TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //           Implementation of the TPC seed class
  21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  23 //-----------------------------------------------------------------
  24 #include "TClonesArray.h"
  25 #include "AliTPCseed.h"
  26 #include "AliTPCReconstructor.h"
  27
  28 ClassImp(AliTPCseed)
  29
  30
  31
  32 AliTPCseed::AliTPCseed():
  33   AliTPCtrack(),
  34   fEsd(0x0),
  35   fClusterOwner(kFALSE),
  36   fPoints(0x0),
  37   fEPoints(0x0),
  38   fRow(0),
  39   fSector(-1),
  40   fRelativeSector(-1),
  41   fCurrentSigmaY2(1e10),
  42   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  43   fErrorY2(1e10),
  44   fErrorZ2(1e10),
  45   fCurrentCluster(0x0),
  46   fCurrentClusterIndex1(-1),
  47   fInDead(kFALSE),
  48   fIsSeeding(kFALSE),
  49   fNoCluster(0),
  50   fSort(0),
  51   fBSigned(kFALSE),
  52   fSeedType(0),
  53   fSeed1(-1),
  54   fSeed2(-1),
  55   fMAngular(0),
  56   fCircular(0)
  57 {
  58   //
  59   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  60   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  61   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  62   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  63   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  64     fDEDX[i] = 0.;
  65     fSDEDX[i] = 1e10;
  66     fNCDEDX[i] = 0;
  67   }
  68   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  69 }
  70
  71 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  72   AliTPCtrack(s),
  73   fEsd(0x0),
  74   fClusterOwner(clusterOwner),
  75   fPoints(0x0),
  76   fEPoints(0x0),
  77   fRow(0),
  78   fSector(-1),
  79   fRelativeSector(-1),
  80   fCurrentSigmaY2(1e10),
  81   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  82   fErrorY2(1e10),
  83   fErrorZ2(1e10),
  84   fCurrentCluster(0x0),
  85   fCurrentClusterIndex1(-1),
  86   fInDead(kFALSE),
  87   fIsSeeding(kFALSE),
  88   fNoCluster(0),
  89   fSort(0),
  90   fBSigned(kFALSE),
  91   fSeedType(0),
  92   fSeed1(-1),
  93   fSeed2(-1),
  94   fMAngular(0),
  95   fCircular(0)
  96 {
  97   //---------------------
  98   // dummy copy constructor
  99   //-------------------------
 100   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 101     fClusterPointer[i]=0;
 102     if (fClusterOwner){
 103       if (s.fClusterPointer[i])
 104         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 105     }else{
 106       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 107     }
 108     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 109   }
 110   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 111   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 112   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 113     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 114     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 115     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 116   }
 117   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 118 }
 119
 120
 121 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 122   AliTPCtrack(t),
 123   fEsd(0x0),
 124   fClusterOwner(kFALSE),
 125   fPoints(0x0),
 126   fEPoints(0x0),
 127   fRow(0),
 128   fSector(-1),
 129   fRelativeSector(-1),
 130   fCurrentSigmaY2(1e10),
 131   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 132   fErrorY2(1e10),
 133   fErrorZ2(1e10),
 134   fCurrentCluster(0x0),
 135   fCurrentClusterIndex1(-1),
 136   fInDead(kFALSE),
 137   fIsSeeding(kFALSE),
 138   fNoCluster(0),
 139   fSort(0),
 140   fBSigned(kFALSE),
 141   fSeedType(0),
 142   fSeed1(-1),
 143   fSeed2(-1),
 144   fMAngular(0),
 145   fCircular(0)
 146 {
 147   //
 148   // Constructor from AliTPCtrack
 149   //
 150   fFirstPoint =0;
 151   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 152   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 153     fClusterPointer[i] = 0;
 154     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 155     if (index>=-1){
 156       SetClusterIndex2(i,index);
 157     }
 158     else{
 159       SetClusterIndex2(i,-3);
 160     }
 161   }
 162   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 163     fDEDX[i] = 0.;
 164     fSDEDX[i] = 1e10;
 165     fNCDEDX[i] = 0;
 166   }
 167   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 168 }
 169
 170 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 171                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 172   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 173   fEsd(0x0),
 174   fClusterOwner(kFALSE),
 175   fPoints(0x0),
 176   fEPoints(0x0),
 177   fRow(0),
 178   fSector(-1),
 179   fRelativeSector(-1),
 180   fCurrentSigmaY2(1e10),
 181   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 182   fErrorY2(1e10),
 183   fErrorZ2(1e10),
 184   fCurrentCluster(0x0),
 185   fCurrentClusterIndex1(-1),
 186   fInDead(kFALSE),
 187   fIsSeeding(kFALSE),
 188   fNoCluster(0),
 189   fSort(0),
 190   fBSigned(kFALSE),
 191   fSeedType(0),
 192   fSeed1(-1),
 193   fSeed2(-1),
 194   fMAngular(0),
 195   fCircular(0)
 196 {
 197   //
 198   // Constructor
 199   //
 200   fFirstPoint =0;
 201   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 202   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 203   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 204   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 205     fDEDX[i] = 0.;
 206     fSDEDX[i] = 1e10;
 207     fNCDEDX[i] = 0;
 208   }
 209   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 210 }
 211
 212 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 213   //
 214   // destructor
 215   if (fPoints) delete fPoints;
 216   fPoints =0;
 217   if (fEPoints) delete fEPoints;
 218   fEPoints = 0;
 219   fNoCluster =0;
 220   if (fClusterOwner){
 221     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 222       delete fClusterPointer[icluster];
 223     }
 224   }
 225 }
 226 //_________________________________________________
 227 AliTPCseed & AliTPCseed::operator =(const AliTPCseed & param)
 228 {
 229   //
 230   // assignment operator - dummy
 231   //
 232   fRow=param.fRow;
 233   return (*this);
 234 }
 235 //____________________________________________________
 236 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 237 {
 238   //
 239   //
 240   return &fTrackPoints[i];
 241 }
 242
 243 void AliTPCseed::RebuildSeed()
 244 {
 245   //
 246   // rebuild seed to be ready for storing
 247   AliTPCclusterMI cldummy;
 248   cldummy.SetQ(0);
 249   AliTPCTrackPoint pdummy;
 250   pdummy.GetTPoint().SetShared(10);
 251   for (Int_t i=0;i<160;i++){
 252     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
 253     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);
 254     if (cl0){
 255       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
 256       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
 257       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
 258     }
 259     else{
 260       *trpoint = pdummy;
 261       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
 262     }
 263
 264   }
 265
 266 }
 267
 268
 269 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 270 {
 271   //
 272   //
 273   // return cluster for n rows bellow first point
 274   Int_t nfoundable = 1;
 275   Int_t nfound      = 1;
 276   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 277     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 278     if (index!=-1) nfoundable++;
 279     if (index>0) nfound++;
 280   }
 281   if (nfoundable<n) return 0;
 282   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 283
 284 }
 285
 286
 287 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 288 {
 289   // get cluster stat.  on given region
 290   //
 291   found       = 0;
 292   foundable   = 0;
 293   shared      =0;
 294   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 295     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 296     if (index!=-1) foundable++;
 297     if (fClusterPointer[i]) {
 298       found++;
 299     }
 300     else
 301       continue;
 302
 303     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 304       shared++;
 305       continue;
 306     }
 307     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 308     //
 309     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 310       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 311         shared++;
 312         continue;
 313       }
 314     }
 315     if ( fClusterPointer[i+1]){
 316       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 317         shared++;
 318         continue;
 319       }
 320     }
 321
 322   }
 323   //if (shared>found){
 324     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 325   //}
 326 }
 327
 328
 329
 330
 331
 332 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 333 {
 334   //
 335   //
 336   SetNumberOfClusters(0);
 337   fNFoundable = 0;
 338   SetChi2(0);
 339   ResetCovariance(10.);
 340   /*
 341   if (fTrackPoints){
 342     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 343       delete [] fTrackPoints[i];
 344     }
 345     delete fTrackPoints;
 346     fTrackPoints =0;
 347   }
 348   */
 349
 350   if (all){
 351     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 352     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 353   }
 354
 355 }
 356
 357
 358 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 359 {
 360
 361   //------------------------------------------------------------------
 362   //This function makes a track forget its history :)
 363   //------------------------------------------------------------------
 364   if (factor<=0) {
 365     ResetCovariance(10.);
 366     return;
 367   }
 368   ResetCovariance(factor);
 369
 370   SetNumberOfClusters(0);
 371   fNFoundable =0;
 372   SetChi2(0);
 373   fRemoval = 0;
 374   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 375   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 376   fNoCluster     = 0;
 377   //fFirstPoint = 160;
 378   //fLastPoint  = 0;
 379 }
 380
 381
 382
 383
 384 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 385 {
 386   //-----------------------------------------------------------------
 387   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 388   // doesn't change internal state of the track
 389   //-----------------------------------------------------------------
 390
 391   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 392
 393   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 394     return 0;
 395   }
 396
 397   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 398   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
 399   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 400
 401   y = GetY();
 402   z = GetZ();
 403   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 404   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 405
 406   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 407   Double_t dz = 0;
 408   //
 409   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 410   /*
 411   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 412     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 413   }else{
 414     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 415   }
 416   */
 417   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 418   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 419   //
 420   y+=dy;
 421   z+=dz;
 422
 423
 424   return 1;
 425 }
 426
 427
 428 //_____________________________________________________________________________
 429 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 430 {
 431   //-----------------------------------------------------------------
 432   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 433   //-----------------------------------------------------------------
 434   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 435   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 436   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 437 }
 438
 439 //_________________________________________________________________________________________
 440
 441
 442 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 443   //-----------------------------------------------------------------
 444   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 445   //-----------------------------------------------------------------
 446   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 447
 448   if (fSort == 0){
 449     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 450     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 451     Double_t z2 = t->GetZ();
 452     Double_t z1 = GetZ();
 453     if (z2>z1) return 1;
 454     if (z2<z1) return -1;
 455     return 0;
 456   }
 457   else {
 458     Float_t f2 =1;
 459     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(TMath::Abs(t->Get1Pt())+0.0066);
 460     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 461
 462     Float_t f1 =1;
 463     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(TMath::Abs(Get1Pt())+0.0066);
 464
 465     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 466
 467     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 468     else return +1;
 469   }
 470 }
 471
 472
 473
 474
 475 //_____________________________________________________________________________
 476 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t /*index*/)
 477 {
 478   //-----------------------------------------------------------------
 479   // This function associates a cluster with this track.
 480   //-----------------------------------------------------------------
 481   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 482   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 483
 484   if (!AliExternalTrackParam::Update(p,cov)) return kFALSE;
 485
 486   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 487   //  fIndex[n]=index;
 488   SetNumberOfClusters(n+1);
 489   SetChi2(GetChi2()+chisq);
 490
 491   return kTRUE;
 492 }
 493
 494
 495
 496 //_____________________________________________________________________________
 497 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
 498   //-----------------------------------------------------------------
 499   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 500   //-----------------------------------------------------------------
 501
 502   Float_t amp[200];
 503   Float_t angular[200];
 504   Float_t weight[200];
 505   Int_t index[200];
 506   //Int_t nc = 0;
 507   //  TClonesArray & arr = *fPoints;
 508   Float_t meanlog = 100.;
 509
 510   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 511   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 512   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 513   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 514   //
 515   //
 516   fNShared =0;
 517
 518   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 519     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 520       {
 521         Int_t index = fIndex[i];
 522         if (index<0||index&0x8000) continue;
 523
 524         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 525         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 526         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 527         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 528         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 529
 530         if (point==0) continue;
 531         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 532         if (cl==0) continue;
 533         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 534         if (cl->IsUsed(11)) {
 535           fNShared++;
 536           continue;
 537         }
 538         Int_t   type   = cl->GetType();
 539         //if (point->fIsShared){
 540         //  fNShared++;
 541         //  continue;
 542         //}
 543         //if (pointm)
 544         //  if (pointm->fIsShared) continue;
 545         //if (pointp)
 546         //  if (pointp->fIsShared) continue;
 547
 548         if (type<0) continue;
 549         //if (type>10) continue;
 550         //if (point->GetErrY()==0) continue;
 551         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 552
 553         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 554         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 555         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 556
 557
 558         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 559         if (cl->GetMax()<5) continue;
 560         Float_t angley = point->GetAngleY();
 561         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 562
 563         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 564         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 565         /*
 566         Float_t ns = 1.;
 567         if (pointm){
 568           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 569           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 570           ns+=1.;
 571         }
 572         if (pointp){
 573           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 574           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 575           ns+=1.;
 576         }
 577         rsigmay/=ns;
 578         rsigmaz/=ns;
 579         */
 580
 581         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 582
 583         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 584         if (i>64){
 585           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 586           ampc = 1.*cl->GetMax();
 587           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 588           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 589           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 590           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 591           //Float_t dz =
 592           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 593           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 594           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 595           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 596           //ampc               *=zfactor;
 597         }
 598         else{
 599           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 600           ampc = 1.0*cl->GetMax();
 601           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 602           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 603           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 604           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 605           //Float_t dz =
 606           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 607
 608           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 609           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 610           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 611           //ampc               *=zfactor;
 612
 613         }
 614         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 615         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 616         Float_t w      =  1.;
 617         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 618         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 619         if (i<64) {
 620           ampc /= 0.6;
 621           //ampc /= (1+0.0008*z);
 622         } else
 623           if (i>128){
 624             ampc /=1.5;
 625             //ampc /= (1+0.0008*z);
 626           }else{
 627             //ampc /= (1+0.0008*z);
 628           }
 629
 630         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 631           // w*= 2.;
 632
 633           continue;
 634         }
 635         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 636         amp[nc[of]]        = ampc;
 637         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 638         weight[nc[of]]     = w;
 639         nc[of]++;
 640       }
 641
 642     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 643     Float_t sumamp=0;
 644     Float_t sumamp2=0;
 645     Float_t sumw=0;
 646     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 647     meanlog = 50;
 648     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 649       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 650       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 651       //
 652       sumw    += weight[index[i]];
 653       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 654       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 655       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 656     }
 657     if (sumw<1){
 658       SetdEdx(0);
 659     }
 660     else {
 661       norm[of] /= sumw;
 662       mean[of]  = sumamp/sumw;
 663       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 664       if (sigma[of]>0.1)
 665         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 666       else
 667         sigma[of] = 1000;
 668
 669     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 670     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 671     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 672     }
 673   }
 674
 675   Float_t dedx =0;
 676   fSdEdx =0;
 677   fMAngular =0;
 678   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 679   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 680
 681
 682   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 683   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 684
 685   Int_t norm2 = 0;
 686   Int_t norm3 = 0;
 687   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 688     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 689       dedx      += mean[i] *nc[i];
 690       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 691       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 692       norm2     += nc[i];
 693       norm3     += nc[i]-2;
 694     }
 695     fDEDX[i]  = mean[i];
 696     fSDEDX[i] = sigma[i];
 697     fNCDEDX[i]= nc[i];
 698   }
 699
 700   if (norm3>0){
 701     dedx   /=norm2;
 702     fSdEdx /=norm3;
 703     fMAngular/=norm2;
 704   }
 705   else{
 706     SetdEdx(0);
 707     return 0;
 708   }
 709   //  Float_t dedx1 =dedx;
 710   /*
 711   dedx =0;
 712   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 713     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 714       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 715       dedx      += mean[i] *nc[i];
 716     }
 717     fDEDX[i]  = mean[i];
 718   }
 719   dedx /= norm2;
 720   */
 721
 722
 723   SetdEdx(dedx);
 724   return dedx;
 725 }
 726 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
 727   //
 728   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
 729   //
 730   Double_t bg2=bg*bg;
 731   Double_t bethe;
 732   if (bg<3.5e1)
 733     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
 734   else // Density effect ( approximately :)
 735     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
 736   return bethe/11.091;
 737 }
 738
 739 void AliTPCseed::CookPID()
 740 {
 741   //
 742   // cook PID information according dEdx
 743   //
 744   Double_t fRange = 10.;
 745   Double_t fRes   = 0.1;
 746   Double_t fMIP   = 47.;
 747   //
 748   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 749   Double_t sumr =0;
 750   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 751     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 752     Double_t mom=GetP();
 753     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 754     Double_t bethe=Bethe(mom/mass);
 755     Double_t sigma=fRes*bethe;
 756     if (sigma>0.001){
 757       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 758         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 759         sumr+=fTPCr[j];
 760         continue;
 761       }
 762       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 763       sumr+=fTPCr[j];
 764     }
 765     else{
 766       fTPCr[j]=1.;
 767       sumr+=fTPCr[j];
 768     }
 769   }
 770   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 771     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 772   }
 773 }
 774
 775 /*
 776 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
 777   //-----------------------------------------------------------------
 778   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 779   //-----------------------------------------------------------------
 780
 781   Float_t amp[200];
 782   Float_t angular[200];
 783   Float_t weight[200];
 784   Int_t index[200];
 785   Bool_t inlimit[200];
 786   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
 787   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
 788   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
 789
 790
 791   //
 792   Float_t meanlog = 100.;
 793   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
 794
 795   Float_t amean     =0;
 796   Float_t asigma    =0;
 797   Float_t anc       =0;
 798   Float_t anorm     =0;
 799
 800   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 801   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 802   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 803   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 804   //
 805   //
 806   fNShared =0;
 807
 808   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
 809   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 810   for (Int_t i =0; i<160;i++)
 811     {
 812         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
 813         if (point==0) continue;
 814         if (point->fIsShared){
 815           fNShared++;
 816           continue;
 817         }
 818         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
 819         if (type<0) continue;
 820         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 821         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
 822         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
 823         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
 824         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
 825         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
 826
 827         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 828         if (i>64){
 829           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
 830         }
 831         else{
 832           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
 833         }
 834         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 835         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
 836
 837         Float_t w      =  1.;
 838         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
 839         if (i<64) {
 840           ampc /= 0.63;
 841         } else
 842           if (i>128){
 843             ampc /=1.51;
 844           }
 845         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 846           continue;
 847         }
 848         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 849         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 850         amp[i]        = ampc/angular[i];
 851         weight[i]     = w;
 852         anc++;
 853     }
 854
 855   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
 856   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
 857     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
 858   }
 859
 860   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
 861   meanlog =10000.;
 862   for (Int_t of =0; of<3; of++){
 863     Float_t sumamp=0;
 864     Float_t sumamp2=0;
 865     Float_t sumw=0;
 866    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 867       {
 868         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
 869         Float_t ampl      = amp[i];
 870         ///angular[i];
 871         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 872         //
 873         sumw    += weight[i];
 874         sumamp  += weight[i]*ampl;
 875         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
 876         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
 877         nc[of]++;
 878       }
 879    if (sumw<1){
 880      SetdEdx(0);
 881    }
 882    else {
 883      norm[of] /= sumw;
 884      mean[of]  = sumamp/sumw;
 885      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 886      if (sigma[of]>0.1)
 887        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 888      else
 889        sigma[of] = 1000;
 890      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 891    }
 892   }
 893
 894   Float_t dedx =0;
 895   fSdEdx =0;
 896   fMAngular =0;
 897   //
 898   Int_t norm2 = 0;
 899   Int_t norm3 = 0;
 900   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
 901   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
 902
 903   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 904     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 905       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
 906       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 907       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 908       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
 909       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 910     }
 911     fDEDX[i]  = mean[i];
 912     fSDEDX[i] = sigma[i];
 913     fNCDEDX[i]= nc[i];
 914   }
 915
 916   if (norm3>0){
 917     dedx   /=norm2;
 918     fSdEdx /=norm3;
 919     fMAngular/=norm2;
 920   }
 921   else{
 922     SetdEdx(0);
 923     return;
 924   }
 925   //  Float_t dedx1 =dedx;
 926
 927   dedx =0;
 928   Float_t norm4 = 0;
 929   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 930     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
 931       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 932       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
 933       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
 934     }
 935     fDEDX[i]  = mean[i];
 936   }
 937   if (norm4>0) dedx /= norm4;
 938
 939
 940
 941   SetdEdx(dedx);
 942
 943   //mi deDX
 944
 945 }
 946 */
 947 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
 948 //-----------------------------------------------------------------
 949 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
 950 //-----------------------------------------------------------------
 951   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
 952     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
 953     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
 954     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
 955     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
 956     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
 957 }
 958