TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //
  21 //           Implementation of the TPC seed class
  22 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  23 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  24 //-----------------------------------------------------------------
  25 #include "TClonesArray.h"
  26 #include "TGraphErrors.h"
  27 #include "AliTPCseed.h"
  28 #include "AliTPCReconstructor.h"
  29 #include "AliTPCClusterParam.h"
  30 #include "AliTPCCalPad.h"
  31 #include "AliTPCCalROC.h"
  32 #include "AliTPCcalibDB.h"
  33 #include "AliTPCParam.h"
  34 #include "AliMathBase.h"
  35 #include "AliTPCTransform.h"
  36 #include "AliSplineFit.h"
  37 #include "AliCDBManager.h"
  38 #include "AliTPCcalibDButil.h"
  39
  40
  41 ClassImp(AliTPCseed)
  42
  43
  44
  45 AliTPCseed::AliTPCseed():
  46   AliTPCtrack(),
  47   fEsd(0x0),
  48   fClusterOwner(kFALSE),
  49   fRow(0),
  50   fSector(-1),
  51   fRelativeSector(-1),
  52   fCurrentSigmaY2(1e10),
  53   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  54   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
  55   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
  56   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
  57   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
  58   //
  59   fErrorY2(1e10),
  60   fErrorZ2(1e10),
  61   fCurrentCluster(0x0),
  62   fCurrentClusterIndex1(-1),
  63   fInDead(kFALSE),
  64   fIsSeeding(kFALSE),
  65   fNoCluster(0),
  66   fSort(0),
  67   fBSigned(kFALSE),
  68   fSeedType(0),
  69   fSeed1(-1),
  70   fSeed2(-1),
  71   fMAngular(0),
  72   fCircular(0),
  73   fPoolID(-1)
  74 {
  75   //
  76   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  77   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  78   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  79   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  80   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  81     fDEDX[i] = 0.;
  82     fSDEDX[i] = 1e10;
  83     fNCDEDX[i] = 0;
  84     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
  85   }
  86   fDEDX[4] = 0;
  87   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  88 }
  89
  90 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  91   AliTPCtrack(s),
  92   fEsd(0x0),
  93   fClusterOwner(clusterOwner),
  94   fRow(0),
  95   fSector(-1),
  96   fRelativeSector(-1),
  97   fCurrentSigmaY2(-1),
  98   fCurrentSigmaZ2(-1),
  99   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 100   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 101   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 102   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 103   fErrorY2(1e10),
 104   fErrorZ2(1e10),
 105   fCurrentCluster(0x0),
 106   fCurrentClusterIndex1(-1),
 107   fInDead(kFALSE),
 108   fIsSeeding(kFALSE),
 109   fNoCluster(0),
 110   fSort(0),
 111   fBSigned(kFALSE),
 112   fSeedType(0),
 113   fSeed1(-1),
 114   fSeed2(-1),
 115   fMAngular(0),
 116   fCircular(0),
 117   fPoolID(-1)
 118 {
 119   //---------------------
 120   // dummy copy constructor
 121   //-------------------------
 122   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 123     fClusterPointer[i]=0;
 124     if (fClusterOwner){
 125       if (s.fClusterPointer[i])
 126         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 127     }else{
 128       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 129     }
 130     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 131   }
 132   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 133   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 134   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 135     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 136     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 137     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 138     fNCDEDXInclThres[i] = s.fNCDEDXInclThres[i];
 139   }
 140   fDEDX[4] = s.fDEDX[4];
 141   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 142
 143 }
 144
 145
 146 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 147   AliTPCtrack(t),
 148   fEsd(0x0),
 149   fClusterOwner(kFALSE),
 150   fRow(0),
 151   fSector(-1),
 152   fRelativeSector(-1),
 153   fCurrentSigmaY2(-1),
 154   fCurrentSigmaZ2(-1),
 155   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 156   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 157   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 158   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 159   fErrorY2(1e10),
 160   fErrorZ2(1e10),
 161   fCurrentCluster(0x0),
 162   fCurrentClusterIndex1(-1),
 163   fInDead(kFALSE),
 164   fIsSeeding(kFALSE),
 165   fNoCluster(0),
 166   fSort(0),
 167   fBSigned(kFALSE),
 168   fSeedType(0),
 169   fSeed1(-1),
 170   fSeed2(-1),
 171   fMAngular(0),
 172   fCircular(0),
 173   fPoolID(-1)
 174 {
 175   //
 176   // Constructor from AliTPCtrack
 177   //
 178   fFirstPoint =0;
 179   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 180   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 181     fClusterPointer[i] = 0;
 182     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 183     if (index>=-1){
 184       SetClusterIndex2(i,index);
 185     }
 186     else{
 187       SetClusterIndex2(i,-3);
 188     }
 189   }
 190   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 191     fDEDX[i] = 0.;
 192     fSDEDX[i] = 1e10;
 193     fNCDEDX[i] = 0;
 194     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
 195   }
 196     fDEDX[4] = 0;
 197   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 198 }
 199
 200 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 201                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 202   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 203   fEsd(0x0),
 204   fClusterOwner(kFALSE),
 205   fRow(0),
 206   fSector(-1),
 207   fRelativeSector(-1),
 208   fCurrentSigmaY2(-1),
 209   fCurrentSigmaZ2(-1),
 210   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 211   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 212   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 213   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 214   fErrorY2(1e10),
 215   fErrorZ2(1e10),
 216   fCurrentCluster(0x0),
 217   fCurrentClusterIndex1(-1),
 218   fInDead(kFALSE),
 219   fIsSeeding(kFALSE),
 220   fNoCluster(0),
 221   fSort(0),
 222   fBSigned(kFALSE),
 223   fSeedType(0),
 224   fSeed1(-1),
 225   fSeed2(-1),
 226   fMAngular(0),
 227   fCircular(0),
 228   fPoolID(-1)
 229 {
 230   //
 231   // Constructor
 232   //
 233   fFirstPoint =0;
 234   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 235   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 236   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 237   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 238     fDEDX[i] = 0.;
 239     fSDEDX[i] = 1e10;
 240     fNCDEDX[i] = 0;
 241     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
 242   }
 243     fDEDX[4] = 0;
 244   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 245 }
 246
 247 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 248   //
 249   // destructor
 250   fNoCluster =0;
 251   if (fClusterOwner){
 252     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 253       delete fClusterPointer[icluster];
 254     }
 255   }
 256
 257 }
 258 //_________________________________________________
 259 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
 260 {
 261   //
 262   // assignment operator
 263   // don't touch pool ID
 264   //
 265   if(this!=&param){
 266     AliTPCtrack::operator=(param);
 267     fEsd =param.fEsd;
 268     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
 269     if (!fClusterOwner) for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i];
 270     else                for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(param.fClusterPointer[i]));
 271     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
 272     // but deleted in the dtor... strange...
 273     fRow            = param.fRow;
 274     fSector         = param.fSector;
 275     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
 276     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
 277     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
 278     fErrorY2        = param.fErrorY2;
 279     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
 280     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
 281     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1;
 282     fInDead         = param.fInDead;
 283     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
 284     fNoCluster      = param.fNoCluster;
 285     fSort           = param.fSort;
 286     fBSigned        = param.fBSigned;
 287     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
 288       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
 289       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
 290       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
 291       fNCDEDXInclThres[i] = param.fNCDEDXInclThres[i];
 292     }
 293       fDEDX[4]   = param.fDEDX[4];
 294     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
 295
 296     fSeedType = param.fSeedType;
 297     fSeed1    = param.fSeed1;
 298     fSeed2    = param.fSeed2;
 299     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
 300     fMAngular = param.fMAngular;
 301     fCircular = param.fCircular;
 302     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
 303   }
 304   return (*this);
 305 }
 306 //____________________________________________________
 307 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 308 {
 309   //
 310   //
 311   return &fTrackPoints[i];
 312 }
 313
 314
 315
 316 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 317 {
 318   //
 319   //
 320   // return cluster for n rows bellow first point
 321   Int_t nfoundable = 1;
 322   Int_t nfound      = 1;
 323   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 324     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 325     if (index!=-1) nfoundable++;
 326     if (index>0) nfound++;
 327   }
 328   if (nfoundable<n) return 0;
 329   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 330
 331 }
 332
 333
 334 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 335 {
 336   // get cluster stat.  on given region
 337   //
 338   found       = 0;
 339   foundable   = 0;
 340   shared      =0;
 341   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 342     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 343     if (index!=-1) foundable++;
 344     if (index&0x8000) continue;
 345     if (fClusterPointer[i]) {
 346       found++;
 347     }
 348     else
 349       continue;
 350
 351     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 352       shared++;
 353       continue;
 354     }
 355     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 356     //
 357     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 358       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 359         shared++;
 360         continue;
 361       }
 362     }
 363     if ( fClusterPointer[i+1]){
 364       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 365         shared++;
 366         continue;
 367       }
 368     }
 369
 370   }
 371   //if (shared>found){
 372     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 373   //}
 374 }
 375
 376
 377
 378
 379
 380 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 381 {
 382   //
 383   //
 384   SetNumberOfClusters(0);
 385   fNFoundable = 0;
 386   SetChi2(0);
 387   ResetCovariance(10.);
 388   /*
 389   if (fTrackPoints){
 390     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 391       delete [] fTrackPoints[i];
 392     }
 393     delete fTrackPoints;
 394     fTrackPoints =0;
 395   }
 396   */
 397
 398   if (all){
 399     for (Int_t i=200;i--;) SetClusterIndex2(i,-3);
 400     if (!fClusterOwner) for (Int_t i=160;i--;) fClusterPointer[i]=0;
 401     else                for (Int_t i=160;i--;) {delete fClusterPointer[i]; fClusterPointer[i]=0;}
 402   }
 403
 404 }
 405
 406
 407 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 408 {
 409
 410   //------------------------------------------------------------------
 411   //This function makes a track forget its history :)
 412   //------------------------------------------------------------------
 413   if (factor<=0) {
 414     ResetCovariance(10.);
 415     return;
 416   }
 417   ResetCovariance(factor);
 418
 419   SetNumberOfClusters(0);
 420   fNFoundable =0;
 421   SetChi2(0);
 422   fRemoval = 0;
 423   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 424   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 425   fNoCluster     = 0;
 426   //fFirstPoint = 160;
 427   //fLastPoint  = 0;
 428 }
 429
 430
 431
 432
 433 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 434 {
 435   //-----------------------------------------------------------------
 436   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 437   // doesn't change internal state of the track
 438   //-----------------------------------------------------------------
 439
 440   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 441
 442   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 443     return 0;
 444   }
 445
 446   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 447   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
 448   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
 449
 450   y = GetY();
 451   z = GetZ();
 452   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 453   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 454
 455   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 456   Double_t dz = 0;
 457   //
 458   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 459   /*
 460   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 461     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 462   }else{
 463     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 464   }
 465   */
 466   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 467   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 468   //
 469   y+=dy;
 470   z+=dz;
 471
 472
 473   return 1;
 474 }
 475
 476
 477 //_____________________________________________________________________________
 478 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 479 {
 480   //-----------------------------------------------------------------
 481   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 482   //-----------------------------------------------------------------
 483   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 484   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 485
 486   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
 487   if (TMath::Abs(dx)>0){
 488     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
 489     Float_t dy = dx*ty;
 490     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
 491     p[0] = c->GetY()-dy;
 492     p[1] = c->GetZ()-dz;
 493   }
 494   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 495 }
 496
 497 //_________________________________________________________________________________________
 498
 499
 500 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 501   //-----------------------------------------------------------------
 502   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 503   //-----------------------------------------------------------------
 504   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 505
 506   if (fSort == 0){
 507     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 508     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 509     Double_t z2 = t->GetZ();
 510     Double_t z1 = GetZ();
 511     if (z2>z1) return 1;
 512     if (z2<z1) return -1;
 513     return 0;
 514   }
 515   else {
 516     Float_t f2 =1;
 517     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
 518     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 519
 520     Float_t f1 =1;
 521     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
 522
 523     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 524
 525     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 526     else return +1;
 527   }
 528 }
 529
 530
 531
 532
 533 //_____________________________________________________________________________
 534 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t index)
 535 {
 536   //-----------------------------------------------------------------
 537   // This function associates a cluster with this track.
 538   //-----------------------------------------------------------------
 539   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 540   Int_t idx=GetClusterIndex(n);    // save the current cluster index
 541
 542   AliCluster cl(*c);  cl.SetSigmaY2(fErrorY2); cl.SetSigmaZ2(fErrorZ2);
 543   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
 544   if (TMath::Abs(dx)>0){
 545     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
 546     Float_t dy = dx*ty;
 547     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
 548     cl.SetY(c->GetY()-dy);
 549     cl.SetZ(c->GetZ()-dz);
 550   }
 551
 552   if (!AliTPCtrack::Update(&cl,chisq,index)) return kFALSE;
 553
 554   if (fCMeanSigmaY2p30<0){
 555     fCMeanSigmaY2p30= c->GetSigmaY2();   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 556     fCMeanSigmaZ2p30= c->GetSigmaZ2();   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 557     fCMeanSigmaY2p30R = 1;   //! current mean sigma Y2 - mean5%
 558     fCMeanSigmaZ2p30R = 1;   //! current mean sigma Z2 - mean5%
 559   }
 560   //
 561   fCMeanSigmaY2p30= 0.70*fCMeanSigmaY2p30 +0.30*c->GetSigmaY2();
 562   fCMeanSigmaZ2p30= 0.70*fCMeanSigmaZ2p30 +0.30*c->GetSigmaZ2();
 563   if (fCurrentSigmaY2>0){
 564     fCMeanSigmaY2p30R = 0.7*fCMeanSigmaY2p30R  +0.3*c->GetSigmaY2()/fCurrentSigmaY2;
 565     fCMeanSigmaZ2p30R = 0.7*fCMeanSigmaZ2p30R  +0.3*c->GetSigmaZ2()/fCurrentSigmaZ2;
 566   }
 567
 568
 569   SetClusterIndex(n,idx);          // restore the current cluster index
 570   return kTRUE;
 571 }
 572
 573
 574
 575 //_____________________________________________________________________________
 576 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t /* onlyused */) {
 577   //-----------------------------------------------------------------
 578   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 579   //-----------------------------------------------------------------
 580   // CookdEdxAnalytical(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Int_t returnVal)
 581   AliTPCParam *param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
 582
 583   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
 584   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
 585   Int_t row2 = row1+param->GetNRowUp2();
 586   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
 587   Int_t useTot = 0;
 588   if (recoParam) useTot = (recoParam->GetUseTotCharge())? 0:1;
 589   //
 590   //
 591   //
 592   fDEDX[0]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,i1  ,i2,   0);
 593   fDEDX[1]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,0   ,row0, 0);
 594   fDEDX[2]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row1, 0);
 595   fDEDX[3]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row1,row2, 0);
 596   fDEDX[4]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row2, 0); // full OROC truncated mean
 597   //
 598   fSDEDX[0]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,i1  ,i2,   1);
 599   fSDEDX[1]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,0   ,row0, 1);
 600   fSDEDX[2]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row1, 1);
 601   fSDEDX[3]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row1,row2, 1);
 602   //
 603   fNCDEDX[0]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, i1  , i2));
 604   fNCDEDX[1]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, 0   , row0));
 605   fNCDEDX[2]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, row0, row1));
 606   fNCDEDX[3]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, row1, row2));
 607   //
 608   fNCDEDXInclThres[0]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, i1  , i2));
 609   fNCDEDXInclThres[1]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, 0   , row0));
 610   fNCDEDXInclThres[2]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, row0, row1));
 611   fNCDEDXInclThres[3]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, row1, row2));
 612   //
 613   SetdEdx(fDEDX[0]);
 614   return fDEDX[0];
 615
 616 //  return CookdEdxNorm(low,up,0,i1,i2,1,0,2);
 617
 618
 619 //   Float_t amp[200];
 620 //   Float_t angular[200];
 621 //   Float_t weight[200];
 622 //   Int_t index[200];
 623 //   //Int_t nc = 0;
 624 //   Float_t meanlog = 100.;
 625
 626 //   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 627 //   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 628 //   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 629 //   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 630 //   //
 631 //   //
 632 //   fNShared =0;
 633
 634 //   Float_t gainGG = 1;
 635 //   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
 636 //     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000.;  //relative gas gain
 637 //   }
 638
 639
 640 //   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 641 //     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 642 //       {
 643 //      Int_t clindex = fIndex[i];
 644 //      if (clindex<0||clindex&0x8000) continue;
 645
 646 //      //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 647 //      AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 648 //      //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 649 //      //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 650 //      //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 651
 652 //      if (point==0) continue;
 653 //      AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 654 //      if (cl==0) continue;
 655 //      if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 656 //      if (cl->IsUsed(11)) {
 657 //        fNShared++;
 658 //        continue;
 659 //      }
 660 //      Int_t   type   = cl->GetType();
 661 //      //if (point->fIsShared){
 662 //      //  fNShared++;
 663 //      //  continue;
 664 //      //}
 665 //      //if (pointm)
 666 //      //  if (pointm->fIsShared) continue;
 667 //      //if (pointp)
 668 //      //  if (pointp->fIsShared) continue;
 669
 670 //      if (type<0) continue;
 671 //      //if (type>10) continue;
 672 //      //if (point->GetErrY()==0) continue;
 673 //      //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 674
 675 //      //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 676 //      //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 677 //      //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 678
 679
 680 //      //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 681 //      if (cl->GetMax()<5) continue;
 682 //      Float_t angley = point->GetAngleY();
 683 //      Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 684
 685 //      Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 686 //      Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 687 //      /*
 688 //      Float_t ns = 1.;
 689 //      if (pointm){
 690 //        rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 691 //        rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 692 //        ns+=1.;
 693 //      }
 694 //      if (pointp){
 695 //        rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 696 //        rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 697 //        ns+=1.;
 698 //      }
 699 //      rsigmay/=ns;
 700 //      rsigmaz/=ns;
 701 //      */
 702
 703 //      Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 704
 705 //      Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 706 //      if (i>64){
 707 //        //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 708 //        ampc = 1.*cl->GetMax();
 709 //        //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 710 //        //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 711 //        //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 712 //        // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 713 //        //Float_t dz =
 714 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 715 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 716 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 717 //        //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 718 //        //ampc               *=zfactor;
 719 //      }
 720 //      else{
 721 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 722 //        ampc = 1.0*cl->GetMax();
 723 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 724 //        //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 725 //        // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 726 //        //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 727 //        //Float_t dz =
 728 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 729
 730 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 731 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 732 //        //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 733 //        //ampc               *=zfactor;
 734
 735 //      }
 736 //      ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 737 //      //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 738 //      Float_t w      =  1.;
 739 //      //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 740 //      //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 741 //      if (i<64) {
 742 //        ampc /= 0.6;
 743 //        //ampc /= (1+0.0008*z);
 744 //      } else
 745 //        if (i>128){
 746 //          ampc /=1.5;
 747 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
 748 //        }else{
 749 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
 750 //        }
 751
 752 //      if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 753 //        // w*= 2.;
 754
 755 //        continue;
 756 //      }
 757 //      if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 758 //      amp[nc[of]]        = ampc;
 759 //      amp[nc[of]]       /=gainGG;
 760 //      angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 761 //      weight[nc[of]]     = w;
 762 //      nc[of]++;
 763 //       }
 764
 765 //     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 766 //     Float_t sumamp=0;
 767 //     Float_t sumamp2=0;
 768 //     Float_t sumw=0;
 769 //     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 770 //     meanlog = 50;
 771 //     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 772 //       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 773 //       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 774 //       //
 775 //       sumw    += weight[index[i]];
 776 //       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 777 //       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 778 //       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 779 //     }
 780 //     if (sumw<1){
 781 //       SetdEdx(0);
 782 //     }
 783 //     else {
 784 //       norm[of] /= sumw;
 785 //       mean[of]  = sumamp/sumw;
 786 //       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 787 //       if (sigma[of]>0.1)
 788 //      sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 789 //       else
 790 //      sigma[of] = 1000;
 791
 792 //     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 793 //     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 794 //     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 795 //     }
 796 //   }
 797
 798 //   Float_t dedx =0;
 799 //   fSdEdx =0;
 800 //   fMAngular =0;
 801 //   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 802 //   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 803
 804
 805 //   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 806 //   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 807
 808 //   Int_t norm2 = 0;
 809 //   Int_t norm3 = 0;
 810 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 811 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 812 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
 813 //       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 814 //       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 815 //       norm2     += nc[i];
 816 //       norm3     += nc[i]-2;
 817 //     }
 818 //     fDEDX[i]  = mean[i];
 819 //     fSDEDX[i] = sigma[i];
 820 //     fNCDEDX[i]= nc[i];
 821 //   }
 822
 823 //   if (norm3>0){
 824 //     dedx   /=norm2;
 825 //     fSdEdx /=norm3;
 826 //     fMAngular/=norm2;
 827 //   }
 828 //   else{
 829 //     SetdEdx(0);
 830 //     return 0;
 831 //   }
 832 //   //  Float_t dedx1 =dedx;
 833 //   /*
 834 //   dedx =0;
 835 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 836 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 837 //       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 838 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
 839 //     }
 840 //     fDEDX[i]  = mean[i];
 841 //   }
 842 //   dedx /= norm2;
 843 //   */
 844
 845
 846 //   SetdEdx(dedx);
 847 //   return dedx;
 848 }
 849
 850 void AliTPCseed::CookPID()
 851 {
 852   //
 853   // cook PID information according dEdx
 854   //
 855   Double_t fRange = 10.;
 856   Double_t fRes   = 0.1;
 857   Double_t fMIP   = 47.;
 858   //
 859   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 860   Double_t sumr =0;
 861   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 862     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 863     Double_t mom=GetP();
 864     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 865     Double_t bethe=AliMathBase::BetheBlochAleph(mom/mass);
 866     Double_t sigma=fRes*bethe;
 867     if (sigma>0.001){
 868       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 869         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 870         sumr+=fTPCr[j];
 871         continue;
 872       }
 873       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 874       sumr+=fTPCr[j];
 875     }
 876     else{
 877       fTPCr[j]=1.;
 878       sumr+=fTPCr[j];
 879     }
 880   }
 881   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 882     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 883   }
 884 }
 885
 886 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
 887 //-----------------------------------------------------------------
 888 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
 889 //-----------------------------------------------------------------
 890   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
 891     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
 892     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
 893     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
 894     Double_t r2=TMath::Sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
 895     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
 896 }
 897
 898
 899
 900 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Bool_t shapeNorm,Int_t posNorm, Int_t padNorm, Int_t returnVal){
 901
 902   //
 903   // calculates dedx using the cluster
 904   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
 905   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster
 906   //           //2- max no corr 3- total+ correction
 907   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
 908   // shapeNorm - kTRUE  -taken from OCDB
 909   //
 910   // posNorm   - usage of pos normalization
 911   // padNorm   - pad type normalization
 912   // returnVal - 0 return mean
 913   //           - 1 return RMS
 914   //           - 2 return number of clusters
 915   //
 916   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
 917   //
 918   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
 919   AliTPCParam * param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
 920   if (!parcl)  return 0;
 921   if (!param) return 0;
 922   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
 923   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
 924
 925   Float_t amp[160];
 926   Int_t   indexes[160];
 927   Int_t   ncl=0;
 928   //
 929   //
 930   Float_t gainGG      = 1;  // gas gain factor -always enabled
 931   Float_t gainPad     = 1;  // gain map  - used always
 932   Float_t corrShape   = 1;  // correction due angular effect, diffusion and electron attachment
 933   Float_t corrPos     = 1;  // local position correction - if posNorm enabled
 934   Float_t corrPadType = 1;  // pad type correction - if padNorm enabled
 935   Float_t corrNorm    = 1;  // normalization factor - set Q to channel 50
 936   //
 937   //
 938   //
 939   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
 940     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000;  //relative gas gain
 941   }
 942
 943   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
 944   const Float_t kedgey =3.;
 945   //
 946   //
 947   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
 948     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
 949     if (!cluster) continue;
 950     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
 951     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
 952     Int_t  ipad= 0;
 953     if (irow>=row0) ipad=1;
 954     if (irow>=row1) ipad=2;
 955     //
 956     //
 957     //
 958     AliTPCCalPad * gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
 959     if (gainMap) {
 960       //
 961       // Get gainPad - pad by pad calibration
 962       //
 963       Float_t factor = 1;
 964       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
 965       if (irow < row0) { // IROC
 966         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
 967       } else {         // OROC
 968         factor = roc->GetValue(irow - row0, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
 969       }
 970       if (factor>0.5) gainPad=factor;
 971     }
 972     //
 973     //do position and angular normalization
 974     //
 975     if (shapeNorm){
 976       if (type<=1){
 977         //
 978         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
 979         Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
 980         Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
 981
 982         Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
 983         corrShape  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
 984       }
 985     }
 986
 987     if (posNorm>0){
 988       //
 989       // Do position normalization - relative distance to
 990       // center of pad- time bin
 991       // Work in progress
 992       //      corrPos = parcl->QnormPos(ipad,type, cluster->GetPad(),
 993       //                                cluster->GetTimeBin(), cluster->GetZ(),
 994       //                                cluster->GetSigmaY2(),cluster->GetSigmaZ2(),
 995       //                                cluster->GetMax(),cluster->GetQ());
 996       // scaled response function
 997       Float_t yres0 = parcl->GetRMS0(0,ipad,0,0)/param->GetPadPitchWidth(cluster->GetDetector());
 998       Float_t zres0 = parcl->GetRMS0(1,ipad,0,0)/param->GetZWidth();
 999       //
1000
1001       AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1002       Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1003       Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
1004
1005       if (type==1) corrPos =
1006         parcl->QmaxCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1007                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,0.4);
1008       if (type==0) corrPos =
1009         parcl->QtotCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1010                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,cluster->GetQ(),2.5,0.4);
1011       if (posNorm==3){
1012         Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1013         Double_t signtgl = (cluster->GetZ()*point->GetAngleZ()>0)? 1:-1;
1014         Double_t p2 = TMath::Abs(TMath::Sin(TMath::ATan(ty)));
1015         Float_t corrHis = parcl->QnormHis(ipad,type,dr,p2,TMath::Abs(point->GetAngleZ())*signtgl);
1016         if (corrHis>0) corrPos*=corrHis;
1017       }
1018
1019     }
1020
1021     if (padNorm==1){
1022       //taken from OCDB
1023       if (type==0 && parcl->QpadTnorm()) corrPadType = (*parcl->QpadTnorm())[ipad];
1024       if (type==1 && parcl->QpadMnorm()) corrPadType = (*parcl->QpadMnorm())[ipad];
1025
1026     }
1027     if (padNorm==2){
1028       corrPadType  =param->GetPadPitchLength(cluster->GetDetector(),cluster->GetRow());
1029       //use hardwired - temp fix
1030       if (type==0) corrNorm=3.;
1031       if (type==1) corrNorm=1.;
1032     }
1033     //
1034     amp[ncl]=charge;
1035     amp[ncl]/=gainGG;
1036     amp[ncl]/=gainPad;
1037     amp[ncl]/=corrShape;
1038     amp[ncl]/=corrPadType;
1039     amp[ncl]/=corrPos;
1040     amp[ncl]/=corrNorm;
1041     //
1042     ncl++;
1043   }
1044
1045   if (type>3) return ncl;
1046   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1047
1048   if (ncl<10) return 0;
1049
1050   Float_t suma=0;
1051   Float_t suma2=0;
1052   Float_t sumn=0;
1053   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1054   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1055   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1056     suma+=amp[indexes[icl]];
1057     suma2+=amp[indexes[icl]]*amp[indexes[icl]];
1058     sumn++;
1059   }
1060   Float_t mean =suma/sumn;
1061   Float_t rms  =TMath::Sqrt(TMath::Abs(suma2/sumn-mean*mean));
1062   //
1063   // do time-dependent correction for pressure and temperature variations
1064   UInt_t runNumber = 1;
1065   Float_t corrTimeGain = 1;
1066   AliTPCTransform * trans = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform();
1067   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
1068   if (trans && recoParam->GetUseGainCorrectionTime()>0) {
1069     runNumber = trans->GetCurrentRunNumber();
1070     //AliTPCcalibDB::Instance()->SetRun(runNumber);
1071     TObjArray * timeGainSplines = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTimeGainSplinesRun(runNumber);
1072     if (timeGainSplines) {
1073       UInt_t time = trans->GetCurrentTimeStamp();
1074       AliSplineFit * fitMIP = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(0);
1075       AliSplineFit * fitFPcosmic = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(1);
1076       if (fitMIP) {
1077         corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitMIP, time);/*fitMIP->Eval(time);*/
1078       } else {
1079         if (fitFPcosmic) corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitFPcosmic, time);/*fitFPcosmic->Eval(time);*/
1080       }
1081     }
1082   }
1083   mean /= corrTimeGain;
1084   rms /= corrTimeGain;
1085   //
1086   if (returnVal==1) return rms;
1087   if (returnVal==2) return ncl;
1088   return mean;
1089 }
1090
1091 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxAnalytical(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Int_t returnVal, Int_t rowThres, Int_t mode){
1092
1093   //
1094   // calculates dedx using the cluster
1095   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
1096   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster
1097   //           //2- max no corr 3- total+ correction
1098   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
1099   //
1100   // posNorm   - usage of pos normalization
1101   // returnVal - 0  return mean
1102   //           - 1  return RMS
1103   //           - 2  return number of clusters
1104   //           - 3  ratio
1105   //           - 4  mean upper half
1106   //           - 5  mean  - lower half
1107   //           - 6  third moment
1108   // mode      - 0 - linear
1109   //           - 1 - logatithmic
1110   // rowThres  - number of rows before and after given pad row to check for clusters below threshold
1111   //
1112   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
1113   //
1114   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1115   AliTPCParam * param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
1116   if (!parcl)  return 0;
1117   if (!param) return 0;
1118   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
1119   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
1120
1121   Float_t amp[160];
1122   Int_t   indexes[160];
1123   Int_t   ncl=0;
1124   Int_t   nclBelowThr = 0; // counts number of clusters below threshold
1125   //
1126   //
1127   Float_t gainGG      = 1;  // gas gain factor -always enabled
1128   Float_t gainPad     = 1;  // gain map  - used always
1129   Float_t corrPos     = 1;  // local position correction - if posNorm enabled
1130   //
1131   //
1132   //
1133   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
1134     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000;  //relative gas gain
1135   }
1136   //
1137   // extract time-dependent correction for pressure and temperature variations
1138   //
1139   UInt_t runNumber = 1;
1140   Float_t corrTimeGain = 1;
1141   TObjArray * timeGainSplines = 0x0;
1142   TGraphErrors * grPadEqual = 0x0;
1143   //
1144   AliTPCTransform * trans = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform();
1145   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
1146   //
1147   if (recoParam->GetNeighborRowsDedx() == 0) rowThres = 0;
1148   //
1149   if (trans) {
1150       runNumber = trans->GetCurrentRunNumber();
1151       //AliTPCcalibDB::Instance()->SetRun(runNumber);
1152       timeGainSplines = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTimeGainSplinesRun(runNumber);
1153       if (timeGainSplines && recoParam->GetUseGainCorrectionTime()>0) {
1154         UInt_t time = trans->GetCurrentTimeStamp();
1155         AliSplineFit * fitMIP = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(0);
1156         AliSplineFit * fitFPcosmic = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(1);
1157         if (fitMIP) {
1158           corrTimeGain =  AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitMIP, time); /*fitMIP->Eval(time);*/
1159         } else {
1160           if (fitFPcosmic) corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitFPcosmic, time); /*fitFPcosmic->Eval(time); */
1161         }
1162         //
1163         if (type==1) grPadEqual = (TGraphErrors * ) timeGainSplines->FindObject("TGRAPHERRORS_MEANQMAX_PADREGIONGAIN_BEAM_ALL");
1164         if (type==0) grPadEqual = (TGraphErrors * ) timeGainSplines->FindObject("TGRAPHERRORS_MEANQTOT_PADREGIONGAIN_BEAM_ALL");
1165       }
1166   }
1167
1168   const Float_t kClusterShapeCut = 1.5; // IMPPRTANT TO DO: move value to AliTPCRecoParam
1169   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1170   const Float_t kedgey =3.;
1171   //
1172   //
1173   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
1174     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1175     if (!cluster && irow > 1 && irow < 157) {
1176       Bool_t isClBefore = kFALSE;
1177       Bool_t isClAfter  = kFALSE;
1178       for(Int_t ithres = 1; ithres <= rowThres; ithres++) {
1179         AliTPCclusterMI * clusterBefore = GetClusterPointer(irow - ithres);
1180         if (clusterBefore) isClBefore = kTRUE;
1181         AliTPCclusterMI * clusterAfter  = GetClusterPointer(irow + ithres);
1182         if (clusterAfter) isClAfter = kTRUE;
1183       }
1184       if (isClBefore && isClAfter) nclBelowThr++;
1185     }
1186     if (!cluster) continue;
1187     //
1188     //
1189     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1190     //
1191     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1192     if (point==0) continue;
1193     Float_t rsigmay = TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1194     if (rsigmay > kClusterShapeCut) continue;
1195     //
1196     if (cluster->IsUsed(11)) continue; // remove shared clusters for PbPb
1197     //
1198     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
1199     Int_t  ipad= 0;
1200     if (irow>=row0) ipad=1;
1201     if (irow>=row1) ipad=2;
1202     //
1203     //
1204     //
1205     AliTPCCalPad * gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
1206     if (gainMap) {
1207       //
1208       // Get gainPad - pad by pad calibration
1209       //
1210       Float_t factor = 1;
1211       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
1212       if (irow < row0) { // IROC
1213         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1214       } else {         // OROC
1215         factor = roc->GetValue(irow - row0, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1216       }
1217       if (factor>0.3) gainPad=factor;
1218     }
1219     //
1220     // Do position normalization - relative distance to
1221     // center of pad- time bin
1222
1223     Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1224     Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
1225     Float_t yres0 = parcl->GetRMS0(0,ipad,0,0)/param->GetPadPitchWidth(cluster->GetDetector());
1226     Float_t zres0 = parcl->GetRMS0(1,ipad,0,0)/param->GetZWidth();
1227
1228     yres0 *=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,0);
1229     zres0 *=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,1);
1230     Float_t effLength=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,4)*0.5;
1231     Float_t effDiff  =(parcl->GetQnormCorr(ipad, type,2)+parcl->GetQnormCorr(ipad, type,3))*0.5;
1232     //
1233     if (type==1) {
1234       corrPos = parcl->GetQnormCorr(ipad, type,5)*
1235         parcl->QmaxCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1236                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,effLength,effDiff);
1237       Float_t drm   = 0.5-TMath::Abs(cluster->GetZ()/250.);
1238       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,0)*drm);
1239       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,1)*ty*ty);
1240       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,2)*tz*tz);
1241       //
1242     }
1243     if (type==0) {
1244       corrPos = parcl->GetQnormCorr(ipad, type,5)*
1245         parcl->QtotCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1246                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,cluster->GetQ(),2.5,effLength,effDiff);
1247
1248       Float_t drm   = 0.5-TMath::Abs(cluster->GetZ()/250.);
1249       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,0)*drm);
1250       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,1)*ty*ty);
1251       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,2)*tz*tz);
1252       //
1253     }
1254     //
1255     // pad region equalization outside of cluster param
1256     //
1257     Float_t gainEqualPadRegion = 1;
1258     if (grPadEqual) gainEqualPadRegion = grPadEqual->Eval(ipad);
1259     //
1260     amp[ncl]=charge;
1261     amp[ncl]/=gainGG;
1262     amp[ncl]/=gainPad;
1263     amp[ncl]/=corrPos;
1264     amp[ncl]/=gainEqualPadRegion;
1265     //
1266     ncl++;
1267   }
1268
1269   if (type==2) return ncl;
1270   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1271   //
1272   if (ncl<10) return 0;
1273   //
1274   Double_t * ampWithBelow = new Double_t[ncl + nclBelowThr];
1275   for(Int_t iCl = 0; iCl < ncl + nclBelowThr; iCl++) {
1276     if (iCl < nclBelowThr) {
1277       ampWithBelow[iCl] = amp[indexes[0]];
1278     } else {
1279       ampWithBelow[iCl] = amp[indexes[iCl - nclBelowThr]];
1280     }
1281   }
1282   //printf("DEBUG: %i shit %f", nclBelowThr, amp[indexes[0]]);
1283   //
1284   Float_t suma=0;
1285   Float_t suma2=0;
1286   Float_t suma3=0;
1287   Float_t sumaS=0;
1288   Float_t sumn=0;
1289   // upper,and lower part statistic
1290   Float_t sumL=0, sumL2=0, sumLN=0;
1291   Float_t sumD=0, sumD2=0, sumDN=0;
1292
1293   Int_t icl0=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*low);
1294   Int_t icl1=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*up);
1295   Int_t iclm=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*(low +(up+low)*0.5));
1296   //
1297   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1298     if (ampWithBelow[icl]<0.1) continue;
1299     Double_t camp=ampWithBelow[icl]/corrTimeGain;
1300     if (mode==1) camp= TMath::Log(camp);
1301     if (icl<icl1){
1302       suma+=camp;
1303       suma2+=camp*camp;
1304       suma3+=camp*camp*camp;
1305       sumaS+=TMath::Power(TMath::Abs(camp),1./3.);
1306       sumn++;
1307     }
1308     if (icl>iclm){
1309       sumL+=camp;
1310       sumL2+=camp*camp;
1311       sumLN++;
1312       }
1313     if (icl<=iclm){
1314       sumD+=camp;
1315       sumD2+=camp*camp;
1316       sumDN++;
1317     }
1318   }
1319   //
1320   Float_t mean = 0;
1321   Float_t meanL = 0;
1322   Float_t meanD = 0;           // lower half mean
1323   if (sumn > 1e-30)   mean =suma/sumn;
1324   if (sumLN > 1e-30)  meanL =sumL/sumLN;
1325   if (sumDN > 1e-30)  meanD =(sumD/sumDN);
1326   /*
1327   Float_t mean =suma/sumn;
1328   Float_t meanL = sumL/sumLN;
1329   Float_t meanD =(sumD/sumDN);           // lower half mean
1330   */
1331
1332   Float_t rms = 0;
1333   Float_t mean2=0;
1334   Float_t mean3=0;
1335   Float_t meanS=0;
1336
1337   if(sumn>0){
1338     rms = TMath::Sqrt(TMath::Abs(suma2/sumn-mean*mean));
1339     mean2=suma2/sumn;
1340     mean3=suma3/sumn;
1341     meanS=sumaS/sumn;
1342   }
1343
1344   if (mean2>0) mean2=TMath::Power(TMath::Abs(mean2),1./2.);
1345   if (mean3>0) mean3=TMath::Power(TMath::Abs(mean3),1./3.);
1346   if (meanS>0) meanS=TMath::Power(TMath::Abs(meanS),3.);
1347   //
1348   if (mode==1) mean=TMath::Exp(mean);
1349   if (mode==1) meanL=TMath::Exp(meanL);  // upper truncation
1350   if (mode==1) meanD=TMath::Exp(meanD);  // lower truncation
1351   //
1352   delete [] ampWithBelow;
1353
1354
1355   //
1356   if (returnVal==1) return rms;
1357   if (returnVal==2) return ncl;
1358   if (returnVal==3) return Double_t(nclBelowThr)/Double_t(nclBelowThr+ncl);
1359   if (returnVal==4) return meanL;
1360   if (returnVal==5) return meanD;
1361   if (returnVal==6) return mean2;
1362   if (returnVal==7) return mean3;
1363   if (returnVal==8) return meanS;
1364   return mean;
1365 }
1366
1367
1368
1369
1370 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1371   //
1372   //
1373   //
1374  //-----------------------------------------------------------------
1375   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1376   //-----------------------------------------------------------------
1377   Float_t means=0;
1378   Float_t meanc=0;
1379   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1380     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1381     if (point==0) continue;
1382
1383     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1384     if (cl==0) continue;
1385
1386     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1387     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1388     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1389     if (type==0) means+=rsigma;
1390     if (type==1) means+=rsigmay;
1391     if (type==2) means+=rsigmaz;
1392     meanc++;
1393   }
1394   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1395   return mean;
1396 }
1397
1398
1399
1400 Int_t  AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed *seed, AliExternalTrackParam * parin, AliExternalTrackParam * parout){
1401   //
1402   // Refit the track
1403   // return value - number of used clusters
1404   //
1405   //
1406   const Int_t kMinNcl =10;
1407   AliTPCseed *track=new AliTPCseed(*seed);
1408   Int_t sector=-1;
1409   // reset covariance
1410   //
1411   Double_t covar[15];
1412   for (Int_t i=0;i<15;i++) covar[i]=0;
1413   covar[0]=10.*10.;
1414   covar[2]=10.*10.;
1415   covar[5]=10.*10./(64.*64.);
1416   covar[9]=10.*10./(64.*64.);
1417   covar[14]=1*1;
1418   //
1419
1420   Float_t xmin=1000, xmax=-10000;
1421   Int_t imin=158, imax=0;
1422   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
1423     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1424     if (!c) continue;
1425     if (sector<0) sector = c->GetDetector();
1426     if (c->GetX()<xmin) xmin=c->GetX();
1427     if (c->GetX()>xmax) xmax=c->GetX();
1428     if (i<imin) imin=i;
1429     if (i>imax) imax=i;
1430   }
1431   if(imax-imin<kMinNcl) {
1432     delete track;
1433     return 0 ;
1434   }
1435   // Not succes to rotate
1436   if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1437     delete track;
1438     return 0;
1439   }
1440   //
1441   //
1442   // fit from inner to outer row
1443   //
1444   AliExternalTrackParam paramIn;
1445   AliExternalTrackParam paramOut;
1446   Bool_t isOK=kTRUE;
1447   Int_t ncl=0;
1448   //
1449   //
1450   //
1451   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1452     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1453     if (!c) continue;
1454     //    if (RejectCluster(c,track)) continue;
1455     sector = (c->GetDetector()%18);
1456     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1457       //continue;
1458     }
1459     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1460     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1461     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1462       isOK=kFALSE;
1463     }
1464     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1465   }
1466   if (!isOK) { delete track; return 0;}
1467   track->AddCovariance(covar);
1468   //
1469   //
1470   //
1471   for (Int_t i=imax; i>=imin; i--){
1472     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1473     if (!c) continue;
1474     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1475     sector = (c->GetDetector()%18);
1476     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1477       //continue;
1478     }
1479     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1480     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1481     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1482       isOK=kFALSE;
1483     }
1484     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1485   }
1486   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1487   paramIn = *track;
1488   track->AddCovariance(covar);
1489   //
1490   //
1491   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1492     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1493     if (!c) continue;
1494     sector = (c->GetDetector()%18);
1495     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1496       //continue;
1497     }
1498     ncl++;
1499     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1500     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1501     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1502     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1503       isOK=kFALSE;
1504     }
1505     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1506   }
1507   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1508   paramOut=*track;
1509   //
1510   //
1511   //
1512   if (parin) (*parin)=paramIn;
1513   if (parout) (*parout)=paramOut;
1514   delete track;
1515   return ncl;
1516 }
1517
1518
1519
1520 Bool_t AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed* /*seed*/, Bool_t /*out*/){
1521   //
1522   //
1523   //
1524   return kFALSE;
1525 }
1526
1527
1528
1529
1530
1531
1532 void  AliTPCseed::GetError(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param,
1533                                   Double_t& erry, Double_t &errz)
1534 {
1535   //
1536   // Get cluster error at given position
1537   //
1538   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1539   Double_t tany,tanz;
1540   Double_t snp1=param->GetSnp();
1541   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1542   //
1543   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1544   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1545   //
1546   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1547   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1548     padSize = 1;                              // medium pads
1549     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1550   }
1551
1552   erry  = clusterParam->GetError0Par( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany) );
1553   errz  = clusterParam->GetError0Par( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) );
1554 }
1555
1556
1557 void  AliTPCseed::GetShape(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param,
1558                                   Double_t& rmsy, Double_t &rmsz)
1559 {
1560   //
1561   // Get cluster error at given position
1562   //
1563   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1564   Double_t tany,tanz;
1565   Double_t snp1=param->GetSnp();
1566   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1567   //
1568   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1569   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1570   //
1571   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1572   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1573     padSize = 1;                              // medium pads
1574     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1575   }
1576
1577   rmsy  = clusterParam->GetRMSQ( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany), TMath::Abs(cluster->GetMax()) );
1578   rmsz  = clusterParam->GetRMSQ( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) ,TMath::Abs(cluster->GetMax()));
1579 }
1580
1581
1582
1583 Double_t AliTPCseed::GetQCorrGeom(Float_t ty, Float_t tz){
1584   //Geoetrical
1585   //ty    - tangent in local y direction
1586   //tz    - tangent
1587   //
1588   Float_t norm=TMath::Sqrt(1+ty*ty+tz*tz);
1589   return norm;
1590 }
1591
1592 Double_t AliTPCseed::GetQCorrShape(Int_t ipad, Int_t type,Float_t z, Float_t ty, Float_t tz, Float_t /*q*/, Float_t /*thr*/){
1593   //
1594   // Q normalization
1595   //
1596   // return value =  Q Normalization factor
1597   // Normalization - 1 - shape factor part for full drift
1598   //                 1 - electron attachment for 0 drift
1599
1600   // Input parameters:
1601   //
1602   // ipad - 0 short pad
1603   //        1 medium pad
1604   //        2 long pad
1605   //
1606   // type - 0 qmax
1607   //      - 1 qtot
1608   //
1609   //z     - z position (-250,250 cm)
1610   //ty    - tangent in local y direction
1611   //tz    - tangent
1612   //
1613
1614   AliTPCClusterParam * paramCl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1615   AliTPCParam   * paramTPC = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
1616
1617   if (!paramCl) return 1;
1618   //
1619   Double_t dr =  250.-TMath::Abs(z);
1620   Double_t sy =  paramCl->GetRMS0( 0,ipad, dr, TMath::Abs(ty));
1621   Double_t sy0=  paramCl->GetRMS0(0,ipad, 250, 0);
1622   Double_t sz =  paramCl->GetRMS0( 1,ipad, dr, TMath::Abs(tz));
1623   Double_t sz0=  paramCl->GetRMS0(1,ipad, 250, 0);
1624
1625   Double_t sfactorMax = TMath::Sqrt(sy0*sz0/(sy*sz));
1626
1627
1628   Double_t dt = 1000000*(dr/paramTPC->GetDriftV());  //time in microsecond
1629   Double_t attProb = TMath::Exp(-paramTPC->GetAttCoef()*paramTPC->GetOxyCont()*dt);
1630   //
1631   //
1632   if (type==0) return sfactorMax*attProb;
1633
1634   return attProb;
1635
1636
1637 }
1638
1639
1640 //_______________________________________________________________________
1641 Float_t AliTPCseed::GetTPCClustInfo(Int_t nNeighbours, Int_t type, Int_t row0, Int_t row1)
1642 {
1643   //
1644   // TPC cluster information
1645   // type 0: get fraction of found/findable clusters with neighbourhood definition
1646   //      1: found clusters
1647   //      2: findable (number of clusters above and below threshold)
1648   //
1649   // definition of findable clusters:
1650   //            a cluster is defined as findable if there is another cluster
1651   //           within +- nNeighbours pad rows. The idea is to overcome threshold
1652   //           effects with a very simple algorithm.
1653   //
1654
1655   const Float_t kClusterShapeCut = 1.5; // IMPPRTANT TO DO: move value to AliTPCRecoParam
1656   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1657   const Float_t kedgey =3.;
1658
1659   Float_t ncl = 0;
1660   Float_t nclBelowThr = 0; // counts number of clusters below threshold
1661
1662   for (Int_t irow=row0; irow<row1; irow++){
1663     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1664
1665     if (!cluster && irow > 1 && irow < 157) {
1666       Bool_t isClBefore = kFALSE;
1667       Bool_t isClAfter  = kFALSE;
1668       for(Int_t ithres = 1; ithres <= nNeighbours; ithres++) {
1669         AliTPCclusterMI * clusterBefore = GetClusterPointer(irow - ithres);
1670         if (clusterBefore) isClBefore = kTRUE;
1671         AliTPCclusterMI * clusterAfter  = GetClusterPointer(irow + ithres);
1672         if (clusterAfter) isClAfter = kTRUE;
1673       }
1674       if (isClBefore && isClAfter) nclBelowThr++;
1675     }
1676     if (!cluster) continue;
1677     //
1678     //
1679     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1680     //
1681     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1682     if (point==0) continue;
1683     Float_t rsigmay = TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1684     if (rsigmay > kClusterShapeCut) continue;
1685     //
1686     if (cluster->IsUsed(11)) continue; // remove shared clusters for PbPb
1687     ncl++;
1688   }
1689
1690   if(ncl<10)
1691     return 0;
1692   if(type==0)
1693     if(nclBelowThr+ncl>0)
1694       return ncl/(nclBelowThr+ncl);
1695   if(type==1)
1696     return ncl;
1697   if(type==2)
1698     return ncl+nclBelowThr;
1699   return 0;
1700 }
1701
1702 //_______________________________________________________________________
1703 void AliTPCseed::Clear(Option_t*)
1704 {
1705   // formally seed may allocate memory for clusters (althought this should not happen for
1706   // the seeds in the pool). Hence we need this method for fwd. compatibility
1707   if (fClusterOwner) for (int i=160;i--;) {delete fClusterPointer[i]; fClusterPointer[i] = 0;}
1708 }