Fixes for the new type of data
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCcalibTime.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /*
17 Comments to be written here:
18
19 1. What do we calibrate.
20
21   Time dependence of gain and drift velocity in order to account for changes in: temperature, pressure, gas composition.
22
23   AliTPCcalibTime *calibTime = new AliTPCcalibTime("cosmicTime","cosmicTime",0, 1213.9e+06, 1213.96e+06, 0.04e+04, 0.04e+04);
24
25 2. How to interpret results
26
27 3. Simple example
28
29   a) determine the required time range:
30
31   AliXRDPROOFtoolkit tool;
32   TChain * chain = tool.MakeChain("pass2.txt","esdTree",0,6000);
33   chain->Draw("GetTimeStamp()")
34
35   b) analyse calibration object on Proof in calibration train 
36
37   AliTPCcalibTime *calibTime = new AliTPCcalibTime("cosmicTime","cosmicTime", StartTimeStamp, EndTimeStamp, IntegrationTimeVdrift);
38
39   c) plot results
40   .x ~/NimStyle.C
41   gSystem->Load("libANALYSIS");
42   gSystem->Load("libTPCcalib");
43
44   TFile f("CalibObjectsTrain1.root");
45   AliTPCcalibTime *calib = (AliTPCcalibTime *)f->Get("calibTime");
46   calib->GetHistoDrift("all")->Projection(2,0)->Draw()
47   calib->GetFitDrift("all")->Draw("lp")
48
49 4. Analysis using debug streamers.    
50
51   gSystem->AddIncludePath("-I$ALICE_ROOT/TPC/macros");
52   gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/TPC/macros/AliXRDPROOFtoolkit.cxx+")
53   AliXRDPROOFtoolkit tool;
54   TChain * chainTime = tool.MakeChainRandom("time.txt","trackInfo",0,10000);
55
56   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timetpctpc.txt","* tpctpc",1) 
57   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timetoftpc.txt","* toftpc",1) 
58   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timeitstpc.txt","* itstpc",1) 
59   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timelaser.txt","* laserInfo",1)  
60   TChain * chainTPCTPC = tool.MakeChainRandom("timetpctpc.txt.Good","tpctpc",0,10000); 
61   TChain * chainTPCITS = tool.MakeChainRandom("timeitstpc.txt.Good","itstpc",0,10000); 
62   TChain * chainTPCTOF = tool.MakeChainRandom("timetoftpc.txt.Good","toftpc",0,10000); 
63   TChain * chainLaser = tool.MakeChainRandom("timelaser.txt.Good","laserInfo",0,10000);
64   chainTime->Lookup();
65   chainLaser->Lookup();
66 */
67
68 #include "Riostream.h"
69 #include "TChain.h"
70 #include "TTree.h"
71 #include "TH1F.h"
72 #include "TH2F.h"
73 #include "TH3F.h"
74 #include "THnSparse.h"
75 #include "TList.h"
76 #include "TMath.h"
77 #include "TCanvas.h"
78 #include "TFile.h"
79 #include "TF1.h"
80 #include "TVectorD.h"
81 #include "TProfile.h"
82 #include "TGraphErrors.h"
83 #include "TCanvas.h"
84 #include "AliTPCclusterMI.h"
85 #include "AliTPCseed.h"
86 #include "AliESDVertex.h"
87 #include "AliESDEvent.h"
88 #include "AliESDfriend.h"
89 #include "AliESDInputHandler.h"
90 #include "AliAnalysisManager.h"
91
92 #include "AliTracker.h"
93 #include "AliMagF.h"
94 #include "AliTPCCalROC.h"
95 #include "AliTPCParam.h"
96
97 #include "AliLog.h"
98
99 #include "AliTPCcalibTime.h"
100 #include "AliRelAlignerKalman.h"
101
102 #include "TTreeStream.h"
103 #include "AliTPCTracklet.h"
104 #include "TTimeStamp.h"
105 #include "AliTPCcalibDB.h"
106 #include "AliTPCcalibLaser.h"
107 #include "AliDCSSensorArray.h"
108 #include "AliDCSSensor.h"
109
110 #include "TDatabasePDG.h"
111 #include "AliTrackPointArray.h"
112
113 ClassImp(AliTPCcalibTime)
114
115
116 AliTPCcalibTime::AliTPCcalibTime() 
117   :AliTPCcalibBase(), 
118    fLaser(0),       // pointer to laser calibration
119    fDz(0),          // current delta z
120    fCutMaxD(3),        // maximal distance in rfi ditection
121    fCutMaxDz(25),      // maximal distance in rfi ditection
122    fCutTheta(0.03),    // maximal distan theta
123    fCutMinDir(-0.99),  // direction vector products
124    fCutTracks(10),
125    fArrayDz(0),          //NEW! Tmap of V drifts for different triggers
126    fAlignITSTPC(0),      //alignemnt array ITS TPC match
127    fAlignTRDTPC(0),      //alignemnt array TRD TPC match 
128    fAlignTOFTPC(0),      //alignemnt array TOF TPC match
129    fTimeBins(0),
130    fTimeStart(0),
131    fTimeEnd(0),
132    fPtBins(0),
133    fPtStart(0),
134    fPtEnd(0),
135    fVdriftBins(0),
136    fVdriftStart(0),
137    fVdriftEnd(0),
138    fRunBins(0),
139    fRunStart(0),
140    fRunEnd(0)
141 //   fBinsVdrift(fTimeBins,fPtBins,fVdriftBins),
142 //   fXminVdrift(fTimeStart,fPtStart,fVdriftStart),
143 //   fXmaxVdrift(fTimeEnd,fPtEnd,fVdriftEnd)
144 {  
145   AliInfo("Default Constructor");  
146   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
147     fHistVdriftLaserA[i]=0;
148     fHistVdriftLaserC[i]=0;
149   }
150   for (Int_t i=0;i<10;i++) {
151     fCosmiMatchingHisto[i]=0;
152   }
153 }
154
155 AliTPCcalibTime::AliTPCcalibTime(const Text_t *name, const Text_t *title, UInt_t StartTime, UInt_t EndTime, Int_t deltaIntegrationTimeVdrift)
156   :AliTPCcalibBase(),
157    fLaser(0),            // pointer to laser calibration
158    fDz(0),               // current delta z
159    fCutMaxD(5*0.5356),   // maximal distance in rfi ditection
160    fCutMaxDz(40),   // maximal distance in rfi ditection
161    fCutTheta(5*0.004644),// maximal distan theta
162    fCutMinDir(-0.99),    // direction vector products
163    fCutTracks(10),
164    fArrayDz(0),            //Tmap of V drifts for different triggers
165    fAlignITSTPC(0),      //alignemnt array ITS TPC match
166    fAlignTRDTPC(0),      //alignemnt array TRD TPC match 
167    fAlignTOFTPC(0),      //alignemnt array TOF TPC match
168    fTimeBins(0),
169    fTimeStart(0),
170    fTimeEnd(0),
171    fPtBins(0),
172    fPtStart(0),
173    fPtEnd(0),
174    fVdriftBins(0),
175    fVdriftStart(0),
176    fVdriftEnd(0),
177    fRunBins(0),
178    fRunStart(0),
179    fRunEnd(0)
180 {
181   SetName(name);
182   SetTitle(title);
183   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
184     fHistVdriftLaserA[i]=0;
185     fHistVdriftLaserC[i]=0;
186   }
187
188   AliInfo("Non Default Constructor");
189   fTimeBins   =(EndTime-StartTime)/deltaIntegrationTimeVdrift;
190   fTimeStart  =StartTime; //(((TObjString*)(mapGRP->GetValue("fAliceStartTime")))->GetString()).Atoi();
191   fTimeEnd    =EndTime;   //(((TObjString*)(mapGRP->GetValue("fAliceStopTime")))->GetString()).Atoi();
192   fPtBins     = 400;
193   fPtStart    = -0.04;
194   fPtEnd      =  0.04;
195   fVdriftBins = 500;
196   fVdriftStart= -0.1;
197   fVdriftEnd  =  0.1;
198   fRunBins    = 1000001;
199   fRunStart   = -1.5;
200   fRunEnd     = 999999.5;
201
202   Int_t    binsVdriftLaser[4] = {fTimeBins , fPtBins , fVdriftBins*20, fRunBins };
203   Double_t xminVdriftLaser[4] = {fTimeStart, fPtStart, fVdriftStart  , fRunStart};
204   Double_t xmaxVdriftLaser[4] = {fTimeEnd  , fPtEnd  , fVdriftEnd    , fRunEnd  };
205   TString axisTitle[4]={
206     "T",
207     "#delta_{P/T}",
208     "value",
209     "run"
210   };
211   TString histoName[3]={
212     "Loffset",
213     "Lcorr",
214     "Lgy"
215   };
216
217   
218   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
219     fHistVdriftLaserA[i] = new THnSparseF("HistVdriftLaser","HistVdriftLaser;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,binsVdriftLaser,xminVdriftLaser,xmaxVdriftLaser);
220     fHistVdriftLaserC[i] = new THnSparseF("HistVdriftLaser","HistVdriftLaser;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,binsVdriftLaser,xminVdriftLaser,xmaxVdriftLaser);
221     fHistVdriftLaserA[i]->SetName(histoName[i]);
222     fHistVdriftLaserC[i]->SetName(histoName[i]);
223     for (Int_t iaxis=0; iaxis<4;iaxis++){
224       fHistVdriftLaserA[i]->GetAxis(iaxis)->SetName(axisTitle[iaxis]);
225       fHistVdriftLaserC[i]->GetAxis(iaxis)->SetName(axisTitle[iaxis]);
226     }
227   }
228   fBinsVdrift[0] = fTimeBins;
229   fBinsVdrift[1] = fPtBins;
230   fBinsVdrift[2] = fVdriftBins;
231   fBinsVdrift[3] = fRunBins;
232   fXminVdrift[0] = fTimeStart;
233   fXminVdrift[1] = fPtStart;
234   fXminVdrift[2] = fVdriftStart;
235   fXminVdrift[3] = fRunStart;
236   fXmaxVdrift[0] = fTimeEnd;
237   fXmaxVdrift[1] = fPtEnd;
238   fXmaxVdrift[2] = fVdriftEnd;
239   fXmaxVdrift[3] = fRunEnd;
240
241   fArrayDz=new TObjArray();
242   fAlignITSTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
243   fAlignTRDTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
244   fAlignTOFTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
245   fAlignITSTPC->SetOwner(kTRUE);
246   fAlignTRDTPC->SetOwner(kTRUE);
247   fAlignTOFTPC->SetOwner(kTRUE);
248   
249   // fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserA[0]);
250 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserA[1]);
251 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserA[2]);
252 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserC[0]);
253 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserC[1]);
254 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserC[2]);
255
256   fCosmiMatchingHisto[0]=new TH1F("Cosmics matching","p0-all"   ,100,-10*0.5356  ,10*0.5356  );
257   fCosmiMatchingHisto[1]=new TH1F("Cosmics matching","p1-all"   ,100,-10*4.541   ,10*4.541   );
258   fCosmiMatchingHisto[2]=new TH1F("Cosmics matching","p2-all"   ,100,-10*0.01134 ,10*0.01134 );
259   fCosmiMatchingHisto[3]=new TH1F("Cosmics matching","p3-all"   ,100,-10*0.004644,10*0.004644);
260   fCosmiMatchingHisto[4]=new TH1F("Cosmics matching","p4-all"   ,100,-10*0.03773 ,10*0.03773 );
261   fCosmiMatchingHisto[5]=new TH1F("Cosmics matching","p0-isPair",100,-10*0.5356  ,10*0.5356  );
262   fCosmiMatchingHisto[6]=new TH1F("Cosmics matching","p1-isPair",100,-10*4.541   ,10*4.541   );
263   fCosmiMatchingHisto[7]=new TH1F("Cosmics matching","p2-isPair",100,-10*0.01134 ,10*0.01134 );
264   fCosmiMatchingHisto[8]=new TH1F("Cosmics matching","p3-isPair",100,-10*0.004644,10*0.004644);
265   fCosmiMatchingHisto[9]=new TH1F("Cosmics matching","p4-isPair",100,-10*0.03773 ,10*0.03773 );
266 //  Char_t nameHisto[3]={'p','0','\n'};
267 //  for (Int_t i=0;i<10;i++){
268 //    fCosmiMatchingHisto[i]=new TH1F("Cosmics matching",nameHisto,8192,0,0);
269 //    nameHisto[1]++;
270 //    if(i==4) nameHisto[1]='0';
271 //  }
272 }
273
274 AliTPCcalibTime::~AliTPCcalibTime(){
275   //
276   // Destructor
277   //
278   for(Int_t i=0;i<3;i++){
279     if(fHistVdriftLaserA[i]){
280       delete fHistVdriftLaserA[i];
281       fHistVdriftLaserA[i]=NULL;
282     }
283     if(fHistVdriftLaserC[i]){
284       delete fHistVdriftLaserC[i];
285       fHistVdriftLaserC[i]=NULL;
286     }
287   }
288   if(fArrayDz){
289     fArrayDz->SetOwner();
290     fArrayDz->Delete();
291     delete fArrayDz;
292     fArrayDz=NULL;
293   }
294   for(Int_t i=0;i<5;i++){
295     if(fCosmiMatchingHisto[i]){
296       delete fCosmiMatchingHisto[i];
297       fCosmiMatchingHisto[i]=NULL;
298     }
299   }
300   fAlignITSTPC->SetOwner(kTRUE);
301   fAlignTRDTPC->SetOwner(kTRUE);
302   fAlignTOFTPC->SetOwner(kTRUE);
303
304   fAlignITSTPC->Delete();
305   fAlignTRDTPC->Delete();
306   fAlignTOFTPC->Delete();
307   delete fAlignITSTPC;
308   delete fAlignTRDTPC;
309   delete fAlignTOFTPC;
310 }
311
312 Bool_t AliTPCcalibTime::IsLaser(AliESDEvent */*event*/){
313   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
314 }
315 Bool_t AliTPCcalibTime::IsCosmics(AliESDEvent */*event*/){
316   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
317 }
318 Bool_t AliTPCcalibTime::IsBeam(AliESDEvent */*event*/){
319   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
320 }
321 void AliTPCcalibTime::ResetCurrent(){
322   fDz=0; //Reset current dz
323 }
324 void AliTPCcalibTime::Process(AliESDEvent *event){
325   if(!event) return;
326   if (event->GetNumberOfTracks()<2) return;
327   ResetCurrent();
328   if(IsLaser  (event)) ProcessLaser (event);
329   if(IsCosmics(event)) ProcessCosmic(event);
330   if(IsBeam   (event)) ProcessBeam  (event);
331 }
332
333 void AliTPCcalibTime::ProcessLaser(AliESDEvent *event){
334   //
335   // Fit drift velocity using laser 
336   // 
337   // 0. cuts
338   const Int_t    kMinTracks     = 40;    // minimal number of laser tracks
339   const Int_t    kMinTracksSide = 20;    // minimal number of tracks per side
340   const Float_t  kMaxDeltaZ     = 30.;   // maximal trigger delay
341   const Float_t  kMaxDeltaV     = 0.05;  // maximal deltaV 
342   const Float_t  kMaxRMS        = 0.1;   // maximal RMS of tracks
343   //
344   /*
345     TCut cutRMS("sqrt(laserA.fElements[4])<0.1&&sqrt(laserC.fElements[4])<0.1");
346     TCut cutZ("abs(laserA.fElements[0]-laserC.fElements[0])<3");
347     TCut cutV("abs(laserA.fElements[1]-laserC.fElements[1])<0.01");
348     TCut cutY("abs(laserA.fElements[2]-laserC.fElements[2])<2");
349     TCut cutAll = cutRMS+cutZ+cutV+cutY;
350   */
351   if (event->GetNumberOfTracks()<kMinTracks) return;
352   //
353   if(!fLaser) fLaser = new AliTPCcalibLaser("laserTPC","laserTPC",kFALSE);
354   fLaser->Process(event);
355   if (fLaser->GetNtracks()<kMinTracks) return;   // small amount of tracks cut
356   if (fLaser->fFitAside->GetNrows()==0  && fLaser->fFitCside->GetNrows()==0) return;  // no fit neither a or C side
357   //
358   // debug streamer  - activate stream level
359   // Use it for tuning of the cuts
360   //
361   // cuts to be applied
362   //
363   Int_t isReject[2]={0,0};
364   //
365   // not enough tracks 
366   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[3]) < kMinTracksSide) isReject[0]|=1; 
367   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[3]) < kMinTracksSide) isReject[1]|=1; 
368   // unreasonable z offset
369   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[0])>kMaxDeltaZ)  isReject[0]|=2;
370   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[0])>kMaxDeltaZ)  isReject[1]|=2;
371   // unreasonable drift velocity
372   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[1]-1)>kMaxDeltaV)  isReject[0]|=4;
373   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[1]-1)>kMaxDeltaV)  isReject[1]|=4;
374   // big chi2
375   if (TMath::Sqrt(TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[4]))>kMaxRMS ) isReject[0]|=8;
376   if (TMath::Sqrt(TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[4]))>kMaxRMS ) isReject[1]|=8;
377
378
379
380
381   if (fStreamLevel>0){
382     printf("Trigger: %s\n",event->GetFiredTriggerClasses().Data());
383
384     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
385     if (cstream){
386       TTimeStamp tstamp(fTime);
387       Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
388       Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
389       Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
390       Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
391       Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
392       Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
393       Double_t vdcorr        = AliTPCcalibDB::Instance()->GetVDriftCorrectionTime(tstamp,fRun,0,1);
394       TVectorD vecGoofie(20);
395       AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
396       if (goofieArray){
397         for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
398           AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
399           if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
400         }
401       }
402       (*cstream)<<"laserInfo"<<
403         "run="<<fRun<<              //  run number
404         "event="<<fEvent<<          //  event number
405         "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
406         "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
407         "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
408         // Environment values
409         "press0="<<valuePressure0<<
410         "press1="<<valuePressure1<<
411         "pt0="<<ptrelative0<<
412         "pt1="<<ptrelative1<<
413         "temp0="<<temp0<<
414         "temp1="<<temp1<<
415         "vecGoofie.="<<&vecGoofie<<
416         "vdcorr="<<vdcorr<<
417         //laser
418         "rejectA="<<isReject[0]<<
419         "rejectC="<<isReject[1]<<
420         "laserA.="<<fLaser->fFitAside<<
421         "laserC.="<<fLaser->fFitCside<<
422         "laserAC.="<<fLaser->fFitACside<<
423         "trigger="<<event->GetFiredTriggerClasses()<<
424         "\n";
425     }
426   }
427   //
428   // fill histos
429   //
430   TVectorD vdriftA(5), vdriftC(5),vdriftAC(5);
431   vdriftA=*(fLaser->fFitAside);
432   vdriftC=*(fLaser->fFitCside);
433   vdriftAC=*(fLaser->fFitACside);
434   Int_t npointsA=0, npointsC=0;
435   Float_t chi2A=0, chi2C=0;
436   npointsA= TMath::Nint(vdriftA[3]);
437   chi2A= vdriftA[4];
438   npointsC= TMath::Nint(vdriftC[3]);
439   chi2C= vdriftC[4];
440
441   TTimeStamp tstamp(fTime);
442   Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
443   Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
444   Double_t driftA=0, driftC=0;
445   if (vdriftA[1]>1.-kMaxDeltaV) driftA = 1./vdriftA[1]-1.;
446   if (vdriftC[1]>1.-kMaxDeltaV) driftC = 1./vdriftC[1]-1.;
447   //
448   Double_t vecDriftLaserA[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,driftA,event->GetRunNumber()};
449   Double_t vecDriftLaserC[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,driftC,event->GetRunNumber()};
450   //  Double_t vecDrift[4]      ={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,1./((*(fLaser->fFitACside))[1])-1,event->GetRunNumber()};
451
452   for (Int_t icalib=0;icalib<3;icalib++){
453     if (icalib==0){ //z0 shift
454       vecDriftLaserA[2]=vdriftA[0]/250.;
455       vecDriftLaserC[2]=vdriftC[0]/250.;
456     }
457     if (icalib==1){ //vdrel shift
458       vecDriftLaserA[2]=driftA;
459       vecDriftLaserC[2]=driftC;
460     }
461     if (icalib==2){ //gy shift - full gy - full drift
462       vecDriftLaserA[2]=vdriftA[2]/250.;
463       vecDriftLaserC[2]=vdriftC[2]/250.;
464     }
465     if (isReject[0]==0) fHistVdriftLaserA[icalib]->Fill(vecDriftLaserA);
466     if (isReject[1]==0) fHistVdriftLaserC[icalib]->Fill(vecDriftLaserC);
467   }
468
469 //   THnSparse* curHist=new THnSparseF("","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
470 //   TString shortName=curHist->ClassName();
471 //   shortName+="_MEAN_DRIFT_LASER_";
472 //   delete curHist;
473 //   curHist=NULL;
474 //   TString name="";
475
476 //   name=shortName;
477 //   name+=event->GetFiredTriggerClasses();
478 //   name.ToUpper();
479 //   curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
480 //   if(!curHist){
481 //     curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
482 //     fArrayDz->AddLast(curHist);
483 //   }
484 //   curHist->Fill(vecDrift);
485           
486 //   name=shortName;
487 //   name+="ALL";
488 //   name.ToUpper();
489 //   curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
490 //   if(!curHist){
491 //     curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
492 //     fArrayDz->AddLast(curHist);
493 //   }
494 //   curHist->Fill(vecDrift);
495 }
496
497 void AliTPCcalibTime::ProcessCosmic(AliESDEvent *event){
498   if (!event) {
499     Printf("ERROR: ESD not available");
500     return;
501   }  
502   if (event->GetTimeStamp() == 0 ) {
503     Printf("no time stamp!");
504     return;
505   }
506   
507   //fd
508   // Find cosmic pairs
509   // 
510   // Track0 is choosen in upper TPC part
511   // Track1 is choosen in lower TPC part
512   //
513   const Int_t kMinClustersCross =30;
514   const Int_t kMinClusters      =80;
515   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks();
516   if (ntracks==0) return;
517   if (ntracks > fCutTracks) return;
518   
519   if (GetDebugLevel()>20) printf("Hallo world: Im here\n");
520   AliESDfriend *ESDfriend=static_cast<AliESDfriend*>(event->FindListObject("AliESDfriend"));
521   
522   TObjArray  tpcSeeds(ntracks);
523   Double_t vtxx[3]={0,0,0};
524   Double_t svtxx[3]={0.000001,0.000001,100.};
525   AliESDVertex vtx(vtxx,svtxx);
526   //
527   // track loop
528   //
529   TArrayI clusterSideA(ntracks);
530   TArrayI clusterSideC(ntracks);
531   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
532     clusterSideA[i]=0;
533     clusterSideC[i]=0;
534     AliESDtrack *track = event->GetTrack(i);
535     
536     const AliExternalTrackParam * trackIn = track->GetInnerParam();
537     const AliExternalTrackParam * trackOut = track->GetOuterParam();
538     if (!trackIn) continue;
539     if (!trackOut) continue;
540     
541     AliESDfriendTrack *friendTrack = ESDfriend->GetTrack(i);
542     if (friendTrack) ProcessSame(track,friendTrack,event);
543     if (friendTrack) ProcessAlignITS(track,friendTrack);
544     if (friendTrack) ProcessAlignTRD(track,friendTrack);
545     if (friendTrack) ProcessAlignTOF(track,friendTrack);
546     TObject *calibObject;
547     AliTPCseed *seed = 0;
548     for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
549     if (seed) {
550       tpcSeeds.AddAt(seed,i);
551       Int_t nA=0, nC=0;
552       for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
553         AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
554         if (!cl) continue;
555         if ((cl->GetDetector()%36)<18) nA++;
556         if ((cl->GetDetector()%36)>=18) nC++;
557       }
558       clusterSideA[i]=nA;
559       clusterSideC[i]=nC;
560     }
561   }
562   if (ntracks<2) return;
563   //
564   // Find pairs
565   //
566
567   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
568     AliESDtrack *track0 = event->GetTrack(i);
569     // track0 - choosen upper part
570     if (!track0) continue;
571     if (!track0->GetOuterParam()) continue;
572     if (track0->GetOuterParam()->GetAlpha()<0) continue;
573     Double_t d1[3];
574     track0->GetDirection(d1);    
575     for (Int_t j=0;j<ntracks;++j) {
576       if (i==j) continue;
577       AliESDtrack *track1 = event->GetTrack(j);   
578       //track 1 lower part
579       if (!track1) continue;
580       if (!track1->GetOuterParam()) continue;
581       if (track0->GetTPCNcls()+ track1->GetTPCNcls()< kMinClusters) continue;
582       Int_t nAC = TMath::Max( TMath::Min(clusterSideA[i], clusterSideC[j]), 
583                               TMath::Min(clusterSideC[i], clusterSideA[j]));
584       if (nAC<kMinClustersCross) continue; 
585       Int_t nA0=clusterSideA[i];
586       Int_t nC0=clusterSideC[i];
587       Int_t nA1=clusterSideA[j];
588       Int_t nC1=clusterSideC[j];
589       //      if (track1->GetOuterParam()->GetAlpha()>0) continue;
590       //
591       Double_t d2[3];
592       track1->GetDirection(d2);
593       
594       AliTPCseed * seed0 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(i);
595       AliTPCseed * seed1 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(j);
596       if (! seed0) continue;
597       if (! seed1) continue;
598       Float_t dir = (d1[0]*d2[0] + d1[1]*d2[1] + d1[2]*d2[2]);
599       Float_t dist0  = track0->GetLinearD(0,0);
600       Float_t dist1  = track1->GetLinearD(0,0);
601       //
602       // conservative cuts - convergence to be guarantied
603       // applying before track propagation
604       if (TMath::Abs(TMath::Abs(dist0)-TMath::Abs(dist1))>fCutMaxD) continue;   // distance to the 0,0
605       if (TMath::Abs(dir)<TMath::Abs(fCutMinDir)) continue;               // direction vector product
606       Float_t bz = AliTracker::GetBz();
607       Float_t dvertex0[2];   //distance to 0,0
608       Float_t dvertex1[2];   //distance to 0,0 
609       track0->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
610       track1->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
611       if (TMath::Abs(dvertex0[1])>250) continue;
612       if (TMath::Abs(dvertex1[1])>250) continue;
613       //
614       //
615       //
616       Float_t dmax = TMath::Max(TMath::Abs(dist0),TMath::Abs(dist1));
617       AliExternalTrackParam param0(*track0);
618       AliExternalTrackParam param1(*track1);
619       //
620       // Propagate using Magnetic field and correct fo material budget
621       //
622       AliTracker::PropagateTrackTo(&param0,dmax+1,0.0005,3,kTRUE);
623       AliTracker::PropagateTrackTo(&param1,dmax+1,0.0005,3,kTRUE);
624       //
625       // Propagate rest to the 0,0 DCA - z should be ignored
626       //
627       //Bool_t b0 = ;
628       param0.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
629       //Bool_t b1 = 
630       param1.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
631       param0.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
632       param1.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
633       Double_t xyz0[3];
634       Double_t xyz1[3];
635       param0.GetXYZ(xyz0);
636       param1.GetXYZ(xyz1);
637       Bool_t isPair = IsPair(&param0,&param1);
638       Bool_t isCross = IsCross(track0, track1);
639       Bool_t isSame = IsSame(track0, track1);
640
641       THnSparse* hist=new THnSparseF("","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
642       TString shortName=hist->ClassName();
643       shortName+="_MEAN_VDRIFT_COSMICS_";
644       delete hist;
645       hist=NULL;
646
647       if((isSame) || (isCross && isPair)){
648         if (track0->GetTPCNcls()+ track1->GetTPCNcls()> 80) {
649           fDz = param0.GetZ() - param1.GetZ();
650           Double_t sign=(nA0>nA1)? 1:-1; 
651           fDz*=sign;
652           TTimeStamp tstamp(fTime);
653           Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
654           Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
655           Double_t vecDrift[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,fDz/500.0,event->GetRunNumber()};
656           THnSparse* curHist=NULL;
657           TString name="";
658
659           name=shortName;
660           name+=event->GetFiredTriggerClasses();
661           name.ToUpper();
662           curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
663           if(!curHist){
664             curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
665             fArrayDz->AddLast(curHist);
666           }
667 //        curHist=(THnSparseF*)(fMapDz->GetValue(event->GetFiredTriggerClasses()));
668 //        if(!curHist){
669 //          curHist=new THnSparseF(event->GetFiredTriggerClasses(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
670 //          fMapDz->Add(new TObjString(event->GetFiredTriggerClasses()),curHist);
671 //        }
672           curHist->Fill(vecDrift);
673           
674           name=shortName;
675           name+="ALL";
676           name.ToUpper();
677           curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
678           if(!curHist){
679             curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
680             fArrayDz->AddLast(curHist);
681           }
682 //        curHist=(THnSparseF*)(fMapDz->GetValue("all"));
683 //        if(!curHist){
684 //          curHist=new THnSparseF("all","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
685 //          fMapDz->Add(new TObjString("all"),curHist);
686 //        }
687           curHist->Fill(vecDrift);
688         }
689       }
690       TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
691       if (fStreamLevel>0){
692         if (cstream){
693         (*cstream)<<"trackInfo"<<
694           "tr0.="<<track0<<
695           "tr1.="<<track1<<
696           "p0.="<<&param0<<
697           "p1.="<<&param1<<
698           "nAC="<<nAC<<
699           "nA0="<<nA0<<
700           "nA1="<<nA1<<
701           "nC0="<<nC0<<
702           "nC1="<<nC1<<
703           "isPair="<<isPair<<
704           "isCross="<<isCross<<
705           "isSame="<<isSame<<
706           "fDz="<<fDz<<
707           "fRun="<<fRun<<
708           "fTime="<<fTime<<
709           "\n";
710         }
711       }
712     } // end 2nd order loop        
713   } // end 1st order loop
714   
715   if (fStreamLevel>0){
716     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
717     if (cstream){
718       TTimeStamp tstamp(fTime);
719       Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
720       Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
721       Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
722       Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
723       Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
724       Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
725       Double_t vdcorr        = AliTPCcalibDB::Instance()->GetVDriftCorrectionTime(tstamp,fRun,0,1);
726       TVectorD vecGoofie(20);
727       AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
728       if (goofieArray){
729         for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
730           AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
731           if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
732         }
733       }
734       (*cstream)<<"timeInfo"<<
735         "run="<<fRun<<              //  run number
736         "event="<<fEvent<<          //  event number
737         "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
738         "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
739         "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
740         // Environment values
741         "press0="<<valuePressure0<<
742         "press1="<<valuePressure1<<
743         "pt0="<<ptrelative0<<
744         "pt1="<<ptrelative1<<
745         "temp0="<<temp0<<
746         "temp1="<<temp1<<
747         "vecGoofie.=<<"<<&vecGoofie<<
748         "vdcorr="<<vdcorr<<
749         //
750         // accumulated values
751         //
752         "fDz="<<fDz<<          //! current delta z
753         "trigger="<<event->GetFiredTriggerClasses()<<
754         "\n";
755     }
756   }
757   if (GetDebugLevel()>20) printf("Trigger: %s\n",event->GetFiredTriggerClasses().Data());
758 }
759
760 void AliTPCcalibTime::ProcessBeam(AliESDEvent */*event*/){
761 }
762
763 void AliTPCcalibTime::Analyze(){}
764
765 THnSparse* AliTPCcalibTime::GetHistoDrift(const char* name){
766   TIterator* iterator = fArrayDz->MakeIterator();
767   iterator->Reset();
768   TString newName=name;
769   newName.ToUpper();
770   THnSparse* newHist=new THnSparseF(newName,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
771   THnSparse* addHist=NULL;
772   while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())){
773   if(!addHist) continue;
774     TString histName=addHist->GetName();
775     if(!histName.Contains(newName)) continue;
776     addHist->Print();
777     newHist->Add(addHist);
778   }
779   return newHist;
780 }
781
782 TObjArray* AliTPCcalibTime::GetHistoDrift(){
783   return fArrayDz;
784 }
785
786 TGraphErrors* AliTPCcalibTime::GetGraphDrift(const char* name){
787   THnSparse* histoDrift=GetHistoDrift(name);
788   TGraphErrors* graphDrift=NULL;
789   if(histoDrift){
790     graphDrift=FitSlices(histoDrift,2,0,400,100,0.05,0.95, kTRUE);
791     TString end=histoDrift->GetName();
792     Int_t pos=end.Index("_");
793     end=end(pos,end.Capacity()-pos);
794     TString graphName=graphDrift->ClassName();
795     graphName+=end;
796     graphName.ToUpper();
797     graphDrift->SetName(graphName);
798   }
799   return graphDrift;
800 }
801
802 TObjArray* AliTPCcalibTime::GetGraphDrift(){
803   TObjArray* arrayGraphDrift=new TObjArray();
804   TIterator* iterator=fArrayDz->MakeIterator();
805   iterator->Reset();
806   THnSparse* addHist=NULL;
807   while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())) arrayGraphDrift->AddLast(GetGraphDrift(addHist->GetName()));
808   return arrayGraphDrift;
809 }
810
811 AliSplineFit* AliTPCcalibTime::GetFitDrift(const char* name){
812   TGraph* graphDrift=GetGraphDrift(name);
813   AliSplineFit* fitDrift=NULL;
814   if(graphDrift && graphDrift->GetN()){
815     fitDrift=new AliSplineFit();
816     fitDrift->SetGraph(graphDrift);
817     fitDrift->SetMinPoints(graphDrift->GetN()+1);
818     fitDrift->InitKnots(graphDrift,2,0,0.001);
819     fitDrift->SplineFit(0);
820     TString end=graphDrift->GetName();
821     Int_t pos=end.Index("_");
822     end=end(pos,end.Capacity()-pos);
823     TString fitName=fitDrift->ClassName();
824     fitName+=end;
825     fitName.ToUpper();
826     //fitDrift->SetName(fitName);
827     delete graphDrift;
828     graphDrift=NULL;
829   }
830   return fitDrift;
831 }
832
833 //TObjArray* AliTPCcalibTime::GetFitDrift(){
834 //  TObjArray* arrayFitDrift=new TObjArray();
835 //  TIterator* iterator = fArrayDz->MakeIterator();
836 //  iterator->Reset();
837 //  THnSparse* addHist=NULL;
838 //  while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())) arrayFitDrift->AddLast(GetFitDrift(addHist->GetName()));
839 //  return arrayFitDrift;
840 //}
841
842 Long64_t AliTPCcalibTime::Merge(TCollection *li) {
843   TIterator* iter = li->MakeIterator();
844   AliTPCcalibTime* cal = 0;
845
846   while ((cal = (AliTPCcalibTime*)iter->Next())) {
847     if (!cal->InheritsFrom(AliTPCcalibTime::Class())) {
848       Error("Merge","Attempt to add object of class %s to a %s", cal->ClassName(), this->ClassName());
849       return -1;
850     }
851     for (Int_t imeas=0; imeas<3; imeas++){
852       if (cal->GetHistVdriftLaserA(imeas) && cal->GetHistVdriftLaserA(imeas)){
853         fHistVdriftLaserA[imeas]->Add(cal->GetHistVdriftLaserA(imeas));
854         fHistVdriftLaserC[imeas]->Add(cal->GetHistVdriftLaserC(imeas));
855       }
856     }
857     TObjArray* addArray=cal->GetHistoDrift();
858     if(!addArray) return 0;
859     TIterator* iterator = addArray->MakeIterator();
860     iterator->Reset();
861     THnSparse* addHist=NULL;
862     while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())){
863       if(!addHist) continue;
864       addHist->Print();
865       THnSparse* localHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(addHist->GetName());
866       if(!localHist){
867         localHist=new THnSparseF(addHist->GetName(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
868         fArrayDz->AddLast(localHist);
869       }
870       localHist->Add(addHist);
871     }
872 //    TMap * addMap=cal->GetHistoDrift();
873 //    if(!addMap) return 0;
874 //    TIterator* iterator = addMap->MakeIterator();
875 //    iterator->Reset();
876 //    TPair* addPair=0;
877 //    while((addPair=(TPair *)(addMap->FindObject(iterator->Next())))){
878 //      THnSparse* addHist=dynamic_cast<THnSparseF*>(addPair->Value());
879 //      if (!addHist) continue;
880 //      addHist->Print();
881 //      THnSparse* localHist=dynamic_cast<THnSparseF*>(fMapDz->GetValue(addHist->GetName()));
882 //      if(!localHist){
883 //        localHist=new THnSparseF(addHist->GetName(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
884 //        fMapDz->Add(new TObjString(addHist->GetName()),localHist);
885 //      }
886 //      localHist->Add(addHist);
887 //    }
888     for(Int_t i=0;i<10;i++) if (cal->GetCosmiMatchingHisto(i)) fCosmiMatchingHisto[i]->Add(cal->GetCosmiMatchingHisto(i));
889     //
890     // Merge alignment
891     //
892     for (Int_t itype=0; itype<3; itype++){
893       //
894       //
895       TObjArray *arr0= 0;
896       TObjArray *arr1= 0;
897       if (itype==0) {arr0=fAlignITSTPC; arr1=cal->fAlignITSTPC;}
898       if (itype==1) {arr0=fAlignTRDTPC; arr1=cal->fAlignTRDTPC;}
899       if (itype==2) {arr0=fAlignTOFTPC; arr1=cal->fAlignTOFTPC;}
900       if (!arr1) continue;
901       if (!arr0) arr0=new TObjArray(arr1->GetEntriesFast());
902       if (arr1->GetEntriesFast()>arr0->GetEntriesFast()){
903         arr0->Expand(arr1->GetEntriesFast());
904       }
905       for (Int_t i=0;i<arr1->GetEntriesFast(); i++){
906         AliRelAlignerKalman *kalman1 = (AliRelAlignerKalman *)arr1->UncheckedAt(i);
907         AliRelAlignerKalman *kalman0 = (AliRelAlignerKalman *)arr0->UncheckedAt(i);
908         if (!kalman1)  continue;
909         if (!kalman0) {arr0->AddAt(new AliRelAlignerKalman(*kalman1),i); continue;}
910         kalman0->SetRejectOutliers(kFALSE);
911         kalman0->Merge(kalman1);
912       }
913     }
914
915   }
916   return 0;
917 }
918
919 Bool_t  AliTPCcalibTime::IsPair(AliExternalTrackParam *tr0, AliExternalTrackParam *tr1){
920   /*
921   // 0. Same direction - OPOSITE  - cutDir +cutT    
922   TCut cutDir("cutDir","dir<-0.99")
923   // 1. 
924   TCut cutT("cutT","abs(Tr1.fP[3]+Tr0.fP[3])<0.03")
925   //
926   // 2. The same rphi 
927   TCut cutD("cutD","abs(Tr0.fP[0]+Tr1.fP[0])<5")
928   //
929   TCut cutPt("cutPt","abs(Tr1.fP[4]+Tr0.fP[4])<1&&abs(Tr0.fP[4])+abs(Tr1.fP[4])<10");  
930   // 1/Pt diff cut
931   */
932   const Double_t *p0 = tr0->GetParameter();
933   const Double_t *p1 = tr1->GetParameter();
934   fCosmiMatchingHisto[0]->Fill(p0[0]+p1[0]);
935   fCosmiMatchingHisto[1]->Fill(p0[1]-p1[1]);
936   fCosmiMatchingHisto[2]->Fill(tr1->GetAlpha()-tr0->GetAlpha()+TMath::Pi());
937   fCosmiMatchingHisto[3]->Fill(p0[3]+p1[3]);
938   fCosmiMatchingHisto[4]->Fill(p0[4]+p1[4]);
939   
940   if (TMath::Abs(p0[3]+p1[3])>fCutTheta) return kFALSE;
941   if (TMath::Abs(p0[0]+p1[0])>fCutMaxD)  return kFALSE;
942   if (TMath::Abs(p0[1]-p1[1])>fCutMaxDz)  return kFALSE;
943   Double_t d0[3], d1[3];
944   tr0->GetDirection(d0);    
945   tr1->GetDirection(d1);       
946   if (d0[0]*d1[0] + d0[1]*d1[1] + d0[2]*d1[2] >fCutMinDir) return kFALSE;
947
948   fCosmiMatchingHisto[5]->Fill(p0[0]+p1[0]);
949   fCosmiMatchingHisto[6]->Fill(p0[1]-p1[1]);
950   fCosmiMatchingHisto[7]->Fill(tr1->GetAlpha()-tr0->GetAlpha()+TMath::Pi());
951   fCosmiMatchingHisto[8]->Fill(p0[3]+p1[3]);
952   fCosmiMatchingHisto[9]->Fill(p0[4]+p1[4]);
953
954   return kTRUE;  
955 }
956 Bool_t AliTPCcalibTime::IsCross(AliESDtrack *tr0, AliESDtrack *tr1){
957   //
958   // check if the cosmic pair of tracks crossed A/C side
959   // 
960   Bool_t result= tr0->GetOuterParam()->GetZ()*tr1->GetOuterParam()->GetZ()<0;
961   if (result==kFALSE) return result;
962   result=kTRUE;
963   return result;
964 }
965
966 Bool_t AliTPCcalibTime::IsSame(AliESDtrack *tr0, AliESDtrack *tr1){
967   // 
968   // track crossing the CE
969   // 0. minimal number of clusters 
970   // 1. Same sector +-1
971   // 2. Inner and outer track param on opposite side
972   // 3. Outer and inner track parameter close each to other
973   // 3. 
974   Bool_t result=kTRUE;
975   //
976   // inner and outer on opposite sides in z
977   //
978   const Int_t knclCut0  = 30;
979   const Double_t kalphaCut = 0.4;
980   //
981   // 0. minimal number of clusters
982   //
983   if (tr0->GetTPCNcls()<knclCut0) return kFALSE;
984   if (tr1->GetTPCNcls()<knclCut0) return kFALSE;
985   //
986   // 1. alpha cut - sector+-1
987   //
988   if (TMath::Abs(tr0->GetOuterParam()->GetAlpha()-tr1->GetOuterParam()->GetAlpha())>kalphaCut) return kFALSE;
989   //
990   // 2. Z crossing
991   //
992   if (tr0->GetOuterParam()->GetZ()*tr0->GetInnerParam()->GetZ()>0) result&=kFALSE;
993   if (tr1->GetOuterParam()->GetZ()*tr1->GetInnerParam()->GetZ()>0) result&=kFALSE;
994   if (result==kFALSE){
995     return result;
996   }
997   //
998   //
999   const Double_t *p0I = tr0->GetInnerParam()->GetParameter();
1000   const Double_t *p1I = tr1->GetInnerParam()->GetParameter();
1001   const Double_t *p0O = tr0->GetOuterParam()->GetParameter();
1002   const Double_t *p1O = tr1->GetOuterParam()->GetParameter();
1003   //
1004   if (TMath::Abs(p0I[0]-p1I[0])>fCutMaxD)  result&=kFALSE;
1005   if (TMath::Abs(p0I[1]-p1I[1])>fCutMaxDz) result&=kFALSE;
1006   if (TMath::Abs(p0I[2]-p1I[2])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1007   if (TMath::Abs(p0I[3]-p1I[3])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1008   if (TMath::Abs(p0O[0]-p1O[0])>fCutMaxD)  result&=kFALSE;
1009   if (TMath::Abs(p0O[1]-p1O[1])>fCutMaxDz) result&=kFALSE;
1010   if (TMath::Abs(p0O[2]-p1O[2])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1011   if (TMath::Abs(p0O[3]-p1O[3])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1012   if (result==kTRUE){
1013     result=kTRUE; // just to put break point here
1014   }
1015   return result;
1016 }
1017
1018
1019 void  AliTPCcalibTime::ProcessSame(AliESDtrack* track, AliESDfriendTrack *friendTrack,AliESDEvent *event){
1020   //
1021   // Process  TPC tracks crossing CE
1022   //
1023   // 0. Select only track crossing the CE
1024   // 1. Cut on the track length
1025   // 2. Refit the terack on A and C side separatelly
1026   // 3. Fill time histograms
1027   const Int_t kMinNcl=100;
1028   const Int_t kMinNclS=25;  // minimul number of clusters on the sides
1029   if (!friendTrack->GetTPCOut()) return;
1030   //
1031   // 0. Select only track crossing the CE
1032   //
1033   if (track->GetInnerParam()->GetZ()*friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()>0) return;
1034   //
1035   // 1. cut on track length
1036   //
1037   if (track->GetTPCNcls()<kMinNcl) return;
1038   //
1039   // 2. Refit track sepparatel on A and C side
1040   //
1041   TObject *calibObject;
1042   AliTPCseed *seed = 0;
1043   for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) {
1044     if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
1045   }
1046   if (!seed) return;
1047   //
1048   AliExternalTrackParam trackIn(*track->GetInnerParam());
1049   AliExternalTrackParam trackOut(*track->GetOuterParam());
1050   Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //use the same errors
1051   Double_t xyz[3]={0,0.,0.0};  
1052   Double_t bz   =0;
1053   Int_t nclIn=0,nclOut=0;
1054   trackIn.ResetCovariance(30.);
1055   trackOut.ResetCovariance(30.);
1056   //
1057   //2.a Refit inner
1058   // 
1059   for (Int_t irow=0;irow<159;irow++) {
1060     AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
1061     if (!cl) continue;
1062     if (cl->GetX()<80) continue;
1063     if (track->GetInnerParam()->GetZ()<0 &&(cl->GetDetector()%36)<18) break;
1064     if (track->GetInnerParam()->GetZ()>0 &&(cl->GetDetector()%36)>=18) break;
1065     Int_t sector = cl->GetDetector();
1066     Float_t dalpha = TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-trackIn.GetAlpha();
1067     if (TMath::Abs(dalpha)>0.01){
1068       if (!trackIn.Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.))) break;
1069     }
1070     Double_t r[3]={cl->GetX(),cl->GetY(),cl->GetZ()};
1071     trackIn.GetXYZ(xyz);
1072     bz = AliTracker::GetBz(xyz);
1073     if (!trackIn.PropagateTo(r[0],bz)) break;
1074     nclIn++;
1075     trackIn.Update(&r[1],cov);    
1076   }
1077   //
1078   //2.b Refit outer
1079   // 
1080   for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
1081     AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
1082     if (!cl) continue;
1083     if (cl->GetX()<80) continue;
1084     if (cl->GetZ()*track->GetOuterParam()->GetZ()<0) break;
1085     if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()<0 &&(cl->GetDetector()%36)<18) break;
1086     if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()>0 &&(cl->GetDetector()%36)>=18) break;
1087     Int_t sector = cl->GetDetector();
1088     Float_t dalpha = TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-trackOut.GetAlpha();
1089     if (TMath::Abs(dalpha)>0.01){
1090       if (!trackOut.Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.))) break;
1091     }
1092     Double_t r[3]={cl->GetX(),cl->GetY(),cl->GetZ()};
1093     trackOut.GetXYZ(xyz);
1094     bz = AliTracker::GetBz(xyz);
1095     if (!trackOut.PropagateTo(r[0],bz)) break;
1096     nclOut++;
1097     trackOut.Update(&r[1],cov);    
1098   }
1099   trackOut.Rotate(trackIn.GetAlpha());
1100   Double_t meanX = (trackIn.GetX()+trackOut.GetX())*0.5;
1101   trackIn.PropagateTo(meanX,bz); 
1102   trackOut.PropagateTo(meanX,bz); 
1103   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
1104   if (cstream){
1105     TVectorD gxyz(3);
1106     trackIn.GetXYZ(gxyz.GetMatrixArray());
1107     TTimeStamp tstamp(fTime);
1108     Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1109     Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1110     Double_t vdcorr        = AliTPCcalibDB::Instance()->GetVDriftCorrectionTime(tstamp,fRun,0,1);
1111     (*cstream)<<"tpctpc"<<
1112       "run="<<fRun<<              //  run number
1113       "event="<<fEvent<<          //  event number
1114       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1115       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1116       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1117       "ptrel0.="<<ptrelative0<<
1118       "ptrel1.="<<ptrelative1<<
1119       "vdcorr="<<vdcorr<<        // drift correction applied
1120       //
1121       "xyz.="<<&gxyz<<             // global position
1122       "tIn.="<<&trackIn<<         // refitterd track in 
1123       "tOut.="<<&trackOut<<       // refitter track out
1124       "nclIn="<<nclIn<<           // 
1125       "nclOut="<<nclOut<<         //
1126       "\n";  
1127   }
1128   //
1129   // 3. Fill time histograms
1130   // Debug stremaer expression
1131   // chainTPCTPC->Draw("(tIn.fP[1]-tOut.fP[1])*sign(-tIn.fP[3]):tIn.fP[3]","min(nclIn,nclOut)>30","")
1132   if (TMath::Min(nclIn,nclOut)>kMinNclS){
1133     fDz = trackOut.GetZ()-trackIn.GetZ();
1134     if (trackOut.GetTgl()<0) fDz*=-1.;
1135     TTimeStamp tstamp(fTime);
1136     Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1137     Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1138     Double_t vecDrift[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,fDz/500.0,event->GetRunNumber()};
1139     //
1140     // fill histograms per trigger class and itegrated
1141     //
1142     THnSparse* curHist=NULL;
1143     for (Int_t itype=0; itype<2; itype++){
1144       TString name="MEAN_VDRIFT_CROSS_";  
1145       if (itype==0){
1146         name+=event->GetFiredTriggerClasses();
1147         name.ToUpper();
1148       }else{
1149         name+="ALL";
1150       }
1151       curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
1152       if(!curHist){
1153         curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
1154         fArrayDz->AddLast(curHist);
1155       }
1156       curHist->Fill(vecDrift);
1157     }
1158   }
1159
1160 }
1161
1162 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignITS(AliESDtrack* track, AliESDfriendTrack *friendTrack){
1163   //
1164   // Process track - Update TPC-ITS alignment
1165   // Updates: 
1166   // 0. Apply standartd cuts 
1167   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1168   // 2. Apply median+-rms cut
1169   // 3. Update kalman filter
1170   //
1171   const Int_t    kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1172   const Int_t    kMinITS  = 3;     // minimal number of ITS cluster
1173   const Double_t kMinZ    = 10;    // maximal dz distance
1174   const Double_t kMaxDy   = 1.;    // maximal dy distance
1175   const Double_t kMaxAngle= 0.01;  // maximal angular distance
1176   const Double_t kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1177   const Double_t kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1178   const Double_t kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1179   const Double_t kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1180   const  Int_t     kN=500;         // deepnes of history
1181   static Int_t     kglast=0;
1182   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1183   /*
1184     0. Standrd cuts:
1185     TCut cut="abs(pTPC.fP[2]-pITS.fP[2])<0.01&&abs(pTPC.fP[3]-pITS.fP[3])<0.01&&abs(pTPC.fP[2]-pITS.fP[2])<1";
1186   */
1187   //
1188   // 0. Apply standard cuts
1189   //
1190   Int_t dummycl[1000];
1191   if (track->GetITSclusters(dummycl)<kMinITS) return;  // minimal amount of clusters
1192   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1193   if (!friendTrack->GetITSOut()) return;  
1194   if (!track->GetInnerParam())   return;
1195   if (!track->GetOuterParam())   return;
1196   // exclude crossing track
1197   if (track->GetOuterParam()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1198   if (TMath::Abs(track->GetInnerParam()->GetZ())<kMinZ)   return;
1199   //
1200   AliExternalTrackParam &pTPC=(AliExternalTrackParam &)(*(track->GetInnerParam()));
1201   AliExternalTrackParam pITS(*(friendTrack->GetITSOut()));
1202   pITS.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1203   pITS.PropagateTo(pTPC.GetX(),fMagF);
1204   if (TMath::Abs(pITS.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1205   if (TMath::Abs(pITS.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1206   if (TMath::Abs(pITS.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1207   //
1208   // 1. Update median and RMS info
1209   //
1210   TVectorD vecDelta(4),vecMedian(4), vecRMS(4);
1211   TVectorD vecDeltaN(5);
1212   Double_t sign=(pITS.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1213   vecDelta[4]=0;
1214   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1215     vecDelta[i]=(pITS.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1216     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1217   }
1218   kglast=(kglast+1);
1219   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1220   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1221     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1222     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1223     vecDeltaN[i] = 0;
1224     if (vecRMS[i]>0.){
1225       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/vecRMS[i];
1226       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1227     }
1228   }
1229   //
1230   // 2. Apply median+-rms cut
1231   //
1232   if (kglast<3)  return;   //median and RMS to be defined
1233   if ( vecDeltaN[4]/4.>kSigmaCut) return;
1234   //
1235   // 3. Update alignment
1236   //
1237   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1238   if (fAlignITSTPC->GetEntries()<htime){
1239     fAlignITSTPC->Expand(htime*2+20);
1240   }
1241   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignITSTPC->At(htime);
1242   if (!align){
1243     // make Alignment object if doesn't exist
1244     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1245     align->SetRunNumber(fRun);
1246     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1247     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1248     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1249     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1250
1251     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1252     align->SetMagField(fMagF); 
1253     fAlignITSTPC->AddAt(align,htime);
1254   }
1255   align->AddTrackParams(&pITS,&pTPC);
1256   align->SetTimeStamp(fTime);
1257   align->SetRunNumber(fRun );
1258   //
1259   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1260   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1261   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1262   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1263   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1264     TTimeStamp tstamp(fTime);
1265     Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
1266     Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
1267     Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1268     Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1269     Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
1270     Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
1271     TVectorD vecGoofie(20);
1272     AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
1273     if (goofieArray){
1274       for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
1275         AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
1276         if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
1277       }
1278     }
1279     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1280     TVectorD gpITS(3), gdITS(3);
1281     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1282     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1283     pITS.GetXYZ(gpITS.GetMatrixArray());
1284     pITS.GetDirection(gdITS.GetMatrixArray());
1285     Double_t vdcorr        = AliTPCcalibDB::Instance()->GetVDriftCorrectionTime(tstamp,fRun,0,1);
1286     (*cstream)<<"itstpc"<<
1287       "run="<<fRun<<              //  run number
1288       "event="<<fEvent<<          //  event number
1289       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1290       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1291       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1292       // Environment values
1293       "press0="<<valuePressure0<<
1294       "press1="<<valuePressure1<<
1295       "pt0="<<ptrelative0<<
1296       "pt1="<<ptrelative1<<
1297       "temp0="<<temp0<<
1298       "temp1="<<temp1<<
1299       "vecGoofie.="<<&vecGoofie<<
1300       "vdcorr="<<vdcorr<<        // drift correction applied
1301       //
1302       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1303       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1304       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1305       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1306       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1307       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1308       "a.="<<align<<            // current alignment
1309       "pITS.="<<&pITS<<         // track param ITS
1310       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1311       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1312       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1313       "gpITS.="<<&gpITS<<       // global position  ITS
1314       "gdITS.="<<&gdITS<<       // global position  ITS
1315       "\n";
1316   }
1317 }
1318
1319
1320
1321
1322 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignTRD(AliESDtrack* track, AliESDfriendTrack *friendTrack){
1323   //
1324   // Process track - Update TPC-TRD alignment
1325   // Updates: 
1326   // 0. Apply standartd cuts 
1327   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1328   // 2. Apply median+-rms cut
1329   // 3. Update kalman filter
1330   //
1331   const Int_t    kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1332   const Int_t    kMinTRD  = 50;    // minimal number of TRD cluster
1333   const Double_t kMinZ    = 20;    // maximal dz distance
1334   const Double_t kMaxDy   = 1.;    // maximal dy distance
1335   const Double_t kMaxAngle= 0.01;  // maximal angular distance
1336   const Double_t kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1337   const Double_t kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1338   const Double_t kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1339   const Double_t kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1340   const  Int_t     kN=500;         // deepnes of history
1341   static Int_t     kglast=0;
1342   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1343   //
1344   // 0. Apply standard cuts
1345   //
1346   Int_t dummycl[1000];
1347   if (track->GetTRDclusters(dummycl)<kMinTRD) return;  // minimal amount of clusters
1348   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1349   if (!friendTrack->GetTRDIn()) return;  
1350   if (!track->GetInnerParam())   return;
1351   if (!track->GetOuterParam())   return;
1352   // exclude crossing track
1353   if (track->GetOuterParam()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1354   if (TMath::Abs(track->GetInnerParam()->GetZ())<kMinZ)   return;
1355   //
1356   AliExternalTrackParam &pTPC=(AliExternalTrackParam &)(*(track->GetOuterParam()));
1357   AliExternalTrackParam pTRD(*(friendTrack->GetTRDIn()));
1358   pTRD.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1359   pTRD.PropagateTo(pTPC.GetX(),fMagF);
1360   ((Double_t*)pTRD.GetCovariance())[2]+=3.*3.;   // increas sys errors
1361   ((Double_t*)pTRD.GetCovariance())[9]+=0.1*0.1; // increse sys errors
1362
1363   if (TMath::Abs(pTRD.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1364   if (TMath::Abs(pTRD.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1365   if (TMath::Abs(pTRD.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1366   //
1367   // 1. Update median and RMS info
1368   //
1369   TVectorD vecDelta(4),vecMedian(4), vecRMS(4);
1370   TVectorD vecDeltaN(5);
1371   Double_t sign=(pTRD.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1372   vecDelta[4]=0;
1373   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1374     vecDelta[i]=(pTRD.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1375     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1376   }
1377   kglast=(kglast+1);
1378   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1379   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1380     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1381     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1382     vecDeltaN[i] = 0;
1383     if (vecRMS[i]>0.){
1384       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/vecRMS[i];
1385       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1386     }
1387   }
1388   //
1389   // 2. Apply median+-rms cut
1390   //
1391   if (kglast<3)  return;   //median and RMS to be defined
1392   if ( vecDeltaN[4]/4.>kSigmaCut) return;
1393   //
1394   // 3. Update alignment
1395   //
1396   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1397   if (fAlignTRDTPC->GetEntries()<htime){
1398     fAlignTRDTPC->Expand(htime*2+20);
1399   }
1400   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignTRDTPC->At(htime);
1401   if (!align){
1402     // make Alignment object if doesn't exist
1403     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1404     align->SetRunNumber(fRun);
1405     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1406     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1407     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1408     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1409     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1410     align->SetMagField(fMagF); 
1411     fAlignTRDTPC->AddAt(align,htime);
1412   }
1413   align->AddTrackParams(&pTRD,&pTPC);
1414   align->SetTimeStamp(fTime);
1415   align->SetRunNumber(fRun );
1416   //
1417   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1418   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1419   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1420   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1421   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1422     TTimeStamp tstamp(fTime);
1423     Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
1424     Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
1425     Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1426     Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1427     Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
1428     Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
1429     TVectorD vecGoofie(20);
1430     AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
1431     if (goofieArray){
1432       for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
1433         AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
1434         if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
1435       }
1436     }
1437     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1438     TVectorD gpTRD(3), gdTRD(3);
1439     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1440     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1441     pTRD.GetXYZ(gpTRD.GetMatrixArray());
1442     pTRD.GetDirection(gdTRD.GetMatrixArray());
1443     Double_t vdcorr        = AliTPCcalibDB::Instance()->GetVDriftCorrectionTime(tstamp,fRun,0,1);
1444     (*cstream)<<"trdtpc"<<
1445       "run="<<fRun<<              //  run number
1446       "event="<<fEvent<<          //  event number
1447       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1448       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1449       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1450       // Environment values
1451       "press0="<<valuePressure0<<
1452       "press1="<<valuePressure1<<
1453       "pt0="<<ptrelative0<<
1454       "pt1="<<ptrelative1<<
1455       "temp0="<<temp0<<
1456       "temp1="<<temp1<<
1457       "vecGoofie.="<<&vecGoofie<<
1458       "vdcorr="<<vdcorr<<        // drift correction applied
1459       //
1460       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1461       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1462       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1463       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1464       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1465       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1466       "a.="<<align<<            // current alignment
1467       "pTRD.="<<&pTRD<<         // track param TRD
1468       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1469       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1470       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1471       "gpTRD.="<<&gpTRD<<       // global position  TRD
1472       "gdTRD.="<<&gdTRD<<       // global position  TRD
1473       "\n";
1474   }
1475 }
1476
1477
1478 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignTOF(AliESDtrack* track, AliESDfriendTrack *friendTrack){
1479   //
1480   //
1481   // Process track - Update TPC-TOF alignment
1482   // Updates: 
1483   // -1. Make a TOF "track"
1484   // 0. Apply standartd cuts 
1485   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1486   // 2. Apply median+-rms cut
1487   // 3. Update kalman filter
1488   //
1489   const Int_t      kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1490   const Double_t   kMinZ    = 10;    // maximal dz distance
1491   const Double_t   kMaxDy   = 5.;    // maximal dy distance
1492   const Double_t   kMaxAngle= 0.01;  // maximal angular distance
1493   const Double_t   kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1494   const Double_t   kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1495   const Double_t   kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1496
1497   const Double_t   kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1498   const  Int_t     kN=1000;         // deepnes of history
1499   static Int_t     kglast=0;
1500   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1501   //
1502   // -1. Make a TOF track-
1503   //     Clusters are not in friends - use alingment points
1504   //
1505   if (track->GetTOFsignal()<=0)  return;
1506   if (!friendTrack->GetTPCOut()) return;
1507   if (!track->GetInnerParam())   return;
1508   if (!track->GetOuterParam())   return;
1509   const AliTrackPointArray *points=friendTrack->GetTrackPointArray();
1510   if (!points) return;
1511   AliExternalTrackParam pTPC(*(track->GetOuterParam()));
1512   AliExternalTrackParam pTOF(pTPC);
1513   Double_t mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("mu+")->Mass();
1514   Int_t npoints = points->GetNPoints();
1515   AliTrackPoint point;
1516   Int_t naccept=0;
1517   //
1518   for (Int_t ipoint=0;ipoint<npoints;ipoint++){
1519     points->GetPoint(point,ipoint);
1520     Float_t xyz[3];
1521     point.GetXYZ(xyz);
1522     Double_t r=TMath::Sqrt(xyz[0]*xyz[0]+xyz[1]*xyz[1]);
1523     if (r<350)  continue;
1524     if (r>400)  continue;
1525     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,r,mass,2.,kTRUE);
1526     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,r,mass,0.1,kTRUE);    
1527     AliTrackPoint lpoint = point.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1528     pTPC.PropagateTo(lpoint.GetX(),fMagF);
1529     pTOF=pTPC;
1530     ((Double_t*)pTOF.GetParameter())[0] =lpoint.GetY();
1531     ((Double_t*)pTOF.GetParameter())[1] =lpoint.GetZ();
1532     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[0]+=3.*3./12.;
1533     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[2]+=3.*3./12.;
1534     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[5]+=0.1*0.1;
1535     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[9]+=0.1*0.1;
1536     naccept++;
1537   }
1538   if (naccept==0) return;  // no tof match clusters
1539   //
1540   // 0. Apply standard cuts
1541   //
1542   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1543   // exclude crossing track
1544   if (track->GetOuterParam()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1545   //
1546   if (TMath::Abs(pTOF.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1547   if (TMath::Abs(pTOF.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1548   if (TMath::Abs(pTOF.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1549   //
1550   // 1. Update median and RMS info
1551   //
1552   TVectorD vecDelta(4),vecMedian(4), vecRMS(4);
1553   TVectorD vecDeltaN(5);
1554   Double_t sign=(pTOF.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1555   vecDelta[4]=0;
1556   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1557     vecDelta[i]=(pTOF.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1558     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1559   }
1560   kglast=(kglast+1);
1561   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1562   Bool_t isOK=kTRUE;
1563   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1564     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1565     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1566     vecDeltaN[i] = 0;
1567     if (vecRMS[i]>0.){
1568       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/(vecRMS[i]+1.);
1569       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1570       if (TMath::Abs(vecDeltaN[i])>kSigmaCut) isOK=kFALSE;
1571     }
1572   }
1573   //
1574   // 2. Apply median+-rms cut
1575   //
1576   if (kglast<10)  return;   //median and RMS to be defined
1577   if (!isOK) return;
1578   //
1579   // 3. Update alignment
1580   //
1581   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1582   if (fAlignTOFTPC->GetEntries()<htime){
1583     fAlignTOFTPC->Expand(htime*2+20);
1584   }
1585   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignTOFTPC->At(htime);
1586   if (!align){
1587     // make Alignment object if doesn't exist
1588     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1589     align->SetRunNumber(fRun);
1590     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1591     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1592     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1593     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1594     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1595     align->SetMagField(fMagF); 
1596     fAlignTOFTPC->AddAt(align,htime);
1597   }
1598   align->AddTrackParams(&pTOF,&pTPC);
1599   align->SetTimeStamp(fTime);
1600   align->SetRunNumber(fRun );
1601   //
1602   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1603   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1604   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1605   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1606   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1607     TTimeStamp tstamp(fTime);
1608     Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
1609     Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
1610     Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1611     Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1612     Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
1613     Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
1614     TVectorD vecGoofie(20);
1615     AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
1616     if (goofieArray){
1617       for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
1618         AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
1619         if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
1620       }
1621     }
1622     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1623     TVectorD gpTOF(3), gdTOF(3);
1624     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1625     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1626     pTOF.GetXYZ(gpTOF.GetMatrixArray());
1627     pTOF.GetDirection(gdTOF.GetMatrixArray());
1628     Double_t vdcorr        = AliTPCcalibDB::Instance()->GetVDriftCorrectionTime(tstamp,fRun,0,1);
1629     (*cstream)<<"toftpc"<<
1630       "run="<<fRun<<              //  run number
1631       "event="<<fEvent<<          //  event number
1632       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1633       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1634       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1635       // Environment values
1636       "press0="<<valuePressure0<<
1637       "press1="<<valuePressure1<<
1638       "pt0="<<ptrelative0<<
1639       "pt1="<<ptrelative1<<
1640       "temp0="<<temp0<<
1641       "temp1="<<temp1<<
1642       "vecGoofie.="<<&vecGoofie<<
1643       "vdcorr="<<vdcorr<<        // drift correction applied
1644       //
1645       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1646       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1647       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1648       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1649       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1650       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1651       "a.="<<align<<            // current alignment
1652       "pTOF.="<<&pTOF<<         // track param TOF
1653       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1654       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1655       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1656       "gpTOF.="<<&gpTOF<<       // global position  TOF
1657       "gdTOF.="<<&gdTOF<<       // global position  TOF
1658       "\n";
1659   }
1660 }
1661
1662