TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //           Implementation of the TPC seed class
  21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  23 //-----------------------------------------------------------------
  24 #include "TClonesArray.h"
  25 #include "AliTPCseed.h"
  26 #include "AliTPCReconstructor.h"
  27 #include "AliTPCClusterParam.h"
  28
  29 ClassImp(AliTPCseed)
  30
  31
  32
  33 AliTPCseed::AliTPCseed():
  34   AliTPCtrack(),
  35   fEsd(0x0),
  36   fClusterOwner(kFALSE),
  37   fPoints(0x0),
  38   fEPoints(0x0),
  39   fRow(0),
  40   fSector(-1),
  41   fRelativeSector(-1),
  42   fCurrentSigmaY2(1e10),
  43   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  44   fErrorY2(1e10),
  45   fErrorZ2(1e10),
  46   fCurrentCluster(0x0),
  47   fCurrentClusterIndex1(-1),
  48   fInDead(kFALSE),
  49   fIsSeeding(kFALSE),
  50   fNoCluster(0),
  51   fSort(0),
  52   fBSigned(kFALSE),
  53   fSeedType(0),
  54   fSeed1(-1),
  55   fSeed2(-1),
  56   fMAngular(0),
  57   fCircular(0),
  58   fClusterMap(159),
  59   fSharedMap(159)
  60 {
  61   //
  62   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  63   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  64   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  65   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  66   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  67     fDEDX[i] = 0.;
  68     fSDEDX[i] = 1e10;
  69     fNCDEDX[i] = 0;
  70   }
  71   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  72   //  for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
  73   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
  74   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
  75   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
  76
  77 }
  78
  79 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  80   AliTPCtrack(s),
  81   fEsd(0x0),
  82   fClusterOwner(clusterOwner),
  83   fPoints(0x0),
  84   fEPoints(0x0),
  85   fRow(0),
  86   fSector(-1),
  87   fRelativeSector(-1),
  88   fCurrentSigmaY2(1e10),
  89   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  90   fErrorY2(1e10),
  91   fErrorZ2(1e10),
  92   fCurrentCluster(0x0),
  93   fCurrentClusterIndex1(-1),
  94   fInDead(kFALSE),
  95   fIsSeeding(kFALSE),
  96   fNoCluster(0),
  97   fSort(0),
  98   fBSigned(kFALSE),
  99   fSeedType(0),
 100   fSeed1(-1),
 101   fSeed2(-1),
 102   fMAngular(0),
 103   fCircular(0),
 104   fClusterMap(s.fClusterMap),
 105   fSharedMap(s.fSharedMap)
 106 {
 107   //---------------------
 108   // dummy copy constructor
 109   //-------------------------
 110   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 111     fClusterPointer[i]=0;
 112     if (fClusterOwner){
 113       if (s.fClusterPointer[i])
 114         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 115     }else{
 116       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 117     }
 118     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 119   }
 120   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 121   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 122   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 123     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 124     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 125     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 126   }
 127   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 128
 129 }
 130
 131
 132 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 133   AliTPCtrack(t),
 134   fEsd(0x0),
 135   fClusterOwner(kFALSE),
 136   fPoints(0x0),
 137   fEPoints(0x0),
 138   fRow(0),
 139   fSector(-1),
 140   fRelativeSector(-1),
 141   fCurrentSigmaY2(1e10),
 142   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 143   fErrorY2(1e10),
 144   fErrorZ2(1e10),
 145   fCurrentCluster(0x0),
 146   fCurrentClusterIndex1(-1),
 147   fInDead(kFALSE),
 148   fIsSeeding(kFALSE),
 149   fNoCluster(0),
 150   fSort(0),
 151   fBSigned(kFALSE),
 152   fSeedType(0),
 153   fSeed1(-1),
 154   fSeed2(-1),
 155   fMAngular(0),
 156   fCircular(0),
 157   fClusterMap(159),
 158   fSharedMap(159)
 159 {
 160   //
 161   // Constructor from AliTPCtrack
 162   //
 163   fFirstPoint =0;
 164   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 165   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 166     fClusterPointer[i] = 0;
 167     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 168     if (index>=-1){
 169       SetClusterIndex2(i,index);
 170     }
 171     else{
 172       SetClusterIndex2(i,-3);
 173     }
 174   }
 175   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 176     fDEDX[i] = 0.;
 177     fSDEDX[i] = 1e10;
 178     fNCDEDX[i] = 0;
 179   }
 180   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 181
 182   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
 183   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
 184   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
 185   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
 186
 187 }
 188
 189 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 190                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 191   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 192   fEsd(0x0),
 193   fClusterOwner(kFALSE),
 194   fPoints(0x0),
 195   fEPoints(0x0),
 196   fRow(0),
 197   fSector(-1),
 198   fRelativeSector(-1),
 199   fCurrentSigmaY2(1e10),
 200   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 201   fErrorY2(1e10),
 202   fErrorZ2(1e10),
 203   fCurrentCluster(0x0),
 204   fCurrentClusterIndex1(-1),
 205   fInDead(kFALSE),
 206   fIsSeeding(kFALSE),
 207   fNoCluster(0),
 208   fSort(0),
 209   fBSigned(kFALSE),
 210   fSeedType(0),
 211   fSeed1(-1),
 212   fSeed2(-1),
 213   fMAngular(0),
 214   fCircular(0),
 215   fClusterMap(159),
 216   fSharedMap(159)
 217 {
 218   //
 219   // Constructor
 220   //
 221   fFirstPoint =0;
 222   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 223   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 224   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 225   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 226     fDEDX[i] = 0.;
 227     fSDEDX[i] = 1e10;
 228     fNCDEDX[i] = 0;
 229   }
 230   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 231 }
 232
 233 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 234   //
 235   // destructor
 236   if (fPoints) delete fPoints;
 237   fPoints =0;
 238   if (fEPoints) delete fEPoints;
 239   fEPoints = 0;
 240   fNoCluster =0;
 241   if (fClusterOwner){
 242     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 243       delete fClusterPointer[icluster];
 244     }
 245   }
 246
 247 }
 248 //_________________________________________________
 249 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
 250 {
 251   //
 252   // assignment operator
 253   //
 254   if(this!=&param){
 255     AliTPCtrack::operator=(param);
 256     fEsd =param.fEsd;
 257     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
 258     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
 259     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
 260     // but deleted in the dtor... strange...
 261     // fPoints =
 262     // fEPoints =
 263     fRow            = param.fRow;
 264     fSector         = param.fSector;
 265     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
 266     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
 267     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
 268     fErrorY2        = param.fErrorY2;
 269     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
 270     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
 271     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1;
 272     fInDead         = param.fInDead;
 273     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
 274     fNoCluster      = param.fNoCluster;
 275     fSort           = param.fSort;
 276     fBSigned        = param.fBSigned;
 277     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
 278       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
 279       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
 280       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
 281     }
 282     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
 283
 284     fSeedType = param.fSeedType;
 285     fSeed1    = param.fSeed1;
 286     fSeed2    = param.fSeed2;
 287     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
 288     fMAngular = param.fMAngular;
 289     fCircular = param.fCircular;
 290     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
 291     fClusterMap = param.fClusterMap;
 292     fSharedMap = param.fSharedMap;
 293   }
 294   return (*this);
 295 }
 296 //____________________________________________________
 297 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 298 {
 299   //
 300   //
 301   return &fTrackPoints[i];
 302 }
 303
 304 void AliTPCseed::RebuildSeed()
 305 {
 306   //
 307   // rebuild seed to be ready for storing
 308   AliTPCclusterMI cldummy;
 309   cldummy.SetQ(0);
 310   AliTPCTrackPoint pdummy;
 311   pdummy.GetTPoint().SetShared(10);
 312   for (Int_t i=0;i<160;i++){
 313     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
 314     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);
 315     if (cl0){
 316       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
 317       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
 318       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
 319     }
 320     else{
 321       *trpoint = pdummy;
 322       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
 323     }
 324
 325   }
 326
 327 }
 328
 329
 330 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 331 {
 332   //
 333   //
 334   // return cluster for n rows bellow first point
 335   Int_t nfoundable = 1;
 336   Int_t nfound      = 1;
 337   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 338     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 339     if (index!=-1) nfoundable++;
 340     if (index>0) nfound++;
 341   }
 342   if (nfoundable<n) return 0;
 343   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 344
 345 }
 346
 347
 348 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 349 {
 350   // get cluster stat.  on given region
 351   //
 352   found       = 0;
 353   foundable   = 0;
 354   shared      =0;
 355   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 356     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 357     if (index!=-1) foundable++;
 358     if (index&0x8000) continue;
 359     if (fClusterPointer[i]) {
 360       found++;
 361     }
 362     else
 363       continue;
 364
 365     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 366       shared++;
 367       continue;
 368     }
 369     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 370     //
 371     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 372       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 373         shared++;
 374         continue;
 375       }
 376     }
 377     if ( fClusterPointer[i+1]){
 378       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 379         shared++;
 380         continue;
 381       }
 382     }
 383
 384   }
 385   //if (shared>found){
 386     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 387   //}
 388 }
 389
 390
 391
 392
 393
 394 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 395 {
 396   //
 397   //
 398   SetNumberOfClusters(0);
 399   fNFoundable = 0;
 400   SetChi2(0);
 401   ResetCovariance(10.);
 402   /*
 403   if (fTrackPoints){
 404     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 405       delete [] fTrackPoints[i];
 406     }
 407     delete fTrackPoints;
 408     fTrackPoints =0;
 409   }
 410   */
 411
 412   if (all){
 413     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 414     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 415   }
 416
 417 }
 418
 419
 420 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 421 {
 422
 423   //------------------------------------------------------------------
 424   //This function makes a track forget its history :)
 425   //------------------------------------------------------------------
 426   if (factor<=0) {
 427     ResetCovariance(10.);
 428     return;
 429   }
 430   ResetCovariance(factor);
 431
 432   SetNumberOfClusters(0);
 433   fNFoundable =0;
 434   SetChi2(0);
 435   fRemoval = 0;
 436   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 437   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 438   fNoCluster     = 0;
 439   //fFirstPoint = 160;
 440   //fLastPoint  = 0;
 441 }
 442
 443
 444
 445
 446 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 447 {
 448   //-----------------------------------------------------------------
 449   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 450   // doesn't change internal state of the track
 451   //-----------------------------------------------------------------
 452
 453   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 454
 455   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 456     return 0;
 457   }
 458
 459   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 460   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
 461   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 462
 463   y = GetY();
 464   z = GetZ();
 465   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 466   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 467
 468   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 469   Double_t dz = 0;
 470   //
 471   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 472   /*
 473   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 474     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 475   }else{
 476     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 477   }
 478   */
 479   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 480   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 481   //
 482   y+=dy;
 483   z+=dz;
 484
 485
 486   return 1;
 487 }
 488
 489
 490 //_____________________________________________________________________________
 491 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 492 {
 493   //-----------------------------------------------------------------
 494   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 495   //-----------------------------------------------------------------
 496   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 497   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 498   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 499 }
 500
 501 //_________________________________________________________________________________________
 502
 503
 504 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 505   //-----------------------------------------------------------------
 506   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 507   //-----------------------------------------------------------------
 508   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 509
 510   if (fSort == 0){
 511     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 512     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 513     Double_t z2 = t->GetZ();
 514     Double_t z1 = GetZ();
 515     if (z2>z1) return 1;
 516     if (z2<z1) return -1;
 517     return 0;
 518   }
 519   else {
 520     Float_t f2 =1;
 521     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
 522     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 523
 524     Float_t f1 =1;
 525     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
 526
 527     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 528
 529     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 530     else return +1;
 531   }
 532 }
 533
 534
 535
 536
 537 //_____________________________________________________________________________
 538 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t /*index*/)
 539 {
 540   //-----------------------------------------------------------------
 541   // This function associates a cluster with this track.
 542   //-----------------------------------------------------------------
 543   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 544   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 545
 546   if (!AliExternalTrackParam::Update(p,cov)) return kFALSE;
 547
 548   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 549   //  fIndex[n]=index;
 550   SetNumberOfClusters(n+1);
 551   SetChi2(GetChi2()+chisq);
 552
 553   return kTRUE;
 554 }
 555
 556
 557
 558 //_____________________________________________________________________________
 559 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
 560   //-----------------------------------------------------------------
 561   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 562   //-----------------------------------------------------------------
 563
 564   Float_t amp[200];
 565   Float_t angular[200];
 566   Float_t weight[200];
 567   Int_t index[200];
 568   //Int_t nc = 0;
 569   //  TClonesArray & arr = *fPoints;
 570   Float_t meanlog = 100.;
 571
 572   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 573   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 574   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 575   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 576   //
 577   //
 578   fNShared =0;
 579
 580   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 581     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 582       {
 583         Int_t index = fIndex[i];
 584         if (index<0||index&0x8000) continue;
 585
 586         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 587         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 588         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 589         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 590         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 591
 592         if (point==0) continue;
 593         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 594         if (cl==0) continue;
 595         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 596         if (cl->IsUsed(11)) {
 597           fNShared++;
 598           continue;
 599         }
 600         Int_t   type   = cl->GetType();
 601         //if (point->fIsShared){
 602         //  fNShared++;
 603         //  continue;
 604         //}
 605         //if (pointm)
 606         //  if (pointm->fIsShared) continue;
 607         //if (pointp)
 608         //  if (pointp->fIsShared) continue;
 609
 610         if (type<0) continue;
 611         //if (type>10) continue;
 612         //if (point->GetErrY()==0) continue;
 613         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 614
 615         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 616         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 617         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 618
 619
 620         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 621         if (cl->GetMax()<5) continue;
 622         Float_t angley = point->GetAngleY();
 623         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 624
 625         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 626         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 627         /*
 628         Float_t ns = 1.;
 629         if (pointm){
 630           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 631           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 632           ns+=1.;
 633         }
 634         if (pointp){
 635           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 636           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 637           ns+=1.;
 638         }
 639         rsigmay/=ns;
 640         rsigmaz/=ns;
 641         */
 642
 643         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 644
 645         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 646         if (i>64){
 647           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 648           ampc = 1.*cl->GetMax();
 649           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 650           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 651           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 652           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 653           //Float_t dz =
 654           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 655           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 656           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 657           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 658           //ampc               *=zfactor;
 659         }
 660         else{
 661           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 662           ampc = 1.0*cl->GetMax();
 663           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 664           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 665           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 666           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 667           //Float_t dz =
 668           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 669
 670           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 671           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 672           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 673           //ampc               *=zfactor;
 674
 675         }
 676         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 677         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 678         Float_t w      =  1.;
 679         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 680         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 681         if (i<64) {
 682           ampc /= 0.6;
 683           //ampc /= (1+0.0008*z);
 684         } else
 685           if (i>128){
 686             ampc /=1.5;
 687             //ampc /= (1+0.0008*z);
 688           }else{
 689             //ampc /= (1+0.0008*z);
 690           }
 691
 692         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 693           // w*= 2.;
 694
 695           continue;
 696         }
 697         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 698         amp[nc[of]]        = ampc;
 699         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 700         weight[nc[of]]     = w;
 701         nc[of]++;
 702       }
 703
 704     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 705     Float_t sumamp=0;
 706     Float_t sumamp2=0;
 707     Float_t sumw=0;
 708     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 709     meanlog = 50;
 710     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 711       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 712       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 713       //
 714       sumw    += weight[index[i]];
 715       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 716       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 717       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 718     }
 719     if (sumw<1){
 720       SetdEdx(0);
 721     }
 722     else {
 723       norm[of] /= sumw;
 724       mean[of]  = sumamp/sumw;
 725       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 726       if (sigma[of]>0.1)
 727         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 728       else
 729         sigma[of] = 1000;
 730
 731     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 732     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 733     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 734     }
 735   }
 736
 737   Float_t dedx =0;
 738   fSdEdx =0;
 739   fMAngular =0;
 740   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 741   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 742
 743
 744   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 745   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 746
 747   Int_t norm2 = 0;
 748   Int_t norm3 = 0;
 749   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 750     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 751       dedx      += mean[i] *nc[i];
 752       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 753       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 754       norm2     += nc[i];
 755       norm3     += nc[i]-2;
 756     }
 757     fDEDX[i]  = mean[i];
 758     fSDEDX[i] = sigma[i];
 759     fNCDEDX[i]= nc[i];
 760   }
 761
 762   if (norm3>0){
 763     dedx   /=norm2;
 764     fSdEdx /=norm3;
 765     fMAngular/=norm2;
 766   }
 767   else{
 768     SetdEdx(0);
 769     return 0;
 770   }
 771   //  Float_t dedx1 =dedx;
 772   /*
 773   dedx =0;
 774   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 775     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 776       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 777       dedx      += mean[i] *nc[i];
 778     }
 779     fDEDX[i]  = mean[i];
 780   }
 781   dedx /= norm2;
 782   */
 783
 784
 785   SetdEdx(dedx);
 786   return dedx;
 787 }
 788 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
 789   //
 790   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
 791   //
 792   Double_t bg2=bg*bg;
 793   Double_t bethe;
 794   if (bg<3.5e1)
 795     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
 796   else // Density effect ( approximately :)
 797     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
 798   return bethe/11.091;
 799 }
 800
 801 void AliTPCseed::CookPID()
 802 {
 803   //
 804   // cook PID information according dEdx
 805   //
 806   Double_t fRange = 10.;
 807   Double_t fRes   = 0.1;
 808   Double_t fMIP   = 47.;
 809   //
 810   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 811   Double_t sumr =0;
 812   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 813     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 814     Double_t mom=GetP();
 815     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 816     Double_t bethe=Bethe(mom/mass);
 817     Double_t sigma=fRes*bethe;
 818     if (sigma>0.001){
 819       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 820         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 821         sumr+=fTPCr[j];
 822         continue;
 823       }
 824       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 825       sumr+=fTPCr[j];
 826     }
 827     else{
 828       fTPCr[j]=1.;
 829       sumr+=fTPCr[j];
 830     }
 831   }
 832   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 833     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 834   }
 835 }
 836
 837 /*
 838 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
 839   //-----------------------------------------------------------------
 840   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 841   //-----------------------------------------------------------------
 842
 843   Float_t amp[200];
 844   Float_t angular[200];
 845   Float_t weight[200];
 846   Int_t index[200];
 847   Bool_t inlimit[200];
 848   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
 849   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
 850   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
 851
 852
 853   //
 854   Float_t meanlog = 100.;
 855   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
 856
 857   Float_t amean     =0;
 858   Float_t asigma    =0;
 859   Float_t anc       =0;
 860   Float_t anorm     =0;
 861
 862   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 863   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 864   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 865   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 866   //
 867   //
 868   fNShared =0;
 869
 870   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
 871   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 872   for (Int_t i =0; i<160;i++)
 873     {
 874         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
 875         if (point==0) continue;
 876         if (point->fIsShared){
 877           fNShared++;
 878           continue;
 879         }
 880         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
 881         if (type<0) continue;
 882         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 883         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
 884         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
 885         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
 886         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
 887         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
 888
 889         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 890         if (i>64){
 891           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
 892         }
 893         else{
 894           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
 895         }
 896         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 897         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
 898
 899         Float_t w      =  1.;
 900         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
 901         if (i<64) {
 902           ampc /= 0.63;
 903         } else
 904           if (i>128){
 905             ampc /=1.51;
 906           }
 907         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 908           continue;
 909         }
 910         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 911         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 912         amp[i]        = ampc/angular[i];
 913         weight[i]     = w;
 914         anc++;
 915     }
 916
 917   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
 918   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
 919     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
 920   }
 921
 922   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
 923   meanlog =10000.;
 924   for (Int_t of =0; of<3; of++){
 925     Float_t sumamp=0;
 926     Float_t sumamp2=0;
 927     Float_t sumw=0;
 928    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 929       {
 930         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
 931         Float_t ampl      = amp[i];
 932         ///angular[i];
 933         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 934         //
 935         sumw    += weight[i];
 936         sumamp  += weight[i]*ampl;
 937         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
 938         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
 939         nc[of]++;
 940       }
 941    if (sumw<1){
 942      SetdEdx(0);
 943    }
 944    else {
 945      norm[of] /= sumw;
 946      mean[of]  = sumamp/sumw;
 947      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 948      if (sigma[of]>0.1)
 949        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 950      else
 951        sigma[of] = 1000;
 952      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 953    }
 954   }
 955
 956   Float_t dedx =0;
 957   fSdEdx =0;
 958   fMAngular =0;
 959   //
 960   Int_t norm2 = 0;
 961   Int_t norm3 = 0;
 962   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
 963   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
 964
 965   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 966     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 967       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
 968       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 969       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 970       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
 971       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 972     }
 973     fDEDX[i]  = mean[i];
 974     fSDEDX[i] = sigma[i];
 975     fNCDEDX[i]= nc[i];
 976   }
 977
 978   if (norm3>0){
 979     dedx   /=norm2;
 980     fSdEdx /=norm3;
 981     fMAngular/=norm2;
 982   }
 983   else{
 984     SetdEdx(0);
 985     return;
 986   }
 987   //  Float_t dedx1 =dedx;
 988
 989   dedx =0;
 990   Float_t norm4 = 0;
 991   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 992     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
 993       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 994       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
 995       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
 996     }
 997     fDEDX[i]  = mean[i];
 998   }
 999   if (norm4>0) dedx /= norm4;
1000
1001
1002
1003   SetdEdx(dedx);
1004
1005   //mi deDX
1006
1007 }
1008 */
1009 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
1010 //-----------------------------------------------------------------
1011 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
1012 //-----------------------------------------------------------------
1013   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
1014     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
1015     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
1016     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
1017     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
1018     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
1019 }
1020
1021 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
1022 {
1023   fClusterMap[ibit] = state;
1024 }
1025 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
1026 {
1027   return fClusterMap[ibit];
1028 }
1029 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
1030 {
1031   fSharedMap[ibit] = state;
1032 }
1033 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
1034 {
1035   return fSharedMap[ibit];
1036 }
1037
1038
1039
1040
1041
1042 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2){
1043
1044   //
1045   // calculates dedx using the cluster
1046   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
1047   // type   -  0 - max charge  or 1- total charge in cluster 2- max no corr 3- total+ correction
1048   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
1049   //
1050   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
1051   //
1052   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCClusterParam::Instance();
1053   if (!parcl) return 0;
1054   Float_t amp[160];
1055   Int_t   indexes[160];
1056   Int_t   ncl=0;
1057   //
1058   //
1059   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1060   const Float_t kedgey =4.;
1061   //
1062   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
1063     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1064     if (!cluster) continue;
1065     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1066     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetQ():cluster->GetMax();
1067     //do normalization
1068     Float_t corr=1;
1069     if (type<=1){
1070       Int_t  ipad= 0;
1071       if (irow>63) ipad=1;
1072       if (irow>128) ipad=2;
1073       //
1074       AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1075       Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1076       Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ());
1077
1078       Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1079       corr  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
1080     }
1081     amp[ncl]=charge/corr;
1082     ncl++;
1083   }
1084   if (type>3) return ncl;
1085   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1086
1087   if (ncl<40) return 0;
1088
1089   Float_t suma=0;
1090   Float_t sumn=0;
1091   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1092   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1093   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1094     suma+=amp[indexes[icl]];
1095     sumn++;
1096   }
1097   return suma/sumn;
1098
1099 }
1100
1101 Double_t AliTPCseed::BetheMass(Double_t mass){
1102   //
1103   // return bethe-bloch
1104   //
1105   Float_t bg= P()/mass;
1106   const Double_t kp1=0.76176e-1;
1107   const Double_t kp2=10.632;
1108   const Double_t kp3=0.13279e-4;
1109   const Double_t kp4=1.8631;
1110   const Double_t kp5=1.9479;
1111
1112   Double_t dbg = (Double_t) bg;
1113
1114   Double_t beta = dbg/TMath::Sqrt(1.+dbg*dbg);
1115
1116   Double_t aa = TMath::Power(beta,kp4);
1117   Double_t bb = TMath::Power(1./dbg,kp5);
1118
1119   bb=TMath::Log(kp3+bb);
1120
1121   return ((Float_t)((kp2-aa-bb)*kp1/aa));
1122 }
1123
1124
1125 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1126   //
1127   //
1128   //
1129  //-----------------------------------------------------------------
1130   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1131   //-----------------------------------------------------------------
1132   Float_t means=0;
1133   Float_t meanc=0;
1134   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1135     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1136     if (point==0) continue;
1137
1138     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1139     if (cl==0) continue;
1140
1141     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1142     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1143     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1144     if (type==0) means+=rsigma;
1145     if (type==1) means+=rsigmay;
1146     if (type==2) means+=rsigmaz;
1147     meanc++;
1148   }
1149   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1150   return mean;
1151 }