M AliTPCcalibTime.cxx - removed printf message
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCcalibTime.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /*
17 Comments to be written here:
18
19 1. What do we calibrate.
20
21   Time dependence of gain and drift velocity in order to account for changes in: temperature, pressure, gas composition.
22
23   AliTPCcalibTime *calibTime = new AliTPCcalibTime("cosmicTime","cosmicTime",0, 1213.9e+06, 1213.96e+06, 0.04e+04, 0.04e+04);
24
25 2. How to interpret results
26
27 3. Simple example
28
29   a) determine the required time range:
30
31   AliXRDPROOFtoolkit tool;
32   TChain * chain = tool.MakeChain("pass2.txt","esdTree",0,6000);
33   chain->Draw("GetTimeStamp()")
34
35   b) analyse calibration object on Proof in calibration train 
36
37   AliTPCcalibTime *calibTime = new AliTPCcalibTime("cosmicTime","cosmicTime", StartTimeStamp, EndTimeStamp, IntegrationTimeVdrift);
38
39   c) plot results
40   .x ~/NimStyle.C
41   gSystem->Load("libANALYSIS");
42   gSystem->Load("libTPCcalib");
43
44   TFile f("CalibObjectsTrain1.root");
45   AliTPCcalibTime *calib = (AliTPCcalibTime *)f->Get("calibTime");
46   calib->GetHistoDrift("all")->Projection(2,0)->Draw()
47   calib->GetFitDrift("all")->Draw("lp")
48
49 4. Analysis using debug streamers.    
50
51   gSystem->AddIncludePath("-I$ALICE_ROOT/TPC/macros");
52   gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/TPC/macros/AliXRDPROOFtoolkit.cxx+")
53   AliXRDPROOFtoolkit tool;
54   TChain * chainTime = tool.MakeChainRandom("time.txt","trackInfo",0,10000);
55
56   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timetpctpc.txt","* tpctpc",1) 
57   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timetoftpc.txt","* toftpc",1) 
58   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timeitstpc.txt","* itstpc",1) 
59   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timelaser.txt","* laserInfo",1)  
60   TChain * chainTPCTPC = tool.MakeChainRandom("timetpctpc.txt.Good","tpctpc",0,10000); 
61   TChain * chainTPCITS = tool.MakeChainRandom("timeitstpc.txt.Good","itstpc",0,10000); 
62   TChain * chainTPCTOF = tool.MakeChainRandom("timetoftpc.txt.Good","toftpc",0,10000); 
63   TChain * chainLaser = tool.MakeChainRandom("timelaser.txt.Good","laserInfo",0,10000);
64   chainTime->Lookup();
65   chainLaser->Lookup();
66 */
67
68 #include "Riostream.h"
69 #include "TChain.h"
70 #include "TTree.h"
71 #include "TH1F.h"
72 #include "TH2F.h"
73 #include "TH3F.h"
74 #include "THnSparse.h"
75 #include "TList.h"
76 #include "TMath.h"
77 #include "TCanvas.h"
78 #include "TFile.h"
79 #include "TF1.h"
80 #include "TVectorD.h"
81 #include "TProfile.h"
82 #include "TGraphErrors.h"
83 #include "TCanvas.h"
84 #include "AliTPCclusterMI.h"
85 #include "AliTPCseed.h"
86 #include "AliESDVertex.h"
87 #include "AliESDEvent.h"
88 #include "AliESDfriend.h"
89 #include "AliESDInputHandler.h"
90 #include "AliAnalysisManager.h"
91
92 #include "AliTracker.h"
93 #include "AliMagF.h"
94 #include "AliTPCCalROC.h"
95 #include "AliTPCParam.h"
96
97 #include "AliLog.h"
98
99 #include "AliTPCcalibTime.h"
100 #include "AliRelAlignerKalman.h"
101
102 #include "TTreeStream.h"
103 #include "AliTPCTracklet.h"
104 #include "TTimeStamp.h"
105 #include "AliTPCcalibDB.h"
106 #include "AliTPCcalibLaser.h"
107 #include "AliDCSSensorArray.h"
108 #include "AliDCSSensor.h"
109
110 #include "TDatabasePDG.h"
111 #include "AliTrackPointArray.h"
112
113 ClassImp(AliTPCcalibTime)
114
115
116 AliTPCcalibTime::AliTPCcalibTime() 
117   :AliTPCcalibBase(), 
118    fLaser(0),       // pointer to laser calibration
119    fDz(0),          // current delta z
120    fCutMaxD(3),        // maximal distance in rfi ditection
121    fCutMaxDz(25),      // maximal distance in rfi ditection
122    fCutTheta(0.03),    // maximal distan theta
123    fCutMinDir(-0.99),  // direction vector products
124    fCutTracks(10),
125    fArrayDz(0),          //NEW! Tmap of V drifts for different triggers
126    fAlignITSTPC(0),      //alignemnt array ITS TPC match
127    fAlignTRDTPC(0),      //alignemnt array TRD TPC match 
128    fAlignTOFTPC(0),      //alignemnt array TOF TPC match
129    fTimeBins(0),
130    fTimeStart(0),
131    fTimeEnd(0),
132    fPtBins(0),
133    fPtStart(0),
134    fPtEnd(0),
135    fVdriftBins(0),
136    fVdriftStart(0),
137    fVdriftEnd(0),
138    fRunBins(0),
139    fRunStart(0),
140    fRunEnd(0)
141 //   fBinsVdrift(fTimeBins,fPtBins,fVdriftBins),
142 //   fXminVdrift(fTimeStart,fPtStart,fVdriftStart),
143 //   fXmaxVdrift(fTimeEnd,fPtEnd,fVdriftEnd)
144 {  
145   AliInfo("Default Constructor");  
146   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
147     fHistVdriftLaserA[i]=0;
148     fHistVdriftLaserC[i]=0;
149   }
150   for (Int_t i=0;i<10;i++) {
151     fCosmiMatchingHisto[i]=0;
152   }
153 }
154
155 AliTPCcalibTime::AliTPCcalibTime(const Text_t *name, const Text_t *title, UInt_t StartTime, UInt_t EndTime, Int_t deltaIntegrationTimeVdrift)
156   :AliTPCcalibBase(),
157    fLaser(0),            // pointer to laser calibration
158    fDz(0),               // current delta z
159    fCutMaxD(5*0.5356),   // maximal distance in rfi ditection
160    fCutMaxDz(40),   // maximal distance in rfi ditection
161    fCutTheta(5*0.004644),// maximal distan theta
162    fCutMinDir(-0.99),    // direction vector products
163    fCutTracks(10),
164    fArrayDz(0),            //Tmap of V drifts for different triggers
165    fAlignITSTPC(0),      //alignemnt array ITS TPC match
166    fAlignTRDTPC(0),      //alignemnt array TRD TPC match 
167    fAlignTOFTPC(0),      //alignemnt array TOF TPC match
168    fTimeBins(0),
169    fTimeStart(0),
170    fTimeEnd(0),
171    fPtBins(0),
172    fPtStart(0),
173    fPtEnd(0),
174    fVdriftBins(0),
175    fVdriftStart(0),
176    fVdriftEnd(0),
177    fRunBins(0),
178    fRunStart(0),
179    fRunEnd(0)
180 {
181   SetName(name);
182   SetTitle(title);
183   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
184     fHistVdriftLaserA[i]=0;
185     fHistVdriftLaserC[i]=0;
186   }
187
188   AliInfo("Non Default Constructor");
189   fTimeBins   =(EndTime-StartTime)/deltaIntegrationTimeVdrift;
190   fTimeStart  =StartTime; //(((TObjString*)(mapGRP->GetValue("fAliceStartTime")))->GetString()).Atoi();
191   fTimeEnd    =EndTime;   //(((TObjString*)(mapGRP->GetValue("fAliceStopTime")))->GetString()).Atoi();
192   fPtBins     = 400;
193   fPtStart    = -0.04;
194   fPtEnd      =  0.04;
195   fVdriftBins = 500;
196   fVdriftStart= -0.1;
197   fVdriftEnd  =  0.1;
198   fRunBins    = 100001;
199   fRunStart   = -1.5;
200   fRunEnd     = 99999.5;
201
202   Int_t    binsVdriftLaser[4] = {fTimeBins , fPtBins , fVdriftBins*20, fRunBins };
203   Double_t xminVdriftLaser[4] = {fTimeStart, fPtStart, fVdriftStart  , fRunStart};
204   Double_t xmaxVdriftLaser[4] = {fTimeEnd  , fPtEnd  , fVdriftEnd    , fRunEnd  };
205   TString axisTitle[4]={
206     "T",
207     "#delta_{P/T}",
208     "value",
209     "run"
210   };
211   TString histoName[3]={
212     "Loffset",
213     "Lcorr",
214     "Lgy"
215   };
216
217   
218   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
219     fHistVdriftLaserA[i] = new THnSparseF("HistVdriftLaser","HistVdriftLaser;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,binsVdriftLaser,xminVdriftLaser,xmaxVdriftLaser);
220     fHistVdriftLaserC[i] = new THnSparseF("HistVdriftLaser","HistVdriftLaser;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,binsVdriftLaser,xminVdriftLaser,xmaxVdriftLaser);
221     fHistVdriftLaserA[i]->SetName(histoName[i]);
222     fHistVdriftLaserC[i]->SetName(histoName[i]);
223     for (Int_t iaxis=0; iaxis<4;iaxis++){
224       fHistVdriftLaserA[i]->GetAxis(iaxis)->SetName(axisTitle[iaxis]);
225       fHistVdriftLaserC[i]->GetAxis(iaxis)->SetName(axisTitle[iaxis]);
226     }
227   }
228   fBinsVdrift[0] = fTimeBins;
229   fBinsVdrift[1] = fPtBins;
230   fBinsVdrift[2] = fVdriftBins;
231   fBinsVdrift[3] = fRunBins;
232   fXminVdrift[0] = fTimeStart;
233   fXminVdrift[1] = fPtStart;
234   fXminVdrift[2] = fVdriftStart;
235   fXminVdrift[3] = fRunStart;
236   fXmaxVdrift[0] = fTimeEnd;
237   fXmaxVdrift[1] = fPtEnd;
238   fXmaxVdrift[2] = fVdriftEnd;
239   fXmaxVdrift[3] = fRunEnd;
240
241   fArrayDz=new TObjArray();
242   fAlignITSTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
243   fAlignTRDTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
244   fAlignTOFTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
245   fAlignITSTPC->SetOwner(kTRUE);
246   fAlignTRDTPC->SetOwner(kTRUE);
247   fAlignTOFTPC->SetOwner(kTRUE);
248   
249   // fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserA[0]);
250 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserA[1]);
251 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserA[2]);
252 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserC[0]);
253 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserC[1]);
254 //   fArrayDz->AddLast(fHistVdriftLaserC[2]);
255
256   fCosmiMatchingHisto[0]=new TH1F("Cosmics matching","p0-all"   ,100,-10*0.5356  ,10*0.5356  );
257   fCosmiMatchingHisto[1]=new TH1F("Cosmics matching","p1-all"   ,100,-10*4.541   ,10*4.541   );
258   fCosmiMatchingHisto[2]=new TH1F("Cosmics matching","p2-all"   ,100,-10*0.01134 ,10*0.01134 );
259   fCosmiMatchingHisto[3]=new TH1F("Cosmics matching","p3-all"   ,100,-10*0.004644,10*0.004644);
260   fCosmiMatchingHisto[4]=new TH1F("Cosmics matching","p4-all"   ,100,-10*0.03773 ,10*0.03773 );
261   fCosmiMatchingHisto[5]=new TH1F("Cosmics matching","p0-isPair",100,-10*0.5356  ,10*0.5356  );
262   fCosmiMatchingHisto[6]=new TH1F("Cosmics matching","p1-isPair",100,-10*4.541   ,10*4.541   );
263   fCosmiMatchingHisto[7]=new TH1F("Cosmics matching","p2-isPair",100,-10*0.01134 ,10*0.01134 );
264   fCosmiMatchingHisto[8]=new TH1F("Cosmics matching","p3-isPair",100,-10*0.004644,10*0.004644);
265   fCosmiMatchingHisto[9]=new TH1F("Cosmics matching","p4-isPair",100,-10*0.03773 ,10*0.03773 );
266 //  Char_t nameHisto[3]={'p','0','\n'};
267 //  for (Int_t i=0;i<10;i++){
268 //    fCosmiMatchingHisto[i]=new TH1F("Cosmics matching",nameHisto,8192,0,0);
269 //    nameHisto[1]++;
270 //    if(i==4) nameHisto[1]='0';
271 //  }
272 }
273
274 AliTPCcalibTime::~AliTPCcalibTime(){
275   //
276   // Destructor
277   //
278   for(Int_t i=0;i<3;i++){
279     if(fHistVdriftLaserA[i]){
280       delete fHistVdriftLaserA[i];
281       fHistVdriftLaserA[i]=NULL;
282     }
283     if(fHistVdriftLaserC[i]){
284       delete fHistVdriftLaserC[i];
285       fHistVdriftLaserC[i]=NULL;
286     }
287   }
288   if(fArrayDz){
289     fArrayDz->SetOwner();
290     fArrayDz->Delete();
291     delete fArrayDz;
292     fArrayDz=NULL;
293   }
294   for(Int_t i=0;i<5;i++){
295     if(fCosmiMatchingHisto[i]){
296       delete fCosmiMatchingHisto[i];
297       fCosmiMatchingHisto[i]=NULL;
298     }
299   }
300   fAlignITSTPC->SetOwner(kTRUE);
301   fAlignTRDTPC->SetOwner(kTRUE);
302   fAlignTOFTPC->SetOwner(kTRUE);
303
304   fAlignITSTPC->Delete();
305   fAlignTRDTPC->Delete();
306   fAlignTOFTPC->Delete();
307   delete fAlignITSTPC;
308   delete fAlignTRDTPC;
309   delete fAlignTOFTPC;
310 }
311
312 Bool_t AliTPCcalibTime::IsLaser(AliESDEvent */*event*/){
313   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
314 }
315 Bool_t AliTPCcalibTime::IsCosmics(AliESDEvent */*event*/){
316   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
317 }
318 Bool_t AliTPCcalibTime::IsBeam(AliESDEvent */*event*/){
319   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
320 }
321 void AliTPCcalibTime::ResetCurrent(){
322   fDz=0; //Reset current dz
323 }
324 void AliTPCcalibTime::Process(AliESDEvent *event){
325   if(!event) return;
326   if (event->GetNumberOfTracks()<2) return;
327   ResetCurrent();
328   if(IsLaser  (event)) ProcessLaser (event);
329   if(IsCosmics(event)) ProcessCosmic(event);
330   if(IsBeam   (event)) ProcessBeam  (event);
331 }
332
333 void AliTPCcalibTime::ProcessLaser(AliESDEvent *event){
334   //
335   // Fit drift velocity using laser 
336   // 
337   // 0. cuts
338   const Int_t    kMinTracks     = 40;    // minimal number of laser tracks
339   const Int_t    kMinTracksSide = 20;    // minimal number of tracks per side
340   const Float_t  kMaxDeltaZ     = 30.;   // maximal trigger delay
341   const Float_t  kMaxDeltaV     = 0.05;  // maximal deltaV 
342   const Float_t  kMaxRMS        = 0.1;   // maximal RMS of tracks
343   //
344   /*
345     TCut cutRMS("sqrt(laserA.fElements[4])<0.1&&sqrt(laserC.fElements[4])<0.1");
346     TCut cutZ("abs(laserA.fElements[0]-laserC.fElements[0])<3");
347     TCut cutV("abs(laserA.fElements[1]-laserC.fElements[1])<0.01");
348     TCut cutY("abs(laserA.fElements[2]-laserC.fElements[2])<2");
349     TCut cutAll = cutRMS+cutZ+cutV+cutY;
350   */
351   if (event->GetNumberOfTracks()<kMinTracks) return;
352   //
353   if(!fLaser) fLaser = new AliTPCcalibLaser("laserTPC","laserTPC",kFALSE);
354   fLaser->Process(event);
355   if (fLaser->GetNtracks()<kMinTracks) return;   // small amount of tracks cut
356   if (fLaser->fFitAside->GetNrows()==0  && fLaser->fFitCside->GetNrows()==0) return;  // no fit neither a or C side
357   //
358   // debug streamer  - activate stream level
359   // Use it for tuning of the cuts
360   //
361   // cuts to be applied
362   //
363   Int_t isReject[2]={0,0};
364   //
365   // not enough tracks 
366   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[3]) < kMinTracksSide) isReject[0]|=1; 
367   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[3]) < kMinTracksSide) isReject[1]|=1; 
368   // unreasonable z offset
369   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[0])>kMaxDeltaZ)  isReject[0]|=2;
370   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[0])>kMaxDeltaZ)  isReject[1]|=2;
371   // unreasonable drift velocity
372   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[1]-1)>kMaxDeltaV)  isReject[0]|=4;
373   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[1]-1)>kMaxDeltaV)  isReject[1]|=4;
374   // big chi2
375   if (TMath::Sqrt(TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[4]))>kMaxRMS ) isReject[0]|=8;
376   if (TMath::Sqrt(TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[4]))>kMaxRMS ) isReject[1]|=8;
377
378
379
380
381   if (fStreamLevel>0){
382     printf("Trigger: %s\n",event->GetFiredTriggerClasses().Data());
383
384     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
385     if (cstream){
386       TTimeStamp tstamp(fTime);
387       Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
388       Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
389       Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
390       Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
391       Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
392       Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
393       TVectorD vecGoofie(20);
394       AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
395       if (goofieArray){
396         for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
397           AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
398           if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
399         }
400       }
401       (*cstream)<<"laserInfo"<<
402         "run="<<fRun<<              //  run number
403         "event="<<fEvent<<          //  event number
404         "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
405         "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
406         "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
407         // Environment values
408         "press0="<<valuePressure0<<
409         "press1="<<valuePressure1<<
410         "pt0="<<ptrelative0<<
411         "pt1="<<ptrelative1<<
412         "temp0="<<temp0<<
413         "temp1="<<temp1<<
414         "vecGoofie.="<<&vecGoofie<<
415         //laser
416         "rejectA="<<isReject[0]<<
417         "rejectC="<<isReject[1]<<
418         "laserA.="<<fLaser->fFitAside<<
419         "laserC.="<<fLaser->fFitCside<<
420         "laserAC.="<<fLaser->fFitACside<<
421         "trigger="<<event->GetFiredTriggerClasses()<<
422         "\n";
423     }
424   }
425   //
426   // fill histos
427   //
428   TVectorD vdriftA(5), vdriftC(5),vdriftAC(5);
429   vdriftA=*(fLaser->fFitAside);
430   vdriftC=*(fLaser->fFitCside);
431   vdriftAC=*(fLaser->fFitACside);
432   Int_t npointsA=0, npointsC=0;
433   Float_t chi2A=0, chi2C=0;
434   npointsA= TMath::Nint(vdriftA[3]);
435   chi2A= vdriftA[4];
436   npointsC= TMath::Nint(vdriftC[3]);
437   chi2C= vdriftC[4];
438
439   TTimeStamp tstamp(fTime);
440   Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
441   Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
442   Double_t driftA=0, driftC=0;
443   if (vdriftA[1]>1.-kMaxDeltaV) driftA = 1./vdriftA[1]-1.;
444   if (vdriftC[1]>1.-kMaxDeltaV) driftC = 1./vdriftC[1]-1.;
445   //
446   Double_t vecDriftLaserA[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,driftA,event->GetRunNumber()};
447   Double_t vecDriftLaserC[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,driftC,event->GetRunNumber()};
448   //  Double_t vecDrift[4]      ={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,1./((*(fLaser->fFitACside))[1])-1,event->GetRunNumber()};
449
450   for (Int_t icalib=0;icalib<3;icalib++){
451     if (icalib==0){ //z0 shift
452       vecDriftLaserA[2]=vdriftA[0]/250.;
453       vecDriftLaserC[2]=vdriftC[0]/250.;
454     }
455     if (icalib==1){ //vdrel shift
456       vecDriftLaserA[2]=driftA;
457       vecDriftLaserC[2]=driftC;
458     }
459     if (icalib==2){ //gy shift - full gy - full drift
460       vecDriftLaserA[2]=vdriftA[2]/250.;
461       vecDriftLaserC[2]=vdriftC[2]/250.;
462     }
463     if (isReject[0]==0) fHistVdriftLaserA[icalib]->Fill(vecDriftLaserA);
464     if (isReject[1]==0) fHistVdriftLaserC[icalib]->Fill(vecDriftLaserC);
465   }
466
467 //   THnSparse* curHist=new THnSparseF("","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
468 //   TString shortName=curHist->ClassName();
469 //   shortName+="_MEAN_DRIFT_LASER_";
470 //   delete curHist;
471 //   curHist=NULL;
472 //   TString name="";
473
474 //   name=shortName;
475 //   name+=event->GetFiredTriggerClasses();
476 //   name.ToUpper();
477 //   curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
478 //   if(!curHist){
479 //     curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
480 //     fArrayDz->AddLast(curHist);
481 //   }
482 //   curHist->Fill(vecDrift);
483           
484 //   name=shortName;
485 //   name+="ALL";
486 //   name.ToUpper();
487 //   curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
488 //   if(!curHist){
489 //     curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
490 //     fArrayDz->AddLast(curHist);
491 //   }
492 //   curHist->Fill(vecDrift);
493 }
494
495 void AliTPCcalibTime::ProcessCosmic(AliESDEvent *event){
496   if (!event) {
497     Printf("ERROR: ESD not available");
498     return;
499   }  
500   if (event->GetTimeStamp() == 0 ) {
501     Printf("no time stamp!");
502     return;
503   }
504   
505   //fd
506   // Find cosmic pairs
507   // 
508   // Track0 is choosen in upper TPC part
509   // Track1 is choosen in lower TPC part
510   //
511   const Int_t kMinClustersCross =30;
512   const Int_t kMinClusters      =80;
513   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks();
514   if (ntracks==0) return;
515   if (ntracks > fCutTracks) return;
516   
517   if (GetDebugLevel()>20) printf("Hallo world: Im here\n");
518   AliESDfriend *ESDfriend=static_cast<AliESDfriend*>(event->FindListObject("AliESDfriend"));
519   
520   TObjArray  tpcSeeds(ntracks);
521   Double_t vtxx[3]={0,0,0};
522   Double_t svtxx[3]={0.000001,0.000001,100.};
523   AliESDVertex vtx(vtxx,svtxx);
524   //
525   // track loop
526   //
527   TArrayI clusterSideA(ntracks);
528   TArrayI clusterSideC(ntracks);
529   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
530     clusterSideA[i]=0;
531     clusterSideC[i]=0;
532     AliESDtrack *track = event->GetTrack(i);
533     
534     const AliExternalTrackParam * trackIn = track->GetInnerParam();
535     const AliExternalTrackParam * trackOut = track->GetOuterParam();
536     if (!trackIn) continue;
537     if (!trackOut) continue;
538     
539     AliESDfriendTrack *friendTrack = ESDfriend->GetTrack(i);
540     if (friendTrack) ProcessSame(track,friendTrack,event);
541     if (friendTrack) ProcessAlignITS(track,friendTrack);
542     if (friendTrack) ProcessAlignTRD(track,friendTrack);
543     if (friendTrack) ProcessAlignTOF(track,friendTrack);
544     TObject *calibObject;
545     AliTPCseed *seed = 0;
546     for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
547     if (seed) {
548       tpcSeeds.AddAt(seed,i);
549       Int_t nA=0, nC=0;
550       for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
551         AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
552         if (!cl) continue;
553         if ((cl->GetDetector()%36)<18) nA++;
554         if ((cl->GetDetector()%36)>=18) nC++;
555       }
556       clusterSideA[i]=nA;
557       clusterSideC[i]=nC;
558     }
559   }
560   if (ntracks<2) return;
561   //
562   // Find pairs
563   //
564
565   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
566     AliESDtrack *track0 = event->GetTrack(i);
567     // track0 - choosen upper part
568     if (!track0) continue;
569     if (!track0->GetOuterParam()) continue;
570     if (track0->GetOuterParam()->GetAlpha()<0) continue;
571     Double_t d1[3];
572     track0->GetDirection(d1);    
573     for (Int_t j=0;j<ntracks;++j) {
574       if (i==j) continue;
575       AliESDtrack *track1 = event->GetTrack(j);   
576       //track 1 lower part
577       if (!track1) continue;
578       if (!track1->GetOuterParam()) continue;
579       if (track0->GetTPCNcls()+ track1->GetTPCNcls()< kMinClusters) continue;
580       Int_t nAC = TMath::Max( TMath::Min(clusterSideA[i], clusterSideC[j]), 
581                               TMath::Min(clusterSideC[i], clusterSideA[j]));
582       if (nAC<kMinClustersCross) continue; 
583       Int_t nA0=clusterSideA[i];
584       Int_t nC0=clusterSideC[i];
585       Int_t nA1=clusterSideA[j];
586       Int_t nC1=clusterSideC[j];
587       //      if (track1->GetOuterParam()->GetAlpha()>0) continue;
588       //
589       Double_t d2[3];
590       track1->GetDirection(d2);
591       
592       AliTPCseed * seed0 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(i);
593       AliTPCseed * seed1 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(j);
594       if (! seed0) continue;
595       if (! seed1) continue;
596       Float_t dir = (d1[0]*d2[0] + d1[1]*d2[1] + d1[2]*d2[2]);
597       Float_t dist0  = track0->GetLinearD(0,0);
598       Float_t dist1  = track1->GetLinearD(0,0);
599       //
600       // conservative cuts - convergence to be guarantied
601       // applying before track propagation
602       if (TMath::Abs(TMath::Abs(dist0)-TMath::Abs(dist1))>fCutMaxD) continue;   // distance to the 0,0
603       if (TMath::Abs(dir)<TMath::Abs(fCutMinDir)) continue;               // direction vector product
604       Float_t bz = AliTracker::GetBz();
605       Float_t dvertex0[2];   //distance to 0,0
606       Float_t dvertex1[2];   //distance to 0,0 
607       track0->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
608       track1->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
609       if (TMath::Abs(dvertex0[1])>250) continue;
610       if (TMath::Abs(dvertex1[1])>250) continue;
611       //
612       //
613       //
614       Float_t dmax = TMath::Max(TMath::Abs(dist0),TMath::Abs(dist1));
615       AliExternalTrackParam param0(*track0);
616       AliExternalTrackParam param1(*track1);
617       //
618       // Propagate using Magnetic field and correct fo material budget
619       //
620       AliTracker::PropagateTrackTo(&param0,dmax+1,0.0005,3,kTRUE);
621       AliTracker::PropagateTrackTo(&param1,dmax+1,0.0005,3,kTRUE);
622       //
623       // Propagate rest to the 0,0 DCA - z should be ignored
624       //
625       //Bool_t b0 = ;
626       param0.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
627       //Bool_t b1 = 
628       param1.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
629       param0.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
630       param1.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
631       Double_t xyz0[3];
632       Double_t xyz1[3];
633       param0.GetXYZ(xyz0);
634       param1.GetXYZ(xyz1);
635       Bool_t isPair = IsPair(&param0,&param1);
636       Bool_t isCross = IsCross(track0, track1);
637       Bool_t isSame = IsSame(track0, track1);
638
639       THnSparse* hist=new THnSparseF("","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
640       TString shortName=hist->ClassName();
641       shortName+="_MEAN_VDRIFT_COSMICS_";
642       delete hist;
643       hist=NULL;
644
645       if((isSame) || (isCross && isPair)){
646         if (track0->GetTPCNcls()+ track1->GetTPCNcls()> 80) {
647           fDz = param0.GetZ() - param1.GetZ();
648           Double_t sign=(nA0>nA1)? 1:-1; 
649           fDz*=sign;
650           TTimeStamp tstamp(fTime);
651           Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
652           Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
653           Double_t vecDrift[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,fDz/500.0,event->GetRunNumber()};
654           THnSparse* curHist=NULL;
655           TString name="";
656
657           name=shortName;
658           name+=event->GetFiredTriggerClasses();
659           name.ToUpper();
660           curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
661           if(!curHist){
662             curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
663             fArrayDz->AddLast(curHist);
664           }
665 //        curHist=(THnSparseF*)(fMapDz->GetValue(event->GetFiredTriggerClasses()));
666 //        if(!curHist){
667 //          curHist=new THnSparseF(event->GetFiredTriggerClasses(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
668 //          fMapDz->Add(new TObjString(event->GetFiredTriggerClasses()),curHist);
669 //        }
670           curHist->Fill(vecDrift);
671           
672           name=shortName;
673           name+="ALL";
674           name.ToUpper();
675           curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
676           if(!curHist){
677             curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
678             fArrayDz->AddLast(curHist);
679           }
680 //        curHist=(THnSparseF*)(fMapDz->GetValue("all"));
681 //        if(!curHist){
682 //          curHist=new THnSparseF("all","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
683 //          fMapDz->Add(new TObjString("all"),curHist);
684 //        }
685           curHist->Fill(vecDrift);
686         }
687       }
688       TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
689       if (fStreamLevel>0){
690         if (cstream){
691         (*cstream)<<"trackInfo"<<
692           "tr0.="<<track0<<
693           "tr1.="<<track1<<
694           "p0.="<<&param0<<
695           "p1.="<<&param1<<
696           "nAC="<<nAC<<
697           "nA0="<<nA0<<
698           "nA1="<<nA1<<
699           "nC0="<<nC0<<
700           "nC1="<<nC1<<
701           "isPair="<<isPair<<
702           "isCross="<<isCross<<
703           "isSame="<<isSame<<
704           "fDz="<<fDz<<
705           "fRun="<<fRun<<
706           "fTime="<<fTime<<
707           "\n";
708         }
709       }
710     } // end 2nd order loop        
711   } // end 1st order loop
712   
713   if (fStreamLevel>0){
714     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
715     if (cstream){
716       TTimeStamp tstamp(fTime);
717       Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
718       Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
719       Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
720       Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
721       Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
722       Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
723       TVectorD vecGoofie(20);
724       AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
725       if (goofieArray){
726         for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
727           AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
728           if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
729         }
730       }
731       (*cstream)<<"timeInfo"<<
732         "run="<<fRun<<              //  run number
733         "event="<<fEvent<<          //  event number
734         "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
735         "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
736         "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
737         // Environment values
738         "press0="<<valuePressure0<<
739         "press1="<<valuePressure1<<
740         "pt0="<<ptrelative0<<
741         "pt1="<<ptrelative1<<
742         "temp0="<<temp0<<
743         "temp1="<<temp1<<
744         "vecGoofie.=<<"<<&vecGoofie<<
745         //
746         // accumulated values
747         //
748         "fDz="<<fDz<<          //! current delta z
749         "trigger="<<event->GetFiredTriggerClasses()<<
750         "\n";
751     }
752   }
753   if (GetDebugLevel()>20) printf("Trigger: %s\n",event->GetFiredTriggerClasses().Data());
754 }
755
756 void AliTPCcalibTime::ProcessBeam(AliESDEvent */*event*/){
757 }
758
759 void AliTPCcalibTime::Analyze(){}
760
761 THnSparse* AliTPCcalibTime::GetHistoDrift(const char* name){
762   TIterator* iterator = fArrayDz->MakeIterator();
763   iterator->Reset();
764   TString newName=name;
765   newName.ToUpper();
766   THnSparse* newHist=new THnSparseF(newName,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
767   THnSparse* addHist=NULL;
768   while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())){
769   if(!addHist) continue;
770     TString histName=addHist->GetName();
771     if(!histName.Contains(newName)) continue;
772     addHist->Print();
773     newHist->Add(addHist);
774   }
775   return newHist;
776 }
777
778 TObjArray* AliTPCcalibTime::GetHistoDrift(){
779   return fArrayDz;
780 }
781
782 TGraphErrors* AliTPCcalibTime::GetGraphDrift(const char* name){
783   THnSparse* histoDrift=GetHistoDrift(name);
784   TGraphErrors* graphDrift=NULL;
785   if(histoDrift){
786     graphDrift=FitSlices(histoDrift,2,0,400,100,0.05,0.95, kTRUE);
787     TString end=histoDrift->GetName();
788     Int_t pos=end.Index("_");
789     end=end(pos,end.Capacity()-pos);
790     TString graphName=graphDrift->ClassName();
791     graphName+=end;
792     graphName.ToUpper();
793     graphDrift->SetName(graphName);
794   }
795   return graphDrift;
796 }
797
798 TObjArray* AliTPCcalibTime::GetGraphDrift(){
799   TObjArray* arrayGraphDrift=new TObjArray();
800   TIterator* iterator=fArrayDz->MakeIterator();
801   iterator->Reset();
802   THnSparse* addHist=NULL;
803   while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())) arrayGraphDrift->AddLast(GetGraphDrift(addHist->GetName()));
804   return arrayGraphDrift;
805 }
806
807 AliSplineFit* AliTPCcalibTime::GetFitDrift(const char* name){
808   TGraph* graphDrift=GetGraphDrift(name);
809   AliSplineFit* fitDrift=NULL;
810   if(graphDrift && graphDrift->GetN()){
811     fitDrift=new AliSplineFit();
812     fitDrift->SetGraph(graphDrift);
813     fitDrift->SetMinPoints(graphDrift->GetN()+1);
814     fitDrift->InitKnots(graphDrift,2,0,0.001);
815     fitDrift->SplineFit(0);
816     TString end=graphDrift->GetName();
817     Int_t pos=end.Index("_");
818     end=end(pos,end.Capacity()-pos);
819     TString fitName=fitDrift->ClassName();
820     fitName+=end;
821     fitName.ToUpper();
822     //fitDrift->SetName(fitName);
823     delete graphDrift;
824     graphDrift=NULL;
825   }
826   return fitDrift;
827 }
828
829 //TObjArray* AliTPCcalibTime::GetFitDrift(){
830 //  TObjArray* arrayFitDrift=new TObjArray();
831 //  TIterator* iterator = fArrayDz->MakeIterator();
832 //  iterator->Reset();
833 //  THnSparse* addHist=NULL;
834 //  while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())) arrayFitDrift->AddLast(GetFitDrift(addHist->GetName()));
835 //  return arrayFitDrift;
836 //}
837
838 Long64_t AliTPCcalibTime::Merge(TCollection *li) {
839   TIterator* iter = li->MakeIterator();
840   AliTPCcalibTime* cal = 0;
841
842   while ((cal = (AliTPCcalibTime*)iter->Next())) {
843     if (!cal->InheritsFrom(AliTPCcalibTime::Class())) {
844       Error("Merge","Attempt to add object of class %s to a %s", cal->ClassName(), this->ClassName());
845       return -1;
846     }
847     for (Int_t imeas=0; imeas<3; imeas++){
848       if (cal->GetHistVdriftLaserA(imeas) && cal->GetHistVdriftLaserA(imeas)){
849         fHistVdriftLaserA[imeas]->Add(cal->GetHistVdriftLaserA(imeas));
850         fHistVdriftLaserC[imeas]->Add(cal->GetHistVdriftLaserC(imeas));
851       }
852     }
853     TObjArray* addArray=cal->GetHistoDrift();
854     if(!addArray) return 0;
855     TIterator* iterator = addArray->MakeIterator();
856     iterator->Reset();
857     THnSparse* addHist=NULL;
858     while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())){
859       if(!addHist) continue;
860       addHist->Print();
861       THnSparse* localHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(addHist->GetName());
862       if(!localHist){
863         localHist=new THnSparseF(addHist->GetName(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
864         fArrayDz->AddLast(localHist);
865       }
866       localHist->Add(addHist);
867     }
868 //    TMap * addMap=cal->GetHistoDrift();
869 //    if(!addMap) return 0;
870 //    TIterator* iterator = addMap->MakeIterator();
871 //    iterator->Reset();
872 //    TPair* addPair=0;
873 //    while((addPair=(TPair *)(addMap->FindObject(iterator->Next())))){
874 //      THnSparse* addHist=dynamic_cast<THnSparseF*>(addPair->Value());
875 //      if (!addHist) continue;
876 //      addHist->Print();
877 //      THnSparse* localHist=dynamic_cast<THnSparseF*>(fMapDz->GetValue(addHist->GetName()));
878 //      if(!localHist){
879 //        localHist=new THnSparseF(addHist->GetName(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
880 //        fMapDz->Add(new TObjString(addHist->GetName()),localHist);
881 //      }
882 //      localHist->Add(addHist);
883 //    }
884     for(Int_t i=0;i<10;i++) if (cal->GetCosmiMatchingHisto(i)) fCosmiMatchingHisto[i]->Add(cal->GetCosmiMatchingHisto(i));
885     //
886     // Merge alignment
887     //
888     for (Int_t itype=0; itype<3; itype++){
889       //
890       //
891       TObjArray *arr0= 0;
892       TObjArray *arr1= 0;
893       if (itype==0) {arr0=fAlignITSTPC; arr1=cal->fAlignITSTPC;}
894       if (itype==1) {arr0=fAlignTRDTPC; arr1=cal->fAlignTRDTPC;}
895       if (itype==2) {arr0=fAlignTOFTPC; arr1=cal->fAlignTOFTPC;}
896       if (!arr1) continue;
897       if (!arr0) arr0=new TObjArray(arr1->GetEntriesFast());
898       if (arr1->GetEntriesFast()>arr0->GetEntriesFast()){
899         arr0->Expand(arr1->GetEntriesFast());
900       }
901       for (Int_t i=0;i<arr1->GetEntriesFast(); i++){
902         AliRelAlignerKalman *kalman1 = (AliRelAlignerKalman *)arr1->UncheckedAt(i);
903         AliRelAlignerKalman *kalman0 = (AliRelAlignerKalman *)arr0->UncheckedAt(i);
904         if (!kalman1)  continue;
905         if (!kalman0) {arr0->AddAt(new AliRelAlignerKalman(*kalman1),i); continue;}
906         kalman0->SetRejectOutliers(kFALSE);
907         kalman0->Merge(kalman1);
908       }
909     }
910
911   }
912   return 0;
913 }
914
915 Bool_t  AliTPCcalibTime::IsPair(AliExternalTrackParam *tr0, AliExternalTrackParam *tr1){
916   /*
917   // 0. Same direction - OPOSITE  - cutDir +cutT    
918   TCut cutDir("cutDir","dir<-0.99")
919   // 1. 
920   TCut cutT("cutT","abs(Tr1.fP[3]+Tr0.fP[3])<0.03")
921   //
922   // 2. The same rphi 
923   TCut cutD("cutD","abs(Tr0.fP[0]+Tr1.fP[0])<5")
924   //
925   TCut cutPt("cutPt","abs(Tr1.fP[4]+Tr0.fP[4])<1&&abs(Tr0.fP[4])+abs(Tr1.fP[4])<10");  
926   // 1/Pt diff cut
927   */
928   const Double_t *p0 = tr0->GetParameter();
929   const Double_t *p1 = tr1->GetParameter();
930   fCosmiMatchingHisto[0]->Fill(p0[0]+p1[0]);
931   fCosmiMatchingHisto[1]->Fill(p0[1]-p1[1]);
932   fCosmiMatchingHisto[2]->Fill(tr1->GetAlpha()-tr0->GetAlpha()+TMath::Pi());
933   fCosmiMatchingHisto[3]->Fill(p0[3]+p1[3]);
934   fCosmiMatchingHisto[4]->Fill(p0[4]+p1[4]);
935   
936   if (TMath::Abs(p0[3]+p1[3])>fCutTheta) return kFALSE;
937   if (TMath::Abs(p0[0]+p1[0])>fCutMaxD)  return kFALSE;
938   if (TMath::Abs(p0[1]-p1[1])>fCutMaxDz)  return kFALSE;
939   Double_t d0[3], d1[3];
940   tr0->GetDirection(d0);    
941   tr1->GetDirection(d1);       
942   if (d0[0]*d1[0] + d0[1]*d1[1] + d0[2]*d1[2] >fCutMinDir) return kFALSE;
943
944   fCosmiMatchingHisto[5]->Fill(p0[0]+p1[0]);
945   fCosmiMatchingHisto[6]->Fill(p0[1]-p1[1]);
946   fCosmiMatchingHisto[7]->Fill(tr1->GetAlpha()-tr0->GetAlpha()+TMath::Pi());
947   fCosmiMatchingHisto[8]->Fill(p0[3]+p1[3]);
948   fCosmiMatchingHisto[9]->Fill(p0[4]+p1[4]);
949
950   return kTRUE;  
951 }
952 Bool_t AliTPCcalibTime::IsCross(AliESDtrack *tr0, AliESDtrack *tr1){
953   //
954   // check if the cosmic pair of tracks crossed A/C side
955   // 
956   Bool_t result= tr0->GetOuterParam()->GetZ()*tr1->GetOuterParam()->GetZ()<0;
957   if (result==kFALSE) return result;
958   result=kTRUE;
959   return result;
960 }
961
962 Bool_t AliTPCcalibTime::IsSame(AliESDtrack *tr0, AliESDtrack *tr1){
963   // 
964   // track crossing the CE
965   // 0. minimal number of clusters 
966   // 1. Same sector +-1
967   // 2. Inner and outer track param on opposite side
968   // 3. Outer and inner track parameter close each to other
969   // 3. 
970   Bool_t result=kTRUE;
971   //
972   // inner and outer on opposite sides in z
973   //
974   const Int_t knclCut0  = 30;
975   const Double_t kalphaCut = 0.4;
976   //
977   // 0. minimal number of clusters
978   //
979   if (tr0->GetTPCNcls()<knclCut0) return kFALSE;
980   if (tr1->GetTPCNcls()<knclCut0) return kFALSE;
981   //
982   // 1. alpha cut - sector+-1
983   //
984   if (TMath::Abs(tr0->GetOuterParam()->GetAlpha()-tr1->GetOuterParam()->GetAlpha())>kalphaCut) return kFALSE;
985   //
986   // 2. Z crossing
987   //
988   if (tr0->GetOuterParam()->GetZ()*tr0->GetInnerParam()->GetZ()>0) result&=kFALSE;
989   if (tr1->GetOuterParam()->GetZ()*tr1->GetInnerParam()->GetZ()>0) result&=kFALSE;
990   if (result==kFALSE){
991     return result;
992   }
993   //
994   //
995   const Double_t *p0I = tr0->GetInnerParam()->GetParameter();
996   const Double_t *p1I = tr1->GetInnerParam()->GetParameter();
997   const Double_t *p0O = tr0->GetOuterParam()->GetParameter();
998   const Double_t *p1O = tr1->GetOuterParam()->GetParameter();
999   //
1000   if (TMath::Abs(p0I[0]-p1I[0])>fCutMaxD)  result&=kFALSE;
1001   if (TMath::Abs(p0I[1]-p1I[1])>fCutMaxDz) result&=kFALSE;
1002   if (TMath::Abs(p0I[2]-p1I[2])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1003   if (TMath::Abs(p0I[3]-p1I[3])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1004   if (TMath::Abs(p0O[0]-p1O[0])>fCutMaxD)  result&=kFALSE;
1005   if (TMath::Abs(p0O[1]-p1O[1])>fCutMaxDz) result&=kFALSE;
1006   if (TMath::Abs(p0O[2]-p1O[2])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1007   if (TMath::Abs(p0O[3]-p1O[3])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1008   if (result==kTRUE){
1009     result=kTRUE; // just to put break point here
1010   }
1011   return result;
1012 }
1013
1014
1015 void  AliTPCcalibTime::ProcessSame(AliESDtrack* track, AliESDfriendTrack *friendTrack,AliESDEvent *event){
1016   //
1017   // Process  TPC tracks crossing CE
1018   //
1019   // 0. Select only track crossing the CE
1020   // 1. Cut on the track length
1021   // 2. Refit the terack on A and C side separatelly
1022   // 3. Fill time histograms
1023   const Int_t kMinNcl=100;
1024   const Int_t kMinNclS=25;  // minimul number of clusters on the sides
1025   if (!friendTrack->GetTPCOut()) return;
1026   //
1027   // 0. Select only track crossing the CE
1028   //
1029   if (track->GetInnerParam()->GetZ()*friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()>0) return;
1030   //
1031   // 1. cut on track length
1032   //
1033   if (track->GetTPCNcls()<kMinNcl) return;
1034   //
1035   // 2. Refit track sepparatel on A and C side
1036   //
1037   TObject *calibObject;
1038   AliTPCseed *seed = 0;
1039   for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) {
1040     if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
1041   }
1042   if (!seed) return;
1043   //
1044   AliExternalTrackParam trackIn(*track->GetInnerParam());
1045   AliExternalTrackParam trackOut(*track->GetOuterParam());
1046   Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //use the same errors
1047   Double_t xyz[3]={0,0.,0.0};  
1048   Double_t bz   =0;
1049   Int_t nclIn=0,nclOut=0;
1050   trackIn.ResetCovariance(30.);
1051   trackOut.ResetCovariance(30.);
1052   //
1053   //2.a Refit inner
1054   // 
1055   for (Int_t irow=0;irow<159;irow++) {
1056     AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
1057     if (!cl) continue;
1058     if (cl->GetX()<80) continue;
1059     if (track->GetInnerParam()->GetZ()<0 &&(cl->GetDetector()%36)<18) break;
1060     if (track->GetInnerParam()->GetZ()>0 &&(cl->GetDetector()%36)>=18) break;
1061     Int_t sector = cl->GetDetector();
1062     Float_t dalpha = TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-trackIn.GetAlpha();
1063     if (TMath::Abs(dalpha)>0.01){
1064       if (!trackIn.Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.))) break;
1065     }
1066     Double_t r[3]={cl->GetX(),cl->GetY(),cl->GetZ()};
1067     trackIn.GetXYZ(xyz);
1068     bz = AliTracker::GetBz(xyz);
1069     if (!trackIn.PropagateTo(r[0],bz)) break;
1070     nclIn++;
1071     trackIn.Update(&r[1],cov);    
1072   }
1073   //
1074   //2.b Refit outer
1075   // 
1076   for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
1077     AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
1078     if (!cl) continue;
1079     if (cl->GetX()<80) continue;
1080     if (cl->GetZ()*track->GetOuterParam()->GetZ()<0) break;
1081     if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()<0 &&(cl->GetDetector()%36)<18) break;
1082     if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()>0 &&(cl->GetDetector()%36)>=18) break;
1083     Int_t sector = cl->GetDetector();
1084     Float_t dalpha = TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-trackOut.GetAlpha();
1085     if (TMath::Abs(dalpha)>0.01){
1086       if (!trackOut.Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.))) break;
1087     }
1088     Double_t r[3]={cl->GetX(),cl->GetY(),cl->GetZ()};
1089     trackOut.GetXYZ(xyz);
1090     bz = AliTracker::GetBz(xyz);
1091     if (!trackOut.PropagateTo(r[0],bz)) break;
1092     nclOut++;
1093     trackOut.Update(&r[1],cov);    
1094   }
1095   trackOut.Rotate(trackIn.GetAlpha());
1096   Double_t meanX = (trackIn.GetX()+trackOut.GetX())*0.5;
1097   trackIn.PropagateTo(meanX,bz); 
1098   trackOut.PropagateTo(meanX,bz); 
1099   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
1100   if (cstream){
1101     TVectorD gxyz(3);
1102     trackIn.GetXYZ(gxyz.GetMatrixArray());
1103     TTimeStamp tstamp(fTime);
1104     Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1105     Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1106     (*cstream)<<"tpctpc"<<
1107       "run="<<fRun<<              //  run number
1108       "event="<<fEvent<<          //  event number
1109       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1110       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1111       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1112       "ptrel0.="<<ptrelative0<<
1113       "ptrel1.="<<ptrelative1<<
1114       //
1115       "xyz.="<<&gxyz<<             // global position
1116       "tIn.="<<&trackIn<<         // refitterd track in 
1117       "tOut.="<<&trackOut<<       // refitter track out
1118       "nclIn="<<nclIn<<           // 
1119       "nclOut="<<nclOut<<         //
1120       "\n";  
1121   }
1122   //
1123   // 3. Fill time histograms
1124   // Debug stremaer expression
1125   // chainTPCTPC->Draw("(tIn.fP[1]-tOut.fP[1])*sign(-tIn.fP[3]):tIn.fP[3]","min(nclIn,nclOut)>30","")
1126   if (TMath::Min(nclIn,nclOut)>kMinNclS){
1127     fDz = trackOut.GetZ()-trackIn.GetZ();
1128     if (trackOut.GetTgl()<0) fDz*=-1.;
1129     TTimeStamp tstamp(fTime);
1130     Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1131     Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1132     Double_t vecDrift[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,fDz/500.0,event->GetRunNumber()};
1133     //
1134     // fill histograms per trigger class and itegrated
1135     //
1136     THnSparse* curHist=NULL;
1137     for (Int_t itype=0; itype<2; itype++){
1138       TString name="MEAN_VDRIFT_CROSS_";  
1139       if (itype==0){
1140         name+=event->GetFiredTriggerClasses();
1141         name.ToUpper();
1142       }else{
1143         name+="ALL";
1144       }
1145       curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
1146       if(!curHist){
1147         curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
1148         fArrayDz->AddLast(curHist);
1149       }
1150       curHist->Fill(vecDrift);
1151     }
1152   }
1153
1154 }
1155
1156 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignITS(AliESDtrack* track, AliESDfriendTrack *friendTrack){
1157   //
1158   // Process track - Update TPC-ITS alignment
1159   // Updates: 
1160   // 0. Apply standartd cuts 
1161   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1162   // 2. Apply median+-rms cut
1163   // 3. Update kalman filter
1164   //
1165   const Int_t    kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1166   const Int_t    kMinITS  = 3;     // minimal number of ITS cluster
1167   const Double_t kMinZ    = 10;    // maximal dz distance
1168   const Double_t kMaxDy   = 1.;    // maximal dy distance
1169   const Double_t kMaxAngle= 0.01;  // maximal angular distance
1170   const Double_t kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1171   const Double_t kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1172   const Double_t kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1173   const Double_t kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1174   const  Int_t     kN=500;         // deepnes of history
1175   static Int_t     kglast=0;
1176   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1177   /*
1178     0. Standrd cuts:
1179     TCut cut="abs(pTPC.fP[2]-pITS.fP[2])<0.01&&abs(pTPC.fP[3]-pITS.fP[3])<0.01&&abs(pTPC.fP[2]-pITS.fP[2])<1";
1180   */
1181   //
1182   // 0. Apply standard cuts
1183   //
1184   Int_t dummycl[1000];
1185   if (track->GetITSclusters(dummycl)<kMinITS) return;  // minimal amount of clusters
1186   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1187   if (!friendTrack->GetITSOut()) return;  
1188   if (!track->GetInnerParam())   return;
1189   if (!track->GetOuterParam())   return;
1190   // exclude crossing track
1191   if (track->GetOuterParam()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1192   if (TMath::Abs(track->GetInnerParam()->GetZ())<kMinZ)   return;
1193   //
1194   AliExternalTrackParam &pTPC=(AliExternalTrackParam &)(*(track->GetInnerParam()));
1195   AliExternalTrackParam pITS(*(friendTrack->GetITSOut()));
1196   pITS.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1197   pITS.PropagateTo(pTPC.GetX(),fMagF);
1198   if (TMath::Abs(pITS.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1199   if (TMath::Abs(pITS.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1200   if (TMath::Abs(pITS.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1201   //
1202   // 1. Update median and RMS info
1203   //
1204   TVectorD vecDelta(4),vecMedian(4), vecRMS(4);
1205   TVectorD vecDeltaN(5);
1206   Double_t sign=(pITS.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1207   vecDelta[4]=0;
1208   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1209     vecDelta[i]=(pITS.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1210     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1211   }
1212   kglast=(kglast+1);
1213   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1214   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1215     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1216     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1217     vecDeltaN[i] = 0;
1218     if (vecRMS[i]>0.){
1219       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/vecRMS[i];
1220       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1221     }
1222   }
1223   //
1224   // 2. Apply median+-rms cut
1225   //
1226   if (kglast<3)  return;   //median and RMS to be defined
1227   if ( vecDeltaN[4]/4.>kSigmaCut) return;
1228   //
1229   // 3. Update alignment
1230   //
1231   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1232   if (fAlignITSTPC->GetEntries()<htime){
1233     fAlignITSTPC->Expand(htime*2+20);
1234   }
1235   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignITSTPC->At(htime);
1236   if (!align){
1237     // make Alignment object if doesn't exist
1238     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1239     align->SetRunNumber(fRun);
1240     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1241     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1242     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1243     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1244
1245     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1246     align->SetMagField(fMagF); 
1247     fAlignITSTPC->AddAt(align,htime);
1248   }
1249   align->AddTrackParams(&pITS,&pTPC);
1250   align->SetTimeStamp(fTime);
1251   align->SetRunNumber(fRun );
1252   //
1253   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1254   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1255   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1256   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1257   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1258     TTimeStamp tstamp(fTime);
1259     Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
1260     Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
1261     Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1262     Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1263     Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
1264     Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
1265     TVectorD vecGoofie(20);
1266     AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
1267     if (goofieArray){
1268       for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
1269         AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
1270         if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
1271       }
1272     }
1273     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1274     TVectorD gpITS(3), gdITS(3);
1275     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1276     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1277     pITS.GetXYZ(gpITS.GetMatrixArray());
1278     pITS.GetDirection(gdITS.GetMatrixArray());
1279     (*cstream)<<"itstpc"<<
1280       "run="<<fRun<<              //  run number
1281       "event="<<fEvent<<          //  event number
1282       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1283       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1284       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1285       // Environment values
1286       "press0="<<valuePressure0<<
1287       "press1="<<valuePressure1<<
1288       "pt0="<<ptrelative0<<
1289       "pt1="<<ptrelative1<<
1290       "temp0="<<temp0<<
1291       "temp1="<<temp1<<
1292       "vecGoofie.="<<&vecGoofie<<
1293       //
1294       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1295       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1296       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1297       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1298       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1299       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1300       "a.="<<align<<            // current alignment
1301       "pITS.="<<&pITS<<         // track param ITS
1302       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1303       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1304       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1305       "gpITS.="<<&gpITS<<       // global position  ITS
1306       "gdITS.="<<&gdITS<<       // global position  ITS
1307       "\n";
1308   }
1309 }
1310
1311
1312
1313
1314 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignTRD(AliESDtrack* track, AliESDfriendTrack *friendTrack){
1315   //
1316   // Process track - Update TPC-TRD alignment
1317   // Updates: 
1318   // 0. Apply standartd cuts 
1319   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1320   // 2. Apply median+-rms cut
1321   // 3. Update kalman filter
1322   //
1323   const Int_t    kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1324   const Int_t    kMinTRD  = 50;    // minimal number of TRD cluster
1325   const Double_t kMinZ    = 20;    // maximal dz distance
1326   const Double_t kMaxDy   = 1.;    // maximal dy distance
1327   const Double_t kMaxAngle= 0.01;  // maximal angular distance
1328   const Double_t kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1329   const Double_t kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1330   const Double_t kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1331   const Double_t kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1332   const  Int_t     kN=500;         // deepnes of history
1333   static Int_t     kglast=0;
1334   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1335   //
1336   // 0. Apply standard cuts
1337   //
1338   Int_t dummycl[1000];
1339   if (track->GetTRDclusters(dummycl)<kMinTRD) return;  // minimal amount of clusters
1340   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1341   if (!friendTrack->GetTRDIn()) return;  
1342   if (!track->GetInnerParam())   return;
1343   if (!track->GetOuterParam())   return;
1344   // exclude crossing track
1345   if (track->GetOuterParam()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1346   if (TMath::Abs(track->GetInnerParam()->GetZ())<kMinZ)   return;
1347   //
1348   AliExternalTrackParam &pTPC=(AliExternalTrackParam &)(*(track->GetOuterParam()));
1349   AliExternalTrackParam pTRD(*(friendTrack->GetTRDIn()));
1350   pTRD.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1351   pTRD.PropagateTo(pTPC.GetX(),fMagF);
1352   ((Double_t*)pTRD.GetCovariance())[2]+=3.*3.;   // increas sys errors
1353   ((Double_t*)pTRD.GetCovariance())[9]+=0.1*0.1; // increse sys errors
1354
1355   if (TMath::Abs(pTRD.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1356   if (TMath::Abs(pTRD.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1357   if (TMath::Abs(pTRD.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1358   //
1359   // 1. Update median and RMS info
1360   //
1361   TVectorD vecDelta(4),vecMedian(4), vecRMS(4);
1362   TVectorD vecDeltaN(5);
1363   Double_t sign=(pTRD.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1364   vecDelta[4]=0;
1365   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1366     vecDelta[i]=(pTRD.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1367     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1368   }
1369   kglast=(kglast+1);
1370   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1371   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1372     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1373     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1374     vecDeltaN[i] = 0;
1375     if (vecRMS[i]>0.){
1376       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/vecRMS[i];
1377       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1378     }
1379   }
1380   //
1381   // 2. Apply median+-rms cut
1382   //
1383   if (kglast<3)  return;   //median and RMS to be defined
1384   if ( vecDeltaN[4]/4.>kSigmaCut) return;
1385   //
1386   // 3. Update alignment
1387   //
1388   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1389   if (fAlignTRDTPC->GetEntries()<htime){
1390     fAlignTRDTPC->Expand(htime*2+20);
1391   }
1392   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignTRDTPC->At(htime);
1393   if (!align){
1394     // make Alignment object if doesn't exist
1395     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1396     align->SetRunNumber(fRun);
1397     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1398     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1399     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1400     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1401     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1402     align->SetMagField(fMagF); 
1403     fAlignTRDTPC->AddAt(align,htime);
1404   }
1405   align->AddTrackParams(&pTRD,&pTPC);
1406   align->SetTimeStamp(fTime);
1407   align->SetRunNumber(fRun );
1408   //
1409   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1410   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1411   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1412   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1413   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1414     TTimeStamp tstamp(fTime);
1415     Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
1416     Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
1417     Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1418     Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1419     Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
1420     Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
1421     TVectorD vecGoofie(20);
1422     AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
1423     if (goofieArray){
1424       for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
1425         AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
1426         if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
1427       }
1428     }
1429     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1430     TVectorD gpTRD(3), gdTRD(3);
1431     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1432     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1433     pTRD.GetXYZ(gpTRD.GetMatrixArray());
1434     pTRD.GetDirection(gdTRD.GetMatrixArray());
1435     (*cstream)<<"trdtpc"<<
1436       "run="<<fRun<<              //  run number
1437       "event="<<fEvent<<          //  event number
1438       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1439       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1440       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1441       // Environment values
1442       "press0="<<valuePressure0<<
1443       "press1="<<valuePressure1<<
1444       "pt0="<<ptrelative0<<
1445       "pt1="<<ptrelative1<<
1446       "temp0="<<temp0<<
1447       "temp1="<<temp1<<
1448       "vecGoofie.="<<&vecGoofie<<
1449       //
1450       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1451       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1452       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1453       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1454       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1455       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1456       "a.="<<align<<            // current alignment
1457       "pTRD.="<<&pTRD<<         // track param TRD
1458       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1459       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1460       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1461       "gpTRD.="<<&gpTRD<<       // global position  TRD
1462       "gdTRD.="<<&gdTRD<<       // global position  TRD
1463       "\n";
1464   }
1465 }
1466
1467
1468 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignTOF(AliESDtrack* track, AliESDfriendTrack *friendTrack){
1469   //
1470   //
1471   // Process track - Update TPC-TOF alignment
1472   // Updates: 
1473   // -1. Make a TOF "track"
1474   // 0. Apply standartd cuts 
1475   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1476   // 2. Apply median+-rms cut
1477   // 3. Update kalman filter
1478   //
1479   const Int_t      kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1480   const Double_t   kMinZ    = 10;    // maximal dz distance
1481   const Double_t   kMaxDy   = 5.;    // maximal dy distance
1482   const Double_t   kMaxAngle= 0.01;  // maximal angular distance
1483   const Double_t   kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1484   const Double_t   kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction 
1485   const Double_t   kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction 
1486
1487   const Double_t   kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1488   const  Int_t     kN=1000;         // deepnes of history
1489   static Int_t     kglast=0;
1490   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1491   //
1492   // -1. Make a TOF track-
1493   //     Clusters are not in friends - use alingment points
1494   //
1495   if (track->GetTOFsignal()<=0)  return;
1496   if (!friendTrack->GetTPCOut()) return;
1497   if (!track->GetInnerParam())   return;
1498   if (!track->GetOuterParam())   return;
1499   const AliTrackPointArray *points=friendTrack->GetTrackPointArray();
1500   if (!points) return;
1501   AliExternalTrackParam pTPC(*(track->GetOuterParam()));
1502   AliExternalTrackParam pTOF(pTPC);
1503   Double_t mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("mu+")->Mass();
1504   Int_t npoints = points->GetNPoints();
1505   AliTrackPoint point;
1506   Int_t naccept=0;
1507   //
1508   for (Int_t ipoint=0;ipoint<npoints;ipoint++){
1509     points->GetPoint(point,ipoint);
1510     Float_t xyz[3];
1511     point.GetXYZ(xyz);
1512     Double_t r=TMath::Sqrt(xyz[0]*xyz[0]+xyz[1]*xyz[1]);
1513     if (r<350)  continue;
1514     if (r>400)  continue;
1515     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,r,mass,2.,kTRUE);
1516     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,r,mass,0.1,kTRUE);    
1517     AliTrackPoint lpoint = point.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1518     pTPC.PropagateTo(lpoint.GetX(),fMagF);
1519     pTOF=pTPC;
1520     ((Double_t*)pTOF.GetParameter())[0] =lpoint.GetY();
1521     ((Double_t*)pTOF.GetParameter())[1] =lpoint.GetZ();
1522     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[0]+=3.*3./12.;
1523     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[2]+=3.*3./12.;
1524     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[5]+=0.1*0.1;
1525     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[9]+=0.1*0.1;
1526     naccept++;
1527   }
1528   if (naccept==0) return;  // no tof match clusters
1529   //
1530   // 0. Apply standard cuts
1531   //
1532   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1533   // exclude crossing track
1534   if (track->GetOuterParam()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1535   //
1536   if (TMath::Abs(pTOF.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1537   if (TMath::Abs(pTOF.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1538   if (TMath::Abs(pTOF.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1539   //
1540   // 1. Update median and RMS info
1541   //
1542   TVectorD vecDelta(4),vecMedian(4), vecRMS(4);
1543   TVectorD vecDeltaN(5);
1544   Double_t sign=(pTOF.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1545   vecDelta[4]=0;
1546   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1547     vecDelta[i]=(pTOF.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1548     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1549   }
1550   kglast=(kglast+1);
1551   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1552   Bool_t isOK=kTRUE;
1553   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1554     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1555     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1556     vecDeltaN[i] = 0;
1557     if (vecRMS[i]>0.){
1558       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/(vecRMS[i]+1.);
1559       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1560       if (TMath::Abs(vecDeltaN[i])>kSigmaCut) isOK=kFALSE;
1561     }
1562   }
1563   //
1564   // 2. Apply median+-rms cut
1565   //
1566   if (kglast<10)  return;   //median and RMS to be defined
1567   if (!isOK) return;
1568   //
1569   // 3. Update alignment
1570   //
1571   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1572   if (fAlignTOFTPC->GetEntries()<htime){
1573     fAlignTOFTPC->Expand(htime*2+20);
1574   }
1575   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignTOFTPC->At(htime);
1576   if (!align){
1577     // make Alignment object if doesn't exist
1578     align=new AliRelAlignerKalman(); 
1579     align->SetRunNumber(fRun);
1580     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1581     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1582     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1583     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1584     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1585     align->SetMagField(fMagF); 
1586     fAlignTOFTPC->AddAt(align,htime);
1587   }
1588   align->AddTrackParams(&pTOF,&pTPC);
1589   align->SetTimeStamp(fTime);
1590   align->SetRunNumber(fRun );
1591   //
1592   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1593   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1594   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1595   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();  
1596   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1597     TTimeStamp tstamp(fTime);
1598     Float_t valuePressure0 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,0);
1599     Float_t valuePressure1 = AliTPCcalibDB::GetPressure(tstamp,fRun,1);
1600     Double_t ptrelative0   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1601     Double_t ptrelative1   = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1602     Double_t temp0         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,0);
1603     Double_t temp1         = AliTPCcalibDB::GetTemperature(tstamp,fRun,1);
1604     TVectorD vecGoofie(20);
1605     AliDCSSensorArray* goofieArray = AliTPCcalibDB::Instance()->GetGoofieSensors(fRun);
1606     if (goofieArray){
1607       for (Int_t isensor=0; isensor<goofieArray->NumSensors();isensor++){
1608         AliDCSSensor *gsensor = goofieArray->GetSensor(isensor);
1609         if (gsensor) vecGoofie[isensor]=gsensor->GetValue(tstamp);
1610       }
1611     }
1612     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1613     TVectorD gpTOF(3), gdTOF(3);
1614     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1615     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1616     pTOF.GetXYZ(gpTOF.GetMatrixArray());
1617     pTOF.GetDirection(gdTOF.GetMatrixArray());
1618     (*cstream)<<"toftpc"<<
1619       "run="<<fRun<<              //  run number
1620       "event="<<fEvent<<          //  event number
1621       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1622       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1623       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1624       // Environment values
1625       "press0="<<valuePressure0<<
1626       "press1="<<valuePressure1<<
1627       "pt0="<<ptrelative0<<
1628       "pt1="<<ptrelative1<<
1629       "temp0="<<temp0<<
1630       "temp1="<<temp1<<
1631       "vecGoofie.="<<&vecGoofie<<
1632       //
1633       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1634       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1635       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1636       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1637       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1638       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1639       "a.="<<align<<            // current alignment
1640       "pTOF.="<<&pTOF<<         // track param TOF
1641       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1642       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1643       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1644       "gpTOF.="<<&gpTOF<<       // global position  TOF
1645       "gdTOF.="<<&gdTOF<<       // global position  TOF
1646       "\n";
1647   }
1648 }
1649
1650