResHistoTPCCE[i]=0;
108     fResHistoTPCITS[i]=0;
109     fResHistoTPCTRD[i]=0;
110     fResHistoTPCTOF[i]=0;
111     fResHistoTPCvertex[i]=0;
112     fTPCVertex[i]=0;
113   }
114   for (Int_t i=0;i<12;i++) {
115     fTPCVertex[i]=0;
116   }
117   for (Int_t i=0;i<5;i++) {
118     fTPCVertexCorrelation[i]=0;
119   }
120   static Int_t counter=0;
121   if (1) {
122     TTimeStamp s;
123     Int_t time=s;
124     AliInfo(Form("Counter Constructor\t%d\t%d",counter,time));
125     counter++;
126   }
127
128 }
129
130 AliTPCcalibTime::AliTPCcalibTime(const Text_t *name, const Text_t *title, UInt_t StartTime, UInt_t EndTime, Int_t deltaIntegrationTimeVdrift, Int_t memoryMode)
131   :AliTPCcalibBase(),
132    fMemoryMode(memoryMode), // 0 -do not fill THnSparse with residuals  1- fill only important QA THn 2 - Fill all THnsparse for calibration
133    fLaser(0),            // pointer to laser calibration
134    fDz(0),               // current delta z
135    fCutMaxD(5*0.5356),   // maximal distance in rfi ditection
136    fCutMaxDz(40),   // maximal distance in rfi ditection
137    fCutTheta(5*0.004644),// maximal distan theta
138    fCutMinDir(-0.99),    // direction vector products
139    fCutTracks(2500),
140    fArrayLaserA(new TObjArray(1000)),      //laser  fit parameters C
141    fArrayLaserC(new TObjArray(1000)),      //laser  fit parameters A
142    fArrayDz(0),            //Tmap of V drifts for different triggers
143    fAlignITSTPC(0),      //alignemnt array ITS TPC match
144    fAlignTRDTPC(0),      //alignemnt array TRD TPC match 
145    fAlignTOFTPC(0),      //alignemnt array TOF TPC match
146    fTimeKalmanBin(60*15), //time bin width for kalman - 15 minutes default
147    fTimeBins(0),
148    fTimeStart(0),
149    fTimeEnd(0),
150    fPtBins(0),
151    fPtStart(0),
152    fPtEnd(0),
153    fVdriftBins(0),
154    fVdriftStart(0),
155    fVdriftEnd(0),
156    fRunBins(0),
157    fRunStart(0),
158    fRunEnd(0)
159 {
160   //
161   // Non deafaul constructor - to be used in the Calibration setups 
162   //
163
164   SetName(name);
165   SetTitle(title);
166   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
167     fHistVdriftLaserA[i]=0;
168     fHistVdriftLaserC[i]=0;
169   }
170
171   for (Int_t i=0;i<5;i++) {
172     fResHistoTPCCE[i]=0;
173     fResHistoTPCITS[i]=0;
174     fResHistoTPCTRD[i]=0;
175     fResHistoTPCTOF[i]=0;
176     fResHistoTPCvertex[i]=0;
177   }
178
179
180   AliInfo("Non Default Constructor");
181   fTimeBins   =(EndTime-StartTime)/deltaIntegrationTimeVdrift;
182   fTimeStart  =StartTime; //(((TObjString*)(mapGRP->GetValue("fAliceStartTime")))->GetString()).Atoi();
183   fTimeEnd    =EndTime;   //(((TObjString*)(mapGRP->GetValue("fAliceStopTime")))->GetString()).Atoi();
184   fPtBins     = 400;
185   fPtStart    = -0.04;
186   fPtEnd      =  0.04;
187   fVdriftBins = 500;
188   fVdriftStart= -0.1;
189   fVdriftEnd  =  0.1;
190   fRunBins    = 1000001;
191   fRunStart   = -1.5;
192   fRunEnd     = 999999.5;
193
194   Int_t    binsVdriftLaser[4] = {fTimeBins , fPtBins , fVdriftBins*20, fRunBins };
195   Double_t xminVdriftLaser[4] = {fTimeStart, fPtStart, fVdriftStart  , fRunStart};
196   Double_t xmaxVdriftLaser[4] = {fTimeEnd  , fPtEnd  , fVdriftEnd    , fRunEnd  };
197   TString axisTitle[4]={
198     "T",
199     "#delta_{P/T}",
200     "value",
201     "run"
202   };
203   TString histoName[3]={
204     "Loffset",
205     "Lcorr",
206     "Lgy"
207   };
208
209   
210   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
211     fHistVdriftLaserA[i] = new THnSparseF("HistVdriftLaser","HistVdriftLaser;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,binsVdriftLaser,xminVdriftLaser,xmaxVdriftLaser);
212     fHistVdriftLaserC[i] = new THnSparseF("HistVdriftLaser","HistVdriftLaser;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,binsVdriftLaser,xminVdriftLaser,xmaxVdriftLaser);
213     fHistVdriftLaserA[i]->SetName(histoName[i]);
214     fHistVdriftLaserC[i]->SetName(histoName[i]);
215     for (Int_t iaxis=0; iaxis<4;iaxis++){
216       fHistVdriftLaserA[i]->GetAxis(iaxis)->SetName(axisTitle[iaxis]);
217       fHistVdriftLaserC[i]->GetAxis(iaxis)->SetName(axisTitle[iaxis]);
218     }
219   }
220   fBinsVdrift[0] = fTimeBins;
221   fBinsVdrift[1] = fPtBins;
222   fBinsVdrift[2] = fVdriftBins;
223   fBinsVdrift[3] = fRunBins;
224   fXminVdrift[0] = fTimeStart;
225   fXminVdrift[1] = fPtStart;
226   fXminVdrift[2] = fVdriftStart;
227   fXminVdrift[3] = fRunStart;
228   fXmaxVdrift[0] = fTimeEnd;
229   fXmaxVdrift[1] = fPtEnd;
230   fXmaxVdrift[2] = fVdriftEnd;
231   fXmaxVdrift[3] = fRunEnd;
232
233   fArrayDz=new TObjArray();
234   fAlignITSTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
235   fAlignTRDTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
236   fAlignTOFTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
237   fAlignITSTPC->SetOwner(kTRUE);
238   fAlignTRDTPC->SetOwner(kTRUE);
239   fAlignTOFTPC->SetOwner(kTRUE);
240   
241
242   fCosmiMatchingHisto[0]=new TH1F("Cosmics matching","p0-all"   ,100,-10*0.5356  ,10*0.5356  );
243   fCosmiMatchingHisto[1]=new TH1F("Cosmics matching","p1-all"   ,100,-10*4.541   ,10*4.541   );
244   fCosmiMatchingHisto[2]=new TH1F("Cosmics matching","p2-all"   ,100,-10*0.01134 ,10*0.01134 );
245   fCosmiMatchingHisto[3]=new TH1F("Cosmics matching","p3-all"   ,100,-10*0.004644,10*0.004644);
246   fCosmiMatchingHisto[4]=new TH1F("Cosmics matching","p4-all"   ,100,-10*0.03773 ,10*0.03773 );
247   fCosmiMatchingHisto[5]=new TH1F("Cosmics matching","p0-isPair",100,-10*0.5356  ,10*0.5356  );
248   fCosmiMatchingHisto[6]=new TH1F("Cosmics matching","p1-isPair",100,-10*4.541   ,10*4.541   );
249   fCosmiMatchingHisto[7]=new TH1F("Cosmics matching","p2-isPair",100,-10*0.01134 ,10*0.01134 );
250   fCosmiMatchingHisto[8]=new TH1F("Cosmics matching","p3-isPair",100,-10*0.004644,10*0.004644);
251   fCosmiMatchingHisto[9]=new TH1F("Cosmics matching","p4-isPair",100,-10*0.03773 ,10*0.03773 );
252   for (Int_t i=0;i<12;i++) {
253     fTPCVertex[i]=0;
254   }
255   for (Int_t i=0;i<5;i++) {
256     fTPCVertexCorrelation[i]=0;
257   }
258   BookDistortionMaps();
259   
260 }
261
262 AliTPCcalibTime::~AliTPCcalibTime(){
263   //
264   // Virtual Destructor
265   //
266   static Int_t counter=0;
267   if (1) {
268     TTimeStamp s;
269     Int_t time=s;
270     AliInfo(Form("Counter Destructor\t%s\t%d\t%d",GetName(),counter,time));
271     counter++;
272   }
273   for(Int_t i=0;i<3;i++){
274     if(fHistVdriftLaserA[i]){
275       delete fHistVdriftLaserA[i];
276       fHistVdriftLaserA[i]=NULL;
277     }
278     if(fHistVdriftLaserC[i]){
279       delete fHistVdriftLaserC[i];
280       fHistVdriftLaserC[i]=NULL;
281     }
282   }
283   if(fArrayDz){
284     fArrayDz->SetOwner();
285     fArrayDz->Delete();
286     delete fArrayDz;
287     fArrayDz=NULL;
288   }
289   for(Int_t i=0;i<5;i++){
290     if(fCosmiMatchingHisto[i]){
291       delete fCosmiMatchingHisto[i];
292       fCosmiMatchingHisto[i]=NULL;
293     }
294   }
295
296   for (Int_t i=0;i<5;i++) {
297     delete fResHistoTPCCE[i];
298     delete fResHistoTPCITS[i];
299     delete fResHistoTPCTRD[i];
300     delete fResHistoTPCTOF[i];
301     delete fResHistoTPCvertex[i];
302     fResHistoTPCCE[i]=0;
303     fResHistoTPCITS[i]=0;
304     fResHistoTPCTRD[i]=0;
305     fResHistoTPCTOF[i]=0;
306     fResHistoTPCvertex[i]=0;
307   }
308
309   if (fTPCVertex[0]) {
310     for (Int_t i=0;i<12;i++)  delete fTPCVertex[i];
311   }
312   if (fTPCVertexCorrelation[0]) {
313     for (Int_t i=0;i<5;i++)  delete fTPCVertexCorrelation[i];
314   }
315
316   if (fAlignITSTPC){
317     fAlignITSTPC->SetOwner(kTRUE);
318     fAlignTRDTPC->SetOwner(kTRUE);
319     fAlignTOFTPC->SetOwner(kTRUE);
320     
321     fAlignITSTPC->Delete();
322     fAlignTRDTPC->Delete();
323     fAlignTOFTPC->Delete();
324     delete fAlignITSTPC;
325     delete fAlignTRDTPC;
326     delete fAlignTOFTPC;
327   }
328 }
329
330 // Bool_t AliTPCcalibTime::IsLaser(const AliESDEvent *const /*event*/) const{
331 //   //
332 //   // Indicator is laser event not yet implemented  - to be done using trigger info or event specie
333 //   //
334 //   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
335 // }
336 // Bool_t AliTPCcalibTime::IsCosmics(const AliESDEvent *const /*event*/){
337 //   //
338 //   // Indicator is cosmic event not yet implemented - to be done using trigger info or event specie
339 //   //
340
341 //   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
342 // }
343 // Bool_t AliTPCcalibTime::IsBeam(const AliESDEvent *const /*event*/) const{
344 //   //
345 //   // Indicator is physic event not yet implemented - to be done using trigger info or event specie
346 //   //
347
348 //   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
349 // }
350 void AliTPCcalibTime::ResetCurrent(){
351   //
352   //ResetCurrent
353   //
354   fDz=0; //Reset current dz
355 }
356
357
358
359 void AliTPCcalibTime::Process(AliESDEvent *event){
360   //
361   // main function to make calibration
362   //
363   if(!event) return;
364   if (event->GetNumberOfTracks()<2) return; 
365   AliESDfriend *ESDfriend=static_cast<AliESDfriend*>(event->FindListObject("AliESDfriend"));
366   if (!ESDfriend) {
367     return;
368   }
369   if (ESDfriend->TestSkipBit()) return;
370   
371   ResetCurrent();
372   //if(IsLaser  (event)) 
373   ProcessLaser (event);
374   //if(IsCosmics(event)) 
375   ProcessCosmic(event);
376   //if(IsBeam   (event)) 
377   ProcessBeam  (event);
378 }
379
380 void AliTPCcalibTime::ProcessLaser(AliESDEvent *event){
381   //
382   // Fit drift velocity using laser 
383   // 
384   // 0. cuts
385   const Int_t    kMinTracks     = 40;    // minimal number of laser tracks
386   const Int_t    kMinTracksSide = 20;    // minimal number of tracks per side
387   const Float_t  kMaxDeltaZ     = 30.;   // maximal trigger delay
388   const Float_t  kMaxDeltaV     = 0.05;  // maximal deltaV 
389   const Float_t  kMaxRMS        = 0.1;   // maximal RMS of tracks
390   //
391   /*
392     TCut cutRMS("sqrt(laserA.fElements[4])<0.1&&sqrt(laserC.fElements[4])<0.1");
393     TCut cutZ("abs(laserA.fElements[0]-laserC.fElements[0])<3");
394     TCut cutV("abs(laserA.fElements[1]-laserC.fElements[1])<0.01");
395     TCut cutY("abs(laserA.fElements[2]-laserC.fElements[2])<2");
396     TCut cutAll = cutRMS+cutZ+cutV+cutY;
397   */
398   if (event->GetNumberOfTracks()<kMinTracks) return;
399   //
400   if(!fLaser) fLaser = new AliTPCcalibLaser("laserTPC","laserTPC",kFALSE);
401   fLaser->Process(event);
402   if (fLaser->GetNtracks()<kMinTracks) return;   // small amount of tracks cut
403   if (fLaser->fFitAside->GetNrows()==0  && fLaser->fFitCside->GetNrows()==0) return;  // no fit neither a or C side
404   //
405   // debug streamer  - activate stream level
406   // Use it for tuning of the cuts
407   //
408   // cuts to be applied
409   //
410   Int_t isReject[2]={0,0};
411   //
412   // not enough tracks 
413   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[3]) < kMinTracksSide) isReject[0]|=1; 
414   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[3]) < kMinTracksSide) isReject[1]|=1; 
415   // unreasonable z offset
416   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[0])>kMaxDeltaZ)  isReject[0]|=2;
417   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[0])>kMaxDeltaZ)  isReject[1]|=2;
418   // unreasonable drift velocity
419   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[1]-1)>kMaxDeltaV)  isReject[0]|=4;
420   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[1]-1)>kMaxDeltaV)  isReject[1]|=4;
421   // big chi2
422   if (TMath::Sqrt(TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[4]))>kMaxRMS ) isReject[0]|=8;
423   if (TMath::Sqrt(TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[4]))>kMaxRMS ) isReject[1]|=8;
424
425
426
427
428   if (fStreamLevel>0){
429     printf("Trigger: %s\n",event->GetFiredTriggerClasses().Data());
430
431     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
432     if (cstream){
433       TTimeStamp tstamp(fTime);
434       (*cstream)<<"laserInfo"<<
435         "run="<<fRun<<              //  run number
436         "event="<<fEvent<<          //  event number
437         "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
438         "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
439         "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
440         //laser
441         "rejectA="<<isReject[0]<<
442         "rejectC="<<isReject[1]<<
443         "laserA.="<<fLaser->fFitAside<<
444         "laserC.="<<fLaser->fFitCside<<
445         "laserAC.="<<fLaser->fFitACside<<
446         "trigger="<<event->GetFiredTriggerClasses()<<
447         "\n";
448     }
449   }
450   //
451   // fill histos
452   //
453   TVectorD vdriftA(5), vdriftC(5),vdriftAC(6);
454   vdriftA=*(fLaser->fFitAside);
455   vdriftC=*(fLaser->fFitCside);
456   vdriftAC=*(fLaser->fFitACside);
457   Int_t npointsA=0, npointsC=0;
458   Float_t chi2A=0, chi2C=0;
459   npointsA= TMath::Nint(vdriftA[3]);
460   chi2A= vdriftA[4];
461   npointsC= TMath::Nint(vdriftC[3]);
462   chi2C= vdriftC[4];
463
464   if (npointsA>kMinTracksSide || npointsC>kMinTracksSide){
465     TVectorD *fitA = new TVectorD(6);
466     TVectorD *fitC = new TVectorD(6);
467     for (Int_t ipar=0; ipar<5; ipar++){
468       (*fitA)[ipar]=vdriftA[ipar];
469       (*fitC)[ipar]=vdriftC[ipar];
470     }
471     (*fitA)[5]=fTime;
472     (*fitC)[5]=fTime;
473     fArrayLaserA->AddLast(fitA);
474     fArrayLaserC->AddLast(fitC);
475   }
476   //
477   
478   TTimeStamp tstamp(fTime);
479   Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
480   Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
481   Double_t driftA=0, driftC=0;
482   if (vdriftA[1]>1.-kMaxDeltaV) driftA = 1./vdriftA[1]-1.;
483   if (vdriftC[1]>1.-kMaxDeltaV) driftC = 1./vdriftC[1]-1.;
484   //
485   Double_t vecDriftLaserA[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,driftA,event->GetRunNumber()};
486   Double_t vecDriftLaserC[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,driftC,event->GetRunNumber()};
487   //  Double_t vecDrift[4]      ={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,1./((*(fLaser->fFitACside))[1])-1,event->GetRunNumber()};
488
489   for (Int_t icalib=0;icalib<3;icalib++){
490     if (icalib==0){ //z0 shift
491       vecDriftLaserA[2]=vdriftA[0]/250.;
492       vecDriftLaserC[2]=vdriftC[0]/250.;
493     }
494     if (icalib==1){ //vdrel shift
495       vecDriftLaserA[2]=driftA;
496       vecDriftLaserC[2]=driftC;
497     }
498     if (icalib==2){ //gy shift - full gy - full drift
499       vecDriftLaserA[2]=vdriftA[2]/250.;
500       vecDriftLaserC[2]=vdriftC[2]/250.;
501     }
502     //if (isReject[0]==0) fHistVdriftLaserA[icalib]->Fill(vecDriftLaserA);
503     //if (isReject[1]==0) fHistVdriftLaserC[icalib]->Fill(vecDriftLaserC);
504     fHistVdriftLaserA[icalib]->Fill(vecDriftLaserA);
505     fHistVdriftLaserC[icalib]->Fill(vecDriftLaserC);
506   }
507 }
508
509 void AliTPCcalibTime::ProcessCosmic(const AliESDEvent *const event){
510   //
511   // process Cosmic event - track matching A side C side
512   //
513   if (!event) {
514     Printf("ERROR: ESD not available");
515     return;
516   }  
517   if (event->GetTimeStamp() == 0 ) {
518     Printf("no time stamp!");
519     return;
520   }
521   
522   //fd
523   // Find cosmic pairs
524   // 
525   // Track0 is choosen in upper TPC part
526   // Track1 is choosen in lower TPC part
527   //
528   const Int_t kMinClustersCross =30;
529   const Int_t kMinClusters      =80;
530   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks();
531   if (ntracks==0) return;
532   if (ntracks > fCutTracks) return;
533   
534   if (GetDebugLevel()>20) printf("Hallo world: Im here\n");
535   AliESDfriend *esdFriend=(AliESDfriend*)(((AliESDEvent*)event)->FindListObject("AliESDfriend"));
536   
537   TObjArray  tpcSeeds(ntracks);
538   Double_t vtxx[3]={0,0,0};
539   Double_t svtxx[3]={0.000001,0.000001,100.};
540   AliESDVertex vtx(vtxx,svtxx);
541   //
542   // track loop
543   //
544   TArrayI clusterSideA(ntracks);
545   TArrayI clusterSideC(ntracks);
546   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
547     clusterSideA[i]=0;
548     clusterSideC[i]=0;
549     AliESDtrack *track = event->GetTrack(i);
550     
551     const AliExternalTrackParam * trackIn = track->GetInnerParam();
552     const AliExternalTrackParam * trackOut = track->GetOuterParam();
553     if (!trackIn) continue;
554     if (!trackOut) continue;
555     
556     AliESDfriendTrack *friendTrack = esdFriend->GetTrack(i);
557     if (!friendTrack) continue;
558     if (friendTrack) ProcessSame(track,friendTrack,event);
559     if (friendTrack) ProcessAlignITS(track,friendTrack,event,esdFriend);
560     if (friendTrack) ProcessAlignTRD(track,friendTrack);
561     if (friendTrack) ProcessAlignTOF(track,friendTrack);
562     TObject *calibObject;
563     AliTPCseed *seed = 0;
564     for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
565     if (seed) {
566       tpcSeeds.AddAt(seed,i);
567       Int_t nA=0, nC=0;
568       for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
569         AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
570         if (!cl) continue;
571         if ((cl->GetDetector()%36)<18) nA++;
572         if ((cl->GetDetector()%36)>=18) nC++;
573       }
574       clusterSideA[i]=nA;
575       clusterSideC[i]=nC;
576     }
577   }
578   if (ntracks<2) return;
579   //
580   // Find pairs
581   //
582
583   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
584     AliESDtrack *track0 = event->GetTrack(i);
585     // track0 - choosen upper part
586     if (!track0) continue;
587     if (!track0->GetOuterParam()) continue;
588     if (track0->GetOuterParam()->GetAlpha()<0) continue;
589     Double_t d1[3];
590     track0->GetDirection(d1);    
591     for (Int_t j=0;j<ntracks;++j) {
592       if (i==j) continue;
593       AliESDtrack *track1 = event->GetTrack(j);   
594       //track 1 lower part
595       if (!track1) continue;
596       if (!track1->GetOuterParam()) continue;
597       if (track0->GetTPCNcls()+ track1->GetTPCNcls()< kMinClusters) continue;
598       Int_t nAC = TMath::Max( TMath::Min(clusterSideA[i], clusterSideC[j]), 
599                               TMath::Min(clusterSideC[i], clusterSideA[j]));
600       if (nAC<kMinClustersCross) continue; 
601       Int_t nA0=clusterSideA[i];
602       Int_t nC0=clusterSideC[i];
603       Int_t nA1=clusterSideA[j];
604       Int_t nC1=clusterSideC[j];
605       //      if (track1->GetOuterParam()->GetAlpha()>0) continue;
606       //
607       Double_t d2[3];
608       track1->GetDirection(d2);
609       
610       AliTPCseed * seed0 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(i);
611       AliTPCseed * seed1 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(j);
612       if (! seed0) continue;
613       if (! seed1) continue;
614       Float_t dir = (d1[0]*d2[0] + d1[1]*d2[1] + d1[2]*d2[2]);
615       Float_t dist0  = track0->GetLinearD(0,0);
616       Float_t dist1  = track1->GetLinearD(0,0);
617       //
618       // conservative cuts - convergence to be guarantied
619       // applying before track propagation
620       if (TMath::Abs(TMath::Abs(dist0)-TMath::Abs(dist1))>fCutMaxD) continue;   // distance to the 0,0
621       if (TMath::Abs(dir)<TMath::Abs(fCutMinDir)) continue;               // direction vector product
622       Float_t bz = AliTracker::GetBz();
623       Float_t dvertex0[2];   //distance to 0,0
624       Float_t dvertex1[2];   //distance to 0,0 
625       track0->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
626       track1->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
627       if (TMath::Abs(dvertex0[1])>250) continue;
628       if (TMath::Abs(dvertex1[1])>250) continue;
629       //
630       //
631       //
632       Float_t dmax = TMath::Max(TMath::Abs(dist0),TMath::Abs(dist1));
633       AliExternalTrackParam param0(*track0);
634       AliExternalTrackParam param1(*track1);
635       //
636       // Propagate using Magnetic field and correct fo material budget
637       //
638       AliTracker::PropagateTrackTo(&param0,dmax+1,TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("e-")->Mass(),3,kTRUE);
639       AliTracker::PropagateTrackTo(&param1,dmax+1,TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("e-")->Mass(),3,kTRUE);
640       //
641       // Propagate rest to the 0,0 DCA - z should be ignored
642       //
643       //Bool_t b0 = ;
644       param0.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
645       //Bool_t b1 = 
646       param1.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
647       param0.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
648       param1.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
649       Double_t xyz0[3];
650       Double_t xyz1[3];
651       param0.GetXYZ(xyz0);
652       param1.GetXYZ(xyz1);
653       Bool_t isPair = IsPair(&param0,&param1);
654       Bool_t isCross = IsCross(track0, track1);
655       Bool_t isSame = IsSame(track0, track1);
656
657       THnSparse* hist=new THnSparseF("","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
658       TString shortName=hist->ClassName();
659       shortName+="_MEAN_VDRIFT_COSMICS_";
660       delete hist;
661       hist=NULL;
662
663       if((isSame) || (isCross && isPair)){
664         if (track0->GetTPCNcls()+ track1->GetTPCNcls()> 80) {
665           fDz = param0.GetZ() - param1.GetZ();
666           Double_t sign=(nA0>nA1)? 1:-1; 
667           fDz*=sign;
668           TTimeStamp tstamp(fTime);
669           Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
670           Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
671           Double_t vecDrift[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,fDz/500.0,event->GetRunNumber()};
672           THnSparse* curHist=NULL;
673           TString name="";
674
675           name=shortName;
676           name+=event->GetFiredTriggerClasses();
677           name.ToUpper();
678           curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
679           if(!curHist){
680             curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
681             fArrayDz->AddLast(curHist);
682           }
683 //        curHist=(THnSparseF*)(fMapDz->GetValue(event->GetFiredTriggerClasses()));
684 //        if(!curHist){
685 //          curHist=new THnSparseF(event->GetFiredTriggerClasses(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
686 //          fMapDz->Add(new TObjString(event->GetFiredTriggerClasses()),curHist);
687 //        }
688           curHist->Fill(vecDrift);
689           
690           name=shortName;
691           name+="ALL";
692           name.ToUpper();
693           curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
694           if(!curHist){
695             curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
696             fArrayDz->AddLast(curHist);
697           }
698 //        curHist=(THnSparseF*)(fMapDz->GetValue("all"));
699 //        if(!curHist){
700 //          curHist=new THnSparseF("all","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
701 //          fMapDz->Add(new TObjString("all"),curHist);
702 //        }
703           curHist->Fill(vecDrift);
704         }
705       }
706       TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
707       if (fStreamLevel>0){
708         if (cstream){
709         (*cstream)<<"trackInfo"<<
710           "tr0.="<<track0<<
711           "tr1.="<<track1<<
712           "p0.="<<&param0<<
713           "p1.="<<&param1<<
714           "nAC="<<nAC<<
715           "nA0="<<nA0<<
716           "nA1="<<nA1<<
717           "nC0="<<nC0<<
718           "nC1="<<nC1<<
719           "isPair="<<isPair<<
720           "isCross="<<isCross<<
721           "isSame="<<isSame<<
722           "fDz="<<fDz<<
723           "fRun="<<fRun<<
724           "fTime="<<fTime<<
725           "\n";
726         }
727       }
728     } // end 2nd order loop        
729   } // end 1st order loop
730   
731   if (fStreamLevel>0){
732     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
733     if (cstream){
734       (*cstream)<<"timeInfo"<<
735         "run="<<fRun<<              //  run number
736         "event="<<fEvent<<          //  event number
737         "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
738         "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
739         "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
740         // Environment values
741         //
742         // accumulated values
743         //
744         "fDz="<<fDz<<          //! current delta z
745         "trigger="<<event->GetFiredTriggerClasses()<<
746         "\n";
747     }
748   }
749   if (GetDebugLevel()>20) printf("Trigger: %s\n",event->GetFiredTriggerClasses().Data());
750 }
751
752 void AliTPCcalibTime::ProcessBeam(const AliESDEvent *const event){
753   //
754   // Process beam data - calculates vartex
755   //                     from A side and C side
756   // Histogram the differences                 
757   // 
758   const Int_t kMinClusters  =80;
759   const Int_t kMinTracks    =2;      // minimal number of tracks to define the vertex
760   const Int_t kMinTracksVertex=30;   // minimal number of tracks to define the cumulative vertex
761   const Double_t kMaxTgl    =1.2;    // maximal Tgl (z angle)
762   const Double_t kMinPt     =0.2;    // minimal pt
763   const Double_t kMaxD0     =5.;     // cut on distance to the primary vertex first guess
764   const Double_t kMaxZ0     =20; 
765   const Double_t kMaxD      =2.5;    // cut on distance to the primary vertex 
766   const Double_t kMaxZ      =4;      // maximal z distance between tracks form the same side
767   const Double_t kMaxChi2   =15;     // maximal chi2 of the TPCvertex 
768   const Double_t kCumulCovarXY=0.003; //increase the error of cumul vertex 30 microns profile
769   const Double_t kCumulCovarZ=250.;  //increase the error of cumul vertex
770   const Double_t kMaxDvertex = 1.0;  // cut to accept the vertex; 
771   //
772   Int_t  flags=0;
773   const  Int_t  kBuffSize=100;
774   static Double_t deltaZ[kBuffSize]={0};
775   static Int_t counterZ=0;
776   static AliKFVertex cumulVertexA, cumulVertexC, cumulVertexAC; // cumulative vertex 
777   AliKFVertex vertexA, vertexC;
778
779   Float_t  dca0[2]={0,0};
780   Double_t dcaVertex[2]={0,0};
781   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks();
782   if (ntracks==0) return;
783   if (ntracks > fCutTracks) return;
784   //
785   AliESDfriend *esdFriend=(AliESDfriend*)(((AliESDEvent*)event)->FindListObject("AliESDfriend"));
786   //
787   // Divide tracks to A and C side tracks - using the cluster indexes
788   TObjArray tracksA(ntracks);  
789   TObjArray tracksC(ntracks);  
790   //
791   AliESDVertex *vertexSPD =  (AliESDVertex *)event->GetPrimaryVertexSPD();
792   AliESDVertex *vertex    =  (AliESDVertex *)event->GetPrimaryVertex();
793   AliESDVertex *vertexTracks =  (AliESDVertex *)event->GetPrimaryVertexTracks();
794   Double_t vertexZA[10000], vertexZC[10000];
795   //
796   Int_t ntracksA= 0;
797   Int_t ntracksC= 0;
798   //
799   for (Int_t itrack=0;itrack<ntracks;itrack++) {
800     AliESDtrack *track = event->GetTrack(itrack);
801     AliESDfriendTrack *friendTrack = esdFriend->GetTrack(itrack);
802     if (!friendTrack) continue;
803     if (TMath::Abs(track->GetTgl())>kMaxTgl) continue;
804     if (TMath::Abs(track->Pt())<kMinPt) continue;
805     const AliExternalTrackParam * trackIn  = track->GetInnerParam();
806     TObject *calibObject=0;
807     AliTPCseed *seed = 0;
808     Int_t nA=0, nC=0;
809     for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
810     if (seed) {
811       for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
812         AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
813         if (!cl) continue;
814         if ((cl->GetDetector()%36)<18) nA++;
815         if ((cl->GetDetector()%36)>=18) nC++;
816       }
817       if ((nA>kMinClusters || nC>kMinClusters) && (nA*nC==0) ){
818         track->GetImpactParameters(dca0[0],dca0[1]);
819         if (TMath::Abs(dca0[0])>kMaxD0) continue;
820         if (TMath::Abs(dca0[1])>kMaxZ0) continue;
821         AliExternalTrackParam pTPCvertex(*trackIn);
822         if (!AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPCvertex,4.+4.*TMath::Abs(dca0[0]),0.1,2,kTRUE)) continue;
823         pTPCvertex.PropagateToDCA(vertex,AliTracker::GetBz(), kMaxD, dcaVertex,0);
824         if (TMath::Abs(dcaVertex[0])>kMaxD) continue;
825         if (nA>kMinClusters &&nC==0) { tracksA.AddLast(pTPCvertex.Clone()); vertexZA[ntracksA++] = pTPCvertex.GetZ();}
826         if (nC>kMinClusters &&nA==0) {tracksC.AddLast(pTPCvertex.Clone());  vertexZC[ntracksC++] = pTPCvertex.GetZ();}
827       }
828     }
829   }
830   Double_t medianZA=TMath::Median(ntracksA, vertexZA);  // tracks median
831   Double_t medianZC=TMath::Median(ntracksC, vertexZC);  // tracks median
832   //
833   ntracksA= tracksA.GetEntriesFast();
834   ntracksC= tracksC.GetEntriesFast();
835   if (ntracksA>kMinTracks && ntracksC>kMinTracks){
836     deltaZ[counterZ%kBuffSize]=medianZA-medianZC;
837     counterZ+=1;
838     Double_t medianDelta=(counterZ>=kBuffSize)? TMath::Median(kBuffSize, deltaZ): TMath::Median(counterZ, deltaZ);
839     if (TMath::Abs(medianDelta-(medianZA-medianZC))>kMaxZ) flags+=16;
840     // increse the error of cumulative vertex at the beginning of event
841     cumulVertexA.Covariance(0,0)+=kCumulCovarXY*kCumulCovarXY;
842     cumulVertexA.Covariance(1,1)+=kCumulCovarXY*kCumulCovarXY;
843     cumulVertexA.Covariance(2,2)+=kCumulCovarZ*kCumulCovarZ;
844     cumulVertexC.Covariance(0,0)+=kCumulCovarXY*kCumulCovarXY;
845     cumulVertexC.Covariance(1,1)+=kCumulCovarXY*kCumulCovarXY;
846     cumulVertexC.Covariance(2,2)+=kCumulCovarZ*kCumulCovarZ;
847     cumulVertexAC.Covariance(0,0)+=kCumulCovarXY*kCumulCovarXY;
848     cumulVertexAC.Covariance(1,1)+=kCumulCovarXY*kCumulCovarXY;
849     cumulVertexAC.Covariance(2,2)+=kCumulCovarZ*kCumulCovarZ;
850     //
851     for (Int_t iA=0; iA<ntracksA; iA++){
852       if (flags!=0) continue;
853       AliExternalTrackParam *aliTrack =  (AliExternalTrackParam *)tracksA.At(iA);
854       if (TMath::Abs(aliTrack->GetZ()-medianZA)>kMaxZ) continue;
855       AliKFParticle part(*aliTrack,211);
856       vertexA+=part;
857     }   
858     for (Int_t iC=0; iC<ntracksC; iC++){
859       if (flags!=0) continue;
860       AliExternalTrackParam *aliTrack =  (AliExternalTrackParam *)tracksC.At(iC);
861       if (TMath::Abs(aliTrack->GetZ()-medianZC)>kMaxZ) continue;
862       AliKFParticle part(*aliTrack,211);
863       vertexC+=part;
864     }    
865     //
866     if (vertexA.GetNDF()<kMinTracks) flags+=32;
867     if (vertexC.GetNDF()<kMinTracks) flags+=32;
868     if (TMath::Abs(vertexA.Z()-medianZA)>kMaxZ) flags+=1;   //apply cuts
869     if (TMath::Abs(vertexC.Z()-medianZC)>kMaxZ) flags+=2;
870     if (TMath::Abs(vertexA.GetChi2()/vertexA.GetNDF()+vertexC.GetChi2()/vertexC.GetNDF())> kMaxChi2) flags+=4;
871     //
872     if (flags==0){
873       for (Int_t iA=0; iA<ntracksA; iA++){
874         if (flags!=0) continue;
875         AliExternalTrackParam *aliTrack =  (AliExternalTrackParam *)tracksA.At(iA);
876         if (TMath::Abs(aliTrack->GetZ()-medianZA)>kMaxZ) continue;
877         AliKFParticle part(*aliTrack,211);
878         cumulVertexA+=part;
879         cumulVertexAC+=part;
880       } 
881       for (Int_t iC=0; iC<ntracksC; iC++){
882         if (flags!=0) continue;
883         AliExternalTrackParam *aliTrack =  (AliExternalTrackParam *)tracksC.At(iC);
884         if (TMath::Abs(aliTrack->GetZ()-medianZC)>kMaxZ) continue;
885         AliKFParticle part(*aliTrack,211);
886         cumulVertexC+=part;
887         cumulVertexAC+=part;
888       }      
889       //
890       if (TMath::Abs(cumulVertexA.X()-vertexA.X())>kMaxDvertex) flags+=64;
891       if (TMath::Abs(cumulVertexA.Y()-vertexA.Y())>kMaxDvertex) flags+=64;
892       if (TMath::Abs(cumulVertexA.Z()-vertexA.Z())>kMaxDvertex) flags+=64;
893       //
894       if (TMath::Abs(cumulVertexC.X()-vertexC.X())>kMaxDvertex) flags+=64;
895       if (TMath::Abs(cumulVertexC.Y()-vertexC.Y())>kMaxDvertex) flags+=64;
896       if (TMath::Abs(cumulVertexC.Z()-vertexC.Z())>kMaxDvertex) flags+=64;
897       
898       
899       if ( flags==0 && cumulVertexC.GetNDF()>kMinTracksVertex&&cumulVertexA.GetNDF()>kMinTracksVertex){
900         Double_t cont[2]={0,fTime};
901         //
902         cont[0]= cumulVertexA.X();
903         fTPCVertex[0]->Fill(cont);
904         cont[0]= cumulVertexC.X();
905         fTPCVertex[1]->Fill(cont);
906         cont[0]= 0.5*(cumulVertexA.X()-cumulVertexC.X());
907         fTPCVertex[2]->Fill(cont);
908         cont[0]= 0.5*(cumulVertexA.X()+cumulVertexC.X())-vertexSPD->GetX();
909         fTPCVertex[3]->Fill(cont);
910         //
911         cont[0]= cumulVertexA.Y();
912         fTPCVertex[4]->Fill(cont);
913         cont[0]= cumulVertexC.Y();
914         fTPCVertex[5]->Fill(cont);
915         cont[0]= 0.5*(cumulVertexA.Y()-cumulVertexC.Y());
916         fTPCVertex[6]->Fill(cont);
917         cont[0]= 0.5*(cumulVertexA.Y()+cumulVertexC.Y())-vertexSPD->GetY();
918         fTPCVertex[7]->Fill(cont);
919         //
920         //
921         cont[0]= 0.5*(cumulVertexA.Z()+cumulVertexC.Z());
922         fTPCVertex[8]->Fill(cont);
923         cont[0]= 0.5*(cumulVertexA.Z()-cumulVertexC.Z());
924         fTPCVertex[9]->Fill(cont);
925         cont[0]= 0.5*(cumulVertexA.Z()-cumulVertexC.Z());
926         fTPCVertex[10]->Fill(cont);      
927         cont[0]= 0.5*(cumulVertexA.Z()+cumulVertexC.Z())-vertexSPD->GetZ();
928         fTPCVertex[11]->Fill(cont);
929         //
930         Double_t correl[2]={0,0};
931         //
932         correl[0]=cumulVertexC.Z();
933         correl[1]=cumulVertexA.Z();
934         fTPCVertexCorrelation[0]->Fill(correl);   // fill A side :TPC
935         correl[0]=cumulVertexA.Z();
936         correl[1]=cumulVertexC.Z(); 
937         fTPCVertexCorrelation[1]->Fill(correl);   // fill C side :TPC
938         //
939         correl[0]=vertexSPD->GetZ();
940         correl[1]=cumulVertexA.Z()-correl[0];
941         fTPCVertexCorrelation[2]->Fill(correl);   // fill A side :ITS
942         correl[1]=cumulVertexC.Z()-correl[0]; 
943         fTPCVertexCorrelation[3]->Fill(correl);   // fill C side :ITS
944         correl[1]=0.5*(cumulVertexA.Z()+cumulVertexC.Z())-correl[0]; 
945         fTPCVertexCorrelation[4]->Fill(correl);   // fill C side :ITS
946       }
947     }        
948     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
949     if (cstream){
950       /*
951         TCut cutChi2= "sqrt(vA.fChi2/vA.fNDF+vC.fChi2/vC.fNDF)<10";  // chi2 Cut e.g 10         
952         TCut cutXY= "sqrt((vA.fP[0]-vC.fP[0])^2+(vA.fP[0]-vC.fP[1])^2)<5";   // vertex Cut      
953         TCut cutZ= "abs(vA.fP[2]-mZA)<3&&abs(vC.fP[2]-mZC)<5";           // vertex Cut  
954         tree->Draw("sqrt(vA.fChi2/vA.fNDF)","sqrt(vA.fChi2/vA.fNDF)<100","")
955         
956       */
957       //vertexA.Print();
958       //vertexC.Print();      
959       (*cstream)<<"vertexTPC"<<
960         "flags="<<flags<<        // rejection flags
961         "vSPD.="<<vertexSPD<<    // SPD vertex
962         "vT.="<<vertexTracks<<   // track vertex
963         "v.="<<vertex<<          // esd vertex
964         "mZA="<<medianZA<<       // median Z position at vertex A side
965         "mZC="<<medianZC<<       // median Z position at vertex C side
966         "mDelta="<<medianDelta<< // median delta A side -C side
967         "counter="<<counterZ<<    // counter Z
968         //
969         "vA.="<<&vertexA<<       // vertex A side
970         "vC.="<<&vertexC<<       // vertex C side
971         "cvA.="<<&cumulVertexA<<       // cumulative vertex A side
972         "cvC.="<<&cumulVertexC<<       // cumulative vertex C side
973         "cvAC.="<<&cumulVertexAC<<       // cumulative vertex A+C side
974         "nA="<<ntracksA<<        // contributors
975         "nC="<<ntracksC<<        // contributors
976         "\n";
977     }      
978   }
979   tracksA.Delete();
980   tracksC.Delete();
981 }
982
983 void AliTPCcalibTime::Analyze(){
984   //
985   // Special macro to analyze result of calibration and extract calibration entries
986   // Not yet ported to the Analyze function yet
987   //
988 }
989
990 THnSparse* AliTPCcalibTime::GetHistoDrift(const char* name) const
991 {
992   //
993   // Get histogram for given trigger mask
994   //
995   TIterator* iterator = fArrayDz->MakeIterator();
996   iterator->Reset();
997   TString newName=name;
998   newName.ToUpper();
999   THnSparse* newHist=new THnSparseF(newName,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
1000   THnSparse* addHist=NULL;
1001   while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())){
1002     //  if(!addHist) continue;
1003     TString histName=addHist->GetName();
1004     if(!histName.Contains(newName)) continue;
1005     addHist->Print();
1006     newHist->Add(addHist);
1007   }
1008   return newHist;
1009 }
1010
1011 TObjArray* AliTPCcalibTime::GetHistoDrift() const
1012 {
1013   //
1014   // return array of histograms
1015   //
1016   return fArrayDz;
1017 }
1018
1019 TGraphErrors* AliTPCcalibTime::GetGraphDrift(const char* name){
1020   //
1021   // Make a drift velocity (delta Z) graph
1022   //
1023   THnSparse* histoDrift=GetHistoDrift(name);
1024   TGraphErrors* graphDrift=NULL;
1025   if(histoDrift){
1026     graphDrift=FitSlices(histoDrift,2,0,400,100,0.05,0.95, kTRUE);
1027     TString end=histoDrift->GetName();
1028     Int_t pos=end.Index("_");
1029     end=end(pos,end.Capacity()-pos);
1030     TString graphName=graphDrift->ClassName();
1031     graphName+=end;
1032     graphName.ToUpper();
1033     graphDrift->SetName(graphName);
1034   }
1035   return graphDrift;
1036 }
1037
1038 TObjArray* AliTPCcalibTime::GetGraphDrift(){
1039   //
1040   // make a array of drift graphs
1041   //
1042   TObjArray* arrayGraphDrift=new TObjArray();
1043   TIterator* iterator=fArrayDz->MakeIterator();
1044   iterator->Reset();
1045   THnSparse* addHist=NULL;
1046   while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())) arrayGraphDrift->AddLast(GetGraphDrift(addHist->GetName()));
1047   return arrayGraphDrift;
1048 }
1049
1050 AliSplineFit* AliTPCcalibTime::GetFitDrift(const char* name){
1051   //
1052   // Make a fit AliSplinefit  of drift velocity
1053   //
1054   TGraph* graphDrift=GetGraphDrift(name);
1055   AliSplineFit* fitDrift=NULL;
1056   if(graphDrift && graphDrift->GetN()){
1057     fitDrift=new AliSplineFit();
1058     fitDrift->SetGraph(graphDrift);
1059     fitDrift->SetMinPoints(graphDrift->GetN()+1);
1060     fitDrift->InitKnots(graphDrift,2,0,0.001);
1061     fitDrift->SplineFit(0);
1062     TString end=graphDrift->GetName();
1063     Int_t pos=end.Index("_");
1064     end=end(pos,end.Capacity()-pos);
1065     TString fitName=fitDrift->ClassName();
1066     fitName+=end;
1067     fitName.ToUpper();
1068     //fitDrift->SetName(fitName);
1069     delete graphDrift;
1070     graphDrift=NULL;
1071   }
1072   return fitDrift;
1073 }
1074
1075
1076 Long64_t AliTPCcalibTime::Merge(TCollection *const li) {
1077   //
1078   // Object specific merging procedure
1079   //
1080   TIterator* iter = li->MakeIterator();
1081   AliTPCcalibTime* cal = 0;
1082   //
1083   while ((cal = (AliTPCcalibTime*)iter->Next())) {
1084     if (!cal->InheritsFrom(AliTPCcalibTime::Class())) {
1085       Error("Merge","Attempt to add object of class %s to a %s", cal->ClassName(), this->ClassName());
1086       return -1;
1087     }
1088     for (Int_t imeas=0; imeas<3; imeas++){
1089       if (cal->GetHistVdriftLaserA(imeas) && cal->GetHistVdriftLaserA(imeas)){
1090         fHistVdriftLaserA[imeas]->Add(cal->GetHistVdriftLaserA(imeas));
1091         fHistVdriftLaserC[imeas]->Add(cal->GetHistVdriftLaserC(imeas));
1092       }
1093     }
1094     //
1095     if (fTPCVertexCorrelation[0] && cal->fTPCVertexCorrelation[0]){
1096       for (Int_t imeas=0; imeas<5; imeas++){
1097         if (fTPCVertexCorrelation[imeas] && cal->fTPCVertexCorrelation[imeas]) fTPCVertexCorrelation[imeas]->Add(cal->fTPCVertexCorrelation[imeas]);
1098       }
1099     }
1100       
1101     if (fTPCVertex[0] && cal->fTPCVertex[0]) 
1102       for (Int_t imeas=0; imeas<12; imeas++){
1103         if (fTPCVertex[imeas] && cal->fTPCVertex[imeas]) fTPCVertex[imeas]->Add(cal->fTPCVertex[imeas]);
1104       }
1105     
1106     if (fMemoryMode>0) for (Int_t imeas=0; imeas<5; imeas++){
1107       if (fMemoryMode>1){
1108         if ( cal->GetResHistoTPCCE(imeas) && cal->GetResHistoTPCCE(imeas)){
1109           fResHistoTPCCE[imeas]->Add(cal->fResHistoTPCCE[imeas]);
1110         }else{
1111           fResHistoTPCCE[imeas]=(THnSparse*)cal->fResHistoTPCCE[imeas]->Clone();
1112         }
1113       }
1114       //
1115       if ((fMemoryMode>0) &&cal->GetResHistoTPCITS(imeas) && cal->GetResHistoTPCITS(imeas)){
1116         if (fMemoryMode>1 || (imeas%2)==1) fResHistoTPCITS[imeas]->Add(cal->fResHistoTPCITS[imeas]);
1117         if (fMemoryMode>1) fResHistoTPCvertex[imeas]->Add(cal->fResHistoTPCvertex[imeas]);
1118       }
1119       //
1120       if ((fMemoryMode>1) && cal->fResHistoTPCTRD[imeas]){
1121         if (fResHistoTPCTRD[imeas])
1122           fResHistoTPCTRD[imeas]->Add(cal->fResHistoTPCTRD[imeas]);
1123         else
1124           fResHistoTPCTRD[imeas]=(THnSparse*)cal->fResHistoTPCTRD[imeas]->Clone();
1125       }
1126       //
1127       if  ((fMemoryMode>1) && cal->fResHistoTPCTOF[imeas]){
1128         if (fResHistoTPCTOF[imeas])
1129           fResHistoTPCTOF[imeas]->Add(cal->fResHistoTPCTOF[imeas]);
1130         else
1131           fResHistoTPCTOF[imeas]=(THnSparse*)cal->fResHistoTPCTOF[imeas]->Clone();      
1132       }
1133       //
1134       if (cal->fArrayLaserA){
1135         fArrayLaserA->Expand(fArrayLaserA->GetEntriesFast()+cal->fArrayLaserA->GetEntriesFast());
1136         fArrayLaserC->Expand(fArrayLaserC->GetEntriesFast()+cal->fArrayLaserC->GetEntriesFast());
1137         for (Int_t ical=0; ical<cal->fArrayLaserA->GetEntriesFast(); ical++){
1138           if (cal->fArrayLaserA->UncheckedAt(ical)) fArrayLaserA->AddLast(cal->fArrayLaserA->UncheckedAt(ical)->Clone());
1139           if (cal->fArrayLaserC->UncheckedAt(ical)) fArrayLaserC->AddLast(cal->fArrayLaserC->UncheckedAt(ical)->Clone());
1140         }
1141       }
1142
1143     }
1144     TObjArray* addArray=cal->GetHistoDrift();
1145     if(!addArray) return 0;
1146     TIterator* iterator = addArray->MakeIterator();
1147     iterator->Reset();
1148     THnSparse* addHist=NULL;
1149     if ((fMemoryMode>1)) while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())){
1150       //      if(!addHist) continue;
1151       addHist->Print();
1152       THnSparse* localHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(addHist->GetName());
1153       if(!localHist){
1154         localHist=new THnSparseF(addHist->GetName(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
1155         fArrayDz->AddLast(localHist);
1156       }
1157       localHist->Add(addHist);
1158     }
1159
1160     for(Int_t i=0;i<10;i++) if (cal->GetCosmiMatchingHisto(i)) fCosmiMatchingHisto[i]->Add(cal->GetCosmiMatchingHisto(i));
1161     //
1162     // Merge alignment
1163     //
1164     const Int_t kMinUpdates=10;
1165     const Float_t kMaxOut=0.1;
1166     for (Int_t itype=0; itype<3; itype++){
1167       //
1168       //
1169       TObjArray *arr0= 0;
1170       TObjArray *arr1= 0;
1171       if (itype==0) {arr0=fAlignITSTPC; arr1=cal->fAlignITSTPC;}
1172       if (itype==1) {arr0=fAlignTRDTPC; arr1=cal->fAlignTRDTPC;}
1173       if (itype==2) {arr0=fAlignTOFTPC; arr1=cal->fAlignTOFTPC;}
1174       if (!arr1) continue;
1175       if (!arr0) arr0=new TObjArray(arr1->GetEntriesFast());
1176       if (arr1->GetEntriesFast()>arr0->GetEntriesFast()){
1177         arr0->Expand(arr1->GetEntriesFast());
1178       }
1179       for (Int_t i=0;i<arr1->GetEntriesFast(); i++){
1180         AliRelAlignerKalman *kalman1 = (AliRelAlignerKalman *)arr1->UncheckedAt(i);
1181         AliRelAlignerKalman *kalman0 = (AliRelAlignerKalman *)arr0->UncheckedAt(i);
1182         if (!kalman1)  continue;
1183         if (kalman1->GetNUpdates()<kMinUpdates) continue;
1184         if (kalman1->GetNOutliers()>(kalman1->GetNUpdates()*kMaxOut)) continue;
1185         if (!kalman0) {arr0->AddAt(new AliRelAlignerKalman(*kalman1),i); continue;}
1186         kalman0->SetRejectOutliers(kFALSE);
1187         kalman0->Merge(kalman1);
1188       }
1189     }
1190
1191   }
1192   return 0;
1193 }
1194
1195 Bool_t  AliTPCcalibTime::IsPair(const AliExternalTrackParam *tr0, const AliExternalTrackParam *tr1){
1196   /*
1197   // 0. Same direction - OPOSITE  - cutDir +cutT    
1198   TCut cutDir("cutDir","dir<-0.99")
1199   // 1. 
1200   TCut cutT("cutT","abs(Tr1.fP[3]+Tr0.fP[3])<0.03")
1201   //
1202   // 2. The same rphi 
1203   TCut cutD("cutD","abs(Tr0.fP[0]+Tr1.fP[0])<5")
1204   //
1205   TCut cutPt("cutPt","abs(Tr1.fP[4]+Tr0.fP[4])<1&&abs(Tr0.fP[4])+abs(Tr1.fP[4])<10");  
1206   // 1/Pt diff cut
1207   */
1208   const Double_t *p0 = tr0->GetParameter();
1209   const Double_t *p1 = tr1->GetParameter();
1210   fCosmiMatchingHisto[0]->Fill(p0[0]+p1[0]);
1211   fCosmiMatchingHisto[1]->Fill(p0[1]-p1[1]);
1212   fCosmiMatchingHisto[2]->Fill(tr1->GetAlpha()-tr0->GetAlpha()+TMath::Pi());
1213   fCosmiMatchingHisto[3]->Fill(p0[3]+p1[3]);
1214   fCosmiMatchingHisto[4]->Fill(p0[4]+p1[4]);
1215   
1216   if (TMath::Abs(p0[3]+p1[3])>fCutTheta) return kFALSE;
1217   if (TMath::Abs(p0[0]+p1[0])>fCutMaxD)  return kFALSE;
1218   if (TMath::Abs(p0[1]-p1[1])>fCutMaxDz)  return kFALSE;
1219   Double_t d0[3], d1[3];
1220   tr0->GetDirection(d0);    
1221   tr1->GetDirection(d1);       
1222   if (d0[0]*d1[0] + d0[1]*d1[1] + d0[2]*d1[2] >fCutMinDir) return kFALSE;
1223
1224   fCosmiMatchingHisto[5]->Fill(p0[0]+p1[0]);
1225   fCosmiMatchingHisto[6]->Fill(p0[1]-p1[1]);
1226   fCosmiMatchingHisto[7]->Fill(tr1->GetAlpha()-tr0->GetAlpha()+TMath::Pi());
1227   fCosmiMatchingHisto[8]->Fill(p0[3]+p1[3]);
1228   fCosmiMatchingHisto[9]->Fill(p0[4]+p1[4]);
1229
1230   return kTRUE;  
1231 }
1232 Bool_t AliTPCcalibTime::IsCross(const AliESDtrack *const tr0, const AliESDtrack *const tr1){
1233   //
1234   // check if the cosmic pair of tracks crossed A/C side
1235   // 
1236   Bool_t result= tr0->GetOuterParam()->GetZ()*tr1->GetOuterParam()->GetZ()<0;
1237   if (result==kFALSE) return result;
1238   result=kTRUE;
1239   return result;
1240 }
1241
1242 Bool_t AliTPCcalibTime::IsSame(const AliESDtrack *const tr0, const AliESDtrack *const tr1){
1243   // 
1244   // track crossing the CE
1245   // 0. minimal number of clusters 
1246   // 1. Same sector +-1
1247   // 2. Inner and outer track param on opposite side
1248   // 3. Outer and inner track parameter close each to other
1249   // 3. 
1250   Bool_t result=kTRUE;
1251   //
1252   // inner and outer on opposite sides in z
1253   //
1254   const Int_t knclCut0  = 30;
1255   const Double_t kalphaCut = 0.4;
1256   //
1257   // 0. minimal number of clusters
1258   //
1259   if (tr0->GetTPCNcls()<knclCut0) return kFALSE;
1260   if (tr1->GetTPCNcls()<knclCut0) return kFALSE;
1261   //
1262   // 1. alpha cut - sector+-1
1263   //
1264   if (TMath::Abs(tr0->GetOuterParam()->GetAlpha()-tr1->GetOuterParam()->GetAlpha())>kalphaCut) return kFALSE;
1265   //
1266   // 2. Z crossing
1267   //
1268   if (tr0->GetOuterParam()->GetZ()*tr0->GetInnerParam()->GetZ()>0) result&=kFALSE;
1269   if (tr1->GetOuterParam()->GetZ()*tr1->GetInnerParam()->GetZ()>0) result&=kFALSE;
1270   if (result==kFALSE){
1271     return result;
1272   }
1273   //
1274   //
1275   const Double_t *p0I = tr0->GetInnerParam()->GetParameter();
1276   const Double_t *p1I = tr1->GetInnerParam()->GetParameter();
1277   const Double_t *p0O = tr0->GetOuterParam()->GetParameter();
1278   const Double_t *p1O = tr1->GetOuterParam()->GetParameter();
1279   //
1280   if (TMath::Abs(p0I[0]-p1I[0])>fCutMaxD)  result&=kFALSE;
1281   if (TMath::Abs(p0I[1]-p1I[1])>fCutMaxDz) result&=kFALSE;
1282   if (TMath::Abs(p0I[2]-p1I[2])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1283   if (TMath::Abs(p0I[3]-p1I[3])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1284   if (TMath::Abs(p0O[0]-p1O[0])>fCutMaxD)  result&=kFALSE;
1285   if (TMath::Abs(p0O[1]-p1O[1])>fCutMaxDz) result&=kFALSE;
1286   if (TMath::Abs(p0O[2]-p1O[2])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1287   if (TMath::Abs(p0O[3]-p1O[3])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1288   if (result==kTRUE){
1289     result=kTRUE; // just to put break point here
1290   }
1291   return result;
1292 }
1293
1294
1295 void  AliTPCcalibTime::ProcessSame(const AliESDtrack *const track, AliESDfriendTrack *const friendTrack, const AliESDEvent *const event){
1296   //
1297   // Process  TPC tracks crossing CE
1298   //
1299   // 0. Select only track crossing the CE
1300   // 1. Cut on the track length
1301   // 2. Refit the the track on A and C side separatelly
1302   // 3. Fill time histograms
1303   const Int_t kMinNcl=100;
1304   const Int_t kMinNclS=25;  // minimul number of clusters on the sides
1305   const Double_t pimass=TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("pi+")->Mass();
1306   const Double_t kMaxDy=1;  // maximal distance in y
1307   const Double_t kMaxDsnp=0.05;  // maximal distance in snp
1308   const Double_t kMaxDtheta=0.05;  // maximal distance in theta
1309   
1310   if (!friendTrack->GetTPCOut()) return;
1311   //
1312   // 0. Select only track crossing the CE
1313   //
1314   if (track->GetInnerParam()->GetZ()*friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()>0) return;
1315   //
1316   // 1. cut on track length
1317   //
1318   if (track->GetTPCNcls()<kMinNcl) return;
1319   //
1320   // 2. Refit track sepparatel on A and C side
1321   //
1322   TObject *calibObject;
1323   AliTPCseed *seed = 0;
1324   for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) {
1325     if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
1326   }
1327   if (!seed) return;
1328   //
1329   AliExternalTrackParam trackIn(*track->GetInnerParam());
1330   AliExternalTrackParam trackOut(*track->GetOuterParam());
1331   Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //use the same errors
1332   Double_t xyz[3]={0,0.,0.0};  
1333   Double_t bz   =0;
1334   Int_t nclIn=0,nclOut=0;
1335   trackIn.ResetCovariance(1000.);
1336   trackOut.ResetCovariance(1000.);
1337   //
1338   //2.a Refit inner
1339   // 
1340   Int_t sideIn=0;
1341   for (Int_t irow=0;irow<159;irow++) {
1342     AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
1343     if (!cl) continue;
1344     if (cl->GetX()<80) continue;
1345     if (sideIn==0){
1346       if (cl->GetDetector()%36<18) sideIn=1;
1347       if (cl->GetDetector()%36>=18) sideIn=-1;
1348     }
1349     if (sideIn== -1 && (cl->GetDetector()%36)<18) break;
1350     if (sideIn==  1 &&(cl->GetDetector()%36)>=18) break;
1351     Int_t sector = cl->GetDetector();
1352     Float_t dalpha = TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-trackIn.GetAlpha();
1353     if (TMath::Abs(dalpha)>0.01){
1354       if (!trackIn.Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.))) break;
1355     }
1356     Double_t r[3]={cl->GetX(),cl->GetY(),cl->GetZ()};
1357     trackIn.GetXYZ(xyz);
1358     bz = AliTracker::GetBz(xyz);
1359     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&trackIn,r[0],pimass,1.,kFALSE);
1360     if (!trackIn.PropagateTo(r[0],bz)) break;
1361     nclIn++;
1362     trackIn.Update(&r[1],cov);    
1363   }
1364   //
1365   //2.b Refit outer
1366   //
1367   Int_t sideOut=0;
1368   for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
1369     AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
1370     if (!cl) continue;
1371     if (cl->GetX()<80) continue;
1372     if (sideOut==0){
1373       if (cl->GetDetector()%36<18) sideOut=1;
1374       if (cl->GetDetector()%36>=18) sideOut=-1;
1375       if (sideIn==sideOut) break;
1376     }
1377     if (sideOut== -1 && (cl->GetDetector()%36)<18) break;
1378     if (sideOut==  1 &&(cl->GetDetector()%36)>=18) break;
1379     //
1380     Int_t sector = cl->GetDetector();
1381     Float_t dalpha = TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-trackOut.GetAlpha();
1382     if (TMath::Abs(dalpha)>0.01){
1383       if (!trackOut.Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.))) break;
1384     }
1385     Double_t r[3]={cl->GetX(),cl->GetY(),cl->GetZ()};
1386     trackOut.GetXYZ(xyz);
1387     bz = AliTracker::GetBz(xyz);
1388     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&trackOut,r[0],pimass,1.,kFALSE);
1389     if (!trackOut.PropagateTo(r[0],bz)) break;
1390     nclOut++;
1391     trackOut.Update(&r[1],cov);    
1392   }
1393   trackOut.Rotate(trackIn.GetAlpha());
1394   Double_t meanX = (trackIn.GetX()+trackOut.GetX())*0.5;
1395   trackIn.PropagateTo(meanX,bz); 
1396   trackOut.PropagateTo(meanX,bz); 
1397   if (TMath::Abs(trackIn.GetY()-trackOut.GetY())>kMaxDy) return;
1398   if (TMath::Abs(trackIn.GetSnp()-trackOut.GetSnp())>kMaxDsnp) return;
1399   if (TMath::Abs(trackIn.GetTgl()-trackOut.GetTgl())>kMaxDtheta) return;
1400   if (TMath::Min(nclIn,nclOut)>kMinNclS){
1401     FillResHistoTPCCE(&trackIn,&trackOut);
1402   }
1403   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
1404   if (cstream){
1405     TVectorD gxyz(3);
1406     trackIn.GetXYZ(gxyz.GetMatrixArray());
1407     TTimeStamp tstamp(fTime);
1408     (*cstream)<<"tpctpc"<<
1409       "run="<<fRun<<              //  run number
1410       "event="<<fEvent<<          //  event number
1411       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1412       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1413       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1414       //
1415       "sideIn="<<sideIn<<         // side at inner part
1416       "sideOut="<<sideOut<<         // side at puter part
1417       "xyz.="<<&gxyz<<             // global position
1418       "tIn.="<<&trackIn<<         // refitterd track in 
1419       "tOut.="<<&trackOut<<       // refitter track out
1420       "nclIn="<<nclIn<<           // 
1421       "nclOut="<<nclOut<<         //
1422       "\n";  
1423   }
1424   //
1425   // 3. Fill time histograms
1426   // Debug stremaer expression
1427   // chainTPCTPC->Draw("(tIn.fP[1]-tOut.fP[1])*sign(-tIn.fP[3]):tIn.fP[3]","min(nclIn,nclOut)>30","")
1428   if (TMath::Min(nclIn,nclOut)>kMinNclS){
1429     fDz = trackOut.GetZ()-trackIn.GetZ();
1430     if (trackOut.GetTgl()<0) fDz*=-1.;
1431     TTimeStamp tstamp(fTime);
1432     Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1433     Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1434     Double_t vecDrift[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,fDz/500.0,event->GetRunNumber()};
1435     //
1436     // fill histograms per trigger class and itegrated
1437     //
1438     THnSparse* curHist=NULL;
1439     for (Int_t itype=0; itype<2; itype++){
1440       TString name="MEAN_VDRIFT_CROSS_";  
1441       if (itype==0){
1442         name+=event->GetFiredTriggerClasses();
1443         name.ToUpper();
1444       }else{
1445         name+="ALL";
1446       }
1447       curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
1448       if(!curHist){
1449         curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
1450         fArrayDz->AddLast(curHist);
1451       }
1452       curHist->Fill(vecDrift);
1453     }
1454   }
1455
1456 }
1457
1458 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignITS(AliESDtrack *const track, const AliESDfriendTrack *const friendTrack, const AliESDEvent *const event, AliESDfriend *const esdFriend){
1459   //
1460   // Process track - Update TPC-ITS alignment
1461   // Updates: 
1462   // 0. Apply standartd cuts 
1463   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1464   // 2. Apply median+-rms cut
1465   // 3. Update kalman filter
1466   //
1467   const Int_t    kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1468   const Int_t    kMinITS  = 3;     // minimal number of ITS cluster
1469   const Double_t kMinZ    = 10;    // maximal dz distance
1470   const Double_t kMaxDy   = 2.;    // maximal dy distance
1471   const Double_t kMaxAngle= 0.07;  // maximal angular distance
1472   const Double_t kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1473   const Double_t kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1474   const Double_t kT0Err   = 3.;  // initial uncertainty of the T0 time
1475   const Double_t kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1476   const Double_t kOutCut  = 3.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1477   const Double_t kMinPt   = 0.3;   // minimal pt
1478   const Double_t kMax1Pt=0.5;        //maximal 1/pt distance
1479   const  Int_t     kN=50;         // deepnes of history
1480   static Int_t     kglast=0;
1481   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1482   //
1483   // 0. Apply standard cuts
1484   // 
1485   Int_t dummycl[1000];
1486   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1487   if (!track->IsOn(AliESDtrack::kTPCrefit)) return;
1488   if (!track->GetInnerParam())   return;
1489   if (!track->GetOuterParam())   return;
1490   if (track->GetInnerParam()->Pt()<kMinPt)  return;
1491   // exclude crossing track
1492   if (track->GetOuterParam()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1493   if (TMath::Abs(track->GetInnerParam()->GetZ())<kMinZ/3.)   return;
1494   if (track->GetInnerParam()->GetX()>90)   return;
1495   //
1496   AliExternalTrackParam &pTPC=(AliExternalTrackParam &)(*(track->GetInnerParam()));
1497   //  
1498   AliExternalTrackParam pITS;   // ITS standalone if possible
1499   AliExternalTrackParam pITS2;  //TPC-ITS track
1500   if (friendTrack->GetITSOut()){
1501     pITS2=(*(friendTrack->GetITSOut()));  //TPC-ITS track - snapshot ITS out
1502     pITS2.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1503     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pITS2,pTPC.GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
1504   }
1505
1506   AliESDfriendTrack *itsfriendTrack=0;
1507   //
1508   // try to find standalone ITS track corresponing to the TPC if possible
1509   //
1510   Bool_t hasAlone=kFALSE;
1511   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks();
1512   for (Int_t i=0; i<ntracks; i++){
1513     AliESDtrack * trackITS = event->GetTrack(i); 
1514     if (!trackITS) continue;
1515     if (trackITS->GetITSclusters(dummycl)<kMinITS) continue;  // minimal amount of clusters
1516     itsfriendTrack = esdFriend->GetTrack(i);
1517     if (!itsfriendTrack) continue;
1518     if (!itsfriendTrack->GetITSOut()) continue;
1519      
1520     if (TMath::Abs(pTPC.GetTgl()-itsfriendTrack->GetITSOut()->GetTgl())> kMaxAngle) continue;
1521     if (TMath::Abs(pTPC.GetSigned1Pt()-itsfriendTrack->GetITSOut()->GetSigned1Pt())> kMax1Pt) continue;
1522     pITS=(*(itsfriendTrack->GetITSOut()));
1523     //
1524     pITS.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1525     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pITS,pTPC.GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
1526     if (TMath::Abs(pTPC.GetY()-pITS.GetY())> kMaxDy) continue;
1527     if (TMath::Abs(pTPC.GetSnp()-pITS.GetSnp())> kMaxAngle) continue;
1528     hasAlone=kTRUE;
1529   }
1530   if (!hasAlone) {
1531     if (track->GetITSclusters(dummycl)<kMinITS) return;
1532     pITS=pITS2;  // use combined track if it has ITS
1533   }
1534   //
1535   if (TMath::Abs(pITS.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1536   if (TMath::Abs(pITS.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1537   if (TMath::Abs(pITS.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1538   //
1539   // 1. Update median and RMS info
1540   //
1541   TVectorD vecDelta(5),vecMedian(5), vecRMS(5);
1542   TVectorD vecDeltaN(5);
1543   Double_t sign=(pITS.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1544   vecDelta[4]=0;
1545   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1546     vecDelta[i]=(pITS.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1547     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1548   }
1549   kglast=(kglast+1);
1550   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1551   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1552     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1553     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1554     vecDeltaN[i] = 0;
1555     if (vecRMS[i]>0.){
1556       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/vecRMS[i];
1557       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1558     }
1559   }
1560   //
1561   // 2. Apply median+-rms cut
1562   //
1563   if (kglast<3)  return;   //median and RMS to be defined
1564   if ( vecDeltaN[4]/4.>kSigmaCut) return;
1565   //
1566   // 3. Update alignment
1567   //
1568   Int_t htime = (fTime-fTimeKalmanBin/2)/fTimeKalmanBin; //time bins number
1569   if (fAlignITSTPC->GetEntriesFast()<htime){
1570     fAlignITSTPC->Expand(htime*2+20);
1571   }
1572   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignITSTPC->At(htime);
1573   if (!align){
1574     // make Alignment object if doesn't exist
1575     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1576     align->SetRunNumber(fRun);
1577     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1578     (*align->GetStateCov())(7,7)=kT0Err*kT0Err;
1579     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1580     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1581     //    align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1582     align->SetRejectOutliers(kTRUE);
1583     align->SetRejectOutliersSigma2Median(kTRUE);
1584
1585     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1586     align->SetMagField(fMagF); 
1587     fAlignITSTPC->AddAt(align,htime);
1588   }
1589   align->AddTrackParams(&pITS,&pTPC);
1590   Double_t averageTime =  fTime;
1591   if (align->GetTimeStamp()>0&&align->GetNUpdates()>0){
1592     averageTime=((Double_t(align->GetTimeStamp())*Double_t(align->GetNUpdates())+Double_t(fTime)))/(Double_t(align->GetNUpdates())+1.);
1593   }
1594   align->SetTimeStamp(Int_t(averageTime));
1595
1596   align->SetRunNumber(fRun );
1597   Float_t dca[2],cov[3];
1598   track->GetImpactParameters(dca,cov);
1599   if (TMath::Abs(dca[0])<kMaxDy){
1600     FillResHistoTPCITS(&pTPC,&pITS);
1601     FillResHistoTPC(track);
1602   }
1603   //
1604   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1605   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates+1));
1606   //  align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1607   align->SetRejectOutliers(kTRUE);
1608   align->SetRejectOutliersSigma2Median(kTRUE);
1609
1610   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1611   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1612     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1613     TVectorD gpITS(3), gdITS(3);
1614     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1615     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1616     pITS.GetXYZ(gpITS.GetMatrixArray());
1617     pITS.GetDirection(gdITS.GetMatrixArray());
1618     (*cstream)<<"itstpc"<<
1619       "run="<<fRun<<              //  run number
1620       "event="<<fEvent<<          //  event number
1621       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1622       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1623       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1624       //
1625       "hasAlone="<<hasAlone<<    // has ITS standalone ?
1626       "track.="<<track<<  // track info
1627       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1628       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1629       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1630       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1631       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1632       "a.="<<align<<            // current alignment
1633       "pITS.="<<&pITS<<         // track param ITS 
1634       "pITS2.="<<&pITS2<<       // track param ITS+TPC
1635       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1636       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1637       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1638       "gpITS.="<<&gpITS<<       // global position  ITS
1639       "gdITS.="<<&gdITS<<       // global position  ITS
1640       "\n";
1641   }
1642 }
1643
1644
1645
1646
1647 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignTRD(AliESDtrack *const track, const AliESDfriendTrack *const friendTrack){
1648   //
1649   // Process track - Update TPC-TRD alignment
1650   // Updates: 
1651   // 0. Apply standartd cuts 
1652   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1653   // 2. Apply median+-rms cut
1654   // 3. Update kalman filter
1655   //
1656   const Int_t    kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1657   const Int_t    kMinTRD  = 50;    // minimal number of TRD cluster
1658   const Double_t kMinZ    = 20;    // maximal dz distance
1659   const Double_t kMaxDy   = 5.;    // maximal dy distance
1660   const Double_t kMaxAngle= 0.1;  // maximal angular distance
1661   const Double_t kSigmaCut= 10;     // maximal sigma distance to median
1662   const Double_t kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1663   const Double_t kT0Err   = 3.;  // initial uncertainty of the T0 time
1664   const Double_t kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1665   const Double_t kOutCut  = 3.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1666   const Double_t kRefX    = 275;   // reference X
1667   const  Int_t     kN=50;         // deepnes of history
1668   static Int_t     kglast=0;
1669   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1670   //
1671   // 0. Apply standard cuts
1672   //
1673   Int_t dummycl[1000];
1674   if (track->GetTRDclusters(dummycl)<kMinTRD) return;  // minimal amount of clusters
1675   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1676   if (!friendTrack->GetTRDIn()) return;  
1677   if (!track->IsOn(AliESDtrack::kTRDrefit)) return;  
1678   if (!track->IsOn(AliESDtrack::kTRDout)) return;  
1679   if (!track->GetInnerParam())   return;
1680   if (!friendTrack->GetTPCOut())   return;
1681   // exclude crossing track
1682   if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1683   if (TMath::Abs(track->GetInnerParam()->GetZ())<kMinZ)   return;
1684   //
1685   AliExternalTrackParam &pTPC=(AliExternalTrackParam &)(*(friendTrack->GetTPCOut()));
1686   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,kRefX,0.1,0.1,kFALSE);
1687   AliExternalTrackParam pTRD(*(friendTrack->GetTRDIn()));
1688   pTRD.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1689   //  pTRD.PropagateTo(pTPC.GetX(),fMagF);
1690   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTRD,pTPC.GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
1691
1692   ((Double_t*)pTRD.GetCovariance())[2]+=3.*3.;   // increas sys errors
1693   ((Double_t*)pTRD.GetCovariance())[9]+=0.1*0.1; // increse sys errors
1694
1695   if (TMath::Abs(pTRD.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1696   if (TMath::Abs(pTRD.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1697   //  if (TMath::Abs(pTRD.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1698   //
1699   // 1. Update median and RMS info
1700   //
1701   TVectorD vecDelta(5),vecMedian(5), vecRMS(5);
1702   TVectorD vecDeltaN(5);
1703   Double_t sign=(pTRD.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1704   vecDelta[4]=0;
1705   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1706     vecDelta[i]=(pTRD.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1707     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1708   }
1709   kglast=(kglast+1);
1710   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1711   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1712     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1713
1714     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1715     vecDeltaN[i] = 0;
1716     if (vecRMS[i]>0.){
1717       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/vecRMS[i];
1718       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1719     }
1720   }
1721   //
1722   // 2. Apply median+-rms cut
1723   //
1724   if (kglast<3)  return;   //median and RMS to be defined
1725   if ( vecDeltaN[4]/4.>kSigmaCut) return;
1726   //
1727   // 3. Update alignment
1728   //
1729   //Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1730   Int_t htime = (Int_t)(fTime-fTimeKalmanBin/2)/fTimeKalmanBin; //time in half hour
1731   if (fAlignTRDTPC->GetEntriesFast()<htime){
1732     fAlignTRDTPC->Expand(htime*2+20);
1733   }
1734   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignTRDTPC->At(htime);
1735   if (!align){
1736     // make Alignment object if doesn't exist
1737     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1738     align->SetRunNumber(fRun);
1739     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1740     (*align->GetStateCov())(7,7)=kT0Err*kT0Err;
1741     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1742     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1743     //    align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1744     align->SetRejectOutliers(kTRUE);
1745     align->SetRejectOutliersSigma2Median(kTRUE);
1746
1747     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1748     align->SetMagField(fMagF); 
1749     fAlignTRDTPC->AddAt(align,htime);
1750   }
1751   align->AddTrackParams(&pTRD,&pTPC);
1752   //align->SetTimeStamp(fTime);
1753   Double_t averageTime =  fTime;
1754   if (align->GetTimeStamp()>0 && align->GetNUpdates()>0) {
1755     averageTime = (((Double_t)fTime) + ((Double_t)align->GetTimeStamp())*align->GetNUpdates()) / (align->GetNUpdates() + 1.);
1756     //printf("align->GetTimeStamp() %d, align->GetNUpdates() %d \n", align->GetTimeStamp(), align->GetNUpdates());
1757   }
1758   align->SetTimeStamp((Int_t)averageTime);
1759
1760   //printf("fTime %d, averageTime %d \n", fTime, (Int_t)averageTime);
1761
1762   align->SetRunNumber(fRun );
1763   Float_t dca[2],cov[3];
1764   track->GetImpactParameters(dca,cov);
1765   if (TMath::Abs(dca[0])<kMaxDy){
1766     FillResHistoTPCTRD(&pTPC,&pTRD);  //only primaries
1767   }
1768   //
1769   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1770   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates+1));
1771   //  align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1772   align->SetRejectOutliers(kTRUE);
1773   align->SetRejectOutliersSigma2Median(kTRUE);
1774
1775   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1776   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1777     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1778     TVectorD gpTRD(3), gdTRD(3);
1779     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1780     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1781     pTRD.GetXYZ(gpTRD.GetMatrixArray());
1782     pTRD.GetDirection(gdTRD.GetMatrixArray());
1783     (*cstream)<<"trdtpc"<<
1784       "run="<<fRun<<              //  run number
1785       "event="<<fEvent<<          //  event number
1786       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1787       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1788       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1789       //
1790       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1791       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1792       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1793       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1794       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1795       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1796       "a.="<<align<<            // current alignment
1797       "pTRD.="<<&pTRD<<         // track param TRD
1798       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1799       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1800       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1801       "gpTRD.="<<&gpTRD<<       // global position  TRD
1802       "gdTRD.="<<&gdTRD<<       // global position  TRD
1803       "\n";
1804   }
1805 }
1806
1807
1808 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignTOF(AliESDtrack *const track, const AliESDfriendTrack *const friendTrack){
1809   //
1810   //
1811   // Process track - Update TPC-TOF alignment
1812   // Updates: 
1813   // -1. Make a TOF "track"
1814   // 0. Apply standartd cuts 
1815   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1816   // 2. Apply median+-rms cut
1817   // 3. Update kalman filter
1818   //
1819   const Int_t      kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1820   //  const Double_t   kMinZ    = 10;    // maximal dz distance
1821   const Double_t   kMaxDy   = 5.;    // maximal dy distance
1822   const Double_t   kMaxAngle= 0.05;  // maximal angular distance
1823   const Double_t   kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1824   const Double_t   kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1825   const Double_t   kT0Err   = 3.;  // initial uncertainty of the T0 time
1826   const Double_t   kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1827
1828   const Double_t   kOutCut  = 3.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1829   const  Int_t     kN=50;         // deepnes of history
1830   static Int_t     kglast=0;
1831   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1832   //
1833   // -1. Make a TOF track-
1834   //     Clusters are not in friends - use alingment points
1835   //
1836   if (track->GetTOFsignal()<=0)  return;
1837   if (!friendTrack->GetTPCOut()) return;
1838   if (!track->GetInnerParam())   return;
1839   if (!friendTrack->GetTPCOut())   return;
1840   const AliTrackPointArray *points=friendTrack->GetTrackPointArray();
1841   if (!points) return;
1842   AliExternalTrackParam pTPC(*(friendTrack->GetTPCOut()));
1843   AliExternalTrackParam pTOF(pTPC);
1844   Double_t mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("mu+")->Mass();
1845   Int_t npoints = points->GetNPoints();
1846   AliTrackPoint point;
1847   Int_t naccept=0;
1848   //
1849   for (Int_t ipoint=0;ipoint<npoints;ipoint++){
1850     points->GetPoint(point,ipoint);
1851     Float_t xyz[3];
1852     point.GetXYZ(xyz);
1853     Double_t r=TMath::Sqrt(xyz[0]*xyz[0]+xyz[1]*xyz[1]);
1854     if (r<350)  continue;
1855     if (r>400)  continue;
1856     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,r,mass,2.,kTRUE);
1857     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,r,mass,0.1,kTRUE);    
1858     AliTrackPoint lpoint = point.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1859     pTPC.PropagateTo(lpoint.GetX(),fMagF);
1860     pTOF=pTPC;
1861     ((Double_t*)pTOF.GetParameter())[0] =lpoint.GetY();
1862     ((Double_t*)pTOF.GetParameter())[1] =lpoint.GetZ();
1863     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[0]+=3.*3./12.;
1864     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[2]+=3.*3./12.;
1865     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[5]+=0.1*0.1;
1866     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[9]+=0.1*0.1;
1867     naccept++;
1868   }
1869   if (naccept==0) return;  // no tof match clusters
1870   //
1871   // 0. Apply standard cuts
1872   //
1873   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1874   // exclude crossing track
1875   if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1876   //
1877   if (TMath::Abs(pTOF.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1878   if (TMath::Abs(pTOF.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1879   if (TMath::Abs(pTOF.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1880   //
1881   // 1. Update median and RMS info
1882   //
1883   TVectorD vecDelta(5),vecMedian(5), vecRMS(5);
1884   TVectorD vecDeltaN(5);
1885   Double_t sign=(pTOF.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1886   vecDelta[4]=0;
1887   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1888     vecDelta[i]=(pTOF.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1889     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1890   }
1891   kglast=(kglast+1);
1892   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1893   Bool_t isOK=kTRUE;
1894   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1895     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1896     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1897     vecDeltaN[i] = 0;
1898     if (vecRMS[i]>0.){
1899       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/(vecRMS[i]+1.);
1900       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1901       if (TMath::Abs(vecDeltaN[i])>kSigmaCut) isOK=kFALSE;
1902     }
1903   }
1904   //
1905   // 2. Apply median+-rms cut
1906   //
1907   if (kglast<10)  return;   //median and RMS to be defined
1908   if (!isOK) return;
1909   //
1910   // 3. Update alignment
1911   //
1912   //Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1913   Int_t htime = (Int_t)(fTime-fTimeKalmanBin)/fTimeKalmanBin; //time bin
1914   if (fAlignTOFTPC->GetEntriesFast()<htime){
1915     fAlignTOFTPC->Expand(htime*2+20);
1916   }
1917   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignTOFTPC->At(htime);
1918   if (!align){
1919     // make Alignment object if doesn't exist
1920     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1921     align->SetRunNumber(fRun);
1922     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1923     (*align->GetStateCov())(7,7)=kT0Err*kT0Err;
1924     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1925     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1926     //    align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1927     align->SetRejectOutliers(kTRUE);
1928     align->SetRejectOutliersSigma2Median(kTRUE);
1929
1930     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1931     align->SetMagField(fMagF); 
1932     fAlignTOFTPC->AddAt(align,htime);
1933   }
1934   align->AddTrackParams(&pTOF,&pTPC);
1935   Float_t dca[2],cov[3];
1936   track->GetImpactParameters(dca,cov);
1937   if (TMath::Abs(dca[0])<kMaxDy){
1938     FillResHistoTPCTOF(&pTPC,&pTOF);
1939   }
1940   //align->SetTimeStamp(fTime);
1941   Double_t averageTime =  fTime;
1942   if (align->GetTimeStamp()>0 && align->GetNUpdates()>0) {
1943     averageTime = (((Double_t)fTime) + ((Double_t)align->GetTimeStamp())*align->GetNUpdates()) / (align->GetNUpdates() + 1.);
1944     //printf("align->GetTimeStamp() %d, align->GetNUpdates() %d \n", align->GetTimeStamp(), align->GetNUpdates());
1945   }
1946   align->SetTimeStamp((Int_t)averageTime);
1947
1948   //printf("fTime %d, averageTime %d \n", fTime, (Int_t)averageTime);
1949
1950   align->SetRunNumber(fRun );
1951   //
1952   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1953   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates+1));
1954   //  align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1955   align->SetRejectOutliers(kTRUE);
1956   align->SetRejectOutliersSigma2Median(kTRUE);
1957
1958   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1959   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1960     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1961     TVectorD gpTOF(3), gdTOF(3);
1962     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1963     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1964     pTOF.GetXYZ(gpTOF.GetMatrixArray());
1965     pTOF.GetDirection(gdTOF.GetMatrixArray());
1966     (*cstream)<<"toftpc"<<
1967       "run="<<fRun<<              //  run number
1968       "event="<<fEvent<<          //  event number
1969       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1970       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1971       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1972       //
1973       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1974       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1975       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1976       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1977       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1978       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1979       "a.="<<align<<            // current alignment
1980       "pTOF.="<<&pTOF<<         // track param TOF
1981       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1982       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1983       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1984       "gpTOF.="<<&gpTOF<<       // global position  TOF
1985       "gdTOF.="<<&gdTOF<<       // global position  TOF
1986       "\n";
1987   }
1988 }
1989
1990
1991 void  AliTPCcalibTime::BookDistortionMaps(){
1992   //
1993   //   Book ndimensional histograms of distortions/residuals
1994   //   Only primary tracks are selected for analysis
1995   //
1996  
1997   Double_t xminTrack[5], xmaxTrack[5];
1998   Int_t binsTrack[5];
1999   TString axisName[5];
2000   TString axisTitle[5];
2001   //
2002   binsTrack[0]  =50;
2003   axisName[0]   ="#Delta";
2004   axisTitle[0]  ="#Delta";
2005   //
2006   binsTrack[1] =44;
2007   xminTrack[1] =-1.1; xmaxTrack[1]=1.1;
2008   axisName[1]  ="tanTheta";
2009   axisTitle[1]  ="tan(#Theta)";
2010   //
2011   binsTrack[2] =180;
2012   xminTrack[2] =-TMath::Pi(); xmaxTrack[2]=TMath::Pi(); 
2013   axisName[2]  ="phi";
2014   axisTitle[2]  ="#phi";
2015   //
2016   binsTrack[3] =20;
2017   xminTrack[3] =-1.; xmaxTrack[3]=1.;   // 0.33 GeV cut 
2018   axisName[3]  ="snp";
2019   axisTitle[3]  ="snp";
2020   //
2021   binsTrack[4] =10;
2022   xminTrack[4] =120.; xmaxTrack[4]=215.;   // crossing radius for CE only 
2023   axisName[4]  ="r";
2024   axisTitle[4] ="r(cm)";
2025   //
2026   // delta y
2027   xminTrack[0] =-1.5; xmaxTrack[0]=1.5;  // 
2028   fResHistoTPCCE[0] = new THnSparseS("TPCCE#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)",    5, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2029   fResHistoTPCITS[0] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2030   fResHistoTPCvertex[0]    = new THnSparseS("TPCVertex#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2031   xminTrack[0] =-1.5; xmaxTrack[0]=1.5;  // 
2032   fResHistoTPCTRD[0] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2033   xminTrack[0] =-5; xmaxTrack[0]=5;  // 
2034   fResHistoTPCTOF[0] = new THnSparseS("TPCTOF#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2035   //
2036   // delta z
2037   xminTrack[0] =-6.; xmaxTrack[0]=6.;  // 
2038   fResHistoTPCCE[1] = new THnSparseS("TPCCE#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)",    5, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2039   fResHistoTPCITS[1] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2040   fResHistoTPCvertex[1]    = new THnSparseS("TPCVertex#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2041   fResHistoTPCTRD[1] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2042   xminTrack[0] =-5.; xmaxTrack[0]=5.;  // 
2043   fResHistoTPCTOF[1] = new THnSparseS("TPCTOF#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2044   //
2045   // delta snp-P2
2046   xminTrack[0] =-0.015; xmaxTrack[0]=0.015;  // 
2047   fResHistoTPCCE[2] = new THnSparseS("TPCCE#Delta_{#phi}","#Delta_{#phi}",    5, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2048   fResHistoTPCITS[2] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{#phi}","#Delta_{#phi}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2049   fResHistoTPCvertex[2] = new THnSparseS("TPCITSv#Delta_{#phi}","#Delta_{#phi}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2050   fResHistoTPCTRD[2] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{#phi}","#Delta_{#phi}", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2051   fResHistoTPCTOF[2] = new THnSparseS("TPCTOF#Delta_{#phi}","#Delta_{#phi}", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2052   //
2053   // delta theta-P3
2054   xminTrack[0] =-0.05; xmaxTrack[0]=0.05;  // 
2055   fResHistoTPCCE[3] = new THnSparseS("TPCCE#Delta_{#theta}","#Delta_{#theta}",    5, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2056   fResHistoTPCITS[3] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{#theta}","#Delta_{#theta}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2057   fResHistoTPCvertex[3] = new THnSparseS("TPCITSv#Delta_{#theta}","#Delta_{#theta}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2058   fResHistoTPCTRD[3] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{#theta}","#Delta_{#theta}", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2059   fResHistoTPCTOF[3] = new THnSparseS("TPCTOF#Delta_{#theta}","#Delta_{#theta}", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2060   //
2061   // delta theta-P4
2062   xminTrack[0] =-0.2; xmaxTrack[0]=0.2;  // 
2063   fResHistoTPCCE[4] = new THnSparseS("TPCCE#Delta_{1/pt}","#Delta_{1/pt}",    5, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2064   fResHistoTPCITS[4] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{1/pt}","#Delta_{1/pt}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2065   fResHistoTPCvertex[4] = new THnSparseS("TPCITSv#Delta_{1/pt}","#Delta_{1/pt}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2066   fResHistoTPCTRD[4] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{1/pt}","#Delta_{1/pt}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2067   fResHistoTPCTOF[4] = new THnSparseS("TPCTOF#Delta_{1/pt}","#Delta_{1/pt}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
2068   //
2069   for (Int_t ivar=0;ivar<4;ivar++){
2070     for (Int_t ivar2=0;ivar2<5;ivar2++){      
2071       fResHistoTPCCE[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
2072       fResHistoTPCCE[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisTitle[ivar2].Data());
2073       if (ivar2<4){
2074         fResHistoTPCITS[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
2075         fResHistoTPCITS[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisTitle[ivar2].Data());
2076         fResHistoTPCTRD[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
2077         fResHistoTPCTRD[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisTitle[ivar2].Data());
2078         fResHistoTPCvertex[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
2079         fResHistoTPCvertex[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisTitle[ivar2].Data());
2080       }
2081     }
2082   }
2083   //
2084   // Book vertex: time histograms
2085   //
2086   Int_t    binsVertex[2]={500, fTimeBins};
2087   Double_t    aminVertex[2]={-5,fTimeStart};
2088   Double_t    amaxVertex[2]={5, fTimeEnd};
2089   const char* hnames[12]={"TPCXAside", "TPCXCside","TPCXACdiff","TPCXAPCdiff",
2090                           "TPCYAside", "TPCYCside","TPCYACdiff","TPCYAPCdiff",
2091                           "TPCZAPCside", "TPCZAMCside","TPCZACdiff","TPCZAPCdiff"}; 
2092   const char* anames[12]={"x (cm) - A side ", "x (cm) - C side","#Delta_{x} (cm) - TPC-A-C","#Delta_{x} (cm) - TPC-Common",
2093                           "y (cm) - A side ", "y (cm) - C side","#Delta_{x} (cm) - TPC-A-C","#Delta_{y} (cm) - TPC-Common",
2094                           "z (cm)", "#Delta_{Z} (cm) A-C side","#Delta_{x} (cm) - TPC-A-C","#Delta_{Z} (cm) TPC-common"}; 
2095   for (Int_t ihis=0; ihis<12; ihis++) {
2096     if (ihis>=8) aminVertex[0]=-20.;
2097     if (ihis>=8) amaxVertex[0]=20.;
2098     fTPCVertex[ihis]=new THnSparseF(hnames[ihis],hnames[ihis],2,binsVertex,aminVertex,amaxVertex);
2099     fTPCVertex[ihis]->GetAxis(1)->SetTitle("Time");
2100     fTPCVertex[ihis]->GetAxis(0)->SetTitle(anames[ihis]);
2101   }
2102   
2103   Int_t    binsVertexC[2]={40, 300};
2104   Double_t aminVertexC[2]={-20,-30};
2105   Double_t amaxVertexC[2]={20,30};
2106   const char* hnamesC[5]={"TPCA_TPC","TPCC_TPC","TPCA_ITS","TPCC_ITS","TPC_ITS"};
2107   for (Int_t ihis=0; ihis<5; ihis++) {
2108     fTPCVertexCorrelation[ihis]=new THnSparseF(hnamesC[ihis],hnamesC[ihis],2,binsVertexC,aminVertexC,amaxVertexC);
2109     fTPCVertexCorrelation[ihis]->GetAxis(1)->SetTitle("z (cm)");
2110     fTPCVertexCorrelation[ihis]->GetAxis(0)->SetTitle("z (cm)");
2111   }
2112 }
2113
2114
2115 void        AliTPCcalibTime::FillResHistoTPCCE(const AliExternalTrackParam * pTPCIn, const AliExternalTrackParam * pTPCOut ){
2116   //
2117   // fill residual histograms pTPCOut-pTPCin - trac crossing CE
2118   // Histogram 
2119   //
2120   if (fMemoryMode<2) return;
2121   Double_t histoX[5];
2122   Double_t xyz[3];
2123   pTPCIn->GetXYZ(xyz);
2124   Double_t phi= TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
2125   histoX[1]= pTPCIn->GetTgl();
2126   histoX[2]= phi;
2127   histoX[3]= pTPCIn->GetSnp();
2128   histoX[4]= pTPCIn->GetX();
2129   AliExternalTrackParam lout(*pTPCOut);
2130   lout.Rotate(pTPCIn->GetAlpha());
2131   lout.PropagateTo(pTPCIn->GetX(),fMagF);
2132   //
2133   for (Int_t ihisto=0; ihisto<5; ihisto++){
2134     histoX[0]=lout.GetParameter()[ihisto]-pTPCIn->GetParameter()[ihisto];
2135     fResHistoTPCCE[ihisto]->Fill(histoX);
2136   }
2137 }  
2138 void        AliTPCcalibTime::FillResHistoTPCITS(const AliExternalTrackParam * pTPCIn, const AliExternalTrackParam * pITSOut ){
2139   //
2140   // fill residual histograms pTPCIn-pITSOut
2141   // Histogram is filled only for primary tracks
2142   //
2143   Double_t histoX[4];
2144   Double_t xyz[3];
2145   pTPCIn->GetXYZ(xyz);
2146   Double_t phi= TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
2147   histoX[1]= pTPCIn->GetTgl();
2148   histoX[2]= phi;
2149   histoX[3]= pTPCIn->GetSnp();
2150   AliExternalTrackParam lits(*pITSOut);
2151   lits.Rotate(pTPCIn->GetAlpha());
2152   lits.PropagateTo(pTPCIn->GetX(),fMagF);
2153   //
2154   for (Int_t ihisto=0; ihisto<5; ihisto++){
2155     histoX[0]=pTPCIn->GetParameter()[ihisto]-lits.GetParameter()[ihisto];
2156     fResHistoTPCITS[ihisto]->Fill(histoX);
2157   }
2158 }  
2159
2160      
2161 void        AliTPCcalibTime::FillResHistoTPC(const AliESDtrack * pTrack){
2162   //
2163   // fill residual histograms pTPC - vertex
2164   // Histogram is filled only for primary tracks
2165   //
2166   if (fMemoryMode<2) return;
2167   Double_t histoX[4];
2168   const AliExternalTrackParam * pTPCIn = pTrack->GetInnerParam();
2169   AliExternalTrackParam pTPCvertex(*(pTrack->GetInnerParam()));
2170   //
2171   AliExternalTrackParam lits(*pTrack);
2172   if (TMath::Abs(pTrack->GetY())>3) return;  // beam pipe
2173   pTPCvertex.Rotate(lits.GetAlpha());
2174   //pTPCvertex.PropagateTo(pTPCvertex->GetX(),fMagF);
2175   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPCvertex,lits.GetX(),0.1,2,kFALSE);
2176   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPCvertex,lits.GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
2177   Double_t xyz[3];
2178   pTPCIn->GetXYZ(xyz);
2179   Double_t phi= TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
2180   histoX[1]= pTPCIn->GetTgl();
2181   histoX[2]= phi;
2182   histoX[3]= pTPCIn->GetSnp();
2183   //
2184   Float_t dca[2], cov[3];
2185   pTrack->GetImpactParametersTPC(dca,cov);
2186   for (Int_t ihisto=0; ihisto<5; ihisto++){
2187     histoX[0]=pTPCvertex.GetParameter()[ihisto]-lits.GetParameter()[ihisto];
2188     //    if (ihisto<2) histoX[0]=dca[ihisto];
2189     fResHistoTPCvertex[ihisto]->Fill(histoX);
2190   }
2191 }
2192
2193
2194 void        AliTPCcalibTime::FillResHistoTPCTRD(const AliExternalTrackParam * pTPCOut, const AliExternalTrackParam * pTRDIn ){
2195   //
2196   // fill resuidual histogram TPCout-TRDin
2197   //
2198   if (fMemoryMode<2) return;
2199   Double_t histoX[4];
2200   Double_t xyz[3];
2201   pTPCOut->GetXYZ(xyz);
2202   Double_t phi= TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
2203   histoX[1]= pTPCOut->GetTgl();
2204   histoX[2]= phi;
2205   histoX[3]= pTPCOut->GetSnp();
2206   //
2207   AliExternalTrackParam ltrd(*pTRDIn);
2208   ltrd.Rotate(pTPCOut->GetAlpha());
2209   //  ltrd.PropagateTo(pTPCOut->GetX(),fMagF);
2210   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&ltrd,pTPCOut->GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
2211
2212   for (Int_t ihisto=0; ihisto<5; ihisto++){
2213     histoX[0]=pTPCOut->GetParameter()[ihisto]-ltrd.GetParameter()[ihisto];
2214     fResHistoTPCTRD[ihisto]->Fill(histoX);
2215   }
2216
2217 }
2218
2219 void        AliTPCcalibTime::FillResHistoTPCTOF(const AliExternalTrackParam * pTPCOut, const AliExternalTrackParam * pTOFIn ){
2220   //
2221   // fill resuidual histogram TPCout-TOFin
2222   // track propagated to the TOF position
2223   if (fMemoryMode<2) return;
2224   Double_t histoX[4];
2225   Double_t xyz[3];
2226
2227   AliExternalTrackParam ltpc(*pTPCOut);
2228   ltpc.Rotate(pTOFIn->GetAlpha());
2229   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&ltpc,pTOFIn->GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
2230   //
2231   ltpc.GetXYZ(xyz);
2232   Double_t phi= TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
2233   histoX[1]= ltpc.GetTgl();
2234   histoX[2]= phi;
2235   histoX[3]= ltpc.GetSnp();
2236   //
2237   for (Int_t ihisto=0; ihisto<2; ihisto++){
2238     histoX[0]=ltpc.GetParameter()[ihisto]-pTOFIn->GetParameter()[ihisto];
2239     fResHistoTPCTOF[ihisto]->Fill(histoX);
2240   }
2241
2242 }