Use the same truncation in the reconstruction and also
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCcalibTimeGain.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /*
17
18 This class provides the calibration of the time dependence of the TPC gain due to pressure and temperature changes etc.
19
20
21 //0.  Libraries to load
22 gSystem->Load("libANALYSIS");
23 gSystem->Load("libSTAT");
24 gSystem->Load("libTPCcalib");
25
26
27 //1. Do calibration ...
28 //
29 // compare reference
30
31 //
32 //2. Visualize results
33 //
34 TFile fcalib("CalibObjects.root");
35 TObjArray * array = (TObjArray*)fcalib.Get("TPCCalib");
36 AliTPCcalibTimeGain * gain = ( AliTPCcalibTimeGain *)array->FindObject("calibTimeGain");
37 TGraphErrors * gr = gain->GetGraphGainVsTime(0,1000)
38
39 // gain->GetHistGainTime()->GetAxis(1)->SetRangeUser(1213.8e6,1214.3e6)
40 TH2D * GainTime = gain->GetHistGainTime()->Projection(0,1)
41 GainTime->GetXaxis()->SetTimeDisplay(kTRUE)
42 GainTime->GetXaxis()->SetTimeFormat("#splitline{%d/%m}{%H:%M}")
43 GainTime->Draw("colz")
44
45 //
46 // MakeSlineFit example
47 //
48 AliSplineFit *fit = AliTPCcalibTimeGain::MakeSplineFit(gr)
49
50 TGraph * grfit = fit.MakeGraph(gr->GetX()[0],gr->GetX()[gr->GetN()-1],50000,0);
51
52 gr->SetMarkerStyle(25);
53 gr->Draw("lp");
54 grfit->SetLineColor(2);
55 grfit->Draw("lu");
56
57 //
58 // QA - dE/dx resoultion as a function of time
59 //TCa
60
61 TGraph * grSigma = AliTPCcalibBase::FitSlicesSigma(gain->GetHistGainTime(),0,1,1800,5)
62
63 TCanvas *c1 = new TCanvas("c1","transparent pad",200,10,700,500);
64    TPad *pad1 = new TPad("pad1","",0,0,1,1);
65    TPad *pad2 = new TPad("pad2","",0,0,1,1);
66    pad2->SetFillStyle(4000); //will be transparent
67    pad1->Draw();
68    pad1->cd();
69
70 GainTime->Draw("colz")
71 gr->Draw("lp")
72
73
74
75   c1->cd();
76  Double_t ymin = -0.04;
77  Double_t ymax = 0.12;
78 Double_t dy = (ymax-ymin)/0.8;
79 Double_t xmin = GainTime->GetXaxis()->GetXmin()
80 Double_t xmax = GainTime->GetXaxis()->GetXmax()
81 Double_t dx = (xmax-xmin)/0.8; //10 per cent margins left and right
82 pad2->Range(xmin-0.1*dx,ymin-0.1*dy,xmax+0.1*dx,ymax+0.1*dy);
83    pad2->Draw();
84    pad2->cd();
85 grSigma->SetLineColor(2);
86 grSigma->SetLineWidth(2);
87 grSigma->Draw("lp")
88 TGaxis *axis = new TGaxis(xmax,ymin,xmax,ymax,ymin,ymax,50510,"+L");
89    axis->SetLabelColor(kRed);
90    axis->SetTitle("dE/dx resolution #sigma_{dE/dx}");
91    axis->Draw();
92
93 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
94
95  ----> make Attachment study
96
97 TFile fcalib("CalibObjects40366b.root");
98 TObjArray * array = (TObjArray*)fcalib.Get("TPCCalib");
99 AliTPCcalibTimeGain * gain = ( AliTPCcalibTimeGain *)array->FindObject("calibTimeGain");
100 TGraphErrors * grAttach = gain->GetGraphAttachment(2000,4)
101
102 TCanvas *c1 = new TCanvas("c1","transparent pad",200,10,700,500);
103    TPad *pad1 = new TPad("pad1","",0,0,1,1);
104    TPad *pad2 = new TPad("pad2","",0,0,1,1);
105    pad2->SetFillStyle(4000); //will be transparent
106    pad1->Draw();
107    pad1->cd();
108
109 gain->GetHistGainTime()->GetAxis(1)->SetRangeUser(1213.8e6,1214.3e6)
110 TH2D * GainTime = gain->GetHistGainTime()->Projection(0,1)
111 GainTime->GetXaxis()->SetTimeDisplay(kTRUE)
112 GainTime->GetXaxis()->SetTimeFormat("#splitline{%d/%m}{%H:%M}")
113 GainTime->Draw("colz")
114 //gr->Draw("lp")
115
116   c1->cd();
117  Double_t ymin = -0.001;
118  Double_t ymax = 0.001;
119 Double_t dy = (ymax-ymin)/0.8;
120 Double_t xmin = GainTime->GetXaxis()->GetXmin()
121 Double_t xmax = GainTime->GetXaxis()->GetXmax()
122 Double_t dx = (xmax-xmin)/0.8; //10 per cent margins left and right
123 pad2->Range(xmin-0.1*dx,ymin-0.1*dy,xmax+0.1*dx,ymax+0.1*dy);
124    pad2->Draw();
125    pad2->cd();
126 grAttach->SetLineColor(2);
127 grAttach->SetLineWidth(2);
128 grAttach->Draw("lp")
129 TGaxis *axis = new TGaxis(xmax,ymin,xmax,ymax,ymin,ymax,50510,"+L");
130    axis->SetLabelColor(kRed);
131    axis->SetTitle("attachment coefficient b");
132    axis->Draw();
133
134
135 */
136
137
138 #include "Riostream.h"
139 #include "TChain.h"
140 #include "TTree.h"
141 #include "TH1F.h"
142 #include "TH2F.h"
143 #include "TH3F.h"
144 #include "THnSparse.h"
145 #include "TGraphErrors.h"
146 #include "TList.h"
147 #include "TMath.h"
148 #include "TCanvas.h"
149 #include "TFile.h"
150 #include "TF1.h"
151 #include "TVectorD.h"
152 #include "TProfile.h"
153 #include "TGraphErrors.h"
154 #include "TCanvas.h"
155
156 #include "AliTPCclusterMI.h"
157 #include "AliTPCseed.h"
158 #include "AliESDVertex.h"
159 #include "AliESDEvent.h"
160 #include "AliESDfriend.h"
161 #include "AliESDInputHandler.h"
162 #include "AliAnalysisManager.h"
163
164 #include "AliTracker.h"
165 #include "AliMagF.h"
166 #include "AliTPCCalROC.h"
167
168 #include "AliLog.h"
169
170 #include "AliTPCcalibTimeGain.h"
171
172 #include "TTreeStream.h"
173 #include "AliTPCTracklet.h"
174 #include "TTimeStamp.h"
175 #include "AliTPCcalibDB.h"
176 #include "AliTPCcalibLaser.h"
177 #include "AliDCSSensorArray.h"
178 #include "AliDCSSensor.h"
179
180 ClassImp(AliTPCcalibTimeGain)
181
182
183 AliTPCcalibTimeGain::AliTPCcalibTimeGain() 
184   :AliTPCcalibBase(), 
185    fHistGainTime(0),
186    fGainVsTime(0),
187    fHistDeDxTotal(0),
188    fIntegrationTimeDeDx(0),
189    fMIP(0),
190    fUseMax(0),
191    fLowerTrunc(0),
192    fUpperTrunc(0),
193    fUseShapeNorm(0),
194    fUsePosNorm(0),
195    fUsePadNorm(0),
196    fUseCookAnalytical(0),
197    fIsCosmic(0),
198    fLowMemoryConsumption(0)
199 {  
200   //
201   // Default constructor
202   //
203   AliInfo("Default Constructor");  
204 }
205
206
207 AliTPCcalibTimeGain::AliTPCcalibTimeGain(const Text_t *name, const Text_t *title, UInt_t StartTime, UInt_t EndTime, Int_t deltaIntegrationTimeGain)
208   :AliTPCcalibBase(),
209    fHistGainTime(0),
210    fGainVsTime(0),
211    fHistDeDxTotal(0),
212    fIntegrationTimeDeDx(0),
213    fMIP(0),
214    fUseMax(0),
215    fLowerTrunc(0),
216    fUpperTrunc(0),
217    fUseShapeNorm(0),
218    fUsePosNorm(0),
219    fUsePadNorm(0),
220    fUseCookAnalytical(0),
221    fIsCosmic(0),
222    fLowMemoryConsumption(0)
223 {
224   //
225   // No default constructor
226   //
227   SetName(name);
228   SetTitle(title);
229   
230   AliInfo("Non Default Constructor");
231   
232   fIntegrationTimeDeDx = deltaIntegrationTimeGain;
233   
234   Double_t deltaTime = EndTime - StartTime;
235   
236   
237   // main histogram for time dependence: dE/dx, time, type (1-muon cosmic,2-pion beam data), meanDriftlength, momenta (only filled if enough space is available), run number
238   Int_t timeBins = TMath::Nint(deltaTime/deltaIntegrationTimeGain);
239   Int_t binsGainTime[6]    = {150,  timeBins,    2,  25, 200, 10000000};
240   Double_t xminGainTime[6] = {0.5, StartTime,  0.5,   0, 0.1,    -0.5};
241   Double_t xmaxGainTime[6] = {  8,   EndTime,  2.5, 250,  50, 9999999.5};
242   fHistGainTime = new THnSparseF("HistGainTime","dEdx time dep.;dEdx,time,type,driftlength,momenta,run number;dEdx",6,binsGainTime,xminGainTime,xmaxGainTime);
243   BinLogX(fHistGainTime, 4);
244   //
245   fHistDeDxTotal = new TH2F("DeDx","dEdx; momentum p (GeV); TPC signal (a.u.)",250,0.01,100.,1000,0.,8);
246   BinLogX(fHistDeDxTotal);
247   
248   // default values for dE/dx
249   fMIP = 50.;
250   fUseMax = kTRUE;
251   fLowerTrunc = 0.02;
252   fUpperTrunc = 0.6;
253   fUseShapeNorm = kTRUE;
254   fUsePosNorm = kFALSE;
255   fUsePadNorm = kFALSE;
256   fUseCookAnalytical = kFALSE;
257   //
258   fIsCosmic = kTRUE;
259   fLowMemoryConsumption = kTRUE;
260   //
261   
262 }
263
264
265
266 AliTPCcalibTimeGain::~AliTPCcalibTimeGain(){
267   //
268   // Destructor
269   //
270   delete fHistGainTime;
271   delete fGainVsTime;
272   delete fHistDeDxTotal;
273 }
274
275
276 void AliTPCcalibTimeGain::Process(AliESDEvent *event) {
277   //
278   // main track loop
279   //
280   if (!event) {
281     Printf("ERROR: ESD not available");
282     return;
283   }
284   
285   if (fIsCosmic) { // this should be removed at some point based on trigger mask !?
286     ProcessCosmicEvent(event);
287   } else {
288     ProcessBeamEvent(event);
289   }
290   
291
292   
293   
294 }
295
296
297 void AliTPCcalibTimeGain::ProcessCosmicEvent(AliESDEvent *event) {
298   //
299   // Process in case of cosmic event
300   //
301   AliESDfriend *esdFriend=static_cast<AliESDfriend*>(event->FindListObject("AliESDfriend"));
302   if (!esdFriend) {
303    Printf("ERROR: ESDfriend not available");
304    return;
305   }
306   //
307   UInt_t time = event->GetTimeStamp();
308   Int_t ntracks = event->GetNumberOfTracks();
309   Int_t runNumber = event->GetRunNumber();
310   //
311   // track loop
312   //
313   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
314
315     AliESDtrack *track = event->GetTrack(i);
316     if (!track) continue;
317     AliESDfriendTrack *friendTrack = esdFriend->GetTrack(i);
318     if (!friendTrack) continue;        
319     const AliExternalTrackParam * trackIn = track->GetInnerParam();
320     const AliExternalTrackParam * trackOut = friendTrack->GetTPCOut();
321     if (!trackIn) continue;
322     if (!trackOut) continue;
323
324     // calculate necessary track parameters
325     Double_t meanP = trackIn->GetP();
326     Double_t meanDrift = 250 - 0.5*TMath::Abs(trackIn->GetZ() + trackOut->GetZ());
327     Int_t nclsDeDx = track->GetTPCNcls();
328
329     // exclude tracks which do not look like primaries or are simply too short or on wrong sectors
330     if (nclsDeDx < 60) continue;     
331     if (TMath::Abs(trackIn->GetTgl()) > 1) continue;
332     if (TMath::Abs(trackIn->GetSnp()) > 0.6) continue;
333     
334     // Get seeds
335     TObject *calibObject;
336     AliTPCseed *seed = 0;
337     for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) {
338       if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
339     }    
340
341     if (seed) { 
342       Double_t tpcSignal = GetTPCdEdx(seed);
343       if (nclsDeDx > 100) fHistDeDxTotal->Fill(meanP, tpcSignal);
344       //
345       if (fLowMemoryConsumption) {
346         if (meanP < 20) continue;
347         meanP = 30; // set all momenta to one in order to save memory
348       }
349       //dE/dx, time, type (1-muon cosmic,2-pion beam data), momenta
350       Double_t vec[6] = {tpcSignal,time,1,meanDrift,meanP,runNumber};
351       fHistGainTime->Fill(vec);
352     }
353     
354   }
355
356 }
357
358
359
360 void AliTPCcalibTimeGain::ProcessBeamEvent(AliESDEvent *event) {
361   //
362   // Process in case of beam event
363   //
364   AliESDfriend *esdFriend=static_cast<AliESDfriend*>(event->FindListObject("AliESDfriend"));
365   if (!esdFriend) {
366    Printf("ERROR: ESDfriend not available");
367    return;
368   }
369   //
370   UInt_t time = event->GetTimeStamp();
371   Int_t ntracks = event->GetNumberOfTracks();
372   Int_t runNumber = event->GetRunNumber();
373   //
374   // track loop
375   //
376   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
377
378     AliESDtrack *track = event->GetTrack(i);
379     if (!track) continue;
380     AliESDfriendTrack *friendTrack = esdFriend->GetTrack(i);
381     if (!friendTrack) continue;
382         
383     const AliExternalTrackParam * trackIn = track->GetInnerParam();
384     const AliExternalTrackParam * trackOut = friendTrack->GetTPCOut();
385     if (!trackIn) continue;
386     if (!trackOut) continue;
387
388     // calculate necessary track parameters
389     Double_t meanP = trackIn->GetP();
390     Double_t meanDrift = 250 - 0.5*TMath::Abs(trackIn->GetZ() + trackOut->GetZ());
391     Int_t nclsDeDx = track->GetTPCNcls();
392
393     // exclude tracks which do not look like primaries or are simply too short or on wrong sectors
394     if (nclsDeDx < 60) continue;     
395     if (TMath::Abs(trackIn->GetTgl()) > 1) continue;
396     if (TMath::Abs(trackIn->GetSnp()) > 0.6) continue;
397     
398     // Get seeds
399     TObject *calibObject;
400     AliTPCseed *seed = 0;
401     for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) {
402       if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
403     }    
404
405     if (seed) { 
406       if (fLowMemoryConsumption) {
407         if (meanP > 0.5 || meanP < 0.4) continue;
408         meanP = 0.45; // set all momenta to one in order to save memory
409       }
410       Double_t tpcSignal = GetTPCdEdx(seed);
411       fHistDeDxTotal->Fill(meanP, tpcSignal);
412       //
413       //dE/dx, time, type (1-muon cosmic,2-pion beam data), momenta
414       Double_t vec[6] = {tpcSignal,time,2,meanDrift,meanP,runNumber};
415       fHistGainTime->Fill(vec);
416     }
417     
418   }
419
420 }
421
422
423 Float_t AliTPCcalibTimeGain::GetTPCdEdx(AliTPCseed * seed) {
424   //
425   // calculate tpc dEdx
426   //
427   Double_t signal = 0;
428   //
429   if (!fUseCookAnalytical) {
430     signal = (1/fMIP)*seed->CookdEdxNorm(fLowerTrunc,fUpperTrunc,fUseMax,0,159,fUseShapeNorm,fUsePosNorm,fUsePadNorm,0);
431   } else {
432     signal = (1/fMIP)*seed->CookdEdxAnalytical(fLowerTrunc,fUpperTrunc,fUseMax);
433   }
434   //
435   return signal;
436 }
437
438
439 void AliTPCcalibTimeGain::AnalyzeRun(Int_t minEntries) {
440   //
441   // Analyze results of calibration
442   //
443   if (fIsCosmic) {
444     fHistGainTime->GetAxis(2)->SetRangeUser(0.51,1.49); // only cosmics
445     fHistGainTime->GetAxis(4)->SetRangeUser(20,100);    // only Fermi-Plateau muons
446   } else {
447     fHistGainTime->GetAxis(2)->SetRangeUser(1.51,2.49); // only beam data
448     fHistGainTime->GetAxis(4)->SetRangeUser(0.39,0.51); // only MIP pions
449   }
450   //
451   fGainVsTime = AliTPCcalibBase::FitSlices(fHistGainTime,0,1,minEntries,10);
452   //
453   return;
454 }
455
456
457 TGraphErrors * AliTPCcalibTimeGain::GetGraphGainVsTime(Int_t runNumber, Int_t minEntries) {
458   //
459   // Analyze results and get the graph 
460   //
461   if (runNumber == 0) {
462     if (!fGainVsTime) {
463       AnalyzeRun(minEntries);
464     }
465   } else {
466     // 1st check if the current run was cosmic or beam event
467     fHistGainTime->GetAxis(5)->SetRangeUser(runNumber,runNumber);
468     AnalyzeRun(minEntries);
469   }
470   if (fGainVsTime->GetN() == 0) return 0;
471   return fGainVsTime;
472 }
473
474 Long64_t AliTPCcalibTimeGain::Merge(TCollection *li) {
475   //
476   // merge component
477   //
478   TIterator* iter = li->MakeIterator();
479   AliTPCcalibTimeGain* cal = 0;
480
481   while ((cal = (AliTPCcalibTimeGain*)iter->Next())) {
482     if (!cal->InheritsFrom(AliTPCcalibTimeGain::Class())) {
483       Error("Merge","Attempt to add object of class %s to a %s", cal->ClassName(), this->ClassName());
484       return -1;
485     }
486
487     // add histograms here...
488     if (cal->GetHistGainTime()) fHistGainTime->Add(cal->GetHistGainTime());
489     if (cal->GetHistDeDxTotal()) fHistDeDxTotal->Add(cal->GetHistDeDxTotal());
490
491   }
492   
493   return 0;
494   
495 }
496
497
498 AliSplineFit * AliTPCcalibTimeGain::MakeSplineFit(TGraphErrors * graph) {
499   //
500   // make spline fit of gain
501   //
502   AliSplineFit *fit = new AliSplineFit();
503   fit->SetGraph(graph);
504   fit->SetMinPoints(graph->GetN()+1);
505   fit->InitKnots(graph,2,0,0.001);
506   fit->SplineFit(0);
507   return fit;
508   
509 }
510
511
512
513 TGraphErrors * AliTPCcalibTimeGain::GetGraphAttachment(Int_t minEntries, Int_t nmaxBin, Float_t /*fracLow*/, Float_t /*fracUp*/) {
514   //
515   // For each time bin the driftlength-dependence of the signal is fitted.
516   //
517   TH3D * hist = fHistGainTime->Projection(1, 0, 3);
518   Double_t *xvec = new Double_t[hist->GetNbinsX()];
519   Double_t *yvec = new Double_t[hist->GetNbinsX()];
520   Double_t *xerr = new Double_t[hist->GetNbinsX()];
521   Double_t *yerr = new Double_t[hist->GetNbinsX()];
522   Int_t counter  = 0;
523   TH2D * projectionHist = 0x0;
524   //
525   for(Int_t i=1; i < hist->GetNbinsX(); i++) {
526     Int_t nsum=0;
527     Int_t imin   =  i;
528     Int_t imax   =  i;    
529     for (Int_t idelta=0; idelta<nmaxBin; idelta++){
530       //
531       imin   =  TMath::Max(i-idelta,1);
532       imax   =  TMath::Min(i+idelta,hist->GetNbinsX());
533       nsum = TMath::Nint(hist->Integral(imin,imax,1,hist->GetNbinsY()-1,1,hist->GetNbinsZ()-1));
534       if (nsum==0) break;
535       if (nsum>minEntries) break;
536     }
537     if (nsum<minEntries) continue;
538     //
539     hist->GetXaxis()->SetRange(imin,imax);
540     projectionHist = (TH2D*)hist->Project3D("yzNUFNOF");
541     //
542     TObjArray arr;
543     projectionHist->FitSlicesY(0,2, projectionHist->GetNbinsX()-2,0,"QNR",&arr);
544     TH1D * histAttach = (TH1D*)arr.At(1);
545     TF1 pol1("polynom1","pol1",10,240);
546     histAttach->Fit(&pol1,"QNR");
547     xvec[counter] = 0.5*(hist->GetXaxis()->GetBinCenter(imin)+hist->GetXaxis()->GetBinCenter(imax));
548     yvec[counter] = pol1.GetParameter(1)/pol1.GetParameter(0);
549     xerr[counter] = 0;
550     yerr[counter] = pol1.GetParError(1)/pol1.GetParameter(0);
551     counter++;
552     //
553     delete projectionHist;
554   }
555   
556   TGraphErrors * graphErrors = new TGraphErrors(counter, xvec, yvec, xerr, yerr);
557   delete [] xvec;
558   delete [] yvec;
559   delete [] xerr;
560   delete [] yerr;
561   delete hist;
562   return graphErrors;
563   
564 }
565
566
567
568 void AliTPCcalibTimeGain::BinLogX(THnSparse *h, Int_t axisDim) {
569   //
570   // Method for the correct logarithmic binning of histograms
571   //
572   TAxis *axis = h->GetAxis(axisDim);
573   int bins = axis->GetNbins();
574
575   Double_t from = axis->GetXmin();
576   Double_t to = axis->GetXmax();
577   Double_t *newBins = new Double_t[bins + 1];
578    
579   newBins[0] = from;
580   Double_t factor = pow(to/from, 1./bins);
581   
582   for (int i = 1; i <= bins; i++) {
583    newBins[i] = factor * newBins[i-1];
584   }
585   axis->Set(bins, newBins);
586   delete newBins;
587   
588 }
589
590
591 void AliTPCcalibTimeGain::BinLogX(TH1 *h) {
592   //
593   // Method for the correct logarithmic binning of histograms
594   //
595   TAxis *axis = h->GetXaxis();
596   int bins = axis->GetNbins();
597
598   Double_t from = axis->GetXmin();
599   Double_t to = axis->GetXmax();
600   Double_t *newBins = new Double_t[bins + 1];
601    
602   newBins[0] = from;
603   Double_t factor = pow(to/from, 1./bins);
604   
605   for (int i = 1; i <= bins; i++) {
606    newBins[i] = factor * newBins[i-1];
607   }
608   axis->Set(bins, newBins);
609   delete newBins;
610   
611 }
612
613
614
615 void AliTPCcalibTimeGain::CalculateBetheAlephParams(TH2F *hist, Double_t * ini) {
616   //
617   // Fit the bethe bloch params
618   //
619   //{0.0762*MIP,10.632,1.34e-05,1.863,1.948}
620   const Double_t sigma = 0.06;
621
622   TH2F *histBG = new TH2F("histBG","dEdxBg; #beta #gamma; TPC signal (a.u.)",TMath::Nint(0.5*hist->GetNbinsX()),0.1,5000.,hist->GetNbinsY(),hist->GetYaxis()->GetXmin(),hist->GetYaxis()->GetXmax());
623   BinLogX(histBG);
624
625   TF1 *foElectron = new TF1("foElectron", "AliExternalTrackParam::BetheBlochAleph(x/0.000511,[0],[1],[2],[3],[4])",0.01,100);
626   TF1 *foMuon = new TF1("foMuon", "AliExternalTrackParam::BetheBlochAleph(x/0.1056,[0],[1],[2],[3],[4])",0.01,100);
627   TF1 *foPion = new TF1("foPion", "AliExternalTrackParam::BetheBlochAleph(x/0.138,[0],[1],[2],[3],[4])",0.01,100);
628   TF1 *foKaon = new TF1("foKaon", "AliExternalTrackParam::BetheBlochAleph(x/0.498,[0],[1],[2],[3],[4])",0.01,100);
629   TF1 *foProton = new TF1("foProton", "AliExternalTrackParam::BetheBlochAleph(x/0.938,[0],[1],[2],[3],[4])",0.01,100);
630   foElectron->SetParameters(ini);
631   foMuon->SetParameters(ini);
632   foPion->SetParameters(ini);
633   foKaon->SetParameters(ini);
634   foProton->SetParameters(ini);
635   
636   TCanvas *canvCheck1 = new TCanvas();
637   hist->Draw("colz");
638   foElectron->Draw("same");
639   foMuon->Draw("same");
640   foPion->Draw("same");
641   foKaon->Draw("same");  
642   foProton->Draw("same");
643  
644   // Loop over all points of the input histogram
645   
646   for(Int_t i=1; i < hist->GetNbinsX(); i++) {
647     Double_t x = hist->GetXaxis()->GetBinCenter(i);   
648     for(Int_t j=1; j < hist->GetNbinsY(); j++) {
649       Long64_t n = hist->GetBin(i, j);
650       Double_t y = hist->GetYaxis()->GetBinCenter(j);
651       Double_t entries = hist->GetBinContent(n);
652       Double_t mass = 0;
653
654       // 1. identify protons
655       mass = 0.938;
656       if (TMath::Abs(y - foProton->Eval(x))/foProton->Eval(x) < 4*sigma && x < 0.65 ) {
657         for(Int_t iEntries =0; iEntries < entries; iEntries++) histBG->Fill(x/mass, y);
658       }
659
660       // 2. identify electrons
661       mass = 0.000511;
662       if (fIsCosmic) {
663         if (TMath::Abs(y - foElectron->Eval(x))/foElectron->Eval(x) < 4*sigma && (x>0.25&&x<0.7) && fIsCosmic) {
664           for(Int_t iEntries =0; iEntries < entries; iEntries++) histBG->Fill(x/mass, y);
665         }
666       } else {
667         if (TMath::Abs(y - foElectron->Eval(x))/foElectron->Eval(x) < 2*sigma && ((x>0.25&&x<0.35) || (x>1.5&&x<1.8) || (x>0.65&&x<0.7))) {
668           for(Int_t iEntries =0; iEntries < entries; iEntries++) histBG->Fill(x/mass, y);
669         }
670       }
671       
672       // 3. identify either muons or pions depending on cosmic or not
673       if (fIsCosmic) {
674         mass = 0.1056;
675         if (TMath::Abs(y - foMuon->Eval(x))/foMuon->Eval(x) < 4*sigma && x > 0.25 && x < 100 ) {
676           for(Int_t iEntries =0; iEntries < entries; iEntries++) histBG->Fill(x/mass, y);
677         }
678       } else {
679         mass = 0.1396;
680         if (TMath::Abs(y - foPion->Eval(x))/foPion->Eval(x) < 4*sigma && x > 0.15 && x < 2) {
681           for(Int_t iEntries =0; iEntries < entries; iEntries++) histBG->Fill(x/mass, y);
682         }
683       }
684       
685       // 4. for pp also Kaons must be included
686       if (!fIsCosmic) {
687         mass = 0.4936;
688         if (TMath::Abs(y - foKaon->Eval(x))/foKaon->Eval(x) < 4*sigma && x > 0.2 && x < 0.3 ) {
689           for(Int_t iEntries =0; iEntries < entries; iEntries++) histBG->Fill(x/mass, y);
690         }
691       }
692     }
693   }
694
695   // Fit Aleph-Parameters to the obtained profile
696   TF1 * funcAlephD = new TF1("AlephParametrizationD", "AliExternalTrackParam::BetheBlochAleph(x,[0],[1],[2],[3],[4])",0.3,10000);
697   funcAlephD->SetParameters(ini);
698
699   TCanvas *canvCheck2 = new TCanvas();
700   histBG->Draw();
701   
702   //FitSlices
703   TObjArray * arr = new TObjArray();
704   histBG->FitSlicesY(0,0,-1,0,"QN",arr);
705   TH1D * fitMean = (TH1D*) arr->At(1);
706   fitMean->Draw("same");
707
708   funcAlephD->SetParLimits(2,1e-3,1e-7);
709   funcAlephD->SetParLimits(3,0.5,3.5);
710   funcAlephD->SetParLimits(4,0.5,3.5);
711   fitMean->Fit(funcAlephD, "QNR");
712   funcAlephD->Draw("same");
713
714   for(Int_t i=0;i<5;i++) ini[i] = funcAlephD->GetParameter(i);
715
716   foElectron->SetParameters(ini);
717   foMuon->SetParameters(ini);
718   foPion->SetParameters(ini);
719   foKaon->SetParameters(ini);
720   foProton->SetParameters(ini);
721   
722   TCanvas *canvCheck3 = new TCanvas();
723   hist->Draw("colz");
724   foElectron->Draw("same");
725   foMuon->Draw("same");
726   foPion->Draw("same");
727   foKaon->Draw("same");  
728   foProton->Draw("same");
729   
730   canvCheck1->Print();
731   canvCheck2->Print();
732   canvCheck3->Print();
733
734   return;
735
736
737 }